chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	1070745	1071151	1070944	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	21004	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	2925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	MMP23B,CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	1744250	1744609	1744432	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	34354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.10961526386551
chr1	1978731	1978937	1978887	Y	NADK,PRKCZ	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM52	130019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	2231691	2232185	2232046	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	88961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	RP3-395M20.8	8499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.68018386773837
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	RP3-395M20.8	7653	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	3269112	3269418	3269330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	99572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	3374928	3375314	3374967	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	5938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr1	3521167	3521613	3521414	Y	NA	MEGF6,RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	MEGF6	4446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	3573384	3573559	3573472	Y	WRAP73,TP73	MEGF6,RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	6059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	4697251	4697504	4697378	Y	NA	AJAP1	NPHP4	IMR90	Hi-C	24141950	AJAP1	15288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	5023187	5023658	5023489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AJAP1	310395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	5172646	5173061	5172846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AJAP1	459854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	5483188	5483543	5483374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP4	566990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	RNF207,RPL22	NA	NA	NA	NA	RNF207	41866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	6301988	6302384	6302218	Y	NA	RNF207,RPL22,ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	HES3	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	6336471	6336830	6336716	Y	ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	17436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	6337854	6338055	6337955	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	18819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	6370006	6370154	6370079	Y	NA	NA	HES3,ICMT,GPR153	IMR90	Hi-C	24141950	GPR153	50971	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,HES2,ESPN	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	99572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	7207208	7207593	7207350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	69827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	7331930	7332127	7331990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	54510	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	184544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	253642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.14715698063566
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	8226138	8226422	8226280	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	141340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	145106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	177425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	8300045	8300389	8300198	Y	NA	NA	PARK7,ERRFI1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	215247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	8319137	8319616	8319397	Y	NA	NA	PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	234339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	376474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	8533889	8534027	8533958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	341675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	8971325	8971721	8971517	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENO1	34017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr1	8999811	9000211	8999889	Y	NA	NA	SLC2A5,SLC2A7	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	62503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	9195486	9195787	9195690	Y	SLC25A33,GPR157	GPR157,RP3-510D11.2	NA	NA	NA	NA	GPR157	8257	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	9223907	9224260	9224149	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	16003	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	9225492	9225752	9225745	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	9318130	9318195	9318182	Y	NA	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	H6PD	25296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	10813352	10813797	10813578	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	40910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	10959985	10960148	10960064	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	11410602	11410834	11410718	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	79339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	11841016	11841080	11841048	Y	NA	AGTRAP,C1orf167,CLCN6,MTHFR	NA	NA	NA	NA	C1orf167	21172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	11942925	11943217	11943160	Y	NPPB,MFN2	NPPB,KIAA2013,PLOD1	CLCN6,MTHFR,NPPB,NPPA,MFN2,PLOD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NPPB	25937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	12050736	12051137	12050880	Y	NPPA,NPPB,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	12498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	12124472	12125118	12124763	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	3038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	12126084	12126429	12126131	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	4650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	12127865	12128182	12128023	Y	MIIP,TNFRSF8	TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	6431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	31661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	12221931	12222397	12222091	Y	FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,MFN2,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	2663	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	12240401	12240902	12240499	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B,VPS13D	VPS13D	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1B	15341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	12544374	12544691	12544532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	131046	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	14656585	14656699	14656641	Y	NA	NA	KAZN	IMR90	Hi-C	24141950	KAZN	266501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	14924209	14924351	14924269	Y	NA	KAZN	NA	NA	NA	NA	KAZN	1009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	69226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	15059594	15059681	15059648	Y	KAZN	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	136394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	15240254	15240560	15240408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	236468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	15575633	15576067	15575825	Y	PLEKHM2,EFHD2,TMEM51,TMEM51,FHAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	98605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16030221	16030623	16030258	Y	NA	PLEKHM2,RP11-169K16.4	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	21394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	RP11-169K16.4,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	16156384	16156536	16156435	Y	EFHD2,CASP9,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	3660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	3332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	40400	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA2	8439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	16553276	16553594	16553536	Y	NA	RSG1	NA	NA	NA	NA	RSG1	8063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	PADI2	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI2	10907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	RP11-380J14.1,PADI1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	3852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	RP11-380J14.1,PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI1	5066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17578205	17578469	17578334	Y	NA	PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	4612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	17796675	17796982	17796736	Y	NA	RCC2	RCC2,ARHGEF10L	IMR90	Hi-C	24141950	RCC2	32455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17880613	17880854	17880734	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	16283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17887951	17888293	17888247	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	23621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	19248887	19249092	19248943	Y	NA	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	21612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	19735064	19735194	19735147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZB	74872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	19926811	19926972	19926927	Y	TMCO4	MINOS1,RPS14P3,NBL1	NA	NA	NA	NA	MINOS1	5334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	20780827	20780970	20780908	Y	PLA2G2A	CAMK2N1	OTUD3,LOC339505	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2N1	29743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	97754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	22236410	22236692	22236686	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	3819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23116669	23117052	23116861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	81337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23589856	23590232	23590037	Y	NA	NA	KDM1A,HTR1D,LUZP1,LOC729059,HNRNPR,TCEA3,E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPR	78597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.1268811790281
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	23901938	23902056	23901997	Y	NA	E2F2,ID3	ID3,MDS2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	17653	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	23925201	23925342	23925271	Y	NA	ID3	TCEB3,HNRNPR,ASAP3,TCEA3,E2F2,ID3,MDS2,LOC100506963,ZNF436	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	40916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	24237439	24237588	24237532	Y	RPL11,PNRC2,FUCA1,CNR2	FUCA1,RP11-4M23.4,CNR2	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	36285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	24265492	24265740	24265616	Y	SRSF10	RP11-4M23.4,CNR2	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	8133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	24581337	24581604	24581474	Y	NA	NA	MYOM3,GRHL3,C1orf201,RCAN3,NIPAL3,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL3	62208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	24854734	24855006	24854870	Y	NA	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	27347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	24968619	24968979	24968799	Y	RUNX3,SRRM1	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	12412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	25319346	25319740	25319543	Y	RCAN3,RUNX3	RUNX3	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	29734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	25354376	25354504	25354473	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	64764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	25665993	25666367	25666180	Y	RUNX3,FAM54B,C1orf63	TMEM50A,C1orf63	NA	NA	NA	NA	C1orf63	3289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	25969249	25969578	25969407	Y	PDIK1L,SYF2,C1orf63,TMEM57,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B	NA	SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	101178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	26319994	26320468	26320326	Y	NA	PAFAH2	NA	NA	NA	NA	PAFAH2	2180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	FAM110D,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr1	26642014	26642169	26642069	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	CD52	279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	26677301	26677628	26677413	Y	CATSPER4,ZNF683	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	26735858	26736255	26735942	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	26738740	26738942	26738863	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	26739065	26739644	26739183	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	27185755	27186143	27185948	Y	C1orf172,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	1490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	27462835	27462988	27462889	Y	ARID1A,PIGV,ZDHHC18,WDTC1,WASF2,FGR,FGR,FGR,SLC9A1	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	28484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	27561705	27561803	27561716	Y	NA	WDTC1	NA	NA	NA	NA	WDTC1	2698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27863218	27863465	27863342	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	48549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	27893697	27893957	27893851	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	34985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27901397	27901604	27901422	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	27338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	27926165	27926491	27926331	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	2451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	27928507	27928973	27928740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHDC1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27982664	27982914	27982811	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	13815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	28143878	28144081	28143936	Y	NA	STX12,PPP1R8,SCARNA1	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	11208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	28305616	28305920	28305789	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	21643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	28752190	28752435	28752364	Y	EYA3,PTAFR,PTAFR,SESN2,MED18,GMEB1	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR4	58076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	28970474	28970729	28970677	Y	NA	TAF12,RNU11,GMEB1	NA	NA	NA	NA	RNU11	2383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	29137630	29137906	29137764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41	73697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	29253461	29253677	29253525	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	41858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	29370205	29370321	29370263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-604A21.1	63085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.00300988644496
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	29683297	29683456	29683378	Y	SRSF4,PTPRU	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRU	122269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	30446180	30446480	30446328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	782187	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr1	30447163	30447510	30447328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	781157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	31216468	31217229	31216636	Y	LAPTM5	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	11438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31220962	31221590	31221236	Y	NA	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	7077	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	31320336	31320627	31320524	Y	NA	RP1-65J11.1	SDC3	K562	ChIA-PET	22265404	RP1-65J11.1	25261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	31375562	31375695	31375629	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	3913	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63894	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	62126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	32108020	32108204	32108102	Y	NA	PEF1	NA	NA	NA	NA	PEF1	293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	58201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	32170830	32171205	32171045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI2	57289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	32227408	32227911	32227671	Y	NA	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	32237691	32238692	32237953	Y	NA	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	9197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	33202470	33202806	33202641	Y	ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	33203093	33203146	33203106	Y	NA	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	KIAA1522,S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	26762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	33405191	33405597	33405376	Y	RNF19B	TMEM54,RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	22689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33716636	33716974	33716805	Y	KIAA1522	ZNF362,AL513327.1	ZSCAN20,PHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF362	3172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	34628613	34629024	34628705	Y	NA	CSMD2	NA	NA	NA	NA	CSMD2	419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	35294449	35294485	35294467	Y	NA	GJB3,GJA4	NA	NA	NA	NA	GJA4	37850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	36283726	36283900	36283813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	50158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	36627717	36628369	36628068	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	8537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	37169397	37169618	37169483	Y	OSCP1,GRIK3	NA	NA	NA	NA	NA	CSF3R	222518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	37235311	37235419	37235379	Y	OSCP1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK3	262311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	37464724	37465074	37465012	Y	NA	GRIK3	NA	NA	NA	NA	GRIK3	32656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	216026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.61112020708799
chr1	37885584	37885820	37885702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	52192	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38311465	38311868	38311723	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	11424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38536566	38536896	38536731	Y	NA	POU3F1,RP5-884C9.2	RRAGC,FHL3,UTP11L	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	25580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	38573869	38574225	38574173	Y	EPHA10,MANEAL,POU3F1	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-884C9.2	62883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	38591881	38592061	38591968	Y	C1orf122,POU3F1	NA	LOC339442	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	80895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	39193613	39193736	39193672	Y	NA	RP11-334L9.1	NA	NA	NA	NA	RP11-334L9.1	21010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP,RHBDL2	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	39624919	39625154	39625144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	79931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	40442472	40442624	40442548	Y	NA	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	23670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	40847285	40847634	40847387	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	38763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	41823971	41824199	41824094	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr1	41994633	41994922	41994778	Y	SCMH1,HIVEP3	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	46289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42071739	42071927	42071841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	123395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.70045966934593
chr1	42136267	42136586	42136329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	187923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	42149945	42149960	42149949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	201601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42180382	42180624	42180465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	232038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42272535	42272820	42272654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	226776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	42275404	42275646	42275525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	223950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42356899	42357259	42356906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	142337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42363874	42364167	42364002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	135429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.89640450902442
chr1	43524188	43524462	43524346	Y	NA	NA	SLC2A1,FLJ32224,LOC100129924,C1orf50,LEPRE1,ERMAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM183A	84362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	FAM183A	74619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43653088	43653279	43653276	Y	NA	FAM183A,WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	17268	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	43760174	43760222	43760211	Y	TIE1	TMEM125,EBNA1BP2,C1orf210,TIE1	C1orf210	K562	ChIA-PET	22265404	TIE1	4442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	43761236	43761355	43761298	Y	NA	TMEM125,EBNA1BP2,C1orf210,TIE1	NA	NA	NA	NA	TIE1	3309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44299891	44300630	44300422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	96362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44331438	44331658	44331560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	65334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44333703	44334024	44333769	Y	SZT2,ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	62968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44378405	44378587	44378508	Y	CCDC24,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	18405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	44692988	44693156	44693052	Y	ATP6V0B	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	15861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	45323747	45323764	45323756	Y	NA	RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	PTCH2	17012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	45787067	45787234	45787139	Y	NA	ZSWIM5,HPDL,TOE1,MUTYH	NA	NA	NA	NA	HPDL	3311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	46796624	46796901	46796763	Y	UQCRH	LRRC41,UQCRH,NSUN4	NSUN4	IMR90	Hi-C	24141950	NSUN4	6948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	47522995	47523190	47523093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4X1	97959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	48570660	48571055	48570858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	340553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	48935854	48936015	48935919	Y	NA	RNU4-61P,SPATA6	NA	NA	NA	NA	SPATA6	9	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	49038282	49038602	49038503	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	102437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	49317577	49317713	49317702	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	76936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	49397467	49397500	49397484	Y	BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	156826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	49522549	49522595	49522572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	281908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	49837709	49837828	49837769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	597068	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	50890174	50890356	50890265	Y	NA	DMRTA2	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	3002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	169825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	51097851	51098184	51098018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	210679	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	51102056	51102361	51102067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	214884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	51779028	51779085	51779057	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	29703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	51886085	51886464	51886275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	77297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	52110368	52110491	52110430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	69517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	52132018	52132585	52132263	Y	TXNDC12,EPS15,NRD1,NRD1,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	91167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	52999324	52999688	52999506	Y	NA	ZCCHC11	PRPF38A,ORC1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC11	17471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	3985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	53128711	53128834	53128721	Y	NA	FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	31695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	21373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	31319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54715450	54715803	54715579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	51741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr1	54778588	54778715	54778652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	98437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54810685	54810861	54810859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	66291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	54844378	54844570	54844456	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	32582	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	54875187	54875373	54875227	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	1779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	54925355	54925634	54925492	Y	NA	SSBP3	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	48203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54940444	54940824	54940607	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	63292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54941159	54941412	54941231	Y	TCEANC2,SSBP3,SSBP3	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	64007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	ACOT11	63935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACOT11	51605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	54956081	54956394	54956179	Y	NA	ACOT11	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACOT11	49536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	56919158	56919299	56919214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	189675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr1	56992489	56992799	56992673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	116175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	57821291	57821329	57821310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	537922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	57854194	57854446	57854303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	570825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	57854714	57855055	57855051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	571345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	57866663	57866674	57866669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	583294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	57873517	57873674	57873652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	590148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	57885160	57885452	57885308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	601791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	57887813	57887926	57887901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	604444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	57988271	57988573	57988424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	531579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	57995135	57995251	57995193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	524901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	58713977	58714213	58714095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	193825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59083441	59083551	59083446	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59170307	59170692	59170487	Y	NA	MYSM1	LOC100131060,JUN,FGGY,MIR4711,HOOK1	IMR90	Hi-C	24141950	MYSM1	6543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	59395500	59395772	59395634	Y	JUN	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	88287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	59478866	59479252	59479013	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	4807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	59479443	59479773	59479608	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	4286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	60087129	60087147	60087138	Y	CYP2J2	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	191311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	81659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	61333622	61333797	61333765	Y	NA	NFIA	INADL	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	4691	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	61385640	61385825	61385787	Y	NA	NA	NFIA	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	56709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	62362299	62362490	62362395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	156150	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	62698531	62698618	62698572	Y	USP1,USP1,KANK4,L1TD1	L1TD1	NA	NA	NA	NA	L1TD1	40028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	62751605	62751997	62751995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L1TD1	93102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	62773248	62773553	62773401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L1TD1	114745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	63785369	63785450	63785384	Y	FOXD3	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	FOXD3	1280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr1	63807580	63807600	63807590	Y	NA	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	RP4-792G4.2	19468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	RP4-535B20.1	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	RP4-535B20.1	3564	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	65677177	65677293	65677243	Y	JAK1,LEPROT,LEPROT,LEPR	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	34609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	66881715	66881835	66881718	Y	TCTEX1D1,PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	506735	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	66930584	66930841	66930604	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	457729	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	66959447	66959772	66959623	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR78	428798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	67847773	67848018	67847895	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	46080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68077196	68077460	68077328	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45A	71284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68101042	68101257	68101151	Y	NA	GADD45A	GADD45A	K562	ChIA-PET	22265404	GADD45A	47487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68647153	68647165	68647159	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	49638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	70040211	70040399	70040305	Y	LRRC7	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	8130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	70207294	70207355	70207325	Y	LRRC7	NA	DEPDC1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC7	175213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	72554223	72554508	72554339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	191909	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	72813657	72813669	72813663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	67240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	73859450	73859778	73859467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ3	802093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	74996182	74996425	74996304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW3	200411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	75445957	75446239	75446083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	248865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	380065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	275722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	76231463	76231678	76231570	Y	NA	ACADM,RABGGTB,SNORD45A	NA	NA	NA	NA	RABGGTB	18201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	76776213	76776609	76776411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	237809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	77236764	77237140	77237135	Y	NA	NA	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	73290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	78703686	78703842	78703764	Y	NEXN	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	260460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	78907891	78908155	78908023	Y	NA	NA	MGC27382,PTGFR	IMR90	Hi-C	24141950	IFI44	205326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	80376648	80376796	80376657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	1263167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	82913618	82913898	82913758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	728240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	83288583	83288596	83288590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	1036110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	83530346	83530531	83530439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	794175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	83971166	83971473	83971320	Y	TTLL7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	353233	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	84083536	84083914	84083802	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	240792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85046655	85046705	85046680	Y	NA	CTBS	CTBS	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CTBS	8492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	86527312	86527621	86527471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	332402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	87355999	87356364	87356182	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	21743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	87359712	87359873	87359793	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	18234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	88150561	88150732	88150650	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	358410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	89112806	89113177	89112978	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	34728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	89149109	89149398	89149189	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	1204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	91801781	91801846	91801814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFM1	66580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92014654	92014767	92014727	Y	NA	NA	GLMN,RPAP2,TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,BRDT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	50246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	180831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92216994	92217085	92217040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	152807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92268637	92268946	92268791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	100946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	93386726	93386941	93386863	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	38116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	154490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94093325	94093611	94093590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	145389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	104717	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	77529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	71480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94474816	94474984	94474873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	101850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94560274	94560395	94560335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	178229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94583651	94584037	94583923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	154587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	94676840	94677023	94676933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	61601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94712051	94712193	94712123	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	NA	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	54183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	95174059	95174304	95174182	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	109533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95191212	95191391	95191280	Y	F3	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	92446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95326006	95326167	95326065	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	CNN3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A3	42108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	95811904	95812058	95811981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWDD3	114193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	96208080	96208328	96208204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWDD3	510369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	97949201	97949316	97949277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	59941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	101000887	101001063	101001039	Y	SLC30A7,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	192303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	101776223	101776281	101776251	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	DPH5	286579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	104585164	104585551	104585358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	518851	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	107877234	107877506	107877370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	196605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	107891659	107891745	107891700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	211030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	108143362	108143805	108143489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	361961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	273605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	108478082	108478329	108478187	Y	VAV3	VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3	27437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	108593971	108594173	108594055	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	88205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	108595513	108595797	108595673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	89747	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	45193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	109788948	109789150	109789063	Y	GSTM3	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	1491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	109797001	109797635	109797309	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	6360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	109802696	109802890	109802772	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	CELSR2	12055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	MYBPHL	5511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	109938897	109939079	109938975	Y	TMEM167B,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	110336950	110337403	110337105	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	54566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	82497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	NA	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AHCYL1	105163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	110444415	110444738	110444538	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	80570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	110976504	110976901	110976673	Y	CD53	SLC16A4	HBXIP,SLC6A17,LOC440600,RBM15,PROK1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC16A4	44800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111163364	111163623	111163482	Y	PROK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNA3	52032	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111191728	111191821	111191775	Y	CD53	KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	23834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111249875	111250151	111250015	Y	LRIF1,CD53	KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	34220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111467127	111467325	111467234	Y	KCNA2,KCNA3,DENND2D,CD53	LRIF1	LRIF1	K562	ChIA-PET	22265404	LRIF1	37376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111762260	111762740	111762451	Y	CD53,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	NA	C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2	IMR90	Hi-C	24141950	DRAM2	81422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	112015702	112015900	112015801	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	25704	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	112291453	112291811	112291686	Y	C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	4056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	112618733	112618998	112618894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND3	88956	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	113339084	113339400	113339242	Y	NA	NA	FAM19A3,RHOC,PPM1J,AKR7A2P1,SLC16A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-522D1.1	51250	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	113369203	113369427	113369274	Y	SLC16A1,SLC16A1	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-522D1.1	21223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	113574968	113575168	113575068	Y	NA	RP11-31F15.2,LRIG2	CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-31F15.2	38559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	113584893	113585079	113584961	Y	NA	RP11-31F15.2,LRIG2	SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-31F15.2	28648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	114575620	114575801	114575630	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	OLFML3	55557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	114575988	114576152	114576061	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	OLFML3	55925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	114656563	114656717	114656645	Y	HIPK1	SYT6	NA	NA	NA	NA	SYT6	37824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	114657343	114657372	114657355	Y	NA	SYT6	NA	NA	NA	NA	SYT6	37169	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	115296637	115296935	115296808	Y	NA	NRAS,CSDE1,SIKE1	NA	NA	NA	NA	CSDE1	2362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	115445129	115445499	115445208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	123823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	115709526	115709713	115709586	Y	NA	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	NGF	169144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	NGF	156359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	71310	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	116694646	116694883	116694753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	177527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	116918317	116918655	116918398	Y	NA	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	117030831	117031034	117030889	Y	ATP1A1,ATP1A1	RP4-655J12.4	ATP1A1,ATP1A1OS,SLC22A15,MAB21L3,CD58	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-655J12.4	11367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	117089417	117089635	117089469	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	22026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	118415993	118416217	118416147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP2	54036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	120607153	120607333	120607254	Y	ZNF697,NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	2907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	144536201	144536370	144536251	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	4163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	85772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	73337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	145435103	145435641	145435221	Y	CD160,TXNIP,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	145454760	145454851	145454762	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	13537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	146753566	146753835	146753733	Y	NA	CHD1L,FMO5	NA	NA	NA	NA	FMO5	40866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	147104963	147105320	147105142	Y	NA	ACP6	NA	NA	NA	NA	ACP6	35298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17	NA	NA	NA	NA	RNVU1-17	23028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	149853331	149853687	149853509	Y	PLEKHO1	HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SV2A,SF3B4	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BE	2545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	149989448	149989604	149989509	Y	NA	OTUD7B,VPS45	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	8823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32E	70740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P,CA14	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	150231710	150231944	150231778	Y	ECM1,CA14	ANP32E,RNU2-17P,CA14,C1orf54,APH1A,C1orf51,MRPS21	NA	NA	NA	NA	CA14	4156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L,HORMAD1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151579004	151579225	151579123	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	3316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	MRPL9	NA	NA	NA	NA	MRPL9	37347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151916920	151917624	151917271	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	36636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151952807	151953143	151952837	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	11723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	152103437	152103779	152103608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	85054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	152137288	152137323	152137306	Y	CELF3,CELF3,CELF3,HRNR	NA	S100A11	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	118905	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	153525322	153525412	153525387	Y	PGLYRP3,S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4	S100A4,S100A5	K562	ChIA-PET	22265404	S100A4	4710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A4	20406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153545866	153546049	153545958	Y	S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14	CHTOP,S100A14,S100A13,S100A16,S100A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	S100A4	25254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	153714845	153715049	153714983	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153718129	153718295	153718212	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	19586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	3108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	154405181	154405498	154405310	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	154529043	154529152	154529118	Y	NA	UBE2Q1,CHRNB2	NA	NA	NA	NA	UBE2Q1	352	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	154582047	154582244	154582145	Y	UBAP2L,ATP8B2,PBXIP1,ADAR,ADAR	CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	16231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154728745	154728994	154728977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN3	111762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154820307	154820671	154820489	Y	NA	KCNN3	NA	NA	NA	NA	KCNN3	20085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	154986150	154986272	154986211	Y	NA	SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	13023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	155568911	155569221	155569066	Y	ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6	FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-29H23.6	9858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	155916072	155916212	155916141	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	13881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	156632199	156632473	156632320	Y	NA	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2983	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	156645551	156645913	156645806	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	NES	362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156663993	156664153	156664073	Y	TMEM79,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	NA	NA	NA	NA	CRABP2	9455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	156676478	156676824	156676750	Y	C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	2870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	156864713	156865066	156864817	Y	PEAR1	INSRR,PEAR1,LRRC71	NA	NA	NA	NA	PEAR1	3223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	157373072	157373269	157373181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	266806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	158075201	158075434	158075415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	70111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1,CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	CD1D	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	158370656	158370973	158370778	Y	CD1B,CD1E,OR6N1,OR6K3,OR10T2,OR10K1	NA	NA	NA	NA	NA	CD1D	222919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	159886226	159886307	159886250	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	7215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	160158522	160158897	160158632	Y	NA	CASQ1,PEA15	NA	NA	NA	NA	CASQ1	237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	160344568	160344717	160344643	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	9711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	160345693	160345986	160345917	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	10836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	9342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160379189	160379307	160379249	Y	NA	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	10813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160444087	160444465	160444324	Y	VANGL2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	75711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-404F10.2	57513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	160711095	160711588	160711244	Y	CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-404F10.2	72527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	92978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160759511	160759977	160759720	Y	CD84,CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	70715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	161052363	161052546	161052461	Y	F11R,PVRL4	TSTD1,USF1,PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2,DEDD	NA	NA	NA	NA	PVRL4	4843	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	161066354	161066604	161066537	Y	NA	PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2,DEDD	NA	NA	NA	NA	KLHDC9	203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	161170933	161171185	161171002	Y	ADAMTS4,NDUFS2	USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,APOA2,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	4087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	161324130	161324422	161324290	Y	NA	MPZ,SDHC,C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	11242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	HSPA7	NA	NA	NA	NA	HSPA7	8131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	161706477	161706712	161706625	Y	HSPA6,FCRLB,ATF6	DUSP12,ATF6	DUSP12	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP12	10836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	98617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	60637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	163098384	163098482	163098454	Y	RGS5,RGS5	NA	NA	NA	NA	NA	RGS4	61819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2	NA	NA	NA	NA	UCK2	2847	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	DUSP27	NA	NA	NA	NA	DUSP27	24924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	167313306	167313474	167313390	Y	MAEL,POU2F1	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	125240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167398939	167399085	167399047	Y	CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	121919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167469653	167470005	167469884	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	50999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167532775	167533094	167532930	Y	CREG1	CREG1	CREG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREG1	11771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167635730	167635903	167635817	Y	NA	RCSD1	NA	NA	NA	NA	RCSD1	38400	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167684406	167684502	167684454	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	3927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	167954240	167954407	167954319	Y	RCSD1	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF6	51219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	168355862	168356010	168355936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	107584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168382983	168383105	168383068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	134705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	168440429	168440721	168440575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	192151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168446219	168446589	168446402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	197941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	169229816	169229911	169229864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NME7	105294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	170637621	170637732	170637679	Y	PRRX1	NA	NA	NA	NA	NA	GORAB	138351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	170794960	170795269	170795115	Y	FMO3	NA	KIFAP3,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	GORAB	295690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	171189238	171189444	171189341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	263207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	171191543	171191565	171191554	Y	C1orf129,C1orf129	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	261086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	171257317	171257381	171257324	Y	PRRC2C,FMO4	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	195270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	172150201	172150456	172150219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf105	237372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf105	60641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf105	59672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	172788027	172788361	172788212	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	376797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	467349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172888696	172888994	172888711	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	477466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	471615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	173092552	173092771	173092714	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	175571336	175571362	175571351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	317749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	175891419	175891824	175891531	Y	NA	RP11-318C24.1	RFWD2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-318C24.1	2308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.84159687709167
chr1	175902819	175902853	175902836	Y	NA	RP11-318C24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	13708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	176750451	176750537	176750521	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA2	320144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	176806612	176806627	176806620	Y	FAM5B,ASTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA2	376305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	176979493	176979609	176979555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA2	549186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	177150553	177151051	177150740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA2	720246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	177151173	177151362	177151277	Y	ASTN1,FAM5B	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA2	720866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178041559	178041872	178041670	Y	NA	RASAL2	NA	NA	NA	NA	RASAL2	18992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178121154	178121309	178121232	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	60290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178235815	178236162	178236004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	174951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	178252303	178252477	178252337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	191439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178903778	178903964	178903860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	88975	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	179160106	179160405	179160222	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	36414	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	179187224	179187335	179187262	Y	AXDND1,ABL2,SOAT1	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	9484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	179595551	179595594	179595573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	171101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	179606990	179607135	179607063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	182540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	39680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180348181	180348230	180348206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	121859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180612177	180612184	180612181	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	13037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180895607	180895967	180895721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	94080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	181042855	181043067	181042961	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	181096103	181096331	181096188	Y	NA	IER5	KIAA1614,IER5,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	40465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	181097947	181098672	181098524	Y	MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	42309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	181100137	181100521	181100329	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	44499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.38064353708431
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	182070634	182071001	182070793	Y	NA	NA	CACNA1E	IMR90	Hi-C	24141950	GLUL	288340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	182118170	182119053	182118696	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	240288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	182259351	182259676	182259514	Y	NA	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	99665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	183149947	183150219	183150157	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	3154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183237084	183237447	183237420	Y	NA	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	83711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183811794	183811833	183811814	Y	NCF2,NCF2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	206978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183839940	183840077	183840009	Y	NCF2,NCF2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	178734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183854555	183854702	183854673	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	164109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	183865521	183866190	183865847	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	152621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184129300	184129941	184129508	Y	NA	NA	C1orf21	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	110489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184130086	184130836	184130514	Y	NA	NA	C1orf21	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	111275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184387904	184388094	184388025	Y	NA	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	33712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	184852237	184852590	184852311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	89092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	185032022	185032401	185032047	Y	SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2	RNF2	NA	NA	NA	NA	RNF2	19526	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	185308384	185308771	185308525	Y	FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	23923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	185389591	185389741	185389658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	105130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	185528945	185529618	185529036	Y	NA	NA	LOC100288079,IVNS1ABP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IVNS1ABP	244484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	186069411	186069628	186069551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	273197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	186090860	186091020	186090873	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	251805	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	187181531	187181740	187181636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	385446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	187599792	187600205	187599999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	803707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	187677375	187677585	187677480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	881290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	187996792	187997117	187996893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1103306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1185875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	192507991	192508486	192508241	Y	NA	NA	UCHL5,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	174827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	192514282	192514417	192514323	Y	RGS1	NA	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	168896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	192583467	192583478	192583473	Y	RGS1	NA	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	99835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	194047687	194047732	194047710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	958540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	194724030	194724097	194724064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	1634883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	196376822	196377173	196376907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	736651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	197739507	197739631	197739601	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	3195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	198136529	198137056	198136658	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	12436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	198431538	198431860	198431694	Y	NA	NA	NEK7,PTPRC	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	307445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	513772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	199253218	199253776	199253487	Y	NA	NA	LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	100493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	199711776	199712042	199711895	Y	NA	NA	NR5A2,C1orf98	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	357507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200068069	200068443	200068256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	308741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200325072	200325315	200325117	Y	ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	51869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	200448306	200448569	200448314	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2,ZNF281	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF281	71122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	200481491	200481643	200481567	Y	NA	NA	NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	104307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200715755	200716027	200715890	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	9069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	200990087	200990628	200990489	Y	NA	KIF21B,RP11-168O16.1	NA	NA	NA	NA	KIF21B	200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	201424936	201425126	201425034	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	11239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	201494461	201494578	201494476	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	17877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201605860	201605966	201605934	Y	NA	NAV1	IPO9,NAV1,PHLDA3,CSRP1,RPS10P7	IMR90	Hi-C	24141950	NAV1	15449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAV1	23138	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201618983	201619286	201619160	Y	NA	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	201639932	201640262	201640169	Y	PTPN7	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	49521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	57435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	56460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	202056138	202056515	202056288	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	55354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr1	202161674	202161898	202161786	Y	NA	ARL8A,PTPN7,LGR6	NA	NA	NA	NA	LGR6	645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	202214153	202214446	202214299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	53124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	202324768	202324787	202324778	Y	NA	UBE2T,PPP1R12B	NA	NA	NA	NA	PPP1R12B	8941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	202781525	202781905	202781812	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5	NA	NA	NA	NA	PCAT6	3443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203061576	203061925	203061715	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	3794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203122696	203123081	203122889	Y	FMOD,ADORA1	CHI3L1	NA	NA	NA	NA	CHI3L1	30796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	12634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203294985	203295146	203295066	Y	NA	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	22366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	46628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	48055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	203723839	203723956	203723897	Y	NA	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	38826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	203732858	203733184	203733007	Y	BTG2,SOX13,LAX1	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	29598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	203965652	203965916	203965843	Y	NA	NA	ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13	IMR90	Hi-C	24141950	SOX13	74327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204098794	204099127	204098964	Y	NA	ETNK2	NA	NA	NA	NA	ETNK2	20180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	89056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	204317952	204318184	204318134	Y	ETNK2,PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	60735	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204432329	204432499	204432494	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	29353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204684045	204684323	204684297	Y	NA	LRRN2	NFASC,LRRN2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRN2	31184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204700209	204700421	204700355	Y	NA	LRRN2	LRRN2,NFASC	IMR90	Hi-C	24141950	LRRN2	47348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	204893245	204893643	204893527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	97466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	204916243	204916629	204916322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	120464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205228000	205228129	205228064	Y	TMEM81,DSTYK,TMCC2	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	TMCC2	32696	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	205262860	205263030	205262955	Y	CNTN2,CDK18	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	25853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.73499149967112
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10,KLHDC8A	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	205410761	205411314	205411209	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	11768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	205413830	205414535	205414383	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	8547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	205423770	205424352	205424110	Y	NA	LEMD1,CDK18	LOC284576,LEMD1	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD1	688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	205426466	205427019	205426690	Y	NA	LEMD1,CDK18	KLHDC8A	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD1	3384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	205466653	205467067	205466868	Y	TMEM81	LEMD1,CDK18	TMCC2,CDK18,KLHDC8A,LOC284576,LOC284578,MFSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDK18	4656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205510005	205510378	205510192	Y	CNTN2,TMEM81,CDK18	CDK18,RNU2-19P,MFSD4	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	23466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P,MFSD4	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	205640119	205640294	205640209	Y	NA	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	7293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	206304417	206304814	206304499	Y	NA	NA	PM20D1,C1orf186,MFSD4,NUCKS1,SLC41A1,LOC284581,SLC26A9,AVPR1B,CTSE	IMR90	Hi-C	24141950	IKBKE	336977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	206877016	206877221	206877081	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	20727	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	206916099	206916418	206916260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	59810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	206926556	206926809	206926654	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	70267	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	PFKFB2	17215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	207589572	207589691	207589631	Y	NA	CR2	PFKFB2,C4BPA,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	35884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	208267767	208267971	208267827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	147694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	208358733	208359022	208358817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	56643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	208387951	208388224	208388088	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	27441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	208670997	208671177	208671087	Y	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	255332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209215272	209215534	209215454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	224034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209331001	209331148	209331080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	108420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr1	209422787	209423049	209422934	Y	NA	ATP5G2P1	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5G2P1	16519	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209528830	209529176	209528970	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	70989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	209538127	209538433	209538258	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR205HG	61732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	42723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	27808	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	21346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209579567	209579719	209579652	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	20446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	209600780	209600928	209600808	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr1	209606620	209606963	209606837	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	6455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	39826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	SYT14	52099	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	210186039	210186345	210186192	Y	SYT14	NA	NA	NA	NA	NA	SYT14	76501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	210386537	210386820	210386679	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	17324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.38064353708431
chr1	210468396	210468551	210468467	Y	HHAT	HHAT	SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	HHAT	31045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	210812063	210812447	210812256	Y	HHAT,HHAT,KCNH1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	266452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	211258865	211259253	211259186	Y	NA	KCNH1	NA	NA	NA	NA	KCNH1	46204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211349385	211349483	211349480	Y	NA	KCNH1,RP11-543B16.1	HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543B16.1	4566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	211662962	211663302	211663132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	86782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211753366	211753524	211753445	Y	TRAF5	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	3282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211754949	211755173	211755061	Y	NA	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	4865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212447459	212447732	212447595	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	DTL,PPP2R5A,NENF	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R5A	9147	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	44106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	212808477	212808830	212808706	Y	RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3	RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	27946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212811770	212812141	212812009	Y	NA	RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	24635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212841280	212841455	212841352	Y	RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3	RP11-338C15.3,BATF3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	4504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212844659	212845312	212845163	Y	RPS6KC1,BATF3,ATF3	RP11-338C15.3,BATF3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	7883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212896080	212896217	212896149	Y	NA	BATF3	NA	NA	NA	NA	BATF3	24753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	213083359	213083697	213083526	Y	FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	38165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	213088240	213088359	213088300	Y	VASH2	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	33503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	213088828	213089171	213088880	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	32691	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr1	213090277	213090696	213090331	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	31166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.02328568805252
chr1	213151011	213151388	213151292	Y	NA	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	VASH2	29149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	213500745	213500914	213500832	Y	RPS6KC1	NA	PROX1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KC1	278156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	213525317	213525339	213525328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	302728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	213605102	213605329	213605216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	382513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	214157858	214157941	214157900	Y	PROX1	PROX1	PROX1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PROX1	3334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr1	214614073	214614284	214614198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	214619335	214619608	214619472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	104184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	215006647	215006892	215006866	Y	KCNK2,KCNK2	GAPDHP24	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	35185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	215164018	215164287	215164098	Y	NA	KCNK2	KCNK2,CENPF,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK2	12831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	215198285	215198630	215198297	Y	KCNK2,KCNK2	KCNK2	NA	NA	NA	NA	KCNK2	21167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	215229840	215229980	215229952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK2	52722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	216914036	216914339	216914195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	888085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	217308487	217308861	217308605	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	493563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	176753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	218662454	218662669	218662563	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRP15	205825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	218757146	218757164	218757156	Y	NA	NA	LOC728463,RRP15,TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	300517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	302274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	317862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr1	219433064	219433395	219433229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	87878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	219633560	219633803	219633682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	288374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	219728784	219728936	219728867	Y	NA	NA	RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	383598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	220347108	220347461	220347410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	77451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	220510650	220511010	220510830	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	66854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	220512278	220512401	220512362	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	68482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	90545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	221273966	221274169	221274090	Y	HLX	NA	DUSP10,HLX	IMR90	Hi-C	24141950	MARC1	315865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	221361834	221362273	221361894	Y	HLX	NA	HLX	IMR90	Hi-C	24141950	MARC1	403733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	221904432	221904724	221904722	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	8794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr1	222000173	222000483	222000346	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	86655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	222135050	222135329	222135215	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	221532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	222152569	222152616	222152593	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	239051	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	222273748	222273768	222273757	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	360230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	222594059	222594200	222594130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHIPL2	125245	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN8,CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224024642	224024959	224024902	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	6715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224026476	224026743	224026681	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	4931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.524790631275
chr1	224458940	224459060	224459002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVL	57029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	224691192	224691563	224691423	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	68457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	224819300	224819585	224819443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	196565	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	224924986	224925307	224925147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	156657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR,RP11-496N12.6	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	225642606	225642805	225642652	Y	NA	LBR,RP11-496N12.6	EPHX1,LBR,ENAH,SRP9,TMEM63A,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-496N12.6	8240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	226084943	226085104	226084975	Y	LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2,LEFTY2	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LEFTY1	11978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	226086980	226087330	226087189	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2,LEFTY2	TMEM63A	MCF7	ChIA-PET	22265404	LEFTY1	9752	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	226298813	226299157	226299132	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	51261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	226404092	226404450	226404271	Y	NA	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	4869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	25811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	226443007	226443187	226443097	Y	NA	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	33688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226592689	226592838	226592760	Y	PSEN2,PARP1	PARP1,RP11-118H4.1	NA	NA	NA	NA	PARP1	942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr1	226841860	226842030	226841923	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	82994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	226849753	226849884	226849818	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	75140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	226867580	226868182	226867972	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	56842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr1	226911425	226911742	226911463	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	13282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	227936688	227936978	227936805	Y	ZNF678	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	15576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	12.4181852538545
chr1	227981750	227981829	227981790	Y	WNT9A	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	60638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.50451482966744
chr1	228073191	228073261	228073226	Y	WNT9A	NA	NA	NA	NA	NA	WNT9A	60338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr1	228074836	228075224	228075030	Y	NA	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	58375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr1	228079986	228080118	228080041	Y	ZNF678,WNT9A	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	53481	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.524790631275
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	228917012	228917506	228917078	Y	RHOU	RHOU	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	48188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	228945464	228945740	228945561	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	76640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	228962635	228963190	228962905	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	93811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	228963953	228964182	228964095	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	95129	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	228972324	228972426	228972361	Y	RHOU	NA	RHOU,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	103500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229166537	229166799	229166668	Y	RAB4A,C1orf96	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	61853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr1	229210489	229210627	229210547	Y	NA	RP5-1065P14.2	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	18025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229229415	229229758	229229591	Y	RHOU	RP5-1065P14.2	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229262900	229263288	229263094	Y	RHOU	RP5-1065P14.2	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	34248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229268905	229269158	229269032	Y	NA	RP5-1065P14.2	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	40253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229290455	229290569	229290522	Y	NA	NA	RHOU,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	61803	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229296726	229296995	229296861	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	68074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	229307664	229307899	229307845	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	79012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	229339200	229339557	229339342	Y	NA	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	65218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229365571	229365974	229365758	Y	RHOU,SPHAR,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	38801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr1	229374566	229374670	229374620	Y	NA	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	30105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.93093633934961
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	229544503	229544714	229544606	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	97389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	229546455	229546768	229546488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	95335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	229546837	229547142	229546975	Y	C1orf96,ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	94961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	229547907	229548085	229548007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	94018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.32282601870659
chr1	230031091	230031621	230031339	Y	NA	NA	GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT2	159915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	230212552	230213069	230212856	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	21016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	230463743	230463957	230463850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	272207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	230559819	230560264	230559949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	215971	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	230887462	230887658	230887571	Y	NA	CAPN9	NA	NA	NA	NA	CAPN9	6332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	CAPN9	NA	NA	NA	NA	CAPN9	8191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	231629288	231629504	231629366	Y	EXOC8	RP11-295G20.2,TSNAX	NA	NA	NA	NA	RP11-295G20.2	32798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	231913853	231914038	231913997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	153292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	232362022	232362384	232362201	Y	NA	NA	SIPA1L2,TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	DISC1	601461	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	232671774	232671885	232671830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-74P	294048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	232725638	232725888	232725699	Y	SIPA1L2	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	240045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	46.5458598363897
chr1	233248043	233248219	233248131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	163692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	233409089	233409391	233409240	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	RPS7P3	13802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	233619313	233619702	233619577	Y	NA	RNU4-77P	SLC35F3	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-77P	36786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	233702725	233703081	233702848	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	44669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	124489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	234254353	234254647	234254499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	215674	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	214864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234471096	234471421	234471259	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	19466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234534667	234535013	234534780	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	27328	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234648411	234648687	234648551	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	35562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	234668185	234668630	234668443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	55336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234709673	234709936	234709805	Y	NA	IRF2BP2	RBM34,TOMM20,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	33335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr1	234754264	234754665	234754337	Y	NA	IRF2BP2	ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	10993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	234757412	234757805	234757606	Y	NA	IRF2BP2	LOC100506810	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IRF2BP2	14141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	LINC01132	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	45575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	234857710	234858181	234857899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01132	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234862200	234862535	234862470	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	4411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr1	234881537	234881788	234881657	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	23748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	234887087	234887295	234887193	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	29298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01132	50362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	234910767	234910877	234910832	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01132	52978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234918221	234918587	234918404	Y	NA	NA	IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01132	60432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	234980393	234980645	234980479	Y	IRF2BP2	NA	LOC100506810,IRF2BP2,LINC00184	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01132	122604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235068890	235069050	235068971	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01132	211101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235080718	235080947	235080875	Y	ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	208305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	182099	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	235120162	235120433	235120341	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	168819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	166313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	154814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235146978	235147112	235146990	Y	IRF2BP2,RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	142140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235151501	235151917	235151577	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	137335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	235151923	235152024	235152010	Y	ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	137228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	102303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	46253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	42395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	235468267	235468477	235468372	Y	NA	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	20188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr1	235842870	235843206	235843038	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	30816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236021417	236021780	236021768	Y	NA	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	23160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236022018	236022676	236022299	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	236082498	236082788	236082539	Y	LYST,GPR137B,EDARADD	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	37558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236083263	236083651	236083332	Y	GPR137B	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	38323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	NID1	90503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236430059	236430250	236430155	Y	NA	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	13069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	236764383	236764568	236764551	Y	NA	HEATR1	NA	NA	NA	NA	HEATR1	1236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	237458744	237458994	237458869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	255239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	238730357	238730538	238730448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	83034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	239877993	239878320	239878052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN2	297328	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	241209593	241209845	241209719	Y	RGS7	RP11-435F13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	49499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	241638824	241639283	241638985	Y	KMO	FH	RGS7	IMR90	Hi-C	24141950	FH	41778	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	241693216	241693255	241693236	Y	KMO	FH,KMO	NA	NA	NA	NA	KMO	179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	242375774	242375872	242375823	Y	NA	RP11-561I11.3	NA	NA	NA	NA	RP11-561I11.3	10917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	243476313	243476499	243476468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	58993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	243654647	243654885	243654744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	237327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	243781710	243782079	243781895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	230302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	243853401	243853550	243853530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	158831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	50838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	C1orf100	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf100	47339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	244467525	244467677	244467619	Y	AKT3,AKT3,ADSS	C1orf100	SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf100	46260	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr1	244482749	244483387	244483098	Y	AKT3,AKT3,ADSS	C1orf100	SDCCAG8,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	30550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	244486299	244486688	244486462	Y	AKT3,AKT3,ADSS	C1orf100	SDCCAG8,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	27249	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	244505125	244505457	244505330	Y	AKT3,AKT3,ADSS	C1orf100	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	8480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	C1orf100	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	1058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	244517098	244517541	244517376	Y	ADSS	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	3161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	244525463	244525578	244525509	Y	NA	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	11526	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	C1orf100	NA	NA	NA	NA	C1orf100	18965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr1	244894306	244894456	244894354	Y	C1orf100,C1orf101	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	122343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	244895593	244895970	244895904	Y	ADSS,PPPDE1,EFCAB2	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	120829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.09234934870291
chr1	244898732	244899130	244898941	Y	ADSS,PPPDE1	NA	PPPDE1,C1orf101,EFCAB2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	117669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.46998299934225
chr1	245082176	245082355	245082237	Y	EFCAB2	EFCAB2	SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	48652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	245217556	245217830	245217613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	86549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	245399077	245399186	245399185	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	82790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	245563795	245563810	245563803	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	247508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	642077	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr1	246086594	246086610	246086602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	582004	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246316735	246316955	246316845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246317158	246317459	246317368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246591935	246592203	246592010	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	76411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	246957671	246957948	246957811	Y	ZNF695	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	72322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr1	246958730	246958915	246958757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	73381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	8.93394622579457
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247295865	247296225	247296038	Y	ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	30191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr1	247381482	247381863	247381677	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	18120	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247523464	247523760	247523570	Y	AHCTF1,NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF496,AHCTF1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF496	30316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247524183	247524555	247524546	Y	NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF496,AHCTF1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF496	31035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	247537279	247537425	247537333	Y	NA	ZNF496	AHCTF1,ZNF496	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	44131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr1	247540028	247540387	247540122	Y	NA	ZNF496	AHCTF1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF496	46880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	179287	179666	179475	Y	NA	ZMYND11	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	1351911	1352187	1351989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	258433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	1352406	1352778	1352644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	258928	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	1390281	1390451	1390366	Y	ADARB2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	296803	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr10	2159978	2160127	2160053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB2	382308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3107913	3108181	3107997	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	1388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3239590	3239795	3239693	Y	NA	PITRM1	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	26587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3284966	3285255	3285136	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	71963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3800307	3800531	3800378	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	24942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3881297	3881662	3881434	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF6	55824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	3932191	3932411	3932301	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	106718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	4015037	4015380	4015183	Y	NA	NA	LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	189564	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	4048194	4048420	4048346	Y	KLF6	NA	LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	222721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	227013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	NA	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	77380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	3494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	6059034	6059338	6059080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	69612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	6100768	6101025	6100869	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	27925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	6128477	6128873	6128542	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,IL2RA,RBM17,RBM17	RBM17	RBM17,FBXO18,IL15RA,IL2RA	IMR90	Hi-C	24141950	RBM17	77	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	6170843	6171197	6171089	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	RBM17,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	13684	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	6321537	6321781	6321618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	136656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	7235109	7235366	7235309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	216084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	7449887	7450154	7450051	Y	TAF3,SFMBT2,SFMBT2	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	1296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	123471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	7583796	7584039	7583868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	122922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	7898819	7898904	7898862	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	40352	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	8139781	8140040	8139908	Y	NA	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	46214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	8145104	8145382	8145246	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	51537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	8262091	8262339	8262214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	168524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	8374227	8374893	8374382	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	280660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	10839185	10839573	10839228	Y	CELF2	SFTA1P	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	4242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	10914098	10914350	10914196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	79155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	11061356	11061896	11061544	Y	NA	CELF2	NA	NA	NA	NA	CELF2	16097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	11077382	11077525	11077432	Y	NA	CELF2	NA	NA	NA	NA	CELF2	32123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	11112343	11112864	11112373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	67084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	11192902	11193147	11193040	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	147643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	11211427	11212417	11211529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	166168	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	11218697	11219244	11218966	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	173438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	11252483	11252766	11252686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	207224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	11301422	11301770	11301497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	256163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	184200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	165082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	12306536	12306777	12306588	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT5	70393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	12313010	12313140	12313022	Y	UPF2,UPF2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	76341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN,CCDC3	NA	NA	NA	NA	CCDC3	3289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	13800483	13800712	13800626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	173556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr10	14015733	14016130	14015958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	388806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	14029325	14029736	14029659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	402398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	14697070	14697400	14697259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	117496	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38	NA	NA	NA	NA	RPP38	20451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	15416548	15416895	15416799	Y	NA	FAM171A1	FAM171A1,NMT2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171A1	5487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	17063866	17063921	17063894	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	178132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	17470783	17471060	17470983	Y	TRDMT1,STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	23269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	ST8SIA6	75301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	17697506	17697813	17697679	Y	ST8SIA6,STAM	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	13382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	19917803	19917915	19917856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	185253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	99946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	20762079	20762171	20762084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	658911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	21210288	21210394	21210343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	250722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	21241912	21242237	21242078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	218879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21390009	21390197	21390106	Y	MLLT10,MLLT10,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	70919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	24770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21570991	21571411	21571151	Y	NA	NA	C10orf114,MLLT10,DNAJC1,C10orf140,PIP4K2A,NEBL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	88468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr10	21582810	21582927	21582873	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,PIP4K2A,MLLT10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	76952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21683965	21683997	21683982	Y	C10orf140	RP11-275N1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	24086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	21703520	21703700	21703684	Y	NA	RP11-275N1.1	MLLT10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	43641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21716825	21717072	21716945	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	56946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr10	21799318	21799715	21799601	Y	C10orf113	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	21379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	22039558	22039808	22039651	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	180264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.16442289579826
chr10	22046684	22046874	22046779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	173198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	22540192	22540343	22540282	Y	DNAJC1,BMI1	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD3	62560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	22722910	22723095	22723003	Y	DNAJC1	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	114770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr10	22932460	22932672	22932594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	23722747	23722999	23722848	Y	OTUD1	OTUD1	OTUD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	OTUD1	3199	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	24002136	24002390	24002180	Y	NA	KIAA1217	NA	NA	NA	NA	KIAA1217	20461	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	25975342	25975493	25975374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO3A	245703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	26503082	26503465	26503187	Y	MYO3A,GAD2	NA	NA	NA	NA	NA	GAD2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	26566922	26567055	26566989	Y	GAD2	NA	NA	NA	NA	NA	GAD2	63686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	26737474	26738103	26737807	Y	ABI1,APBB1IP	NA	NA	NA	NA	NA	GAD2	234238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	26971794	26972079	26972065	Y	MASTL,ABI1	PDSS1	ABI1	IMR90	Hi-C	24141950	PDSS1	12509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	26980784	26980978	26980863	Y	MASTL,ABI1,PDSS1	PDSS1	PDSS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDSS1	3610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	27069899	27070563	27070182	Y	MASTL,ACBD5,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	ABI1	77453	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	27419520	27419901	27419745	Y	NA	ANKRD26,MASTL,YME1L1	NA	NA	NA	NA	MASTL	21852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	28002936	28003088	28002983	Y	ARMC4,MKX	MKX	NA	NA	NA	NA	MKX	29901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	28223709	28223737	28223723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	62240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	28230250	28230547	28230399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	55430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	28694229	28694387	28694304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	72814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	28733034	28733315	28733175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	86107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29449059	29449232	29449154	Y	NA	NA	WAC,LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	484788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	29493243	29493378	29493326	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	528972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29562481	29562773	29562673	Y	NA	NA	WAC,BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	SVIL	460937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	113795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29922205	29922549	29922392	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	101161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29924706	29925406	29925356	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	98304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	29966336	29966345	29966343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	57365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	SVIL	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	49497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	72739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	30224610	30224950	30224780	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462,MTPAP	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	177473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	30441068	30441357	30441150	Y	NA	KIAA1462	MTPAP,KIAA1462	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	38645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	30842081	30842302	30842110	Y	NA	NA	MAP3K8,LOC729668,KIAA1462,MTPAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	121215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	31993148	31993429	31993299	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	222313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32034546	32034864	32034695	Y	NA	NA	ZNF438,ARHGAP12	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	180878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	32521454	32521704	32521579	Y	NA	NA	KIF5B,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	131233	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	32639699	32640002	32639940	Y	NA	EPC1	EPC1,C10orf68	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	25724	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	33406704	33407129	33406923	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	113984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	33621123	33621423	33621243	Y	NRP1	NRP1	NA	NA	NA	NA	NRP1	1767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	174968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	34700087	34700433	34700328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	250596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	34816179	34816294	34816237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	134735	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35028968	35029134	35029048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	73119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	35098240	35098611	35098558	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	3642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35195075	35195256	35195166	Y	NA	SS18L2P1	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	32937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	35739762	35740277	35740119	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	FZD8	188085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	FZD8	NA	NA	NA	NA	FZD8	3791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	38418230	38418599	38418292	Y	NA	ZNF37A	NA	NA	NA	NA	ZNF37A	36966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	RET,CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	RET	30420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	RASGEF1A	934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr10	43782816	43783033	43782934	Y	CSGALNACT2	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	RASGEF1A	22449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	43817898	43817965	43817923	Y	NA	FXYD4	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	FXYD4	47125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43818292	43818511	43818402	Y	NA	FXYD4	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	FXYD4	46579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43872885	43873113	43872972	Y	NA	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	FXYD4	7795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43913618	43913796	43913710	Y	CSGALNACT2,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	ZNF487P	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-517P14.2	390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	44100382	44100859	44100681	Y	CSGALNACT2	ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF485	527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	44806540	44806774	44806646	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL12	73167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	45445885	45445945	45445917	Y	RASSF4	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	6910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	45469010	45469359	45469182	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	2899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	45914844	45915133	45915015	Y	NA	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	47183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	45965771	45965877	45965832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	98110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	58768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	188277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-463P17.1	674126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	49820546	49821434	49821281	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	40876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	51039519	51039692	51039605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	71094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	52751732	52752116	52752062	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	2787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	53406907	53407200	53407014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	50155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	54211545	54211936	54211751	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	139489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	55358740	55359098	55358883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	1286684	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	60090277	60090586	60090450	Y	IPMK,UBE2D1	UBE2D1	UBE2D1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2D1	2149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	60674120	60674133	60674127	Y	BICC1	NA	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	260217	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	15376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	63807017	63807353	63807186	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	147958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	64394928	64395134	64395066	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	167382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	65026237	65026642	65026597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	135187	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	125539	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	68690818	68690961	68690956	Y	NA	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	7054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	68718064	68718186	68718126	Y	LRRTM3	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	34300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	68802540	68803252	68802892	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	118776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	68831780	68831983	68831882	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	148016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69040041	69040437	69040395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	356277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr10	69466144	69466519	69466384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	129405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69550767	69550960	69550901	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	44964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	69621525	69621936	69621738	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1,MYPN,HERC4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIRT1	20491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	NA	NA	NA	NA	NA	ATOH7	76146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	69947860	69948185	69948022	Y	RUFY2,RUFY2,MYPN	ATOH7	NA	NA	NA	NA	ATOH7	41686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	70805220	70805884	70805439	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	NA	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	58733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	70811970	70812239	70812007	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	NA	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	65483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71002181	71002454	71002318	Y	NA	HKDC1,RP11-227H15.4,HK1	NA	NA	NA	NA	RP11-227H15.4	11935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71228522	71228843	71228683	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	19293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71328689	71329080	71328776	Y	NA	NEUROG3	NA	NA	NA	NA	NEUROG3	1914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr10	71386629	71386882	71386756	Y	NA	C10orf35	NA	NA	NA	NA	C10orf35	1125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71568355	71568510	71568433	Y	NA	COL13A1	NA	NA	NA	NA	COL13A1	8711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71662112	71662205	71662157	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	102468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71675422	71675425	71675424	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	115778	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	72202124	72202468	72202392	Y	EIF4EBP2,NODAL	EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	3239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.19895472612345
chr10	72218739	72219166	72218841	Y	NA	NODAL	KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27	IMR90	Hi-C	24141950	NODAL	13032	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	72730591	72731001	72730786	Y	NA	NA	CDH23,UNC5B	IMR90	Hi-C	24141950	PCBD1	84050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	73109189	73109511	73109382	Y	SLC29A3	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	32174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	73946489	73946835	73946688	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	26952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74007983	74008154	74008117	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	23524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	74085147	74085316	74085305	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	27672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74544491	74544662	74544597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCU	94602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74836640	74837022	74836864	Y	NA	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	17710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	74991679	74992005	74991988	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	14615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	75211378	75211476	75211427	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	30924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	75653245	75653472	75653359	Y	NA	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	13463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	76682814	76683108	76682864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	99474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	77155063	77155414	77155221	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4250	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	77418041	77418318	77418185	Y	C10orf11	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF503	258377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	388581	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	78059263	78059337	78059300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	899599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	78784039	78784371	78784322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	611982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	78826666	78827029	78826848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	569324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79051599	79051864	79051683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	344489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79314756	79315094	79314952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	81259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79324798	79325050	79324993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	71303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	79526031	79526385	79526077	Y	NA	NA	KCNMA1,POLR3A,DLG5	IMR90	Hi-C	24141950	KCNMA1	129678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79545596	79545879	79545660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	138499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79592026	79592206	79592119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	92172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	79651191	79651354	79651229	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	33024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr10	80918312	80918688	80918452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	80925867	80926207	80926136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	99075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80943996	80944377	80944135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	117204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	80981088	80981226	80981157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	123999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	81048115	81048599	81048253	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	56626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	82176099	82176325	82176238	Y	C10orf58	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	10514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	82259709	82259999	82259959	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	47787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	82415742	82416112	82416077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	203820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	86104605	86104727	86104619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR1	152195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	119468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	88571811	88572082	88571947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	57404	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	88631620	88631813	88631713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCG	84562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	SNCG,MMRN2,AGAP11	NA	NA	NA	NA	SNCG	2012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr10	90053186	90053542	90053532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLS	288745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	90320077	90320086	90320082	Y	LIPK	RNLS	NA	NA	NA	NA	RNLS	22201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	90760903	90761071	90761028	Y	FAS	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	12489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	91096650	91097012	91096836	Y	IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1	IFIT2	NA	NA	NA	NA	IFIT2	36938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	93647022	93647304	93647153	Y	FGFBP3	BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	34222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	93924948	93925271	93925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	123573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	95032769	95033088	95033006	Y	NA	RP11-624L12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	9227	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	95040458	95040930	95040561	Y	NA	RP11-624L12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	1385	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95081157	95081194	95081175	Y	O3FAR1	RP11-624L12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	38842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	95195782	95196689	95196040	Y	MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	43385	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	95513454	95513618	95513536	Y	FRA10AC1,LGI1	LGI1	LGI1,O3FAR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LGI1	1948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	95851610	95851772	95851690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	99864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	RP11-310E22.5,RP11-310E22.4	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-310E22.5	17215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97128395	97128611	97128526	Y	NA	NA	PDLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	79614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97302511	97302656	97302624	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	16515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97311589	97311866	97311827	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	7305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97319295	97319590	97319525	Y	C10orf129,SORBS1,SORBS1	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	97687985	97688127	97688056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	69873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	98468328	98468564	98468493	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	9707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	99113804	99114043	99113888	Y	C10orf12,FRAT1,ZFYVE27,ZFYVE27,PI4K2A,FRAT2,RRP12	FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2,RRP12	FRAT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	FRAT2	21346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99174702	99174858	99174830	Y	ZFYVE27,PI4K2A,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	RRP12	K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99307029	99307251	99307137	Y	NA	PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	34880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99334341	99334704	99334523	Y	NA	PI4K2A	NA	NA	NA	NA	PI4K2A	7427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	99356549	99356930	99356740	Y	NA	PI4K2A,MORN4	NA	NA	NA	NA	PI4K2A	14418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	99408797	99409067	99408957	Y	NA	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	17453	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	100082942	100083374	100083163	Y	C10orf28	NA	LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LOXL4	56935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	101026177	101026506	101026344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM1	60350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	101300631	101300706	101300670	Y	NA	NKX2-3	NA	NA	NA	NA	NKX2-3	9941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	101677861	101678026	101677917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	89650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	102030171	102030375	102030254	Y	SEC31B	CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2	NA	NA	NA	NA	CWF19L1	4734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	102490299	102490653	102490523	Y	PAX2	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	2707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	102490692	102490976	102490862	Y	NA	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	2384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	102949466	102949800	102949508	Y	NA	LBX1	BTRC,C10orf76,TLX1NB,FBXW4,POLL,DPCD	IMR90	Hi-C	24141950	LBX1	37751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.82433096192907
chr10	102950131	102950148	102950140	Y	NA	LBX1	BTRC,C10orf76,TLX1NB,FBXW4,POLL,DPCD	IMR90	Hi-C	24141950	LBX1	37403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	103538980	103539052	103538998	Y	NA	FGF8,NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	2118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	103539197	103539512	103539463	Y	NA	FGF8,NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	1658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,C10orf95,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104387544	104387817	104387672	Y	GBF1,CUEDC2,ACTR1A	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	14436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104533606	104534005	104533917	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32,C10orf26	NA	NA	NA	NA	NA	SFXN2	61311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104562998	104563277	104563137	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	C10orf32	NA	NA	NA	NA	C10orf32	48703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104780741	104781119	104780930	Y	LOC729020,PDCD11	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM2	104691	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	104964563	104964973	104964825	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	13507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2,INA	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	32952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr10	105014349	105014646	105014389	Y	NA	INA	NA	NA	NA	NA	INA	20274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105230970	105231363	105231243	Y	NT5C2,CALHM2	CALHM2	CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5	IMR90	Hi-C	24141950	CALHM2	20310	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	105255021	105255220	105255121	Y	NA	CALHM2	NA	NA	NA	NA	CALHM2	44361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	92115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	176901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	105448441	105448500	105448481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	164801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	105466638	105466810	105466737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	146491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105521334	105521711	105521524	Y	SH3PXD2A	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	91590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105530330	105530632	105530481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	82669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	106383721	106383738	106383730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	287559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	107870046	107870052	107870049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	1773884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	108200536	108200832	108200752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	2104374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	108695824	108695948	108695886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	2599662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	110360095	110360471	110360395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1320840	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	110671685	110671807	110671696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1009504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	111650301	111650520	111650491	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	30791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	111766410	111766784	111766651	Y	ADD3	ADD3	NA	NA	NA	NA	ADD3	12284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	112123790	112124003	112123953	Y	MXI1	NA	SMC3,DUSP5,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	61081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	112215418	112215452	112215427	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	40144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	112402938	112403137	112402952	Y	NA	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	783	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	RBM20	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	RBM20	30103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112562548	112562691	112562671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	66874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	113990529	113990656	113990593	Y	NA	GPAM	NA	NA	NA	NA	GPAM	17394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	114148894	114149633	114149365	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC6	55039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	114292106	114292272	114292196	Y	ZDHHC6,VTI1A	NA	NA	NA	NA	NA	VTI1A	87350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	115251940	115252325	115252226	Y	NA	NA	GUCY2GP,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	184617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118,TDRD1	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	116392908	116393338	116393223	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	49424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	116394389	116394785	116394496	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	47977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr10	116556570	116556696	116556633	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	22807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	116726934	116727115	116726983	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	30982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	117830248	117830294	117830271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf82	597481	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	118643126	118643297	118643273	Y	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	143041	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	118922718	118922822	118922754	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	38621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	119008392	119008724	119008502	Y	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	124254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	120997743	120998072	120997908	Y	NA	GRK5	NA	NA	NA	NA	GRK5	32642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	110070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	121446860	121447228	121446967	Y	NA	BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	37978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	122263752	122264109	122263932	Y	NA	PPAPDC1A	NA	NA	NA	NA	PPAPDC1A	49286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	123340054	123340398	123340080	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	15574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	123418268	123418559	123418278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	62296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	123900798	123900950	123900924	Y	TACC2	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	154109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	124222687	124222865	124222833	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	3646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	124249700	124250033	124249857	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	30659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CPXM2	57133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr10	126021099	126021412	126021201	Y	CHST15	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	84133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126139767	126140160	126139923	Y	NKX1-2	OAT,NKX1-2,LHPP,RPS10P18	NA	NA	NA	NA	NKX1-2	3014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr10	126329893	126330183	126330084	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	100655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126359464	126359807	126359742	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	71031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126407586	126408269	126407949	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	22569	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126421726	126422139	126421939	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	8699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126445536	126445891	126445571	Y	ZRANB1	FAM53B,METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	14698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126717665	126717735	126717700	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	113953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126768245	126768621	126768433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	79118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	126797219	126797324	126797258	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	50415	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126837951	126838191	126838020	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	9548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	127576777	127576887	127576832	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	127587236	127587432	127587340	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	4128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	127835963	127836173	127836068	Y	MMP21	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	252855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	127865568	127866004	127865890	Y	ADAM12,MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	282460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	127877615	127877988	127877913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	294507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	127915196	127915439	127915419	Y	ADAM12,MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	332088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	128075178	128075883	128075417	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	492070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	128595349	128595449	128595411	Y	DOCK1	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	3371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	129239664	129239829	129239755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI2	293670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	129789575	129789766	129789637	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	132883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	130339551	130339892	130339738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	416902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	132099901	132100191	132100002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	167238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	133742915	133743140	133742982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	50295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	133763722	133764008	133763747	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	29427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	134225356	134225596	134225555	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	16684	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	26035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	134235789	134236113	134236058	Y	NA	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	27117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	57944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	134975074	134975296	134975198	Y	NA	KNDC1	NA	NA	NA	NA	KNDC1	3123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr10	135048867	135049308	135048949	Y	TUBGCP2,ADAM8	UTF1	NA	NA	NA	NA	VENTX	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr10	135059182	135059590	135059282	Y	TUBGCP2	UTF1,VENTX	NA	NA	NA	NA	VENTX	10274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	UTF1,VENTX,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	VENTX	25783	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	VENTX,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr10	135107749	135108037	135107982	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	11942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	312288	312763	312359	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3	NA	NA	NA	NA	IFITM1	782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	316246	316608	316492	Y	TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3	NA	NA	NA	NA	IFITM1	4740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	316965	317318	317187	Y	SIRT3,SIGIRR,SIGIRR,LRRC56,ANO9,ATHL1,IFITM1	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3	NA	NA	NA	NA	IFITM1	5459	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	333787	334164	333964	Y	NA	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8250	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr11	341474	341670	341587	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	RIC8A,SIRT3,BET1L,IFITM3,IFITM1,IFITM5,PSMD13,IFITM2,NLRP6,ATHL1,PTDSS2,SIGIRR,ANO9,B4GALNT4,PKP3,RNH1	IMR90	Hi-C	24141950	IFITM3	15937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	16705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr11	353403	353830	353519	Y	CEND1,B4GALNT4	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	13966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	738048	738285	738171	Y	PKP3,SIGIRR	EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1	NA	NA	NA	NA	TALDO1	7044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	840856	841090	840896	Y	NA	SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	TSPAN4	48	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	1043654	1043838	1043746	Y	MUC6	NA	AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	AP2A2	120760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	87672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	1245627	1245992	1245771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	82892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	1543133	1543339	1543203	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	47811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	1567391	1567752	1567532	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	23398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	1772582	1772778	1772637	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	5503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	1894620	1894889	1894765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC139143.2	71295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	2008416	2008795	2008568	Y	NA	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	41908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	2031573	2031928	2031751	Y	NA	NA	TH,INS-IGF2,MIR4686,KRTAP5-4,MOB2,KRTAP5-2,KRTAP5-3,KRTAP5-6,FAM99B,IGF2-AS1,IGF2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL23	65065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	2200082	2200579	2200535	Y	SYT8,ASCL2,IGF2,TH	IGF2	NA	NA	NA	NA	IGF2	31249	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	2226111	2226485	2226212	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	57278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	2402008	2402516	2402305	Y	KCNQ1	RPL26P30,CD81,CD81-AS1,TSSC4	NA	NA	NA	NA	CD81-AS1	4786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	2619837	2620105	2619972	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	99119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	2643075	2643474	2643317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	75750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	2714612	2714953	2714746	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	4271	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	4455172	4455497	4455357	Y	TRIM21	TRIM21	NA	NA	NA	NA	TRIM21	42246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	4485531	4485899	4485569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM21	72605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	5301836	5302123	5301938	Y	HBB,HBD,HBG1,HBG2	NA	HBG1,HBG2	IMR90	Hi-C	24141950	AC104389.32	79722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	6273296	6273510	6273448	Y	NA	FAM160A2,CCKBR	NA	NA	NA	NA	CCKBR	5456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	6884595	6884618	6884606	Y	DCHS1,OR2AG2,OR2AG1,OR6A2,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF215	61017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	7719377	7719648	7719531	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	22924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9023312	9023663	9023569	Y	ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	NRIP3	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9083517	9083608	9083563	Y	ZNF143,RPL27A,NRIP3,DENND5A	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP3	59921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	SCUBE2	NA	NA	NA	NA	SCUBE2	27725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	9639557	9639822	9639717	Y	WEE1	WEE1,SWAP70	LOC283104,LOC440028,SBF2,SWAP70,ZNF143	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	43802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9697347	9697585	9697499	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	13723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70,SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	45590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	9770028	9770265	9770206	Y	WEE1,SWAP70	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	7574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	9907928	9908258	9908093	Y	NA	NA	SWAP70,LOC440028,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	SBF2-AS1	130089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	225973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	10063724	10063946	10063792	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	249808	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	10302186	10302573	10302380	Y	NA	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	SBF2	11181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	ADM	22961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	10388178	10388602	10388329	Y	ADM	NA	SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	63951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	10404161	10404389	10404339	Y	ADM	NA	SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	79934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	12222498	12222995	12222733	Y	MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	108955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	143692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr11	13184094	13184485	13184290	Y	NA	NA	LOC100506305,RASSF10,TEAD1	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	111714	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	13244798	13244951	13244872	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	51248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	14362320	14362599	14362499	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	21453	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	15599138	15599455	15599287	Y	NA	NA	C11orf58	IMR90	Hi-C	24141950	CALCA	607238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	16893238	16893541	16893423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	101019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	17008586	17008989	17008853	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	14026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	17929463	17929485	17929474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	103224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	19681860	19681955	19681908	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	311589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	20134058	20134420	20134284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	248811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	26003639	26003950	26003795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUC15	587830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	26223138	26223326	26223232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUC15	368454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	27451921	27452137	27452029	Y	NA	LGR4	NA	NA	NA	NA	LGR4	40185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	28795482	28795636	28795549	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	667627	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	30510063	30510254	30510126	Y	FSHB,MPPED2,MPPED2	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	96165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	32109882	32110285	32110029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX6	272373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	WT1	NA	NA	NA	NA	WT1	12434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	33668919	33669067	33668993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD59	86924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	33964663	33964690	33964681	Y	NA	NA	LMO2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMO2	52827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	34230085	34230408	34230173	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	NAT10	104936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	34255626	34256042	34255739	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	99508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	34272631	34272979	34272746	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	82571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	ELF5	173525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	35109319	35109885	35109545	Y	CD44	CD44	CD44,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	48532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	35395403	35395808	35395629	Y	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PAMR1	154040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9,PRR5L	NA	NA	NA	NA	PRR5L	15365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	36530791	36531124	36530883	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	36706778	36707052	36706817	Y	RAG1,RAG2	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	92727	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	43773446	43773547	43773497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf96	171345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf96	165488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44123492	44123510	44123502	Y	NA	ACCS,EXT2	NA	NA	NA	NA	EXT2	8393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX4	89548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	ALX4	NA	NA	NA	NA	ALX4	2390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	44340765	44340927	44340816	Y	ALX4	ALX4	EXT2,ALX4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALX4	11049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	44341406	44341701	44341459	Y	ALX4	ALX4	EXT2,ALX4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALX4	11690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44702928	44703040	44702985	Y	NA	TSPAN18	EXT2	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	42975	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	44749241	44749630	44749607	Y	TSPAN18	TSPAN18	PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	3226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	44758780	44759166	44758916	Y	NA	TSPAN18	TSPAN18,PRDM11,CD82,TP53I11,SYT13	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	12765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44883806	44884166	44884088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	86674	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	44884936	44885127	44885041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	85713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44938363	44938586	44938477	Y	NA	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	32254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	44963197	44963482	44963283	Y	NA	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	7358	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	45107723	45107880	45107802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	136883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	45110922	45111223	45111073	Y	TP53I11	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	140082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	45519986	45520403	45520306	Y	MAPK8IP1	NA	CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	CHST1	164769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	46022978	46023304	46023145	Y	NA	NA	GYLTL1B,MAPK8IP1,C11orf94,PEX16	IMR90	Hi-C	24141950	GYLTL1B	81806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	26745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	46312210	46312394	46312323	Y	NA	CREB3L1,DGKZ	NA	NA	NA	NA	CREB3L1	14998	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	50184566	50184586	50184575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-347H15.4	71164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	56980843	56981208	56981026	Y	NA	APLNR	NA	NA	NA	NA	APLNR	21501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	57083068	57083441	57083322	Y	NA	TNKS1BP1,SSRP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	6985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	57224938	57225034	57225001	Y	SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3	RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	41033	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	57713900	57713912	57713908	Y	UBE2L6,OR9I1,OR5B17,OR1S1,OR10Q1,OR5B3,OR5B2,OR5B12,OR1S2,OR10W1,OR9Q2,OR9Q1,OR6Q1	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND1	195185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	59582834	59583156	59582993	Y	NA	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	6489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	59868075	59868428	59868178	Y	MRPL16,MS4A3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL16	291730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	60809729	60810107	60810025	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	116982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	60871198	60871450	60871295	Y	CD6,SDHAF2,CD5	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	55639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	60917835	60918043	60917849	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	9046	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.61112020708799
chr11	61064926	61064998	61064962	Y	NA	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	4030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	LRRC10B	7635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	47643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr11	61446826	61446957	61446891	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61467819	61468013	61467906	Y	CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	21914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61484059	61484366	61484213	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,DAGLA,FTH1	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	38154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61600948	61601213	61601130	Y	CYBASC3	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	6158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61668685	61669076	61668735	Y	C11orf9,BEST1	FADS3,RAB3IL1	NA	NA	NA	NA	FADS3	11162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61690120	61690238	61690179	Y	NA	FADS3,RAB3IL1,FTH1	RAB3IL1,FTH1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB3IL1	4379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	61690816	61690947	61690856	Y	RAB3IL1	FADS3,RAB3IL1,FTH1	RAB3IL1,FTH1,INCENP	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB3IL1	5075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	61800988	61801486	61801080	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	67856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	62690251	62690389	62690292	Y	NA	CHRM1	NA	NA	NA	NA	CHRM1	2972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	LGALS12,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.10961526386551
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	LGALS12,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	19101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	63377121	63377300	63377211	Y	HRASLS5,LGALS12,LGALS12,PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	5055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	63377789	63377920	63377869	Y	PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	4435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	44639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	63837811	63837961	63837886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUB1	86486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	84501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr11	63954598	63954956	63954814	Y	FERMT3,CCDC88B,OTUB1	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB	NA	NA	NA	NA	STIP1	3854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	64363562	64364093	64364079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN2	124567	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	64416675	64417001	64416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN2	71659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.02027580160756
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	8.30856998998896
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.71772558450853
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	22.7815628757762
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	14950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	66094685	66094783	66094735	Y	CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248	YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	7528	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	66849173	66849303	66849226	Y	NA	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	26884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	67270751	67271055	67270865	Y	NA	TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	PITPNM1	679	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	67367234	67367512	67367373	Y	NA	GSTP1,NDUFV1,NUDT8,ACY3	NA	NA	NA	NA	NDUFV1	4811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	68273880	68274272	68274031	Y	NA	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	47694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	68516686	68516842	68516764	Y	NA	MTL5	NA	NA	NA	NA	MTL5	190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr11	68623126	68623609	68623402	Y	MTL5,CPT1A	CPT1A,MRPL21,IGHMBP2	CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPT1A	13248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	68722813	68723020	68722901	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	53503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	68775199	68775469	68775336	Y	NA	MRGPRF,TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	MRGPRF	3408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	MRGPRF	2332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.66291795257578
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	NA	NA	NA	NA	MRGPRF	88	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr11	68808319	68808729	68808592	Y	IGHMBP2,TPCN2	MRGPRF,TPCN2	MTL5,CPT1A,IGHMBP2,MRPL21,MRGPRD,MRGPRF,TPCN2,CCND1,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	5636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr11	68921150	68921435	68921292	Y	NA	NA	ORAOV1,CCND1,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	106785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	AP000439.2	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	21935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69250208	69250340	69250290	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	7171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	5270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr11	69257004	69257137	69257079	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69257578	69257894	69257648	Y	NA	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	67	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.2,AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr11	69325355	69325496	69325426	Y	NA	AP000439.3	MYEOV,MRGPRD,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	32647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.66291795257578
chr11	69586936	69586990	69586963	Y	FGF4	FGF4	NA	NA	NA	NA	FGF4	1181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	FGF4	206472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	FGF4	207375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69808413	69808546	69808480	Y	NA	NA	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	FGF4	220242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69809602	69809958	69809614	Y	NA	NA	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	FGF4	221431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	FGF4	223819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr11	69818525	69818834	69818617	Y	NA	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	FADD	228435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	69906060	69906083	69906072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FADD	141186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	70090856	70091139	70091025	Y	NA	FADD,PPFIA1	PPFIA1,FADD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPFIA1	23667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	70413927	70414164	70414002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	171333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	70748291	70748347	70748332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHANK2	213276	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	71892346	71892672	71892509	Y	NA	RP11-807H22.5,FOLR1,INPPL1	RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FOLR1	5930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	72455084	72455310	72455221	Y	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	47334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	39897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	72555518	72555570	72555544	Y	ATG16L2	ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	32165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	72906397	72906513	72906453	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	20830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	72909664	72909952	72909864	Y	RELT,RELT,P2RY2,P2RY2	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	17391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	73034605	73034942	73034774	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	17271	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	74667774	74667939	74667906	Y	RNF169	XRRA1,SPCS2,NEU3	NA	NA	NA	NA	SPCS2	9482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75041361	75041638	75041486	Y	ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	19235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr11	75051761	75052000	75051847	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	8873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	75060567	75060771	75060596	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	75060875	75061139	75061045	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	2	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	14345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75581181	75581426	75581320	Y	MAP6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	56730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	138198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75883349	75883640	75883491	Y	NA	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	36140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	27137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	76285451	76285730	76285592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf30	131484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	76474777	76474856	76474817	Y	OMP	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90	Hi-C	24141950	TSKU	16439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5,MYO7A	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	77156016	77156186	77156101	Y	PAK1	PAK1	NA	NA	NA	NA	PAK1	27494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	78029499	78029864	78029682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	97530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	78060066	78060579	78060413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	66815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	78061236	78062132	78061949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	65262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	78113040	78113383	78113360	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	14011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	78823414	78823685	78823657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	539495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	78896496	78896592	78896544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	612577	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	79082463	79082536	79082500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	798544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	79093983	79094278	79094131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	810064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	79117451	79117736	79117547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	833532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	79149040	79149340	79149145	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	865121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	80458246	80458570	80458327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1940001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	81132350	81132370	81132360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1266201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	83448603	83448921	83448762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	282347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	84093911	84093923	84093916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	927655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	84842464	84842648	84842557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	494981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	85768953	85769276	85769115	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	9648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	86642953	86643307	86643130	Y	NA	FZD4	NA	NA	NA	NA	FZD4	21126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	86841159	86841223	86841164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	94273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	90822237	90822333	90822285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	808509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	91338604	91338624	91338614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	1324876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	93253925	93254245	93254149	Y	SLC36A4,C11orf75	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	12389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	94383983	94384336	94384252	Y	NA	NA	AMOTL1	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	53261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95163190	95163241	95163211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESN3	199485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95890101	95890693	95890420	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	183651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95893318	95893469	95893394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	180875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr11	96024131	96024308	96024240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	50036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	100547720	100547959	100547794	Y	ARHGAP42	ARHGAP42	ARHGAP42	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP42	8425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr11	100590591	100590889	100590693	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	34207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	100947372	100947678	100947525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	390988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	101881929	101882102	101882031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	97090	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	102461117	102461349	102461270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM123	122002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	104565898	104566071	104565977	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16	404087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	108519095	108519272	108519184	Y	NA	DDX10	ATM,ACAT1,NPAT	IMR90	Hi-C	24141950	DDX10	14480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	109358669	109358908	109358789	Y	NA	NA	DDX10	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	603179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	109948670	109948938	109948846	Y	ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZC3H12C	13149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	MIR34B,LAYN	NA	NA	NA	NA	LAYN	6266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111402940	111403306	111403128	Y	NA	MIR34B,LAYN	NA	NA	NA	NA	LAYN	5699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111664556	111665052	111664796	Y	SIK2,BCO2	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	29405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111849134	111849433	111849303	Y	SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	44105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	111853928	111854208	111854100	Y	NA	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	39330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	113828537	113828676	113828607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	84245	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	17089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	114086670	114086890	114086745	Y	ZBTB16,ZBTB16	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	39619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	115172228	115172553	115172441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	201122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	115345794	115346124	115345959	Y	NA	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	27551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	115867610	115867831	115867734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-136I14.5	416595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	116061103	116061309	116061204	Y	NA	NA	CADM1,FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	580395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	116271769	116271780	116271773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	369924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	116310023	116310403	116310367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	331301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	102088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	116870646	116870996	116870865	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	33771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	117679991	117680281	117680071	Y	IL10RA	DSCAML1,RP11-728F11.4	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	5959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr11	117685393	117685836	117685712	Y	IL10RA	DSCAML1,RP11-728F11.4	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	404	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	DSCAML1,RP11-728F11.4	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr11	117756668	117756781	117756736	Y	FXYD6	FXYD6-FXYD2,FXYD6,TMPRSS13	FXYD6-FXYD2	IMR90	Hi-C	24141950	FXYD6	10467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	117817562	117817842	117817764	Y	NA	TMPRSS13	FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,IL10RA	IMR90	Hi-C	24141950	TMPRSS13	19388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	117879327	117879545	117879418	Y	AMICA1,AMICA1,IL10RA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS4	66208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	118187372	118187677	118187544	Y	DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D	CD3D,CD3G,UBE4A	NA	NA	NA	NA	CD3D	23782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	118489001	118489167	118489084	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	13846	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	118562658	118562793	118562724	Y	FOXR1	NA	BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDB1	87503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.14715698063566
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	11160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	119377463	119377481	119377472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THY1	83768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	119562613	119562997	119562902	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	34797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	119626512	119626655	119626589	Y	USP2	PVRL1	LOC100499227,PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	28718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	120164292	120164384	120164342	Y	NA	TMEM136,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	TMEM136	29454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121330249	121330515	121330350	Y	SORL1	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	8527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121335104	121335660	121335286	Y	SORL1	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	13382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	15694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr11	121338733	121339149	121338843	Y	SORL1	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	17011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121353016	121353670	121353326	Y	SORL1	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	31294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	204318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	121526794	121527145	121526879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	205072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	121593077	121593718	121593342	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-730K11.1	271355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122080743	122080920	122080836	Y	NA	NA	SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166D19.1	95712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122100461	122100655	122100524	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166D19.1	115430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	192677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	NA	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	UBASH3B	212711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	122527331	122527938	122527906	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	2948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr11	122847536	122847832	122847753	Y	C11orf63,BSX	BSX	NA	NA	NA	NA	BSX	2596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr11	123172652	123173022	123172941	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	108663	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	123293400	123293723	123293427	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	229411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	123407861	123408201	123408031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	115751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	54613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	123613222	123613605	123613414	Y	NA	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	2839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	123613702	123613859	123613783	Y	OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	3319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr11	123984777	123984974	123984888	Y	VWA5A	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	124062644	124062948	124062749	Y	OR6X1,OR6M1,OR8D4,OR4D5,OR6T1,OR10G4,OR10G7,VWA5A,OR8D2,OR8B12,OR8A1,OR8D1,OR8B8,TBRG1,OR8G2,OR8G1	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	78575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	125146411	125146772	125146529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM218	166752	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON,NAP1L1P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L1P1	2454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	126175725	126175882	126175809	Y	HYLS1,DCPS	FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	3512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	126303472	126303676	126303574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	79937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	126322273	126322455	126322358	Y	NA	NA	ST3GAL4	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL4	98738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	126534137	126534148	126534143	Y	FOXRED1,KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	310602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	126790922	126791265	126791130	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	567387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	128480883	128481272	128481046	Y	ETS1,FLI1,FLI1	ETS1	ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	25430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	128579282	128579748	128579400	Y	FLI1,FLI1	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	24852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	128589113	128589189	128589151	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	34683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	46251	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr11	129920255	129920483	129920343	Y	APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14	IMR90	Hi-C	24141950	APLP2	17249	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	130016455	130016576	130016492	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	10881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	130860257	130860277	130860267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	75853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	NTM	924306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	133820960	133821043	133820967	Y	IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	3837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr11	133825450	133825979	133825755	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	3605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr11	133919324	133919581	133919497	Y	IGSF9B	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	17239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr11	134688539	134688830	134688760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	408727	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	134704831	134705001	134704917	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	425019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	428274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr11	134863685	134863877	134863782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	583873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	647081	647236	647154	Y	ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	46416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	13275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	8152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	690377	690646	690594	Y	NA	RP5-1154L15.2,RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	3006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	788188	788669	788451	Y	NA	NINJ2	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ2	17243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	831737	831923	831794	Y	NA	WNK1	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNK1	27836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	833741	833842	833785	Y	NA	WNK1	NINJ2,B4GALNT3,WNK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNK1	25917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	1387073	1387485	1387229	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	249572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	125697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	52725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	1699844	1700200	1699934	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	1131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr12	1744932	1745222	1745077	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	43601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B,RP5-1096D14.6	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1096D14.6	32445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	2161154	2161552	2161208	Y	LRTM2	DCP1B,RP5-1096D14.6	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	49322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	2175107	2175395	2175116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	63275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	2307539	2307834	2307597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	195707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	2401865	2402116	2401991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	290033	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	2442171	2442390	2442316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	330339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3226381	3226449	3226415	Y	TSPAN9	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	41860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3326549	3326840	3326665	Y	TSPAN9	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	7453	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3420231	3420354	3420293	Y	PRMT8	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT8	68161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	PRMT8	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	PRMT8	37568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3570607	3570823	3570738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT8	82092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3856709	3856898	3856806	Y	PARP11,EFCAB4B	NA	NA	NA	NA	NA	PARP11	123710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	3979182	3979441	3979276	Y	PARP11	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	1167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4027276	4027298	4027287	Y	FGF23	PARP11	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	46668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	4071693	4072058	4071911	Y	EFCAB4B,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	91085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4131276	4131377	4131327	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	150668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	4245075	4245501	4245252	Y	PARP11,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	135437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4252128	4252433	4252201	Y	EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	128505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	4262574	4262924	4262750	Y	EFCAB4B,PARP11,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	118014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4274113	4274463	4274167	Y	CCND2	NA	NA	NA	NA	NA	CCND2	106475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	4313058	4313407	4313227	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	67531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4378284	4379414	4378568	Y	PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	PARP11	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	1524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr12	4396260	4396408	4396285	Y	NA	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2-AS2	14029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4402799	4402949	4402883	Y	NA	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2-AS2	20568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4403384	4403473	4403428	Y	NA	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2-AS2	21153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	4406037	4406342	4406147	Y	PARP11,CCND2	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	22029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	4747603	4747847	4747725	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	AKAP3	8366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	4758958	4759134	4759102	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	2697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	4845288	4845672	4845482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNA6	70670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	4880425	4880454	4880440	Y	NA	KCNA6	NA	NA	NA	NA	KCNA6	35888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	5566178	5566568	5566311	Y	NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	26900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTF3	50259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	137643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	6288535	6288780	6288632	Y	CD9,VWF	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	18101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6383862	6383986	6383924	Y	ACRBP	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	33616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	6482550	6482923	6482687	Y	SCNN1A,SCNN1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	TNFRSF1A	K562	ChIA-PET	22265404	LTBR	339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6537554	6537731	6537643	Y	NA	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	7933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2	NA	NA	NA	NA	IFFO1	9	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.18168881096085
chr12	7709963	7710079	7710022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOBEC1	106420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	7736832	7737158	7736952	Y	PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1	NA	NA	NA	NA	NA	APOBEC1	79341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	7790789	7791157	7790868	Y	NA	APOBEC1	NA	NA	NA	NA	APOBEC1	25342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	7865522	7865674	7865603	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	APOBEC1,GDF3,DPPA3	NA	NA	NA	NA	DPPA3	3472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr12	7978463	7978836	7978682	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	NANOG	NA	NA	NA	NA	NANOG	40073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	7987438	7987606	7987534	Y	SLC2A3,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A	NANOG	NA	NA	NA	NA	NANOG	49048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	8013004	8013217	8013212	Y	NA	SLC2A14	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	28527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	8059074	8059227	8059161	Y	NA	SLC2A14,SLC2A3	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	17330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.73499149967112
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	8605684	8606164	8606043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC4E	85395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr12	8763701	8764050	8764012	Y	AICDA	SCARNA11,AICDA,MFAP5	NA	NA	NA	NA	AICDA	234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	8797579	8797828	8797667	Y	NA	SCARNA11,AICDA,MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	15656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	8828014	8828577	8828369	Y	NA	MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	RIMKLB	3619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	8966613	8966834	8966743	Y	CLEC6A,CLEC4E,PHC1,M6PR	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	14709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr12	8969039	8969453	8969246	Y	NA	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	12090	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	8971788	8972170	8971968	Y	NA	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	9373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	9059535	9059596	9059566	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	9060195	9060360	9060254	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	9185999	9186130	9186065	Y	CLEC4E,M6PR,KLRG1	NA	NA	NA	NA	NA	A2M	80695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9228740	9228924	9228916	Y	NA	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	37901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9491229	9491519	9491373	Y	NA	NA	C12orf33,LOC144571	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP4	100302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	9802084	9802505	9802358	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	KLRB1,RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	3479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	KLRB1,RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	4764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9804148	9804385	9804240	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	KLRB1,RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	5543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9915681	9915930	9915778	Y	OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	4184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9917181	9917686	9917498	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	5684	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9931938	9932092	9931986	Y	NA	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	20441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9966772	9967089	9966969	Y	KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF2,KLRF1,CLEC2B	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	53646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	CLEC1A,CLEC7A,OLR1	NA	NA	NA	NA	OLR1	16283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	10337097	10337455	10337232	Y	NA	OLR1,GABARAPL1	NA	NA	NA	NA	OLR1	14360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	10409972	10410105	10410016	Y	NA	GABARAPL1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	46915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	11582484	11582789	11582637	Y	TAS2R50,TAS2R43,TAS2R42	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	217999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	11778051	11778121	11778086	Y	NA	ETV6	ETV6,MANSC1,BCL2L14	IMR90	Hi-C	24141950	ETV6	22667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	11902953	11903896	11903427	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	102165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	11926847	11927297	11927011	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	126059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	11966137	11966507	11966203	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	165349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	11976145	11976420	11976223	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	175357	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12032964	12033203	12033084	Y	BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	167575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12161273	12161524	12161399	Y	LOH12CR1	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	39254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12162075	12162513	12162342	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	38265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	36222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	12425810	12426042	12425926	Y	NA	LRP6	BCL2L14,LRP6,MIR1244-2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP6	7864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12512304	12512319	12512312	Y	NA	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	4291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12532834	12533375	12533099	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,BCL2L14,LOH12CR1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	24821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12594845	12595716	12595015	Y	LOH12CR1,GPR19,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	86832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12654210	12654272	12654270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP16	59045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12735834	12736179	12735985	Y	NA	DUSP16,CREBL2	LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP16	22517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.03754171677016
chr12	12775556	12775830	12775680	Y	LOH12CR1,CDKN1B,APOLD1,DUSP16	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	12795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	13257470	13257645	13257541	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	62252	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	13320198	13320450	13320349	Y	NA	EMP1	APOLD1,HTR7P1,EMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	27200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13408937	13409175	13409167	Y	NA	NA	HTR7P1,HEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	61287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13431254	13431391	13431326	Y	NA	NA	C12orf36	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	83604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13677891	13678188	13677997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf36	139790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	13959726	13960014	13959880	Y	GRIN2B	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf36	421625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	14112244	14112326	14112257	Y	GRIN2B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P11	404111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	105420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	102512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr12	14549073	14549306	14549114	Y	WBP11,ATF7IP	RPL30P11,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	32463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	15138089	15138465	15138277	Y	NA	ERP27,ARHGDIB	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	25427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	15287124	15287167	15287146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	174462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	15409824	15410065	15409954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6K23.1	180396	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	15916950	15917280	15917185	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	115983	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	16698348	16698413	16698381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO3	63115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	16970054	16970256	16970077	Y	LMO3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1018J11.1	169804	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	18975317	18975464	18975389	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	305184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	19017500	19017849	19017674	Y	NA	NA	PIK3C2G,PLEKHA5	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	262799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	19557871	19558201	19558036	Y	NA	AEBP2	AEBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	2892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	19635536	19635865	19635672	Y	NA	RP11-841C19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-841C19.1	23973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	19932429	19932596	19932501	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	57060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	248940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	20193417	20193449	20193433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-146P	318048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	20365637	20365979	20365748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	154200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	PDE3A	NA	NA	NA	NA	PDE3A	23207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	20746479	20746810	20746645	Y	LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	226300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	259898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	455045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B,C12orf39	NA	NA	NA	NA	C12orf39	10863	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	23625293	23625709	23625512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114G22.1	774500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24020753	24020934	24020819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	692590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	24752569	24752849	24752709	Y	BCAT1	RP11-444D3.1	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	39045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24819835	24820078	24819957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	106311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24865404	24865546	24865458	Y	BCAT1	NA	SOX5,LINC00477	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	151880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24959393	24959656	24959538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	140737	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	24991472	24991796	24991668	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	108597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25004985	25005042	25005012	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	95351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	25075175	25075409	25075293	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	24984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	25380896	25381137	25381017	Y	NA	CASC1,LYRM5,KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	20733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.86187267869923
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	26512613	26512980	26512754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	235063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26522536	26522924	26522687	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	244986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26626326	26626794	26626426	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	348776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26663094	26663473	26663334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	320658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26889779	26890108	26889932	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	94023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26921613	26921734	26921675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	62397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27174273	27174510	27174392	Y	C12orf71	TM7SF3,MED21	NA	NA	NA	NA	MED21	794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	27748114	27748496	27748421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	73750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	28185706	28185999	28185851	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	98183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29255855	29256205	29256030	Y	NA	FAR2	NA	NA	NA	NA	FAR2	43831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29360104	29360380	29360183	Y	NA	NA	FAR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	60068	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29384315	29384619	29384467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR2	84279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	29395025	29395583	29395357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR2	94989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29395961	29396397	29396130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR2	95925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	29793130	29793229	29793210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	142463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	29859887	29860252	29860216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	75440	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	29903685	29903894	29903854	Y	NA	TMTC1	NA	NA	NA	NA	TMTC1	31798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	30570849	30571198	30571024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	275722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	30975226	30975478	30975347	Y	NA	LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	29249	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	2790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr12	31523933	31524084	31523973	Y	DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	3698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.57357849031783
chr12	31524246	31524432	31524371	Y	NA	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	4011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	31754010	31754391	31754188	Y	DENND5B,METTL20	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B	IMR90	Hi-C	24141950	DENND5B	11979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	31789524	31789538	31789533	Y	NA	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B,METTL20	IMR90	Hi-C	24141950	METTL20	8556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.96847805611977
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	31904092	31904287	31904219	Y	NA	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	NA	NA	NA	NA	RP11-467L13.5	1364	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	31905440	31905706	31905591	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	NA	NA	NA	NA	RP11-467L13.5	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	31909925	31910440	31910295	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	4274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	32204633	32204870	32204740	Y	METTL20,AMN1,H3F3C	NA	METTL20,BICD1,AMN1	IMR90	Hi-C	24141950	BICD1	52899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	32405506	32405740	32405609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	147737	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	32426821	32426960	32426892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	169052	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	32607967	32608138	32608054	Y	NA	NA	FGD4,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	221996	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32688261	32688652	32688566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	141482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	32742557	32742716	32742609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	87418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	32881013	32881116	32881065	Y	NA	RP11-278C7.1,YARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-278C7.1	2692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	33044985	33045279	33045082	Y	NA	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	2495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	33048688	33048837	33048763	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	33470577	33470720	33470634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT10	120034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	39094852	39095225	39095039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	204007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	39297687	39297825	39297799	Y	NA	CPNE8	NA	NA	NA	NA	CPNE8	1407	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	39766876	39767120	39766998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21A	68072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	40531165	40531312	40531256	Y	NA	SLC2A13	LRRK2	GM12878	5C	22955621	SLC2A13	33274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	41264985	41265046	41264997	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	180741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	42074614	42074792	42074703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	461889	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	42734111	42734478	42734288	Y	NA	ZCRB1	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	16191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	42879735	42879922	42879834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	102235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	42958967	42958984	42958976	Y	NA	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	23173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	44976377	44976736	44976725	Y	NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	336895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	45241724	45241928	45241862	Y	DBX2,NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	71703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	45628991	45629732	45629167	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	21167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	46798246	46798498	46798428	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	22784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	47074564	47074850	47074707	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	299102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	47613849	47614234	47614042	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	142115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	47616513	47616764	47616594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	144779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	200081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3,ENDOU	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	48195468	48195540	48195504	Y	ASB8	SLC48A1,RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	48204446	48204457	48204451	Y	NA	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	20458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	48205363	48205594	48205444	Y	PFKM	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	19321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,RND1,CCDC65	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RND1	18626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49277442	49277626	49277534	Y	NA	DDX23,RND1,CCDC65	RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC65	18267	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	49380850	49380994	49380918	Y	DHH,CCDC65	ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	RP11-386G11.5	9156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49449678	49450138	49449974	Y	CCDC65,DHH	PRKAG1,RHEBL1	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	11670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49592771	49592915	49592838	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	11664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	43789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	38054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49739029	49739393	49739097	Y	PRPF40B,C1QL4,DNAJC22	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	49762011	49762098	49762055	Y	TUBA1A,PRPF40B	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	3644	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	49822830	49822961	49822896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2	64463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	FAIM2	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAIM2	43326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	50340061	50340418	50340240	Y	NA	FAIM2	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAIM2	44061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	50911573	50911988	50911666	Y	SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	14805	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	50932147	50932418	50932300	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	35379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51322260	51322312	51322286	Y	DIP2B	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	7005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,POU6F1,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	POU6F1	1237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51712804	51712960	51712882	Y	DAZAP2,BIN2	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	3492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	4088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	51765347	51765619	51765517	Y	FIGNL2,GALNT6	BIN2,SLC4A8,GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A8	17482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	51768324	51768713	51768389	Y	NA	SLC4A8,GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A8	14388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51783532	51783718	51783602	Y	NA	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	SLC4A8	431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	51833393	51833425	51833407	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	48742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	51835468	51835599	51835503	Y	POU6F1,SCN8A,SLC4A8	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT6	50817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	96609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52184760	52184919	52184839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	94825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52241099	52241559	52241297	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	38185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	37418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr12	52243040	52243117	52243080	Y	SCN8A,ACVRL1,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36627	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	52249721	52249808	52249784	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	29936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr12	52257333	52257459	52257384	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	22285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52257879	52258204	52258030	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	21540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.00300988644496
chr12	52278286	52278855	52278613	Y	NR4A1	ANKRD33	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	889	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52279748	52280043	52279838	Y	NR4A1	ANKRD33	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	4	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	52299499	52299740	52299665	Y	NA	ANKRD33,ACVR1B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	19755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52423514	52423824	52423679	Y	NA	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	8898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.524790631275
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.9714879425647
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52808882	52809091	52808984	Y	NA	RP3-416H24.4,KRT75	NA	NA	NA	NA	KRT75	17218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	52915277	52915747	52915499	Y	C12orf44	NA	NA	NA	NA	NA	KRT75	88968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT75	89831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr12	53370058	53370275	53370187	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4B	27667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B,RP11-983P16.4	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	53515585	53515944	53515597	Y	NA	SPRYD3,IGFBP6,HIGD1AP1,RP11-1136G11.6	NA	NA	NA	NA	HIGD1AP1	17893	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	ITGB7	11758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	53627985	53628353	53628269	Y	NA	ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	MFSD5	K562	ChIA-PET	22265404	RARG	3221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	53731844	53731991	53731931	Y	NA	PFDN5,C12orf10,RP11-680A11.5,AAAS,SP1	NA	NA	NA	NA	AAAS	15196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53892109	53892322	53892185	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54149784	54149995	54149877	Y	PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	30255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.53904665999264
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC13-AS,HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	12047	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54424968	54425277	54425216	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	55806634	55807051	55806823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	300769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	299381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	298940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	56357532	56357679	56357667	Y	NA	DGKA,WIBG,CDK2,PMEL,RAB5B,SUOX,IKZF4	NA	NA	NA	NA	CDK2	874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	56876109	56876291	56876201	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	3907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.61112020708799
chr12	57073427	57073817	57073648	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	6342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57094657	57094840	57094721	Y	STAT2,STAT6,NAB2	PTGES3,NACA,HSD17B6,PRIM1	NA	NA	NA	NA	PTGES3	14498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	57407966	57408056	57408000	Y	NA	ZBTB39,TAC3	NA	NA	NA	NA	ZBTB39	9736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TAC3,TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57746067	57746152	57746110	Y	NA	NA	R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	76636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	GLI1	3460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,KIF5A,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	58271285	58271589	58271437	Y	NA	CTDSP2	AVIL,CTDSP2	IMR90	Hi-C	24141950	CTDSP2	32763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	59460921	59461120	59461028	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	148618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	59995567	59995830	59995598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	683264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	61495854	61496021	61495938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	1156098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	62396688	62396737	62396702	Y	FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	255382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	62605397	62605543	62605465	Y	C12orf61	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	46576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	62644447	62644716	62644645	Y	C12orf61,USP15	USP15	USP15	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP15	7403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	62712963	62713140	62713056	Y	C12orf61,MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	60844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	62725942	62726315	62725965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	73823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63067118	63067447	63067283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	71652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63091878	63091979	63091882	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	96412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	138076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	63304430	63304640	63304492	Y	PPM1H	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	22177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	64336767	64336917	64336914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	100694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	64718599	64718738	64718727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPOT	77392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	65063507	65064284	65063678	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	61214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	65151664	65152043	65151935	Y	NA	GNS	NA	NA	NA	NA	GNS	437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	HMGA2	172590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66061664	66061966	66061876	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	HMGA2	153945	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	69933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	66289506	66290040	66289751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	73595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	66440623	66440641	66440633	Y	NA	RP11-118B13.1	HMGA2,MSRB3,LLPH	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-118B13.1	11608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66581649	66582001	66581823	Y	HELB,TMBIM4,IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	LLPH	59101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66584162	66585501	66584509	Y	TMBIM4,IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	LLPH	61614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	66697484	66697842	66697547	Y	HELB	HELB	NA	NA	NA	NA	HELB	3159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	68166573	68166761	68166704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	126455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	68766640	68767030	68766969	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	42479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	68773026	68773359	68773243	Y	RAP1B	MDM1	RAP1B,LOC100507250	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	48865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	69070582	69070990	69070845	Y	MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2	RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RPL7P42	5385	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69200663	69200867	69200763	Y	CPSF6,CPM,CPM,MDM1,RAP1B,NUP107,SLC35E3,MDM2	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	69418832	69418872	69418851	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	55482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSF6	55209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70327018	70327311	70327165	Y	NA	NA	PTPRB,PTPRR,KCNMB4	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3IP	196557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70329390	70329536	70329438	Y	NA	NA	PTPRB,KCNMB4	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3IP	198929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70360347	70360458	70360404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	229886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70360720	70360860	70360789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	230259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70644560	70644959	70644584	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	9420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	71039604	71039990	71039715	Y	NA	PTPRB	NA	NA	NA	NA	PTPRB	10384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	72236663	72237026	72236820	Y	NA	TBC1D15	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	5176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	72341450	72341874	72341635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	109963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	72728711	72729061	72728940	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	62024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	73639499	73639785	73639508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	972812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	17530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	75955852	75956146	75955999	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	52436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76093732	76093874	76093819	Y	NA	NA	NAP1L1,OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	190316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76197528	76197897	76197766	Y	KRR1	NA	KRR1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	227815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	76215246	76215339	76215312	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	210373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76283192	76283327	76283260	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	142385	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	76353921	76354019	76353970	Y	NA	NA	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	71693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76363545	76363908	76363622	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	61804	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76938616	76938968	76938946	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	12621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	77005504	77005696	77005596	Y	OSBPL8	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	53915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	77056574	77056895	77056735	Y	NA	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC17	98473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	77156465	77156658	77156516	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	1097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	78338246	78338645	78338266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	115561	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	78398581	78398785	78398710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	175896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	69548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	100295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	310972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	279160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	278360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	265105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	234316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	80327802	80327850	80327826	Y	NA	RP11-84G21.1,PPP1R12A	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7A	157369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	81271643	81271697	81271669	Y	LIN7A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7A	58007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	82362285	82362429	82362357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	388155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	85674653	85675022	85674864	Y	ALX1	ALX1	NA	NA	NA	NA	ALX1	2768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	88703962	88704349	88704186	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	169889	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	88826876	88827166	88827020	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	145462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	89461276	89461656	89461568	Y	DUSP6	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	283392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	90251511	90251925	90251741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	150434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	90257323	90257921	90257575	Y	POC1B	NA	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	156246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	90500380	90500398	90500381	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1,POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	399303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	92341288	92341601	92341484	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	195748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	92427755	92427874	92427825	Y	CLLU1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	109475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	92471870	92472505	92472386	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	64844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	92637830	92638067	92637978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	100157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	332960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	93002299	93002373	93002366	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	318734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	93474339	93474443	93474391	Y	NA	AC138123.2	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	1008	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	93489257	93489472	93489362	Y	NA	AC138123.2	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	13806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	93762169	93762549	93762358	Y	NA	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	7110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	93767024	93767186	93767090	Y	CRADD,NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	2473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	93770329	93770575	93770474	Y	NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	94428471	94428481	94428476	Y	NA	NA	CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	112018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	PLXNC1	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLXNC1	44141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	94546167	94546575	94546217	Y	CRADD,TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	5668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	94574376	94574751	94574543	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	CCDC41	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	33877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr12	95093724	95093947	95093852	Y	NA	NA	PLXNC1,TMCC3,CCDC41,NDUFA12	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	51386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	95198689	95198784	95198750	Y	NA	NA	TMCC3,PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	156351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	95199817	95200100	95199987	Y	VEZT	NA	TMCC3,PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC3	157479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	95226806	95227127	95226860	Y	CCDC41	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	168419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	96502190	96502534	96502487	Y	NA	NA	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	LTA4H	66892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	97355714	97355975	97355919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	56713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	99043983	99044295	99044139	Y	NA	IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	APAF1	7064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	99235060	99235389	99235225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	198141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	99250809	99251297	99251146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	213890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	100596885	100596960	100596910	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-175P13.3	5324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	102285250	102285626	102285359	Y	DRAM1	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	16121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	102734344	102734692	102734517	Y	NA	NA	IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	NUP37	222442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	102892301	102892634	102892501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	380399	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	103359249	103359470	103359411	Y	NA	ASCL1,PAH	NA	NA	NA	NA	PAH	9061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	104963305	104963849	104963618	Y	CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	116232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	105030278	105030644	105030428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	183205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	105076733	105077008	105076882	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	229660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	105486221	105486404	105486313	Y	NA	ALDH1L2,KIAA1033	ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1L2	9866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	183988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	105900072	105900358	105900257	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	APPL2	272056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	106663801	106663878	106663834	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NUAK1,CKAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	29829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	107723329	107723653	107723513	Y	NA	BTBD11	NA	NA	NA	NA	BTBD11	13139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.29130407482636
chr12	108054666	108054768	108054732	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	22741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	108056293	108056559	108056439	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	20950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.2537623580562
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	109297152	109297589	109297254	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	47786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	110315812	110316035	110315886	Y	C12orf34,TCHP,TCHP	TRPV4,GLTP,TCHP	NA	NA	NA	NA	GLTP	258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	110319208	110319481	110319350	Y	C12orf34,C12orf76	TRPV4,GLTP,TCHP	NA	NA	NA	NA	GLTP	2915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	110735237	110735389	110735298	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	18676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	111473237	111473713	111473408	Y	CUX2	CUX2	NA	NA	NA	NA	CUX2	3409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	111881338	111881509	111881420	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	39586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	112534496	112534670	112534605	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	10156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	112908037	112908227	112908154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	53395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	113502885	113503086	113502986	Y	DTX1	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL1	68958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	113925032	113925100	113925066	Y	NA	NA	RBM19,DTX1	IMR90	Hi-C	24141950	SDS	62926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	114025549	114025908	114025724	Y	NA	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDS	163443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDS	167165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.77253321644128
chr12	114713809	114714132	114713971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM19	311633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	115130244	115130426	115130316	Y	TBX3	TBX3	TBX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBX3	10275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	115172990	115173109	115173029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX3	53021	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116193913	116194329	116194111	Y	NA	NA	TBX3,RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	518814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116796896	116797249	116796984	Y	NA	NA	MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	83753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116864232	116864472	116864363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	104755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	116865168	116865340	116865257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	103887	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	116872632	116872752	116872692	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	96475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	75409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	116946088	116946451	116946189	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	117039313	117039620	117039517	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC00173	70086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	117375665	117375672	117375669	Y	NA	FBXW8	NA	NA	NA	NA	FBXW8	28904	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	118209559	118209890	118209580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	194898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	118497859	118498236	118498048	Y	NA	RFC5	NA	NA	NA	NA	WSB2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	118605193	118605499	118605376	Y	NA	PEBP1,VSIG10	NA	NA	NA	NA	VSIG10	33362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	119079795	119080190	119079993	Y	NA	NA	LOC144742	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA38	244179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	120486152	120486402	120486307	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	66904	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120665661	120665757	120665705	Y	ACADS	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	28567	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120666780	120666906	120666823	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	29686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1,PLA2G1B	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-1	337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120851941	120852093	120852022	Y	NA	MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC	PLA2G1B,MSI1,GATC,COX6A1,TRIAP1,SRSF9,DYNLL1	IMR90	Hi-C	24141950	COX6A1	21800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121038763	121038810	121038786	Y	CABP1,CABP1	POP5,RPL11P5,CABP1	POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL11P5	8412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121497390	121497638	121497514	Y	OASL	C12orf43	SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf43	45085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122006998	122007221	122007110	Y	P2RX4,SETD1B,RHOF	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	9476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122014724	122015549	122015007	Y	NA	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	1148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.20196461256841
chr12	122020670	122020879	122020764	Y	KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	122155083	122155323	122155204	Y	NA	MORN3,TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	6425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122186812	122187117	122186965	Y	NA	TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	38154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	123555205	123555330	123555222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	77232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	123625857	123625976	123625910	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	6586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	124864827	124865003	124864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	185132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	98406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	124962828	124963212	124962933	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	86923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	124985154	124985447	124985301	Y	DHX37	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	64688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr12	125028947	125029179	125029054	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	20956	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	125034286	125034471	125034389	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	15664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125050536	125050830	125050706	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	401	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.76952332999632
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	60743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.46697311289729
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	67760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	125165952	125166242	125166057	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	115817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	125171572	125171968	125171622	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	121437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr12	125174261	125174641	125174459	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	124126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125185875	125186011	125185947	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	135740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.03754171677016
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	147421	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125198204	125198603	125198442	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	148069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125211865	125212230	125212112	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCARB1	152984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125218943	125219209	125219142	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	146005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr12	125369233	125369624	125369429	Y	NA	SCARB1,UBC	UBC	K562	ChIA-PET	22265404	SCARB1	4019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	125405622	125405939	125405923	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	5708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	12507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	125765176	125765295	125765221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	95794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	129725693	129725893	129725793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	419165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	130012974	130013180	130013078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132D	373031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10	179669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662M24.2	274602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	266536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	131706292	131706484	131706406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	269840	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	131714239	131714475	131714357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	277787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	131941405	131941587	131941511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	252039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	132315862	132315946	132315904	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	133005224	133005492	133005298	Y	NA	MUC8	P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	43234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr12	133034888	133034907	133034894	Y	NA	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	13819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	20750174	20750288	20750230	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	16986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	21571909	21572149	21572029	Y	NA	RNU4-9P	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	38657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	21649697	21649802	21649731	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	LATS2,SAP18	IMR90	Hi-C	24141950	LATS2	16011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	22243438	22243610	22243458	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	FGF9	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	340107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	22636222	22636574	22636412	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	392700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	23455872	23456128	23456000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	187159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	23485782	23486124	23485811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	217069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	23733450	23734509	23733658	Y	NA	HMGA1P6	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	27137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	23973487	23973793	23973652	Y	NA	SACS	NA	NA	NA	NA	SACS	32048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	10686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-309I15.1	145054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-309I15.1	170978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr13	25115809	25116061	25115886	Y	RNF17	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	30861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	25621314	25621890	25621623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE2P1	80689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE2P1	150729	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr13	26118734	26119070	26118902	Y	FAM123A,ATP8A2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A2	174525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr13	26475840	26476144	26475975	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	318647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	26551633	26551678	26551661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	243113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	26948386	26948578	26948482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK8	122110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	27165274	27165454	27165331	Y	NA	WASF3	NA	NA	NA	NA	WASF3	35434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	27608814	27608959	27608884	Y	WASF3,GPR12	NA	RASL11A,USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	USP12	135074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	2665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	29460778	29461116	29460949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTUS2	135632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr13	30808184	30808483	30808334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	59801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	LINC01058	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	11592	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	31004513	31004723	31004587	Y	USPL1	LINC01058	KATNAL1,LINC00426,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	10139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	31407198	31407336	31407268	Y	HSPH1	NA	USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	USPL1	217368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	31438859	31439207	31438915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	249029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	31447062	31447451	31447297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	257232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	31775014	31775311	31775185	Y	HSPH1	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	2941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	32433681	32434084	32433895	Y	NA	EEF1DP3	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	14703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	32687742	32687974	32687911	Y	N4BP2L2,N4BP2L2	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	84305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	33526715	33527061	33526891	Y	NA	NA	KL,PDS5B,STARD13	IMR90	Hi-C	24141950	PDS5B	368151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	178022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr13	34781635	34781805	34781767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	391449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	36412583	36412954	36412753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	290489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	36872739	36873168	36872839	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	2760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	37173334	37173635	37173485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNA1	169367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	38020689	38020970	38020810	Y	POSTN	NA	CSNK1A1L	IMR90	Hi-C	24141950	POSTN	150011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	40064271	40064571	40064449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFP	111094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	40331110	40331478	40331245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	103346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	40344833	40345034	40344934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	117069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	41624170	41624528	41624466	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90	Hi-C	24141950	WBP4	8882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	41811647	41811915	41811781	Y	NA	KBTBD7,MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	23827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	42137571	42138044	42137923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	254230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	473361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	197890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	42967379	42967658	42967522	Y	TNFSF11,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	123090	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	43149619	43149668	43149644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	305330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	186161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	43570775	43570983	43570833	Y	EPSTI1	EPSTI1,DNAJC15	EPSTI1,ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	6368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	43623808	43623875	43623842	Y	EPSTI1	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	28469	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.2567722445012
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.53904665999264
chr13	43727960	43728297	43728107	Y	NA	NA	ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	132621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr13	43912615	43912772	43912726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	317276	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	LACC1	91289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	170685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	74402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46724053	46724328	46724215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	59678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46736375	46736487	46736423	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	47519	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr13	46750972	46751177	46751169	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	32829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46761558	46761874	46761821	Y	SPERT	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	22132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46914448	46914600	46914500	Y	LCP1,C13orf18	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0226L	95725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46957218	46957500	46957457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0226L	52825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	46962246	46962519	46962401	Y	LCP1,C13orf18	KIAA0226L	NA	NA	NA	NA	KIAA0226L	47806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr13	48718696	48718843	48718708	Y	RCBTB2,RB1,ITM2B,MED4	POLR2KP2	NA	NA	NA	NA	POLR2KP2	12026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	48758454	48758724	48758623	Y	NA	ITM2B	NA	NA	NA	NA	ITM2B	46570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	49148350	49148443	49148412	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,CYSLTR2,RCBTB2	RCBTB2	ITM2B	IMR90	Hi-C	24141950	RCBTB2	42981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	49154464	49154790	49154627	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	49095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	50704264	50704590	50704561	Y	NA	DLEU1,DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	6408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-175B12.2	65000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	RP11-175B12.2	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-175B12.2	3695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-175B12.2	100807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr13	51210187	51210463	51210320	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-175B12.2	110602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51288107	51288409	51288197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-175B12.2	188522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51508208	51508301	51508255	Y	NA	RNASEH2B	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	26394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	152305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	51743934	51744340	51744171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	50163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr13	52115699	52115709	52115704	Y	UTP14C	WDFY2	MIR4703,WDFY2,INTS6,DHRS12,LINC00282	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WDFY2	40935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	52494302	52494692	52494497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	88938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	52505834	52506318	52505967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	77312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr13	52956042	52956135	52956089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS36	66628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	LECT1	NA	NA	NA	NA	LECT1	24818	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	57309762	57309863	57309815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00458	2604761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr13	61157781	61157905	61157871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	189190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr13	61626383	61626760	61626680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	657792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	67240182	67240351	67240267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	562117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	70081949	70082002	70081975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00383	287471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	72349266	72349293	72349278	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	90037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	72439142	72439615	72439332	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	73118273	73118475	73118375	Y	PIBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	157356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	74445258	74445348	74445303	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	261046	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	75346258	75346396	75346327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	639864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	253692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	76159377	76159493	76159435	Y	NA	COMMD6,UCHL3,LMO7	NA	NA	NA	NA	LMO7	33077	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	77548213	77548408	77548323	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	5643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	77898193	77898346	77898226	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	80078013	80078214	80078058	Y	NA	NDFIP2	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	24726	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr13	80934191	80934539	80934365	Y	NA	SPRY2	SPRY2	K562	ChIA-PET	22265404	SPRY2	21105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	81913928	81913973	81913949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	1000842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	82448743	82448950	82448847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	1535657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	SLITRK1	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	26122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	84515909	84516210	84516058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	61381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr13	91869538	91869920	91869747	Y	NA	NA	MIR17HG	K562	ChIA-PET	22265404	MIR17HG	128154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	92871734	92872145	92872019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	873660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	779762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	94762314	94762622	94762468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	483889	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	96791796	96791815	96791806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	88060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	97274522	97274914	97274718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	570786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	97636174	97636720	97636457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	234968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	99169761	99169891	99169826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	58303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	173924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	99772014	99772367	99772137	Y	GPR18	DOCK9	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK9	35135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	99874246	99874352	99874282	Y	NA	UBAC2-AS1,UBAC2	NA	NA	NA	NA	UBAC2	23218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	100024364	100024560	100024446	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	127111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100028420	100028640	100028476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	123031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100310859	100311153	100311058	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	53940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100642436	100643177	100642812	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	10410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	100760491	100760725	100760608	Y	NA	PCCA,RPL15P18	NA	NA	NA	NA	PCCA	21222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	101046682	101046918	101046816	Y	A2LD1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	245336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	101163000	101163083	101163042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	162264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	102565701	102565995	102565836	Y	FGF14,FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	498858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	103150766	103150859	103150813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	96494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	106751889	106752019	106751954	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	466493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr13	106810133	106810294	106810212	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	408218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	216448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107222796	107223196	107222998	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	4284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107409899	107410182	107409996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	96114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	107569449	107569874	107569676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	255664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	108153519	108153767	108153691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	363316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	666456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110144647	110144871	110144759	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	260744	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	AL162497.1	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL162497.1	45982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110631754	110631774	110631764	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	194839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	110780432	110780795	110780703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	175364	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110781860	110782469	110782431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	173690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	110785109	110785340	110785201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	170819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	38167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr13	111843624	111843915	111843820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	78718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	112711940	112712042	112711992	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SNORD44	7548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SOX1	6849	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.36036773547675
chr13	112727649	112728064	112727870	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SOX1	7736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr13	113421890	113422034	113421962	Y	C13orf35	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	79247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	113434951	113435188	113435090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	92308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	106764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	113588902	113588931	113588917	Y	NA	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MCF2L-AS1	32207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	MCF2L-AS1	23862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	113660175	113660436	113660306	Y	NA	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	39037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	13.9369561122395
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	PROZ	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	PROZ	4058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	PROZ	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	PROZ	2222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	114557275	114557469	114557370	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	7577	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	21268104	21268276	21268208	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	1161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	21284681	21284943	21284789	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	15244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	19176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr14	21529107	21529436	21529241	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	6993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	22021508	22021808	22021646	Y	NA	METTL3,SALL2	NA	NA	NA	NA	SALL2	18158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	22025629	22026018	22025838	Y	NA	METTL3,SALL2	NA	NA	NA	NA	SALL2	22279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	23083172	23083436	23083304	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	ABHD4	18026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	23259673	23259774	23259709	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	OXA1L,CTD-2555K7.2,SLC7A7,MRPL52,MMP14	NA	NA	NA	NA	CTD-2555K7.2	25902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	RBM23	18558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr14	24006568	24006872	24006716	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	16344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	24008139	24008541	24008214	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	14675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr14	24016944	24017157	24017064	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	6059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	25142710	25142963	25142951	Y	CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	232599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	25911186	25911198	25911192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	176644	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	26369871	26369995	26369970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	635329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	932436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	27998275	27998515	27998360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	933315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	28591045	28591340	28591192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	365776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	NA	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	G2E3	362004	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	30768972	30768989	30768981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	G2E3	257340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr14	33838745	33838916	33838831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	886739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	34837330	34837452	34837391	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SPTSSA	92110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35303172	35303324	35303248	Y	SRP54,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	38225	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35435578	35435890	35435735	Y	NA	SRP54,RP11-85K15.2	NA	NA	NA	NA	SRP54	13273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35755957	35756376	35756177	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	10118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35802936	35803364	35803178	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	52911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35836736	35837242	35837045	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	19033	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	36235126	36235268	36235197	Y	NA	RALGAPA1	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	41242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	36641300	36641610	36641453	Y	NA	NA	SFTA3	IMR90	Hi-C	24141950	MBIP	146272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	36778207	36778309	36778259	Y	NA	MBIP	NA	NA	NA	NA	MBIP	9573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	36977511	36977654	36977606	Y	MBIP,SFTA3,NKX2-1,NKX2-1	SFTA3	NA	NA	NA	NA	SFTA3	3380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	14816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	38542945	38543074	38543011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2142D14.1	115114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	38614811	38615058	38614936	Y	NA	CTD-2142D14.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2142D14.1	43130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	39122804	39122976	39122949	Y	NA	NA	SSTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SEC23A	453874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	975530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	LRFN5	NA	NA	NA	NA	LRFN5	365	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	42158111	42158422	42158211	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	83338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	42286206	42286221	42286213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	211433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	42297588	42297942	42297766	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	222815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	43420114	43420297	43420206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	1345341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	46620797	46620809	46620803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	900054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS29	687333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	50349630	50349838	50349718	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,SOS2,ARF6	NEMF,ARF6	C14orf182,ARF6,SOS2,METTL21D	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARF6	7972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	50374574	50374717	50374657	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,C14orf183,ARF6	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	16764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	5806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf182	55373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50531720	50532221	50531875	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf182	59482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K5	99502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	51066593	51066625	51066609	Y	TRIM9,CDKL1,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	40749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	51367871	51368235	51368053	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	41219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	52074354	52074735	52074485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	120536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	52256018	52256093	52256056	Y	GNG2	GNG2	PYGL,TMX1,GNG2,TRIM9,C14orf166,LOC283553,FRMD6	IMR90	Hi-C	24141950	GNG2	34820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	52324092	52324216	52324141	Y	NA	GNG2	NA	NA	NA	NA	GNG2	33179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	50409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	52774627	52775077	52774946	Y	GNG2,PTGER2	NA	NA	NA	NA	NA	NID2	240915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	53302326	53302477	53302407	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	45940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	54443717	54444101	54443910	Y	NA	BMP4	NA	NA	NA	NA	BMP4	20238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	54603712	54603948	54603796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	180233	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	54917293	54917567	54917392	Y	GMFB,GCH1,CGRRF1	GMFB	CNIH,CGRRF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GMFB	36347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	57378201	57378572	57378356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	355154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	59130535	59130927	59130732	Y	NA	DACT1	NA	NA	NA	NA	DACT1	31850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	60061321	60061594	60061405	Y	DAAM1,RTN1,C14orf38,RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	JKAMP	112160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	60214885	60214948	60214918	Y	RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	120736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	61645426	61645731	61645594	Y	NA	NA	SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM30B	100827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	61795045	61795395	61795255	Y	PRKCH	TMEM30B	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	48487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	61904242	61904399	61904321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	130859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	61937176	61937384	61937282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	97874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	61985151	61985397	61985317	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	49861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	62018127	62018466	62018303	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	16792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	2262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	64144701	64144896	64144792	Y	NA	WDR89,SGPP1	NA	NA	NA	NA	WDR89	38122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	64358003	64358294	64358235	Y	NA	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	40320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65115289	65115345	65115316	Y	NA	NA	ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	53475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65148642	65149174	65148980	Y	HSPA2,FNTB	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG3	19646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	65256809	65256946	65256906	Y	NA	NA	PLEKHG3	IMR90	Hi-C	24141950	SPTB	87655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65273271	65273625	65273457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTB	70976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	SPTB	2559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	65524481	65524844	65524562	Y	PLEKHG3	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	42569	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.2	45812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	65748716	65749124	65748896	Y	FNTB	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.2	61651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr14	65749378	65749653	65749574	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.2	62313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	65801624	65801887	65801778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	73423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	68961774	68962026	68961864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	74861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	178496	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	69216365	69216576	69216463	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFP36L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	44614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	69301401	69301774	69301727	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	40211	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	69598076	69598493	69598218	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	19374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	70700911	70701061	70700986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX16	123387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	71022218	71022570	71022394	Y	ADAM20	MED6	NA	NA	NA	NA	MED6	42814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	72050156	72050543	72050232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	263625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	72650490	72650870	72650581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS6	253334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	73319855	73320202	73320119	Y	DPF3	DPF3	NA	NA	NA	NA	DPF3	38607	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	73373247	73373392	73373372	Y	NA	DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPF3	14438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	73695241	73695452	73695329	Y	ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf169	PAPLN,RP4-647C14.2	NA	NA	NA	NA	PAPLN	6753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	73826978	73827275	73827127	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	101073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	40937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	41734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	45854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	74793012	74793450	74793309	Y	NA	ABCD4,VRTN	NA	NA	NA	NA	VRTN	25240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	74868763	74868996	74868887	Y	ABCD4,VRTN	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4709	75911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	43525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	75061819	75062011	75061938	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	15295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	75084188	75084360	75084254	Y	PGF,EIF2B2	LTBP2,CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	2838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2,RP11-293M10.1	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	75721756	75722023	75721798	Y	NA	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-293M10.2	2091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	76027371	76027398	76027385	Y	NA	FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	15562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	76334268	76334588	76334390	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	31891	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	76734272	76734379	76734290	Y	ESRRB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	365625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77181991	77182261	77182202	Y	NA	RP11-187O7.3,VASH1	ANGEL1,VASH1,C14orf166B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187O7.3	8794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77365860	77365973	77365943	Y	NA	RP11-488C13.1	C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737,ZDHHC22,TMED8,POMT2,GSTZ1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488C13.1	14767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.32282601870659
chr14	77381505	77381598	77381569	Y	NA	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	30412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	77386872	77387221	77387005	Y	ZDHHC22	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77388817	77389330	77389083	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.7	34651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr14	77396429	77396646	77396562	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.7	27335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	77444143	77444725	77444469	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.1	11117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77473789	77473986	77473849	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	19048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	77488566	77488578	77488572	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr14	77503944	77504718	77504558	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	10910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	77505083	77505447	77505354	Y	TMEM63C,TMED8,KIAA1737	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	12049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77508586	77508871	77508699	Y	IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	15552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	77591216	77591790	77591612	Y	TMED8,NGB	TMEM63C,ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	10305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	78059840	78060228	78060134	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	20888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	78121399	78121579	78121501	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	40283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	78129695	78129950	78129826	Y	NA	SPTLC2,ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	42413	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	79406333	79406507	79406344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1141907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	79728948	79729331	79729131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	1122769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	79748672	79748684	79748678	Y	NRXN3	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	1103416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	80050129	80050354	80050306	Y	NRXN3	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	801746	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	81594127	81594446	81594295	Y	GTF2A1,GTF2A1	RP11-114N19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-114N19.3	40312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.32282601870659
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2,RP11-299L17.3	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	81868469	81868528	81868519	Y	GTF2A1,GTF2A1	STON2,RP11-299L17.3	NA	NA	NA	NA	STON2	32281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	88788436	88788474	88788455	Y	SPATA7,KCNK10,KCNK10	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA7	60794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	89630928	89631154	89631021	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	124784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	89680457	89680908	89680785	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	75030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	89770346	89770725	89770409	Y	FOXN3,FOXN3	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	14408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	15582	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	131285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	89895882	89896217	89896119	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	139944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	141291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	89959649	89959712	89959681	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	123781	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90049518	90049848	90049714	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	33645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90081839	90081992	90081916	Y	FOXN3,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	1501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90083771	90084428	90084236	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90280261	90280500	90280379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	138621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90560682	90560941	90560765	Y	KCNK13	NA	NA	NA	NA	NA	TDP1	141399	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	91791698	91791809	91791759	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	90379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	91880070	91880210	91880118	Y	TC2N,RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	1978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	92446493	92446853	92446680	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	FBLN5	NA	NA	NA	NA	FBLN5	34162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	92451454	92451633	92451538	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	FBLN5	NA	NA	NA	NA	FBLN5	39123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93114264	93114489	93114415	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	98558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93328820	93329009	93328917	Y	RIN3,MOAP1,KIAA1409,C14orf142,C14orf109,C14orf109,BTBD7	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA5	70244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr14	93738394	93738720	93738557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	58718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7,UNC79,COX8C	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	94360342	94360641	94360452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUB2	130034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	95014834	95014854	95014844	Y	NA	SERPINA5	SERPINA4	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINA5	10925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	95064751	95064770	95064761	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	11944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	96086261	96086587	96086424	Y	NA	RP11-1070N10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.5	1010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	96097186	96097458	96097322	Y	NA	RP11-1070N10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.5	11935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	96562177	96562641	96562498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDKRB2	106375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	96599113	96599472	96599314	Y	NA	NA	BDKRB2,BDKRB1	IMR90	Hi-C	24141950	BDKRB2	69544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	97146331	97146650	97146491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	114991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99423594	99423887	99423722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	311974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	99700697	99700801	99700734	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	35060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	99711955	99712816	99712233	Y	NA	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	23045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr14	99713000	99713727	99713367	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	22134	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99713782	99713973	99713884	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	21888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	99726837	99727734	99727584	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	8127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	91505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	100138998	100139105	100139062	Y	HHIPL1	CYP46A1	NA	NA	NA	NA	CYP46A1	9536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	100196933	100197043	100196991	Y	NA	CYP46A1,EML1	NA	NA	NA	NA	EML1	4987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	100413453	100413552	100413495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	210948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	100478682	100479045	100478865	Y	NA	NA	EVL	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	145455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	182207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	92049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	88346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	83877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101175303	101175416	101175368	Y	NA	NA	SNORD113-7,SNORD113-5,SNORD113-6,SNORD113-4,SNORD113-9,DLK1,MIR127,MIR432,MIR337,MIR433,MIR665,RTL1,MIR136,MIR493,MIR431,MEG3,WDR25	IMR90	Hi-C	24141950	MEG3	68331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101288434	101288543	101288490	Y	NA	MEG3,RP11-123M6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-123M6.2	36820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101370822	101370975	101370899	Y	BEGAIN,RTL1	RP11-123M6.2,MEG8,SNORD113-3,SNORD113-4,SNORD114-1	NA	NA	NA	NA	MEG8	11715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-1,SNORD114-14,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21,MIR543	NA	NA	NA	NA	SNORD114-21	8602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	101539526	101539734	101539702	Y	NA	MIR543	NA	NA	NA	NA	MIR543	43202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102001660	102001854	102001726	Y	PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1	DIO3OS,DIO3	NA	NA	NA	NA	DIO3OS	22914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102181963	102182125	102182053	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	13320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102193066	102193341	102193142	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	RP11-1029J19.5	2104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102258119	102258367	102258242	Y	NA	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	31984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.76952332999632
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	23148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.55631257515523
chr14	103097343	103097523	103097412	Y	NA	RCOR1	NA	NA	NA	NA	RCOR1	40345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103112299	103112666	103112355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCOR1	55301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103221108	103221258	103221164	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	20555	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103577820	103578081	103577991	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	9698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103584331	103584767	103584436	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	3012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103710310	103710630	103710449	Y	NA	NA	LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	87251	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	103848844	103849188	103848935	Y	TNFAIP2,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	103878784	103878999	103878892	Y	NA	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	29055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	104009097	104009329	104009267	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	15576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	105143455	105143754	105143546	Y	GPR132	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	10189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	5331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	70050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105527767	105528238	105527899	Y	GPR132	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	42282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105536057	105536658	105536303	Y	CRIP1,GPR132	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA4	50572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105541748	105541955	105541831	Y	CRIP1,PLD4,GPR132	NA	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	56263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr14	105631701	105632085	105631796	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	1076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1996448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	20599040	20599336	20599188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1944753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	20612710	20612766	20612738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1931323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	21914435	21914569	21914482	Y	OR4N4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	629520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	21925957	21925972	21925965	Y	OR4N4,OR4M2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	618117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	22897960	22898211	22898128	Y	CYFIP1,CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	7955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	22927527	22927784	22927666	Y	CYFIP1	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	37522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	22938552	22938923	22938737	Y	CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	48547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	23841916	23842255	23842027	Y	MKRN3	MAGEL2	NA	NA	NA	NA	MAGEL2	46920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	24083287	24083513	24083400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	152837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	25209245	25209272	25209252	Y	NA	SNURF,SNHG14,SNORD64,SNORD108	NA	NA	NA	NA	SNURF	11064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25606189	25606253	25606221	Y	UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	75875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25748610	25748872	25748744	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	66482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	25889400	25889660	25889527	Y	NA	NA	LOC503519	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	207272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	25913612	25913652	25913632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	194665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	25981968	25982324	25982145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	125993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	26007212	26007450	26007251	Y	UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	100867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	26094944	26095277	26095056	Y	UBE3A,UBE3A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	13040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	26104619	26105255	26104951	Y	UBE3A,ATP10A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	3062	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	26106001	26106167	26106105	Y	UBE3A,ATP10A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	2150	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	26146039	26146375	26146226	Y	NA	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	37722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	26487850	26488175	26488017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	379533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	26965581	26965938	26965866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	143572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr15	27300157	27300177	27300166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRG3	85728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	29277250	29277459	29277367	Y	NDNL2,APBA2	NA	NA	NA	NA	NA	APBA2	149621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	29285332	29285464	29285400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBA2	157703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	29726288	29726577	29726433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM189A1	134350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	31371728	31372108	31371866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	89918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	31600574	31600756	31600662	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	16302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	31739959	31740450	31740309	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	122901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	102835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	180428	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	33437895	33438002	33437965	Y	NA	FMN1	FMN1	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	46895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	FMN1	NA	NA	NA	NA	FMN1	9225	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	FMN1	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	17244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	33650854	33651169	33650965	Y	RYR3	RYR3	NA	NA	NA	NA	RYR3	49691	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	33994157	33994391	33994274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	334986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	34625973	34627107	34626354	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	1154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	35354346	35354732	35354466	Y	NA	NA	ATPBD4,ZNF770	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	75858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr15	35362321	35362339	35362330	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	83833	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	35376835	35377041	35376987	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	98347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	35502627	35502996	35502807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	86645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	199113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	36547085	36547100	36547092	Y	C15orf41	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	322712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	37403099	37403474	37403147	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	MEIS2	LOC100507466,C15orf41,MEIS2	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS2	11595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	37877991	37878069	37878030	Y	TMCO5A	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	486487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	38346750	38346987	38346848	Y	NA	NA	SPRED1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED1	195540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	38814347	38814382	38814365	Y	C15orf53,RASGRP1	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	41394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	39326121	39326439	39326280	Y	C15orf54	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	470345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	39541225	39541623	39541385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	329657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	186796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40069787	40070165	40070008	Y	NA	FSIP1	NA	NA	NA	NA	FSIP1	2866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40077574	40077698	40077636	Y	NA	FSIP1	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	4543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40180090	40180249	40180216	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	30844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40390220	40390395	40390296	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	8698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	PLCB2,C15orf52,PHGR1,DISP2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	40781674	40781798	40781689	Y	BAHD1	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	20514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3,MGA	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	42788912	42789178	42789135	Y	TTBK2	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	SNAP23	7481	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	42792289	42792533	42792361	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	10858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	42800654	42800904	42800762	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	19223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	43462121	43462322	43462222	Y	NA	TMEM62,CCNDBP1	NA	NA	NA	NA	CCNDBP1	12994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	44760894	44761150	44760908	Y	NA	CTDSPL2	NA	NA	NA	NA	CTDSPL2	43462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	46256210	46256268	46256256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	563681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	46528514	46528549	46528532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	835985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	46545564	46545905	46545872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	853035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	47821798	47822190	47821994	Y	SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	198942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	47894451	47894745	47894501	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	126387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	48311619	48311717	48311668	Y	NA	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	156997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51369445	51369616	51369500	Y	TRPM7,SPPL2A	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	170576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	51369900	51370046	51369953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	171031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51382019	51382273	51382147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	183150	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	NA	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	AP4E1	214498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51477619	51477870	51477745	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	278750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51479240	51479465	51479382	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	280371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51628727	51629122	51629096	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	283908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	51868984	51870333	51869210	Y	NA	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	42697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	51878196	51878692	51878342	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	34338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	52120789	52121195	52120954	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	52587042	52587046	52587044	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	1047	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5C	98592	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR72	109960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	57844002	57844282	57844063	Y	NA	POLR2M	NA	NA	NA	NA	POLR2M	37949	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	58733027	58733372	58733200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	306805	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	58761932	58762090	58762054	Y	NA	NA	ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	278087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	59138361	59138756	59138559	Y	NA	ZNF444P1,RNF111	NA	NA	NA	NA	ZNF444P1	16449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	ZNF444P1,RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	61501689	61502023	61501856	Y	NA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	17495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	62416318	62416522	62416393	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	38960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	100010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	63296233	63296451	63296342	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3	NA	NA	NA	NA	TPM1	36380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	28810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	33043	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr15	63386917	63387072	63386993	Y	RPS27L,TPM1	RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	24927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	63432131	63432432	63432186	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	15788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	64057692	64057995	64057851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	66146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	64310077	64310418	64310248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK2	51814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	64397616	64397971	64397713	Y	SNX1	DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22	NA	NA	NA	NA	SNX1	13294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	64997362	64997587	64997475	Y	MTFMT	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	3882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	65101103	65101281	65101196	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	14586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	65103266	65103574	65103420	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	12293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr15	65135268	65135743	65135404	Y	TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	3180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	65186654	65187183	65187027	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	54566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	65657580	65657851	65657711	Y	NA	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	10527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	65709516	65709749	65709576	Y	NA	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	3661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	65711297	65711582	65711440	Y	NA	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	1828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	65713781	65714189	65713985	Y	IGDCC3,IGDCC4	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	66121036	66121211	66121107	Y	DPP8,DPP8,DIS3L,DENND4A	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44	IMR90	Hi-C	24141950	DENND4A	38405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	66662192	66662458	66662267	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	NA	NA	NA	NA	TIPIN	14626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	66914097	66914368	66914142	Y	SMAD6,SMAD6	NA	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	78198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	67394592	67394967	67394687	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	40491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	67533518	67533775	67533647	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	10734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	67606820	67606971	67606914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	61287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	68132952	68133362	68133003	Y	PIAS1,CALML4	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	68207456	68207574	68207516	Y	NA	NA	CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	136943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	68260561	68260756	68260687	Y	C15orf61	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	83761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	68852038	68852173	68852100	Y	NOX5,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	17135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	68900803	68901132	68901037	Y	CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	31495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	68993008	68993104	68993034	Y	CORO2B,CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	115456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	69087536	69088004	69087836	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	SPESP1	20556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	LINC00277	NA	NA	NA	NA	LINC00277	22336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70006588	70006856	70006758	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	263465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70027564	70027712	70027628	Y	NA	NA	TLE3,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	284441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	70449426	70449750	70449588	Y	NA	NA	TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	60911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70592913	70593206	70593078	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	204398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	70827382	70827642	70827515	Y	NA	NA	TLE3,LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	226290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	70850665	70850865	70850772	Y	NA	NA	KIF23	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	203067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	70867778	70867861	70867857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UACA	186071	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	71078596	71078640	71078618	Y	NA	UACA	UACA,LARP6	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	24664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	71406673	71406868	71406715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	223549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	71428826	71429023	71428945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	245702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	72213908	72214290	72214099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	190309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	72671459	72671771	72671611	Y	PARP6,ARIH1,HEXA	HEXA,RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-106M3.1	1408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	73448773	73449049	73448902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	106722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	73493017	73493414	73493026	Y	NEO1	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	150966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	ISLR2	NA	NA	NA	NA	ISLR2	22341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	74493587	74493665	74493592	Y	CCDC33,ISLR	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	74823971	74824076	74824015	Y	NA	ARID3B	ARID3B	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARID3B	7442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	75081771	75082003	75081872	Y	ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	9373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	75288966	75289325	75289146	Y	CPLX3,ULK3,SCAMP5	SCAMP5,RPP25,PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75338663	75338960	75338803	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75449127	75449383	75449255	Y	NA	C15orf39	PPCDC,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	36601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	75820261	75820616	75820439	Y	NA	PTPN9	NA	NA	NA	NA	PTPN9	49014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	76658083	76658321	76658202	Y	NA	ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	31018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	78110584	78110799	78110731	Y	LINGO1	LINGO1	NA	NA	NA	NA	LINGO1	443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr15	78340097	78340467	78340288	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	27599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	78476376	78476653	78476619	Y	ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	CIB2	54490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	CRABP1	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CRABP1	36915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	80194397	80194544	80194472	Y	ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	MTHFS	6676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	80786706	80787081	80786777	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	92014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	80789855	80790023	80789938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	95163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	80828578	80828783	80828681	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	133886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	186521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	55499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr15	81131497	81131895	81131781	Y	IL16	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	61813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	81321783	81322073	81321879	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	C15orf26,IL16	IMR90	Hi-C	24141950	MESDC1	30488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	81393942	81394130	81394078	Y	NA	NA	IL16,C15orf26	IMR90	Hi-C	24141950	MESDC1	102647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	82061645	82062005	82061987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	274477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	82340231	82340454	82340397	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	3749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	83231949	83232133	83232017	Y	NA	RPS17L	NA	NA	NA	NA	RPS17L	24634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	83329401	83329783	83329629	Y	AP3B2,CPEB1,CPEB1	RP11-752G15.4,AP3B2	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.4	29327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	AP3B2	14	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	85566958	85567254	85567106	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	45287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	85711891	85712151	85712051	Y	NA	NA	PDE8A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE8A	190220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	86131454	86131632	86131493	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	204629	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	86285642	86285870	86285715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	50391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	87328596	87328625	87328612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	992335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	88697338	88697352	88697347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK3	100647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	88801535	88801887	88801766	Y	NA	NTRK3	NA	NA	NA	NA	NTRK3	3536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	89148971	89149164	89149068	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	13363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	89149774	89150157	89149841	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	12370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	89152639	89152930	89152746	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	9597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	89156201	89156887	89156382	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	5640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	89536188	89536571	89536367	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	81546	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90604221	90604520	90604374	Y	ANPEP,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	39216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	90605708	90605863	90605756	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	37873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr15	90606841	90607396	90607176	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	36340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	90669829	90670140	90669985	Y	NA	IDH2,SEMA4B	IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IDH2	26093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90950706	90950784	90950761	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	91379655	91379770	91379704	Y	IQGAP1,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,FES	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	1184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	91673515	91673609	91673520	Y	NA	SV2B	NA	NA	NA	NA	SV2B	32335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	92461389	92461789	92461546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	66464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	92612839	92613223	92613006	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	213848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93180228	93180540	93180295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	72437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	ASB9P1,FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	93425040	93425223	93425112	Y	C15orf32	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93611936	93612095	93612013	Y	RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA	RGMA	NA	NA	NA	NA	RGMA	18338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93633328	93633692	93633549	Y	RGMA,RGMA,RGMA,RGMA	RGMA	NA	NA	NA	NA	RGMA	2895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	234448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	95128045	95128087	95128066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	355278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	95370202	95370491	95370347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	597435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	95586467	95586687	95586577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	813700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	95802916	95802946	95802933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	1030149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	96455471	96455904	96455768	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NR2F2	411263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	15452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	31918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	97325630	97326019	97325642	Y	SPATA8	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	457040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99090927	99091248	99091140	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr15	99091450	99092159	99091603	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98041	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr15	99223373	99223476	99223421	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	33173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	119818	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	101787304	101787467	101787386	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	2670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	615969	616302	616108	Y	RGS11,NHLRC4	PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	658205	658397	658303	Y	NA	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	20848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	802051	802260	802100	Y	NA	FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	MSLN	6502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr16	809662	809847	809755	Y	MSLN,MSLN,MSLN	METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	MSLN	900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68447	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	1150049	1150415	1150232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	50826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	31098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	1339188	1339523	1339417	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UBE2I	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2I	14025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	1522812	1522824	1522818	Y	MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	1963457	1963729	1963593	Y	HS3ST6	HS3ST6,NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9	C16orf73,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST6	2712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	HS3ST6,NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST6	13288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	2041117	2041468	2041266	Y	MAPK8IP3,EME2,SPSB3	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2	NA	NA	NA	NA	SYNGR3	3456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	2104972	2105164	2105052	Y	NA	ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	NTHL1	9105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	2175102	2175363	2175212	Y	NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2	SNORD60,TRAF7	NA	NA	NA	NA	SNORD60	27743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	2219906	2220018	2219962	Y	NA	SNORD60,TRAF7,CASKIN1,MLST8,PGP	NA	NA	NA	NA	TRAF7	16207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr16	2844544	2844902	2844723	Y	MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2	PRSS41	K562	ChIA-PET	22265404	TCEB2	19246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2	NA	NA	NA	NA	TCEB2	20513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3013245	3013631	3013382	Y	KREMEN2	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9	NA	NA	NA	NA	KREMEN2	1300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	4293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	3058105	3058264	3058160	Y	ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,NAT15,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1,SRRM2,PRSS33,MMP25	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	2193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3114137	3114295	3114216	Y	ZNF263,ZNF205,PRSS41,ZSCAN10	TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,IL32,ZSCAN10,ZNF205	NA	NA	NA	NA	IL32	839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr16	3145997	3146167	3146082	Y	NA	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZSCAN10	1151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3148559	3148729	3148623	Y	ZSCAN10,ZNF597,ZNF263,OR1F1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZSCAN10	1241	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	3763227	3763392	3763351	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	2206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	3908512	3908774	3908643	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	19953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr16	4264073	4264474	4264297	Y	SRL	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP4	56602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr16	4343991	4344084	4344046	Y	NA	TFAP4	CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	22915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr16	4713771	4714092	4713866	Y	CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1	MGRN1,NUDT16L1	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	27603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	SEC14L5,PPL	NA	NA	NA	NA	SEC14L5	20959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	520390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	5920372	5920634	5920563	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	774563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	6422300	6423402	6422643	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1276491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	6556527	6556948	6556619	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1410718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	6807749	6808080	6807872	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1661940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8010227	8010459	8010246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	703081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	8032889	8032980	8032935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	680560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	8139980	8140105	8140050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	573435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	8163053	8163492	8163342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	550048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr16	8232837	8233487	8232942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	480053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr16	8360834	8360851	8360843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	352689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8931520	8931573	8931545	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	29293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	9767919	9768425	9768098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN2A	506186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr16	9832660	9832831	9832663	Y	GRIN2A	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN2A	441780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	9843836	9844157	9843968	Y	GRIN2A,GRIN2A	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN2A	430454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	9874200	9874550	9874338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN2A	400061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	10125381	10125508	10125448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIN2A	149103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	10670416	10670533	10670472	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	2022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	10941145	10941488	10941317	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	NA	TEKT5,NUBP1,FAM18A,CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	DEXI	92829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	10964024	10964207	10964107	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	NA	NA	NA	NA	NA	DEXI	70110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11059393	11059782	11059502	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	23048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11075663	11076095	11075881	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	39318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11078476	11078702	11078589	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	42131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11126143	11126448	11126303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	89798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11277053	11277355	11277217	Y	LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	64121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11397402	11397565	11397484	Y	NA	SOCS1	CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS1	49366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11407202	11407368	11407306	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	59166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	11409407	11409806	11409472	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	61371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	11421314	11421464	11421433	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	73278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr16	11422943	11423238	11423117	Y	LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	11484891	11485075	11484982	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	136855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	11654480	11655021	11654741	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	73216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11709603	11709900	11709765	Y	RUNDC2A	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	18337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	11946483	11946539	11946512	Y	NA	RSL1D1	NA	NA	NA	NA	RSL1D1	3041	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	13533694	13533856	13533709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	478158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	14050567	14050869	14050623	Y	MKL2	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	38553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	14377810	14378205	14378026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	214632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.19895472612345
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	15069619	15069687	15069631	Y	PDXDC1	PDXDC1	NA	NA	NA	NA	PDXDC1	3171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	15766344	15766530	15766415	Y	C16orf45	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	15979661	15979785	15979715	Y	NA	FOPNL,RPL15P20	NA	NA	NA	NA	FOPNL	697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	17249481	17249668	17249540	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	313070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	17447725	17447942	17447834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	114796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	18153312	18153685	18153560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	590574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	19888695	19888945	19888820	Y	NA	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	6544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	19893504	19893863	19893602	Y	NA	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	1626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	21148579	21148762	21148671	Y	NA	TMEM159	NA	NA	NA	NA	TMEM159	18936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM	634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	22229382	22229580	22229448	Y	NA	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	13779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23291084	23291445	23291261	Y	USP31	NA	SCNN1B,SCNN1G,COG7	IMR90	Hi-C	24141950	SCNN1G	99048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23866430	23866734	23866590	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	21108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23869779	23870194	23869980	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	24457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23962345	23962550	23962469	Y	GGA2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	117023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	23963300	23964011	23963518	Y	GGA2,PRKCB	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	117978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	24263992	24264018	24264005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	78850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	24431166	24431395	24431229	Y	RBBP6	NA	PRKCB	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA1	88298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	24538501	24538703	24538598	Y	RBBP6	RBBP6	NA	NA	NA	NA	RBBP6	8311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	25867249	25867392	25867321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST4	165902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	26115477	26115883	26115595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST4	414130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	26609483	26609820	26609735	Y	NA	NA	HS3ST4	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	668295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	26625836	26626028	26625891	Y	NA	NA	HS3ST4	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	652087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	27417796	27418436	27417849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL4R	94807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	27421651	27422200	27421657	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R	NA	NA	NA	NA	NA	IL4R	98662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	27737057	27737407	27737240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	177603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	28545865	28546104	28546001	Y	EIF3CL,EIF3C,SULT1A1,SPNS1,APOBR,IL27	CLN3,NUPR1,CCDC101	NA	NA	NA	NA	NUPR1	2391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	29150851	29151075	29150925	Y	NA	NA	SPNS1	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	66688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	29159118	29159675	29159295	Y	NA	NA	SPNS1	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	74955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	29170991	29171253	29171129	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	86828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	29702683	29703007	29702845	Y	NA	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	30083	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	29709853	29709969	29709906	Y	QPRT	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	37253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	29721114	29721129	29721122	Y	NA	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	48514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	29749958	29750047	29750034	Y	NA	KIF22	NA	NA	NA	NA	KIF22	49993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	29796508	29796713	29796645	Y	KCTD13,C16orf92,ALDOA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP	NA	NA	NA	NA	KIF22	3327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	31264985	31265278	31265093	Y	STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM	NA	NA	NA	NA	NA	PYCARD	52214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.76952332999632
chr16	33948799	33949141	33948910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2065720	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	33959236	33959284	33959270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2076157	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	34441880	34442279	34442062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2558801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	34825389	34825630	34825495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2942310	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	34979653	34980053	34979874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3096574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	46406585	46406940	46406771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	246598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	46780849	46781142	46780994	Y	MYLK3	MYLK3	NA	NA	NA	NA	MYLK3	41177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	1464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	46863838	46864241	46863904	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	48610830	48611144	48611073	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	40915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	48645394	48646040	48645807	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	6019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	48657602	48657960	48657802	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	5543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	48822479	48822613	48822546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	170420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	CBLN1	NA	NA	NA	NA	CBLN1	2519	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49487989	49488142	49488067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf78	82255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49542422	49542557	49542490	Y	ZNF423	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf78	136688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49734501	49734890	49734846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf78	328767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49892592	49892787	49892690	Y	ZNF423	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	205065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49893175	49893278	49893262	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	204574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	49910498	49910724	49910573	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	187128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	50236881	50237262	50237048	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	40786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	50280304	50280568	50280347	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	2256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	51179674	51179928	51179801	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	3350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr16	51795949	51796284	51796182	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	118282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	51797343	51797505	51797414	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	119676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	53077641	53077824	53077723	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	9121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	55535734	55536073	55535896	Y	NA	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	4837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	55740914	55740956	55740934	Y	SLC6A2,SLC6A2	NA	NA	NA	NA	NA	CES1P1	51504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	56194642	56194698	56194670	Y	NA	GNAO1	NA	NA	NA	NA	GNAO1	28604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	56330131	56330433	56330241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAO1	106829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	56581201	56581558	56581471	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2	MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP	IMR90	Hi-C	24141950	BBS2	29006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	56646552	56646712	56646632	Y	NA	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT1L	2676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57164348	57164453	57164406	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	39899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	CCL22,CX3CL1	NA	NA	NA	NA	CX3CL1	18081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57510567	57510918	57510632	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	8321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57518028	57518100	57518073	Y	DOK4	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	1139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57564039	57564411	57564096	Y	ZNF319,GPR114	DOK4,CCDC102A	NA	NA	NA	NA	CCDC102A	4100	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	57680678	57681373	57680764	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	38114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	61776736	61777059	61776898	Y	CDH8	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	291880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	62021508	62021884	62021766	Y	NA	CDH8	NA	NA	NA	NA	CDH8	47055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	1206384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	65337559	65337576	65337568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	179544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	66195856	66196211	66196038	Y	CMTM2,CMTM1,CMTM1	NA	CDH11,LOC283867	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00920	244216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	66558803	66559094	66558929	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	25353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	67150652	67150777	67150712	Y	LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70	C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4	NA	NA	NA	NA	C16orf70	8791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68039646	68040046	68039896	Y	SLC7A6OS,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3,DDX28	SLC12A4,DDX28	DPEP3,DPEP2	IMR90	Hi-C	24141950	DDX28	15724	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68049692	68049950	68049796	Y	C16orf86,TSNAXIP1,SLC12A4,DPEP3	SLC12A4,DDX28	NA	NA	NA	NA	DDX28	5820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68129095	68129275	68129185	Y	NA	NFATC3	NA	NA	NA	NA	NFATC3	12441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr16	68303268	68303682	68303412	Y	THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	6835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	CDH1	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDH1	2819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	68824913	68825217	68824976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH1	55785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	69106233	69106613	69106351	Y	NA	HAS3,CHTF8	NA	NA	NA	NA	HAS3	30854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.68018386773837
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	70740989	70741599	70741286	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	23020	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70759138	70759547	70759396	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	41169	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70769740	70769941	70769843	Y	NA	NA	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	51771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	70783169	70783447	70783290	Y	NA	VAC14	NA	NA	NA	NA	VAC14	49617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	71046758	71046771	71046763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	213694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	71072056	71072175	71072116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	238992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	71580921	71580983	71580949	Y	NA	CHST4,ZNF19	NA	NA	NA	NA	ZNF19	16009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	71731364	71731710	71731537	Y	NA	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	24894	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	72257967	72258413	72258290	Y	NA	PMFBP1	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PMFBP1	49190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMFBP1	250381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	73031148	73031384	73031285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	60213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	73096616	73096908	73096789	Y	NA	ZFHX3	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	5019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	73159100	73159118	73159110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	74083907	74083919	74083914	Y	NA	NA	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD7	244754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	74901429	74901821	74901545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FA2H	94700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75286788	75287025	75286897	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	12926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75291027	75291212	75291109	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	8739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75604496	75604511	75604504	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	6247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	78029706	78030119	78030008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	101191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	78309369	78309676	78309602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	178059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	78802745	78802853	78802799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	671435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	80710391	80710578	80710565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	125648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr16	82600130	82600149	82600140	Y	NA	NA	CDH13	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	58259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	82685978	82686417	82686161	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	27570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	83136521	83136871	83136696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	478113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	83159856	83159879	83159868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	501448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	83480656	83480733	83480694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	358715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	84210153	84210392	84210356	Y	OSGIN1,COTL1,TAF1C	HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	8277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85062384	85062545	85062427	Y	ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	3009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85185210	85185759	85185517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	125835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.66291795257578
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85268297	85268637	85268360	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	208922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	85751381	85751721	85751674	Y	NA	GINS2,C16orf74	NA	NA	NA	NA	GINS2	29702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	86312346	86312714	86312528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	229419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	176264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	36450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87498995	87499259	87499135	Y	BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO31	75247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87756631	87757179	87757021	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	40419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87759379	87759621	87759456	Y	C16orf95,FBXO31,ZCCHC14,JPH3	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	37977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr16	87904170	87904524	87904347	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	3076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr16	88063556	88063600	88063578	Y	BANP,BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	82706	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	88540534	88540913	88540729	Y	FAM38A,CTU2,APRT,ZNF469	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	22809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	88826966	88827318	88827200	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	22301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	88829964	88830251	88830166	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	19368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	52508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr16	89039891	89040100	89039996	Y	CBFA2T3	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	1512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89184955	89185230	89185162	Y	CYBA,RNF166,RNF166,CBFA2T3	ACSF3	LINC00304,LOC400558,CDH15	IMR90	Hi-C	24141950	ACSF3	32172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr16	89380978	89381130	89380989	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	98860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	424170	424290	424251	Y	FAM101B,VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	134497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	438529	438886	438717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	119901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	698193	698349	698271	Y	NA	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	14612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	817943	818099	818016	Y	FAM57A	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	62911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	873777	873849	873813	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016292.1	91892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	1094047	1094290	1094169	Y	SLC43A2,PITPNA	AC016292.1,ABR	NA	NA	NA	NA	AC016292.1	10860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	1100738	1101160	1100939	Y	SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	AC016292.1,ABR	YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	AC016292.1	17551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	1107024	1107388	1107281	Y	NA	AC016292.1,ABR	ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	22927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	1134847	1135025	1134980	Y	WDR81,WDR81,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	ABR	ABR,CRK,YWHAE,INPP5K,LOC100306951,PITPNA,SCARF1,RILP	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	4532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	1666519	1666783	1666685	Y	RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	3266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	1667462	1668045	1667797	Y	PITPNA,SLC43A2,WDR81,WDR81	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	4209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	61743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	1926930	1927151	1927006	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	1994416	1994643	1994603	Y	HIC1,HIC1	HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	38968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2026015	2026378	2026080	Y	SERPINF2,SERPINF2	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	70567	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2078039	2078451	2078156	Y	TSR1,HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	122591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	2626418	2626796	2626607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	131914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	132635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	2652547	2653322	2653300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	158043	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	2717801	2718168	2718053	Y	MNT,METTL16,RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	223297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	2718511	2718548	2718518	Y	TSR1,MNT,METTL16,RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	224007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	369041	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	2927507	2927680	2927594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	433003	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	3791085	3791371	3791288	Y	OR1E2,ZZEF1,P2RX1	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	3817602	3817987	3817757	Y	UBE2G1,P2RX5,ZZEF1,P2RX1,ATP2A3	CAMKK1,ATP2A3	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	21417	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	4297300	4297441	4297368	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr17	4299458	4299796	4299670	Y	MYBBP1A,UBE2G1	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	31535	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr17	4617083	4617473	4617191	Y	NA	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	5299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4655440	4655557	4655500	Y	ZNF232,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16,PSMB6	NA	NA	NA	NA	CXCL16	14223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	4756821	4757222	4756899	Y	MINK1	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	22138	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	4950916	4951277	4951137	Y	NA	ZFP3	NA	NA	NA	NA	ZFP3	28266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	ZFP3,AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	5736283	5736492	5736391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	62729	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	5813088	5813344	5813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	139534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	6375097	6375395	6375262	Y	WSCD1,AIPL1	AIPL1,FAM64A	NA	NA	NA	NA	FAM64A	29362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	6399359	6399733	6399545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	53624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6614362	6614643	6614518	Y	SLC16A13,SLC16A11,ASGR2,ASGR2,ASGR1,SLC13A5	NA	MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100	IMR90	Hi-C	24141950	C17orf100	61391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6656419	6656747	6656461	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	98433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6771162	6771276	6771219	Y	NA	ALOX12P2	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	15982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6818045	6818590	6818345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	62865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6829755	6829811	6829784	Y	NA	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12	67573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	6851869	6852198	6852047	Y	XAF1,GABARAP,RNASEK	ALOX12	NA	NA	NA	NA	ALOX12	45186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7035868	7036444	7036277	Y	TNFSF12,SAT2,POLR2A,CD68,CD68,XAF1,GABARAP,EIF5A,ACAP1	NA	CLEC10A,SLC16A13,BCL6B,ASGR1,ASGR2	IMR90	Hi-C	24141950	ACADVL	82000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7379219	7379555	7379279	Y	RNASEK,CLEC10A,GABARAP,EIF5A,WRAP53,SAT2,KDM6B,EIF4A1,CD68,CD68,TNFSF12,POLR2A	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	6027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7380968	7381115	7381038	Y	EIF5A	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	4467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	8407322	8407642	8407416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEL1	92873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8762126	8762262	8762190	Y	PIK3R5,PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	104767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8762730	8763052	8762926	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	103977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	8825548	8827035	8825911	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	39994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8869986	8870720	8870441	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	2957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	8958048	8958250	8958149	Y	NA	NTN1	NA	NA	NA	NA	NTN1	35189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	9688019	9688182	9688075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCVRN	118756	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	9925808	9925968	9925891	Y	GAS7,GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RCVRN	118870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	10029003	10029256	10029103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	130823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	10053386	10053763	10053585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	106316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	10075017	10075299	10075198	Y	MYH4,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	84780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	10075775	10076068	10075982	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	84011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	10220640	10220911	10220834	Y	GAS7,MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	60561	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	10658369	10658680	10658526	Y	SHISA6,TMEM220,PIRT	TMEM220,RP11-963H4.2	ZNF18,SHISA6,PIRT	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-963H4.2	10509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	11266931	11267244	11267127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P21	504152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	11874981	11875002	11874992	Y	DNAH9	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	ZNF18	23825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	12334623	12334859	12334741	Y	NA	NA	FLJ34690,MYOCD	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP44	355997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	14331583	14331800	14331731	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	129183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	15869590	15869983	15869922	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	23359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	16035892	16036125	16036009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGL	82380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2,FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	16388389	16388725	16388555	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	4742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17204544	17204774	17204670	Y	NA	COPS3	NA	NA	NA	NA	NT5M	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	17348587	17348892	17348689	Y	NA	MED9,RASD1	MED9,PEMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MED9	29408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	17420385	17420786	17420623	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	22676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17470517	17470759	17470631	Y	LRRC48	PEMT	RASD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PEMT	22263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	17641556	17641857	17641643	Y	MYO15A	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	58769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	17687276	17687668	17687631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	50657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.37763365063934
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	18865012	18865259	18865128	Y	NA	FAM83G	NA	NA	NA	NA	FAM83G	40858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	19268894	19269122	19269008	Y	NA	MAPK7,B9D1	NA	NA	NA	NA	MAPK7	9912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	AC004448.5,SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	19760986	19761170	19761020	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	8079	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	20814751	20814975	20814753	Y	KCNJ18	NA	NA	NA	NA	NA	SCDP1	128793	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr17	21360373	21360746	21360457	Y	NA	NA	USP22,MAP2K3,KCNJ12,C17orf51	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	82864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	21416302	21416539	21416421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	59183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.48423902805988
chr17	25800672	25801019	25800756	Y	WSB1,KSR1	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	19002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr17	25823612	25823763	25823676	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	41942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	25856308	25856397	25856353	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	74638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	25902272	25902658	25902374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS9	52166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	26361320	26361470	26361415	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	5293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	26552347	26552427	26552387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	91694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	26578258	26578420	26578387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	26578773	26579067	26578920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	26870881	26871048	26870951	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC	NA	NA	NA	NA	UNC119	6638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27264479	27264617	27264556	Y	UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12	FLOT2,DHRS13,PIPOX,PHF12	NA	NA	NA	NA	PIPOX	10914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	27299558	27299805	27299699	Y	NA	PIPOX,PHF12,SEZ6	NA	NA	NA	NA	PHF12	22769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	27766880	27767142	27766912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	51200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	29717293	29717639	29717335	Y	OMG,RAB11FIP4	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	29759240	29759393	29759318	Y	NA	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	42598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	29787763	29788137	29787829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	71121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	30593810	30594211	30593930	Y	NA	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	2615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	32627723	32627988	32627794	Y	CCL8,CCL2,CCL7	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	47419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	32940308	32940705	32940417	Y	TMEM132E	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	345844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	32979074	32979302	32979236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	307247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	33824805	33825214	33825002	Y	SLFN5,SLFN12L,CCL5	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN12	66503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	RASL10B	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	RASL10B	10853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	RP11-445F12.1,AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-445F12.1	13803	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	35425108	35425365	35425237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	120933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36008623	36009017	36008727	Y	NA	SYNRG,DDX52	SYNRG,DDX52,HNF1B,LOC284100	IMR90	Hi-C	24141950	DDX52	7130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36122885	36123141	36123013	Y	NA	NA	DDX52,HNF1B,SYNRG	IMR90	Hi-C	24141950	DDX52	121392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	36610879	36611283	36611138	Y	NA	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	28217	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	36759357	36759542	36759426	Y	NA	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	36765523	36765920	36765825	Y	NA	SRCIN1	SRCIN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRCIN1	5340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.68018386773837
chr17	36899884	36899982	36899923	Y	SOCS7,FBXO47,C17orf98	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	PCGF2	4088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	37056956	37057300	37057070	Y	NA	SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	32844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	37065070	37065230	37065172	Y	NA	LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	40958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38231838	38232188	38231911	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	16370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38263980	38264229	38263993	Y	RARA,RARA,MSL1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr17	38266320	38266663	38266514	Y	NA	NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	MSL1	9888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38488015	38488253	38488146	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	24571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	38666550	38666883	38666717	Y	TNS4	TNS4	CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P	IMR90	Hi-C	24141950	TNS4	10701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	38678609	38678667	38678638	Y	NA	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	22760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39572748	39572757	39572754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC019349.5	82478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	AC019349.5,KRT19	NA	NA	NA	NA	AC019349.5	1884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	AC019349.5,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	AC019349.5,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	AC019349.5,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19	53332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF1	34994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	32315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39824125	39824441	39824310	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	18696	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	40163251	40163440	40163343	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	1851	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7,ZNF385C	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF385C	14093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	40438296	40438586	40438441	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	40464466	40464885	40464704	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	26901	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	40559988	40560462	40560227	Y	RAMP2,CNP	STAT3,PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	13073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	40689876	40689925	40689901	Y	NA	NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP	NA	NA	NA	NA	NAGLU	3686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	40805539	40806065	40805782	Y	NA	TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	3258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	41657407	41657423	41657415	Y	MPP2	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	2419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	41778909	41778996	41778931	Y	NA	NA	MPP2,LOC100130581,MPP3,MEOX1,DUSP3,DHX8,ARL4D,MIR2117,ETV4,C17orf105,SOST,CD300LG	IMR90	Hi-C	24141950	SOST	55160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr17	42410887	42411017	42410922	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	GRN	9597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42416163	42416367	42416282	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	GRN	4247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8,FZD2	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	42619909	42620020	42619938	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12905	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	CRHR1	NA	NA	NA	NA	CRHR1	36094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44198056	44198387	44198212	Y	STH,KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44268679	44268848	44268762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	298931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	44850644	44850747	44850696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	53111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	44896658	44896796	44896753	Y	WNT3,WNT9B	WNT9B	NA	NA	NA	NA	WNT9B	11771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2,RPRML	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	45277552	45277907	45277885	Y	NA	CDC27	CDC27,MYL4,ITGB3,C17orf57,NPEPPS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC27	12764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	45282976	45283116	45283053	Y	NA	CDC27,ITGB3	MYL4	K562	ChIA-PET	22265404	CDC27	18188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	45352964	45353080	45353020	Y	WNT9B	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	23701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	53430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	45798483	45798953	45798740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	73641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	45818522	45818785	45818780	Y	OSBPL7,TBX21	NA	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL7	78415	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	20861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	46168455	46168716	46168586	Y	NA	NFE2L1,CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	CBX1	8167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	46605931	46606242	46606161	Y	TTLL6,HOXB1	HOXB1,HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB1	117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	47081384	47081547	47081466	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	47092021	47092148	47092036	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	19247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	47098330	47098693	47098445	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	25556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	27085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	ABI3	15080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	47815825	47816028	47815963	Y	MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	31449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	47943194	47943405	47943297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	72489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	48013600	48013625	48013613	Y	DLX4,DLX4,DLX3	DLX4	NGFR,SPOP,KAT7,ITGA3,SLC35B1,FLJ45513,TAC4,NXPH3,FAM117A,DLX4,DLX3	IMR90	Hi-C	24141950	DLX4	30709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48066634	48067004	48066930	Y	NA	DLX4,DLX3	NA	NA	NA	NA	DLX3	3584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	25047	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	COL1A1	20876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr17	48288364	48288588	48288396	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	11371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	48290532	48290619	48290576	Y	NA	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	13539	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	48996377	48996488	48996474	Y	RSAD1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	23586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	48998350	48998465	48998408	Y	CHAD	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	21609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	49008376	49008926	49008868	Y	NA	RP11-700H6.1	WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	11148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	8014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	49714308	49714449	49714379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	378419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	49983117	49983475	49983437	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	CA10	251902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	50024582	50024600	50024591	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	CA10	210777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	52086926	52087074	52087000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	253695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	53394900	53394943	53394922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLF	54527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	53457178	53457442	53457269	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	39911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	53654184	53654435	53654393	Y	NA	NA	PCTP	IMR90	Hi-C	24141950	MMD	156831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	54502486	54502858	54502493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOG	166202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	54674985	54675165	54675040	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	5925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	54833294	54833574	54833432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	75886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55101345	55101678	55101512	Y	NA	SCPEP1	NA	NA	NA	NA	SCPEP1	47879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55210991	55211279	55211077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP1	50538	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55434822	55435211	55435067	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	103610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55472969	55473349	55473111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	141757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	55568668	55569013	55568840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	237456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55741402	55741415	55741409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55912487	55912699	55912681	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	55969951	55970070	55970020	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	55976255	55976501	55976378	Y	OR4D2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	50838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56441767	56441894	56441848	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	13313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56480586	56480907	56480747	Y	NA	RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	12049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	56989340	56989615	56989430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1E	158110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	57443948	57444266	57444003	Y	NA	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	36898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	CA4	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CA4	12892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58220284	58220524	58220391	Y	VMP1,USP32,PPM1D,CA4	CA4	HEATR6,PPM1D,USP32,APPBP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CA4	4773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58222591	58223049	58222811	Y	CA4	CA4	CA4	K562	ChIA-PET	22265404	CA4	2248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58240902	58241117	58241010	Y	NA	CA4	NA	NA	NA	NA	CA4	15605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58467674	58467818	58467746	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	30013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	58475654	58476033	58475933	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	USP32,PPM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP32	21798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	58977545	58977928	58977702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	167304	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	68115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	59328360	59328558	59328442	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	146699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	59398606	59399069	59398760	Y	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	76188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	12960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	59532462	59532698	59532510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	57205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	52970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	60707106	60707291	60707232	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	4344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	61356227	61356695	61356586	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	165044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	KCNH6,DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	LIMD2	NA	NA	NA	NA	LIMD2	27954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,GH2	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	62196117	62196293	62196169	Y	NA	ERN1,SNORD104	ICAM2	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	9886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	62985207	62985536	62985392	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	15513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	63019276	63019534	63019390	Y	RGS9,GNA13	AMZ2P1,GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	31423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63569009	63569274	63569155	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	13244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65001910	65002048	65001970	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	42884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65318264	65318584	65318454	Y	NA	PSMD12	NA	NA	NA	NA	PSMD12	42159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	65505765	65506408	65506331	Y	HELZ,PSMD12,BPTF	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	134190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65516763	65517072	65516877	Y	PITPNC1	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	145188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	65823373	65823579	65823476	Y	SLC16A6,PITPNC1,BPTF	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	3733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	21088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	66595732	66596064	66595787	Y	NA	FAM20A	NA	NA	NA	NA	FAM20A	202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66597881	66598319	66598164	Y	FAM20A	FAM20A	NA	NA	NA	NA	FAM20A	2351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	66599244	66599673	66599435	Y	NA	FAM20A	NA	NA	NA	NA	FAM20A	3714	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	66618888	66618909	66618898	Y	NA	FAM20A	ABCA10,ABCA8,ABCA9	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20A	23358	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	69755219	69755553	69755499	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	140100	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	69824557	69824843	69824637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01152	199589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	70779461	70779663	70779556	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	71286924	71287020	71286972	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	19294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	71320337	71320718	71320484	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP4	14023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	71339324	71339501	71339471	Y	SSTR2,CDC42EP4	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	33010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	71496173	71496542	71496358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	141686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	1209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr17	71898249	71898423	71898326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	260021	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	99725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	98586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72673744	72674303	72674161	Y	KCTD2,GRIN2C,RAB37,RAB37,RAB37	RAB37	NA	NA	NA	NA	RAB37	9027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72737762	72737935	72737848	Y	RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	4856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.68018386773837
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73312070	73312303	73312159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	1107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	73456096	73456218	73456157	Y	KIAA0195	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	20856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	73531533	73531826	73531590	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	12372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73854851	73855120	73855038	Y	GRB2,GRB2,C17orf109,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,ACOX1,UNC13D,WBP2	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	UNC13D,UNK,WBP2	IMR90	Hi-C	24141950	WBP2	4263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	74025620	74025914	74025713	Y	H3F3B,TRIM47,EVPL	CDK3,EVPL,SRP68	NA	NA	NA	NA	EVPL	4087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	74067493	74067877	74067630	Y	RNF157,FAM100B	EVPL,SRP68,EXOC7	NA	NA	NA	NA	SRP68	759	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74116537	74116786	74116688	Y	NA	SRP68,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.2882941883814
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	74233896	74234348	74234226	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	74359249	74359572	74359412	Y	RHBDF2,SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	PRPSAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK1	11093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74481730	74482020	74481883	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	13852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74496600	74496786	74496748	Y	NA	UBE2O,RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	19178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74692944	74693312	74693210	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	11786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	74696685	74696955	74696820	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	8143	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	74704169	74704303	74704279	Y	CYGB,PRCD	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	74836829	74837207	74837140	Y	UBE2O,MGAT5B	MGAT5B	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5B	25331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	75266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	4194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	10285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr17	75386259	75386377	75386341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	75387909	75388384	75388205	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	113258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75388510	75388802	75388677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	113859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	75405377	75405733	75405639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	130726	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	75450694	75450827	75450755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	176043	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	187151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75553117	75553125	75553121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	278466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	75692874	75693017	75692949	Y	NA	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT9	418223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75769300	75769393	75769353	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	TMC8	355458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	31.5368301770549
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	168532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76147929	76148019	76147974	Y	NA	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	14620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	76335027	76335218	76335120	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	18940	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76347582	76348110	76347694	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	6048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	76361692	76362147	76361865	Y	NA	SOCS3,PGS1	PGS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	7534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	76555163	76555596	76555265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	182442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76588219	76588768	76588537	Y	NA	NA	DNAH17,CYTH1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	187611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76592779	76593067	76592910	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1,CANT1	NA	DNAH17,CYTH1,PGS1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	183312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76669540	76669658	76669599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	106721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76764263	76764724	76764556	Y	SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	11655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76813236	76813533	76813481	Y	CYTH1,ENGASE,USP36	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	21990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr17	77117014	77117407	77117247	Y	NA	ENGASE	NA	NA	NA	NA	ENGASE	47993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78198081	78198434	78198366	Y	NA	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	SGSH	5359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	78834696	78835167	78835087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	128231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78864265	78865139	78864341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	98259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	79046413	79046604	79046526	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	39465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79066141	79066299	79066207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	59193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr17	79066626	79066874	79066750	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	59678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	TMEM105	335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79313114	79313481	79313281	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	10640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr17	80183373	80183743	80183482	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	CD7,SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80328282	80328672	80328333	Y	NA	SECTM1,TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	13159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	27471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80655375	80655626	80655561	Y	RAB40B,FN3K	RAB40B,FN3KRP,FN3K	NA	NA	NA	NA	RAB40B	771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	2034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	9541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80829054	80829460	80829235	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	32600	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr17	80845276	80845458	80845382	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	48822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	93162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP14	145162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	999057	999295	999176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	188510	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	382273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	680593	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	2963165	2963356	2963277	Y	TGIF1,MYL12B,METTL4,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	47957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3059400	3059535	3059456	Y	MYL12B,METTL4,SMCHD1	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	48087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3179850	3179998	3179924	Y	EMILIN2,TGIF1,TGIF1,TGIF1	MYOM1	NA	NA	NA	NA	MYOM1	38108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	3552509	3552635	3552572	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	142903	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3610673	3610894	3610785	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	201067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3612432	3612598	3612515	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	202826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr18	3741003	3741403	3741194	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	331397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	4356734	4357177	4357014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	947128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	4373306	4373648	4373563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	963700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	4453597	4454207	4453941	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	1043991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	5584856	5584964	5584919	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	828272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	783116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	LAMA1	NA	NA	NA	NA	LAMA1	513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	7950764	7950916	7950843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	385984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	8661812	8662039	8661951	Y	NA	NA	ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	54369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9494685	9495048	9494827	Y	ANKRD12,ANKRD12,VAPA,RAB31	RALBP1	NA	NA	NA	NA	RALBP1	21678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	9613164	9613539	9613352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9771568	9771961	9771765	Y	RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	RAB31	65406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	9899069	9899359	9899167	Y	NA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	12640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	10133595	10133911	10133753	Y	NA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	221596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	10372349	10372498	10372437	Y	NA	NA	APCDD1,NAPG	IMR90	Hi-C	24141950	APCDD1	80127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	10852460	10852708	10852534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	328558	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	30712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	12880036	12880906	12880743	Y	NA	PTPN2	NA	NA	NA	NA	PTPN2	46736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	13219877	13220140	13220009	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	230516	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	13452540	13452718	13452594	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	271941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	18513293	18513512	18513419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	176300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	19397108	19397142	19397125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	114190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	19675139	19675157	19675148	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	72247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	19746222	19746392	19746310	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	1012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	122695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	LAMA3	NA	NA	NA	NA	LAMA3	38600	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	69932	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	150248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	21463540	21463749	21463607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	106988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	23255522	23255766	23255604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF521	325368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	23943332	23943387	23943360	Y	KCTD1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4B	139432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	24267222	24267336	24267279	Y	KCTD1	KCTD1	NA	NA	NA	NA	KCTD1	31857	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	24581946	24582207	24582077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST9	181074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	24645556	24645568	24645562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST9	117713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	989726	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	26915236	26915445	26915422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	1159826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29080100	29080413	29080257	Y	NA	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	4094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29196916	29197276	29197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT6	66523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29228956	29229096	29229026	Y	RNF125	B4GALT6	NA	NA	NA	NA	B4GALT6	34703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	29232383	29232901	29232639	Y	NA	B4GALT6	NA	NA	NA	NA	B4GALT6	30898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	29628778	29629024	29628889	Y	RNF125,RNF138,RNF138	RNF125,RNF138	NA	NA	NA	NA	RNF125	32443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29665661	29665831	29665728	Y	NA	RNF138	NA	NA	NA	NA	RNF138	3987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	32386590	32386868	32386730	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	168024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	32424641	32425032	32424811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	32610382	32610507	32610471	Y	ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	55490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	32800058	32800164	32800111	Y	DTNA,ZNF397	ZNF397	NA	NA	NA	NA	ZNF397	18830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	33042995	33043415	33043130	Y	MAPRE2	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	32540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	33185452	33185527	33185471	Y	ZNF397,GALNT1	GALNT1	NA	NA	NA	NA	GALNT1	26371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	33407474	33407836	33407618	Y	ZNF24,ZNF396,INO80C	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf21	142210	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	35009721	35010039	35009931	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	133961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	36850987	36851328	36851158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	62311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	38400153	38400634	38400214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1132537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	38446239	38446490	38446414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1086681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	39021552	39021652	39021602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	511519	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	40289843	40290198	40289863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	756672	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	42419261	42419416	42419316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	161123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	162271	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	43622844	43623013	43623010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAUS1	59285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	43732950	43733330	43733193	Y	RNF165,C18orf25	C18orf25	NA	NA	NA	NA	C18orf25	18189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	43830546	43830877	43830624	Y	EPG5,PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	73895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	44120296	44120642	44120476	Y	LOXHD1,LOXHD1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	215524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	100970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	44451829	44452200	44451995	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	43255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	45472001	45472124	45472045	Y	NA	SMAD2	SMAD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD2	16486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	45494348	45494736	45494572	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	38833	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr18	45754780	45755059	45754896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB7C	180064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	46130104	46130567	46130233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	66687	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	291028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46368946	46369173	46369117	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	305529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46375185	46375303	46375244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	311768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr18	46382446	46382625	46382534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	319029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	387792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46458611	46458800	46458705	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	395194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	402091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	46467138	46467469	46467322	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	403721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46472885	46473143	46472966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	409468	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	46486224	46486525	46486411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	422807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	441929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.1674327822432
chr18	46733107	46733359	46733209	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	252358	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	47628723	47629107	47629104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	90356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	MRO	NA	NA	NA	NA	MRO	47957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	48375517	48375619	48375577	Y	ME2	MRO,ME2	ELAC1	IMR90	Hi-C	24141950	MRO	25745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	51675484	51675804	51675634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	73354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	51741820	51741880	51741850	Y	STARD6	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	7278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	51773425	51773767	51773527	Y	NA	MBD2,POLI	POLI	MCF7	ChIA-PET	22265404	POLI	20007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	53072982	53073437	53073370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	256581	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	54080263	54080466	54080381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR7	236108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55513608	55513807	55513708	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,ALPK2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP8B1	45275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55864213	55864707	55864433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	154614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	56514801	56515232	56515114	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	12600	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr18	56516862	56517001	56516932	Y	NA	ZNF532	ZNF532	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF532	10831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	56533618	56533625	56533622	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	5786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	56701404	56701604	56701510	Y	ALPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	103105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	57531424	57531809	57531587	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	PMAIP1	33371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr18	60544702	60545081	60544795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	164030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	60857192	60857346	60857314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	128015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr18	61121848	61122109	61121956	Y	SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5	VPS4B,SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	19885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	65027496	65027665	65027594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	154552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	67862254	67862313	67862284	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	8868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	67901995	67902279	67902045	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	30814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	70536769	70537080	70536861	Y	CBLN2,NETO1,NETO1	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	3388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	70814652	70814839	70814746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	281271	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	70998412	70998732	70998572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	465031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	477584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	71730939	71731058	71731041	Y	FBXO15	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	82042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	71910001	71910146	71910074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM21	96255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	72135904	72136231	72136084	Y	FBXO15,FBXO15,FAM69C,CNDP1	CNDP2	NA	NA	NA	NA	CNDP2	24820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	72146993	72147098	72147046	Y	CNDP2	CNDP2	FAM69C,CNDP1	IMR90	Hi-C	24141950	CNDP2	13953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	72706946	72707254	72707048	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	212049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	72779359	72779673	72779506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	139630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74088486	74089010	74088832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	116136	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74194351	74194716	74194640	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	10430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74199867	74199923	74199879	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	5223	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	74214607	74214778	74214699	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	ZNF516	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-17M16.1	9130	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74230733	74230810	74230772	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	ZNF516,LOC284276	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-17M16.1	25256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr18	74735151	74735398	74735253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	202588	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74754529	74754928	74754700	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	221966	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74764294	74764548	74764423	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	231731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	236092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	74780243	74780707	74780579	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	247680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr18	74810011	74810388	74810104	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	277448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	280798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74814335	74814742	74814712	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	281772	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74815308	74815668	74815588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	282745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74821198	74821567	74821500	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	288635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	307587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74840794	74841428	74841367	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	308231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	309342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	75115540	75115770	75115653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	582977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr18	75211926	75212034	75211980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	679363	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	75803264	75803274	75803269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	935001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	76574789	76574960	76574953	Y	SALL3	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	163315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.44970719773469
chr18	76737711	76738510	76737981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr18	76740873	76741825	76741734	Y	NA	SALL3	NA	NA	NA	NA	SALL3	2598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr18	76828001	76828378	76828185	Y	NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	716	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	76955177	76955415	76955295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	127892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	77163451	77163662	77163546	Y	ATP9B,CTDP1,NFATC1,NFATC1	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NFATC1	9595	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	77164575	77164861	77164733	Y	ATP9B,CTDP1,NFATC1,NFATC1	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NFATC1	10719	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr18	77220515	77220732	77220603	Y	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	66659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	77682652	77682872	77682762	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	26792	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr18	77713083	77713430	77713261	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	3419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr18	77715299	77715635	77715515	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	5635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr18	77721815	77722347	77722078	Y	PQLC1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr18	77723013	77723575	77723504	Y	HSBP1L1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr19	380759	380771	380765	Y	NA	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	26368	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	384369	384669	384409	Y	SHC2,C2CD4C,MIER2	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	22470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	15.0983691215928
chr19	417829	418007	417918	Y	NA	C2CD4C,SHC2	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	10690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	437457	437640	437549	Y	PALM,HCN2,FGF22,SHC2	C2CD4C,SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	21356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	445179	445348	445264	Y	NA	C2CD4C,SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	13648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	461817	462164	462146	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1	NA	NA	NA	NA	SHC2	2821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	15.7237453573985
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr19	791303	791398	791349	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	791656	792058	791976	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	CFD,MED16,R3HDM4,KISS1R	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	CFD,MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	933164	933556	933549	Y	NA	MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	9383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	954903	955312	954982	Y	KISS1R,ARID3A	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	25862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.02027580160756
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.62838612225058
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	1632932	1633212	1633140	Y	STK11	MBD3,UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	17392	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1669192	1669298	1669247	Y	C19orf26,EFNA2,APC2,TCF3,TCF3	TCF3	TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	18588	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	ONECUT3	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	ONECUT3	24495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	ONECUT3	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ONECUT3	2822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	1909763	1910077	1909925	Y	KLF16	KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	ADAT3	6386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2017271	2017442	2017356	Y	NA	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	15438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2171377	2171588	2171512	Y	REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	8913	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2171641	2172019	2171832	Y	NA	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	9177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2394369	2394570	2394516	Y	NA	TIMM13	NA	NA	NA	NA	TIMM13	31322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2495780	2495940	2495859	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	21660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	2588002	2588286	2588143	Y	LINGO3,GNG7,DIRAS1	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	112421	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2599036	2599584	2599134	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	101123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2668275	2668465	2668389	Y	SPPL2B,AES,GNG7	GNG7	NA	NA	NA	NA	GNG7	32242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2679436	2679769	2679633	Y	NA	GNG7,DIRAS1	NA	NA	NA	NA	GNG7	20938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2711591	2711804	2711730	Y	GADD45B,GNA15	GNG7,DIRAS1,SLC39A3	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	7612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2719845	2720284	2720049	Y	JSRP1,TLE6,AES,GNG7,DIRAS1	GNG7,DIRAS1,SLC39A3	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	2789518	2789719	2789619	Y	NA	SGTA,THOP1,ZNF554,ZNF555	NA	NA	NA	NA	THOP1	6060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF556,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	2926811	2926963	2926923	Y	NA	ZNF57,ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	ZNF77	16006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	2974450	2974580	2974523	Y	NFIC,TLE2,TLE2	ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	TLE6	864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.03754171677016
chr19	3231384	3231772	3231576	Y	ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5	NCLN,CELF5	NA	NA	NA	NA	CELF5	8683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	3397236	3397600	3397594	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	39675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.53904665999264
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	3683675	3684043	3683874	Y	NA	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	14434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	3693047	3693257	3693152	Y	RAX2	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	5220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	4014917	4015042	4014976	Y	NA	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	PIAS4	9273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4051584	4052099	4051914	Y	CCDC94	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4061318	4061457	4061400	Y	SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	3486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4063699	4063930	4063813	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	1013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	4123124	4123351	4123249	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	MAP2K2	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	998	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.32282601870659
chr19	4634649	4634985	4634807	Y	CCDC94,SEMA6B,TICAM1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	2545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4744883	4745173	4745028	Y	NA	DPP9,MIR7-3HG,FEM1A	DPP9,UHRF1,MIR7-3HG,ARRDC5,PLIN3	IMR90	Hi-C	24141950	MIR7-3HG	21944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	MIR7-3HG,FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	4837640	4837813	4837751	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1,PLIN3	NA	NA	NA	NA	TICAM1	7924	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	4970760	4971027	4970931	Y	NA	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	3635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5048305	5048678	5048483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	81180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5357360	5357663	5357512	Y	NA	PTPRS	PTPRS,ZNRF4,KDM4B,SAFB2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	18546	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.64565203741318
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5585977	5586132	5586057	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	34914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5829202	5829624	5829506	Y	NA	DUS3L	NA	NA	NA	NA	DUS3L	39953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5953003	5953253	5953208	Y	SAFB2,FUT5	CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	22900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSBG2	75501	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	6063576	6063994	6063809	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSBG2	69264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6132012	6132373	6132181	Y	NA	ACSBG2	NA	NA	NA	NA	ACSBG2	885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	6462383	6462634	6462493	Y	RFX2	KHSRP,CRB3,SLC25A23,TUBB4A	NA	NA	NA	NA	SLC25A23	580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	6528964	6529120	6528979	Y	NA	TUBB4A	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.48423902805988
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	14463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.03754171677016
chr19	6588124	6588275	6588192	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	13839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	6588388	6589226	6588715	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	12888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	6589429	6589697	6589573	Y	PSPN,TNFSF9,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	12417	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	6593602	6593939	6593861	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	8175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	1823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	7266028	7266415	7266222	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	25630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	7456481	7456588	7456536	Y	LRRC8E,ARHGEF18	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	7720323	7720877	7720670	Y	PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,RETN,C19orf59,XAB2,LOC100131801,STXBP2	XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	20556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	CCL25	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8272965	8273383	8273152	Y	NA	CERS4	NA	NA	NA	NA	CERS4	3345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	8488334	8488459	8488398	Y	PRAM1,MYO1F,MARCH2	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.41216548096454
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8580278	8580518	8580443	Y	PRAM1,MYO1F	ZNF414	NA	NA	NA	NA	ZNF414	3230	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	9855997	9856274	9856136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP22	63248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	10138488	10138727	10138608	Y	EIF3G,COL5A3	COL5A3	NA	NA	NA	NA	COL5A3	19341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10346765	10347120	10347031	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	NA	NA	NA	NA	DNMT1	6803	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10442358	10442615	10442487	Y	NA	ICAM4,ICAM5,FDX1L,RAVER1,ICAM3,TYK2	NA	NA	NA	NA	RAVER1	42	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10517647	10518072	10517920	Y	NA	TYK2,MIR1181	CDC37	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR1181	5433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10526573	10526793	10526623	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	14359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10713789	10714290	10714179	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,AP1M2,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	2656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	10728527	10728590	10728559	Y	NA	AP1M2,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	17394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10842367	10842486	10842420	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	15612	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10925932	10926095	10926043	Y	ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,DNM2,C19orf38	TMED1	NA	NA	NA	NA	TMED1	18899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	10992105	10992492	10992295	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	11916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ELAVL3,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ELAVL3	3043	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	11675625	11675958	11675811	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627,ACP5	NA	NA	NA	NA	ZNF627	7436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	12261625	12261922	12261774	Y	NA	ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136	NA	NA	NA	NA	ZNF625	3624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	12427205	12427564	12427426	Y	NA	ZNF44,ZNF563,ZNF442	NA	NA	NA	NA	ZNF563	14970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	12892597	12892707	12892653	Y	ZNF44,ZNF563,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,STX10,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	7603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	13144758	13144905	13144801	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	40336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13147424	13147812	13147700	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	43002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	59023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr19	13171487	13171654	13171570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	54727	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13188264	13188490	13188383	Y	ZNF490,PRDX2,KLF1,STX10,LYL1	TRMT1,NACC1	NA	NA	NA	NA	TRMT1	37891	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.71772558450853
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.96546816967481
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	13444695	13444933	13444906	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	185466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13519848	13519992	13519920	Y	NANOS3,SYCE2	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1A	212812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13732373	13732509	13732441	Y	NA	CACNA1A	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1A	295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	13743837	13744244	13743993	Y	NA	CACNA1A	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1A	11033	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4,NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	26194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	16163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	15288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	11491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	13959901	13960035	13959978	Y	CCDC130,RFX1,ZSWIM4	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	10842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	NANOS3,CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	NANOS3	1487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.2882941883814
chr19	14097142	14097697	14097482	Y	CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	DCAF15,RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	18154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	14115648	14116111	14115801	Y	CCDC130,ZSWIM4,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14404408	14404769	14404597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN1	89409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	14473667	14474081	14473883	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,PKN1,CD97	NA	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	DDX39A	54111	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	NA	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	DDX39A	53912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	14632915	14633462	14633057	Y	IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	DNAJB1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJB1	5120	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14661096	14661426	14661346	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	19448	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	14999338	14999543	14999395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	98217	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3,EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	8499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3,EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	7770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	15752781	15753122	15752960	Y	BRD4,AKAP8,RAB8A,HSH2D,CYP4F3	NA	NA	NA	NA	NA	WIZ	194019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	227712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	201389	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	16364400	16364769	16364668	Y	NWD1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1M1	58011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	16452764	16452992	16452877	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	19136	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	16493561	16493905	16493595	Y	KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	16576710	16576784	16576751	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	4112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	16772555	16772747	16772653	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	2617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	16779311	16779659	16779460	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	9373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	17236053	17237400	17237360	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	51462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,USHBP1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	18064785	18064952	18064869	Y	NA	CCDC124,KCNN1,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	KCNN1	4683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.1268811790281
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.05781751837771
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	LRRC25	8450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	18498524	18498706	18498615	Y	ARRDC2,IFI30,JUND	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	LRRC25	7721	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	18528819	18529396	18529072	Y	ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,CRLF1,KLHL26	NA	NA	NA	NA	CRLF1	5866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	18740732	18741107	18740923	Y	NA	C19orf60,CRLF1,KLHL26	NA	NA	NA	NA	KLHL26	4668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	18810961	18811220	18811091	Y	NA	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	18474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19005223	19006062	19005586	Y	TMEM59L,KLHL26,CRTC1,SUGP2,SLC25A42,NCAN,HAPLN4,HOMER3,HOMER3,GDF1	GDF1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	CERS1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19078398	19078892	19078760	Y	ELL,GATAD2A,HOMER3	DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	HOMER3	28328	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	19370628	19370854	19370732	Y	GDF1,SUGP2,NCAN	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2AP	58395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	19504149	19504345	19504247	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	9514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19571175	19572073	19571752	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	52472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19572734	19572965	19572860	Y	MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	51580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	19573019	19573301	19573248	Y	MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	51244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	19701908	19702346	19702068	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	PBX4,LPAR2	NA	NA	NA	NA	PBX4	25379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr19	20747496	20747853	20747738	Y	NA	ZNF737	NA	NA	NA	NA	ZNF737	881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	21505293	21505670	21505490	Y	ZNF429,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	4557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	21882044	21882358	21882227	Y	ZNF676,ZNF208	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	66072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	22610267	22610542	22610420	Y	ZNF208,ZNF257,ZNF676,ZNF492,ZNF98	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P34	60513	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.94820225451221
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	8.21923052773101
chr19	22724616	22724856	22724736	Y	ZNF257,ZNF98,ZNF492	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	11329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	23855421	23855665	23855541	Y	NA	ZNF675	NA	NA	NA	NA	ZNF675	12357	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	27733398	27733788	27733670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1968660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	27733888	27734761	27733974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1967687	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	28232001	28232276	28232191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28234930	28234990	28234960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	28241688	28242434	28242171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1460014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	28385204	28385282	28385243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1317166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	29210558	29210810	29210684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	491638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	29896046	29896124	29896085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	193598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	30334239	30334593	30334547	Y	NA	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	33434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	30864626	30864772	30864676	Y	ZNF536	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	452075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	31843033	31843344	31843257	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	4580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr19	34398114	34398257	34398186	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	113276	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	34724001	34724111	34724046	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	19331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,HPN,FXYD3	NA	NA	NA	NA	HPN	28372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35636009	35636339	35636175	Y	NA	FXYD3,LGI4,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD7	3855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	35696373	35696472	35696417	Y	FFAR1,CD22,USF2	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	40761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	35701711	35701918	35701833	Y	ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5,FFAR3	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	35315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35702745	35703411	35703060	Y	ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	33822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35763871	35764402	35764192	Y	FXYD1,FXYD1,HAMP	LSR,USF2,CD22	NA	NA	NA	NA	USF2	5990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35806837	35807076	35807010	Y	NA	USF2,CD22	NA	NA	NA	NA	CD22	1088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	35812312	35812429	35812332	Y	HPN,LGI4,USF2,MAG,FFAR2,U2AF1L4,FFAR3,FFAR1	CD22	NA	NA	NA	NA	CD22	4148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	36030863	36031038	36030900	Y	NA	DMKN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	3459	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	UPK1A-AS1	31058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	36274503	36274656	36274589	Y	GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	ARHGAP33	11069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	COX7A1	6618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,COX7A1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	COX7A1	24673	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.91668031063198
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	2810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569,ZNF793	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	38186506	38186731	38186619	Y	ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573	ZNF781,ZFP30,ZNF607	NA	NA	NA	NA	ZFP30	5268	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	38674383	38674545	38674477	Y	ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1	DPF1	NA	NA	NA	NA	DPF1	43809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	38717073	38717581	38717079	Y	NA	DPF1,SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	DPF1	773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	38719187	38719304	38719247	Y	ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1	DPF1,SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	DPF1	833	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	38925195	38925518	38925467	Y	NA	GGN,FAM98C,RASGRP4,RYR1	NA	NA	NA	NA	RYR1	2856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	39189644	39189919	39189773	Y	RINL	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4	53355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	39283371	39283483	39283427	Y	NA	CAPN12,LGALS4,ECH1	NA	NA	NA	NA	LGALS4	18521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4,NCCRP1	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	40042107	40042358	40042233	Y	NA	EID2B,EID2,LGALS13	DLL3,EID2,LGALS17A	IMR90	Hi-C	24141950	EID2	13237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	42411	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41652867	41652884	41652876	Y	CYP2A6,CYP2B6	RPL36P16,CYP2S1	NA	NA	NA	NA	RPL36P16	20882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	7193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	9.5593224616002
chr19	41695552	41695583	41695568	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	1371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	41701582	41701929	41701850	Y	CYP2A13,CYP2F1	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	4628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41702138	41702290	41702230	Y	ADCK4,ITPKC,TGFB1,CCDC97	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	5184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	42289644	42289819	42289732	Y	NA	CEACAM6	NA	NA	NA	NA	CEACAM6	36759	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19	NA	NA	NA	NA	RPS19	17587	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19	NA	NA	NA	NA	RPS19	42914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42430880	42431141	42430883	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	30401	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	42501283	42501478	42501381	Y	TMEM145	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	1634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42532310	42532673	42532485	Y	NA	ATP1A3,ZNF574	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	32661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	DEDD2	29017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.09234934870291
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	42902919	42903213	42903066	Y	TMEM145	NA	CNFN	MCF7	ChIA-PET	22265404	MEGF8	75158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	42964614	42965000	42964807	Y	CEACAM8,DEDD2	NA	CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM1	98386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	43770053	43770115	43770084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD177	85696	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	CD177	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	CD177	19969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	44555398	44555498	44555444	Y	ZNF155,ZNF223	ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224	NA	NA	NA	NA	ZNF223	1878	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	44780646	44780756	44780701	Y	NA	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	26443	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	45100230	45100376	45100298	Y	NA	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	44722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.61112020708799
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1,APOC1P1	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	45604142	45604476	45604278	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	11488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	45606484	45606609	45606525	Y	CEACAM16,FOSB,RELB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	13830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	45616872	45617353	45617125	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	24218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	163936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	46803943	46804533	46804229	Y	IRF2BP1,MYPOP,HIF3A,HIF3A,HIF3A,CCDC8	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	43718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	46853988	46854113	46854077	Y	PRKD2	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	5737	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C,CCDC8	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	46905606	46905628	46905621	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	9213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.34310182031415
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47234783	47235117	47235027	Y	PTGIR,ZC3H4,PRKD2,STRN4	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	FKRP	12186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47295326	47295559	47295464	Y	NA	FKRP,STRN4,SLC1A5	FKRP,STRN4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A5	5475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	47487878	47488175	47487946	Y	ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1	NPAS1	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS1	32902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	NPAS1,TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	47611153	47611400	47611382	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	MIR3191	831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	47961170	47962467	47962382	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	10958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	48293591	48293754	48293716	Y	CABP5,CRX	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	2393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr19	48352522	48352636	48352584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	56375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	48596127	48596433	48596418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIG1	75427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	48625125	48625566	48625247	Y	NA	LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	46294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	48832028	48832343	48832234	Y	CARD8,IZUMO1,EMP3	EMP3,CCDC114,TMEM143	NA	NA	NA	NA	CCDC114	8877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2,LMTK3	NA	NA	NA	NA	LMTK3	18067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	LMTK3	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LMTK3	32168	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	LMTK3	NA	NA	NA	NA	LMTK3	42682	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	23859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	20673	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49775600	49775657	49775630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	66208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	50400896	50401285	50401161	Y	ALDH16A1,RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	AKT1S1	21180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	50425284	50425454	50425359	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	4505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr19	50835948	50836015	50835982	Y	IL4I1,NR1H2,KCNC3	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	1176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr19	50888786	50889179	50888984	Y	ACPT,LOC342918	POLD1,MYBPC2	NA	NA	NA	NA	POLD1	3325	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15266	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr19	51068838	51069258	51069152	Y	NA	LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	44	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	51111018	51111676	51111369	Y	NA	LRRC4B,C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	39026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	51182448	51182932	51182864	Y	NA	C19orf81,SYT3	NA	NA	NA	NA	SYT3	12797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	51796169	51796569	51796297	Y	NA	NA	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	ETFB	71103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr19	51797467	51797679	51797598	Y	NA	NA	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	ETFB	69993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr19	52051082	52051228	52051165	Y	ZNF615,ZNF614,CD33,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175	ZNF175	ZNF175,CEACAM18	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF175	21323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.89640450902442
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	35277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	53132219	53132465	53132335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	59284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	53173643	53173679	53173660	Y	ZNF83	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	18070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	53239075	53239317	53239102	Y	NA	ZNF83,ZNF611,ZNF600	NA	NA	NA	NA	ZNF611	2749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	53449736	53449992	53449814	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	5882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	54049099	54049989	54049424	Y	ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	80110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	54052581	54053344	54052712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	83592	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	54116077	54116235	54116154	Y	NA	NA	DPRX	IMR90	Hi-C	24141950	MIR526B	79412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	MIR526B,MIR519B	NA	NA	NA	NA	MIR526B	27421	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr19	54286017	54286259	54286128	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	54291187	54291209	54291198	Y	BIRC8,ZNF845,ZNF765,ZNF761,ZNF813	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2258	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr19	54291781	54292027	54291904	Y	ZNF331,DPRX,NLRP12	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	54433325	54433420	54433359	Y	TARM1,ZNF813,DPRX,CACNG7	CACNG7	NA	NA	NA	NA	CACNG7	22736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9,LILRB3	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	54828104	54828567	54828302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LILRB3	83502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	54936601	54936866	54936734	Y	NA	TTYH1,LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	TTYH1	12208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	SYT5,PTPRH,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	TMEM150B,SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	55937400	55937853	55937600	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	TMEM238,RPL28,UBE2S,ISOC2,ZNF628	NA	NA	NA	NA	UBE2S	20255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	55976006	55976393	55976362	Y	NA	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ISOC2	4296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SSC5D,SBK2	NA	NA	NA	NA	SBK2	14879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14871	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	56224436	56224703	56224570	Y	TMEM150B	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	39844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	69441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	57218016	57218204	57218110	Y	NA	ZNF835	NA	NA	NA	NA	ZNF835	36865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	57349423	57349757	57349684	Y	ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3	PEG3,ZIM2	NA	NA	NA	NA	PEG3	339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58080640	58080798	58080711	Y	NA	ZNF549,ZNF550,ZIK1,ZNF416,ZNF530,ZNF134	ZNF550,ZNF549	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZIK1	7026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.46697311289729
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551,ZNF154	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF671	765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	58398826	58399093	58399050	Y	ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418	ZNF587,ZNF814,ZNF417,ZNF418	NA	NA	NA	NA	ZNF814	384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr19	58480028	58480253	58480224	Y	NA	ZNF418,ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF256	22985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	10870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZNF135	10951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.48423902805988
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	129541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	1115244	1115256	1115249	Y	SNTG2	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG2	170690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	1476597	1477084	1476655	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	150107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	31991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	1661359	1661779	1661556	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	34168	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	1676691	1676995	1676843	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	49500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	1719023	1719384	1719170	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	27240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.48423902805988
chr2	3072634	3072961	3072804	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	306692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	3106532	3106816	3106764	Y	NA	NA	MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	272837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.7928090180488
chr2	3172486	3172640	3172538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	207013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.36036773547675
chr2	3198841	3199068	3198933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	180585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	3698707	3698801	3698754	Y	NA	TMSB4XP2	NA	NA	NA	NA	TMSB4XP2	35360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	3707060	3707165	3707123	Y	NA	TMSB4XP2	NA	NA	NA	NA	TMSB4XP2	43713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr2	7965738	7966104	7965909	Y	NA	NA	LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	850871	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8007041	8007241	8007118	Y	NA	NA	LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	809734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8019339	8019650	8019528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	797325	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	8295099	8295585	8295262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	521390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8317157	8317412	8317175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	499563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8344767	8345207	8345065	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	471768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8369680	8369964	8369925	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	447011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	8453183	8453334	8453274	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	363641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	8621577	8621887	8621772	Y	NA	NA	LOC100506274,LOC339788,LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	195088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8686801	8687006	8686925	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	129969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	8713737	8713978	8713829	Y	NA	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	102997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM17	52334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	9811704	9812003	9811849	Y	NA	YWHAQ	NA	NA	NA	NA	YWHAQ	42561	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	9816070	9816294	9816134	Y	NA	YWHAQ	YWHAQ,ADAM17	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAQ	46927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	10572027	10572239	10572154	Y	NA	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	14391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	10657601	10657707	10657654	Y	NA	NA	NOL10,ODC1,HPCAL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-320M2.1	70781	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	10984211	10984590	10984279	Y	NA	PDIA6	C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDIA6	8108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	11253048	11253286	11253167	Y	NA	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	40038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	11890513	11890846	11890740	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	70927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	11894336	11894526	11894507	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	74750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	11970136	11970284	11970210	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16136	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	12466136	12466597	12466183	Y	TRIB2	NA	LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	388418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	12596433	12596805	12596535	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	258210	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	12805628	12805875	12805752	Y	NA	TRIB2	LPIN1,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	49140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	429184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	15949825	15950073	15949883	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	57990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr2	16084165	16084643	16084249	Y	NBAS,DDX1,MYCN	MYCN,MYCNOS	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	3794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	16210624	16210684	16210654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	130253	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	16243100	16243429	16243303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	162729	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr2	16576517	16576693	16576605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	268906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	17770668	17770974	17770883	Y	MSGN1	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	52275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	19273463	19273583	19273517	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	533517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	TTC32	634820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20037141	20037249	20037195	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC32	62498	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	MATN3,LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	2914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	20415166	20415327	20415249	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	7867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	20432677	20432919	20432791	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	9483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20435780	20436055	20435965	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	12586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	20732744	20733106	20733037	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOB	87909	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	20811186	20811439	20811262	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	37410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	21474623	21474859	21474741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	453741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	23051641	23052027	23051835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	554061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	23412802	23412834	23412819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	193254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	24047559	24047784	24047672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	100200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	24122171	24122336	24122254	Y	NA	ATAD2B,UBXN2A	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	25648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	24552849	24553177	24552876	Y	NA	RPL36AP13,ITSN2	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	2204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NCOA1	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA1	563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	25136821	25136958	25136890	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	3750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	124324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	25482494	25482888	25482692	Y	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	80571	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	25780615	25780755	25780681	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	25874787	25874953	25874848	Y	RAB10	DTNB	NA	NA	NA	NA	DTNB	19550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	26184450	26184595	26184522	Y	NA	KIF3C,UQCRHP2	NA	NA	NA	NA	KIF3C	19023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	2	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27072078	27072262	27072179	Y	UCN,CCDC164,OTOF,MAPRE3,DPYSL5	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	3463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27073037	27073234	27073155	Y	NA	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	4422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27194386	27194503	27194476	Y	NA	MAPRE3	NA	NA	NA	NA	MAPRE3	2906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	NA	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL33	52800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	27939854	27940151	27940111	Y	NA	NA	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL33	52433	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28137373	28137669	28137575	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	25408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	28492228	28492339	28492284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	AC097724.3	150025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	AC097724.3,PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB,SPDYA	NA	NA	NA	NA	SPDYA	6313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	29050679	29050871	29050775	Y	NA	SPDYA,TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	40296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	29650647	29650979	29650813	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	332076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	30231247	30231635	30231440	Y	NA	NA	ALK	IMR90	Hi-C	24141950	ALK	88815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	30391485	30391578	30391503	Y	YPEL5	YPEL5	NA	NA	NA	NA	YPEL5	23678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	30490099	30490308	30490211	Y	NA	LBH,AC104698.1	NA	NA	NA	NA	AC104698.1	10906	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	30644745	30644849	30644777	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104698.1	165552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	30644994	30645276	30645103	Y	LBH	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104698.1	165801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN13	233239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	31442526	31442753	31442658	Y	NA	EHD3	NA	NA	NA	NA	EHD3	12127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	33688539	33688685	33688612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	133764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	36882679	36883018	36882845	Y	NA	FEZ2,VIT	LOC100288911,CRIM1,FEZ2,VIT	IMR90	Hi-C	24141950	FEZ2	11449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	36980864	36981389	36981193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIT	59031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	37617673	37618124	37617783	Y	CDC42EP3,EIF2AK2	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	47956	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37885188	37885619	37885408	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	77992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	37892431	37892964	37892857	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	70647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	38007638	38007650	38007644	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38146886	38147198	38147079	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	183275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38265039	38265434	38265056	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	69610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38333760	38333892	38333836	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	1152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38334903	38335105	38334999	Y	NA	NA	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38607567	38607881	38607689	Y	ATL2	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	5140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	38840461	38840529	38840511	Y	GALM	NA	GALM,HNRPLL,ATL2,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALM	50523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	39443973	39444333	39444109	Y	SOS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	94487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	39732092	39732298	39732165	Y	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	69639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	39766086	39766205	39766146	Y	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	103633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	39800503	39800829	39800666	Y	CDKL4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	138050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	40260196	40260378	40260267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	575815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	40767004	40767399	40767181	Y	NA	NA	SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	68794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42053679	42053991	42053965	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	219169	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42182061	42182670	42182320	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	90490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42194638	42194757	42194709	Y	NA	NA	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	78403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42278314	42278459	42278342	Y	NA	PKDCC	NA	NA	NA	NA	PKDCC	5154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42685973	42686346	42686160	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	32891	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	42783314	42783348	42783329	Y	NA	AC025750.7	MTA3	IMR90	Hi-C	24141950	AC025750.7	24732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	42952930	42953056	42952997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAAO	64677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43020336	43020977	43020619	Y	HAAO	HAAO	NA	NA	NA	NA	HAAO	2603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43023531	43023735	43023679	Y	NA	HAAO	NA	NA	NA	NA	HAAO	5798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	134093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	185797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	43672480	43672679	43672609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHH2	189733	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	44362673	44362844	44362743	Y	NA	PPM1B	PPM1B,SLC3A1	IMR90	Hi-C	24141950	PPM1B	30264	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	44398343	44398537	44398440	Y	NA	PPM1B	NA	NA	NA	NA	PPM1B	5235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	44944979	44944991	44944986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	219347	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	45030101	45030473	45030141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	133865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	45160125	45160245	45160184	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	4093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	45164223	45164580	45164499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	45870946	45871356	45871039	Y	NA	SRBD1,PRKCE	PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCE	5128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	46578990	46579175	46579103	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	60184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	46593968	46594050	46594011	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	75162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	46662046	46662321	46662184	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,LOC388946,ATP6V1E2,RHOQ,PIGF,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	RHOQ	104624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	46689045	46689341	46689164	Y	TTC7A,MCFD2,RHOQ	NA	EPAS1,PRKCE,PIGF,CRIPT,ATP6V1E2,RHOQ,LOC388946,SOCS5,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOQ	77604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	46931823	46932125	46932006	Y	NA	SOCS5	NA	NA	NA	NA	SOCS5	7732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	47027530	47027861	47027840	Y	NA	NA	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS5	103439	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	47171092	47171539	47171232	Y	TTC7A,MCFD2	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	4098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	47284732	47284905	47284823	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	116835	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr2	47297632	47297822	47297725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	103918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	47299215	47299677	47299496	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	47790557	47790758	47790693	Y	KCNK12	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	5320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	47926766	47926950	47926857	Y	NA	AC079250.1,MSH6	KCNK12	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	6097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	50468354	50468602	50468556	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1713832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	53162553	53162576	53162564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	830353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54682152	54682577	54682442	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	730	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr2	54714209	54714329	54714214	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	32787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	54971761	54972012	54971777	Y	NA	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	23125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.76952332999632
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	55360803	55361407	55361172	Y	SMEK2,CCDC88A,RTN4	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	23046	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	56112478	56112793	56112711	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	36481	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	56298220	56298424	56298323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC85A	110834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC85A	64019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	57657043	57657316	57657246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	475470	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	58105448	58105884	58105678	Y	NA	VRK2	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	VRK2	26902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	58726353	58726421	58726382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	73419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	58767946	58768124	58768017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	115012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60133192	60133207	60133200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	476533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	60661623	60661756	60661690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	51883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	67204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60747849	60747913	60747881	Y	PEX13,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	30789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60760023	60760353	60760231	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	18349	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	60778604	60778787	60778696	Y	REL,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	60784320	60784652	60784428	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	5618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	63601034	63601048	63601041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	212695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	63840549	63840673	63840604	Y	NA	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	26806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	63840978	63841207	63841026	Y	NA	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	27235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64342969	64343339	64343172	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	25034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64360908	64361228	64361132	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	7145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64368431	64369198	64368837	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	58	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64439546	64439941	64439735	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	69958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64500610	64500974	64500772	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	131022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	91703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64844748	64845048	64844870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	95283	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	66387873	66388127	66388063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	270457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	66673073	66673647	66673570	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	14471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	143297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr2	67898821	67899162	67898930	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	276370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	69025646	69026018	69025855	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	212292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr2	70000495	70000634	70000556	Y	MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	54140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70160460	70161117	70160745	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	PCBP1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ASPRV1	26280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70174757	70175015	70174885	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	12382	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70226911	70227071	70226991	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	70331843	70331986	70331900	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	4160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr2	70737372	70737558	70737528	Y	FIGLA,CD207	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	41767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	71679813	71679928	71679869	Y	NAGK,ZNF638,DYSF	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF638	178122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	72012191	72012365	72012276	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF638	510500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	72713565	72713630	72713598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	337540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	74258403	74258434	74258418	Y	NA	AC073046.25,TET3	DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	30563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74408934	74409182	74409080	Y	NAT8B,TET3,MOBKL1B	BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MOB1A	4909	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74616605	74616668	74616637	Y	NA	DCTN1,C2orf81,WDR54	NA	NA	NA	NA	DCTN1	546	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,TLX2,DQX1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	8242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74766124	74766334	74766228	Y	NA	LBX2,PCGF1,TLX2,DQX1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	7819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	39739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	28489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	75775367	75775568	75775468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	96341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	75779311	75779317	75779314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	92592	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	76357037	76357141	76357089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFC2	420922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	77317962	77318191	77318070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	695317	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	78033031	78033054	78033043	Y	NA	AC105399.2	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	19523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	78055629	78055831	78055731	Y	NA	AC105399.2	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	42121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	78683398	78683574	78683486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	79561735	79561976	79561903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA2	151378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	81107061	81107275	81107187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	718800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1393267	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	82234121	82234430	82234356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1845860	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	83058262	83058376	83058322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	1626793	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	83744068	83744130	83744079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	941039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr2	84299529	84299779	84299675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	385390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85185071	85185576	85185382	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	10640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85362106	85362578	85362371	Y	NA	LSM3P3,TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	3573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	85442728	85442944	85442894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	84195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85567649	85568034	85567918	Y	NA	TGOLN2,ELMOD3,RETSAT	TGOLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELMOD3	11483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	85932755	85933081	85932924	Y	SH2D6	RNU1-38P	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	20379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	86299445	86299644	86299569	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	31634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	SNORD94,IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	SNORD94	27224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	86562971	86563338	86563025	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	REEP1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	88803075	88803473	88803273	Y	FOXI3,C2orf51	AC104134.2	C2orf51	IMR90	Hi-C	24141950	AC104134.2	32765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2758114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2872873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2891225	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	95972113	95972447	95972295	Y	KCNIP3	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	94022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	96911483	96911666	96911570	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1	NA	NA	NA	NA	TMEM127	18066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97175211	97175545	97175411	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	24935	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97428705	97428844	97428785	Y	NA	LMAN2L,CNNM4	NA	NA	NA	NA	CNNM4	4066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97540190	97540589	97540281	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	5696	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97547885	97548242	97548064	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	13391	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	97557375	97557484	97557475	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	22881	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	98628885	98629540	98629356	Y	TMEM131	TMEM131	TMEM131,VWA3B,ZAP70	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM131	18497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	98750707	98751016	98750841	Y	TMEM131	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	140319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	99723014	99723348	99723222	Y	TSGA10	C2orf15,LIPT1,TSGA10	NA	NA	NA	NA	C2orf15	32600	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	100323852	100324185	100324151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	219355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	401505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	100685193	100685529	100685389	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	346589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	SNORD89	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	102332970	102333042	102333006	Y	MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	21658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	181539	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	103104673	103104833	103104753	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	129333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	105461382	105461873	105461636	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	5768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	105489803	105490153	105490078	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	22162	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	105505799	105505908	105505854	Y	NA	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	38158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	106412674	106413002	106412675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	53320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	106551669	106551989	106551685	Y	NCK2	NA	C2orf40	IMR90	Hi-C	24141950	NCK2	192315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	106809174	106809856	106809272	Y	UXS1	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	105284	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	109686360	109686496	109686432	Y	NA	NA	MALL,SEPT10,SH3RF3,EDAR	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC138	285147	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	458145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	109864376	109864774	109864388	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	463163	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	110402204	110402551	110402400	Y	NA	SEPT10,SOWAHC	SEPT10,SOWAHC	IMR90	Hi-C	24141950	SOWAHC	32293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	111446206	111446411	111446291	Y	NA	BUB1,ACOXL	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	BUB1	12515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	111446465	111446692	111446609	Y	NPHP1	BUB1,ACOXL	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	BUB1	12774	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	111606246	111606509	111606357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOXL	118096	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	111817819	111818113	111817910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	56842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	111874507	111874890	111874668	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	65	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112376562	112376898	112376751	Y	BCL2L11	NA	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	263369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	112420062	112420336	112420200	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	219931	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112462014	112462125	112462055	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	178142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	112789561	112789661	112789622	Y	MERTK	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	21139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	113392052	113392142	113392097	Y	IL37,IL1A	AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	9292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	113568769	113568943	113568854	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A	NA	NA	NA	NA	IL1A	28602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	113869431	113870096	113869786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	97003	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	114831268	114831607	114831438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	185731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	115524775	115524984	115524851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	326899	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	19353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	116469497	116469517	116469506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	552577	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	118984054	118984207	118984149	Y	NA	AC093901.1	EN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC093901.1	42092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr2	119076927	119077186	119077054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	134965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	119145172	119145468	119145321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	203210	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	119661238	119661644	119661313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EN1	57984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	121299175	121299329	121299252	Y	NA	NA	RALB,GLI2,INHBB,LOC84931	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLI2	191870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	121334562	121334634	121334591	Y	NA	NA	LOC84931	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	156565	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	121495919	121496279	121496111	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4720	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	121556170	121556432	121556293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	64971	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	121581288	121581630	121581332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	90089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC013399.3	67020	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	122536391	122536587	122536559	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	43712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	122660785	122660843	122660814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	168106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	122905373	122905708	122905509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	412694	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	122994452	122994784	122994618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	501773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	123419039	123419339	123419226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	926360	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC3	73929	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128165400	128165641	128165534	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	21359	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr2	128651321	128651407	128651347	Y	PROC,LIMS2,AMMECR1L	POLR2D	SAP130	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2D	37590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	129252189	129252574	129252389	Y	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	178038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	130500448	130500646	130500548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	195144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	131112712	131112965	131112906	Y	NA	IMP4,CCDC115,PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	1132	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	363500	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	262083	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	131745045	131745246	131745147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	103787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.55631257515523
chr2	133111183	133111270	133111216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	60877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	136973752	136974110	136973839	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	100017	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	129862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	137063280	137063468	137063377	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	189545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	137084668	137085432	137085239	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	210933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	138127012	138127161	138127087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNMT	592429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	140977991	140978216	140978106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	1720620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	142426940	142427341	142427318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	2660794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	143580379	143580549	143580472	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1507586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	144020720	144020920	144020801	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1067215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	144141667	144141860	144141721	Y	ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	946275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	144769205	144769351	144769311	Y	GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	318784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145418039	145419056	145418771	Y	GTDC1,ZEB2	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	137892	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145420866	145421073	145420998	Y	ZEB2	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	140719	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145444229	145444926	145444607	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	164082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145795788	145796304	145796070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	296494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145821367	145821376	145821372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	271422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145942500	145942836	145942668	Y	NA	NA	ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	149962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	145998951	145999148	145999049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	93650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	148089200	148089222	148089211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	476693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	148366263	148366285	148366274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	199630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	149371983	149372154	149372046	Y	EPC2	EPC2	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	EPC2	27855	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	149372340	149372450	149372396	Y	EPC2	EPC2	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	EPC2	27559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	149571188	149571523	149571357	Y	NA	NA	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	KIF5C	59296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	149645940	149646152	149646140	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	15121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	150971624	150972028	150971707	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	421497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	152742904	152743255	152743079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	59898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	153311931	153312064	153312029	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	122180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	154333342	154333495	154333419	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	20	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	1410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	154448468	154448804	154448636	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	GALNT13	NA	NA	NA	NA	GALNT13	2647	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	158102968	158103210	158103130	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1C	380307	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	365412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	158118717	158119062	158118890	Y	GALNT5	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	364455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	160226895	160226913	160226904	Y	BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	85585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	161077067	161077509	161077240	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	48890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	161173742	161174088	161173899	Y	NA	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	47343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	163695900	163696326	163696258	Y	NA	KCNH7	NA	NA	NA	NA	KCNH7	2660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	384734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	165327196	165327565	165327381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	148793	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	165371083	165371396	165371192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	104962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	165924693	165924835	165924764	Y	SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	226504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3,AC009495.2	NA	NA	NA	NA	AC009495.2	21885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	115478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	169434382	169434732	169434541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	124010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	170218108	170218468	170218381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS5	115220	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	170221024	170221462	170221353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS5	112226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	170777121	170777463	170777246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	95153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	171069063	171069605	171069336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	387095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	171222273	171222592	171222467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP5	347269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	171362276	171362354	171362315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP5	207507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	171623254	171623407	171623331	Y	NA	EIF2S2P4,AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	AC007405.4	1869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	171679560	171679730	171679653	Y	NA	GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	11837	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	172693152	172693396	172693274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAT1	83562	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	173111540	173111762	173111691	Y	ITGA6	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	145912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	173452376	173452526	173452455	Y	NA	PDK1,AC093818.1	NA	NA	NA	NA	AC093818.1	33052	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	173638341	173638732	173638537	Y	NA	RAPGEF4	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	40339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	174129335	174129853	174129516	Y	ZAK	MLK7-AS1	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	14911	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	174518967	174519016	174518991	Y	NA	NA	OLA1,CIR1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7	301419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	174888201	174889400	174889077	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	59771	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	174889919	174890381	174890067	Y	NA	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	61489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	174896632	174897390	174896767	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1,CDCA7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	68202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD13,HOXD12,HOXD11,HOXD9,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4	NA	NA	NA	NA	HOXD11	2917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4,AC009336.24,HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	HOXD1	3990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	178176683	178176989	178176836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3128	57945	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,AC074286.1,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	179132542	179132630	179132587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL6	75334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	179896524	179896909	179896662	Y	CCDC141	CCDC141	NA	NA	NA	NA	CCDC141	15904	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	180127574	180128171	180127755	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	57	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	180579667	180579746	180579673	Y	ZNF385B,ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	290094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	180625658	180625928	180625899	Y	ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	243912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	182284297	182284552	182284389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E3	454322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	182675600	182675877	182675735	Y	SSFA2	NA	SSFA2	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	78683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	182956199	182956480	182956369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1C	139231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	183626884	183626903	183626894	Y	NA	DNAJC10	NA	NA	NA	NA	DNAJC10	47885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	186616540	186616923	186616825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	731960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	187754125	187754379	187754252	Y	NA	NA	CALCRL	IMR90	Hi-C	24141950	AC007319.1	111568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	188436185	188436320	188436253	Y	NA	TFPI	TFPI,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	7698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	188451203	188451588	188451273	Y	NA	TFPI	GULP1,TFPI	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	22716	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	188463858	188463880	188463868	Y	TFPI	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	188899561	188899722	188899605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P2	211493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	189064441	189064772	189064607	Y	NA	NA	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	GULP1	89624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	189973214	189973535	189973374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	69070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	191030826	191031069	191031046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	175127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	191244175	191244540	191244301	Y	HIBCH,INPP1,MFSD6	INPP1,HIBCH,MFSD6	NA	NA	NA	NA	MFSD6	26541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	STAT4	NA	NA	NA	NA	STAT4	29641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192030894	192031017	192030956	Y	NA	STAT4	STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STAT4	16572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192714242	192714365	192714337	Y	SDPR	SDPR	NA	NA	NA	NA	SDPR	4261	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192839658	192840009	192839864	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	129677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192882025	192882303	192882164	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	172044	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192889960	192890123	192890039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	168312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	142465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	192966910	192967316	192967133	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	91119	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	193054279	193054640	193054459	Y	NA	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	3795	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	193356347	193356635	193356490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	297912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1083948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	197264939	197265165	197265058	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	225712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	197327086	197327270	197327178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC150	175008	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	197974548	197974560	197974555	Y	ANKRD44	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	151275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	198123324	198123674	198123472	Y	SF3B1,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	2161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	198158784	198159350	198159060	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	14547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	200446933	200447042	200447037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	112944	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	200466887	200467221	200467154	Y	NA	NA	FONG	IMR90	Hi-C	24141950	SATB2	132898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	200579268	200579381	200579325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf69	194598	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	202100663	202100910	202100770	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	4497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	202888272	202888578	202888425	Y	NA	NA	FZD7,ALS2,MPP4,SUMO1,CDK15	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2P3	153442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	204373438	204373815	204373626	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	24318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	206572878	206573110	206572995	Y	NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	28164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.53904665999264
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS1	54126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	207669258	207669658	207669463	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	40987	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	207981292	207981447	207981370	Y	NA	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	48544	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	168830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	170021	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	208202390	208203219	208202610	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	172399	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	208749045	208749238	208749090	Y	NA	AC083900.1	NA	NA	NA	NA	AC083900.1	16406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	208942960	208943012	208942996	Y	NA	NA	FZD5,CCNYL1,PLEKHM3,FASTKD2,METTL21A	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHM3	54676	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	6.70045966934593
chr2	211032670	211033036	211032982	Y	NA	AC006994.2	NA	NA	NA	NA	AC006994.2	1206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	AC006994.2	370693	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	212273112	212273708	212273419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013404.1	111198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	214010561	214010823	214010756	Y	IKZF2,IKZF2	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	608996	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	651476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr2	214053816	214053901	214053846	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	ERBB4	652251	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	214054270	214054576	214054510	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	ERBB4	652705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	87864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	216522690	216522921	216522813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	126834	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	216557446	216557685	216557585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	161590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	216698635	216698894	216698754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	197925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	217035180	217035407	217035275	Y	NA	NA	PKI55	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC5	64993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	217204686	217204947	217204817	Y	MARCH4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	70190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	217400220	217400574	217400443	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	DIRC3,XRCC5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AC098820.3	38736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	217501395	217501614	217501574	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	5844	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	217934616	217935002	217934772	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	439065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	219152622	219152760	219152751	Y	USP37,SLC11A1,PNKD	AAMP,PNKD,TMBIM1	NA	NA	NA	NA	TMBIM1	2549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	219584291	219584413	219584352	Y	NA	STK36,RNF25,TTLL4	NA	NA	NA	NA	TTLL4	10723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	17960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	219862366	219862575	219862480	Y	FEV	CDK5R2,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	AC097468.4	2362	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	220138813	220139187	220138862	Y	INHA,CCDC108,ATG9A,GLB1L	ATG9A,ANKZF1,STK16,GLB1L,TUBA4A,DNAJB2,PTPRN	NA	NA	NA	NA	TUBA4A	1705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	220215460	220215932	220215582	Y	NA	PTPRN,DNPEP	STK16,GLB1L,TUBA4B,CDK5R2,LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,MIR375,LOC151300,FEV,NHEJ1,FAM134A,SLC23A3,CNPPD1,ABCB6,ZFAND2B,ATG9A,ANKZF1,TUBA4A,DNAJB2,RESP18,PTPRN,DNPEP	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRN	43090	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	220386924	220387263	220387141	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	19122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	220460061	220460205	220460133	Y	NA	OBSL1,STK11IP,SLC4A3	NA	NA	NA	NA	STK11IP	377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr2	222305020	222305156	222305087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	131766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr2	222890722	222890987	222890846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	453800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	223155643	223155970	223155818	Y	PAX3,CCDC140	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	363086	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	223776983	223777159	223777060	Y	SGPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	53331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	223987654	223987955	223987802	Y	NA	NA	MOGAT1,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL3	264002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	224332054	224332327	224332161	Y	WDFY1	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	368417	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	272312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	224591304	224591516	224591410	Y	NA	NA	AP1S3	MCF7	ChIA-PET	22265404	AP1S3	109228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	225325353	225325370	225325362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	122740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	225340678	225341017	225340847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	107093	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	225848740	225848962	225848850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	56200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	226140993	226141218	226141066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	235831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	226985613	226985988	226985800	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	676487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr2	227726085	227726127	227726089	Y	NA	RHBDD1	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	27788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	228473163	228473433	228473298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	107295	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	228522025	228522410	228522050	Y	CCL20,AGFG1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	58318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	228568825	228569005	228568935	Y	SLC19A3	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	11723	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	228576764	228576787	228576777	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	3941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	229407284	229407450	229407381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	726551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	230172024	230172330	230172167	Y	PID1	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	38023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	231227266	231227536	231227388	Y	NA	SP140L	NA	NA	NA	NA	SP140L	37367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	231649547	231649844	231649697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	61429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	AC012507.3	72869	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	232044610	232045091	232044820	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	16169	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	232106599	232106881	232106746	Y	B3GNT7	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	45339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	28137	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	232254414	232254430	232254422	Y	NA	B3GNT7	B3GNT7	K562	ChIA-PET	22265404	B3GNT7	3824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.66291795257578
chr2	232470282	232470477	232470427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	93232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.30556010354399
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.32282601870659
chr2	232532385	232532510	232532473	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr2	232546670	232546982	232546826	Y	NA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22623	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	232547138	232547293	232547212	Y	PTMA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	233279498	233279714	233279606	Y	NA	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	9945	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr2	233367792	233368150	233367876	Y	ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1	ECEL1,EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	ECEL1	17254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	233489337	233489574	233489364	Y	NA	EFHD1	NA	NA	NA	NA	EFHD1	20570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr2	233499533	233499991	233499677	Y	EFHD1	EFHD1	NA	NA	NA	NA	EFHD1	30766	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	111775	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	233927963	233928349	233928218	Y	INPP5D	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	51981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	234074569	234074943	234074824	Y	NA	ATG16L1	NA	NA	NA	NA	ATG16L1	41754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	234330770	234331121	234330825	Y	INPP5D,ATG16L1	NA	USP40	IMR90	Hi-C	24141950	DGKD	69617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	234882556	234882776	234882660	Y	TRPM8	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3P1	107466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	235214636	235215000	235214802	Y	ARL4C	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4C	188697	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	235360536	235360912	235360678	Y	NA	ARL4C	TRPM8,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	42785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	235400661	235400783	235400733	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	2914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	235748055	235748426	235748121	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	110191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr2	236514356	236514561	236514454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	113623	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	236568663	236568900	236568814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	167930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr2	237117535	237117935	237117735	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	GBX2	42523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	237512810	237512898	237512837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	437798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	350902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	237761223	237761483	237761366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	230472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	237765492	237765769	237765631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	237784498	237784842	237784604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	207113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	238188101	238188190	238188146	Y	COPS8,COL6A3	NA	COL6A3,MLPH,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	132828	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	238384383	238384688	238384583	Y	LRRFIP1	NA	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC112721.1	52464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	238512238	238512938	238512467	Y	LRRFIP1	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	RAB17	3981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	238609405	238609661	238609494	Y	MLPH,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	75186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	239108088	239108227	239108158	Y	ILKAP	FAM132B,ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	ILKAP	2143	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	NA	NA	NA	NA	NA	ASB1	445740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	177053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	240179337	240179507	240179411	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	141841	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	240190277	240190476	240190405	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	130872	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	1013	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	241719064	241719393	241719333	Y	KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	241796889	241797214	241796939	Y	GPR35,AGXT	KIF1A,C2orf54	NA	NA	NA	NA	C2orf54	37092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	202220	202381	202310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf96	67009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	709042	709425	709354	Y	NA	NA	CSNK2A1,RSPO4,SRXN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRXN1	77028	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	1333009	1333271	1333126	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	1757222	1757297	1757260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115857	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	2202667	2202961	2202765	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,TGM3	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	122410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	2802059	2802221	2802148	Y	CPXM1	CPXM1,VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	17128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	3041356	3041698	3041528	Y	NA	MRPS26,OXT	NA	NA	NA	NA	OXT	8568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3188788	3188839	3188809	Y	NA	UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	1274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3520013	3520365	3520159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	70326	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3660633	3661051	3660900	Y	CENPB,ADAM33	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM33	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	3960925	3961306	3961172	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	32923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	4018656	4019040	4018859	Y	PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	16104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	4148418	4148828	4148571	Y	NA	SMOX	NA	NA	NA	NA	SMOX	48791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	4792276	4792776	4792707	Y	SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2	RASSF2	NA	NA	NA	NA	RASSF2	9515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4810214	4810539	4810355	Y	SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2	RASSF2,SNORA31	NA	NA	NA	NA	RASSF2	7923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4906233	4906312	4906273	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA31	58603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	4931181	4931354	4931276	Y	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	57585	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	5695211	5695702	5695385	Y	C20orf196	C20orf196	GPCPD1,C20orf196	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf196	33337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	5899454	5899753	5899716	Y	NA	RNU1-55P,CHGB,TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	CHGB	9378	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	6678677	6678999	6678684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	576486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	6975107	6975482	6975156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	872916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	940219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	9065873	9065924	9065899	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	18463	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	9089602	9089856	9089687	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	42192	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	9100209	9100421	9100248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	52799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	9254416	9254452	9254434	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	207006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	9480861	9480978	9480968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK7	336711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	10197196	10197344	10197281	Y	SNAP25	SNAP25	NA	NA	NA	NA	SNAP25	134	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	10447085	10447351	10447236	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	34215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	10472654	10473100	10472965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	59784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	10501861	10501978	10501938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	88991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	12055042	12055294	12055170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	185671	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	12250218	12250236	12250226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	380847	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	12578364	12578389	12578377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	409238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	12734495	12734674	12734580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	252953	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	13311967	13312338	13312291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	111549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	13380021	13380161	13380091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	179603	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	13846581	13846836	13846730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	83049	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	17402450	17402801	17402626	Y	PCSK2,BANF2	NA	NA	NA	NA	NA	BFSP1	145064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	17519291	17519778	17519563	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	28087	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	19783112	19783320	19783290	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	46760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	68361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	20347223	20347613	20347293	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	458	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	20432950	20433312	20432989	Y	C20orf26,INSM1	NA	NA	NA	NA	NA	INSM1	86185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	20779576	20779697	20779638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	88445	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	21058164	21058497	21058329	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	NA	NA	NA	NA	LINC00237	26502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00237	1910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.69744978290097
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	23226243	23226447	23226434	Y	NAPB	NA	THBD	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	102926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	24452235	24452353	24452295	Y	TMEM90B	SYNDIG1	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	4400	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	24510047	24510433	24510242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	62212	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	24710485	24710875	24710680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	262650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	24947572	24947946	24947787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD6	226383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25047846	25048544	25048538	Y	NA	NA	ACSS1	IMR90	Hi-C	24141950	ENTPD6	125785	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25299092	25299564	25299289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	70055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25445422	25445550	25445504	Y	ACSS1,ABHD12	NA	NA	NA	NA	NA	GINS1	59059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	112354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	116327	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	29637104	29637239	29637172	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	27247	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	29650599	29650997	29650932	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30263216	30263335	30263276	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr20	30439389	30439785	30439556	Y	DEFB121,TTLL9	FOXS1,TTLL9	NA	NA	NA	NA	FOXS1	7969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30646515	30646916	30646613	Y	BCL2L1,PLAGL2,C20orf112,HCK	HCK,TM9SF4	NA	NA	NA	NA	HCK	8524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	30807220	30807332	30807276	Y	NA	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	13537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31126196	31126450	31126244	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	31126982	31127359	31127172	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	43517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31152951	31153099	31153025	Y	PLAGL2,MAPRE1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	17777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31170393	31170766	31170763	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31171182	31171312	31171248	Y	DNMT3B,C20orf203	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr20	31269107	31269491	31269215	Y	C20orf185,C20orf203	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	60312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	31339575	31339797	31339687	Y	NA	COMMD7,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMT3B	8394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33735973	33736225	33736096	Y	TRPC4AP,EDEM2	PROCR	NA	NA	NA	NA	PROCR	21651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3,MMP24	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33811435	33811561	33811498	Y	NA	MT1P3,MMP24	NA	NA	NA	NA	MMP24	896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33840961	33841098	33841051	Y	SPAG4,RBM39	MT1P3,MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	22830	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	33943108	33943431	33943270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF6	72320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	34093619	34093844	34093641	Y	NA	ERGIC3	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	33926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr20	34685769	34686042	34685906	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L1	8343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	34686333	34686697	34686525	Y	SPAG4,RBM39,PHF20	EPB41L1	SCAND1,C20orf152,EPB41L1	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L1	8907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35019888	35020140	35020089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	127630	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.76952332999632
chr20	35083291	35083376	35083331	Y	EPB41L1,DLGAP4,NDRG3,KIAA0889,KIAA0889	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	84511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr20	35305679	35305903	35305811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	66578	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35947612	35947897	35947800	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	23191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	35976644	35977028	35976788	Y	SAMHD1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	36045421	36045655	36045607	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	26281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	SLC32A1	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	SLC32A1	47639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	37351314	37351914	37351610	Y	SLC32A1	SLC32A1,ACTR5	NA	NA	NA	NA	SLC32A1	209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	37398577	37398739	37398665	Y	NA	SLC32A1,ACTR5,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	ACTR5	23492	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	37471404	37471600	37471507	Y	RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B	PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	PPP1R16B	39056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	37499452	37499626	37499537	Y	RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	53329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	37500884	37501078	37500926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	51877	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	37908580	37908938	37908759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	319638	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	38908222	38908337	38908279	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	407543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	42118767	42119112	42118938	Y	PTPRT,TOX2,SGK2,L3MBTL1	SRSF6,L3MBTL1	SGK2	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL1	15208	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	42137465	42137802	42137552	Y	NA	L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	L3MBTL1	3145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	42809563	42809791	42809669	Y	FITM2,JPH2	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	JPH2	4427	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	43214306	43214431	43214386	Y	C20orf111	NA	NA	NA	NA	NA	PKIG	55880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	43214930	43215275	43215159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIG	56504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADA	42740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	44393897	44394275	44394207	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	24301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335,SLC12A5	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF335	23299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	44632907	44633142	44632963	Y	PCIF1,CD40,ZNF335	ZNF335,SLC12A5	SLC12A5,NCOA5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A5	15214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	44739156	44739452	44739364	Y	ZNF335,CD40	NCOA5,RPL13P2	SLC12A5,CD40	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL13P2	12999	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	44935542	44935954	44935889	Y	ZNF334,SLC12A5,CDH22	NA	CDH22	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35C2	55089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	45076144	45076286	45076215	Y	NA	ELMO2	NA	NA	NA	NA	ELMO2	16440	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	45753513	45753645	45753557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	55009	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	35133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.46697311289729
chr20	46057073	46057256	46057165	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	71345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	46082300	46082410	46082355	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	46191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	46122337	46122452	46122395	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	6149	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	46429440	46429610	46429525	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	16080	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	46430567	46430747	46430684	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	17207	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	46924305	46924474	46924390	Y	NA	NA	SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SULF2	510945	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	47355645	47355720	47355673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	86700	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47372882	47372931	47372907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	69489	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47400245	47400718	47400585	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	41702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	47773105	47773432	47773269	Y	NA	STAU1	NA	NA	NA	NA	STAU1	29472	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	48040275	48040654	48040626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB1	56530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48065517	48065771	48065626	Y	NA	KCNB1	NA	NA	NA	NA	KCNB1	31413	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48313235	48313496	48313350	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	14919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	48316345	48316673	48316621	Y	NA	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	11742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48598723	48598794	48598730	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	RNF114,SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	1187	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	48663510	48663968	48663673	Y	NA	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SNAI1	65974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr20	48664895	48665291	48665189	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2V1	65205	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	48876301	48877479	48876571	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	NA	PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	70925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	146419	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	49406894	49407134	49407016	Y	NA	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	2297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	KCNG1	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCNG1	12670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	275263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	50134591	50134950	50134771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	214122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	170758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	95991	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	51699247	51699566	51699407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	524880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52127266	52127520	52127375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	96926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	52333135	52333286	52333219	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	108689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	SUMO1P1	109355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	52392953	52393088	52393021	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	SUMO1P1	97008	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	SUMO1P1	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	45204	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	7042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	5920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	SUMO1P1	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	42219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	53767730	53768068	53767902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	78575	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	55311396	55311684	55311475	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	109038	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	7.50451482966744
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	160352	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	161109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2C	177198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	55434478	55434638	55434557	Y	NA	NA	TFAP2C	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2C	232120	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	55780606	55780977	55780774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP7	58708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	55838908	55839396	55838948	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	289	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	56027077	56027304	56027131	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	34779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	57300192	57300206	57300199	Y	NA	NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	38005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	58632319	58632618	58632585	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	118967	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	58964846	58965478	58965226	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3D	451494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	59761167	59761446	59761307	Y	NA	NA	CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	64036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60011356	60011607	60011563	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	185874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr20	60095984	60096281	60096088	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	270502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr20	60758632	60758689	60758683	Y	GATA5,CABLES2	PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	41810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	C20orf166	NA	NA	NA	NA	C20orf166	46945	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	DPH3P1,TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.68018386773837
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	DPH3P1,TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	61585554	61585775	61585703	Y	SLC17A9	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3502	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr20	61639302	61639436	61639344	Y	TCFL5,DIDO1,BHLHE23	BHLHE23	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	2915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	61646020	61646413	61646169	Y	C20orf11,YTHDF1	BHLHE23	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	9633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	87658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr20	61899212	61899429	61899321	Y	NA	BIRC7,NKAIN4,ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	NKAIN4	2617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	62085174	62085706	62085468	Y	BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2	KCNQ2,EEF1A2	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	16287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr20	62113410	62113704	62113637	Y	ZNF512B,EEF1A2	KCNQ2,EEF1A2,PPDPF	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	11417	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,SRMS	NA	NA	NA	NA	SRMS	6512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	62176586	62176848	62176717	Y	NA	EEF1A2,PPDPF,SRMS	NA	NA	NA	NA	SRMS	9	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr20	62182537	62182817	62182669	Y	NA	PPDPF,SRMS	NA	NA	NA	NA	SRMS	5680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr20	62478016	62478296	62478069	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	16300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr21	10852099	10852403	10852350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE	175316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	11082328	11082591	11082458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE	54609	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	16241159	16241535	16241312	Y	NRIP1	NA	NRIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NRIP1	193786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17125389	17125620	17125425	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	25045	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr21	17153700	17154031	17153865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	53356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	17678130	17678559	17678221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	577786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17842479	17842645	17842562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	742135	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	858572	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	859056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr21	18173060	18173407	18173379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXADR	709293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	18706000	18706364	18706182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXADR	176336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	18809176	18809383	18809253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXADR	73317	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	20000884	20000961	20000923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP22	227136	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	21964766	21965142	21964954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	403491	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	23121365	23121760	23121563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	752732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1169380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	23855769	23855794	23855782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	923654	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	26831737	26831904	26831853	Y	NA	NA	MIR155HG	IMR90	Hi-C	24141950	RPL13AP7	99602	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	26882215	26882658	26882608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL39	95171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	27544040	27544194	27544117	Y	APP	APP	NA	NA	NA	NA	APP	2594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr21	27867729	27867957	27867835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	103775	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	27941974	27942311	27942142	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	178020	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	27997477	27997614	27997546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	218114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	28219280	28219541	28219411	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	28300536	28300937	28300780	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	35895	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	28796596	28796902	28796773	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	459764	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	460235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	29186148	29186441	29186404	Y	NA	NA	LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	849316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	29476694	29476903	29476871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	778790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30191610	30191885	30191792	Y	C21orf7	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	63808	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30276081	30276287	30276184	Y	C21orf7	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	20388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.1441470941907
chr21	30472474	30472512	30472479	Y	USP16,BACH1,BACH1	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	28356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30543403	30543636	30543483	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	7324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30591516	30591874	30591674	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	27124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	30617454	30617803	30617527	Y	USP16,BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	53062	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	32532795	32532952	32532925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	396606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.59084440548043
chr21	32546701	32546751	32546739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	382807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	32654582	32654950	32654771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	274608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	32926891	32927175	32926925	Y	NA	AP000251.3,TIAM1	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	2383	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	32929453	32930069	32929726	Y	TIAM1	TIAM1	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	34755296	34756154	34755534	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	IFNGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFNGR2	17048	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.2882941883814
chr21	35308653	35309105	35308775	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	22369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	35391273	35391398	35391369	Y	NA	NA	MRPS6,ATP5O,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	52126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	35402450	35402634	35402553	Y	GART,GART	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	40890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	35508184	35508396	35508291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	64314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36351037	36351195	36351156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	365596	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36511746	36511757	36511752	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,SETD4	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	526305	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RCAN1	653222	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36798542	36798764	36798653	Y	NA	NA	CLIC6,RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	576201	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	36864275	36864649	36864330	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX1	510316	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	38062761	38063015	38062888	Y	NA	SIM2	CLDN14,HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	6418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	38294804	38294853	38294850	Y	NA	AP000704.5	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	41959	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.34009193386919
chr21	39543838	39544086	39544003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	257089	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	39651448	39651595	39651593	Y	KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	364699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	39683359	39683503	39683360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	396610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	437006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	39848171	39848499	39848471	Y	ERG	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	326732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40451581	40451961	40451677	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	101816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40476284	40476629	40476514	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	77148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40484017	40484221	40484185	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	69556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	40983593	40983719	40983659	Y	LCA5L,SH3BGR,PCP4	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	845	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	41428469	41428477	41428473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCP4	191226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	41872740	41872794	41872767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCP4	635497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	43174806	43174946	43174886	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	10320	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	43181534	43181711	43181623	Y	MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3555	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	43426535	43426580	43426552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	54536	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	44087083	44087334	44087223	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	15337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44091107	44091303	44091206	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	19361	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44166357	44166444	44166401	Y	TFF2	NA	NA	NA	NA	NA	PDE9A	94611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	ERVH48-1	12229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	44379846	44380185	44379931	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	NDUFV3,PKNOX1,CBS,U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	12435	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44465598	44466060	44465736	Y	PKNOX1	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	28993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44529146	44529448	44529286	Y	U2AF1	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	U2AF1	3449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	44582937	44583304	44583126	Y	NA	NA	HSF2BP,LINC00313,U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	57240	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	44598375	44598751	44598475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	72678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	44599156	44599262	44599209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	73459	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44631329	44631684	44631488	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	105632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44727003	44727328	44727122	Y	RRP1,HSF2BP	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117680	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	117409	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	92001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	44759656	44759904	44759692	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	85104	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	84095	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr21	44796506	44796705	44796660	Y	NA	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	48303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.23348655644864
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.84159687709167
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr21	44832284	44832425	44832365	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	12583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44862613	44862764	44862681	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	17605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45018693	45018962	45018883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	58412	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45563949	45564214	45564057	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	12462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45574660	45575436	45575042	Y	NA	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	23173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45587301	45587635	45587415	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	C21orf33	K562	ChIA-PET	22265404	C21orf33	35814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	45640329	45640509	45640452	Y	TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	ICOSLG,DNMT3L	C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	ICOSLG	18340	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45662608	45662724	45662682	Y	TRAPPC10,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG,DNMT3L,AIRE	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3759	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45683777	45683905	45683814	Y	KRTAP10-6,KRTAP10-11,KRTAP12-4,KRTAP10-12,KRTAP12-2,KRTAP12-1,KRTAP10-8,DNMT3L,AIRE,AIRE	ICOSLG,DNMT3L,AIRE,PFKL	NA	NA	NA	NA	DNMT3L	3678	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr21	45914106	45914226	45914202	Y	NA	LRRC3,AP001065.15	NA	NA	NA	NA	AP001065.15	10646	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	AP001065.15	NA	NA	NA	NA	AP001065.15	40318	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr21	45968847	45969150	45969078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001065.15	65387	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	31919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	46122910	46123100	46123005	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	6395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	46124045	46124372	46124063	Y	DNMT3L,AIRE,AIRE,TSPEAR	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	5123	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr21	46127419	46127576	46127516	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	1919	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.50150494322248
chr21	46128352	46128532	46128434	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	46129789	46130121	46129955	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	46185657	46185775	46185721	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	34159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	46389792	46390113	46389960	Y	POFUT2,ITGB2	ITGB2,FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	31867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	46738832	46739011	46738964	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr21	46850245	46850628	46850488	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	27193	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	47394721	47394936	47394787	Y	NA	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4715	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr21	47395087	47395227	47395108	Y	COL6A2,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr21	47524636	47524785	47524711	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	8625	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	48319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr21	47637534	47637799	47637667	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	LSS	8939	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	17567178	17567397	17567371	Y	CECR2,IL17RA,CECR1	IL17RA,CECR6	NA	NA	NA	NA	IL17RA	3334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	17709753	17709871	17709804	Y	BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5,CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	35752	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	17715051	17715201	17715110	Y	GAB4,CECR5,CECR1	AC005300.5,CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	30422	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	17745323	17745619	17745476	Y	NA	CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	4	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	CECR2	NA	NA	NA	NA	CECR2	10563	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	17850637	17851018	17850672	Y	NA	CECR2	NA	NA	NA	NA	CECR2	11800	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	18162976	18163469	18163294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	53355	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	18919384	18919770	18919551	Y	PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	2296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	18921428	18921794	18921531	Y	MICAL3,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	272	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.51877085838508
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.21622064128605
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.87612870741686
chr22	19946096	19946477	19946360	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	18755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	19946850	19947150	19946987	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	19509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr22	21925144	21925370	21925257	Y	NA	SCARNA17,UBE2L3	NA	NA	NA	NA	UBE2L3	23408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	22861017	22861374	22861318	Y	ZNF280B	ZNF280B,ZNF280A	NA	NA	NA	NA	ZNF280B	131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23415058	23415342	23415197	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	4518	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23520668	23520822	23520745	Y	NA	RTDR1,RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23731897	23732182	23732040	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	10731	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23863249	23863551	23863355	Y	NA	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	120336	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr22	23869031	23869208	23869053	Y	NA	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	126118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	23876230	23876637	23876426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	133317	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr22	23888781	23888894	23888838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	145868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr22	23907888	23908026	23907993	Y	IGLL1	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP11	149517	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	23908349	23908676	23908605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP11	148867	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	24184973	24185254	24185128	Y	C22orf43	DERL3,SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	DERL3	5658	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	24186544	24186827	24186686	Y	DERL3	DERL3,SLC2A11,MIF	DERL3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	DERL3	7229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	24234499	24234593	24234547	Y	NA	SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	308	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	24470506	24470556	24470531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABIN1	64864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	24594084	24594331	24594185	Y	DDTL,GGT1	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	18857	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	24639681	24640084	24639778	Y	GGT1	SPECC1L,SPECC1L-ADORA2A	NA	NA	NA	NA	SPECC1L	24702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	15543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	24903018	24903252	24903052	Y	GGT1,ADORA2A	UPB1,SNRPD3	NA	NA	NA	NA	UPB1	41812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	25231608	25231984	25231796	Y	GGT1,TMEM211,PIWIL3,SGSM1	SGSM1	NA	NA	NA	NA	SGSM1	31372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr22	25349333	25349980	25349695	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	54152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	25466969	25467233	25467138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD56	171788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	25551532	25551738	25551635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	247606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	26967025	26967265	26967145	Y	TFIP11	TPST2	NA	NA	NA	NA	TPST2	23416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	27028638	27029036	27028851	Y	NA	TPST2,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	11356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr22	27038834	27039211	27039123	Y	NA	TPST2,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	1181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	27054967	27055259	27055032	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	11471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr22	27415901	27416173	27415987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-40G4P.1	134390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	27547429	27547553	27547491	Y	NA	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	265918	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	27870917	27871291	27871105	Y	NA	NA	PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	324195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	322457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	28106286	28106571	28106415	Y	NA	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	88915	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.42943139612713
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	72244	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	29132423	29132599	29132510	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	3420	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30547529	30547853	30547760	Y	LIF	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-85E5.10	73060	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30584123	30584251	30584196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIF	56589	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30620211	30620567	30620379	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	20273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	13948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31005316	31005631	31005442	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,CTA-963H5.5	NA	NA	NA	NA	PES1	4246	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31115382	31115758	31115570	Y	NA	OSBP2	NA	NA	NA	NA	OSBP2	27613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	31645719	31645849	31645807	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	39494	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	32465502	32465679	32465590	Y	SLC5A4,SLC5A1	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	32025	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	32984353	32984530	32984442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	115690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	33176423	33176673	33176603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYN3	275685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	33221390	33221677	33221534	Y	SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	SYN3	230681	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	33226594	33226824	33226709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYN3	225534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	33238776	33239102	33239072	Y	SYN3,SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	SYN3	213256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	216506	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	35238816	35239159	35238991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGXB4	412286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	35674868	35675158	35675013	Y	NA	HMGXB4,TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	18110	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	35702518	35702966	35702671	Y	APOL6,TOM1,TOM1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	9250	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	35772921	35773272	35773050	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	1082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	272624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	249530	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36310688	36310985	36310744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	111488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr22	36828742	36828858	36828800	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14,TXN2	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1119A7.14	20133	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.78678924515892
chr22	36855477	36855678	36855599	Y	NA	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	6486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	36924116	36924377	36924195	Y	NA	TXN2,FOXRED2,EIF3D	NA	NA	NA	NA	EIF3D	633	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37299850	37299981	37299916	Y	C1QTNF6	CTA-833B7.2	NA	NA	NA	NA	CTA-833B7.2	35367	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37484097	37484413	37484195	Y	IL2RB	KCTD17,TMPRSS6	NA	NA	NA	NA	TMPRSS6	19190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	RP1-151B14.6,IL2RB,C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37624836	37624960	37624904	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1,RAC2	NA	NA	NA	NA	Z82188.1	4801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr22	37731445	37731637	37731610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN2	89868	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	37948648	37948841	37948736	Y	NA	CARD10,CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	5613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	38847286	38847612	38847528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX17	54053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	39231993	39232165	39232069	Y	NA	SUN2,DNAL4,NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	NPTXR	5822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr22	39608827	39609203	39608881	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	29553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr22	39686679	39687117	39686848	Y	NA	PDGFB,RPL3	CBX7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3	27277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	39693596	39693744	39693670	Y	MGAT3	RPL3	NA	NA	NA	NA	RPL3	20650	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	39784258	39784471	39784339	Y	MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1	SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	9275	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	39854172	39854554	39854368	Y	CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3	MGAT3	NA	NA	NA	NA	MGAT3	2823	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	39954931	39955300	39955094	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	CACNA1I,ENTHD1,TNRC6B,MGAT3,GRAP2,FAM83F,LOC100130899,ADSL	IMR90	Hi-C	24141950	RPS19BP1	28071	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	40357456	40357744	40357564	Y	TNRC6B,GRAP2	FAM83F	NA	NA	NA	NA	FAM83F	31209	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	40451411	40451463	40451437	Y	NA	TNRC6B,RPL7P52	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	12590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	40573139	40573276	40573210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	72069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37,MCHR1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	41079087	41079368	41079234	Y	MCHR1	MKL1,GAPDHP37,MCHR1	NA	NA	NA	NA	MCHR1	6333	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	41080878	41081122	41080979	Y	NA	GAPDHP37,MCHR1	NA	NA	NA	NA	MCHR1	8124	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	MCHR1	56097	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	41416837	41417114	41416960	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	40942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	42696005	42696062	42696030	Y	SEPT3,NFAM1	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	67180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	42696920	42697075	42696965	Y	NA	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	66167	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr22	42772096	42772265	42772163	Y	ARFGAP3,NAGA,NFAM1	Z83851.1	NA	NA	NA	NA	Z83851.1	8854	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	42835802	42836124	42835869	Y	POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1	CTA-126B4.7	MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-126B4.7	3773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	42944911	42945251	42945081	Y	NA	RRP7A,SERHL2,RRP7B	NA	NA	NA	NA	SERHL2	2372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	43084467	43084751	43084635	Y	TSPO,MCAT,CYB5R3,A4GALT	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	30553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	43387243	43387305	43387274	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	21846	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	43809202	43809620	43809410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	228063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	SULT4A1	NA	NA	NA	NA	SULT4A1	37529	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	45525658	45525880	45525792	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	31782	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	45879926	45880282	45880095	Y	NA	FBLN1	FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	FBLN1	15836	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	45899980	45900171	45900075	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	3862	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	46159997	46160538	46160082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	94319	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT7B	52196	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	47173530	47173804	47173706	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	17012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	47498045	47498267	47498202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	341527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	47498614	47499010	47498804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	342096	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	48883958	48884244	48884181	Y	FAM19A5	FAM19A5	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	48959888	48960020	48959956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	76616	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	49001738	49001947	49001827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	118466	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	49190154	49190286	49190220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	306882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	49548057	49548240	49548148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	500950	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr22	49843892	49843993	49843957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	205197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	51051274	51051666	51051314	Y	NA	CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	12941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	51080489	51080596	51080545	Y	NA	MAPK8IP2,CHKB,ARSA,SHANK3	SHANK3,LOC100144603,CHKB-CPT1B,ARSA,NCAPH2,LMF2,PPP6R2,SBF1	IMR90	Hi-C	24141950	ARSA	15882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr22	51110202	51110387	51110248	Y	MAPK11,FAM116B,MAPK8IP2,SHANK3	ARSA,SHANK3	SHANK3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SHANK3	456	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	4949670	4949798	4949744	Y	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	69003	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	5035978	5036317	5036132	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5077846	5078259	5077971	Y	BHLHE40	NA	ITPR1,EGOT	IMR90	Hi-C	24141950	BHLHE40-AS1	58200	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	5705387	5705605	5705472	Y	EDEM1	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	478056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM7	235649	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	7015968	7016152	7016014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM7	206280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	8783302	8783537	8783436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	219920	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	9006142	9006408	9006272	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	2685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	9904404	9904624	9904511	Y	OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE	NA	NA	NA	NA	CIDEC	15314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	10202652	10202802	10202719	Y	TATDN2,VHL,IRAK2	BRK1,VHL	NA	NA	NA	NA	VHL	21960	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	10229832	10229943	10229888	Y	NA	VHL	NA	NA	NA	NA	VHL	49140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	11320526	11320900	11320739	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	8531	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	11581408	11581480	11581447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	178740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	12567743	12567843	12567793	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	28670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	12584271	12584371	12584321	Y	NA	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	12142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	4.91367042418702
chr3	13045680	13046084	13045881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	66533	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	13152253	13152557	13152379	Y	NUP210,IQSEC1	IQSEC1	LOC285375,NUP210,HDAC11	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	39636	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	13932354	13932493	13932424	Y	NA	WNT7A,TPRXL	C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7A	12736	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A,TPRXL	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr3	14444961	14445761	14445267	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	2885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	14495430	14495824	14495495	Y	NR2C2,C3orf19,XPC,SLC6A6	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	53354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	15344031	15344281	15344245	Y	NR2C2,ZFYVE20,CAPN7,EAF1,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	36594	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	15847096	15847637	15847448	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	205758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	16106573	16106816	16106695	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	197663	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	16219854	16220197	16220075	Y	GALNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPH3	84282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	16280641	16280873	16280792	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	DPH3	23606	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	16550067	16550455	16550405	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3078	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	780292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	18022713	18023080	18023018	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	461229	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr3	18766351	18766415	18766381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	188186	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	20098670	20099049	20098920	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	19155	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	20329736	20330068	20329903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL1	103952	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr3	21654380	21654503	21654471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	72072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	21755607	21755966	21755787	Y	ZNF385D	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	173299	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	23752138	23752437	23752199	Y	NA	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	92957	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	23782023	23782329	23782145	Y	NR1D2,UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	63065	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	23787915	23788432	23788117	Y	UBE2E1	NA	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	56962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	24563741	24564038	24564033	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	28968	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	26758769	26758926	26758778	Y	LRRC3B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	764985	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	27396607	27396872	27396740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	127039	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	27575366	27575733	27575573	Y	NA	NA	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	51455	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	27707886	27708022	27707939	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	54184	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	27756583	27756832	27756794	Y	EOMES	EOMES	NA	NA	NA	NA	EOMES	5374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	28083836	28084064	28083984	Y	EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	197011	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	1107586	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	30383908	30384096	30384004	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	261898	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	30586274	30586622	30586478	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	59372	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	ZNF860	NA	NA	NA	NA	ZNF860	18462	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32506024	32506133	32506068	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	36767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	32836613	32836654	32836634	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	11475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.75225741483372
chr3	32863625	32863886	32863704	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	6115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	33002804	33002999	33002866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	70356	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	33190938	33191178	33190994	Y	NA	CRTAP	NA	NA	NA	NA	CRTAP	37467	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	36536348	36536512	36536414	Y	MLH1,MLH1,EPM2AIP1	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	116512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	226617	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	37240480	37240740	37240610	Y	NA	LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1	LRRFIP2,MLH1,GOLGA4	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	17300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	PLCD1	NA	NA	NA	NA	PLCD1	3632	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	38144034	38144304	38144167	Y	VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88	ACAA1,MYD88	NA	NA	NA	NA	ACAA1	32429	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	39372633	39372790	39372689	Y	MOBP,CCR8	CCR8	NA	NA	NA	NA	CCR8	3436	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	CCR8,SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	39446360	39446713	39446516	Y	NA	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	RPSA	180	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr3	39547353	39547744	39547364	Y	NA	MOBP	NA	NA	NA	NA	MOBP	40664	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	41043965	41044133	41044050	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	190195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	42078040	42078206	42078049	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	24746	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	42103073	42103570	42103397	Y	NA	TRAK1	ZNF621,ZNF620,TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	49779	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	42122071	42122336	42122239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	68777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.05480763193275
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	97126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	44038399	44038801	44038781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR138-1	114903	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	112870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	5.18168881096085
chr3	44042164	44042329	44042275	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	111375	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	44073188	44073424	44073310	Y	NA	NA	FAM198A,ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	80280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	46177032	46177307	46177205	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	141716	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46341741	46342039	46341904	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR2	NA	SLC6A20,CCR9,CCR3,CCR5,LOC100132146,FYCO1	IMR90	Hi-C	24141950	RTP3	194942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46410817	46410992	46410849	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	RTP3	125989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46440905	46441384	46441314	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	CCR1,CCR2,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	RTP3	95597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46458266	46458446	46458353	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	RTP3	78535	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	46587372	46587917	46587474	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	26128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	13826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr3	46606309	46606464	46606411	Y	PRSS50,PRSS46,LRRC2	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	7581	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46616855	46617260	46617039	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	2329	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	46617968	46618021	46617995	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	1568	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	46671101	46671453	46671216	Y	CCDC12,PRSS45	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	51512	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	46927126	46927341	46927234	Y	NA	PTH1R	NA	NA	NA	NA	PTH1R	9890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	47078393	47078462	47078449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	56893	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	47466111	47466297	47466204	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	45610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	47520842	47520999	47520921	Y	NA	SCAP	NA	NA	NA	NA	SCAP	4226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.60811032064302
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	49171125	49171202	49171164	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71	NA	NA	NA	NA	LAMB2	2574	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	AMT,NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	50411624	50411893	50411737	Y	NA	TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	TMEM115	16583	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	50488140	50488331	50488249	Y	RBM5,GNAI2,RASSF1,RASSF1,MAPKAPK3,CACNA2D2	NA	CYB561D2,TMEM115,NPRL2	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA2D2	51344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH,MIR4787,DOCK3	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	50980831	50981015	50980923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK3	270159	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.16141300935329
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	TLR9,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	52299133	52299501	52299437	Y	NA	TLR9,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	GLYCTK	19604	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	54675181	54675533	54675345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	520607	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	54725134	54725214	54725174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	570560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	54851764	54851786	54851775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	697190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	54856337	54856720	54856396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	701763	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	54990078	54990247	54990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	835504	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	55203569	55203824	55203706	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA2D3	1048995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	55601569	55601909	55601898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	898482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	56818012	56818198	56818042	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	102747	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57051619	57051945	57051783	Y	NA	SPATA12	NA	NA	NA	NA	SPATA12	40524	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57096152	57096374	57096203	Y	ASB14	SPATA12,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	SPATA12	3683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr3	57164609	57165207	57164899	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	RP11-157F20.1	963	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	57194526	57194869	57194698	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	IL17RD	7465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	57964155	57964263	57964209	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	27864	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57968397	57968639	57968468	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	23488	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	58202964	58203031	58202998	Y	KCTD6,DNASE1L3,PXK	ABHD6	DNASE1L3,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD6	18202	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	58570984	58571306	58571233	Y	PXK,FAM107A	FAM107A	NA	NA	NA	NA	FAM107A	40031	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	59316034	59316229	59316222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	282224	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	59372016	59372292	59372137	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	338206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	60131975	60132178	60132077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1098165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	60994842	60995056	60994945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	240077	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	61414830	61414900	61414885	Y	NA	NA	PTPRG	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRG	130343	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	61548977	61549431	61549203	Y	NA	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	3734	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	62364078	62364515	62364449	Y	NA	PTPRG-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	11073	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	62427415	62427809	62427798	Y	FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	74410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	62802316	62802326	62802325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	56728	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	LINC00698	NA	NA	NA	NA	LINC00698	7312	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	64674446	64674694	64674571	Y	ADAMTS9	ADAMTS9-AS2,ADAMTS9	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	2770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	65045774	65045784	65045779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	374098	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.25075247161124
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	66549724	66550124	66549864	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	37	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	69262443	69262764	69262745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	130348	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	69337600	69337654	69337627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	205505	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	69380103	69380434	69380250	Y	MITF,FRMD4B	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4B	209300	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	69698353	69698679	69698548	Y	NA	NA	MITF	IMR90	Hi-C	24141950	MITF	87907	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	71829095	71829466	71829305	Y	FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2	GPR27,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	EIF4E3	27171	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	72545339	72545749	72545633	Y	NA	NA	LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	51270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	73022372	73022552	73022446	Y	PPP4R2,EBLN2	FTH1P23,PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	21384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	73812106	73812354	73812245	Y	NA	NA	PDZRN3,GXYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	PDZRN3	140015	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	75472638	75472968	75472803	Y	NA	FAM86DP	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	9293	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	75765975	75766371	75766287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-413E6.1	93671	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	76160921	76161072	76160934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO2	207075	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	76778043	76778075	76778059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	296874	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	79667523	79667843	79667648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	147122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	80630991	80631014	80631005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	816026	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	11.0780933199853
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	81766105	81766391	81766248	Y	NA	GBE1	NA	NA	NA	NA	GBE1	42921	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	85580627	85580764	85580696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	574495	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	87022678	87022843	87022761	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	15426	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	90003600	90003859	90003730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA3	848926	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	90132744	90133405	90132853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA3	978070	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	98044011	98044208	98044126	Y	NA	NA	GABRR3	IMR90	Hi-C	24141950	CLDND1	195702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	98257458	98257775	98257645	Y	OR5K4,ST3GAL6,CPOX,GPR15	CLDND1	NA	NA	NA	NA	CLDND1	17548	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	99248067	99248436	99248240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	106883	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223831	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	228974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	101424395	101424716	101424556	Y	NA	ZBTB11,RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	16053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	101547647	101547882	101547766	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	2812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	103188921	103189148	103189133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	312117	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	103861090	103861239	103861165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	984286	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	106276246	106276374	106276310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	681165	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	107942977	107943064	107943017	Y	HHLA2,CD47	IFT57	NA	NA	NA	NA	IFT57	3560	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	109074614	109074989	109074804	Y	NA	DPPA2,DPPA4	NA	NA	NA	NA	DPPA4	20195	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	109075200	109075484	109075317	Y	NA	DPPA2,DPPA4	NA	NA	NA	NA	DPPA4	20781	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112076880	112077055	112076913	Y	BTLA	CD200,RP11-231E6.1	NA	NA	NA	NA	CD200	27686	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112143988	112144379	112144150	Y	NA	RP11-231E6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-231E6.1	18007	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112486003	112486364	112486061	Y	ATG3	NA	CD200R1L,CD200R1,GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	119626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	112531892	112532184	112532038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC80	165515	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112652910	112653110	112653010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	54655	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	112966345	112966604	112966475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf17	229637	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	152852	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115137571	115137675	115137649	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	202496	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	218257	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115717910	115718046	115717986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	377739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	436190	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	115863058	115863426	115863241	Y	LSAMP	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	522887	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	116697369	116697471	116697420	Y	NA	PTMAP8	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	46074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	116967153	116967360	116967255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	223608	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	120819033	120819273	120819055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	194114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	HCLS1	NA	NA	NA	NA	HCLS1	3226	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	121450275	121450346	121450335	Y	NA	GOLGB1	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	16256	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121664489	121664635	121664539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	74416	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121731708	121731977	121731832	Y	CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	7074	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121778262	121778510	121778467	Y	EAF2,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	39211	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121791947	121792054	121791993	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	52896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	121964741	121964940	121964825	Y	CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,DTX3L,CSTA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	77151	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	122151096	122151154	122151125	Y	KPNA1	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18214	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	122486684	122487080	122486948	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	23591	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	123355394	123355731	123355464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53005	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	123356199	123356268	123356234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	123358215	123358608	123358268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	55826	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	123469666	123469916	123469803	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	167277	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	124221645	124221997	124221821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	225216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A3	108923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	2626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.714715698063566
chr3	125987620	125987662	125987641	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	3981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126108107	126108472	126108304	Y	NA	KLF15	KLF15,CCDC37,ALDH1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	33822	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126423873	126424195	126424114	Y	NA	CHCHD6	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	2810	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126680194	126680270	126680232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	259131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	126700801	126701293	126700904	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	279738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	127018107	127018461	127018341	Y	TPRA1,TPRA1	NA	CHST13	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	296605	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	127266508	127266786	127266647	Y	KBTBD12	MCM2,TPRA1	CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	48280	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	127416375	127416550	127416435	Y	NA	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	26597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	3.39489956580194
chr3	127472997	127473428	127473061	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	66623	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	127539467	127539812	127539513	Y	MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	127544672	127545057	127544806	Y	NA	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	4621	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	128152586	128152939	128152776	Y	NA	NA	EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPN1	244979	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	128153952	128154067	128154030	Y	GATA2	NA	EEFSEC,C3orf27,GATA2,LOC90246,DNAJB8-AS1,DNAJB8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPN1	243851	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	NA	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPN1	180995	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	129167159	129167354	129167260	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	10191	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	129313710	129313984	129313815	Y	H1FOO	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	9677	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	129315034	129315445	129315335	Y	COPG,PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	8216	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	129343419	129343754	129343587	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	19758	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	129344975	129345039	129344984	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	21314	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.804055160321512
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	7509	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	132671278	132671513	132671409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM108	83722	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	132787514	132787599	132787560	Y	CCRL1,UBA5,TMEM108	TMEM108	NA	NA	NA	NA	TMEM108	32279	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	142880	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	133686653	133686998	133686826	Y	SLCO2A1,C3orf36	NA	NA	NA	NA	NA	RAB6B	73973	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134087826	134088207	134088017	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	4114	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	134206320	134206511	134206427	Y	CEP63,CEP63,CEP63	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	2762	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	135488806	135488993	135488900	Y	NA	NA	KY,EPHB1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R3A	193522	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	138510806	138511198	138511002	Y	NA	PIK3CB	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	40582	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	138594717	138594956	138594896	Y	NA	PIK3CB	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	42937	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	140800268	140800553	140800397	Y	NA	SPSB4	NA	NA	NA	NA	SPSB4	32024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	140919701	140920097	140919901	Y	NA	ACPL2	NA	NA	NA	NA	ACPL2	25471	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141047061	141047339	141047200	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	6006	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141746457	141746834	141746789	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	14206	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141758636	141758867	141758743	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2173	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	141833838	141834123	141833981	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	32263	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	20024	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	142844486	142844557	142844519	Y	NA	CHST2,PBX2P1	NA	NA	NA	NA	CHST2	8313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	142844875	142844897	142844886	Y	PAQR9,CHST2	CHST2,PBX2P1	NA	NA	NA	NA	CHST2	8702	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.62537623580562
chr3	143026592	143026945	143026781	Y	CHST2	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	133465	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	144134299	144134312	144134306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	445659	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	149297469	149297617	149297606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	87022	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.446697311289729
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149824540	149825048	149824918	Y	NA	NA	RNF13,PFN2,LOC646903,TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	PFN2	57965	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	149901549	149901792	149901671	Y	NA	NA	PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFN2	134974	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	151065337	151065743	151065553	Y	CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	32597	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	151582597	151582803	151582700	Y	NA	NA	MED12L	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	376814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	161259	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	153007263	153007499	153007331	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	129234	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	153332507	153332644	153332576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2B	454478	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	153358840	153358996	153358919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF26	477796	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	155442955	155443143	155443049	Y	NA	PLCH1	C3orf33	IMR90	Hi-C	24141950	PLCH1	17713	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	156782227	156782502	156782370	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-6F2.5	15128	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	157019065	157019219	157019119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550I24.2	128053	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	158491929	158492257	158492161	Y	NA	MFSD1	RARRES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFSD1	43942	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	158846510	158846720	158846529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD1	398523	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	75109	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16377	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16853	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	164789607	164789821	164789770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	2307313	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1880791	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	165217698	165218028	165217864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1879106	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	167737805	167738014	167737910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	73749	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	170975109	170975430	170975328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	200767	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171093920	171094155	171093992	Y	PLD1	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	82042	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	171495458	171495728	171495684	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	31012	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171542633	171542898	171542814	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	15893	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171825348	171825521	171825406	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	69930	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	171927297	171927567	171927433	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	171879	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	56626	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	172229975	172230511	172230380	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	87096	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	173790508	173790769	173790639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	302265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	174257765	174258124	174258055	Y	NA	NA	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	103402	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	175245221	175245455	175245299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	79812	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	176276751	176276920	176276836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	636341	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	176504226	176504517	176504371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	408744	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.893394622579458
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.982734084837403
chr3	177079124	177079508	177079413	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	165863	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	177303534	177303876	177303705	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	390273	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	808122	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	178752797	178753279	178753036	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	34788	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	178755149	178755598	178755383	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	32469	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	179049621	179049719	179049674	Y	NA	ZNF639,MFN1	NA	NA	NA	NA	ZNF639	10842	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	179684304	179684515	179684308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	315761	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	8912	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	181437056	181437346	181437302	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	9342	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	181438058	181438556	181438099	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	10344	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	2.85886279225426
chr3	181445730	181446151	181445947	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	18016	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	181674999	181675167	181675083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	247285	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	182264358	182264360	182264359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	244928	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	9076	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11885	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	183252064	183252271	183252179	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	99085	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	184655907	184656134	184656021	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	127976	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	185482318	185482647	185482554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	58197	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	185533882	185534105	185533994	Y	NA	IGF2BP2	SENP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2BP2	6739	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	186606472	186606663	186606569	Y	ST6GAL1,RTP4	RPS20P14,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	RPS20P14	9324	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	1.07207354709535
chr3	186715660	186715959	186715816	Y	RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	69386	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	186733684	186733815	186733810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	87410	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	186745346	186745889	186745388	Y	TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99072	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	186784569	186784773	186784671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	111923	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	186892076	186892095	186892086	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	4601	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	186901070	186901277	186901226	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	4374	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	186903601	186903921	186903764	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	6905	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187004502	187004623	187004526	Y	MASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	107806	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187322064	187322194	187322129	Y	NA	NA	RPL39L,MASP1,RTP4	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	139321	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187464496	187464942	187464863	Y	NA	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2981	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.536036773547675
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	187948643	187949049	187948891	Y	LPP,LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	78798	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	188312026	188312153	188312088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	442181	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	189134489	189134632	189134561	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	212573	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	189240469	189240487	189240479	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	106718	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	189284341	189284455	189284398	Y	NA	NA	TPRG1,TP63	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TP63	62750	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	189524070	189524362	189524216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	176865	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	189627444	189627802	189627598	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	210424	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	190414781	190414901	190414841	Y	CLDN1	NA	LEPREL1,IL1RAP	IMR90	Hi-C	24141950	IL1RAP	184941	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	191160044	191160233	191160139	Y	PYDC2	NA	FGF12	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC50	115178	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	191873125	191873377	191873252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	610176	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	194058	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.268018386773837
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.357357849031783
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	136567	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	194341751	194341921	194341813	Y	NA	TMEM44-AS1,TMEM44,LSG1	NA	NA	NA	NA	TMEM44	10497	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	LSG1	170660	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	194754255	194754281	194754268	Y	NA	NA	XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2	IMR90	Hi-C	24141950	XXYLT1	235615	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.178678924515892
chr3	194821602	194822296	194821841	Y	PPP1R2,ACAP2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	167600	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	194824432	194824598	194824501	Y	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	165298	CAGE	NEC15	hg19	FANTOM5	0.0893394622579458
chr3	194826238	194826399