chr1 918449 918555 918505 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN NA NA NA NA HES4 14997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.86160047461633 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNF223 7147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 1173386 1173736 1173661 Y PLEKHN1 TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D NA NA NA NA B3GALT6 7757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1 NA NA NA NA TAS1R3 983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,VWA1 NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA MMP23B,CDK11B,MMP23A,CDK11A NA NA NA NA MMP23A 17254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 2111429 2112079 2111937 Y NA C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 30080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 2162325 2162996 2162733 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 20166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 2177615 2177829 2177732 Y NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 35456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 2253622 2253773 2253699 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 67373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 2509702 2510198 2509855 Y SKI,TNFRSF14 TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 5732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 51771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 3463934 3464260 3464145 Y ARHGEF16 NA NA NA NA NA MEGF6 61799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 6034742 6034859 6034801 Y NA NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 15674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 6341896 6342142 6342067 Y GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 22861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 6360191 6360625 6360507 Y PLEKHG5,PLEKHG5,HES2 GPR153 NA NA NA NA GPR153 41156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 6451759 6451831 6451795 Y NA ACOT7,HES2,ESPN NA NA NA NA ACOT7 620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 6894689 6894717 6894703 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 51305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8054249 8054565 8054423 Y NA PARK7,ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 29803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 8143203 8143348 8143235 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 58405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8154517 8154933 8154754 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 69719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8156648 8157003 8156918 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 71850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 72619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 8198088 8198334 8198235 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 113290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA NA ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 120979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 8257762 8258040 8257906 Y NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 117846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8264458 8264788 8264713 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 111098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 103496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 8319137 8319616 8319397 Y NA NA PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 56270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1-IT1 2141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 8999811 9000211 8999889 Y NA NA SLC2A5,SLC2A7 IMR90 Hi-C 24141950 ENO1 62503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 9222919 9223181 9223073 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 17082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 9335683 9335930 9335747 Y SLC25A33 H6PD,SPSB1 NA NA NA NA SPSB1 15009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 9760502 9760837 9760631 Y NA RP11-558F24.4 NA NA NA NA RP11-558F24.4 14889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 9889535 9889880 9889709 Y KIF1B CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 6951 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 9902068 9902153 9902107 Y KIF1B CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 19484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 10496880 10497075 10496978 Y KIF1B PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA NA NA NA NA APITD1,APITD1-CORT 8721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 10559059 10559458 10559098 Y NA PEX14,DFFA NA NA NA NA DFFA 28476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 12513404 12513748 12513535 Y AADACL4,VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 161989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 14087510 14087640 14087574 Y NA NA NA NA NA NA PRDM2 62817 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 15041115 15041310 15041140 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 117915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 15664307 15664455 15664338 Y NA NA EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 69936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 15742467 15743324 15742634 Y TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9 EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 8076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 15762061 15762268 15762214 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 27670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 16209325 16209770 16209445 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 36683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 16479299 16479465 16479382 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 17495208 17495390 17495300 Y NA NA PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 51260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA NA NA NA NA NA PADI2 90739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 17578205 17578469 17578334 Y NA NA NA NA NA NA PADI2 134257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 17896198 17896624 17896362 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 31868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 19248887 19249092 19248943 Y NA ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 21612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 19333976 19334220 19334098 Y NA NA UBR4,IFFO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 52796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 19701557 19701789 19701674 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 64737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21558552 21558736 21558644 Y EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA EIF4G3 57175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 21650806 21651685 21651350 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 18312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21655798 21656254 21656078 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 13743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21670382 21670956 21670695 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21931612 21931850 21931825 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 61951 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 28328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 21967959 21968010 21967985 Y NA RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 25791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 22221933 22221950 22221942 Y NA HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 39840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 22266159 22266438 22266333 Y HSPG2 HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 4369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 23123668 23124069 23123697 Y NA NA NA NA NA NA EPHB2 88336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 23445594 23445963 23445683 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 56338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 24476382 24476609 24476496 Y PNRC2,GRHL3 IL22RA1 IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 8771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 24477754 24478041 24477856 Y NA IL22RA1 IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 10143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 GRHL3,NIPAL3 NA NA NA NA GRHL3 48021 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 24789793 24789894 24789844 Y NA NIPAL3,RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 37493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 25095502 25095845 25095665 Y NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 25654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 25823926 25824130 25824028 Y NA LDLRAP1 LDLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 43941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 26123435 26123824 26123740 Y NA SEPN1 NA NA NA NA SEPN1 843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 26453982 26454320 26454195 Y UBXN11,UBXN11 PDIK1L,ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA PDIK1L 18318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 27185755 27186143 27185948 Y C1orf172,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 1490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.22568925803492 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 27762936 27763307 27763206 Y WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38 GPR3 NA NA NA NA GPR3 45788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27848725 27849287 27848935 Y WDTC1,SYTL1,FAM76A WASF2 NA NA NA NA WASF2 34056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 27869425 27869556 27869494 Y NA NA NA NA NA NA WASF2 54756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 27893697 27893957 27893851 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 34985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 28189568 28190269 28189912 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA PPP1R8 34279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 28190756 28191157 28191022 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA PPP1R8 35467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 28201800 28202156 28201857 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA RPA2 37101 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 28355043 28355235 28355139 Y NA NA NA NA NA NA EYA3 57972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 28439074 28439949 28439426 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 25867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29104880 29105053 29104930 Y NA YTHDF2 NA NA NA NA YTHDF2 43747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29224369 29224479 29224424 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 12766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 30447163 30447510 30447328 Y NA NA NA NA NA NA RP1-65J11.1 847565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 31904621 31905133 31905124 Y NA SERINC2 NA NA NA NA SERINC2 24209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 31943761 31943827 31943813 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63349 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 32701561 32701886 32701724 Y NA CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B NA NA NA NA MTMR9LP 3335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B,HDAC1 NA NA NA NA FAM167B 21737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 33082385 33082406 33082394 Y ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 32098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 33203093 33203146 33203106 Y NA SYNC,KIAA1522 KIAA1522 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1522 2340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 33645848 33646140 33645995 Y HPCA,PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 33802277 33802571 33802529 Y NA AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 39302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 33804092 33804324 33804199 Y NA AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 36283726 36283900 36283813 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 50158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 36431149 36431388 36431272 Y STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 121088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA TRAPPC3 20544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 36721428 36721771 36721600 Y NA THRAP3,SH3D21 NA NA NA NA THRAP3 33411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 38010731 38010979 38010768 Y ZC3H12A,MTF1 MEAF6,SNIP1,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 6924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 38287158 38287399 38287321 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA YRDC 15301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 39357087 39357474 39357146 Y MACF1,GJA9 RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA MYCBP 11798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 39624919 39625154 39625144 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 79931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 39651405 39651741 39651429 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 106417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 40848967 40849502 40849291 Y MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 40445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41365158 41365531 41365407 Y NA CITED4 CITED4,CTPS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 39140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41967378 41967702 41967588 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 141784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 41994633 41994922 41994778 Y SCMH1,HIVEP3 NA NA NA NA NA FOXO6 169039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42073844 42074019 42073961 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 248250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42126621 42126978 42126699 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 301027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 42180382 42180624 42180465 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 318972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42201445 42201633 42201491 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 297963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42248889 42249252 42248981 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 250344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 42334608 42334670 42334638 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 164926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42354251 42354647 42354385 Y RIMKLA,HIVEP3 NA NA NA NA NA HIVEP3 144949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 42363874 42364167 42364002 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 135429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 42367142 42367456 42367439 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 42372562 42373017 42372843 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 126579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 43407355 43407700 43407616 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 14830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 10143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 43839359 43839523 43839441 Y NA RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2 NA NA NA NA ELOVL1 7663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 44232152 44232509 44232262 Y SLC6A9,IPO13,ST3GAL3 NA NA NA NA NA ST3GAL3 62657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 45895307 45895445 45895389 Y TESK2 NA NA NA NA NA TESK2 59427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 64365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 63570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 46955737 46955918 46955906 Y DMBX1 NA FAAH,DMBX1,MKNK1 IMR90 Hi-C 24141950 MKNK1 124597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 46986321 46986408 46986365 Y DMBX1 NA NA NA NA NA MKNK1 94107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 47102400 47102701 47102616 Y NA MKNK1,ATPAF1 NA NA NA NA MKNK1 21885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 49317577 49317713 49317702 Y SPATA6,BEND5 NA NA NA NA NA BEND5 76936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 49430429 49430657 49430543 Y NA NA NA NA NA NA BEND5 189788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 49522549 49522595 49522572 Y NA NA NA NA NA NA BEND5 281908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 49812572 49812854 49812712 Y NA NA NA NA NA NA BEND5 571931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 49902417 49902596 49902507 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 584989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 49995089 49995393 49995241 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 492192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 50141272 50141561 50141492 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 346024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 50580035 50580167 50580147 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 92450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 51298202 51298577 51298390 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 125358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 51475380 51475551 51475487 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 50963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 51486737 51486965 51486837 Y NA NA FAF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2C 62320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 51809780 51810107 51809799 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 51997947 51998232 51998197 Y NA RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS15 14947 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 52029722 52030067 52029870 Y NA RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL9 10784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 52035422 52035744 52035601 Y NA OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 5107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 52507951 52508154 52508101 Y NA KTI12,BTF3L4,TXNDC12 NA NA NA NA KTI12 10463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 53703343 53703361 53703351 Y NA CPT2,C1orf123,MAGOH NA NA NA NA MAGOH 1061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54052889 54052991 54052940 Y NA NA NA NA NA NA LRP8 261147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54163740 54163856 54163800 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 190551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 54276863 54277244 54277063 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 77163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 54965120 54965643 54965198 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 87968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 55327144 55327486 55327453 Y NA RP11-67L3.5,DHCR24 NA NA NA NA RP11-67L3.5 23062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 55909250 55909597 55909489 Y NA NA PPAP2B,PRKAA2 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 230464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 56771744 56771759 56771752 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 337215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 56974162 56974535 56974381 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 134439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 57024882 57025247 57025166 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 83727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 58969564 58969575 58969570 Y NA DAB1,OMA1 NA NA NA NA DAB1 40831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59083441 59083551 59083446 Y NA TACSTD2 TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TACSTD2 42275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 59221049 59221462 59221387 Y NA JUN,LINC01135 FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59251646 59251903 59251775 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 2823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 59350687 59351233 59350859 Y FGGY NA NA NA NA NA LINC01135 101864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 59608749 59609120 59609039 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 124690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 59761390 59761720 59761439 Y NA FGGY NA NA NA NA FGGY 1080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 121127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 61662774 61662930 61662815 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 333843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 61707460 61707670 61707565 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 378529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 62609116 62609459 62609128 Y NA NA NA NA NA NA USP1 290509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 62773248 62773553 62773401 Y NA NA NA NA NA NA USP1 126415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 64197270 64197475 64197385 Y NA ROR1 ROR1,UBE2U,PGM1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 40218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 64531287 64531606 64531300 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 223931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 65363729 65364057 65363938 Y JAK1 NA NA NA NA NA JAK1 66130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 65381647 65381826 65381744 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 48361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 10019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 66757072 66757442 66757250 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 500875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 67847773 67848018 67847895 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 46080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 68688308 68688621 68688465 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 8182 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 68849988 68850367 68850179 Y NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 110537 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 68858132 68858533 68858311 Y NA NA WLS,LOC100289178 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 102371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.54364486632563 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 22556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 39652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 72073753 72074154 72073955 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 528746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 72686486 72686621 72686551 Y NEGR1 NA NA NA NA NA NEGR1 59796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 72696545 72696864 72696705 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 49553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 4000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 75168986 75169131 75169081 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 27705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 75590785 75591155 75591084 Y SLC44A5 NA NA NA NA NA CRYZ 393693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 75972237 75972619 75972428 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 102182 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 76645391 76645540 76645467 Y NA NA NA NA NA NA RABGGTB 395512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 77547345 77547669 77547455 Y NA NA NA NA NA NA PIGK 135446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA NA NA NA NA NA PIGK 86739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 78002564 78002920 78002661 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 144184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78132928 78133068 78133059 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 14036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 78171350 78171363 78171357 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 24246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 78469106 78469287 78469191 Y DNAJB4 FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA DNAJB4 26247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 78703686 78703842 78703764 Y NEXN RP11-183M13.1 NA NA NA NA RP11-183M13.1 10403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 78907891 78908155 78908023 Y NA NA MGC27382,PTGFR IMR90 Hi-C 24141950 PTGFR 140323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 79154444 79154658 79154581 Y NA IFI44 NA NA NA NA IFI44 40963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 83528650 83529168 83528896 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 795538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 83530346 83530531 83530439 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 794175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 85270218 85270566 85270347 Y NA NA NA NA NA NA LPAR3 86330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 85349108 85349420 85349289 Y LPAR3 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 7476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 85763626 85763846 85763779 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 22853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 85795855 85796291 85796120 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 85826803 85827129 85827050 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 86030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 86010067 86010444 86010393 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 31489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 27423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 28441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 86091549 86091558 86091554 Y NA DDAH1,CYR61 ZNHIT6,DDAH1,CYR61 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 47105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 86805161 86805335 86805245 Y SH3GLB1 NA NA NA NA NA ODF2L 54688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87190718 87190974 87190846 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 22459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87306817 87307030 87306985 Y SH3GLB1 NA NA NA NA NA SEP15 71077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87359712 87359873 87359793 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 18234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87691904 87692436 87692089 Y NA NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 99715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 88150561 88150732 88150650 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 358410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr1 89887466 89887838 89887537 Y GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B NA NA NA NA NA LRRC8B 100557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 90190139 90190909 90190374 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 93508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 92270160 92270686 92270504 Y RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 92549605 92549624 92549615 Y NA BTBD8 NA NA NA NA BTBD8 5743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA RNU4-59P 160446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 93032261 93032386 93032324 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-59P 132105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 47399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 34130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 31697 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 28580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 33954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94093325 94093611 94093590 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 37569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94125861 94126246 94126059 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1033H22.2 70105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94128177 94128297 94128262 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1033H22.2 72421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1033H22.2 89791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 10.0685942625389 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.55736371883342 chr1 94161111 94161471 94161388 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 77529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 71480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 70675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 94169341 94169462 94169391 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 69538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 94203705 94204234 94204026 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 34766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94204695 94204800 94204748 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 34200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94224546 94224929 94224684 Y DNTTIP2 RP11-488P3.1 MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 14071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 5939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 94309612 94309956 94309784 Y NA BCAR3,DNTTIP2 NA NA NA NA BCAR3 750 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94371317 94371601 94371445 Y NA DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA GCLM 1365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94527681 94527931 94527843 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 154715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94535371 94535770 94535449 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 162405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148B18.1 89541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 94626535 94626661 94626598 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148B18.1 84803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94676840 94677023 94676933 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 34441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 94701813 94701865 94701839 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 NA NA NA NA RP11-148B18.1 9599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 94712051 94712193 94712123 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-148B18.1 587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-148B18.1 931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.39152648843417 chr1 94784984 94785158 94785071 Y NA ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 11665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 8231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr1 94792807 94793133 94793077 Y ARHGAP29 RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 3690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 95267524 95267667 95267664 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 16170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 95388205 95388608 95388523 Y NA CNN3 NA NA NA NA CNN3 2226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 97308752 97309076 97308966 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 123531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98334223 98334553 98334370 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 50052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98373500 98373836 98373707 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 10769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 98425688 98426065 98426013 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 41083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 109639 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr1 98497100 98497277 98497188 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 112495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 98499783 98500490 98500262 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 115178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 258104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 98693625 98693976 98693800 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 309020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 98781999 98782036 98782018 Y NA NA LOC729987 IMR90 Hi-C 24141950 SNX7 343200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 SNX7 336008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 100138206 100138591 100138311 Y AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD PALMD NA NA NA NA PALMD 28707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 100140321 100140582 100140449 Y NA PALMD NA NA NA NA PALMD 30822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 100820585 100820838 100820683 Y HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 12001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA NA NA NA NA NA EXTL2 156983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 101485385 101485713 101485528 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 101725356 101725679 101725470 Y SLC30A7,SLC30A7 S1PR1 NA NA NA NA S1PR1 24912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 105668101 105668429 105668265 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 1601788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 107809244 107809255 107809250 Y NA NA NA NA NA NA NTNG1 128615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108441090 108441173 108441132 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 64593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108478963 108479298 108479233 Y VAV3 VAV3 NA NA NA NA VAV3 26468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108593971 108594173 108594055 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 88205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108595998 108596525 108596457 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 90232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108622242 108622251 108622249 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 116476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 108650339 108650754 108650436 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 90717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 108673419 108673672 108673564 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 67799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 109133120 109133338 109133232 Y STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 32409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 109572587 109572654 109572620 Y NA WDR47,TAF13 NA NA NA NA WDR47 10196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 109938897 109939079 109938975 Y TMEM167B,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 110142749 110143055 110142903 Y PSRC1,GNAT2 AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 13671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 110502633 110502891 110502762 Y NA AHCYL1 CYB561D1,GNAI3,MIR197,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM3,EPS8L3,CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 22417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 112163826 112164071 112163877 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 112276731 112276883 112276807 Y C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 18984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 113014906 113015158 113015047 Y CAPZA1 NA NA NA NA NA CTTNBP2NL 78103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 113684444 113684648 113684532 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 24968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 91953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 116039640 116039989 116039911 Y NA NA NGF,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 142585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117040346 117040781 117040440 Y ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 NAP1L4P1 NA NA NA NA NAP1L4P1 33933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117051576 117051921 117051802 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 NA NA NA NA NAP1L4P1 22793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117080047 117080432 117080232 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 5333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117081238 117081452 117081381 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 6524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 117112460 117112738 117112567 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 118415993 118416217 118416147 Y NA NA NA NA NA NA GDAP2 54036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 142536204 142536464 142536463 Y NA NA NA NA NA NA RP11-417J8.3 80305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 144536201 144536370 144536251 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 4163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 43743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 45407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 57405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145005016 145005394 145005195 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 62344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 145030583 145030978 145030933 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 43208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 145036432 145036531 145036463 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 37655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145042783 145043227 145042898 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 30959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145056399 145056625 145056543 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 17561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 145702718 145703106 145702912 Y NA PDZK1 NA NA NA NA PDZK1 21812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 146774989 146775112 146775013 Y NA NA NA NA NA NA FMO5 62289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 146956714 146956895 146956804 Y GPR89B NA NA NA NA NA BCL9 54287 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 147012349 147012550 147012481 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 1167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 147189197 147189465 147189317 Y NA ACP6 ACP6,LOC100289211 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACP6 48579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 5.08728973265125 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA RNVU1-17 NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNVU1-17 30502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 149853331 149853687 149853509 Y PLEKHO1 HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SF3B4 NA NA NA NA HIST2H2BE 2545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 149978692 149979077 149978971 Y SV2A,CA14,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 150294873 150295138 150294978 Y PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3 C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2 NA NA NA NA PRPF3 2948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 150510569 150510713 150510587 Y NA ECM1,LINC00568,ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA ADAMTSL4 9171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 150600412 150600701 150600561 Y CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 ENSA NA NA NA NA ENSA 324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 151249767 151250096 151249960 Y FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687 PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB NA NA NA NA ZNF687 1998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151418157 151418544 151418397 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA POGZ 11397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151485676 151485841 151485746 Y C2CD4D,CGN,TUFT1 CGN,SNORA44,TUFT1 NA NA NA NA CGN 4690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 151486181 151486300 151486231 Y SELENBP1,RORC,CGN CGN,SNORA44,TUFT1 NA NA NA NA CGN 5195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151696469 151696693 151696535 Y NA MRPL9 NA NA NA NA MRPL9 37347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10,NBPF18P S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 151945068 151945221 151945146 Y TUFT1,S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 19645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151945504 151945625 151945562 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 19241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151949461 151949565 151949513 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 15301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151952807 151953143 151952837 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 11723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,NBPF18P,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 153505144 153505346 153505245 Y NA BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2 NA NA NA NA BX470102.3 1065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 153704694 153704943 153704839 Y NA INTS3,SLC27A3 NA NA NA NA INTS3 6151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 153818420 153818667 153818544 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A3 73590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 153824989 153825297 153825210 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 68154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 154405619 154406249 154405788 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR IL6R NA NA NA NA IL6R 29950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155443130 155443303 155443253 Y NA NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 86518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 ASH1L 38313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 156133837 156133883 156133860 Y C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6 SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1 NA NA NA NA SLC25A44 27997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 156468556 156468776 156468632 Y MEF2D NA NA NA NA NA MEF2D 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156631732 156631960 156631846 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 2516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156632199 156632473 156632320 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 2983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156645551 156645913 156645806 Y NES RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA NES 362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156662788 156663099 156662881 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24 BCAN,NES IMR90 Hi-C 24141950 CRABP2 10509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156677217 156677612 156677436 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 3609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 157030350 157030742 157030546 Y NA ARHGEF11,KRT8P45 NA NA NA NA KRT8P45 10307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 158994687 158995148 158994758 Y OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A IFI16 NA NA NA NA IFI16 26929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 159852272 159852569 159852526 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 159892447 159892988 159892803 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9 NA NA NA NA TAGLN2 534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 159907968 159908165 159908117 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9 NA NA NA NA IGSF9 5221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA ITLN1 156643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 160713171 160713322 160713249 Y COPA,CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7 NA NA NA NA NA ITLN1 139638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 161352257 161352597 161352426 Y NA NA NA NA NA NA SDHC 70210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 161360317 161360802 161360606 Y NA NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,NDUFS2,ADAMTS4,SDHC,UFC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 78270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 161700146 161700332 161700210 Y NA FCRLB,DUSP12,ATF6 NA NA NA NA FCRLB 10793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 161706477 161706712 161706625 Y HSPA6,FCRLB,ATF6 FCRLB,DUSP12,ATF6 DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP12 10836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 162518132 162518252 162518187 Y HSD17B7,SH2D1B,UHMK1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 11071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 162685333 162685375 162685354 Y NOS1AP NA NA NA NA NA UAP1 156010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 162827762 162827953 162827847 Y NA NA NA NA NA NA RGS4 208612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 164685981 164686133 164686057 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163160 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 164736884 164737252 164737025 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 214063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 165345662 165345996 165345868 Y NA NA LRRC52,LOC400794 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 252102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 165674774 165675083 165674866 Y NA ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 8674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 166102836 166102913 166102873 Y NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 31293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 166895888 166895941 166895915 Y ILDR2 NA NA NA NA NA TADA1 52324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 167322904 167323093 167323001 Y NA NA NA NA NA NA POU2F1 134838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 167518258 167518508 167518451 Y CREG1 CREG1 NA NA NA NA CREG1 2496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 167730247 167730494 167730371 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 41818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 168660111 168660285 168660198 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 411833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 168961520 168961569 168961544 Y NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 111366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 169860308 169860488 169860348 Y KIFAP3,SCYL3 SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 171407653 171408026 171407772 Y FMO4,PRRC2C PRRC2C PRRC2C IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2C 44625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172369341 172369683 172369640 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 41547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 172418117 172418641 172418353 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 6887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr1 172445364 172445579 172445472 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 34134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172468818 172469289 172468991 Y NA NA DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIGC 57588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172606833 172606931 172606882 Y FASLG,C1orf9 NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 195603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 172667452 172667583 172667527 Y C1orf9,C1orf9,FASLG NA FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 256222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172788027 172788361 172788212 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 376797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 172903010 172903534 172903241 Y TNFSF18,TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 491780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 173008475 173008781 173008627 Y TNFSF18 NA NA NA NA NA PRDX6 435624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 173167258 173167319 173167289 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 277086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 173382392 173382663 173382522 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 61742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 173398914 173399297 173399234 Y NA PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 45108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr1 173958715 173958784 173958750 Y NA RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 30651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 174503176 174503233 174503205 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 376628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 177146488 177146831 177146659 Y ASTN1,FAM5B NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 858254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 177151173 177151362 177151277 Y ASTN1,FAM5B NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 853723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 178121154 178121309 178121232 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 60290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA C1orf220 204551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 178414274 178414285 178414280 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 95602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 179115539 179115872 179115703 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 67027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 180100723 180101052 180100780 Y NA QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 20917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 180251899 180252130 180252121 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 129930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 180389473 180389640 180389557 Y NA NA LHX4,LOC100527964 IMR90 Hi-C 24141950 ACBD6 80449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 181065454 181065797 181065538 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 9816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 181081690 181081905 181081806 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 182101242 182101505 182101381 Y NA NA LINC00272,TEDDM1,GLUL IMR90 Hi-C 24141950 GLUL 257836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 182259351 182259676 182259514 Y NA NA GLUL K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 99665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 182580570 182580950 182580946 Y NA RGS16 NA NA NA NA RGS16 9027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 182682922 182683008 182682965 Y DHX9 NA RGS8,RNASEL IMR90 Hi-C 24141950 RGS16 111379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 LAMC2 LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 23866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 3154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183166871 183167293 183166889 Y NA LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 13498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183171353 183171815 183171539 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 17980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183178797 183178927 183178861 Y NA LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 25424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183526698 183527308 183526965 Y SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2 NA NA NA NA NCF2 30703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA NCF2,ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183811794 183811833 183811814 Y NCF2,NCF2 NA NA NA NA NA TSEN15 206978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 183846576 183846867 183846649 Y NMNAT2,RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 171944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 184506061 184506260 184506127 Y NA NA NA NA NA NA C1orf21 151869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 184836042 184836526 184836376 Y EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA FAM129A 105156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 184924828 184925180 184925091 Y IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 16502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 186707372 186707639 186707555 Y C1orf27,PLA2G4A,PTGS2 NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 59813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 186936898 186937303 186937025 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 140813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 187267139 187267250 187267195 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 471054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 192757327 192757592 192757471 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1 RGS2 NA NA NA NA RGS2 18577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA TROVE2 110765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 192921207 192921501 192921311 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 TROVE2 105051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 91557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 194047687 194047732 194047710 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 958540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 194399926 194400197 194400074 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 1310779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 196378121 196378217 196378169 Y CFHR3,KCNT2 NA NA NA NA NA CFH 240791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 197482296 197482309 197482303 Y F13B,ZBTB41 NA NA NA NA NA DENND1B 260517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 197530309 197530378 197530355 Y NA NA NA NA NA NA DENND1B 212448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 197582182 197582565 197582448 Y NA NA NA NA NA NA DENND1B 160261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 526837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 199436119 199436458 199436291 Y NA NA PTPRC,LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 940726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 199763377 199763643 199763534 Y NA NA NA NA NA NA ZNF281 613541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 200323350 200323623 200323553 Y DDX59,ZNF281 NA NA NA NA NA ZNF281 53561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 200341273 200341515 200341438 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 35669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 200831452 200831819 200831500 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 26357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 200839315 200839533 200839446 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 18643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 200862818 200862950 200862864 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 4642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 200865264 200865418 200865332 Y C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr1 201084133 201084558 201084403 Y NA NA NA NA NA NA TMEM9 54144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 14415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 201244405 201244769 201244526 Y PKP1 PKP1 PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2 IMR90 Hi-C 24141950 PKP1 5811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 201277004 201277220 201277102 Y NA PKP1 NA NA NA NA PKP1 26424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201277329 201277484 201277406 Y PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 26749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201295169 201295564 201295367 Y PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 44589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201424936 201425126 201425034 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 11239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201445401 201445412 201445405 Y NAV1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 9036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201883288 201883655 201883472 Y NA SHISA4,LMOD1,TIMM17A IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 SHISA4 27480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 14668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 26403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 202016172 202016526 202016316 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ELF3,RP11-465N4.4 ELF3,NAV1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-465N4.4 38691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 202781525 202781905 202781812 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5 NA NA NA NA PCAT6 3443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 43291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 203643182 203643803 203643474 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 49493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204044571 204044810 204044641 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 4328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204073791 204074252 204073934 Y LAX1,PPP1R15B,SOX13 SOX13,ETNK2 NA NA NA NA SOX13 33548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 57427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204274077 204274452 204274265 Y NA NA NA NA NA NA GOLT1A 92857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204330284 204330553 204330417 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 48366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 204422279 204422591 204422449 Y NA PPP1R15B,PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 39261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 205144631 205144860 205144785 Y NA DSTYK NA NA NA NA DSTYK 33867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 205426466 205427019 205426690 Y NA LEMD1,CDK18 KLHDC8A IMR90 Hi-C 24141950 LEMD1 3384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P,MFSD4 NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 205638734 205639222 205638979 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 8365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 206641354 206641644 206641366 Y IL19,RASSF5,MAPKAPK2,DYRK3,RASSF5,IKBKE IKBKE,RASSF5 NA NA NA NA IKBKE 147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 206642854 206643037 206642964 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE IKBKE,RASSF5 NA NA NA NA IKBKE 1063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 206751685 206751882 206751743 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 32022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 206877016 206877221 206877081 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 20727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 207069223 207069337 207069332 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 207203424 207203586 207203506 Y C1orf116 C1orf116,PFKFB2,YOD1 NA NA NA NA C1orf116 515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 207997315 207997832 207997786 Y CR1,CD46 C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 42663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 208286487 208286766 208286698 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 128899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208349565 208349646 208349606 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 66019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208412497 208412696 208412591 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209528830 209529176 209528970 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 70989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209556903 209557123 209556922 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 43042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 209571959 209572357 209572220 Y LAMB3 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 27808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209577571 209577627 209577601 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 22538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 209578512 209578819 209578654 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 21346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 209798058 209798744 209798639 Y NA LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 25067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209820544 209820823 209820626 Y G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 2988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209829183 209829498 209829302 Y IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 5372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 209830400 209831026 209830727 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 6589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 51246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 211841432 211841643 211841573 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 5317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212315044 212315217 212315131 Y NA NA TMEM206,DTL,PPP2R5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL21P28 91673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 212484976 212485048 212485012 Y NA PPP2R5A,RP11-384C4.3 TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-384C4.3 4116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 212576325 212576581 212576449 Y ATF3,ATF3,ATF3 TMEM206,NENF NA NA NA NA TMEM206 9662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212643548 212643711 212643612 Y NA NENF ATF3 K562 ChIA-PET 22265404 NENF 39319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 212655370 212655477 212655424 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 51141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 212840606 212841015 212840787 Y C1orf227,BATF3,PPP2R5A,ATF3,FAM71A RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 3830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 215006647 215006892 215006866 Y KCNK2,KCNK2 GAPDHP24 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP24 35185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 215691115 215691317 215691220 Y NA KCTD3 KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD3 47418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr1 217105953 217106090 217106023 Y NA NA NA NA NA NA ESRRG 203007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218338759 218338973 218338866 Y NA NA ESRRG IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 117656 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 218382752 218383112 218382930 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 73517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 218523725 218524123 218523798 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 6148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218546684 218546887 218546789 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 29107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218550674 218551089 218550794 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 33097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 218553747 218554148 218553928 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 36170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 218662454 218662669 218662563 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 144877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 218758903 218759111 218758977 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 241326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 219262446 219262621 219262479 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 82565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 116148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 219498496 219498646 219498574 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 115338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 219547203 219547495 219547349 Y NA NA LOC728463,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 66489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 219722653 219722988 219722821 Y NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-95P13.1 108669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 220399770 220399931 220399853 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 24981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 221567491 221567844 221567649 Y NA NA C1orf140,HLX IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 345674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 221612801 221613016 221612980 Y DUSP10,DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 300502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 221881394 221881826 221881629 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 31692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 221887766 221888016 221887890 Y DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 25502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 222161205 222161607 222161394 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 247687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 222814663 222814910 222814786 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 25235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 223095586 223095912 223095632 Y NA NA NA NA NA NA DISP1 109180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 223363832 223364028 223363934 Y TLR5 TLR5 CAPN8,SUSD4 IMR90 Hi-C 24141950 TLR5 49208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 223892678 223892997 223892836 Y NA CAPN8,CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 5383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224014874 224015267 224015181 Y CAPN2,FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 16407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.87531932712412 chr1 224240602 224240763 224240683 Y TP53BP2 NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 59026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224359201 224359533 224359347 Y NA RP11-365O16.1,DEGS1 NA NA NA NA RP11-365O16.1 1875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224458940 224459060 224459002 Y NA NA NA NA NA NA NVL 57029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 CNIH3,WDR26 NA NA NA NA CNIH3 21944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226163769 226163979 226163848 Y NA NA NA NA NA NA PYCR2 53791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226189681 226190319 226189910 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 57233 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226366367 226366621 226366494 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 5810 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226890098 226890374 226890232 Y NA ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 29330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 226911425 226911742 226911463 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 13282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 227002760 227003096 227002965 Y NA NA ITPKB,C1orf95 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSEN2 52789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 227009018 227009221 227009120 Y NA PSEN2 ITPKB,C1orf95 IMR90 Hi-C 24141950 PSEN2 46664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 227730002 227730151 227730029 Y NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 227982614 227983033 227982728 Y CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35 NA NA NA NA NA JMJD4 61502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 228124828 228124930 228124870 Y ARF1,ARF1 WNT9A NA NA NA NA WNT9A 8669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 228686214 228686407 228686300 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 13452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 109840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RNF187 110504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.64963006908919 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 111200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 229196056 229196102 229196080 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 208673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 229825145 229825279 229825212 Y NA NA TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 65164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 230249347 230250007 230249645 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 57811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 230407650 230408034 230407910 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 216114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 230978470 230978520 230978495 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 24815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 231036878 231036937 231036909 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 33543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 231531271 231531676 231531476 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 27114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 108200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 232106545 232106680 232106599 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 345984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 232117893 232118046 232117970 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 357332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 232428903 232429197 232429192 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 536736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 6.88903817963191 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 233472763 233473058 233472911 Y NA RPS7P3,PCNXL2 NA NA NA NA PCNXL2 43304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 3040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 233763606 233763782 233763694 Y NA KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 15856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 233811305 233811449 233811378 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 63555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA SLC35F3 124489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA SLC35F3 215674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 234372658 234373012 234372835 Y TARBP1 NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 117740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234559176 234559516 234559346 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.4 51837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr1 234767593 234767925 234767750 Y TARBP1 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 24322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 17696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 235108272 235108467 235108376 Y IRF2BP2,RBM34,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 6084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 235134086 235134438 235134232 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 19535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 235242792 235242999 235242934 Y NA TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA TOMM20 NA NA NA NA TOMM20 22507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 235850857 235851038 235851012 Y LYST,ARID4B NA NA NA NA NA B3GALNT2 185076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 236764383 236764568 236764551 Y NA HEATR1 NA NA NA NA HEATR1 1236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 297328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 239893728 239894036 239893786 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 281612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 240433849 240434175 240434014 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 102394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 240514375 240514531 240514453 Y FMN2,GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 182920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 241093225 241093542 241093384 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F13.2 66552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 241163854 241163966 241163910 Y RGS7 RP11-435F13.2 NA NA NA NA RP11-435F13.2 3760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 241392345 241392701 241392526 Y RGS7,KMO NA NA NA NA NA RGS7 125829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 241705436 241706018 241705703 Y KMO FH,KMO NA NA NA NA KMO 12002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 241790752 241791037 241791008 Y NA CHML,OPN3 NA NA NA NA CHML 6195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 243654647 243654885 243654744 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 237327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 243853401 243853550 243853530 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 158831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 243923195 243923609 243923504 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 88772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 244439620 244440012 244439977 Y NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 173424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 244512430 244512879 244512496 Y ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 100557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 245255337 245255432 245255385 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB2 124330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 245915127 245915205 245915167 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 753409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 245939665 245940062 245939864 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 728552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 697228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 246007613 246007922 246007768 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 660692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246086594 246086610 246086602 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 582004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246316735 246316955 246316845 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 246387027 246387389 246387208 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 281225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 246760708 246760962 246760810 Y SMYD3,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 32962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 247297966 247298129 247298007 Y NA ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 32292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr1 247507326 247507475 247507401 Y NA ZNF496 ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 14178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 247564649 247565106 247564983 Y AHCTF1,NLRP3,NLRP3 NA NLRP3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF496 71501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr1 249117788 249118228 249118121 Y SH3BP5L MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692 NA NA NA NA MIR3124 348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 699938 700531 700398 Y DIP2C DIP2C NA NA NA NA DIP2C 33152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3123873 3124204 3123982 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 17348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3441336 3441600 3441518 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 228333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 3507725 3507898 3507811 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 294722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 3782267 3782514 3782443 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 42959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3808656 3808872 3808754 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 16601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3890689 3890931 3890823 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 65216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3896143 3896475 3896326 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 70670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3915881 3916422 3916098 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 90408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3932191 3932411 3932301 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 106718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 3948614 3948936 3948805 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 123141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 3984866 3985563 3985082 Y KLF6 NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 159393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4289203 4289519 4289251 Y NA LINC00702 KLF6,LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 5099 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4375511 4376105 4375643 Y NA NA NA NA NA NA LINC00702 91407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 112070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4685784 4686138 4685885 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 32208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4711881 4712067 4712000 Y AKR1E2 LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 6279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 4712833 4713220 4712996 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 5126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4807724 4807860 4807810 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00704 89378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 4812953 4813314 4813133 Y NA NA KLF6,PITRM1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00704 94607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4852300 4852352 4852326 Y NA NA KLF6,NET1 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 80444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 4855217 4855416 4855349 Y NA NA KLF6,NET1 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 77380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 5336164 5336286 5336241 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 116228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 5530637 5531333 5530982 Y NA NA NA NA NA NA NET1 78123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 5535635 5536039 5535950 Y NA NA NA NA NA NA NET1 83121 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5587810 5588190 5587923 Y NA RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 47891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 5588881 5589169 5589084 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 46912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 45786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5593718 5593999 5593816 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NET1 IMR90 Hi-C 24141950 RP13-463N16.6 42082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 5608647 5608913 5608759 Y NA RP13-463N16.6,RP11-336A10.5 NET1,CALML5 IMR90 Hi-C 24141950 RP13-463N16.6 27168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5638863 5639270 5639216 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6,RP11-336A10.5 NET1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP13-463N16.6 2782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 5770570 5770836 5770703 Y NA FAM208B NA NA NA NA FAM208B 45769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 5986377 5986825 5986602 Y NA RP11-536K7.3,IL15RA NA NA NA NA RP11-536K7.3 514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6183553 6183785 6183703 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 1096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6213842 6214122 6214025 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 28961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6234464 6234853 6234702 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 49583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 6313629 6313822 6313726 Y PRKCQ NA LOC399715 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 128748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6343712 6343937 6343834 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 158831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 6449763 6450038 6449901 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 264882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 11220579 11221039 11220795 Y CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 385636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA USP6NL 184200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 11866902 11867068 11866972 Y C10orf47 NA LOC219731 IMR90 Hi-C 24141950 USP6NL 215149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA UPF2 165082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 11924114 11924319 11924232 Y C10orf47 NA NA NA NA NA UPF2 158850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 12307693 12308050 12307912 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 71550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 12749537 12749904 12749742 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 360056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 13142941 13143287 13143115 Y NA OPTN NA NA NA NA OPTN 3492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 13924181 13924825 13924574 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 297254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 14026617 14027027 14026853 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 399690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 14083240 14083439 14083425 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 418702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 14594148 14594360 14594257 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 92007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 100178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 14628830 14629278 14629071 Y HSPA14 NA NA NA NA NA FRMD4A 126689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 14647138 14647588 14647478 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 144997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38 NA NA NA NA RPP38 20451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 15306901 15307170 15307036 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 98209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 16810720 16810994 16810786 Y NA RSU1 NA NA NA NA RSU1 46533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 20219970 20220256 20220113 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 116802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21210288 21210394 21210343 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 250722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21241912 21242237 21242078 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 218879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21291623 21291954 21291791 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 169162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 143196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 21318909 21319293 21319209 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 141823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 21389618 21389984 21389801 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 71132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21390009 21390197 21390106 Y MLLT10,MLLT10,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 70919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21430870 21431276 21431139 Y NEBL,C10orf113 NEBL NA NA NA NA NEBL 29840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21436057 21436346 21436225 Y C10orf113,NEBL NEBL NA NA NA NA NEBL 24770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 22053811 22054026 22053942 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP37 166046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22519481 22519667 22519580 Y BMI1,EBLN1 NA COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 83236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22535612 22535856 22535691 Y NA NA ARMC3,LOC100130992 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 67047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 22624164 22624549 22624505 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 16024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 22722910 22723095 22723003 Y DNAJC1 NA NA NA NA NA BMI1 114770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr10 22817226 22817294 22817260 Y EBLN1 NA NA NA NA NA PIP4K2A 184190 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22894974 22895386 22895290 Y PIP4K2A NA NA NA NA NA PIP4K2A 106098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 22970665 22970972 22970902 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 30512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 22972039 22972536 22972328 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 28948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 24498955 24499204 24499146 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 511393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 25201195 25201516 25201227 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 38017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA PDSS1 209028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 27027283 27027887 27027754 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 42695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 27032794 27033066 27033024 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 48206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 28366743 28367106 28366855 Y ARMC4 NA NA NA NA NA ARMC4 80766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 29010919 29011116 29010957 Y NA BAMBI LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 46648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 29877671 29877896 29877784 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 181340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 225874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 228375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL NA SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 328815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 30092989 30093361 30093263 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 309062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 31192523 31192722 31192556 Y NA NA NA NA NA NA ZNF438 126144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 31289701 31290078 31290005 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 28788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 31290771 31290943 31290831 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 27923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 32233498 32233707 32233615 Y NA ARHGAP12 ARHGAP12,KIF5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 17756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32579146 32579267 32579207 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 86459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32606832 32606984 32606880 Y CCDC7,C10orf68,EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 58742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32607439 32608014 32607606 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 57712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32611846 32612286 32612204 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 53440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 32626420 32626786 32626539 Y NA EPC1 NA NA NA NA EPC1 38940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 32668626 32668988 32668673 Y EPC1,C10orf68 EPC1 EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 2900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 33272272 33272613 33272373 Y ITGB1,ITGB1,ITGB1 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 33422989 33423776 33423207 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 130269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 33493386 33493597 33493492 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 129593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 33503049 33503394 33503286 Y ITGB1 NA NA NA NA NA NRP1 119796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 33537661 33538041 33537751 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 85149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 33541909 33542109 33542065 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 81081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 33547800 33548221 33548104 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 74969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr10 33560971 33561296 33561097 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 61894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.07357088014347 chr10 33654776 33655204 33655009 Y NA NRP1 PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 31586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 33893152 33893448 33893300 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 269962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 34489415 34489720 34489567 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 461309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 34816179 34816294 34816237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 134735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 34922261 34922558 34922409 Y PARD3 RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 28471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 34924725 34924738 34924731 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 26291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35080769 35081009 35080876 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 21244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 35431185 35431238 35431212 Y NA CREM NA NA NA NA CREM 17466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 35573688 35573878 35573784 Y NA CCNY NA NA NA NA CCNY 39735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35589038 35589427 35589190 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA CCNY 55085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35739762 35740277 35740119 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA MIR4683 187903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35755393 35755512 35755453 Y NA NA NA NA NA NA MIR4683 172668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 35768783 35768937 35768860 Y NA NA NA NA NA NA MIR4683 159243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 36781891 36782110 36782001 Y NA NAMPTL FZD8 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPTL 29052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 36783467 36783622 36783545 Y NA NAMPTL FZD8 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPTL 27540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 36823544 36823839 36823735 Y NA NAMPTL NA NA NA NA NAMPTL 12382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 38149659 38150080 38149945 Y ZNF248 RP11-162G10.1,RP11-162G10.5,ZNF248 NA NA NA NA ZNF248 4625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 38325428 38325718 38325598 Y ZNF25,ZNF37A ZNF33A NA NA NA NA ZNF33A 27850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 42400063 42400397 42400233 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 565291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 42798094 42798242 42798168 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 167446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 42800348 42800675 42800512 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 165013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 42817169 42817557 42817529 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 148131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 43422233 43422523 43422379 Y NA NA RET IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 145984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 44806540 44806774 44806646 Y NA NA TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3P1 522675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 45731417 45731707 45731606 Y C10orf10 NA NA NA NA NA C10orf25 237081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 45927566 45927962 45927775 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5 NA NA NA NA NA MARCH8 160392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA RP11-463P17.1,ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-463P17.1 6445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 50595145 50595278 50595227 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 149808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 50742859 50743547 50743006 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA PGBD3 1539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 52058471 52058580 52058526 Y NA DYNC1I2P1 NA NA NA NA DYNC1I2P1 35733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 52079574 52079882 52079666 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 56836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 52167205 52167434 52167402 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 144467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 52217733 52218081 52217894 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 164842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 52266916 52267259 52267072 Y SGMS1 NA NA NA NA NA SGMS1 115664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 52270106 52270351 52270231 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 112572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 52889311 52889633 52889472 Y NA NA NA NA NA NA PRKG1 140366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 53930569 53930919 53930744 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 141137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 54078280 54078480 54078433 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 54203502 54203868 54203680 Y DKK1 RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 54208151 54208375 54208306 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 19918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 16357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 54212412 54212659 54212464 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 54212715 54213183 54212814 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 54224630 54224737 54224684 Y NA RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-346D6.6 3556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-346D6.6 18264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 138802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 54529752 54530157 54530006 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 301459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 59452175 59452288 59452232 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 573406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 60889159 60889241 60889200 Y NA NA NA NA NA NA FAM13C 231698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 61019605 61019954 61019626 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA FAM13C 100985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 61580750 61581126 61580938 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 83288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 61664562 61664999 61664893 Y CCDC6 CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 62111952 62112088 62112018 Y ANK3,ANK3 NA NA NA NA NA CDK1 424001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 62185134 62185430 62185353 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 350659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 62491040 62491560 62491373 Y ANK3 CDK1 NA NA NA NA CDK1 44529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 62674070 62674082 62674076 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB1 85116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63150806 63151275 63151001 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB1 391608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63431131 63431268 63431149 Y C10orf107 NA NA NA NA NA ARID5B 227791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 63697389 63697783 63697593 Y NA ARID5B NA NA NA NA ARID5B 38330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 63697847 63698199 63697988 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 38788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63703432 63703559 63703511 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 44373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 63753079 63753613 63753266 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 94020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63778860 63779091 63779011 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 119801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63779948 63780456 63780395 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 120889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63839926 63839992 63839961 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 180867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63842469 63842743 63842551 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 183410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 63979384 63979550 63979547 Y NA RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 46916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 64292101 64292416 64292208 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 160150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 64495564 64495934 64495778 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA ZNF365,EGR2,JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 ADO 66582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 64982889 64983009 64982950 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 91839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65053315 65053443 65053389 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 131614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 106321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 59406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA PRELID1P3 11753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 65282188 65282459 65282345 Y JMJD1C,JMJD1C REEP3 NA NA NA NA REEP3 3065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr10 65460115 65460254 65460185 Y NA NA JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 180992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 65793520 65793903 65793712 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 132515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 67848646 67848843 67848745 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 834921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 68010262 68010544 68010403 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 673220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 68137896 68138170 68138033 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 545594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 68690818 68690961 68690956 Y NA LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 7054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 118776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 72507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 69578155 69578433 69578238 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 17491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 69579652 69579872 69579788 Y DNAJC12 DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 16052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 69822197 69822546 69822385 Y NA HERC4 NA NA NA NA HERC4 10559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4 ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 21777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 NA NA NA NA NA HERC4 80202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 70736024 70736384 70736191 Y SRGN DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1 NA NA NA NA SUPV3L1 38978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 71657953 71658245 71658099 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA COL13A1 98309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 71662112 71662205 71662157 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA COL13A1 102468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 71675422 71675425 71675424 Y H2AFY2 NA NA NA NA NA COL13A1 115778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 71693212 71693346 71693279 Y NA NA NA NA NA NA H2AFY2 117206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 72117206 72117607 72117506 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA LRRC20 22775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 72124245 72124646 72124446 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA LRRC20 15736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 72433363 72433696 72433541 Y ADAMTS14 ADAMTS14 NA NA NA NA ADAMTS14 2804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 72593001 72593337 72593129 Y SGPL1 RP11-399N22.3,SGPL1 NA NA NA NA SGPL1 19284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 73734357 73734754 73734458 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 12234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 73840531 73840743 73840590 Y ASCC1,ASCC1,SPOCK2 NA NA NA NA NA CHST3 118408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 74544491 74544662 74544597 Y NA NA NA NA NA NA MCU 94602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 74836640 74837022 74836864 Y NA P4HA1,NUDT13 NA NA NA NA P4HA1 17710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 74991679 74992005 74991988 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 14615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75222632 75223003 75222818 Y NA RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 30280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75337715 75337998 75337857 Y CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54 USP54 NA NA NA NA USP54 45713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 75887856 75888019 75887938 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA AP3M1 20802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 75931649 75931916 75931783 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 22689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 75987927 75988078 75987990 Y KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK NA NA NA NA NA ADK 78967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 76053029 76053199 76053114 Y NA NA NA NA NA NA ADK 144069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 76682814 76683108 76682864 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 99474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 76916394 76916800 76916595 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA VDAC2 51112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 76985148 76985510 76985329 Y NA VDAC2,COMTD1,HMGA1P5 NA NA NA NA COMTD1 8278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 77022416 77022492 77022443 Y NA COMTD1,HMGA1P5 COMTD1,ZNF503-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1P5 11912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 77155063 77155414 77155221 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 77155629 77155954 77155896 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 3710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 77165098 77165501 77165301 Y C10orf11 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 5434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 77290134 77290404 77290261 Y SAMD8 NA C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 68594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 77300831 77301201 77300915 Y NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 57797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 77533067 77533251 77533127 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 174069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 77548245 77548262 77548254 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 189247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78641476 78641804 78641730 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 754549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78698062 78698447 78698255 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 697906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78784039 78784371 78784322 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 611982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78790288 78790415 78790352 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 605938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78858331 78858440 78858373 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 537913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78920467 78920779 78920602 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 475574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 78923836 78924098 78923933 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 472255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 78954967 78955278 78955208 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 441075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 79002896 79003188 79003042 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 393165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79005800 79005944 79005879 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 390409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79019003 79019258 79019131 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 377095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 79152642 79152983 79152827 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 243370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 79166166 79166289 79166224 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 230064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 130184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 79268227 79268357 79268284 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 127996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 79284063 79284455 79284320 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 111898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 104574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 79313411 79313746 79313629 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 82607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79324798 79325050 79324993 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 71303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 79382631 79383090 79382827 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 13263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79465060 79465341 79465251 Y NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMA1 68707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79470426 79470747 79470598 Y NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMA1 74073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 79545596 79545879 79545660 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 138499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 79636555 79636603 79636579 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 47775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 80015034 80015301 80015187 Y RPS24 NA NA NA NA NA RPS24 223516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 80684242 80684460 80684352 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 142332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 80943996 80944377 80944135 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 117204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 81042130 81042560 81042322 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 62665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81045880 81046806 81046457 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 58419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81086644 81087006 81086940 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 18219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81088418 81088982 81088641 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 16243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81091409 81091966 81091732 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 81138677 81139093 81139046 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 33452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 81248199 81248547 81248259 Y NA ZCCHC24 ZCCHC24,PPIF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC24 44816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81946319 81946704 81946639 Y ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 16624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81956011 81956585 81956252 Y ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 6743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 88571811 88572082 88571947 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1A 57404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 89322777 89322992 89322885 Y NA NA NA NA NA NA MINPP1 60145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 90053186 90053542 90053532 Y NA NA NA NA NA NA RP11-380G5.3 349927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3,IFIT2 NA NA NA NA RP11-149I23.3 21045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 91199827 91200195 91200013 Y NA IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 27484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C NA NA NA NA NA TNKS2 182154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NA NA NA NA NA CPEB3 57392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 94195534 94195885 94195710 Y NA NA NA NA NA NA IDE 135948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 94367821 94367909 94367865 Y CYP26C1,KIF11 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 16778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 95145053 95145431 95145242 Y NA NA NA NA NA NA MYOF 94643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 95197787 95197992 95197919 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr10 97048077 97048324 97048201 Y SORBS1 PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 457 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 97148349 97148600 97148588 Y NA NA PDLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 99568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 97166659 97166942 97166773 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA PDLIM1 117878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 97168692 97169197 97168969 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM1 119911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 97302511 97302656 97302624 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 16515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 97319295 97319590 97319525 Y C10orf129,SORBS1,SORBS1 SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 98432353 98432529 98432425 Y LCOR,PIK3AP1 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 45742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 99302007 99302242 99302124 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 PI4K2A 39889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 99302907 99303185 99303057 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 PI4K2A 38946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 99408797 99409067 99408957 Y NA MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 17453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 101300631 101300706 101300670 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A28 77660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 101425049 101425416 101425233 Y NA SLC25A28,ENTPD7,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 7786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 101744070 101744300 101744185 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 23376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 101767938 101768201 101768028 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 101873975 101874319 101874110 Y NA NA CPN1,ERLIN1,CHUK IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN1 71772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 102130336 102130669 102130535 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 102140082 102140467 102140275 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 8710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM178A 181343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 102792815 102793017 102792917 Y NA C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA SFXN3 3824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 102831127 102831150 102831139 Y NA PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA KAZALD1 11529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 103453403 103453880 103453587 Y LDB1,BTRC,MGEA5 FBXW4 NA NA NA NA FBXW4 351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 103717791 103718012 103717910 Y C10orf76 NA NA NA NA NA C10orf76 95938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr10 104470539 104470788 104470556 Y FBXL15 ARL3,SFXN2 NA NA NA NA ARL3 1376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 104909684 104910071 104909878 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 40985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 104953975 104954222 104954115 Y C10orf26,C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 2919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr10 105001544 105001968 105001663 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 105208274 105208534 105208404 Y NA CALHM2 NA NA NA NA CALHM2 2126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 143752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 110138864 110139232 110139127 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1542079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 110297861 110298217 110298073 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1383094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 110360095 110360471 110360395 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1320840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112116359 112116685 112116467 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 53650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112117126 112117443 112117281 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 54417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 112169656 112169922 112169805 Y SMC3 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr10 112174673 112174737 112174702 Y NA NA SMC3,DUSP5,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 80859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112295745 112296221 112296000 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5,SMC3 SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 29228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 112668861 112669237 112669049 Y PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 7795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114718173 114718547 114718195 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 10164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 114745782 114746117 114745950 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 37773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 114853789 114854299 114853993 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 145780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 114859283 114859636 114859547 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 151274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 115033380 115033572 115033427 Y TCF7L2 NA TECTB,GUCY2GP,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 325371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 115070178 115070533 115070251 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 362169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 116392908 116393338 116393223 Y ABLIM1 ABLIM1 NA NA NA NA ABLIM1 49424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 118643126 118643297 118643273 Y KIAA1598 RP11-539I5.1 NA NA NA NA RP11-539I5.1 35410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 118926635 118926763 118926722 Y C10orf82,VAX1 KIAA1598,VAX1 NA NA NA NA VAX1 30823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 119445831 119446065 119445953 Y NA NA CASC2 IMR90 Hi-C 24141950 PDZD8 312853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 94093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 121065390 121065964 121065436 Y NA NA NA NA NA NA PRDX3 129045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 121249100 121249168 121249139 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 51052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 121682284 121682432 121682358 Y NA MCMBP,SEC23IP NA NA NA NA SEC23IP 32061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 122270774 122271036 122270905 Y NA NA NA NA NA NA PPAPDC1A 56308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 123340054 123340398 123340080 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 345429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 123900074 123900243 123900143 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 153385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 124133234 124133500 124133290 Y NA PLEKHA1 NA NA NA NA PLEKHA1 1022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 124249700 124250033 124249857 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 30659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 126369280 126369606 126369413 Y FAM175B,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 61232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 126373894 126374059 126373997 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 56779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 126748587 126748846 126748786 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 126773443 126773862 126773517 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 73877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 126782105 126782284 126782195 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 65455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 127130064 127130207 127130136 Y MMP21 NA NA NA NA NA ALDOAP2 224312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 127587236 127587432 127587340 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 4128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 128592998 128593177 128593088 Y NA DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 1020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 129851192 129851341 129851267 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 71308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr10 131438209 131438380 131438294 Y NA NA NA NA NA NA MGMT 174761 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 12824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 13298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 134385594 134385710 134385631 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 36270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 134388737 134389185 134389009 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 39413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr10 134826942 134827305 134827042 Y NA NA LOC399829,INPP5A IMR90 Hi-C 24141950 TTC40 72615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 134913452 134913599 134913525 Y NA NA NA NA NA NA TTC40 159125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511 NA NA NA NA ADAM8 15244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 3745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 4064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 135190202 135190644 135190450 Y CYP2E1 ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 51 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr10 135191872 135192182 135191943 Y NA ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 1177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr10 135342737 135342867 135342819 Y KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1 NA NA NA NA NA MTG1 137139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 469770 469895 469845 Y B4GALNT4,CEND1 ANO9,PTDSS2,RNH1 NA NA NA NA PTDSS2 23502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 1039894 1040259 1040094 Y MUC6 MUC6,MUC2 AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 MUC6 5188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 1053255 1053594 1053287 Y NA MUC6,MUC2 MUC5B,MOB2,AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 MUC6 18549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A MUC6,MUC2 NA NA NA NA MUC2 494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA MUC5AC MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 MUC5AC 1423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 1241085 1241212 1241149 Y NA MUC5B NA NA NA NA MUC5B 1084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 1245627 1245992 1245771 Y NA MUC5B NA NA NA NA MUC5B 3331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2197020 2197182 2197031 Y KRTAP5-6,ASCL2,TH IGF2 NA NA NA NA IGF2 28187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 2200082 2200579 2200535 Y SYT8,ASCL2,IGF2,TH IGF2 NA NA NA NA IGF2 31249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2234751 2234909 2234870 Y ASCL2 NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2 65918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2238005 2238048 2238027 Y NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2 69172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2643944 2644417 2644202 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 74807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 2933631 2934118 2933874 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 14567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195 NA NA NA NA ZNF195 45291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 4111553 4111947 4111636 Y STIM1 RRM1 NA NA NA NA RRM1 1990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 4505648 4505760 4505741 Y TRIM21,OR51G1,OR51D1,OR51T1,OR51F2,OR52K2,OR52K1 NA NA NA NA NA TRIM21 92722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 6420739 6420978 6420859 Y NA SMPD1,APBB1 NA NA NA NA SMPD1 11084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 6884595 6884618 6884606 Y DCHS1,OR2AG2,OR2AG1,OR6A2,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2 NA NA NA NA NA ZNF215 61017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 8607763 8607778 8607771 Y ASCL3,STK33 NA NA NA NA NA RPL27A 94180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 9185386 9185638 9185566 Y NA NA NA NA NA NA DENND5A 99299 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 9703256 9703389 9703323 Y WEE1 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 19632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 7574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 10060683 10060760 10060722 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2 252994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 10246954 10247167 10247061 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 66587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 10302186 10302573 10302380 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3 NA NA NA NA SBF2 11181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 10935638 10935889 10935764 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 CTD-2003C8.2 EIF4G2,LOC729013,ZBED5,USP47,DKK3,CTR9 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2003C8.2 16769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 36648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 12063877 12064119 12063998 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 42319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12065635 12065803 12065720 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 40635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 14306265 14306627 14306419 Y NA NA NA NA NA NA RRAS2 77425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 16073747 16074032 16073896 Y SOX6,SOX6 NA NA NA NA NA C11orf58 558647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 16945489 16945781 16945647 Y NA RP11-466H18.1 NA NA NA NA RP11-466H18.1 48779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 17878699 17879035 17878754 Y NA NA NA NA NA NA SERGEF 153674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 RP11-613F22.5,TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 19599589 19599793 19599635 Y NAV2,NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 229318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 19681860 19681955 19681908 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 311589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 19748565 19748818 19748690 Y NA NA NA NA NA NA NAV2 378294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 20053197 20053569 20053404 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 329662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 27419147 27419279 27419213 Y NA CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 35732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 28795482 28795636 28795549 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 73320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 28831581 28831914 28831617 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 109419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 28853592 28853798 28853653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 131430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 29302148 29302272 29302237 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 579986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 29323978 29324331 29324155 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 601816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 29332369 29332533 29332436 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 610207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 29974880 29975070 29974975 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115J23.1 1252718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 31489332 31489346 31489341 Y NA IMMP1L,ELP4 NA NA NA NA IMMP1L 39846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 31835564 31835985 31835634 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA PAX6 1524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 33096691 33097088 33096864 Y NA TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 37728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 33342450 33342853 33342574 Y NA NA NA NA NA NA HIPK3 66232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 33394151 33394320 33394196 Y C11orf41 RP1-130L23.1 NA NA NA NA RP1-130L23.1 28442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 33427027 33427076 33427050 Y NA RP1-130L23.1 C11orf41,C11orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-130L23.1 4265 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 33468371 33468737 33468467 Y NA RP1-130L23.1 C11orf41,LOC338739 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-130L23.1 45609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 33742880 33743486 33743237 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 12505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 33778086 33778269 33778178 Y FBXO3 CD59,FBXO3 NA NA NA NA FBXO3 15820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34183211 34183613 34183509 Y NA NA NA NA NA NA NAT10 58062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34236527 34236812 34236617 Y ABTB2 NA NA NA NA NA NAT10 111378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34331523 34331863 34331783 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 23687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34676467 34676782 34676555 Y ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF EHF NA NA NA NA EHF 35827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA EHF 66237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 34919844 34920223 34920054 Y ELF5,EHF PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 15153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35053542 35053729 35053593 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 104688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35077849 35078170 35078010 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 80247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35258280 35258546 35258460 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 99863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35395403 35395808 35395629 Y SLC1A2 NA NA NA NA NA CD44 236986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 35643691 35643948 35643820 Y NA FJX1,TRIM44 NA NA NA NA FJX1 5956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 36132577 36133046 36132774 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 169046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 36171228 36171637 36171430 Y TRAF6,COMMD9 NA NA NA NA NA COMMD9 137362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 43473758 43474114 43473936 Y NA NA NA NA NA NA TTC17 95276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 43779324 43779404 43779364 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 120957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 44306158 44306224 44306191 Y ALX4 NA NA NA NA NA EXT2 191059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 45000515 45000921 45000720 Y SYT13,TSPAN18 TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 29675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 45067583 45067753 45067679 Y CD82 NA SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 TP53I11 96743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 45122042 45122442 45122242 Y PRDM11 NA NA NA NA NA TP53I11 151202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46085573 46085592 46085583 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 55393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CTD-2589M5.4,CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 34865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 28900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46385171 46385493 46385285 Y NA DGKZ,MDK NA NA NA NA MDK 14813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46497144 46497389 46497267 Y NA NA NA NA NA NA MDK 96838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 47215723 47215949 47215852 Y NA ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PACSIN3 9729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 47872031 47872166 47872095 Y OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 3924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 48028073 48028508 48028179 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 27960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48053215 48053601 48053578 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 53102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48069279 48069643 48069343 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 69166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48102794 48103200 48102989 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 102681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48163334 48163507 48163430 Y OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 163221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 48193627 48193663 48193645 Y OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NA NA NA NA NA PTPRJ 193514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 57224938 57225034 57225001 Y SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3 SLC43A3,RTN4RL2 NA NA NA NA RTN4RL2 988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 58965379 58965764 58965549 Y PATL1,FAM111A,MPEG1 DTX4 NA NA NA NA DTX4 28476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 58984097 58984658 58984465 Y FAM111A,MPEG1,PATL1,OSBP DTX4 NA NA NA NA DTX4 47194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 58986441 58986687 58986574 Y FAM111A,MPEG1,PATL1,OSBP DTX4 NA NA NA NA DTX4 49538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 59539177 59539402 59539266 Y NA MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 36943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 60499458 60499898 60499803 Y MS4A6E,MS4A14,MS4A5,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 107646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 60753567 60754105 60753691 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 63632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61319246 61319400 61319342 Y NA SYT7 NA NA NA NA SYT7 27220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA SYT7,RPLP0P2 NA NA NA NA RPLP0P2 13755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,TMEM258,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 61762479 61762659 61762569 Y C11orf9 FTH1 FADS3,FADS2,RAB3IL1,FADS1,BEST1,FTH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 29347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61800988 61801486 61801080 Y DAGLA,FTH1 NA FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 67856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 62310227 62311393 62310863 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 78 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 62321348 62321821 62321541 Y NA RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 62624183 62624258 62624224 Y NA STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 2665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 63321382 63321591 63321464 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3,HRASLS2 NA NA NA NA HRASLS2 7264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 63328335 63328557 63328446 Y NA RARRES3,HRASLS2 NA NA NA NA HRASLS2 298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3,HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA HRASLS2 5663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA HRASLS2 8867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 63822776 63822835 63822807 Y NA NA NA NA NA NA OTUB1 71451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 63846659 63847077 63846694 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 84501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 64629180 64629438 64629292 Y TIGD3,CDC42EP2,RASGRP2,RASGRP2,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,FAU,EHD1,ATG2A CDC42BPG,EHD1 NA NA NA NA CDC42BPG 19139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 64636604 64637051 64636910 Y CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1 CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B NA NA NA NA EHD1 16717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 64987523 64987676 64987600 Y NA CAPN1,POLA2 NA NA NA NA POLA2 39557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65075657 65076292 65075967 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 3997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65083603 65083722 65083697 Y NA CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 3314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 65152750 65152863 65152819 Y LOC100130348,CDC42EP2,DKFZp761E198,FRMD8 FRMD8,NEAT1 NA NA NA NA FRMD8 680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.17955608290703 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 14950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65559034 65559399 65559282 Y NA OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 6541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65581703 65581968 65581801 Y CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198 OVOL1,MUS81,CFL1 NA NA NA NA OVOL1 29210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65582060 65582341 65582183 Y NA OVOL1,MUS81,CFL1 NA NA NA NA OVOL1 29567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 5.61721574646909 chr11 65852297 65852657 65852298 Y TMEM151A,CNIH2 GAL3ST3,SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 16463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 65949541 65949768 65949655 Y NA NA NA NA NA NA KLC2 72997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66094685 66094783 66094735 Y CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248 YIF1A,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 7528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66221780 66221966 66221875 Y RBM4 MRPL11,PELI3,DPP3,CTD-3074O7.5 PELI3,DPP3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL11 10243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66374477 66374855 66374526 Y NA CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4 RBM14-RBM4 IMR90 Hi-C 24141950 RBM14 7198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66487767 66487982 66487867 Y NA RBM4B,SPTBN2,C11orf80 NA NA NA NA SPTBN2 6715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SPTBN2 83 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 37612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC,SYT12 PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67032465 67032551 67032477 Y NA ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr11 67142500 67143040 67142970 Y CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 3445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67144956 67145205 67145097 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 5901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68065646 68065898 68065824 Y CHKA,LRP5 C11orf24,LRP5 SUV420H1,C11orf24,LRP5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP5 12179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68270416 68270689 68270553 Y MRGPRD PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 44230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68387136 68387210 68387173 Y NA NA NA NA NA NA GAL 62037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69042063 69042459 69042261 Y NA MYEOV MYEOV,CCND1,ORAOV1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 17146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69067534 69068152 69067999 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 7929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 69069179 69069344 69069260 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69069522 69069665 69069598 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 69089155 69089700 69089444 Y MRGPRD MYEOV CCND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYEOV 29550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69182957 69183170 69183095 Y ORAOV1,CCND1,MYEOV NA CCND1,MYEOV MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 123352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA NA MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 175784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 69251942 69252241 69252024 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 192337 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 69639961 69640299 69640038 Y NA NA FGF3 K562 ChIA-PET 22265404 FGF19 122551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 127588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr11 69795546 69795838 69795683 Y ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 126570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69808413 69808546 69808480 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 113862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69894907 69895080 69894991 Y ANO1 ANO1 ANO1,FADD,FGF4 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 27328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 69927034 69927161 69927098 Y ANO1 ANO1 NA NA NA NA ANO1 4626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 69965939 69966135 69966116 Y NA ANO1 NA NA NA NA ANO1 43531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 69969786 69970187 69969839 Y NA ANO1 NA NA NA NA ANO1 47378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70005779 70006157 70005922 Y ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD FADD NA NA NA NA FADD 41112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 70155804 70155966 70155885 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 40998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70232495 70232810 70232653 Y NA CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA CTTN 9700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 70367951 70368077 70368014 Y SHANK2 NA NA NA NA NA AP000487.5 125357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70400886 70401022 70400954 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 158292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 70759663 70760245 70759930 Y NA NA NA NA NA NA SHANK2 201378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 71493756 71493898 71493829 Y NA FAM86C1 NA NA NA NA FAM86C1 2658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 71702677 71703050 71702869 Y FOLR3,IL18BP,IL18BP NA NA NA NA NA RNF121 64930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA NA NA NA NA NA RNF121 66878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 INPPL1 NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 58224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 70390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 72686902 72687109 72687004 Y RELT,RELT NA NA NA NA NA ATG16L2 163549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 72904950 72905270 72905106 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 P2RY2 22073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 72953792 72954055 72953924 Y NA P2RY2,P2RY6 NA NA NA NA P2RY6 19495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA P2RY6,ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 2421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 73095869 73096760 73096281 Y FCHSD2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 10560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73126084 73126768 73126402 Y RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 40775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73240043 73240049 73240046 Y NA NA NA NA NA NA FAM168A 67185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73256735 73256785 73256760 Y NA NA NA NA NA NA FAM168A 50449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 74077556 74077917 74077717 Y NA PGM2L1 NA NA NA NA PGM2L1 29601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 74257729 74258089 74257917 Y KCNE3 NA KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLD3 54833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 75046698 75047081 75046998 Y NEU3 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 13792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 75248214 75248465 75248264 Y UVRAG GDPD5,SERPINH1 GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDPD5 13266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 75537561 75537829 75537710 Y ARRB1,DGAT2,UVRAG UVRAG NA NA NA NA UVRAG 13349 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 163545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 3883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 78061236 78062132 78061949 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 65262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 78134473 78134617 78134544 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 7079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 78144030 78144327 78144179 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 16636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 78426480 78426845 78426663 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 142561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr11 78508087 78508456 78508162 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 224168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 78512207 78512629 78512463 Y GAB2 NA NA NA NA NA NARS2 228288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 78571472 78571494 78571483 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 287553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 82781050 82781223 82781203 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 85 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 83190033 83190209 83190121 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 194583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 83203378 83203797 83203488 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 207928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 83852006 83852160 83852083 Y DLG2,DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 856556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 85160814 85160851 85160833 Y DLG2 NA NA NA NA NA TMEM126B 176778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF NA NA NA NA CREBZF 27540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 85463912 85464270 85464111 Y CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 55914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 85555514 85555895 85555623 Y NA SYTL2,AP000974.1 SYTL2,CCDC83,CCDC89,PICALM,EED IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000974.1 8091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86171239 86171469 86171359 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 159986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86195168 86195425 86195393 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 183915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86343883 86344000 86343960 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 37678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86430919 86431170 86431045 Y PRSS23 ME3 PRSS23,ME3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ME3 49241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86447030 86447398 86447213 Y NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 52703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86451588 86451883 86451813 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 48218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86620154 86620414 86620285 Y NA FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 44019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 86627337 86627645 86627491 Y FZD4 FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 36788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 86631607 86631965 86631913 Y ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4 FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 32468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 86803275 86803509 86803398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 56389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr11 87133739 87133898 87133788 Y NA NA GRM5,FZD4,LOC100506368 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 386853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 88288248 88288652 88288406 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 219293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 89144511 89144785 89144648 Y NA NA NA NA NA NA FOLH1B 224898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 89937153 89937335 89937244 Y NA CHORDC1 NA NA NA NA CHORDC1 17197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 91979590 91979911 91979751 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 949219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95065796 95065922 95065807 Y KDM4DL NA NA NA NA NA SESN3 102091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 95749380 95749532 95749413 Y NA NA NA NA NA NA MTMR2 92901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 95778897 95779169 95779022 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 122418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 95901866 95902123 95902033 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 172221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 95906618 95906816 95906767 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 167528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95940732 95941197 95941091 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 133147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95990308 95990455 95990418 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 83889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95991442 95991675 95991614 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 82669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 95994127 95994433 95994401 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 79911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 96024131 96024308 96024240 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 50036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 97836778 97837204 97837004 Y NA NA NA NA NA NA JRKL 1715625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 100590591 100590889 100590693 Y NA ARHGAP42 NA NA NA NA ARHGAP42 34207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 102175501 102175731 102175600 Y BIRC2 BIRC3,BIRC2 MMP7,BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 10484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 102296028 102296376 102296245 Y NA TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 42739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 102753440 102753618 102753537 Y NA MMP3,MMP12 MMP3,LOC100288077 IMR90 Hi-C 24141950 MMP12 9676 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 102867069 102867245 102867157 Y NA MMP13 MMP13,DCUN1D5,MMP3 IMR90 Hi-C 24141950 MMP13 42606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 107671635 107671653 107671644 Y ACAT1 NA NA NA NA NA RP11-832N8.1 105493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 107818531 107818875 107818638 Y NA RP11-832N8.1,SLC35F2,RAB39A NA NA NA NA RAB39A 21302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 107986432 107986807 107986620 Y NA ACAT1 NA NA NA NA ACAT1 3436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 108844177 108844477 108844316 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 310425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 109939977 109940512 109940366 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C K562 ChIA-PET 22265404 ZC3H12C 21575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr11 109947189 109947580 109947295 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 14507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 109948670 109948938 109948846 Y ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZC3H12C 13149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 109965770 109966113 109965869 Y RDX,FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 3683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 109966397 109966711 109966537 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 4310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 110002516 110002895 110002708 Y RDX ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 40429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 111849134 111849433 111849303 Y SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1 DLAT NA NA NA NA DLAT 44105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 111929773 111930099 111929899 Y DIXDC1 DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA C11orf57 12711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 111990973 111991528 111991378 Y IL18 C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 112702815 112703009 112702912 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-839D17.3 480150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 112842081 112842529 112842265 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 340630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 113552333 113552865 113552581 Y NA NA NA NA NA NA ZW10 89668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 116723326 116723638 116723620 Y SIK3 NA NA NA NA NA ZNF259 66560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA AP000936.1 102088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 116857252 116857500 116857432 Y SIK3 AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 47267 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 116867531 116867975 116867966 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 36792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 116870646 116870996 116870865 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 33771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118109664 118110018 118109732 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3 MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 11047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 118146006 118146232 118146062 Y FXYD6,MPZL2 MPZL3,MPZL2 MPZL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MPZL2 12755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118740767 118741727 118741016 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 MIR4492 DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4492 37690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 5420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 119395840 119396223 119396096 Y CBL NA LOC100499227,PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 76795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 120079363 120079802 120079708 Y NA TRIM29,POU2F3 NA NA NA NA OAF 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 120083069 120083545 120083438 Y GRIK4,ARHGEF12,OAF TRIM29,OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 3594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 120363124 120363469 120363220 Y NA GRIK4 NA NA NA NA GRIK4 16999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 121314934 121315243 121315071 Y NA SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 5669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 121321006 121321403 121321144 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 94 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 121337416 121337512 121337466 Y NA SORL1 NA NA NA NA SORL1 16504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 121493426 121493689 121493485 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 172514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 121542614 121542884 121542776 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 221702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 121699845 121700197 121699934 Y BLID NA MIR100HG,MIR125B1,BLID IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 268355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 121983293 121983692 121983594 Y NA MIR125B1,RP11-166D19.1,MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA RP11-166D19.1 1339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 122049218 122049681 122049522 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 28202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 122059856 122060218 122060121 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 38840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 122063445 122063834 122063519 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 42429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 122527331 122527938 122527906 Y UBASH3B UBASH3B NA NA NA NA UBASH3B 2948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 122584764 122585535 122585367 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 60381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 122616909 122617169 122616983 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 92526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 122727425 122727730 122727613 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P23 176845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 122989373 122989577 122989478 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8 57435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123345048 123345386 123345163 Y NA AP000783.1,LINC01059 CLMP,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 21942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123352361 123352657 123352509 Y OR8D4,OR6M1 LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 29255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123353850 123354009 123353930 Y NA LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 30744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 123381868 123382248 123382089 Y SCN3B,GRAMD1B NA GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 58762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123397233 123397392 123397331 Y SCN3B,GRAMD1B NA NA NA NA NA LINC01059 74127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123407861 123408201 123408031 Y NA NA NA NA NA NA LINC01059 84755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 123468998 123469339 123469251 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 54613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 124458771 124459153 124459140 Y OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1 NA NA NA NA TBRG1 31579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 124552795 124553089 124552942 Y OR8B4,C11orf61 SPA17,SIAE NA NA NA NA SIAE 10514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 124631233 124631497 124631343 Y ROBO4,ESAM NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA ESAM 1047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA ESAM 38702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 124733065 124733412 124733214 Y NA ROBO4 NA NA NA NA ROBO3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125384251 125384436 125384328 Y SLC37A2 FEZ1 EI24,STT3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEZ1 20038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125665065 125665247 125665168 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 86262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125696963 125697011 125697006 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 54498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125697407 125697462 125697419 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 54047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125898187 125898226 125898207 Y CDON CDON NA NA NA NA CDON 33004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 126001132 126001515 126001324 Y CDON NA CDON IMR90 Hi-C 24141950 CDON 69902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr11 126210041 126210184 126210131 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 126290424 126290762 126290592 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 66889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 126554448 126554559 126554501 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 330913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 126838913 126839134 126839118 Y KIRREL3 NA NA NA NA NA ST3GAL4 615378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 127859699 127859802 127859739 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 595651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 128149754 128150077 128149906 Y NA NA KCNJ1,FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 305376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128204456 128204853 128204574 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 250600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 128211301 128211582 128211378 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 243871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 128339730 128340284 128340256 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 115169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128346619 128346923 128346838 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 108530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128352415 128352744 128352497 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 102709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 128387749 128388099 128387998 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 67354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 128584156 128584534 128584279 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 29726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 129102482 129102753 129102618 Y NA ARHGAP32 NA NA NA NA ARHGAP32 44466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 129716429 129716681 129716540 Y TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 32715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 129717042 129717234 129717138 Y ST14,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 33328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 129723853 129724184 129723902 Y NFRKB TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 39301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr11 129781322 129781453 129781412 Y APLP2 NFRKB NA NA NA NA NFRKB 17837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr11 129912030 129912233 129912119 Y PRDM10,APLP2 PRDM10,TCEB2P2,APLP2 PRDM10,LINC00167,APLP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCEB2P2 10915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 129942098 129942391 129942179 Y PRDM10 TCEB2P2,APLP2 NA NA NA NA APLP2 4366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 130016455 130016576 130016492 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 10881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 130321179 130321606 130321259 Y ADAMTS15 ADAMTS15 NA NA NA NA ADAMTS15 4310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 130505078 130505260 130505180 Y NA NA ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 188209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr11 130506997 130507161 130507118 Y NA NA ADAMTS15,ADAMTS8 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 190128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 130743628 130743895 130743754 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 40509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 130969081 130969230 130969156 Y NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 184677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 131759058 131759559 131759199 Y NA AP004372.1 NA NA NA NA AP004372.1 5443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr11 131934936 131935322 131935091 Y NTM NA NA NA NA NA AP004372.1 169934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 131995649 131996509 131995944 Y NTM NA NA NA NA NA AP004372.1 230647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8,GLB1L3 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr11 134704831 134705001 134704917 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 505063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 508318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 1024438 1024795 1024721 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 72424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 1211682 1211803 1211740 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 114007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 1584094 1584332 1584168 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 52725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 2547305 2547477 2547330 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 354642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 2952217 2952396 2952310 Y NA ITFG2,RP4-816N1.6,FOXM1,TULP3 NA NA NA NA FOXM1 31810 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 4448343 4448720 4448381 Y PARP11,CCND2,C12orf5 C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 19972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 6276820 6277298 6277162 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 29583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG6 29449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6663248 6663743 6663420 Y GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1 SCARNA10,GAPDH,NOP2 NA NA NA NA NOP2 12114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2,LAG3 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA C12orf57 8422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 7790789 7791157 7790868 Y NA NA NA NA NA NA RP11-157G21.2 200203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 NA SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 59553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP NA NA NA NA NA PTMAP4 81609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 9910959 9911930 9911334 Y KLRB1,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69 NA NA NA NA NA CLEC2B 108805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA CLEC2B NA NA NA NA CLEC2B 33813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 10409972 10410105 10410016 Y NA GABARAPL1,KLRD1 NA NA NA NA KLRD1 33315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11902953 11903896 11903427 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 102165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11951921 11952163 11952067 Y ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 151133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12038206 12038369 12038301 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA BCL2L14 162409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 88880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12185852 12185959 12185898 Y ETV6,BCL2L14 BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL2L14 14819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 12609505 12609975 12609758 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 101492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 12735834 12736179 12735985 Y NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 22517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12766295 12766634 12766503 Y DUSP16,CREBL2 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 3534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 13050548 13050563 13050554 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA GPRC5A 8832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 13056884 13057235 13057060 Y GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA MIR614 9528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 13075067 13075388 13075228 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA MIR614 8304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 13255105 13255488 13255167 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 59887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 13320198 13320450 13320349 Y NA EMP1 APOLD1,HTR7P1,EMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 27200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 13326583 13326856 13326645 Y EMP1 EMP1 HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP1 20794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 13376138 13376415 13376269 Y HEBP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 28488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 14549073 14549306 14549114 Y WBP11,ATF7IP ATF7IP NA NA NA NA ATF7IP 32463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 15105208 15105676 15105381 Y WBP11,ARHGDIB ERP27,ARHGDIB NA NA NA NA ARHGDIB 6986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 20746479 20746810 20746645 Y LST-3TM12 NA NA NA NA NA PDE3A 226300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 20950319 20950359 20950339 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 430140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 20959036 20959191 20959158 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 438857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 20975224 20975562 20975349 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 455045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 11.4464018984653 chr12 21059259 21059529 21059394 Y SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2 NA NA NA NA NA PYROXD1 529020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 21666002 21666378 21666190 Y NA RECQL,GOLT1B,C12orf39 NA NA NA NA C12orf39 10863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr12 26130090 26130317 26130202 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 19392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 26142824 26143171 26142998 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 32126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA RP11-283G6.5 SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.5 42621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 26495152 26495452 26495369 Y ITPR2 RP11-283G6.5 NA NA NA NA RP11-283G6.5 24499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 26626326 26626794 26626426 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.5 155673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27174273 27174510 27174392 Y C12orf71 TM7SF3,MED21 NA NA NA NA MED21 794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 27593588 27593602 27593594 Y C12orf71 NA NA NA NA NA PPFIBP1 80762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 27746027 27746077 27746069 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 71663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 27931494 27931809 27931627 Y MANSC4 NA NA NA NA NA MRPS35 69788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 28119724 28120118 28120115 Y MANSC4,PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 3520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 28126453 28126843 28126791 Y PTHLH,PTHLH PTHLH NA NA NA NA PTHLH 2815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 28176067 28176342 28176190 Y PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 PTHLH 52429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 28283625 28284072 28283761 Y PTHLH,PTHLH CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 28814319 28814559 28814439 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-54P 343923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr12 29194633 29194954 29194755 Y NA NA CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 105082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 29317763 29317994 29317897 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 17727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 29361177 29361284 29361196 Y NA NA FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 61141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 29395025 29395583 29395357 Y NA NA NA NA NA NA FAR2 94989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 29489399 29489493 29489486 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 42629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 30570849 30571198 30571024 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 275722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 32881013 32881116 32881065 Y NA RP11-278C7.1,YARS2 NA NA NA NA RP11-278C7.1 2692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 39539251 39539539 39539453 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 240019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 42879735 42879922 42879834 Y NA NA NA NA NA NA PRICKLE1 102235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 42958967 42958984 42958976 Y NA PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 23173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 42984702 42985091 42984897 Y GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1 PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 2545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 43699836 43700036 43699910 Y NA NA PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 450584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 46797992 46798094 46798088 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 22530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 46825426 46825886 46825665 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 49964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 46845656 46846014 46845792 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 70194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 46894676 46894859 46894768 Y SLC38A4 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 119214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 8.58480142384899 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 46956105 46956322 46956188 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 180643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 47033293 47033660 47033445 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 257831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 47058808 47059020 47058972 Y SLC38A2 NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 283346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 280057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 47755231 47755452 47755328 Y NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 283497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 48053201 48053247 48053224 Y ASB8 RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 44597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 48261486 48261659 48261573 Y NA HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 36571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 48282882 48283045 48282955 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR NA NA NA NA NA VDR 51786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 48294417 48294695 48294497 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR VDR NA NA NA NA VDR 40136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C,COL2A1 TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 COL2A1 825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 48579978 48580344 48580161 Y OR8S1,OR10AD1 ASB8,DKFZP779L1853 NA NA NA NA ASB8 6982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 49452736 49452852 49452791 Y NA PRKAG1,RHEBL1,DHH,LMBR1L NA NA NA NA RHEBL1 8956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,C1QL4,SPATS2 NA NA NA NA C1QL4 10999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 49866902 49867154 49867028 Y PRPF40B,PRPF40B NA NA NA NA NA KCNH3 63786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 50019010 50019299 50019155 Y FMNL3 NA NA NA NA NA PRPF40B 59009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 50019907 50020190 50020017 Y NA NA NA NA NA NA PRPF40B 59906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 50860078 50860266 50860172 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 36502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 50926707 50927114 50926974 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 29939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 50932147 50932418 50932300 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 35379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 51765347 51765619 51765517 Y FIGNL2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A8 17482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 52184760 52184919 52184839 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1B 158532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 52540237 52540565 52540533 Y NA KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 43219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.54364486632563 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.86160047461633 chr12 52545730 52546132 52545994 Y KRT6A,C12orf44 KRT80 NA NA NA NA KRT80 37652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 52584709 52584955 52584807 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52609215 52609817 52609526 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 14487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 52617951 52618303 52618240 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 6001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr12 52629756 52630207 52629959 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 5452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr12 52835077 52835369 52835228 Y NA KRT75,KRT6B,KRT6A KRT75 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT6B 8541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53266551 53266796 53266674 Y NA NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 60216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 61446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT4 66934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53611077 53612140 53611274 Y PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 12624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 53955466 53955638 53955506 Y NA NA NA NA NA NA ATF7 62561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 53969356 53969561 53969448 Y NA ATF7 NA NA NA NA ATF7 48638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54012118 54012371 54012242 Y PFDN5 ATF7,RP11-972K6.1 NA NA NA NA ATF7 5828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54017367 54017528 54017445 Y NA ATF7,RP11-972K6.1 NA NA NA NA ATF7 671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA SNORD81 HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD81 15886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 54384983 54385161 54385072 Y TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9 HOXC12,HOXC10,HOXC6,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC6 2575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54415475 54415883 54415632 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 8754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 56147551 56147694 56147624 Y NA BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 12487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 56474601 56474862 56474633 Y SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3 RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1 NA NA NA NA ERBB3 2960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 56690284 56690436 56690361 Y NA ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A NA NA NA NA RP11-977G19.11 1490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 56876109 56876291 56876201 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 3907 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.39152648843417 chr12 57073427 57073817 57073648 Y NA BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 6342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 57635972 57636429 57636328 Y SLC26A10,R3HDM2,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25,NDUFA4L2 NXPH4,SHMT2 NA NA NA NA SHMT2 14862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NA NA NA NA NA SHMT2 51635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 57735992 57736374 57736348 Y NA NA R3HDM2 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 86414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 58262646 58262949 58262748 Y KIF5A,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1,AVIL CTDSP2 CTDSP2 K562 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 24124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 58758718 58759055 58758893 Y XRCC6BP1 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC6BP1 425394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 59426251 59426629 59426440 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LRIG3 113948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 59441566 59441855 59441676 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 129263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 62685666 62685938 62685802 Y C12orf61,MON2,USP15 USP15,FAM19A2 NA NA NA NA FAM19A2 14735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 62727827 62728150 62727887 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A2 56896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2 NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 62983522 62983540 62983531 Y NA RP11-631N16.2 NA NA NA NA RP11-631N16.2 10992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 57300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 63067118 63067447 63067283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 72586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 63091878 63091979 63091882 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 97346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 63133542 63133622 63133582 Y NA NA NA NA NA NA RP11-631N16.2 139010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 63294376 63294638 63294612 Y NA PPM1H NA NA NA NA PPM1H 32179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64310301 64310738 64310490 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 74228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64312639 64312950 64312683 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA SRGAP1 76566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64349679 64350074 64349795 Y TBK1 NA NA NA NA NA SRGAP1 113606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64386107 64386411 64386216 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 150034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64414724 64414736 64414730 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 178651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 64955008 64955199 64955103 Y C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 RASSF3,GNS,MIR548Z IMR90 Hi-C 24141950 RASSF3 47094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65528086 65528453 65528315 Y NA LEMD3 WIF1,TBC1D30,LEMD3,FLJ41278 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD3 32898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65926688 65927190 65926918 Y NA NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 67459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65959414 65959817 65959668 Y NA RP11-221N13.3 HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 34832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 66004084 66004433 66004259 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 9435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66025227 66025796 66025503 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 30578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66028423 66029056 66028712 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 33774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr12 66034360 66034755 66034412 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 39711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66042799 66043321 66043056 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 48150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 66048868 66049228 66049091 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 54219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66051570 66051762 66051716 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 56921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66089335 66089636 66089544 Y IRAK3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 94686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66159144 66159329 66159237 Y NA NA NA NA NA NA HMGA2 56582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 19179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 23936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RPSAP52 67090 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 66292016 66292293 66292025 Y NA NA NA NA NA NA RPSAP52 73262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr12 66311039 66311339 66311117 Y HMGA2 NA NA NA NA NA RPSAP52 92285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 66316992 66317322 66317175 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RPSAP52 98238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 67361974 67362194 67362149 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 98748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 67371255 67371618 67371453 Y GRIP1 NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 89324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 67392180 67392257 67392219 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 68685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 67404997 67405349 67405173 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 55593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 68221654 68222227 68222103 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 181536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.92145250225201 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 69291565 69291701 69291633 Y NA NA NA NA NA NA CPM 71649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ RP11-1143G9.2,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 26375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 70360347 70360458 70360404 Y NA NA NA NA NA NA RAB3IP 229886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 70360720 70360860 70360789 Y NA NA NA NA NA NA RAB3IP 230259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 70605032 70605426 70605086 Y CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 29348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 70630767 70631060 70630914 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 3714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 70650618 70650832 70650694 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 15478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 297581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 71555404 71555561 71555484 Y TSPAN8 NA NA NA NA NA LGR5 275989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 71770650 71771010 71770955 Y NA NA NA NA NA NA LGR5 60540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 72690281 72690495 72690341 Y TPH2,TRHDE TRHDE-AS1 NA NA NA NA TRHDE-AS1 23594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 72700873 72701321 72700945 Y TPH2 TRHDE-AS1 NA NA NA NA TRHDE-AS1 34186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 72767670 72768001 72767685 Y NA NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 100983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 72875098 72875358 72875202 Y TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 208411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 76053870 76054229 76054024 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 150454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-114H23.1 155843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 RP11-114H23.1 PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-114H23.1 37148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 76347823 76348161 76347983 Y GLIPR1,PHLDA1 RP11-114H23.1 PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-114H23.1 27634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA RP11-114H23.1 OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-114H23.1 3668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 76373014 76373318 76373236 Y GLIPR1,PHLDA1 RP11-114H23.1 OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-114H23.1 2477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 76414095 76414311 76414227 Y NA RP11-114H23.1,PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 11401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA RP11-114H23.1,PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 76811286 76811641 76811626 Y NA NA NA NA NA NA BBS10 71064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 76938616 76938968 76938946 Y NA OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 12621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 77377580 77377874 77377727 Y NA NA ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 E2F7 79486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 77426192 77426447 77426357 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 30913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr12 79323956 79323978 79323967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 68183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 77404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 79918085 79918441 79918422 Y NA RP1-78O14.1 SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-78O14.1 22909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 80032366 80032529 80032417 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 50348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 80098707 80098999 80098853 Y NA PAWR SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 15830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 82073563 82073755 82073659 Y PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2 NA NA NA NA NA CCDC59 676829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 82350374 82350688 82350420 Y CCDC59 NA NA NA NA NA CCDC59 399896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 83157091 83157416 83157138 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 78432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 86658149 86658358 86658243 Y NA NA NA NA NA NA NTS 392076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 87822808 87822965 87822871 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 602658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 89960420 89960675 89960548 Y NA POC1B,GALNT4 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNT4 42381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 90127113 90127954 90127635 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 26036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 90353904 90354400 90354158 Y ATP2B1 NA ATP2B1,LOC338758,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 252827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 90354567 90354976 90354683 Y POC1B,ATP2B1 NA ATP2B1,LOC338758,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 253490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92446330 92446640 92446498 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 88050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 64494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 92474192 92474586 92474423 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 60104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92490612 92490822 92490679 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 43868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92505299 92505700 92505686 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 28990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92509431 92509711 92509674 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 24979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 92528487 92528918 92528861 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 5772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 92995849 92996628 92996444 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 324479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 93305938 93306210 93306048 Y CLLU1OS EEA1 NA NA NA NA EEA1 14897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 93531854 93532122 93531996 Y EEA1 NA NA NA NA NA AC138123.2 56403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 93949724 93949882 93949803 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2 11708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 93971019 93971312 93971141 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2-AS1 7475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 94179016 94179409 94179114 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 109865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 94493473 94493774 94493548 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS2P1 322971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 138437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 94954640 94954945 94954835 Y NA NA NA NA NA NA TMCC3 87393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr12 95040140 95040532 95040337 Y NA TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 1806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 95492031 95492186 95492111 Y NA NR2C1 NA NA NA NA NR2C1 26552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr12 95597894 95598075 95597980 Y NA FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 11183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 95609786 95609977 95609896 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA VEZT 264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 96027575 96027687 96027629 Y NA NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 NTN4 155243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96031341 96031520 96031430 Y NTN4 NA NA NA NA NA NTN4 151410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA NTN4 134714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96138744 96139091 96139013 Y NA NTN4 NA NA NA NA NTN4 43839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96592675 96593197 96592888 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 6515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 96631530 96631765 96631742 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 45370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 96633740 96633767 96633754 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 47580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96635574 96636027 96635766 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 49414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96637849 96638243 96638007 Y LTA4H,ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 51689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96664847 96665248 96665048 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 78687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96685157 96685428 96685293 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 98997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17,RN7SKP11 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96810217 96810461 96810410 Y LTA4H,ELK3 CDK17,RN7SKP11 CDK17,ELK3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RN7SKP11 8803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 96842223 96842407 96842329 Y NA CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 22959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 97203899 97204065 97203983 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 94936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 97205009 97205147 97205078 Y NA NA NEDD1 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD1 93854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 99541137 99541427 99541282 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 504218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 100596885 100596960 100596910 Y NA ACTR6,RP11-175P13.3 NA NA NA NA RP11-175P13.3 5324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 100628061 100628323 100628191 Y NA ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2 NA NA NA NA SCYL2 30595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 101099927 101100118 101100023 Y NA NA SLC17A8 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-575G13.2 129405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 102169550 102169734 102169688 Y NA NA NA NA NA NA GNPTAB 52982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH NA NA NA NA NA NUP37 397706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA CHST11 NA NA NA NA CHST11 98 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 104912129 104912512 104912321 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 65056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 105101205 105101513 105101338 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 249009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 106621316 106621679 106621542 Y TCP11L2 NA NA NA NA NA TCP11L2 72028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 106640032 106640193 106640140 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 53514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 106642668 106643242 106642944 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 50465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 106694592 106694855 106694698 Y NA TCP11L2,CKAP4 NA NA NA NA TCP11L2 885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr12 107473112 107473328 107473221 Y NA CRY1 NA NA NA NA CRY1 12279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr12 109011185 109011417 109011288 Y USP30,SSH1,SELPLG,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 56827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109084686 109085066 109084867 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 38306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 109088465 109088864 109088838 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 34508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 109899131 109899209 109899162 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 13998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109900309 109900503 109900403 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 12704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 111015565 111016027 111015682 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 3098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 111867956 111868269 111868101 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 112920682 112921011 112920993 Y NA NA NA NA NA NA RPL6 66040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 113798034 113798144 113798106 Y SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS PLBD2 SDS,SDSL IMR90 Hi-C 24141950 PLBD2 3663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 113903072 113903274 113903194 Y NA SDSL NA NA NA NA SDSL 45030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 113908135 113908376 113908300 Y NA NA NA NA NA NA SDSL 50093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 115105863 115106455 115106375 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 13514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 115123119 115123458 115123382 Y NA TBX3 NA NA NA NA TBX3 3150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 115129219 115129332 115129273 Y TBX3 TBX3 TBX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBX3 9250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 115130244 115130426 115130316 Y TBX3 TBX3 TBX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBX3 10275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116188760 116188962 116188861 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 524181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116570796 116571229 116571121 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 141914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116572704 116573066 116572889 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 140077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116666460 116666763 116666749 Y NA MED13L NA NA NA NA MED13L 46380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116872632 116872752 116872692 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 96475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116930750 116930937 116930851 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00173 38290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116946088 116946451 116946189 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 116946674 116946880 116946778 Y NA LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 118123457 118123641 118123524 Y NA NA NA NA NA NA KSR2 281147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 118209559 118209890 118209580 Y NA NA NA NA NA NA KSR2 194898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 119632995 119633391 119633197 Y TMEM233 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 18548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 120665661 120665757 120665705 Y ACADS GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN NA NA NA NA PXN-AS1 28567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120666780 120666906 120666823 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN NA NA NA NA PXN-AS1 29686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 120675783 120676003 120675893 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 GCN1L1,RPLP0,LOC100506649 K562 ChIA-PET 22265404 PXN 25571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120689817 120690140 120689965 Y CCDC64,RAB35,RNF10,PXN PXN,NME2P1,RNU4-2 NA NA NA NA PXN 11434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120700086 120700381 120700233 Y RAB35,PXN,PXN PXN,NME2P1,RNU4-2 NA NA NA NA PXN 1193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-2 825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120912483 120912692 120912652 Y NA COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 6830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 120926786 120926862 120926830 Y SIRT4 TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA DYNLL1 21133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120953454 120953584 120953519 Y MSI1 SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 15699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121021309 121021477 121021390 Y NA POP5,RPL11P5 NA NA NA NA POP5 4108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 121462488 121462659 121462590 Y NA C12orf43,OASL C12orf43 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf43 10183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121715307 121715461 121715407 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 18650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121888305 121888670 121888535 Y NA NA NA NA NA NA RNF34 52461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 121998241 121998591 121998487 Y P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RHOF RP13-941N14.1,KDM2B NA NA NA NA RP13-941N14.1 18106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122224293 122224471 122224351 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 14838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 122444524 122444823 122444769 Y BCL7A BCL7A NA NA NA NA BCL7A 10505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122462417 122462775 122462615 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 7089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 122897459 122897572 122897541 Y NA CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 7607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 123964050 123964332 123964151 Y PITPNM2,RILPL1 RILPL2,SNRNP35 NA NA NA NA SNRNP35 23862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 124198913 124199092 124199012 Y ATP6V0A2 TCTN2,ATP6V0A2 NA NA NA NA ATP6V0A2 4048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 124864827 124865003 124864908 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 185132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 124866398 124866679 124866460 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 183456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 174399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr12 124951666 124951729 124951686 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 98406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 124963399 124963744 124963551 Y UBC NA NA NA NA NA NCOR2 86391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125003619 125003834 125003727 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 46301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125038421 125038650 125038536 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 11485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125050536 125050830 125050706 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125165952 125166242 125166057 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 115817 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125169582 125169721 125169665 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 119447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 125171572 125171968 125171622 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 121437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125211865 125212230 125212112 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCARB1 152984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125331273 125331577 125331425 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 33637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125332280 125332520 125332389 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 32694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 127567979 127568114 127568034 Y NA RP11-575F12.1 NA NA NA NA RP11-575F12.1 25033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 127610420 127610860 127610670 Y NA AC079949.1 NA NA NA NA AC079949.1 37812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 127745158 127745329 127745244 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 96486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr12 132315862 132315946 132315904 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 132356836 132357024 132356894 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 20172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 132861217 132861370 132861294 Y P2RX2,GALNT9 RP13-895J2.2 NA NA NA NA RP13-895J2.2 11240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 20271500 20271544 20271543 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 65712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 20546038 20546426 20546233 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 15228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA GJA3 88714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 20694627 20695029 20694906 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 38159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 31088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 20993930 20994321 20994126 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 103675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 21015788 21016178 21015983 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 81818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 21241518 21241702 21241584 Y NA NA NA NA NA NA IFT88 102933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 21398890 21399124 21398998 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 52793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 23895900 23896291 23896206 Y NA NA NA NA NA NA SACS 109550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA TNFRSF19 146492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 28.7219899489269 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 24440474 24440724 24440677 Y NA C1QTNF9B-AS1,MIPEP NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 20304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24543608 24543809 24543709 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 82050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIPEP 261369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 24835829 24835982 24835890 Y NA NA NA NA NA NA PARP4 248966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 24854044 24854200 24854080 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 230748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 25859422 25859518 25859470 Y NUPL1,MTMR6 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA MTMR6 629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 25886402 25886789 25886419 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 12740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 26551633 26551678 26551661 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 243113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 26948386 26948578 26948482 Y NA NA NA NA NA NA CDK8 122110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27608814 27608959 27608884 Y WASF3,GPR12 NA RASL11A,USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 135074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 27706563 27707017 27706898 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 37016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27728821 27729155 27728988 Y USP12 USP12 NA NA NA NA USP12 14878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27734553 27734882 27734861 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 9151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 27808177 27808245 27808213 Y NA RPL21,RASL11A USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21 15201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr13 28540285 28540611 28540449 Y LNX2,CDX2 NA NA NA NA NA PAN3-AS1 169719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 28873154 28873233 28873194 Y FLT1 NA NA NA NA NA EEF1A1P3 86504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 29106089 29106574 29106395 Y NA FLT1 FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLT1 38824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 29148829 29149214 29148994 Y POMP EIF4A1P7 FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A1P7 21756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 30332929 30333348 30333111 Y UBL3 NA NA NA NA NA UBL3 89473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 31775014 31775311 31775185 Y HSPH1 HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 2941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 32956405 32956487 32956432 Y NA N4BP2L1 NA NA NA NA N4BP2L1 43828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 33778763 33779029 33778994 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 143738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 33858244 33858802 33858357 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 63965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 34729958 34730262 34730146 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 339772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 34730516 34730744 34730573 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 340330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 37107892 37108239 37108072 Y NA NA NA NA NA NA CCNA1 103925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 37723502 37723846 37723737 Y FAM48A,CSNK1A1L NA POSTN,LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 ALG5 151104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 40331110 40331478 40331245 Y NA NA NA NA NA NA COG6 103346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 41051870 41052082 41051977 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 186652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 41202839 41203181 41203053 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 35553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 41586512 41586699 41586606 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 46711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 41627549 41627939 41627788 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WBP4 5471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA DGKH 342701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 42276592 42276928 42276845 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 335248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 42397573 42397928 42397750 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 214248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 42422497 42422720 42422629 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA DGKH 189456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 42453037 42453433 42453235 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 158743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 43149619 43149668 43149644 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 305330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 43382131 43382356 43382244 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 182051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 DGKZP1 SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 2172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr13 44818555 44818615 44818583 Y C13orf31,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERP2 127186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 44842198 44842383 44842274 Y NA NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 SERP2 103418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 64710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr13 44882133 44882330 44882202 Y NA NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 63471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 44884974 44885381 44885134 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 60420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr13 44978399 44978598 44978577 Y NA SERP2 NA NA NA NA SERP2 32598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 45030393 45030697 45030548 Y NA NA NA NA NA NA SERP2 84592 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 45211496 45211845 45211671 Y NA NA NUFIP1,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 62213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 45288309 45288506 45288432 Y KCTD4 NA NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 139026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 45629728 45629998 45629866 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 62652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr13 45846557 45846941 45846749 Y NA NA NA NA NA NA TPT1-AS1 66539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 45941510 45941762 45941695 Y COG3,TPT1 TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30 NA NA NA NA TPT1 28005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46095529 46095772 46095647 Y TPT1 NA NA NA NA NA COG3 58469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46102041 46102392 46102214 Y NA NA NA NA NA NA COG3 64981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 46244354 46244716 46244645 Y NA NA NA NA NA NA COG3 207294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46688680 46689111 46688972 Y ZC3H13,LCP1 NA NA NA NA NA ZC3H13 63786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46709325 46709604 46709495 Y NA NA NA NA NA NA LCP1 74402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46750972 46751177 46751169 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 32829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 46752144 46752602 46752461 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 31404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 48636284 48636323 48636312 Y NA NUDT15,SUCLA2,MED4 NA NA NA NA SUCLA2 26159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 46274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 18138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 51886195 51886377 51886335 Y NA NA FAM124A IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 91692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 52218212 52218391 52218309 Y NA NA NA NA NA NA WDFY2 61568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 52220633 52220708 52220687 Y INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 63989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 55208577 55208909 55208656 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 1983733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 59854407 59854488 59854447 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 881633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 60033102 60033487 60033176 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 702634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 60570337 60570455 60570340 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 165666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 60635732 60636010 60635830 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 100111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA PCDH20 1021408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 63626096 63626398 63626247 Y NA NA NA NA NA NA PCDH20 1625876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 71803868 71804000 71803934 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 443199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 74184794 74185193 74184838 Y NA NA PIBF1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-10P 421129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 75882191 75882614 75882549 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 171636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 75965393 75965547 75965541 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 88703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 76289938 76289995 76289967 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 97368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 76290964 76291186 76291007 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 98394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 77364596 77364759 77364678 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 93781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 78003842 78004097 78003950 Y MYCBP2 NA NA NA NA NA SCEL 103712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 78090399 78090658 78090529 Y NA SCEL NA NA NA NA SCEL 17151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 80822359 80822707 80822533 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 90379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 88259012 88259340 88259160 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1887389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 88345046 88345403 88345227 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1973423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 88384592 88384886 88384741 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 2012969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 90167002 90167321 90167160 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1830753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 91580553 91580648 91580601 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 417426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 91807857 91808125 91807991 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 189949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 94913778 94913870 94913813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 332641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 95753354 95753450 95753358 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 198237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 96424038 96424083 96424061 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 96645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 98599587 98599881 98599659 Y NA IPO5 NA NA NA NA IPO5 4031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 99123285 99123381 99123333 Y NA NA NA NA NA NA STK24 104813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr13 99278853 99278891 99278872 Y NA CALM2P4 STK24,FARP1 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2P4 12602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA SLC15A1 159803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99931812 99933023 99932107 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 65800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99934888 99935365 99935021 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 68876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 69832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99953890 99954205 99953920 Y NA NA NA NA NA NA H2AFZP3 87878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99955691 99955924 99955808 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 89679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99957500 99957664 99957598 Y DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 91488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99957911 99958107 99958020 Y DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 91899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 108533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 100024364 100024560 100024446 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA TM9SF2 127111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 100314131 100314374 100314299 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 57212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 102236775 102236811 102236793 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 133809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 103250853 103251030 103250900 Y NA TPP2 NA NA NA NA TPP2 3500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 107070030 107070366 107070265 Y NA LINC00460 EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 43119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 107170805 107171068 107170962 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 47444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 363316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 109595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 108520964 108521235 108521194 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 109808669 109809037 109808800 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 596578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr13 110299478 110299796 110299637 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 105819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 110401088 110401398 110401243 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA AL162497.1 4217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr13 110631754 110631774 110631764 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 194839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 110762303 110762556 110762479 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL4A2 193603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111022548 111022884 111022711 Y ING1 NA NA NA NA NA COL4A1 65052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111049993 111050394 111050073 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 92497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111212014 111212166 111212090 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 NA COL4A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB20 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111212967 111213224 111213111 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB20 887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr13 111658607 111658954 111658781 Y NA NA ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 93191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 106764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr13 113588902 113588931 113588917 Y NA MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MCF2L-AS1 32207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 114065698 114065892 114065794 Y MCF2L,ADPRHL1 GRTP1 NA NA NA NA GRTP1 49252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr13 114459608 114459701 114459670 Y NA NA NA NA NA NA GAS6-AS1 56902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 114740287 114740680 114740494 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 155406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr13 114892702 114892820 114892783 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 3266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 19176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 21577986 21578258 21578000 Y NA ARHGEF40,ZNF219 NA NA NA NA ZNF219 7105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 23222866 23223018 23222950 Y NA OXA1L NA NA NA NA OXA1L 10713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 23308431 23309148 23308805 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 4665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 24481106 24481351 24481229 Y NA DHRS4L2,LRRC16B NA NA NA NA LRRC16B 37855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 25476676 25476861 25476696 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P6 257681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 27311220 27311475 27311345 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 246260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 28957970 28957982 28957974 Y NA RPL26P3 NA NA NA NA RPL26P3 854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 31055388 31055443 31055417 Y NA G2E3,SCFD1 NA NA NA NA G2E3 29059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 31905446 31905450 31905448 Y NA HEATR5A,RP11-176H8.1 NA NA NA NA HEATR5A 17658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 32699129 32699310 32699220 Y NA NA NUBPL,AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5-AS1 155130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 32941850 32942320 32942112 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 9686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 33098616 33098902 33098649 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 146610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 33756619 33756719 33756669 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 354480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EAPP NA NA NA NA SPTSSA 36690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 34987475 34987508 34987491 Y EAPP EAPP NA NA NA NA EAPP 19408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 35562791 35563105 35562948 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA PPP2R3C 26618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 35625298 35625573 35625393 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 35543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 35876265 35876636 35876451 Y FAM177A1,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 4310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 37134370 37134658 37134514 Y NA PAX9 NA NA NA NA PAX9 9597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 37233433 37233885 37233827 Y NA NA NA NA NA NA PAX9 108660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 37587049 37587449 37587434 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A21 52622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 38052089 38052429 38052199 Y NA RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 10623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 38052956 38053419 38053189 Y FOXA1 RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 9633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 38054173 38054544 38054319 Y NA RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 8508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr14 38057887 38058022 38057995 Y FOXA1 RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 5030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr14 38067310 38067714 38067659 Y NA RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA FOXA1 65 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.9675856773799 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 41585190 41585196 41585195 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1685486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 41662407 41662459 41662451 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1762703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 42297588 42297942 42297766 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2397884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 44804196 44804463 44804330 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398E10.1 445569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 45160440 45160781 45160566 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398E10.1 89251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 45483090 45483569 45483224 Y NA KLHL28 NA NA NA NA KLHL28 25956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 45592379 45592731 45592576 Y PRPF39 PRPF39,FKBP3,FANCM NA NA NA NA FKBP3 9791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 48030000 48030393 48030347 Y MDGA2,MDGA2 NA NA NA NA NA RPL13AP2 361693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RN7SL1 675222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 49979013 49979291 49979168 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RN7SL1 72006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 50378479 50378620 50378548 Y RPL36AL,MGAT2,C14orf182,SOS2,ARF6 ARF6 NA NA NA NA ARF6 20669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 81921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50465888 50466432 50466066 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 108078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr14 50511824 50512400 50511896 Y RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182 NA C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARF6 154014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA SOS2 167466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50552755 50553092 50552901 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 143184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 50988191 50988449 50988343 Y NA ATL1,MAP4K5 NA NA NA NA ATL1 8778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 51074312 51074388 51074350 Y TRIM9,ATL1 MAP4K5 SAV1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K5 48468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 51295991 51296327 51296165 Y NA NIN NA NA NA NA NIN 152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 51434779 51434836 51434798 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 25325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 RP11-255G12.3 LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-255G12.3 3789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 51909639 51909898 51909736 Y NA RP11-255G12.3,FRMD6 FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 43920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 51999901 52000168 52000035 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 46083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52008545 52008925 52008735 Y TRIM9 NA NA NA NA NA FRMD6 54727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52074354 52074735 52074485 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 120536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 52304523 52304675 52304599 Y NA GNG2 TMX1,TRIM9,GNG2,C14orf166,FRMD6 IMR90 Hi-C 24141950 GNG2 13610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52329207 52329783 52329305 Y NA GNG2 NA NA NA NA GNG2 38294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 52547300 52547782 52547649 Y NA NID2 NID2,C14orf166,TXNDC16 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 13588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 53392802 53392977 53392890 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 24176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr14 54573774 54574066 54573953 Y NA NA NA NA NA NA AL162759.1 258174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 54649490 54649642 54649566 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 211925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 54758286 54758405 54758397 Y NA NA NA NA NA NA CDKN3 103162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55073001 55073254 55073103 Y NA SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 41186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55094268 55094954 55094583 Y GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 NA NA NA NA NA SAMD4A 62453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55104908 55105113 55104939 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 73093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55109619 55109800 55109713 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 77804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55115744 55116109 55115959 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 83929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 55120784 55121076 55120951 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 88969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 55144129 55144414 55144262 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 112314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 55179095 55179183 55179143 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 147280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 55544097 55544118 55544108 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.81546729948844 chr14 55584452 55585250 55584591 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 3578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55589429 55589640 55589507 Y NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 55841053 55841315 55841186 Y MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14 ATG14 NA NA NA NA ATG14 35261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 56733293 56733420 56733313 Y PELI2 NA NA NA NA NA LINC00520 471887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 57047832 57047974 57047932 Y PELI2,C14orf101 NA NA NA NA NA EXOC5 685752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 57725682 57725794 57725735 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 58726838 58727438 58727133 Y NA PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA PSMA3 17289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 59002332 59002438 59002384 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 59874044 59874284 59874170 Y NA NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR135 55776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 59908838 59908842 59908840 Y NA GPR135,JKAMP NA NA NA NA GPR135 21218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61188145 61188381 61188263 Y NA SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61188472 61188761 61188676 Y PPM1A SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 81318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 PRKCH SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 39952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61652622 61652735 61652681 Y NA PRKCH SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61811731 61812149 61812030 Y PRKCH RP11-902B17.1 NA NA NA NA RP11-902B17.1 24195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61822624 61823005 61822699 Y PRKCH RP11-902B17.1 NA NA NA NA RP11-902B17.1 35088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61855306 61855686 61855500 Y PRKCH NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 67770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61865216 61865457 61865337 Y PRKCH NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 77680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61937176 61937384 61937282 Y NA NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 149640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 150732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61939634 61940081 61939867 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 152098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61946614 61946719 61946667 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 159078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61946856 61947374 61946994 Y NA NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 159320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61960753 61960767 61960760 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 173217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 181993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 61979288 61979588 61979394 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 180643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 61993702 61994099 61993768 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 166132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 62018127 62018466 62018303 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 141765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 62032593 62032996 62032785 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 127235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 62052395 62052634 62052478 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 107597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 62053265 62053527 62053394 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 106704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 62115448 62115553 62115501 Y PRKCH,SYT16 HIF1A,HIF1A-AS1 NA NA NA NA HIF1A 44678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 62170336 62170562 62170449 Y NA HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2 NA NA NA NA HIF1A-AS1 9795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 62219407 62219640 62219496 Y HIF1A,SNAPC1 RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1 NA NA NA NA HIF1A-AS2 3592 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 62454456 62454478 62454466 Y SYT16 NA SYT16 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 157369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr14 62625618 62625869 62625715 Y NA NA RHOJ,KCNH5 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 328531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 62636657 62636665 62636660 Y SYT16 NA RHOJ,KCNH5,GPHB5 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 339570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 63088627 63088999 63088813 Y NA NA RHOJ IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 791540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 63829601 63829975 63829789 Y WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 178117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64170371 64170528 64170450 Y NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 22229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64358003 64358294 64358235 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 40320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64403874 64404095 64403883 Y NA NA NA NA NA NA SYNE2 86191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64670198 64670275 64670237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 133042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 97988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64720777 64720916 64720847 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 82401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64912318 64912487 64912430 Y ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5 AKAP5 NA NA NA NA AKAP5 17730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 65006188 65006351 65006244 Y NA ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA HSPA2 5565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 65147051 65147198 65147125 Y NA PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 21622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 65272532 65272626 65272579 Y NA NA NA NA NA NA SPTB 71975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 65273271 65273625 65273457 Y NA NA NA NA NA NA SPTB 70976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 65525721 65526064 65525893 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 41349 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 65546452 65546770 65546602 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 20643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA CTD-2509G16.2 LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2509G16.2 49292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr14 65641048 65641253 65641171 Y NA CTD-2509G16.2 LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2509G16.2 45812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 65691594 65691779 65691731 Y NA CTD-2509G16.2 FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2509G16.2 4529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 65722117 65722532 65722424 Y NA CTD-2509G16.2 LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2509G16.2 35052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 66104549 66104610 66104580 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 229239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 66912712 66912753 66912717 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 59372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 67728313 67728625 67728469 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 22487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 68456427 68456429 68456428 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 171931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68529528 68529897 68529655 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 245032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 68644384 68644906 68644390 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 242007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 68677466 68677903 68677626 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 209010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68860375 68860378 68860377 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 26535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 68961774 68962026 68961864 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 74861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 69065409 69066172 69065453 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA CTD-2325P2.3 84110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr14 69162018 69162337 69162187 Y NA CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 11736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 69241519 69241814 69241672 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 19376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 69361596 69361764 69361692 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 82393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69400981 69401191 69401073 Y ZFP36L1,DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 42966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69402735 69403079 69402843 Y GALNTL1 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 41078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 69516483 69516670 69516577 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 72326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69576488 69576915 69576681 Y NA DCAF5 NA NA NA NA DCAF5 40952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 69913588 69913836 69913761 Y NA NA NA NA NA NA ERH 50244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 70081383 70081681 70081508 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 5070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 70251267 70251371 70251319 Y SLC10A1 NA NA NA NA NA SRSF5 59650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 70575518 70575625 70575572 Y NA NA NA NA NA NA COX16 248823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 71158950 71159205 71159125 Y NA RP6-65G23.1 NA NA NA NA RP6-65G23.1 4210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 RP6-65G23.1 NA NA NA NA RP6-65G23.1 1119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 71811948 71812060 71812004 Y NA SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 25417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 52112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 83841 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 73100225 73100572 73100516 Y NA NA RGS6,DPF3 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 258237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 73110081 73110359 73110171 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 248450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr14 73585185 73585324 73585255 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 15802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 73824884 73825148 73825019 Y ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB NA NA NA NA NA NUMB 103200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 73919503 73919783 73919743 Y NA NUMB,C14orf169 NA NA NA NA NUMB 8565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 74140666 74140779 74140723 Y FAM161B RP3-414A15.10,DNAL1,PNMA1 NA NA NA NA DNAL1 31088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA NA NA NA NA NA PTGR2 64044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 74793012 74793450 74793309 Y NA ABCD4 NA NA NA NA ABCD4 25253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75015716 75015962 75015839 Y NA NA NA NA NA NA NPC2 56836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 43525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 75037027 75037351 75037159 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 39955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 38286 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 75063394 75063798 75063525 Y NPC2,LTBP2 LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 13508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF LTBP2,CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 5059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75125565 75125963 75125764 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 44215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75607767 75608156 75607957 Y FOS RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK9 15720 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75649674 75650038 75649826 Y FOS TMED10 TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMED10 8340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75697272 75697400 75697329 Y NA RP11-293M10.2,FOS TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 26714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 75768536 75769006 75768683 Y NA RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 25059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 76026175 76026384 76026299 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 16576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 76444839 76444980 76444910 Y ESRRB,TGFB3 TGFB3 NA NA NA NA TGFB3 2354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77425025 77425260 77425132 Y C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.7 1044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr14 77503944 77504718 77504558 Y NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 10910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 77517690 77517970 77517808 Y NA IRF2BPL C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 24656 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 77639599 77639692 77639653 Y NA NA C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63C 58688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 78047292 78047714 78047418 Y NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 33402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 78059840 78060228 78060134 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 20888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 79502772 79503033 79502836 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1238346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 80156436 80156705 80156544 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 695395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA DIO2 167091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 81088140 81088388 81088236 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 236040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 81484958 81485153 81484991 Y TSHR NA NA NA NA NA CEP128 61097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.33167446079849 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 STON2 NA NA NA NA STON2 33193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 83674613 83674690 83674652 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 1676408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 84176891 84176909 84176900 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L 2178686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 89493430 89493694 89493607 Y NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 204933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 125810 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA CAP2P1 131285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 89935615 89935871 89935745 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 147622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 90378938 90379536 90379158 Y FOXN3,FOXN3,KCNK13 EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA EFCAB11 39585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 90910680 90911014 90910847 Y NA CALM1 CALM1,TTC7B MCF7 ChIA-PET 22265404 CALM1 49834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 90975200 90975474 90975336 Y NA NA LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 114354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91090658 91091172 91090732 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 189651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91423143 91423331 91423289 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA RPS6KA5 101649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 91488828 91489143 91489063 Y NA RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 35837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91556459 91556738 91556599 Y NA RPS6KA5 RPS6KA5,CCDC88C IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA5 31479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91696123 91696361 91696283 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 NA NA NA NA NA RPS6KA5 171143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91730791 91731194 91731191 Y NA NA GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC88C 150994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 91759632 91759894 91759768 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 122294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 91814664 91814951 91814783 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 67237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 93030823 93030949 93030917 Y ATXN3,LGMN NA NA NA NA NA RIN3 52705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 93121718 93122010 93121905 Y ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 91037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 93192576 93192808 93192662 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 20239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 93635981 93636377 93636218 Y NA MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA MOAP1 12896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 45744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 94861741 94861876 94861812 Y SERPINA1 SERPINA1 SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINA1 6711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA NA NA NA NA NA GLRX5 51030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 97646734 97646983 97646791 Y NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 385093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 100045606 100045757 100045663 Y CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 22606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 100138998 100139105 100139062 Y HHIPL1 HHIPL1,CYP46A1 NA NA NA NA CYP46A1 9536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 100256117 100256421 100256129 Y NA NA EML1,CYP46A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EML1 54087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 128705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 100497913 100498157 100498035 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 126343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 101151381 101151698 101151540 Y RTL1,DLK1 NA NA NA NA NA BEGAIN 99631 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 101155057 101155401 101155388 Y NA NA NA NA NA NA BEGAIN 103307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA NA NA NA NA NA BEGAIN 107508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 101370822 101370975 101370899 Y BEGAIN,RTL1 NA NA NA NA NA AL132709.1 171272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102176439 102176788 102176690 Y PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C PPP2R5C,LINC00239 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-1029J19.5 18657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102193066 102193341 102193142 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C NA NA NA NA RP11-1029J19.5 2104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102258119 102258367 102258242 Y NA PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 31984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102292259 102292630 102292392 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 66124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 102396001 102396203 102396103 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 32662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102662808 102663069 102662945 Y TECPR2,HSP90AA1,WDR20 NA NA NA NA NA HSP90AA1 58772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 102868139 102868468 102868196 Y HSP90AA1,RCOR1,TECPR2 CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 40839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 102977207 102977381 102977329 Y AMN ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 3071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102989903 102989915 102989909 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 15767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 102997284 102997579 102997375 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 MIR4309,RCOR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 23148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103097343 103097523 103097412 Y NA RCOR1 NA NA NA NA RCOR1 40345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103234724 103234907 103234791 Y RCOR1,TNFAIP2,TRAF3 TRAF3 TRAF3,TECPR2,RCOR1,CDC42BPB,AMN MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRAF3 6906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 103299136 103299384 103299260 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3 57323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103537585 103537989 103537775 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 15786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 29772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103726827 103727460 103727139 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103781496 103782004 103781810 Y EXOC3L4,TNFAIP2 EIF5 RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF5 15877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 103828242 103828602 103828384 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 EIF5,MARK3 NA NA NA NA MARK3 21127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 103848844 103849188 103848935 Y TNFAIP2,EIF5,MARK3 MARK3 NA NA NA NA MARK3 541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 104228992 104229118 104229080 Y NA XRCC3,ZFYVE21 NA NA NA NA ZFYVE21 48925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA MIR203,KIF26A NA NA NA NA MIR203 1311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105124209 105124541 105124354 Y NA RP11-982M15.6,INF2 NA NA NA NA RP11-982M15.6 20942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 105154013 105154712 105154273 Y ADSSL1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 70 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA RPS26P49 NA NA NA NA RPS26P49 31538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105368048 105368162 105368106 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P49 72540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105399879 105400289 105400091 Y NA AHNAK2,C14orf79 NA NA NA NA AHNAK2 42405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105434041 105434308 105434245 Y NA AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 6.67706777410477 chr14 105493379 105493756 105493698 Y NA C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 7894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr14 105549558 105549976 105549724 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 64073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105653618 105653649 105653635 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA NUDT14 7958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr14 106029905 106030244 106030075 Y NA TMEM121 NA NA NA NA TMEM121 38965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1261991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 1973869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1946869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 637959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr15 22450316 22450421 22450369 Y OR4N4 NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 93668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 24114794 24115156 24114976 Y NA NA NA NA NA NA MKRN3 306340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 25123469 25123644 25123557 Y SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA SNRPN 56675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 25554216 25554517 25554319 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 127611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 25597069 25597306 25597188 Y SNRPN,SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 84822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 25604152 25604594 25604190 Y SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 77534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 25606189 25606253 25606221 Y UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 75875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 25642287 25642724 25642425 Y UBE3A UBE3A NA NA NA NA UBE3A 39404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 25981968 25982324 25982145 Y NA NA NA NA NA NA ATP10A 125993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 26097872 26097956 26097914 Y NA ATP10A NA NA NA NA ATP10A 10361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 27143884 27143956 27143920 Y NA NA NA NA NA NA ATP10A 1035567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 27668360 27668703 27668532 Y GABRG3 NA NA NA NA NA HERC2P9 1163935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA RP11-680F8.1 57328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 31215782 31215951 31215851 Y FAN1,FAN1,MTMR10 FAN1 NA NA NA NA FAN1 21727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 33083952 33084023 33083988 Y NA NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 74744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 33111010 33111355 33111242 Y NA NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 101802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 33120518 33121018 33120854 Y GREM1 NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 111310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 33188603 33188636 33188634 Y NA NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 179395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-758N13.1 409598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 34531616 34532056 34531745 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A6 96205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr15 34625973 34627107 34626354 Y NA SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA SLC12A6 1154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 34983371 34983524 34983448 Y NA NA AQR,ZNF770 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA8A,GOLGA8B 104667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 35931462 35931854 35931625 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 652974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 35983013 35983197 35983137 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 704525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 36910960 36911073 36911017 Y MEIS2,C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 41148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 98737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 139725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37261192 37261563 37261502 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 127977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37278170 37278456 37278428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 111084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 38345293 38345611 38345599 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 196916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 38376586 38376698 38376641 Y NA NA SPRED1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 165829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 38422177 38422570 38422209 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 119957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.86160047461633 chr15 38814347 38814382 38814365 Y C15orf53,RASGRP1 NA NA NA NA NA FAM98B 70019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 38828822 38829084 38828901 Y RASGRP1 NA NA NA NA NA FAM98B 84494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 38853240 38853506 38853363 Y C15orf53,RASGRP1 NA NA NA NA NA FAM98B 108912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39163582 39163767 39163675 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 419254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39175462 39175521 39175492 Y NA NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 431134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 355219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 296120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 39425474 39425830 39425675 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 291566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 267321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39484062 39484453 39484282 Y NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 232943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 39524753 39525004 39524927 Y THBS1 NA C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 192392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39561378 39561942 39561743 Y THBS1 NA NA NA NA NA RP11-624L4.1 155454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 39866856 39867109 39867069 Y FSIP1 THBS1 THBS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 THBS1 4171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 31189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 40200668 40200777 40200723 Y NA GPR176,EIF2AK4 NA NA NA NA GPR176 10316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr15 40339886 40340243 40340062 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 10497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 41074954 41075332 41075143 Y NA GCHFR,C15orf62,ZFYVE19,DNAJC17 NA NA NA NA C15orf62 14795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 41158071 41158384 41158228 Y RHOV SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 6103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr15 41741039 41741403 41741222 Y NA NDUFAF1,RTF1,ITPKA NA NA NA NA ITPKA 42188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 41788010 41788393 41788374 Y NA ITPKA,RPAP1 NA NA NA NA ITPKA 4419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 41878002 41878382 41878246 Y NA RPAP1,TYRO3,MGA NA NA NA NA TYRO3 30129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 42083275 42083582 42083459 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA MAPKBP1 18643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 42213328 42213713 42213448 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 49063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 42226071 42226526 42226165 Y EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 36250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 42226984 42227301 42227216 Y LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 35475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 42232566 42232958 42232887 Y EHD4 EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 29818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 43152474 43152861 43152772 Y STARD9,TTBK2 NA NA NA NA NA TTBK2 58146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76,PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 4337 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 44431053 44431468 44431357 Y NA NA NA NA NA NA FRMD5 53982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 45016631 45017046 45016657 Y SPG11,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA TRIM69 2140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 45746745 45747578 45747238 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 26018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 27742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 28588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 48436189 48436527 48436248 Y SLC24A5 MYEF2 NA NA NA NA MYEF2 32187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 48884247 48884306 48884277 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 51740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 49160709 49161101 49160898 Y NA EID1 NA NA NA NA EID1 6982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 49488021 49488225 49488024 Y NA GALK2,COPS2 NA NA NA NA COPS2 42163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 50620432 50620711 50620437 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 24814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 50633863 50634132 50634006 Y ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1 GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 11393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 51595036 51595426 51595331 Y NA GLDN NA NA NA NA GLDN 36400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 51909690 51910017 51909879 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 3013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 52120789 52121195 52120954 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 54459797 54459817 54459807 Y UNC13C NA NA NA NA NA RSL24D1 1027448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 55503902 55504218 55504040 Y RAB27A,PIGB RSL24D1 RSL24D1 K562 ChIA-PET 22265404 RSL24D1 16637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 56341448 56341541 56341527 Y NA NA NEDD4 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD4 57504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 57648977 57649377 57649143 Y NA CGNL1 CGNL1 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 16788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 57798359 57798473 57798399 Y NA NA NA NA NA NA GCOM1 83633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 57946197 57946519 57946360 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 63966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 59469464 59469853 59469728 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 74187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA FAM81A 75499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2 NA NA NA NA ANXA2 7526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr15 61459603 61459724 61459664 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 690226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 62042724 62043095 62042895 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 307577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 62430374 62430555 62430466 Y NA NA NA NA NA NA C2CD4A 73198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 62685382 62685737 62685634 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 4657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 63782902 63783064 63782983 Y HERC1,LACTB,RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 11729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 63792570 63793348 63792650 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 1445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 64397616 64397971 64397713 Y SNX1 DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22 NA NA NA NA SNX1 13294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 37654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 64995974 64996331 64996160 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 2494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 66764584 66765048 66764851 Y NA SNAPC5,ZWILCH,RPL4 NA NA NA NA SNAPC5 23103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 66972187 66972410 66972299 Y NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 20156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 67394592 67394967 67394687 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 40491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 67409139 67409556 67409296 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 55038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr15 67716264 67716618 67716446 Y NA NA NA NA NA NA C15orf61 94788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 68878617 68878894 68878756 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 9309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 69487654 69488051 69487853 Y NA GLCE NA NA NA NA GLCE 36731 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr15 70392397 70392607 70392502 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71126164 71126470 71126369 Y NA LRRC49,LARP6 NA NA NA NA LRRC49 17108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71363973 71364162 71364068 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90 Hi-C 24141950 THAP10 180849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 71406673 71406868 71406715 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 223549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 71571969 71572363 71572175 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 71677897 71678187 71678028 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 494773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 564145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 72003894 72004173 72003980 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 400426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 72082448 72082758 72082608 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 321841 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr15 72124774 72125030 72124885 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 279569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 72226785 72227154 72226872 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 177445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 73939698 73939908 73939794 Y NA NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 15223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr15 74216715 74216840 74216797 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 5024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr15 74222908 74223263 74222994 Y LOXL1,STOML1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 6578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 74226590 74227025 74226821 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 10260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.49751169119774 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA RP11-60L3.1 79798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 74677413 74677899 74677622 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A SEMA7A K562 ChIA-PET 22265404 SEMA7A 46909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr15 74689389 74689592 74689450 Y SEMA7A,SEMA7A SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 74693129 74693507 74693351 Y SEMA7A,SEMA7A,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 31301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 74693719 74694069 74694004 Y NA SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 30739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75338663 75338960 75338803 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 24767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75353716 75354155 75353786 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 39820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75398506 75398605 75398540 Y MAN2C1,CLK3,C15orf39 NA C15orf39 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPCDC 84610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75404629 75405178 75404816 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 80806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75516793 75516921 75516865 Y NA C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 30809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75939210 75939595 75939262 Y NA SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 77055500 77055901 77055892 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 139884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 77635534 77635848 77635691 Y NA NA NA NA NA NA PEAK1 74638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 77675113 77675384 77675318 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA PEAK1 35102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 78031317 78031646 78031484 Y LINGO1 NA NA NA NA NA HMG20A 320563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA TBC1D2B 255769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 78953383 78953770 78953429 Y MORF4L1 RPL18P11 CHRNA5,CHRNB4,LOC729911 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18P11 1465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 79635470 79635474 79635472 Y NA TMED3 NA NA NA NA TMED3 34066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 79669806 79669918 79669862 Y NA NA MTHFS,ST20-MTHFS,C15orf37,KIAA1024,ZFAND6 IMR90 Hi-C 24141950 TMED3 68402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 79735078 79735475 79735257 Y NA NA NA NA NA NA TMED3 133674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 80258107 80258932 80258427 Y MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 2856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA ARNT2 186521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 81082693 81083043 81082764 Y KIAA1199 KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 13009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 81219891 81220152 81220022 Y STARD5 NA NA NA NA NA MESDC2 60067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 81291796 81292315 81292076 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 81316981 81317108 81317017 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 25686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 83603228 83603538 83603384 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 49123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 83683877 83683893 83683890 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 5484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 83712711 83713060 83712967 Y NA C15orf40,BTBD1 C15orf40 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD1 21046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 83847712 83847957 83847821 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 26813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 80180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 84048302 84048583 84048506 Y BNC1 NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 65397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85131508 85131753 85131631 Y PDE8A ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 10464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85361646 85361991 85361963 Y ALPK3 ALPK3 NA NA NA NA ALPK3 3735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 85711891 85712151 85712051 Y NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 190220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85951741 85952026 85951782 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 29939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 86166895 86167159 86167083 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 169102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 87227426 87227675 87227551 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 890485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 89663203 89663358 89663281 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 14368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 89878895 89879173 89879043 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 2803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 90363996 90364798 90364610 Y POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 7363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr15 90365179 90365539 90365285 Y POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 8546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90366635 90367145 90366908 Y NA ANPEP NA NA NA NA ANPEP 10002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90371902 90372049 90371963 Y ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 15269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90419728 90419914 90419806 Y ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 15660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 5294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90578762 90579351 90578884 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 36138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1,TTLL13 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 90938187 90938493 90938325 Y NA ZNF774,IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 8737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 91153046 91153352 91153276 Y NA NA NA NA NA NA CRTC3 81889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 92491615 92492039 92491744 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 96690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1,FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA ASB9P1,FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 94739822 94739990 94739899 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 32777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 94830973 94831315 94831184 Y MCTP2 NA MCTP2,NMUR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 MCTP2 58206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96103160 96103444 96103266 Y NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 763723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96867848 96868085 96868000 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96890448 96891058 96890571 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 5042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 220051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 191210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 186205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99525654 99525915 99525785 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 110505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA NA PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 SYNM 77228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr15 99943673 99944058 99943986 Y NA NA NA NA NA NA MEF2A 71312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99965380 99965718 99965580 Y MEF2A,MEF2A MEF2A LRRC28,MEF2A,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 49652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 99975346 99975780 99975666 Y NA MEF2A LRRC28,LYSMD4,MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 39590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101102236 101102405 101102321 Y NA ASB7,LINS NA NA NA NA ASB7 38334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101253659 101254026 101253922 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 112224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr15 101261253 101261648 101261594 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 119818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr15 101462538 101462736 101462613 Y NA ALDH1A3,LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 5118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101723592 101723961 101723926 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 66176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101790495 101790968 101790609 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr15 102213485 102213850 102213667 Y NA TM2D3,TARSL2 NA NA NA NA TM2D3 22891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 377235 377950 377755 Y SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 22723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 575519 575832 575766 Y NHLRC4 PIGQ NA NA NA NA PIGQ 39163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 643606 643989 643708 Y SSTR5,RAB40C,RAB40C PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 6249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 11551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr16 1344323 1344595 1344461 Y NA UBE2I,BAIAP3 UNKL IMR90 Hi-C 24141950 UBE2I 8953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 1696376 1696557 1696439 Y NA IFT140,CRAMP1L,HN1L NA NA NA NA HN1L 29700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 2065446 2065768 2065545 Y NA TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 RAB26 MCF7 ChIA-PET 22265404 NPW 7519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 2407421 2407607 2407514 Y NA ABCA3 NA NA NA NA ABCA3 18674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA ZG16B 7591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 2904626 2904661 2904644 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS22 1510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr16 2924940 2925188 2925019 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLYWCH2 5999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr16 3512084 3512361 3512129 Y OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1 NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1 NA NA NA NA NAA60 20473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 3889135 3889287 3889211 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 39440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4102835 4103049 4102865 Y CORO7 NA NA NA NA NA ADCY9 61137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr16 4582537 4582680 4582608 Y NA NMRAL1 HMOX2,NMRAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NMRAL1 38773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL SEC14L5,PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC14L5 12588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr16 8950746 8950997 8950816 Y NA CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 9869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 9221431 9221974 9221622 Y USP7,C16orf72 C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 37926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 10549193 10549271 10549232 Y EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 123284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 77653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11012685 11013009 11012730 Y TEKT5,FAM18A,CIITA,CLEC16A DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 21308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11308064 11308220 11308142 Y NA RMI2,SOCS1 SOCS1,CLEC16A,PRM3,PRM2,TNP2,RMI2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 33256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11489659 11490054 11489857 Y NA NA BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 141623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11955170 11955449 11955310 Y NA RSL1D1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 11728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 12541943 12542343 12542144 Y RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 353531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 14281850 14282200 14281986 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 118672 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 14472258 14472411 14472327 Y NA NA PARN,MIR365A,MIR193B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 252174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 15085192 15085402 15085309 Y C16orf45 PDXDC1 NTAN1 IMR90 Hi-C 24141950 PDXDC1 18744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr16 16198084 16198445 16198250 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 156650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19103583 19103758 19103655 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 19496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 16555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19221625 19221975 19221736 Y SMG1,COQ7 SYT17 NA NA NA NA SYT17 44332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19489216 19489473 19489247 Y NA RNU4-46P,GDE1,CCP110 NA NA NA NA RNU4-46P 18459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19714468 19714843 19714656 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 10935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 19822629 19822921 19822772 Y NA NA GPRC5B IMR90 Hi-C 24141950 GPRC5B 72568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 20729381 20729771 20729568 Y LYRM1,DCUN1D3 THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 21635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 20917792 20918142 20917892 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 DNAH3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D3 8086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 20922860 20922979 20922921 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 13154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9 NA NA NA NA METTL9 31348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 22227582 22228085 22227763 Y EEF2K EEF2K NA NA NA NA EEF2K 11979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 22406960 22407340 22407096 Y NA CDR2,RRN3P3 POLR3E,CDR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDR2 39146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 22432961 22433094 22433028 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 13392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 22630276 22630657 22630449 Y NA NA SLC7A5P2,OTOA,CRYM,CRYM-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P3 183240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 24284906 24285056 24284981 Y NA NA NA NA NA NA SNORA1 57812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 25121755 25122029 25121858 Y SLC5A11 LCMT1 NA NA NA NA LCMT1 705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 27149778 27150235 27150058 Y NA NA HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 127880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 28496890 28497119 28497100 Y NA CLN3 NA NA NA NA CLN3 7777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 29319340 29319597 29319480 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A5P1 303364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr16 30713870 30713962 30713916 Y NA FBRS,SRCAP,PHKG2 NA NA NA NA SRCAP 6340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C,CTF1 NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 31005740 31006063 31006002 Y ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4 ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX1B,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 11221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD NA NA NA NA PYCARD 10709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 33952235 33952334 33952272 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 47072084 47072446 47072376 Y DNAJA2 NA ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJA2 66385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 47348245 47348526 47348436 Y NA NA NA NA NA NA PHKB 144508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 49888231 49888307 49888269 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 209545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 52052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 50287533 50287795 50287656 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 102704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 51704772 51704784 51704778 Y LOC388276 HNRNPA1P48 SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 27105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 53075249 53075847 53075790 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 11098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 53947888 53947948 53947918 Y NA NA NA NA NA NA FTO 212013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 56985400 56985562 56985481 Y NA HERPUD1,NLRC5 CETP IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD1 21440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 57294233 57294672 57294611 Y CPNE2,GPR56 ARL2BP,PLLP NA NA NA NA ARL2BP 17223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 57338123 57338348 57338237 Y NA PLLP NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 21524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 65047832 65047877 65047854 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 110138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 65103847 65103999 65103923 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 54016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 65105283 65105525 65105355 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 52490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 66416297 66416567 66416426 Y CDH5 LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 23860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 66440915 66440994 66440955 Y CMTM3,CMTM3 LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 66555983 66556387 66556198 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 28060 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 67011641 67011860 67011695 Y NA FAM96B,CES2,CES3,CES4A,CBFB NA NA NA NA CES4A 8632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 67345616 67346198 67345888 Y RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4 PLEKHG4 NA NA NA NA PLEKHG4 36203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 67689330 67689673 67689514 Y NA RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 3040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 68804487 68804868 68804749 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 35359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 CDH1 NA NA NA NA CDH1 49086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69019845 69020210 69019891 Y NA NA CHTF8,HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 117257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA HAS3,CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 16053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69477830 69478460 69477879 Y NA TERF2,CYB5B NA NA NA NA CYB5B 21402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr16 69603393 69603628 69603450 Y NA NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 6396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 190450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 71828659 71828769 71828714 Y NA SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1 NA NA NA NA AP1G1 12335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 72460868 72461258 72460965 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 334538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr16 74545615 74545910 74545763 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 93102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 74610751 74610842 74610827 Y NA GLG1 NA NA NA NA GLG1 28170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 31619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 75294692 75295061 75294835 Y TERF2IP,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 4890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 75359436 75359702 75359569 Y NA NA BCAR1 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR1 59485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 78876925 78876962 78876944 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 745615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 776970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 80614104 80614217 80614175 Y C16orf61 DYNLRB2 DYNLRB2 IMR90 Hi-C 24141950 DYNLRB2 41473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 80648932 80649251 80648956 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 76301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 81465654 81465943 81465745 Y PLCG2,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 10832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 81503648 81503971 81503709 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 26873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 81649296 81649780 81649593 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 120922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 81650024 81650627 81650533 Y CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 120075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 81666319 81666849 81666608 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 103853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 81855087 81855491 81855343 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 84385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 83960761 83960901 83960832 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA OSGIN1 18986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 84634431 84634711 84634540 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 14972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 85734545 85734806 85734797 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 12866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85751381 85751721 85751674 Y NA GINS2,C16orf74 NA NA NA NA GINS2 29702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr16 86664163 86664323 86664252 Y NA NA FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 77322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 86698129 86698417 86698281 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 111288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 86698644 86698785 86698699 Y FOXL1 NA FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 111803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 86878430 86878569 86878503 Y NA NA FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FOXC2,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 291589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 378017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 398569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr16 87888208 87888468 87888297 Y KLHDC4,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 12626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 88063556 88063600 88063578 Y BANP,BANP,BANP NA NA NA NA NA BANP 82706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 88082514 88082829 88082672 Y NA NA NA NA NA NA BANP 101664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 88448195 88448445 88448286 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 69280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 88474264 88474567 88474378 Y BANP,BANP,BANP,CYBA ZFPM1 BANP,CA5A,ZNF469 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 43158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 88683643 88683946 88683795 Y NA ZC3H18,MVD NA NA NA NA MVD 43623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 88839973 88840262 88840126 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 9357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA NA TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNS 70326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89050259 89050442 89050349 Y CBFA2T3,CBFA2T3 NA NA NA NA NA CTD-2555A7.2 66931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89086731 89086969 89086798 Y NA CTD-2555A7.2 ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2555A7.2 30404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 10.8104906818839 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89382399 89382987 89382651 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ZNF778 100281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89388621 89389157 89388908 Y ZNF276,C16orf7 NA NA NA NA NA ZNF778 106503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 89396771 89397135 89396953 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 114653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89449545 89449691 89449606 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 105278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89488709 89489334 89489046 Y ZNF276,TCF25,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 65635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89568763 89569125 89568979 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPG7 13438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89573610 89573931 89573734 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 18285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr16 89879863 89880236 89880053 Y NA FANCA,SPIRE2 NA NA NA NA FANCA 829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 185919 186143 186025 Y RNMTL1 RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 47902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 505873 506062 505986 Y VPS53 NA NA NA NA NA RPS4XP17 52725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 576455 576740 576580 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 17668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 595370 595681 595607 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 753267 753352 753310 Y NA NA NA NA NA NA GLOD4 69686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 990722 991295 990801 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 92365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 1863470 1863779 1863610 Y SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 NA NA NA NA NA RTN4RL1 62860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 1926930 1927151 1927006 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA RTN4RL1 291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 1970904 1971232 1971070 Y HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 15456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA HIC1 70567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 2040718 2040966 2040824 Y PAFAH1B1,SCARF1,WDR81 NA NA NA NA NA HIC1 85270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2074761 2075171 2074968 Y NA NA NA NA NA NA HIC1 119313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 122591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2143435 2143643 2143533 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 61034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2167377 2167408 2167381 Y NA SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2241529 2241816 2241651 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA TSR1 2728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2397010 2397265 2397138 Y NA METTL16 LOC284009 IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 15920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 3694919 3695190 3695001 Y CTNS,ZZEF1,P2RX1 ITGAE NA NA NA NA ITGAE 7347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4233037 4233303 4233170 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 34620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4386875 4387235 4387089 Y NA SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 12898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 4615866 4616105 4615999 Y MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16,ZMYND15 NA NA NA NA ARRB2 4082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4704497 4704876 4704590 Y ZNF232,KIF1C TM4SF5,VMO1,PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA PLD2 3515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 VMO1,PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4752478 4752731 4752552 Y ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 17795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 5245508 5245890 5245691 Y NA NA NA NA NA NA RABEP1 61950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 NA XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX12P2 98977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 6814987 6815378 6815170 Y DLG4 NA NA NA NA NA ALOX12P2 59807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 6821400 6821836 6821600 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 66220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 67587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 6829755 6829811 6829784 Y NA NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX12P2 74575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13,SLC16A11 NA NA NA NA MIR497HG 4174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 7233457 7233867 7233744 Y WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1 NA NA NA NA NEURL4 2745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 8391640 8392024 8391937 Y NA NA NA NA NA NA RP11-713H12.1 70524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 15363919 15364293 15364237 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 111040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA SNORA74 80954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA NCOR1 69751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 17644687 17645051 17644950 Y TOM1L2,LRRC48,LLGL1 NA NA NA NA NA RAI1 61900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 18084670 18084979 18084825 Y NA ALKBH5,LLGL1 NA NA NA NA ALKBH5 278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 18200436 18200727 18200570 Y SMCR8,TOP3A FLII,TOP3A,SMCR8 NA NA NA NA TOP3A 15594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 18242712 18242812 18242762 Y FBXW10,SHMT1 TOP3A,SMCR8,SHMT1 NA NA NA NA SHMT1 22044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 18825562 18825708 18825647 Y FAM83G,TRIM16L NA NA NA NA NA PRPSAP2 84164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 19834604 19834673 19834639 Y NA AKAP10 NA NA NA NA AKAP10 44983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 20690369 20690534 20690439 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 4411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA KCNJ12 NA NA NA NA KCNJ12 36757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 21515861 21516199 21516031 Y NA C17orf51 CCDC144NL K562 ChIA-PET 22265404 C17orf51 40139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 25571634 25571826 25571715 Y LGALS9,WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 47276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 25571981 25572190 25572120 Y LGALS9,WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 25794670 25794745 25794710 Y NA KSR1 TBC1D3P5,KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 13000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 26929593 26929935 26929764 Y TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119 PIGS,ALDOC,SPAG5,KIAA0100 NA NA NA NA SPAG5 5296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 27918652 27918967 27918817 Y GIT1,EFCAB5,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 28031718 28032050 28032008 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 83793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 28416461 28416826 28416644 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 23713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 28690653 28690812 28690780 Y SSH2,NSRP1,GOSR1,CPD,CPD CPD NSRP1,CPD,GOSR1,BLMH,TMIGD1,SLC6A4 IMR90 Hi-C 24141950 CPD 13111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 29212303 29212381 29212342 Y OMG,NF1,C17orf42 ADAP2,TEFM NA NA NA NA ADAP2 18981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2A NA NA NA NA EVI2A 49870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2A NA NA NA NA EVI2A 9262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 30846365 30846870 30846526 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 34728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 30907001 30907345 30907172 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 95364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 31062983 31063086 31063034 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 139109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 31155018 31155230 31155072 Y MYO1D MYO1D NA NA NA NA MYO1D 46965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 33407531 33407770 33407731 Y NA RFFL,RAD51D NA NA NA NA RFFL 6568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 33414530 33415581 33415167 Y SLFN5,ZNF830,RFFL RFFL,RAD51D NA NA NA NA RFFL 192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 12852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 34400015 34400366 34400057 Y MYO19,C17orf50,C17orf66,CCL5,RDM1,RDM1,LYZL6,LYZL6 NA NA NA NA NA RDM1 144238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 AATF 26018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 35608489 35608691 35608590 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 156218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 36748013 36748410 36748212 Y NA SRCIN1 ARHGAP23 IMR90 Hi-C 24141950 SRCIN1 11773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 36947324 36947688 36947677 Y NA PCGF2,PSMB3,PIP4K2B,CWC25,MIR4727 NA NA NA NA PIP4K2B 6691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 37010933 37011093 37011014 Y FBXO47,C17orf98 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA RPS20P35 1366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 37056956 37057300 37057070 Y NA SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 32844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 37065070 37065230 37065172 Y NA LASP1 NA NA NA NA LASP1 40958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA GSDMB,ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 38085522 38085789 38085697 Y ERBB2,IKZF3,ORMDL3 GSDMB,ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 3668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38254249 38254664 38254597 Y GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38467869 38468243 38468028 Y NA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 4425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38470934 38471197 38471090 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 7490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 38482426 38483282 38482568 Y IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 18982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 38630978 38631299 38631288 Y NA IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA TNS4 24550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38656717 38656888 38656754 Y KRT24,KRT10,TNS4 TNS4 NA NA NA NA TNS4 868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 19029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 38677736 38678132 38678052 Y KRT24,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 21887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39110175 39110404 39110304 Y KRTAP3-2 KRTAP3-2 NA NA NA NA KRTAP3-2 43734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39536188 39536609 39536415 Y NA KRT34 NA NA NA NA KRT34 46 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT15 23430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39656265 39656585 39656468 Y KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37 KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT15 20196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39682585 39682843 39682821 Y JUP,KRTAP4-11,KRT19 KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 25 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 39703664 39703881 39703736 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 21104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 21402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 39782029 39782271 39782148 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16 NA NA NA NA KRT16 11878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39810156 39810822 39810530 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 32315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1,GAST KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA EIF1,GAST KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 40942176 40942529 40942199 Y NA EZH1,VPS25,WNK4,PSME3,BECN1 NA NA NA NA WNK4 11480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL4D 64187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.60349689396131 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 42861642 42861917 42861696 Y NA ADAM11,GJC1 NA NA NA NA ADAM11 27243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 42872286 42872458 42872432 Y FMNL1,GRN ADAM11,GJC1 NA NA NA NA GJC1 33726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43061310 43061333 43061322 Y C1QL1 KIF18B,C1QL1 EFTUD2,CCDC103,GFAP,KIF18B,DCAKD IMR90 Hi-C 24141950 C1QL1 17871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43200086 43200194 43200154 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 7773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43221862 43221955 43221890 Y ACBD4,HEXIM1 ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM1 729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA PLEKHM1 94696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 43886863 43886873 43886868 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 82875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 44135698 44135955 44135827 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 165950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 44213270 44213366 44213318 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 243522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 45144155 45144236 45144196 Y NA NA NPEPPS IMR90 Hi-C 24141950 CDC27 120552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 45775278 45775495 45775446 Y OSBPL7,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 50436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 53430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 45983662 45984115 45983847 Y CDK5RAP3 SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L PNPO IMR90 Hi-C 24141950 SP2 12146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46073519 46073818 46073669 Y NA PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA CDK5RAP3 30343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 46168455 46168716 46168586 Y NA NFE2L1,CBX1,SNX11 NA NA NA NA CBX1 8167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46217226 46217562 46217317 Y CDK5RAP3,SKAP1 CBX1,SNX11 NA NA NA NA SNX11 38507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 46318516 46318700 46318601 Y SKAP1,HOXB4 NA NA NA NA NA SNX11 139797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB6,HOXB9 NA NA NA NA HOXB6 17949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB6,HOXB9 NA NA NA NA HOXB6 17123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB6,HOXB9 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 46823953 46824311 46824136 Y HOXB2,HOXB4,IGF2BP1,PRAC HOXB13,CTD-2377D24.4 NA NA NA NA CTD-2377D24.4 15500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 47017432 47017466 47017449 Y NA ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P NA NA NA NA SNF8 3013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-42P 24911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 47278932 47279253 47279189 Y NA PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 26875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 47585577 47585730 47585714 Y NA NGFR NA NA NA NA NGFR 14922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 47586040 47586243 47586212 Y NA NGFR NA NA NA NA NGFR 15385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 48066634 48067004 48066930 Y NA DLX4,DLX3 NA NA NA NA DLX3 3584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 DLX3,ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 48136569 48136863 48136794 Y NA ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 5237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 48710151 48710394 48710214 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 13 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr17 48716691 48717083 48716761 Y CHAD,SPAG9 ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 48726648 48726741 48726695 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 16510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA RP11-700H6.1 WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 11148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 49027288 49027482 49027366 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 7214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 49142836 49143005 49142922 Y NA NA NA NA NA NA SPAG9 53221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 49182545 49182921 49182907 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 13305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 994723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 53047778 53047982 53047880 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA COX11 3632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 53171922 53172041 53171982 Y NA NA NA NA NA NA COX11 127776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 53510591 53510934 53510743 Y NA MMD MMD,TMEM100,PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 13238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 54367618 54367784 54367724 Y NA NA NA NA NA NA NOG 301276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 54502486 54502858 54502493 Y NA NA NA NA NA NA NOG 166202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr17 54876339 54876519 54876454 Y DGKE DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 32941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 54890834 54891042 54890937 Y NA DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 18418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 54947312 54947763 54947640 Y SCPEP1,TRIM25 DGKE,C17orf67,TRIM25 NA NA NA NA C17orf67 33178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 55477911 55478459 55478198 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 146699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 55501996 55502706 55502262 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 170784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 55952714 55953105 55953007 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 27297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 55978714 55978990 55978831 Y NA NA NA NA NA NA CUEDC1 51694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 55979553 55979719 55979663 Y NA NA NA NA NA NA CUEDC1 50965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56012688 56013140 56012704 Y NA CUEDC1 VEZF1,SRSF1,CUEDC1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 17544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56696420 56696582 56696517 Y NA RNU1-60P,RNU1-108P C17orf47,SEPT4 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-60P 38084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P,RNU1-108P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57512618 57512946 57512830 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YPEL2 105568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr17 57884074 57884248 57884161 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 32379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57904186 57904344 57904253 Y VMP1,CA4 MIR21 NA NA NA NA MIR21 12283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 57908316 57908645 57908515 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 7982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 57932450 57932798 57932624 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 15823 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 16355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 58468371 58468697 58468395 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 29134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 59150035 59150103 59150069 Y BCAS3 NA NA NA NA NA TBX2 325154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 59434096 59434461 59434196 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 40796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 59645902 59646266 59646152 Y NA NACA2 NA NA NA NA NACA2 20297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 59786803 59787088 59786946 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 120240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 60058924 60058941 60058933 Y NA NA NA NA NA NA INTS2 55547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 60649611 60649792 60649701 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MRC2 52970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60745829 60746119 60745974 Y TLK2 MRC2 NA NA NA NA MRC2 43067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 60856273 60856623 60856561 Y EFCAB3 NA NA NA NA NA MRC2 153511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60868052 60868313 60868162 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 165290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60897286 60897580 60897414 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 194524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 60954347 60954674 60954509 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 251585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 60970243 60970809 60970465 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 267481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 61279197 61279372 61279284 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 242367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 61282907 61283291 61283099 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 238448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 61323201 61323584 61323320 Y NA NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 198155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 61356227 61356695 61356586 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 165044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 61357224 61357494 61357377 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 164245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 61431510 61431613 61431567 Y STRADA,ACE NA MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 90126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62093758 62094015 62093997 Y NA C17orf72 NA NA NA NA C17orf72 20047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62154723 62155082 62154942 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 51097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr17 62196117 62196293 62196169 Y NA ERN1,SNORD104 ICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 ERN1 9886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62258830 62259200 62259015 Y SCN4A SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 37387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62409252 62409599 62409468 Y ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62409604 62410133 62409977 Y ICAM2,ERN1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62586168 62586194 62586181 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 69992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 62612826 62613207 62613064 Y NA SMURF2 NA NA NA NA SMURF2 42979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 62773066 62773435 62773116 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM1P 57837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 63019276 63019534 63019390 Y RGS9,GNA13 AMZ2P1,GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 31423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63030127 63030512 63030385 Y NA GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 20445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63035715 63036037 63035950 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 14920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63044063 63044405 63044261 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 6552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63207974 63208314 63208101 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 76425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 523220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 64418368 64418393 64418381 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 121614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 64488395 64488515 64488455 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 191641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64505568 64505880 64505716 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 208814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64518890 64518971 64518949 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 222136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64544411 64544774 64544437 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 247657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64690651 64690854 64690753 Y PRKCA,CACNG4 NA NA NA NA NA CACNG4 268172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 263173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 64714382 64714708 64714545 Y PRKCA NA NA NA NA NA CACNG4 244318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 65130860 65131108 65130984 Y NA NA NA NA NA NA HELZ 108997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 65242250 65242562 65242536 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 2145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 65418011 65418377 65418257 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 46436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 65437128 65437554 65437154 Y HELZ,PITPNC1,BPTF NA NA NA NA NA PITPNC1 65553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 65485462 65485785 65485684 Y HELZ,BPTF NA NA NA NA NA PITPNC1 113887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 65487114 65487504 65487449 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA NA PITPNC1 115539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 65990543 65990874 65990748 Y AMZ2,BPTF,C17orf58 C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA C17orf58 2778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 66231111 66231433 66231269 Y BPTF,SLC16A6 AMZ2,ARSG NA NA NA NA AMZ2 10282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 66326781 66326981 66326881 Y NA SLC16A6 NA NA NA NA SLC16A6 41373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 66818173 66818316 66818245 Y NA NA ABCA8 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA8 131217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 67431803 67432172 67431988 Y NA MAP2K6 NA NA NA NA MAP2K6 22964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 67463547 67463710 67463574 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 54708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 67757945 67758523 67758299 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 349106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 68523657 68524030 68523849 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 360843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 69437254 69437446 69437407 Y NA NA SOX9,LOC100499467,SLC39A11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 177673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70122851 70122907 70122879 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 7690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 70147771 70147892 70147832 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 32610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 70335121 70335458 70335290 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9-AS1 119144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA SOX9-AS1 179740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70398105 70398184 70398145 Y NA NA NA NA NA NA SOX9-AS1 182128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70403681 70403886 70403813 Y SOX9 NA NA NA NA NA SOX9-AS1 187704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA SOX9-AS1 201238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr17 70423161 70423493 70423326 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 197877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70432780 70433062 70433017 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 188308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70464411 70464702 70464656 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 156668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33,LINC00511 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 29822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70680022 70680249 70680147 Y NA LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 45411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 77797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70939903 70940361 70940187 Y SSTR2,C17orf80 NA NA NA NA NA SLC39A11 146490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 70975015 70975329 70975170 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 111522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 71087635 71087942 71087798 Y SLC39A11 SLC39A11 NA NA NA NA SLC39A11 784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 71200352 71200549 71200451 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA COG1 13223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 71603632 71603970 71603800 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 297318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 72247418 72247796 72247504 Y NA RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2 NA NA NA NA TTYH2 39765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 72728741 72729539 72729096 Y KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 13252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 73309965 73310187 73310156 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 3223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73337527 73337917 73337722 Y NA AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 24117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73351805 73351921 73351820 Y NA AC011933.1,GRB2 NA NA NA NA AC011933.1 38395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73369885 73369909 73369897 Y NA GRB2 NA NA NA NA GRB2 29881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73391809 73391943 73391876 Y NA GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA GRB2 7847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73546030 73546166 73546084 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 26869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74067493 74067877 74067630 Y RNF157,FAM100B EVPL,SRP68,EXOC7 NA NA NA NA SRP68 759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 12787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 74213607 74213973 74213891 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 6914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74248222 74248574 74248373 Y ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B ATF4P3,RNF157 RNF157 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF157 13768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 74258854 74259227 74259062 Y ST6GALNAC1 ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 24400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74494294 74494838 74494393 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 1034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74496600 74496786 74496748 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74593355 74593659 74593547 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6 ST6GALNAC2,ST6GALNAC1 ST6GALNAC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ST6GALNAC2 12317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74696685 74696955 74696820 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 8143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 74764385 74764732 74764559 Y NA JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA SRSF2 32929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74837613 74837891 74837804 Y NA MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 24647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 74994156 74994635 74994367 Y SRSF2 NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 86163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75041584 75041844 75041683 Y SEPT9 LINC00338,SEC14L1 MGAT5B,SRSF2,MFSD11,METTL23,SEC14L1,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 38954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75111736 75111750 75111743 Y SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 30938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75112462 75112730 75112694 Y SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 31664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 75118026 75118235 75118074 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 37228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.45137851606985 chr17 75160724 75161106 75160798 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 79926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 75167597 75167895 75167730 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 86799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA NA SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00338,SEC14L1 170636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75278845 75279720 75279369 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 198047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 75359988 75360125 75360083 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 279190 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 307111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 341561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 381004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-80P 409356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr17 76154299 76154669 76154484 Y C17orf99 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID NA NA NA NA SYNGR2 7970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76291015 76291144 76291081 Y NA NA DNAH17,CYTH1,PGS1,SOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS3 63014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76325206 76325964 76325662 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 28194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 76330688 76331173 76330803 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 22985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76379911 76380778 76380428 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 7190 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76384421 76384943 76384751 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 11700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76588219 76588768 76588537 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 187611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76649052 76649341 76649203 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 127038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76801462 76801678 76801575 Y DNAH17,USP36,CYTH1 CYTH1,USP36 NA NA NA NA CYTH1 25083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76813236 76813533 76813481 Y CYTH1,ENGASE,USP36 CYTH1,USP36 NA NA NA NA USP36 21990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 76919844 76920193 76919970 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 15794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 77132825 77133081 77132897 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 63804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 77784894 77785612 77785337 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 11412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 77970749 77971301 77971166 Y CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 36346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78228476 78228940 78228764 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 3725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.49751169119774 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78560725 78560872 78560817 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 44106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78725388 78725609 78725479 Y AATK NA NA NA NA NA RPTOR 208769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78747875 78748340 78748187 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 215058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 78843399 78843729 78843500 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 119669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78864265 78865139 78864341 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 98259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 78901796 78901941 78901869 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 61457 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79011561 79011905 79011851 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 79018501 79018654 79018571 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 11553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79055149 79055334 79055253 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 48201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79128807 79129119 79128972 Y C17orf56 NA NA NA NA NA AZI1 65680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79261011 79261270 79261067 Y NA C17orf89,SLC38A10,LINC00482,TMEM105 NA NA NA NA SLC38A10 6077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10,LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 13779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 15311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 17338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA TMEM105 SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM105 37227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA TMEM105 57934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr17 79363961 79364269 79364114 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 61487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80214734 80215057 80214944 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr17 80292742 80293207 80293087 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 2792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80342594 80342740 80342634 Y NA TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 27471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80508755 80508786 80508770 Y CCDC57,CD7 FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 33166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 126103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr17 80840475 80841074 80840735 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 132535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.22568925803492 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 679559 679568 679564 Y NA TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 23219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 1192820 1193070 1192907 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP72 129016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr18 2548368 2548472 2548420 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 21036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 2888759 2889155 2888912 Y NA NA NA NA NA NA LPIN2 122158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 2978254 2978441 2978377 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 32872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 2981236 2981736 2981487 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2,LPIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 29577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 3490071 3490183 3490142 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 80465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 4453597 4454207 4453941 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 1043991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 5464285 5464628 5464403 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 164071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 5542461 5543034 5542604 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 85665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 5582937 5583209 5583037 Y NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 45490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 6.04115655752337 chr18 6193210 6193559 6193391 Y NA NA NA NA NA NA L3MBTL4 219677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 6922958 6923281 6923120 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP28 195241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 7751060 7751343 7751235 Y NA NA NA NA NA NA PTPRM 186280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 7950764 7950916 7950843 Y NA NA NA NA NA NA PTPRM 385984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 8141224 8141378 8141301 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 466065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 8844710 8845084 8844897 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 237267 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 9017103 9017601 9017310 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 83027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9017601 9018155 9017805 Y NA NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 82473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9375216 9375438 9375327 Y NA TWSG1 NA NA NA NA TWSG1 42451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 9648954 9649088 9649002 Y PPP4R1 PPP4R1 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1 35716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9658069 9658457 9658201 Y PPP4R1 PPP4R1,RAB31 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 44831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 9740164 9740351 9740265 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 34002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9762577 9762794 9762699 Y RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 56415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr18 10290052 10290643 10290400 Y NAPG,VAPA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 233259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 10545349 10545498 10545424 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 21447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12076743 12076871 12076848 Y NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 97719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 12317654 12318000 12317871 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 11986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 12777545 12777688 12777651 Y NA NA NA NA NA NA CEP76 76769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 13219693 13219734 13219713 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 230332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 18515990 18516559 18516297 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 173253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 19279600 19279639 19279620 Y NA ABHD3,MIB1 NA NA NA NA ABHD3 3127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 19373794 19374099 19373861 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 90876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 19457629 19457900 19457765 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 174711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr18 20072671 20072686 20072680 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 303538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21091625 21091887 21091629 Y C18orf8 C18orf8 NA NA NA NA C18orf8 10152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21173695 21174031 21173886 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 8833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29,LAMA3 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA LAMA3 68845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21364980 21365182 21365090 Y NA NA NA NA NA NA LAMA3 97573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21368551 21368843 21368697 Y NA NA NA NA NA NA LAMA3 101144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21415229 21415459 21415332 Y C18orf8,NPC1 NA NA NA NA NA LAMA3 147822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA LAMA3 150248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21440084 21440297 21440180 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 130440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21515812 21516136 21515930 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 54601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 21552370 21552656 21552582 Y C18orf8,TTC39C,TTC39C TTC39C NA NA NA NA TTC39C 18081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21562247 21562750 21562607 Y NA TTC39C TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 TTC39C 7987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21780839 21781231 21781002 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 63897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 21808250 21808465 21808434 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 91308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 22730586 22730811 22730699 Y ZNF521 NA NA NA NA NA ZNF521 199343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 22813900 22814028 22813957 Y ZNF521 NA NA NA NA NA ZNF521 116126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 22828001 22828237 22828119 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 101917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 24581946 24582207 24582077 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 346581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 25536974 25537193 25537082 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 218217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 25691984 25692409 25692174 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 63001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 29080100 29080413 29080257 Y NA DSG2 NA NA NA NA DSG2 4094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 29092491 29092685 29092630 Y DSC3,DSC2,DSG1,DSG2 DSG2 NA NA NA NA DSG2 16485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 29196916 29197276 29197096 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT6 66523 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 29952485 29952862 29952679 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 282667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 32386590 32386868 32386730 Y MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 168024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 32414940 32415436 32415021 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 139456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 32436094 32436130 32436112 Y DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 118762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 32990022 32990156 32990089 Y NA ZNF396 GALNT1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF396 34721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 33038926 33039146 33039052 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 36809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 33040584 33040905 33040747 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 35050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 34107164 34107375 34107280 Y RPRD1A,FHOD3 NA NA NA NA NA FHOD3 231487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 34532943 34533308 34533124 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 125785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 34547272 34547713 34547483 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 140114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 35230475 35230627 35230551 Y CELF4 NA NA NA NA NA TPGS2 823317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 42295257 42295574 42295401 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 37119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 43344062 43344307 43344170 Y NA SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 41970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr18 43351602 43351892 43351629 Y SLC14A1 SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 49510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 43381768 43381900 43381886 Y NA SIGLEC15 EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIGLEC15 21577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 SIGLEC15 NA NA NA NA SIGLEC15 4210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 43543003 43543287 43543010 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 1953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA RNF165 73895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 44370223 44370563 44370393 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 124892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 44386287 44386347 44386318 Y HDHD2 NA NA NA NA NA KATNAL2 109108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 102317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 44487034 44487390 44487355 Y NA KATNAL2,PIAS2 NA NA NA NA KATNAL2 8065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 45353824 45354074 45353943 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 101441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 45541725 45542128 45542097 Y SMAD2,SMAD2 NA NA NA NA NA SMAD2 86210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 46204089 46204193 46204141 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 140672 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 47216686 47217049 47216797 Y NA NA MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 121281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 47250062 47250416 47250239 Y NA NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 87914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 47512458 47512491 47512475 Y NA NA NA NA NA NA ACAA2 174128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 47626417 47626670 47626561 Y MYO5B,MBD1,MBD1 NA NA NA NA NA MYO5B 92793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 4568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 47794579 47794725 47794639 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 3687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 51447036 51447236 51447153 Y STARD6,C18orf54 NA NA NA NA NA MBD2 301922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 51675484 51675804 51675634 Y NA NA NA NA NA NA MBD2 73354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 51736292 51736523 51736417 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 12635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 52274779 52275056 52274934 Y NA NA NA NA NA NA RAB27B 108035 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 52504794 52504822 52504808 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 119917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 52549117 52549282 52549200 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 75457 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 54327448 54327828 54327638 Y NA WDR7,TXNL1 NA NA NA NA TXNL1 10617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 54384245 54384484 54384365 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 67414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 54487568 54487957 54487622 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 170737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55250571 55250884 55250819 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 1120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 55474402 55474444 55474420 Y NA ATP8B1 ATP8B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP8B1 6069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55480522 55480777 55480650 Y NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP8B1 12189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55756032 55756268 55756150 Y NA NEDD4L NA NA NA NA NEDD4L 46433 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55863542 55863917 55863628 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 153943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 55864213 55864707 55864433 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 154614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55872819 55873190 55873005 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 163220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55889534 55890049 55889817 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 179935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr18 55892299 55892691 55892549 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 182700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 55893671 55893850 55893725 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 184072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 55929917 55930363 55930116 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 220318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 55957381 55957780 55957581 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 247782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 56028576 56028863 56028681 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 237000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 56337372 56337558 56337406 Y MALT1 MALT1 NA NA NA NA MALT1 754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 56359373 56359598 56359412 Y NA MALT1 NA NA NA NA MALT1 22755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 56394566 56394962 56394680 Y MALT1 NA NA NA NA NA MALT1 57948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 10091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 56633214 56633485 56633410 Y ZNF532 NA NA NA NA NA ZNF532 105382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 57584956 57585106 57585031 Y PMAIP1 PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 19776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 57585799 57586003 57585903 Y PMAIP1 PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 20619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 59766177 59766307 59766242 Y NA NA NA NA NA NA PIGN 86044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr18 60854025 60854354 60854177 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 131007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 61046049 61046189 61046119 Y NA KDSR,VPS4B NA NA NA NA KDSR 13306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 61121848 61122109 61121956 Y SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5 VPS4B,SERPINB5 NA NA NA NA SERPINB5 19885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 61350519 61350880 61350698 Y SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11 SERPINB3 SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB3 23322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr18 63445505 63445788 63445646 Y CDH7 CDH7 NA NA NA NA CDH7 30017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 65434285 65434424 65434346 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 252068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 67682034 67682164 67682099 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 189017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 68001159 68001386 68001197 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 47022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 68020113 68020138 68020126 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 65976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 70998412 70998732 70998572 Y NA NA NA NA NA NA NETO1 465031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 71010965 71011298 71011132 Y NA NA NA NA NA NA NETO1 477584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr18 72135904 72136231 72136084 Y FBXO15,FBXO15,FAM69C,CNDP1 CNDP2 NA NA NA NA CNDP2 24820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 72452985 72453338 72453047 Y C18orf63 NA NA NA NA NA ZNF407 189879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 72501282 72501640 72501447 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 238176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 72628834 72629114 72629049 Y NA NA NA NA NA NA ZADH2 290189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr18 72706946 72707254 72707048 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 72837213 72837401 72837237 Y NA NA ZNF407 IMR90 Hi-C 24141950 ZADH2 81902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 73201827 73202008 73201925 Y NA NA ZNF407,TSHZ1 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ1 281117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74768655 74769369 74768895 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 236092 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74773141 74773504 74773389 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 240578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 74775208 74775557 74775363 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 242645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74780243 74780707 74780579 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 247680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74814335 74814742 74814712 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 281772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74816269 74816488 74816400 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 283706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 74829789 74830209 74830033 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr18 76740873 76741825 76741734 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 85460 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 76955177 76955415 76955295 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 127892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr18 77483337 77483442 77483373 Y KCNG2 CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 45536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr18 77723013 77723575 77723504 Y HSBP1L1 PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA HSBP1L1 452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2 NA NA NA NA MIER2 33 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 461817 462164 462146 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1 NA NA NA NA SHC2 2821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 532930 533293 533259 Y C19orf6,C19orf22,ARID3A MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG NA NA NA NA CDC34 3216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG NA NA NA NA BSG 4137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 753188 753320 753238 Y C19orf20 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 41755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.02743770501558 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 800594 800755 800691 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA MIR4745 2185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 958944 959162 959060 Y NA R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 22012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1152270 1152379 1152325 Y MIDN SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 19903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 1747200 1747550 1747426 Y PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3 ONECUT3 TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ONECUT3 2822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 1763363 1763749 1763439 Y NA ONECUT3,ATP8B3 NA NA NA NA ONECUT3 12991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2489253 2489454 2489354 Y BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13 LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 15133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 2529574 2529858 2529677 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 55454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 2620825 2621136 2620936 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 79571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 2775891 2776162 2776129 Y NA SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 5207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 3969049 3969183 3969116 Y NA SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA DAPK3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4379386 4379764 4379673 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 18780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 MIR7-3HG,FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 4837640 4837813 4837751 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1,PLIN3 NA NA NA NA TICAM1 7924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 5091674 5091892 5091780 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 124549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5250100 5250567 5250354 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 25178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 5339517 5339797 5339748 Y HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5435162 5435432 5435167 Y NA NA KDM4B,PTPRS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 96348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5578316 5578496 5578453 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 42550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3 NA NA NA NA CAPS 31142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 5966194 5966581 5966386 Y CAPS RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 9572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 5989815 5989915 5989890 Y SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 13662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 6092440 6092966 6092758 Y RFX2 NA NA NA NA NA RFX2 104617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 6273754 6274259 6273940 Y VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 3700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 6518032 6518368 6518308 Y RFX2,CD70,TNFSF9 TUBB4A,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 10642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 6674780 6675150 6675080 Y DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 NA NA NA NA NA C3 53423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 7196747 7197124 7196928 Y KIAA1543,INSR NA NA NA NA NA INSR 94921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 7437354 7437833 7437574 Y ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 20166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 7456079 7456435 7456169 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 1564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 7456481 7456588 7456536 Y LRRC8E,ARHGEF18 ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 1411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 7893818 7893973 7893891 Y NA EVI5L NA NA NA NA EVI5L 699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 8051436 8051456 8051449 Y NA TIMM44,ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 17087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 119941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 30088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr19 9748883 9749171 9749027 Y OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 18808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 9855997 9856274 9856136 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP22 63248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 9974094 9974487 9974263 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 30161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 OLFM2 NA NA NA NA OLFM2 11008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 10529596 10529758 10529677 Y NA TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 17382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10829647 10829946 10829894 Y ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 QTRT1,DNM2 NA NA NA NA DNM2 2892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10862011 10862152 10862080 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 DNM2 NA NA NA NA DNM2 35256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10863039 10863158 10863099 Y NA DNM2 NA NA NA NA DNM2 36284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 10988040 10988081 10988060 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 7851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3 NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 11641329 11641510 11641441 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 3340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 12065633 12065838 12065735 Y NA ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2 NA NA NA NA CTD-2006C1.2 30594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 12245844 12245929 12245887 Y NA ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF20 3293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 12427205 12427564 12427426 Y NA ZNF44,ZNF563,ZNF442 NA NA NA NA ZNF563 14970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 12724614 12724901 12724730 Y ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1 ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15 NA NA NA NA ZNF791 4882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr19 12894545 12895330 12894818 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 4980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 12957682 12957886 12957783 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,HOOK2,DNASE2,GCDH NA NA NA NA MAST1 14917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13006078 13006409 13006086 Y NA HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A NA NA NA NA GCDH 6238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13024998 13025376 13025029 Y NA HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA SYCE2 2714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13123653 13124120 13123822 Y WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 19231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13129050 13129163 13129107 Y MAST1,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 24628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA NA NA NA NA NA NFIX 60225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 59023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 13171487 13171654 13171570 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 54727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13232805 13233031 13232944 Y WDR83,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 5888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13233224 13233603 13233413 Y WDR83,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 6307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13855893 13856042 13855968 Y NA CCDC130,MRI1,C19orf53,ZSWIM4 MRI1,C19orf53 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC130 15319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4,NANOS3 NA NA NA NA NANOS3 26194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NANOS3 NA NA NA NA NANOS3 11491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 NANOS3,CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA NANOS3 1487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 NANOS3,CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA NANOS3 5868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 13995889 13996057 13995977 Y NA NANOS3,CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 18957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 14115648 14116111 14115801 Y CCDC130,ZSWIM4,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA IL27RA NA NA NA NA RFX1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 14172809 14173223 14173004 Y NA IL27RA,EEF1DP1,SAMD1 NA NA NA NA EEF1DP1 5931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr19 14241315 14241555 14241521 Y NA SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA ASF1B 4213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1,PTGER1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 14617819 14618098 14617969 Y IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1 PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 7799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 14636614 14636887 14636775 Y OR7C2 GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA DNAJB1 1695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 14895618 14895793 14895687 Y CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2 EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA AC005255.3 5328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 11290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 15492858 15492952 15492905 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 4249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 UCA1 NA NA NA NA UCA1 9846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 RAB8A NA NA NA NA RAB8A 38598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 RAB8A NA NA NA NA RAB8A 30415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 16453203 16453340 16453316 Y NWD1,MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 16576710 16576784 16576751 Y NA EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 4112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 16706007 16706238 16706123 Y KLF2,MED26 SLC35E1,MED26 NA NA NA NA SLC35E1 24814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 17225282 17225997 17225467 Y SIN3B,CPAMD8 HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 40691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 MAP1S NA NA NA NA MAP1S 36681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18365499 18365609 18365555 Y B3GNT3 PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188 NA NA NA NA PDE4C 1270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 18504645 18504988 18504829 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 21104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18594405 18594611 18594516 Y HOMER3,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 ISYNA1,ELL NA NA NA NA ELL 36326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 18722417 18722765 18722581 Y GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L UBA52,C19orf60,TMEM59L,KLHL26 NA NA NA NA TMEM59L 6177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 19248225 19248392 19248286 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19711724 19712118 19712001 Y RFXANK,GATAD2A,GMIP PBX4,LPAR2,GMIP NA NA NA NA PBX4 15607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 23971294 23971621 23971458 Y NA ZNF681,RPSAP58 NA NA NA NA RPSAP58 27487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 27732067 27732764 27732500 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1969684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 28208615 28209033 28208726 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1493415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 28242746 28243185 28242855 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1459263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 28270762 28271411 28271062 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1431037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 30206961 30207337 30207149 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 2597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 30322162 30322300 30322231 Y C19orf2,C19orf2,POP4,PLEKHF1,C19orf12 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 21357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 31705006 31705320 31705186 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF507 1129180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 31841682 31842327 31842237 Y NA NA NA NA NA NA ZNF507 992173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 33532238 33532582 33532339 Y RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 21212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 34311417 34311691 34311576 Y KCTD15 KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 34724001 34724111 34724046 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 19331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 34746041 34746169 34746166 Y KIAA0355 KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 2599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 35100505 35100815 35100739 Y ZNF302 NA NA NA NA NA AC020910.2 65671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 35453242 35453666 35453504 Y ZNF792 ZNF30,ZNF792,GRAMD1A NA NA NA NA ZNF792 289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD3,FXYD7,FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 36202440 36202452 36202444 Y CD22,FFAR1,NFKBID,ZBTB32,U2AF1L4 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55 NA NA NA NA IGFLR1 28902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 36666444 36666524 36666464 Y NA CAPNS1,ZNF146 NA NA NA NA ZNF146 36980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 37171128 37171323 37171227 Y NA ZNF461,AC074138.3,ZNF567 ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850 IMR90 Hi-C 24141950 AC074138.3 5028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 37262228 37262609 37262419 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 37942009 37942313 37942161 Y ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569 ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 14174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 38482400 38482784 38482644 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 86532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1,SPINT2 NA NA NA NA DPF1 773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 38721338 38721526 38721432 Y NA DPF1,SPINT2 NA NA NA NA DPF1 2984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 38791297 38791661 38791416 Y C19orf33 C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA C19orf33 1140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 39166302 39166492 39166383 Y LGALS7B ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 30013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 39177340 39177518 39177421 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 41051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 39550329 39550402 39550365 Y EID2B,LGALS7,PAPL FBXO27,PAPL SAMD4B,FBXO27,GMFG IMR90 Hi-C 24141950 PAPL 22151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA PRX 5826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 40969437 40969789 40969613 Y BLVRB SERTAD1,SERTAD3 NA NA NA NA BLVRB 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 41803374 41803837 41803699 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 10257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 42239278 42239383 42239331 Y CEACAM7 CEACAM5,CEA,CEACAM6 NA NA NA NA CEACAM6 13502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 42303520 42303673 42303597 Y TGFB1,TMEM91,B9D2,TMEM91,CEACAM21,CEACAM4,ERF,DEDD2,ARHGEF1,CEACAM3 NA NA NA NA NA CEACAM6 50635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42404902 42404963 42404932 Y NA RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 19674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42710307 42710321 42710316 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA POU2F2 11570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA ERF 675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 14986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 17070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF NA NA NA NA ERF 18683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,MEGF8 NA NA NA NA ERF 26778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 43624762 43624964 43624855 Y NA NA PSG5,PSG9 IMR90 Hi-C 24141950 PSG9 146718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PSG9 63866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 43974415 43974832 43974599 Y NA LYPD3,PHLDB3 LYPD3 K562 ChIA-PET 22265404 LYPD3 6603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44179506 44179853 44179716 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 44257292 44257551 44257463 Y NA SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44261449 44261664 44261525 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 4307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44281170 44281414 44281217 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 44294757 44295133 44294844 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 11348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44749585 44749846 44749685 Y LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233 ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF233 2472 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45189303 45189576 45189367 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 PVR NA NA NA NA PVR 44205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA CBLC NA NA NA NA BCL3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3,CBLC NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45279679 45279961 45279836 Y CEACAM19,CBLC,BCAM BCL3,CBLC,BCAM NA NA NA NA CBLC 553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45663964 45664347 45664315 Y NA TRAPPC6A,BLOC1S3 NA NA NA NA TRAPPC6A 15148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L KLC3,ERCC2 NA NA NA NA KLC3 9958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 45931993 45932316 45932152 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 NA NA NA NA PPP1R13L 24386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA PPM1N 2708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 46018095 46018753 46018479 Y GIPR,CLASRP,BLOC1S3,FOSB,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 10258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 46104301 46104701 46104603 Y NOVA2,GPR4 GPR4,OPA3,EML2 NA NA NA NA OPA3 831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 GPR4,OPA3,EML2,GIPR NA NA NA NA EML2 12667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 163936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 46992955 46993234 46993212 Y NA NA NA NA NA NA GAPDHP38 66664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47253619 47253881 47253750 Y NA PRKD2,FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA STRN4 5368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 47531623 47531790 47531707 Y NA TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 18098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 47818553 47819137 47818792 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,DHX34 NA NA NA NA DHX34 31401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 47854917 47855115 47854986 Y ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 4379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA EHD2 62472 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 48625125 48625566 48625247 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 13051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2,LMTK3 NA NA NA NA LMTK3 18067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49046614 49046906 49046677 Y NA LMTK3,SULT2B1 SULT2B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULT2B1 6426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 49482120 49482542 49482303 Y FUT1,C19orf73 DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 12025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49486890 49487028 49486959 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 7539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 49698080 49698342 49698211 Y NA TRPM4 NA NA NA NA TRPM4 39082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 DKKL1,TEAD2 NA NA NA NA DKKL1 30134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 SLC17A7,PIH1D1 NA NA NA NA SLC17A7 19141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 50090402 50090603 50090503 Y NA PRRG2,NOSIP,PRR12 NA NA NA NA NOSIP 916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50231635 50231822 50231729 Y NA CPT1C,AP2A1 NA NA NA NA AP2A1 36403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50362574 50362883 50362717 Y PRRG2,MYH14,PNKP FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1 NA NA NA NA PNKP 6283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 50990086 50990332 50990328 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 12076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 50993276 50993671 50993522 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr19 51003635 51004295 51004006 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 8315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 47334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr19 52075080 52075242 52075159 Y ZNF615,ZNF614,ZNF613,SIGLEC7,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175 ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 2529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 52193633 52193945 52193814 Y ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 94 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53128477 53128840 53128754 Y NA NA NA NA NA NA ZNF83 62909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53425304 53425713 53425359 Y ERVV-1,ZNF320 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 18141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53449736 53449992 53449814 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83 ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 5882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 53660263 53660559 53660411 Y NA ZNF415,ZNF665 NA NA NA NA ZNF347 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 54048513 54048640 54048574 Y NA NA NA NA NA NA ZNF813 79524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 54049099 54049989 54049424 Y ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331 NA NA NA NA NA ZNF813 80110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,AC008753.6,CACNG7 NA NA NA NA AC008753.6 3374 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA CACNG7 54654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM VSTM1 NA NA NA NA VSTM1 41426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 54981954 54982383 54982298 Y NA LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5 NA NA NA NA CDC42EP5 28 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 55582606 55582776 55582718 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA EPS8L1 1218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr19 55721470 55721547 55721521 Y NA PTPRH,PPP6R1 NA NA NA NA PTPRH 2596 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA SSC5D 33439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 29193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56673673 56673939 56673846 Y NA ZNF787,ZNF444 GALP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF444 31705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 88266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56795373 56795512 56795477 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 82240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZSCAN5A 69725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA ZIM2 1047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 57980425 57980680 57980553 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 6258 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 58217187 58217439 58217313 Y NA ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF671 19553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr19 58788473 58788748 58788728 Y NA ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22 NA NA NA NA ZNF8 155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 58911739 58912056 58911822 Y NA A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA SH3YL1 129541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 628526 628919 628630 Y NA TMEM18 FAM150B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 46520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 1590812 1591204 1590899 Y NA AC144450.2 PXDN,MYT1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC144450.2 35987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 18973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 31991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 1661359 1661779 1661556 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 34168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 1676691 1676995 1676843 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 49500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 1679499 1679591 1679561 Y NA NA NA NA NA NA AC144450.2 52308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 1721166 1721471 1721224 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 25153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 20764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 1735614 1736022 1735851 Y PXDN PXDN NA NA NA NA PXDN 10602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 1813532 1813689 1813613 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 66908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 3487019 3487372 3487201 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 34135 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 6998422 6998819 6998665 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 5118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 7082324 7082720 7082522 Y RNF144A RNF144A NA NA NA NA RNF144A 26801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 7100927 7101152 7100993 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 45404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 7913445 7913926 7913614 Y NA NA LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 807996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 7965738 7966104 7965909 Y NA NA LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 755818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 8231020 8231604 8231329 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 490318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 8259720 8260124 8259943 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 461798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 8357542 8357722 8357598 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 364200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 8816590 8817048 8816915 Y NA NA NA NA NA NA ID2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 9427289 9427526 9427454 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 82395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 9922366 9922715 9922451 Y NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 58768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 10231138 10231270 10231204 Y NA RRM2 GRHL1,HPCAL1,NOL10,YWHAQ,RRM2,ODC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRM2 29185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 10425680 10425925 10425803 Y HPCAL1 HPCAL1 HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 15090 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 10441145 10441558 10441458 Y KLF11 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 10501440 10501782 10501611 Y C2orf48 NA NA NA NA NA HPCAL1 60425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 10540655 10540950 10540779 Y KLF11,KLF11,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 45680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 10572027 10572239 10572154 Y NA ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 14391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 10633765 10634017 10633925 Y NOL10 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M2.1 46945 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 10721200 10721506 10721353 Y NA NA NA NA NA NA NOL10 106595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 10984211 10984590 10984279 Y NA PDIA6 C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 8108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11072089 11072388 11072239 Y NA KCNF1 NA NA NA NA KCNF1 22026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11443913 11444199 11444137 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 42257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11547236 11547448 11547321 Y NA NA ROCK2,PQLC3,C2orf50 IMR90 Hi-C 24141950 E2F6 56849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 11838238 11838829 11838549 Y E2F6,LPIN1 LPIN1 GREB1,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 22517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 12460124 12460450 12460316 Y TRIB2 NA LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 394565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 12466136 12466597 12466183 Y TRIB2 NA LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 388418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 12842396 12842661 12842517 Y NA TRIB2 LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 12354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr2 13069256 13069287 13069272 Y NA NA TRIB2,LPIN1,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 214241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 13447993 13448374 13448173 Y NA NA NA NA NA NA TRIB2 592978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 13793212 13793312 13793262 Y NA NA NA NA NA NA TRIB2 938197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 15282327 15282677 15282506 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 416777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 15397207 15397542 15397373 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 301912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 15481171 15481552 15481362 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 217902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 18807557 18807914 18807789 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 67611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 18811449 18811776 18811476 Y NA NA OSR1,NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 71503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 19150904 19151018 19150988 Y NA NA MIR4757,OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSR1 405396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 19340591 19340734 19340664 Y OSR1 NA OSR1,MIR4757 IMR90 Hi-C 24141950 OSR1 215680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 20382454 20382566 20382495 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 40628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 20432677 20432919 20432791 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 9483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 20435780 20436055 20435965 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 12586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 20638245 20638508 20638456 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,GDF7 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 6327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 23643689 23643801 23643697 Y NA KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 37601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA KLHL29 75853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 24122171 24122336 24122254 Y NA ATAD2B,UBXN2A,SDHCP3 NA NA NA NA ATAD2B 25648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 24234264 24234694 24234378 Y MFSD2B MFSD2B,C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA MFSD2B 3313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 24238466 24238799 24238602 Y NA MFSD2B,C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA MFSD2B 7515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 24535588 24535972 24535848 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA RPL36AP13 19409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 25126016 25126204 25126110 Y NA ADCY3 NA NA NA NA ADCY3 14504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A POMC NA NA NA NA POMC 37304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 25514055 25514238 25514170 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 49221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,UQCRHP2,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UQCRHP2 5015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26258152 26258567 26258448 Y RAB10 UQCRHP2,RAB10 NA NA NA NA RAB10 3176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26352135 26352230 26352183 Y NA NA NA NA NA NA RAB10 97159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26567616 26567683 26567653 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA GPR113 2 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 27877424 27877712 27877568 Y NA GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 6626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 28498872 28499304 28499073 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 114011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28583784 28584228 28583975 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 16536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28806831 28807046 28806964 Y FOSL2 NA NA NA NA NA PPP1CB 165460 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 28830984 28831210 28831041 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 141296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28833397 28833696 28833546 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 138810 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 28856660 28856889 28856764 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 115617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B PPP1CB SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 30141215 30141484 30141346 Y ALK ALK NA NA NA NA ALK 948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 30440662 30440911 30440739 Y NA LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 11486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 30887906 30888094 30887998 Y NA NA NA NA NA NA CAPN13 153314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 30889265 30889652 30889547 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CAPN13 151756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 33383509 33383834 33383717 Y FAM98A NA NA NA NA NA LTBP1 213470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 33435749 33436022 33435923 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 223369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 33441691 33441836 33441744 Y LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 217555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 33463216 33463618 33463322 Y RASGRP3 NA NA NA NA NA RASGRP3 195773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 36654413 36654491 36654452 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 73344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 37199283 37199286 37199285 Y NA STRN NA NA NA NA STRN 7668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37497492 37497655 37497574 Y HEATR5B CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 40636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37603882 37604154 37604086 Y QPCT NA NA NA NA NA PRKD3 53931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT NA NA NA NA NA PRKD3 55720 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37617673 37618124 37617783 Y CDC42EP3,EIF2AK2 NA NA NA NA NA PRKD3 67722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 37868257 37868517 37868387 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 95094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 37885188 37885619 37885408 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 77992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 38369402 38369882 38369670 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 34358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 38538303 38538646 38538475 Y NA NA NA NA NA NA ATL2 63781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 38552581 38552739 38552658 Y NA ATL2 NA NA NA NA ATL2 49688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 38949741 38950194 38950072 Y HNRPLL,SRSF7 SRSF7,GEMIN6 NA NA NA NA SRSF7 26442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr2 39683895 39683929 39683912 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 21442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 39695061 39695250 39695144 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 32608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40358852 40359026 40359015 Y SLC8A1 NA NA NA NA NA THUMPD2 354445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40563137 40563534 40563392 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 272659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40662022 40662435 40662315 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 173758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 40853155 40853298 40853196 Y NA SLC8A1 NA NA NA NA SLC8A1 16962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40899157 40899397 40899276 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 62964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40961979 40962343 40962119 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 125786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 40964157 40964324 40964261 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 127964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43269026 43269323 43269208 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43313736 43313941 43313748 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 137807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 43401535 43402035 43401733 Y OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 49713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43434759 43434952 43434875 Y OXER1 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 16796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43440136 43440508 43440361 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 11240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43530162 43530544 43530351 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 78414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43635676 43636063 43635871 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 183928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43647114 43647287 43647224 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 173898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43685237 43685474 43685356 Y NA NA NA NA NA NA THADA 135711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43908548 43908922 43908739 Y PLEKHH2 PLEKHH2 NA NA NA NA PLEKHH2 46136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 43942410 43942694 43942547 Y PLEKHH2 NA NA NA NA NA DYNC2LI1 56484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 43905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 44944979 44944991 44944986 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K21.1 219347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA RP11-89K21.1,AC012354.8 NA NA NA NA RP11-89K21.1 12159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 45237112 45237533 45237325 Y SIX2 AC012354.8,SIX2 NA NA NA NA SIX2 2543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 45411635 45411970 45411804 Y NA NA NA NA NA NA SIX2 177066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 45870946 45871356 45871039 Y NA SRBD1,PRKCE PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCE 5128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 45974142 45974515 45974197 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 97658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 45999486 45999797 45999642 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 123002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46586439 46586863 46586504 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 67633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46636668 46636826 46636747 Y NA NA EPAS1,PRKCE,RHOQ,PIGF,CRIPT IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 117862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46797577 46797967 46797772 Y NA RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF NA NA NA NA ATP6V1E2 29881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 46993562 46993962 46993767 Y NA NA NA NA NA NA SOCS5 69471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 46997897 46997963 46997932 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA SOCS5 73806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47199058 47199402 47199110 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 32064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47214273 47214540 47214407 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 47279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 47284732 47284905 47284823 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 116835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47405225 47405390 47405334 Y NA CALM2 C2orf61 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 3485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 47499706 47499760 47499719 Y C2orf61 NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 70453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 50631357 50631742 50631589 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 1876835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 50951878 50951957 50951935 Y NA NA NA NA NA NA STON1 2197356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 53079014 53079114 53079064 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 913815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 55212013 55212317 55212165 Y CCDC88A NA NA NA NA NA RTN4 125440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 56070301 56070618 56070423 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EFEMP1 78656 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 57861899 57862248 57862095 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 270538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 58049396 58049664 58049530 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 83122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 58271974 58272513 58272036 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 139188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 58336722 58337105 58336916 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 129402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61112067 61112568 61112226 Y REL REL NA NA NA NA REL 5411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA NA NA NA NA NA REL 58707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 62806044 62806443 62806244 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 69015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 62881470 62881867 62881666 Y NA EHBP1 EHBP1,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 EHBP1 17119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 63129477 63129780 63129501 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 145412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64587056 64587400 64587325 Y NA NA AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 91703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64772977 64773339 64773158 Y SLC1A4,AFTPH AFTPH NA NA NA NA AFTPH 23512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 64879615 64879792 64879667 Y SERTAD2 NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64894012 64894430 64894356 Y NA NA SERTAD2,AFTPH K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 81709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64927379 64927577 64927485 Y SLC1A4,RAB1A,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 48562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 65656801 65657217 65657146 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 554 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.33167446079849 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 68428934 68429266 68429100 Y NA WDR92,PNO1 NA NA NA NA PNO1 45958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 68432380 68432395 68432387 Y NA WDR92,PNO1,PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 48974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 69040869 69041120 69040946 Y NA NA NA NA NA NA GKN2 136982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA GKN2 ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 GKN2 42245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 69390293 69390547 69390355 Y ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 151983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 69481133 69481450 69481229 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 130932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 69750715 69750748 69750731 Y NA NA NA NA NA NA NFU1 87955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70160460 70161117 70160745 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 PCBP1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ASPRV1 26280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70173540 70174234 70173890 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 13163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70226911 70227071 70226991 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 39514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70270545 70270983 70270722 Y MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 41602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 70667389 70667575 70667482 Y NA NA NA NA NA NA TGFA 111750 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 71944095 71944430 71944253 Y NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 DYSF 265243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 72849954 72850312 72850133 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 200858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 74258403 74258434 74258418 Y NA AC073046.25,TET3 DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TET3 30563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 74616605 74616668 74616637 Y NA DCTN1,C2orf81,WDR54 NA NA NA NA DCTN1 546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 75090921 75091085 75091029 Y NA HK2 NA NA NA NA HK2 31813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 75103488 75103536 75103515 Y LBX2,HK2 HK2,AC104135.3 NA NA NA NA AC104135.3 39739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA AC104135.3 NA NA NA NA AC104135.3 28489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 80016891 80017267 80017079 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 370994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 80308072 80308323 80308198 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 79938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 81107061 81107275 81107187 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 718800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 85186958 85187334 85187145 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 8882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 85442728 85442944 85442894 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L1 84195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 16040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86120990 86121249 86121122 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 6853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 86121717 86122002 86121863 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 7580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86262986 86263343 86263241 Y GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3 NA NA NA NA NA POLR1A 67935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA SNORD94,IMMT,MRPL35 NA NA NA NA SNORD94 27224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86761300 86761347 86761323 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA RNF103 87642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 86922220 86922584 86922381 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 22712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 88590567 88590888 88590740 Y C2orf51 NA NA NA NA NA THNSL2 122732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 88899554 88899981 88899832 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 25113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 88913679 88914090 88914022 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 11004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 95966425 95966560 95966493 Y NA PROM2,KCNIP3 NA NA NA NA KCNIP3 5373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 14516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 97330891 97331185 97331060 Y TMEM127,ARID5A,KIAA1310 KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 24367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 89408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA VWA3B 121353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 99525863 99526206 99526035 Y C2orf55 NA NA NA NA NA MGAT4A 180274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 100061589 100061940 100061765 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 42557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 101397207 101397582 101397418 Y C2orf29 NPAS2 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 37032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr2 101566889 101567103 101566996 Y NA RPL31 NA NA NA NA RPL31 49074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 101872333 101872649 101872491 Y RNF149 TBC1D8,SNORD89 NA NA NA NA TBC1D8 5005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,SNORD89,RNF149 NA NA NA NA SNORD89 2837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 101922561 101923216 101923063 Y NA SNORD89 NA NA NA NA RNF149 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREG2 131722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 102332970 102333042 102333006 Y MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 21658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 102353138 102353817 102353456 Y IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 41826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 102382879 102383094 102382925 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 71567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 102515032 102515286 102515160 Y IL1R2 NA NA NA NA NA IL1R1 163718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 102549846 102550051 102549852 Y NA NA NA NA NA NA IL1R1 128953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 106374121 106374298 106374210 Y C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 14767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 106444120 106444569 106444380 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 84766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 109506497 109506716 109506551 Y LIMS1,CCDC138,EDAR NA NA NA NA NA CCDC138 105284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 109830137 109830521 109830352 Y RANBP2 NA NA NA NA NA CCDC138 428924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 109859358 109859584 109859496 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 458145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 109872122 109872341 109872247 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 470909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 110097588 110097865 110097829 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 271918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 110871797 110872011 110872000 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr2 111817819 111818113 111817910 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 56842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 111874507 111874890 111874668 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 65 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 111941595 111941939 111941767 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 66640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 112375521 112375561 112375551 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC1 264706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 113380153 113380493 113380323 Y IL1A CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 2409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 113398370 113398650 113398523 Y NA AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 2784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 113448371 113448563 113448450 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 46937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 15948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 113643095 113643585 113643305 Y IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G NA CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1B 50615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 113916006 113916157 113916098 Y IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN NA IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAX8-AS1 50942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 114634434 114634643 114634539 Y NA ACTR3 ACTR3 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 10894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 118309015 118309417 118309218 Y NA NA NA NA NA NA DDX18 260809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 119145172 119145468 119145321 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 203210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 121155649 121155973 121155708 Y INHBB NA LOC84931,INHBB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INHBB 53930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA INHBB 98648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 124260647 124260891 124260797 Y NA NA NA NA NA NA TSN 1767968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 127772292 127772580 127772500 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 90351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 127797908 127797991 127797950 Y GYPC NA NA NA NA NA BIN1 64940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 127975624 127975823 127975720 Y NA NA NA NA NA NA CYP27C1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 128171512 128171657 128171580 Y SFT2D3,IWS1,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 27471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 128375938 128376247 128376093 Y NA NA NA NA NA NA LIMS2 61113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 128587553 128587803 128587688 Y MAP3K2,WDR33 WDR33,POLR2D NA NA NA NA WDR33 20792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 128761594 128761964 128761779 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 21730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 130928401 130928722 130928538 Y NA MZT2B,SMPD4 NA NA NA NA MZT2B 8588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 133319536 133319741 133319639 Y NA NA NA NA NA NA LYPD1 107411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 133561799 133561885 133561850 Y NA NA LYPD1,GPR39 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD1 134647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 133755375 133755495 133755435 Y NA NA NA NA NA NA LYPD1 328223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 134570885 134571181 134570989 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 246851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 141284265 141284563 141284414 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 1602707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 141778689 141779072 141778931 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 1108198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 143611653 143611718 143611684 Y NA NA KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 LRP1B 724383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 143615896 143616223 143616082 Y KYNU NA KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 LRP1B 728626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU NA NA NA NA NA LRP1B 743512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 144155569 144155721 144155633 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 932414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 145287402 145287696 145287537 Y NA ZEB2 ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB2 7255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 145450771 145451350 145451012 Y ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 170624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 147189297 147189317 147189307 Y NA NA NA NA NA NA PABPC1P2 153695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 148094719 148094877 148094798 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 505209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 149416749 149416956 149416876 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 16740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 149571188 149571523 149571357 Y NA NA KIF5C IMR90 Hi-C 24141950 KIF5C 59296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 150999106 150999378 150999253 Y RND3 NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 394147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 151385999 151386295 151386059 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 151477368 151477581 151477492 Y RND3 NA RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 83843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 152971717 152971973 152971845 Y NA NA NA NA NA NA STAM2 58533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 153261807 153262193 153261950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 72056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 153275296 153275683 153275311 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 85545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 153568262 153568351 153568307 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA ARL6IP6 4056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA NA NA NA NA NA AC012501.2 68220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 154442869 154442990 154442930 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 4811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 155569761 155570004 155569789 Y NA NA NA NA NA NA GALNT13 843335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 157147606 157147983 157147795 Y NA NR4A2 NA NA NA NA NR4A2 48877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 NA NA NA NA NA ACVR1 612269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 158325372 158325693 158325539 Y CYTIP NA NA NA NA NA ACVR1 404681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 158549329 158549574 158549452 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 180800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 158673009 158673352 158673181 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 57022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 159581549 159581597 159581577 Y NA NA CCDC148,LOC554201,PKP4,UPP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANC1 241549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 159749466 159749905 159749830 Y NA NA LY75-CD302,TANC1,WDSUB1,BAZ2B IMR90 Hi-C 24141950 TANC1 73241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 160100045 160100277 160100255 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 41033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 160411225 160411529 160411489 Y NA NA NA NA NA NA AC009506.1 58278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161014381 161014772 161014663 Y NA NA NA NA NA NA PLA2R1 97260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB6 61519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 161065805 161066369 161066265 Y CD302 NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB6 60030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 ITGB6 TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB6 27776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 29547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 161177458 161178011 161177649 Y NA NA NA NA NA NA ITGB6 51059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 161277229 161277590 161277411 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 14836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 161991888 161992259 161991958 Y NA TANK NA NA NA NA TANK 469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr2 164501816 164502222 164502220 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 88300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 267758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 165640958 165641192 165641060 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 56997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166161416 166161745 166161474 Y SCN2A,SCN2A NA NA NA NA NA SCN3A 102839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166523404 166523752 166523720 Y NA NA NA NA NA NA GALNT3 125440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3,AC009495.2 NA NA NA NA AC009495.2 21885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166778122 166778316 166778220 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 30037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166796102 166796135 166796119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166821082 166821089 166821086 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 166982475 166982914 166982672 Y SCN1A,SCN1A NA NA NA NA NA TTC21B 174122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 168150182 168150557 168150197 Y NA AC074363.1 NA NA NA NA AC074363.1 2501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 168263159 168263570 168263327 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 115478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 168291941 168292335 168292012 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA AC074363.1 144260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 168366215 168366278 168366264 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 218534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 168633177 168633438 168633308 Y NA NA NA NA NA NA STK39 469213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 168994093 168994243 168994234 Y NA NA NA NA NA NA STK39 108408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 169347640 169347834 169347737 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 37268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 169816441 169816821 169816578 Y ABCB11 SPC25 NA NA NA NA SPC25 48560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 169961196 169961524 169961361 Y NOSTRIN,DHRS9,DHRS9 DHRS9 NA NA NA NA DHRS9 41897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 171997679 171997950 171997833 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 87874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 172101823 172102272 172102041 Y NA TLK1 METTL8,TLK1 IMR90 Hi-C 24141950 TLK1 15999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 172287168 172287529 172287349 Y TLK1 DCAF17,METTL8 NA NA NA NA DCAF17 1198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 172621126 172621511 172621230 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 79207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 173306862 173307108 173306983 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 16780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 173316258 173316587 173316571 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 26176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 173908830 173909139 173908955 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 308409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 173942556 173942831 173942720 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 274717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 173966331 173966790 173966623 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 250758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 135041 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 177419249 177419407 177419328 Y NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01117 81031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 177530948 177531117 177531033 Y NA LINC01117,LINC01116 HOXD-AS1,HOXD1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01116 30289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 179132542 179132630 179132587 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL6 75334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 180044911 180045098 180045020 Y SESTD1 NA NA NA NA NA SESTD1 82419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 180127574 180128171 180127755 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 57 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 180560876 180561013 180560945 Y ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 163219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 181739754 181740031 181739816 Y NA FTH1P20 NA NA NA NA FTH1P20 3613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 181749072 181749389 181749231 Y NA FTH1P20 NA NA NA NA FTH1P20 12931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 182741385 182741846 182741532 Y SSFA2 SSFA2 PPP1R1C IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 12714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 185997791 185998168 185997977 Y NA NA NA NA NA NA ZNF804A 536698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 186638782 186639016 186638929 Y NA FSIP2 NA NA NA NA FSIP2 37427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 186645587 186645801 186645694 Y NA FSIP2 NA NA NA NA FSIP2 44232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 187409105 187409391 187409239 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 187419172 187419512 187419384 Y ITGAV,ITGAV ITGAV NA NA NA NA ITGAV 33280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 188389811 188390126 188390006 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 38361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 188463858 188463880 188463868 Y TFPI TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 189194773 189194794 189194784 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 40377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 189988166 189988248 189988206 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 54357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190025289 190025449 190025364 Y COL3A1 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 17156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 190056615 190056806 190056658 Y NA COL5A2 GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 14010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190067676 190068381 190068047 Y NA COL5A2 GULP1,COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 25071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190073490 190073745 190073639 Y NA COL5A2 COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 30885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190075572 190075716 190075672 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 32967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 190090759 190091067 190090911 Y NA COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 48154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 190215290 190215452 190215408 Y NA NA COL5A2,GULP1,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 88707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190244640 190245037 190244845 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 59122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 190308827 190308942 190308831 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 4668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191030826 191031069 191031046 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 175127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191443312 191443866 191443668 Y NA TMEM194B TMEM194B MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM194B 45864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 191583583 191583867 191583725 Y STAT4,NAB1 NA PMS1,MFSD6,TMEM194B,NAB1,GLS,STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 74111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191706618 191706816 191706674 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 36737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 191706974 191707041 191707034 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 36512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191708638 191708846 191708778 Y STAT4,NAB1,STAT1,GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 34707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 191711355 191711777 191711579 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 31776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 192034233 192034465 192034355 Y MYO1B,MYO1B NA MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 73446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 192082382 192082563 192082473 Y MYO1B,MYO1B MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 25348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYO1B 392614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 454645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 192915570 192915970 192915770 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 807659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 196547563 196547821 196547646 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 108862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 58422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 197420372 197420700 197420626 Y NA HECW2 NA NA NA NA HECW2 35716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 197529863 197529926 197529879 Y NA CCDC150 NA NA NA NA CCDC150 27585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 197779870 197780287 197779995 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 10233 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 197934286 197934620 197934500 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 143766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 198024213 198024664 198024538 Y SF3B1,COQ10B NA NA NA NA NA ATP5G2P3 101171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 198123324 198123674 198123472 Y SF3B1,COQ10B,ANKRD44 ATP5G2P3 NA NA NA NA ATP5G2P3 2161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 198224203 198224295 198224249 Y NA NA PGAP1,ANKRD44 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD44 50306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 198537682 198538053 198537906 Y NA MARS2 NA NA NA NA MARS2 30034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 199532447 199532679 199532564 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 801310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 199736102 199736481 199736292 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 597508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 200328214 200328741 200328463 Y SATB2,SATB2,SATB2 SATB2 NA NA NA NA SATB2 5248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 201172384 201172536 201172446 Y NA SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 3780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 201262818 201262970 201262894 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 94214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201454959 201455229 201455094 Y NA NA NA NA NA NA KCTD18 72452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 201991403 201992374 201991715 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 12576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 202109391 202109622 202109507 Y NA NA NA NA NA NA CASP10 63787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 202296875 202297065 202296939 Y ALS2 STRADB,TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 17237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 203341668 203341778 203341723 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 102009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 203520524 203520862 203520558 Y NA FAM117B NA NA NA NA FAM117B 22623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 205530118 205530314 205530216 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 121602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 206613471 206613845 206613585 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 68757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 208609048 208609450 208609191 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 22837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 210580281 210580584 210580403 Y NA NA NA NA NA NA UNC80 54133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 213770329 213770669 213770422 Y NA NA NA NA NA NA IKZF2 244482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 216216979 216217372 216217176 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 42439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216222058 216222324 216222191 Y FN1 ATIC NA NA NA NA ATIC 47518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 216222811 216223009 216222866 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48271 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216223263 216223304 216223303 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216291390 216291532 216291529 Y FN1 FN1 NA NA NA NA FN1 7363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216393234 216393610 216393392 Y NA NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 FN1 94339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 216402536 216402702 216402564 Y FN1 NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 FN1 103641 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216782951 216783107 216783015 Y NA NA FN1,LOC646324,ATIC,MREG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MREG 113712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 216847055 216847597 216847305 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 49222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 217357637 217357999 217357758 Y NA RPL37A,AC098820.3 RPL37A IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 2913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 218027339 218027548 218027469 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 469091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr2 218258363 218258761 218258688 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 700115 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 219236812 219237028 219236984 Y ARPC2,ARPC2,USP37,TTLL4,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 AC021016.7,CTDSP1 NA NA NA NA AC021016.7 20014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 219676094 219676389 219676199 Y PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1 CYP27A1 NA NA NA NA CYP27A1 31622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 219759139 219759434 219759370 Y WNT6,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 219774108 219774202 219774159 Y USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1 WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 31023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 219972742 219972853 219972823 Y NA IHH LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH IMR90 Hi-C 24141950 IHH 49553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA AC009502.1 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.1 6236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.1 452574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC009502.1 545915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 221484317 221484590 221484474 Y NA NA NA NA NA NA AC009502.1 936800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 222305020 222305156 222305087 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 131766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 222356179 222356366 222356273 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 80556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 223709158 223709348 223709234 Y SGPP2 ACSL3 ACSL3,MOGAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 14304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 223824867 223825201 223825044 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 101215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 224413942 224414282 224414142 Y NA NA NA NA NA NA AP1S3 286462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 224564336 224564481 224564409 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 136263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 224751909 224752110 224752042 Y WDFY1 NA NA NA NA NA AP1S3 51165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 224761528 224761781 224761678 Y WDFY1 WDFY1 NA NA NA NA WDFY1 46323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 224808298 224808709 224808400 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 224951199 224951592 224951399 Y NA SERPINE2 NA NA NA NA SERPINE2 49163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 225010758 225010857 225010808 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 108722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 225749040 225749244 225749203 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 155918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 225875465 225875930 225875836 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 29232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 225880660 225880871 225880768 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 24291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 225892075 225892370 225892223 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 12792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227288071 227288537 227288255 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 239984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 244279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 227448462 227448628 227448535 Y NA NA IRS1,LOC646736,NYAP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 213847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227586845 227587105 227586929 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 75370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 227822351 227822632 227822559 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 124054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 228742760 228743014 228742884 Y WDR69 NA NA NA NA NA CCL20 66202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 229407284 229407450 229407381 Y NA NA NA NA NA NA PID1 726551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 118198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 230274489 230274615 230274507 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 140488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 231636017 231636396 231636213 Y NA BANF1P3 NA NA NA NA BANF1P3 47899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 231658746 231658958 231658902 Y SP140L,SP100,SP100 NA NA NA NA NA ITM2C 68396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA HTR2B,ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232032893 232033210 232033082 Y NA HTR2B,ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 28050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232229850 232230117 232229960 Y NA B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 28137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232485741 232486244 232485851 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 83361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 43843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 46817 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr2 234074569 234074943 234074824 Y NA ATG16L1 NA NA NA NA ATG16L1 41754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 234156397 234156705 234156566 Y INPP5D,DGKD ATG16L1,SCARNA5 NA NA NA NA SCARNA5 25668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 74835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 235198516 235198843 235198584 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 204854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 235542442 235542778 235542606 Y NA NA SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 138745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 88346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 237657869 237658188 237658029 Y NA NA CXCR7 MCF7 ChIA-PET 22265404 IQCA1 243684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IQCA1 271188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 237784498 237784842 237784604 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 207113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238016795 238017153 238016975 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 24335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238292882 238293292 238292932 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 AC112721.2 NA NA NA NA AC112721.2 48173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 AC112721.2 NA NA NA NA AC112721.2 41333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238384383 238384688 238384583 Y LRRFIP1 AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 7383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 238411273 238411418 238411341 Y NA MLPH NA NA NA NA MLPH 19202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 238421741 238422134 238421894 Y MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 29670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 238585463 238585872 238585569 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 51244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238596328 238596696 238596497 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 62109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238779455 238779579 238779499 Y RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 13919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238810877 238811153 238811015 Y NA RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 45341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr2 239593183 239593431 239593307 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 161242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 239870450 239870747 239870599 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 115777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 240207977 240208290 240208163 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 112840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 240321591 240321797 240321685 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA HDAC4 243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 242455386 242455795 242455485 Y NEU4,C2orf85 STK25,BOK NA NA NA NA STK25 8241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr2 242711564 242711834 242711650 Y NEU4,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 39570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 268547 268840 268655 Y NA C20orf96,ZCCHC3,SOX12 NA NA NA NA C20orf96 550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 351057 351207 351131 Y NA SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 8054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 381159 381302 381208 Y NA TRIB3,RBCK1 RBCK1 IMR90 Hi-C 24141950 RBCK1 4840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 519765 520062 519888 Y NA CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 2403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 823028 823308 823133 Y FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 10670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 8932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 4215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 1259137 1259285 1259212 Y C20orf46,C20orf202 SNPH,SDCBP2 NA NA NA NA SNPH 14177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG SDCBP2 NA NA NA NA SDCBP2 2975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 24402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 25126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 25714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1396685 1396983 1396828 Y SDCBP2,SIRPA FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 24879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr20 1548183 1548579 1548480 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,SIRPB2 NA NA NA NA NA SIRPB1 50128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1744868 1745008 1744937 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 128146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1757222 1757297 1757260 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 2851057 2851398 2851292 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 8227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 2978820 2979208 2979015 Y NA MRPS26 NA NA NA NA MRPS26 45383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 3993168 3993585 3993445 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4090299 4090467 4090408 Y SMOX SMOX LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 9160 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 20797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4210249 4210540 4210481 Y ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 17181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4423594 4423998 4423801 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 ADRA1D 195873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 4443344 4443661 4443503 Y NA NA ADRA1D,PRNP IMR90 Hi-C 24141950 ADRA1D 215623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 4444215 4444654 4444345 Y NA NA ADRA1D,PRNP IMR90 Hi-C 24141950 ADRA1D 216494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 4487937 4488131 4488040 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 176751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 4493607 4493844 4493709 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 171038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 4941641 4941708 4941700 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 47231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 5042007 5042186 5042103 Y PRNP,PRNP,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA-AS1,PCNA IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 53068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 5899454 5899753 5899716 Y NA TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 29429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 6015657 6015992 6015825 Y NA CRLS1 NA NA NA NA CRLS1 30921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 6987777 6987996 6987887 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 241466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 9089602 9089856 9089687 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 42192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 9100209 9100421 9100248 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 52799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 9291356 9291748 9291412 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 243946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 9390788 9390859 9390825 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 343378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 9476940 9477296 9477117 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 429530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 10090179 10090302 10090295 Y PAK7 NA NA NA NA NA MKKS 322568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10299398 10299502 10299451 Y MKKS NA NA NA NA NA MKKS 113368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10477280 10477577 10477381 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 64410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10532947 10533172 10533034 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 91842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 10655214 10655688 10655561 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 30200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 11159709 11159935 11159829 Y NA NA JAG1,C20orf94,LOC339593 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 534695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 13035099 13035480 13035216 Y SPTLC3 SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 47472 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 13036502 13036844 13036725 Y NA SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 48875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 13329451 13329858 13329636 Y NA NA TASP1 IMR90 Hi-C 24141950 ISM1 129033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 13678137 13678519 13678328 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 60550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 13705752 13706023 13705888 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 57509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 13734374 13734725 13734663 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 28807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 14500869 14501154 14501002 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 184607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 14697041 14697213 14697128 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 380779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 15282242 15282264 15282251 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 965980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 18683386 18683430 18683408 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 116849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19230107 19230495 19230381 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 505857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19737104 19737460 19737269 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19766218 19766359 19766289 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 29866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr20 19797665 19798070 19797910 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 61313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 19837391 19837690 19837414 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 101039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 124586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 NA NA NA NA NA NAA20 114042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 19889354 19889507 19889429 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 106253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19890524 19890778 19890583 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 104982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 19895665 19896589 19896325 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 99171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19917960 19918777 19918135 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 76983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 19922797 19923187 19922871 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 72573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 19967147 19967464 19967305 Y NA NAA20 NA NA NA NA NAA20 28296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 20586775 20587103 20586803 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 104028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 22555806 22556424 22556290 Y NA LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 22558447 22558719 22558568 Y FOXA2,FOXA2 LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 1167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 24116508 24116689 24116681 Y NA NA NA NA NA NA CST2 311140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25267859 25268242 25268026 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 41154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25299092 25299564 25299289 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 70055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25445422 25445550 25445504 Y ACSS1,ABHD12 NA NA NA NA NA GINS1 59059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 29650599 29650997 29650932 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30148718 30149081 30148825 Y HCK,HM13 HM13,ID1 NA NA NA NA ID1 42005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 30161920 30162316 30162154 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 28770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30260311 30260679 30260495 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 49113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr20 31171182 31171312 31171248 Y DNMT3B,C20orf203 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 31998840 31999088 31998873 Y C20orf185 CDK5RAP1,SNTA1 CDK5RAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK5RAP1 11473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 32623943 32624156 32623948 Y NA RALY,RP5-1125A11.1 NA NA NA NA RP5-1125A11.1 43780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 32783228 32783544 32783386 Y NA NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33236140 33236313 33236227 Y AHCY,TP53INP2,MYH7B PIGU NA NA NA NA PIGU 26597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33491673 33492056 33491689 Y TP53INP2,ACSS2 ACSS2,GGT7,GSS NA NA NA NA GGT7 33010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 33643621 33643805 33643685 Y TP53INP2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 34869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33861234 33861630 33861491 Y NA EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EDEM2 2298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 33899361 33899545 33899443 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 28573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 34093619 34093844 34093641 Y NA ERGIC3 NA NA NA NA ERGIC3 33926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 34384504 34384863 34384702 Y SPAG4,RBM39,SCAND1,PHF20 RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 26608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 34658286 34658599 34658390 Y EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 18827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 35172533 35172668 35172598 Y MYL9 MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2 NA NA NA NA MYL9 4646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 35251667 35252083 35251778 Y NA C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 19530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 35978324 35978819 35978616 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 7236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36007590 36007925 36007762 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 36502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 36008343 36008504 36008424 Y SAMHD1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 37255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 36374070 36374256 36374109 Y NA NA NA NA NA NA CTNNBL1 53662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36542426 36542653 36542463 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 12927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36693519 36693713 36693616 Y RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA RPRD1B 33571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 36796708 36797026 36796907 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 TGM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TGM2 3728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 36831796 36832119 36831958 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 38816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 37685372 37685389 37685381 Y NA NA NA NA NA NA DHX35 96430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 38120202 38120215 38120209 Y NA NA NA NA NA NA DHX35 531260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 39632234 39632572 39632465 Y MAFB,TOP1 RNU2-52P,TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU2-52P 18273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 42137465 42137802 42137552 Y NA L3MBTL1,SGK2 NA NA NA NA L3MBTL1 3145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 43062949 43062981 43062965 Y NA RPL37AP1,TTPAL NA NA NA NA RPL37AP1 30501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43181587 43181787 43181669 Y NA SERINC3,PKIG NA NA NA NA PKIG 23161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43239191 43239604 43239345 Y C20orf111,STK4,ADA ADA NA NA NA NA ADA 39270 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43607893 43608251 43608061 Y NA TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 14778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43767332 43767709 43767669 Y NA PI3 STK4,MATN4,RBPJL IMR90 Hi-C 24141950 PI3 33808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 43972131 43972359 43972259 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 2705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 43974041 43974470 43974334 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 44136889 44137182 44137082 Y NA NA NA NA NA NA PIGT 94172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA DNTTIP1 8072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 45006307 45006609 45006393 Y PCIF1,ZNF335 SLC35C2 NA NA NA NA SLC35C2 15264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 45251611 45251999 45251807 Y NA NA NA NA NA NA TP53RK 64419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 45858819 45859007 45858915 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND8 124560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 20353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 46162026 46162326 46162051 Y NA NCOA3 NA NA NA NA NCOA3 33425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr20 46316176 46316372 46316269 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 96988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 46351193 46351379 46351286 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 61981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46394797 46395044 46394952 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 18316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46417679 46418052 46417809 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 4319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 46419082 46419263 46419121 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 5722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46420724 46421103 46420967 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 7364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr20 46438543 46438763 46438619 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 25183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.49751169119774 chr20 46523491 46523897 46523893 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 110131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46556797 46557054 46556926 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 143437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46618615 46619022 46618889 Y NA NA SULF2,CMTM7,BCAS1 MCF7 ChIA-PET 22265404,19890323 SULF2 205255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr20 47347266 47347566 47347411 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 94854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 47796581 47796870 47796726 Y NA STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 6034 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 48384741 48385230 48384965 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48385312 48385495 48385398 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48416880 48416976 48416956 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 SLC9A8,B4GALT5,KCNB1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 10274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48533898 48534043 48533948 Y B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 3818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48615959 48616196 48616096 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 18423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 48810888 48811172 48811109 Y B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 5512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48875786 48876183 48875986 Y NA RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 5840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48885650 48885800 48885698 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB RP11-290F20.3 PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 3627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 49130261 49130753 49130448 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 5370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 49170357 49170595 49170426 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 45466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49346260 49347200 49346344 Y NA PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 49430215 49430240 49430227 Y PARD6B,BCAS4,ADNP BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 20784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 49943865 49944229 49943998 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 NFATC2 233141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 49963208 49963745 49963374 Y NFATC2 NA KCNG1,ATP9A,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 NFATC2 213625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 199995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA NFATC2 193837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr20 50033542 50033860 50033623 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 143510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50054102 50054305 50054204 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 123065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50059094 50059263 50059179 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 118107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50113765 50113981 50113873 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 63389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50134591 50134950 50134771 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 42420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50141744 50142683 50142582 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 34687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 50145288 50145440 50145335 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 31930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50146423 50146676 50146612 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 30694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr20 50244610 50244912 50244769 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 67240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 70300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.17955608290703 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 75345 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.22568925803492 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 75917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 143970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 50664352 50664405 50664395 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 154442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr20 52196593 52196861 52196746 Y TSHZ2,ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr20 52212842 52213180 52212942 Y ZNF217 ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52238141 52238435 52238216 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 13695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr20 52256215 52256545 52256380 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 31769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52351984 52352361 52352104 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 127538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr20 52392953 52393088 52393021 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 168507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr20 52481702 52482101 52481977 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 257256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52533564 52534521 52533763 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 287865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 52726626 52726868 52726743 Y CYP24A1 NA CYP24A1,DOK5 IMR90 Hi-C 24141950 PFDN4 95518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52738821 52739082 52738998 Y NA NA DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 83304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA NA NA NA NA NA PFDN4 72102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 52784442 52785020 52784595 Y PFDN4 PFDN4 NA NA NA NA PFDN4 37366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 55264382 55264603 55264519 Y NA PTMAP6 BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 9967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr20 55379556 55380011 55379738 Y TFAP2C NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 104986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 56008066 56008273 56008156 Y ZBP1 RBM38 NA NA NA NA RBM38 43603 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 56027077 56027304 56027131 Y NA HMGB1P1 MIR5095 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1P1 34779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 56323662 56324029 56323724 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 39070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 56592321 56592469 56592395 Y PMEPA1,PMEPA1 NA ZBP1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1L 290026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 57186271 57186506 57186395 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 37822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 57579440 57580501 57580194 Y NA ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 57586300 57586427 57586364 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60328357 60328661 60328509 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 310205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60605862 60606121 60605992 Y NA TAF4 NA NA NA NA TAF4 32745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60735261 60735480 60735370 Y NA LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 18439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60914790 60915105 60914838 Y NA ADRM1,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 25263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60935306 60935741 60935523 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 4627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 61001783 61002051 61001918 Y NA RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 21442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 61185365 61185586 61185478 Y DPH3P1,OGFR C20orf166-AS1 NA NA NA NA C20orf166-AS1 38632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA C20orf166-AS1 NA NA NA NA C20orf166-AS1 45872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf166-AS1 54146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 33351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr20 61553883 61554120 61553955 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 13184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr20 61639302 61639436 61639344 Y TCFL5,DIDO1,BHLHE23 NA NA NA NA NA DIDO1 71998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 62085174 62085706 62085468 Y BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2 RP11-358D14.2,KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA RP11-358D14.2 7770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 62170184 62170345 62170251 Y YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195 EEF1A2,PPDPF,PTK6,SRMS NA NA NA NA PTK6 3461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr20 62176586 62176848 62176717 Y NA EEF1A2,PPDPF,PTK6,SRMS NA NA NA NA SRMS 9 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA TNFRSF6B 11796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 62478016 62478296 62478069 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5 NA NA NA NA TPD52L2 16300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr21 10702468 10703121 10702761 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 393859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 11122554 11122900 11122727 Y NA BAGE2 BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 25574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 77534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 14888211 14888445 14888335 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 509297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 16251857 16252256 16251994 Y SAMSN1,NRIP1 AF127936.7 NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AF127936.7 40 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 16345757 16346184 16346094 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 89137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 17054611 17055027 17054700 Y USP25 USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr21 17103695 17103792 17103750 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 3351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 17104761 17105053 17104812 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 4417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 18183865 18184137 18183887 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 528776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 20000884 20000961 20000923 Y NA NA NA NA NA NA AL109763.2 129360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr21 20089064 20089357 20089211 Y NA AL109763.2 NA NA NA NA AL109763.2 40964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 22545026 22545343 22545185 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 176393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 22572618 22572960 22572789 Y NCAM2 NA NA NA NA NA NCAM2 203985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 26701473 26701861 26701653 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 275968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 26735412 26735442 26735427 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 242387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 26745282 26745696 26745293 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 232133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 27082933 27083032 27082983 Y NA GABPA,ATP5J NA NA NA NA GABPA 21849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 27298348 27298650 27298452 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 192364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 27335144 27335525 27335335 Y APP NA NA NA NA NA APP 205921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 27340051 27340173 27340112 Y NA NA NA NA NA NA APP 201273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 28219280 28219541 28219411 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 28300536 28300937 28300780 Y ADAMTS5,ADAMTS1 NA NA NA NA NA ADAMTS1 84808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 29186148 29186441 29186404 Y NA NA LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 970420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 249001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr21 30009367 30009732 30009551 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 245961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 30191610 30191885 30191792 Y C21orf7 NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 63808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30557550 30557806 30557610 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 6586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30567218 30567411 30567380 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 2826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30924978 30925301 30925140 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 360586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 32662959 32662987 32662974 Y NA NA NA NA NA NA TIAM1 267303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 33105563 33105881 33105775 Y SCAF4 SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 3175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 33822696 33822707 33822702 Y C21orf63,C21orf62 NA NA NA NA NA C21orf119 59257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 33836273 33836551 33836412 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 72834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 33853478 33853730 33853567 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 90039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 33896612 33897009 33896807 Y NA NA NA NA NA NA C21orf59 86167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 34020244 34020455 34020360 Y SYNJ1,SYNJ1 C21orf59 NA NA NA NA C21orf59 37068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 34571192 34571326 34571223 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,OLIG2,OLIG1,IFNAR2 IFNAR2 GCFC1-AS1,GCFC1,IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,C21orf54,GART,CRYZL1 IMR90,H1ESC,GM12878,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 28880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 34587985 34588369 34588051 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR2,TMEM50B,IFNGR2 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 11837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 34752926 34753284 34753094 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 19918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 130159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 35863434 35863747 35863591 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 121694 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 35925582 35925949 35925790 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 59492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr21 36167928 36168243 36168166 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 182487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 194238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 234432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36220332 36220721 36220527 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 234891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 235308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 247775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 272470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36281882 36282257 36282001 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 296441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 36326686 36327019 36326981 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 341245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 36342558 36342757 36342568 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 357117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36349860 36350141 36349984 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 364419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 438201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 36458819 36458923 36458887 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN1 473378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37558722 37558993 37558858 Y NA DOPEY2 NA NA NA NA DOPEY2 31642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37670543 37670742 37670650 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 19745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 37695369 37695803 37695437 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 4882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37809570 37809739 37809678 Y MORC3 AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 8912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 37843578 37844008 37843756 Y NA AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 42920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 37850474 37850838 37850572 Y NA AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 49816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38062761 38063015 38062888 Y NA SIM2 CLDN14,HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 6418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38074425 38074708 38074699 Y NA SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 4992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 38151764 38151954 38151859 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 82331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 38189032 38189251 38189142 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 119599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 38349168 38349478 38349323 Y TTC3,DYRK1A,HLCS AP000704.5,HLCS NA NA NA NA HLCS 11058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 38590434 38590491 38590485 Y NA DSCR9,AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA AP001432.14 1229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 38825760 38825986 38825873 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 89668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38839400 38839766 38839583 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 103308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 39649239 39650359 39649644 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 524872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 39696232 39696607 39696353 Y NA NA KCNJ6,DSCR10,KCNJ15,DSCR8 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 478624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 40127775 40128062 40127985 Y NA ETS2 NA NA NA NA ETS2 47169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 40691878 40692008 40691991 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 41003318 41003469 41003395 Y NA C21orf88 NA NA NA NA C21orf88 20570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 41005118 41005297 41005205 Y NA C21orf88 SH3BGR IMR90 Hi-C 24141950 C21orf88 22370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 41146916 41147071 41146994 Y LCA5L NA NA NA NA NA C21orf88 164168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 MIR3197,BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 42598872 42599018 42598944 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 61144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 42610946 42611279 42611113 Y BACE2 NA NA NA NA NA FAM3B 62860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43174806 43174946 43174886 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 10320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43181534 43181711 43181623 Y MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.54364486632563 chr21 43331076 43331447 43331406 Y NA PRDM15,C2CD2 NA NA NA NA PRDM15 33485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43372239 43372638 43372317 Y C2CD2 C2CD2 NA NA NA NA C2CD2 240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43426535 43426580 43426552 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 54536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43518001 43518239 43518148 Y ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 NA NA NA NA NA ABCG1 99560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43944597 43944892 43944856 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 30133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 43952961 43953452 43953160 Y PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 38497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr21 44831891 44832268 44832005 Y SIK1 SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 12740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 3069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44908266 44908370 44908324 Y NA LINC00319,LINC00313 LINC00319,SIK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 LINC00313 10852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 17052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 20588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 39370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 44937921 44938237 44938215 Y NA LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 40507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45198694 45199238 45199184 Y NA CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 4368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.64963006908919 chr21 45237788 45238060 45237872 Y TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3 CSTB,RRP1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 30394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45267315 45267647 45267419 Y NA AGPAT3 AGPAT3,PDXK,CSTB,TRAPPC10,LOC284837 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT3 15420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45358133 45358224 45358178 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC10 71976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45573018 45573302 45573138 Y PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 21531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 45574660 45575436 45575042 Y NA PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 23173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45592447 45593398 45592771 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 PWP2,ICOSLG IMR90 Hi-C 24141950 C21orf33 40960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45604332 45605113 45604833 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG NA ICOSLG,PWP2,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 52845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr21 45614142 45614593 45614385 Y NA ICOSLG AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ICOSLG 44256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr21 45627966 45628150 45628090 Y NA ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 30699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 45640329 45640509 45640452 Y TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG ICOSLG C21orf33 IMR90 Hi-C 24141950 ICOSLG 18340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45663780 45664167 45664129 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 4931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45683777 45683905 45683814 Y KRTAP10-6,KRTAP10-11,KRTAP12-4,KRTAP10-12,KRTAP12-2,KRTAP12-1,KRTAP10-8,DNMT3L,AIRE,AIRE ICOSLG,PFKL NA NA NA NA ICOSLG 24928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 45890728 45891129 45890927 Y NA LRRC3 NA NA NA NA LRRC3 17359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA NA NA NA NA NA LRRC3 70409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 46172768 46173172 46172977 Y NA UBE2G2 NA NA NA NA UBE2G2 46762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 46266361 46266565 46266476 Y ITGB2 UBE2G2,SUMO3,PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 25187 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 46298625 46298957 46298811 Y ITGB2 PTTG1IP PTTG1IP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTTG1IP 6873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 46336832 46337112 46336960 Y NA PTTG1IP,ITGB2,FAM207A NA NA NA NA ITGB2 12792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 46952785 46952947 46952858 Y POFUT2,SLC19A1,SLC19A1 SLC19A1 NA NA NA NA SLC19A1 9378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 47191109 47191365 47191237 Y NA NA LOC100129027,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 129501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47236151 47236483 47236315 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 163168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 47394721 47394936 47394787 Y NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47411286 47411466 47411356 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 11635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47442529 47442669 47442610 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 42878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47469357 47469652 47469491 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 46359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 47480637 47481027 47480832 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 34984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47499343 47499535 47499461 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 16476 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 47543656 47544056 47543951 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 27645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr21 47637534 47637799 47637667 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA LSS 8939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr21 47651317 47651563 47651562 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA MCM3AP-AS1 4186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 NA NA NA NA NA PRMT2 59185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 17697692 17697885 17697853 Y BCL2L13,IL17RA,CECR1 AC005300.5 NA NA NA NA AC005300.5 25866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 18162976 18163469 18163294 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L13 53355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 18251941 18252335 18252187 Y CECR2,BCL2L13,BID,BID BID NA NA NA NA BID 3201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 18258142 18258247 18258197 Y BCL2L13,BID,BID BID NA NA NA NA BID 2606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 19043288 19043502 19043327 Y NA NA NA NA NA NA DGCR2 64465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 19427862 19428165 19428014 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 5059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 GNB1L 34052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 22010846 22011267 22010978 Y YPEL1 YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 6287 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr22 22187099 22187411 22187395 Y PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 32559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 22290676 22291029 22290778 Y MAPK1,PPM1F PPM1F,TOP3B NA NA NA NA PPM1F 14180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 23624437 23624690 23624563 Y BCR NA NA NA NA NA BCR 104546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 24188777 24188988 24188883 Y DERL3 DERL3,SLC2A11,MIF DERL3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC2A11 7902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr22 24470506 24470556 24470531 Y NA NA NA NA NA NA CABIN1 64864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 24603179 24603438 24603254 Y GGT1,ADORA2A SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 27952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 24756229 24756614 24756466 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 91363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 131881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 CRIP1P4 PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP1P4 23434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGSM1 148495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SGSM1 181604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 25390259 25390306 25390285 Y NA NA KIAA1671 MCF7 ChIA-PET 22265404 SGSM1 190023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 25463741 25463900 25463813 Y NA NA NA NA NA NA SGSM1 263505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 25551532 25551738 25551635 Y NA NA NA NA NA NA LRP5L 247606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 26262749 26262880 26262815 Y MYO18B NA NA NA NA NA CRYBB2P1 420677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 27520301 27520693 27520370 Y NA NA NA NA NA NA RP1-40G4P.1 238790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MN1 322457 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 29194018 29194404 29194339 Y NA CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 NA NA NA NA XBP1 181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 29281576 29281858 29281717 Y NA ZNRF3 C22orf31,KREMEN1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF3 3996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 29365910 29365950 29365937 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF3 88330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 29640757 29640993 29640832 Y NA EMID1,EWSR1,RHBDD3 NA NA NA NA EWSR1 21005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1 NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 29730982 29731069 29731026 Y NA GAS2L1 NA NA NA NA GAS2L1 30410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30014203 30014547 30014300 Y NA NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 16658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 20486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 30096148 30096264 30096206 Y NA CABP7 NA NA NA NA CABP7 17809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30440424 30440670 30440589 Y MTMR3,OSM,CCDC157 NA NA NA NA NA MTMR3 163280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 30598549 30598642 30598596 Y LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 42198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30631749 30632163 30631958 Y RNF215,MTFP1,GAL3ST1 LIF NA NA NA NA LIF 8677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 2940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr22 30652191 30652351 30652329 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.81546729948844 chr22 30666798 30667328 30667040 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA GATSL3 16288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31030399 31030736 31030505 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18 NA NA NA NA SLC35E4 760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 31226011 31226350 31226247 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 135934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31229455 31229575 31229536 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 132709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31291343 31291446 31291429 Y SEC14L4,OSBP2 NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 70838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31294163 31294373 31294268 Y OSBP2 NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 67911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 20054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 31692333 31692587 31692466 Y SMTN,RNF185 PIK3IP1,PATZ1,AC005003.1 NA NA NA NA PIK3IP1 5813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 32291389 32291694 32291650 Y RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5 YWHAH NA NA NA NA YWHAH 46753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 32322992 32323244 32323115 Y RFPL2,EIF4ENIF1,EIF4ENIF1,YWHAH YWHAH NA NA NA NA YWHAH 15203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 32737226 32737568 32737481 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 131095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 33091404 33091880 33091552 Y TIMP3,SYN3 NA NA NA NA NA FBXO7 222741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 35772921 35773272 35773050 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 HMOX1 1082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 35983528 35983815 35983759 Y NA RASD2 NA NA NA NA RASD2 48613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr22 35998340 35998679 35998418 Y TOM1,TOM1,HMOX1,APOL6,MB,MB APOL6 NA NA NA NA APOL6 43763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36448788 36448904 36448856 Y NA RBFOX2 RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 RBFOX2 26315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36847830 36847945 36847861 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB RP5-1119A7.14,TXN2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 1046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 36855477 36855678 36855599 Y NA RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 6486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 37624836 37624960 37624904 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,RAC2 NA NA NA NA Z82188.1 4801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 Z82188.1,RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH4 12488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 37669607 37669944 37669799 Y LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,CYTH4 Z82188.1,RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH4 6124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 37681037 37681416 37681291 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 RAC2,CYTH4 NA NA NA NA CYTH4 4969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 37703673 37703847 37703799 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 CYTH4 NA NA NA NA CYTH4 27605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 37731445 37731637 37731610 Y NA NA NA NA NA NA CYTH4 55377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 37897761 37897917 37897872 Y NA MFNG,CARD10 NA NA NA NA CARD10 15632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr22 38292237 38292573 38292408 Y CARD10,SH3BP1,MICALL1 EIF3L,ANKRD54,MICALL1 NA NA NA NA MICALL1 7091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 38330051 38330075 38330063 Y NA MICALL1,POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA POLR2F 16539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 38653163 38653507 38653358 Y NA TMEM184B MAFF IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184B 13533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 38711439 38711868 38711815 Y SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6 TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 44399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 39253318 39253463 39253391 Y KCNJ4,LOC646851 NPTXR,CBX6 NA NA NA NA CBX6 12856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 39462078 39462341 39462224 Y NA APOBEC3G,APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3G 27154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr22 39486366 39486808 39486580 Y LOC646851,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3D,APOBEC3G,APOBEC3H APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3H 4421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr22 39540965 39541288 39541019 Y NA APOBEC3H,CBX7 NA NA NA NA CBX7 5391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 39608827 39609203 39608881 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 29553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr22 39673318 39673703 39673519 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 34562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 40573139 40573276 40573210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 72069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 40832612 40832827 40832769 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 68017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 40885973 40886127 40886071 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 121378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 42527695 42528060 42527840 Y CYP2D6 NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA OLA1P1 24738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 42840483 42840921 42840577 Y SEPT3 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 8454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 43076677 43076928 43076817 Y NFAM1,ARFGAP3 CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA CYB5R3 33103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 50501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr22 43795472 43795645 43795562 Y NA NA SCUBE1,EFCAB6,SULT4A1,MPPED1 IMR90 Hi-C 24141950 Z99756.1 125511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 44541394 44541995 44541679 Y NA NA NA NA NA NA PARVB 148303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 44730251 44730590 44730516 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1L 161588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 44731310 44731638 44731630 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1L 160540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 44756999 44757252 44757125 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 44947082 44947372 44947286 Y PARVG,PARVG NA PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 54904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,UPK3A,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 UPK3A 13649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 46330758 46331082 46331012 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 39927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 46970983 46971382 46971054 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 1074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 47173530 47173804 47173706 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A NA NA NA NA TBC1D22A 17012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 47487256 47487562 47487389 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 330738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr22 48184441 48184585 48184513 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 159018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 160536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50248429 50248807 50248623 Y TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4 BRD1,ZBED4 NA NA NA NA ZBED4 2939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50273824 50274276 50274235 Y TUBGCP6,HDAC10,ZBED4 ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 28334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50330725 50331030 50330945 Y MAPK12,MAPK11 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 20619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50344780 50345228 50344944 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 6933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50590886 50591023 50590963 Y MIOX,CPT1B,C22orf41,MOV10L1,MOV10L1 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 16137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 50629840 50630128 50630062 Y BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA SELO 7280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50680113 50680250 50680180 Y SELO SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 1171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 50815545 50815813 50815668 Y MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 35812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 4870806 4870892 4870849 Y NA NA NA NA NA NA EGOT 79532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA EGOT 80232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 4885679 4886087 4885777 Y NA NA NA NA NA NA EGOT 94405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 4892426 4892911 4892721 Y BHLHE40 NA NA NA NA NA EGOT 101152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5030402 5030899 5030722 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 10756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5031774 5032131 5032047 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 12128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5035978 5036317 5036132 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5036570 5037120 5036867 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 5058332 5058543 5058409 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 38686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5063521 5063694 5063575 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 43875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 5145575 5145674 5145603 Y NA ARL8B ITPR1,EGOT IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 16231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 7761541 7761882 7761712 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 779511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 8540908 8541201 8541046 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 8544131 8544195 8544133 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 2738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 8781836 8782151 8782020 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 27163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 8783302 8783537 8783436 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 25777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 9050336 9050687 9050476 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 46879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 9165522 9165918 9165724 Y LHFPL4,SRGAP3 NA NA NA NA NA RAD18 162065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 9344109 9344331 9344220 Y NA NA RAD18,SRGAP3,C3orf32,CAV3,OXTR IMR90 Hi-C 24141950 THUMPD3 58195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 9749509 9749829 9749669 Y NA BRPF1,OGG1 NA NA NA NA BRPF1 21584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 9926228 9926446 9926367 Y LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1 IL17RE,IL17RC,JAGN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 JAGN1 3792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 10228924 10229327 10229283 Y VHL,IRAK2,TATDN2 VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 24375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 10265421 10265646 10265492 Y BRPF1,VHL,IRAK2,TATDN2,GHRL TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 22061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 10593561 10593984 10593868 Y NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 232699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11187629 11187920 11187792 Y HRH1 HRH1 NA NA NA NA HRH1 10850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11230556 11230841 11230699 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 53777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11279893 11280094 11280011 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 31901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 11314967 11316155 11315793 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 2972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11332891 11333370 11333202 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 20896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 12350153 12350305 12350183 Y NA PPARG NA NA NA NA PPARG 23286 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 12386663 12386813 12386738 Y PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 59796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 12395386 12395555 12395486 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 68519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 12398616 12399008 12398699 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 71749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 12512871 12513125 12512991 Y PPARG,PPARG TSEN2 PPARG,TSEN2,SYN2,TIMP4 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN2 10806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 12567743 12567843 12567793 Y NA TSEN2,MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 28670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 12621651 12621927 12621686 Y RPL32 MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 25138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 12688995 12689498 12689361 Y RAF1 RAF1 NA NA NA NA RAF1 14227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 12972627 12972739 12972683 Y NA NA NA NA NA NA RPL32 91540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 13042124 13042470 13042313 Y RAF1 NA NA NA NA NA IQSEC1 70147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 13062449 13062850 13062655 Y RPL32,NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 49767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 13152253 13152557 13152379 Y NUP210,IQSEC1 IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 39636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr3 13153064 13153212 13153138 Y RPL32,IQSEC1 IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 40447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr3 13526767 13526807 13526787 Y NA HDAC11,HDAC11-AS1 NA NA NA NA HDAC11-AS1 7214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 13877889 13878107 13877998 Y NA WNT7A NA NA NA NA WNT7A 41511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 13884272 13884624 13884569 Y WNT7A WNT7A NA NA NA NA WNT7A 34994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 13920516 13920583 13920566 Y WNT7A WNT7A NA NA NA NA WNT7A 898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA WNT7A,TPRXL C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7A 17231 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43,AC093495.4 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 14483107 14483358 14483285 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 41031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 14797683 14797698 14797691 Y NA NA NA NA NA NA C3orf20 83077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 14848047 14848355 14848186 Y SLC6A6 NA NA NA NA NA C3orf20 133441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 15675662 15676068 15675826 Y NA BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 34324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 15695837 15696119 15696028 Y HACL1 NA NA NA NA NA HACL1 54499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 15702831 15703150 15702848 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 61493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 16381472 16381685 16381579 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 76766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 17020237 17020570 17020404 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 178078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17204205 17204233 17204219 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 362046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 664422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 700704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 701153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 17661435 17661830 17661633 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 819276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 18415394 18415659 18415606 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 68650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 95162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 20082717 20083237 20083200 Y RAB5A,KAT2B KAT2B NA NA NA NA KAT2B 3202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 21722785 21723001 21722895 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 689811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 21755607 21755966 21755787 Y ZNF385D NA NA NA NA NA ZNF385D 656846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 21898256 21898481 21898369 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 514331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 23127365 23127541 23127536 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 114970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 23709947 23710120 23710034 Y UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 135274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 23782023 23782329 23782145 Y NR1D2,UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 63065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 23787915 23788432 23788117 Y UBE2E1 NA UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 56962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 23991964 23992189 23991965 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA NKIRAS1 5882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 24197996 24198283 24198140 Y NA NA NA NA NA NA NKIRAS1 211914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 24340917 24341295 24341106 Y NA NA NA NA NA NA THRB 193478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 24370369 24370393 24370381 Y NA NA NA NA NA NA THRB 164380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA AC098614.2,EOMES NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 42894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 27984483 27984771 27984759 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA EOMES 222277 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 28367464 28367703 28367584 Y NA AZI2,ZCWPW2 NA NA NA NA AZI2 20915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29531228 29531586 29531407 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 210755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 248197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 404564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 30723230 30723490 30723363 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 77236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 31055934 31056092 31056013 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 409940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 32426467 32426762 32426639 Y NA CMTM7 CMTM7 IMR90 Hi-C 24141950 CMTM7 4401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 32453477 32453643 32453560 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 22314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 32463504 32463726 32463567 Y CMTM6 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 32341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 32499535 32499861 32499683 Y CCR4,CMTM7 CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 43039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 32557705 32558097 32557882 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 14805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 33060795 33061128 33060939 Y CCR4 SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 12227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 33063733 33064078 33063817 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 9277 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 33554713 33555077 33554895 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 73850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 33639579 33639904 33639592 Y CLASP2 NA NA NA NA NA CLASP2 117944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 34811902 34812223 34812063 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 974058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 35701081 35701743 35701437 Y ARPP21 NA NA NA NA NA STAC 718093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 36999426 36999810 36999630 Y LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 TRANK1,EPM2AIP1,MLH1 EPM2AIP1,MLH1 K562 ChIA-PET 22265404 TRANK1 14878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 37519285 37519417 37519356 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC097359.1 235599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 38046580 38046956 38046768 Y SLC22A14 PLCD1 NA NA NA NA PLCD1 22297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 38195534 38195789 38195689 Y VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 OXSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OXSR1 8791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 38207945 38208258 38208101 Y VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 3365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 38209266 38209592 38209336 Y VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 4686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 38216296 38216490 38216393 Y NA ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 11716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 42113196 42113588 42113376 Y CCK NA NA NA NA NA TRAK1 59902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 42237448 42237989 42237678 Y NA NA NA NA NA NA TRAK1 184154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 42518371 42518582 42518469 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 9239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 42922564 42922793 42922612 Y C3orf39 NA NA NA NA NA KRBOX1 73589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 43220536 43220835 43220673 Y CCDC13 NA SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 105169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 43221606 43221805 43221773 Y CCDC13,SNRK NA SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 104199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 43368782 43368949 43368860 Y NA SNRK NA NA NA NA SNRK 42778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 43913925 43914045 43914001 Y ANO10 NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 182839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3,CLEC3B NA NA NA NA CLEC3B 5163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CLEC3B 65233 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45140818 45140977 45140897 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 44937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45147419 45147607 45147508 Y TMEM158,CDCP1 CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 38307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 45161726 45162069 45161866 Y TMEM158 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 23845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45164613 45164770 45164669 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 21144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 45673092 45673584 45673283 Y NA NA NA NA NA NA SACM1L 54964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 45913452 45913513 45913481 Y CCR9 LZTFL1 CCR9,CCR2,SLC6A20,LZTFL1,LARS2,CLEC3B,CCR5 IMR90 Hi-C 24141950 LZTFL1 42021 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 46445679 46445962 46445725 Y CCR1,PRSS45,CCR5,CCRL2,CCRL2 RP11-24F11.2,CCRL2 CCRL2,CCR5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-24F11.2 588 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr3 46704560 46704953 46704713 Y NA ALS2CL NA NA NA NA ALS2CL 28241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 46988775 46989017 46988932 Y SETD2,KLHL18,KIF9,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 30156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 46995135 46995433 46995392 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 23740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47004561 47004925 47004746 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 14248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47078393 47078462 47078449 Y NA NA NA NA NA NA CCDC12 56893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47120016 47120037 47120026 Y SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12 NA NA NA NA NA SETD2 83420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47134411 47134793 47134602 Y SETD2 NA NA NA NA NA SETD2 68664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47204029 47204492 47204291 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA KIF9-AS1 42 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 48779728 48779922 48779796 Y TREX1,DALRD3,ARIH2 IP6K2 NA NA NA NA IP6K2 3942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 49425171 49425361 49425266 Y ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7 USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1 NA NA NA NA TCTA 22278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 49696171 49696492 49696217 Y NA APEH,RNF123,MST1 APEH,MST1,RNF123 IMR90 Hi-C 24141950 APEH 12943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,CAMKV,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3 NA NA NA NA RP11-493K19.3 3192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3 NA NA NA NA RP11-493K19.3 10083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr3 50204265 50204566 50204413 Y HYAL2 SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3 NA NA NA NA RP11-493K19.3 12747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 50204844 50205012 50204945 Y NA SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3 NA NA NA NA RP11-493K19.3 13326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 50628296 50628501 50628442 Y RASSF1,RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 50629910 50630235 50630098 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 16716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 50657930 50658131 50658036 Y GNAI2,GNAI2,RASSF1,RASSF1,CYB561D2,MAPKAPK3 MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA CISH 10668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 51062777 51063032 51062936 Y VPRBP,RBM15B NA NA NA NA NA DOCK3 352105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 51728520 51728585 51728552 Y NA TEX264,GRM2 NA NA NA NA GRM2 10501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 52503087 52503472 52503331 Y ABHD14B,NISCH SEMA3G,TNNC1,NISCH NA NA NA NA NISCH 15953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 53107324 53107487 53107433 Y TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 53360286 53360418 53360351 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 19236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 157228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 56416908 56417062 56416985 Y ERC2 NA NA NA NA NA ERC2 83329 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 56814931 56815295 56815113 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 99666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 56925207 56925322 56925265 Y NA NA NA NA NA NA SPATA12 167147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57051619 57051945 57051783 Y NA SPATA12 NA NA NA NA SPATA12 40524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 57564978 57565360 57565163 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 16587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57779621 57779638 57779630 Y FAM116A,SLMAP SLMAP NA NA NA NA SLMAP 40444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57874517 57874643 57874579 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 117484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 57958534 57958833 57958768 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 33294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.64963006908919 chr3 57963451 57963815 57963633 Y NA FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 28312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 57964155 57964263 57964209 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 27864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 58159699 58160034 58159862 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 61199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 58162589 58162663 58162637 Y KCTD6 NA NA NA NA NA ABHD6 58570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 58164078 58164222 58164150 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 58168035 58168365 58168200 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 52868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 58336517 58336871 58336595 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 58859909 58860302 58860288 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 173508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 58984210 58984527 58984399 Y NA C3orf67 NA NA NA NA C3orf67 49283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 59579572 59579902 59579705 Y NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 545762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60013358 60013756 60013558 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 979548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60067500 60067675 60067588 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 1033690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60131975 60132178 60132077 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 1098165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60501466 60501824 60501659 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 733309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 60804439 60804744 60804592 Y FHIT NA NA NA NA NA FHIT 430389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7 NA NA NA NA THOC7 695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 65909802 65910182 65909992 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 112327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 65939140 65939412 65939262 Y MAGI1 NA NA NA NA NA MAGI1 83097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 67050514 67050733 67050633 Y KBTBD8 KBTBD8 NA NA NA NA KBTBD8 3787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 67455058 67455415 67455236 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 247623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 67512199 67512308 67512254 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 190730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 68954073 68954327 68954200 Y NA NA NA NA NA NA TMF1 145157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 69797197 69797346 69797210 Y NA MITF NA NA NA NA MITF 10611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 70905629 70905860 70905775 Y NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 725280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 71031841 71032211 71032107 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 598929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71080443 71080735 71080627 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 550405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71116020 71116294 71116249 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 514846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71136796 71137147 71137136 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 71298409 71298581 71298470 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 332559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 71553174 71553740 71553492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 77400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 71628462 71628802 71628743 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 2338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 72445751 72445968 72445860 Y NA RYBP NA NA NA NA RYBP 48101 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 72536556 72536893 72536709 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 42487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 72871393 72871600 72871481 Y RYBP,PPP4R2 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 37465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 76577806 76578430 76578088 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 96637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 76583087 76583286 76583187 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 101918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 79013956 79013976 79013966 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 800989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 80239226 80239506 80239338 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 424261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 816026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 11.3404166957018 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr3 81522183 81522529 81522356 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 286783 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 85071263 85071596 85071400 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 65131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 85158641 85158936 85158716 Y CADM2 NA NA NA NA NA CADM2 152509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 194997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 87382490 87382853 87382616 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 108069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 93945004 93945149 93945097 Y NA NA NA NA NA NA DHFRL1 164771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr3 96786728 96787034 96786881 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 255303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 98449231 98449446 98449340 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA CPOX 138664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 98483541 98483706 98483644 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 134827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 108948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 98528830 98529143 98529110 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 89390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2,CTD-2021J15.1 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 CTD-2021J15.1 5909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 98681428 98681771 98681644 Y DCBLD2 LINC00973 MIR548G,COL8A1,DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 16131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99201113 99201346 99201253 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 153973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 99381280 99381540 99381410 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 25961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99555247 99555560 99555404 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 199928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99570772 99571127 99571120 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 215453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 223910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99581173 99581391 99581282 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 225854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 228974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99614794 99615242 99614937 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA COL8A1 259475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 264726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99646991 99647087 99647049 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 291672 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99724570 99724720 99724642 Y TBC1D23 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 253124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 226512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 216538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 99766371 99766625 99766459 Y NA NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 211219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 99909937 99910189 99910085 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 67655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 100492916 100493238 100493125 Y NA NA NA NA NA NA TFG 66711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101109184 101109394 101109269 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 120691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 101592355 101592794 101592687 Y NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 47520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 101598094 101598345 101598104 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 101598551 101599071 101598955 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 101620912 101621401 101621096 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 76077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101637736 101637924 101637829 Y FAM55C NA NA NA NA NA NFKBIZ 92901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101645465 101645839 101645546 Y NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 100630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr3 101657359 101657748 101657478 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 112524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101739616 101740068 101739897 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA FAM55C,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 194781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101745622 101745695 101745682 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA FAM55C,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 200787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101843193 101843415 101843276 Y ZPLD1 NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 298358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 101899188 101899342 101899284 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 354353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 104014158 104014524 104014365 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1069229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.22568925803492 chr3 104241726 104241855 104241791 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 841898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 105316935 105317233 105317084 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 233182 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 105416337 105416655 105416542 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 169741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 105486064 105486421 105486242 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 99975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 105716646 105717231 105716913 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 130250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 106054492 106054583 106054538 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 468096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 106839867 106840135 106840037 Y NA NA NA NA NA NA LINC00883 117404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107085712 107085944 107085942 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 128173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107376610 107376921 107376801 Y NA NA NA NA NA NA BBX 136827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107657296 107657394 107657308 Y CD47 NA NA NA NA NA CD47 150478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107661188 107661414 107661285 Y CD47 NA NA NA NA NA CD47 146458 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107707360 107707957 107707585 Y CD47 NA MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 99915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 107850030 107850463 107850156 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 42158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 110545896 110546080 110545988 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 240838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111326248 111326357 111326303 Y CD96,ZBED2 ZBED2 NA NA NA NA ZBED2 13958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111420857 111420932 111420895 Y NA PLCXD2,PHLDB2 PHLDB2,CD96,ABHD10 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 28412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111481970 111482358 111482172 Y PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 32626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 8077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111834106 111834381 111834309 Y BTLA,C3orf52,GCET2 C3orf52 NA NA NA NA C3orf52 30924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 111866338 111866609 111866454 Y NA NA NA NA NA NA C3orf52 63156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 112165241 112165518 112165388 Y CD200 NA NA NA NA NA SLC35A5 113038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 113293012 113293390 113293190 Y SPICE1,SIDT1 SIDT1 NA NA NA NA SIDT1 43869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 113416036 113416177 113416128 Y SIDT1 KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NA NA NA NA KIAA2018 2543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 114287427 114287687 114287530 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 513967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 114373701 114374062 114373901 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 490056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 114724447 114724794 114724621 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 139324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 638640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 115558428 115558819 115558693 Y GAP43 NA NA NA NA NA ZBTB20 694310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 115918215 115918449 115918332 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 825096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 117441288 117441601 117441524 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 272494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 118900816 118900962 118900889 Y UPK1B,B4GALT4 NA NA NA NA NA B4GALT4 56988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119042640 119043071 119042746 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH ARHGAP31,ARHGAP31-AS1 NA NA NA NA ARHGAP31-AS1 3033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119068324 119068683 119068464 Y NA ARHGAP31-AS1 NA NA NA NA ARHGAP31-AS1 28717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119142297 119142580 119142348 Y ARHGAP31,NR1I2,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 43097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119202050 119202231 119202120 Y NA TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 13148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 119274077 119274607 119274276 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH ADPRH,PLA1A NA NA NA NA ADPRH 21508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119436291 119436418 119436355 Y C3orf15,NR1I2 COX17 NA NA NA NA COX17 41990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 119758013 119758347 119758179 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 52917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119864415 119864682 119864534 Y COX17,GSK3B NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 52673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 119876721 119876867 119876800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 64979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 121149194 121149225 121149210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP11 61732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 121450275 121450346 121450335 Y NA GOLGB1 NA NA NA NA GOLGB1 16256 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 121783086 121783706 121783373 Y HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86 ILDR1 NA NA NA NA ILDR1 44035 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 122467278 122467457 122467368 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 43214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123508502 123508917 123508819 Y NA NA NA NA NA NA MYLK 92261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123511285 123511578 123511394 Y NA NA NA NA NA NA MYLK 89600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123511748 123512001 123511875 Y NA NA NA NA NA NA MYLK 89177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123756806 123757178 123756992 Y NA NA KALRN,CCDC14 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 78242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 123824591 123825032 123824690 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 146027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 124605050 124605342 124605178 Y ITGB5 ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 12923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 124874501 124874828 124874663 Y NA NA NA NA NA NA HEG1 101699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 125053590 125053890 125053754 Y NA NA NA NA NA NA SNX4 183151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA CHCHD6 209278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 369236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127266508 127266786 127266647 Y KBTBD12 MCM2,TPRA1 CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 48280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 127453672 127453937 127453742 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 63894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 127544672 127545057 127544806 Y NA MGLL NA NA NA NA MGLL 4621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 127632728 127633069 127632897 Y KBTBD12 NA KBTBD12,MCM2,PODXL2,ABTB1,MGLL,SEC61A1 IMR90 Hi-C 24141950 MGLL 92677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 128054461 128054660 128054529 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475N22.4 151395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 128838520 128838686 128838629 Y MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 128945338 128945482 128945420 Y MBD4,ISY1,CNBP CNBP KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 44573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 129436791 129437287 129437073 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 113130 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 129486149 129486279 129486214 Y NA NA NA NA NA NA TMCC1 124140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 129519745 129520139 129519943 Y H1FOO NA NA NA NA NA TMCC1 90280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 130073130 130073578 130073320 Y ATP2C1 NA NA NA NA NA PIK3R4 390095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 131168625 131168945 131168770 Y NA NA NA NA NA NA MRPL3 50882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 134262801 134263184 134262890 Y CEP63,CEP63,CEP63 NA NA NA NA NA ANAPC13 59243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 136448168 136448437 136448423 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 20783 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 136631651 136631818 136631718 Y NA IL20RB NA NA NA NA IL20RB 31254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 138552268 138552612 138552378 Y MRAS PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 488 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr3 139271371 139271598 139271484 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 123261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141131172 141131505 141131226 Y SLC25A36,RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 72384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141173878 141174028 141173977 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 29861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141174545 141175038 141174891 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 141887290 141887616 141887590 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 20904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 142844486 142844557 142844519 Y NA CHST2 NA NA NA NA CHST2 8313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 143693787 143694146 143693885 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 5147 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 143717163 143717502 143717283 Y NA C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 28523 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 146031799 146032049 146031857 Y PLSCR4 NA PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 64833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR2,PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR2 12586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 146745799 146745822 146745813 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 485148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 148899476 148899525 148899501 Y AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP CP NA NA NA NA CP 38317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA CP NA NA NA NA CP 5001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 148963630 148964002 148963862 Y NA CP,RP11-206M11.7 GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CP 25788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149099928 149100323 149100052 Y TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 6276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 149108520 149108892 149108690 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 14868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 149113631 149114007 149113702 Y NA TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 19979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149180653 149180836 149180808 Y RNF13 RP11-278L15.6 HPS3,TM4SF18,TM4SF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 29611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149225388 149225682 149225672 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 14941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149225895 149226130 149226044 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 15448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr3 149297469 149297617 149297606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 87022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149339543 149339560 149339552 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 112941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr3 149361418 149361700 149361559 Y WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 90801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149592323 149592638 149592448 Y RNF13 NA NA NA NA NA RNF13 63828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr3 149666531 149666918 149666689 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 17254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 149669691 149669713 149669697 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 14459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 150482569 150482635 150482602 Y NA SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2 3305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 151064162 151064557 151064224 Y P2RY14,P2RY13 GPR87 NA NA NA NA GPR87 31422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 151263826 151263968 151263832 Y NA NA NA NA NA NA RP11-64D22.2 222248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 151514227 151514622 151514246 Y NA RP11-64D22.2 NA NA NA NA RP11-64D22.2 28011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 151739734 151740181 151739895 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 219436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 151978363 151978615 151978373 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 6729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 152091128 152091426 152091240 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 105784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 152100220 152100544 152100298 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 114876 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 152120876 152121103 152120983 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 135532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 152574912 152575303 152575043 Y P2RY1,RAP2B P2RY1 NA NA NA NA P2RY1 24176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 155382767 155382896 155382833 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 77960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 155463707 155463869 155463800 Y NA PLCH1 NA NA NA NA PLCH1 2851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156506552 156506943 156506814 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 19578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 156847368 156847750 156847738 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 28799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 157147600 157147913 157147782 Y CCNL1,PTX3 PTX3 NA NA NA NA PTX3 4665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 157336015 157336135 157336022 Y NA NA NA NA NA NA C3orf55 76980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 158491929 158492257 158492161 Y NA MFSD1,RARRES1 RARRES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RARRES1 43444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 158846510 158846720 158846529 Y NA NA NA NA NA NA RARRES1 398025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 159116809 159117059 159116893 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 438591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159123796 159123957 159123826 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 431693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 379436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159183407 159183504 159183456 Y SCHIP1,IQCJ,SCHIP1 NA NA NA NA NA SCHIP1 372146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159356402 159356534 159356468 Y SCHIP1,SCHIP1 NA NA NA NA NA SCHIP1 199116 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 159480182 159480541 159480238 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 75109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 61889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159532172 159532274 159532246 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 23376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 15173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 13133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 159745418 159745477 159745450 Y NA IL12A NA NA NA NA IL12A 40881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 159852433 159852554 159852494 Y KPNA4 NA IFT80 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 147896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 161086549 161087201 161086872 Y NA SPTSSB NA NA NA NA SPTSSB 1467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 161087231 161087661 161087620 Y NA SPTSSB NA NA NA NA SPTSSB 1007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 161125031 161125340 161125185 Y NA SPTSSB NMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 36363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 161133387 161133714 161133484 Y NA SPTSSB NMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 44719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 161133836 161133975 161133914 Y NA SPTSSB NMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 45168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 161138601 161138921 161138632 Y NMD3,C3orf57 SPTSSB NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 49933 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr3 161139893 161140384 161140069 Y NA NA NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSB 51225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 163939562 163939697 163939594 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 1613563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 167579478 167579761 167579515 Y NA NA NA NA NA NA SERPINI1 128447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 169075984 169076327 169076322 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 303079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 169299138 169299197 169299168 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 80209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 140452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 170527099 170527304 170527203 Y EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 170627321 170627621 170627516 Y EIF5A2 RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA EIF5A2 2839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA EIF5A2 258584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171519572 171519961 171519854 Y NA PP13439,PLD1 NA NA NA NA PP13439 5753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171542633 171542898 171542814 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 FNDC3B,PLD1,TMEM212 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 15893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171792323 171792831 171792493 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 36905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr3 171878014 171878468 171878150 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 122596 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 171927297 171927567 171927433 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 171879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171935922 171936083 171936003 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 180504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 172038895 172038985 172038971 Y FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 103894 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 172280796 172281206 172280981 Y TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 41499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 172423916 172424228 172424139 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 2780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 173747920 173748305 173748100 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 344729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 174260946 174261332 174261139 Y NA NA NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 106583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 174949841 174950235 174950187 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 484223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 175056588 175056892 175056754 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 377566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 175204149 175204623 175204405 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 229835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 177309103 177309580 177309365 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 395842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 179049621 179049719 179049674 Y NA ZNF639,MFN1 NA NA NA NA ZNF639 10842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 179471930 179472312 179472121 Y NA NA NA NA NA NA USP13 103387 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 179550123 179550276 179550202 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 181580 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 179659956 179660305 179660211 Y PEX5L NA NA NA NA NA PEX5L 92536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA PEX5L 65262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 181035769 181036114 181035791 Y SOX2,DNAJC19,DNAJC19 NA NA NA NA NA DNAJC19 330207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 NA NA NA NA NA DNAJC19 712583 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 182550667 182550775 182550721 Y ATP11B ATP11B NA NA NA NA ATP11B 41379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 182978108 182978472 182978157 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 9076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr3 183088664 183088916 183088772 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 55650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 184458237 184458578 184458314 Y NA MAGEF1 VPS8,EPHB3,POLR2H,CLCN2,FAM131A,EIF4G1,THPO,CHRD,MAGEF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAGEF1 30401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 184624847 184625231 184625035 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 96916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA EIF2S2P2 186778 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA C3orf65 NA NA NA NA C3orf65 22403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA C3orf65 NA NA NA NA C3orf65 34913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 185482318 185482647 185482554 Y NA NA NA NA NA NA C3orf65 54002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 185905496 185905742 185905693 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 79389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186001404 186001736 186001631 Y DGKG NA NA NA NA NA DGKG 76290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186200833 186200839 186200836 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB11 82353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186715660 186715959 186715816 Y RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 69386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186745346 186745889 186745388 Y TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186746012 186746360 186746185 Y RTP1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 186926447 186926523 186926484 Y NA RPL39L NA NA NA NA RPL39L 29751 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 1871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 187467867 187468249 187468141 Y BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 6352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 187948643 187949049 187948891 Y LPP,LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 78798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 188149383 188149832 188149544 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 279538 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 188224984 188225450 188225214 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 355139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 188276216 188276468 188276344 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 406371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 188667737 188668123 188668016 Y NA NA LPP,BCL6,LPP-AS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 797892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 189022377 189022942 189022424 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 813811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 189034066 189034494 189034299 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 802259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 189192792 189192813 189192806 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 643940 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 189428483 189428800 189428617 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 407953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 189559377 189559697 189559485 Y CLDN1,TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 277056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 189626513 189626760 189626607 Y TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 209993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 190336230 190336434 190336308 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 106390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA OSTN NA NA NA NA OSTN 41131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 190957563 190957649 190957606 Y NA OSTN NA NA NA NA OSTN 42533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 192332888 192333028 192332958 Y FGF12 NA NA NA NA NA MB21D2 300922 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 192610862 192611520 192611033 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 22430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 192675084 192675828 192675653 Y MB21D2 MB21D2 MB21D2 IMR90 Hi-C 24141950 MB21D2 41134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 193588211 193588236 193588227 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 263698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 193590130 193590422 193590276 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 261512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 193758380 193758567 193758474 Y NA NA LOC647323 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 93367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr3 193983162 193983541 193983368 Y TMEM44 NA LOC647323,OPA1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC15 104931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 LRRC15 NA NA NA NA LRRC15 47562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr3 194041526 194041906 194041553 Y HES1 LRRC15 NA NA NA NA LRRC15 46566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 194227767 194228126 194227819 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 10674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.01371885250779 chr3 194296552 194296878 194296640 Y HES1,ATP13A3 TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 5862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194319358 194319899 194319518 Y LRRC15 TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44 NA NA NA NA TMEM44-AS1 16618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A NA NA NA NA NA FAM43A 57068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194826238 194826399 194826316 Y FAM43A NA NA NA NA NA XXYLT1 163497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194839135 194839291 194839213 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 150605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 118403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 194942294 194942570 194942358 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 47326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 195258657 195259038 195258847 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 9171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 195430866 195431240 195430948 Y NA MUC20 NA NA NA NA MUC20 14513 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 195531239 195531516 195531404 Y NA NA NA NA NA NA MUC20 85486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 195542423 195542578 195542499 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA TNK2 94238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 3591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 2512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr3 195946209 195946432 195946330 Y UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19 NA NA NA NA NA PCYT1A 66396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 196694427 196694825 196694642 Y NA NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 196855650 196855726 196855688 Y NA NA NA NA NA NA MFI2 100963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 43479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 683740 684022 683889 Y GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 13515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 693278 693552 693364 Y GAK,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 3985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 873387 873975 873731 Y NA NA NA NA NA NA GAK 50186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 918576 918805 918690 Y KIAA1530,PIGG,ZNF721,TMEM175,GAK,DGKQ GAK,TMEM175 NA NA NA NA GAK 5356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 1339085 1339471 1339276 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 1874737 1875082 1874826 Y WHSC1 LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 3586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 7251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 3026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr4 2814764 2815186 2815021 Y NA SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 22014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3061780 3062086 3061842 Y RGS12,SH3BP2,SH3BP2 HTT NA NA NA NA HTT 12322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3127770 3127782 3127776 Y RGS12,SH3BP2 NA NA NA NA NA HTT 53362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3357519 3357800 3357660 Y NA NA NA NA NA NA RGS12 64764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3390647 3391111 3390815 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 97892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3463022 3463837 3463465 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 68449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 5640113 5640289 5640201 Y NA NA NA NA NA NA EVC2 68986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 6022258 6022662 6022459 Y NA NA NA NA NA NA CRMP1 129473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 6928884 6929127 6929009 Y KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 19915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B,CCDC96 NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 7191564 7191944 7191754 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 7651364 7651970 7651802 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 101847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 7807485 7807548 7807490 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 53668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 79300 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 80240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 7974971 7975417 7975298 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 35318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 8614691 8614733 8614712 Y NA CPZ NA NA NA NA CPZ 22304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 10830954 10831154 10831060 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 373920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 11410203 11410376 11410250 Y HS3ST1 MIR572,RNPS1P1,HS3ST1 NA NA NA NA HS3ST1 19013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr4 13219623 13219635 13219629 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 113403 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 13329661 13329866 13329822 Y NA HSP90AB2P HSP90AB2P IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AB2P 3172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 14857617 14857813 14857737 Y CPEB2 NA CPEB2,LOC441009 MCF7 ChIA-PET 22265404 CPEB2 144485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15660440 15660677 15660613 Y CD38,FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 20608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15895700 15895839 15895750 Y FGFBP1 FGFBP1 CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 42524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 15922988 15923279 15923080 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 15084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 16544160 16544423 16544292 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 287982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 17642152 17642177 17642165 Y CLRN2 MED28 NA NA NA NA MED28 27898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 19620943 19621209 19621076 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 164326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr4 19825132 19825140 19825136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 368515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr4 20198231 20198535 20198383 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 54348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 87828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 20757566 20757961 20757877 Y KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 61661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 21554604 21554992 21554968 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 858699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 21792715 21792997 21792947 Y NA NA NA NA NA NA GPR125 722680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 24322640 24323331 24322979 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 260842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 24474307 24474984 24474891 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 109189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 24888902 24889089 24888911 Y NA NA NA NA NA NA CCDC149 90737 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 26090058 26090547 26090383 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 72530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 26114173 26114191 26114182 Y SLC34A2 RBPJ RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 48886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 27012249 27012271 27012260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 152028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 27362567 27362929 27362697 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 502346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1220976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 35107542 35107966 35107823 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1136165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 38821118 38821520 38821242 Y NA TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 34918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 38870386 38870769 38870503 Y FAM114A1 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39045195 39045532 39045360 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39045588 39045914 39045752 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39048044 39048301 39048173 Y KLF3,TLR1,TLR6 TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 3385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39619957 39620342 39620150 Y NA RP11-539G18.2 NA NA NA NA RP11-539G18.2 18418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39813102 39813401 39813252 Y NA NA NA NA NA NA UBE2K 115438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 40519982 40520039 40520011 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 110853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 40589734 40590029 40589952 Y RBM47 RBM47 NA NA NA NA RBM47 40863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 40628320 40628499 40628391 Y NA RBM47 NA NA NA NA RBM47 2393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 41979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 40911488 40911803 40911603 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 161574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 40998550 40998604 40998585 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 218127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 41454099 41454301 41454195 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 94475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 42615195 42615457 42615407 Y NA ATP8A1 NA NA NA NA ATP8A1 41665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 48125578 48125743 48125738 Y TEC NA NA NA NA NA CNGA1 108889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 53985720 53986039 53985931 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 244203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54032997 54033196 54033097 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 197046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 LNX1 SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 3326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54866446 54866641 54866544 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 62216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 54886131 54886730 54886449 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 42127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54890749 54890967 54890889 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 37890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54906868 54907157 54907139 Y NA CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 21700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.9675856773799 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 55259500 55259759 55259647 Y KIT NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 166236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 56323586 56323848 56323646 Y NA NA NA NA NA NA TMEM165 63462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 56453376 56453745 56453528 Y NA CLOCK,NMU NA NA NA NA CLOCK 42071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 57313900 57314193 57314047 Y NA PPAT,PAICS,SRP72 NA NA NA NA PAICS 13993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 57623645 57623837 57623739 Y NA RPL17P20 PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 RPL17P20 49419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 57831930 57832208 57832081 Y NA POLR2B,NOA1 NA NA NA NA POLR2B 9680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 57905676 57905866 57905771 Y NA NA NA NA NA NA NOA1 62687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 61590476 61590574 61590525 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 1048994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 66899965 66900079 66900021 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 57765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA RP11-396M11.1 NA NA NA NA RP11-396M11.1 2746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.22568925803492 chr4 71695000 71695080 71695041 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 8582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 71768830 71769244 71769107 Y DCK,MOBKL1A MOB1B NA NA NA NA MOB1B 2787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 73887463 73887489 73887476 Y NA COX18 ADAMTS3 IMR90 Hi-C 24141950 COX18 45983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 73999620 73999782 73999700 Y NA NA NA NA NA NA COX18 66148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74472194 74472476 74472318 Y RASSF6,RASSF6 RASSF6 NA NA NA NA RASSF6 11872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74545430 74545943 74545736 Y CXCL6,CXCL1 NA CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,PF4 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 58280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 74581765 74581937 74581894 Y ANKRD17,IL8 IL8 MTHFD2L,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 22286 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74591640 74592145 74591915 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 12078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 10425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr4 74596111 74596370 74596188 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 7853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 74600074 74600136 74600093 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL8 4087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74680452 74680792 74680616 Y NA CXCL6,PF4V1 MTHFD2L,CXCL1 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL6 19422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 74783021 74783195 74783091 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1 CXCL1,CXCL1P RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL1P 24846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 75094731 75095678 75095332 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA EPGN 76512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 75187079 75187238 75187159 Y EPGN EPGN NA NA NA NA EPGN 14889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 75228037 75228384 75228211 Y NA NA NA NA NA NA EPGN 55847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 75554137 75554451 75554233 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 BTC 163445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 75585032 75585282 75585171 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTC 132614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 75859868 75860329 75860092 Y BTC,PARM1 PARM1 NA NA NA NA PARM1 3563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 77468225 77468282 77468244 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 113972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 78096366 78096378 78096373 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 82418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 78977065 78977655 78977359 Y NA FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 79537274 79537650 79537411 Y BMP2K NA NA NA NA NA ANXA3 66601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 80814219 80814317 80814268 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 230291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 80900549 80900754 80900650 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 143854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 80979830 80980309 80980136 Y ANTXR2 NA NA NA NA NA ANTXR2 64299 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 81048415 81048773 81048660 Y ANTXR2,PRDM8 ANTXR2 PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR2 3807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 81063632 81063826 81063726 Y ANTXR2,PRDM8 ANTXR2,PRDM8 NA NA NA NA ANTXR2 19024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 84092650 84093086 84092779 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8 PLAC8 PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 36422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 84237643 84238153 84237819 Y THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE COQ2,HPSE NA NA NA NA HPSE 16153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 84241779 84242152 84241951 Y THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE COQ2,HPSE COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 HPSE 12154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 84773321 84773491 84773400 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 318254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 85798168 85798515 85798434 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 87023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 85868944 85869302 85869263 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 16236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 86927841 86928538 86928361 Y MAPK10,MAPK10,MAPK10 NA NA NA NA NA ARHGAP24 533574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 87815640 87815940 87815774 Y NA AFF1,C4orf36 NA NA NA NA AFF1 38214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 89453548 89453843 89453722 Y NA HERC3,PIGY NA NA NA NA PIGY 12608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 89455158 89455345 89455247 Y NA HERC3,PIGY NA NA NA NA PIGY 14218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 89677444 89677595 89677520 Y FAM13A NA NA NA NA NA PIGY 236504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 282601 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 92239234 92239407 92239321 Y NA NA NA NA NA NA GRID2 984143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 93226746 93226922 93226838 Y GRID2 GRID2 NA NA NA NA GRID2 3196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 93555263 93555546 93555317 Y GRID2 NA NA NA NA NA GRID2 331713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 95406092 95406259 95406175 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 35055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 99443713 99444102 99443889 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 133678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 99469455 99469759 99469656 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 108021 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 99580316 99580421 99580372 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 99827146 99827610 99827384 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 21528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 3942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 99853675 99854028 99853903 Y EIF4E,EIF4E AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA EIF4E 3887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 101977991 101978172 101977999 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 288765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 102113415 102113532 102113437 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 153405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 102131266 102131303 102131283 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 135634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 102266716 102267419 102267189 Y NA PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103341379 103341431 103341405 Y SLC39A8 SLC39A8 NA NA NA NA SLC39A8 8984 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 103359657 103359837 103359736 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 9242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103360468 103360812 103360586 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103483964 103484649 103484311 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 63478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103536028 103536474 103536149 Y NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 115542 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 103793013 103793145 103793075 Y MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 4878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 106390941 106391445 106391094 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 1793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 106416067 106416252 106416160 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA EEF1A1P9 12212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 110361567 110361723 110361645 Y NA SEC24B,SEC24B-AS1 NA NA NA NA SEC24B-AS1 8594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 110469853 110470280 110470027 Y SEC24B,CCDC109B CCDC109B NA NA NA NA CCDC109B 9081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 110604562 110604565 110604563 Y NA CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 18174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 113004366 113004696 113004523 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 59857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 113547591 113547910 113547748 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA LARP7 8210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 114366444 114366711 114366574 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 314372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 114382932 114383313 114383209 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 297770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 291278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 114525266 114525292 114525279 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 155791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 43041 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 132804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 120493215 120493297 120493256 Y C4orf3 NA NA NA NA NA PDE5A 54849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 120647796 120647973 120647885 Y NA NA NA NA NA NA PDE5A 99650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 121274788 121275179 121275049 Y NA NA NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 288559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 122609803 122610189 122610094 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 6079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 124410194 124410374 124410218 Y NA NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 94244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 125354669 125354869 125354769 Y NA TECRP2 ANKRD50 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECRP2 28076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 139747631 139747907 139747769 Y NA NA LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 187036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr4 140235316 140235657 140235500 Y ELF2,RAB33B NAA15,NDUFC1 NA NA NA NA NDUFC1 13611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 140690476 140690707 140690592 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 105554 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140696118 140696274 140696196 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 111196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 140748220 140748477 140748349 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 163298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140787614 140787718 140787639 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 202692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 140986447 140986603 140986580 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 86735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 141013693 141013823 141013696 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 141020500 141020888 141020694 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 52450 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 141218386 141218686 141218436 Y MAML3,SCOC SCOC NA NA NA NA SCOC 41946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 143012897 143013276 143013057 Y NA NA NA NA NA NA IL15 457145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 143059861 143060134 143059998 Y NA NA NA NA NA NA IL15 504109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 143185718 143186074 143185891 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 580511 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 143337797 143338156 143337961 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 428429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 143393475 143393485 143393480 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 373100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 143521441 143521512 143521455 Y INPP4B NA NA NA NA NA INPP4B 245073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 143536371 143536723 143536559 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 229862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 144280232 144280410 144280287 Y USP38,SMARCA5,GAB1 GAB1 NA NA NA NA GAB1 24317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 146015172 146015244 146015208 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 1840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 146703198 146703494 146703347 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 154293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 146833675 146833816 146833746 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 23971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 147183888 147184022 147183955 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 89051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 147329066 147329172 147329119 Y NA NA NA NA NA NA SLC10A7 111951 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 149109723 149110098 149109949 Y NR3C2 NA NA NA NA NA NR3C2 253752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 149124468 149124612 149124541 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 239238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 149756405 149756578 149756515 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 392555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 151316952 151317347 151317150 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 319526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 151557010 151557332 151557171 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 377547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152048107 152048440 152048274 Y LRBA,LRBA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 29382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 152105959 152106222 152106091 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 87234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152117073 152117218 152117121 Y FAM160A1,SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 98348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 152143714 152143771 152143743 Y SH3D19 NA NA NA NA NA SH3D19 101013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152226044 152226315 152226216 Y NA SH3D19 NA NA NA NA SH3D19 18469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 SH3D19 FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3D19 1248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 152367520 152367754 152367585 Y NA RP11-610P16.1,FAM160A1 NA NA NA NA FAM160A1 39152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152405859 152406228 152406131 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 77491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 152650918 152651090 152650938 Y NA PET112 NA NA NA NA PET112 29085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 153023305 153023605 153023314 Y NA RP11-18H21.1 SH3D19,FBXW7,RPS3A,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-18H21.1 3399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 153313306 153313343 153313324 Y NA NA NA NA NA NA FBXW7 141910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 153630965 153631147 153631056 Y NA TMEM154 TMEM154 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM154 31648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 154176673 154176745 154176706 Y NA NA NA NA NA NA MND1 87056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 154253952 154254140 154254046 Y NA MND1 NA NA NA NA MND1 9661 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 154360422 154360809 154360778 Y MND1,KIAA0922 KIAA0922 MND1,TRIM2,KIAA0922 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0922 24689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 154429389 154429734 154429551 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 43891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 154598070 154598582 154598380 Y TLR2 TLR2 TLR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TLR2 22070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 157811355 157811573 157811537 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 78973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 157867687 157867968 157867878 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 157868046 157868334 157868214 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 159101630 159101785 159101708 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B NA NA NA NA FAM198B 9160 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 159857327 159857643 159857481 Y NA NA NA NA NA NA FNIP2 169037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 164414222 164414415 164414319 Y TKTL2,C4orf43 NA NA NA NA NA NPY1R 150238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 207505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 164532440 164532627 164532559 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 268456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 164817939 164818272 164818106 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 553955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 164876357 164876532 164876526 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 612373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 NACA3P NA NA NA NA NACA3P 19861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 166319201 166319584 166319393 Y NA CPE NA NA NA NA CPE 38855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 166603847 166604073 166603959 Y NA NA NA NA NA NA TLL1 188337 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 166874416 166874673 166874545 Y NA NA NA NA NA NA TLL1 82006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 167969514 167970188 167969851 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK3 183759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 169361585 169362025 169361769 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA PALLD 54192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 169509077 169509260 169509148 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 52140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 169514585 169514902 169514734 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 57648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 169658786 169659496 169659136 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 201849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 169716186 169716224 169716221 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 213202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 169718415 169718594 169718475 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA CBR4 210832 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 170172551 170172946 170172870 Y NA SH3RF1 NA NA NA NA SH3RF1 17310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 170193381 170193745 170193612 Y SH3RF1 SH3RF1 NA NA NA NA SH3RF1 3125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 170266359 170266712 170266646 Y NA NA CBR4,SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF1 76103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 174106562 174106852 174106704 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 17759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 174185845 174186217 174186078 Y NA NA NA NA NA NA HMGB2 68059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 175299709 175299785 175299764 Y NA NA NA NA NA NA FBXO8 96294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 177191849 177192202 177191988 Y ASB5 SPCS3,RP11-87F15.2 SPATA4 IMR90 Hi-C 24141950 SPCS3 46913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 177379481 177379743 177379612 Y NA NA NA NA NA NA RP11-87F15.2 139872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 177699134 177699410 177699361 Y NA VEGFC NA NA NA NA VEGFC 12471 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 177705907 177706270 177706189 Y NA VEGFC NA NA NA NA VEGFC 5611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 177710943 177711419 177711262 Y VEGFC VEGFC NA NA NA NA VEGFC 462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 177715411 177715680 177715585 Y VEGFC VEGFC NA NA NA NA VEGFC 3530 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 177760403 177760587 177760468 Y NA VEGFC VEGFC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFC 48522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 177824075 177824477 177824359 Y NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 112194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 180320165 180320256 180320211 Y NA NA NA NA NA NA RP11-404J23.1 64203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 183730445 183730610 183730498 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 106479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 183897058 183897307 183897172 Y NA NA WWC2,FAM92A3 IMR90 Hi-C 24141950 DCTD 59969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 184256615 184256836 184256706 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 106908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr4 184270914 184271169 184271084 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 92575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr4 184376829 184376946 184376888 Y CLDN24 CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 13085 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 184391190 184391347 184391268 Y CDKN2AIP CDKN2AIP,ING2 CDKN2AIP IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 27446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 185205400 185205552 185205478 Y NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 188182 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 185296800 185297408 185297103 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 96326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr4 185605803 185606253 185606149 Y IRF2,CASP3,CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 37140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 186227102 186227608 186227442 Y NA NA NA NA NA NA LRP2BP 87445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA NA NA NA NA NA CCDC110 104154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 186818044 186818172 186818109 Y SORBS2 NA NA NA NA NA TLR3 170134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 187597728 187597911 187597833 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 47965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 187622574 187622751 187622592 Y FAT1 FAT1 NA NA NA NA FAT1 23125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 187648916 187649309 187649113 Y NA FAT1 FAT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAT1 3040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 188403012 188403193 188403108 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 757136 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 188504416 188504571 188504495 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-219G10.1 764607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 190197516 190197817 190197669 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 431051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 190820880 190821275 190820936 Y NA FRG1 NA NA NA NA FRG1 38668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 162156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA ZDHHC11 64078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr5 1080709 1080898 1080802 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 29252 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1130725 1130985 1130924 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 20575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 1316464 1316882 1316563 Y TERT,SLC6A3 TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 23280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1497353 1497517 1497465 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 24575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1503544 1504024 1503726 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 18068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1516282 1516761 1516468 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 5331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1562820 1563021 1562959 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1,SDHAP3 NA NA NA NA SDHAP3 29714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 1564127 1564592 1564359 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1,SDHAP3 NA NA NA NA SDHAP3 28143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 5352474 5352824 5352649 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 65953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 6273315 6273566 6273420 Y NA NA NA NA NA NA MED10 103141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.86160047461633 chr5 6766717 6766947 6766763 Y SRD5A1,PAPD7 RP11-332J15.3 NA NA NA NA RP11-332J15.3 2713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 7397224 7397590 7397441 Y C5orf49,ADCY2 NA NA NA NA NA MTRR 451709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 8981221 8981557 8981405 Y NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5A 562630 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 10270287 10270466 10270406 Y NA FAM173B,CCT5,CMBL NA NA NA NA CCT5 22254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 11487050 11487322 11487183 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 414833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 11591848 11592143 11592119 Y CTNND2 NA NA NA NA NA CTNND2 310012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 12246135 12246533 12246334 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 343980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 14038478 14038912 14038655 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 95826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 14039774 14040034 14039980 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 97122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr5 14108761 14108933 14108800 Y TRIO TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14582921 14583040 14582953 Y FAM105A FAM105A NA NA NA NA FAM105A 3037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14600164 14600334 14600249 Y FAM105B FAM105A NA NA NA NA FAM105A 20280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 FAM105B 22726 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 16723637 16724009 16723823 Y BASP1 NA NA NA NA NA FAM134B 108470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 16733521 16733894 16733888 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 118354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 17118695 17119132 17119047 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 54988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 20447344 20447494 20447490 Y CDH18 NA NA NA NA NA GUSBP1 892448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 21392233 21392585 21392409 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 52291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 21551190 21551442 21551193 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 211248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 23303766 23303789 23303778 Y NA NA NA NA NA NA CDH12 452035 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 32164142 32164348 32164245 Y ZFR GOLPH3 NA NA NA NA GOLPH3 8108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 32274798 32274903 32274861 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 36212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 32283224 32283342 32283283 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 27773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 32768263 32768639 32768422 Y SUB1 NA NA NA NA NA NPR3 81087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 33003912 33004012 33003962 Y NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-36C20.1 156273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 33312073 33312323 33312255 Y NA CTD-2066L21.3 NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2066L21.3 16057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.11970405527136 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 34715239 34715402 34715248 Y NA NA NA NA NA NA RAI14 60897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 34717862 34718081 34717968 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 63520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 34835599 34835693 34835610 Y NA TTC23L NA NA NA NA TTC23L 1245 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 34877157 34877486 34877355 Y NA TTC23L,BRIX1,RAD1 NA NA NA NA BRIX1 35995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA CAPSL NA NA NA NA CAPSL 12207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 39025065 39025383 39025224 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 47127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 39077105 39077361 39077230 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 4595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 39713773 39713912 39713841 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 253371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 40388555 40388624 40388591 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 288976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 41084074 41084331 41084322 Y NA NA NA NA NA NA CARD6 244788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 41288648 41289018 41288835 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD3 219712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 41497221 41497345 41497332 Y NA PLCXD3 NA NA NA NA PLCXD3 11385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 41509799 41509858 41509829 Y PLCXD3 PLCXD3 NA NA NA NA PLCXD3 1069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 64299 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 42999523 42999876 42999700 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 16655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 4127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 43038627 43038828 43038720 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA AC025171.1 849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52094372 52094720 52094546 Y NA ITGA1,PELO NA NA NA NA PELO 12598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52155124 52155267 52155195 Y NA NA NA NA NA NA PELO 73350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52319874 52320078 52320019 Y NA ITGA2,CTD-2175A23.1 LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2175A23.1 35766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 43484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52332019 52332357 52332083 Y FST,ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 47911 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 49226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 52545484 52545615 52545603 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 141591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr5 52619379 52619641 52619531 Y ITGA2,FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 154598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 52629043 52629307 52629159 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 144932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52662185 52662487 52662317 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 111752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 59200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr5 52715258 52715483 52715372 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 58756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 53460447 53460703 53460575 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 143709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 54964345 54964561 54964453 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A9 102461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 263845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 640970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 605797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 58365928 58366326 58366127 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 611841 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58408149 58408473 58408383 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 654062 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 754756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58926109 58926323 58926216 Y NA NA NA NA NA NA PART1 855217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PART1 829526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 58952543 58952885 58952791 Y NA NA NA NA NA NA PART1 828655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 59004737 59004748 59004743 Y PDE4D NA NA NA NA NA PART1 776792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 60315642 60315784 60315678 Y NA NA NA NA NA NA NDUFAF2 76686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 60600910 60601202 60601013 Y ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 24898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 61917589 61917885 61917879 Y NA NA NA NA NA NA CKS1B 111280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 64505244 64505511 64505327 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 270236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 64778400 64778738 64778694 Y NA ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 2653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 65126679 65127012 65126845 Y TRIM23 NA NA NA NA NA ERBB2IP 93291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 68823946 68824105 68824026 Y NA OCLN NA NA NA NA OCLN 37827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 71785493 71785739 71785612 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 171020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 72234221 72234359 72234290 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 15449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 72995047 72995144 72995131 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 135536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 73839049 73839165 73839086 Y NA NA CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 HEXB 94683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 74861939 74862072 74862007 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 55976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 74997783 74997822 74997793 Y COL4A3BP,COL4A3BP POC5 NA NA NA NA POC5 13491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 76110007 76110333 76110205 Y NA F2RL1 NA NA NA NA F2RL1 2425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 76147668 76147777 76147734 Y IQGAP2,S100Z F2RL1 NA NA NA NA F2RL1 34910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77178463 77178819 77178704 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 15859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77289736 77289928 77289813 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 127132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77412957 77413018 77412987 Y NA NA NA NA NA NA AP3B1 175561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77589539 77589820 77589680 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 960 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77800435 77801147 77800993 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 146096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77825252 77825732 77825631 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 170913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77843085 77843301 77843193 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 188746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77882234 77882399 77882291 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 181445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 77940704 77941073 77940964 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 122771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 78439900 78440059 78439990 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 89802 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 78585055 78585206 78585119 Y NA NA NA NA NA NA JMY 55043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 80260404 80260721 80260547 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 311602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 81702078 81702394 81702360 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129682 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82356692 82356869 82356781 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 14448 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82576471 82576688 82576580 Y NA NA NA NA NA NA VCAN 188596 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 156368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82696125 82696357 82696275 Y VCAN NA TMEM167A,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 VCAN 68927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82771448 82771603 82771549 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 6164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 82886397 82886761 82886578 Y VCAN NA NA NA NA NA VCAN 121113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA HAPLN1 NA NA NA NA HAPLN1 2654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 83219939 83220298 83220055 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 204507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83266909 83267113 83267063 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 251477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83588624 83588917 83588807 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 89328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83674189 83674553 83674373 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 3692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 83776854 83777163 83777009 Y NA NA NA NA NA NA EDIL3 98243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 85654132 85654483 85654435 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 257238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 85833622 85833763 85833693 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 77958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86617714 86617757 86617736 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 56009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86619927 86620237 86620117 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 58222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86629389 86629577 86629451 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 67684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86653612 86653965 86653789 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 52871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86663167 86663443 86663248 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 43393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 87214641 87214647 87214644 Y NA NA NA NA NA NA TMEM161B-AS1 348065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 88030090 88030417 88030349 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 146728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 88177466 88177636 88177509 Y NA MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 88367349 88367581 88367488 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 169427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 90680524 90680637 90680608 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 92913655 92914013 92913834 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 3030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 94038768 94039036 94038830 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0825 86459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX,C5orf27 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 96142552 96142955 96142798 Y CAST,CAST,LNPEP ERAP1 NA NA NA NA ERAP1 749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 97444170 97444562 97444463 Y NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 227886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 97445347 97445652 97445445 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 97643613 97643769 97643691 Y NA CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 28679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 97750593 97751065 97750933 Y RGMB NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 78145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 99386410 99387139 99386777 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 481827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 106823409 106823505 106823457 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 181091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 107555103 107555441 107555272 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 160358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 108460806 108460908 108460857 Y NA NA NA NA NA NA PJA2 282787 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 110838164 110838531 110838380 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 7757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 112509140 112509432 112509369 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 198741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 114749513 114749705 114749609 Y FEM1C NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 118985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 114913600 114913827 114913746 Y NA FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2 NA NA NA NA AC010226.4 21927 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 115205022 115205387 115205036 Y FEM1C AP3S1,ATG12 NA NA NA NA ATG12 29467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 115236990 115237113 115237051 Y NA NA NA NA NA NA ATG12 61435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 115721196 115721558 115721420 Y NA NA SEMA6A IMR90 Hi-C 24141950 CTB-118N6.1 174700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 117774677 117774715 117774696 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP2 532776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 119576176 119576345 119576273 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 221628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 119837700 119837812 119837711 Y PRR16 PRR16 NA NA NA NA PRR16 39727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 122796075 122796194 122796152 Y CEP120 CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 IMR90 Hi-C 24141950 CEP120 38789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 125686848 125687181 125687011 Y GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3,ALDH7A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 6643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 125773418 125773804 125773609 Y GRAMD3 NA NA NA NA NA GRAMD3 79594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 125779791 125780174 125779834 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 85967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 126094157 126094598 126094339 Y LMNB1,LMNB1 LMNB1 LMNB1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNB1 15717 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 126181513 126181654 126181594 Y MARCH3 NA NA NA NA NA LMNB1 71198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 127295109 127295375 127295239 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC12A2 122083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 127849179 127849476 127849294 Y NA NA NA NA NA NA FBN2 143402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 129387025 129387306 129387155 Y CHSY3 NA NA NA NA NA CHSY3 148860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 130730635 130730890 130730763 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 151449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 130976279 130976499 130976398 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 7350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131015627 131015946 131015841 Y FNIP1,CDC42SE2 RAPGEF6 RAPGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF6 46698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 22572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 131437879 131438240 131437995 Y RAPGEF6,IRF1 CSF2 PDLIM4,IL3 IMR90 Hi-C 24141950 CSF2 30396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131439036 131439325 131439215 Y NA CSF2 PDLIM4,IL3 IMR90 Hi-C 24141950 CSF2 31553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 131747457 131747923 131747553 Y NA SLC22A5,AC034220.3,C5orf56 NA NA NA NA C5orf56 3129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 131764930 131765294 131765112 Y NA C5orf56,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 20602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 132581339 132581487 132581431 Y ANKRD43 NA NA NA NA NA HSPA4 195685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133455254 133455613 133455348 Y NA TCF7 NA NA NA NA TCF7 6852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133460893 133461176 133461013 Y PHF15,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 12491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 18816 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B AC005355.1 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.1 31947 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.1 68908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA AC005355.1 92728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.48379283868995 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 137785775 137785891 137785836 Y WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2 REEP2,EGR1 NA NA NA NA REEP2 13069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 138078029 138078389 138078209 Y NA NA CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNA1 133373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138319677 138319832 138319813 Y DNAJC18,LRRTM2 NA NA NA NA NA MATR3 287609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138325344 138325620 138325482 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 281821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SPATA24 NA NA NA NA SPATA24 10439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 21887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138851930 138852095 138852011 Y NA TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 8425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA,IGIP NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 139683573 139683663 139683637 Y NA PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 2867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 139691635 139691999 139691907 Y HBEGF PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 10929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr5 140322933 140323011 140322970 Y PCDHGA8,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA7,PCDHB4,PCDHA13,PCDHAC2 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 20809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC5 NA NA NA NA PCDHGC5 8831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 141056831 141057056 141056944 Y NA HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 2732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 141659754 141659954 141659854 Y NA AC005592.2,SPRY4 SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC005592.2 42904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 141824245 141824298 141824272 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 120225 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142024486 142024769 142024581 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 123180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142105384 142105400 142105392 Y FGF1 ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 42549 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142580387 142580630 142580509 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 129540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 142690864 142691375 142691192 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 18795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 143685934 143686297 143686110 Y NA NA NA NA NA NA YIPF5 137656 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 145447855 145448292 145447919 Y NA NA NA NA NA NA LARS 111931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 145808290 145808429 145808360 Y POU4F3 TCERG1 NA NA NA NA TCERG1 16445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 146378574 146378711 146378699 Y NA NA NA NA NA NA CTC-255N20.1 233711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147024840 147025034 147024978 Y DPYSL3,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 135304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147160341 147160727 147160571 Y NA JAKMIP2 NA NA NA NA JAKMIP2 3 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147266523 147266583 147266553 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 17518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147283651 147283737 147283694 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147603808 147604119 147603866 Y SPINK6,SPINK13 SPINK13 NA NA NA NA SPINK13 41624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147722722 147723108 147722793 Y SPINK14,SPINK7 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA RP11-373N22.3 38238 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 147738650 147738787 147738783 Y SPINK14 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA RP11-373N22.3 22559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 148170506 148170627 148170569 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 33529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148290314 148290586 148290452 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 86158 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 148292484 148292904 148292843 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 88328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148349939 148350092 148350025 Y NA NA NA NA NA NA SH3TC2 90634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA SH3TC2 87833 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr5 148505231 148505419 148505389 Y NA ABLIM3 ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 13627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.33167446079849 chr5 148508817 148508996 148508890 Y NA ABLIM3 ADRB2,AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3,PCYOX1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABLIM3 10050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 148515213 148515594 148515276 Y ABLIM3 ABLIM3 ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 3452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148520255 148520308 148520282 Y NA ABLIM3 NA NA NA NA ABLIM3 1209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148600871 148601299 148600941 Y ARHGEF37,SH3TC2 AFAP1L1 AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 AFAP1L1 48135 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 148664180 148664379 148664280 Y NA AFAP1L1 NA NA NA NA AFAP1L1 14746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148836415 148836621 148836572 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 92386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 148839357 148839440 148839397 Y CSNK1A1 NA NA NA NA NA CSNK1A1 89567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 149111957 149112473 149112231 Y AFAP1L1,IL17B,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 4096 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 149172151 149172518 149172335 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1B 64290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 149849253 149849476 149849346 Y NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 13905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 150108879 150109189 150109172 Y SYNPO RBM22,DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 27482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA NA NA NA NA NA TNIP1 67497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150505089 150505277 150505181 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6 TNIP1,ANXA6 TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA6 30166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 150533385 150533816 150533573 Y NA ANXA6 NA NA NA NA ANXA6 1627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 151088912 151089056 151088970 Y SLC36A3 SPARC NA NA NA NA SPARC 24186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 151108065 151108456 151108379 Y NA SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 35483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr5 156718541 156718931 156718583 Y HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2 CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 27452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL4 69987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 157029541 157029807 157029692 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 28758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 157030326 157030804 157030600 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 29543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 157040513 157041041 157040628 Y NIPAL4,ADAM19 ADAM19 NA NA NA NA ADAM19 39730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 157097652 157097963 157097872 Y NA NA NA NA NA NA THG1L 58242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.02743770501558 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 158938695 158938959 158938847 Y EBF1 NA ADRA1B,LOC285627,TTC1 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 250606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 159637065 159637397 159637293 Y FABP6 RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 45863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA MIR146A 58339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 160754027 160754417 160754191 Y NA NA NA NA NA NA GLRXP3 422357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 166427113 166427459 166427286 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 972797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 25142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 168279021 168279443 168279141 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 237704 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 169398141 169398453 169398335 Y NA FAM196B NA NA NA NA FAM196B 7291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 169893945 169894299 169894207 Y LCP2,KCNMB1 NA NA NA NA NA FOXI1 363044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 169918518 169918694 169918619 Y LCP2,KCNMB1 NA NA NA NA NA RANBP17 368180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 170179191 170179549 170179383 Y GABRP NA NA NA NA NA RANBP17 107325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 171505010 171505317 171505162 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 73133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 171660495 171660734 171660615 Y NA STK10,UBTD2 NA NA NA NA STK10 47105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 171854785 171855084 171854937 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 24443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172167900 172168183 172168030 Y UBTD2,DUSP1 DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 28015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 172205264 172205447 172205353 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 9066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172209593 172209865 172209663 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 13395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172350033 172350394 172350214 Y NA RPL26L1 NA NA NA NA RPL26L1 33338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172729503 172729731 172729610 Y NA STC2 NA NA NA NA STC2 24775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 172761341 172761739 172761505 Y STC2 STC2 NA NA NA NA STC2 6835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172881373 172881649 172881564 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 126867 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 127777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 172883833 172884047 172883943 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 129327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 173237626 173237876 173237751 Y NA NA BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 75407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 173346462 173346760 173346662 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 33179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 173390340 173390538 173390358 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 77057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1,MXD3 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 177373047 177373130 177373089 Y PROP1 RP11-1252I4.2 NA NA NA NA RP11-1252I4.2 8424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 CLK4 NA NA NA NA CLK4 21196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 178069436 178069827 178069736 Y NA CLK4 ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6 IMR90 Hi-C 24141950 CLK4 13820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 179532958 179533118 179533038 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 35840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 180085881 180086092 180086053 Y NA NA BTNL8 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT1 154560 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 180541875 180541994 180541989 Y OR2Y1 NA BTNL8,MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-338M12.5 74930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 224011 224106 224080 Y NA NA EXOC2,DUSP22,IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 65524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 319799 320052 319899 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 30169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 322947 323248 323077 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 33317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 541825 541828 541827 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 149289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 567084 567274 567179 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 123843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 1641578 1641903 1641733 Y NA FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 32897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 1966604 1966616 1966610 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 277310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 2029223 2029245 2029234 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 214681 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 2684459 2684567 2684519 Y SERPINB9,SERPINB1,NQO2 NA NA NA NA NA C6orf195 51622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 2818084 2818421 2818253 Y SERPINB9 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 3072108 3072295 3072201 Y NA RIPK1,BPHL NA NA NA NA RIPK1 9883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 3308463 3308483 3308477 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 78499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 3385907 3386183 3386010 Y SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 69073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 3403581 3403822 3403689 Y BPHL,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 51434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 4613428 4613746 4613742 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 90647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 5190782 5191184 5190977 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 67988 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 5280343 5280601 5280557 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 21066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 401666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 6712780 6713068 6712936 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 392762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 6803868 6804205 6804018 Y RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 301625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 6807115 6807400 6807321 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 298430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 6825409 6825642 6825558 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 280188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 7126223 7126536 7126378 Y NA RREB1 NA NA NA NA RREB1 20393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 7143191 7143555 7143322 Y NA RREB1 NA NA NA NA RREB1 37361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 7157997 7158379 7158000 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 52167 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 7996922 7997003 7996963 Y BMP6,TXNDC5,TXNDC5 TXNDC5 NA NA NA NA TXNDC5 27643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 10355646 10355875 10355765 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 62017 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 10552532 10552740 10552636 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 62076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 10719904 10720278 10720060 Y NA PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA TMEM14C 870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 167522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 167367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11270585 11270869 11270602 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 109712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11299498 11299626 11299552 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 80955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 11434091 11434361 11434207 Y NA NA NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD9 53510 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 233485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 11772710 11773287 11772940 Y NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 233708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 12288026 12288260 12288136 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 12291396 12291672 12291434 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 2800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 12484193 12484504 12484246 Y EDN1 RPL15P3 EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 27838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 12587436 12587655 12587553 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 75094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13307248 13307611 13307538 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 LOC100130357 K562 ChIA-PET 22265404 TBC1D7 19204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13354550 13354809 13354680 Y NA TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 27735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 13662469 13662838 13662724 Y NA NOL7,RANBP9 NA NA NA NA RANBP9 46958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 13671877 13672171 13672102 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83 RANBP9 NOL7,SIRT5 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 37625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 14640701 14640843 14640773 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 524829 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 14671680 14671958 14671829 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 555808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 14711169 14711813 14711625 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 532714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2-AS1 53059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 118745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 15516223 15516554 15516389 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 144735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 15530882 15531100 15530987 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 130189 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 15580663 15580900 15580755 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 80389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 15622564 15622845 15622741 Y JARID2 DTNBP1 NA NA NA NA DTNBP1 38444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16322882 16323237 16323091 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 86071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16439523 16439703 16439580 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 202712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16474193 16474630 16474472 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 237382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 244593 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16481928 16482422 16482245 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 245117 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16668776 16668955 16668866 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 90414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16673403 16673483 16673443 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 85886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16684094 16684384 16684208 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 16687739 16687973 16687884 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 71396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16699529 16700051 16699938 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 59318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16714644 16714961 16714802 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 44408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 16747394 16747788 16747685 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 11581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 16766520 16766751 16766672 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562 ChIA-PET 22265404 ATXN1 6798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 17033300 17033417 17033356 Y RBM24 NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 RBM24 246160 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 18148522 18148811 18148697 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 TPMT 4494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 18353568 18353841 18353735 Y RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 12938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 18405939 18406237 18405987 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 39160 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 20910575 20910817 20910696 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 377887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 22222867 22222924 22222901 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 630895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 22475595 22475903 22475749 Y NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 883623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 24927472 24927654 24927651 Y ALDH5A1,TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 GMNN 154313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 25406864 25407254 25406949 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 129558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 25458860 25459089 25458879 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 181554 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 25525007 25525226 25525060 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2AA 199564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr6 26006011 26006046 26006038 Y HIST1H4G,HIST1H2AA,HIST1H2BA,HIST1H1T TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 9994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 26029019 26029363 26029242 Y NA HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr6 26169489 26169538 26169514 Y BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1 HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE NA NA NA NA HIST1H2BE 12420 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 26233560 26233958 26233761 Y NA HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H1D 344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 26283996 26284379 26284279 Y NA HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H4H 234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 26397110 26397374 26397265 Y NA BTN3A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3 NA NA NA NA BTN3A1 3091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27071259 27071558 27071409 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH NA NA NA NA HIST1H2BJ 26983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27136362 27136689 27136526 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 23501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27780866 27781094 27780996 Y ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL NA NA NA NA HIST1H2BM 44 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 28299231 28299616 28299424 Y GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1 ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 16075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 28885422 28885544 28885424 Y NA HCG14,TRIM27 NA NA NA NA TRIM27 4222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 28985048 28985267 28985158 Y NA HCG15,ZNF311 TRIM27,LOC401242 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF311 13955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 26974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.90773364974422 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 28146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 30175844 30176213 30176153 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30182160 30182533 30182417 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr6 30434534 30434831 30434712 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 RANP1,HLA-E PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANP1 16886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 30651242 30651620 30651357 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 30716024 30716359 30716084 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 5693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 23127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30774085 30774428 30774395 Y NA HCG20 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 41483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 30910531 30910726 30910623 Y NA GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 36512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 31761868 31762215 31762042 Y LY6G5C VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48 NA NA NA NA VARS 138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 32050642 32051035 32051003 Y LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL NA NA NA NA TNXB 30076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA TNXB 4932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 32427743 32428120 32427936 Y PRRT1 NA NA NA NA NA GPSM3 266443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 33029858 33030076 33029983 Y HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DOA,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1 NA NA NA NA NA BRD2-IT1 93849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 33590898 33591125 33590902 Y ITPR3 BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 33950913 33951144 33951041 Y NA NA NA NA NA NA LEMD2 196000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 34099261 34099385 34099317 Y GRM4 NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 85831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 34512763 34512881 34512822 Y SPDEF SPDEF,RP3-391O22.3 NA NA NA NA SPDEF 9229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 34514432 34514838 34514655 Y NA SPDEF,RP3-391O22.3 NA NA NA NA SPDEF 7272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 34521580 34522143 34521703 Y NA RP3-391O22.3 NA NA NA NA SPDEF 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35152934 35153484 35153156 Y NA SCUBE3 UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE3 26706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35311267 35311540 35311417 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD DEF6,PPARD NA NA NA NA PPARD 2932 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35595279 35595514 35595405 Y FKBP5,FKBP5 NA NA NA NA NA RP3-340B19.2 73629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35622155 35622366 35622317 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 71994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 35681097 35681517 35681302 Y FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 12843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35866676 35867072 35866874 Y NA SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 20047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 MAPK13 NA NA NA NA MAPK13 6845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 36089275 36089599 36089442 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,PXT1,KCTD20,BRPF3 MAPK13 NA NA NA NA MAPK13 3987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN1A 13302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CDKN1A 95453 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 37024161 37024556 37024514 Y NA NA CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 MTCH1 72087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 37025964 37026081 37026014 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1 NA CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 MTCH1 73890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 37523438 37523883 37523533 Y NA NA NA NA NA NA CCDC167 57740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 39171657 39171958 39171719 Y NA KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 23268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 21224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 41994407 41994555 41994505 Y TFEB CCND3,TAF8 NA NA NA NA CCND3 21540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42086253 42086632 42086383 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 21725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 42090479 42090803 42090657 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 17554 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42219475 42219699 42219588 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 35872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 42259187 42259201 42259195 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 75584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42348376 42348588 42348501 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 69201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42358029 42358310 42358233 Y CCND3,TAF8,UBR2,TBCC,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 59479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42372266 42372455 42372353 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 45334 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 42898508 42898648 42898552 Y NA C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6 NA NA NA NA CNPY3 3570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 43058034 43058580 43058415 Y NA CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 16028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43635973 43636240 43636108 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 17288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE NA NA NA NA NA RP5-1120P11.3 60749 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA NA NA NA NA RP5-1120P11.3 59441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 43990134 43990470 43990221 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 NA NA NA NA RP5-1120P11.3 49180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 29897 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 27771 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 27165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 44020614 44020967 44020695 Y NFKBIE RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 18683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45299904 45300369 45300004 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45330194 45330521 45330358 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 13169 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45503698 45503963 45503769 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 160008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 45575518 45575910 45575680 Y NA NA RUNX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUPT3H 231828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 46291119 46291322 46291276 Y CLIC5,ENPP4,ENPP5,SLC25A27,RCAN2 NA NA NA NA NA ENPP5 154411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 46686763 46687109 46687028 Y PLA2G7,PLA2G7 PLA2G7 NA NA NA NA PLA2G7 14321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 46698621 46699122 46698847 Y PLA2G7,PLA2G7 PLA2G7 NA NA NA NA PLA2G7 2308 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 46825145 46825263 46825204 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G7 123715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 47004647 47005009 47004828 Y NA GPR110 NA NA NA NA GPR110 3090 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 47102503 47102708 47102571 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR110 94404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 GPR115 NA NA NA NA GPR115 32680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 49521190 49521511 49521254 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 5077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 49533704 49534052 49533813 Y C6orf141 C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 17591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 51642474 51642504 51642490 Y NA NA NA NA NA NA PKHD1 307919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr6 52261634 52261809 52261784 Y EFHC1 PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 21297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 52741236 52741253 52741245 Y NA NA NA NA NA NA GSTA4 116923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 52911792 52912057 52911925 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA FBXO9 2732 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53175462 53175877 53175681 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 36070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53191249 53191636 53191614 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 20311 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53199994 53200715 53200310 Y FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 11232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 53838542 53838554 53838548 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 181247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 56239637 56240034 56239826 Y NA COL21A1 DST IMR90 Hi-C 24141950 COL21A1 16858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 56459514 56459884 56459699 Y NA NA NA NA NA NA COL21A1 202622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 56573677 56574046 56573938 Y NA NA DST,BEND6,ZNF451 IMR90 Hi-C 24141950 DST 243380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 57267458 57267955 57267680 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 89855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 57327654 57327860 57327770 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 150051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 63124224 63124506 63124365 Y NA NA NA NA NA NA FKBP1C 794845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 65227331 65227644 65227620 Y NA NA NA NA NA NA RP11-59D5__B.2 712602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 71184425 71184878 71184622 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 63781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 71856502 71856731 71856607 Y B3GAT2 NA NA NA NA NA OGFRL1 139775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 76498619 76498787 76498703 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 41710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 79718228 79718616 79718429 Y PHIP NA NA NA NA NA PHIP 67337 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 80487784 80488033 80487927 Y NA NA NA NA NA NA SH3BGRL2 148784 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 80838245 80838506 80838365 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 23881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 81048044 81048318 81048128 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 233680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 82554529 82554698 82554614 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 94038 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr6 83106802 83107017 83106898 Y NA TPBG TPBG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPBG 35879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 83765933 83765959 83765946 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 9426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 84577292 84577766 84577526 Y CYB5R4 CYB5R4 NA NA NA NA CYB5R4 9930 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 86174491 86174911 86174693 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 16682 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 89470471 89470676 89470540 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 200672 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90031448 90031662 90031542 Y PNRC1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 28905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90797796 90798074 90797935 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 206553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90951466 90952108 90951796 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 52519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 92185644 92186055 92185825 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 890880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 100902140 100902274 100902209 Y SIM1 NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 73878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 101211686 101211775 101211752 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 115473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 105743987 105744339 105744163 Y NA NA NA NA NA NA PREP 104620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 105907845 105908047 105907966 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 58886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 106258484 106259193 106259052 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 273002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 106537985 106538349 106538117 Y PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 5790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 107306631 107306860 107306745 Y NA C6orf203 NA NA NA NA C6orf203 40547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 108143478 108143727 108143556 Y SCML4 NA NA NA NA NA SEC63 133666 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 108490902 108491184 108491048 Y NA OSTM1 NA NA NA NA OSTM1 5844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 108961437 108961619 108961493 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 82399 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 112097804 112098263 112098017 Y NA NA NA NA NA NA FYN 94392 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 112525181 112525504 112525289 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 48637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 112535932 112536093 112536020 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 38048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 112570641 112571001 112570894 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 3140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 112572318 112572651 112572607 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 1490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 112619249 112619579 112619380 Y LAMA4 LAMA4 LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 45108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 502546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 114318333 114318559 114318390 Y NA RP3-399L15.3,HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 11913 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 116767554 116767785 116767590 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA RWDD1 122745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 117785630 117785714 117785673 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 12650 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 118759105 118759218 118759162 Y NA NA NA NA NA NA CEP85L 270020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 119468463 119468799 119468540 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 119523776 119524187 119523976 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 55224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 119606195 119606320 119606258 Y NA RP3-354N19.3 NA NA NA NA RP3-354N19.3 17316 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 119661427 119661533 119661480 Y MAN1A1 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 7393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 122990249 122990620 122990435 Y NA NA NA NA NA NA SMPDL3A 117695 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 123017370 123017507 123017435 Y NA NA NA NA NA NA SMPDL3A 90808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 125579970 125580036 125580003 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 41246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 128577381 128577403 128577392 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 262467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 128754727 128754989 128754858 Y PTPRK,PTPRK NA NA NA NA NA PTPRK 84881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 128919743 128920041 128919928 Y PTPRK,PTPRK NA PTPRK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPRK 79873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 129822485 129822770 129822701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 206600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 129989152 129989478 129989315 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 39892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 171126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 131375294 131375442 131375382 Y NA EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 7020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 131480053 131480064 131480059 Y NA AKAP7 NA NA NA NA AKAP7 25247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 131595636 131595766 131595737 Y MED23,AKAP7 NA NA NA NA NA AKAP7 140830 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 132265494 132265746 132265620 Y NA CTGF NA NA NA NA CTGF 4767 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 132714700 132714987 132714844 Y NA MOXD1 NA NA NA NA MOXD1 5697 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 133020075 133020153 133020114 Y NA NA NA NA NA NA RPS12 113427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 135707385 135707414 135707388 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 109075 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136227219 136227382 136227241 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 381607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136688131 136688248 136688227 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 79142 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136729350 136729610 136729525 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 120361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136795244 136795664 136795596 Y MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA MAP7 74293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 136839838 136840084 136840036 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 29873 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136907576 136907759 136907659 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 37619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 136912004 136912367 136912204 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 42047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 137469913 137470185 137470040 Y IFNGR1 NA NA NA NA NA IFNGR1 68401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 138038588 138039125 138038794 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 147226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 138085431 138085825 138085756 Y NA NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 100526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 138776959 138777186 138777132 Y PBOV1 NA NA NA NA NA HEBP2 54291 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 138786189 138786282 138786236 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 63521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC28A 178098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 139578405 139578747 139578569 Y CCDC28A NA NA NA NA NA CITED2 115010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 139656661 139656994 139656829 Y NA CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 36763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 139854911 139854985 139854931 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 391847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 140984884 140985153 140985121 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1291127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 142644630 142644955 142644766 Y NA GPR126 NA NA NA NA GPR126 23639 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 143124343 143124671 143124507 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 139667 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 143134397 143134731 143134564 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 129607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 143143599 143143667 143143633 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 120671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 143154152 143154557 143154355 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 109781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 143166332 143166721 143166456 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 97617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 143171849 143172301 143172148 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 92037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 143221710 143222285 143222093 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 42053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 144302032 144302409 144302359 Y PLAGL1 NA NA NA NA NA PLAGL1 81326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 144644192 144644433 144644313 Y NA UTRN NA NA NA NA UTRN 39355 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 144657152 144657284 144657222 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 52315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 144675203 144675442 144675288 Y UTRN NA NA NA NA NA UTRN 70366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 146596232 146596574 146596403 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 266255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 146866760 146867250 146866919 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 3931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 148588961 148589218 148589102 Y UST SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 2222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 148715468 148715705 148715580 Y SASH1 NA NA NA NA NA SASH1 124028 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 148822303 148822649 148822378 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 230863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 149069640 149070024 149069807 Y UST UST NA NA NA NA UST 3176 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 149082428 149082821 149082685 Y NA UST NA NA NA NA UST 15964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 149537612 149537784 149537698 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 151248402 151248558 151248480 Y NA RP1-99E18.2 NA NA NA NA RP1-99E18.2 5546 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151365804 151366060 151365928 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 52605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151366767 151366942 151366858 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 51723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 151647622 151647708 151647665 Y NA NA ZBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 62975 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 313723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 152213732 152213746 152213738 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 442310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 152492317 152492580 152492431 Y SYNE1 NA NA NA NA NA SYNE1 464356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 153358098 153358156 153358117 Y SYNE1,RGS17 MTRF1L NA NA NA NA MTRF1L 36278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 153411582 153411939 153411751 Y MTRF1L RGS17 NA NA NA NA RGS17 38445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr6 154525556 154525879 154525580 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 303914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 155506879 155507250 155506955 Y NA NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 68608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 155509471 155509833 155509659 Y NA NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 66025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 157299126 157299275 157299174 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 202063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 157639062 157639495 157639253 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 103138 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158034114 158034488 158034146 Y NA NA NA NA NA NA SNX9 207808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158191942 158192437 158192205 Y SNX9 SNX9 SNX9,SYNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 49859 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr6 158375265 158375579 158375328 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 25309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr6 158895983 158896180 158896053 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 167591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158896747 158897140 158897018 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 166631 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 75680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159171374 159171393 159171384 Y NA NA NA NA NA NA EZR 67051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159211450 159211647 159211549 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 26797 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 159315379 159315577 159315478 Y NA C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 26408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159383408 159383511 159383422 Y NA RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 159434370 159434675 159434475 Y TAGAP RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 15151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 160399624 160399885 160399732 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1 IGF2R NA NA NA NA IGF2R 11493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 161678868 161678882 161678875 Y NA AGPAT4 MAP3K4 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT4 14211 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 161855973 161856365 161856002 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 163098494 163098513 163098505 Y PARK2,PACRG,PACRG PACRG,PARK2 NA NA NA NA PACRG 47651 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 163776894 163776984 163776946 Y NA NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 56048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 163840967 163841346 163841003 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 7935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr6 163972161 163972427 163972234 Y NA NA NA NA NA NA QKI 139129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 165988383 165988522 165988473 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 409569 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 166078176 166078539 166078376 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 319552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 166689031 166689408 166689363 Y PRR18 NA RPS6KA2 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D1 64671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 166795008 166795404 166795174 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 40929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 168558082 168558596 168558447 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 332480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 790893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr6 170089976 170090376 170090176 Y NA WDR27,C6orf120,PHF10 NA NA NA NA WDR27 9783 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 213646 214008 213845 Y NA FAM20C NA NA NA NA FAM20C 22677 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 475920 475996 475984 Y NA NA HEATR2,PRKAR1B MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 81937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 875702 875833 875757 Y SUN1,SUN1 SUN1,GET4 NA NA NA NA SUN1 22174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 949099 949177 949151 Y ZFAND2A,ADAP1 GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 34910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 988760 989207 989097 Y ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 3836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1101900 1102191 1102037 Y ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK GPR146 NA NA NA NA GPR146 19688 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1125303 1125884 1125584 Y GPER,GPER GPR146 NA NA NA NA GPR146 43091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1546424 1546775 1546565 Y NA MICALL2,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 1598591 1598955 1598779 Y NA MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA TMEM184A 134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2306623 2306831 2306646 Y MAD1L1 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA NUDT1 26766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2647516 2647699 2647608 Y SNX8,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 21886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2648242 2648706 2648452 Y LFNG TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 20879 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2778515 2778860 2778688 Y NA NA NA NA NA NA AC006028.11 94395 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2812534 2812892 2812775 Y SNX8,LFNG,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 60363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2842322 2842519 2842421 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 30736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 3490744 3491107 3491069 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 151664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 3699539 3699733 3699636 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 360459 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 3877207 3877255 3877231 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 538127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5379232 5379531 5379399 Y NA NA NA NA NA NA SLC29A4 67232 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5490349 5490801 5490564 Y NA TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 27304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 5731889 5732558 5731976 Y CCZ1 NA NA NA NA NA RNF216 86812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 7249464 7249811 7249639 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 54899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 7984706 7984926 7984839 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 11211603 11211773 11211701 Y NA AC004538.3 NA NA NA NA AC004538.3 7586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 11832549 11832888 11832860 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 36936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 12105634 12105996 12105845 Y NA NA NA NA NA NA TMEM106B 142871 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 12582030 12582229 12582042 Y NA SCIN SCIN IMR90 Hi-C 24141950 SCIN 25974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 12759260 12759464 12759402 Y NA ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 13818689 13818849 13818801 Y ETV1 NA NA NA NA NA ETV1 210201 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 13889552 13889950 13889896 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 139100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 16961680 16961908 16961842 Y NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 AGR2 90623 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 158534 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 17314276 17314419 17314335 Y AHR AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AHR 21827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 17315787 17316189 17315986 Y NA AHR,AC003075.4 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 20057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 18285971 18286293 18286132 Y SNX13,HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA SNX13 307847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18548166 18548343 18548284 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 570042 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA SNX13 585380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18583507 18583829 18583636 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 571466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18611788 18612131 18611882 Y HDAC9 NA NA NA NA NA TWIST1 543164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18678711 18679112 18678888 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 476183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 18688713 18688867 18688789 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA TWIST1 466428 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18847495 18847887 18847515 Y FERD3L NA NA NA NA NA TWIST1 307408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 18892477 18892482 18892480 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 262813 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 19746950 19747169 19747121 Y NA TWISTNB NA NA NA NA TWISTNB 240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20009712 20010019 20009851 Y NA RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 30327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20123446 20123761 20123595 Y TWISTNB,ITGB8 NA NA NA NA NA RPL21P75 83100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 20202226 20202605 20202544 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 52422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20217388 20217681 20217578 Y TWISTNB,MACC1 MACC1 NA NA NA NA MACC1 37346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 MACC1 NA NA NA NA MACC1 26480 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20242848 20242947 20242898 Y NA MACC1 NA NA NA NA MACC1 12080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20254261 20255002 20254926 Y MACC1 MACC1 NA NA NA NA MACC1 25 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20439186 20439753 20439406 Y NA NA NA NA NA NA ITGB8 70861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20447290 20447655 20447472 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 78965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 20638818 20638965 20638895 Y ITGB8 NA NA NA NA NA SP8 185540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 22258487 22259062 22258816 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 274785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 73122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 23060904 23061101 23061016 Y IL6,FAM126A FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 9155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA IGF2BP3 132005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 24092646 24092866 24092724 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 374241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 24813861 24813988 24813926 Y OSBPL3 DFNA5 DFNA5,OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 DFNA5 6617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 24860577 24860798 24860662 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 24924727 24925102 24925076 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 94151 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 25010250 25010501 25010375 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 8752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 26697823 26697978 26697927 Y NA NA NA NA NA NA AC004947.2 108382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA6,HOXA3 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 27176174 27176251 27176224 Y HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA6,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11 NA NA NA NA HOXA4 7756 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 27188378 27188640 27188509 Y NA HOXA-AS2,HOXA4,HOXA6,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOTTIP,HOXA13 NA NA NA NA HOXA6 156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 27206716 27206932 27206874 Y HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10 HOXA4,HOXA6,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOTTIP,HOXA13 NA NA NA NA HOXA10-AS 478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA6,HOXA3,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOTTIP,HOXA13 NA NA NA NA HOTTIP 4196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 27386345 27386573 27386562 Y NA AC004009.3 NA NA NA NA AC004009.3 12889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 27531639 27532015 27531830 Y NA EIF4HP1 NA NA NA NA EIF4HP1 35171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 27907829 27908035 27907932 Y NA NA NA NA NA NA AC004549.6 129815 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 122955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 23067 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 29041948 29042327 29041980 Y NA NA NA NA NA NA CHN2 117563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 29294942 29295238 29295004 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 61875 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 29486224 29486601 29486413 Y CHN2 NA NA NA NA NA AC007255.8 114685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 29534563 29534631 29534599 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 66655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 30220432 30220648 30220509 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 101275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 30387689 30388072 30387783 Y NOD1,ZNRF2 AC006978.6 NA NA NA NA AC006978.6 20915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 30514545 30514933 30514653 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 1467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 31033316 31033696 31033508 Y CRHR2,FAM188B NA NA NA NA NA GHRHR 57032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 31923409 31923701 31923603 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 609194 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.07357088014347 chr7 33079333 33079582 33079400 Y NA NA NA NA NA NA RP9 67431 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 35629037 35629048 35629043 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 104133 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 36325961 36326134 36326050 Y AOAH,SEPT7,EEPD1 NA NA NA NA NA ANLN 101281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 36331807 36331936 36331811 Y NA NA NA NA NA NA ANLN 95479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 36698240 36698520 36698401 Y AOAH NA NA NA NA NA NPM1P18 158044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 40129508 40130170 40129872 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 141872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 40946906 40947042 40946974 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 793664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 41087461 41087737 41087599 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 652969 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 41147789 41147992 41147892 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 592714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 41771654 41771750 41771721 Y NA INHBA NA NA NA NA INHBA 30948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 42026442 42026777 42026611 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 248692 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 42145452 42145673 42145563 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 129796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 42147213 42147355 42147278 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 128114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 42194393 42194489 42194441 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 80980 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 42896548 42896903 42896642 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 53001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43683947 43684262 43684105 Y POLM,DBNL,STK17A NA NA NA NA NA STK17A 63590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43835897 43835899 43835898 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 39618 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44297372 44297806 44297600 Y NA NA NA NA NA NA YKT6 58805 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 44654798 44655022 44654925 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA OGDH 10627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44658456 44658730 44658526 Y PURB,TMED4,OGDH DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA OGDH 14285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44674941 44675231 44675112 Y PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 30770 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44764845 44765151 44764999 Y RAMP3 ZMIZ2 NA NA NA NA ZMIZ2 21029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 44775082 44775384 44775244 Y OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2 ZMIZ2 DDX56,TMED4,OGDH,PPIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ2 10796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 44884505 44884603 44884554 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA H2AFV 1079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 46708141 46708157 46708149 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 748668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47302239 47302434 47302368 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 317722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 47390589 47390737 47390670 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 229419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47496897 47497228 47497063 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 122928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 47554592 47554957 47554775 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 65199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47573930 47574208 47574136 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 45948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 47644474 47644665 47644612 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 24318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA NA NA NA NA NA HUS1 190582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 48122110 48122308 48122209 Y NA C7orf57,UPP1 UPP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UPP1 3917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 48126389 48126700 48126545 Y NA UPP1 NA NA NA NA UPP1 164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 48127053 48127182 48127123 Y HUS1,UPP1,UPP1 UPP1 NA NA NA NA UPP1 828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 48429398 48429915 48429720 Y HUS1,UPP1,UPP1 NA NA NA NA NA ABCA13 220343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 50332008 50332237 50332142 Y IKZF1 NA IKZF1 K562 ChIA-PET 22265404 FIGNL1 183851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 86477 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 50769181 50769534 50769358 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 89625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 50905745 50905993 50905866 Y GRB10 GRB10 COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 46586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 50948563 50948792 50948678 Y GRB10 NA NA NA NA NA GRB10 89404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 51382954 51383359 51383079 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55063452 55063479 55063466 Y NA EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 21235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 55235458 55235690 55235573 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 150744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55253994 55254266 55254079 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 169280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr7 55600779 55601841 55601199 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55601949 55602581 55602160 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 RP4-725G10.3 NA NA NA NA RP4-725G10.3 14686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 64295695 64295915 64295830 Y ZNF680 ZNF138,ZNF273 NA NA NA NA ZNF273 32635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 66184244 66184571 66184390 Y NA RABGEF1 LOC493754,RABGEF1,LOC729156 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 39093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 66783772 66783944 66783858 Y NA STAG3L4,PMS2P4 NA NA NA NA PMS2P4 17878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 73132412 73132545 73132481 Y LAT2,BCL7B WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 410 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 73180066 73180446 73180256 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4 NA NA NA NA CLDN3 2154 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 LAT2,RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73686776 73686884 73686792 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14921 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73704690 73704803 73704747 Y CLIP2 RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 2885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 73866647 73867033 73866768 Y LAT2 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 73987997 73988205 73988054 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 81789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 CCL26,RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 75701168 75701283 75701226 Y NA STYXL1,MDH2,AC005077.12 NA NA NA NA MDH2 25799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 AC005077.12 59736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 76627484 76628238 76628092 Y NA NA NA NA NA NA FAM185BP 121195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 76874732 76875015 76874923 Y NA FGL2 NA NA NA NA FGL2 47589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 77199277 77199536 77199359 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 34685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 77316787 77316835 77316811 Y NA RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L-AS1 6747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 77908468 77908642 77908513 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 482346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 683799 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 82596075 82596467 82596271 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 193779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 83688045 83688341 83688303 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 411719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 83866816 83867276 83866988 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 252764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 84717663 84717972 84717818 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 96199 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 86287114 86287421 86287268 Y KIAA1324L NA NA NA NA NA KIAA1324L 399594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 86601476 86601934 86601661 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 85081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 86946167 86946460 86946286 Y NA TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 26371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 87898214 87898528 87898354 Y STEAP4 SRI,STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 35678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 87918906 87919150 87919043 Y SRI STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 15056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 90250368 90250899 90250569 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 25701 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 90253502 90253813 90253671 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 28835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 90305838 90306207 90306023 Y NA NA NA NA NA NA AC002456.2 81171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 90331258 90331430 90331344 Y NA NA CDK14,STEAP1 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 AC002456.2 106591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 92533719 92534002 92533863 Y SAMD9 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 CDK6 69811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 162543 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 94107956 94108189 94108073 Y NA CASD1 PPP1R9A,ASB4 IMR90 Hi-C 24141950 CASD1 28342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 94751086 94751478 94751282 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R9A 216572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 94781809 94782176 94781990 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R9A 247295 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 94799053 94799326 94799190 Y PPP1R9A,PPP1R9A NA NA NA NA NA PON2 263184 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 95645399 95645785 95645516 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 245533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 95877265 95877280 95877275 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 72179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 95913909 95914253 95914081 Y SLC25A13 SLC25A13 NA NA NA NA SLC25A13 35206 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 98557558 98557720 98557639 Y KPNA7 NA NA NA NA NA MIR3609 80285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 MYH16 SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 MYH16 24733 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA MYH16,ARPC1A NA NA NA NA MYH16 37506 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 99094567 99094648 99094634 Y NA PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5 NA NA NA NA ZNF394 1299 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 100142246 100142436 100142312 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 7412 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 100144720 100144853 100144769 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 100757831 100758077 100757885 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 10293 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 101045498 101045795 101045583 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 82394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101579917 101580029 101579973 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 122958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101586234 101586281 101586260 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 129275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101678350 101678537 101678444 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 221391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101784419 101784868 101784539 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 217451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 4.45137851606985 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 102056938 102057102 102057040 Y ORAI2 ORAI2,ALKBH4,LRWD1 NA NA NA NA ORAI2 14451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102071349 102071499 102071491 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 54 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 128808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 103277543 103277794 103277680 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A5 192919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 RP11-325F22.2 NA NA NA NA RP11-325F22.2 18121 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 28600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 104844953 104845066 104844998 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 192689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 104884738 104885065 104884890 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 152690 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 104960256 104960357 104960307 Y MLL5,SRPK2 NA NA NA NA NA SRPK2 77398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 105123568 105123582 105123575 Y NA PUS7,RINT1 NA NA NA NA PUS7 37132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 105705488 105705603 105705542 Y NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106009960 106010160 106010041 Y PIK3CG,NAMPT NA CCDC71L,SYPL1,NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 85188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106062610 106062971 106062823 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 137838 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106193303 106193479 106193401 Y NAMPT,PIK3CG NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 105963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106360961 106361340 106361088 Y NA NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 61519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 106413227 106413352 106413289 Y FLJ36031 NA CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 113785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 107079032 107079264 107079148 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 122665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 84760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 107554407 107554624 107554481 Y DLD DLD NA NA NA NA DLD 24992 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 108139925 108140311 108140116 Y PNPLA8,DNAJB9 RPL7P32 NA NA NA NA RPL7P32 8366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111156714 111156954 111156834 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 43619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111200844 111201149 111201059 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 271 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 111421395 111421784 111421410 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 220822 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111633053 111633148 111633101 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 211318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111745442 111745761 111745634 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 98705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111760791 111761135 111760993 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 83331 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111814530 111814935 111814850 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 29531 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 111819433 111819596 111819575 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 24870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 112404343 112404501 112404446 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 24146 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 115849891 115849987 115849939 Y NA TES NA NA NA NA TES 1344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 115873924 115874179 115873941 Y TES TES NA NA NA NA TES 25377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 115912136 115912451 115912327 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV2 NA NA NA NA CAV2 12983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 120589568 120589730 120589649 Y ING3 ING3 NA NA NA NA ING3 765 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 120644740 120645140 120644839 Y NA NA NA NA NA NA ING3 55937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 120723269 120723399 120723324 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 134466 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 121120093 121120403 121120217 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 85675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 121170860 121171233 121171047 Y PTPRZ1 NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 136442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 121951485 121951902 121951877 Y NA FEZF1-AS1,FEZF1 NA NA NA NA FEZF1 2740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 121955592 121955853 121955810 Y NA FEZF1-AS1,FEZF1 NA NA NA NA FEZF1 6847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 122148231 122148536 122148406 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P31 170808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 122273442 122273779 122273758 Y CADPS2 RPS26P31 NA NA NA NA RPS26P31 45565 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 122311337 122311706 122311522 Y NA RPS26P31 NA NA NA NA RPS26P31 7638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 123387168 123387479 123387315 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 47 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 123410612 123410856 123410679 Y NA WASL WASL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WASL 23491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 127663304 127663714 127663503 Y IMPDH1,GCC1,LRRC4 NA NA NA NA NA RBM28 318248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.2855412856706 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 128366228 128366292 128366260 Y CCDC136 CALU NA NA NA NA CALU 11054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 128915299 128915657 128915368 Y NA NA NA NA NA NA AHCYL2 52435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 129469996 129470292 129470140 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 120497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 129508183 129508482 129508331 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 82307 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 129540244 129540548 129540396 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 50241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130005893 130006126 130006010 Y MEST NA NA NA NA NA CEP41 74148 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA MIR335 NA NA NA NA MIR335 17840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130530611 130530821 130530670 Y NA NA MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 65248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 43640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 130583676 130584341 130584164 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 11728 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130697034 130697567 130697379 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95288 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130763104 130763469 130763293 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 29386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 131105085 131105454 131105312 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1-AS 94104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 131239359 131239620 131239490 Y NA PODXL NA NA NA NA PODXL 1356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 411440 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 132106504 132106703 132106622 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 224744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 132116252 132116592 132116280 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 214855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA EXOC4 212210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA EXOC4 287892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 133431716 133432104 133431827 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 377948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 103354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA NA NA NA NA NA AKR1B10 93033 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.33167446079849 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5180 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 135430585 135430983 135430863 Y FAM180A NA NA NA NA NA C7orf73 85341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 137661285 137661695 137661644 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 23118 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 138650306 138650635 138650366 Y SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 13429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139320693 139321014 139320839 Y PARP12,LUC7L2 NA NA NA NA NA ERHP1 103707 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139354231 139354464 139354322 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 120386 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 108924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 139366770 139367125 139366961 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA TBXAS1 107725 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139367160 139367381 139367316 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 107469 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 64179 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 139420496 139420947 139420749 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 NA NA NA NA NA TBXAS1 53903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139425752 139426584 139426362 Y TBXAS1,JHDM1D TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA TBXAS1 48266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 139431881 139432226 139432135 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA TBXAS1 42624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 139588015 139588387 139588262 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 112438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 140024684 140024714 140024699 Y NA NA NA NA NA NA RAB19 77129 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 140267387 140267618 140267517 Y DENND2A NA NA NA NA NA MKRN1 90018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 140336135 140336509 140336322 Y NA ADCK2,DENND2A DENND2A,MKRN1 IMR90 Hi-C 24141950 ADCK2 34444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 140572858 140572991 140572984 Y BRAF BRAF NA NA NA NA BRAF 49573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 140774728 140775101 140774915 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 61700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 368518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 142191082 142191483 142191195 Y NA NA NA NA NA NA TRBV7-3 54132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 142246179 142246560 142246372 Y EPHB6 TRBV7-3 EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 TRBV7-3 564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 142554592 142555033 142554706 Y EPHB6 TRBV30,EPHB6,TRPV6 NA NA NA NA EPHB6 3800 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,TMEM139,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 143048257 143048354 143048306 Y TRPV5,OR9A2,OR6V1,TAS2R40,TAS2R41,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA FAM131B 9509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 143856214 143856503 143856359 Y NA NA NA NA NA NA FAM115A 258923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 146054322 146054858 146054524 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA CNTNAP2 242869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 146086153 146086538 146086171 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 274700 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 146179295 146179312 146179304 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 367842 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 149191913 149192296 149192075 Y SSPO,ZNF746 ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 149266694 149267035 149266833 Y NA NA NA NA NA NA ZNF767 52808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 149323228 149323272 149323250 Y NA ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 3385 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 150063162 150063570 150063276 Y GIMAP2 LRRC61,ACTR3C,ZNF775 NA NA NA NA REPIN1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151622915 151623433 151623313 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA LOC100505483,PRKAG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 50705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151806252 151806472 151806362 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 85493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 151823102 151823484 151823293 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 102343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P3 66552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 25886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr7 152365221 152365384 152365303 Y MLL3 XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 5866 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 155137693 155138087 155137815 Y NA NA INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INSIG1 50207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA SHH NA NA NA NA SHH 22517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 155678402 155678700 155678446 Y NA NA LMBR1 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 75435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 155714561 155715080 155714837 Y NA NA LMBR1 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 111594 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 155744220 155744341 155744281 Y NA NA LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHH 141253 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 155744375 155744769 155744531 Y NA NA LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHH 141408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr7 155752755 155752934 155752845 Y SHH NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 149788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 151591 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157070019 157070314 157070105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 55761 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157103071 157103446 157103266 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 22629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157338058 157338440 157338352 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 211983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr7 157378993 157379067 157379007 Y DNAJB6,DNAJB6 NA NA NA NA NA DNAJB6 252918 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 269521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr7 158410794 158411171 158410984 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 84349 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 158603982 158604371 158604316 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 16573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 158609735 158609944 158609833 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 11000 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 1693574 1694042 1693752 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 1736486 1736690 1736554 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10 NA NA NA NA CTD-2336O2.1 25818 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 3643658 3643668 3643663 Y NA NA NA NA NA NA PAICSP4 999186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 6417141 6417596 6417436 Y ANGPT2 NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 146134 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 6605896 6606328 6606048 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 42018 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 8787622 8787836 8787719 Y NA MFHAS1 MFHAS1,FLJ10661,SGK223 IMR90 Hi-C 24141950 MFHAS1 38467 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 9912937 9913246 9913138 Y NA MSRA NA NA NA NA MSRA 3159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A NA NA NA NA NA AF131216.5 111244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 17665479 17665814 17665519 Y NA RP11-156K13.1 NA NA NA NA RP11-156K13.1 8625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 17708923 17709156 17709065 Y MTMR7,MTUS1 NA NA NA NA NA RP11-156K13.1 52069 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 18585215 18585382 18585299 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 354858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 18874321 18874582 18874494 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 65658 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 18993184 18993532 18993372 Y NA NA LOC100128993,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 52944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 19058200 19058838 19058472 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 110290 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 19066932 19067320 19067099 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 101808 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 19236420 19236600 19236592 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 67292 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 19266409 19266742 19266623 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA SH2D4A 97281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA CSGALNACT1 79760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 20119235 20119348 20119250 Y NA NA ATP6V1B2,LZTS1,DOK2,XPO7 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 66357 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 22240884 22241560 22241218 Y C8orf58 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 18122 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 22395519 22395867 22395693 Y PPP3CC RP11-382J24.2,SORBS3,PDLIM2 NA NA NA NA SORBS3 4632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 23210314 23210863 23210698 Y NA NA NA NA NA NA LOXL2 69978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 23405243 23405645 23405476 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 20925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 24013716 24014104 24013764 Y STC1 NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 81045 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 24624446 24624496 24624472 Y NEFM,NEFM,NEFL NA NA NA NA NA NEFL 188128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr8 24857844 24858008 24857898 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45220 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 24861094 24861317 24861155 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 48470 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 25092167 25092564 25092364 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 51929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 25242857 25243137 25242939 Y NA NA KCTD9 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD9 70855 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 25284653 25284746 25284700 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA KCTD9 29246 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 26123466 26123833 26123529 Y NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 23174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 27114452 27114997 27114718 Y NA NA NA NA NA NA TRIM35 51839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 27474556 27474730 27474657 Y NA CLU,SCARA3 SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLU 4008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 28198305 28198911 28198312 Y PNOC RPL5P22 NA NA NA NA RPL5P22 43105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 28890628 28890717 28890674 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 20735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 28930417 28930501 28930459 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 18965 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29198749 29199265 29198931 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 6920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29204481 29204724 29204678 Y NA DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 1461 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29492579 29492739 29492696 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 286394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29495067 29495424 29495202 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 288882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr8 29513029 29513506 29513190 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 306844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29513867 29514215 29514082 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 307682 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 7.52494939621331 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 29663943 29664184 29664064 Y DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 274539 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29758918 29759047 29759036 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 179676 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 29914930 29915195 29915084 Y NA TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA TMEM66 23528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 30273402 30273800 30273435 Y NA RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 32485 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 117727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 30363851 30364149 30364000 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 122934 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 30435369 30435466 30435408 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 78302 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 30462940 30463157 30463081 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 50611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 5.08728973265125 chr8 36629562 36629944 36629753 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150O12.1 779757 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 409083 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 407150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 37761676 37761790 37761689 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 6691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 38384926 38385302 38385064 Y HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86 NA NA NA NA NA FGFR1 60574 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 39957250 39957527 39957387 Y NA NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 51462 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 40032102 40032537 40032342 Y IDO1 C8orf4 NA NA NA NA C8orf4 23113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 40207660 40208018 40207838 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 198671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 41628099 41628173 41628135 Y ANK1 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 194212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 173635 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 41851790 41851810 41851800 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 55698 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 41882456 41882591 41882524 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 24917 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 42072486 42072556 42072531 Y NA PLAT AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 PLAT 9244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 42149533 42149606 42149596 Y NA RP11-231D20.2,IKBKB,POLB NA NA NA NA IKBKB 22713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.43765966356206 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr8 43097072 43097415 43097345 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 103516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 206989 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 48853752 48854057 48853918 Y NA PRKDC,MCM4 NA NA NA NA PRKDC 16686 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 48910578 48910837 48910684 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 8123 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 49541228 49541500 49541360 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 104370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 55573 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 52342191 52342269 52342254 Y NA RP11-119N19.1 NA NA NA NA RP11-119N19.1 3893 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-400K9.4 177527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 108243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 192966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 59768911 59769118 59769011 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 198508 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 69923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 60010619 60010999 60010857 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 18600 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 60832747 60832939 60832831 Y NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 RP11-163N6.2 594415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 62385898 62385985 62385942 Y CLVS1 NA NA NA NA NA ASPH 239170 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 62566892 62567143 62567071 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 58012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr8 62630891 62631364 62631206 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 5544 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 62937802 62937913 62937858 Y NA NA NA NA NA NA MIR4470 312455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 65281748 65282274 65281884 Y NA NA NA NA NA NA CYP7B1 427044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 13095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 67425057 67425564 67425100 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 84637 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 67445791 67446197 67446047 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 NA NA NA NA NA MYBL1 78285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 67447907 67448273 67448065 Y MYBL1,C8orf45 NA NA NA NA NA MYBL1 76209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 67454365 67454567 67454497 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 69915 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA CPA6 1015455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 69717744 69718003 69717874 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 1026343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 69983747 69983982 69983910 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 760364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-159H10.3 433222 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 71084923 71085298 71085131 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 70509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 71129648 71130032 71129927 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 115234 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 71569342 71569635 71569535 Y NA LACTB2,XKR9 NA NA NA NA LACTB2 9774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 74625237 74625516 74625377 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 32427 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96 NA NA NA NA LY96 25026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 77128503 77128819 77128661 Y NA NA NA NA NA NA LINC01111 188070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 77469082 77469378 77469240 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 122076 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 77589671 77589739 77589705 Y NA ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 1715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 77729936 77730258 77730097 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 136423 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 77731385 77731402 77731393 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 137872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 79661368 79661417 79661393 Y NA NA NA NA NA NA IL7 54341 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 79670742 79671103 79670995 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 44655 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 80032626 80032752 80032689 Y NA NA NA NA NA NA IL7 316868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 80216218 80216356 80216290 Y NA NA NA NA NA NA HEY1 461742 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr8 80251129 80251474 80251433 Y NA NA NA NA NA NA HEY1 426624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr8 80275634 80276026 80275830 Y STMN2 NA NA NA NA NA HEY1 402072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.07357088014347 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 81050951 81051119 81051010 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 90348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81059132 81059394 81059212 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 82073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 81394996 81395282 81395074 Y NA ZBTB10 ZBTB10 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB10 572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81615108 81615487 81615408 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 219254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81639602 81640013 81639931 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 243748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 81699574 81699876 81699725 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 303720 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81749885 81750162 81750025 Y ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 272141 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 81831009 81831253 81831114 Y ZBTB10,PAG1 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 191050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81933989 81934508 81934361 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 87795 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81938706 81938999 81938911 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 83304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 81962809 81963138 81963038 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 59165 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 82046824 82047197 82047011 Y NA PAG1 NA NA NA NA PAG1 24521 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 82673208 82673424 82673316 Y NA CHMP4C,ZFAND1 NA NA NA NA ZFAND1 30070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 85475808 85476019 85475813 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 541363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA CPNE3 178901 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 89611097 89611516 89611162 Y NA NA NA NA NA NA MMP16 272843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 90213226 90213534 90213296 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 554421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 90556024 90556173 90556098 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 211782 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 90627835 90627903 90627892 Y NA NA MMP16 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37B2.1 140052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 90787257 90787620 90787439 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 19282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 90849173 90849652 90849503 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 62435 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 90853789 90854138 90854056 Y RIPK2,OSGIN2 NA RIPK2,NBN,OSGIN2 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 57949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 91064955 91065319 91065136 Y NA CALB1 NA NA NA NA CALB1 40384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 91479808 91480381 91480048 Y NA NA NA NA NA NA TMEM64 321479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 94003281 94003430 94003355 Y NA NA C8orf83 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM92A1 705359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 94698311 94698521 94698416 Y NA FAM92A1 NA NA NA NA FAM92A1 10268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 94971751 94971853 94971800 Y GEM NA RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDP1 103716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 95089628 95089913 95089904 Y NA NA GEM,CDH17,RAD54B IMR90 Hi-C 24141950 KB-1247B1.1 123367 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 95271404 95271652 95271620 Y GEM GEM NA NA NA NA GEM 926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 96102684 96103088 96102778 Y PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 40944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 97571754 97571902 97571855 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 68175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 98032764 98033078 98032931 Y PGCP NA NA NA NA NA TSPYL5 255098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 98841899 98841938 98841919 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 33344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 99485745 99486120 99486088 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 181124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 99643221 99643590 99643555 Y NA NA NA NA NA NA STK3 309465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 100618724 100618876 100618800 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 285414 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 100901053 100901332 100901194 Y NA COX6C NA NA NA NA COX6C 2958 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 101476271 101476730 101476459 Y YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD46 93282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 101500158 101500422 101500292 Y NA NA RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 69590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 101801288 101801504 101801352 Y NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 68251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 82683 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102423654 102423774 102423714 Y NA NA GRHL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NACAP1 51632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.05985202763568 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 14330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 102543448 102543645 102543547 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 40788 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 103549503 103549899 103549700 Y NA KB-1980E6.3 UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1980E6.3 10535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 103743323 103743460 103743418 Y NA NA KLF10 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 77193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 100344 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1,KB-1639H6.2 NA NA NA NA KB-1639H6.2 27976 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 104457896 104458033 104457972 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA SLC25A32 32479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 105034041 105034154 105034124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 464424 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 105523001 105523289 105523222 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 75963 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 106444510 106444790 106444650 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 115590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 107485450 107485801 107485626 Y NA NA NA NA NA NA OXR1 204977 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 107614798 107614912 107614855 Y OXR1,OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 93329 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 107735956 107736285 107736121 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 27715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 107740443 107740789 107740616 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 32202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 109455148 109455290 109455182 Y NA EIF3E NA NA NA NA EIF3E 9586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 110248064 110248088 110248074 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 96465 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1,PKHD1L1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 110589431 110589605 110589518 Y NA EBAG9 NA NA NA NA EBAG9 39491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 110647152 110647483 110647459 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 54537 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 113119329 113119491 113119407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1267407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 1112249 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 116450341 116450508 116450425 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 369391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 116474696 116474834 116474765 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 345065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 116990613 116990894 116990712 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 170714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA NA TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 319739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr8 117630556 117630790 117630561 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 145952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 117664096 117664364 117664167 Y RAD21 NA NA NA NA NA UTP23 112378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 118776615 118776789 118776702 Y NA NA MED30,EXT1,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 245663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 119303956 119304407 119304075 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 181864 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 119319913 119320138 119320129 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 197821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119323544 119323883 119323714 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 201452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119536200 119536581 119536442 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 95653 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119781554 119781682 119781618 Y NA RPS26P35 TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 9114 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 119862438 119862804 119862573 Y NA NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 89998 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 120124666 120124779 120124723 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 50494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 120217398 120217670 120217528 Y MAL2 MAL2 NA NA NA NA MAL2 42125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR NA DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 DEPTOR 208931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121396509 121396604 121396557 Y NA NA NA NA NA NA MTBP 59036 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121442839 121443137 121442988 Y NA MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MTBP 12503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121456351 121456697 121456524 Y SNTB1,MTBP,MRPL13 MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MRPL13 709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121702901 121703232 121703165 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 120281 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121737162 121737328 121737239 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 86185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 122157265 122157468 122157378 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 333752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 122176324 122176668 122176537 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 352811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 122755244 122755615 122755430 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 103614 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 123155976 123156193 123156085 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 504346 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 123554742 123554841 123554763 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 236792 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 124050911 124051177 124051044 Y NA DERL1 NA NA NA NA DERL1 1486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 124407044 124407322 124407183 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 19268 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.27182243316281 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 124642629 124642836 124642770 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 91183 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 125212215 125212575 125212395 Y NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 50051 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 20536 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 125784373 125784835 125784614 Y ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 MTSS1,RP11-1082L8.4 MTSS1,NDUFB9,ZNF572 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1082L8.4 41089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 126232175 126232753 126232302 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130093 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 126283499 126283849 126283769 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 156714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr8 126322031 126322772 126322054 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 117791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126335524 126335526 126335525 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 105037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126372255 126372562 126372409 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 68001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126400704 126400965 126400873 Y NA TRIB1 TRIB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIB1 39598 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126525260 126525748 126525427 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 84697 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126526927 126527334 126527200 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 86364 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 126556751 126557301 126556981 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 116188 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 127325042 127325066 127325054 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 243054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 127574722 127575027 127574875 Y NA RP11-89K10.1,FAM84B NA NA NA NA FAM84B 6084 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 127640965 127641019 127640992 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 72327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 544207 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128185119 128185731 128185383 Y NA NA NA NA NA NA MYC 559949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA NA NA NA NA NA MYC 548552 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 MYC 526928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128227053 128227754 128227491 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYC 517926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 507948 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 128239593 128240207 128240123 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 505473 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 487418 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128264964 128265070 128265034 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 480610 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128305149 128305567 128305521 Y NA NA NA NA NA NA MYC 440113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 438397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.64963006908919 chr8 128309901 128310145 128310009 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 435535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr8 128311072 128311242 128311156 Y MYC NA NA NA NA NA MYC 434438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128352367 128352670 128352528 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 393010 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128519696 128520090 128519909 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 225590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 128680448 128680536 128680487 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 65144 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128910613 128910985 128910818 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 105834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128988975 128989172 128989023 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 31685 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 128999913 129000275 129000158 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 20582 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129114844 129115073 129114937 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 93987 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 129279863 129280046 129279972 Y NA NA MYC,MIR1208 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-25P 259006 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129436806 129436985 129436896 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 415949 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 129655139 129655338 129655239 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 634282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130501651 130501893 130501731 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 GSDMC 295241 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130558328 130558659 130558367 Y FAM49B NA NA NA NA NA GSDMC 238475 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130697904 130698138 130698105 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 GSDMC 98996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 GSDMC 76576 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 79332 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 100703 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 130907129 130907396 130907263 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 109995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 130975001 130975392 130975263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 51983 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130996669 130996803 130996748 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 130997889 130997894 130997892 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 29481 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 131027030 131027189 131027125 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 186 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 131089372 131089764 131089568 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 61997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131114299 131114376 131114317 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 86924 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131148484 131148822 131148654 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 121109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131201084 131201473 131201279 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 173709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 131204007 131204378 131204106 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 176632 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr8 131245360 131245556 131245456 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 208350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 131259857 131260132 131260043 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 193774 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131269679 131269819 131269766 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 184087 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131271304 131271556 131271460 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 182350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 131271729 131272058 131271952 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 181848 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 131296989 131297286 131297259 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 156620 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 131456841 131457348 131457080 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 2935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 133336709 133336808 133336784 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 349030 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 133689212 133689471 133689356 Y PHF20L1 LRRC6 NA NA NA NA LRRC6 3374 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 133846055 133846325 133846220 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 60437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134065338 134065765 134065507 Y TMEM71,PHF20L1,TG,SLA NA NA NA NA NA NDRG1 246500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134083709 134084409 134083868 Y NA NA NA NA NA NA NDRG1 227856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134230111 134230161 134230154 Y ST3GAL1 NA NA NA NA NA NDRG1 82104 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA NA NA NA NA NA NDRG1 78009 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 134368494 134368766 134368633 Y NDRG1 CTC-458A3.1,ST13P6 WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-458A3.1 32254 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134403538 134403742 134403629 Y ST3GAL1 ST13P6 TG,WISP1,PHF20L1,NDRG1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 ST13P6 14507 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134453521 134453599 134453592 Y SLA ST13P6 NA NA NA NA ST13P6 35272 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chr8 134513057 134513519 134513217 Y SLA,ST3GAL1 NA NA NA NA NA ST3GAL1 68664 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134532639 134533046 134532970 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 49137 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134538889 134539172 134539021 Y SLA,ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 43011 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 134552406 134552812 134552641 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 29371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 134562758 134562922 134562840 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 19261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr8 134664147 134664493 134664336 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 81964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 135352426 135352442 135352435 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 370850 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 135469388 135469911 135469674 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 253381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 135697258 135697603 135697427 Y NA ZFAT NA NA NA NA ZFAT 25689 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 136476552 136476867 136476709 Y NA KHDRBS3 NA NA NA NA KHDRBS3 8852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 140115684 140115926 140115805 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 597373 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 140830815 140831120 140830968 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 117516 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141073642 141073994 141073818 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 360343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141179581 141179847 141179769 Y EIF2C2,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 286831 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141190446 141190798 141190723 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 275880 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 141361313 141361457 141361385 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 105221 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 2.9675856773799 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141607900 141608150 141608005 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 88503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 141608422 141608817 141608788 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 89025 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141655804 141656158 141655981 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 136407 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 141725005 141725293 141725149 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 205608 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141800912 141801386 141801027 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA PTK2 208929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141849368 141849592 141849371 Y TRAPPC9 NA NA NA NA NA PTK2 160723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 141920743 141920803 141920776 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 89512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 142047873 142048201 142048171 Y PTK2 PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 37558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3 NA NA NA NA DENND3 38363 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 142182442 142182863 142182588 Y NA NA NA NA NA NA DENND3 57065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 142289630 142289814 142289772 Y NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 26590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 NA BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 51397 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA PSCA,JRK NA NA NA NA JRK 3491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 143809767 143809928 143809818 Y C8orf55 JRK NA NA NA NA JRK 48381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 143813380 143813410 143813405 Y GPIHBP1 NA NA NA NA NA JRK 51994 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 144302525 144302816 144302585 Y LY6H,LY6H,LY6H ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 24464 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 144629463 144629732 144629564 Y SPATC1,GRINA ZC3H3,GSDMD,TIGD5,EEF1D NA NA NA NA GSDMD 3645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA MAPK15 11039 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA MAPK15 2759 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 144843026 144843252 144843141 Y NA MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 SCRIB,PUF60 IMR90 Hi-C 24141950 FAM83H-AS1 28716 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr8 145129247 145129547 145129402 Y GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOSC4 1982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 145826020 145826191 145826170 Y NA NA NA NA NA NA C8orf82 73504 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145847503 145847804 145847651 Y SCRT1,KIFC2,ZNF34,ARHGAP39 NA ARHGAP39,ZNF251 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 61390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 145869377 145869481 145869429 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP39 39713 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145909522 145909717 145909620 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.58977804145352 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 616775 617021 616903 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 148484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 637253 637595 637415 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 168962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 2200625 2200752 2200689 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 187283 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 2839342 2839735 2839533 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 2506 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 3863148 3863487 3863216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 338425 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 374522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 4083576 4083986 4083877 Y GLIS3,GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 262406 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 4086123 4086410 4086330 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 259982 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 4241498 4241696 4241599 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 104696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 4340074 4340431 4340362 Y NA GLIS3 GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 GLIS3 5961 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 4937465 4937643 4937548 Y JAK2 JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 45390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5086081 5086478 5086137 Y CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2 NA NA NA NA NA JAK2 103048 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5488554 5488907 5488829 Y NA CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 19638 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5563943 5564345 5564035 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 NA NA NA NA NA PDCD1LG2 55398 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5582977 5583121 5583054 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 43904 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5895206 5895407 5895334 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 64089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 6485944 6485989 6485946 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 74793 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 13082855 13083077 13082983 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 194512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 249325 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr9 14575436 14575689 14575562 Y ZDHHC21 NA NA NA NA NA ZDHHC21 115780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 14813463 14813789 14813501 Y NFIB NA NA NA NA NA FREM1 95204 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 15999707 15999922 15999846 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 474026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16062752 16063225 16063009 Y NA NA CNTLN,C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 537071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr9 16321710 16321985 16321848 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 402827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16337405 16337786 16337534 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 387026 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 198319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16666623 16666991 16666807 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 57821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 17520540 17520838 17520658 Y NA NA NA NA NA NA SH3GL2 56242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 533941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 19704722 19704817 19704786 Y SLC24A2 NA NA NA NA NA RP11-363E7.3 242200 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 20784777 20784885 20784831 Y IFNW1 NA NA NA NA NA MLLT3 164235 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 20927571 20927855 20927623 Y NA NA NA NA NA NA IFNB1 148088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21491701 21492113 21492049 Y NA MIR31 NA NA NA NA MIR31 18071 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21496569 21496909 21496764 Y NA MIR31 NA NA NA NA MIR31 13275 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21674915 21675193 21674990 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 117247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21688773 21688952 21688863 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 111590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr9 21964976 21965347 21965178 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 27953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 21984231 21984381 21984318 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 8919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 22026827 22027085 22026888 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 16673 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 22148170 22148538 22148388 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 138016 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 22240757 22240884 22240825 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2A,C9orf53,CDKN2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 203956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 22792837 22793126 22792982 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA1 347997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 23622735 23622745 23622740 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 201590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 26243860 26243998 26243927 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 567004 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 26260192 26260607 26260418 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 583336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr9 26265141 26265461 26265258 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 588285 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 27460604 27461032 27460875 Y C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 66747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 28649799 28650020 28649948 Y LINGO2 NA NA NA NA NA C9orf72 1077935 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 32701589 32701944 32701680 Y NA NA NA NA NA NA NDUFB6 130429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 33164497 33164994 33164772 Y APTX,APTX,APTX,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 33770440 33770694 33770558 Y NA PRSS3,UBE2R2 NA NA NA NA PRSS3 21925 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 33814905 33815171 33814978 Y UBE2R2,UBAP1 UBE2R2 NA NA NA NA UBE2R2 394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 34454815 34455060 34454916 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1161 79964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 84777 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,MSMP,NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA MSMP 15370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 36166552 36166755 36166690 Y CREB3,TLN1 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA CLTA 22098 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 36294075 36294254 36294162 Y OR13J1,OR2S2 GNE RNF38,CLTA,GNE IMR90 Hi-C 24141950 GNE 19022 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 37197241 37197478 37197431 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78705 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr9 37902777 37903120 37902949 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 103343 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 37963992 37964293 37964120 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 102391 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 38035956 38036107 38036020 Y NA RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 30577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 46909 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 66835234 66835620 66835427 Y NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-764K9.4 1617755 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 68433806 68433981 68433894 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 19394 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 71162494 71162673 71162583 Y NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 155902 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA NA NA NA NA NA FXN 80021 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 141741 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 71795556 71796114 71795819 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 147381 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 72801648 72801771 72801710 Y MAMDC2 NA NA NA NA NA SMC5 70166 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 72871058 72871439 72871223 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 498 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 NA TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMC5 161826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 NA TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMC5 163624 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 74515794 74516103 74515949 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 8323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 75172533 75172850 75172692 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND5 194370 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 75764491 75764669 75764593 Y ANXA1 ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 4 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 75791521 75791823 75791639 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 26848 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 79018113 79018533 79018297 Y NA RFK,GCNT1 NA NA NA NA RFK 10680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 81627556 81627780 81627606 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 376439 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 84046577 84046973 84046817 Y NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 255247 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr9 84270722 84271111 84271084 Y NA TLE1,RP11-154D17.1 NA NA NA NA TLE1 31109 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 85587803 85587810 85587807 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 88282 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439K3.1 56276 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 86051693 86051979 86051837 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 99482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 88588670 88588806 88588674 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 34609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 91022048 91022386 91022218 Y NA SPIN1 NA NA NA NA SPIN1 20714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 91096507 91096802 91096655 Y NA NA NA NA NA NA SPIN1 95173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.80174844698065 chr9 93862627 93863018 93862659 Y SYK,SYK,NFIL3 NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 259177 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 94182259 94182597 94182338 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 1547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 94834730 94835154 94834963 Y OGN SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 40512 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 94866274 94866418 94866346 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 9248 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 95029374 95029660 95029516 Y NA IARS NA NA NA NA IARS 24378 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 95732704 95733017 95732861 Y NINJ1,C9orf89,FGD3 NA NA NA NA NA SUSD3 85972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 96701891 96702241 96702065 Y NA NA NA NA NA NA PTPDC1 88835 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr9 97411409 97411895 97411585 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 FBP1 FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBP1 10878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 97624826 97625112 97624969 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 137843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 97672080 97672130 97672087 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 185097 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 98075518 98075673 98075591 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 2318 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435O5.2 86740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 99051538 99051687 99051623 Y NA HSD17B3 NA NA NA NA HSD17B3 10747 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA HSD17B3,SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chr9 99182775 99182932 99182834 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 4164 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 99322452 99322838 99322645 Y ZNF782 NA HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 57274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 106488406 106488545 106488476 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 365996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 107628415 107628839 107628708 Y ABCA1 NA NA NA NA NA ABCA1 59679 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 107640582 107640899 107640765 Y NA ABCA1 NA NA NA NA ABCA1 47619 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 107954000 107954398 107954183 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A1 50505 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 109655422 109655715 109655552 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 32044 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 110266981 110267369 110267173 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 16218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 15956 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 516730 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 111482488 111482546 111482517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 95375 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 112262069 112262452 112262225 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 3479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 26333 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112813346 112813601 112813470 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 27708 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112827300 112827392 112827326 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 41662 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112831833 112832445 112832154 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 46195 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112903621 112903940 112903708 Y AKAP2 NA NA NA NA NA C9orf152 64529 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 112905689 112906067 112905829 Y NA NA NA NA NA NA C9orf152 62402 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 291586 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 113515835 113516213 113516024 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 282768 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 113645848 113645899 113645874 Y OR2K2 NA NA NA NA NA LPAR1 153082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 113680597 113681099 113680790 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 117882 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chr9 113753501 113753784 113753656 Y NA LPAR1 NA NA NA NA LPAR1 45197 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 113783956 113784262 113784109 Y NA LPAR1 NA NA NA NA LPAR1 14719 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114700203 114700566 114700273 Y DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2 UGCG NA NA NA NA UGCG 43157 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 114790932 114791388 114791198 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133886 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114836654 114837091 114837061 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 98597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 114960117 114960327 114960222 Y NA SUSD1 NA NA NA NA SUSD1 24429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 116304651 116305008 116304842 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 99640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 136243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117135053 117135760 117135486 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 129970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117137275 117137511 117137393 Y DFNB31,DFNB31 NA NA NA NA NA DFNB31 128219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117176279 117176545 117176480 Y TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1 NA NA NA NA NA DFNB31 89185 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117249092 117249487 117249472 Y NA DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 16243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 117314293 117314590 117314355 Y TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1 DFNB31,ATP6V1G1 DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1G1 33436 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117481130 117481475 117481264 Y TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 84931 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117566825 117567042 117566994 Y TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 419 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117671276 117671580 117671329 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 104870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 117751312 117751579 117751418 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA TNFSF8,TNFSF15 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 126957 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 118024698 118025071 118024956 Y NA NA NA NA NA NA TNC 146162 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 533952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 119404408 119404429 119404420 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 43152 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1075775 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 123834049 123834395 123834258 Y TRAF1,TRAF1,CNTRL CNTRL CNTRL,TRAF1 IMR90 Hi-C 24141950 CNTRL 746 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 123834475 123834791 123834714 Y TRAF1,TRAF1 CNTRL CNTRL,TRAF1,MEGF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTRL 350 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.69576324421708 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 126105825 126105916 126105882 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 76970 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 126291594 126291648 126291621 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 262739 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 126468286 126468378 126468332 Y STRBP,STRBP NA NA NA NA NA DENND1A 222053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 127156535 127156658 127156597 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 19065 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 127976903 127977044 127976974 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 16082 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 128274126 128274455 128274251 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 193058 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 128299092 128299304 128299184 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168209 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 129767664 129767889 129767775 Y NA NA NA NA NA NA RALGPS1 92611 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130341922 130342377 130342071 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2654 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130342769 130343108 130342811 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 3501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 13790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 130681632 130682091 130681875 Y FAM129B,TOR2A,CDK9 AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,DPM2 NA NA NA NA ST6GALNAC4 4315 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130718218 130718307 130718248 Y NA ST6GALNAC4,DPM2,FAM102A NA NA NA NA DPM2 19455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130731999 130732057 130732026 Y SLC25A25,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 8735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130736209 130736450 130736330 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 4342 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 130907941 130908020 130907981 Y SLC27A4,PIP5KL1,PTGES2 PTGES2,LCN2,C9orf16 NA NA NA NA LCN2 1330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 131900982 131901116 131901071 Y ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA CRAT 29514 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.95386682487211 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 ASB6 NA NA NA NA ASB6 42780 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132385793 132386123 132385875 Y C9orf106,TOR1B,PRRX2 ASB6,PRRX2 NA NA NA NA ASB6 16321 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132712659 132713039 132713009 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 90434 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 132758529 132758977 132758901 Y FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 44496 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 5.29926013817839 chr9 133711348 133711666 133711497 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 101007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 134603973 134604163 134604103 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 9298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 134604574 134605174 134604949 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 8287 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 134774819 134775116 134774968 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 161358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 134950793 134951083 134950938 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 2212 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 135016724 135016887 135016786 Y NA NTNG2 MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 18447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 135251810 135252069 135251940 Y NA SETX,TTF1,C9orf171 NA NA NA NA SETX 23438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 136001171 136001330 136001249 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 35971 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 136001357 136002105 136001796 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 35196 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 136999790 136999893 136999856 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 1303 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 137252796 137253042 137252967 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 45852 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 137305745 137306050 137305907 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 98801 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 138894941 138895015 138894978 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 43715 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 139024359 139024752 139024554 Y NA NACC2,C9orf69 C9orf69 MCF7 ChIA-PET 22265404 C9orf69 15628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 139434156 139434495 139434364 Y FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1 NA NA NA NA NOTCH1 3819 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 139556086 139556385 139556211 Y NA AGPAT2,FAM69B NA NA NA NA AGPAT2 23490 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 3.92145250225201 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA MRPL41 54881 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chr9 140463644 140464019 140463889 Y FAM166A,C9orf173 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 18923 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chr9 140689053 140689448 140689207 Y NA NA NA NA NA NA EHMT1 177609 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 7896783 7897141 7896963 Y VCX PNPLA4 NA NA NA NA PNPLA4 3003 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 9477403 9477544 9477474 Y FAM9B,TBL1X,LOC100288814 TBL1X NA NA NA NA TBL1X 48068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 9509355 9509595 9509475 Y NA NA NA NA NA NA TBL1X 80020 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 9700566 9700851 9700709 Y LOC100288814 NA NA NA NA NA SHROOM2 51645 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.741896419344975 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 9948395 9948719 9948558 Y NA WWC3 NA NA NA NA WWC3 32883 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 10547215 10547494 10547354 Y NA NA NA NA NA NA MID1 302279 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 11061735 11061767 11061751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120D5.1 65494 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 11359316 11359697 11359568 Y MSL3,MSL3,HCCS NA NA NA NA NA HCCS 231895 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 11360130 11360328 11360210 Y MSL3 NA NA NA NA NA HCCS 232709 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 11460430 11460509 11460495 Y AMELX NA NA NA NA NA ARHGAP6 221312 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 12890725 12890918 12890822 Y NA NA NA NA NA NA PRPS2 83251 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 12965371 12965491 12965432 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 25736 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 13128879 13129151 13129129 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 137652 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 13282012 13282232 13282116 Y TLR7 NA LOC100133123 IMR90 Hi-C 24141950 GPX1P1 113227 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 14584256 14584543 14584400 Y NA NA NA NA NA NA FANCB 304648 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 15354246 15354416 15354344 Y ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA PIGA NA NA NA NA PIGA 2570 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 15787454 15787695 15787561 Y NA ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 18900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 16176605 16176961 16176614 Y GRPR GRPR,RPL6P30 NA NA NA NA GRPR 36926 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 16671538 16671979 16671762 Y NA NA NA NA NA NA CTPS2 57080 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 16680488 16680840 16680664 Y NA CTPS2 NA NA NA NA CTPS2 48219 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 16769633 16769754 16769694 Y NA CTPS2,SYAP1,TXLNG NA NA NA NA TXLNG 32796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 17415371 17415448 17415410 Y NA NHS NA NA NA NA NHS 23828 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 20281516 20281702 20281609 Y SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3 RPS6KA3 NA NA NA NA RPS6KA3 1821 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 21962010 21962116 21962060 Y NA SMS NA NA NA NA SMS 5319 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 22013670 22013825 22013692 Y NA NA NA NA NA NA SMS 56979 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 22015039 22015434 22015124 Y NA NA NA NA NA NA SMS 58348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 23821683 23821773 23821728 Y NA ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1 NA NA NA NA SAT1 22393 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 23916832 23916979 23916884 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 APOO NA NA NA NA APOO 7078 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 24027801 24028121 24027962 Y NA EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 42712 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 24187705 24188069 24187889 Y NA ZFX NA NA NA NA ZFX 22415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 25664451 25664736 25664645 Y MAGEB18 NA NA NA NA NA POLA1 954415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 26656235 26656312 26656257 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P1 107834 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 29496854 29497166 29496936 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 893338 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 30302023 30302242 30302150 Y GK,CXorf21 NA NA NA NA NA FTLP2 344173 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 30676806 30676985 30676878 Y CXorf21,GK FTLP2,GK NA NA NA NA GK 7330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 31848875 31849137 31848986 Y NA NA NA NA NA NA TAB3 857674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 39612631 39612800 39612742 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 32590 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chrX 39767458 39767957 39767519 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 122068 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 162597 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 40633117 40633446 40633258 Y ATP6AP2,MED14 MED14-AS1,MED14 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 40007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA NDP 57840 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 32007 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 44877456 44877597 44877527 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 146699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 45210801 45210962 45210882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 151671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 45305345 45305614 45305509 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 57019 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 23860 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 11995 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 14174 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 45570603 45570921 45570704 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 32773 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 45645081 45645275 45645187 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 40551 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 45665386 45665505 45665456 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 43415 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 46120012 46120235 46120091 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 64845 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46435390 46435934 46435628 Y RP2,ZNF674,CHST7 ZNF674,CHST7 NA NA NA NA CHST7 4171 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46487332 46487848 46487692 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 56113 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46509009 46509283 46509068 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 77790 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46573129 46573518 46573302 Y SLC9A7 SLC9A7 NA NA NA NA SLC9A7 42972 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46651969 46652131 46652053 Y ZNF674,CHST7,RP2 SLC9A7,RP2 CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A7 35479 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 47374044 47374207 47374095 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 33699 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 47467971 47468313 47468102 Y NA ARAF,TIMP1,ELK1,UXT NA NA NA NA TIMP1 28259 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 48348956 48349364 48349102 Y PORCN,PORCN,FTSJ1 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 15986 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 48428427 48428710 48428643 Y LOC100509575 TBC1D25,RBM3,WDR13 NA NA NA NA RBM3 2127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 49008826 49009047 49008937 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP NA NA NA NA PLP2 17226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 49011448 49011844 49011738 Y GATA1,HDAC6,MAGIX GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 14429 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 53467183 53467489 53467297 Y FAM156A,TSPYL2,IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 7863 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 57490949 57491197 57490977 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 125072 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 57633706 57634078 57633955 Y NA ZXDB NA NA NA NA ZXDB 17437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 64464605 64464940 64464771 Y ZC4H2,ZC3H12B NA NA NA NA NA ZC4H2 212012 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 67382331 67382438 67382385 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 269317 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 67870380 67870574 67870477 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 4872 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA RNU1-56P,SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 70849459 70849557 70849508 Y CXCR3 NA NA NA NA NA OGT 98526 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA RPS4X 140764 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 71768805 71768968 71768887 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 21985 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 71785357 71785413 71785385 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 5540 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 RP13-36G14.3 NA NA NA NA RP13-36G14.3 46120 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA RP13-36G14.3 NA NA NA NA RP13-36G14.3 33360 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 75368142 75368530 75368366 Y NA NA NA NA NA NA LDHBP2 185714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA LPAR4 92243 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 79965324 79965547 79965436 Y BRWD3 NA NA NA NA NA BRWD3 97640 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.16583723039925 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 94559694 94559705 94559699 Y NA NA NA NA NA NA CALM1P1 192898 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 95228939 95229189 95229110 Y NA NA NA NA NA NA CALM1P1 476336 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 95690630 95690825 95690798 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 246837 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 98566116 98566278 98566197 Y NA NA NA NA NA NA PCDH19 1096993 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 99913933 99914424 99914133 Y SYTL4,SYTL4 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 16718 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 100664036 100664412 100664274 Y NA RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4 NA NA NA NA HNRNPH2 2753 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX6 77437 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 104559193 104559437 104559342 Y NA NA NA NA NA NA NRK 505099 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 105065481 105065866 105065484 Y NRK NRK NA NA NA NA NRK 945 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 106693156 106693529 106693316 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176208 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 106917807 106918338 106918010 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 48070 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 113170298 113170599 113170449 Y NA NA NA NA NA NA SSU72P1 452528 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA EEF1GP5 303352 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 119276319 119276451 119276385 Y FAM70A NA NA NA NA NA NKAPP1 100671 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.847881622108542 chrX 120720651 120720690 120720671 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 958646 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.423940811054271 chrX 124339178 124339332 124339255 Y NA RP1-161N10.1 NA NA NA NA RP1-161N10.1 2991 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 124340013 124340052 124340037 Y NA RP1-161N10.1 NA NA NA NA RP1-161N10.1 3826 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 1.37780763592638 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 430054 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 128942088 128942398 128942239 Y ELF4,ELF4,XPNPEP2 ZDHHC9 NA NA NA NA ZDHHC9 33487 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.317955608290703 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 131744643 131744985 131744814 Y USP26,HS6ST2 NA NA NA NA NA MBNL3 122647 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 132089755 132090160 132089782 Y NA NA NA NA NA NA GPC4 457358 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 132400242 132400521 132400363 Y NA NA NA NA NA NA GPC4 146997 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 139847313 139847514 139847421 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 421796 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 139855409 139855570 139855490 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 413740 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 410547 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 144930014 144930037 144930026 Y NA NA NA NA NA NA RP13-150K15.1 220278 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 149534295 149534593 149534360 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 6606 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.529926013817839 chrX 149865562 149865927 149865671 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 6127 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.635911216581407 chrX 152064300 152064566 152064432 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 66789 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 152065195 152065303 152065205 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 67684 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 153265554 153265740 153265647 Y NA HCFC1,TMEM187,IRAK1 NA NA NA NA IRAK1 17691 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 153829365 153829583 153829391 Y NA NA NA NA NA NA G6PD 55578 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 21348 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.211970405527136 chrX 153960949 153961180 153961050 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 16678 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,BRCC3 NA NA NA NA FUNDC2 3870 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrY 15547664 15548123 15547956 Y TMSB4Y NA NA NA NA NA AGKP1 1200853 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568 chrY 28555690 28555797 28555743 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 11806714 CAGE PC-3 hg19 FANTOM5 0.105985202763568