chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.48636597065289 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 1063914 1064111 1063979 Y AGRN,VWA1 C1orf159 B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1orf159 14173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 2246556 2246763 2246722 Y SKI NA NA NA NA NA MORN1 74383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 3231556 3231634 3231595 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 137356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 51771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 3421438 3421558 3421506 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 52448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 3459907 3460197 3460078 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 65862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 6040561 6040806 6040680 Y NA KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA KCNAB2 8720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 6760819 6760983 6760901 Y NA DNAJC11 NA NA NA NA DNAJC11 835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 6803995 6804151 6804092 Y NA DNAJC11,RP11-312B8.1,CAMTA1 CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312B8.1 38752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 7137904 7138115 7138010 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 294520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 37068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8156648 8157003 8156918 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 72280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA NA ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 120979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8445817 8446112 8445964 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 69931 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8450820 8451072 8450834 Y RERE,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 74934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8724042 8724475 8724233 Y NA NA NA NA NA NA RERE 151227 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1-IT1 2141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 8964053 8964236 8964145 Y ENO1 ENO1-IT1,ENO1 ENO1-AS1,ENO1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ENO1 26745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 9223692 9223875 9223840 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 16388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 9241165 9241560 9241362 Y NA RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 902 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 9889535 9889880 9889709 Y KIF1B CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 6951 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 10726049 10726261 10726116 Y CASZ1 NA NA NA NA NA CASZ1 128446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 10804844 10805001 10804872 Y NA CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 49706 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 10926873 10927035 10926954 Y NA NA PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 72166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 10960432 10960567 10960498 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 12493313 12493712 12493478 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 182025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 12493910 12494304 12493999 Y AADACL4 NA NA NA NA NA DHRS3 181433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 12508783 12509005 12508873 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 166732 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 12533412 12533678 12533545 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 142059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 12546528 12546819 12546674 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 128918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 65698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 12697437 12697451 12697444 Y NA DHRS3 VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 DHRS3 21700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 15266491 15266726 15266609 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 210302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 15499033 15499473 15499185 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 22005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 15673118 15673422 15673270 Y NA NA NA NA NA NA EFHD2 60969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 15738146 15738632 15738365 Y SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9 EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 3755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16030221 16030623 16030258 Y NA PLEKHM2,RP11-169K16.4 NA NA NA NA PLEKHM2 21394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16209325 16209770 16209445 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 36683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16277350 16278224 16277618 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 22403 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 16478939 16479163 16479034 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 16479299 16479465 16479382 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA MFAP2,ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17494378 17494745 17494634 Y NA RP11-380J14.1,PADI1 PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 19533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17495208 17495390 17495300 Y NA RP11-380J14.1,PADI1 PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 18888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17518130 17518260 17518142 Y NA RP11-380J14.1,PADI1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 3852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 RP11-380J14.1,PADI1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 4663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA RP11-380J14.1,PADI1,PADI3 NA NA NA NA PADI1 5066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 18092065 18092204 18092136 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10L 227735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 18200796 18200931 18200864 Y NA NA ACTL8,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF10L 336466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 19839147 19839427 19839318 Y NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,AKR7A2,CAPZB CAPZB,RNU4-28P CAPZB,C1orf151-NBL1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-28P 4060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr1 20930711 20931037 20930891 Y CDA PINK1 PINK1 IMR90 Hi-C 24141950 PINK1 26911 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST,KIF17 NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 21724067 21724372 21724186 Y NA NBPF3 ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 40249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 21895072 21895699 21895173 Y NA NA NA NA NA NA ALPL 61214 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 21916510 21916997 21916827 Y NA NA NA NA NA NA ALPL 82652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP NA NA NA NA NA ALPL 131303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 22266159 22266438 22266333 Y HSPG2 RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 4369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 22468030 22468558 22468270 Y NA NA NA NA NA NA WNT4 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 22611972 22612241 22612107 Y WNT4 NA C1QC,C1QB,EPHA8,C1QA,CDC42,WNT4,ZBTB40 IMR90 Hi-C 24141950 WNT4 143510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 23448967 23449247 23449107 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 53054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA NA NA NA NA NA ZNF436 55038 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 23882500 23882866 23882600 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 1419 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 23912037 23912393 23912293 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 27752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 24736156 24736250 24736199 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 4034 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 24789793 24789894 24789844 Y NA NIPAL3,RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 37493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25198155 25198203 25198179 Y NA NA NA NA NA NA CLIC4 128307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25855984 25856012 25855998 Y NA LDLRAP1 MAN1C1,LDLRAP1,TMEM57,C1orf135,FAM54B,RHCE,SEPN1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 12059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA DHDDS 20518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27626897 27627231 27626926 Y NA TMEM222,RP11-4K3__A.5 NA NA NA NA TMEM222 19420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 27928507 27928973 27928740 Y NA NA NA NA NA NA AHDC1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 30984785 30985089 30984937 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 394519 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 31251697 31252042 31251870 Y NA NA LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC3 127566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA SNRNP40 29711 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 31944306 31944695 31944578 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 32250836 32250955 32250895 Y IQCC BAI2,SPOCD1 NA NA NA NA BAI2 22342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 32803558 32803627 32803622 Y PTP4A2,PTP4A2 HDAC1,MARCKSL1,TSSK3 NA NA NA NA MARCKSL1 3578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 33220963 33221073 33221021 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 15477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 33227148 33227387 33227320 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 21662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 33433896 33434020 33433958 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 5610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33448758 33448929 33448798 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 20472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33458800 33459074 33458865 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 30514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33645848 33646140 33645995 Y HPCA,PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 188 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 33685276 33685676 33685470 Y NA TRIM62,ZNF362 TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF362 34470 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 35336428 35336734 35336581 Y NA NA C1orf212 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLGAP3 56452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 36817040 36817280 36817137 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 SH3D21,FAM176B K562 ChIA-PET 22265404 STK40 32217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 36952484 36952865 36952715 Y MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R OSCP1,MRPS15 NA NA NA NA MRPS15 24446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 38391752 38391859 38391812 Y NA INPP5B NA NA NA NA INPP5B 18870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 38495782 38495936 38495884 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2 NA NA NA NA POU3F1 14514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 39327096 39327575 39327204 Y NA RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA RP5-864K19.4 3424 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 39598118 39598362 39598293 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 53130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 39607620 39607869 39607817 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 62632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 39633654 39634014 39633702 Y BMP8A NA NA NA NA NA MACF1 88666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 39651405 39651741 39651429 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 106417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 39857791 39857995 39857869 Y NA KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 16156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIT1 82063 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1,RP1-118J21.5 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 40426190 40426638 40426252 Y MFSD2A MFSD2A NA NA NA NA MFSD2A 7388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 40866111 40866454 40866257 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 NA NA NA NA NA SMAP2 57589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 41952015 41952273 41952132 Y EDN2 EDN2 NA NA NA NA EDN2 3671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 13581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 41962532 41962651 41962593 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 14188 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 123395 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 44692988 44693156 44693052 Y ATP6V0B DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 15861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 45323747 45323764 45323756 Y NA RNU5E-6P NA NA NA NA RNU5E-6P 40078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 46351629 46351956 46351793 Y C1orf190 NA NA NA NA NA MAST2 100970 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 47729037 47729382 47729210 Y NA TAL1,STIL TAL1 K562 ChIA-PET 22265404 TAL1 33145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 803780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 53559901 53560045 53560040 Y NA NA NA NA NA NA CPT2 100056 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 56797894 56798374 56798151 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 310600 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 57297629 57297838 57297785 Y NA NA DAB1,C1orf168,C8A,C8B IMR90 Hi-C 24141950 PRKAA2 188634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 58317106 58317467 58317287 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 202685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 18599 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59229881 59230252 59230003 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 17533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 59509588 59509786 59509693 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 25529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59524373 59524568 59524471 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 40314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 59537846 59538168 59538009 Y NA NA MIR4711,FGGY,JUN,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 53787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59608045 59608421 59608204 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 123986 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 59616706 59617089 59616861 Y NA NA HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 132647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 59758328 59758666 59758447 Y FGGY FGGY NA NA NA NA FGGY 1644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 60216360 60216669 60216553 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 61789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 62119868 62120084 62119981 Y NA NA TM2D1,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 69011 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 62362299 62362490 62362395 Y NA NA NA NA NA NA INADL 156150 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 64197270 64197475 64197385 Y NA ROR1 ROR1,UBE2U,PGM1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 40218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 64505281 64505575 64505361 Y ROR1,UBE2U NA NA NA NA NA CFL1P3 197925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 65381647 65381826 65381744 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 48361 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 65389011 65389411 65389276 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 40776 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 65507944 65508037 65507991 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 23383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 65775838 65775991 65775933 Y PDE4B,DNAJC6 NA NA NA NA NA DNAJC6 63936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 66930584 66930841 66930604 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 WDR78 457729 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 67029191 67029437 67029359 Y NA NA NA NA NA NA WDR78 359133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68027599 68027762 68027652 Y NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 120982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68036173 68036524 68036291 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 112220 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.87177426636275 chr1 68257818 68258216 68258148 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 38934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 68314949 68315302 68315127 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 17799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA DIRAS3 57644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 72696545 72696864 72696705 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 49553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 72715442 72715840 72715642 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 30577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 4000 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 77977128 77977445 77977326 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 169659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 78002564 78002920 78002661 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 144184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 78561383 78561632 78561506 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 118524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 78567287 78567595 78567375 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 124428 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 82172386 82172576 82172503 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 12802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 85005554 85005595 85005576 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 32568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 85349108 85349420 85349289 Y LPAR3 NA NA NA NA NA MCOLN2 111376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 85763626 85763846 85763779 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 22853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 85795855 85796291 85796120 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55082 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr1 85796595 85797055 85796822 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55822 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 85810010 85810182 85810130 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 69237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 85968002 85968172 85968087 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 73761 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 86010493 86010816 86010648 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 31117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 28441 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 86077140 86077408 86077190 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 32696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr1 87239429 87239698 87239491 Y NA NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 87241358 87241518 87241438 Y NA NA NA NA NA NA SH3GLB1 73099 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 87355999 87356364 87356182 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 21743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 87689823 87690165 87689994 Y HS2ST1,LMO4 NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 101986 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 87691904 87692436 87692089 Y NA NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 99715 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 90185639 90185820 90185728 Y LRRC8C NA NA NA NA NA LRRC8C 89008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA ZNF326 85942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 90374317 90375036 90374524 Y LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA ZNF326 83635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA ZNF326 81915 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 91478571 91478975 91478771 Y ZNF644,ZNF644 ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 6854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 92021775 92022091 92021979 Y NA NA TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 57367 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 92198149 92198440 92198227 Y TGFBR3 NA NA NA NA NA TGFBR3 171452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 92207117 92207174 92207146 Y BRDT NA NA NA NA NA TGFBR3 162718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 93270252 93270588 93270467 Y NA EVI5,RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 EVI5 14291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 92882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr1 94158127 94158185 94158167 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 80815 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.87177426636275 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 71480 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 70675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 94201362 94201612 94201551 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 37388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 94203705 94204234 94204026 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 34766 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 8231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 94937052 94937396 94937225 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 55119 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 95003688 95004160 95004042 Y NA F3 NA NA NA NA F3 1196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 RP11-86H7.7 F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-86H7.7 26074 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 97656052 97656450 97656352 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 352807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98232940 98233333 98233137 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 151272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98258555 98258669 98258612 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 125936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 109639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 9.54163318283948 chr1 98497100 98497277 98497188 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 112495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 31459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 98677142 98677181 98677162 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 2839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1070A16.1 114667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 98789496 98789901 98789701 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1070A16.1 115193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA NA NA NA NA NA EXTL2 156983 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 101725356 101725679 101725470 Y SLC30A7,SLC30A7 RP4-575N6.4,S1PR1 NA NA NA NA S1PR1 24912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 107891659 107891745 107891700 Y NA NA NA NA NA NA NTNG1 211030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 108132692 108133060 108132878 Y NTNG1,NTNG1,VAV3 NA NA NA NA NA NTNG1 452063 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 109938897 109939079 109938975 Y TMEM167B,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110160052 110160461 110160231 Y GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2 AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 3326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110366477 110366702 110366587 Y GSTM2,CSF1 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 84093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110435112 110435421 110435324 Y SORT1,SORT1 CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 15443 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 110879130 110879445 110879277 Y CSF1 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA RBM15 2 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 112276731 112276883 112276807 Y C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 18984 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA WNT2B 65207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 113574968 113575168 113575068 Y NA RP11-31F15.2,LRIG2 CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-31F15.2 38559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 114245723 114246101 114246018 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 115968975 115969167 115969071 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 NGF 90118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 117256857 117256976 117256917 Y NA IGSF3 CD101,TTF2 IMR90 Hi-C 24141950 IGSF3 48482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 174517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 120026458 120026860 120026657 Y NA HSD3B1 NA NA NA NA HSD3B1 20961 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 120052717 120053071 120052727 Y HSD3B1 HSD3B1 NA NA NA NA HSD3B1 4896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 120147764 120147961 120147863 Y HSD3B1 GAPDHP33,ZNF697 NA NA NA NA GAPDHP33 9962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 120530218 120530524 120530431 Y NOTCH2,FCGR1B,ZNF697 NA NA NA NA NA NOTCH2 79716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 120530787 120531205 120531127 Y NOTCH2,ZNF697 NA NA NA NA NA NOTCH2 79035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 144908312 144908601 144908436 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 34071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 144927217 144927550 144927432 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 15122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 1070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 50527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 145640932 145641287 145641091 Y NBPF10 POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 31896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 146956714 146956895 146956804 Y GPR89B NA NA NA NA NA ACP6 183723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 147344950 147345054 147345002 Y NA NA GJA5 IMR90 Hi-C 24141950 GJA5 101466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 150510569 150510713 150510587 Y NA ECM1,ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA ADAMTSL4 9171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 151166314 151166527 151166421 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA VPS72 517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA FLG-AS1 NA NA NA NA FLG-AS1 1778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.30287302482905 chr1 152878475 152878651 152878603 Y NA IVL NA NA NA NA IVL 370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 152878925 152879083 152878954 Y NA NA NA NA NA NA IVL 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A2,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 153670755 153671012 153670885 Y S100A9,S100A12 SNAPIN,ILF2,INTS3 NA NA NA NA INTS3 27531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 153671679 153672046 153671861 Y NA SNAPIN,ILF2,INTS3 NA NA NA NA INTS3 26497 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 153718129 153718295 153718212 Y NA INTS3,SLC27A3 NA NA NA NA INTS3 19586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 154728745 154728994 154728977 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 130270 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155443130 155443303 155443253 Y NA NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 86518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 155951073 155951535 155951364 Y NA KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 23326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 156864713 156865066 156864817 Y PEAR1 LRRC71 NA NA NA NA LRRC71 23376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 157124774 157125221 157124855 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 ETV3,ETV3L K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETV3 18508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 157966753 157967127 157966789 Y NA KIRREL NA NA NA NA KIRREL 5690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA ELL2P1 LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2P1 25856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 159158093 159158524 159158429 Y NA CADM3 NA NA NA NA CADM3 18694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 159914077 159914586 159914278 Y NHLH1,VANGL2,IGSF9 CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9,LINC01133 NA NA NA NA IGSF9 691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 160711095 160711588 160711244 Y CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7 NA NA NA NA NA ITLN1 141372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 160881277 160881698 160881498 Y NA ITLN1,RP11-312J18.5 CD244,ITLN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312J18.5 18507 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr1 160972513 160972848 160972620 Y SLAMF7,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 16290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 161050902 161051096 161051032 Y PVRL4 TSTD1,USF1,ARHGAP30,NIT1,PFDN2,DEDD NA NA NA NA ARHGAP30 13142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 161066354 161066604 161066537 Y NA ARHGAP30,NIT1,PFDN2,DEDD NA NA NA NA NIT1 19272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 161324130 161324422 161324290 Y NA SDHC NA NA NA NA SDHC 42083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 135042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 162827762 162827953 162827847 Y NA NA NA NA NA NA RGS4 208612 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 162954567 162954830 162954669 Y RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA RGS4,RGS5,C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 81735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 163005587 163006022 163005933 Y UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 RGS4 C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 30543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 163006587 163006657 163006633 Y RGS4,RGS4,RGS4 RGS4 C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 29908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 164580985 164581415 164581219 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 58164 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 164681412 164681799 164681686 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 158591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 164734934 164735098 164735029 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 212113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 165868061 165868423 165868295 Y NA NA NA NA NA NA TMCO1 73069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 167635730 167635903 167635817 Y NA NA NA NA NA NA MPZL1 52526 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 167730247 167730494 167730371 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 41818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172715484 172715760 172715631 Y NA NA C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 302343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 172790579 172790978 172790769 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 227125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172796968 172797220 172797094 Y TNFSF4 NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 220883 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172804293 172804464 172804387 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 213639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172852442 172852809 172852725 Y NA NA LOC100506023,TNFSF18,TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 165294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172874674 172874828 172874762 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 143275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 138747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.85335186230056 chr1 172888696 172888994 172888711 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 129109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172903010 172903534 172903241 Y TNFSF18,TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 114569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 172917653 172917863 172917731 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 100240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 172938789 172938985 172938853 Y NA NA TNFSF4,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 79118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 172959872 172960111 172959992 Y TNFSF18 NA LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 57992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 172972573 172972790 172972603 Y PRDX6 TNFSF18 NA NA NA NA TNFSF18 45313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 173081389 173081497 173081443 Y NA NA TNFSF4,TNFSF18,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 63286 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 173091914 173092434 173092232 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 73811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 173092552 173092771 173092714 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 74449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 177896186 177896486 177896298 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 164378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178121154 178121309 178121232 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 60290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178207948 178208160 178207999 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 147084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178235815 178236162 178236004 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 174951 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178252303 178252477 178252337 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 191439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 178298668 178299096 178298877 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 210791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA C1orf220 204551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178378072 178378430 178378251 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 131457 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 178379281 178379736 178379396 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 130151 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 179144823 179145001 179144950 Y NA NA NA NA NA NA ABL2 51818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 181082184 181082367 181082268 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 181110732 181111003 181110864 Y STX6,MR1,IER5 NA STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 55094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC1 138521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 183132366 183132749 183132653 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 141771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 143013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr1 183237084 183237447 183237420 Y NA NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG7 201904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 183239968 183240242 183240112 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG7 199109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG7 197484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA SMG7 189897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 183256519 183256577 183256548 Y NMNAT2 NA NA NA NA NA SMG7 182774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 183526698 183527308 183526965 Y SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2 NA NA NA NA NCF2 30703 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 183577563 183577895 183577671 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2,ARPC5,RGL1 NA NA NA NA NCF2 19552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA NCF2,ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 184357629 184357933 184357738 Y EDEM3 C1orf21 NA NA NA NA C1orf21 3437 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 184700299 184700688 184700567 Y NA EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 21359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 184922808 184923031 184922923 Y EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 18651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 197908297 197908430 197908355 Y NA C1orf53 NA NA NA NA C1orf53 38520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 197950697 197951087 197950780 Y DENND1B NA ATP6V1G3,PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 C1orf53 80920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr1 198840125 198840497 198840438 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 716032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 198888798 198889070 198888879 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 764705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 199826452 199826640 199826531 Y NA NA C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 550544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA IGFN1 78053 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 201618983 201619286 201619160 Y NA NAV1 NA NA NA NA NAV1 28572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 201682596 201682901 201682784 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 92185 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 201717535 201717792 201717621 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 78477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 201743848 201744120 201743952 Y CSRP1,CSRP1,NAV1 NA NA NA NA NA IPO9 52149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA ELF3 NA NA NA NA ELF3 28406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 202045307 202045525 202045416 Y PPP1R12B,ELF3 NA NA NA NA NA ARL8A 66344 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 203122696 203123081 203122889 Y FMOD,ADORA1 CHI3L1 NA NA NA NA CHI3L1 30796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 203489584 203489741 203489635 Y BTG2 NA NA NA NA NA ATP2B4 103948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA GOLT1A 74778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 204388302 204388627 204388415 Y NA PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 9383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA LRRN2 NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRN2 31184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 205144631 205144860 205144785 Y NA DSTYK NA NA NA NA DSTYK 33867 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 206807155 206807335 206807245 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 207069223 207069337 207069332 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 435 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 208357514 208358085 208357775 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 57580 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 209557331 209557442 209557421 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 117763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 212658172 212658571 212658328 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 53943 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 212739888 212740789 212739945 Y NA ATF3 NA NA NA NA ATF3 3212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 213101984 213102303 213102117 Y VASH2 NA FLVCR1,VASH2,TATDN3,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLVCR1 72387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 214648804 214649025 214648867 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 74767 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 215130656 215131050 215130800 Y KCNK2,KCNK2 KCNK2 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK2 46068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 215164018 215164287 215164098 Y NA KCNK2 KCNK2,CENPF,PTPN14 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK2 12831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 216099547 216099924 216099737 Y NA NA NA NA NA NA KCTD3 360812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 222050666 222050976 222050756 Y DUSP10,DUSP10 NA NA NA NA NA DUSP10 137148 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 222544700 222544953 222544838 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 HHIPL2 174492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 223904365 223904567 223904454 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 17070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 224019430 224020596 224019827 Y FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 11078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr1 224633276 224633598 224633406 Y NA CNIH3,WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 10541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 224685994 224686507 224686055 Y NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 63259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 224914627 224914789 224914675 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 167175 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 226005413 226005573 226005512 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 9619 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 227499470 227499818 227499796 Y NA CDC42BPA NA NA NA NA CDC42BPA 4357 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 227981750 227981829 227981790 Y WNT9A NA NA NA NA NA JMJD4 60638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 228124828 228124930 228124870 Y ARF1,ARF1 WNT9A NA NA NA NA WNT9A 8669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 228338299 228338457 228338378 Y GJC2 C1orf35,MRPL55,GUK1,IBA57 NA NA NA NA GUK1 12636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr1 231531271 231531676 231531476 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 27114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 231944869 231945038 231944953 Y EXOC8 NA NA NA NA NA DISC1 184308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 232117893 232118046 232117970 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 357332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 232362022 232362384 232362201 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 601461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 233763606 233763782 233763694 Y NA KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 15856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 327405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 236105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234275805 234276023 234275906 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 214729 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 23634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 236414606 236414689 236414648 Y GPR137B ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 28630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 240405898 240406270 240405998 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 74443 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 240437557 240437954 240437680 Y FMN2 NA NA NA NA NA ADH5P3 106102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 240514375 240514531 240514453 Y FMN2,GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 182920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 243428005 243428394 243428166 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 10685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 244417754 244418100 244418029 Y AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS NA LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 195336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 244462616 244463099 244462949 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 150337 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 244512430 244512879 244512496 Y ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 100557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 244763140 244763529 244763408 Y ADSS,EFCAB2 NA NA NA NA NA ADSS 149704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 245613844 245614251 245613905 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 297557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247297966 247298129 247298007 Y NA ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 32292 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 247714961 247715210 247715127 Y OR2G2,C1orf150 NA NA NA NA NA ZNF496 221813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr1 249117788 249118228 249118121 Y SH3BP5L MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692 NA NA NA NA MIR3124 348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 516106 516519 516355 Y ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 217164 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.85335186230056 chr10 3133662 3133717 3133688 Y PITRM1,PFKP PFKP NA NA NA NA PFKP 27137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 3710838 3711066 3710976 Y KLF6 NA KLF6 K562 ChIA-PET 22265404 KLF6 114407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 3929991 3930887 3930290 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 104518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 5590959 5591270 5591035 Y NET1 RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 44811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 6764164 6764384 6764289 Y NA NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 PFKFB3 579283 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 7583205 7583490 7583242 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 123471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 8927492 8927792 8927642 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 1069025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 10839185 10839573 10839228 Y CELF2 SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 4242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 10953472 10953723 10953520 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 91536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 11077382 11077525 11077432 Y NA CELF2 NA NA NA NA CELF2 32123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 11112343 11112864 11112373 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 67084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 11252483 11252766 11252686 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 207224 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 53588 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 11866902 11867068 11866972 Y C10orf47 NA LOC219731 IMR90 Hi-C 24141950 ECHDC3 84537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 135463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 11924114 11924319 11924232 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 141749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 12749537 12749904 12749742 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 360056 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 205805 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr10 13924181 13924825 13924574 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 189458 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14003091 14003406 14003339 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 110877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14417107 14417451 14417285 Y NA NA FRMD4A,FAM107B,PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 84690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 14438165 14438288 14438234 Y NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 63853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr10 14441741 14441971 14441846 Y NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 60170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14446040 14446232 14446114 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 55909 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 54683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr10 14458446 14458565 14458455 Y NA FRMD4A FRMD4A,MIR1265,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 43576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 14518978 14519126 14519049 Y NA FRMD4A FRMD4A IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 16837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 100178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 15158719 15159034 15158939 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA RPP38 21540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 17280857 17281170 17281014 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 NA NA NA NA RP11-124N14.3 6025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 17697506 17697813 17697679 Y ST8SIA6,STAM PTPLA,STAM NA NA NA NA STAM 13382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 19943656 19943825 19943742 Y NA NA ARL5B,NSUN6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXDC2 159343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 20115618 20116154 20115807 Y PLXDC2 PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 12450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 20126415 20126499 20126449 Y NA PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 23247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 20134637 20134650 20134644 Y PLXDC2 PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 31469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 20203114 20203263 20203197 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 99946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 20384805 20385193 20384998 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 281637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 20446340 20446583 20446461 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 343172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 20517791 20518055 20517886 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 414623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 22535914 22536341 22536050 Y NA NA ARMC3,LOC100130992 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 66562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 22922432 22922728 22922682 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 78756 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 22970665 22970972 22970902 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 30512 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 24498955 24499204 24499146 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 511393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr10 31364412 31364707 31364567 Y NA ZNF438 ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 45546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 32034546 32034864 32034695 Y NA NA ZNF438,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 180878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 32047879 32048374 32048138 Y ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167368 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 34816179 34816294 34816237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 134735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 38490067 38490220 38490144 Y NA NA NA NA NA NA ZNF37A 108803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 43800197 43800376 43800318 Y CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF RASGEF1A ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 RASGEF1A 39830 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 44100382 44100859 44100681 Y CSGALNACT2 CAP1P2,ZNF485,ZNF32 NA NA NA NA ZNF485 527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-38L15.3 107903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 47080536 47081217 47080878 Y GPRIN2 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 131064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 47092142 47092537 47092340 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 142670 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 47113842 47114070 47114068 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 164370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 180022 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 188277 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-463P17.1 674126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 49814847 49815442 49815148 Y NA ARHGAP22 NA NA NA NA ARHGAP22 46868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 49848485 49848580 49848572 Y NA ARHGAP22 NA NA NA NA ARHGAP22 13730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 50595145 50595278 50595227 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 149808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 50742859 50743547 50743006 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA PGBD3 1539 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 52154516 52154956 52154688 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 131778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 131012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 54203502 54203868 54203680 Y DKK1 NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 131446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 54232102 54232449 54232243 Y NA NA DKK1,LOC100506939 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 160046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr10 60091544 60091861 60091608 Y IPMK,UBE2D1 UBE2D1 UBE2D1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2D1 874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 62174641 62174784 62174750 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 361305 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 63807017 63807353 63807186 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 147958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 106321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 119010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr10 69856894 69857171 69856968 Y NA HERC4 MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 23789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,HKDC1,RP11-227H15.4 NA NA NA NA HKDC1 627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 71109104 71109433 71109270 Y NA NA NA NA NA NA HK1 81364 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 71198445 71198595 71198514 Y NA TSPAN15 HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSPAN15 10634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B,UNC5B-AS1 NA NA NA NA UNC5B-AS1 1736 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr10 73528339 73528873 73528813 Y CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 2382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 22240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 73745585 73745830 73745708 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 23462 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 74544491 74544662 74544597 Y NA NA NA NA NA NA MCU 94602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 75716399 75716797 75716501 Y FUT11,NDST2 PLAU,VCL CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VCL 39075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 78923836 78924098 78923933 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 472255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 78954967 78955278 78955208 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 441075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 79006844 79007202 79006984 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 389151 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr10 79261142 79261358 79261250 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 134995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 130184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 79268227 79268357 79268284 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 127996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 104574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 80925867 80926207 80926136 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 99075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 80943996 80944377 80944135 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 117204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81005366 81005598 81005460 Y PPIF NA NA NA NA NA PPIF 99627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81059255 81059879 81059575 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 45346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81080868 81081434 81081104 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 23791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 81088418 81088982 81088641 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 16243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 82237584 82237869 82237663 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 25662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 46720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 48518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 82415742 82416112 82416077 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN14 203820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 86108374 86108507 86108453 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 209692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 86152070 86152317 86152175 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 165882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 274790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 89417361 89417513 89417446 Y NA NA NA NA NA NA PAPSS2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 89465152 89465360 89465258 Y NA PAPSS2 ATAD1 IMR90 Hi-C 24141950 PAPSS2 47782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 89912666 89913039 89912909 Y NA NA KLLN,PTEN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 209407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 90495559 90495751 90495657 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 141740 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 90745683 90745943 90745816 Y NA FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 2471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 90791932 90792275 90792106 Y NA FAS,ACTA2 NA NA NA NA ACTA2 42785 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3,IFIT2 NA NA NA NA RP11-149I23.3 21045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 93320562 93320757 93320661 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3C 70054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 93697836 93698042 93697939 Y NA BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 16310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 94367821 94367909 94367865 Y CYP26C1,KIF11 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 16778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 95136235 95136595 95136450 Y MYOF NA NA NA NA NA MYOF 103479 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 95222493 95222944 95222696 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 17130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 95224699 95224811 95224754 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15263 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 97024100 97024800 97024493 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 23981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 98332019 98332237 98332217 Y NA NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 12972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 99173709 99174019 99173866 Y FRAT1,ZFYVE27,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 99302007 99302242 99302124 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,ANKRD2,HOGA1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD2 27956 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 99302907 99303185 99303057 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,ANKRD2,HOGA1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD2 27013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr10 99408797 99409067 99408957 Y NA MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 17453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 101537826 101537964 101537919 Y ABCC2 COX15 NA NA NA NA COX15 47969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 101736797 101737134 101736959 Y BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP DNMBP NA NA NA NA DNMBP 30542 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr10 103662146 103662497 103662405 Y NA NA NA NA NA NA MGEA5 85450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 103708018 103708327 103708173 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 105623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 104359512 104359806 104359659 Y ACTR1A,C10orf26 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 42447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 104364219 104364413 104364273 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 37840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 104387544 104387817 104387672 Y GBF1,CUEDC2,ACTR1A TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 14436 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr10 104683249 104683568 104683410 Y NA CNNM2 NA NA NA NA CNNM2 7199 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 104953975 104954222 104954115 Y C10orf26,C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 2919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 105001544 105001968 105001663 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 105452274 105452407 105452303 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 160894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 156759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 106052804 106053054 106052846 Y MEIR5,MEIR5,GSTO1 GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA GSTO2 26173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 106082205 106082621 106082398 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 13541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 108512830 108513223 108513027 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP5 1068750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 111650301 111650520 111650491 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 30791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 111666185 111666517 111666351 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 14794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 114891441 114891844 114891554 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 183432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 117502747 117502760 117502754 Y NA NA NA NA NA NA TRUB1 806795 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 120632969 120633291 120633120 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 153937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1 146542 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 126336359 126336702 126336537 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B-AS1 53492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 126349618 126349650 126349637 Y NA FAM53B-AS1 NA NA NA NA FAM53B-AS1 40544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 127919956 127919968 127919963 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 155056 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 128592998 128593177 128593088 Y NA DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 1020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 130590720 130590941 130590831 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 668071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 131765501 131765764 131765633 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 166899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A RP11-432J24.5,INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 44831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27233 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A NA NA NA NA NA AP2A2 150475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 NA NA NA NA NA TOLLIP 80662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 1847921 1848122 1848046 Y KRTAP5-3 AC139143.2,SYT8 H19 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYT8 1212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 1870283 1870513 1870420 Y CTSD,MOB2 AC139143.2,SYT8 NA NA NA NA SYT8 23574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2465201 2465287 2465244 Y INS TSSC4,KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 1287 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2619837 2620105 2619972 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 99119 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2635710 2635980 2635769 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 83244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2847272 2847432 2847347 Y NA NA NA NA NA NA CDKN1C 57679 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 3860220 3860837 3860518 Y NA PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA RHOG 7 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 3902068 3902471 3902356 Y OR52B4,CHRNA10,NUP98,RHOG,STIM1 RHOG,STIM1 NA NA NA NA STIM1 28311 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 7913705 7913868 7913824 Y NA NA NA NA NA NA NLRP10 71105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 8944739 8945112 8945060 Y ASCL3 AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B NA NA NA NA AKIP1 14053 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 8973817 8973979 8973898 Y NA AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B C11orf16 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9B-AS1 10243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 9060824 9061053 9060961 Y ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A NA NA NA NA NA TMEM9B 76266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 9639557 9639822 9639717 Y WEE1 WEE1,SWAP70 LOC283104,LOC440028,SBF2,SWAP70,ZNF143 IMR90 Hi-C 24141950 SWAP70 43802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 10323282 10323617 10323398 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3 NA NA NA NA RP11-351I24.1 31 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 10396762 10397165 10396941 Y ADM NA SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 68902 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 10940363 10940655 10940518 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 CTD-2003C8.2 CTR9,ZBED5,LOC729013,EIF4G2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 21494 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 10948299 10948671 10948479 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 29430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 36796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 11547720 11547907 11547841 Y NA NA NA NA NA NA USP47 313063 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 11641691 11641934 11641813 Y GALNTL4 NA NA NA NA NA USP47 219036 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 11998818 11999068 11999003 Y MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 114475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr11 12063877 12064119 12063998 Y NA MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 49424 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 12065635 12065803 12065720 Y NA MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 47740 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 12097914 12098716 12098251 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 14827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 12101706 12102070 12101803 Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 11473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr11 12109558 12109847 12109697 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 3696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12177917 12178047 12177953 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 64374 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12180569 12180722 12180645 Y MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 12184848 12185162 12185016 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 71305 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 12222498 12222995 12222733 Y MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 108955 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr11 12561282 12561501 12561392 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 132468 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 14306265 14306627 14306419 Y NA NA NA NA NA NA RRAS2 77425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 14354673 14355035 14354941 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 29017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 14436782 14437066 14436859 Y NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRAS2 52730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAS2 59835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 16893238 16893541 16893423 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 101019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 17099866 17100401 17100030 Y NA SNORD14A,RPS13 NA NA NA NA RPS13 2532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 RP11-613F22.5,TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 366621 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 20134058 20134420 20134284 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 248811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 23924626 23924923 23924775 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 1074781 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 27693843 27694020 27693988 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 47585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 25451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 27725050 27725226 27725138 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 16379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 28010741 28010769 28010755 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 100161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA RP11-115J23.1 BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 42589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 28779294 28779601 28779473 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 57132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr11 28792909 28793103 28792913 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 70747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 37.6160538938864 chr11 28795482 28795636 28795549 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 73320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 28853592 28853798 28853653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 131430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr11 28856336 28856685 28856610 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 134174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.13780248306741 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 28997579 28997988 28997773 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115J23.1 275417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 29302148 29302272 29302237 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 579986 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 31693471 31693827 31693649 Y NA NA NA NA NA NA RCN1 138112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 34621875 34622041 34621973 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF NA APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CAT 163403 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 NA NA NA NA NA CAT 217107 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA PDHX 228200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 34919844 34920223 34920054 Y ELF5,EHF PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 15153 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 25458 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 44590064 44591217 44590888 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 6087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 44596231 44596678 44596336 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 12254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 44702928 44703040 44702985 Y NA TSPAN18 EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 42975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 44882780 44883083 44882907 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 87757 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 45167156 45167357 45167300 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 196316 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ NA PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 93222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 87257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 NA CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 81988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 46379063 46379180 46379102 Y NA DGKZ,MDK NA NA NA NA MDK 21126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 47215723 47215949 47215852 Y NA ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PACSIN3 9729 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,ACP2,MADD NA NA NA NA ACP2 15448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 47395886 47396392 47396204 Y MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 MYBPC3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 30291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 47968538 47968912 47968651 Y CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ RP11-793I11.1,PTPRJ PTPRJ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRJ 31201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 48028073 48028508 48028179 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 27960 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 57044676 57044864 57044770 Y UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 45562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 57366352 57366685 57366510 Y RTN4RL2,SLC43A1,SLC43A1,UBE2L6,SERPING1,SERPING1 UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1 NA NA NA NA SERPING1 3492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 60929738 60929978 60929839 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 2649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 61064926 61064998 61064962 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 61456345 61456647 61456520 Y CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 10440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 61463458 61463769 61463630 Y CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 17553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 61467819 61468013 61467906 Y CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 21914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 62311446 62311797 62311501 Y WDR74,STX5,NXF1,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 62321348 62321821 62321541 Y NA RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 63822776 63822835 63822807 Y NA NA NA NA NA NA OTUB1 71451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 64636604 64637051 64636910 Y CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1 CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B NA NA NA NA EHD1 16717 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 64637838 64638320 64638071 Y RASGRP2,SF1,SF1,EHD1,ATG2A CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B NA NA NA NA EHD1 15448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65083603 65083722 65083697 Y NA CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 3314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 MALAT1 23363 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65259637 65259913 65259840 Y SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr11 65411467 65411885 65411633 Y TIGD3,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,DKFZp761E198,SIPA1,SIPA1,RELA MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA SIPA1 7899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65583188 65583268 65583228 Y NA MUS81,CFL1 NA NA NA NA MUS81 39329 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.93588713318138 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CST6,SF3B2 NA NA NA NA CST6 5662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 65852297 65852657 65852298 Y TMEM151A,CNIH2 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 16463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 66094685 66094783 66094735 Y CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248 YIF1A,TMEM151A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 7528 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 MRGPRF 2332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 NA NA NA NA MRGPRF 88 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 69069179 69069344 69069260 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA IFITM9P 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 69089155 69089700 69089444 Y MRGPRD MYEOV,IFITM9P CCND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM9P 19881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA AP000439.2 MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 21935 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 AP000439.2 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 583 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 70090856 70091139 70091025 Y NA FADD,PPFIA1 PPFIA1,FADD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPFIA1 23667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 70107513 70107580 70107548 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 7226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 70144122 70144421 70144277 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 29316 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 71892346 71892672 71892509 Y NA INPPL1 RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1 IMR90 Hi-C 24141950 INPPL1 40073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 72351414 72351690 72351438 Y NA PDE2A NA NA NA NA PDE2A 31945 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 72429149 72429366 72429274 Y ATG16L2,ARAP1,ARAP1 PDE2A NA NA NA NA PDE2A 45514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 72449101 72449742 72449392 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 52902 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 72868553 72869130 72868609 Y NA FCHSD2 STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 17247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 72968455 72968625 72968568 Y NA P2RY2,ARHGEF17 P2RY6 MCF7 ChIA-PET 22265404 P2RY2 41112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 73034605 73034942 73034774 Y NA ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 17271 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 73729347 73729733 73729506 Y NA UCP2 NA NA NA NA UCP2 36995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 74742390 74742651 74742474 Y ARRB1 NEU3 XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEU3 45211 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 75537561 75537829 75537710 Y ARRB1,DGAT2,UVRAG UVRAG NA NA NA NA UVRAG 13349 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 76285451 76285730 76285592 Y NA NA NA NA NA NA LRRC32 94061 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 76463883 76464042 76463970 Y NA RP11-21L23.4,TSKU ACER3,TSKU,B3GNT6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 13225 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 76474777 76474856 76474817 Y OMP RP11-21L23.4,TSKU B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-21L23.4 2411 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 77271215 77271363 77271291 Y NA AQP11 MYO7A,GDPD4,CAPN5,PAK1,AQP11 IMR90 Hi-C 24141950 AQP11 27073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 78426480 78426845 78426663 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 142561 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 78544305 78544548 78544426 Y GAB2 NA NA NA NA NA NARS2 260386 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 79794635 79795000 79794859 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 1510716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 16.8813510157929 chr11 85873395 85873578 85873505 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED,CCDC83 IMR90 Hi-C 24141950 EED 80008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 86025840 86026030 86025935 Y NA C11orf73 NA NA NA NA C11orf73 14587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 86399785 86399941 86399864 Y NA ME3 ME3,PRSS23 IMR90 Hi-C 24141950 ME3 18107 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr11 86430919 86431170 86431045 Y PRSS23 ME3 PRSS23,ME3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ME3 49241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 86451588 86451883 86451813 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 48218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 86452946 86453377 86453076 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 46724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 86514557 86514754 86514624 Y NA PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 14456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 86631607 86631965 86631913 Y ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4 FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 32468 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 87133739 87133898 87133788 Y NA NA GRM5,FZD4,LOC100506368 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 386853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 93868403 93868611 93868483 Y FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 8309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 94480491 94481212 94480556 Y AMOTL1 AMOTL1 AMOTL1,PIWIL4 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 42894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95778897 95779169 95779022 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 122418 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95831850 95832175 95832093 Y MAML2 NA NA NA NA NA MTMR2 175371 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95886290 95886343 95886317 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 188001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95888692 95889856 95889448 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 184488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 95994127 95994433 95994401 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 79911 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 97836778 97837204 97837004 Y NA NA NA NA NA NA CNTN5 1052479 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 101881929 101882102 101882031 Y NA C11orf70 NA NA NA NA C11orf70 34072 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 MMP1 NA NA NA NA MMP1 35507 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 104838372 104838510 104838471 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 CASP4 NA NA NA NA CASP4 209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 107966906 107967320 107967120 Y NA ACAT1 ACAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACAT1 22923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 108741188 108741366 108741295 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 207436 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 110067293 110067585 110067439 Y NA NA ZC3H12C,RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 97862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 111402540 111402739 111402658 Y NA LAYN NA NA NA NA LAYN 6266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 111560054 111560414 111560322 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 74737 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 IL18,BCO2 NA NA NA NA IL18 16061 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 112752270 112752453 112752335 Y NCAM1 NA NA NA NA NA TTC12 430798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 114162667 114162750 114162694 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36158 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 114224881 114225192 114225037 Y NA RBM7,C11orf71 FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM7 43560 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 116884410 116884712 116884644 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 20055 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 117745558 117745882 117745720 Y DSCAML1,SCN4B,SCN2B,FXYD6,FXYD6 NA NA NA NA NA SCN4B 275721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118489703 118490017 118489779 Y NA ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 14548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118493108 118493651 118493460 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 17953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118493849 118494041 118493911 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 18694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 118785112 118785368 118785332 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 5695 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118786339 118786473 118786384 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 6922 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 118787524 118788054 118787588 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6263 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr11 118806138 118806167 118806153 Y NA MIR4492,BCL9L PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9L 11821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 119124696 119124715 119124706 Y NA CBL NA NA NA NA CBL 49944 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 9059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 119612950 119613345 119613188 Y NA PVRL1 PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 15156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 120302835 120303154 120303088 Y OAF,ARHGEF12 NA NA NA NA NA GRIK4 77314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 121337416 121337512 121337466 Y NA SORL1 NA NA NA NA SORL1 16504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 121353016 121353670 121353326 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 121915938 121916278 121916104 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1,BLID,SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 52274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 121947541 121947705 121947629 Y NA MIR125B1,RP11-166D19.1 NA NA NA NA MIR125B1 20847 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 121983293 121983692 121983594 Y NA MIR125B1,RP11-166D19.1,MIR100 NA NA NA NA RP11-166D19.1 1339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 122049218 122049681 122049522 Y NA MIR100 NA NA NA NA MIR100 28202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 122059856 122060218 122060121 Y NA MIR100 NA NA NA NA MIR100 38840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 129362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 124587586 124587756 124587671 Y ROBO4,NRGN,ESAM SPA17,SIAE,NRGN NA NA NA NA NRGN 19986 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 124940571 124941111 124940841 Y TBRG1,SLC37A2 TMEM218 NA NA NA NA TMEM218 38548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 125670081 125670467 125670312 Y CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2 NA NA NA NA NA HYLS1 81042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 126029421 126029682 126029619 Y NA FAM118B,RPUSD4 HYLS1,CDON IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 49627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr11 126790922 126791265 126791130 Y KIRREL3 NA NA NA NA NA KIRREL3 80090 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 128291574 128291714 128291646 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 163739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 128376227 128376457 128376317 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 78996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 128388897 128389626 128389454 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 65827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 128419505 128419554 128419521 Y NA ETS1 NA NA NA NA ETS1 35899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 128586554 128587109 128586817 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 32124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 128605969 128606121 128606047 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA FLI1 51539 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA BARX2 230204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 130321179 130321606 130321259 Y ADAMTS15 ADAMTS15 NA NA NA NA ADAMTS15 4310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 130450344 130450649 130450537 Y NA NA ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 133475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr11 133903772 133904156 133904071 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 78892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr11 134688539 134688830 134688760 Y NA NA NA NA NA NA B3GAT1 408727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 52557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 1157508 1157869 1157627 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 59833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 1211682 1211803 1211740 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 114007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 1583254 1583583 1583419 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 53474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 1584094 1584332 1584168 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 52725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 1744932 1745222 1745077 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 43601 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 1876861 1877254 1877034 Y NA RPS4XP14 NA NA NA NA RPS4XP14 11684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 2026044 2026229 2026139 Y CACNA2D4 NA NA NA NA NA CACNA1C 51723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 2175107 2175395 2175116 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 63406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 262453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 356114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 3340124 3340182 3340154 Y NRIP2 RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 21028 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 3450642 3450947 3450795 Y NA NA PRMT8,EFCAB4B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-543P15.1 131546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 4115951 4116335 4116221 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 135343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 4120809 4121079 4120983 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 140201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 4274113 4274463 4274167 Y CCND2 NA NA NA NA NA CCND2 106475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 CCND2,CCND2-AS2,C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 1524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 5915509 5915755 5915702 Y NA NA NA NA NA NA CD9 391126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 61127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,LPAR5,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 8112195 8112747 8112462 Y NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 25324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 9803369 9803672 9803507 Y KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4 NA NA NA NA RP11-705C15.4 4764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA CLEC2B NA NA NA NA CLEC2B 33813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 10794413 10794704 10794528 Y NA MAGOHB,STYK1 NA NA NA NA MAGOHB 30191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 11911642 11913422 11912121 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 110854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 11915588 11916131 11915796 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 114800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12030986 12031138 12031062 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 230198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12605511 12605890 12605533 Y NA NA NA NA NA NA LOH12CR1 97498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12708006 12708373 12708190 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 4944 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12711400 12711706 12711553 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP16 1611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.5873236455959 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 13050548 13050563 13050554 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 8832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 13056884 13057235 13057060 Y GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA MIR614 9528 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 13075067 13075388 13075228 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA RP11-392P7.6 3272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 13247337 13247745 13247512 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 52119 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 14410616 14411017 14410842 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 105593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 15910995 15911177 15911085 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 122086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA DERA 491593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA DERA 492147 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 18905579 18905804 18905692 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 374844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 23883924 23884166 23883932 Y NA NA NA NA NA NA ETNK1 1107915 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 NA NA NA NA NA BCAT1 426587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 25062577 25063016 25062829 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 37377 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr12 26512613 26512980 26512754 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 235063 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 26538001 26538320 26538173 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 260451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 27513734 27513812 27513790 Y NA ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 29947 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 31602301 31602617 31602553 Y NA NA NA NA NA NA FAM60A 124309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B-AS1 68826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 31886733 31886952 31886810 Y NA AMN1 C12orf35 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 6625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 32543557 32543792 32543676 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 285788 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 33048688 33048837 33048763 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 33072560 33072656 33072597 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 24786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 33137070 33137259 33137186 Y PKP2 NA NA NA NA NA PKP2 89296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 39094852 39095225 39095039 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 204007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 42470575 42470704 42470641 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 65977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 42537125 42537342 42537234 Y NA GXYLT1 NA NA NA NA GXYLT1 444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 45644542 45644793 45644668 Y ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 36718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 46902978 46903383 46903115 Y NA NA SLC38A2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-96H19.1 127516 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.03684480812439 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 47058808 47059020 47058972 Y SLC38A2 NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 283346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47096740 47097106 47096923 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 321278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 280057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.66985891647672 chr12 47476610 47477096 47476829 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 4876 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47482441 47482676 47482559 Y NA AMIGO2 AMIGO2 K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO2 10707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 47661403 47661671 47661594 Y NA NA FAM113B,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 189669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 47670448 47670925 47670783 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 198714 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47671815 47672221 47672059 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 200081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47786916 47787157 47787032 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 310687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 47787801 47788194 47788086 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 309650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM106C 39923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 48815092 48815327 48815161 Y PFKM,C12orf68,ZNF641 NA NA NA NA NA ZNF641 71895 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 49452736 49452852 49452791 Y NA PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L NA NA NA NA RHEBL1 8956 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 49972592 49972801 49972676 Y NA KCNH3,MCRS1,PRPF40B MCRS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRPF40B 12591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 51035200 51035582 51035391 Y NA NA NA NA NA NA ATF1 119911 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 51177941 51178161 51178051 Y POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 22448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA NA NA NA NA NA SLC11A2 92566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 51534048 51534251 51534150 Y POU6F1 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 30675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 52184760 52184919 52184839 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1B 158532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52243040 52243117 52243080 Y SCN8A,ACVRL1,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 100334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52418719 52418897 52418793 Y NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1 C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 42133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 34608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.85335186230056 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr12 52545730 52546132 52545994 Y KRT6A,C12orf44 KRT80 NA NA NA NA KRT80 37652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr12 52575658 52575765 52575707 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 8019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52580785 52580889 52580797 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 2895 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52583620 52584080 52583828 Y NA KRT7 NA NA NA NA KRT80 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52584709 52584955 52584807 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr12 52587798 52588065 52587861 Y ACVRL1,ACVRL1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 4014 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 5203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr12 52592399 52592846 52592466 Y ACVR1B,ACVR1B,GRASP,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 8615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52624687 52625139 52624914 Y KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 52629756 52630207 52629959 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 5452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52835077 52835369 52835228 Y NA KRT75,KRT6A KRT75 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT75 8768 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52888449 52888608 52888529 Y C12orf44,KRT6A,KRT5 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT6A 3408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 52889322 52889458 52889391 Y KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT6A 4281 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 52890343 52890794 52890475 Y C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT6A 5302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 52915277 52915747 52915499 Y C12orf44 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT5 2806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53229080 53229305 53229193 Y NA KRT4 NA NA NA NA KRT4 22745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53253974 53254173 53254090 Y RARG,KRT6A,KRT5 KRT4 KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4 IMR90 Hi-C 24141950 KRT4 47639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT4 58707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 61446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr12 53338460 53338676 53338568 Y KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr12 53368990 53369278 53369065 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B,KRT18 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT8 27252 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53370058 53370275 53370187 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF4B 27667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 53890170 53890360 53890251 Y MFSD5 MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 1487 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 53955466 53955638 53955506 Y NA NA NA NA NA NA ATF7 62561 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 54017367 54017528 54017445 Y NA ATF7 NA NA NA NA ATF7 671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 54413422 54413659 54413446 Y ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 54589708 54589846 54589777 Y CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84 SMUG1 SMUG1,HOXC4,HOXC9 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SMUG1 8930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 6.6057460496581 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 57751585 57751906 57751872 Y R3HDM2 NA INHBC IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 70882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 57986482 57986782 57986634 Y R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25 DCTN2,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1 NA NA NA NA PIP4K2C 3525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 RP11-620J15.1 NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 62525889 62526278 62526197 Y MON2,FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 125841 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 62609319 62609899 62609601 Y C12orf61,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 42220 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA MIRLET7I 56366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 63097406 63097648 63097535 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 101940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 63124974 63125146 63125033 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 129508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 63126917 63127025 63126971 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 131451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 63177678 63177947 63177765 Y C12orf61 NA NA NA NA NA PPM1H 148870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 63256455 63256601 63256528 Y PPM1H NA NA NA NA NA PPM1H 70216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 63304430 63304640 63304492 Y PPM1H PPM1H NA NA NA NA PPM1H 22177 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 64386107 64386411 64386216 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 150034 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr12 64574864 64574988 64574911 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 39088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 64575299 64575468 64575384 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 38608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 65015023 65015259 65015145 Y TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 12730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 65026482 65026674 65026578 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 24189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 65074143 65074354 65074186 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 71850 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 66028423 66029056 66028712 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 33774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 66048868 66049228 66049091 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 54219 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 66050300 66050400 66050342 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 55651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 66050559 66051086 66050841 Y LEMD3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 55910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 26779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 66286698 66286979 66286899 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr12 67274459 67274765 67274734 Y GRIP1 NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 186177 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 67362694 67363196 67363004 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 97746 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 67363946 67364340 67364143 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 96602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 67392180 67392257 67392219 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 68685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 67404997 67405349 67405173 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 55593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 67411263 67411633 67411591 Y NA RP11-123O10.4 NA NA NA NA RP11-123O10.4 49309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 70081797 70082155 70082063 Y NA RAB3IP NA NA NA NA RAB3IP 48306 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 297581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 72125251 72125450 72125351 Y NA TMEM19,RAB21 NA NA NA NA RAB21 21204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 75284095 75284191 75284160 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 354544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76034915 76034997 76034960 Y NA NA PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 131499 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76104986 76105336 76105144 Y NA NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRR1 201570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76373014 76373318 76373236 Y GLIPR1,PHLDA1 NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 52394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 76414095 76414311 76414227 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 11401 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76497491 76497684 76497588 Y NA NAP1L1 OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1 20678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 76942062 76942423 76942413 Y NA OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 9166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 77425555 77425931 77425698 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 31429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr12 78338246 78338645 78338266 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 115561 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 78412779 78412965 78412883 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 190094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 78544842 78545234 78545038 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 322157 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 79804284 79804517 79804401 Y PAWR NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 90659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA RP1-78O14.1 NA NA NA NA RP1-78O14.1 46615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 79918085 79918441 79918422 Y NA RP1-78O14.1 SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-78O14.1 22909 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR RP1-78O14.1 SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 45845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA RP1-78O14.1 SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 48215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 80085577 80085980 80085873 Y NA PAWR NA NA NA NA PAWR 2700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA PTPRQ 374069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 83269676 83269939 83269806 Y TMTC2 NA NA NA NA NA TMTC2 191017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 84902694 84902984 84902888 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P25 1359584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 86051841 86052071 86051956 Y NA NA NA NA NA NA NTS 214002 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 86488031 86488389 86488210 Y NA NA NA NA NA NA NTS 221958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 87822808 87822965 87822871 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 602658 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 88692589 88692733 88692660 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 158516 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 88700433 88700684 88700558 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 166360 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 89038835 89039086 89038961 Y NA NA LOC728084 IMR90 Hi-C 24141950 KITLG 66207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 90125293 90125953 90125608 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 24216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 90150470 90150910 90150738 Y NA ATP2B1 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2B1 49393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 90353904 90354400 90354158 Y ATP2B1 NA ATP2B1,LOC338758,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 252827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 91972476 91973067 91972734 Y NA NA NA NA NA NA BTG1 564606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 92172749 92173207 92172879 Y BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTG1 364466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 92947125 92947543 92947361 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 373564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 94493473 94493774 94493548 Y NA PLXNC1 CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLXNC1 46725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 95508307 95508578 95508443 Y NA NR2C1 NA NA NA NA NR2C1 42828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 95597894 95598075 95597980 Y NA FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 11183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 95609786 95609977 95609896 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA VEZT 264 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 96592675 96593197 96592888 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 6515 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 96819131 96819446 96819342 Y NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 96839212 96840356 96839676 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 19948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 96842223 96842407 96842329 Y NA CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 22959 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 99043983 99044295 99044139 Y NA IKBIP,APAF1 NA NA NA NA APAF1 7064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 100970454 100970954 100970686 Y NA GAS2L3 NA NA NA NA RP11-575G13.2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 101412491 101412895 101412554 Y NA NA NA NA NA NA UTP20 258992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 102253465 102253916 102253642 Y DRAM1 GNPTAB,DRAM1 GNPTAB,DRAM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DRAM1 15213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 102283097 102283236 102283152 Y NA DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 13968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA CHST11 NA NA NA NA CHST11 98 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 104997803 104998291 104998125 Y TXNRD1,TXNRD1,CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 150730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 105076733 105077008 105076882 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 229660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 105812004 105812354 105812179 Y NA NA NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-474B16.1 93209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 106640032 106640193 106640140 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 53514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 107001353 107001364 107001359 Y NA NA NA NA NA NA RIC8B 165009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 108877904 108878160 108878033 Y SSH1,SELPLG,SELPLG FICD NA NA NA NA FICD 28802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 109023569 109024011 109023688 Y SSH1,SELPLG,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 69211 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 109900309 109900503 109900403 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 12704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1 NA NA NA NA TPCN1 4064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 118497859 118498236 118498048 Y NA RFC5 NA NA NA NA WSB2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 118605193 118605499 118605376 Y NA PEBP1,VSIG10 NA NA NA NA VSIG10 33362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 118745418 118745709 118745623 Y NA NA NA NA NA NA TAOK3 63041 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA CCDC64 NA NA NA NA CCDC64 858 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 120700935 120701192 120701121 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1 NA NA NA NA PXN 382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 121976471 121976819 121976719 Y NA KDM2B NA NA NA NA KDM2B 40101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122155083 122155323 122155204 Y NA MORN3,TMEM120B NA NA NA NA TMEM120B 6425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122771781 122771848 122771815 Y NA VPS33A NA NA NA NA VPS33A 22713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 124716985 124717336 124717220 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 261197 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 124721310 124721532 124721425 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 265522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 124823049 124823325 124823212 Y FAM101A NA NA NA NA NA NCOR2 226810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 174399 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 124875953 124876085 124876023 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 174050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 124926088 124926324 124926239 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 125033431 125034089 125033755 Y UBC NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 16046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 125073637 125073873 125073849 Y UBC NCOR2 NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 23502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 60743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 125117895 125118180 125118038 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 67760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr12 125581977 125582373 125582099 Y TMEM132B AACS NA NA NA NA AACS 34052 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 128873272 128873462 128873368 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 433066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 129276448 129276714 129276635 Y GLT1D1 SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 29814 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 130604079 130604318 130604215 Y NA NA NA NA NA NA STX2 717493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132647278 132647407 132647355 Y SFSWAP,ULK1,FBRSL1 DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2 NA NA NA NA NOC4L 20285 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132861217 132861370 132861294 Y P2RX2,GALNT9 GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 42565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132889754 132889878 132889816 Y GALNT9 GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 14057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132903795 132904258 132904060 Y GALNT9 NA NA NA NA NA GALNT9 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 133058289 133058810 133058527 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 FBRSL1 FBRSL1 K562 ChIA-PET 22265404 FBRSL1 5327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 20271500 20271544 20271543 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 65712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 20546038 20546426 20546233 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 15228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA ZMYM2 113459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 20771601 20771692 20771689 Y NA GJB2 NA NA NA NA GJB2 6564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 21571909 21572149 21572029 Y NA NA NA NA NA NA LATS2 61537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 24080861 24081253 24081061 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 61256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 25886402 25886789 25886419 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 12740 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 29290769 29291025 29290846 Y POMP SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 82 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 30407984 30408178 30408116 Y UBL3 UBL3 NA NA NA NA UBL3 14643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 32664585 32664831 32664706 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 222780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 33762622 33762899 33762709 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 159868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 33858244 33858802 33858357 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 63965 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 34069113 34069239 34069161 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 146346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 34781635 34781805 34781767 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 391449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 34914782 34915013 34914898 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 524596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 36501740 36502135 36501882 Y NA NA NA NA NA NA CCDC169 367842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 38192754 38192981 38192894 Y NA POSTN NA NA NA NA POSTN 21773 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 38825601 38825615 38825608 Y NA NA NA NA NA NA UFM1 96371 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 40057425 40057642 40057534 Y NA NA NA NA NA NA LHFP 118023 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 40139698 40140018 40139948 Y NA LHFP NA NA NA NA LHFP 35647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 40450520 40450761 40450584 Y NA NA NA NA NA NA COG6 222756 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 40738384 40738430 40738407 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 500304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 41624170 41624528 41624466 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 WBP4 8882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 41751912 41752021 41751942 Y NA KBTBD6,CALM2P3,KBTBD7 NA NA NA NA CALM2P3 8628 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 41825625 41825697 41825634 Y KBTBD7,NAA16 MTRF1 NA NA NA NA MTRF1 10045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 42683498 42683540 42683519 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 160749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 42705100 42705257 42705170 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 139032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 68254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 44028316 44028697 44028507 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 330347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 45288309 45288506 45288432 Y KCTD4 NA NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 139026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 45389747 45390055 45389901 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330,NUFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NUFIP1 171563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 45629728 45629998 45629866 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 62652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 60170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 45774024 45774110 45774098 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 81374 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 45941510 45941762 45941695 Y COG3,TPT1 TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30 NA NA NA NA TPT1 28005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 46233080 46233407 46233244 Y NA NA NA NA NA NA COG3 196020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 47688288 47688343 47688330 Y NA NA NA NA NA NA ESD 318921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 50696626 50696754 50696746 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 1102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 51464273 51464487 51464380 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 17327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 51508208 51508301 51508255 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 25360 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 52218212 52218391 52218309 Y NA NA NA NA NA NA WDFY2 61568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 52922324 52922434 52922379 Y THSD1 NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 THSD1 56195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr13 52923212 52923413 52923314 Y NA NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 THSD1 55216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr13 59685905 59686157 59686031 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1049964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 81840178 81840277 81840228 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 927092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 84433897 84434216 84434044 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 3520811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 87776313 87776722 87776395 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4221352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 91369763 91370108 91369936 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 627966 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 93096966 93097333 93097096 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 386869 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 93361116 93361155 93361136 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 515940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 93899040 93899272 93899121 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 21945 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 95926561 95926799 95926680 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 24888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 99135278 99135706 99135580 Y NA NA NA NA NA NA STK24 92488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA DOCK9 173924 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 99644715 99645037 99644840 Y DOCK9 NA NA NA NA NA DOCK9 91842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 100115582 100115885 100115820 Y NA TM9SF2 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 35786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 109115794 109116062 109115942 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF13B 214206 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 666456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr13 109808669 109809037 109808800 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 596578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 509716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 495801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr13 110780432 110780795 110780703 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 175364 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 110965035 110965206 110965124 Y COL4A1,COL4A2 COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 7539 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 110972696 110972889 110972807 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 15200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 111013776 111014136 111013979 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 56280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 111096220 111096502 111096363 Y NA NA NA NA NA NA RAB20 115578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr13 111843624 111843915 111843820 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 78718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 114548051 114548420 114548108 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 16626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.66985891647672 chr13 114611317 114611637 114611421 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 46271 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 6.97273194130577 chr13 114740287 114740680 114740494 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 155406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 114770181 114770639 114770503 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 125447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr14 23584186 23584501 23584299 Y C14orf119 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 21363 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 24014427 24014724 24014635 Y DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4 THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 8492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 24712544 24712898 24712739 Y DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2 TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA NA NA NA NA TINF2 2664 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 25397817 25398161 25397990 Y NA NA NA NA NA NA STXBP6 119342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 25464405 25464804 25464526 Y CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6 NA NA NA NA NA STXBP6 52699 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 25476676 25476861 25476696 Y NA STXBP6 NA NA NA NA STXBP6 40642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 27311220 27311475 27311345 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 246260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 28061472 28061526 28061498 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 895590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 31101250 31101606 31101429 Y NA SCFD1 NA NA NA NA SCFD1 11932 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 281070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 32420109 32420203 32420156 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 123117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 34504920 34505230 34505078 Y NA NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 424332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr14 34987475 34987508 34987491 Y EAPP EAPP NA NA NA NA EAPP 19408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 35120187 35120582 35120411 Y SNX6,SNX6 SNX6 SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 SNX6 22798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 36641300 36641610 36641453 Y NA NA SFTA3 IMR90 Hi-C 24141950 MBIP 146272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 37465189 37465490 37465428 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA MIPOL1 199628 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 41662407 41662459 41662451 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1762703 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 42297588 42297942 42297766 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2397884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 45505148 45505421 45505276 Y NA KLHL28,PRPF39 NA NA NA NA KLHL28 4104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 47696508 47696702 47696627 Y NA RPL13AP2 NA NA NA NA RPL13AP2 28201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 48030000 48030393 48030347 Y MDGA2,MDGA2 NA NA NA NA NA RPL13AP2 361693 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 48101040 48101412 48101227 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 432733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 48109739 48110114 48110083 Y MDGA2 NA NA NA NA NA RPL13AP2 441432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 49979013 49979291 49979168 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RPS29 84117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr14 50349630 50349838 50349718 Y RPL36AL,MGAT2,C14orf182,SOS2,ARF6 NEMF,ARF6 C14orf182,ARF6,SOS2,METTL21D IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF6 7972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 51144322 51144826 51144405 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,NIN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 11273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 RP11-255G12.3 LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-255G12.3 3789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr14 51915852 51916182 51915957 Y NA FRMD6 FRMD6,LOC283553,GNG2,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 37636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 51999901 52000168 52000035 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 46083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 192082 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 209862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 54465835 54466164 54465918 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 42356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 54573774 54574066 54573953 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 150295 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 55538737 55539349 55538846 Y FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 22388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 56184098 56184447 56184174 Y NA NA PELI2,RPL13AP3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00520 76959 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 58449709 58450271 58450031 Y NA NA C14orf37 IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P3 155726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 58544876 58545175 58545024 Y C14orf37 NA NA NA NA NA UBA52P3 60822 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.77081659141974 chr14 59744882 59745126 59745004 Y NA NA NA NA NA NA DAAM1 91518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 59800555 59800809 59800631 Y GPR135 NA NA NA NA NA DAAM1 147191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA TRMT5 124189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 61865216 61865457 61865337 Y PRKCH NA NA NA NA NA HIF1A 294774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 62219407 62219640 62219496 Y HIF1A,SNAPC1 RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1 NA NA NA NA HIF1A-AS2 3592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 65147051 65147198 65147125 Y NA PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 21622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 65193422 65193546 65193484 Y ZBTB1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 24602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 65273271 65273625 65273457 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 104451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 68571232 68571846 68571404 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 286736 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.48636597065289 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 68614207 68614598 68614344 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 272315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 187169 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 68712620 68712855 68712738 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 174058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 68870731 68871233 68871108 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 15680 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr14 68884830 68884917 68884875 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 1996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr14 69010932 69011443 69011159 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 124019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 69162018 69162337 69162187 Y NA CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 11736 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 69162598 69162770 69162709 Y NA CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 12316 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69181651 69182330 69182100 Y ZFP36L1 CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2325P2.3 31369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69247587 69247770 69247677 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 13420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69251306 69251504 69251405 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 9686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69252204 69252483 69252314 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 8707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 69361596 69361764 69361692 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 82393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69516483 69516670 69516577 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 72326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69544472 69544808 69544638 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 73059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 70099072 70099485 70099117 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 22759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 71022218 71022570 71022394 Y ADAM20 MED6 NA NA NA NA MED6 42814 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 71253294 71253580 71253437 Y NA MAP3K9,RP6-65G23.3 NA NA NA NA MAP3K9 20671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 71425019 71425182 71425094 Y NA NA NA NA NA NA PCNX 52897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 73133487 73133748 73133630 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 225061 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 73824884 73825148 73825019 Y ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB NA NA NA NA NA NUMB 103200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 73826978 73827275 73827127 Y ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43 NA NA NA NA NA NUMB 101073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 74220065 74220506 74220203 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 40937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 74918684 74918707 74918696 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 VRTN IMR90 Hi-C 24141950 MIR4709 26200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 74949377 74949710 74949544 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA MIR4709 4470 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 47569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 42330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 75087327 75087770 75087539 Y PGF,EIF2B2,LTBP2 CTD-2207P18.2 YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2207P18.2 5977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 75125565 75125963 75125764 Y NA CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 44215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 75920164 75920191 75920178 Y JDP2 JDP2 NA NA NA NA JDP2 27745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 76026175 76026384 76026299 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 16576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 76401422 76401643 76401519 Y ESRRB,TGFB3 IFT43 NA NA NA NA IFT43 34943 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 77508586 77508871 77508699 Y IRF2BPL IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 15552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 78031689 78031913 78031801 Y SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 49203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 79941274 79941440 79941360 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 910660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 80051183 80051363 80051265 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 800737 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 80052385 80052697 80052460 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 799403 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 80284396 80284755 80284543 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 567345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 81588946 81589112 81589029 Y GTF2A1,GTF2A1 RP11-114N19.3 NA NA NA NA RP11-114N19.3 45646 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 81674995 81675128 81675066 Y GTF2A1,GTF2A1 RP11-114N19.3,SNORA79,GTF2A1,DYNLL1P1 NA NA NA NA SNORA79 7817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr14 85881762 85881957 85881956 Y FLRT2 NA NA NA NA NA FLRT2 112531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 86053629 86053936 86053651 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 59141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 89935615 89935871 89935745 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 147622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 90761350 90761506 90761428 Y NA PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 40511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 91090658 91091172 91090732 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 189651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 158627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 91814664 91814951 91814783 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 67237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr14 93511721 93512085 93511905 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 68580 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 93540322 93540650 93540529 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 40015 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 93552204 93552427 93552400 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 28238 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 93569992 93570233 93570210 Y KIAA1409,C14orf109,C14orf109 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 10432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 45744 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 94840163 94840451 94840311 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 14579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 95779970 95780439 95780333 Y DICER1,CLMN CLMN NA NA NA NA CLMN 3804 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 97685606 97685621 97685614 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 423965 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 100068632 100068970 100068687 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 100486645 100486967 100486738 Y NA NA EVL,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 215668 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 100497913 100498157 100498035 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 204478 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 100883887 100884104 100884057 Y BEGAIN WDR25,WARS NA NA NA NA WARS 42745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA NA NA NA NA NA WARS 188653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 101049817 101049857 101049837 Y DLK1,BEGAIN NA WDR25,MEG3,BEGAIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEG3 193890 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 101539526 101539734 101539702 Y NA NA NA NA NA NA SNORD114-21 93214 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 102089844 102089938 102089891 Y NA NA MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B IMR90 Hi-C 24141950 DIO3 64156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 102971480 102971658 102971568 Y NA ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 2478 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 102993844 102994139 102994010 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANKRD9 19708 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 103051810 103052039 103051996 Y NA RCOR1 TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 4959 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 103490121 103490395 103490347 Y NA CDC42BPB NA NA NA NA CDC42BPB 31404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 29772 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 103575159 103575514 103575439 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 12265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 103672017 103672095 103672056 Y NA NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 84238 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 103672309 103672597 103672449 Y EXOC3L4 NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 84530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr14 103675395 103675682 103675539 Y NA NA LOC100131366,EXOC3L4,EIF5,CDC42BPB,MARK3,RCOR1,TNFAIP2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 87616 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 103710310 103710630 103710449 Y NA NA LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 87251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 104228992 104229118 104229080 Y NA XRCC3,ZFYVE21 NA NA NA NA ZFYVE21 48925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105148231 105148612 105148591 Y INF2 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 2748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105290315 105290696 105290451 Y GPR132 AKT1,RPS26P49 NA NA NA NA RPS26P49 4812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA RPS26P49 NA NA NA NA RPS26P49 31538 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105330138 105330246 105330192 Y NA RPS26P49 NA NA NA NA RPS26P49 34630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105434041 105434308 105434245 Y NA AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8386 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105435117 105435479 105435281 Y KIAA0284 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 7215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 105533738 105533893 105533826 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 48253 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105549558 105549976 105549724 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 64073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105554572 105554923 105554752 Y NA NA BTBD6,BRF1,AHNAK2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 69087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 31751373 31751610 31751484 Y NA NA OTUD7A MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF13 134315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA SCG5 216296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 34277588 34277641 34277608 Y C15orf55 NA NA NA NA NA AVEN 51736 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 34531616 34532056 34531745 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A6 96205 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 208049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 35983013 35983197 35983137 Y NA NA NA NA NA NA RP11-323I15.2 600331 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 36502579 36502898 36502738 Y NA NA NA NA NA NA C15orf41 366914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 37278170 37278456 37278428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 111084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 38421726 38421911 38421855 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 120616 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 421205 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 31189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 40395466 40395787 40395613 Y NA NA NA NA NA NA BUB1B 55437 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 42232566 42232958 42232887 Y EHD4 EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 29818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 27742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 45914427 45914634 45914531 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 6712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 45929603 45930187 45929917 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 8257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 45932818 45933115 45932936 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 11472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 45933530 45934014 45933606 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 12184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 45938532 45938945 45938638 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 17186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 46416141 46416404 46416273 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 494795 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 51909690 51910017 51909879 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 3013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 52120789 52121195 52120954 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 52369278 52369628 52369325 Y MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 GNB5,BCL2L10,MYO5C IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2184D3.1 15864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 52385766 52385957 52385877 Y DMXL2,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 52395777 52396019 52395882 Y DMXL2,TMOD3,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.5 5057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 52545063 52545254 52545150 Y MAPK6 MYO5C NA NA NA NA MYO5C 40741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 55514866 55515077 55514981 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 27601 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 94234 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 56201661 56201754 56201731 Y NEDD4 NA NA NA NA NA NEDD4 82190 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 56419675 56420043 56419859 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 113440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 56717939 56718122 56718071 Y RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9 MNS1 NA NA NA NA MNS1 37213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 57844002 57844282 57844063 Y NA POLR2M NA NA NA NA POLR2M 37949 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 58307957 58308317 58308137 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 425726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 58761932 58762090 58762054 Y NA ALDH1A2 ADAM10 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 25975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 59194300 59194605 59194559 Y NA RNF111,SLTM NA NA NA NA SLTM 29247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA FAM81A 75499 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 59592534 59592835 59592690 Y BNIP2,RNF111,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 70057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 60699729 60699909 60699819 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5067 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 63486176 63486338 63486267 Y LACTB,USP3,RAB8B RPS27L,RAB8B APH1B IMR90 Hi-C 24141950 RAB8B 6508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 65027953 65028147 65028050 Y NA OAZ2,RBPMS2 NA NA NA NA OAZ2 34473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 65135268 65135743 65135404 Y TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2 PIF1,AC069368.3,PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 3180 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 66701075 66701322 66701144 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 SNAPC5,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,ZWILCH,SNORD16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 23920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 67175645 67176118 67175872 Y NA NA IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 177983 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67341124 67341334 67341261 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD3 12767 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.40383069977207 chr15 67373443 67373710 67373534 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 19342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67394592 67394967 67394687 Y NA SMAD3,RP11-342M21.2 NA NA NA NA SMAD3 40491 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3,RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 37502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3,RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 34637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 23518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 67440032 67440420 67440131 Y NA RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 2755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 3398 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 5070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RP11-342M21.2 51221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68174845 68175044 68174931 Y PIAS1,CALML4 NA PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686,IQCH,SKOR1 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 169473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68366463 68366575 68366519 Y NA PIAS1 NA NA NA NA PIAS1 21946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68878617 68878894 68878756 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 9309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 68894151 68894553 68894360 Y CORO2B,CORO2B,CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 24843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 69114506 69114876 69114758 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA ANP32A 3270 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 69866659 69866776 69866722 Y NA NA NA NA NA NA RPLP1 123536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 70051353 70051726 70051572 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 308230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 70433556 70433653 70433637 Y TLE3 TLE3 LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 45041 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 70767457 70767783 70767604 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 286149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 70785060 70785587 70785260 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 268345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71084406 71084742 71084644 Y UACA,LARP6 UACA UACA,LARP6,LRRC49 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 30474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71155799 71156069 71155993 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 11301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA THAP10 6013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71335765 71335967 71335867 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 152641 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71336506 71336742 71336642 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 153382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 71344757 71344812 71344802 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 161633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.40383069977207 chr15 71372469 71372708 71372707 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 189345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71373131 71373408 71373250 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 190007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.30287302482905 chr15 71406673 71406868 71406715 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 223549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71408872 71409066 71408998 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 225748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr15 71428826 71429023 71428945 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 245702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 71571969 71572363 71572175 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 432685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 71872548 71872837 71872596 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 531762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 72003894 72004173 72003980 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 400426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 72041767 72041974 72041871 Y SENP8 NA NA NA NA NA SENP8 362625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 72124774 72125030 72124885 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 279569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 GRAMD2 NA NA NA NA GRAMD2 30488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 73032689 73032951 73032815 Y PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 43236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 74216715 74216840 74216797 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 385 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 74217117 74217259 74217188 Y LOXL1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 74222908 74223263 74222994 Y LOXL1,STOML1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 6578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 74223574 74223817 74223712 Y LOXL1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 7244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 6.42225310383426 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 74677413 74677899 74677622 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A SEMA7A K562 ChIA-PET 22265404 SEMA7A 46909 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 74693719 74694069 74694004 Y NA SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 30739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 74699762 74699966 74699869 Y LOXL1,STOML1 SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 24842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 74721161 74721821 74721539 Y SEMA7A,SEMA7A SEMA7A,UBL7 NA NA NA NA SEMA7A 2987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3 NA NA NA NA EDC3 32032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 75460054 75460405 75460311 Y NA C15orf39 SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 25579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 77332766 77333147 77332913 Y PSTPIP1 PSTPIP1,TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 41179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 77739736 77739821 77739778 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 28982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78326319 78326481 78326425 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B NA NA NA NA TBC1D2B 41585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78342105 78342280 78342151 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 25786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78357095 78357144 78357119 Y NA TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 10922 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78361071 78361580 78361229 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 6486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78364826 78365348 78365071 Y DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 2718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 78368268 78368362 78368315 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 79152508 79152900 79152703 Y IREB2 RPL21P116 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL21P116 1171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 80254561 80254851 80254751 Y MTHFS,MTHFS,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 6937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 80771335 80771476 80771406 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 76643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 80772387 80772765 80772517 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 77695 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr15 80773280 80773702 80773515 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 78588 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr15 80786706 80787081 80786777 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 92014 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 80841630 80841706 80841692 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 146938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA ARNT2 186521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 81082693 81083043 81082764 Y KIAA1199 KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 13009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 81277983 81278007 81277997 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 81321783 81322073 81321879 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 C15orf26,IL16 IMR90 Hi-C 24141950 MESDC1 30488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 82302959 82303245 82303102 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 33237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 83239509 83239741 83239625 Y AP3B2,CPEB1 RPS17L NA NA NA NA RPS17L 32194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 83847712 83847957 83847821 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 26813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 3484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr15 83956370 83956763 83956596 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 4904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 83957181 83957322 83957252 Y NA BNC1 NA NA NA NA BNC1 5715 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 84040858 84041607 84041233 Y NA NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 72373 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 84048302 84048583 84048506 Y BNC1 NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 65397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 84687922 84688115 84688025 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN2 454102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 85131508 85131753 85131631 Y PDE8A ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 10464 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 85874454 85874742 85874552 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 85887676 85888027 85887852 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 33775 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 86111518 86111581 86111550 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 189716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 86267591 86267810 86267701 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 88877677 88878020 88877849 Y NA NA NA NA NA NA NTRK3 79678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90012673 90012880 90012781 Y NA NA NA NA NA NA POLG 136581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90379956 90380186 90379992 Y NA NA NA NA NA NA AP3S2 55388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 90419728 90419914 90419806 Y ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 15660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1,TTLL13 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 90950706 90950784 90950761 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 90958026 90958305 90958134 Y ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 28576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA MAN2A2 NA NA NA NA MAN2A2 25604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10 NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 92491615 92492039 92491744 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 96690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 5626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA MIR3175 74413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 96739448 96739540 96739494 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 127627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 96871345 96871608 96871517 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA NR2F2-AS1 2755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 25697 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 26018 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 98698078 98698430 98698265 Y IGF1R NA NA NA NA NA ARRDC4 237294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 99090927 99091248 99091140 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98952 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr15 99295015 99295222 99295065 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 104815 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 186205 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 99561438 99561561 99561500 Y NA NA PGPEP1L,IGF1R MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SYNM 74859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 100914283 100914527 100914405 Y ADAMTS17 ADAMTS17 NA NA NA NA ADAMTS17 34073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 101102236 101102405 101102321 Y NA ASB7,LINS NA NA NA NA ASB7 38334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 101233795 101233911 101233855 Y ASB7,ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 LINS 92360 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr15 101234924 101235169 101235060 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 93489 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr15 101253659 101254026 101253922 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 112224 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 101261253 101261648 101261594 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 119818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr15 101265417 101265591 101265495 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 123982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr15 101546574 101546638 101546606 Y NA NA NA NA NA NA LRRK1 89154 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 101677939 101678117 101678028 Y CHSY1 NA CHSY1,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 112020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 1166792 1167154 1166886 Y NA CACNA1H CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1H 34087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 1232339 1232689 1232437 Y NA CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 31098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 2209355 2209786 2209516 Y NPW SNORD60,TRAF7,MLST8 NA NA NA NA TRAF7 5656 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 2212881 2213081 2213004 Y NA SNORD60,TRAF7,MLST8,PGP NA NA NA NA TRAF7 9182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,RNU1-125P,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 4264073 4264474 4264297 Y SRL NA NA NA NA NA TFAP4 56602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 4424244 4424335 4424249 Y CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 4395 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPL 15012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 5666199 5666502 5666317 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 520390 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 6132184 6132568 6132193 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 986375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 6281507 6281857 6281681 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1135698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 6420461 6420698 6420580 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1274652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 6705372 6705494 6705481 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1559563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 6822644 6823191 6822880 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1676835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 7170846 7171392 7171105 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA METTL22 1542148 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr16 9171086 9171431 9171335 Y C16orf72,USP7 C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12074 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 10746944 10747196 10747087 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 74389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 10759043 10759292 10759209 Y NA NA NA NA NA NA NUBP1 76351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 77653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 11299930 11300255 11300088 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1 RMI2,SOCS1 CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 41221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 14396583 14397514 14397260 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 233405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 14397958 14398068 14398015 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 234780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 14423320 14423633 14423477 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 14424623 14424858 14424825 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 261445 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 16055043 16055430 16055122 Y NDE1,NDE1,ABCC1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 13609 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 16092294 16092782 16092512 Y NDE1 NA NA NA NA NA ABCC1 50860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 16214258 16214439 16214353 Y ABCC1 NA ABCC6 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC1 172824 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 16242630 16242651 16242642 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 201196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 19221625 19221975 19221736 Y SMG1,COQ7 SYT17 NA NA NA NA SYT17 44332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr16 19822629 19822921 19822772 Y NA NA GPRC5B IMR90 Hi-C 24141950 GPRC5B 72568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 20863043 20863195 20863109 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 45995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr16 20915885 20916169 20915941 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 6179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 20917792 20918142 20917892 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 DNAH3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D3 8086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 21620302 21620588 21620483 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 13763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 22203475 22203890 22203761 Y POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 11713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 22432961 22433094 22433028 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 13392 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 23518606 23518950 23518778 Y GGA2 GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 12366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 24855986 24856230 24856033 Y NA NA NA NA NA NA TNRC6A 116970 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 24863023 24863279 24863154 Y NA NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 124007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 28153289 28153624 28153397 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 67617 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 28176884 28177249 28177153 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 43992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 28179891 28180117 28180009 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 41124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 29137517 29137756 29137607 Y SPNS1 NA NA NA NA NA SPNS1 153975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 29283104 29283213 29283156 Y SPNS1 NA NA NA NA NA SPNS1 299562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 31005740 31006063 31006002 Y ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4 ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 11221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 31888684 31889219 31888998 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 46839113 46839505 46839309 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 23818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 47454284 47454574 47454519 Y NA PHKB,ITFG1 NA NA NA NA PHKB 38460 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 49734501 49734890 49734846 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 362962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 52052 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1E,MT1A,MT1B,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 57350531 57350815 57350676 Y NA PLLP CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17 IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 33932 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 57680678 57681373 57680764 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 38114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 63294066 63294457 63294335 Y NA NA NA NA NA NA CDH8 1225127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 65036446 65036851 65036669 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 121164 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 65105283 65105525 65105355 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 52490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 65154285 65154635 65154564 Y NA CDH11 NA NA NA NA CDH11 3380 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 66416297 66416567 66416426 Y CDH5 LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 23860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 66416918 66416958 66416940 Y NA LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 23469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 66559760 66560016 66559944 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 24431 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 66962213 66962449 66962329 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA FAM96B 3877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 67150652 67150777 67150712 Y LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70 C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4 NA NA NA NA C16orf70 8791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 68433458 68433594 68433558 Y NA SMPD3 NA NA NA NA SMPD3 46997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 68503731 68504029 68503905 Y NA SMPD3 PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMPD3 23140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 69556739 69556897 69556827 Y HAS3,TERF2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 40100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 70727989 70728270 70728171 Y NA MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 10020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 70769740 70769941 70769843 Y NA NA MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 51771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 73076128 73076469 73076445 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 15128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 73102955 73103191 73103082 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 11358 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 77868575 77868689 77868637 Y NA VAT1L NA NA NA NA VAT1L 48148 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 80401381 80401567 80401473 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 CDYL2 434659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 80965900 80966145 80965922 Y NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 CENPN 71958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 485308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 485636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 84624738 84624752 84624744 Y HSDL1,COTL1 COTL1 NA NA NA NA COTL1 24931 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 84704578 84704887 84704734 Y NA KLHL36,USP10 NA NA NA NA KLHL36 24447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 85037797 85037883 85037799 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 5258 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.13780248306741 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 85339922 85340091 85340012 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 280547 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 85733301 85733460 85733373 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 11622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 85783425 85783755 85783547 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 86417419 86417805 86417701 Y NA NA LOC400550,LOC732275,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 124328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 86421149 86421325 86421222 Y FOXF1,FOXC2 NA LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 120808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 364029 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 366001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 386553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr16 87609810 87610118 87609964 Y NA NA MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 FBXO31 186062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88366840 88367234 88367013 Y BANP,BANP,ZC3H18,CYBA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 150491 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 88686245 88686708 88686493 Y ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18 CYBA,MVD NA NA NA NA CYBA 28852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88700249 88701257 88700631 Y ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA CYBA,MVD,SNAI3 NA NA NA NA CYBA 14303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88701263 88701663 88701374 Y SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA CYBA,MVD,SNAI3 NA NA NA NA CYBA 13897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88848168 88848452 88848343 Y CYBA,RNF166,RNF166 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 1167 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88919657 88920044 88919827 Y SNAI3,RNF166,RNF166,CBFA2T3 APRT,TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA TRAPPC2L 584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA CBFA2T3 TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 CBFA2T3 49455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89380978 89381130 89380989 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778 NA NA NA NA NA ZNF778 98860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89382399 89382987 89382651 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ZNF778 100281 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr16 89568763 89569125 89568979 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPG7 13438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 594616 594984 594846 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27973 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 595370 595681 595607 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27276 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 773525 773702 773655 Y RNMTL1 NA NA NA NA NA GLOD4 89944 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr17 1492205 1492514 1492391 Y NA PITPNA,SLC43A2 NA NA NA NA PITPNA 28095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 1533068 1533815 1533453 Y CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,SCARF1,RILP NA NA NA NA SLC43A2 2888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr17 2075592 2075724 2075696 Y HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 120144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 2082960 2083277 2083133 Y NA NA NA NA NA NA SRR 121400 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 2143435 2143643 2143533 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 61034 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 301456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 457619 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 6814987 6815378 6815170 Y DLG4 NA NA NA NA NA ALOX12P2 59807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 7657457 7657665 7657600 Y NLGN2,AMAC1L3,WRAP53 NA NA NA NA NA EFNB3 50937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr17 7784207 7784538 7784352 Y POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2 CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA CHD3 1586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 9131847 9132010 9131919 Y WDR16,NTN1 NA NA NA NA NA NTN1 208988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 13249594 13249869 13249742 Y HS3ST3A1 NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 253375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 13288916 13289223 13288974 Y NA NA HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 214021 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 13444400 13444811 13444590 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 58433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 13447669 13448094 13447771 Y HS3ST3A1 NA NA NA NA NA HS3ST3A1 55150 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr17 13472221 13472595 13472561 Y NA HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 30649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 13575065 13575361 13575332 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 71821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 15877316 15877536 15877426 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 23158 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 18200436 18200727 18200570 Y SMCR8,TOP3A FLII,TOP3A,SMCR8 NA NA NA NA TOP3A 15594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3A 52233 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 106941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 21272298 21272502 21272399 Y KCNJ18 KCNJ12 C17orf51,KCNJ12 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ12 5007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 22069559 22069863 22069667 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 593837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 26368091 26368384 26368254 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 1328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 26712546 26712820 26712749 Y NA POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA VTN 14436 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 26734916 26735044 26734980 Y NA SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 2701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27439260 27439514 27439393 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 65916 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27482450 27482602 27482543 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 22828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 27703475 27703981 27703860 Y TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1 TAOK1,MIR4523 MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAOK1 11501 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27814311 27814661 27814484 Y NA NA NA NA NA NA TP53I13 76409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27918652 27918967 27918817 Y GIT1,EFCAB5,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1,CORO6 NA NA NA NA CORO6 18187 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 28031718 28032050 28032008 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 83793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 28037853 28038223 28038205 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 89928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 29816760 29817002 29816913 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 100118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 29887922 29888057 29887990 Y NA NA MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP4 171280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 175492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 29909272 29909544 29909457 Y EVI2B,EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 192630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 30115229 30115607 30115424 Y NA NA RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 UTP6 111177 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 31062983 31063086 31063034 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 139109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 31598855 31599016 31598936 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 345927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 32579001 32579427 32579231 Y NA CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 32581116 32581488 32581294 Y NA CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 12852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 34871446 34871455 34871448 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 17392 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 34948982 34949076 34949029 Y DHRS11 DHRS11,MRM1 NA NA NA NA DHRS11 2754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 35208602 35208822 35208707 Y NA NA NA NA NA NA AATF 95353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 AATF 26018 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 36032703 36032990 36032855 Y NA DDX52 NA NA NA NA DDX52 31210 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 36585417 36585600 36585486 Y ARHGAP23 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 2755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 38226807 38227182 38226872 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 38463315 38463694 38463488 Y RARA CDC6 NA NA NA NA RARA 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 38666550 38666883 38666717 Y TNS4 TNS4 CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P IMR90 Hi-C 24141950 TNS4 10701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 19029 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 38677736 38678132 38678052 Y KRT24,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 21887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 39218168 39218609 39218458 Y NA NA NA NA NA NA TMEM99 244810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39536188 39536609 39536415 Y NA KRT34 NA NA NA NA KRT34 46 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 29209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 39703664 39703881 39703736 Y NA KRT19,KRT14 NA NA NA NA KRT19 21104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr17 39705098 39705383 39705310 Y NA KRT19,KRT14 NA NA NA NA KRT19 22538 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39807728 39808143 39807934 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT17 28634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1,GAST KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA KRT17,EIF1,GAST KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 40163251 40163440 40163343 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 1851 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 14871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 40816292 40816343 40816318 Y NA TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 6969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 41669625 41669874 41669775 Y NA ETV4 LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 14637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.30287302482905 chr17 42619909 42620020 42619938 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 12905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 42620579 42620851 42620665 Y GJC1,FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 12074 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 42624253 42624886 42624582 Y TMUB2,TMUB2,GRN GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD2 8039 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43230123 43230516 43230320 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 5551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43389475 43389771 43389724 Y FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14 MAP3K14 TEX34,LOC100133991 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 2643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA MAP3K14 268397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 44847625 44847956 44847902 Y WNT3 NA NA NA NA NA RPS7P11 50092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.77081659141974 chr17 45144155 45144236 45144196 Y NA NA NPEPPS IMR90 Hi-C 24141950 CDC27 120552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46226881 46226967 46226912 Y TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1 CBX1,SNX11 SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 SNX11 48162 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46318516 46318700 46318601 Y SKAP1,HOXB4 NA NA NA NA NA SNX11 139797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 46334759 46335012 46334885 Y OSBPL7,SKAP1 NA NA NA NA NA SNX11 156040 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-42P 24911 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 47929255 47929264 47929260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613C6.4 58550 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 47960332 47960723 47960647 Y NA NA DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,TAC4,FLJ45513,DLX4,PDK2,ITGA3,LOC284080 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DLX4 83611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 48467638 48467952 48467795 Y NA XYLT2,MRPL27,EME1,LRRC59,ACSF2 NA NA NA NA LRRC59 4962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 48908408 48908498 48908454 Y NA TOB1 TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483 IMR90 Hi-C 24141950 TOB1 34841 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 48996377 48996488 48996474 Y RSAD1 NA LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 53038 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 55947370 55947506 55947438 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 21953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 56417498 56417914 56417645 Y MTMR4,HSF5 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 10540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 57231102 57231481 57231293 Y C17orf71 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 57509065 57509242 57509141 Y NA NA YPEL2,GDPD1,PRR11 IMR90 Hi-C 24141950 DHX40 131644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 58169287 58169683 58169398 Y RNFT1 HEATR6 HEATR6,LOC645638 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR6 14995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 58470515 58470600 58470558 Y RNFT1 USP32 NA NA NA NA USP32 27231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 59780215 59780354 59780263 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 113652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 59843979 59844190 59844083 Y NA NA NA NA NA NA BRIP1 94692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 60707106 60707291 60707232 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 4344 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 61282907 61283291 61283099 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 238448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 61629052 61629111 61629082 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 3230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 62583721 62583959 62583840 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 72227 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 62705157 62705447 62705234 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 48971 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 63035715 63036037 63035950 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 14920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr17 63752923 63753189 63753062 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 433013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64432039 64432445 64432242 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 135285 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 64544411 64544774 64544437 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 247657 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64796276 64796554 64796503 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 162472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 64961597 64961937 64961768 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 2571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 68943933 68944102 68944047 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 671017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 71087635 71087942 71087798 Y SLC39A11 SLC39A11 NA NA NA NA SLC39A11 784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 71286924 71287020 71286972 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 19294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 71336325 71336719 71336454 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42EP4 30011 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 72565404 72566131 72565833 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA GPRC5C 146414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 72595328 72595714 72595383 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,SLC16A5,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA SLC9A3R1 147077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 19943 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73426423 73426691 73426652 Y MRPS7 GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 8549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 73684314 73684419 73684412 Y NA SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 23045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73689850 73690283 73690148 Y KIAA0195,CASKIN2,WBP2 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 25125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 74496600 74496786 74496748 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 74692944 74693312 74693210 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 11786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75118026 75118235 75118074 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 37228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 204138 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75312591 75312808 75312697 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 231793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75321712 75322201 75321955 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 240914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 321249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 336396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 340504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 341561 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.48636597065289 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76347582 76348110 76347694 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 6048 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76349549 76349649 76349633 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4509 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76379911 76380778 76380428 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 7190 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76382008 76383398 76383057 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 9287 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76384421 76384943 76384751 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 11700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76813236 76813533 76813481 Y CYTH1,ENGASE,USP36 CYTH1,USP36 NA NA NA NA USP36 21990 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 77481345 77481685 77481515 Y NA NA NA NA NA NA CBX2 268246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 77814369 77814482 77814427 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 3141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 77817686 77818105 77817998 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 6458 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 78134790 78135293 78135090 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 78198081 78198434 78198366 Y NA SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA SGSH 5359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 38702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 80712796 80713169 80712899 Y ZNF750,TBCD FN3KRP,FN3K,TBCD NA NA NA NA TBCD 4856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 394915 395311 395219 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 128865 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 395466 395650 395558 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 129416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 2031840 2031857 2031849 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 537651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr18 2797990 2798254 2798233 Y NA EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 46774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 3794813 3795294 3795021 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 385207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA EPB41L3 333860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 7048074 7048376 7048212 Y NA NA NA NA NA NA LAMA1 67437 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 8412266 8412506 8412385 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 194937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 8689782 8689966 8689874 Y NA NA NDUFV2,RAB12,CCDC165,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 82339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 8730480 8730718 8730581 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 123037 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 9643596 9643835 9643765 Y NA PPP4R1 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 30358 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 9758210 9758472 9758414 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 52048 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 10475783 10476043 10475911 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 47859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 12092408 12092760 12092594 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 113384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr18 12641281 12641332 12641311 Y SPIRE1,SPIRE1,PSMG2 SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA SPIRE1 14801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 12808880 12809062 12808971 Y NA NA NA NA NA NA CEP76 108104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12837862 12838421 12838235 Y PTPN2 NA NA NA NA NA PTPN2 89221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 13137958 13138425 13138153 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 148597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 13408431 13408818 13408626 Y C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 315841 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 19746222 19746392 19746310 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 1012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr18 19759263 19759580 19759296 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 11859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 19926493 19926623 19926531 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 179089 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 20131932 20132167 20132050 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 244057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 20272481 20272650 20272518 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 103574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr18 20291430 20291660 20291501 Y NA NA GATA6,CABLES1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 84564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 20406610 20407011 20406855 Y NA RBBP8 RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 30386 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 21173695 21174031 21173886 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 8833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 21364980 21365182 21365090 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD29 124131 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 21415229 21415459 21415332 Y C18orf8,NPC1 NA NA NA NA NA TTC39C 155278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 25502058 25502147 25502103 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 253263 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 25623626 25623889 25623758 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 131521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 25645418 25645770 25645581 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 109640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 25645893 25646031 25645963 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 109379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 25691984 25692409 25692174 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 63001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr18 26745136 26745536 26745463 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 989726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 30862088 30862282 30862185 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 1192270 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 33038926 33039146 33039052 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 36809 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 35138994 35139043 35139019 Y CELF4 NA NA NA NA NA TPGS2 731836 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 38446239 38446490 38446414 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1086681 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 38655284 38655543 38655423 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 877628 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 42419261 42419416 42419316 Y NA NA NA NA NA NA SETBP1 161123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 42857952 42858246 42858076 Y NA NA NA NA NA NA SETBP1 599814 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 43542357 43542726 43542619 Y PSTPIP2,C18orf25,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 2514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 43543003 43543287 43543010 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 1953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr18 46345038 46345364 46345209 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 129717 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 51860775 51860976 51860876 Y NA NA NA NA NA NA POLI 67001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 54171191 54171431 54171311 Y NA NA TCF4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR7 145143 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55474402 55474444 55474420 Y NA ATP8B1 ATP8B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP8B1 6069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55480522 55480777 55480650 Y NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP8B1 12189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55513608 55513807 55513708 Y NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B1 45275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 55892299 55892691 55892549 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 182700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 55957381 55957780 55957581 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 247782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr18 56194097 56194141 56194127 Y NEDD4L,MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 71722 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 56248728 56248836 56248808 Y NA SNORD28,ALPK2 NA NA NA NA SNORD28 17027 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 56337372 56337558 56337406 Y MALT1 ALPK2,MALT1 NA NA NA NA MALT1 754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 ALPK2,MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 56631378 56631745 56631564 Y NA NA NA NA NA NA U8 147130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 57552932 57553277 57553219 Y PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 K562 ChIA-PET 22265404 PMAIP1 11903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 60544702 60545081 60544795 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 164030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 60598497 60598585 60598560 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 217825 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 60944557 60944827 60944760 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 40534 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 61549883 61550442 61550030 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2 SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB2 12957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 66131807 66132182 66131996 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 248264 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 67590845 67591199 67591022 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 279982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 67711885 67712217 67712098 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 158964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 68044126 68044452 68044254 Y NA NA RTTN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 89989 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 71819121 71819367 71819268 Y C18orf55 TIMM21 NA NA NA NA TIMM21 5375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74214607 74214778 74214699 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 ZNF516 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-17M16.1 9130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 74732235 74732272 74732254 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 199672 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74732491 74732837 74732665 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 199928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74813361 74814191 74813850 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 280798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74829789 74830209 74830033 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr18 74837664 74837983 74837939 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 305101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 74840794 74841428 74841367 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 308231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 76884362 76884757 76884560 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 57077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr18 77327843 77328066 77328013 Y NA NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 109735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 461817 462164 462146 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1 NA NA NA NA SHC2 2821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 678997 679265 679214 Y HCN2,PALM POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 4605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 753188 753320 753238 Y C19orf20 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 41755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr19 908605 908810 908775 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 2430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 1213863 1214369 1213961 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 21657 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2264561 2264657 2264590 Y TMPRSS9,SPPL2B SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1 NA NA NA NA OAZ1 2828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2452794 2453150 2452981 Y NA TIMM13,LMNB2,GADD45B NA NA NA NA LMNB2 1844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 2770206 2770498 2770360 Y DIRAS1,AES SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 10871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 3177322 3177366 3177344 Y AES,S1PR4 NCLN NA NA NA NA NCLN 6195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 3404656 3404792 3404728 Y TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 47095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 3428769 3429112 3428821 Y TLE2,NFIC C19orf77 NA NA NA NA C19orf77 49428 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 3552794 3553085 3553017 Y GNA15,C19orf28 FZR1,HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 17690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 3670243 3670423 3670333 Y NFIC PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 28054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 4061318 4061457 4061400 Y SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 3486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 4067781 4068111 4067963 Y SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 4369210 4369467 4369256 Y ZBTB7A,CCDC94,TICAM1,SEMA6B STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA MPND 27686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B LRG1 EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 LRG1 36802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 5435162 5435432 5435167 Y NA NA KDM4B,PTPRS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 96348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 6060958 6061480 6061122 Y RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 84805 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 6516969 6517178 6517079 Y NA TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 11832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 7437354 7437833 7437574 Y ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 20166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 7440359 7440731 7440482 Y NA ARHGEF18 INSR,ARHGEF18 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 17268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 7746304 7746484 7746360 Y ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59 STXBP2,TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 2575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 8060665 8061040 8060896 Y FLJ22184,FBN3 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 7503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 8607140 8607451 8607227 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 30092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 8676425 8676449 8676437 Y NA ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 2805 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 119941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 9776683 9777096 9776903 Y OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6680 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA COL5A3 62635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 10304383 10304612 10304534 Y TYK2,KRI1,ILF3 S1PR2,DNMT1 PPAN-P2RY11,EIF3G MCF7 ChIA-PET 22265404 S1PR2 35336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 10317020 10317257 10317138 Y NA S1PR2,DNMT1,MRPL4 DNMT1 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR2 22691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 10728527 10728590 10728559 Y NA SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 17394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ZNF653 21415 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 11642939 11643084 11643012 Y CCDC159 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA CNN1 4448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 13006078 13006409 13006086 Y NA HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A NA NA NA NA GCDH 6238 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 47005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 44617 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 14084978 14085262 14085120 Y NA DCAF15,RFX1 NA NA NA NA DCAF15 23674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 23835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F2 58811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 16573693 16573897 16573763 Y HSH2D EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 6999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 17201349 17201870 17201496 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 16758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 17307223 17307519 17307336 Y MYO9B USE1,OCEL1,NR2F6 NA NA NA NA USE1 16636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 18131991 18132570 18132392 Y MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 22050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 18793678 18793914 18793817 Y PDE4C KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 1191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 19571175 19572073 19571752 Y ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 52472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF724P 121713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 28334161 28334293 28334227 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1368155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 28917737 28917979 28917845 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 784469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 31618240 31618367 31618270 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 220086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 31705006 31705320 31705186 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 133133 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 33165229 33165376 33165346 Y NA RGS9BP,ANKRD27,NUDT19 NA NA NA NA ANKRD27 127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 34210649 34211032 34210767 Y NA NA NA NA NA NA KCTD15 73806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 34724001 34724111 34724046 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 19331 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 LGI4,FXYD7,FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 37942009 37942313 37942161 Y ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569 ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 14174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 3160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38186506 38186731 38186619 Y ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573 ZFP30,ZNF607 NA NA NA NA ZFP30 5268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38482400 38482784 38482644 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 86532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 38575229 38575296 38575264 Y NA NA NA NA NA NA DPF1 143058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38674383 38674545 38674477 Y ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1 DPF1 NA NA NA NA DPF1 43809 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 38791297 38791661 38791416 Y C19orf33 C19orf33,YIF1B,KCNK6 NA NA NA NA C19orf33 1140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 38796841 38796867 38796854 Y NA C19orf33,YIF1B,KCNK6 NA NA NA NA C19orf33 4040 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6 NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 38917975 38918308 38918233 Y LGALS7,RINL,MAP4K1 FAM98C NA NA NA NA FAM98C 26200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 39627416 39627544 39627474 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 13006 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr19 39810585 39810976 39810672 Y CLC,LRFN1 SAMD4B NA NA NA NA SAMD4B 20060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 40283749 40284047 40283932 Y NA DYRK1B NA NA NA NA DYRK1B 38794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 40447509 40447978 40447857 Y SERTAD1,ZNF546,FCGBP PSMC4,ZNF546 LEUTX IMR90 Hi-C 24141950 CTC-471F3.4 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 41816681 41817091 41817051 Y NA CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 2587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 43241725 43242137 43241944 Y NA PSG3 NA NA NA NA PSG3 584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 43267088 43267316 43267247 Y CEACAM1,PSG5 PSG3 NA NA NA NA PSG3 24367 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 43355116 43355369 43355287 Y NA PSG8,PSG1 NA NA NA NA PSG8 2474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 43380742 43381113 43380927 Y PSG5 PSG8,PSG1,PSG6 PSG10P IMR90 Hi-C 24141950 PSG1 861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 43469411 43469727 43469501 Y NA PSG6 PSG2 IMR90 Hi-C 24141950 PSG6 47696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 43624762 43624964 43624855 Y NA PSG2 PSG5,PSG9 IMR90 Hi-C 24141950 PSG2 39565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PSG9 63866 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 44152096 44152277 44152103 Y ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF428,CADM4,PLAUR CADM4 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CADM4 10105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 44267676 44267996 44267772 Y TEX101,LYPD3,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9 NA NA NA NA SMG9 10534 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 44781587 44781871 44781729 Y ZNF404,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZFP112,ZNF233,ZNF233,ZNF235 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 25328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA IGFL2,IGFL1 NA NA NA NA IGFL2 39593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 46688176 46688573 46688180 Y PTGIR IGFL2,IGFL1 NA NA NA NA IGFL1 42436 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 46802245 46802621 46802425 Y IRF2BP1,MYPOP,DACT3,HIF3A,HIF3A,CCDC8 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 45630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47033456 47033629 47033471 Y NA GAPDHP38 NA NA NA NA GAPDHP38 26269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,PTGIR,DACT3 NA NA NA NA PTGIR 15820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 47552678 47552827 47552750 Y NA TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 2790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 48629286 48629473 48629353 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 17212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 48832028 48832343 48832234 Y CARD8,IZUMO1,EMP3 EMP3,CCDC114,TMEM143 NA NA NA NA CCDC114 8877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 49046614 49046906 49046677 Y NA NA SULT2B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPHK2 73642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 49051864 49052159 49052158 Y NA NA NA NA NA NA SPHK2 68389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 50116585 50116794 50116665 Y NA NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1 NA NA NA NA PRR12 23685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 50414628 50414884 50414779 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 47334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 51166998 51167396 51167198 Y KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918 C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 16296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 51221435 51221859 51221691 Y KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 NA NA NA NA NA C19orf81 70733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 489 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 52193633 52193945 52193814 Y ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 94 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 555 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 52228457 52228756 52228505 Y NA MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 34418 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 53128477 53128840 53128754 Y NA NA NA NA NA NA ZNF83 62909 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,PRKCG NA NA NA NA MYADM 6258 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA PRKCG 84799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA NDUFA3 80255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 54538982 54539278 54539125 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA3 64758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 8.25718256207262 chr19 55985101 55985287 55985184 Y ISOC2,SSC5D ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 412 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14,SSC5D,SBK2 NA NA NA NA SBK2 14879 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA SBK2,ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 SBK2 14342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56064106 56064277 56064192 Y ZNF579 SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1 NA NA NA NA SBK2 17650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56623049 56623274 56623140 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 7375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56698517 56698525 56698522 Y NA NA NA NA NA NA ZNF444 56549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 88266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56810811 56811236 56810900 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 66516 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 56811653 56811926 56811777 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 65826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 57980425 57980680 57980553 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 6258 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr19 58532436 58532530 58532517 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 19719 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 605283 605589 605326 Y NA NA TPO,MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 69850 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 1810384 1810763 1810574 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 63760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 8231020 8231604 8231329 Y NA NA NA NA NA NA ID2 585371 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA ID2 55810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 9391833 9392063 9392058 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 46939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 9692579 9693026 9692911 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 895 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 9815627 9815977 9815711 Y NA YWHAQ NA NA NA NA YWHAQ 46484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B NA GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 93617 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 10176248 10176551 10176348 Y NA KLF11,CYS1 NA NA NA NA KLF11 4425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 10549320 10549595 10549372 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 37035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 15309828 15310293 15310034 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 389161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 15815563 15815811 15815751 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 86261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 16123687 16124268 16124038 Y NBAS,DDX1,MYCN NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 115624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 18807557 18807914 18807789 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 67611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 19273463 19273583 19273517 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSR1 282831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 19562818 19563058 19562929 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 6404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 19788015 19788399 19788228 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 231601 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 20037141 20037249 20037195 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC32 62498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 20407883 20408194 20408074 Y RHOB,SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 15000 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 20417309 20417694 20417511 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 5500 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 20811186 20811439 20811262 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 37410 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA KLHL29 75853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 23840114 23840588 23840464 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 234026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 24234264 24234694 24234378 Y MFSD2B C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA C2orf44 35751 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 24587849 24588329 24588089 Y ATAD2B RPL36AP13,ITSN2 ITSN2 K562 ChIA-PET 22265404 ITSN2 6266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 24705481 24705982 24705701 Y ITSN2 NCOA1 CENPO,ADCY3,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 6801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NCOA1 CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 104020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28497824 28498240 28497982 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 115075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28519223 28519459 28519305 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 93856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28629645 28630316 28629830 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 16330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 18760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 28668874 28669088 28668964 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA BRE,RBKS,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 55559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 28811153 28811289 28811218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 161217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 29352302 29352469 29352324 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 33731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 30440662 30440911 30440739 Y NA LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 11486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 30516276 30516651 30516416 Y NA NA LCLAT1,LBH IMR90 Hi-C 24141950 LBH 63879 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 30791728 30792075 30791902 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 123636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 36665586 36666219 36665918 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 84517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 36687110 36687380 36687132 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 106041 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 36700444 36700711 36700553 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 119375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2,AC007390.4 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 37998725 37999059 37998933 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 35114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 38003207 38003253 38003231 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 39596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 38770175 38770358 38770267 Y NA NA NA NA NA NA RPLP0P6 63255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 39683895 39683929 39683912 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 21442 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 40260196 40260378 40260267 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 255789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 40662022 40662435 40662315 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 173758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 40899157 40899397 40899276 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 62964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 42046531 42047126 42046845 Y PKDCC NA NA NA NA NA AC104654.2 111737 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 9163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr2 42155945 42156079 42156067 Y NA AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 2784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 42157961 42158315 42158139 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 2747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 42224568 42224788 42224773 Y NA PKDCC LOC388942,C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 48372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 280047 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 185797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 43269026 43269323 43269208 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 43313736 43313941 43313748 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 137807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 44601254 44601363 44601309 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA CAMKMT 14165 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA AC012354.8 NA NA NA NA AC012354.8 45006 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47041376 47041664 47041544 Y NA NA NA NA NA NA TTC7A 99632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63051 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 47109327 47109734 47109459 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 TTC7A NA NA NA NA TTC7A 31562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 47212237 47212567 47212294 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47213827 47213985 47213928 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 46833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47229826 47230084 47229931 Y TTC7A NA NA NA NA NA MCFD2 62832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 47569796 47569847 47569822 Y NA NA EPCAM,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 MSH2 58261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 51010628 51010803 51010737 Y NRXN1,NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 2256106 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA EFEMP1 NA NA NA NA EFEMP1 36481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 57600725 57600909 57600817 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 531877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 57947710 57947899 57947805 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 184887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 58339709 58340405 58340032 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 126102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 60228228 60228402 60228315 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 381338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA NA NA NA NA NA REL 58707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 63452850 63453196 63453026 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 177658 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 63514058 63514136 63514097 Y WDPCP NA NA NA NA NA OTX1 238866 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 63841794 63842078 63841905 Y NA MDH1 NA NA NA NA MDH1 28051 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 64207040 64207416 64207228 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 36790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 65583296 65583698 65583484 Y NA NA NA NA NA NA SPRED2 74073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 67730161 67730513 67730267 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 107710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 68993342 68993784 68993560 Y PLEK,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25 NA BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 GKN1 205921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 12300 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 69481133 69481450 69481229 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 130932 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 70608938 70609447 70609175 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 81716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 71725442 71725771 71725690 Y DYSF DYSF NA NA NA NA DYSF 46590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 71727655 71727841 71727721 Y DYSF DYSF NA NA NA NA DYSF 48803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 72789461 72789923 72789792 Y EXOC6B NA NA NA NA NA EXOC6B 261247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 74793766 74794164 74794010 Y WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1 HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 12949 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 74801154 74801351 74801200 Y DOK1 HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 20337 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 75775367 75775568 75775468 Y NA NA NA NA NA NA MRPL19 96341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 75779311 75779317 75779314 Y NA NA NA NA NA NA MRPL19 92592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5,AC105053.4 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 86120990 86121249 86121122 Y NA ST3GAL5,AC105053.4 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 AC105053.4 6587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 86224309 86224458 86224357 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 106820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 86225018 86225303 86225260 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 86225783 86226050 86225999 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 86922220 86922584 86922381 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 22712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 88913679 88914090 88914022 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 11004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 91786584 91786786 91786661 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 RPIA 2797422 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 91815826 91816191 91816014 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826664 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 91954549 91954973 91954634 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2965387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 95982487 95982780 95982632 Y TRIM43B,KCNIP3 NA NA NA NA NA FAHD2A 83689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 95982962 95983225 95982998 Y PROM2 NA NA NA NA NA FAHD2A 83244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 96911483 96911666 96911570 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1 NA NA NA NA TMEM127 18066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 96922307 96922515 96922363 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200 NA NA NA NA TMEM127 7217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA FER1L5 14466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 97330891 97331185 97331060 Y TMEM127,ARID5A,KIAA1310 FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 24367 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 99250910 99251133 99251091 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 27868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 99525863 99526206 99526035 Y C2orf55 NA NA NA NA NA MGAT4A 180274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 100496681 100496959 100496872 Y NA NA NA NA NA NA REV1 392184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA CHST10 401505 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 124173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 102081384 102081611 102081486 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4,RFX8 NA NA NA NA NA CREG2 79327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 102327240 102327383 102327307 Y NA MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 15928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 102382879 102383094 102382925 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 71567 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 102727591 102727968 102727780 Y NA IL1R1 IL1RL2,IL1R1,IL1R2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 48587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 106009982 106010344 106010250 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 42626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 106020017 106020290 106020154 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 32680 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 106022630 106022770 106022732 Y GPR45 FHL2 NA NA NA NA FHL2 30200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 106419035 106419424 106419178 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 59681 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 109209973 109210484 109210252 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61116 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr2 109706111 109706459 109706286 Y NA NA EDAR,SEPT10,SH3RF3,LOC100287216 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 304898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA NA NA NA NA NA NPHP1 101146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL NA NA NA NA NA NPHP1 96715 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 111941595 111941939 111941767 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 66640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 113380153 113380493 113380323 Y IL1A CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 2409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 113450750 113451037 113450852 Y NA SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 49316 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113550957 113551489 113551296 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 10790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 113563232 113563409 113563324 Y IL36G,IL1RN CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1A 23065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113568769 113568943 113568854 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 23537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 113571813 113572166 113571903 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 20314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 113629155 113629320 113629193 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B IL1B,CKAP2L,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 36675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 113634636 113634920 113634776 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B IL1B,CKAP2L,IL1A,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 42156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 113635122 113635394 113635287 Y NA IL1B IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 42642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 113637417 113638142 113637790 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 44937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 113638257 113639193 113638961 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B CKAP2L,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 45777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 114039556 114039944 114039632 Y NA NA NA NA NA NA IL36G 310776 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 299991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr2 114126317 114126521 114126419 Y IL1F10,IL1F10 NA PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 256285 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 115897297 115897567 115897434 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA ACTR3 1251760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 115944602 115944633 115944617 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA ACTR3 1299065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 118722673 118722961 118722817 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 46748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 119498698 119498987 119498818 Y NA NA NA NA NA NA STEAP3 480397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 119731021 119731371 119731347 Y NA NA NA NA NA NA STEAP3 248013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 120190413 120190812 120190613 Y SCTR,PCDP1,TMEM37 TMEM37 NA NA NA NA TMEM37 4936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 121040381 121040601 121040491 Y NA RALB NA NA NA NA RALB 44741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 121556170 121556432 121556293 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 64971 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr2 122479618 122479882 122479768 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 12797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 133226429 133226806 133226618 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 54282 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 135931129 135931440 135931285 Y NA NA NA NA NA NA RAB3GAP1 123294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 141193779 141194149 141193964 Y NA NA NA NA NA NA NXPH2 1657861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 142874625 142874987 142874896 Y LRP1B NA NA NA NA NA GTDC1 2213148 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 143756654 143756995 143756685 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 1331140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 148394087 148394646 148394415 Y ACVR2A NA NA NA NA NA ACVR2A 205440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 149925246 149925613 149925433 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 258886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 150971624 150972028 150971707 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 421497 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 150999673 151000010 150999769 Y NA NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 393515 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 151377866 151378135 151377929 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 15390 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 151537937 151538357 151538169 Y NA NA RBM43,RND3,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 144412 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 662369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 159251786 159251944 159251889 Y NA NA NA NA NA NA PKP4 59532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 159908773 159909006 159908845 Y NA NA NA NA NA NA TANC1 85627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 160013990 160014170 160014100 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 127140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 161013283 161013451 161013369 Y NA NA NA NA NA NA PLA2R1 96162 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 161014381 161014772 161014663 Y NA NA NA NA NA NA PLA2R1 97260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 147543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr2 161065805 161066369 161066265 Y CD302 NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 148684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 NA RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 161179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 161080666 161080905 161080769 Y NA NA ITGB6,RBMS1,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 163545 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 105999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 161173742 161174088 161173899 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 88305 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr2 161244338 161244737 161244615 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 17656 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 161277229 161277590 161277411 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 14836 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 164530260 164530475 164530368 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 60047 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 164534395 164534690 164534543 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 55832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 164991272 164991524 164991400 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 400750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA AC019181.2,COBLL1 NA NA NA NA AC019181.2 11972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 167269953 167270071 167269980 Y NA SCN9A NA NA NA NA SCN9A 39450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 171679560 171679730 171679653 Y NA GAD1 NA NA NA NA GAD1 11837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 172792873 172793084 172792979 Y NA HAT1 NA NA NA NA HAT1 15915 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 173114788 173114930 173114869 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 149160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 173117910 173118399 173118084 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 152282 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 174518967 174519016 174518991 Y NA NA OLA1,CIR1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7 301419 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 178036272 178036551 178036470 Y NFE2L2 HNRNPA3 LOC100130691,NFE2L2,AGPS,HNRNPA3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 38740 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 12322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 186832070 186832214 186832142 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 516669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 187953968 187954250 187954072 Y NA NA NA NA NA NA AC007319.1 88021 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 188280188 188280462 188280371 Y NA NA NA NA NA NA ST13P2 407606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 190151091 190151337 190151257 Y NA NA COL5A2,GULP1,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 152822 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 190235497 190235832 190235693 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 NA NA NA NA NA PMS1 82702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 192034233 192034465 192034355 Y MYO1B,MYO1B NA MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 73446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 192084344 192084437 192084391 Y NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 23474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 192112527 192112680 192112632 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 4616 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 208368 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 192889960 192890123 192890039 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 179979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 196351873 196352054 196351969 Y NA NA DNAH7,SLC39A10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 86647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 196478695 196478993 196478847 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 39994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 196531201 196531576 196531334 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 92500 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 201289842 201289940 201289893 Y NA NA NA NA NA NA SGOL2 82791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 201978583 201978718 201978642 Y CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr2 201995421 201995893 201995513 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA CFLAR 16594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 33756 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 204548440 204549024 204548878 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 150307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 204646981 204647288 204647136 Y NA NA CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 248848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 204668913 204669218 204669026 Y NA NA RAPH1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 270780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 204676480 204676691 204676598 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 278347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 208378687 208378932 208378791 Y CREB1 CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 13529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 208609048 208609450 208609191 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 22837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 217180784 217180970 217180877 Y NA NA NA NA NA NA MARCH4 53780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 217181584 217181763 217181674 Y NA NA NA NA NA NA MARCH4 52987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 217934616 217935002 217934772 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 376368 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 218798822 218799459 218799101 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 66259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 219760047 219760178 219760137 Y WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16962 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 220317654 220318040 220317775 Y GMPPA,GMPPA SPEG,GMPPA NA NA NA NA SPEG 20086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 220386924 220387263 220387141 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 19122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA NA DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 SLC4A3 63704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A3 510042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC4A3 603383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.03684480812439 chr2 221360545 221360555 221360550 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A3 870496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 222312152 222312375 222312261 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 124547 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 223757137 223757389 223757313 Y NA ACSL3 NA NA NA NA ACSL3 33485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 223784632 223784923 223784806 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 60980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 224804297 224804525 224804424 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 3579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 224808298 224808709 224808400 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 224951199 224951592 224951399 Y NA SERPINE2 NA NA NA NA SERPINE2 49163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 225880660 225880871 225880768 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 24291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 225965618 225965990 225965841 Y NA NA DOCK10 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 60456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 244279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 227586845 227587105 227586929 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 75370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 228018054 228018265 228018160 Y COL4A4 COL4A4 NA NA NA NA COL4A4 8564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 228280402 228280578 228280475 Y CCL20,AGFG1 NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 54290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 228717939 228718338 228718141 Y NA CCL20 WDR69 IMR90 Hi-C 24141950 CCL20 41381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 228728073 228728272 228728126 Y NA NA NA NA NA NA CCL20 51515 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 118198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 234266690 234266835 234266770 Y INPP5D,ATG16L1,DGKD DGKD NA NA NA NA DGKD 5537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 234330770 234331121 234330825 Y INPP5D,ATG16L1 NA USP40 IMR90 Hi-C 24141950 DGKD 69617 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 234357256 234357513 234357369 Y NA NA NA NA NA NA DGKD 96103 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA NA NA NA NA NA USP40 135151 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA NA NA NA NA NA USP40 141449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 90774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 235353626 235353934 235353758 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 49763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 235360536 235360912 235360678 Y NA ARL4C TRPM8,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 42785 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 235905010 235905389 235905297 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 46393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 236453392 236453640 236453439 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 52659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 236698901 236699175 236699041 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 298168 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 238016795 238017153 238016975 Y NA COPS8 NA NA NA NA COPS8 24840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 238611190 238611575 238611206 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 76971 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 239108088 239108227 239108158 Y ILKAP FAM132B,ILKAP,HES6 NA NA NA NA ILKAP 2143 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 239758150 239758505 239758333 Y NA TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 3477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 240143817 240143953 240143885 Y NA NA NA NA NA NA HDAC4 177395 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 124012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA HDAC4 118903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 240248408 240248826 240248656 Y NA NA NA NA NA NA HDAC4 72522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 53682 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 241313615 241314182 241313884 Y NA NA GPC1 IMR90 Hi-C 24141950 GPC1 58906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 241845496 241845803 241845554 Y NA NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 KIF1A 87771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr2 242801923 242802843 242802016 Y NA AC131097.3 NA NA NA NA AC131097.3 18671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 478652 479003 478850 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA TBC1D20 37455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SNPH 62868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 1548183 1548579 1548480 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,SIRPB2 NA NA NA NA NA NSFL1C 95696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 1790289 1790734 1790591 Y NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 82420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 3188788 3188839 3188809 Y NA UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 1274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 5630956 5631337 5631203 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 41284 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 6142519 6142722 6142563 Y NA FERMT1,RP4-775C13.1 HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 FERMT1 40328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 9015889 9016122 9016006 Y NA PLCB4 PLCB4,PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 31288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 9032235 9032553 9032394 Y NA PLCB4 PLCB1,PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 14857 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 9053538 9053794 9053641 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 6128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 9112642 9112699 9112675 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 65232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 14503147 14503522 14503333 Y NA NA NA NA NA NA MACROD2 529132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 17644857 17645185 17645058 Y NA RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 15755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 17816995 17817233 17817164 Y DSTN NA BANF2,RRBP1,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 124356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 19574578 19574842 19574710 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 161510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 19796265 19796476 19796342 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 59913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 19797665 19798070 19797910 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 61313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 124586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 19967147 19967464 19967305 Y NA NAA20 NA NA NA NA NAA20 28296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 20795537 20795761 20795649 Y NA NA NA NA NA NA RALGAPA2 104406 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 21417020 21417216 21417107 Y NA NA XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 XRN2 135078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 22743134 22743499 22743315 Y NA NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 284879 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 283878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr20 22776496 22776845 22776664 Y NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 251533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 23226243 23226447 23226434 Y NAPB NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 102926 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 23437165 23437374 23437259 Y NXT1 NAPB NA NA NA NA NAPB 37040 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 24653528 24653728 24653628 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 383888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 25071353 25071583 25071428 Y GINS1 ACSS1 ACSS1,VSX1,ENTPD6,PYGB IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 33737 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 166731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30110463 30111086 30110768 Y HM13 REM1,HM13 NA NA NA NA HM13 10232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 30430838 30430847 30430843 Y NA FOXS1,DUSP15 NA NA NA NA FOXS1 573 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr20 31126196 31126450 31126244 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 44426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 31171182 31171312 31171248 Y DNMT3B,C20orf203 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 306 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 31560072 31560429 31560192 Y CDK5RAP1 NA NA NA NA NA MAPRE1 154373 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 33803083 33803443 33803260 Y NA PROCR,MT1P3,MMP24 TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MT1P3 369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 33861234 33861630 33861491 Y NA MMP24,EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EDEM2 2298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 33899361 33899545 33899443 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 28573 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.85335186230056 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr20 33943108 33943431 33943270 Y NA NA NA NA NA NA EIF6 72320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 34018897 34019177 34019037 Y MYH7B GDF5,CEP250 NA NA NA NA GDF5 21391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA CPNE1,RBM12 NA NA NA NA CPNE1,RBM12 33318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 35851515 35851770 35851561 Y SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1 RPN2 NA NA NA NA RPN2 46702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36048250 36048624 36048494 Y VSTM2L RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 23312 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36722822 36723019 36722924 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI NA NA NA NA NA RPRD1B 62874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 39938508 39938643 39938544 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 5669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 39939044 39939335 39939233 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 4977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 42571412 42571561 42571487 Y C20orf111 TOX2 NA NA NA NA TOX2 29908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43271158 43271637 43271427 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 7237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43700046 43700199 43700110 Y NA NA NA NA NA NA PI3 101318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43869504 43869693 43869682 Y DBNDD2,SLPI SLPI NA NA NA NA SLPI 11512 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 38884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 20353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 47961628 47961789 47961714 Y NA NA B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD12 66408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 48165703 48166239 48166052 Y PTGIS PTGIS NA NA NA NA PTGIS 16444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48168443 48168863 48168748 Y NA PTGIS NA NA NA NA PTGIS 13820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48200445 48200486 48200453 Y NA PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 17762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48201281 48201539 48201531 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 18598 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48207635 48208270 48207977 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 24952 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48221158 48221415 48221229 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 38475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48316345 48316673 48316621 Y NA B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 11742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48384741 48385230 48384965 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 48406651 48406821 48406652 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 20429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48650281 48650896 48650575 Y NA NA TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 52745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48809447 48810205 48810164 Y B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 4071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 CEBPB 97730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 48938558 48938763 48938674 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 133182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 48995783 48996016 48995938 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 128875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 49057048 49057261 49057196 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 49157621 49157908 49157761 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 32730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 49345638 49345902 49345710 Y MOCS3,PARD6B PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 21252 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 49982226 49982434 49982404 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 194936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA NFATC2 193837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 70300 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 51109650 51109945 51109791 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 290803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 52323078 52323315 52323172 Y NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 98632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 244941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52753645 52754029 52753762 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 34483 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 52757453 52757742 52757598 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 30770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 52784442 52785020 52784595 Y PFDN4 CYP24A1,PFDN4 NA NA NA NA CYP24A1 3492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 54012587 54012833 54012710 Y NA NA NA NA NA NA RPL12P4 323432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 54994060 54994381 54994298 Y C20orf107,CASS4,CASS4,C20orf43 AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 28633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 54997703 54998108 54997901 Y NA AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 32276 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 161109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 56016094 56016430 56016231 Y NA NA NA NA NA NA RBM38 51631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 57228113 57228577 57228221 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 3623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 60033866 60034028 60033960 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 208384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 60935306 60935741 60935523 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 4627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 60939635 60939778 60939673 Y SLCO4A1,NTSR1,LAMA5 RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr20 60943690 60943839 60943760 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 60944265 60944566 60944463 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 61076779 61077313 61077048 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 GATA5 NA NA NA NA GATA5 27753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 61335955 61336196 61336080 Y NA NA C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLCO4A1 64158 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NA NA NA NA NA OGFR 62260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr20 61687989 61688195 61688101 Y NA NA NA NA NA NA DIDO1 120685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA TNFRSF6B 11796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 16222795 16222981 16222977 Y NA AF127936.7 NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AF127936.7 29315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 16354668 16355055 16354876 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 80266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 16596629 16597038 16596898 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 161308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA USP25 860323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 18886111 18886899 18886569 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 3411 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 18919922 18920266 18920094 Y CXADR CXADR NA NA NA NA CXADR 37222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 26701473 26701861 26701653 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 275968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 28795435 28795716 28795624 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 458603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr21 28796596 28796902 28796773 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 459764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr21 28797067 28797570 28797293 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 460235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 28942187 28942353 28942343 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605355 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 28942556 28942990 28942803 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr21 28945118 28945334 28945247 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 608286 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 28952733 28952925 28952772 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 615901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 30005077 30005224 30005162 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 250469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 249001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr21 30390843 30391016 30390919 Y NA LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 NA NA NA NA RWDD2B 1144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 34752256 34752448 34752342 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 20754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 34801962 34801998 34801980 Y NA IFNGR2,TMEM50B NA NA NA NA IFNGR2 28760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr21 36167928 36168243 36168166 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 182487 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 238290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 36379576 36379916 36379746 Y RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 394135 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 37695369 37695803 37695437 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 4882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA HLCS 127817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA HLCS 78016 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 40455445 40455742 40455689 Y ETS2 NA ETS2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 98035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 41146916 41147071 41146994 Y LCA5L NA NA NA NA NA LCA5L 331185 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 41872740 41872794 41872767 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 664934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 43062216 43062499 43062352 Y MX1 NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 SNORA32 153083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 43372239 43372638 43372317 Y C2CD2 C2CD2 NA NA NA NA C2CD2 240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 43467986 43468177 43468082 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 95987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 43832072 43832298 43832177 Y NA TMPRSS3 NA NA NA NA TMPRSS3 17117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44582937 44583304 44583126 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 57240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44752617 44753007 44752874 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 92001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 15770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 72994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44930607 44930875 44930782 Y PDXK,SIK1 NA NA NA NA NA SIK1 85599 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 44937659 44937875 44937741 Y PDXK NA NA NA NA NA SIK1 92651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 44939768 44940090 44939875 Y PDXK NA NA NA NA NA SIK1 94760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 45577373 45578052 45577512 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 25886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3 NA NA NA NA LRRC3 17359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46185657 46185775 46185721 Y NA UBE2G2 NA NA NA NA UBE2G2 34159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46302248 46302499 46302417 Y ITGB2 PTTG1IP PTTG1IP MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 10496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46726845 46727332 46727050 Y NA POFUT2 NA NA NA NA POFUT2 21032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46749567 46749782 46749739 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 43754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46786853 46787266 46786994 Y COL18A1,POFUT2 COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 35786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr21 46836537 46836812 46836569 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 13485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46891281 46891413 46891347 Y NA NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 68229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 46952785 46952947 46952858 Y POFUT2,SLC19A1,SLC19A1 SLC19A1 NA NA NA NA SLC19A1 9378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 47167832 47168236 47167895 Y NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 106224 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 18402838 18403339 18403237 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 101986 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 18452405 18452779 18452681 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 52546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 19043288 19043502 19043327 Y NA NA NA NA NA NA DGCR2 64465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.20191534988603 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L NA NA NA NA GNB1L 28939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr22 20885626 20885829 20885752 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 37426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 23725705 23725832 23725738 Y NA ZDHHC8P1 NA NA NA NA ZDHHC8P1 17081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 23743297 23743498 23743398 Y NA ZDHHC8P1 NA NA NA NA ZDHHC8P1 384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 28570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 58459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CRIP1P4 242472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 25350277 25350613 25350445 Y NA NA KIAA1671,TMEM211,SGSM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CRIP1P4 244018 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 25354945 25355076 25355012 Y NA NA KIAA1671,SGSM1,TMEM211 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP1P4 248686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP1P4 275581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 25466969 25467233 25467138 Y NA NA NA NA NA NA LRP5L 332111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 27415901 27416173 27415987 Y NA NA NA NA NA NA RP1-40G4P.1 134390 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 27501495 27502092 27501824 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 116596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 27527504 27527688 27527616 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 91000 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr22 27870917 27871291 27871105 Y NA NA PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 252229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 254091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 29339124 29339474 29339174 Y NA NA KREMEN1,C22orf31 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF3 61544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1 NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1 NA NA NA NA NIPSNAP1 42705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 30178140 30178286 30178234 Y NA ZMAT5,UQCR10 NA NA NA NA UQCR10 16782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 30591285 30591521 30591419 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF NA NA NA NA LIF 49319 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr22 30631749 30632163 30631958 Y RNF215,MTFP1,GAL3ST1 LIF NA NA NA NA LIF 8677 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 2940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 6.42225310383426 chr22 30646485 30646883 30646861 Y SEC14L2,RNF215,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 5645 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 31226011 31226350 31226247 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 135934 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 20054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 32042427 32042918 32042716 Y RNF185,LIMK2 PISD NA NA NA NA PISD 13500 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-633O19__A.1 23476 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 37490501 37490532 37490517 Y NA KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 44722 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 37582993 37583226 37583109 Y NA C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 10199 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 37655075 37655389 37655235 Y NA Z82188.1,RAC2 CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 16587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 37703673 37703847 37703799 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA RAC2 65185 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 37948648 37948841 37948736 Y NA CARD10,CDC42EP1 NA NA NA NA CDC42EP1 5613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 38292237 38292573 38292408 Y CARD10,SH3BP1,MICALL1 EIF3L,ANKRD54,MICALL1 NA NA NA NA MICALL1 7091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 38458818 38459072 38458999 Y SOX10,PLA2G6,PLA2G6,PICK1,SLC16A8 PICK1,BAIAP2L2 NA NA NA NA PICK1 8500 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF NA NA NA NA MAFF 3997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 39462078 39462341 39462224 Y NA APOBEC3F,APOBEC3G,APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3G 27154 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 39572231 39572423 39572299 Y TOMM22,PDGFB CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 25552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 39693596 39693744 39693670 Y MGAT3 RPL3 NA NA NA NA RPL3 20650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 39784258 39784471 39784339 Y MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1 SYNGR1,TAB1 NA NA NA NA TAB1 9275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 40384673 40384943 40384833 Y FAM83F NA NA NA NA NA UQCRFS1P1 115380 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 40636754 40637006 40636831 Y GRAP2,TNRC6B NA NA NA NA NA ADSL 103501 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr22 41430686 41430887 41430758 Y NA RP11-12M9.3,RP11-12M9.4 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 27169 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 42835802 42836124 42835869 Y POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-126B4.7 3773 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 43550927 43551235 43551079 Y ARFGAP3 BIK,MCAT,TSPO,TTLL12 NA NA NA NA TSPO 5407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 45624322 45624510 45624404 Y KIAA0930 KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 10140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3157 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 47134957 47135355 47135288 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 2799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50345940 50346570 50346146 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 5591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50710173 50710402 50710310 Y MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11 TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2 NA NA NA NA MAPK11 2977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50740463 50740842 50740722 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 3214 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50741799 50742849 50742615 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 1207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 4763636 4764014 4763825 Y NA EGOT NA NA NA NA EGOT 27260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 5036570 5037120 5036867 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16924 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5037242 5038218 5038020 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 17596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5058332 5058543 5058409 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 38686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5059566 5059965 5059743 Y ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 39920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 8524896 8525313 8525187 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 16080 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 8781836 8782151 8782020 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 27163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 8783302 8783537 8783436 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 25777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 8802643 8803023 8802833 Y OXTR OXTR NA NA NA NA OXTR 6291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr3 8924124 8924195 8924160 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 79262 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 8978841 8979048 8978945 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 24409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 9452001 9452408 9452073 Y MTMR14,SETD5 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5-AS1 13738 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 10237175 10237307 10237243 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 32626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 11138272 11138477 11138338 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 11197111 11197379 11197271 Y VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1 HRH1 NA NA NA NA HRH1 20332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 11279893 11280094 11280011 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 31901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 11645125 11645451 11645297 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 114769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 12235782 12236012 12235937 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA TSEN2 287919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 12893106 12893439 12893273 Y NA RPL32 NA NA NA NA RPL32 12019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 13580930 13581161 13581030 Y FBLN2 FBLN2 HDAC11,FBLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBLN2 9106 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43,AC093495.4 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 15341871 15342528 15342442 Y ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 38347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 15651699 15651909 15651804 Y NA BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 10361 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 15675662 15676068 15675826 Y NA BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 34324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 15677848 15678314 15678139 Y ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1 BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 36510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 16102393 16102705 16102619 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 201774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 16145048 16145389 16145286 Y NA NA GALNTL2,ANKRD28,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 159090 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 16181971 16182303 16182167 Y GALNTL2 NA GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 122176 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 16545937 16546186 16546046 Y PLCL2,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 7347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 16551037 16551376 16551345 Y NA RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 2157 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 17505233 17505390 17505312 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 663074 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 700704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 17650424 17650697 17650561 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 808265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 23991964 23992189 23991965 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA NKIRAS1 5882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 150696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA NA NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 195189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 29412640 29413015 29412700 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 92167 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 29496223 29496522 29496266 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 175750 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 404564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 29735360 29735534 29735491 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 414887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 29736457 29736614 29736535 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 415984 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 33002804 33002999 33002866 Y NA NA NA NA NA NA SEC13P1 70356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 35443388 35443740 35443564 Y NA NA NA NA NA NA STAC 976096 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 37131567 37131685 37131626 Y NA NA NA NA NA NA RPL29P11 75062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 37221290 37221535 37221382 Y NA LRRFIP2 LRRFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 1645 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 37526942 37526947 37526945 Y C3orf35 NA NA NA NA NA AC097359.1 243256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 42065241 42065265 42065254 Y NA TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 11947 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 42103073 42103570 42103397 Y NA TRAK1 ZNF621,ZNF620,TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 49779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 42108875 42109165 42109003 Y ULK4 NA NA NA NA NA TRAK1 55581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 42694090 42694456 42694126 Y FAM198A,HHATL RP4-613B23.1 NA NA NA NA RP4-613B23.1 210 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 42864988 42865260 42865043 Y NA HIGD1A NA NA NA NA HIGD1A 20965 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 43913925 43914045 43914001 Y ANO10 NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 182839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 45141662 45142027 45141978 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 43887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 45208648 45208845 45208728 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 8981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 45686431 45686643 45686512 Y NA SACM1L SACM1L,LOC644714 IMR90 Hi-C 24141950 SACM1L 41905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 45688648 45689066 45688756 Y LIMD1 SACM1L SACM1L,LOC644714 IMR90 Hi-C 24141950 SACM1L 39482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 46427756 46428118 46427902 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 RTP3 108863 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 46434949 46435277 46435219 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA RTP3 101704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 RTP3 NA NA NA NA RTP3 9426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 47879431 47879730 47879653 Y SPINK8 DHX30 NA NA NA NA DHX30 37032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 50280819 50280975 50280878 Y RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,UBA7,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B,IFRD2 NA NA NA NA GNAI2 19095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 52073968 52074235 52074157 Y GPR62 RPL29,DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 14331 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 52142420 52142715 52142428 Y NA POC1A NA NA NA NA POC1A 43991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 52949406 52949635 52949457 Y PRKCD,DCP1A TMEM110-MUSTN1,TMEM110 TMEM110-MUSTN1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM110 19794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 157228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 58372741 58373260 58372916 Y PXK,FAM107A PDHB NA NA NA NA PDHB 44324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 66491612 66491762 66491706 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 57925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 67925227 67925376 67925302 Y NA NA NA NA NA NA RP11-81N13.1 222106 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 69228052 69228449 69228187 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 95957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 69797197 69797346 69797210 Y NA MITF NA NA NA NA MITF 10611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71137411 71137566 71137489 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71439009 71439199 71439166 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 191941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71441439 71441788 71441676 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 189352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71535859 71536392 71536211 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 94748 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71628462 71628802 71628743 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 2338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA GXYLT2 800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA NA NA NA NA NA CCDC75P1 467172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 77239163 77239286 77239225 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 757994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 79674571 79674688 79674630 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 140277 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 98685741 98686133 98685825 Y NA LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 11769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 99262027 99262447 99262268 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 92872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 99263702 99264060 99263882 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 91259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 99367111 99367532 99367193 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 11792 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 99377938 99378211 99378054 Y COL8A1 COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 22619 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 231919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 99614794 99615242 99614937 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 216115 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 99752092 99752383 99752194 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 78974 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 100516379 100516430 100516403 Y ABI3BP NA NA NA NA NA TFG 90174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 100784871 100785104 100785043 Y ABI3BP NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 74512 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 100898529 100898766 100898648 Y NA NA ABI3BP,GPR128 IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 188170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 101899188 101899342 101899284 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 354353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 101914180 101914598 101914381 Y NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1 NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 369345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 104014158 104014524 104014365 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1069229 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr3 105081269 105081374 105081321 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 2379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 105316935 105317233 105317084 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 233182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 107085712 107085944 107085942 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 128173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 111420857 111420932 111420895 Y NA PLCXD2,PHLDB2 PHLDB2,CD96,ABHD10 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 28412 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 111521164 111521550 111521388 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA PHLDB2 71820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112076380 112076550 112076391 Y NA CD200 NA NA NA NA CD200 27186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 112076880 112077055 112076913 Y BTLA CD200 NA NA NA NA CD200 27686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 112095378 112095510 112095470 Y CD200 CD200 NA NA NA NA CD200 46184 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112097877 112098105 112098057 Y ATG3 CD200 NA NA NA NA CD200 48683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112109657 112110558 112110278 Y CD200 NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 CD200 60463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112165241 112165518 112165388 Y CD200 NA NA NA NA NA SLC35A5 113038 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 112348564 112348626 112348595 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 17751 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112366095 112366266 112366169 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC80 111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 112370377 112370712 112370567 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 4000 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 112372486 112372667 112372577 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 6109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 112395778 112395997 112395824 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC80 29401 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 112494891 112495176 112495106 Y ATG3 NA GTPBP8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 128514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 638640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639719 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 115696572 115696769 115696673 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 832454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 115724212 115724599 115724432 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 860094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 118900816 118900962 118900889 Y UPK1B,B4GALT4 UPK1B NA NA NA NA UPK1B 10452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 119019675 119019984 119019904 Y ARHGAP31,ADPRH ARHGAP31 NA NA NA NA ARHGAP31 8455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 119798224 119798287 119798255 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 12977 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 120120515 120120873 120120694 Y FSTL1 FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 47227 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 120361404 120361730 120361550 Y NA NDUFB4 NA NA NA NA NDUFB4 48248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 NA NA NA NA NA GOLGB1 92054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 122463361 122463618 122463490 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 47053 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 122493180 122493752 122493620 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 16919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124708345 124708776 124708566 Y NA NA NA NA NA NA HEG1 64026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124770854 124771405 124771326 Y HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 1397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124773884 124774020 124773942 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 1082 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124786089 124786383 124786283 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 13287 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 124964412 124964802 124964608 Y NA SLC12A8 SLC12A8 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A8 31219 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 125053590 125053890 125053754 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A8 57569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 126074775 126075511 126074965 Y ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15 KLF15 NA NA NA NA KLF15 490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 126259496 126259659 126259567 Y ZXDC CHST13 NA NA NA NA CHST13 18370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 PLXNA1 NA NA NA NA PLXNA1 15639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 127298108 127298175 127298142 Y NA MCM2,TPRA1,PODXL2 NA NA NA NA MCM2 16891 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 127453672 127453937 127453742 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 63894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 127469268 127470071 127469577 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 69980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 127470580 127470980 127470857 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 69071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 127487223 127487760 127487461 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 52291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128267469 128267837 128267725 Y NA NA GATA2 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-475N22.4 61414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 128967680 128967946 128967799 Y NA NA NA NA NA NA H1FX 65174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 129436791 129437287 129437073 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 113130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 129519745 129520139 129519943 Y H1FOO NA NA NA NA NA TMCC1 90280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 131090710 131090810 131090760 Y NA NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16 NA NA NA NA RP11-933H2.4 7509 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 133289121 133289251 133289178 Y SRPRB CDV3 CDV3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDV3 1323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 133811108 133811508 133811147 Y SLCO2A1 SLCO2A1 SLCO2A1,C3orf36 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO2A1 42080 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 134031444 134031760 134031541 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-200A1.1 1026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 134034499 134034569 134034531 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-200A1.1 4081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 15282 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr3 134047160 134047394 134047241 Y ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 16742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr3 134050159 134050571 134050486 Y AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 19741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr3 134053436 134053779 134053672 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 19624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 134145641 134145965 134145857 Y NA NA ANAPC13,AMOTL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL2 53320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 135615560 135615771 135615666 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 66744 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 136631651 136631818 136631718 Y NA IL20RB NA NA NA NA IL20RB 31254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 138594717 138594956 138594896 Y NA PIK3CB NA NA NA NA PIK3CB 42937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 82539 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 139018358 139018692 139018412 Y FOXL2,C3orf72 NA BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 87882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 141129371 141129776 141129494 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 74113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 141131172 141131505 141131226 Y SLC25A36,RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 72384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 142804014 142804376 142804307 Y NA CHST2 CHST2 K562 ChIA-PET 22265404 CHST2 31797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr3 146031799 146032049 146031857 Y PLSCR4 NA PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 64833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P20 218998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA TM4SF1 NA NA NA NA TM4SF1 35671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 149669691 149669713 149669697 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 14459 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr3 150478267 150478712 150478564 Y TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2 SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 150943935 150944361 150944164 Y P2RY14 NA NA NA NA NA GPR87 88379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 154788699 154789128 154788815 Y NA MME MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 48786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 156849691 156850000 156849844 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 26549 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 157053563 157053826 157053695 Y NA NA NA NA NA NA PTX3 98752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 157248921 157249245 157249148 Y NA VEPH1 C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1 IMR90 Hi-C 24141950 VEPH1 163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1,RP11-379F4.4,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 158491929 158492257 158492161 Y NA MFSD1,RP11-379F4.4,RARRES1 RARRES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RARRES1 43444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 159465414 159465509 159465463 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 239028 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 159480182 159480541 159480238 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 223996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 159538960 159539273 159539207 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 165264 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 164060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 162020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 159647586 159647883 159647684 Y NA NA IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 56654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 159765726 159765787 159765757 Y NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 61189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 167659472 167659590 167659531 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 152173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 167769401 167769602 167769443 Y NA GOLIM4 NA NA NA NA GOLIM4 42161 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 168930237 168930275 168930257 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 449131 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 170420897 170421107 170421029 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 36047 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 10240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 170463049 170463502 170463289 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 5895 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr3 170527099 170527304 170527203 Y EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 170529231 170529401 170529316 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 56871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 170627321 170627621 170627516 Y EIF5A2 RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA EIF5A2 2839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 170712510 170712744 170712722 Y SLC2A2 NA NA NA NA NA EIF5A2 88028 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 170807604 170807852 170807633 Y NA NA NA NA NA NA EIF5A2 183122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 172366671 172366874 172366806 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 60134 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 172377276 172377377 172377327 Y NA NCEH1 NA NA NA NA NCEH1 49631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 173176022 173176131 173176077 Y NA NA NA NA NA NA NLGN1 63948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 174157357 174157932 174157609 Y NA NAALADL2 NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 2994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 90712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 177623981 177624160 177624047 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 91328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 178752797 178753279 178753036 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 34788 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 178754661 178754788 178754723 Y KCNMB3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 33279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 318687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 179850996 179851355 179851175 Y NA NA NA NA NA NA TTC14 466563 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 181035769 181036114 181035791 Y SOX2,DNAJC19,DNAJC19 NA NA NA NA NA DNAJC19 330207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 183089068 183089238 183089169 Y B3GNT5,KLHL6 NA NA NA NA NA MCF2L2 55328 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 185374091 185374577 185374335 Y NA NA NA NA NA NA SENP2 75807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 77293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 190284228 190284576 190284349 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 54388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 191049369 191049653 191049414 Y NA CCDC50 NA NA NA NA CCDC50 4503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-135A1.3 219504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-135A1.3 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 RP11-135A1.3 NA NA NA NA HES1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 194227767 194228126 194227819 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 10674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 194290837 194291591 194291263 Y HES1,ATP13A3 TMEM44-AS1 FLJ34208,ATP13A3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 11149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 194296552 194296878 194296640 Y HES1,ATP13A3 TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 5862 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 194319358 194319899 194319518 Y LRRC15 TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44 NA NA NA NA TMEM44-AS1 16618 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 4439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 195153778 195154174 195153996 Y NA ACAP2 NA NA NA NA ACAP2 7633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 179157 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 AC011322.1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 196784656 196784743 196784700 Y CEP19,PIGX,PAK2 MFI2 NA NA NA NA MFI2 29969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 197033346 197033465 197033406 Y DLG1 DLG1 NA NA NA NA DLG1 9175 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 197036480 197036785 197036693 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 12309 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 AC128709.2 61396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 197190389 197190580 197190458 Y NA AC128709.2 DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC128709.2 7113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 197214864 197215009 197214889 Y NA AC128709.2 DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 AC128709.2 31588 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 197216995 197217339 197217145 Y DLG1 AC128709.2 NA NA NA NA AC128709.2 33719 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA NA NA NA NA NA AC128709.2 71288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 873387 873975 873731 Y NA NA NA NA NA NA GAK 50186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1184509 1184886 1184846 Y RNF212,CRIPAK NA NA NA NA NA CTBP1 56855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1769544 1769746 1769644 Y FGFR3 TMEM129,TACC3,FGFR3 FGFR3 MCF7 ChIA-PET 22265404 FGFR3 23288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 1874737 1875082 1874826 Y WHSC1 LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 3586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 73060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 3228357 3228568 3228469 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 64187 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 4854782 4854915 4854832 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 4478 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 4855584 4855774 4855697 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 3619 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 5760535 5760807 5760671 Y NA EVC NA NA NA NA EVC 49611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 7969878 7969938 7969908 Y SH3TC1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 30225 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 7972368 7972631 7972565 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 32715 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 7974971 7975417 7975298 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 35318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 7978189 7978377 7978271 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 38536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 7999396 7999553 7999475 Y ABLIM2 NA NA NA NA NA AFAP1 59743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 10182678 10183260 10182921 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 66105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 13329661 13329866 13329822 Y NA HSP90AB2P HSP90AB2P IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AB2P 3172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 13908947 13909321 13909089 Y NA NA LOC441009,CPEB2,LOC152742 IMR90 Hi-C 24141950 AC006445.7 276724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15533007 15533164 15533086 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 63518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 26707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr4 15895700 15895839 15895750 Y FGFBP1 FGFBP1 CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 42524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 15915213 15915572 15915412 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 22791 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 15922988 15923279 15923080 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 15084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 16186973 16187010 16186992 Y NA TAPT1 NA NA NA NA TAPT1 40023 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 373572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 17495942 17496188 17496050 Y MED28,LAP3 QDPR NA NA NA NA QDPR 15669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 87828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 25828026 25828318 25828201 Y NA SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 35064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 25972032 25972237 25972135 Y NA NA RBPJ,C4orf52,TBC1D19,STIM2,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 108650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 26123354 26123506 26123386 Y NA RBPJ RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 39571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 26347905 26348036 26347971 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 184828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 26689488 26689564 26689526 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 113429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 33064964 33065218 33065098 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 2344927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 33937784 33937916 33937850 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2306215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1220976 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 36078000 36078189 36078065 Y DTHD1,ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 165942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 36191564 36191723 36191675 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 52408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 38102941 38103486 38103298 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 142885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr4 38147438 38147709 38147590 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 187382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38159115 38159505 38159287 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 199059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38320550 38320897 38320770 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 4113 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38671040 38671097 38671090 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 6536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38674773 38675062 38674906 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 10269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 7536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 38870386 38870769 38870503 Y FAM114A1 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 39638477 39638619 39638541 Y C4orf34 NA NA NA NA NA UBE2K 59045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 40578690 40579499 40579160 Y RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 522244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 40620437 40620847 40620835 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 563991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APBB2 541382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 40997224 40997582 40997567 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 219149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 40998550 40998604 40998585 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 218127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 41197133 41197282 41197239 Y NA APBB2 NA NA NA NA APBB2 19449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 41384257 41384615 41384267 Y NA LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 24633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 41413971 41414162 41414067 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 54347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 41509451 41509766 41509557 Y LIMCH1 NA NA NA NA NA LIMCH1 149827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 41573569 41573937 41573753 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 213945 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 46723004 46723195 46723100 Y GABRA4 RAC1P2 NA NA NA NA RAC1P2 1430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 47121817 47122010 47121920 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 341726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 47308450 47308659 47308604 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 155077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 47464691 47464980 47464836 Y NA COMMD8,ATP10D NA NA NA NA COMMD8 955 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 47495543 47495885 47495605 Y COMMD8 COMMD8,ATP10D NA NA NA NA ATP10D 10238 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 55501453 55501772 55501575 Y KIT NA NA NA NA NA PDGFRA 408189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 56419632 56419978 56419838 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 8327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 57132335 57132393 57132366 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP31 87908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA RP11-396M11.1 NA NA NA NA RP11-396M11.1 2746 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 69219009 69219244 69219130 Y NA YTHDC1 NA NA NA NA YTHDC1 5202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74570970 74571346 74571160 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 32877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74588737 74589023 74588915 Y ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 15200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74591640 74592145 74591915 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 12078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 10425 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 74974850 74975280 74974976 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 2611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SEPT11 356995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 324882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 77674311 77674688 77674546 Y SEPT11 NA NA NA NA NA SEPT11 194168 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 79473983 79474151 79474067 Y ANXA3 ANXA3 NA NA NA NA ANXA3 3310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 14255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 79579251 79579554 79579361 Y BMP2K LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 14194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 81228486 81228584 81228534 Y NA FGF5,C4orf22 NA NA NA NA C4orf22 26290 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 81229160 81229644 81229481 Y NA FGF5,C4orf22 NA NA NA NA C4orf22 25230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 83681282 83681423 83681411 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 36587 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 84773321 84773491 84773400 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 318254 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 85798168 85798515 85798434 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 87023 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 86684588 86684743 86684670 Y ARHGAP24 NA NA NA NA NA ARHGAP24 290321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 87849171 87849370 87849272 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 4784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 87881950 87882282 87882116 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 12674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 87882810 87883321 87882982 Y KLHL8,AFF1,AFF1 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 13534 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 87920181 87920277 87920229 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 50905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 88038562 88038726 88038648 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 120740 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 88128695 88128755 88128733 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30711 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 88899947 88900287 88900059 Y NA SPP1,RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA SPP1 5128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 3942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 100325584 100326020 100325850 Y ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C NA NA NA NA NA ADH5 317632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 102153053 102153484 102153407 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 113453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 103483964 103484649 103484311 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 63478 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 105981759 105982082 105982008 Y TET2,TET2 NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 82950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 106227483 106227804 106227645 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 162451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 107955286 107955747 107955665 Y DKK2 NA NA NA NA NA PAPSS1 683861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA RP11-115A14.1 21210 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA RP11-269F21.3 258735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 113172339 113172711 113172527 Y NEUROG2 AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA AP1AR 21446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 120024463 120024846 120024696 Y NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 106896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 122077221 122077584 122077249 Y TNIP3 NA NA NA NA NA TNIP3 69037 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 123685251 123685615 123685333 Y FGF2 BBS12 NA NA NA NA BBS12 33394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 123705556 123705703 123705648 Y NA FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40160 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 123719302 123719557 123719375 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 26306 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 124398959 124399392 124399124 Y NA NA NA NA NA NA SPATA5 556730 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 129275726 129275798 129275762 Y NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 67742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 129438976 129439122 129439055 Y NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 230992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 129474102 129474409 129474120 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 266118 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 130505538 130505741 130505620 Y C4orf33 NA NA NA NA NA SCLT1 492774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 134046475 134046584 134046530 Y NA PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 21886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 138974806 138975089 138974892 Y NA SLC7A11-AS1 NA NA NA NA SLC7A11-AS1 1529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 138975341 138975477 138975408 Y NA SLC7A11-AS1 NA NA NA NA SLC7A11-AS1 1141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 141581582 141581699 141581656 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D9 93575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 144276815 144277022 144276900 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 20900 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 144981582 144981869 144981726 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA5 548966 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 146833675 146833816 146833746 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 23971 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 148746659 148746986 148746792 Y PRMT10,ARHGAP10 NA NA NA NA NA ARHGAP10 95445 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 149364278 149364693 149364534 Y NR3C2 NR3C2 NA NA NA NA NR3C2 428 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 150808373 150808555 150808464 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 1126324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 150977820 150977939 150977880 Y NA NA DCLK2 IMR90 Hi-C 24141950 LRBA 956940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 151769111 151769151 151769130 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 165728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 152033251 152033470 152033361 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 14526 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 152406480 152406763 152406721 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 78112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 154248193 154248592 154248328 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 15209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 154463481 154463580 154463534 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0922 77983 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 164871108 164871241 164871176 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 785035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 164876357 164876532 164876526 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 790284 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA NACA3P 651653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 NACA3P,TRIM61 NA NA NA NA TRIM61 14196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 166247009 166247140 166247075 Y NA MSMO1,CPE NA NA NA NA MSMO1 234 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 166315734 166315907 166315821 Y NA CPE NA NA NA NA CPE 35388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 167356237 167356241 167356239 Y NA NA NA NA NA NA CPE 1075891 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 169378098 169378392 169378240 Y NA PALLD NA NA NA NA PALLD 37825 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 169408175 169408648 169408311 Y DDX60,DDX60L PALLD,DDX60L DDX60,DDX60L,PALLD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PALLD 7569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 169509077 169509260 169509148 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 52140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 170030173 170030283 170030178 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 100747 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 174112212 174112389 174112298 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 23409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 177191849 177192202 177191988 Y ASB5 SPCS3 SPATA4 IMR90 Hi-C 24141950 SPCS3 46913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 177715411 177715680 177715585 Y VEGFC VEGFC NA NA NA NA VEGFC 3530 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 177824075 177824477 177824359 Y NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 112194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 183397757 183397986 183397872 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 333355 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 183481652 183481875 183481779 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 355214 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 183536176 183536411 183536208 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 300678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 183564955 183565246 183565103 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 271843 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 184256615 184256836 184256706 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 106908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 185324238 185324411 185324337 Y ACSL1,IRF2,CASP3 NA NA NA NA NA IRF2 69323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 186481104 186481365 186481225 Y NA PDLIM3 PDLIM3,SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM3 26338 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 187371571 187371697 187371634 Y NA NA NA NA NA NA CYP4V2 260897 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 187591076 187591113 187591095 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 54763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr4 187597728 187597911 187597833 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 47965 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr4 187614690 187615080 187614853 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 30796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 162156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 6373242 6373393 6373318 Y NA MED10 NA NA NA NA MED10 3314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 3.11938007900521 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 168 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 9547741 9548115 9547963 Y NA SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 3429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 10551479 10551871 10551616 Y NA ANKRD33B MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33B 10571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 10562652 10562841 10562738 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 210 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14034644 14034850 14034764 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 91992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14114865 14115129 14114997 Y NA TRIO TRIO IMR90 Hi-C 24141950 TRIO 26682 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 14204877 14205144 14204973 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 63066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14208272 14208510 14208423 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 66461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14408020 14408375 14408038 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 171509 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 16855522 16855861 16855692 Y NA CTB-55B8.1 NA NA NA NA CTB-55B8.1 44889 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 16898106 16898497 16898302 Y MYO10 CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 2253 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 17249327 17249860 17249454 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP133 93865 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 17255490 17256325 17255691 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 87400 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 18391290 18391435 18391363 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 343631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 21397863 21398161 21398050 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 57921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 24155781 24155941 24155882 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 653649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1100991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.22033775394823 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 623119 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1292603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 33343896 33344023 33343967 Y NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2203K17.1 94702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 33789074 33789288 33789217 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 101009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 33807297 33807469 33807384 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 82828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 34525926 34526105 34525960 Y NA NA RAI14,RAD1,BRIX1,TTC23L,DNAJC21 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 128237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 34571249 34571361 34571303 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 34710052 34710312 34710173 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 55710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 34717862 34718081 34717968 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 63520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 36740224 36740324 36740257 Y NA NA LOC646719,NIPBL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 NIPBL 134537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 38672702 38672722 38672712 Y NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 66246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 39519768 39520016 39519839 Y DAB2 NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 59366 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 55101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 54840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 50677492 50677845 50677668 Y NA ISL1 NA NA NA NA ISL1 571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 59200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 52715258 52715483 52715372 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 58756 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 54751142 54751459 54751301 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 73070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST NA NA NA NA IL6ST 784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 55643078 55643375 55643183 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 155524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA ACTBL2 PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 44663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 39040 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 56738135 56738571 56738168 Y ACTBL2 ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 38065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 56784239 56784594 56784302 Y GPBP1,ACTBL2 ACTBL2 PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 7603 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 56790461 56790772 56790742 Y NA ACTBL2 ACTBL2,PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 13825 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 57076259 57076553 57076406 Y NA NA PLK2,GPBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 299623 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 57099848 57100234 57100012 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 323212 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 335279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 336178 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr5 57117655 57118000 57117917 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 341019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 344185 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 57122032 57122386 57122209 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 345396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 57133445 57133721 57133581 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 356809 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 57137483 57137861 57137645 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 360847 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr5 57158264 57158637 57158547 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 381628 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 60526663 60526879 60526778 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 99221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64486221 64486631 64486280 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 289116 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64498189 64498386 64498364 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 277361 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64504102 64504227 64504158 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 271520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64505244 64505511 64505327 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 270236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 64796548 64796879 64796719 Y PPWD1,CENPK ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 20801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 65814686 65814967 65814740 Y MAST4 NA NA NA NA NA MAST4 75209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 65918246 65918267 65918259 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 28070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 66597093 66597537 66597250 Y NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 706917 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 67752610 67752698 67752666 Y PIK3R1 NA PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIK3R1 243062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 71804159 71804292 71804254 Y ZNF366 NA NA NA NA NA MRPS27 189686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 72792808 72793048 72792966 Y NA BTF3 NA NA NA NA BTF3 575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr5 72995047 72995144 72995131 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 135536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 73114160 73114455 73114328 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 254649 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 73439577 73439790 73439675 Y ENC1 NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 HEXB 494058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 73612322 73612454 73612340 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 73839049 73839165 73839086 Y NA NA CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 HEXB 94683 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 74861939 74862072 74862007 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 55976 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 77581141 77581448 77581332 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 7131 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77779546 77779957 77779719 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 125207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77802337 77802767 77802745 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 147998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 77825252 77825732 77825631 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 170913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77826174 77826769 77826484 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 171835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77829299 77829474 77829415 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 174960 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 77882234 77882399 77882291 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 181445 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 77892981 77893377 77893333 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 170467 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 78056204 78056542 78056372 Y NA LHFPL2 NA NA NA NA LHFPL2 7302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 80564528 80564843 80564784 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 30536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 80579237 80579431 80579394 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 15948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN NA NA NA NA NA RNU4-11P 327634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 326678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 78798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 83214867 83215139 83214962 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA RNU4-11P 117494 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 83219939 83220298 83220055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 122566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 83221150 83221158 83221154 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 123777 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 83674189 83674553 83674373 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 3692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 87530742 87531117 87530930 Y NA TMEM161B-AS1,TMEM161B NA NA NA NA TMEM161B-AS1 31595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 94033836 94034405 94034124 Y KIAA0825,ANKRD32 NA NA NA NA NA KIAA0825 81527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 55218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 95406696 95406840 95406768 Y NA RP11-254I22.1 ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 22877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 31077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 96217415 96217751 96217602 Y CAST,CAST ERAP2 NA NA NA NA ERAP2 7772 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 97445347 97445652 97445445 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr5 97643613 97643769 97643691 Y NA CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 28679 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 97650049 97650331 97650134 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 22117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 106802102 106802350 106802226 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 202246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 106837531 106838094 106837969 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 166502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 106907307 106907511 106907485 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 108251515 108251852 108251684 Y NA NA NA NA NA NA FER 169992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 109079577 109079706 109079642 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 56510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 110790342 110790723 110790533 Y NA NA NA NA NA NA STARD4 55565 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 111342511 111342737 111342622 Y STARD4 NA NREP,LOC100505678 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L4A-AS1 151486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 112825129 112825430 112825300 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA MCC 2602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 114755701 114755980 114755870 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 122611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 119940626 119940961 119940736 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 142653 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 121516793 121517196 121516968 Y LOX,LOX NA NA NA NA NA LOX 104813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 121519182 121519443 121519230 Y NA NA NA NA NA NA LOX 107202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 404650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 126708435 126708706 126708571 Y NA NA NA NA NA NA PRRC1 142595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 130970028 130970178 130970095 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 1099 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 22572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 131604535 131604860 131604707 Y NA PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 13171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA IRF1 NA NA NA NA IRF1 29002 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 38489 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA AC005355.2 PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 22887 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA AC005355.2 51369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 141201064 141201327 141201197 Y PCDH1 NA PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 55484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 142562980 142563339 142563259 Y NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 146831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 142580387 142580630 142580509 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 129540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 144740586 144740760 144740654 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 472172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 144741919 144742138 144742043 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 470794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 145326011 145326414 145326305 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 11869 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 145356389 145356594 145356491 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 42247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 145724324 145724652 145724327 Y GPR151,GRXCR2 NA NA NA NA NA TCERG1 100222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 103475 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 148293572 148293925 148293745 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 89416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA ADRB2 148427 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 148832906 148833066 148832986 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 95941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 148835583 148835880 148835720 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 93127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149667554 149667894 149667725 Y SYNPO,SLC6A7,CAMK2A ARSI NA NA NA NA ARSI 48976 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 149668238 149668366 149668283 Y SYNPO,SLC6A7,CAMK2A ARSI NA NA NA NA ARSI 48504 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149696810 149697163 149696894 Y SYNPO,PDGFRB ARSI,TCOF1 SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 ARSI 19707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 149840923 149841036 149840980 Y SYNPO,ZNF300 RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 NDST1,SYNPO,RBM22,DCTN4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS14 13604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 149849253 149849476 149849346 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 13905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 149852669 149852742 149852704 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 10639 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 152730391 152730628 152730512 Y GRIA1 NA NA NA NA NA MFAP3 685838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 154313326 154313392 154313358 Y NA GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA GEMIN5 2377 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 157030326 157030804 157030600 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 29543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 158886935 158887155 158887040 Y RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA UBLCP1 198846 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 48187 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 589726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 491436 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 167230041 167230378 167230210 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 486278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 167298999 167299254 167299082 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 417402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 167343894 167343960 167343927 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 372696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 167372516 167372785 167372694 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 343871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 276566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 167716783 167717259 167717053 Y NA WWC1 NA NA NA NA WWC1 127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 25142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 137638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 170179191 170179549 170179383 Y GABRP NA NA NA NA NA NPM1 632571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 250189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 171702162 171702431 171702281 Y DUSP1,UBTD2,STK10 UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 6644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 171847636 171847998 171847816 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 31529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172064248 172064489 172064361 Y NA NEURL1B,CTB-79E8.3 NA NA NA NA NEURL1B 1780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172160207 172160396 172160286 Y NA DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.93588713318138 chr5 172167900 172168183 172168030 Y UBTD2,DUSP1 DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 28015 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 172202171 172203025 172202666 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 5973 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172226784 172227709 172227394 Y ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 30586 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 172262088 172262814 172262509 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 2810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172308731 172309533 172309021 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 49453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172313877 172314602 172314167 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 54599 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr5 172314817 172315056 172314937 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 55539 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr5 172327024 172327318 172327167 Y NA NA NA NA NA NA RPL26L1 56414 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr5 172380663 172381064 172380838 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 2668 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 173208911 173209406 173209234 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 103877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 173252274 173252478 173252451 Y NA NA BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 60805 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr5 178741194 178741503 178741376 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 28928 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 179386785 179386995 179386917 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA TBC1D9B 53926 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 179461499 179461900 179461782 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 35218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 179894931 179895217 179894999 Y NA CTC-573N18.1,CNOT6 GFPT2,MAPK9,CNOT6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT6 24195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 TRIM41 NA NA NA NA TRIM41 36142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 13382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 12696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 2980500 2980669 2980575 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NQO2 5552 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3789456 3789809 3789635 Y NA PXDC1 SLC22A23,PXDC1,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 39196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 401666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NA NA NA NA NA FARS2 749610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 447821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 7505623 7505742 7505694 Y RREB1,DSP DSP DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 34066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 7692548 7692711 7692643 Y NA BMP6 PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP6 32319 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 9037386 9037741 9037564 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 603592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 9503675 9503928 9503802 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 913964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 10316491 10316897 10316818 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 100995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 10719904 10720278 10720060 Y NA PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA TMEM14C 870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 11609469 11609947 11609818 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 73531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 11615625 11615765 11615678 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 79687 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 233485 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 12729754 12730156 12729835 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 217412 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 13009334 13009508 13009424 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 202780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 13059086 13059210 13059117 Y PHACTR1 NA NA NA NA NA RNU1-11P 153078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 13107797 13107872 13107835 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 104416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 13383914 13384048 13383981 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,GFOD1 NA NA NA NA NA TBC1D7 57099 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 13709903 13710182 13710119 Y TBC1D7,CD83,RANBP9 RANBP9 SIRT5,NOL7 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 107 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 15541251 15541598 15541282 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 119691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 16215873 16216103 16215954 Y MYLIP GMPR GMPR,JARID2,DTNBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GMPR 20708 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 16684094 16684384 16684208 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74985 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 17729455 17729796 17729624 Y NA NUP153 NUP153 K562 ChIA-PET 22265404 NUP153 24799 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 17932767 17932988 17932837 Y RNF144B,KDM1B NA NA NA NA NA KIF13A 52866 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 18327832 18328148 18328035 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 38631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 19147287 19147423 19147355 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 655560 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 21129910 21130117 21129994 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 461855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 24323980 24324360 24324286 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 NA NA NA NA NA MRS2 76793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 24981053 24981388 24981201 Y NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 183405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27065086 27065154 27065121 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH NA NA NA NA HIST1H2BJ 33387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA NA NA NA NA NA RP11-209A2.1 123656 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 128816 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 29949488 29949840 29949664 Y NA HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-J 22520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30175844 30176213 30176153 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30448319 30448624 30448479 Y NA RANP1,HLA-E MRPS18B,PPP1R10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RANP1 3093 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30719576 30719814 30719695 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9245 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 27125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 55704 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 30811913 30812084 30812025 Y NA DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 30114 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 32050642 32051035 32051003 Y LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL NA NA NA NA TNXB 30076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA TNXB 8834 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA TNXB 4932 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA TNXB 541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 33129390 33129479 33129402 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 36743 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 33159164 33159383 33159309 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 6839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 34624445 34624747 34624649 Y TAF11 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37889 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 35185451 35185811 35185631 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 38875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 35336371 35336758 35336422 Y NA PPARD NA NA NA NA PPARD 28036 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36264933 36265263 36265049 Y MAPK13,BRPF3,SRSF3,PXT1,KCTD20,CDKN1A,CDKN1A NA NA NA NA NA ETV7 88901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36330558 36330875 36330837 Y NA ETV7 NA NA NA NA ETV7 23289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36399958 36400295 36400126 Y NA ETV7,KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 8249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36404249 36404468 36404378 Y MAPK14,PNPLA1,STK38 KCTD20 ETV7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD20 4076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 LAP3P2 10591 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 36821118 36821514 36821315 Y NA CPNE5,C6orf89,PPIL1 CPNE5 IMR90 Hi-C 24141950 CPNE5 15340 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 37095912 37096089 37096014 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 39890 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 37212541 37212901 37212835 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 10647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TMEM217 3126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 37673124 37673343 37673226 Y NA MDGA1 MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 MDGA1 8042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 39171657 39171958 39171719 Y NA KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 23268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 40904550 40904902 40904649 Y UNC5CL NA APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 133782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 41456339 41456683 41456511 Y NA NA FOXP4,TFEB,MDFI IMR90,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 55481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 42067343 42067714 42067701 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 40643 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 42335050 42335266 42335166 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA MRPS10 151447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 108733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 108038 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 42735698 42735757 42735728 Y NA ATP6V0CP3,TBCC TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 23140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 42944777 42944970 42944923 Y NA CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 43295599 43295850 43295834 Y TJAP1 CRIP3,ZNF318 NA NA NA NA CRIP3 21064 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 43774176 43774478 43774332 Y NA VEGFA NA NA NA NA VEGFA 38255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 44010067 44010199 44010133 Y C6orf223 RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 29451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 12297 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 44040704 44041103 44040711 Y C6orf223,NFKBIE RP5-1120P11.3 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 1054 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 44443307 44443732 44443616 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 90045 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 44594803 44595107 44595003 Y AARS2 NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 241541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 44706347 44706582 44706475 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 353085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 45317803 45318343 45317888 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 25347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 45557969 45558292 45558091 Y NA NA RUNX2,CDC5L,SUPT3H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 214279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 45575518 45575910 45575680 Y NA NA RUNX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUPT3H 231828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 46259169 46259392 46259281 Y ENPP4,SLC25A27 NA NA NA NA NA ENPP5 122461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 49508939 49509088 49508998 Y NA NA NA NA NA NA CENPQ 79848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA RP3-437C15.1 NA NA NA NA RP3-437C15.1 1925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 52247517 52247853 52247539 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 23298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 52377018 52377269 52377212 Y GSTA5,TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 62444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 53165916 53166137 53165996 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 45810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr6 53617793 53617916 53617855 Y NA LRRC1 LRRC1,GCLC IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 39379 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 53678166 53678361 53678262 Y NA LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 20871 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 54845767 54846152 54846043 Y GFRAL NA NA NA NA NA FAM83B 136198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 56543882 56543906 56543894 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 DST 273520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 56578288 56578394 56578341 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 DST 239032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA DST,BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DST 5393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 57251417 57251660 57251585 Y KIAA1586 NA NA NA NA NA PRIM2 73814 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 64629183 64629230 64629207 Y NA NA NA NA NA NA RP11-59D5__B.2 114454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 71960082 71960298 71960205 Y OGFRL1 OGFRL1 OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 36208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 72103736 72104124 72104114 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 7200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.38540829570987 chr6 72683550 72683736 72683643 Y RIMS1 NA NA NA NA NA KRT19P1 391126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 55167 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 60647 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 74861347 74861685 74861516 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 457839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 79043157 79043230 79043194 Y NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 531959 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 80220281 80220611 80220519 Y NA LCA5 NA NA NA NA LCA5 24564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 81044268 81044294 81044292 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 229904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 81197510 81197656 81197595 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 383146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 81253590 81253803 81253687 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 439226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 84917634 84917758 84917696 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 17595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 85834833 85835082 85834958 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 322727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 89090505 89090612 89090559 Y CNR1 NA NA NA NA NA ACTBP8 105797 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 89758081 89758394 89758222 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 30076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 100008682 100008928 100008805 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 5921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 330995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 106645133 106645598 106645505 Y PRDM1 NA NA NA NA NA ATG5 126068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 108143478 108143727 108143556 Y SCML4 NA NA NA NA NA SEC63 133666 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 108435932 108436209 108436071 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1,SEC63 IMR90,H1ESC,GM12878,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 OSTM1 48849 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 110456590 110456951 110456841 Y WASF1,CDC40,C6orf186 WASF1,CDC40 NA NA NA NA WASF1 42256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111720734 111721265 111721077 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 81449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111784023 111784230 111784203 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 18484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111889822 111890007 111889856 Y REV3L TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 35474 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 112134730 112134859 112134835 Y NA NA NA NA NA NA FYN 57796 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 112145008 112145393 112145362 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 47262 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 112525181 112525504 112525289 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 48637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 112573913 112574044 112574030 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 97 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 113505450 113505765 113505678 Y NA NA FLJ34503,MARCKS,HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 670776 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 502546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 113966975 113967088 113966980 Y MARCKS NA MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCKS 209453 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 200356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 116707738 116708095 116707832 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 108672 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 116708158 116708375 116708238 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 121759226 121759877 121759689 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 4388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 122016612 122016787 122016747 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 243345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 130921923 130922144 130922034 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 237044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 130922387 130922557 130922422 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 237508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 131327805 131328036 131327854 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L2 54426 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 131375294 131375442 131375382 Y NA EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 7020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 134679459 134679725 134679553 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 42209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 134684660 134684778 134684697 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 47410 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 134742048 134742399 134742278 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 135231583 135231692 135231635 Y NA ALDH8A1 NA NA NA NA ALDH8A1 37568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 136133495 136133602 136133548 Y NA NA PDE7B,LINC00271 IMR90 Hi-C 24141950 AHI1 316581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 137555218 137555651 137555304 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 16632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 138085431 138085825 138085756 Y NA NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 100526 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 139724388 139724651 139724520 Y NA CITED2 CITED2,TXLNB,LOC645434,LOC100132735 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 30631 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 140069895 140070090 140070024 Y NA NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 376138 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 140383051 140383491 140383322 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 689294 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 140807335 140807614 140807478 Y NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1113578 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 142335769 142335959 142335859 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 130408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr6 143223836 143224147 143224035 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 40191 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 144479850 144480240 144479875 Y NA STX11,TPT1P4 NA NA NA NA STX11 10187 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA UTRN UTRN IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 19137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA UTRN UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 17469 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 146866760 146867250 146866919 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 3931 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 147200853 147201003 147200933 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 322558 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 148588961 148589218 148589102 Y UST SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 2222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 149429145 149429475 149429310 Y NA NA ZC3H12D,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 108302 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 149657882 149658028 149657899 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 120105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 149798853 149798873 149798863 Y ZC3H12D NA NA NA NA NA PPIL4 66301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11,RAET1E NA NA NA NA LRP11 686 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 150200694 150201094 150200866 Y NA LRP11,RAET1E,RAET1G NA NA NA NA RAET1E 16144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 151090718 151090960 151090871 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA MTHFD1L 93725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 151392463 151392726 151392659 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 25939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 152497154 152497169 152497162 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 459767 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 152583976 152584217 152584151 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 372719 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 152634983 152635621 152635105 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 321315 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 12.4775203160209 chr6 155492232 155492854 155492387 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 83004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 156571786 156572058 156571922 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 525005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 157857242 157857636 157857360 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC14 57077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 158808734 158809093 158808911 Y TMEM181 NA NA NA NA NA GTF2H5 221350 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 159195572 159195684 159195582 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 42760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32985 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 35481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 160137124 160138386 160137829 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 6231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 161646912 161646998 161646955 Y NA AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 46095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 161855973 161856365 161856002 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 163776294 163776859 163776538 Y QKI NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 56173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 163972161 163972427 163972234 Y NA NA NA NA NA NA QKI 139129 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 166067950 166069085 166068916 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 329006 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 166689031 166689408 166689363 Y PRR18 NA RPS6KA2 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D1 64671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr6 168356861 168357132 168356996 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 131259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 168558082 168558596 168558447 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 332480 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 251753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 169470702 169471012 169470790 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 90007 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr6 169473606 169473776 169473633 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 87243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr6 169495883 169496177 169495989 Y NA NA PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 64842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 169497404 169497715 169497550 Y THBS2 NA PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 63304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr6 169569548 169569688 169569622 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 8529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr6 169573934 169574190 169574061 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 12915 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA RP11-417E7.1 WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 27461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 169690222 169690462 169690289 Y NA THBS2 NA NA NA NA THBS2 38083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 170449336 170449548 170449442 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 148013 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr6 170654095 170654292 170654195 Y FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 56304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 101307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 875702 875833 875757 Y SUN1,SUN1 SUN1,GET4 NA NA NA NA SUN1 22174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 919141 919296 919237 Y NA GET4 NA NA NA NA GET4 4952 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1270215 1270604 1270440 Y UNCX NA NA NA NA NA ZFAND2A 71820 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1616013 1616182 1616098 Y ELFN1 MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 TFAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 7372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1709256 1709641 1709356 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 100615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 1945683 1945719 1945693 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 325159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2351826 2352447 2352374 Y SNX8 EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 39274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2569854 2570215 2570046 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2672306 2673216 2673099 Y LFNG,TTYH3 TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 2721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2676969 2677494 2677317 Y LFNG TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 7384 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2749963 2750288 2750147 Y LFNG,LFNG,CARD11 AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 32807 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 2843425 2843709 2843567 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 29546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 2960647 2961036 2960906 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 78689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 2980860 2981267 2981182 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 98902 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 3022606 3022704 3022655 Y LFNG,LFNG,CARD11 NA NA NA NA NA CARD11 58875 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 3453682 3454067 3453904 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 114602 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 4723112 4724257 4723950 Y NA FOXK1 NA NA NA NA FOXK1 41724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12,RADIL NA NA NA NA RADIL 7663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 5740810 5741077 5740967 Y WIPI2,ACTB,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 78293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 7197591 7197789 7197703 Y C1GALT1 C1GALT1 COL28A1 IMR90 Hi-C 24141950 C1GALT1 3026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 7604061 7604281 7604173 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 222 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 12759260 12759464 12759402 Y NA ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34779 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 17409796 17409963 17409863 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 72815 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 18483962 18483986 18483974 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 505838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 18548166 18548343 18548284 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 570042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 18560411 18560650 18560558 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 582287 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 18824817 18824988 18824903 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 330307 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 22861021 22861212 22861181 Y NA TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA TOMM7 551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 23060904 23061101 23061016 Y IL6,FAM126A FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 9155 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 24860577 24860798 24860662 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53333 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 24875802 24875986 24875894 Y NA NA NA NA NA NA DFNA5 68558 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 24947142 24947425 24947387 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 71828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 24960670 24960974 24960767 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 58279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25002827 25003181 25002973 Y C7orf31,OSBPL3 OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 16072 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr7 25010250 25010501 25010375 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 8752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr7 25068217 25068495 25068356 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 48964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25892049 25892317 25892170 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 NFE2L3 297543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 26317891 26318244 26318068 Y NA AC010677.5,SNX10 HNRNPA2B1,CBX3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC010677.5 4076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 26815721 26816027 26815980 Y SNX10,SNX10,SKAP2 NA NA NA NA NA SKAP2 216831 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA7 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 27176174 27176251 27176224 Y HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA7,HOXA10 NA NA NA NA HOXA5 5036 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 122955 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 23067 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 30500037 30500161 30500099 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 16239 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 33762230 33762341 33762268 Y NA NA BMPER,BBS9 IMR90 Hi-C 24141950 BMPER 180182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 34026970 34027411 34027080 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 84447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 36157611 36157822 36157717 Y NA EEPD1 EEPD1,KIAA0895 IMR90 Hi-C 24141950 EEPD1 32936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 36574030 36574714 36574417 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 146296 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 415606 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 37221797 37222057 37221923 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 264795 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 40961938 40962183 40962107 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 778523 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 41025919 41026252 41026112 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 714454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 41800026 41800177 41800090 Y INHBA NA NA NA NA NA INHBA 59320 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 42533163 42533415 42533331 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 257694 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 42896548 42896903 42896642 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 53001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 44426024 44426371 44426281 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 53848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 44764845 44765151 44764999 Y RAMP3 ZMIZ2 NA NA NA NA ZMIZ2 21029 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 46184955 46185274 46185142 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 225482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 46186512 46186858 46186578 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 227039 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 47390589 47390737 47390670 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 229419 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 47604317 47604552 47604435 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 15604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 47641076 47641289 47641172 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 20920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 47644474 47644665 47644612 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 24318 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 47797544 47797859 47797606 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 35030 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 48127053 48127182 48127123 Y HUS1,UPP1,UPP1 UPP1 NA NA NA NA UPP1 828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 51382954 51383359 51383079 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR CALM1P2 EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 CALM1P2 2993 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 55543241 55543436 55543358 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95245 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 55600079 55600443 55600389 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 38238 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 55600779 55601841 55601199 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 55601949 55602581 55602160 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA RP4-725G10.3 1477596 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 66159622 66159870 66159746 Y NA RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 14471 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 68171287 68171584 68171440 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 67502 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 72990459 72990574 72990513 Y NA BCL7B,TBL2 NA NA NA NA TBL2 547 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 73015142 73015298 73015257 Y NA BCL7B,TBL2 NA NA NA NA TBL2 24021 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 WBSCR22 32741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 73547862 73548178 73548020 Y NA EIF4H NA NA NA NA EIF4H 38397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 73686776 73686884 73686792 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14921 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 73866647 73867033 73866768 Y LAT2 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 75291375 75291448 75291402 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 74832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 CCL26,RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 75920543 75920716 75920673 Y NA HSPB1 HSPB1 IMR90 Hi-C 24141950 HSPB1 9145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,SRCRB4D YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG,SRCRB4D NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA SRCRB4D NA NA NA NA SRCRB4D 15680 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 77039475 77039927 77039691 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 124665 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 77910166 77910185 77910178 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 484044 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 78786871 78787189 78787030 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 293009 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 78912622 78912826 78912721 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 167372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 157068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 80512986 80513276 80513113 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 36399 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 80571600 80571811 80571745 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 21925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 81894820 81895003 81894975 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 176111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 89824940 89825230 89825139 Y NA STEAP1 NA NA NA NA STEAP1 43251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 90596654 90596860 90596743 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 294923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 90600966 90601241 90601095 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 290542 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92261903 92262272 92262087 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92264263 92264527 92264407 Y SAMD9 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 46555 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 92271612 92271814 92271678 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 92274593 92274946 92274914 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 56885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92282305 92282698 92282463 Y LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 64597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92382003 92382200 92382102 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 81597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 92412911 92413100 92413006 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 50697 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 92459714 92460134 92460069 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 3663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 92673041 92673276 92673159 Y NA NA CDK6,FAM133B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAMD9 72060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 93511378 93511666 93511551 Y BET1,TFPI2 TFPI2 NA NA NA NA TFPI2 6637 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 180994 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 95645399 95645785 95645516 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 245533 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 95877265 95877280 95877275 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 72179 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 96295796 96295968 96295882 Y FLJ42280 SHFM1 NA NA NA NA SHFM1 41235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 99969754 99970252 99970079 Y OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 32223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 100752309 100752636 100752570 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1 NA NA NA NA SERPINE1 15734 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 100757831 100758077 100757885 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 10293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 100772917 100773243 100773005 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4547 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101045498 101045795 101045583 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 82394 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 101525517 101525682 101525579 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 68558 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101613260 101613283 101613272 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 156301 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101678350 101678537 101678444 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 221391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101707897 101708291 101708217 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 250938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 102514621 102514825 102514690 Y NA NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 127203 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 128808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 102919685 102919710 102919698 Y NAPEPLD DPY19L2P2,PMPCB NA NA NA NA DPY19L2P2 828 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 104842983 104843396 104843385 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 191492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 104992589 104992852 104992773 Y NA SRPK2 NA NA NA NA SRPK2 44903 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 106358724 106358979 106358846 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031 NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 59282 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 107205466 107205592 107205534 Y COG5 DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA COG5 2507 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 107606262 107606577 107606420 Y NRCAM LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 35123 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 153741 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 111641194 111641556 111641398 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 202910 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 111971895 111972278 111972086 Y NA RN7SKP187 NA NA NA NA RN7SKP187 45217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 31798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 116319612 116319902 116319758 Y NA MET NA NA NA NA MET 9168 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 123387168 123387479 123387315 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 47 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 126214480 126214602 126214539 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 855376 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 128472556 128472915 128472760 Y NA CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130583676 130584341 130584164 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 11728 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 131010342 131010498 131010376 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1-AS NA NA NA NA MKLN1-AS 483 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 131289586 131289917 131289766 Y PODXL PODXL PODXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PODXL 48610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 131304608 131304982 131304803 Y NA NA PODXL MCF7 ChIA-PET 22265404 PODXL 63632 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 131314351 131314532 131314442 Y NA NA PODXL,MKLN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PODXL 73375 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 131580267 131580830 131580536 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 339291 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 134144888 134145050 134144951 Y AKR1B1 AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 2852 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 135430585 135430983 135430863 Y FAM180A NA NA NA NA NA C7orf73 85341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 113880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 137138499 137138631 137138565 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 546182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 137264728 137264844 137264813 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 419969 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 137352437 137352725 137352566 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 332088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 137671053 137671416 137671301 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 13397 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 139615919 139616013 139615969 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA HIPK2 140342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 140271542 140271796 140271668 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 94173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 140497709 140498045 140497887 Y NA NA NA NA NA NA NDUFB2 109132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 148637842 148638122 148637883 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 149193399 149193541 149193458 Y ZNF467,ZNF746 ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 491 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 149266694 149267035 149266833 Y NA NA NA NA NA NA ZNF767 52808 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 151496256 151496476 151496337 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2 75734 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 157092515 157093215 157092989 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 32860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr7 157112606 157112849 157112710 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 13226 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 582547 582966 582856 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 103140 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 637812 637858 637835 Y NA ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 48248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 1736486 1736690 1736554 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10 NA NA NA NA CTD-2336O2.1 25818 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 1836847 1837132 1836956 Y KBTBD11 NA NA NA NA NA ARHGEF10 66705 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 6663567 6663735 6663651 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT5 99689 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 10573649 10573859 10573801 Y SOX7 NA NA NA NA NA SOX7 121498 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 10659261 10659473 10659367 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 35884 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 18116 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 10922710 10923064 10922845 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 133811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 24343 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 11310026 11310392 11310209 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 19832 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.13780248306741 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 11367839 11367991 11367915 Y BLK FAM167A NA NA NA NA FAM167A 37615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 11368445 11368737 11368558 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 38221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 11373324 11373814 11373559 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 43100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 11735335 11735756 11735393 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 10378 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 13004776 13005088 13004835 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 366079 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 13210778 13210972 13210875 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 160195 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr8 13230060 13230464 13230283 Y DLC1 NA NA NA NA NA DLC1 140703 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 19236420 19236600 19236592 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 67292 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr8 22103553 22103662 22103605 Y NA MIR320A,POLR3D NA NA NA NA POLR3D 2936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3 NA NA NA NA BIN3 36382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 22758648 22758881 22758765 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 84049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 11189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 23203813 23204244 23204131 Y LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 76597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 23210314 23210863 23210698 Y NA NA NA NA NA NA LOXL2 69978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 23211536 23211676 23211614 Y TNFRSF10D,LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 69165 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 23390028 23390384 23390041 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 5710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 23397982 23398147 23398067 Y TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 13664 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 23401814 23402175 23401976 Y TNFRSF10B SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 17496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 23411826 23412031 23411908 Y TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37,RNU4-71P NA NA NA NA SLC25A37 27508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 181753 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 25242857 25243137 25242939 Y NA NA KCTD9 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD9 70855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 25284653 25284746 25284700 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA KCTD9 29246 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 26437404 26437761 26437433 Y PNMA2,DPYSL2,DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 67613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 27198229 27198437 27198331 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 31230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 27517363 27517693 27517481 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA SCARA3 27978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 28637206 28637596 28637433 Y EXTL3,KIF13B NA NA NA NA NA INTS9 108163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 28859805 28860025 28859905 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647L4.4 51427 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 28886327 28886717 28886347 Y HMBOX1,HMBOX1,DUSP4 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 24735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 32490865 32491103 32490993 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 837837 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 32572764 32572916 32572840 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 756024 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 32642880 32643214 32643047 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 685726 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.65143651241452 chr8 36488969 36489000 36488983 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150O12.1 920701 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 36758959 36759166 36759082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150O12.1 650535 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 409083 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 407150 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 37005639 37005772 37005739 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 403929 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 37773592 37773777 37773685 Y NA RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 18607 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 37939512 37939733 37939625 Y NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 21027 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 38384926 38385302 38385064 Y HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86 NA NA NA NA NA FGFR1 60574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.22033775394823 chr8 38781974 38782296 38782041 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 25221 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr8 38862169 38862388 38862283 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 9781 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 NA GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 142260 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 40207660 40208018 40207838 Y NA CTA-392C11.1 ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 8739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 41680611 41680957 41680800 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 226551 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 42009513 42009865 42009727 Y NA AP3M2 NA NA NA NA AP3M2 1049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 42053833 42054135 42053951 Y NA AP3M2,PLAT NA NA NA NA PLAT 9107 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 42149533 42149606 42149596 Y NA RP11-231D20.2,IKBKB,POLB NA NA NA NA IKBKB 22713 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 48350721 48350922 48350822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 152249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49229155 49229573 49229245 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 65577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49282720 49283033 49282877 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 12117 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr8 49321087 49321473 49321210 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25937 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 49321645 49321846 49321764 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 26495 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 49426742 49426952 49426814 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131592 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49541228 49541500 49541360 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 246078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49550038 49550119 49550080 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 254888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 130727 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 1136604 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr8 57360424 57360919 57360645 Y SDR16C5,PENK,PENK NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 138025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 108243 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 58333215 58333500 58333329 Y NA NA NA NA NA NA IMPAD1 428812 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 59710658 59710976 59710817 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 14135 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 59768911 59769118 59769011 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 43800 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 69923 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr8 61708880 61709194 61708899 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 119543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 61825257 61825601 61825298 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 235920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 62937802 62937913 62937858 Y NA NA NA NA NA NA MIR4470 312455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 65281748 65282274 65281884 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 1202636 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 13095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 79398 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 67424340 67424761 67424541 Y C8orf45 NA NA NA NA NA ADHFE1 83920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 67445791 67446197 67446047 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 NA NA NA NA NA MYBL1 78285 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 67447907 67448273 67448065 Y MYBL1,C8orf45 NA NA NA NA NA MYBL1 76209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 69837388 69837920 69837570 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 538939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 72143679 72143939 72143809 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1102P16.1 358321 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA NA TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 MSC 253531 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 74276592 74276996 74276782 Y C8orf84,RDH10 NA STAU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 70568 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 74371877 74372089 74371987 Y RDH10 NA NA NA NA NA RPL7 165853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.40383069977207 chr8 74544159 74544287 74544223 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 113656 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 77389631 77389653 77389643 Y NA NA NA NA NA NA LINC01111 72742 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 77585675 77585844 77585753 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 5610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 984 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 234269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 81050951 81051119 81051010 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 90348 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA CPNE3 178901 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 91020764 91021152 91020912 Y NA DECR1,NBN NA NA NA NA NBN 7308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 93963655 93963936 93963796 Y C8orf83 NA NA NA NA NA FAM92A1 744853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 94850724 94850939 94850832 Y GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17096 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 94971751 94971853 94971800 Y GEM NA RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDP1 103716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 96814161 96814420 96814290 Y NA NA NA NA NA NA GDF6 356600 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 98001253 98001769 98001454 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 497674 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 99478821 99479039 99478921 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 174200 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 99658802 99659210 99659171 Y NA NA NA NA NA NA STK3 293845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 100461450 100461455 100461453 Y NA NA NA NA NA NA VPS13B 437956 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 101801288 101801504 101801352 Y NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 68251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 101912406 101912993 101912785 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6 NA NA NA NA RPS26P6 6432 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102100153 102100310 102100232 Y YWHAZ NA NA NA NA NA ZNF706 116111 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102161878 102162231 102162054 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 54190 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NACAP1 NA NA NA NA NACAP1 16484 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103750893 103751082 103750980 Y AZIN1,KLF10,KLF10 NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 84763 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 100344 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 106290444 106290757 106290601 Y NA ZFPM2 ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 38163 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 106411260 106411358 106411309 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 82340 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 106511726 106511821 106511774 Y ZFPM2 NA NA NA NA NA ZFPM2 182806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 253244 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 106671593 106671660 106671627 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 342673 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 110248064 110248088 110248074 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 96465 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 111381887 111381916 111381903 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 679867 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 113119329 113119491 113119407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1267407 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 113791450 113791716 113791698 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 595182 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 114447535 114447912 114447629 Y CSMD3 CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA RP11-536K17.1 753248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 118958698 118959000 118958912 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 163092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 119921281 119921551 119921414 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P35 148841 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR NA DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 DEPTOR 208931 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 124013159 124013422 124013291 Y NA DERL1 NA NA NA NA DERL1 39241 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 124642629 124642836 124642770 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 91183 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 124684984 124685340 124685256 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 93356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 125764120 125764533 125764318 Y ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 MTSS1 MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTSS1 25390 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 126399593 126399657 126399625 Y NA TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 40906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 127387635 127388005 127387836 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 180115 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 127445901 127446376 127445998 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 121744 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 127640965 127641019 127640992 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 72327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 127732344 127732562 127732346 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 163706 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 544207 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128208934 128209645 128209301 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 MYC 536035 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 507948 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 128678694 128678799 128678726 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 66881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 97248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 129139934 129140421 129140284 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 119077 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 129205979 129206284 129206246 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 185122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 129336748 129337038 129336807 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 315891 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr8 129351022 129351309 129351127 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 330165 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 129527030 129527320 129527153 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 506173 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 130697904 130698138 130698105 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 329237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 306817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 131027030 131027189 131027125 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 186 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131058084 131058195 131058140 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131245360 131245556 131245456 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 208350 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 131456841 131457348 131457080 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 2935 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 131540584 131540868 131540737 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 86678 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 135512580 135513062 135513051 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 210230 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 135984758 135985124 135984941 Y NA NA NA NA NA NA MIR30D 169570 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 140843827 140843872 140843850 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 622806 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 142036879 142037195 142037043 Y NA PTK2 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 26564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA GPR20,PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 JRK 135833 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 144301806 144302247 144302025 Y MAFA ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 25033 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 447782 447949 447838 Y DOCK8,DOCK8 KANK1 NA NA NA NA KANK1 20342 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 374522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 4086123 4086410 4086330 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 259982 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 4162852 4162875 4162864 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 183517 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 4241498 4241696 4241599 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 104696 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 4296901 4297617 4297146 Y GLIS3 GLIS3 NA NA NA NA GLIS3 48775 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1 NA NA NA NA RCL1 38997 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 5499914 5500215 5500099 Y NA PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 8330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 5552355 5552554 5552455 Y NA PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 43810 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 5586544 5586797 5586563 Y C9orf46,CD274 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 40228 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 6384866 6385180 6385056 Y NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 25971 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr9 13268477 13268830 13268663 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 8759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 14547369 14547550 14547460 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 143919 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 15999707 15999922 15999846 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 474026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16062752 16063225 16063009 Y NA NA CNTLN,C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 537071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16192245 16192373 16192308 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 532439 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 16203449 16203717 16203596 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 521095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 16337405 16337786 16337534 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 387026 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 16505238 16505575 16505407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 219237 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 16506213 16506544 16506471 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 218268 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 16508530 16508711 16508621 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 216101 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 198319 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16666623 16666991 16666807 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 57821 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16709928 16710291 16710201 Y NA RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 14521 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16854631 16854704 16854668 Y NA BNC2 NA NA NA NA BNC2 14137 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 533941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 19704722 19704817 19704786 Y SLC24A2 NA NA NA NA NA RPS6 326470 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 68078 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21081727 21081778 21081753 Y NA NA NA NA NA NA PTPLAD2 52092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD2 66759 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 21681581 21681928 21681849 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 118614 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21685022 21685416 21685227 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 115126 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21688773 21688952 21688863 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 111590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 21964976 21965347 21965178 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 27953 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 32437038 32437275 32437091 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 54420 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 34124231 34124372 34124320 Y NA DCAF12 NA NA NA NA DCAF12 1025 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 2865 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 4061 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 28421 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 29917 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,MSMP NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 35924357 35924707 35924422 Y NA YBX1P10 NA NA NA NA YBX1P10 45608 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,RNU4-53P,GNE NA NA NA NA RNU4-53P 33655 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 38016375 38016730 38016641 Y NA RP11-613M10.9 NA NA NA NA RP11-613M10.9 49954 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 71795556 71796114 71795819 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 61347 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 72591131 72591428 72591305 Y NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,TJP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 218256 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 73021810 73022419 73022127 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5121 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 73025378 73025559 73025525 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 1981 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.5689012415337 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 73203378 73203385 73203382 Y TRPM3 NA NA NA NA NA KLF9 175838 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 73569162 73569421 73569277 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 541622 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr9 76299237 76299618 76299309 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 534564 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 576520 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 81804624 81804840 81804732 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 379848 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 86051693 86051979 86051837 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 99482 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 86911270 86911583 86911478 Y NA NA NA NA NA NA RMI1 317644 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 89952631 89952908 89952845 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 157235 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 89953262 89953308 89953285 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 156835 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 89990510 89990850 89990781 Y NA NA DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 119293 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 90182587 90182864 90182726 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 44370 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 90279667 90279982 90279701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 141450 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 91150927 91151269 91151097 Y NA NA NA NA NA NA SPIN1 149593 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 91392809 91392997 91392941 Y NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,S1PR3,NXNL2,CKS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S1PR3 211365 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 91754392 91754739 91754520 Y NA SHC3 NA NA NA NA SHC3 36943 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.87177426636275 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 94668024 94668724 94668369 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 41720 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 94968812 94969005 94968908 Y NA NA NA NA NA NA IARS 85033 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 96057122 96057472 96057169 Y ZNF484,ZNF484,WNK2 NA NA NA NA NA FAM120A 154532 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 37062 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.0184224040622 chr9 97411409 97411895 97411585 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 75088 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 97574717 97574955 97574837 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 87734 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 97895370 97895760 97895554 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 182231 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 100548546 100549029 100548790 Y FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 90907 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 100993569 100993588 100993579 Y NA CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 22327 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 100994380 100994637 100994474 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 21278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 101002580 101002910 101002849 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 13005 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 101011075 101011589 101011252 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 4326 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 101015938 101016120 101016078 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 23 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 101136906 101136938 101136922 Y ANKS6 NA NA NA NA NA TBC1D2 120991 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 101137509 101137713 101137616 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D2 121594 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 101572840 101572995 101572898 Y GALNT12 ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 4859 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 102006739 102006945 102006777 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 107510718 107511248 107511059 Y ABCA1,NIPSNAP3A NIPSNAP3A NA NA NA NA NIPSNAP3A 2749 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 107635337 107635884 107635542 Y ABCA1 NA NA NA NA NA RP11-217B7.2 51950 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 RP11-217B7.2,ABCA1 NA NA NA NA RP11-217B7.2 18109 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 107769025 107769996 107769532 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 80507 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 108220808 108221168 108220887 Y NA FSD1L NA NA NA NA FSD1L 12731 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 109714113 109714149 109714131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 90735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 109975791 109976065 109975989 Y KLF4 NA NA NA NA NA RAD23B 67353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 110474119 110474209 110474164 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 179448 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 110517575 110517896 110517754 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 222904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 112262069 112262452 112262225 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 3479 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 26333 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 112861625 112861803 112861710 Y AKAP2 NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 75987 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 112878723 112879133 112878887 Y AKAP2 NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 93085 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 112905689 112906067 112905829 Y NA NA NA NA NA NA TXN 110853 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 113412585 113412772 113412669 Y NA NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 386209 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA C9orf84 NA NA NA NA C9orf84 49492 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.13780248306741 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr9 114723325 114723781 114723480 Y NA NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 66279 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114754924 114755117 114754987 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 97878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114790542 114790702 114790622 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114808602 114808743 114808666 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 126945 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 114809786 114810087 114810015 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 125601 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 2.75239418735754 chr9 114812315 114812544 114812429 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 123144 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114812842 114813221 114813099 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 122467 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 114819352 114819642 114819392 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 116046 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 114821548 114821936 114821739 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 113752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 114835497 114835862 114835756 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 99826 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.83492945823836 chr9 114836654 114837091 114837061 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 98597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr9 115067475 115067560 115067518 Y SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2 PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 26387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 76776 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 RP11-18B16.2 NA NA NA NA RP11-18B16.2 25718 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 116937744 116937911 116937764 Y ORM1,COL27A1 COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 21904 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 220925 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 117732454 117732820 117732578 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,AKNA,C9orf91 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 145716 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 118378080 118378500 118378342 Y NA NA PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 DEC1 475983 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 501323 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 118430899 118431573 118430988 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 482510 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478393 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 212389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 118704303 118704501 118704353 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 209582 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 207058 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 118760141 118760468 118760319 Y NA NA PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 153615 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 118789906 118790104 118789991 Y NA NA LINC00474,PAPPA,ASTN2 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 123979 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 118858385 118858739 118858560 Y NA NA LINC00474,PAPPA,LOC100128505,ASTN2 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 55344 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 118914445 118914679 118914506 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 362 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 3771 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 118993225 118993558 118993231 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA 79142 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 120507373 120507587 120507563 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1059792 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 121771632 121771910 121771804 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1568538 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 124125049 124125440 124125316 Y NA STOM NA NA NA NA STOM 5091 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 124383753 124383935 124383823 Y DAB2IP NA NA NA NA NA DAB2IP 56417 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA PTGS1 TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 PTGS1 21387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 125663245 125663345 125663303 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 2275 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 126126718 126127057 126126872 Y CRB2 CRB2 NA NA NA NA CRB2 10269 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.10095767494302 chr9 126138103 126138404 126138241 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 21654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 126154038 126154354 126154284 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 37589 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 126160444 126160608 126160526 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 43995 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 126895140 126895472 126895256 Y NA NA DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 122413 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 126901442 126901607 126901525 Y NA NA DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 116278 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 127018843 127019044 127018944 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 127059883 127060148 127059983 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 41998 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 128298527 128298744 128298662 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 128394575 128395007 128394820 Y PPP6C NA NA NA NA NA MAPKAP1 72506 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 128395270 128395491 128395304 Y PPP6C,HSPA5,GAPVD1 NA NA NA NA NA MAPKAP1 72022 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 128408655 128409172 128408692 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 58341 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 130307843 130308200 130307973 Y SLC2A8,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 31068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 130328926 130329278 130329070 Y FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9990 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 131988173 131988389 131988342 Y NA IER5L LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50 IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IER5L 49633 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 70706 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 132464908 132465166 132465090 Y C9orf50,PRRX2 PRRX2,PTGES NA NA NA NA PRRX2 38988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132466012 132466377 132466073 Y NA PRRX2,PTGES NA NA NA NA PRRX2 40092 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132757819 132758165 132758070 Y TOR1B,FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 45308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 132814142 132814504 132814316 Y TOR1B FNBP1,GPR107 NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR107 437 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 133721974 133722320 133722184 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FIBCD1 90353 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 133722867 133723250 133723071 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FIBCD1 89423 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A NA NA NA NA NA NUP214 132654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 136282042 136282102 136282072 Y NA SURF4,REXO4 NA NA NA NA REXO4 878 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chr9 136821729 136822115 136821856 Y NA VAV2 NA NA NA NA VAV2 33611 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 136996268 136996567 136996488 Y NA WDR5,RNU6ATAC WDR5 K562 ChIA-PET 22265404 WDR5 1920 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 137231518 137231916 137231717 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 24574 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 137264490 137265116 137264820 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 57546 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 137535299 137535511 137535433 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 3679 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.28445062076685 chr9 137667512 137667789 137667676 Y OLFM1,OLFM1 NA NA NA NA NA COL5A1 135892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 137670812 137671011 137670912 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 139192 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 186642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 138818727 138819161 138818918 Y CAMSAP1,CARD9 CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1 NA NA NA NA RP11-432J22.2 21069 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 NOTCH1 7580 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 139613892 139613944 139613895 Y NA AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA SNHG7 6692 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 5.87177426636275 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chr9 140200054 140200221 140200146 Y EXD3,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 5351 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA MRPL41 54881 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140411407 140411807 140411605 Y CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 MRPL41 NA NA NA NA MRPL41 31844 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chr9 140487255 140487495 140487481 Y CACNA1B,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 4313 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 7901438 7901508 7901476 Y NA PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 7658 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 10135057 10135251 10135239 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 153455 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 11460430 11460509 11460495 Y AMELX NA NA NA NA NA MSL3 313769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 13106166 13106719 13106370 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA FAM9C IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 114939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 13128879 13129151 13129129 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 137652 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 13709946 13709989 13709968 Y RAB9A RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 4702 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 13711501 13711681 13711616 Y ATXN3L,RAB9A RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 6257 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 16203717 16204054 16203956 Y NA RPL6P30 CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P30 11358 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 112388 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 128434 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 19874693 19875106 19874808 Y SH3KBP1 SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 28613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 21945015 21945333 21945248 Y NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 11358 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 22239204 22239352 22239279 Y NA NA NA NA NA NA SMS 282513 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 23829236 23829783 23829513 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1,RPL9P7 NA NA NA NA RPL9P7 23676 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 38742577 38742732 38742665 Y MID1IP1 NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 83892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 39964528 39964690 39964611 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 69892 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 40792948 40793319 40793225 Y ATP6AP2 RP11-77G22.2 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 27711 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chrX 41190836 41191010 41190932 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 185 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA FUNDC1 511159 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 23860 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 14174 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 1.46794356659069 chrX 45569317 45570037 45569421 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 33657 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45647781 45648040 45647909 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43251 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45666059 45666529 45666404 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42391 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 45668056 45668432 45668257 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 40488 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 46338861 46339028 46338937 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 40712 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 46524990 46525241 46525097 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A7 91249 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 47180934 47181052 47180967 Y ELK1,CDK16 NA UBA1,USP11 IMR90 Hi-C 24141950 USP11 90845 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 48938465 48938570 48938518 Y NA TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW NA NA NA NA PRAF2 8735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22 NA NA NA NA CCDC22 49329 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 57421884 57422193 57422039 Y FAAH2 NA NA NA NA NA ZXDB 194076 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 57930677 57931162 57931079 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 77958 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 282939 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 62728532 62728688 62728610 Y NA NA NA NA NA NA RP11-357C3.3 50263 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 64898955 64899156 64899089 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 92698 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 64917800 64918054 64917950 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 111543 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 67624994 67625390 67625192 Y NA OPHN1 NA NA NA NA OPHN1 26365 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 67919830 67920138 67919911 Y STARD8 NA NA NA NA NA STARD8 54322 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 69386644 69386665 69386655 Y NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 35345 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA RNU1-56P,SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 13891 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.91746472911918 chrX 71785357 71785413 71785385 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 5540 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 75247 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 73338057 73338325 73338191 Y NA NA NA NA NA NA USMG5P1 53400 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 73833460 73833840 73833652 Y NA RLIM NA NA NA NA RLIM 1008 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2,NOX1 NA NA NA NA NOX1 15882 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 107552407 107552661 107552546 Y COL4A6,COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA NA COL4A6 128066 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 107639720 107640073 107639886 Y COL4A6 COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA COL4A6 40654 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 109083180 109083422 109083333 Y ACSL4 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 108548 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 109330355 109330526 109330451 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 86496 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 110863259 110863845 110863518 Y NA EIF4BP7,ALG13 NA NA NA NA EIF4BP7 542 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 125556519 125556645 125556582 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 48223 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 4.77081659141974 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 129982936 129983220 129983074 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 51988 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA GPC3 187840 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.366985891647672 chrX 133756354 133756493 133756422 Y NA NA MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542 IMR90 Hi-C 24141950 HPRT1 164171 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 140218304 140218459 140218382 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 50851 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 147498488 147498733 147498611 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P8 366735 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chrX 153239828 153239923 153239886 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,MECP2,EMD,DNASE1L1,TMEM187 ARHGAP4,NAA10,HCFC1,TMEM187,IRAK1 NA NA NA NA TMEM187 4050 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 153359354 153359823 153359622 Y NA MECP2 NA NA NA NA MECP2 1389 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 153828728 153829141 153828914 Y NA AF277315.19 NA NA NA NA AF277315.19 2970 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 153829365 153829583 153829391 Y NA AF277315.19 NA NA NA NA AF277315.19 2528 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrX 153963988 153964279 153964176 Y F8 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 13579 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrY 7637940 7638259 7638201 Y NA NA NA NA NA NA PRKY 497927 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.733971783295344 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.550478837471508 chrY 15547664 15548123 15547956 Y TMSB4Y UTY NA NA NA NA UTY 42430 CAGE NCI-H226 hg19 FANTOM5 0.183492945823836