chr1 840753 841210 840812 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 51479 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4 NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA PANK4 118304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 3374928 3375314 3374967 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 5938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 5957166 5957512 5957348 Y KCNAB2,KCNAB2,CHD5 NA NA NA NA NA NPHP4 93021 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 6301988 6302384 6302218 Y NA RPL22,ICMT,GPR153 NA NA NA NA ICMT 7956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 7331930 7332127 7331990 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 488546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8143203 8143348 8143235 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 58405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8450820 8451072 8450834 Y RERE,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 74934 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 123201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8724042 8724475 8724233 Y NA NA NA NA NA NA RERE 151227 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 8971325 8971721 8971517 Y NA ENO1-IT1,ENO1 ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENO1 34017 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 9291783 9292106 9291820 Y NA H6PD H6PD,GPR157,SLC2A5,SLC2A7,MIR34A,SPSB1,SLC25A33,TMEM201 IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 10359215 10359483 10359349 Y NA NA NA NA NA NA KIF1B 90352 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 10851136 10851604 10851471 Y NA NA NA NA NA NA TARDBP 218810 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 12210430 12211346 12210689 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 13714 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 14590335 14590448 14590392 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 332752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 14924209 14924351 14924269 Y NA KAZN NA NA NA NA KAZN 1009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 14927160 14927496 14927328 Y KAZN KAZN NA NA NA NA KAZN 3960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 16553276 16553594 16553536 Y NA RSG1 NA NA NA NA RSG1 8063 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 17019394 17019738 17019426 Y SPATA21,NBPF1 EIF1AXP1,CROCC NA NA NA NA EIF1AXP1 8844 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1,CROCC NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.6034444813639 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 17865185 17865523 17865202 Y ARHGEF10L ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 855 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 21655798 21656254 21656078 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 13743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 22076024 22076450 22076245 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 31649 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 24265492 24265740 24265616 Y SRSF10 RP11-4M23.4,CNR2 NA NA NA NA RP11-4M23.4 8133 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA NA LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNR2 65791 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 24890021 24890356 24890213 Y C1orf130 NA NA NA NA NA RCAN3 62634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 25969249 25969578 25969407 Y PDIK1L,SYF2,C1orf63,TMEM57,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B NA SEPN1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 101178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 26003805 26004144 26003975 Y NA NA NA NA NA NA SEPN1 120523 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 26453982 26454320 26454195 Y UBXN11,UBXN11 PDIK1L,ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA PDIK1L 18318 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 26615527 26615997 26615758 Y FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11860 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA LIN28A 589 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 26745463 26745863 26745681 Y NA LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA LIN28A 10194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 27337570 27337809 27337727 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 28152962 28153213 28153036 Y NA PPP1R8,SCARNA1 NA NA NA NA PPP1R8 2076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 28238886 28239222 28239086 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38 RPA2,SMPDL3B,XKR8 NA NA NA NA RPA2 35 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 28618110 28618271 28618191 Y ATPIF1 SESN2,MED18 NA NA NA NA SESN2 34072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 29253461 29253677 29253525 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 41858 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 29370205 29370321 29370263 Y NA NA NA NA NA NA RP4-604A21.1 63085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 29513219 29513546 29513454 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 6720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 29565515 29565732 29565598 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31360609 31360977 31360897 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 18631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31602770 31603168 31602969 Y NKAIN1 NA PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40 IMR90 Hi-C 24141950 PUM1 65932 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 31772172 31772177 31772175 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 4330 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 NA PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 PEF1 72106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr1 34628613 34629024 34628705 Y NA CSMD2 NA NA NA NA CSMD2 419 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 36173458 36173573 36173482 Y TEKT2,EIF2C1 C1orf216 NA NA NA NA C1orf216 9500 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 36283726 36283900 36283813 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 50158 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 36351655 36352020 36351717 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 118087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 36397577 36397741 36397665 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 154735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 38391752 38391859 38391812 Y NA INPP5B NA NA NA NA INPP5B 18870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 38573869 38574225 38574173 Y EPHA10,MANEAL,POU3F1 NA NA NA NA NA RP5-884C9.2 62883 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 39624919 39625154 39625144 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 79931 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr1 40841336 40841595 40841379 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 ZNF643 IMR90 Hi-C 24141950 SMAP2 32814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 40954031 40954187 40954167 Y ZNF684,DEM1 RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA RP11-656D10.3 18146 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 41622480 41622650 41622563 Y NA NA CTPS,LOC100507178 IMR90 Hi-C 24141950 SCMH1 83176 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 42126621 42126978 42126699 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 301027 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr1 42272535 42272820 42272654 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 226776 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 42372562 42373017 42372843 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 126579 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43426742 43427095 43427089 Y CLDN19,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 4022 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43473183 43473398 43473279 Y C1orf210,C1orf210,SLC2A1 NA NA NA NA NA SLC2A1-AS1 50463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43533809 43534205 43534063 Y NA NA FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A1-AS1 111089 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43666420 43666443 43666435 Y NA NA NA NA NA NA TMEM125 67222 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 43901568 43901739 43901659 Y NA MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA HYI 15921 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 46999025 46999241 46999126 Y ATPAF1-AS1 NA NA NA NA NA MKNK1 81274 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 48570660 48571055 48570858 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-61P 340553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 50580035 50580167 50580147 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 92450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 51097851 51098184 51098018 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 325751 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7,FAM159A NA NA NA NA FAM159A 3985 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 53128711 53128834 53128721 Y NA FAM159A NA NA NA NA FAM159A 31695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 54940444 54940824 54940607 Y NA NA TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 63292 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 56917995 56918217 56918107 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 190757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 56919158 56919299 56919214 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 189675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 57854714 57855055 57855051 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 745719 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 57873517 57873674 57873652 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 764522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 TACSTD2 9073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 59394323 59394565 59394423 Y NA NA FGGY,JUN,LOC100131060 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 146538 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 59537686 59537803 59537744 Y FGGY NA MIR4711,FGGY,JUN,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 222507 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 62698531 62698618 62698572 Y USP1,USP1,KANK4,L1TD1 L1TD1 NA NA NA NA L1TD1 40028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 63785369 63785450 63785384 Y FOXD3 LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6 NA NA NA NA FOXD3 1280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65307822 65308022 65307967 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 99044 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65510370 65510451 65510413 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 20969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65527577 65527856 65527728 Y NA RP4-535B20.1 AK4 K562 ChIA-PET 22265404 RP4-535B20.1 3564 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65534177 65534450 65534358 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 RP4-535B20.1 AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-535B20.1 2757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65534990 65535126 65535068 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 RP4-535B20.1 AK4,LEPR,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-535B20.1 3570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 66740731 66741065 66740898 Y NA NA NA NA NA NA WDR78 647505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 68166463 68166766 68166597 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 17719 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA ANKRD13C 71377 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 72493439 72493635 72493537 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 948432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA LHX8 102453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 77399446 77399567 77399507 Y NA NA NA NA NA NA RP4-706A16.3 193201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 78214350 78214750 78214605 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 8787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NA NA NA NA NA FUBP1 94366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA PTGFR 448204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 85614354 85614436 85614429 Y NA NA NA NA NA NA SYDE2 50293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 91183313 91183764 91183661 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 131443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA CDC7 218835 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 92184014 92184251 92184134 Y NA NA NA NA NA NA CDC7 219606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 92218581 92218971 92218958 Y NA NA NA NA NA NA BRDT 193957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 92496267 92496651 92496624 Y NA EPHX4,BTBD8 NA NA NA NA EPHX4 2728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 144948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 93414710 93414781 93414746 Y NA FAM69A NA NA NA NA FAM69A 10276 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 172648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94480579 94480958 94480750 Y DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA NA ABCA4 103730 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA ABCA4 NA NA NA NA ABCA4 37224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 94701813 94701865 94701839 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 NA NA NA NA RP11-148B18.1 9599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 836 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 95186012 95186295 95186154 Y NA NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 97542 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 95249173 95249377 95249275 Y NA LINC01057,SLC44A3 ABCD3,F3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 34460 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 95263833 95264301 95264195 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 19536 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA SNX7 518774 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 100859089 100859486 100859291 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 50505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 103126263 103126396 103126338 Y NA NA NA NA NA NA OLFM3 665677 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 107684770 107685020 107684841 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 87503 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 107767992 107768000 107767996 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 170725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 108199393 108199592 108199493 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 306174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 108484494 108484671 108484559 Y NA VAV3 NA NA NA NA VAV3 21095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 108592862 108593109 108592904 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 87096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 109156863 109156955 109156909 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 45193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 109159407 109159722 109159520 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 42426 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 109850258 109850620 109850439 Y WDR47 PSRC1 NA NA NA NA PSRC1 26450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 110141142 110141149 110141146 Y NA AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 15577 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 4371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 111677638 111678032 111677835 Y NA CEPT1,DRAM2 NA NA NA NA CEPT1 2217 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 111729234 111729498 111729366 Y NA CEPT1,DRAM2 NA NA NA NA DRAM2 48396 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 111758440 111759106 111758811 Y CD53,RAP1A,CEPT1,DENND2D,CHI3L2 NA WDR77,OVGP1,C1orf88 IMR90 Hi-C 24141950 DRAM2 77602 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 111759901 111760085 111760021 Y DENND2D NA WDR77,OVGP1,C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2 IMR90 Hi-C 24141950 DRAM2 79063 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 112048437 112048734 112048588 Y C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 34106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 112196411 112196803 112196596 Y C1orf183,RAP1A NA NA NA NA NA DDX20 99064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 112276731 112276883 112276807 Y C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 18984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 112901525 112901779 112901652 Y NA CTTNBP2NL ST7L,CAPZA1 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 35024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 113339084 113339400 113339242 Y NA NA FAM19A3,RHOC,PPM1J,AKR7A2P1,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-522D1.1 51250 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 113369203 113369427 113369274 Y SLC16A1,SLC16A1 RP3-522D1.1,RP11-426L16.8 RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-522D1.1 21223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 113394964 113395159 113395070 Y NA RP3-522D1.1,RP11-426L16.8 FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 RP11-426L16.8 3699 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 113584893 113585079 113584961 Y NA LRIG2 SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRIG2 28752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA MAGI3,RP11-512F24.1 NA NA NA NA MAGI3 18358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 114997819 114998047 114997990 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 53734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 115025085 115025405 115025244 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 26376 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 117359174 117359463 117359379 Y TTF2,CD2 NA NA NA NA NA PTGFRN 91216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 120052717 120053071 120052727 Y HSD3B1 NA NA NA NA NA GAPDHP33 84731 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 55474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 120275491 120275880 120275569 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 75070 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 121154332 121154613 121154395 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 104530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 142538903 142539547 142539454 Y NA NA NA NA NA NA RP11-417J8.3 77222 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 144927217 144927550 144927432 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 15122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 43743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA SEC22B 69671 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 145030583 145030978 145030933 Y NA NA NA NA NA NA SEC22B 63242 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 145064438 145064839 145064449 Y PDE4DIP SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC22B 29381 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 145065676 145066007 145065842 Y NA SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 28213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 145702718 145703106 145702912 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 93682 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 146612089 146612358 146612259 Y CHD1L,PRKAB2 PRKAB2,PDIA3P1 NA NA NA NA PRKAB2 29771 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 147790636 147790862 147790749 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 14024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.49685864962855 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA RNVU1-17,RNU1-92P NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-92P 9471 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 149853331 149853687 149853509 Y PLEKHO1 HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SV2A,SF3B4 NA NA NA NA HIST2H2BE 2545 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA ARNT NA NA NA NA ARNT 46401 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 151696469 151696693 151696535 Y NA RIIAD1,MRPL9 NA NA NA NA RIIAD1 15560 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 151916920 151917624 151917271 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 36636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 151962641 151962839 151962740 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 2027 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 152006910 152007460 152006991 Y SNX27,S100A11 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10923 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 154405181 154405498 154405310 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,IL6R,ADAR,ADAR IL6R NA NA NA NA IL6R 29512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 156480721 156480806 156480764 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 12101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 156966343 156966626 156966486 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 46536 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 157010714 157010878 157010796 Y NA ARHGEF11,KRT8P45 NA NA NA NA ARHGEF11 2284 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 157249264 157249609 157249447 Y NA NA NA NA NA NA ETV3 142998 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 157532312 157532617 157532460 Y FCRL5 NA NA NA NA NA ETV3 426046 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 158256846 158257127 158257047 Y NA NA NA NA NA NA ELL2P1 111301 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 158942717 158942925 158942799 Y OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1 IFI16 NA NA NA NA IFI16 24833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 160242090 160242278 160242184 Y NA RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19,SUMO1P3 NA NA NA NA DCAF8 10642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 160345693 160345986 160345917 Y NA NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2 NA NA NA NA NHLH1 10836 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 160568524 160568531 160568528 Y NA NA NA NA NA NA VANGL2 200148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 161170933 161171185 161171002 Y ADAMTS4,NDUFS2 USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,APOA2,TOMM40L NA NA NA NA ADAMTS4 4087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 161324130 161324422 161324290 Y NA SDHC NA NA NA NA SDHC 42083 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 161892699 161893027 161892754 Y NA NA NA NA NA NA NOS1AP 144537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 162216729 162216804 162216767 Y NOS1AP NA NA NA NA NA NOS1AP 179165 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 162604417 162604795 162604606 Y NA DDR2 NA NA NA NA DDR2 5254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 164685981 164686133 164686057 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 164723371 164723492 164723438 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 200550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 168337258 168337475 168337348 Y NA NA LOC100505918,MIR557 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 88980 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 168467604 168467716 168467660 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 219326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 169452813 169453010 169452905 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 170636506 170636902 170636792 Y PRRX1 NA NA NA NA NA GORAB 137236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 172715484 172715760 172715631 Y NA NA C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 304254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 172872881 172872916 172872899 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 461651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 173958715 173958784 173958750 Y NA RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 30651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 175159885 175160247 175160001 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 175891419 175891824 175891531 Y NA RP11-318C24.1 RFWD2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-318C24.1 2308 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 176024233 176024593 176024503 Y NA NA NA NA NA NA RP11-318C24.1 135122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 176174471 176174980 176174673 Y RFWD2 NA NA NA NA NA RFWD2,RP11-195C7.1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 176235705 176235715 176235710 Y NA NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 60921 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 176750451 176750537 176750521 Y PAPPA2 NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 575667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 176964272 176964382 176964323 Y ASTN1 NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 789488 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 179606990 179607135 179607063 Y NA TDRD5 NA NA NA NA TDRD5 48242 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 180251899 180252130 180252121 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 129930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 180403880 180403893 180403887 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 66196 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr1 182274457 182274562 182274517 Y NA NA GLUL K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 84779 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 183557915 183558504 183558249 Y SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5 ARPC5,RGL1 NA NA NA NA NCF2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 183567713 183567879 183567843 Y NCF2,NCF2 NCF2,ARPC5,RGL1 DKFZP564C196,SMG7,NCF2,LAMC1,NMNAT2,ARPC5,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 NCF2 9702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 183776671 183777014 183776784 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA RGL1 173451 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 184128022 184128982 184128128 Y NA NA C1orf21 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 109211 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 184357629 184357933 184357738 Y EDEM3 C1orf21 NA NA NA NA C1orf21 3437 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 190286298 190286417 190286358 Y FAM5C NA NA NA NA NA RP11-373J16.2 1185875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 191536543 191536778 191536610 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 1146535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 466737 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 192569418 192569748 192569583 Y RGS1 NA RGS1,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 113565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 192577525 192577907 192577716 Y NA NA UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 105406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 193226500 193227132 193226836 Y RGS2 NA NA NA NA NA CDC73 137353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 193726401 193726456 193726429 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 637254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 194047687 194047732 194047710 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 958540 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 196379497 196379989 196379846 Y CFHR3,KCNT2,CFH NA NA NA NA NA KCNT2 196366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 197513718 197513772 197513745 Y CRB1,DENND1B NA NA NA NA NA EEF1A1P32 142118 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 200050544 200050911 200050727 Y NA NA NA NA NA NA ZNF281 326273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 200076437 200076447 200076441 Y NR5A2 NA NA NA NA NA ZNF281 300737 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr1 200122559 200122752 200122651 Y ZNF281 NA NA NA NA NA ZNF281 254432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 200332454 200332650 200332616 Y ZNF281 ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 44534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 200448306 200448569 200448314 Y NA NA C1orf98,NR5A2,ZNF281 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF281 71122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 200750000 200750140 200750089 Y NA CAMSAP2 NA NA NA NA CAMSAP2 43314 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 201424936 201425126 201425034 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 11239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3 NA NA NA NA ELF3 17076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 202055098 202055409 202055277 Y ELF3,GPR37L1 NA ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARL8A 56460 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 202214153 202214446 202214299 Y NA NA NA NA NA NA LGR6 53124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 203417736 203417980 203417842 Y NA NA PRELP,FMOD,PPFIA4,CYB5R1,ATP2B4,BTG2,LOC730227 IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 145117 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE NA NA NA NA NA ATP2B4 102204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 203723839 203723956 203723897 Y NA ZC3H11A NA NA NA NA ZC3H11A 38826 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 204044571 204044810 204044641 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 4328 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 204422279 204422591 204422449 Y NA PPP1R15B,PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 39261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 206861410 206861458 206861434 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 5121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 208028503 208028730 208028615 Y NA NA NA NA NA NA CD46 105101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 209215272 209215534 209215454 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 224034 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 209585617 209585757 209585708 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 14408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 209600780 209600928 209600808 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 615 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr1 209601291 209601611 209601405 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 1126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.7868283365293 chr1 211593638 211593702 211593670 Y TRAF5 LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 39493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2,RP11-122M14.1 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 212291571 212291809 212291658 Y PPP2R5A NA NA NA NA NA RPL21P28 68200 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 213088240 213088359 213088300 Y VASH2 VASH2 NA NA NA NA VASH2 33503 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 213090277 213090696 213090331 Y VASH2,FLVCR1 VASH2 NA NA NA NA VASH2 31166 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr1 213605102 213605329 213605216 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 382513 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 220510650 220511010 220510830 Y NA NA MARK1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3GAP2 66854 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 221904432 221904724 221904722 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 8794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 222461432 222461724 222461569 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-378J18.3 299443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 224019430 224020596 224019827 Y FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 11078 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 7.10030313099244 chr1 224924541 224924939 224924681 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 157025 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 225780677 225780772 225780725 Y NA NA NA NA NA NA ENAH 58072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226063760 226064118 226063778 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 NA NA NA NA TMEM63A 3951 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226366367 226366621 226366494 Y NA ACBD3,MIXL1 NA NA NA NA ACBD3 5810 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3,MIXL1 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A MIXL1 NA NA NA NA MIXL1 25811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 228634060 228634141 228634103 Y TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9419 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 228945464 228945740 228945561 Y RHOU NA RHOU,NUP133,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 76640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 229166537 229166799 229166668 Y RAB4A,C1orf96 NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 237976 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 229307664 229307899 229307845 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 96876 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 229335784 229335916 229335795 Y RHOU,C1orf96 NA RHOU,NUP133,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 68859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 229409656 229409997 229409713 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A NA NA NA NA RAB4A 4834 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 9.46707084132326 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 235994307 235994722 235994588 Y NA NA NA NA NA NA LYST 50218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 236866415 236866949 236866639 Y NA ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 18661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 430746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 237833544 237833823 237833684 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 630039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 453135 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 239893728 239894036 239893786 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 437419 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 240437557 240437954 240437680 Y FMN2 NA NA NA NA NA ADH5P3 106102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 241191454 241191834 241191645 Y RGS7 RP11-435F13.2 NA NA NA NA RP11-435F13.2 31360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 241469731 241469956 241469941 Y RGS7 NA NA NA NA NA FH 211105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 242609605 242610011 242609798 Y PLD5,PLD5 NA NA NA NA NA MAP1LC3C 449230 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 243654647 243654885 243654744 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 237327 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 243853401 243853550 243853530 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 158831 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 244512430 244512879 244512496 Y ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 100557 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr1 246751015 246751281 246751184 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 23269 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 354662 355000 354689 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 176257 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 1100843 1101035 1100898 Y NA IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 7365 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 1240958 1241356 1241181 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 147480 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 1374654 1374709 1374682 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 281176 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 1390281 1390451 1390366 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 296803 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 2670956 2671206 2671086 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 435319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 3917358 3918120 3917657 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 91885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 5528772 5529321 5529050 Y NA NA NA NA NA NA NET1 76258 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 5707430 5707726 5707563 Y NA ASB13,FAM208B NA NA NA NA ASB13 872 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr10 6322373 6322594 6322421 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 137492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 6503496 6503541 6503519 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PRKCQ 116722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 7223481 7223753 7223543 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT2 227697 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 7449149 7449274 7449212 Y NA SFMBT2 NA NA NA NA SFMBT2 2176 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA CELF2 NA NA NA NA CELF2 27158 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 11737081 11737223 11737138 Y NA ECHDC3 USP6NL IMR90 Hi-C 24141950 ECHDC3 45142 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 13131256 13131517 13131341 Y NA OPTN,CCDC3 CDC123,CAMK1D IMR90 Hi-C 24141950 OPTN 7932 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 13200624 13201003 13200885 Y NA MCM10 NA NA NA NA MCM10 551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38 NA NA NA NA RPP38 20451 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 17430166 17430520 17430415 Y NA ST8SIA6-AS1 NA NA NA NA ST8SIA6-AS1 3231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr10 21683965 21683997 21683982 Y C10orf140 NA NA NA NA NA MLLT10 137097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 22026318 22026683 22026671 Y EBLN1 NA NA NA NA NA RN7SKP37 193389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 22029877 22030194 22029992 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 189878 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr10 22624164 22624549 22624505 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 7850 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 22658531 22658793 22658663 Y NA SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 26132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 22817226 22817294 22817260 Y EBLN1 NA NA NA NA NA PIP4K2A 184190 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 23344774 23344811 23344800 Y NA MSRB2 NA NA NA NA MSRB2 37624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 24858253 24858468 24858359 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 152129 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 25724945 25725304 25725156 Y NA NA NA NA NA NA GPR158 262954 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 26191189 26191209 26191199 Y NA MYO3A NA NA NA NA MYO3A 29987 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 27032794 27033066 27033024 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 48206 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 27147453 27147834 27147772 Y YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1 ABI1 NA NA NA NA ABI1 182 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 28694229 28694387 28694304 Y NA NA NA NA NA NA MPP7 72814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 29970673 29971027 29970896 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 274342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 32100174 32100489 32100483 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP12 115253 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 32598255 32598442 32598434 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 67284 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 35195075 35195256 35195166 Y NA SS18L2P1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 SS18L2P1 32937 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM NA NA NA NA NA CUL2 60644 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 42817169 42817557 42817529 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 148131 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 44100382 44100859 44100681 Y CSGALNACT2 ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32 NA NA NA NA ZNF485 527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 45463684 45463996 45463754 Y ALOX5,RASSF4 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 8262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 45871674 45871974 45871739 Y FAM21C,ALOX5 ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 4013 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 47183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 49564940 49565014 49564977 Y NA NA ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 52242 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 49598208 49598504 49598305 Y NA NA MAPK8,ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 85510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 52167205 52167434 52167402 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 144467 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 56854357 56854710 56854534 Y NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 502040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 144986 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 98071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 68690818 68690961 68690956 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 951466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 68755189 68755293 68755241 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 887134 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 119010 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 71355649 71355822 71355737 Y NA C10orf35 HK1,TSPAN15,NEUROG3,COL13A1,HKDC1 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf35 32185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 72202124 72202468 72202392 Y EIF4EBP2,NODAL EIF4EBP2,NODAL NA NA NA NA NODAL 3239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr10 72218739 72219166 72218841 Y NA NODAL KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27 IMR90 Hi-C 24141950 NODAL 13032 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B,UNC5B-AS1 NA NA NA NA UNC5B-AS1 1736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA UNC5B-AS1 50192 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 73126563 73126688 73126624 Y PSAP,C10orf54 SLC29A3,CDH23 NA NA NA NA CDH23 28003 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 73887320 73887439 73887380 Y NA SPOCK2 NA NA NA NA SPOCK2 40530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 73954988 73955333 73955161 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 18454 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 75408900 75409185 75408963 Y CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54 USP54,AGAP5 NA NA NA NA USP54 25189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 76866248 76866511 76866390 Y NA SAMD8 NA NA NA NA SAMD8 8904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 76916394 76916800 76916595 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA VDAC2 51112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 76997919 76998322 76998050 Y NA VDAC2,COMTD1,HMGA1P5 NA NA NA NA COMTD1 4131 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 77155629 77155954 77155896 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 3710 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 78790288 78790415 78790352 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 605938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 80983096 80983503 80983267 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 121722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 80997251 80997825 80997438 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 107400 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 81004480 81004949 81004783 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 100276 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 81078771 81079085 81078950 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 85324845 85324972 85324948 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 572224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 86152070 86152317 86152175 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 165882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 88571811 88572082 88571947 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1A 57404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 96282867 96283106 96282931 Y TBC1D12 HELLS NA NA NA NA HELLS 20441 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 97319295 97319590 97319525 Y C10orf129,SORBS1,SORBS1 SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA NA NA NA NA NA PYROXD2 152695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 101425049 101425416 101425233 Y NA SLC25A28,ENTPD7,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 7786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 101677861 101678026 101677917 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 89650 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 102030171 102030375 102030254 Y SEC31B CHUK,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2 NA NA NA NA CWF19L1 4734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 103124787 103125187 103124970 Y NA BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12967 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 103648556 103648892 103648724 Y NA NA NA NA NA NA MGEA5 71860 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 103876632 103876931 103876782 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 1279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 104838794 104839158 104838851 Y NA NA NA NA NA NA NT5C2 111898 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105448441 105448500 105448481 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 227463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105466638 105466810 105466737 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 209153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105611177 105611504 105611341 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 64459 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105630915 105631032 105630972 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 44931 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105725440 105725838 105725745 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA SLK 481 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105869782 105869970 105869884 Y GSTO1,GSTO1,CCDC147,SLK,MEIR5,MEIR5 SFR1 NA NA NA NA SFR1 9846 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 105941427 105941470 105941449 Y SORCS3,WDR96 WDR96 NA NA NA NA WDR96 48650 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 106020526 106021193 106020581 Y SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1 WDR96,GSTO1,MIR4482-1,GSTO2 NA NA NA NA MIR4482-1 4984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 111650301 111650520 111650491 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 30791 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 114693939 114693964 114693952 Y NA TCF7L2 TCF7L2,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 14045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 116556570 116556696 116556633 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 22807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 116927566 116927896 116927668 Y NA NA NA NA NA NA ATRNL1 76442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA SLC18A2 NA NA NA NA SLC18A2 47730 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 123027203 123027438 123027321 Y NA NA FGFR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-159H3.1 135966 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 123526019 123526096 123526058 Y NA NA NA NA NA NA ATE1 160220 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 123763910 123763923 123763917 Y TACC2 NSMCE4A,TACC2 NA NA NA NA TACC2 17221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 125990441 125990533 125990483 Y NA NA CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 115012 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 797 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr10 127576777 127576887 127576832 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 127577281 127577575 127577428 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 34 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr10 127591696 127592016 127591824 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 8588 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr10 128357201 128357366 128357267 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 234612 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 128592998 128593177 128593088 Y NA DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 1020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 131765501 131765764 131765633 Y NA EBF3 NA NA NA NA EBF3 5396 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 134430075 134430311 134430209 Y INPP5A NA NA NA NA NA INPP5A 80751 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 134527729 134527887 134527815 Y KNDC1,GPR123,C10orf92,NKX6-2 NA NA NA NA NA INPP5A 178405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 134975074 134975296 134975198 Y NA KNDC1 NA NA NA NA KNDC1 3123 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr10 135048867 135049308 135048949 Y TUBGCP2,ADAM8 UTF1,ADAM8 NA NA NA NA VENTX 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr10 135342737 135342867 135342819 Y KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1 SYCE1 NA NA NA NA SYCE1 38009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 334344 334553 334421 Y NA RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 NA NA NA NA IFITM3 8807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 1015139 1015297 1015218 Y NA NA NA NA NA NA AP2A2 92245 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 417 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 1991146 1991394 1991373 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 24638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 2643075 2643474 2643317 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 75750 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195 NA NA NA NA ZNF195 45291 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 7719377 7719648 7719531 Y NA CYB5R2 NA NA NA NA CYB5R2 22924 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 9787824 9788205 9787956 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 104200 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 10373632 10373924 10373723 Y NA ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 10404161 10404389 10404339 Y ADM NA SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM IMR90 Hi-C 24141950 ADM 79934 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 10436257 10436513 10436356 Y ZBED5,EIF4G2,SBF2,ADM,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA MRVI1,SBF2,LOC283104,MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1,LYVE1,AMPD3,SWAP70 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L8 92210 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 10634601 10634999 10634904 Y MRVI1,MRVI1,MRVI1 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73782 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 12352954 12352993 12352974 Y NA PARVA NA NA NA NA PARVA 43739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 14362320 14362599 14362499 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 21453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 27023421 27023808 27023612 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 359607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 27451921 27452137 27452029 Y NA LGR4 NA NA NA NA LGR4 40185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF NA NA NA NA NA RP11-1033A18.1 170264 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 736727 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 43779324 43779404 43779364 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 120957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 44306158 44306224 44306191 Y ALX4 NA NA NA NA NA EXT2 191059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 44882780 44883083 44882907 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 87757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 44883806 44884166 44884088 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 86674 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 44903953 44904102 44903996 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 66738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 46465667 46466056 46465959 Y NA NA NA NA NA NA MDK 65361 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 57269501 57269878 57269690 Y NA RTN4RL2,SLC43A1,TIMM10 RTN4RL2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A1 11381 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 59582834 59583156 59582993 Y NA MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 6489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 59941614 59941716 59941665 Y MS4A7,MS4A4A,MS4A6A,MS4A6A NA NA NA NA NA RP11-736I10.2 98791 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 60679748 60680120 60679877 Y CD5,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3 NA NA NA NA TMEM109 402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 60926054 60926399 60926274 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 60931528 60932206 60931841 Y SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 4439 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 60932642 60932735 60932710 Y GPR44,SLC15A3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 5553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 11.8338385516541 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 62267714 62268111 62267986 Y NA RP11-864I4.4 NA NA NA NA RP11-864I4.4 43360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63319099 63319170 63319152 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS5 62433 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 47272 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63366734 63367020 63366890 Y NA PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 15335 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 63687620 63687907 63687858 Y LGALS12,RCOR2 RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 5304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63744435 63744483 63744459 Y KCNK4 NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA AP000721.4 4343 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 63954598 63954956 63954814 Y FERMT3,CCDC88B,OTUB1 MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,VEGFB NA NA NA NA STIP1 3854 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 64320859 64321220 64321040 Y C11orf85 NA SLC22A12,NRXN2 IMR90 Hi-C 24141950 NRXN2 167440 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 7.81033344409169 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65555605 65556077 65555902 Y TSGA10IP,CATSPER1 OVOL1,SNX32 NA NA NA NA OVOL1 3112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 66080826 66081241 66080906 Y CD248 RAB1B,CNIH2,YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8 NA NA NA NA CD248 1274 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 66093813 66094193 66094103 Y NA YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 8118 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 66845907 66846062 66845990 Y PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 67253659 67253853 67253760 Y PTPRCAP,NUDT8,AIP CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA AIP 5147 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 67895703 67896078 67896017 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 8792 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 69257578 69257894 69257648 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195961 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 69586936 69586990 69586963 Y FGF4 FGF4 NA NA NA NA FGF4 1181 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr11 69809602 69809958 69809614 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4 IMR90 Hi-C 24141950 FGF4 221431 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 70339442 70339588 70339533 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 96848 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 70400886 70401022 70400954 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 158292 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 70483542 70483760 70483651 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 240948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 71658678 71659025 71658708 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RNF121 20931 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA PHOX2A NA NA NA NA PHOX2A 48427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 72449101 72449742 72449392 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA STARD10 52984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 74171904 74172163 74171977 Y SPCS2,RNF169,C2CD3 KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA KCNE3 4611 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 75041361 75041638 75041486 Y ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 19235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 75060875 75061139 75061045 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 2 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr11 75581181 75581426 75581320 Y MAP6 NA NA NA NA NA UVRAG 56969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 75945169 75945568 75945242 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 25389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 76883031 76883248 76883107 Y NA NA NA NA NA NA CAPN5 107052 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 78426480 78426845 78426663 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 142561 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 85047149 85047448 85047300 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 290181 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 92083144 92083535 92083339 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 845595 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 102296028 102296376 102296245 Y NA TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 42739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 102461117 102461349 102461270 Y NA NA NA NA NA NA TMEM123 122002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 103321873 103321933 103321886 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 43488 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 105090888 105091203 105091058 Y CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA NA NA NA NA CASP4 252725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 105513261 105513284 105513272 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA RNU4-55P 180076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 105674568 105674985 105674652 Y KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 RNU4-55P NA NA NA NA RNU4-55P 18375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr11 106577276 106577400 106577281 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD3 630784 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 108600247 108600616 108600285 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 66495 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 117687155 117687422 117687274 Y NA NA NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 57960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 117805497 117805937 117805753 Y NA NA FXYD6-FXYD2 IMR90 Hi-C 24141950 FXYD6 59296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 118109192 118109437 118109315 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3 MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 11628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46 NA NA NA NA IFT46 40065 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L,FOXR1 NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 119598046 119598312 119598172 Y USP2 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 252 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 121448904 121449244 121449069 Y SORL1 NA NA NA NA NA SORL1 127992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 122614600 122615453 122614815 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 90217 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 123293400 123293723 123293427 Y NA AP000783.1 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 5335 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 123613702 123613859 123613783 Y OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1 ZNF202,RNU1-21P NA NA NA NA ZNF202 3319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr11 124638889 124639135 124639012 Y NA NRGN NA NA NA NA NRGN 31147 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 125670081 125670467 125670312 Y CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2 NA NA NA NA NA HYLS1 81042 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 126838913 126839134 126839118 Y KIRREL3 NA NA NA NA NA ST3GAL4 615378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 128590332 128590660 128590581 Y ETS1,FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 35902 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 128605969 128606121 128606047 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA FLI1 51539 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr11 130479003 130479154 130479069 Y ADAMTS15 NA ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB44 296422 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 131928107 131928500 131928434 Y NA NA NA NA NA NA NTM 689734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 132871578 132871910 132871744 Y NA NA NA NA NA NA OPCML 528504 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr11 132940132 132940357 132940242 Y OPCML NA NA NA NA NA OPCML 460057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr11 133991300 133991384 133991342 Y NA NA NA NA NA NA JAM3 54480 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 597311 597678 597495 Y NINJ2 B4GALNT3 NA NA NA NA B4GALNT3 29781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 731666 731908 731742 Y CCDC77,KDM5A,WNK1 RP11-218M22.1,NINJ2 NA NA NA NA RP11-218M22.1 6149 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 1157508 1157869 1157627 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 59833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 2103073 2103532 2103387 Y FBXL14 CACNA1C,DCP1B,RP5-1096D14.6 NA NA NA NA DCP1B 8169 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 2364427 2364812 2364581 Y LRTM2 NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 252595 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 2444773 2444895 2444888 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 332941 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 2547305 2547477 2547330 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1C-AS1 250889 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 3313495 3313728 3313584 Y NRIP2 RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 5368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 3333828 3333981 3333926 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 14732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 3450642 3450947 3450795 Y NA PRMT8 PRMT8,EFCAB4B IMR90 Hi-C 24141950 PRMT8 37568 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 3856709 3856898 3856806 Y PARP11,EFCAB4B EFCAB4B NA NA NA NA EFCAB4B 15087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 3979182 3979441 3979276 Y PARP11 PARP11 NA NA NA NA PARP11 1167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4131276 4131377 4131327 Y CCND2 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 150668 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.15359604686012 chr12 4252128 4252433 4252201 Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 128505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4274113 4274463 4274167 Y CCND2 NA NA NA NA NA CCND2 106475 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4287687 4287885 4287726 Y NA NA NA NA NA NA CCND2 93053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4333452 4333582 4333514 Y EFCAB4B,PARP11 CCND2 CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 47356 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 CCND2,C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 1524 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 4380607 4381576 4381205 Y PARP11,CCND2 C12orf5 NA NA NA NA CCND2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 4402799 4402949 4402883 Y NA CCND2,C12orf5 NA NA NA NA CCND2 21861 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 4406037 4406342 4406147 Y PARP11,CCND2 CCND2,C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 22029 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 4845288 4845672 4845482 Y NA NA NA NA NA NA KCNA6 70670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 6163759 6163858 6163809 Y SCNN1A,ANO2 NA NA NA NA NA ANO2 110361 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 6339954 6340271 6340062 Y VAMP1,TAPBPL,IFFO1 CD9 NA NA NA NA CD9 33073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA PLEKHG6 14713 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 6482550 6482923 6482687 Y SCNN1A,SCNN1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A TNFRSF1A K562 ChIA-PET 22265404 LTBR 339 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 7058106 7058233 7058157 Y ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7127 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 7781011 7781133 7781040 Y SLC2A14 NA NA NA NA NA GDF3 65239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 7790789 7791157 7790868 Y NA NA NA NA NA NA GDF3 55215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 7792912 7793287 7793081 Y PEX5,PEX5,NANOG,DPPA3,SLC2A14,GDF3 NA NA NA NA NA GDF3 53085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.15359604686012 chr12 7978463 7978836 7978682 Y DPPA3,SLC2A3,NANOG NANOG NA NA NA NA NANOG 40073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 8013004 8013217 8013212 Y NA SLC2A14 NA NA NA NA SLC2A14 28527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.73353542066163 chr12 8147722 8148111 8148026 Y NA FOXJ2 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 35188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 8828014 8828577 8828369 Y NA RP11-438L7.3,RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 3619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 8966613 8966834 8966743 Y CLEC6A,CLEC4E,PHC1,M6PR A2ML1,A2ML1-AS1 A2ML1 IMR90 Hi-C 24141950 A2ML1 6234 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 8969039 8969453 8969246 Y NA A2ML1,A2ML1-AS1 A2ML1 IMR90 Hi-C 24141950 A2ML1 3615 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 8971788 8972170 8971968 Y NA A2ML1,A2ML1-AS1 A2ML1 IMR90 Hi-C 24141950 A2ML1 898 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr12 9059535 9059596 9059566 Y PHC1 PHC1,M6PR NA NA NA NA PHC1 4896 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9060195 9060360 9060254 Y PHC1 PHC1,M6PR NA NA NA NA PHC1 4132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 9236028 9236753 9236097 Y KLRG1 A2M NA NA NA NA A2M 30072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP A2M NA NA NA NA A2M 42107 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9491229 9491519 9491373 Y NA NA C12orf33,LOC144571 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP4 100302 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9802084 9802505 9802358 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA CD69 108992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9804148 9804385 9804240 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA CD69 107112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9855016 9855380 9855049 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69 NA NA NA NA NA CD69 56117 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9912135 9912729 9912724 Y NA CD69 NA NA NA NA CD69 638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9947226 9947346 9947290 Y OLR1,CLEC7A,CLEC2B,CD69 CD69 CD69,CLEC7A K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD69 35729 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA NA NA NA NA NA CD69 75086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 10097110 10097368 10097201 Y CD69,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A NA NA NA NA NA CLEC9A 83908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10130625 10130889 10130637 Y CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A NA NA NA NA NA CLEC9A 50387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10273911 10274123 10274066 Y CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CLEC1B,KLRD1,GABARAPL1,OLR1,CLEC7A CLEC7A NA NA NA NA CLEC7A 6734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 154430 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10707226 10707846 10707473 Y KLRD1,KLRD1,KLRK1,KLRC4,KLRC4-KLRK1,KLRC3,KLRC2,KLRC1 NA CLEC1A,KLRC4-KLRK1 IMR90 Hi-C 24141950 MAGOHB 56376 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 11838255 11838510 11838381 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 37467 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 11864651 11864937 11864724 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 63863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 11951921 11952163 11952067 Y ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 151133 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 11962012 11962232 11962094 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 161224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 12032964 12033203 12033084 Y BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 228894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 12084529 12084746 12084638 Y NA NA LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 177351 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 12255233 12255559 12255327 Y BCL2L14 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 6538 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 12408234 12408471 12408413 Y NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 9475 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 12532834 12533375 12533099 Y DUSP16,CDKN1B,APOLD1,BCL2L14,LOH12CR1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA LOH12CR1 24821 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 13292095 13292429 13292230 Y NA NA EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1467 96877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 13326583 13326856 13326645 Y EMP1 NA HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1467 131365 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 13376138 13376415 13376269 Y HEBP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 180920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 13986267 13986354 13986298 Y NA NA NA NA NA NA ATF7IP 530256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 15287124 15287167 15287146 Y NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 174462 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 17006116 17006369 17006243 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1018J11.1 133691 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 18511225 18511610 18511392 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 769038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 19496981 19496995 19496989 Y NA NA NA NA NA NA AEBP2 57984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 19842357 19842456 19842392 Y NA RNU1-146P NA NA NA NA RNU1-146P 32913 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 21428924 21429039 21428982 Y SLCO1B3,SLCO1B1,SLCO1A2,KCNJ8,GYS2,SLCO1A2 NA NA NA NA NA PYROXD1 159510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 22441224 22441581 22441385 Y NA NA NA NA NA NA CMAS 244116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 22654594 22654831 22654713 Y NA NA NA NA NA NA ETNK1 121178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 23738517 23738975 23738828 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 362991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 23883924 23884166 23883932 Y NA NA NA NA NA NA SOX5 217800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 25245550 25245859 25245676 Y LRMP NA NA NA NA NA CASC1 100237 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 16493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.02350510756238 chr12 26130090 26130317 26130202 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 19392 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 26142824 26143171 26142998 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 32126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA BHLHE41 NA NA NA NA BHLHE41 8249 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 26435526 26435801 26435631 Y NA NA BHLHE41,ITPR2,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 159466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 26495152 26495452 26495369 Y ITPR2 NA NA NA NA NA BHLHE41 219092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 26624362 26624835 26624675 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA BHLHE41 348302 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 26663094 26663473 26663334 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 320658 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 26805266 26805775 26805502 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 178356 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 27174273 27174510 27174392 Y C12orf71 TM7SF3,MED21 NA NA NA NA MED21 794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 27379304 27379685 27379495 Y NA STK38L STK38L,MED21,FGFR1OP2 IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 15216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 27497251 27497478 27497364 Y MED21,ARNTL2 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 13464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 27513734 27513812 27513790 Y NA ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 29947 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 28433746 28433796 28433771 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 36600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 29601520 29601624 29601572 Y NA NA NA NA NA NA OVCH1-AS1 61293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 30570849 30571198 30571024 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 275722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 2790 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 31523933 31524084 31523973 Y DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 3698 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 38.3416369073592 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 32465088 32465196 32465142 Y FGD4,BICD1 NA NA NA NA NA BICD1 207319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 32559552 32559716 32559634 Y BICD1 NA BICD1,FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 270418 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 32607110 32607326 32607203 Y NA NA FGD4,DNM1L,BICD1 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 222808 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 32607967 32608138 32608054 Y NA NA FGD4,BICD1 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 221996 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 32636528 32636789 32636676 Y NA NA FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 193345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 40382618 40382994 40382971 Y LRRK2 NA NA NA NA NA SLC2A13 114897 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 41137156 41137542 41137225 Y CNTN1 NA NA NA NA NA SLC2A13 639265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 41286923 41287191 41287057 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A13 789032 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 42537125 42537342 42537234 Y NA GXYLT1 NA NA NA NA GXYLT1 444 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 43506983 43507174 43507167 Y ADAMTS20 NA NA NA NA NA RP11-25I15.1 436057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 46845656 46846014 46845792 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 70194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 51608031 51608240 51608135 Y BIN2 TFCP2,POU6F1,DAZAP2 NA NA NA NA POU6F1 1237 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 51885274 51885441 51885406 Y NA NA NA NA NA NA SCN8A 96609 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 52184760 52184919 52184839 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1B 158532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 52243040 52243117 52243080 Y SCN8A,ACVRL1,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 100334 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 52559335 52559488 52559400 Y ACVR1B,ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA NA KRT7 64816 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 53359181 53359363 53359294 Y PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8,EIF4B NA NA NA NA KRT8 17443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 54149784 54149995 54149877 Y PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 30255 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA SNORD81 HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD81 15886 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 54228175 54228372 54228274 Y ATP5G2 SNORD81 HOXC13,HOXC12,SMUG1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD81 45086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 54589708 54589846 54589777 Y CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84 SMUG1 SMUG1,HOXC4,HOXC9 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SMUG1 8930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 55806634 55807051 55806823 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 266279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.26018187859547 chr12 56069411 56069730 56069504 Y ZC3H10,MMP19,BLOC1S1 METTL7B,BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7 NA NA NA NA METTL7B 3600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 56193144 56193361 56193252 Y OR6C3,OR6C75 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA SARNP 16179 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.02350510756238 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 57162340 57162564 57162470 Y PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6 NACA,PRIM1 NA NA NA NA PRIM1 18183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 57764553 57764898 57764725 Y NA NA INHBC,R3HDM2,ARHGAP9 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 57890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 62388270 62388603 62388449 Y FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 263516 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 62685666 62685938 62685802 Y C12orf61,MON2,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 33547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 65037414 65037710 65037562 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 35121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 67319023 67319379 67319201 Y NA NA NA NA NA NA CAND1 341682 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 68166573 68166761 68166704 Y NA NA NA NA NA NA DYRK2 126455 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 68705071 68705359 68705215 Y IL22 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18802 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA NUP107 7524 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 70007126 70007281 70007265 Y LRRC10 CCT2 NA NA NA NA CCT2 30012 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 70603919 70603997 70603958 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 30777 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 70605032 70605426 70605086 Y CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 29348 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 71770650 71771010 71770955 Y NA NA NA NA NA NA ZFC3H1 288495 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 73141333 73141529 73141426 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D15 909846 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 73639499 73639785 73639508 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1289766 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 KRR1 NA NA NA NA KRR1 17530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 76250053 76250409 76250231 Y NA NA NA NA NA NA PHLDA1 175303 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 76949947 76950382 76950258 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 1207 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 77156465 77156658 77156516 Y NA ZDHHC17 NA NA NA NA ZDHHC17 1097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 77426192 77426447 77426357 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 30913 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 79444921 79445122 79445022 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 189148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 79804284 79804517 79804401 Y PAWR NA NA NA NA NA PAWR 278360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 80907201 80907494 80907379 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244J10.1 412088 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 157259 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 90251511 90251925 90251741 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B1 150434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-796E2.4 761916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 92863747 92864031 92863808 Y NA NA NA NA NA NA BTG1 326074 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 94546167 94546575 94546217 Y CRADD,TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA CCDC41 305189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA CCDC41 77597 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA CCDC41 NA NA NA NA CCDC41 33416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 95411707 95411975 95411841 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 16161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 95939436 95939751 95939594 Y NA USP44 NA NA NA NA USP44 3515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA USP44 104726 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 96138744 96139091 96139013 Y NA NTN4 NA NA NA NA NTN4 43839 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 97355714 97355975 97355919 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 56713 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 99541793 99542207 99542018 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 504874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 102169550 102169734 102169688 Y NA SYCP3 NA NA NA NA SYCP3 38300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 102734344 102734692 102734517 Y NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 222442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 105486221 105486404 105486313 Y NA ALDH1L2,KIAA1033 ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1L2 9866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 105900072 105900358 105900257 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL2 272056 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 107153976 107154194 107154103 Y RFX4,RIC8B RIC8B NA NA NA NA RIC8B 12179 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 107473112 107473328 107473221 Y NA CRY1 NA NA NA NA CRY1 12279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 108054058 108054330 108054150 Y NA PWP1 NA NA NA NA PWP1 23179 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 109037814 109037911 109037861 Y SSH1,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 83456 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 109120887 109121218 109121134 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 2154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 110319208 110319481 110319350 Y C12orf34,C12orf76 TRPV4,GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 2915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 110687741 110688014 110687886 Y TRPV4,ATP2A2 ATP2A2 ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP2A2 28547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA HMGA1P3 1049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111015565 111016027 111015682 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 3098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111095518 111095878 111095698 Y PPTC7,HVCN1,HVCN1 TCTN1,HVCN1 NA NA NA NA HVCN1 44877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111252728 111252961 111252814 Y NA NA CUX2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CC 73984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111473237 111473713 111473408 Y CUX2 CUX2 NA NA NA NA CUX2 3409 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111475040 111475231 111475136 Y NA CUX2 NA NA NA NA CUX2 5212 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 112215177 112215502 112215206 Y FAM109A,SH2B3,ALDH2 ALDH2 NA NA NA NA ALDH2 12486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 113644189 113644365 113644286 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA TPCN1 12490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 113903072 113903274 113903194 Y NA SDSL,RP11-82C23.2 NA NA NA NA RP11-82C23.2 4534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 114029271 114029455 114029396 Y LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-82C23.2 121463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 5.68024250479395 chr12 114833369 114833814 114833717 Y TBX5,TBX5 NA NA NA NA NA TBX3 286155 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 114842378 114842779 114842612 Y TBX5,TBX5,TBX5 NA NA NA NA NA TBX3 277190 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 116308098 116308555 116308414 Y NA NA RBM19,TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 404588 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 116946674 116946880 116946778 Y NA LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 119632995 119633391 119633197 Y TMEM233 NA NA NA NA NA CCDC60 137126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 121019899 121020145 121020000 Y NA COQ5,POP5,RPL11P5 NA NA NA NA POP5 2698 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 122014724 122015549 122015007 Y NA RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA RP13-941N14.1 1148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.49685864962855 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA MORN3 21809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 122897459 122897572 122897541 Y NA CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 7607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr12 123627472 123627989 123627683 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 4573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 123636095 123636496 123636485 Y NA PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 3533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 5.20688896272779 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 356195 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 125028947 125029179 125029054 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 336035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 125117108 125117622 125117163 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 247592 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 23288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr12 125765176 125765295 125765221 Y NA NA NA NA NA NA TMEM132B 95794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr12 129415293 129415562 129415333 Y NA NA NA NA NA NA GLT1D1 79321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 130012974 130013180 130013078 Y NA NA NA NA NA NA FZD10 631824 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr12 133065143 133065512 133065289 Y NA FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 1006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 21939171 21939396 21939283 Y NA NA NA NA NA NA MIPEPP3 68893 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 22000564 22000681 22000573 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 30828 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 22107257 22107449 22107379 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 75748 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 22545143 22545315 22545232 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7P10 343989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 23500406 23500844 23500578 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 12616 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 23733450 23734509 23733658 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 27137 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 23815337 23815738 23815537 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P6 109024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 24736701 24736916 24736809 Y NA NA NA NA NA NA MIPEP 275143 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 24839245 24839460 24839321 Y NA NA NA NA NA NA PARP4 245488 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 25115809 25116061 25115886 Y RNF17 PARP4 NA NA NA NA PARP4 30861 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 28968527 28968805 28968721 Y PAN3 NA NA NA NA NA EEF1A1P3 181877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 30722241 30722391 30722328 Y USPL1 NA HMGB1,LINC00426,KATNAL1,UBL3 IMR90 Hi-C 24141950 KATNAL1 157230 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 30812389 30812594 30812492 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL1 67027 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA USPL1 254727 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 33781660 33782051 33781892 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 140716 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 33788488 33788595 33788542 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 134172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr13 36630888 36631287 36631099 Y DCLK1 NA NA NA NA NA CCDC169 238690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 36853236 36853259 36853249 Y CCNA1,C13orf38 CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 NA NA NA NA CCDC169 16718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 37611695 37611945 37611820 Y NA EXOSC8,ALG5 NA NA NA NA ALG5 39297 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 38099023 38099410 38099217 Y NA NA NA NA NA NA POSTN 71571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 41624170 41624528 41624466 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 WBP4 8882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42137571 42138044 42137923 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 254230 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42188044 42188379 42188211 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 304703 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42225921 42226073 42225966 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 342580 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42280247 42280717 42280439 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 396906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42370920 42370928 42370925 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 473361 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 42646001 42646399 42646206 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 197890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 42942077 42942145 42942079 Y TNFSF11,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 97788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 43391123 43391178 43391135 Y EPSTI1 NA CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 173229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 43410663 43410880 43410773 Y NA NA CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 153527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 43617981 43618110 43618046 Y TNFSF11 DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 22642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 44740455 44740696 44740576 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 SERP2 205105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 44884974 44885381 44885134 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 60420 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 45059021 45059160 45059095 Y NA NA NA NA NA NA TSC22D1 90123 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 45711306 45711547 45711428 Y NA GTF2F2 NA NA NA NA GTF2F2 18656 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 46736375 46736487 46736423 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1 NA NA NA NA LCP1 47519 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr13 49130835 49131251 49131085 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 25466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 49136516 49136688 49136661 Y FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,CYSLTR2,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 31147 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 49615947 49616340 49616144 Y SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 67899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 50701411 50701707 50701686 Y ARL11 DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 3555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 51034237 51034585 51034411 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 100338 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 51200392 51200766 51200454 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 266493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 51620780 51620813 51620797 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 137932 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 52126260 52126496 52126383 Y INTS6,DHRS12,DHRS12,WDFY2 WDFY2 NA NA NA NA WDFY2 30148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA RP11-327P2.5 72877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 55208577 55208909 55208656 Y NA NA NA NA NA NA LINC00458 503576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 59432708 59433064 59432886 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1303057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr13 61754011 61754066 61754041 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 785420 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R2P10 1361781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA LINC00383 2332752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 73486233 73486587 73486410 Y NA NA NA NA NA NA DIS3 131999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 73982945 73982960 73982953 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 309822 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 555551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 74467154 74467532 74467385 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 794031 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 75800411 75800558 75800473 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 253692 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 80030193 80030565 80030379 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 22722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr13 81913928 81913973 81913949 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 1000842 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr13 87444403 87444606 87444585 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4553468 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 90465670 90466055 90465862 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1532019 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 38125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 95749553 95749872 95749713 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 201815 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 95926561 95926799 95926680 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 24888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 98926557 98926890 98926623 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 133741 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 99123285 99123381 99123333 Y NA NA NA NA NA NA STK24 104813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 99930007 99930140 99930028 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 78979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 99950103 99950501 99950500 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 99075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 99953890 99954205 99953920 Y NA NA NA NA NA NA UBAC2 102862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 99956842 99956954 99956899 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 105814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 99962652 99963115 99962844 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 111624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 123517 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 100084902 100085483 100085174 Y GPR183 NA MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 66188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100318044 100318289 100318076 Y ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA NA CLYBL 61125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100339200 100339671 100339308 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 82281 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100580859 100581019 100580939 Y NA ZIC5 PCCA,A2LD1,NALCN IMR90 Hi-C 24141950 ZIC5 41144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100641170 100641291 100641224 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 9144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 100642436 100643177 100642812 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 10410 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 101041976 101042276 101042034 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 240630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 102565701 102565995 102565836 Y FGF14,FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 681358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 102955015 102955394 102955376 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 291959 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 106751889 106752019 106751954 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 466493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr13 106777477 106777605 106777541 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 440907 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr13 106810133 106810294 106810212 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 408218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 107448247 107448283 107448269 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 134462 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 108099145 108099375 108099322 Y FAM155A NA NA NA NA NA LIG4 769341 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA LIG4 557375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 110039921 110040112 110039986 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 365503 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 110147333 110147690 110147511 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 257925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 110299478 110299796 110299637 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 105819 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 111174336 111174835 111174468 Y ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 37245 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr13 111819312 111819589 111819392 Y ING1,ING1,ING1,ANKRD10,ARHGEF7,ARHGEF7 NA NA NA NA NA ARHGEF7 54406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 112347236 112347393 112347316 Y NA NA SOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD44 356999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 112711940 112712042 112711992 Y NA SNORD44 NA NA NA NA SNORD44 7548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 113312485 113312628 113312557 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 30015 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr13 113388452 113388651 113388552 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 45809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 113434951 113435188 113435090 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 92308 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 171523 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr13 113549464 113549664 113549543 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 206821 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 113588902 113588931 113588917 Y NA NA MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 ATP11A 246259 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 114557275 114557469 114557370 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 7577 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr13 114944657 114944766 114944693 Y NA RASA3 ATP4B,TFDP1,RASA3,FLJ44054,CDC16,FAM70B IMR90 Hi-C 24141950 RASA3 48571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 21268104 21268276 21268208 Y NA RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 1161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 22961127 22961337 22961231 Y RBM23 NA DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 94838 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 23308431 23309148 23308805 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 4665 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 24006568 24006872 24006716 Y NA ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA ZFHX2 16529 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA AP1G2 128484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 24743214 24743836 24743517 Y DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2 NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA,DHRS1 NA NA NA NA RABGGTA 4269 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 27263370 27263754 27263562 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P6 1528828 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 28846944 28847285 28847115 Y FOXG1 NA NA NA NA NA RPL26P3 109831 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 29345370 29345639 29345447 Y FOXG1 CTD-2384A14.1 NA NA NA NA CTD-2384A14.1 47920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 31455672 31455729 31455709 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 36583 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 35625298 35625573 35625393 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 35543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 35754543 35755119 35754804 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 8704 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 38534360 38534722 38534543 Y NA NA NA NA NA NA FOXA1 467115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 975530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 41880555 41880659 41880564 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 194114 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 365 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr14 42212404 42212545 42212475 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 137631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 42980587 42980987 42980723 Y NA NA NA NA NA NA LRFN5 905814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 43816626 43817007 43816818 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1547491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 44072704 44073040 44072872 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1291458 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 48184413 48184780 48184597 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 516106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 50349630 50349838 50349718 Y RPL36AL,MGAT2,C14orf182,SOS2,ARF6 NEMF,ARF6 C14orf182,ARF6,SOS2,METTL21D IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF6 7972 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 81921 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA ABHD12B,PYGL NA NA NA NA ABHD12B 30993 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 52336144 52336756 52336579 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 45231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 53294197 53294464 53294329 Y NA GNPNAT1 FERMT2 IMR90 Hi-C 24141950 GNPNAT1 37811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 53302326 53302477 53302407 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 45940 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 53361596 53362059 53361840 Y NA NA NA NA NA NA FERMT2 55094 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 53575786 53575939 53575850 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 42061 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 54444458 54444658 54444588 Y NA NA BMP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDKN3 416909 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 55921336 55921695 55921412 Y NA ATG14 NA NA NA NA ATG14 44760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 59094580 59094799 59094664 Y NA DACT1 KIAA0586,DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DACT1 3886 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 59159760 59159979 59159850 Y NA NA DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DACT1 61075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 59861080 59861273 59861260 Y DAAM1,RTN1 NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 JKAMP 87888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 62110411 62110684 62110506 Y HIF1A HIF1A NA NA NA NA HIF1A 49547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 62115448 62115553 62115501 Y PRKCH,SYT16 HIF1A NA NA NA NA HIF1A 44678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 62625618 62625869 62625715 Y NA NA RHOJ,KCNH5 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 328531 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 64358003 64358294 64358235 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 40320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 65256809 65256946 65256906 Y NA NA PLEKHG3 IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 87655 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 66856568 66856818 66856763 Y GPHN NA NA NA NA NA GPHN 115307 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 67998625 67999040 67998762 Y NA NA NA NA NA NA PIGH 65964 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 68005927 68006205 68006064 Y MPP5,TMEM229B,PLEKHH1 NA NA NA NA NA PIGH 58799 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 69047219 69047274 69047247 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 160306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr14 72021176 72021324 72021237 Y SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 234645 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 72397692 72397730 72397711 Y SIPA1L1,RGS6,RGS6,RGS6 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 611161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 72650490 72650870 72650581 Y NA NA NA NA NA NA DCAF4 740170 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 73100225 73100572 73100516 Y NA NA RGS6,DPF3 IMR90 Hi-C 24141950 DCAF4 290468 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 73595262 73595380 73595321 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 5746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 73919503 73919783 73919743 Y NA NUMB,C14orf169 NA NA NA NA NUMB 8565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 74918684 74918707 74918696 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 VRTN IMR90 Hi-C 24141950 MIR4709 26200 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 75084188 75084360 75084254 Y PGF,EIF2B2 LTBP2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LTBP2 6882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 76401422 76401643 76401519 Y ESRRB,TGFB3 IFT43 NA NA NA NA IFT43 34943 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA IFT43 147497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 365625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 79406333 79406507 79406344 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1141907 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 79756853 79757329 79757011 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1492427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 80161976 80161991 80161984 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 1261870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 80241894 80242194 80242045 Y DIO2 NA NA NA NA NA CEP128 1181667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr14 84176891 84176909 84176900 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 2178686 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 88531180 88531607 88531441 Y KCNK10 NA NA NA NA NA GALC 73171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 89466992 89467193 89467101 Y FOXN3 NA EFCAB11,FOXN3,PRO1768,EML5,TTC8,LOC400236,TDP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 178495 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 89470593 89470919 89470743 Y FOXN3 NA EFCAB11,EML5,TTC8,FOXN3,TDP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 182096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 125810 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA CAP2P1 131285 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 89933895 89934174 89934034 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 149319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 89950912 89951066 89950980 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 132427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 90083286 90083622 90083526 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 91423143 91423331 91423289 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA C14orf159 101346 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 129226 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 91759632 91759894 91759768 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 122294 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 91830447 91830798 91830608 Y SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 51390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 94121988 94122062 94121998 Y FAM181A,FAM181A,FAM181A,PRIMA1 NA NA NA NA NA COX8C 310451 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 95680303 95680655 95680479 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 57956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 95779970 95780439 95780333 Y DICER1,CLMN CLMN NA NA NA NA CLMN 3804 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 96086261 96086587 96086424 Y NA RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 1010 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr14 97043507 97043643 97043575 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLA 77737 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 97282222 97282363 97282293 Y NA VRK1 NA NA NA NA VRK1 20581 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 99132884 99133181 99132894 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 602680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr14 99700697 99700801 99700734 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 35060 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr14 99711955 99712816 99712233 Y NA BCL11B NA NA NA NA BCL11B 23045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 91505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 128705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 100566376 100566553 100566536 Y EVL NA NA NA NA NA DEGS2 57947 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 100768169 100768349 100768287 Y NA SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 2535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 100804523 100804880 100804765 Y NA SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 26085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 101162987 101163312 101163166 Y NA DLK1 WARS,WDR25,LINC00523,DLK1,MEG3,MIR2392,SNORD113-7,SNORD113-5,SNORD113-6,SNORD113-4,SNORD113-9 IMR90 Hi-C 24141950 DLK1 26730 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 101370822 101370975 101370899 Y BEGAIN,RTL1 RP11-123M6.2,MEG8,SNORD113-3,SNORD113-4,SNORD114-1 NA NA NA NA MEG8 11715 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 101454914 101455185 101454975 Y DLK1,RTL1 SNORD114-1,SNORD114-13,SNORD114-14,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21,MIR543 NA NA NA NA SNORD114-21 8602 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-1029J19.5 6569 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 102277268 102277494 102277347 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 51133 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 102997284 102997579 102997375 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 MIR4309,RCOR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 23148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 123915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 103878784 103878999 103878892 Y NA MARK3 NA NA NA NA MARK3 29055 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 104435433 104435522 104435478 Y NA C14orf2,TDRD9 NA NA NA NA TDRD9 42634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 104601589 104601707 104601649 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 1353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 104616017 104616378 104616259 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 12957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 105132512 105132664 105132612 Y TMEM179,INF2 INF2 NA NA NA NA INF2 21279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr14 105949862 105949973 105949911 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 1563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 20500145 20500389 20500187 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 2043700 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1946869 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 25604152 25604594 25604190 Y SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 77534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 25606189 25606253 25606221 Y UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 75875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 26106001 26106167 26106105 Y UBE3A,ATP10A ATP10A NA NA NA NA ATP10A 2150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 27014024 27014086 27014055 Y GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5 NA NA NA NA NA GABRA5 95424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 31372759 31373034 31372889 Y MTMR10 NA NA NA NA NA MTMR10 90949 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 31620735 31621235 31621017 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 3677 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 33994157 33994391 33994274 Y NA NA NA NA NA NA AVEN 334986 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 35354346 35354732 35354466 Y NA NA ATPBD4,ZNF770 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 75858 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.26018187859547 chr15 35376835 35377041 35376987 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 98347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr15 35588902 35588944 35588923 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 310414 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 37169508 37169702 37169583 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 221802 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 38309756 38310203 38310060 Y NA NA SPRED1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 232324 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 38376586 38376698 38376641 Y NA NA SPRED1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 165829 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 39559141 39559459 39559346 Y NA NA NA NA NA NA THBS1 311821 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 39559889 39560120 39560079 Y NA NA NA NA NA NA THBS1 311160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 39702122 39702492 39702291 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 168788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr15 40460566 40460976 40460804 Y NA BUB1B,PAK6 NA NA NA NA BUB1B 9342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 43081091 43081306 43081168 Y NA NA NA NA NA NA CDAN1 53767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA NA NA NA NA NA SPATA5L1 200197 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 50356629 50356698 50356664 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 115695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 50358473 50358749 50358576 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 113644 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 52684587 52684775 52684686 Y NA NA NA NA NA NA MYO5C 98592 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 53034525 53034782 53034651 Y NA NA NA NA NA NA RP11-209K10.2 60357 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 53804819 53805218 53805019 Y NA NA NA NA NA NA WDR72 247857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 56475345 56475479 56475412 Y RFX7 NA NA NA NA NA TEX9 58728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM ZNF444P1,RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr15 60142100 60142185 60142180 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP6 83557 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 60818402 60818756 60818740 Y RORA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA RP11-219B17.1 49025 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 61329284 61329972 61329593 Y NA NA NA NA NA NA RORA 189546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 62017918 62017955 62017937 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 332717 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 63372629 63373133 63372992 Y NA TPM1,LACTB NA NA NA NA LACTB 38866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 63484209 63484716 63484320 Y LACTB,USP3,RAB8B RPS27L,RAB8B APH1B IMR90 Hi-C 24141950 RAB8B 4541 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 63771566 63772233 63772016 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 22560 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,AC069368.3,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 AC069368.3 3874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 NA NA NA NA NA PLEKHO2 53563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65657580 65657851 65657711 Y NA IGDCC3 NA NA NA NA IGDCC3 10527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65841762 65842141 65841952 Y PARP16 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 21006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 68852393 68852527 68852460 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 16781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 69087536 69088004 69087836 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 20556 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 70850665 70850865 70850772 Y NA NA KIF23 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 203067 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 72671459 72671771 72671611 Y PARP6,ARIH1,HEXA HEXA,RP11-106M3.1 NA NA NA NA RP11-106M3.1 1408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 73255768 73256006 73255887 Y NA NA NEO1,ADPGK,HIGD2B,BBS4,LOC100287559 IMR90 Hi-C 24141950 NEO1 86045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 73435699 73435965 73435801 Y NEO1,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 93648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 73538661 73539057 73538860 Y NEO1 NA NA NA NA NA HCN4 120548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 74909072 74909376 74909224 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 20231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75328661 75328897 75328778 Y MAN2C1,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 14765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 76218014 76218024 76218019 Y NA FBXO22 NA NA NA NA FBXO22 23814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 76455838 76456047 76455943 Y NA NA NA NA NA NA C15orf27 105660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr15 77739736 77739821 77739778 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 28982 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 78110584 78110799 78110731 Y LINGO1 LINGO1 NA NA NA NA LINGO1 443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr15 78340097 78340467 78340288 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 27599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 78342444 78343156 78342879 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 24910 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 78536987 78537366 78537177 Y NA DNAJA4 NA NA NA NA DNAJA4 17062 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr15 80240668 80240846 80240766 Y ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA ST20-MTHFS 26572 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 80265919 80266168 80266026 Y MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 NA NA NA NA NA ST20-MTHFS 51823 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 82061645 82062005 82061987 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 274477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 82202578 82202690 82202619 Y NA NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 133792 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 82302959 82303245 82303102 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 33237 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 83376680 83377056 83376874 Y NA RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA AP3B2 14 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 89027924 89028249 89027989 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 19240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 89536188 89536571 89536367 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 81546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 89795623 89795958 89795791 Y NA FANCI NA NA NA NA FANCI 10443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 89878895 89879173 89879043 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 2803 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A NA NA NA NA KIF7 877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 90241907 90242276 90242092 Y NA KIF7,PEX11A NA NA NA NA PEX11A 9893 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 90581471 90581912 90581727 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 38847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA CTD-3094K11.1 NA NA NA NA CTD-3094K11.1 49218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 91412875 91413318 91412960 Y IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES CTD-3094K11.1,FURIN,MAN2A2 NA NA NA NA FURIN 3053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 92236778 92236791 92236785 Y NA NA SV2B IMR90 Hi-C 24141950 SLCO3A1 158134 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 5626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 96895727 96895870 96895799 Y NA NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 28560 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 196829 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99403545 99404056 99403701 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 213345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 101787304 101787467 101787386 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 2670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 102023301 102023573 102023437 Y NA PCSK6 NA NA NA NA PCSK6 39832 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr15 102213485 102213850 102213667 Y NA TM2D3,TARSL2 NA NA NA NA TM2D3 22891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 575519 575832 575766 Y NHLRC4 PIGQ NA NA NA NA PIGQ 39163 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA PRSS21,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS22 20027 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 3031604 3031823 3031757 Y PAQR4 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA PKMYT1 3064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 3858926 3859164 3859045 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 69563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 4424244 4424335 4424249 Y CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 4395 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 8041589 8041898 8041750 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 671642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 8852303 8852368 8852337 Y NA PMM2,TMEM186 PMM2,TMEM186 IMR90 Hi-C 24141950 PMM2 28312 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 8932650 8933046 8932848 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 27820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 9277609 9277994 9277792 Y NA NA ATF7IP2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 94104 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.15359604686012 chr16 9325793 9326174 9325910 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 142288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 9583805 9584097 9583876 Y NA NA GRIN2A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 400300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 11405627 11405832 11405704 Y NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 57591 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 11422424 11422652 11422552 Y NA NA CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 74388 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 12630003 12630276 12630127 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 265598 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 14050567 14050869 14050623 Y MKL2 ERCC4 NA NA NA NA ERCC4 38553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 14377810 14378205 14378026 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 214632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 14529113 14529156 14529135 Y NA NA NA NA NA NA PARN 195429 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 14752031 14752218 14752119 Y NA PARN,BFAR NA NA NA NA BFAR 27359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 15140552 15140757 15140655 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 7164 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 15769690 15769796 15769712 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 34566 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 17328915 17329184 17329121 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 233554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 17471383 17471727 17471579 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 91011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 19893504 19893863 19893602 Y NA GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 1626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 22432961 22433094 22433028 Y NA SMG1P1,CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA SMG1P1 13235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 24679861 24680253 24680057 Y NA NA TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 58763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 25104411 25104695 25104554 Y NA LCMT1 SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 LCMT1 16355 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 25723900 25724286 25724093 Y ZKSCAN2,HS3ST4 HS3ST4 NA NA NA NA HS3ST4 22553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 28108728 28108802 28108745 Y APOBR,XPO6 GSG1L NA NA NA NA GSG1L 35898 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14 PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA BCL7C,CTF1 NA NA NA NA BCL7C 27675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr16 34377841 34378195 34377988 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2494762 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr16 34956727 34956933 34956830 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3073648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 46392244 46392645 46392447 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD26P1 208364 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 46406585 46406940 46406771 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD26P1 194069 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 46792369 46792477 46792422 Y MYLK3 NA MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 ORC6 70814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 49056369 49056621 49056485 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 404310 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 55921292 55921652 55921472 Y MMP2 NA NA NA NA NA GNAO1 301650 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 56458239 56458402 56458321 Y NA AMFR,OGFOD1,NUDT21 NA NA NA NA AMFR 789 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 57703353 57703558 57703535 Y FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 64084 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 64377838 64377886 64377853 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 780129 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 66164410 66164809 66164674 Y NA NA LOC283867,CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 275618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 66170755 66170866 66170865 Y NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 269561 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 66659405 66659873 66659770 Y NA CMTM3 NA NA NA NA CMTM3 23628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA CES2 21759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 67150652 67150777 67150712 Y LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70 C16orf70,TRADD NA NA NA NA C16orf70 8791 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 67278264 67278626 67278472 Y RRAD,C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,ACD,LRRC29,LRRC29,PLEKHG4,FHOD1 ELMO3,TMEM208,FHOD1,PLEKHG4 NA NA NA NA FHOD1 935 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 68039646 68040046 68039896 Y SLC7A6OS,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3,DDX28 SLC12A4,DPEP3,DDX28 DPEP3,DPEP2 IMR90 Hi-C 24141950 DDX28 15724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 68415381 68415552 68415488 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-30P 53949 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 CDH1 NA NA NA NA CDH1 49086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 69106233 69106613 69106351 Y NA HAS3,CHTF8 NA NA NA NA HAS3 30854 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.73353542066163 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 70564094 70564236 70564165 Y NA COG4,SF3B3,SNORD111B,IL34 NA NA NA NA SNORD111B 2682 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 72257967 72258413 72258290 Y NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 131637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr16 73461043 73461303 73461173 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 369446 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 74545615 74545910 74545763 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 93102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr16 75294692 75295061 75294835 Y TERF2IP,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 4890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 75359436 75359702 75359569 Y NA NA BCAR1 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR1 59485 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 75594050 75594208 75594144 Y NA TMEM231,GABARAPL2 CHST5,TMEM231 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GABARAPL2 4041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 80710391 80710578 80710565 Y NA NA NA NA NA NA CDYL2 125648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 82172740 82172851 82172799 Y SDR42E1 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 28980 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 82600130 82600149 82600140 Y NA NA CDH13 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 58259 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 82693893 82694152 82693974 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 35485 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 410992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 83835897 83836084 83835978 Y NA HSBP1 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSBP1 3364 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 84177434 84177775 84177582 Y NA MBTPS1,HSDL1,TAF1C,ADAD2 NA NA NA NA HSDL1 637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 84424110 84424272 84424217 Y NECAB2 ATP2C2 NA NA NA NA ATP2C2 23977 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 84788106 84788226 84788167 Y COTL1 NA NA NA NA NA USP10 56522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 85020713 85021068 85020917 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 22073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 9.46707084132326 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 85995905 85996102 85996008 Y NA NA IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 65496 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 88448195 88448445 88448286 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 69280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 89101477 89101571 89101537 Y NA NA ACSF3,CBFA2T3,LOC400558,LINC00304,CDH15 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 51212 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.15359604686012 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 518432 518691 518584 Y NA RPS4XP17 NA NA NA NA RPS4XP17 40096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 576455 576740 576580 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 17668 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 1046722 1046841 1046786 Y NA NA NA NA NA NA ABR 83474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 1134847 1135025 1134980 Y WDR81,WDR81,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR ABR,CRK,YWHAE,INPP5K,LOC100306951,PITPNA,SCARF1,RILP IMR90 Hi-C 24141950 ABR 4532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 1585953 1586309 1586247 Y NA RILP,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA PRPF8 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 1986889 1987344 1987111 Y MNT,SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 43562 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 2241529 2241816 2241651 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA TSR1 2728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 2652547 2653322 2653300 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 158043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 263315 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 457619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 3289388 3289823 3289641 Y SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA NA NA NA NA NA SHPK 247793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 13.0172224068195 chr17 3791812 3792145 3792008 Y GSG2 C17orf85,CAMKK1 NA NA NA NA CAMKK1 4040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4297300 4297441 4297368 Y NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29377 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4297689 4298014 4297723 Y NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29766 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4299458 4299796 4299670 Y MYBBP1A,UBE2G1 UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 31535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA C17orf107,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA C17orf107 10934 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA ZFP3,AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 5455197 5455437 5455334 Y ZFP3,ZNF232,NLRP1 NA MIS12,DERL2 IMR90 Hi-C 24141950 DERL2 67066 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 5813088 5813344 5813243 Y NA NA NA NA NA NA WSCD1 139534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 6924662 6924902 6924783 Y BCL6B ALOX12,RNASEK,C17orf49,BCL6B NA NA NA NA BCL6B 323 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B ALOX12,RNASEK,C17orf49,BCL6B NA NA NA NA BCL6B 813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.55015156549622 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 8869986 8870720 8870441 Y PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 2957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 9368693 9368815 9368742 Y GAS7 NA NA NA NA NA STX8 109093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 10747016 10747338 10747115 Y NA RPL15P21 PIRT MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL15P21 15441 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 13463603 13463645 13463626 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 39599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 15368147 15368483 15368202 Y NA NA NA NA NA NA TEKT3 125189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 15869590 15869983 15869922 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 23359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 15895023 15895192 15895111 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 5502 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 16487545 16487788 16487743 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 17025 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 17493657 17493822 17493814 Y RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT PEMT NA NA NA NA PEMT 635 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr17 17687276 17687668 17687631 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 50657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 17725605 17725781 17725666 Y NA SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 12544 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr17 18242712 18242812 18242762 Y FBXW10,SHMT1 TOP3A,SMCR8,SHMT1 NA NA NA NA SHMT1 22044 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 19398359 19398685 19398615 Y NA AC004448.5,SLC47A1 SLC47A2,B9D1,EPN2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 1661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA AC004448.5,SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr17 21360373 21360746 21360457 Y NA NA USP22,MAP2K3,KCNJ12,C17orf51 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ12 82864 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 21908682 21908761 21908685 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 432960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 25620233 25620423 25620280 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 1131 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 26458610 26458889 26458687 Y NA NA NA NA NA NA NLK 91847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 26578258 26578420 26578387 Y NA NA NA NA NA NA TMEM97 65701 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 26870881 26871048 26870951 Y NA UNC119,PIGS,ALDOC NA NA NA NA UNC119 6638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42A,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 27189702 27189769 27189736 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 9746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 27299558 27299805 27299699 Y NA PHF12,SEZ6 NA NA NA NA PHF12 22769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 27405810 27406234 27406188 Y NA NA NA NA NA NA SEZ6 74352 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 28031718 28032050 28032008 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 83793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 28928053 28928382 28928251 Y NA SMURF2P1,LRRC37BP1 NA NA NA NA SMURF2P1 2239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 116550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 29717293 29717639 29717335 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr17 29719593 29719962 29719805 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 2951 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 175492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 30593810 30594211 30593930 Y NA NA NA NA NA NA C17orf75 80831 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 31733043 31733261 31733152 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 480115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 32426847 32427221 32427145 Y TMEM132E,C17orf102,ACCN1 NA NA NA NA NA CCL2 153083 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 33383216 33383365 33383329 Y SLFN5,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 30973 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA RASL10B RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 RASL10B 10853 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 36853458 36853679 36853598 Y NA C17orf96,MLLT6,CISD3 NA NA NA NA MLLT6 6116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 36996415 36996671 36996600 Y SOCS7,FBXO47,C17orf98 PIP4K2B,CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA SNORA21 10576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 37010933 37011093 37011014 Y FBXO47,C17orf98 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA RPL23 2837 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 37751880 37751882 37751881 Y NA PPP1R1B,STARD3 NA NA NA NA PPP1R1B 29111 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 4628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 40155760 40155995 40155877 Y STAT5A CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 5405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 40163251 40163440 40163343 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 1851 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr17 42425585 42425836 42425708 Y TMUB2,TMUB2,GRN SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA GRN 4971 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 42589268 42589584 42589359 Y C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104 GPATCH8,FZD2 ATXN7L3,GPATCH8 K562 ChIA-PET 22265404 GPATCH8 10470 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 42919802 42920006 42919936 Y NA GJC1 NA NA NA NA GJC1 13618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 43253543 43253622 43253574 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 17476 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 NA NA NA NA NA HEXIM2 69098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 43951029 43951274 43951198 Y NA MAPT NA NA NA NA MAPT 18474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 44896658 44896796 44896753 Y WNT3,WNT9B NA NA NA NA NA RPS7P11 99125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr17 45983662 45984115 45983847 Y CDK5RAP3 SP2,AC003665.1,PNPO PNPO IMR90 Hi-C 24141950 SP2 12146 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 47092021 47092148 47092036 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 19247 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 47099859 47100181 47099940 Y PRAC,IGF2BP1 IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 27085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr17 47290816 47291067 47290942 Y GNGT2 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 15061 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 47586040 47586243 47586212 Y NA NGFR NA NA NA NA NGFR 15385 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 48348027 48348139 48348077 Y COL1A1,TMEM92 TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 1260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 50795913 50796132 50795928 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 1037099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 54669912 54670125 54669969 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 852 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 54994598 54994773 54994687 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 5199 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55706775 55707069 55706919 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 218348 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55801190 55801558 55801374 Y NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 123859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 80172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 58228760 58229091 58228985 Y VMP1,USP32,PPM1D,CA4 CA4 NA NA NA NA CA4 3463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 58467674 58467818 58467746 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 30013 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 59232853 59233252 59232919 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 433311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 59780215 59780354 59780263 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 113652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 60250221 60250413 60250340 Y NA NA NA NA NA NA RPS23P7 222345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 61282907 61283291 61283099 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 238448 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 61514078 61514307 61514301 Y SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561 CYB561,ACE NA NA NA NA CYB561 7432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 63035715 63036037 63035950 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 14920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 63043139 63043174 63043152 Y NA GNA13 NA NA NA NA GNA13 7783 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 99004 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 64524337 64524637 64524487 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 227583 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 64963064 64963179 64963122 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 4038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 65242250 65242562 65242536 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 2145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 65318264 65318584 65318454 Y NA PSMD12 NA NA NA NA PSMD12 42159 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 65470400 65470556 65470469 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 98825 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 66379549 66379922 66379702 Y SLC16A6,WIPI1 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 71732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 66380161 66380700 66380381 Y SLC16A6 NA NA NA NA NA WIPI1 70954 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 66595732 66596064 66595787 Y NA FAM20A NA NA NA NA FAM20A 202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 66597881 66598319 66598164 Y FAM20A FAM20A NA NA NA NA FAM20A 2351 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 66607533 66607779 66607649 Y NA FAM20A NA NA NA NA FAM20A 12003 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 66618888 66618909 66618898 Y NA FAM20A ABCA10,ABCA8,ABCA9 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20A 23358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 68262582 68262864 68262748 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 AC002539.1 139582 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 69824557 69824843 69824637 Y NA NA NA NA NA NA LINC01152 199589 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 70878407 70878514 70878507 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 208337 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 71286924 71287020 71286972 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 19294 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 71639437 71639585 71639501 Y SDK2 SDK2 NA NA NA NA SDK2 1209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 71909993 71910008 71910001 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 271765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 72247418 72247796 72247504 Y NA RPL38,TTYH2 NA NA NA NA TTYH2 39765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 73032786 73033119 73032977 Y TSEN54,GGA3 ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5 NA NA NA NA KCTD2 6116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 73319762 73319905 73319788 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 36171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 12787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74188633 74188942 74188716 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 31945 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74189615 74189996 74189806 Y RNF157 ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 30891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74195648 74195812 74195731 Y UBE2O,AANAT,FBF1,RNF157,FAM100B ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 25075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74359249 74359572 74359412 Y RHBDF2,SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 PRPSAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPHK1 11093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74444372 74444742 74444506 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 2546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr17 75096190 75096538 75096428 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 15392 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 229848 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 75769300 75769393 75769353 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 144787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 56.0923947348403 chr17 75955923 75956319 75956134 Y TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 41743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 76023092 76023250 76023241 Y NA NA NA NA NA NA TMC6 103238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 76770526 76771358 76771190 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 5021 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 76912078 76912524 76912123 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 6945 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 77814369 77814482 77814427 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 3141 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 78901796 78901941 78901869 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 61457 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 79126074 79126501 79126440 Y C17orf56 NA NA NA NA NA AZI1 68298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA NA SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A10 72354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 40195 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr17 80029941 80030069 80030002 Y HEXDC STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA DUS1L 8178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr17 80328282 80328672 80328333 Y NA TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 13159 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr17 80712796 80713169 80712899 Y ZNF750,TBCD FN3KRP,FN3K,TBCD NA NA NA NA TBCD 4856 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 10894 11221 11019 Y NA NA NA NA NA NA USP14 145162 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 410446 410458 410452 Y ADCYAP1,ADCYAP1 NA NA NA NA NA COLEC12 88264 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 781638 782117 782009 Y NA RNU1-109P,YES1 NA NA NA NA RNU1-109P 14019 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 RNU1-109P,YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr18 1888648 1888915 1888782 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP72 566562 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 2223503 2223515 2223509 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 345993 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 2549022 2549121 2549072 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 20387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.6034444813639 chr18 3508912 3509046 3509010 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 3923986 3924227 3923998 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 514380 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P27 565211 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 6187863 6188007 6187935 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P27 273007 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 8661812 8662039 8661951 Y NA NA ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 54369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 9554563 9554587 9554575 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 58651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 11431991 11432229 11432112 Y NA NA NA NA NA NA GNAL 254726 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 11846235 11846388 11846281 Y GNAL,GNAL CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 3007 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 12092408 12092760 12092594 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 113384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 12777545 12777688 12777651 Y NA NA NA NA NA NA CEP76 76769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 12882540 12883190 12882840 Y PTPN2 PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 44452 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 20913960 20914007 20913982 Y NA NA NA NA NA NA TMEM241 101918 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA NPC1 171390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 21337339 21337459 21337412 Y C18orf45 NA NA NA NA NA NPC1 172477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 14.673959804051 chr18 23255522 23255766 23255604 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 325368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 24251818 24252166 24251992 Y KCTD1 KCTD1 NA NA NA NA KCTD1 16453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 25536974 25537193 25537082 Y NA NA NA NA NA NA CHST9 773693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 26915236 26915445 26915422 Y NA NA NA NA NA NA DSC3 1705336 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 28830890 28831119 28831005 Y NA NA NA NA NA NA DSC2 150512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 29441885 29441939 29441912 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC8 89160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr18 32413678 32413828 32413755 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 141064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 32440585 32440846 32440600 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 114046 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 32619678 32619870 32619774 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 64786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 32800058 32800164 32800111 Y DTNA,ZNF397 ZNF397 NA NA NA NA ZNF397 18830 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 33057648 33057699 33057650 Y MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C INO80C NA NA NA NA INO80C 18256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 35114898 35115196 35115047 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 707740 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA5 55657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 45353824 45354074 45353943 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 101441 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 46375185 46375303 46375244 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 311768 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 397724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 46467138 46467469 46467322 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 403721 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 46486224 46486525 46486411 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 422807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 46518186 46518409 46518369 Y NA NA CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTIF 454769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 47620136 47620367 47620252 Y NA NA NA NA NA NA CCDC11 170525 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 48301659 48301815 48301762 Y NA NA NA NA NA NA ME2 101604 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 54140840 54141163 54141035 Y NA NA TCF4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR7 175411 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 56188664 56188776 56188720 Y NEDD4L NA NA NA NA NA SNORD28 77087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 56199819 56200128 56199981 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 65735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 10091 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 56701404 56701604 56701510 Y ALPK2 NA NA NA NA NA SEC11C 103105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 67683360 67683665 67683513 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 187516 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 70814652 70814839 70814746 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 998261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 70998412 70998732 70998572 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 814368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 71010965 71011298 71011132 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 801802 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr18 73966259 73966767 73966600 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 238379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 74230733 74230810 74230772 Y NA ZNF516 ZNF516,LOC284276 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF516 25587 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 74399023 74399139 74399084 Y NA NA LOC284276,ZNF516 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF236 133424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 74837664 74837983 74837939 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 305101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 76828001 76828378 76828185 Y NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 716 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr18 77218531 77218849 77218576 Y NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 64675 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr18 77713083 77713430 77713261 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 3419 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 384369 384669 384409 Y SHC2,C2CD4C,MIER2 MIER2,C2CD4C NA NA NA NA C2CD4C 22470 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA MADCAM1 5383 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 555976 556322 556024 Y NA CDC34,GZMM,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 12975 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,GZMM,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 1909763 1910077 1909925 Y KLF16 KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA ADAT3 6386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 2804437 2804563 2804500 Y NA SGTA,THOP1,ZNF554,ZNF555 NA NA NA NA ZNF554 13309 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 3131132 3131258 3131157 Y NA GNA11 NA NA NA NA GNA11 38724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 3969049 3969183 3969116 Y NA SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA DAPK3 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B PLIN5 EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN5 42052 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 5536566 5536826 5536635 Y NA NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 84220 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 5578316 5578496 5578453 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 42550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA ACSBG2 75501 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 6600003 6600291 6600148 Y NA CD70 NA NA NA NA CD70 1823 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1 NA NA NA NA C19orf45 7486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 7563641 7563779 7563686 Y PCP2,EVI5L,C19orf45,PNPLA6,PNPLA6 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1 NA NA NA NA PEX11G 3306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 7701239 7701460 7701364 Y NA CAMSAP3,XAB2,STXBP2,TRAPPC5 NA NA NA NA STXBP2 1472 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 10215397 10215725 10215533 Y TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,FBXL12,ICAM3,C19orf66,PPAN C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G NA NA NA NA PPAN 432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 11375157 11375492 11375297 Y DOCK6 DOCK6 TSPAN16 MCF7 ChIA-PET 22265404 DOCK6 4000 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 11675625 11675958 11675811 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 7436 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 12245844 12245929 12245887 Y NA ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF20 3293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 12261625 12261922 12261774 Y NA ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136,CTD-2666L21.1 NA NA NA NA ZNF625 3624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 12270640 12270828 12270733 Y NA ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136,CTD-2666L21.1 NA NA NA NA ZNF136 1051 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr19 12427205 12427564 12427426 Y NA ZNF44,ZNF563,ZNF442 NA NA NA NA ZNF563 14970 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 13975574 13976059 13975671 Y CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 38955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 14241315 14241555 14241521 Y NA SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA ASF1B 4213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 14404408 14404769 14404597 Y NA NA NA NA NA NA CD97 84544 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr19 14414232 14414293 14414263 Y NA NA NA NA NA NA CD97 75020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 14665322 14665552 14665478 Y SLC1A6 TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 15322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 15492858 15492952 15492905 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 4249 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 16279649 16279838 16279744 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 HSH2D,FAM32A,AP1M1 NA NA NA NA FAM32A 14353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18588665 18588964 18588926 Y NA ISYNA1,ELL NA NA NA NA ISYNA1 41554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 19562909 19563265 19563209 Y RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 61280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 19572734 19572965 19572860 Y MAU2,GATAD2A,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 51580 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 21505293 21505670 21505490 Y ZNF429,ZNF708,ZNF493 ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 4557 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 21511296 21511520 21511376 Y NA ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 1069 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 1908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 27733888 27734761 27733974 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1967687 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 28335206 28335537 28335292 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1366911 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 30864626 30864772 30864676 Y ZNF536 NA NA NA NA NA URI1 452075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 31209983 31210381 31210125 Y ZNF536 NA NA NA NA NA TSHZ3 628072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 33049643 33049878 33049760 Y NA PDCD5 NA NA NA NA PDCD5 20096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 33796303 33796393 33796348 Y SLC7A9,CEBPA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 4833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 35464346 35464465 35464376 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A GRAMD1A,LOC100128675,ZNF599,ZNF30,ZNF792,HPN,SCN1B,FXYD1,FXYD3,FXYD7,LGI4,FXYD5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF792 11393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 35557782 35557965 35557875 Y MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4 HPN,FXYD3 NA NA NA NA HPN 28372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 UPK1A-AS1 31058 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 36274503 36274656 36274589 Y GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,HSPB6,C19orf55,ARHGAP33 NA NA NA NA ARHGAP33 11069 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 36400295 36400642 36400477 Y FFAR2,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP APLP1,NFKBID,TYROBP,LRFN3 NA NA NA NA TYROBP 3098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 36648389 36648571 36648491 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1 NA NA NA NA COX7A1 6618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 36879565 36879874 36879872 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 11464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1,SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA DPF1 773 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 39453898 39453904 39453901 Y NA MRPS12,SARS2,FBXO17 NA NA NA NA FBXO17 10646 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 39849240 39849632 39849436 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36 MED29,PAF1 IMR90 Hi-C 24141950 SAMD4B 18204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 41037324 41037469 41037389 Y ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4 SHKBP1 NA NA NA NA SHKBP1 43288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA RPL36P16,CYP2S1 CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36P16 8178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.55015156549622 chr19 41701582 41701929 41701850 Y CYP2A13,CYP2F1 RPL36P16,CYP2S1 NA NA NA NA CYP2S1 4628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42501283 42501478 42501381 Y TMEM145 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 1634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42532310 42532673 42532485 Y NA ATP1A3,ZNF574 NA NA NA NA ATP1A3 32661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42606774 42607144 42606983 Y NA ZNF574 NA NA NA NA ZNF574 36145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 42722677 42722859 42722787 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA ZNF526 254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 42964614 42965000 42964807 Y CEACAM8,DEDD2 NA CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM1 98386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 44138598 44138945 44138732 Y ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4 IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA CADM4 3046 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 45995542 45995743 45995643 Y NANOS2,NKPD1,EXOC3L2 FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA RTN2 2576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 46014236 46014617 46014413 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 6399 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 46385401 46385465 46385433 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1911 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 7192 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr19 47062362 47062544 47062453 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 2464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr19 47854917 47855115 47854986 Y ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 4379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 47892475 47892975 47892646 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 27805 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 47961170 47962467 47962382 Y SLC8A2 MEIS3,SLC8A2,KPTN NA NA NA NA SLC8A2 10958 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA EHD2 62472 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48293591 48293754 48293716 Y CABP5,CRX GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80 NA NA NA NA RPL23AP80 2393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48642255 48642637 48642446 Y NA LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 29223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 48927915 48927964 48927940 Y NA KDELR1,GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA GRWD1 19066 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 48974873 48974967 48974920 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 4584 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 49590520 49590786 49590652 Y NA SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 3844 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50276330 50276635 50276461 Y VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25 AP2A1,FUZ,MED25 NA NA NA NA AP2A1 8105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50413852 50414197 50414025 Y LOC645971,NR1H2 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15762 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50825197 50825861 50825498 Y NA NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA NR1H2 5049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50990086 50990332 50990328 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 12076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 51111018 51111676 51111369 Y NA LRRC4B,C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 39026 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 51774338 51774710 51774481 Y NA IGLON5 NA NA NA NA IGLON5 38392 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 51796169 51796569 51796297 Y NA IGLON5 CD33,IGLON5 IMR90 Hi-C 24141950 IGLON5 16533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr19 51797467 51797679 51797598 Y NA IGLON5 CD33,IGLON5 IMR90 Hi-C 24141950 IGLON5 15423 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 52996616 52996734 52996658 Y NA ZNF578,ZNF808 NA NA NA NA ZNF808 32171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.55015156549622 chr19 54052581 54053344 54052712 Y NA NA NA NA NA NA ZNF813 83592 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 54168099 54168226 54168160 Y ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX NA NA NA NA NA AC008753.3 108627 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr19 54286017 54286259 54286128 Y ZNF765,ZNF761,ZNF813 AC008753.3,MIR371A,NLRP12 NA NA NA NA MIR371A 2670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 54288550 54288757 54288603 Y ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX AC008753.3,MIR371A,NLRP12 NA NA NA NA MIR371A 172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr19 54291187 54291209 54291198 Y BIRC8,ZNF845,ZNF765,ZNF761,ZNF813 AC008753.3,MIR371A,NLRP12 NA NA NA NA MIR371A 2258 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr19 54291781 54292027 54291904 Y ZNF331,DPRX,NLRP12 AC008753.3,MIR371A,NLRP12 NA NA NA NA MIR371A 2852 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NLRP12,MYADM,PRKCG,CACNG7 NA NA NA NA MYADM 6258 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 54433325 54433420 54433359 Y TARM1,ZNF813,DPRX,CACNG7 CACNG7 NA NA NA NA CACNG7 22736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA CACNG7 54654 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55034604 55034910 55034757 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP5 52193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55540419 55540558 55540460 Y SHISA7,KIR2DL3,NCR1 RDH13 NA NA NA NA RDH13 40101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55976006 55976393 55976362 Y NA ISOC2,ZNF628,NAT14 NA NA NA NA ISOC2 4296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14 NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA ZNF524 6820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 56796830 56796936 56796883 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 80532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 1115244 1115256 1115249 Y SNTG2 NA NA NA NA NA SNTG2 170690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 138406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 3106532 3106816 3106764 Y NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 272837 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8008845 8009018 8008931 Y NA NA LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 712904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8198915 8199123 8199032 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 522799 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8448158 8448403 8448281 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 273519 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8617164 8617264 8617232 Y NA NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 104658 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8743061 8743194 8743128 Y ID2 AC011747.4 LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 21139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 8767111 8767480 8767322 Y NA AC011747.4,ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 45189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA NA NA NA NA NA AC106875.1 150550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 12703502 12703613 12703558 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 151402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 15129751 15130135 15129940 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 569319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 15199994 15200355 15200088 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 499099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 15734291 15734400 15734305 Y NBAS,MYCN,DDX1 NBAS,DDX1 NA NA NA NA DDX1 4989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 106096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 17967823 17967867 17967845 Y MSGN1 GEN1,SMC6 NA NA NA NA SMC6 11642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 23412802 23412834 23412819 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 193254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 62972 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A POMC NA NA NA NA POMC 37304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 25482494 25482888 25482692 Y DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 80571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 25646148 25646487 25646318 Y NA NA NA NA NA NA DNMT3A 82689 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 25789731 25789834 25789815 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 104669 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 27939397 27939784 27939607 Y TRIM54 NA RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL33 52800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 28083143 28083293 28083218 Y RBKS BRE,RBKS NA NA NA NA BRE 27515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 28134368 28134411 28134390 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 22403 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 28137373 28137669 28137575 Y FOSL2,RBKS BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 25408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 28513236 28513438 28513331 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 99877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB,SPDYA NA NA NA NA SPDYA 6313 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 29026080 29026331 29026243 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB SPDYA NA NA NA NA SPDYA 22697 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 36980864 36981389 36981193 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 109634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 37811087 37811457 37811150 Y NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 152154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 38341642 38341844 38341699 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1,QPCT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP1B1 6598 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 38368766 38369153 38368894 Y CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 33722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 38372999 38373624 38373225 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 37955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 38538303 38538646 38538475 Y NA NA NA NA NA NA ATL2 63781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 41997270 41997551 41997541 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 275609 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 43363400 43363787 43363633 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 87961 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 43905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 44718441 44718530 44718486 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 131352 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 44996263 44996426 44996345 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 225126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 46452124 46452363 46452229 Y RHOQ NA PRKCE,EPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 66443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 46593968 46594050 46594011 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 75162 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 46931823 46932125 46932006 Y NA SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 7732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 47795442 47795451 47795448 Y MSH2,MSH6,FBXO11,KCNK12 KCNK12 NA NA NA NA KCNK12 627 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 47796567 47796699 47796698 Y NA KCNK12 NA NA NA NA KCNK12 489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 47946277 47946754 47946432 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 25608 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 48118003 48118146 48118074 Y NA FBXO11 NA NA NA NA FBXO11 12786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 48427803 48428156 48428061 Y FOXN2 NA NA NA NA NA FOXN2 111620 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.7868283365293 chr2 57623387 57623716 57623641 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 509070 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 58271974 58272513 58272036 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 139188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 58336722 58337105 58336916 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 129402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 60133192 60133207 60133200 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 476533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 60937962 60938223 60938025 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 43142 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 61126778 61127091 61126822 Y REL REL,RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 9347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr2 64291243 64291430 64291349 Y NA VPS54 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 47037 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 64368431 64369198 64368837 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 58 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 64540204 64540217 64540210 Y NA NA LINC00309,PELI1,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 170616 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 65609993 65610402 65610168 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 47369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 65656801 65657217 65657146 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr2 65782552 65782570 65782560 Y NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED2 124781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 65849750 65849939 65849914 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 191979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 66616837 66617254 66616981 Y NA MEIS1 MEIS1,MIR4778 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MEIS1 41330 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 68432380 68432395 68432387 Y NA WDR92,PNO1,PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 48974 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 12300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 69857892 69858266 69858093 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 11291 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 69981246 69981481 69981365 Y MXD1 NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 73293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 72713565 72713630 72713598 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 337540 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 74153090 74153262 74153147 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 1137 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 74616605 74616668 74616637 Y NA DCTN1,C2orf81,WDR54 NA NA NA NA DCTN1 546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 78055629 78055831 78055731 Y NA AC105399.2 NA NA NA NA AC105399.2 42121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 78464924 78465229 78465077 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 451416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 81107061 81107275 81107187 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM1 577187 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr2 83744068 83744130 83744079 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG1 941039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 85932755 85933081 85932924 Y SH2D6 RNU1-38P ATOH8 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 20379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 40102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 86921835 86922055 86921945 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 23241 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 88590567 88590888 88590740 Y C2orf51 NA NA NA NA NA THNSL2 122732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA FER1L5 14466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 99118904 99119212 99119061 Y NA NA NA NA NA NA INPP4A 59587 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 99250910 99251133 99251091 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 27868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 100576722 100576856 100576853 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 455262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 101926137 101926537 101926326 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 2974 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 102478902 102479140 102479043 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 167590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 102654225 102654461 102654316 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 342913 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 105275028 105275190 105275110 Y NA NA LOC100506421 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS9 377251 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 105477972 105479094 105478260 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 173347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 105505799 105505908 105505854 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 146533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 221558 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 111817819 111818113 111817910 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 56842 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 113008998 113009283 113009141 Y ZC3H6 ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H8 1430 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 113292630 113292957 113292832 Y IL1A POLR1B,CHCHD5 NA NA NA NA POLR1B 4535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 113563232 113563409 113563324 Y IL36G,IL1RN CKAP2L NA NA NA NA CKAP2L 42978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 299991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 115420103 115420171 115420136 Y DPP10,DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10 222227 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 115524775 115524984 115524851 Y NA NA NA NA NA NA DPP10 326899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 115897297 115897567 115897434 Y DPP10,DPP10,DPP10 DPP10-AS1 NA NA NA NA DPP10-AS1 19353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 116027974 116028021 116027995 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10-AS1 111054 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 116280969 116281118 116281045 Y NA NA NA NA NA NA DPP10-AS1 364049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 118309015 118309417 118309218 Y NA NA NA NA NA NA DDX18 260809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 118737562 118738119 118738029 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 31590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 119076927 119077186 119077054 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 134965 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 119498698 119498987 119498818 Y NA NA NA NA NA NA EN1 104267 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 120025136 120025424 120025403 Y DBI STEAP3 NA NA NA NA STEAP3 45752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 120891923 120892273 120892121 Y NA NA NA NA NA NA AC012363.4 79847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 121495235 121495636 121495561 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4036 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 127006133 127006203 127006166 Y NA NA NA NA NA NA AC023347.1 57884 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 127416778 127417376 127416886 Y NA GYPC NA NA NA NA GYPC 5269 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 128173465 128174362 128173731 Y SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 29424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr2 130345127 130345363 130345316 Y NA NA NA NA NA NA MZT2B 591947 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 130928401 130928722 130928538 Y NA MZT2B,SMPD4,TUBA3E NA NA NA NA MZT2B 8588 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 133025188 133025675 133025588 Y NA NA GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD1 401477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 136389932 136390301 136390118 Y NA NA NA NA NA NA R3HDM1 102907 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 136887149 136887816 136887360 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 13414 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 139674784 139674842 139674810 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 417413 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 140168949 140169074 140169000 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 911578 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 140977991 140978216 140978106 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 1720620 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 141284265 141284563 141284414 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 2026894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 146510109 146510425 146510227 Y NA NA DKFZp686O1327,ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 417311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 148397071 148397198 148397141 Y ACVR2A NA NA NA NA NA ACVR2A 202888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA KIF5C 102882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 149571188 149571523 149571357 Y NA NA KIF5C IMR90 Hi-C 24141950 KIF5C 59296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 149819679 149819759 149819686 Y KIF5C NA NA NA NA NA LYPD6B 72862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA NA NA NA NA NA MMADHC 219754 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 150314581 150314916 150314749 Y NA NA NA NA NA NA MMADHC 127414 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 157038752 157038990 157038871 Y NR4A2 NA NR4A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GPD2 250812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 662369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 158277774 158278150 158278051 Y ACVR1,ACVR1,CYTIP NA NA NA NA NA ACVR1 452224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 160106082 160106269 160106215 Y MARCH7 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 35041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 29547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 161177458 161178011 161177649 Y NA NA NA NA NA NA ITGB6 51059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 163376672 163376691 163376681 Y NA NA NA NA NA NA GCA 203322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 164955524 164955689 164955619 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 742500 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 165327196 165327565 165327381 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 370624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 170777121 170777463 170777246 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 95153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 174889919 174890381 174890067 Y NA NA SP3,OLA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 61489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 179736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 176608884 176609040 176608962 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1715 256527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 179471296 179471384 179471314 Y TTN NA NA NA NA NA TTN-AS1 87386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 24269 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B NA NA NA NA NA ITGAV 148585 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA NA NA NA NA NA GULP1 827671 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 189155414 189155583 189155499 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 1018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr2 191416774 191417126 191416837 Y MFSD6,TMEM194B TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 192487445 192487642 192487543 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 379534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 192717272 192717408 192717316 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 341027 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 192882025 192882303 192882164 Y TMEFF2 NA NA NA NA NA TMEFF2 176132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 193054279 193054640 193054459 Y NA TMEFF2 NA NA NA NA TMEFF2 3795 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 196547563 196547821 196547646 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 108862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 196617949 196618273 196617953 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 179248 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 197271750 197271952 197271866 Y HECW2 NA NA NA NA NA CCDC150 230326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 197686451 197686687 197686569 Y PGAP1,C2orf66 GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 24002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 197934286 197934620 197934500 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 191215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 199736102 199736481 199736292 Y NA NA NA NA NA NA FTCDNL1 977415 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 201262818 201262970 201262894 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 94214 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 201397001 201397079 201397012 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 14494 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA DAZAP2P1 165924 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 7.81033344409169 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 203341668 203341778 203341723 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 102009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 203830057 203830223 203830140 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 47298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 205037741 205037858 205037800 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 639608 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 206564438 206564682 206564481 Y INO80D,NRP2 NA NA NA NA NA AC007383.3 382647 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.15359604686012 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 208942960 208943012 208942996 Y NA NA FZD5,CCNYL1,PLEKHM3,FASTKD2,METTL21A IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHM3 54676 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr2 216224117 216224404 216224261 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 49577 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 216557446 216557685 216557585 Y NA NA NA NA NA NA AC012668.2 161590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A NA NA NA NA NA CYP27A1 129043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr2 223776983 223777159 223777060 Y SGPP2 NA NA NA NA NA ACSL3 53331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 223823432 223823602 223823532 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 99780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 223824867 223825201 223825044 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 101215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 224477772 224478078 224477872 Y NA NA AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 222666 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 225307433 225307612 225307516 Y FAM124B NA FAM124B,CUL3,SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 140498 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 225880660 225880871 225880768 Y DOCK10 NA NA NA NA NA CUL3 432550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 227015814 227016273 227016071 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 646202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 231636017 231636396 231636213 Y NA BANF1P3 NA NA NA NA BANF1P3 47899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18343 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA NMUR1 85186 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 232532385 232532510 232532473 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232536483 232536778 232536606 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32827 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 232546670 232546982 232546826 Y NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22623 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr2 233283707 233283952 233283753 Y ALPPL2 ALPPL2 NA NA NA NA ALPPL2 14154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr2 233916070 233916578 233916265 Y NA NGEF NA NA NA NA NGEF 40088 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 234266690 234266835 234266770 Y INPP5D,ATG16L1,DGKD DGKD NA NA NA NA DGKD 5537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA UGT1A7 NA NA NA NA UGT1A7 26914 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 235732390 235732720 235732555 Y NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 125897 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 237117535 237117935 237117735 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA GBX2 42523 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 238052381 238052681 238052563 Y COL6A3 NA MLPH,COPS8,COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 59921 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 RAB17 3981 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 238585463 238585872 238585569 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 51244 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 240906119 240906290 240906205 Y NA NA MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 56529 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 RAD21L1 NA NA NA NA RAD21L1 49573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 2189828 2190037 2189979 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA PDYN,TGM3,TGM6 IMR90 Hi-C 24141950 TGM3 84610 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 2964753 2965068 2964761 Y NA NA NA NA NA NA MRPS26 59523 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 3041356 3041698 3041528 Y NA MRPS26,OXT NA NA NA NA OXT 8568 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr20 4070898 4071147 4070999 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 28480 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 4970261 4970448 4970382 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 18491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5610913 5611049 5610981 Y NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 21241 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5669321 5669748 5669457 Y GPCPD1,TRMT6 NA GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 59291 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5899454 5899753 5899716 Y NA RNU1-55P,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 29429 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 5900941 5901075 5900974 Y GPCPD1,TRMT6 RNU1-55P,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 28107 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 7998924 7999176 7999047 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 448 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 212225 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA TMX4 466137 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 10472654 10473100 10472965 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 59784 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 12734495 12734674 12734580 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 865124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 13734374 13734725 13734663 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 28807 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 14500869 14501154 14501002 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 184607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 16373141 16373392 16373267 Y OTOR NA NA NA NA NA KIF16B 178686 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 17876337 17876490 17876431 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD17 65099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 17876981 17877249 17877175 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD17 64340 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 19660392 19660672 19660518 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 75680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 NA NA NA NA NA NAA20 114042 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 20586775 20587103 20586803 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 104028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 21082914 21083089 21083038 Y NA LINC00237,PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00237 1910 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 25226687 25226893 25226791 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 30303594 30303801 30303667 Y TTLL9,DUSP15 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 5991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 31339575 31339797 31339687 Y NA COMMD7,DNMT3B COMMD7,DNMT3B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMT3B 8394 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 31352490 31352753 31352633 Y C20orf203,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 4299 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 32753335 32753546 32753441 Y NA RPS2P1 ITCH,AHCY,PXMP4,ZNF341,DYNLRB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 45059 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 32782933 32783102 32782955 Y ASIP NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 32803033 32803441 32803244 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 94167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 32966378 32966977 32966403 Y GGT7 ITCH NA NA NA NA ITCH 17337 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 33699049 33699250 33699220 Y TRPC4AP,EDEM2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 20375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 33899361 33899545 33899443 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 28573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 34093619 34093844 34093641 Y NA ERGIC3 NA NA NA NA ERGIC3 33926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 35019888 35020140 35020089 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 127630 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35305263 35305453 35305359 Y NA NA NA NA NA NA NDRG3 67028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35633884 35634240 35634054 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 55638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 37280609 37280856 37280791 Y SLC32A1 NA NA NA NA NA ACTR5 94229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.02350510756238 chr20 37351314 37351914 37351610 Y SLC32A1 ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 38970274 38970496 38970388 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 345384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 42137465 42137802 42137552 Y NA L3MBTL1 NA NA NA NA L3MBTL1 3145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 42545648 42546044 42545953 Y NA TOX2 NA NA NA NA TOX2 4144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 43152518 43152864 43152699 Y NA TTPAL,SERINC3,PKIG NA NA NA NA SERINC3 3768 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 43272652 43273023 43272879 Y C20orf111,STK4,ADA ADA NA NA NA NA ADA 5851 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 43607893 43608251 43608061 Y NA TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 14778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 43744637 43744818 43744729 Y WFDC5 NA NA NA NA NA SLPI 136387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 46438543 46438763 46438619 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 25183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP ADNP NA NA NA NA ADNP 29532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 21252 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 50033542 50033860 50033623 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 143510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 50416342 50416699 50416509 Y NA ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA SALL4 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr20 51962199 51962423 51962230 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 262023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52268867 52269118 52269044 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 44421 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 SUMO1P1 NA NA NA NA SUMO1P1 9218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52489475 52489586 52489523 Y NA SUMO1P1 NA NA NA NA SUMO1P1 510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52514730 52515023 52514955 Y ZNF217 SUMO1P1 ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUMO1P1 24634 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA SUMO1P1 52959 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 52812299 52812959 52812479 Y NA PFDN4 SULF2,DOK5,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PFDN4 9427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 55311396 55311684 55311475 Y NA PTMAP6 TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 36826 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 55379556 55380011 55379738 Y TFAP2C NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 104986 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 56247287 56247513 56247399 Y PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 37079 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 57300192 57300206 57300199 Y NA NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 38005 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 57677920 57678303 57678192 Y STX16 NA ZNF831,GNAS-AS1,GNAS IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 61956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 57722243 57722385 57722335 Y STX16,PHACTR3,ZNF831 NA MIR298,GNAS-AS1,MIR296,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 106279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 58437773 58438005 58437846 Y NA NA NA NA NA NA SYCP2 68705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 58677979 58678143 58678083 Y NA NA C20orf197 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPP1R3D 164627 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 59325352 59325574 59325428 Y NA NA NA NA NA NA CDH4 499908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 60529765 60530009 60529928 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 108857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 61505589 61505880 61505712 Y BHLHE23,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCFL5 14474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr20 62820558 62820833 62820696 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD2 64261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr20 62908248 62908643 62908435 Y NA PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 23154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TPTE 102403 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 TPTE 146795 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 269184 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 18266996 18267114 18267057 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 611907 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr21 24819380 24819635 24819508 Y NA TUBAP NA NA NA NA TUBAP 39932 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 24909209 24909354 24909282 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 129761 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 26840397 26840546 26840424 Y NA NA MIR155HG IMR90 Hi-C 24141950 MRPL39 137283 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr21 27563947 27564215 27564081 Y NA APP APP IMR90 Hi-C 24141950 APP 22501 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 32532795 32532952 32532925 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 396606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr21 32862869 32863036 32862944 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 66522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr21 32878321 32878337 32878329 Y TIAM1,SOD1 NA NA NA NA NA AP000251.3 51221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 32929453 32930069 32929726 Y TIAM1 TIAM1 NA NA NA NA AP000251.3 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 33670455 33670601 33670551 Y NA MIS18A NA NA NA NA MIS18A 21075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 33702310 33702533 33702421 Y NA NA NA NA NA NA MIS18A 52930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 33853478 33853730 33853567 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 90039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 33870747 33870982 33870865 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 107308 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 34524822 34524923 34524879 Y GART,GART,DNAJC28,DNAJC28 NA NA NA NA NA IFNAR2 75283 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr21 34801962 34801998 34801980 Y NA IFNGR2,TMEM50B NA NA NA NA IFNGR2 28760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr21 39112163 39112449 39112332 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 376071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 39189154 39189496 39189325 Y NA NA NA NA NA NA DSCR4 301958 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 39430494 39430871 39430698 Y DSCR4 NA NA NA NA NA DSCR4 60583 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr21 39543838 39544086 39544003 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 52293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 39551710 39551858 39551784 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 60165 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 39641440 39641711 39641539 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 149895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 40039218 40039450 40039331 Y ETS2 NA NA NA NA NA ETS2 135781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr21 41428469 41428477 41428473 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT5 502100 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 43647963 43648761 43648270 Y C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 30164 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 15770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 45337582 45337952 45337767 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT3 54515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG,DNMT3L,AIRE NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3,AP001065.15 NA NA NA NA AP001065.15 12331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA AP001065.15 NA NA NA NA AP001065.15 40318 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 31919 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 46127419 46127576 46127516 Y NA TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 1919 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr21 46266361 46266565 46266476 Y ITGB2 UBE2G2,SUMO3,PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 25187 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 47027110 47027382 47027175 Y NA PCBP3 PCBP3,SLC19A1,POFUT2 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 34226 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 47394721 47394936 47394787 Y NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4715 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 47442529 47442669 47442610 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 42878 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr21 47524636 47524785 47524711 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 8625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 17091097 17091180 17091141 Y IL17RA FABP5P11,TPTEP1 NA NA NA NA TPTEP1 10320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 17306294 17306463 17306397 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA GAB4 180649 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 17528836 17529213 17528959 Y NA GAB4,IL17RA NA NA NA NA IL17RA 34631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 17715051 17715201 17715110 Y GAB4,CECR5,CECR1 AC005300.5,CECR1,CECR3 NA NA NA NA CECR1 14172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 10563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 11800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 18372617 18372984 18372801 Y NA NA NA NA NA NA BID 117081 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 18402838 18403339 18403237 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 101986 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH NA NA NA NA PRODH 4696 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr22 19337870 19338225 19337898 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 60631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L NA NA NA NA GNB1L 28939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 21979927 21980091 21980009 Y NA YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA YDJC 2262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 22186398 22186549 22186531 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 33421 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 23876230 23876637 23876426 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC8P1 133317 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 13631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 NA PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM211B 95277 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 25349333 25349980 25349695 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGSM1 149097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 25350277 25350613 25350445 Y NA NA KIAA1671,TMEM211,SGSM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGSM1 150041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 26921035 26921055 26921043 Y TPST2 HPS4,SRRD,TFIP11 NA NA NA NA TFIP11 14564 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 27028638 27029036 27028851 Y NA TPST2,CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 37694 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 27488405 27488660 27488521 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP1-40G4P.1 206894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 28106286 28106571 28106415 Y NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 88915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA TTC28 235661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 29365910 29365950 29365937 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF3 88330 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 29467563 29467858 29467701 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 29600744 29600965 29600829 Y CHEK2,EWSR1,EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 29877762 29878123 29877961 Y NA NEFH NA NA NA NA NEFH 3543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 31343097 31343477 31343430 Y NA TUG1 NA NA NA NA TUG1 21186 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 31629034 31629491 31629163 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 22809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 32291389 32291694 32291650 Y RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5 YWHAH NA NA NA NA YWHAH 46753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 36602435 36602641 36602473 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,APOL1 APOL2 NA NA NA NA APOL2 31359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 24084 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYH9 33299 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 38012270 38012654 38012462 Y NA GGA1,SH3BP1,PDXP NA NA NA NA GGA1 9789 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 39462955 39463374 39463017 Y NA APOBEC3F,APOBEC3G,APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3H 27855 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 42096331 42096684 42096508 Y CHADL,WBP2NL,MEI1 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA NHP2L1 11823 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 42327988 42328313 42328152 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 TNFRSF13C MCF7 ChIA-PET 22265404 TNFRSF13C 7166 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 42345988 42346366 42346055 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3,WBP2NL NA NA NA NA CENPM 4820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 42867366 42867483 42867394 Y NA CTA-126B4.7,SERHL,RRP7A WBP2NL,SEPT3 IMR90 Hi-C 24141950 SERHL 27102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 43100819 43101017 43100994 Y NA A4GALT NA NA NA NA A4GALT 14287 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 43116155 43116318 43116237 Y CYB5R3,A4GALT A4GALT NA NA NA NA A4GALT 851 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr22 43144166 43144283 43144173 Y NA A4GALT CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 28862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 43326716 43327350 43327278 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2 NA NA NA NA NA ARFGAP3 74604 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 43653252 43653585 43653298 Y NA NA NA NA NA NA TTLL12 72113 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 44218722 44218869 44218865 Y NA EFCAB6,SULT4A1 NA NA NA NA EFCAB6 12505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 44321391 44321759 44321599 Y PNPLA3 PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5 NA NA NA NA PNPLA3 3772 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B PHF21B NA NA NA NA PHF21B 145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 NUP50 NA NA NA NA NUP50 13846 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 45575306 45575472 45575328 Y FAM118A,NUP50 NUP50 NA NA NA NA NUP50 17584 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 45899980 45900171 45900075 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 3862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 46028588 46028889 46028879 Y WNT7B ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 36789 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 46035019 46035329 46035174 Y NA ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 30349 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 47498614 47499010 47498804 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 342096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 48723476 48723799 48723638 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 1325391 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 49001738 49001947 49001827 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 1047243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 49123378 49123388 49123383 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 925802 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 49843892 49843993 49843957 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 205197 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 50232497 50232886 50232656 Y TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2 BRD1,ZBED4 ZBED4 K562 ChIA-PET 22265404 ZBED4 12604 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 50608010 50608409 50608105 Y MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 850 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 50741057 50741253 50741136 Y PIM3,TRABD MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2803 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 50764173 50764461 50764208 Y NA PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 15272 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 51080489 51080596 51080545 Y NA MAPK8IP2,CHKB,ARSA,SHANK3 SHANK3,LOC100144603,CHKB-CPT1B,ARSA,NCAPH2,LMF2,PPP6R2,SBF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARSA 15882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr22 51110202 51110387 51110248 Y MAPK11,FAM116B,MAPK8IP2,SHANK3 ARSA,SHANK3 SHANK3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SHANK3 456 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 5043972 5044716 5044216 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 24326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 5181258 5181597 5181446 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 19353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 6741976 6742157 6742067 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1514645 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 8398896 8399319 8399110 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 604138 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 8924124 8924195 8924160 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 79262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 12972627 12972739 12972683 Y NA NA NA NA NA NA RPL32 91540 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 13460446 13460799 13460651 Y NA NUP210 NA NA NA NA NUP210 637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr3 15105615 15105982 15105798 Y NA MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 773 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 15723851 15723947 15723900 Y NA NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 HACL1 82513 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 15783171 15783247 15783208 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 141833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 HACL1 172406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 15845201 15845372 15845268 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA HACL1 203863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 16102393 16102705 16102619 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 201774 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 17345014 17345355 17345310 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA DAZL 635201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA DAZL 668499 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 17679954 17680161 17680022 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 804148 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18013789 18014053 18013921 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 470256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18024656 18024931 18024818 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 459378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18060236 18060629 18060433 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 423680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18252681 18253057 18252788 Y TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 231252 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chr3 18782261 18782430 18782338 Y SATB1 NA NA NA NA NA RAD23BP1 204096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 610204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 20012721 20012798 20012760 Y NA RAB5A NA NA NA NA RAB5A 26150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 23991964 23992189 23991965 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA NKIRAS1 5882 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 27707886 27708022 27707939 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 35419 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 28180863 28181045 28181010 Y NA NA NA NA NA NA CMC1 100030 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 301 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.55015156549622 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 35790038 35790162 35790114 Y ARPP21 NA NA NA NA NA EPM2AIP1 1242633 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 36805780 36806178 36806113 Y NA NA NA NA NA NA EPM2AIP1 226617 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 37221290 37221535 37221382 Y NA LRRFIP2 LRRFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 1645 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 37595659 37595670 37595665 Y NA NA NA NA NA NA ITGA9 104053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 37904355 37904605 37904570 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 2904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 CCR8,SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 39446360 39446713 39446516 Y NA SLC25A38,RPSA NA NA NA NA RPSA 180 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 41181029 41181045 41181037 Y NA NA NA NA NA NA CTNNB1 53283 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 41757851 41758229 41758040 Y NA NA NA NA NA NA ULK4 243693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 101913 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr3 45512532 45512880 45512706 Y NA NA NA NA NA NA LIMD1 82006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 45681547 45681721 45681608 Y LIMD1 SACM1L NA NA NA NA SACM1L 46827 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 48734201 48734270 48734236 Y NA NCKIPSD,IP6K2 NA NA NA NA NCKIPSD 12404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 50204265 50204566 50204413 Y HYAL2 SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 13787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 51140543 51140838 51140691 Y NA NA NA NA NA NA MANF 279640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 53286308 53286764 53286678 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 1304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr3 55363946 55364201 55364163 Y WNT5A NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 705704 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 56416908 56417062 56416985 Y ERC2 NA NA NA NA NA ERC2 83329 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 57164609 57165207 57164899 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA RP11-157F20.1 963 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 57779621 57779638 57779630 Y FAM116A,SLMAP SLMAP NA NA NA NA SLMAP 40444 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 60067500 60067675 60067588 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 1033690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 60777295 60777669 60777482 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 457464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 61579072 61579152 61579112 Y PTPRG PTPRG NA NA NA NA PTPRG 33829 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 62008406 62008528 62008467 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP6 281626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 66491047 66491055 66491050 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 58632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 66543351 66543557 66543448 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 6130 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 69337600 69337654 69337627 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 205505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 69826244 69826723 69826526 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 39658 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 71478043 71478236 71478134 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 152904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 72274303 72274536 72274420 Y NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 219533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 72445751 72445968 72445860 Y NA RYBP NA NA NA NA RYBP 48101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 76778043 76778075 76778059 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 296874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 1178298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 13.9639294909518 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 81541330 81541813 81541427 Y GBE1 NA NA NA NA NA GBE1 267499 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 83266585 83266839 83266721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-260O18.1 1233296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 90174746 90175099 90174894 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P5 1526535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr3 97200440 97200579 97200496 Y EPHA6 NA NA NA NA NA ARL6 280786 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 97211520 97211837 97211678 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 269528 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 108948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 98572463 98572830 98572744 Y NA DCBLD2 NA NA NA NA DCBLD2 45703 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 99909937 99910189 99910085 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 67655 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr3 101046086 101046265 101046174 Y ZBTB11,SENP7,CEP97 NA NA NA NA NA SENP7 183820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 107504411 107504731 107504449 Y NA NA NA NA NA NA BBX 264628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 109074614 109074989 109074804 Y NA DPPA2,DPPA4 NA NA NA NA DPPA4 20195 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 109075200 109075484 109075317 Y NA DPPA2,DPPA4 NA NA NA NA DPPA4 20781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 111018172 111018454 111018312 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 231254 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 112436805 112436974 112436889 Y NA NA CD200R1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 70428 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 112486003 112486364 112486061 Y ATG3 NA CD200R1L,CD200R1,GTPBP8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 119626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 112866931 112867023 112866972 Y BOC NA BOC,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 BOC 60827 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 115843003 115843038 115843021 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 900507 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 115863058 115863426 115863241 Y LSAMP NA NA NA NA NA PTMAP8 880119 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 115918215 115918449 115918332 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 825096 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 117441288 117441601 117441524 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 272494 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 119071062 119071469 119071190 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH ARHGAP31-AS1 NA NA NA NA ARHGAP31-AS1 31455 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 120120515 120120873 120120694 Y FSTL1 FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 47227 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA POLQ,ARGFX NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 124419861 124420177 124419915 Y KALRN UMPS NA NA NA NA UMPS 27036 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 124535064 124535375 124535191 Y NA NA NA NA NA NA ITGB5 82890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 124604448 124604779 124604703 Y NA ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 13486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 124860643 124860954 124860853 Y OSBPL11 NA NA NA NA NA ITGB5 242378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA SLC41A3 108923 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 126187165 126187389 126187309 Y ZXDC ZXDC NA NA NA NA ZXDC 5373 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 126292509 126292856 126292714 Y NA TXNRD3NB NA NA NA NA TXNRD3NB 32542 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 127459354 127459715 127459535 Y NA NA NA NA NA NA ABTB1 69576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 127494264 127494411 127494370 Y NA MGLL NA NA NA NA MGLL 45640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 127539467 127539812 127539513 Y MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 128417695 128417825 128417815 Y NA RPN1,RAB7A RAB7A,LOC653712,RPN1,KIAA1257 IMR90 Hi-C 24141950 RPN1 19777 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 128589304 128589705 128589400 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 6734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 128838520 128838686 128838629 Y MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 958 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 128957834 128958071 128957930 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 57069 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 128958880 128959235 128959095 Y H1FOO NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 58115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 129167159 129167354 129167260 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 10191 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr3 130558055 130558328 130558247 Y NA ATP2C1 NA NA NA NA ATP2C1 9111 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 132137953 132138107 132138033 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 3583 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 136448168 136448437 136448423 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 20783 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 137938227 137938395 137938336 Y ARMC8 DBR1,ARMC8 NA NA NA NA ARMC8 34118 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 138410318 138410460 138410372 Y NA NA NA NA NA NA FAIM 84870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 138565329 138565569 138565472 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 13549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 138581550 138581663 138581597 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 141175186 141175511 141175311 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 141887290 141887616 141887590 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 20904 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 142580771 142580984 142580878 Y NA RP11-372E1.1,PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 25061 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 144134299 144134312 144134306 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 445659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 146745799 146745822 146745813 Y NA NA NA NA NA NA ZIC1 363387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 148781596 148781850 148781723 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 149533104 149533741 149533325 Y RNF13 RNF13 NA NA NA NA RNF13 4609 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 150482569 150482635 150482602 Y NA SIAH2 NA NA NA NA SIAH2 3305 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 152371360 152371697 152371555 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 179039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 152705631 152705718 152705686 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 154895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 156356152 156356341 156356222 Y NA TIPARP,TIPARP-AS1 LOC339894 IMR90 Hi-C 24141950 TIPARP 32683 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 157019065 157019219 157019119 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550I24.2 128053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 40739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 165215447 165215733 165215492 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 2154038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 165215973 165216343 165216172 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 2153428 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 165217698 165218028 165217864 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 2151743 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 NA CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 143584 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 170579509 170579531 170579522 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 6741 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 170712510 170712744 170712722 Y SLC2A2 NA NA NA NA NA EIF5A2 88028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 171792323 171792831 171792493 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 36905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 171853185 171854055 171853751 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 97767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 176916249 176916425 176916364 Y NA TBL1XR1 NA NA NA NA TBL1XR1 2988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 177167478 177167833 177167747 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 254217 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 177170399 177170552 177170483 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 257138 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 178231751 178231896 178231824 Y NA NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 556171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 NA NA NA NA NA ZNF639 60042 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr3 179191425 179191682 179191521 Y GNB4 GNB4 GNB4,ACTL6A IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 24047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 180475891 180475917 180475905 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 108012 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 181436210 181436850 181436775 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 8496 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 14555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr3 182550667 182550775 182550721 Y ATP11B ATP11B NA NA NA NA ATP11B 41379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 182887417 182887606 182887510 Y KLHL6,LAMP3,B3GNT5 LAMP3 NA NA NA NA LAMP3 7790 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 182980670 182980835 182980709 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11638 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 184078263 184078665 184078465 Y NA EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD NA NA NA NA POLR2H 757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 199839 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA EIF2S2P2 186778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 89948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 185533882 185534105 185533994 Y NA IGF2BP2 SENP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2BP2 6739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 186746012 186746360 186746185 Y RTP1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP NA NA NA NA LPP 35840 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 187948643 187949049 187948891 Y LPP,LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP 79571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA NA NA NA NA NA LPP 749453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 188826947 188827206 188827077 Y NA NA BCL6,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 957875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 189240469 189240487 189240479 Y TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 596266 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 189524070 189524362 189524216 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 312391 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 191899426 191899438 191899432 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 734512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 194925332 194925664 194925571 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 64232 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 195264699 195265107 195264994 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 3102 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 195891844 195892227 195892035 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 84784 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 195946209 195946432 195946330 Y UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19 NA NA NA NA NA PCYT1A 66396 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 197035558 197035706 197035585 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 11387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 43479 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr3 197840450 197840806 197840557 Y LRCH3,IQCG NA LMLN,ANKRD18DP IMR90 Hi-C 24141950 LMLN 155379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 47637 47939 47761 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 3240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 257243 257573 257339 Y PDE6B ZNF732 NA NA NA NA ZNF732 39537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 789468 789689 789607 Y NA RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 15831 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 867282 867339 867287 Y NA CPLX1 NA NA NA NA CPLX1 49296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 1710531 1710811 1710671 Y NA SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 1471 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 2762487 2762593 2762537 Y SH3BP2 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 6384 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 11.3604850095879 chr4 2765898 2766146 2766030 Y NA TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 9795 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 2780332 2780529 2780439 Y NA TNIP2,SH3BP2 NA NA NA NA SH3BP2 12221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 3872963 3873310 3873200 Y NA NA LOC100133461,FAM86EP,FLJ35424,ADRA2C IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 81836 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 3931557 3931999 3931672 Y NA FAM86EP NA NA NA NA FAM86EP 23147 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA JAKMIP1 23303 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 6247478 6247620 6247538 Y PPP2R2C,PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA WFS1 21956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B,CCDC96 NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 7973730 7974208 7973960 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 34077 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 7981410 7981607 7981517 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 41757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 8614691 8614733 8614712 Y NA NA NA NA NA NA ACOX3 174241 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 10830954 10831154 10831060 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 373920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 11029361 11029726 11029544 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 338725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 11603431 11603452 11603441 Y NA NA NA NA NA NA RNPS1P1 231832 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 14857906 14858386 14858211 Y CPEB2 NA CPEB2,LOC441009 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CPEB2 143912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15533007 15533164 15533086 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 63518 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15651682 15652058 15651870 Y NA FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 29227 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 15820988 15821366 15820993 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115L11.1 89738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 16003610 16004023 16003987 Y NA NA NA NA NA NA PROM1 79978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 16186973 16187010 16186992 Y NA TAPT1 NA NA NA NA TAPT1 40023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 16728731 16729070 16728970 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 169362 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 16821985 16822190 16822187 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 76242 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 16871833 16872157 16872139 Y LDB2 LDB2 NA NA NA NA LDB2 26275 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 20780664 20780780 20780767 Y KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 84759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 24050121 24050356 24050240 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 533817 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 24322640 24323331 24322979 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 260842 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 24913671 24913932 24913802 Y CCDC149 NA NA NA NA NA CCDC149 65894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 26290055 26290515 26290382 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 126978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 27085890 27086000 27085963 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 225669 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 28281974 28282232 28282102 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1421753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 36327190 36327471 36327331 Y ARAP2 NA NA NA NA NA RELL1 1358527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 36350285 36350555 36350410 Y ARAP2 NA NA NA NA NA RELL1 1335443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 39152863 39152994 39152905 Y NA WDR19 TLR10,FAM114A1,KLB IMR90 Hi-C 24141950 WDR19 29030 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 39392246 39392603 39392519 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 26251 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 39548258 39548506 39548382 Y KLHL5 UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH 20327 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 183866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40578690 40579499 40579160 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 51393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 40589734 40590029 40589952 Y RBM47 RBM47 NA NA NA NA RBM47 40863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40623743 40623952 40623867 Y RBM47 RBM47 NA NA NA NA RBM47 6940 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40628627 40628976 40628881 Y NA RBM47 NA NA NA NA RBM47 1916 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 41979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 40803649 40803948 40803799 Y APBB2,APBB2 NA NA NA NA NA NSUN7 53735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 40943410 40943552 40943502 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 193496 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 47265985 47266214 47266100 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 197522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 54055240 54055561 54055400 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 174681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 54866446 54866641 54866544 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 62216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 54906868 54907157 54907139 Y NA CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 21700 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 54928262 54928437 54928381 Y NA CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 420 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 56323586 56323848 56323646 Y NA NA NA NA NA NA TMEM165 63462 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 56453376 56453745 56453528 Y NA CLOCK,NMU NA NA NA NA CLOCK 42071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr4 68128399 68128586 68128524 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 436311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 68264537 68264852 68264695 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 300045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 76892 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 73673744 73673875 73673808 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS3 241228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 74977575 74978125 74977847 Y NA NA RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 77724798 77724936 77724862 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 143920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 125323 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 70546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 78823537 78823752 78823560 Y NA MRPL1 NA NA NA NA MRPL1 41863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 84887961 84887976 84887969 Y NA NA NA NA NA NA FAM175A 445460 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 84934181 84934545 84934426 Y NA NA NA NA NA NA FAM175A 491680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 86435968 86436285 86436110 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3 550424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 87839773 87840193 87839957 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 13961 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr4 88128695 88128755 88128733 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30711 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 89185531 89185830 89185781 Y NA ABCG2,PPM1K NA NA NA NA PPM1K 18091 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 95406092 95406259 95406175 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 35055 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 101659601 101659826 101659610 Y NA NA NA NA NA NA DDIT4L 549662 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 103485535 103485935 103485588 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 65049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 110623287 110623426 110623357 Y LRIT3 CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 113547591 113547910 113547748 Y NA LARP7,C4orf21,MIR302A,MIR302C,MIR302B NA NA NA NA LARP7 8210 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21,MIR302A,MIR302C,MIR302B NA NA NA NA MIR302B 3661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 5.20688896272779 chr4 113672704 113673017 113672851 Y NA RP11-148B6.2,RP11-119H12.1,RPL7AP30 NA NA NA NA RP11-119H12.1 14876 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 113797634 113797869 113797752 Y NEUROG2,ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 60369 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 114894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 114104327 114104616 114104364 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RNU1-138P 234863 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 115198943 115199113 115199023 Y NA NA ARSJ,ANK2 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2D 517860 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 115371462 115371746 115371604 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 690379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 119187150 119187543 119187362 Y NA SNHG8 NA NA NA NA SNHG8 10321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53,RP11-455G16.1 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120432594 120432728 120432661 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 58648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 120650163 120650548 120650386 Y NA NA PDE5A,MAD2L1 IMR90 Hi-C 24141950 PDE5A 102017 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 122869375 122869534 122869455 Y TRPC3 NA NA NA NA NA BBS7 79723 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 123751494 123751575 123751556 Y FGF2 NA NA NA NA NA NUDT6 90548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 123771840 123772248 123772020 Y NA NA NA NA NA NA NUDT6 69875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 127699482 127699754 127699681 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 842672 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 127828532 127828546 127828541 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 713880 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 133266182 133266225 133266204 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 802245 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 133292934 133293335 133293044 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 775135 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 135338942 135339299 135339295 Y NA NA NA NA NA NA PABPC4L 218039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 139829865 139830205 139830035 Y NA NA SLC7A11,LOC641365,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 104738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 140650307 140650710 140650510 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 65385 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 141163698 141163887 141163736 Y NA SCOC MAML3,SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 12553 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 141218386 141218686 141218436 Y MAML3,SCOC SCOC NA NA NA NA SCOC 41946 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 144276815 144277022 144276900 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 20900 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 146015172 146015244 146015208 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 1840 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 146703198 146703494 146703347 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 154293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 149467274 149467593 149467420 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 816060 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 150756513 150756641 150756613 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 1178238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 152143714 152143771 152143743 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 124989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 152582106 152582499 152582283 Y NA NA NA NA NA NA PET112 97676 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 153424227 153424394 153424311 Y NA FBXW7 NA NA NA NA FBXW7 30859 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 153599392 153599746 153599719 Y FBXW7,ARFIP1,TMEM154 TMEM154 NA NA NA NA TMEM154 75 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 154154502 154154721 154154529 Y TRIM2,TRIM2 NA NA NA NA NA TRIM2 83008 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 154253952 154254140 154254046 Y NA MND1 NA NA NA NA MND1 9661 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 159641149 159641258 159641192 Y NA ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 1290 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 200219 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA RP11-366M4.2 629426 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 169361585 169362025 169361769 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA PALLD 54192 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 175440867 175440935 175440897 Y HPGD HPGD NA NA NA NA HPGD 1370 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 176349248 176349641 176349474 Y NA NA NA NA NA NA WDR17 635344 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 178469887 178470022 178469954 Y NA NA NA NA NA NA RP11-130F10.1 105754 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr4 184330014 184330225 184330125 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 33519 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 185331149 185331516 185331503 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 62218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 185781182 185781867 185781492 Y IRF2,ACSL1 NA NA NA NA NA CASP3 212519 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 186007389 186007737 186007420 Y LRP2BP,CCDC110 NA CASP3,SLC25A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 54658 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr4 186721569 186721813 186721702 Y PDLIM3,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2 NA NA NA NA NA FAM149A 301760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 186831211 186831564 186831371 Y SORBS2 NA NA NA NA NA FAM149A 192009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 187371571 187371697 187371634 Y NA F11-AS1 NA NA NA NA F11-AS1 48454 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 187621819 187622251 187622136 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 23625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 187810272 187810501 187810328 Y NA RP11-11N5.1 FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-11N5.1 149 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr4 189029344 189029687 189029466 Y ZFP42,TRIML2 TRIML2 FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIML2 587 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 4.73353542066163 chr4 189144165 189144266 189144216 Y NA NA NA NA NA NA TRIML2 115408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 1470037 1470319 1470275 Y SLC12A7,LPCAT1 SLC6A3 NA NA NA NA SLC6A3 26492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 SLC6A3,LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A3 34784 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 1522529 1522699 1522639 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 437 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 1725421 1725568 1725519 Y NA NA MIR4277 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL36 73912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 1876782 1877128 1876955 Y NA CTD-2194D22.3,IRX4 NA NA NA NA CTD-2194D22.3 4952 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 2594554 2594649 2594602 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 155596 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 5351586 5351742 5351664 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 67035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 10371627 10371888 10371758 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 19812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 10636353 10636579 10636473 Y ANKRD33B NA NA NA NA NA ANKRD33B 73911 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 10800983 10801250 10801024 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 41599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 11487050 11487322 11487183 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 414833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 12314219 12314247 12314235 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 412064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA NA FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 581914 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 16133001 16133217 16133109 Y NA MARCH11 NA NA NA NA MARCH11 45654 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 202047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 185222 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 164795 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 16740893 16741285 16741194 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 159465 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.04701021512477 chr5 16927331 16927389 16927360 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA MYO10 6983 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 17177639 17177702 17177672 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 113932 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 17184758 17185051 17184904 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 121051 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 18299452 18299668 18299545 Y NA NA LOC285696,BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36AP21 251793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 18403562 18403676 18403619 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 355903 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 19315150 19315342 19315248 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124N3.3 174695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 24272966 24273308 24273185 Y NA NA NA NA NA NA CDH10 369779 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 25438068 25438428 25438198 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 249303 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 25443137 25443499 25443483 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 254372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 25456035 25456404 25456210 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 267270 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 27309667 27310060 27309866 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 160339 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1292603 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 32543498 32543706 32543602 Y NA SUB1 SUB1,ZFR IMR90 Hi-C 24141950 SUB1 13759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 34835599 34835693 34835610 Y NA TTC23L NA NA NA NA TTC23L 1245 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 35673129 35673344 35673237 Y SPEF2,IL7R NA NA NA NA NA UGT3A2 396116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36243430 36243676 36243553 Y SLC1A3 NA NA NA NA NA SKP2 93339 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36358126 36358437 36358252 Y NA NA RANBP3L IMR90 Hi-C 24141950 SKP2 208035 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36425659 36425959 36425758 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A3 178498 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 36665318 36665543 36665428 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A3 60861 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 36854982 36855055 36855019 Y NA NIPBL NA NA NA NA NIPBL 19806 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 38514652 38514707 38514680 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 40956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 39014770 39014929 39014863 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 57581 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 39069838 39069965 39069908 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 2545 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 39224309 39224533 39224438 Y FYB NA NA NA NA NA RICTOR 151799 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 41294971 41295128 41295059 Y NA NA NA NA NA NA CARD6 455685 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 41826733 41826755 41826744 Y NA OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 41866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 55101 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 54840 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 53496834 53497083 53496859 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 107329 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA ANKRD55 55509 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 58050203 58050468 58050292 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 296116 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 411833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 58232883 58233370 58233101 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 478796 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 60315642 60315784 60315678 Y NA NA NA NA NA NA NDUFAF2 76686 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 60736184 60736544 60736365 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 50486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 64796548 64796879 64796719 Y PPWD1,CENPK NA NA NA NA NA CENPK 60119 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 72715317 72715478 72715398 Y NA FOXD1 FCHO2,TMEM171,TMEM174,FOXD1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 26874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 77832292 77832355 77832327 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 177550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 79376408 79376431 79376418 Y THBS4 NA NA NA NA NA MTX3 91326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 79440817 79441220 79441029 Y ZFYVE16,FAM151B,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 108678 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 79480253 79480678 79480326 Y NA NA NA NA NA NA SERINC5 69220 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 79531979 79532366 79532173 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 17532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 156368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 83933466 83933504 83933476 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 836093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 84744146 84744237 84744174 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 1167484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 85654132 85654483 85654435 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 257238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 85833622 85833763 85833693 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 77958 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 86524222 86524964 86524759 Y RASA1,RASA1 RASA1 MIR4280,RASA1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 36741 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 86663167 86663443 86663248 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 43393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 87798983 87799105 87799057 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP22 123209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 90355365 90355552 90355477 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-90P 208992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 94033836 94034405 94034124 Y KIAA0825,ANKRD32 NA NA NA NA NA KIAA0825 81527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 186609 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 95904696 95905047 95904872 Y NA CAST PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 45725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 96152147 96152486 96152312 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 10344 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr5 101404486 101404751 101404619 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4C1 225502 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 102862604 102862805 102862675 Y NA NUDT12 NA NA NA NA NUDT12 33689 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 103048573 103048840 103048666 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 152079 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 106632102 106632323 106632213 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 372273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 107272988 107273215 107273140 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 268392 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 108022286 108022631 108022483 Y NA NA NA NA NA NA FER 58892 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 108329034 108329385 108329210 Y NA NA NA NA NA NA FER 247511 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 109870902 109871116 109871008 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 200721 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 110608063 110608453 110608093 Y NA NA NA NA NA NA AC010468.1 81323 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 116259364 116259561 116259432 Y SEMA6A NA NA NA NA NA RPS17P2 209435 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 122087226 122087448 122087366 Y NA SNX2 PRDM6 IMR90 Hi-C 24141950 SNX2 21243 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 124029260 124029627 124029444 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 52873 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 126087846 126088015 126087939 Y NA LMNB1 MEGF10,LMNB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNB1 22300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 126782344 126782609 126782476 Y NA NA NA NA NA NA PRRC1 68692 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 127211761 127211779 127211769 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A2 205679 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 130824249 130824445 130824350 Y FNIP1 NA NA NA NA NA RAPGEF6 144484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 131434793 131435181 131435055 Y RAPGEF6,FNIP1,IRF1,IL3,CSF2 NA PDLIM4,IL3 IMR90 Hi-C 24141950 AC063976.3 79640 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 132851323 132851715 132851519 Y NA NA NA NA NA NA C5orf15 450763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 133750575 133750781 133750672 Y NA CDKL3,UBE2B,CDKN2AIPNL NA NA NA NA CDKN2AIPNL 4986 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 133763329 133763680 133763576 Y NA CDKN2AIPNL CDKN2AIPNL MCF7 ChIA-PET 22265404 CDKN2AIPNL 17740 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 56760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 133847692 133847829 133847767 Y NA NA PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 102103 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 134729023 134729250 134729122 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 4354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 138248139 138248403 138248239 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 303483 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 140381838 140382244 140382041 Y DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 38018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 140457576 140457668 140457630 Y NA PCDHB2,PCDHB3 NA NA NA NA PCDHB2 14559 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 47397 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141163260 141163447 141163330 Y SLC25A2,PCDHGA2,PCDHGA3,PCDHGB2,PCDHGB3,PCDHGA6,PCDHGA7,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4,PCDHGC5,NDFIP1 NA LOC729080,KIAA0141,PCDH12,RNF14,PCDH1 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 93364 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141262176 141262446 141262287 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 PCDH1,KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 5365 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141589976 141590075 141590026 Y NA NA FGF1,GNPDA1,SPRY4,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 103906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141684732 141684818 141684775 Y PCDH1,SPRY4 AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA AC005592.2 18040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141706626 141706892 141706857 Y NA AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA SPRY4 2606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 142157420 142157683 142157517 Y NA ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 9471 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 142384131 142384662 142384553 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 236182 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 142415813 142416201 142415818 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 267864 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 142785420 142785784 142785543 Y NR3C1 NR3C1 ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 27293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 145094622 145094634 145094628 Y GRXCR2 NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 118298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 146242419 146242610 146242553 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P48 157256 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 147253882 147254078 147253986 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 366263 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA FBXO38 297393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr5 147605275 147606051 147605859 Y NA NA NA NA NA NA FBXO38 155447 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 147722722 147723108 147722793 Y SPINK14,SPINK7 FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 38390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO38 410847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 148738164 148738422 148738235 Y PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L NA NA NA NA PCYOX1L 2594 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 92386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 148869266 148869383 148869317 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 59624 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 149849253 149849476 149849346 Y NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 13905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 150902961 150903053 150903007 Y FAT2 NA NA NA NA NA SLC36A1 88354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 151470527 151470867 151470697 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 320434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 152822087 152822411 152822258 Y NA GRIA1 GRIA1 IMR90 Hi-C 24141950 GRIA1 44764 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L-AS1 13813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 154071115 154071211 154071188 Y NA LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 19251 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr5 156602262 156602644 156602455 Y FNDC9,ITK HAVCR2,MED7 NA NA NA NA MED7 18232 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr5 159586814 159587463 159587155 Y PWWP2A,FABP6 PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 24911 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 161496016 161496172 161496094 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 1366160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 161528591 161528706 161528649 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 1333626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 164595581 164595748 164595665 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 858568 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 167066911 167067143 167066981 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 649513 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 167243967 167244280 167244072 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 472376 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 168221385 168221766 168221495 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 180068 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 168229147 168229460 168229328 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 187830 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 169083177 169083346 169083258 Y DOCK2 DOCK2 NA NA NA NA DOCK2 20926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 170172646 170172739 170172712 Y NA GABRP NA NA NA NA GABRP 15615 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 71942 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 171605314 171605550 171605494 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 7840 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 171660495 171660734 171660615 Y NA STK10,UBTD2 NA NA NA NA STK10 47105 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 171845132 171845429 171845292 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 34098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 171870556 171870796 171870680 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 8731 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 172127299 172127478 172127433 Y NEURL1B CTB-79E8.3 NA NA NA NA CTB-79E8.3 45583 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 172257827 172258390 172258174 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 175347355 175347516 175347492 Y NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPLX2 126042 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 176543923 176544044 176544003 Y TSPAN17,PRR7,DBN1 FGFR4,NSD1 NA NA NA NA NSD1 13982 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1,MXD3 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 177513304 177513421 177513395 Y NA RP11-889L3.1,N4BP3,RMND5B NHP2,RMND5B,HNRNPAB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 N4BP3 25023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 177542150 177542670 177542238 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 3706 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 NA NA NA NA COL23A1 18566 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 178985972 178986151 178986083 Y NA RUFY1 NA NA NA NA RUFY1 10413 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 179496400 179496705 179496553 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 413 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 179510185 179510353 179510296 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 13067 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr5 180050392 180050585 180050489 Y NA FLT4 NA NA NA NA FLT4 24039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 180285670 180285966 180285744 Y NA MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA ZFP62 320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 12696 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 319799 320052 319899 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 30169 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 2726588 2726793 2726728 Y SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2 WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 36855 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 2790944 2791090 2791014 Y NA WRNIP1,SERPINB1 SERPINB1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 27296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 2849123 2849376 2849246 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 8883 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 2902288 2902696 2902436 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB9 MGC39372,MIR4645,SERPINB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERPINB9 774 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 2980500 2980669 2980575 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NQO2 5552 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 2992078 2992424 2992251 Y NA SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 NA NA NA NA NQO2 5857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 3308463 3308483 3308477 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 78499 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 3317564 3317616 3317590 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 87600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 3351823 3351920 3351872 Y TUBB2B,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 103336 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 4189159 4189278 4189216 Y C6orf201,C6orf146 RP3-400B16.2 CDYL IMR90 Hi-C 24141950 RP3-400B16.2 1809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 3687 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 6970116 6970321 6970219 Y NA NA LY86 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 135509 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 7058764 7058925 7058840 Y DSP RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 7166669 7166920 7166778 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 60839 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 7167368 7167553 7167460 Y CAGE1,RREB1,RREB1 NA NA NA NA NA RREB1 61538 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr6 7324752 7324983 7324884 Y RREB1,RREB1 RP11-69L16.5,SSR1 NA NA NA NA RP11-69L16.5 12818 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 8083649 8083837 8083720 Y NA EEF1E1 NA NA NA NA EEF1E1 16974 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A NA NA NA NA NA GCNT2 82702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11277425 11277816 11277607 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 102765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11390283 11390548 11390416 Y NEDD9 NEDD9 NEDD9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NEDD9 9702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11463374 11463445 11463410 Y TMEM170B,NEDD9 NA NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD9 82793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11495068 11495420 11495113 Y TMEM170B,NEDD9 NA NEDD9,LOC100506409,ELOVL2,ERVFRD-1,C6orf228,SYCP2L,GCM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 114487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11605309 11605625 11605467 Y NA NA TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD9 224728 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 11931418 11931784 11931557 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 75211 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 12638264 12638403 12638331 Y EDN1 NA NA NA NA NA PHACTR1 77490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 13147785 13147909 13147848 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 64379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14587491 14587822 14587657 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 656705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14721191 14721587 14721406 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 522940 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14766593 14766865 14766789 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 477662 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14837546 14837947 14837747 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 406580 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 14910842 14911169 14911097 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 333358 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14945973 14946248 14946214 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 298279 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14966546 14966931 14966759 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 277596 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 14975402 14975457 14975430 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 269070 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 14982265 14982427 14982346 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 262100 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 15022090 15022421 15022413 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.55015156549622 chr6 15485085 15485275 15485180 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 176014 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 15589107 15589675 15589446 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 71614 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 15616123 15616332 15616207 Y JARID2 DTNBP1 NA NA NA NA DTNBP1 44957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 16245085 16245414 16245229 Y NA GMPR NA NA NA NA GMPR 8274 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 16607418 16607798 16607611 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 151571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 17430018 17430227 17430123 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 38571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 20239005 20239080 20239045 Y NA MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 28335 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 21740205 21740397 21740265 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 148233 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 21838162 21838485 21838169 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 246190 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 22073995 22074367 22074183 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 482023 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 22145253 22145497 22145375 Y NA NA NA NA NA NA HDGFL1 422181 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 22796105 22796114 22796110 Y NA NA NA NA NA NA HDGFL1 228427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 24228927 24229160 24229097 Y NA NA NA NA NA NA NRSN1 104577 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 24799813 24800204 24799968 Y DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1 GMNN NA NA NA NA GMNN 26654 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 25050592 25050945 25050684 Y C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 75945 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 25836224 25836451 25836337 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BA 111087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr6 26233560 26233958 26233761 Y NA HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H1D 344 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 26283996 26284379 26284279 Y NA HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H4H 234 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12 NA NA NA NA ZSCAN12 49442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN12 91714 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 30010922 30011054 30010960 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 13622 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 30182160 30182533 30182417 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2956 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 30731781 30732171 30732168 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 21450 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 XXbac-BPG27H4.8 FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XXbac-BPG27H4.8 25684 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 31140737 31140986 31140881 Y NA CCHCR1,TCF19,POU5F1 NA NA NA NA POU5F1 5522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA ATF6B 21753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 32325803 32326070 32325937 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG154L12.4 104315 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA BRD2,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA BRD2,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 12653 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 33781645 33781809 33781745 Y LEMD2,LEMD2 LEMD2,MLN IP6K3,LEMD2,LOC100507584,MIR1275,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,MLN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLN 11857 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 33818239 33818267 33818253 Y NA MLN GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 MLN 48451 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 NA NA NA NA NA MLN 102380 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 35693475 35694027 35693643 Y PPARD,FKBP5,FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 333 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 37067331 37067581 37067437 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 68398 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 37093441 37093739 37093580 Y NA PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 42240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 37750628 37750998 37750792 Y MDGA1 ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 34277 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 37879889 37880256 37879963 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 94614 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 38122967 38123257 38123161 Y ZFAND3,BTBD9 NA NA NA NA NA ZFAND3 337692 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 39122561 39122673 39122617 Y NA SAYSD1 GLP1R,DNAH8 IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 41596 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 40964511 40964818 40964666 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73866 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 40965087 40965613 40965406 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 41471691 41471833 41471786 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 40331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 41472054 41472459 41472263 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 39705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 41546441 41546593 41546496 Y FRS3 FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA RP11-328M4.2 32082 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 41608113 41608435 41608156 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 5493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 41612844 41613289 41612975 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 10224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 41964920 41965094 41964987 Y GUCA1A NA NA NA NA NA CCND3 51001 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 42738530 42739530 42738949 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226 ATP6V0CP3,TBCC KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 25972 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 42743007 42743021 42743017 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226 TBCC KIAA0240,UBR2,RPL7L1,C6orf226,PTCRA,TBCC,PRPH2,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 30449 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 43332066 43332081 43332075 Y NA ZNF318 NA NA NA NA ZNF318 3135 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 44043583 44043857 44043624 Y SLC35B2 RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 3194 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 44044328 44044673 44044418 Y C6orf223,NFKBIE RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 3939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 44185571 44185900 44185742 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 329 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 44443307 44443732 44443616 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 90045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 44783475 44783845 44783660 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 430213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 29370 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 45330194 45330521 45330358 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 13169 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 46738555 46739161 46738809 Y PLA2G7,PLA2G7 NA NA NA NA NA TDRD6 84943 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 NA NA NA NA NA CD2AP 175280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 51738790 51738977 51738878 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 408702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 52911792 52912057 52911925 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA FBXO9 2732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 53195071 53195341 53195324 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 16606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 53329907 53330283 53330016 Y NA NA GCM1 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 117960 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 53454332 53454653 53454605 Y NA GCLC KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 25115 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 55228034 55228050 55228042 Y HMGCLL1,GFRAL NA NA NA NA NA FAM83B 518465 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA NA BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KIAA1586 97314 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 66497701 66498057 66497748 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2153976 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 66637182 66637579 66637401 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2293457 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 71835104 71835283 71835120 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 161223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 72056766 72057142 72057043 Y OGFRL1 NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 60260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 72640618 72640942 72640781 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 644112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 73355182 73355469 73355282 Y NA NA NA NA NA NA KHDC1L 578024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA KHDC1L 65595 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 75917428 75917795 75917727 Y NA COX7A2 NA NA NA NA COX7A2 40244 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 76498619 76498787 76498703 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 41710 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 80207886 80208176 80208031 Y NA LCA5 NA NA NA NA LCA5 36999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 80873508 80873660 80873570 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 59144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 81197510 81197656 81197595 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 383146 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 82785578 82785603 82785590 Y NA NA C9orf46 MCF7 ChIA-PET 19890323 IBTK 169868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 84577292 84577766 84577526 Y CYB5R4 CYB5R4 NA NA NA NA CYB5R4 9930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 88160287 88160298 88160293 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 18043 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 331210 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 89440448 89440768 89440686 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 230580 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 89470471 89470676 89470540 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 200672 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 89754563 89754924 89754852 Y UBE2J1,RRAGD,PNRC1,RNGTT PNRC1 PNRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNRC1 33546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 90596283 90596734 90596349 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 58670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr6 90818937 90819075 90819003 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 185552 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 91424968 91425340 91425086 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 130204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 96304846 96305132 96304924 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 281427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 97681036 97681361 97681334 Y NA MMS22L NA NA NA NA MMS22L 47732 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 99081727 99082103 99081968 Y POU3F2 NA NA NA NA NA FBXL4 311746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 99292960 99293281 99293125 Y NA NA NA NA NA NA FBXL4 100568 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 LIN28B NA NA NA NA LIN28B 13286 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 105941085 105941388 105941231 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 92126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 330995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA AIM1 56310 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 108440032 108440340 108440122 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 44718 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr6 108954654 108955002 108954825 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 75616 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 108972074 108972278 108972175 Y FOXO3 NA NA NA NA NA FOXO3 93036 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 109059217 109059645 109059338 Y FOXO3 NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 107974 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 109102631 109102946 109102736 Y NA NA NA NA NA NA ARMC2 64673 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr6 109246414 109246449 109246432 Y NA RP11-249L21.4 SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-249L21.4 19338 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 109602805 109602853 109602823 Y NA NA CCDC162P IMR90 Hi-C 24141950 CD164 98909 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 110094407 110094557 110094483 Y NA NA NA NA NA NA FIG4 83908 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 111795712 111796054 111795883 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 6660 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 114056297 114056582 114056455 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 119959 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 114391441 114391608 114391525 Y HS3ST5 NA NA NA NA NA HDAC2 60969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 114603610 114603654 114603632 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 58555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr6 114664746 114665107 114665068 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 2537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 114815822 114815857 114815840 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 153613 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 115795867 115795888 115795877 Y NA NA NA NA NA NA NT5DC1 624124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 117914764 117915043 117914904 Y NA GOPC NA NA NA NA GOPC 6648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 118008335 118008695 118008355 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 13670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 119166106 119166505 119166300 Y NA ASF1A NA NA NA NA ASF1A 46879 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 121940262 121940519 121940410 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-35P 166995 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 122172452 122172679 122172567 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 399185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1 NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 125952984 125953298 125953141 Y NA NA NA NA NA NA HINT3 322629 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 126108316 126108682 126108499 Y NA NA NA NA NA NA HINT3 167245 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 129455076 129455285 129455181 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 574085 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 129480057 129480411 129480316 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 548959 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA L3MBTL3 180636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 131327805 131328036 131327854 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L2 54426 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 131375294 131375442 131375382 Y NA EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 7020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA MED23 17360 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 133837061 133837238 133837150 Y NA NA NA NA NA NA TCF21 371038 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 134504980 134505079 134505030 Y SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 132171 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 134557122 134557494 134557365 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 79756 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 134622486 134622615 134622584 Y SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 14635 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 134668918 134669336 134669288 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 31668 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 134669516 134669878 134669820 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 32266 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 136227219 136227382 136227241 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 381607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 PEX7 NA NA NA NA PEX7 32074 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 139841535 139841931 139841798 Y HECA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 147778 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 142091291 142091499 142091406 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 374868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 144053697 144053884 144053799 Y STX11,PLAGL1 NA NA NA NA NA LTV1 108597 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 149080716 149081059 149080880 Y NA UST NA NA NA NA UST 14252 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 149081701 149082266 149082198 Y UST UST NA NA NA NA UST 15237 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 149368124 149368336 149368236 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 169441 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 149376073 149376391 149376158 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 161386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 150286198 150286452 150286311 Y ULBP1 RAET1G,ULBP2,ULBP1,RAET1K NA NA NA NA ULBP1 3055 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 150647426 150647808 150647617 Y NA RNU4-7P PPP1R14C IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-7P 1527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 150963010 150963101 150963056 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 44011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 151074633 151074860 151074746 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1L 109825 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 116097 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 154505237 154505477 154505359 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 324316 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 NA NA NA NA NA CNKSR3 164535 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 155179611 155179904 155179758 Y NA TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 27780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 29481 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 43210 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 156571786 156572058 156571922 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 525005 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 157609644 157610034 157609839 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 132599 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SERAC1 105604 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 75680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 160409606 160409719 160409663 Y IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 21475 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 160837218 160837569 160837394 Y NA NA NA NA NA NA IGF2R 449087 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 161545851 161546111 161545978 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 135092 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 162530667 162531055 162530909 Y NA NA NA NA NA NA PARK2 615748 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 166711154 166711571 166711225 Y PRR18 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 42508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 169473606 169473776 169473633 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 626383 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 170461964 170462067 170462016 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 135494 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 555332 555565 555456 Y GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 2368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr7 556288 556672 556400 Y LOC100288524,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 1261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 1708705 1709030 1708796 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 100064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 2077094 2077375 2077195 Y LFNG,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 193503 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 2150639 2150902 2150796 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 119976 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 2276986 2277172 2277058 Y LFNG,SNX8 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA FTSJ2 2668 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 2356665 2356933 2356799 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 34788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 2980860 2981267 2981182 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 98902 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3053866 3054071 3053969 Y NA CARD11 NA NA NA NA CARD11 27508 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3522204 3522406 3522287 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 183124 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3568098 3568478 3568121 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 229018 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3603136 3603457 3603297 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 264056 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3668930 3669293 3669112 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 329850 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3699539 3699733 3699636 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 360459 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 3877207 3877255 3877231 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 538127 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 4723112 4724257 4723950 Y NA FOXK1 NA NA NA NA FOXK1 41724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 4746884 4747018 4746986 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 65496 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 4747693 4747769 4747737 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 66305 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 4773446 4773760 4773608 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 92058 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 5638553 5639025 5638653 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 8114 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 5650367 5650762 5650403 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 19928 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 5731889 5732558 5731976 Y CCZ1 NA NA NA NA NA RNF216 86812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6319055 6319208 6319146 Y NA CYTH3 USP42 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH3 8780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 8165403 8166093 8165752 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA ICA1 134224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 8482629 8482725 8482675 Y NXPH1 NA NA NA NA NA ICA1 182312 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 11293871 11294115 11293993 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 282372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 13512547 13512927 13512737 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 ETV1 516123 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 13694099 13694114 13694107 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 334936 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 13700759 13700990 13700876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 328060 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 13758700 13759051 13758876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 269999 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 14042792 14042945 14042854 Y NA ETV1 NA NA NA NA ETV1 13742 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 17664691 17664931 17664811 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 313193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20059372 20059444 20059408 Y NA RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 19026 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20163699 20164108 20163996 Y NA AC005062.2 NA NA NA NA AC005062.2 13968 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA NA TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005062.2 168738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20386006 20386499 20386153 Y ITGB8 NA NA NA NA NA AC005062.2 207930 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 20414219 20414454 20414223 Y NA NA NA NA NA NA AC005062.2 236143 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 20439186 20439753 20439406 Y NA NA NA NA NA NA AC005062.2 261110 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 20463565 20463840 20463661 Y ITGB8 NA NA NA NA NA AC005062.2 285489 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 20474863 20475329 20475074 Y ITGB8 NA NA NA NA NA AC005062.2 296787 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20488084 20488380 20488322 Y NA NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 AC005062.2 310008 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20488630 20489286 20488971 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 AC005062.2 310554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20516668 20517013 20516807 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 SP8 307492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 20547767 20548194 20547808 Y ITGB8 NA NA NA NA NA SP8 276311 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20582388 20582432 20582424 Y ITGB8 NA NA NA NA NA SP8 242073 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,LINC01162 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 20993749 20993911 20993806 Y SP8 NA NA NA NA NA LINC01162 120699 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 21120779 21120894 21120878 Y NA NA NA NA NA NA LINC01162 247729 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 22122992 22123068 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 139290 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 22631710 22632105 22631870 Y IL6 STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 38439 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 22742975 22743282 22743130 Y NA NA FAM126A,LOC100506178 IMR90 Hi-C 24141950 STEAP1B 72431 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 22851635 22851773 22851763 Y NA TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 8697 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23061903 23062212 23061975 Y IL6 FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 10154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 AC079780.3 3989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 24438416 24438737 24438577 Y NA NA NA NA NA NA MPP6 172150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 25992296 25992472 25992423 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 197388 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 26369550 26369804 26369732 Y CBX3,SNX10,SNX10 SNX10,AC004540.4 NA NA NA NA SNX10 40009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 23488 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 30224515 30225078 30224817 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 96845 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA TBX20 215061 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 415606 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 36885113 36885488 36885361 Y KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895 NA NA NA NA NA KIAA0895 457379 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 37487081 37487482 37487160 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 ELMO1 NA NA NA NA ELMO1 229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 37731277 37731583 37731449 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 244425 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 38347341 38347566 38347473 Y STARD3NL,TARP AC006033.22 LOC100506776 IMR90 Hi-C 24141950 AC006033.22 1418 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 38426501 38426719 38426610 Y NA NA NA NA NA NA AC006033.22 77517 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 39660879 39661112 39661042 Y NA NA NA NA NA NA RALA 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 40584238 40584551 40584395 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 596602 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 41670449 41670706 41670569 Y NA NA C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 604763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 44845785 44846169 44845977 Y DDX56 PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 11506 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1,SUN3,C7orf57 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 150763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 50948563 50948792 50948678 Y GRB10 NA NA NA NA NA GRB10 89404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr7 55600079 55600443 55600389 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 38238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 55603072 55603362 55603151 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 35319 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 55608174 55608360 55608336 Y NA VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 30321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 55614421 55614857 55614666 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 23824 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2,NUPR1L NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA NUPR1L 424264 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA ZNF716 NA NA NA NA ZNF716 35912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-73B2.6 1414954 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 65762762 65763060 65762890 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 94576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.62694958892628 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 66783772 66783944 66783858 Y NA STAG3L4,PMS2P4 NA NA NA NA PMS2P4 17878 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 69069799 69069881 69069840 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 7894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 69409562 69409698 69409630 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 347657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 69963084 69963238 69963161 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 901179 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 70146101 70146417 70146317 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1084196 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 70253382 70253537 70253463 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1191477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 71803548 71803903 71803734 Y CALN1 NA NA NA NA NA TYW1B 492874 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 77753891 77754159 77754025 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 327769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 78412122 78412354 78412238 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 986000 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 82014296 82014582 82014440 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 56532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 83089748 83090034 83089772 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 299502 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 84248657 84248668 84248663 Y NA NA NA NA NA NA AC074183.4 318893 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 86534596 86534997 86534797 Y NA NA NA NA NA NA DMTF1 244680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 88029071 88029091 88029081 Y NA NA NA NA NA NA SRI 174763 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 90242419 90242638 90242578 Y NA NA CDK14,FZD1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK14 148681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 91142488 91142502 91142497 Y MTERF NA NA NA NA NA FZD1 250705 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 91206328 91206484 91206406 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 301550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 92279692 92280069 92279965 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 61984 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 NA NA NA NA NA TFPI2 286796 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 91903 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 95645399 95645785 95645516 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 303674 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 98099989 98100186 98100071 Y TMEM130 NA TMEM130 IMR90 Hi-C 24141950 BAIAP2L1 71609 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 100434359 100434559 100434459 Y SAP25,EPHB4 SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 11238 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 100752309 100752636 100752570 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1 NA NA NA NA SERPINE1 15734 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 102452256 102452586 102452421 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 64838 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 102512857 102513072 102512991 Y NA NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 NFE4 98897 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 102790674 102790901 102790766 Y NAPEPLD RPL19P12,NAPEPLD NA NA NA NA NAPEPLD 2667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 104842983 104843396 104843385 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 191492 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 105088667 105088879 105088749 Y MLL5,ATXN7L1,SRPK2 NA NA NA NA NA SRPK2 50912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 105329677 105330033 105329813 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB10 90355 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 105416484 105416867 105416678 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 98183 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 106061034 106061788 106061567 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 136262 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 107079032 107079264 107079148 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 122665 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 84760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 325972 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 113233852 113234207 113234027 Y NA NA NA NA NA NA LINC00998 477184 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 114018736 114018896 114018817 Y FOXP2 NA NA NA NA NA LINC00998 1262068 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 114571241 114571658 114571396 Y MDFIC NA NA NA NA NA TES 1276889 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 115326798 115327008 115326857 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 TES 521539 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 115873924 115874179 115873941 Y TES TES NA NA NA NA TES 25377 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 117953120 117953279 117953191 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 131034 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 119269873 119270211 119270042 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 275218 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 261423 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 119300626 119300913 119300840 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 244516 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 119435371 119435694 119435534 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 109735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 120420082 120420394 120420238 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 76062 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 120422644 120422993 120422820 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 73463 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr7 120589568 120589730 120589649 Y ING3 ING3 NA NA NA NA ING3 765 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 122319383 122319737 122319553 Y NA RPS26P31 NA NA NA NA RPS26P31 39 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 124120610 124120698 124120659 Y NA NA GPR37 IMR90 Hi-C 24141950 POT1-AS1 447229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 124419446 124419631 124419539 Y NA NA NA NA NA NA POT1-AS1 148296 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129005588 129005946 129005786 Y AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 42265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129014301 129014725 129014533 Y AHCYL2,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 33486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129410177 129410359 129410300 Y NA NA NA NA NA NA NRF1 160622 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 10.1771011544225 chr7 129420694 129421120 129420768 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 169669 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129421490 129421976 129421792 Y FAM40B NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 168813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 177366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 134555607 134555837 134555722 Y CALD1,STRA8 NA NA NA NA NA AGBL3 113422 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A SLC13A4 C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC13A4 31434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 136582219 136582518 136582369 Y NA NA NA NA NA NA PTN 444093 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 136635462 136635508 136635485 Y NA NA NA NA NA NA PTN 391103 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 138250447 138250496 138250473 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA TRIM24 107368 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 138662189 138662362 138662288 Y NA KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 1702 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 139227178 139227349 139227257 Y NA CLEC2L,ERHP1 NA NA NA NA ERHP1 10192 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 139615919 139616013 139615969 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA HIPK2 140342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 139929659 139930294 139929953 Y TBXAS1,RAB19,JHDM1D NA JHDM1D,LOC100134229 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP12 168138 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 140324221 140324519 140324370 Y NA ADCK2,DENND2A DENND2A,MKRN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCK2 46434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 143856214 143856503 143856359 Y NA NA NA NA NA NA FAM115A 258923 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 145860816 145861156 145860986 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1329328 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 145925339 145925571 145925397 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1393851 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 145932628 145933064 145932806 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1401140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr7 145933200 145933594 145933373 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1401712 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 145934224 145934573 145934546 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1402736 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 145940282 145940834 145940467 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1408794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 145943025 145943194 145943108 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1411537 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 149112304 149112563 149112312 Y ZNF862 NA NA NA NA NA ZNF746 80345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 149280287 149280529 149280408 Y NA ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 39314 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 150063162 150063570 150063276 Y GIMAP2 LRRC61,ACTR3C,RARRES2,ZNF775 NA NA NA NA REPIN1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 152219127 152219295 152219254 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 151955 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr7 152235560 152235891 152235729 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 135359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr7 153946886 153947279 153947083 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 845515 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 156735476 156735625 156735551 Y MNX1 NOM1 LMBR1 K562 ChIA-PET 22265404 NOM1 4792 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr7 156800292 156800601 156800569 Y MNX1,MNX1 MNX1 NA NA NA NA MNX1 744 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 157956905 157957265 157957085 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA NCAPG2 538255 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 158110398 158110735 158110581 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 384785 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 158194918 158195318 158194932 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 300202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 158603982 158604371 158604316 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 16573 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr7 158905033 158905150 158905046 Y NA NA NA NA NA NA WDR60 257764 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 1011862 1012449 1011913 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 ERICH1 325756 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 9040807 9041224 9041065 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA RP11-10A14.4 33555 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 9764051 9764441 9764391 Y MSRA LINC00599 NA NA NA NA LINC00599 3175 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 9912937 9913246 9913138 Y NA MSRA NA NA NA NA MSRA 3159 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 9978890 9979101 9978960 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 69112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA NA NA NA NA NA AF131216.5 109876 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 28107 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 12608373 12608831 12608472 Y NA LONRF1 NA NA NA NA LONRF1 2751 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 12975034 12975328 12975181 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 173883 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 15546823 15547116 15546970 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 274099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 16476986 16477261 16477122 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 534277 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 16981456 16981640 16981548 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 29898 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 18244410 18244774 18244528 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 218424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 19243434 19243614 19243539 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 74306 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 20365880 20366059 20365989 Y NA NA NA NA NA NA LZTS1 206406 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.3902728178932 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFM,NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 25864670 25864945 25864828 Y EBF2 NA NA NA NA NA PPP2R2A 282062 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 27517363 27517693 27517481 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA SCARA3 27978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 28355222 28355409 28355286 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 5493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 29946002 29946367 29946215 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 4547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 30262933 30263230 30262977 Y NA RBPMS NA NA NA NA RBPMS 22989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 30273402 30273800 30273435 Y NA RBPMS NA NA NA NA RBPMS 33458 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr8 35156288 35156553 35156421 Y NA NA NA NA NA NA UNC5D 65313 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.28368698615785 chr8 37656576 37656905 37656741 Y GOT1L1 PROSC,GPR124,BRF2 NA NA NA NA GPR124 16867 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 38009325 38009705 38009661 Y NA ASH2L,STAR,BAG4,LSM1 NA NA NA NA STAR 2542 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 STAR,BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 38816649 38817007 38816807 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA TM2D2 35336 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 40016557 40016909 40016733 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT4 736443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 41462271 41462436 41462354 Y NA AGPAT6,NKX6-3 NA NA NA NA AGPAT6 29565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 42356471 42356680 42356560 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 38389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 48350721 48350922 48350822 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 276228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 48504387 48504764 48504567 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 144884 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 48903451 48903743 48903597 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 15217 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 53607875 53608327 53608179 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 48076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 54658367 54658716 54658684 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 95402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 55018716 55018874 55018809 Y ATP6V1H,ATP6V1H LYPLA1,MRPL15 LYPLA1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LYPLA1 6139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 57122742 57122884 57122813 Y NA PLAG1,CHCHD7 NA NA NA NA CHCHD7 497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr8 62600598 62600698 62600684 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 24457 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 64908546 64908816 64908686 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 829434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 70033144 70033349 70033247 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 343510 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 SULF1 65735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 70985003 70985175 70985161 Y NA PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA PRDM14 3075 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chr8 72009245 72009445 72009345 Y NA NA NA NA NA NA XKR9 429645 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 73139685 73140008 73139881 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 153833 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 73230861 73231003 73230932 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 245009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr8 76648023 76648030 76648026 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 753273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 79000264 79000479 79000281 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 425895 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 96960626 96960710 96960668 Y NA NA NA NA NA NA UQCRB 285152 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 97173806 97174188 97174149 Y NA NA NA NA NA NA UQCRB 71674 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 98051049 98051098 98051078 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL5 237078 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 98892233 98892331 98892282 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA MATN2 13165 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 99643221 99643590 99643555 Y NA NA NA NA NA NA STK3 309465 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 100594115 100594434 100594137 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 309856 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 101427912 101428321 101428112 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 81466 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr8 101455424 101455703 101455525 Y PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 108978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 101912406 101912993 101912785 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA NA NA NA NA YWHAZ 50623 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 11144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 103401606 103401938 103401841 Y NA UBR5 NA NA NA NA UBR5 21131 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 104305857 104306236 104306047 Y NA FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA FZD6 2425 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 944209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 109090499 109090792 109090646 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 354770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 109132004 109132262 109132106 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 313300 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 114422111 114422275 114422193 Y CSMD3 RP11-709P2.1,CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 25053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 115227918 115228008 115227963 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267L5.1 64288 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267L5.1 415273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 117378539 117378781 117378660 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 397961 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 118072404 118072549 118072412 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 187299 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 118100487 118100851 118100669 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 215382 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 119339236 119339376 119339324 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 217144 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 123193210 123193342 123193276 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 541580 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 123883965 123883977 123883971 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 168686 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 125249599 125249607 125249603 Y NA NA TMEM65,FER1L6 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 87435 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 125468258 125468440 125468349 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 7210 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 126187682 126188060 126187888 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85600 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 126317403 126317692 126317515 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 122871 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 126399072 126399443 126399281 Y NA TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 41120 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chr8 126643765 126643775 126643770 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB1 203202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 126834397 126834705 126834582 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 393834 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 127829528 127829825 127829677 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 260890 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 127928770 127929133 127928805 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 360132 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 127963308 127963680 127963494 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 394670 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA POU5F1B 353906 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA POU5F1B 324993 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA POU5F1B 257008 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128182261 128182424 128182343 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 242111 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 166273 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128413471 128413778 128413602 Y MYC POU5F1B LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 10757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128911546 128911899 128911640 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 106767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 128993662 128993919 128993808 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 129163348 129163834 129163669 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 142491 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 129593885 129594223 129593976 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 573028 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr8 129614909 129615287 129615035 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 594052 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 129626202 129626412 129626297 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 605345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr8 129655139 129655338 129655239 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 634282 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr8 130373600 130373989 130373795 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 653386 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 130501651 130501893 130501731 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 525482 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 130548053 130548359 130548185 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 479016 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 131012344 131012436 131012358 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 14939 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 131260848 131261137 131260957 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 192769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 133508104 133508400 133508366 Y NA NA KCNQ3,LRRC6 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC6 177438 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 134141328 134141671 134141507 Y TG NA NA NA NA NA NDRG1 170594 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA NA NA NA NA NA NDRG1 78009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 134562758 134562922 134562840 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 19261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 135515802 135516060 135515897 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 207232 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 135842490 135842788 135842753 Y NA MIR30D ZFAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 27302 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 137765888 137765903 137765896 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 1013150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 137937938 137938287 137938113 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 1185200 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 138127767 138128050 138127889 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 1375029 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 139299523 139299711 139299616 Y NA NA NA NA NA NA COL22A1 624538 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 139470723 139471056 139470890 Y NA NA NA NA NA NA COL22A1 453193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 139925414 139925432 139925424 Y NA COL22A1 NA NA NA NA COL22A1 1165 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 141179581 141179847 141179769 Y EIF2C2,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 286831 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 141920743 141920803 141920776 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 89512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142182442 142182863 142182588 Y NA NA NA NA NA NA DENND3 57065 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142255319 142255549 142255470 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA SLC45A4 60855 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142403963 142404243 142404183 Y PTP4A3 PTP4A3 FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 3870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142919518 142919535 142919527 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P38 452343 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 142975914 142976309 142976112 Y NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 TSNARE1 506292 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr8 143403466 143403590 143403541 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 79011 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 143404071 143404506 143404336 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 78095 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 143405050 143405259 143405133 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 77342 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 143449565 143449834 143449726 Y TSNARE1 TSNARE1 NA NA NA NA TSNARE1 32767 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 144328155 144328364 144328211 Y NA ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA ZFP41 875 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,MAPK15,FAM83H NA NA NA NA MAPK15 2759 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 145118322 145118976 145118932 Y LOC100130274,SPATC1 OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,KIAA1875,SHARPIN NA NA NA NA OPLAH 1587 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 145938520 145938651 145938564 Y NA ARHGAP39,ZNF251 NA NA NA NA ARHGAP39 29326 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr8 146047058 146047297 146047178 Y ZNF34 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 3552 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 972038 972418 972053 Y NA DMRT3 NA NA NA NA DMRT3 2546 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 2018914 2019279 2019030 Y NA SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 5572 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 18263 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 12785 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 4864348 4864647 4864448 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 16057 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 5086081 5086478 5086137 Y CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2 NA NA NA NA NA INSL6 97190 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 5518146 5518272 5518209 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1432 108753 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 13502665 13502870 13502768 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 225076 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 18437501 18437903 18437771 Y NA NA FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-296P7.4 586987 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 19231297 19231777 19231673 Y PLIN2 NA DENND4C IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 84009 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 19252213 19252529 19252372 Y NA NA NA NA NA NA PLIN2 104925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA PTPLAD2 235413 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 21681581 21681928 21681849 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 118614 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 21809706 21810111 21809856 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 9164 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 23622735 23622745 23622740 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 201590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 24920693 24920988 24920699 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 755868 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 26921358 26921728 26921543 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 23309 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 194363 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA TOPORS 14694 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 33375284 33375639 33375462 Y NA NA NA NA NA NA AQP3 69970 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 35232989 35233276 35233133 Y DNAJB5 NA NA NA NA NA UNC13B 72990 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37924173 37924321 37924247 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 124739 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 37963992 37964293 37964120 Y NA NA NA NA NA NA SHB 102917 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 38016375 38016730 38016641 Y NA NA NA NA NA NA SHB 50480 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 68410626 68410725 68410676 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 42650 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 13.2538991778526 chr9 71413577 71413589 71413582 Y NA FAM122A NA NA NA NA FAM122A 20613 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 71487093 71487366 71487280 Y NA NA NA NA NA NA FAM122A 94129 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 TJP2 NA NA NA NA TJP2 49794 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 71790550 71790929 71790586 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 56341 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 71795556 71796114 71795819 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 61347 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 72027379 72027424 72027413 Y PRKACG NA NA NA NA NA TJP2 293170 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 72344996 72345326 72345161 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 27549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 72653472 72653608 72653542 Y NA NA MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 218329 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 75125387 75125400 75125394 Y TMC1 NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 147224 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 245566 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 76944728 76944906 76944817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-197P3.1 603186 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 77765912 77766310 77766149 Y OSTF1 NA NA NA NA NA OSTF1 64453 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 78511057 78511456 78511257 Y NA PCSK5 NA NA NA NA PCSK5 7497 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 79350296 79350357 79350327 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA AL161626.1 165565 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 79383801 79384093 79383990 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA PRUNE2 134910 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 79390981 79391367 79391174 Y NA NA NA NA NA NA PRUNE2 127636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 80560530 80561013 80560815 Y GNAQ NA NA NA NA NA GNAQ 83361 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 81131124 81131152 81131138 Y CEP78 NA NA NA NA NA PSAT1 221065 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 81309838 81310145 81309901 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 399779 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 81341677 81341857 81341765 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 431618 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 81586798 81586848 81586823 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 417371 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 82226280 82226508 82226439 Y TLE4 TLE4 NA NA NA NA TLE4 41592 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 82495908 82496274 82496091 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 311220 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 85169013 85169170 85169091 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 506922 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 86271805 86271878 86271876 Y NA RP11-522I20.3,UBQLN1 NA NA NA NA RP11-522I20.3 48631 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 88184194 88184649 88184621 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 170295 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 88286391 88286647 88286519 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 68297 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 90171863 90172233 90171972 Y CTSL1,DAPK1 RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 33646 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 90386290 90386442 90386322 Y NA NA NA NA NA NA CDK20 201226 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 91148176 91148373 91148274 Y NA NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 91540452 91540830 91540576 Y S1PR3,C9orf47 NA LOC286238,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 63532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr9 92050487 92050811 92050719 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 60234 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 92218967 92219282 92219262 Y NA GADD45G NA NA NA NA GADD45G 1039 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.7868283365293 chr9 92887274 92887574 92887411 Y NA NA UNQ6494,SYK,DIRAS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-389K14.3 306213 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 94123007 94123342 94123181 Y NA AUH NA NA NA NA AUH 812 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 94834730 94835154 94834963 Y OGN SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 40512 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 95029374 95029660 95029516 Y NA IARS NA NA NA NA IARS 24378 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 95288173 95288480 95288343 Y NA NA NA NA NA NA IPPK 142067 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 95973709 95973758 95973734 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 79139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 96044305 96044695 96044445 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 149735 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 96057122 96057472 96057169 Y ZNF484,ZNF484,WNK2 NA NA NA NA NA FAM120A 154532 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 96057493 96057765 96057581 Y ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2 NA NA NA NA NA FAM120A 154239 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 96335202 96335517 96335360 Y NA PHF2 NA NA NA NA PHF2 1172 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 96845736 96845997 96845867 Y NA CYCSP24 NA NA NA NA CYCSP24 47424 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr9 97520794 97521111 97520953 Y C9orf3 C9orf3 FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 33811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 97590305 97590486 97590422 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 103322 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 97950881 97951234 97951005 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 126757 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 98527125 98527421 98527164 Y NA NA LOC158435,LINC00476,C9orf102 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 108838 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 98931605 98932004 98931930 Y NA EIF4BP3 FBP1,FANCC,LOC158435,LOC100507346,PTCH1,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 25316 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 100841115 100841498 100841123 Y C9orf156 NANS,TRIM14 NA NA NA NA NANS 24094 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 101002580 101002910 101002849 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 13005 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 101013285 101013628 101013443 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 2287 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 101030800 101031187 101030994 Y NA TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 14885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chr9 101081243 101081884 101081560 Y GABBR2 NA NA NA NA NA TBC1D2 65328 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 102276070 102276271 102276153 Y NR4A3 NA SEC61B,ALG2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC61B 293724 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 102580616 102580992 102580865 Y NA RP11-554F20.1 NA NA NA NA RP11-554F20.1 445 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 102767343 102767551 102767505 Y NA NA NA NA NA NA ERP44 91771 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 102908427 102908826 102908633 Y NA ERP44,INVS NA NA NA NA INVS 48889 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 103641019 103641318 103641311 Y TMEFF1 NA NA NA NA NA LPPR1 147673 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 104004490 104004540 104004515 Y NA NA NA NA NA NA MRPL50 154356 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 107723549 107723790 107723714 Y NIPSNAP3A,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 35031 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 107983498 107983520 107983511 Y NA SLC44A1 SLC44A1,ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 21383 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 108621964 108622364 108622354 Y NA NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 167139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 109159029 109159177 109159103 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 464201 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 110437099 110437420 110437250 Y KLF4 NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 142428 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 111872786 111872983 111872905 Y NA NA NA NA NA NA CTNNAL1 98977 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 111880224 111880422 111880303 Y NA NA NA NA NA NA CTNNAL1 106415 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 112419836 112420089 112419963 Y C9orf4,PALM2 NA PALM2-AKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 PALM2-AKAP2 120500 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 113412585 113412772 113412669 Y NA NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 386209 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 114292075 114292469 114292256 Y NA KIAA0368,ZNF483 NA NA NA NA ZNF483 6636 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 115067475 115067560 115067518 Y SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2 PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 26387 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 115624285 115624808 115624606 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 113167 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 117134599 117134885 117134873 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 130845 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 117135053 117135760 117135486 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 129970 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 117345821 117345927 117345874 Y NA ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chr9 117942308 117942603 117942434 Y NA NA NA NA NA NA TNC 63772 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 117976093 117976379 117976336 Y NA NA NA NA NA NA TNC 97557 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 119404408 119404429 119404420 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 43152 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 119992393 119992471 119992467 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 182877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 120176306 120176455 120176377 Y NA ASTN2 NA NA NA NA ASTN2 958 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 120522424 120523171 120522785 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 57814 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 123446824 123446976 123446902 Y TRAF1,TRAF1 MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 27772 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 123652531 123653088 123652891 Y CNTRL,FBXW2,TRAF1,TRAF1,TRAF1 PSMD5,PHF19 PHF19 IMR90 Hi-C 24141950 PHF19 14925 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 123653794 123654121 123654065 Y NA PHF19 NA NA NA NA PHF19 16188 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 124363625 124363839 124363710 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 36289 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 8.99371729925709 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 125168700 125168938 125168792 Y NA PTGS1 NA NA NA NA PTGS1 37876 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 125956223 125956395 125956307 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72460 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 126029655 126030141 126030108 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 800 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 126138103 126138404 126138241 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 109248 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127266277 127266534 127266531 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 90554 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127267013 127267383 127267321 Y NR5A1 NA NA NA NA NA PSMB7 91290 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127384209 127384538 127384362 Y ARPC5L NA NA NA NA NA NR6A1 147051 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.7868283365293 chr9 128415828 128415846 128415837 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 51667 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 128422195 128422516 128422378 Y HSPA5 MAPKAP1 NA NA NA NA MAPKAP1 44997 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 129929259 129929425 129929350 Y LRSAM1,RALGPS1 NA NA NA NA NA GARNL3 55119 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 130307843 130308200 130307973 Y SLC2A8,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 31068 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,MIR219-2,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 131660472 131660616 131660545 Y NA LRRC8A,CCBL1,PHYHD1,DOLK,NUP188 NA NA NA NA CCBL1 17699 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 132705367 132705623 132705495 Y C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 97850 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 133001906 133002144 133002026 Y NA HMCN2 NA NA NA NA HMCN2 42738 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 91219 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.31347479446314 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 134610888 134611363 134611119 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 2098 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 134773213 134773507 134773412 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 159752 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 134913456 134913470 134913463 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 39825 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 135059697 135059990 135059854 Y NA NA SETX IMR90 Hi-C 24141950 MED27 106402 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 135145655 135145895 135145765 Y NA NA NA NA NA NA SETX 82477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 135231921 135232175 135232157 Y NA SETX,TTF1 NA NA NA NA SETX 3549 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 16.0940204302495 chr9 136019465 136020353 136020023 Y NA RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 16948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chr9 136738611 136738757 136738701 Y NA NA NA NA NA NA VAV2 116969 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 137231518 137231916 137231717 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 24574 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 138780125 138780291 138780208 Y CAMSAP1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 16783 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.84012125239698 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,ENTPD8 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA GPR143 50948 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 10138679 10138762 10138721 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 15655 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM9C 59123 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K15 243608 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 20076106 20076490 20076168 Y NA NA NA NA NA NA MAP7D2 56545 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 23368174 23368523 23368350 Y NA PTCHD1 NA NA NA NA PTCHD1 18041 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 31848875 31849137 31848986 Y NA NA NA NA NA NA TAB3 857674 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.18338385516541 chrX 39865489 39865898 39865566 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 168684 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 39949495 39949781 39949700 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 84801 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 3.07679802343006 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 39961698 39961932 39961714 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 72650 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chrX 40015911 40016135 40015987 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 18447 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40016662 40016910 40016734 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 17672 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40031344 40032243 40032130 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 2339 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA MKRN4P NA NA NA NA MKRN4P 388 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 362298 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 46509009 46509283 46509068 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 77790 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 49008826 49009047 49008937 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP NA NA NA NA PLP2 17226 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 53398923 53399250 53399087 Y NA SMC1A NA NA NA NA SMC1A 48427 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA SMC1A 18996 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA KLF8 NA NA NA NA KLF8 12989 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA FAAH2 108870 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 57929641 57930031 57929858 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 79089 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 63554308 63554471 63554461 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 58862 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chrX 67382331 67382438 67382385 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 269317 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chrX 69386644 69386665 69386655 Y NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 35345 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 GDPD2,DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 13891 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.89341416826465 chrX 70411067 70411368 70411206 Y TEX11 RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 4657 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 70769326 70769616 70769471 Y NA OGT,ACRC NA NA NA NA OGT 18393 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 70842464 70842816 70842607 Y TAF1,OGT,CXCR3 ACRC NA NA NA NA ACRC 46203 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA CITED1 110877 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 75247 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 73338544 73338621 73338582 Y NA NA NA NA NA NA USMG5P1 53104 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 73352212 73352497 73352336 Y NA USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 39228 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 77357639 77357943 77357791 Y NA PGK1,TAF9B NA NA NA NA TAF9B 35260 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 235327 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 85145367 85145588 85145476 Y NA NA NA NA NA NA CHM 154978 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.13009093929773 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 95228939 95229189 95229110 Y NA RP5-961K14.1 NA NA NA NA RP5-961K14.1 1625 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 96701855 96702106 96701982 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 764193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 99903962 99904188 99904076 Y SRPX2 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 6747 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 102651183 102651525 102651372 Y NA WBP5,NGFRAP1 NA NA NA NA NGFRAP1 21915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 103019589 103020004 103019883 Y NA PLP1 LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1 IMR90 Hi-C 24141950 PLP1 6643 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 6.62694958892628 chrX 104559193 104559437 104559342 Y NA NA NA NA NA NA NRK 505099 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 106804874 106804888 106804884 Y NA NA PRPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 64849 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 107965891 107966297 107966133 Y NA RP6-24A23.3 NA NA NA NA RP6-24A23.3 10944 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 109147674 109147976 109147825 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 95883 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 109315579 109315956 109315731 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 71720 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 111187632 111187918 111187775 Y ZCCHC16,TRPC5 NA NA NA NA NA ALG13 280589 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 111866747 111867081 111866914 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 214962 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 111949700 111949719 111949710 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 132324 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 114819160 114819326 114819285 Y NA PLS3 NA NA NA NA PLS3 25659 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 114956184 114956305 114956232 Y NA EEF1GP5,RP1-241P17.1 NA NA NA NA RP1-241P17.1 887 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 117487110 117487426 117487273 Y DOCK11,WDR44 WDR44 NA NA NA NA WDR44 9074 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 118407628 118408020 118407835 Y NA PGRMC1 NA NA NA NA PGRMC1 39412 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.65673739723157 chrX 119076607 119076872 119076702 Y NKRF NKAP NA NA NA NA NKAP 872 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 119276319 119276451 119276385 Y FAM70A NA NA NA NA NA NKAPP1 100671 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 125406399 125406559 125406479 Y NA NA NA NA NA NA MTND4P24 198309 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 11.597161780621 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 430054 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 129245756 129246153 129246006 Y NA NA NA NA NA NA AIFM1 51708 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 1.42006062619849 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 129982936 129983220 129983074 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 51988 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 130013053 130013179 130013116 Y NA ENOX2 NA NA NA NA ENOX2 22029 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 130698816 130699203 130699008 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 167139 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 130706744 130706880 130706830 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 175067 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 MIR363 NA NA NA NA MIR363 4280 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 133307362 133307774 133307418 Y PHF6,CCDC160 MIR363 NA NA NA NA MIR363 5880 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 136632347 136632538 136632444 Y ZIC3 RP1-137H15.2,ZIC3 NA NA NA NA RP1-137H15.2 12008 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA RP1-137H15.2,ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 2.36676771033081 chrX 138002307 138002505 138002406 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 300434 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 140218304 140218459 140218382 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 50851 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 149737740 149738101 149737940 Y MTMR1,MTM1 MTM1 NA NA NA NA MTM1 2671 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 149863588 149863865 149863755 Y MTM1,MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 4153 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.710030313099244 chrX 150071678 150071798 150071740 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 6389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.473353542066163 chrX 150347417 150347568 150347539 Y GPR50 NA NA NA NA NA RPL19P21 187443 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.946707084132326 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA PNMA5 NA NA NA NA PNMA5 32915 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 152980497 152980777 152980637 Y NA SLC6A8,PNCK,BCAP31,ABCD1 NA NA NA NA BCAP31 7375 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 153359354 153359823 153359622 Y NA MECP2 NA NA NA NA MECP2 1389 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA NA NA CAGE NEC8 hg19 FANTOM5 0.236676771033081