chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA C1orf159 NA NA NA NA C1orf159 44755 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 3374928 3375314 3374967 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 5938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 6034742 6034859 6034801 Y NA NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 15674 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 6040561 6040806 6040680 Y NA NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 9727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 6321567 6321961 6321896 Y THAP3,THAP3,GPR153 ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 2532 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 52933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8154517 8154933 8154754 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 70149 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8858188 8858497 8858477 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 17205 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 9318130 9318195 9318182 Y NA H6PD,SPSB1 NA NA NA NA H6PD 25296 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 9885367 9885695 9885655 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 2783 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 9912448 9912800 9912669 Y KIF1B,CLSTN1 CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 29864 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 10853986 10854555 10854168 Y ANGPTL7,CASZ1 NA NA NA NA NA TARDBP 215859 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 11050864 11051128 11051022 Y NA TARDBP C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 TARDBP 19286 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 11525445 11525525 11525485 Y NA PTCHD2 UBIAD1,PTCHD2 IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD2 11698 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 12193120 12193399 12193251 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 31661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 12579035 12579403 12579221 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 96334 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 12614115 12614248 12614183 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 61489 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 14087510 14087640 14087574 Y NA NA NA NA NA NA PRDM2 62817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 15208206 15208308 15208257 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 268720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA SPEN 3332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN NA NA NA NA SPEN 40400 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 16227810 16227873 16227842 Y C1orf64,SPEN NA NA NA NA NA SPEN 55451 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 4493 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 9980 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.69806042971821 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFAP2 73626 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 MFAP2 64547 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.20234139740706 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 19248887 19249092 19248943 Y NA ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 21612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 19276270 19276542 19276361 Y AKR7A2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 4638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 19926811 19926972 19926927 Y TMCO4 MINOS1,RPS14P3,NBL1 NA NA NA NA MINOS1 5334 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 21664400 21664833 21664668 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 5164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 21724067 21724372 21724186 Y NA NBPF3 ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 40249 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 22534891 22535254 22535198 Y NA NA EPHA8,C1QA,C1QC,ZBTB40,CDC42,C1QB IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 157771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 22692086 22692330 22692263 Y NA NA C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 84014 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 23357547 23357765 23357628 Y NA KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 13606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 23916918 23917225 23917105 Y HNRNPR ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 32633 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 24519628 24519970 24519647 Y GRHL3 NA MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 52017 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 25095502 25095845 25095665 Y NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 25654 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 25237083 25237520 25237460 Y NA NA NA NA NA NA RUNX3 52092 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 25319346 25319740 25319543 Y RCAN3,RUNX3 RUNX3 RUNX3 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 29734 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26003805 26004144 26003975 Y NA NA NA NA NA NA SEPN1 120523 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26123435 26123824 26123740 Y NA SEPN1 NA NA NA NA SEPN1 843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26453982 26454320 26454195 Y UBXN11,UBXN11 PDIK1L,ZNF593,RP11-96L14.7 NA NA NA NA PDIK1L 18318 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 NA C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-344H11.4 79301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 28204631 28205027 28204647 Y NA PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA RPA2 34230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 28389248 28389585 28389551 Y NA EYA3 NA NA NA NA EYA3 23622 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 32656692 32656709 32656701 Y ZBTB8A TXLNA,CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP NA NA NA NA CCDC28B 7278 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 32805161 32805466 32805332 Y PTP4A2,KHDRBS1,MARCKSL1 HDAC1,MARCKSL1,TSSK3 NA NA NA NA MARCKSL1 5181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 33232248 33232565 33232367 Y NA KIAA1522,S100PBP,YARS NA NA NA NA KIAA1522 26762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.69806042971821 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2,COL8A2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA ADPRHL2,COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA COL8A2 3531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 38408316 38408623 38408470 Y NA INPP5B,SF3A3 NA NA NA NA INPP5B 2106 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 38518708 38519047 38518874 Y NA FHL3,UTP11L,POU3F1 POU3F1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU3F1 8258 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 39598118 39598362 39598293 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 53130 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 39598673 39599090 39598722 Y MACF1 NA NA NA NA NA MACF1 53685 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 39629010 39629413 39629213 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 84022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 40081061 40081282 40081172 Y BMP8A PABPC4,HEYL NA NA NA NA HEYL 22335 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1,RP1-118J21.5 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 40402545 40402801 40402630 Y PPIE,BMP8B,TRIT1,SMAP2,ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,SMAP2,RLF,PPT1,CAP1,MFSD2A RP1-118J21.5,MFSD2A CAP1,PPT1,MFSD2A,MYCL1,TRIT1 IMR90 Hi-C 24141950 MFSD2A 16001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 41119684 41120000 41119793 Y NA RIMS3,NFYC NA NA NA NA RIMS3 9329 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 41914594 41914877 41914736 Y HIVEP3,SCMH1,SCMH1 NA SCMH1,EDN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXO6 89000 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 42204580 42205516 42204895 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 294080 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 43761236 43761355 43761298 Y NA EBNA1BP2 NA NA NA NA EBNA1BP2 26629 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 44378405 44378587 44378508 Y CCDC24,B4GALT2,ARTN ARTN,RP11-7O11.3,IPO13 NA NA NA NA ARTN 18405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 45323747 45323764 45323756 Y NA RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA PTCH2 17012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 46351629 46351956 46351793 Y C1orf190 NA NA NA NA NA MAST2 100970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 47102400 47102701 47102616 Y NA MKNK1,ATPAF1 NA NA NA NA MKNK1 21885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 48936089 48936471 48936227 Y NA RP11-329A14.1,SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 51475380 51475551 51475487 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 50963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 51475745 51476056 51475832 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 51328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 52341008 52341095 52341052 Y CC2D1B,OSBPL9 NRD1 NA NA NA NA NRD1 1382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7 NA NA NA NA GPX7 26603 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 54771290 54771540 54771415 Y NA NA MRPL37,CYB5RL IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 105612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 54804829 54805209 54805022 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 71943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 55327144 55327486 55327453 Y NA RP11-67L3.5,DHCR24 NA NA NA NA RP11-67L3.5 23062 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 56974162 56974535 56974381 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 134439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 59478866 59479252 59479013 Y NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 JUN 231081 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 60009140 60009290 60009214 Y CYP2J2 NA NA NA NA NA FGGY 248830 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 60174952 60174968 60174960 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 103490 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 61369297 61369400 61369351 Y NA NFIA NA NA NA NA NFIA 40366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 61516303 61516687 61516329 Y NA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 187372 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 61662774 61662930 61662815 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 333843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 63886654 63886800 63886727 Y NA NA NA NA NA NA ALG6 55393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA NA NA NA NA NA AK4 90560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 66619497 66619618 66619516 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 363300 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 67494221 67494361 67494358 Y SLC35D1,MIER1 SLC35D1 NA NA NA NA SLC35D1 23421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 39652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD13C 72329 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 75094879 75094982 75094978 Y NA NA NA NA NA NA TYW3 101854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 76541670 76541922 76541777 Y ST6GALNAC3 ST6GALNAC3 NA NA NA NA ST6GALNAC3 3266 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 77713696 77713788 77713742 Y NA PIGK,AK5 PIGK,AK5,ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 30581 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 77879256 77879430 77879369 Y NA NA NA NA NA NA AK5 133520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78132928 78133068 78133059 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 14036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78214350 78214750 78214605 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 8787 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78298815 78299027 78298921 Y NA NA NEXN IMR90 Hi-C 24141950 NEXN 53171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 79154444 79154658 79154581 Y NA IFI44 NA NA NA NA IFI44 40963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 83479623 83479625 83479624 Y NA NA NA NA NA NA TTLL7 983208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 85143846 85143980 85143979 Y SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP SSX2IP NA NA NA NA SSX2IP 10506 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 87190718 87190974 87190846 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 22459 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 88749888 88750086 88749988 Y NA NA LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 PKN2 397819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 89188530 89188764 89188647 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 40625 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 89382528 89382593 89382561 Y NA GTF2B NA NA NA NA GTF2B 26901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 91034804 91034815 91034810 Y NA NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 280392 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 93270252 93270588 93270467 Y NA EVI5,RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 EVI5 14291 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 93812976 93813243 93813111 Y NA DR1 NA NA NA NA DR1 3531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 94128177 94128297 94128262 Y NA NA NA NA NA NA MIR760 182091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 116701 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 96537517 96537524 96537521 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 372962 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 98315619 98315765 98315702 Y DPYD NA NA NA NA NA DPYD 68840 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 98677142 98677181 98677162 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 2839 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA LRRC39,DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 101725356 101725679 101725470 Y SLC30A7,SLC30A7 NA NA NA NA NA DPH5 235712 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 102141288 102141454 102141371 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556K13.1 110605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 106836458 106836476 106836467 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 760791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 108347574 108347600 108347587 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 158166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 108870455 108870699 108870577 Y NA NA SLC25A24 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC25A24 128984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 109469350 109469540 109469522 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 34566 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 109938897 109939079 109938975 Y TMEM167B,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 324 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 110142749 110143055 110142903 Y PSRC1,GNAT2 AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 13671 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr1 110420039 110420145 110420092 Y UBL4B CSF1 CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 30719 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA SLC16A4 3494 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 112015702 112015900 112015801 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 25704 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 114245723 114246101 114246018 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 114566071 114566240 114566155 Y NA OLFML3 SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 46008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 116191587 116191760 116191750 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 9013 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 117100772 117101124 117100940 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 10537 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 117367696 117367920 117367797 Y NA NA NA NA NA NA PTGFRN 82759 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 117368438 117368774 117368618 Y NA NA PTGFRN K562 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 81905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 117424835 117425013 117424940 Y PTGFRN PTGFRN PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 25666 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 117493512 117493635 117493571 Y NA PTGFRN CD101 IMR90 Hi-C 24141950 PTGFRN 42833 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 118653984 118654263 118654124 Y NA NA NA NA NA NA WDR3 183641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 118792385 118792801 118792430 Y NA NA NA NA NA NA WDR3 322042 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 120608824 120609208 120608880 Y NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 1032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 144987154 144987391 144987382 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 86795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 85772 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 80942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 73337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 145065676 145066007 145065842 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 8179 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,HFE2,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HFE2 13897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 146774989 146775112 146775013 Y NA NA NA NA NA NA FMO5 62289 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr1 147104963 147105320 147105142 Y NA ACP6 NA NA NA NA ACP6 35298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.86615408561449 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P,CA14 NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 151418157 151418544 151418397 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA POGZ 11397 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 152025147 152025277 152025212 Y NA S100A11 THEM4,S100A11,TCHH,TCHHL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 S100A11 6764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A16 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 153704694 153704943 153704839 Y NA INTS3,SLC27A3 NA NA NA NA INTS3 6151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 154910155 154910399 154910216 Y ADAR,PBXIP1,MTX1 PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 2688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156631732 156631960 156631846 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 2516 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 156645551 156645913 156645806 Y NES RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA NES 362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,DCAF8 NA NA NA NA PEA15 30850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 160332348 160332525 160332392 Y SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2 NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2 NA NA NA NA NHLH1 2332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 160344568 160344717 160344643 Y NA NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2 NA NA NA NA NHLH1 9711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 161155098 161155533 161155366 Y FCGR3A,FCGR3A,CD48,LY9,USF1,ARHGAP30,PPOX UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 9361 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 161155908 161155971 161155957 Y HSPA6,CD48,SLAMF7,CD244,USF1,ARHGAP30,FCGR2A,FCER1G UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 8923 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLA 92256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 162657724 162657971 162657804 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 58561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 164961189 164961330 164961260 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 438368 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 167135568 167135867 167135776 Y NA RP11-277B15.1 CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-277B15.1 5494 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 167424728 167425462 167425239 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 95542 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 169884881 169885211 169885155 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 23473 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 170604086 170604323 170604205 Y NA PRRX1 KIFAP3,GORAB,METTL11B IMR90 Hi-C 24141950 PRRX1 25546 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 170636506 170636902 170636792 Y PRRX1 PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 6637 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 171832189 171832290 171832196 Y DNM3 DNM3 NA NA NA NA DNM3 23568 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 171948446 171948693 171948570 Y NA NA NA NA NA NA DNM3 139825 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 172106187 172106635 172106273 Y NA MIR214,MIR199A2,DNM3OS NA NA NA NA MIR214 140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA C1orf105 95902 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA C1orf105 60641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA C1orf105 59672 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 172369341 172369683 172369640 Y NA C1orf105,PIGC NA NA NA NA C1orf105 18145 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.36187311792565 chr1 172468818 172469289 172468991 Y NA NA DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIGC 57588 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 172828423 172828792 172828524 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,PRDX6,ZBTB37 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 417193 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 173008475 173008781 173008627 Y TNFSF18 NA NA NA NA NA PRDX6 435624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 174061489 174061703 174061596 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 64845 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 175224481 175224839 175224660 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 64346 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 178231351 178231525 178231428 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 170487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 179555221 179555646 179555325 Y TDRD5,TDRD5,TDRD5 NA NA NA NA NA HNRNPA1P54 130771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 127822 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 128843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 180895607 180895967 180895721 Y NA NA NA NA NA NA STX6 94080 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 182580570 182580950 182580946 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 9027 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr1 183855028 183855346 183855094 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 163465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 184794829 184794875 184794854 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 72782 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 184820980 184820991 184820986 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 98933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 185811948 185812170 185812059 Y NA NA NA NA NA NA HMCN1 110265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 144099 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 94789 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 192921207 192921501 192921311 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 78092 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA B3GALT2 NA NA NA NA B3GALT2 26920 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 193418722 193419025 193418873 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 264938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 198526099 198526320 198526230 Y PTPRC ATP6V1G3 NA NA NA NA ATP6V1G3 18024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 198845240 198845523 198845521 Y NA NA NA NA NA NA PTPRC 239439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA PTPRC 244437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 198888798 198889070 198888879 Y PTPRC NA NA NA NA NA PTPRC 282997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 199146939 199147083 199147011 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 207186 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 200401856 200401944 200401900 Y NA ZNF281 NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 24672 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 200831452 200831819 200831500 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 124766 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 201768733 201769083 201768901 Y NA IPO9,IPO9-AS1 IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 27186 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA MYOG,ADORA1,MYBPH NA NA NA NA MYBPH 41695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 205410761 205411314 205411209 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 11768 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 205413132 205413367 205413271 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 9715 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 205413830 205414535 205414383 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 8547 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208029774 208030104 208029939 Y NA NA NA NA NA NA CD34 52643 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208314292 208314663 208314422 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 101002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208349565 208349646 208349606 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 66019 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208412497 208412696 208412591 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208415648 208415868 208415811 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 209331001 209331148 209331080 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 108420 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 209833148 209833823 209833488 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 G0S2 NA NA NA NA G0S2 12942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 210425971 210426288 210426079 Y NA SERTAD4 NA NA NA NA SERTAD4 21827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 210567003 210567330 210567209 Y SYT14 RNU5A-8P NA NA NA NA RNU5A-8P 21392 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 211423824 211424043 211423934 Y NA RCOR3 NA NA NA NA RCOR3 5676 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 211712804 211713120 211712963 Y NA SLC30A1 NEK2,RD3,SLC30A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 36964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 211912030 211912428 211912229 Y NA NA NA NA NA NA NEK2 65070 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 212113260 212113497 212113379 Y NA NA NA NA NA NA INTS7 93387 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 212993371 212993544 212993485 Y NA NSL1,TATDN3,FLVCR1-AS1,FLVCR1 NA NA NA NA TATDN3 30201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 215225203 215225566 215225385 Y NA KCNK2 NA NA NA NA KCNK2 48085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 216938634 216938811 216938777 Y NA NA NA NA NA NA ESRRG 370286 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 219264603 219264919 219264762 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 80267 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 219722653 219722988 219722821 Y NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 377467 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 221219642 221220032 221219744 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 169943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 221904432 221904724 221904722 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 8794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 5.7151843004736 chr1 224458940 224459060 224459002 Y NA NA NA NA NA NA NVL 57029 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 226086980 226087330 226087189 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 9752 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A MIXL1 NA NA NA NA MIXL1 25811 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 226890098 226890374 226890232 Y NA ITPKB NA NA NA NA ITPKB 34650 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 228686214 228686407 228686300 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 13452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 229570562 229570652 229570607 Y NA NA NA NA NA NA NUP133 71451 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 230212552 230213069 230212856 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 21016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 232073278 232073500 232073389 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 312717 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 13.6155861275989 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 327540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 234668851 234669143 234668986 Y NA NA NA NA NA NA TARBP1 56002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 234887087 234887295 234887193 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 143816 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 192181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 235126160 235126371 235126266 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 163880 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA TOMM20 NA NA NA NA TOMM20 22507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 236162583 236163199 236162893 Y GPR137B NA NA NA NA NA NID1 63263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 236866415 236866949 236866639 Y NA ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 18661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 297328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 241646029 241646431 241646168 Y KMO FH NA NA NA NA FH 34630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 243487001 243487352 243487082 Y CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA NA SDCCAG8 69681 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 243806306 243806448 243806376 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 205933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA AKT3 203127 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 246007613 246007922 246007768 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 660692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 246249452 246249819 246249636 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 418795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 246316735 246316955 246316845 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 246730569 246731007 246730621 Y AHCTF1,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 2823 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 246751015 246751281 246751184 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 23269 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA NA NA NA NA NA ZNF669 59904 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 247507326 247507475 247507401 Y NA ZNF496 ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 14178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 247521124 247521311 247521171 Y NA ZNF496 NA NA NA NA ZNF496 27976 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr10 3497590 3497951 3497729 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 284587 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 3845250 3845852 3845788 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19777 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 6017924 6018316 6018090 Y RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA NA NA NA NA NA ANKRD16 88055 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 6074786 6074988 6074887 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA NA NA NA NA NA RBM17 53962 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 10831008 10831167 10831105 Y NA SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 3776 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 10914098 10914350 10914196 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 79155 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 10953472 10953723 10953520 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 118529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 11054573 11055101 11054777 Y CELF2,CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 219630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 376484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 11284467 11284694 11284626 Y CELF2 NA NA NA NA NA USP6NL 367059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 13388296 13388525 13388411 Y NA PHYH NA NA NA NA SEPHS1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 14592372 14592822 14592665 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 90231 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 14594148 14594360 14594257 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 92007 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA MLLT10 503174 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 28620190 28620210 28620200 Y WAC NA MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 WAC 199212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 75067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 29980945 29980999 29980955 Y NA SVIL NA NA NA NA SVIL 42711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 33291145 33291309 33291227 Y NA ITGB1 ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 1411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 50243711 50244078 50243895 Y NA NA NA NA NA NA VSTM4 77476 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 50385443 50385844 50385615 Y C10orf128 NA NA NA NA NA VSTM4 63889 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 50388476 50388821 50388639 Y C10orf128 NA NA NA NA NA VSTM4 66922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 50536610 50536839 50536655 Y NA C10orf71 NA NA NA NA C10orf71 31423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 50791340 50791620 50791497 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 45756 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 60422217 60422354 60422286 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 151317 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA PHYHIPL NA NA NA NA PHYHIPL 15376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 93060 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 64502250 64502733 64502570 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 59783 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 125539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 65231848 65231938 65231929 Y NA JMJD1C,REEP3 NA NA NA NA JMJD1C 8126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr10 66085994 66086251 66086123 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 424989 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 67848646 67848843 67848745 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 834921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 68137896 68138170 68138033 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 545594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 69550767 69550960 69550901 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 44964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 71077076 71077284 71077148 Y DDX21,HK1 HK1 NA NA NA NA HK1 49336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 71283312 71283690 71283502 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN15 74083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 72254726 72255114 72254952 Y KIAA1274 NA NA NA NA NA EIF4EBP2 92591 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 72435631 72435850 72435741 Y ADAMTS14 NA NA NA NA NA RP11-399N22.3 116429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B,UNC5B-AS1 NA NA NA NA UNC5B-AS1 1736 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA UNC5B-AS1 50192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 74544491 74544662 74544597 Y NA NA NA NA NA NA MCU 94602 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,FAM149B1,ECD NA NA NA NA P4HA1 23026 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 74991679 74992005 74991988 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 14615 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 75222632 75223003 75222818 Y NA RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 30280 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 75887856 75888019 75887938 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA AP3M1 20802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 77189888 77190112 77189953 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 30224 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr10 79526031 79526385 79526077 Y NA NA KCNMA1,POLR3A,DLG5 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 157993 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr10 80944867 80945213 80944956 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 118075 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 81138677 81139093 81139046 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 33452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 82176099 82176325 82176238 Y C10orf58 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA FAM213A 10514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 88713984 88714363 88714198 Y SNCG SNCG NA NA NA NA SNCG 2012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30,ANKRD1 NA NA NA NA ANKRD1 2278 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 92783161 92783490 92783369 Y NA NA PCGF5,ANKRD1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 104128 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr10 93643606 93643969 93643849 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 23271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 95327729 95327872 95327806 Y O3FAR1 RBP4 NA NA NA NA RBP4 31629 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 97239836 97240237 97240046 Y SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 78934 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 97308667 97309047 97308880 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 10124 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 100019738 100019959 100019849 Y C10orf28 LOXL4 NA NA NA NA LOXL4 6048 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 100993810 100993952 100993927 Y NA HPSE2 NA NA NA NA HPSE2 191 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 104909684 104910071 104909878 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 40985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 105448441 105448500 105448481 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 164801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 105849432 105849729 105849581 Y GSTO1,GSTO1,CCDC147,SLK,MEIR5,MEIR5 SFR1 NA NA NA NA SFR1 30087 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 108349452 108349469 108349463 Y NA NA NA NA NA NA ITPRIP 2253290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 111650301 111650520 111650491 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 30791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 112582466 112582715 112582708 Y SMC3,ADRA2A PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 46850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 112668861 112669237 112669049 Y PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 7795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 114693939 114693964 114693952 Y NA TCF7L2 TCF7L2,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 14045 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 114823862 114824125 114823994 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 115853 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM1 187173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 118034123 118034494 118034359 Y GFRA1,GFRA1,GFRA1 GFRA1 NA NA NA NA GFRA1 3144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 118743836 118743980 118743960 Y PNLIP,PNLIPRP1,PNLIPRP2,HSPA12A,KCNK18,VAX1,KIAA1598 NA NA NA NA NA KIAA1598 140117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 120997743 120998072 120997908 Y NA GRK5 NA NA NA NA GRK5 32642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 125800015 125800214 125800088 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 50992 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 128995351 128995518 128995467 Y NA NA NA NA NA NA DOCK1 403373 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 130324634 130324907 130324771 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 401985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 131644019 131644215 131644117 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 115890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 131688064 131688242 131688188 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 71863 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr10 131758339 131758817 131758766 Y EBF3 EBF3 NA NA NA NA EBF3 1288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 134043390 134043516 134043464 Y JAKMIP3 NA NA NA NA NA STK32C 99835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B,C10orf91 NA NA NA NA PWWP2B 13298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 134225356 134225596 134225555 Y NA PWWP2B,C10orf91 NA NA NA NA PWWP2B 16684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 4510 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA RP11-432J24.5,INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.5 1137 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr10 134373708 134374041 134373810 Y PWWP2B,INPP5A RP11-432J24.5,INPP5A NA NA NA NA INPP5A 24384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr10 134638718 134639092 134638998 Y NA NA NA NA NA NA INPP5A 289394 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 1870283 1870513 1870420 Y CTSD,MOB2 TNNI2 NA NA NA NA TNNI2 12064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 1988846 1989279 1989052 Y IGF2,TH,IGF2,IGF2,SYT8,TNNI2,TNNI2,TNNT3 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 22338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 1991146 1991394 1991373 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 24638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 2635710 2635980 2635769 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 83244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 6667820 6668268 6668018 Y OR6A2,DCHS1 RRP8,ILK,TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA DCHS1 6817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 7600846 7601278 7601083 Y NA NA CYB5R2 IMR90 Hi-C 24141950 PPFIBP2 68317 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 9294937 9295497 9295430 Y ZNF143,TMEM9B,NRIP3,TMEM41B,IPO7,DENND5A DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA DENND5A 10000 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 7574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 9786985 9787566 9787311 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 9146 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr11 10135641 10135992 10135817 Y NA NA LOC283104,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2 177762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 58841 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 11326137 11326382 11326218 Y NA NA NA NA NA NA ZBED5 447794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 12821812 12822118 12821851 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 127843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA RASSF10 143692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 15219194 15219222 15219209 Y INSC NA NA NA NA NA CALCA 227294 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 16001674 16002038 16001856 Y SOX6,SOX6 NA NA NA NA NA C11orf58 630641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 16073747 16074032 16073896 Y SOX6,SOX6 NA NA NA NA NA C11orf58 558647 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 16411231 16411535 16411524 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 221144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 16457424 16457760 16457639 Y SOX6,SOX6,SOX6 NA NA NA NA NA C11orf58 174919 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 16574843 16575024 16574936 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 57655 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 16625688 16626709 16626131 Y SOX6,SOX6 C11orf58 SOX6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf58 5970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 17878699 17879035 17878754 Y NA NA NA NA NA NA KCNC1 124340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,LDHC NA NA NA NA LDHC 5256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 24448444 24448604 24448524 Y NA NA LOC100500938 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 1598599 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA RP11-1L12.3 NA NA NA NA RP11-1L12.3 16106 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 27350498 27350718 27350608 Y BDNF CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 32697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 27657269 27657593 27657433 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 84012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 28010741 28010769 28010755 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 100161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 31835564 31835985 31835634 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA PAX6 1524 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 33723473 33723762 33723676 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 32229 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 35053022 35053283 35053109 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105134 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 35094290 35094666 35094566 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 CD44 63751 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 35101226 35101524 35101367 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 56893 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 44359184 44359364 44359336 Y ALX4 ALX4 EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 ALX4 29468 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 44547557 44547712 44547661 Y NA CD82 EXT2,CHST1,ACCS,CD82,TSPAN18 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 36265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr11 46015298 46015560 46015479 Y NA NA GYLTL1B,PEX16 K562 ChIA-PET 22265404 GYLTL1B 74126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 48193627 48193663 48193645 Y OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NA NA NA NA NA PTPRJ 193514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 57371918 57372022 57371970 Y SLC43A1,SERPING1 UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1 NA NA NA NA SERPING1 9058 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 57549936 57550183 57550060 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 31221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 58942854 58942992 58942911 Y OR4D6,OR5A2,OR5A1 FAM111A,DTX4 NA NA NA NA DTX4 5951 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 58991962 58992424 58992241 Y FAM111A,MPEG1,PATL1,OSBP NA NA NA NA NA DTX4 55059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 60931528 60932206 60931841 Y SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 4439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA VWCE,DAK,DDB1 NA NA NA NA VWCE 4484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 61600948 61601213 61601130 Y CYBASC3 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 6158 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RCC2P6 75008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL NA NA NA NA GANAB 935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 62624183 62624258 62624224 Y NA STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 2665 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4,AP003774.6 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 64147622 64147982 64147957 Y NA RPS6KA4,AP003774.6 NA NA NA NA AP003774.6 13321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 64363562 64364093 64364079 Y NA NA NA NA NA NA NRXN2 124567 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 64427372 64427588 64427564 Y BATF2 NA NA NA NA NA NRXN2 61072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.02568580613308 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65492459 65492791 65492625 Y NA KAT5,RNASEH2C RNASEH2C MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNASEH2C 6041 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65583188 65583268 65583228 Y NA SNX32,MUS81,CFL1 NA NA NA NA SNX32 15844 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 65739201 65739551 65739464 Y NA SART1,BANF1,EIF1AD NA NA NA NA SART1 12041 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 66080826 66081241 66080906 Y CD248 RAB1B,CNIH2,YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8 NA NA NA NA CD248 1274 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.01712387075539 chr11 66844888 66845141 66844944 Y RHOD KDM2A NA NA NA NA KDM2A 39599 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 67032465 67032551 67032477 Y NA ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 584 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 67388322 67388349 67388342 Y NA GSTP1,NDUFV1,NUDT8 NA NA NA NA NUDT8 7052 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 68516686 68516842 68516764 Y NA MTL5 NA NA NA NA MTL5 190 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 68924761 68925032 68924956 Y TPCN2 NA ORAOV1,CCND1,MYEOV IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 110396 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 69264597 69264784 69264706 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 189071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 69517228 69517437 69517319 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA FGF19 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA NA NA NA NA NA RNF121 66878 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 INPPL1,PHOX2A NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA PHOX2A NA NA NA NA PHOX2A 48427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 72868553 72869130 72868609 Y NA FCHSD2 STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 17247 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 74609863 74609988 74609926 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48257 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 74814562 74814987 74814735 Y ARRB1 SLCO2B1 XRRA1,LOC100507050 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO2B1 4954 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 SLCO2B1 NA NA NA NA SLCO2B1 47796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 75581181 75581426 75581320 Y MAP6 NA NA NA NA NA UVRAG 56969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 83337920 83338003 83337962 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 342470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 85310773 85310968 85310871 Y NA TMEM126B,TMEM126A NA NA NA NA TMEM126B 26661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 85484523 85484565 85484546 Y NA SYTL2 NA NA NA NA SYTL2 35619 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 86025840 86026030 86025935 Y NA C11orf73 NA NA NA NA C11orf73 14587 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 86229748 86229843 86229795 Y NA NA NA NA NA NA ME3 151835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 86328094 86328121 86328109 Y NA NA NA NA NA NA ME3 53557 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 86841159 86841223 86841164 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 94273 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 87133739 87133898 87133788 Y NA NA GRM5,FZD4,LOC100506368 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 386853 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 87637570 87637859 87637715 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 431096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 91958948 91959142 91959077 Y FAT3 NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 969988 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 92001294 92001526 92001411 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 927604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 92083144 92083535 92083339 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 845595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 95801750 95802104 95801927 Y NA NA NA NA NA NA MTMR2 145271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 102430698 102430798 102430749 Y BIRC3,MMP20 NA NA NA NA NA TMEM123 91583 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 NA NA NA NA NA TMEM123 291951 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 108600247 108600616 108600285 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 66495 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 110002516 110002895 110002708 Y RDX ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 40429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 112752270 112752453 112752335 Y NCAM1 NA NA NA NA NA NCAM1 77544 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 88293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 115373347 115373590 115373469 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 85 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 116061103 116061309 116061204 Y NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00900 431758 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 116857252 116857500 116857432 Y SIK3 AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 47267 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 117050933 117051273 117050997 Y SIDT2 PAFAH1B2,SIDT2,TAGLN,PCSK7 NA NA NA NA SIDT2 3484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 142361 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 119703414 119703632 119703459 Y NA NA TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 105620 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 120363124 120363469 120363220 Y NA GRIK4 NA NA NA NA GRIK4 16999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 121307019 121307215 121307117 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 13697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 121335104 121335660 121335286 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 14192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 121337416 121337512 121337466 Y NA SORL1 NA NA NA NA SORL1 16504 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 121712728 121712747 121712738 Y NA NA MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 255805 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 122100877 122101142 122101009 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 115846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 122177708 122178168 122177914 Y NA NA NA NA NA NA RP11-820L6.1 113411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 123002865 123003144 123002952 Y NA NA NA NA NA NA CLMP 60845 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 123008344 123008427 123008386 Y CLMP NA NA NA NA NA CLMP 55562 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 123353850 123354009 123353930 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 54792 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 123513712 123514126 123514044 Y NA SCN3B NA NA NA NA SCN3B 9826 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 123519920 123520232 123520133 Y OR8D4,SCN3B SCN3B NA NA NA NA SCN3B 3720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125037243 125037532 125037366 Y NA PKNOX2 NA NA NA NA PKNOX2 4660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125145861 125146105 125145988 Y PKNOX2,FEZ1 NA NA NA NA NA PKNOX2 113278 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125146411 125146772 125146529 Y NA NA NA NA NA NA PKNOX2 113828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 125904022 125904031 125904027 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 27199 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 6658 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125971052 125971538 125971358 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 39822 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 125985079 125985242 125985162 Y CDON,ST3GAL4 NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 53849 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 125997963 125998111 125998066 Y NA NA CDON IMR90 Hi-C 24141950 CDON 66733 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 126001132 126001515 126001324 Y CDON NA CDON IMR90 Hi-C 24141950 CDON 69902 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 126180283 126180636 126180409 Y NA FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 8070 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 127859699 127859802 127859739 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 595651 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr11 128149754 128150077 128149906 Y NA NA KCNJ1,FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 305376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 128294765 128294892 128294836 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 160561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr11 128373673 128373898 128373813 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 81555 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 128927593 128927968 128927781 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ5 168342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 129730176 129730501 129730339 Y TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 32984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 129993921 129994394 129994167 Y PRDM10,APLP2 NA NA NA NA NA APLP2 56189 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 132574661 132574990 132574797 Y OPCML NA NA NA NA NA RP11-713P17.3 1325177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 133017323 133017551 133017437 Y NA NA NA NA NA NA RP11-713P17.3 882616 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 134688539 134688830 134688760 Y NA NA NA NA NA NA ACAD8 567150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 586697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 NA NA NA NA NA CCDC77 197951 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 1691461 1691635 1691524 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 9696 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 1744932 1745222 1745077 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 43601 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 2401865 2402116 2401991 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 290164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 3334572 3334968 3334768 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 15476 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 3913952 3914004 3913978 Y NA EFCAB4B NA NA NA NA EFCAB4B 41967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 4333452 4333582 4333514 Y EFCAB4B,PARP11 CCND2,CCND2-AS2 CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 47356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 4380607 4381576 4381205 Y PARP11,CCND2 CCND2-AS2,C12orf5 NA NA NA NA CCND2 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr12 4406037 4406342 4406147 Y PARP11,CCND2 CCND2,CCND2-AS2,C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 22029 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 4425726 4425978 4425852 Y NA CCND2,CCND2-AS2,C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 2393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 4880425 4880454 4880440 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA9 124164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 5542952 5543350 5543174 Y NTF3,NTF3 NTF3 NA NA NA NA NTF3 3674 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 5589537 5589706 5589616 Y NA NA NA NA NA NA NTF3 50259 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 7058106 7058233 7058157 Y ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7127 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG NA NA NA NA NA PEX5 252901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 56603 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 10538589 10538605 10538596 Y KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4 RP11-277P12.9,RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 24221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 12408234 12408471 12408413 Y NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 9475 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 12711400 12711706 12711553 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP16 1611 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 13643087 13643098 13643093 Y NA NA NA NA NA NA EMP1 295437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 15758880 15759078 15758989 Y NA NA NA NA NA NA RERG 259271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 15916950 15917280 15917185 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 115983 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 RP11-444D3.1 NA NA NA NA RP11-444D3.1 39718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 24952536 24952732 24952634 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 147661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 24959393 24959656 24959538 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 140737 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 24993015 24993329 24993020 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 107064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 26392228 26392317 26392290 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE41 116168 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 26676709 26676991 26676900 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 307140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 28275745 28275985 28275876 Y NA CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 8197 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 29194633 29194954 29194755 Y NA NA CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 105082 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 43506983 43507174 43507167 Y ADAMTS20 NA NA NA NA NA RP11-25I15.1 436057 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46571692 46571878 46571769 Y SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 89922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 47670448 47670925 47670783 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 198714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 47702305 47702647 47702429 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 230571 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 47787551 47787794 47787709 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 310050 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 48201899 48202220 48202071 Y SENP1,PFKM,ASB8 RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 22695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C,COL2A1 TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 COL2A1 825 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA COL2A1 NA NA NA NA COL2A1 35013 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 49198499 49198542 49198521 Y LALBA ADCY6,CACNB3,DDX23 NA NA NA NA CACNB3 7035 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 49449678 49450138 49449974 Y CCDC65,DHH PRKAG1,RHEBL1 NA NA NA NA RHEBL1 11670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 1270 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 50019010 50019299 50019155 Y FMNL3 NA NA NA NA NA PRPF40B 59009 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50100082 50100376 50100305 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA FMNL3 134 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 50924450 50924587 50924549 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 27682 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 51177941 51178161 51178051 Y POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 22448 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 52146424 52146626 52146525 Y NA NA NA NA NA NA ACVRL1 152066 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 52242460 52242886 52242778 Y SLC4A8,ANKRD33 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 55806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 52257879 52258204 52258030 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 40488 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 35384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 96681 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 52575658 52575765 52575707 Y NA NA NA NA NA NA KRT81 107553 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 54012118 54012371 54012242 Y PFDN5 ATF7,RP11-972K6.1 NA NA NA NA ATF7 5828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54072437 54072838 54072741 Y CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1 RP11-972K6.1,ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 3245 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.37043505330334 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 54149784 54149995 54149877 Y PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 30255 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 54150655 54151094 54151055 Y NA CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 31126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC13-AS,HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54384983 54385161 54385072 Y TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9 HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC9 1518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54400493 54400742 54400596 Y HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 90 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54400746 54401119 54400931 Y NA HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 54415475 54415883 54415632 Y NA HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 8754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54746696 54746816 54746742 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 53710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54749329 54749578 54749455 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 56343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 55435077 55435406 55435254 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R1A 454634 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 56069411 56069730 56069504 Y ZC3H10,MMP19,BLOC1S1 METTL7B,BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7 NA NA NA NA METTL7B 3600 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA SPRYD4 17160 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.36187311792565 chr12 57735992 57736374 57736348 Y NA NA R3HDM2 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 86414 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 59364972 59365264 59365118 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150C16.1 52552 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 59478697 59478823 59478760 Y NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150C16.1 166277 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 62605397 62605543 62605465 Y C12orf61 USP15 NA NA NA NA USP15 46576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 62609319 62609899 62609601 Y C12orf61,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 42220 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 65063507 65064284 65063678 Y C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 61214 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 65959414 65959817 65959668 Y NA RP11-221N13.3 HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 34832 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 65975670 65975966 65975841 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 18683 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66004084 66004433 66004259 Y NA RP11-221N13.3,RP11-230G5.2 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 9435 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RPSAP52 67090 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66311039 66311339 66311117 Y HMGA2 NA NA NA NA NA RPSAP52 92285 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66319590 66319707 66319630 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RPSAP52 100836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 67396755 67396891 67396823 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 64051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68617256 68617530 68617393 Y NUP107,MDM1,IL22 IL26 NA NA NA NA IL26 71 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.35331118254795 chr12 68660485 68660819 68660713 Y IL26,IL22 IL26 NA NA NA NA IL26 42884 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68661732 68662103 68661918 Y NA IL26 NA NA NA NA IL26 44131 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68705071 68705359 68705215 Y IL22 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.01712387075539 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr12 68761672 68762016 68761874 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 37511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68790406 68790697 68790550 Y IL22 NA NA NA NA NA MDM1 66245 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68799801 68800197 68799999 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 NA NA NA NA NA MDM1 75640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr12 68848831 68849142 68848987 Y RAP1B NA NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 124670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68894598 68894866 68894732 Y NA NA RAP1B,IL26,NUP107 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 107753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 68925817 68926196 68926068 Y IL22,MDM1,NUP107,MDM2 NA MDM1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 76423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA NUP107 7524 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr12 69122207 69122406 69122269 Y NA NUP107,SLC35E3 NA NA NA NA SLC35E3 15480 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr12 69150078 69150205 69150130 Y NA SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 12192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 69163885 69164101 69163897 Y SLC35E3 SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 25999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr12 69200663 69200867 69200763 Y CPSF6,CPM,CPM,MDM1,RAP1B,NUP107,SLC35E3,MDM2 MDM2 NA NA NA NA MDM2 707 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 69220588 69221011 69220784 Y NA MDM2 NA NA NA NA MDM2 20632 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 69227269 69227544 69227345 Y SLC35E3 MDM2 NA NA NA NA MDM2 27313 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69291565 69291701 69291633 Y NA NA NA NA NA NA CPM 71649 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 69311802 69312020 69311891 Y CPM NA NA NA NA NA CPM 51330 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 69312043 69312322 69312251 Y NA NA NA NA NA NA CPM 51028 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69313266 69313951 69313772 Y CPM CPM NA NA NA NA CPM 49399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 69316243 69316419 69316405 Y RAP1B,CPM,CPM CPM NA NA NA NA CPM 46931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr12 69345630 69345835 69345831 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,CPM,YEATS4,CPSF6,CPM CPM NA NA NA NA CPM 17515 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr12 69376854 69377042 69376929 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,CPM,YEATS4,FRS2,CPSF6 CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 13504 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.35331118254795 chr12 69401246 69401453 69401353 Y RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 37896 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 5.21090333278475 chr12 69402346 69402644 69402509 Y RAP1B,SLC35E3,CPM,LYZ,CPM CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 38996 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr12 69403025 69403359 69403177 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 39675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.36187311792565 chr12 69418832 69418872 69418851 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 55482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.87471602099219 chr12 69446892 69447106 69446965 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPM 83542 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69449484 69449868 69449621 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPM 86134 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69593360 69593487 69593424 Y NA CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 37830 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 10.4218066655695 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA RP11-1143G9.2 NA NA NA NA RP11-1143G9.2 10349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.52140483844423 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ RP11-1143G9.2,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 26375 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69731953 69732266 69732062 Y CPM,CPM,LYZ YEATS4 LYZ K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 19217 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr12 69806775 69807146 69806965 Y NA NA NA NA NA NA FRS2 54983 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 69839614 69839824 69839719 Y CPSF6,FRS2,CCT2,CCT2,YEATS4 FRS2 FRS2 IMR90 Hi-C 24141950 FRS2 22305 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.52996677382193 chr12 70007126 70007281 70007265 Y LRRC10 MIR3913-1,CCT2 NA NA NA NA CCT2 30012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr12 70013289 70013310 70013299 Y CPSF6,YEATS4,FRS2,CCT2,CCT2,RAB3IP MIR3913-1,CCT2 NA NA NA NA CCT2 36175 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.69806042971821 chr12 70156698 70156941 70156820 Y NA RAB3IP NA NA NA NA RAB3IP 26237 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 70329390 70329536 70329438 Y NA NA PTPRB,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3IP 198929 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 70360720 70360860 70360789 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320P7.2 211258 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 70382625 70382986 70382644 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA CNOT2,KCNMB4,PTPRB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-320P7.2 189132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.8575921502368 chr12 70388549 70388859 70388715 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA PTPRB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320P7.2 183259 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr12 70393617 70393726 70393672 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320P7.2 178392 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.19377946202936 chr12 70633612 70633702 70633681 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 1072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 70634012 70634396 70634290 Y RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 72690281 72690495 72690341 Y TPH2,TRHDE TRHDE-AS1 NA NA NA NA TRHDE-AS1 23594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 75986624 75986957 75986791 Y NA NA PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 83208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 76256965 76257237 76257100 Y NA NA PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 168475 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 76938616 76938968 76938946 Y NA OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 12621 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 77156465 77156658 77156516 Y NA ZDHHC17 NA NA NA NA ZDHHC17 1097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 77425555 77425931 77425698 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 31429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 77771188 77771377 77771281 Y CSRP2 NA NA NA NA NA E2F7 313828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 78134909 78135174 78135084 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 87511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 78398192 78398473 78398333 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 175507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 79324302 79324765 79324409 Y SYT1,SYT1,SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 758112 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA MYF6 124893 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 81077970 81078246 81078130 Y NA MYF6,MYF5 NA NA NA NA MYF6 21031 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 85674653 85675022 85674864 Y ALX1 ALX1 NA NA NA NA ALX1 2768 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 89737833 89738159 89738081 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 6889 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 89740084 89740418 89740292 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 89978345 89978700 89978451 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA GALNT4 60306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 92484962 92485088 92485023 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 52261 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 92863747 92864031 92863808 Y NA NA NA NA NA NA BTG1 326074 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 93002299 93002373 93002366 Y NA NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 318734 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 93305938 93306210 93306048 Y CLLU1OS EEA1 NA NA NA NA EEA1 14897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 94201755 94201874 94201816 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 132604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 94581330 94581746 94581508 Y TMCC3,PLXNC1 NA CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS2P1 234999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 138437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 95037542 95037565 95037554 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 4773 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 96311989 96312050 96312020 Y NA NA NA NA NA NA SNRPF 61283 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 96828064 96828263 96828182 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17 LTA4H,ELK3,CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 35726 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA NA LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 TMPO 88618 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 105043287 105043477 105043345 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA SLC41A2 307045 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 108877904 108878160 108878033 Y SSH1,SELPLG,SELPLG FICD NA NA NA NA FICD 28802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 109003329 109003729 109003508 Y NA ISCU,TMEM119 NA NA NA NA TMEM119 13233 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG NA NA NA NA UNG 37197 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 110540205 110540443 110540322 Y NA C12orf76,IFT81 ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFT81 19697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 110735237 110735389 110735298 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 18676 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 110809213 110809452 110809351 Y NA ANAPC7 NA NA NA NA ANAPC7 30083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA ARPC3 18728 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 114200256 114200532 114200390 Y NA RP11-438N16.1 NA NA NA NA RP11-438N16.1 8956 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 116308098 116308555 116308414 Y NA NA RBM19,TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P7 279310 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-2 825 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 120912483 120912692 120912652 Y NA COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 6830 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 121581639 121581946 121581768 Y P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7 NA NA NA NA NA P2RX4 63714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1 NA NA NA NA ORAI1 24037 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122225058 122225273 122225168 Y KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 14036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122229588 122230472 122229850 Y KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 8837 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr12 124823049 124823325 124823212 Y FAM101A NA NA NA NA NA NCOR2 226810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 174399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 124963399 124963744 124963551 Y UBC NA NA NA NA NA NCOR2 86391 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 22142 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 12507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 129296403 129296565 129296505 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 9963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 132265042 132265050 132265046 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 71416 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA NA NA NA NA NA ULK1 83375 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 133005224 133005492 133005298 Y NA MUC8 P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1 IMR90 Hi-C 24141950 MUC8 43234 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 133034888 133034907 133034894 Y NA MUC8,FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90 Hi-C 24141950 MUC8 13819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr12 133178906 133179327 133179219 Y NA NA NA NA NA NA POLE 82624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 20624080 20624132 20624092 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM2 93270 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA GJA3 88714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 20692936 20693199 20693068 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39989 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA FGF9 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 22249294 22249707 22249608 Y FGF9 RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 5772 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr13 22249979 22250230 22250030 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 6457 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 22583629 22583981 22583861 Y EFHA1 NA NA NA NA NA FGF9 340107 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.68949849434052 chr13 23485782 23486124 23485811 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 1666 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 24131522 24131823 24131734 Y SACS TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 10686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA TNFRSF19 146492 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH SPATA13 SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 23252 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr13 26265597 26265968 26265783 Y NA NA NA NA NA NA NUPL1 391935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 26456265 26456499 26456340 Y CDK8 NA NA NA NA NA RNF6 338292 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 27706563 27707017 27706898 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 37016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 27734553 27734882 27734861 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 9151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 28873154 28873233 28873194 Y FLT1 NA NA NA NA NA EEF1A1P3 86504 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 28968527 28968805 28968721 Y PAN3 NA NA NA NA NA FLT1 98460 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 29067304 29067673 29067579 Y NA FLT1 NA NA NA NA FLT1 39 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 29106089 29106574 29106395 Y NA FLT1 FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLT1 38824 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 29638535 29638553 29638543 Y MTUS2 MTUS2 NA NA NA NA MTUS2 41787 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 30060513 30060580 30060547 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A1 107245 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 30812389 30812594 30812492 Y NA NA NA NA NA NA PRDX2P1 55690 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA USPL1 254727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 32501315 32501650 32501483 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 82337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 34216569 34217156 34216982 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 173030 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 37881013 37881265 37881086 Y POSTN NA LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 POSTN 289716 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 41811647 41811915 41811781 Y NA KBTBD7,MTRF1 NA NA NA NA MTRF1 23827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 42646001 42646399 42646206 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 197890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 43662550 43662935 43662749 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA DNAJC15 67211 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 43796435 43796650 43796543 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 201096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 43952045 43952412 43952203 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 356706 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 44201276 44201468 44201373 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 157576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 44740455 44740696 44740576 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 288628 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 47149300 47149814 47149489 Y NA LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 23997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13 NA NA NA NA TRIM13 29452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 50696626 50696754 50696746 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 1102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 50703291 50703484 50703377 Y NA DLEU1,DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 5435 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 340742 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 127240 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 71905168 71905271 71905222 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 341928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 72359501 72359862 72359720 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 79468 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 72366390 72366725 72366609 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 72605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 72375972 72376220 72376216 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 63110 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 74339681 74339964 74339912 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 366430 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 74706134 74706569 74706487 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 80324347 80324731 80324539 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 271060 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 80357144 80357292 80357207 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 303857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 80934191 80934539 80934365 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 21105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 80936113 80936309 80936180 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 23027 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 81084769 81085090 81084930 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 171683 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 94472931 94472950 94472936 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 595836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 94976563 94976881 94976571 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 269630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 95919951 95920261 95920073 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 31426 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 99135278 99135706 99135580 Y NA NA NA NA NA NA STK24 92488 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 99880215 99880463 99880360 Y GPR183 UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3 NA NA NA NA H2AFZP3 14203 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 69832 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 100607991 100608280 100608183 Y PCCA,ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 13883 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 101310141 101310446 101310274 Y TMTC4 TMTC4 NA NA NA NA TMTC4 14901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 107571886 107572151 107572019 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 258101 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr13 111863058 111863169 111863068 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 98152 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 114809032 114809271 114809129 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 86815 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr13 114886123 114886363 114886224 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 9723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 24018554 24018930 24018908 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 4286 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA DHRS2 66439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 25625433 25625557 25625532 Y NA NA NA NA NA NA STXBP6 107930 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 27998275 27998515 27998360 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 933315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA AP4S1 92092 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 31905446 31905450 31905448 Y NA HEATR5A,RP11-176H8.1 NA NA NA NA HEATR5A 17658 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 32852666 32852915 32852789 Y NA RP11-320M16.2 NA NA NA NA RP11-320M16.2 32265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 32941850 32942320 32942112 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.2 56670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 32976944 32977104 32977024 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.2 91764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 33098616 33098902 33098649 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.2 213436 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 33485809 33485898 33485821 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 83670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 34176402 34176558 34176443 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 753004 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP RPS19P3,SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 35346506 35346753 35346630 Y PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA BAZ1A 3653 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr14 35821559 35821658 35821609 Y NA RP11-561B11.1 PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90 Hi-C 24141950 RP11-561B11.1 34617 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 322370 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.36187311792565 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 365 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 87834 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 55249380 55249603 55249505 Y LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 NA NA NA NA NA SAMD4A 217565 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 57424216 57424296 57424257 Y OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 309430 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 274422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr14 59565112 59565514 59565267 Y NA NA KIAA0586,DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DAAM1 87850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 59628600 59628806 59628703 Y NA DAAM1 DAAM1,KIAA0586,GPR135 IMR90 Hi-C 24141950 DAAM1 24558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 59861080 59861273 59861260 Y DAAM1,RTN1 NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 JKAMP 87888 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr14 61122184 61122613 61122502 Y NA SIX1 SLC38A6 IMR90 Hi-C 24141950 SIX1 364 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 62015577 62015884 62015776 Y PRKCH NA NA NA NA NA HIF1A 144347 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 62923756 62924041 62923899 Y SYT16 NA KCNH5 IMR90 Hi-C 24141950 SNAPC1 696681 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 63088627 63088999 63088813 Y NA NA RHOJ IMR90 Hi-C 24141950 RHOJ 579833 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68407691 68408026 68407854 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123195 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68456427 68456429 68456428 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 171931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68571232 68571846 68571404 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 286736 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68844207 68844566 68844276 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 42347 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 68928051 68928068 68928059 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 41138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 69065409 69066172 69065453 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 178496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 69104286 69104416 69104358 Y NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 156774 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 69203432 69203557 69203504 Y ZFP36L1,DCAF5 NA RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 57633 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 69287375 69287603 69287477 Y DCAF5 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 26185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 69287859 69287985 69287926 Y NA ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 26669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 70627626 70628027 70627962 Y NA RP11-486O13.2,SLC8A3 NA NA NA NA RP11-486O13.2 23813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 72397692 72397730 72397711 Y SIPA1L1,RGS6,RGS6,RGS6 NA NA NA NA NA SIPA1L1 612526 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 73595262 73595380 73595321 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 5746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 75447372 75447747 75447564 Y NA PGF,EIF2B2 MLH3,ZC2HC1C,NEK9,PGF,EIF2B2,ACYP1,RPS6KL1,DLST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2B2 19867 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 75704218 75704581 75704341 Y NA RP11-293M10.2,FOS TMED10,FOS,LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 19533 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 75764194 75764310 75764255 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2 RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 20717 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 76035300 76035417 76035361 Y BATF RP11-507E23.1 NA NA NA NA RP11-507E23.1 25132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 76564687 76564726 76564707 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 117353 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 77181991 77182261 77182202 Y NA VASH1 ANGEL1,VASH1,C14orf166B IMR90 Hi-C 24141950 VASH1 44271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 77386872 77387221 77387005 Y ZDHHC22 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 77488566 77488578 77488572 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 4456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 77517690 77517970 77517808 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-7F17.3 22717 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr14 85881762 85881957 85881956 Y FLRT2 NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 112375 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 86073952 86074255 86074109 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 79464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 88468736 88469338 88468995 Y GALC,GALC,GPR65 GALC NA NA NA NA GALC 10727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 125810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 91267745 91267886 91267834 Y NA TTC7B,CTD-3035D6.2 NA NA NA NA TTC7B 12937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33663 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 99657940 99658586 99658223 Y C14orf177,BCL11B NA NA NA NA NA BCL11B 77275 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 99711955 99712816 99712233 Y NA BCL11B NA NA NA NA BCL11B 23045 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr14 99739493 99739630 99739557 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 3632 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 91505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 238450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 101023349 101023562 101023455 Y BEGAIN BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 28188 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 101143693 101144188 101144055 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 45854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 101454914 101455185 101454975 Y DLK1,RTL1 NA NA NA NA NA AL132709.1 87062 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 103575159 103575514 103575439 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 12265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 103867345 103867626 103867486 Y NA MARK3 NA NA NA NA MARK3 17616 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA C14orf80 1298739 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 20616457 20616559 20616506 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 2214836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 21914435 21914569 21914482 Y OR4N4 NA NA NA NA NA TUBGCP5 916826 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 24114794 24115156 24114976 Y NA NA NA NA NA NA NDN 184344 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25108650 25109004 25108827 Y NA SNRPN NA NA NA NA SNRPN 41856 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25123469 25123644 25123557 Y SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA SNRPN 56675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25587380 25587405 25587393 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 94723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 25623423 25623523 25623473 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 58605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 25642287 25642724 25642425 Y UBE3A UBE3A NA NA NA NA UBE3A 39404 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 26854717 26854952 26854835 Y NA NA NA NA NA NA GABRA5 254558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 29949236 29949642 29949365 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 309426 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 31680805 31681075 31680940 Y MTMR10 NA NA NA NA NA KLF13 63747 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 33111010 33111355 33111242 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 102835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 33742285 33742304 33742295 Y NA NA NA NA NA NA AVEN 587073 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 2271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 35588902 35588944 35588923 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 206220 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 35599049 35599138 35599102 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 216367 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 38954760 38954890 38954768 Y NA NA RASGRP1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 98984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 39689205 39689637 39689475 Y NA NA THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 181643 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 39696909 39697463 39697288 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 173817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 40397293 40397725 40397605 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1368 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 41878002 41878382 41878246 Y NA RPAP1,TYRO3,MGA NA NA NA NA TYRO3 30129 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 42261117 42261163 42261140 Y EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 1613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 42723209 42723609 42723409 Y NA NA NA NA NA NA SNAP23 57822 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 43356735 43357067 43356746 Y NA UBR1,RPS3AP47 NA NA NA NA UBR1 39244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 43801380 43801544 43801432 Y TP53BP1 TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 224 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN NA NA NA NA NA SPATA5L1 55940 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 48851315 48851882 48851845 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 84164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 50793550 50793719 50793635 Y USP8,TRPM7 NA NA NA NA NA USP8 78973 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 50948351 50948714 50948533 Y NA TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 28298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 52526918 52527038 52526972 Y KIAA1370,GNB5 GNB5 NA NA NA NA GNB5 45352 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 52587042 52587046 52587044 Y NA MYO5C NA NA NA NA MYO5C 1047 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 55273105 55273417 55273157 Y NA NA NA NA NA NA RSL24D1 213848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 96873 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 59478138 59478489 59478268 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 82861 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 59649595 59649770 59649683 Y NA FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1 NA NA NA NA FAM81A 13122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 60818402 60818756 60818740 Y RORA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA RP11-219B17.1 49025 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA APH1B NA NA NA NA APH1B 36759 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 64932987 64933351 64933169 Y PLEKHO2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 49809 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 65713781 65714189 65713985 Y IGDCC3,IGDCC4 IGDCC3,IGDCC4 NA NA NA NA IGDCC4 371 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 65716164 65716565 65716475 Y NA IGDCC3,IGDCC4 NA NA NA NA IGDCC4 2754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 33898 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 70091169 70091533 70091456 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 296982 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 70850665 70850865 70850772 Y NA NA KIF23 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 203067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 71413315 71413428 71413372 Y NA THSD4 NA NA NA NA THSD4 26024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 72226785 72227154 72226872 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 177445 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 72383313 72383702 72383619 Y CELF6,SENP8,SENP8 SENP8,MYO9A NA NA NA NA SENP8 20897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 73032689 73032951 73032815 Y PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 43236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 74464511 74464760 74464636 Y CD276,LOXL1,PML,UBL7,UBL7,ISLR,ISLR ISLR,RP11-60L3.1,STRA6 NA NA NA NA ISLR 499 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3 NA NA NA NA EDC3 32032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 75075558 75076065 75075775 Y ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 3160 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 75163276 75163409 75163342 Y SCAMP2 ULK3,SCAMP2,MPI NA NA NA NA SCAMP2 297 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 76658083 76658321 76658202 Y NA ISL2 NA NA NA NA ISL2 31018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 78031317 78031646 78031484 Y LINGO1 NA NA NA NA NA LINGO1 79596 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 78326319 78326481 78326425 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B NA NA NA NA TBC1D2B 41585 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 81277983 81278007 81277997 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 83683877 83683893 83683890 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 5484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 83869144 83869263 83869183 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 86547032 86547326 86547179 Y AGBL1 NA NA NA NA NA KLHL25 210771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 NA NA NA NA NA IDH2 68664 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 95847774 95848063 95847919 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1019104 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 96387184 96387206 96387195 Y NA NA NR2F2,LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 479961 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 97129304 97129480 97129390 Y NA NA NR2F2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR1469 254814 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 98044402 98044848 98044694 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 415936 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA PGPEP1L 153022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA PGPEP1L 152359 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA PGPEP1L 140039 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99411740 99412504 99411960 Y NA NA NA NA NA NA PGPEP1L 136520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99489789 99490246 99490040 Y IGF1R NA NA NA NA NA PGPEP1L 58778 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA PGPEP1L PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 PGPEP1L 9983 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 99914657 99915195 99914962 Y NA NA NA NA NA NA MEF2A 100175 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr15 101102236 101102405 101102321 Y NA ASB7,LINS NA NA NA NA ASB7 38334 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 101579798 101579973 101579888 Y NA NA NA NA NA NA LRRK1 122378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 101723592 101723961 101723926 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 66176 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr15 101787304 101787467 101787386 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 2670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 858833 859023 858927 Y RHBDL1,FBXL16,SOX8 CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA RPUSD1 22436 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 809 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,RNU1-125P,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,RNU1-125P,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA SRL 55999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 SRL,TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr16 7380911 7381241 7380947 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA METTL22 1332299 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 7473619 7473766 7473686 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1239774 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 7488424 7488536 7488480 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1225004 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 8931520 8931573 8931545 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 29293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 9237080 9237205 9237143 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 53575 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 11249162 11249647 11249552 Y DEXI,SOCS1 NA NA NA NA NA RMI2 91829 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 12574173 12574607 12574346 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 321267 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 12641085 12641468 12641420 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 254406 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 19714468 19714843 19714656 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 10935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 20149024 20149328 20149176 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5B 253535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA NA NA NA NA NA TMEM159 145340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 21812929 21813171 21813061 Y CRYM,METTL9,IGSF6 NA NA NA NA NA UQCRC2 148810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 23031481 23031663 23031565 Y NA NA NA NA NA NA USP31 126928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 23419986 23420351 23420270 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 42150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 23818447 23818772 23818505 Y GGA2,PRKCB NA PRKCB IMR90 Hi-C 24141950 PLK1 131470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 27242037 27242327 27242262 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 35788 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 27254406 27254878 27254778 Y IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 23237 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr16 27532420 27532769 27532492 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 26465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1,ATP2A1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT QPRT NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 30383396 30383957 30383596 Y ALDOA,ALDOA,ZNF48,ZNF48,MYLPF CD2BP2,TBC1D10B,MYLPF,ZNF48,ZNF771 NA NA NA NA MYLPF 3141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,MYLPF,ZNF48,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA DCTPP1 10853 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,TRIM72 NA NA NA NA TRIM72 138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 31891820 31892363 31891972 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 8741 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 33952235 33952334 33952272 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 33952793 33953560 33953111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 49542422 49542557 49542490 Y ZNF423 NA NA NA NA NA HEATR3 555295 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 49892592 49892787 49892690 Y ZNF423 NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 205065 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 49910498 49910724 49910573 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 187128 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 50101332 50101352 50101341 Y NA HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 3480 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 51909181 51909528 51909355 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 231514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 52489873 52490156 52490047 Y NA NA NA NA NA NA TOX3 89558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 53134908 53135206 53135001 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 47963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 56458239 56458402 56458321 Y NA AMFR,OGFOD1,NUDT21 NA NA NA NA AMFR 789 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 57682541 57682687 57682607 Y GPR114,C16orf80 NA NA NA NA NA KATNB1 84955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 64944348 64944657 64944578 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 213358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 65047832 65047877 65047854 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 110138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 67186810 67187094 67186952 Y NA B3GNT9,FBXL8,TRADD,NOL3,KIAA0895L,E2F4 NA NA NA NA B3GNT9 3693 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr16 70769740 70769941 70769843 Y NA NA MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 51771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 114857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 76566154 76566369 76566287 Y NA NA NA NA NA NA RPL18P13 298633 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 78325751 78325980 78325865 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 194441 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 79608644 79608940 79608781 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 23671 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 79619926 79620106 79620016 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 12505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA CDYL2 141241 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 82693893 82694152 82693974 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 35485 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 83480656 83480733 83480694 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 358715 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 84788106 84788226 84788167 Y COTL1 NA NA NA NA NA USP10 56522 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 9.24515107429553 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85268297 85268637 85268360 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 208922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85424430 85424739 85424585 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 296940 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85470615 85470779 85470696 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 250900 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85600571 85600865 85600718 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 120814 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85603305 85603679 85603564 Y KIAA0182 NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 118000 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 86797610 86797756 86797704 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31,MAP1LC3B IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 198753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 87856343 87856555 87856434 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 44539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr16 90088262 90088277 90088270 Y PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 3726 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 154480 154575 154515 Y DOC2B NA NA NA NA NA RPH3AL 79470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 505873 506062 505986 Y VPS53 NA NA NA NA NA RPS4XP17 52725 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 942821 943085 942871 Y MYO1C TIMM22 NA NA NA NA TIMM22 44464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr17 1864830 1864896 1864863 Y NA NA NA NA NA NA DPH1 66508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 1994416 1994643 1994603 Y HIC1,HIC1 HIC1 NA NA NA NA HIC1 38968 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 3699697 3700093 3699885 Y ZZEF1,ATP2A3 ITGAE,C17orf85 NA NA NA NA ITGAE 2444 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 4233037 4233303 4233170 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 34620 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 4299458 4299796 4299670 Y MYBBP1A,UBE2G1 UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 31535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 4915328 4915680 4915430 Y NA SPAG7,CAMTA2,KIF1C NA NA NA NA KIF1C 16085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA ZFP3,AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 6542489 6542952 6542608 Y NA TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100 NA NA NA NA KIAA0753 242 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 6656419 6656747 6656461 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 NA NA NA NA XAF1 19 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.35331118254795 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 5.04280967688847 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 9.74943204198438 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA PER1 27708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 8602115 8602249 8602166 Y MYH10 NA MYH10 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 70036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 10075775 10076068 10075982 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 84011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 10220640 10220911 10220834 Y GAS7,MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 60561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 18200436 18200727 18200570 Y SMCR8,TOP3A FLII,TOP3A,SMCR8 NA NA NA NA TOP3A 15594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 18820621 18820763 18820720 Y NA NA NA NA NA NA PRPSAP2 79223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 19769871 19770228 19769963 Y NA ULK2 NA NA NA NA ULK2 622 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 21515861 21516199 21516031 Y NA C17orf51 CCDC144NL K562 ChIA-PET 22265404 C17orf51 40139 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 11.5984622568435 chr17 25558342 25558695 25558519 Y NA NA KSR1,WSB1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 60407 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 25676124 25676302 25676192 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 57022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 25856308 25856397 25856353 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 74638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27482450 27482602 27482543 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 22828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 27918652 27918967 27918817 Y GIT1,EFCAB5,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 28210608 28210734 28210655 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 44560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12 NA NA NA NA SLFN12 29106 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 34227790 34227961 34227895 Y SLFN12L,CCL5 RDM1 NA NA NA NA RDM1 27816 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 36757754 36758081 36757810 Y GPR179,SOCS7,ARHGAP23,PIP4K2B,SRCIN1 SRCIN1 NA NA NA NA SRCIN1 2102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 37010933 37011093 37011014 Y FBXO47,C17orf98 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA RPS20P35 1366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 37159505 37159646 37159582 Y CWC25,FBXL20,CDK12,FBXO47 NA PLXDC1,LOC100131347,MIR4727,CWC25,C17orf98,RPL23,LASP1,LOC100505576,FBXO47,FLJ43826,STAC2,RPL19,ARL5C,CACNB1,FBXL20,CDK12,PIP4K2B IMR90 Hi-C 24141950 LASP1 135393 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 37817781 37818074 37817928 Y STAC2,FBXL20,MSL1 STARD3,ERBB2,PGAP3 NA NA NA NA ERBB2 24093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 38374652 38374886 38374755 Y KRT222,THRA,THRA,NR1D1,RARA,RAPGEFL1,WIPF2 RAPGEFL1,WIPF2 NA NA NA NA WIPF2 1096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 38502716 38503032 38502793 Y NA RARA NA NA NA NA RARA 39272 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.03424774151078 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr17 42278333 42278607 42278473 Y ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 2852 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 42343917 42344252 42344114 Y UBTF,SLC4A1,SLC25A39 UBTF,RUNDC3A NA NA NA NA RUNDC3A 39529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 42619291 42619496 42619449 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 13429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 53430 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46080436 46080890 46080812 Y CDK5RAP3 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 32502 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46226881 46226967 46226912 Y TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1 CBX1,SNX11 SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 SNX11 48162 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA AC090627.1 80297 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 46647653 46647800 46647722 Y HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 7673 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46664992 46665342 46665097 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 9519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 46824657 46824780 46824719 Y PHOSPHO1 HOXB13 NA NA NA NA HOXB13 20117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,GNGT2 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 47815825 47816028 47815963 Y MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4 SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 31449 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48208282 48208563 48208423 Y NA PDK2,SAMD14,PPP1R9B,SGCA NA NA NA NA SAMD14 3036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,SGCA,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48294109 48294288 48294184 Y NA COL1A1 XYLT2,ITGA3,PDK2,PPP1R9B,HILS1,SGCA,COL1A1,LOC284080,SAMD14,TMEM92 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 17116 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48348027 48348139 48348077 Y COL1A1,TMEM92 TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 1260 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48421685 48421964 48421826 Y NA XYLT2,MRPL27,EME1 NA NA NA NA XYLT2 232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 50877242 50877515 50877351 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 955716 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 52086926 52087074 52087000 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 253695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 54655252 54655609 54655360 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 13451 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 54669912 54670125 54669969 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 852 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 54674985 54675165 54675040 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 5925 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr17 54995280 54995673 54995559 Y NA TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 5881 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 55501996 55502706 55502262 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 170784 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 55741402 55741415 55741409 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 184002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 55749375 55749748 55749439 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 175669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chr17 55993641 55993992 55993778 Y NA CUEDC1 VEZF1,CUEDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUEDC1 36692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 56138078 56138257 56138212 Y NA DYNLL2 AKAP1,DYNLL2,MRPS23,VEZF1,SRSF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYNLL2 20519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 57833423 57834077 57833636 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 50436 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 57866887 57867071 57866969 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 49556 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 57908316 57908645 57908515 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 7982 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 58228293 58228479 58228403 Y CA4 NA NA NA NA NA HEATR6 74001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 61153436 61153733 61153585 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 368006 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 61352706 61353153 61352892 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 168586 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62174589 62174791 62174690 Y NA ERN1,SNORD104 ICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 ERN1 31388 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62257655 62257782 62257719 Y DDX5,ERN1 SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 36212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 62537971 62538164 62538007 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 35654 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 63030127 63030512 63030385 Y NA GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 20445 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 63752923 63753189 63753062 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 197158 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 65991969 65992126 65992052 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA C17orf58 4204 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 66041204 66041633 66041268 Y NA KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 11569 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 67270709 67270940 67270826 Y NA NA NA NA NA NA ABCA5 50445 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 68033950 68033965 68033958 Y NA NA KCNJ16,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 128849 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 43063 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 70939903 70940361 70940187 Y SSTR2,C17orf80 NA NA NA NA NA SLC39A11 146490 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 71024945 71025268 71025108 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 61583 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 71064440 71064923 71064668 Y CPSF4L SLC39A11 NA NA NA NA SLC39A11 21928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 71152430 71152655 71152530 Y C17orf80,SSTR2 COG1 NA NA NA NA COG1 34474 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 71496173 71496542 71496358 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 141686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 72189661 72189728 72189666 Y KIF19 RPL38,TTYH2 NA NA NA NA RPL38 7993 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 72241426 72241789 72241666 Y NA RPL38,TTYH2 NA NA NA NA TTYH2 33773 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 72470215 72470385 72470321 Y RAB37,RAB37 NA NA NA NA NA GPRC5C 51225 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 72775758 72775904 72775844 Y CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LF SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 5136 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 74298375 74298696 74298649 Y MFSD11,AANAT,FBF1,CDK3,QRICH2 NA NA NA NA NA RNF157 63921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.69806042971821 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 74525516 74525637 74525615 Y NA RHBDF2,PRCD NA NA NA NA PRCD 3848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75096190 75096538 75096428 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 15392 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75167597 75167895 75167730 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 86799 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 142543 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75429541 75429800 75429625 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 154890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.01712387075539 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 229848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75662697 75663098 75662732 Y NA NA TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 335151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 22.5245498901018 chr17 76125814 76126042 76125869 Y TNRC6C,PGS1,TMC6,TMC8,TMC6 TMC6,SYNGR2 NA NA NA NA TMC6 446 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 76349549 76349649 76349633 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4509 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 76669146 76669243 76669181 Y DNAH17 NA NA NA NA NA CYTH1 107136 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 77776510 77776898 77776679 Y CCDC40 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 3028 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr17 77778301 77778701 77778443 Y CBX2,CBX8,CBX4 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr17 78652497 78652856 78652573 Y SGSH,RNF213 NA NA NA NA NA RPTOR 135878 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78803936 78804105 78804080 Y AATK NA NA NA NA NA CHMP6 159293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78853513 78853762 78853623 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 109636 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78900870 78900990 78900942 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 62408 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 78962835 78962976 78962910 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA CHMP6 422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 17338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA TMEM105 57934 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr17 79362745 79363068 79363048 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 60271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 68280 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 79375864 79375954 79375909 Y DYSFIP1,BAHCC1 NA NA NA NA NA TMEM105 73390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 79958827 79959194 79958989 Y NA NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG NA NA NA NA LRRC45 19984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,CD7,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr17 80328282 80328672 80328333 Y NA SECTM1,TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 13159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.19377946202936 chr17 80330864 80331011 80330938 Y NA SECTM1,TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 15741 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr17 80817904 80818262 80818042 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 109964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 410446 410458 410452 Y ADCYAP1,ADCYAP1 NA NA NA NA NA COLEC12 88264 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 2978254 2978441 2978377 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 32872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 3058527 3058678 3058565 Y MYL12B,SMCHD1,LPIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 47214 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 3508912 3509046 3509010 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr18 3509218 3509430 3509419 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 99612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 6193210 6193559 6193391 Y NA NA NA NA NA NA L3MBTL4 219677 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 6752571 6752962 6752632 Y NA ARHGAP28 ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP28 24854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9129786 9129925 9129855 Y PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9548277 9548390 9548335 Y ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1 NA NA NA NA NA PPP4R1 64848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9740164 9740351 9740265 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 34002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9742137 9742641 9742378 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 35975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9812085 9812326 9812208 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA NA NA NA NA VAPA 99673 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 9838439 9838883 9838628 Y NA NA NA NA NA NA VAPA 73116 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 11490584 11490685 11490652 Y NA NA NA NA NA NA GNAL 196270 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 12092408 12092760 12092594 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 113384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 12408700 12408821 12408736 Y NA AFG3L2,SLMO1 SPIRE1 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO1 2805 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 14111961 14112330 14112146 Y NA ZNF519 NA NA NA NA ZNF519 18159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 20835223 20835287 20835255 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 122695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 22043448 22044004 22043747 Y NA IMPACT NA NA NA NA IMPACT 38868 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 25536974 25537193 25537082 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 218217 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 31229161 31229406 31229348 Y NA NA NA NA NA NA ASXL3 72582 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 32291109 32291369 32291156 Y MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 219855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 34107164 34107375 34107280 Y RPRD1A,FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 299694 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 34908671 34908689 34908687 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 501513 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 42261426 42261651 42261539 Y NA SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 3288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 44386287 44386347 44386318 Y HDHD2 NA NA NA NA NA KATNAL2 109108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 45444466 45444807 45444662 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 10708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 46259226 46259357 46259315 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 195809 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 402091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 414813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 47252630 47252839 47252704 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85491 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 47325286 47325511 47325399 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 12819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA MBD1,CXXC1 NA NA NA NA MBD1 19820 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 56208933 56209328 56209119 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 56535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 58114055 58114449 58114252 Y NA NA NA NA NA NA MC4R 76054 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 61220427 61220683 61220555 Y NA NA NA NA NA NA VPS4B 132711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr18 65781416 65781525 65781473 Y NA NA TMX3 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 598921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 72424911 72425171 72425041 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 161805 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 73118858 73118990 73118932 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ1 198148 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr18 74088486 74089010 74088832 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 116136 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 74754529 74754928 74754700 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 221966 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 275811 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr18 74818309 74818676 74818510 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 285746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 76498631 76498821 76498726 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 328464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr18 77284524 77284884 77284797 Y ATP9B,NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 130668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA MADCAM1 5383 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 947564 948104 947641 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf6 R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 23783 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 2167436 2167667 2167594 Y CSNK1G2,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 4972 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 3314117 3314647 3314306 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 42914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4057405 4058198 4058044 Y CCDC94,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 6745 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4123124 4123351 4123249 Y MATK,ZFR2,ATCAY MAP2K2 NA NA NA NA MAP2K2 998 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4393849 4394251 4394129 Y NA SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 4293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 4568924 4569300 4569153 Y TICAM1,KDM4B,SEMA6B PLIN5 NA NA NA NA PLIN5 35688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4620862 4621172 4621017 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 16358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4835065 4835273 4835169 Y NA FEM1A,TICAM1,PLIN3 NA NA NA NA TICAM1 5349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 35011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 7559450 7559827 7559455 Y NA ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA ZNF358 18351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 9974094 9974487 9974263 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 30161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 10120163 10120467 10120323 Y NA COL5A3 NA NA NA NA COL5A3 1016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 10925932 10926095 10926043 Y ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,DNM2,C19orf38 TMED1 NA NA NA NA TMED1 18899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 10989126 10989500 10989238 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 8937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.8575921502368 chr19 12929124 12929310 12929217 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA MAST1 13455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13023589 13024232 13023881 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA SYCE2 3858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13095998 13096573 13096246 Y ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 7849 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13138013 13138252 13138133 Y TNPO2,TNPO2,MAST1,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 33591 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 13324184 13324516 13324349 Y MAST1,CACNA1A NA NA NA NA NA IER2 64955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 14570486 14570855 14570729 Y OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1 DDX39A,PKN1,PTGER1,GIPC1 NA NA NA NA PTGER1 13319 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 14597679 14597949 14597721 Y NA PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1 NA NA NA NA GIPC1 6995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 23835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA TPM4 227712 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 48597 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 16556086 16556488 16556261 Y RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1 EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 24408 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 16560891 16561165 16561157 Y NA EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 19731 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 16576710 16576784 16576751 Y NA EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 4112 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 17127706 17127720 17127713 Y NA NA NA NA NA NA HAUS8 56715 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 18760437 18760612 18760525 Y NA TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 14662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 18768622 18768973 18768794 Y KIAA1683 KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA KLHL26 22847 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 19410078 19410150 19410102 Y NA HAPLN4,TM6SF2,MAU2,SUGP1 NA NA NA NA MAU2 19340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 19504149 19504345 19504247 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 9514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 19514283 19514636 19514393 Y HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 19648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 19573019 19573301 19573248 Y MAU2,GATAD2A,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 51244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 23416597 23416606 23416602 Y NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 14586 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 28231226 28231711 28231495 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1470737 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 31041576 31041942 31041745 Y NA NA NA NA NA NA ZNF536 324379 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 31843033 31843344 31843257 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 4580 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 32842918 32843112 32843016 Y ZNF507 ZNF507 NA NA NA NA ZNF507 8418 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 33875552 33875576 33875564 Y NA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 13316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 33977879 33978014 33977973 Y SLC7A10 PEPD NA NA NA NA PEPD 32686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 38674383 38674545 38674477 Y ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1 DPF1 NA NA NA NA DPF1 43809 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1 NA NA NA NA DPF1 773 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 38925195 38925518 38925467 Y NA FAM98C,RYR1 NA NA NA NA RYR1 2856 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 MAP4K1,EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 39177340 39177518 39177421 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 41051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 39283371 39283483 39283427 Y NA ECH1 NA NA NA NA ECH1 37162 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 39919610 39919819 39919723 Y NA PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 4769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 40473949 40474218 40474067 Y ZNF546,FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA PSMC4 694 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41120897 41121111 41120992 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 24108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 41803374 41803837 41803699 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 10257 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41819266 41819494 41819482 Y NA CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 5172 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42098078 42098289 42098184 Y NA NA NA NA NA NA ATP5SL 153456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42501283 42501478 42501381 Y TMEM145 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 1634 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42527414 42527647 42527531 Y NA ATP1A3,ZNF574 NA NA NA NA ATP1A3 27765 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA CKM 68046 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 45803954 45804164 45804074 Y NA CKM NA NA NA NA CKM 20071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L CKM,ERCC2 NA NA NA NA CKM 20415 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA ERCC2,CD3EAP NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.01712387075539 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA PPM1N 2708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA CCDC8 NA NA NA NA CCDC8 7192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,PTGIR,DACT3 NA NA NA NA PTGIR 15820 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 47448240 47448462 47448420 Y PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1 NA NA NA NA NA NPAS1 72615 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 47600896 47601033 47600983 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 13498 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA SLC17A7 19141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 50415245 50415445 50415345 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 14514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 50860908 50861268 50861186 Y PNKP,VRK3,NR1H2 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 24193 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 50990086 50990332 50990328 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 22278 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 50993276 50993671 50993522 Y MYH14,MYBPC2 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 18939 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr19 51003635 51004295 51004006 Y MYH14,MYBPC2 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 8315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 51797467 51797679 51797598 Y NA NA CD33,IGLON5 IMR90 Hi-C 24141950 ETFB 69993 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 120291 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.19377946202936 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 56623811 56623981 56623918 Y ZNF865,EPN1 ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 6668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 57349423 57349757 57349684 Y ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA PEG3 339 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58501905 58502197 58501915 Y ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135 ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1 NA NA NA NA CTD-2368P22.1 9232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58886804 58887095 58886950 Y ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584 NA NA NA NA ZNF837 3332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr2 1661359 1661779 1661556 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 84845 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 3707060 3707165 3707123 Y NA TMSB4XP2,ALLC NA NA NA NA ALLC 3275 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 9826242 9826464 9826356 Y NA NA YWHAQ,ADAM17 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 57099 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 12323357 12323603 12323480 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 AC106875.1 503771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 14921579 14921878 14921874 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 150769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 15397207 15397542 15397373 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 301912 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 15464031 15464396 15464252 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 235058 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 15783989 15784378 15784047 Y NBAS,MYCN,DDX1 NA NA NA NA NA DDX1 54687 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 20385260 20385778 20385600 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 37416 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 20630632 20630977 20630855 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 13858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 23631132 23631189 23631161 Y NA KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 25044 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 23783139 23783161 23783150 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 177051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 23923305 23923445 23923375 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 224539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 24495048 24495317 24495183 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 60064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 139264 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 25514055 25514238 25514170 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 49221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 25528159 25528373 25528263 Y DNAJC27,DNMT3A DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 35086 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 31520585 31520905 31520706 Y NA NA NA NA NA NA EHD3 65705 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 37199283 37199286 37199285 Y NA STRN NA NA NA NA STRN 7668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 37497492 37497655 37497574 Y HEATR5B CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 40636 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 37892431 37892964 37892857 Y QPCT,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 70647 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 38571888 38572175 38572032 Y FAM82A1,ATL2 ATL2 NA NA NA NA ATL2 30252 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 39683895 39683929 39683912 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 21442 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 226687 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 43195156 43195444 43195331 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 69242 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 AC016735.2 1038 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43273834 43273859 43273847 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 AC016735.2 9148 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43635676 43636063 43635871 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 183928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 43908548 43908922 43908739 Y PLEKHH2 PLEKHH2 NA NA NA NA PLEKHH2 46136 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA SIX3 5427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 45486924 45487080 45487002 Y NA NA NA NA NA NA LINC01121 61354 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 45834799 45835123 45834961 Y NA SRBD1,PRKCE NA NA NA NA SRBD1 2181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 47171092 47171539 47171232 Y TTC7A,MCFD2 TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 4098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 47926766 47926950 47926857 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 6097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 50445313 50445652 50445545 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 1690791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 52799520 52799826 52799685 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1193103 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 53331505 53331666 53331586 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 661263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 53502591 53502613 53502603 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 490316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 54165408 54165630 54165519 Y NA ACYP2,PSME4 NA NA NA NA ACYP2 30345 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 55346891 55347057 55346962 Y NA RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 9134 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 55347806 55348001 55347900 Y CCDC88A RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 10049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 55349627 55349798 55349713 Y CCDC88A RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 11870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 58347874 58348075 58347917 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 118432 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60694019 60694324 60694172 Y BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 84279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.01712387075539 chr2 60696747 60696946 60696847 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 81756 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 60711222 60711498 60711369 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 67204 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 60732807 60733201 60733004 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 45501 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60742807 60743148 60742962 Y REL BCL11A NA NA NA NA BCL11A 35554 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60747849 60747913 60747881 Y PEX13,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 30789 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60757053 60757301 60757153 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 21401 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 60760023 60760353 60760231 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 18349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 61080674 61081167 61080838 Y REL REL NA NA NA NA REL 25489 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 62689007 62689250 62689129 Y NA TMEM17 EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 47779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 62753696 62753810 62753753 Y NA TMEM17 TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 16667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 64821728 64822106 64821796 Y SLC1A4,PELI1 NA NA NA NA NA AFTPH 72263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 64879615 64879792 64879667 Y SERTAD2 NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96347 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 66721852 66722243 66721943 Y NA NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 63250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 68544914 68545935 68545552 Y CNRIP1 NA NA NA NA NA CNRIP1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 69533320 69533461 69533391 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 69888349 69888615 69888483 Y NA ANXA4,AAK1 NFU1,AAK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAK1 10866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 70226911 70227071 70226991 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 39514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 70270545 70270983 70270722 Y MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 41602 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 70296121 70296604 70296392 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 15981 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 72541323 72541406 72541365 Y NA NA NA NA NA NA CYP26B1 168156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 74206209 74206465 74206360 Y SLC4A5,MOBKL1B,TET3 DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3 DGUOK MCF7 ChIA-PET 22265404 DGUOK-AS1 103 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 TET3 9462 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 74298270 74298885 74298717 Y MOBKL1B FNBP1P1 NA NA NA NA FNBP1P1 46922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 74804828 74804964 74804881 Y MOBKL1B,DOK1 AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 24011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 80261096 80261278 80261177 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 126983 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 84683355 84683532 84683444 Y NA SUCLG1 NA NA NA NA SUCLG1 1637 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85362106 85362578 85362371 Y NA LSM3P3,TCF7L1 NA NA NA NA TCF7L1 3573 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85483180 85483288 85483234 Y NA NA NA NA NA NA TGOLN2 70260 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85972206 85972706 85972281 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 3761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 17095 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86129642 86129982 86129887 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 15505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86224674 86224821 86224747 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 106457 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86262986 86263343 86263241 Y GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3 NA NA NA NA NA POLR1A 67935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA IMMT,MRPL35 NA NA NA NA IMMT 32286 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 86562971 86563338 86563025 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA REEP1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 86722014 86722392 86722297 Y RMND5A NA NA NA NA NA KDM3A 56244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2752348 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 91815826 91816191 91816014 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2752502 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 92317324 92317742 92317530 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD36BP2 3254000 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 97561594 97561991 97561828 Y FAM178B ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 27100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 98364129 98364314 98364298 Y TMEM131,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 85559 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 99250910 99251133 99251091 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 27868 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 99344413 99344676 99344545 Y INPP4A,MGAT4A MGAT4A NA NA NA NA MGAT4A 913 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 100026434 100026453 100026444 Y NA NA NA NA NA NA TXNDC9 71269 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 100576722 100576856 100576853 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 455262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 102515032 102515286 102515160 Y IL1R2 NA NA NA NA NA MAP4K4 203720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 102516830 102516950 102516890 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 205518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 102856746 102856850 102856799 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL18R1 69139 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 102878603 102878966 102878726 Y NA IL18R1 NA NA NA NA IL18R1 47023 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 105461382 105461873 105461636 Y GPR45,POU3F3 NA NA NA NA NA MRPS9 190568 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 105664202 105664255 105664229 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 11761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 105913488 105913594 105913541 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA TGFBRAP1 30897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 109855106 109855410 109855221 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 453893 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 111817819 111818113 111817910 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 56842 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 112420062 112420336 112420200 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 219931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 112433293 112433453 112433387 Y NA NA ACOXL,BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 206814 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 112768370 112768716 112768510 Y MERTK TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 42084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B NA NA NA NA NA CKAP2L 55962 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 113847761 113847860 113847813 Y IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN NA NA NA NA NA CKAP2L 327507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 256849 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 115420103 115420171 115420136 Y DPP10,DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA ACTR3 774566 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 118309015 118309417 118309218 Y NA NA NA NA NA NA DDX18 260809 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 120222602 120222796 120222714 Y NA TMEM37 NA NA NA NA TMEM37 37125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 121495919 121496279 121496111 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.68949849434052 chr2 122132591 122132855 122132729 Y CLASP1 NA NA NA NA NA AC013399.3 67020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 122297511 122297730 122297621 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 11054 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 122480192 122480543 122480332 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 12136 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 126490577 126490865 126490721 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP2 822874 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 128171512 128171657 128171580 Y SFT2D3,IWS1,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 27471 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1 NA NA NA NA IWS1 590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 128470034 128470252 128470136 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 13437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 129381655 129381863 129381711 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 307504 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr2 131110123 131110429 131110276 Y NA IMP4,CCDC115,PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 1151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 133011418 133011623 133011538 Y NA NA NA NA NA NA AC093838.4 763032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 136314098 136314477 136314288 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA R3HDM1 27073 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 138845772 138845790 138845781 Y NA NA HNMT IMR90 Hi-C 24141950 HNMT 126182 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 142150307 142150490 142150399 Y NA NA NA NA NA NA AC096558.1 2085868 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 144476408 144476703 144476621 Y NA NA NA NA NA NA AC096558.1 240050 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 144488458 144488893 144488487 Y NA NA NA NA NA NA AC096558.1 252100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr2 145115622 145115908 145115729 Y ZEB2 GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 27487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr2 145122623 145122802 145122719 Y GTDC1,ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 34488 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145136238 145136489 145136344 Y ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 48103 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145202638 145202856 145202713 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 77291 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145212298 145212826 145212615 Y GTDC1,GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 67321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145214152 145214623 145214350 Y GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 65524 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 145794026 145794356 145794065 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 298442 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145821367 145821376 145821372 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 271422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 145998951 145999148 145999049 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 93650 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 148126586 148126890 148126739 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 473196 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA KIF5C 102882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 151377866 151378135 151377929 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 15390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 152896580 152896660 152896620 Y NA NA NA NA NA NA STAM2 133846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 155556801 155556983 155556830 Y NA KCNJ3 NA NA NA NA KCNJ3 3990 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 155569761 155570004 155569789 Y NA KCNJ3 NA NA NA NA KCNJ3 16950 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 155717139 155717166 155717153 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ3 164328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 156002242 156002543 156002420 Y KCNJ3 NA NA NA NA NA KCNJ3 449431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chr2 157293916 157294289 157294044 Y NA GPD2 NA NA NA NA GPD2 4114 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 158325372 158325693 158325539 Y CYTIP NA NA NA NA NA ACVR1C 157824 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 160353770 160354019 160353895 Y MARCH7,CD302 AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 36003 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 105999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 161173742 161174088 161173899 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 88305 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 161238176 161238388 161238285 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 24005 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 161244338 161244737 161244615 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 17656 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 NA NA NA NA NA PSMD14 67138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 163604975 163605274 163605125 Y NA NA NA NA NA NA GCA 431625 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 164518951 164519177 164519064 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 71345 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 164563373 164563497 164563435 Y FIGN FIGN NA NA NA NA FIGN 27025 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 164991272 164991524 164991400 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 400750 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 166240556 166240626 166240591 Y SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3 NA NA NA NA NA CSRNP3 83531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 166523404 166523752 166523720 Y NA NA NA NA NA NA CSRNP3 199247 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 166796102 166796135 166796119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 167269953 167270071 167269980 Y NA SCN9A NA NA NA NA SCN9A 39450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 167986377 167986743 167986559 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 160938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 168911148 168911462 168911308 Y NA NA NA NA NA NA STK39 191189 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 169434382 169434732 169434541 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 124010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 171865748 171866100 171865790 Y TLK1 NA NA NA NA NA GORASP2 82774 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA CHN1 105750 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 176839402 176839757 176839580 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 25810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD12,HOXD11,HOXD10,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD10 1222 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 35.6358550500119 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 182367881 182368047 182367964 Y ITGA4 ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 47952 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 183626884 183626903 183626894 Y NA DNAJC10 NA NA NA NA DNAJC10 47885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 185499442 185500071 185499458 Y NA ZNF804A NA NA NA NA ZNF804A 38349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 188464486 188464724 188464607 Y NA TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 190025289 190025449 190025364 Y COL3A1 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 17156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 190308827 190308942 190308831 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 4668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 1064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 191443312 191443866 191443668 Y NA TMEM194B TMEM194B MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM194B 45864 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 192529976 192530334 192530120 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 179647 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 196523919 196524096 196523991 Y SLC39A10 NA NA NA NA NA SLC39A10 85218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 196547563 196547821 196547646 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 108862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 225712 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 197623019 197623245 197623231 Y NA GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 39204 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 197787148 197787421 197787192 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 3099 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 198782595 198782956 198782734 Y NA NA NA NA NA NA PLCL1 115169 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 33756 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 202897639 202898135 202897874 Y FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 329 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr2 203231501 203231745 203231624 Y NA BMPR2 BMPR2,NOP58 IMR90 Hi-C 24141950 BMPR2 7914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 203830574 203830808 203830669 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 46713 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr2 204646981 204647288 204647136 Y NA NA CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 248848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 204816181 204816619 204816422 Y CD28,ICOS NA NA NA NA NA RAPH1 418048 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 208153315 208153645 208153471 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 123324 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 208484440 208484730 208484623 Y PLEKHM3,CREB1,METTL21A,METTL21A METTL21A NA NA NA NA METTL21A 3922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 208883092 208883191 208883110 Y PTH2R,C2orf80 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 212430721 212430773 212430747 Y NA NA NA NA NA NA AC013404.1 268807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 212893529 212893915 212893722 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 507650 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 212897670 212897774 212897723 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 503791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 212906311 212906509 212906411 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 495056 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 213168681 213168967 213168824 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 232598 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 213242050 213242407 213242229 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 159158 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 213339164 213339568 213339278 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 61997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 213340230 213340572 213340527 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 60993 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 213401643 213402097 213401658 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 78 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 213842063 213842076 213842069 Y IKZF2,IKZF2 NA NA NA NA NA IKZF2 173075 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 37890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 216222811 216223009 216222866 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48271 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 216402536 216402702 216402564 Y FN1 NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 AC012462.1 103560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 216876845 216877231 216877087 Y MREG MREG NA NA NA NA MREG 19588 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 217501395 217501614 217501574 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5844 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 217731694 217732027 217731849 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 173446 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 218549825 218550302 218550107 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 69014 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 219584291 219584413 219584352 Y NA STK36,RNF25,TTLL4 NA NA NA NA TTLL4 10723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA INHA,OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA AC009502.1 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.1 6236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 221372972 221373224 221373091 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.1 825455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr2 223157138 223157255 223157183 Y PAX3,CCDC140 PAX3 NA NA NA NA PAX3 4460 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 225325353 225325370 225325362 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 122740 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 226986846 226987128 226987011 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 60959 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 227048517 227048542 227048530 Y NA AC068138.1 NA NA NA NA AC068138.1 430 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 227304166 227304579 227304264 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 256079 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 228236714 228236871 228236778 Y CCL20,AGFG1 MFF NA NA NA NA MFF 48847 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 228522025 228522410 228522050 Y CCL20,AGFG1 NA NA NA NA NA SLC19A3 58318 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 230106282 230106638 230106611 Y NA PID1 NA NA NA NA PID1 27363 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 230275750 230275810 230275797 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 141749 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 231322204 231322520 231322312 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 43547 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 231636017 231636396 231636213 Y NA BANF1P3 NA NA NA NA BANF1P3 47899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 233563344 233563704 233563468 Y NA GIGYF2 NA NA NA NA GIGYF2 3335 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 234219980 234220343 234220164 Y SAG DGKD NA NA NA NA DGKD 40810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 130399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 235282322 235282425 235282352 Y ARL4C NA NA NA NA NA ARL4C 121272 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 235388083 235388436 235388365 Y NA ARL4C NA NA NA NA ARL4C 15261 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 238052381 238052681 238052563 Y COL6A3 NA MLPH,COPS8,COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 59921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr2 238053401 238053581 238053504 Y NA NA MLPH,COPS8,COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 60941 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 NA LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 53265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 25097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr2 238694351 238694559 238694455 Y NA NA NA NA NA NA LRRFIP1 160132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 238807318 238807662 238807419 Y PER2,ILKAP,ESPNL,UBE2F,RAMP1 NA NA NA NA NA UBE2F 65807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 239078028 239078257 239078143 Y NA KLHL30,FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 12405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 239597207 239597573 239597401 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 157100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 239779123 239779526 239779330 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 24450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 239997480 239997793 239997637 Y NA NA NA NA NA NA TWIST2 242807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 240145548 240145836 240145702 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 175512 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 124012 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 240355727 240356102 240355822 Y NA HDAC4 HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 34379 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 240917886 240918180 240918030 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 44639 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr2 242455386 242455795 242455485 Y NEU4,C2orf85 STK25,BOK NA NA NA NA STK25 8241 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.7066223650959 chr2 242485030 242485360 242485049 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 10776 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 242703403 242703714 242703570 Y ATG4B,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 31409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr2 242710043 242710405 242710079 Y NA D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 38049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 623135 623319 623297 Y NA TCF15,SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 1789800 1790010 1789904 Y SDCBP2,SIRPB2,PDYN,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 83144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 10486121 10486184 10486148 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 73251 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 16555525 16555956 16555640 Y NA KIF16B NA NA NA NA KIF16B 3447 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 19194656 19195454 19194994 Y NA SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 3366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 19241410 19241666 19241515 Y NA NA NA NA NA NA SLC24A3 50120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 19848562 19849136 19848901 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 112210 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 19983799 19983958 19983881 Y NA NAA20 NA NA NA NA NAA20 11802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 23347147 23347295 23347221 Y THBD,CD93,GZF1 NXT1,RP3-322G13.5,GZF1 NA NA NA NA GZF1 6360 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 25445422 25445550 25445504 Y ACSS1,ABHD12 NA NA NA NA NA GINS1 59059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 170704 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA MIR663A 113396 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 18.9945831162799 chr20 30110463 30111086 30110768 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 10232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 30699679 30699866 30699769 Y BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 4370 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chr20 31126528 31126767 31126720 Y ASXL1 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 44109 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 46851 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 33646463 33646512 33646488 Y TP53INP2,MYH7B TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 32162 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 34479476 34479734 34479606 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 5895 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 35239893 35239986 35239939 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 7756 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr20 35723463 35723698 35723601 Y NA RBL1 NA NA NA NA RBL1 1275 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 35874402 35874620 35874497 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 35985970 35986139 35986055 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 14882 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 36542931 36543304 36543133 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 13432 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 38910785 38911109 38910947 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 404771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 42809563 42809791 42809669 Y FITM2,JPH2 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA JPH2 4427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 43436178 43436522 43436351 Y NA RIMS4 NA NA NA NA RIMS4 457 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 43607893 43608251 43608061 Y NA TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 14778 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 45210571 45210900 45210742 Y NA NA NA NA NA NA TP53RK 105518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 47367806 47368111 47367871 Y STAU1,PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 74309 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 47405213 47405452 47405443 Y ZNFX1,PREX1 PREX1 NA NA NA NA PREX1 36968 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr20 49487134 49487591 49487436 Y NA NA NA NA NA NA RP5-914P20.5 57930 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 52364781 52365137 52364834 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 140335 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 52367753 52368082 52368002 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 143307 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 54997703 54998108 54997901 Y NA AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 32276 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 56950925 56951211 56951109 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 10967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 57228113 57228577 57228221 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 3623 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 57697313 57697490 57697364 Y NA NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 81349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 58402426 58402798 58402570 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 110554 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA PPP1R3D 61565 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 60803093 60803442 60803179 Y NA HRH3,OSBPL2 NA NA NA NA OSBPL2 8138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 61883812 61884064 61883938 Y NA YTHDF1,NKAIN4,ARFGAP1 NA NA NA NA NKAIN4 17982 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 62466212 62466776 62466445 Y OPRL1,ABHD16B ZBTB46,TPD52L2 PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB46 5615 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 MIR3648 1350682 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 16047822 16048195 16048009 Y NA NA NA NA NA NA HSPA13 294017 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 16064365 16064765 16064448 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA HSPA13 310560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 16354668 16355055 16354876 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 80266 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 237288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 17681993 17682347 17682285 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 241151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 17745935 17746301 17746052 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 305093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 466067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 483431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 519825 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 19157127 19157381 19157167 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 32322 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 21370888 21371541 21371452 Y NA NA NA NA NA NA RPL37P3 2106086 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 22510106 22510468 22510126 Y NCAM2 NA NA NA NA NA TUBAP 2268980 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 26882215 26882658 26882608 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 95171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 28219280 28219541 28219411 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3552 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.19377946202936 chr21 30579515 30579904 30579685 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 15123 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 30758449 30758782 30758692 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 194057 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 30927917 30928144 30928028 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 363525 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 33301390 33301573 33301482 Y NA NA NA NA NA NA HUNK 57762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 33702310 33702533 33702421 Y NA NA NA NA NA NA MIS18A 52930 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 NA NA NA NA NA RCAN1 234258 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 37694250 37694633 37694410 Y NA MORC3 NA NA NA NA MORC3 3763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 37909542 37909917 37909766 Y NA NA NA NA NA NA CHAF1B 153866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 38434187 38434580 38434547 Y NA PIGP,TTC3 NA NA NA NA PIGP 8890 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr21 39135127 39135274 39135173 Y KCNJ6 NA NA NA NA NA KCNJ6 151475 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 39638764 39638897 39638765 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 147219 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 40071291 40071394 40071343 Y NA NA ETS2,ERG,BRWD1,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 103837 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 41729839 41730224 41730032 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT5 803470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 72994 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 45146832 45147391 45147298 Y NA PDXK,CSTB NA NA NA NA PDXK 9857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 45359018 45359208 45359125 Y ICOSLG,C21orf2,TRAPPC10 NA NA NA NA NA TRAPPC10 70992 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA NA NA NA NA NA LRRC3 70409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr21 47637534 47637799 47637667 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA LSS 8939 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 17528836 17529213 17528959 Y NA IL17RA NA NA NA NA IL17RA 34631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 17726337 17726494 17726401 Y CECR2,BCL2L13,IL17RA,CECR1 CECR1,CECR3 NA NA NA NA CECR3 19129 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 17745323 17745619 17745476 Y NA CECR1,CECR3 NA NA NA NA CECR3 4 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 10563 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 19072724 19073088 19073012 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 34879 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chr22 19476851 19477107 19476979 Y NA HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA CDC45 11869 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 23876230 23876637 23876426 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC8P1 133317 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCB1 26138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 13631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 26455753 26456126 26455940 Y MYO18B NA MYO18B,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 MYO18B 319642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 27816576 27816924 27816809 Y NA NA MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 378562 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 29206791 29206989 29206921 Y EMID1,CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1 K562 ChIA-PET 22265404 CTA-292E10.6 12120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 32983251 32983414 32983333 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 114588 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 33238776 33239102 33239072 Y SYN3,SYN3 TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 43089 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 NA NA NA NA NA TIMP3 69996 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 34167018 34167152 34167086 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 68112 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 36245846 36246212 36246206 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 176261 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 6.55565257995501 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 37038382 37038610 37038496 Y APOL3 NA NA NA NA NA EIF3D 114899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 37219328 37219591 37219472 Y NA IFT27 NA NA NA NA IFT27 49028 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 37675587 37675874 37675731 Y TRIOBP RAC2 NA NA NA NA RAC2 37099 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 38351215 38351232 38351224 Y NA POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA C22orf23 3539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 39686679 39687117 39686848 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL3 27277 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 39698105 39698354 39698234 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 16040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 40451411 40451463 40451437 Y NA TNRC6B,RPL7P52 NA NA NA NA TNRC6B 12590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 40982487 40982801 40982645 Y NA MKL1 NA NA NA NA MKL1 47905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 41079087 41079368 41079234 Y MCHR1 MKL1,GAPDHP37,MCHR1 NA NA NA NA MCHR1 6333 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 41080878 41081122 41080979 Y NA GAPDHP37,MCHR1 NA NA NA NA MCHR1 8124 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr22 42008568 42008780 42008674 Y NA PMM1,XRCC6 NA NA NA NA XRCC6 6343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 44443702 44443981 44443822 Y NA NA NA NA NA NA PARVB 50611 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 45106642 45106985 45106689 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 NA NA NA NA ARHGAP8 10287 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 NUP50 NA NA NA NA NUP50 13846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 45615470 45615494 45615482 Y NA KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 19156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46159997 46160538 46160082 Y NA NA NA NA NA NA ATXN10 94319 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA NA NA NA NA NA RP6-109B7.3 72139 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46393370 46393721 46393470 Y C22orf26 NA C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP6-109B7.3 53864 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 46423205 46423605 46423251 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 23980 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46441533 46441708 46441621 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 5877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46462776 46462894 46462836 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr22 46641618 46641856 46641678 Y PPARA TTC38,GTSE1 NA NA NA NA TTC38 20002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 160536 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 50741799 50742849 50742615 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 1207 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 306134 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 4428359 4428568 4428464 Y NA NA NA NA NA NA SUMF1 78397 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 147131 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 5037242 5038218 5038020 Y BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 18441 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 8335682 8335807 8335745 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 205586 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 8801864 8802112 8802043 Y NA CAV3 NA NA NA NA CAV3 28378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 9721492 9721576 9721535 Y IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC MTMR14,BRPF1 NA NA NA NA MTMR14 32375 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 10215234 10216150 10215734 Y NA VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 10685 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 10276652 10276834 10276729 Y NA TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 10873 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 11324850 11325078 11324951 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 12855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 11645125 11645451 11645297 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 114769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 13460446 13460799 13460651 Y NA NUP210 NA NA NA NA NUP210 637 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 15561676 15562052 15561831 Y ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ NA NA NA NA NA BTD 78796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 16380469 16380852 16380674 Y DPH3 NA NA NA NA NA OXNAD1 75763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 16385971 16386232 16386102 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 81265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 17505233 17505390 17505312 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 663074 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 18722396 18722640 18722477 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 144231 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 20122748 20122899 20122825 Y NA KAT2B NA NA NA NA KAT2B 43233 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA NA NA NA NA NA NKIRAS1 577659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 26688087 26688474 26688152 Y LRRC3B NA NA NA NA NA SLC4A7 835437 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.69806042971821 chr3 28951989 28952356 28952173 Y NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS3 368117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 29288264 29288669 29288439 Y NA RBMS3 RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS3 31804 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 248197 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 30723230 30723490 30723363 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 77236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 32673 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr3 36942339 36942611 36942476 Y TRANK1,GOLGA4 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 41937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 37805955 37806276 37805982 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC093415.2 94995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr3 39191403 39191804 39191748 Y NA TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1 NA NA NA NA CSRNP1 2249 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 42237448 42237989 42237678 Y NA NA NA NA NA NA TRAK1 184154 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.68093655896282 chr3 45688648 45689066 45688756 Y LIMD1 SACM1L SACM1L,LOC644714 IMR90 Hi-C 24141950 SACM1L 39482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 46365618 46366089 46365745 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA CCR1 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 330302 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA NA NA NA NA NA PTH1R 317017 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 46995135 46995433 46995392 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 23740 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47000781 47001063 47000953 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 18110 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47485746 47485855 47485805 Y NA SCAP NA NA NA NA SCAP 30761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 48407940 48408314 48408284 Y TREX1 NA CCDC51,PLXNB1,ATRIP,CCDC72 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNB1 61280 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 C3orf62,USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 4232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 52039668 52039907 52039792 Y NA PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29,DUSP7 RPL29 K562 ChIA-PET 22265404 RPL29 11710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 54734224 54734587 54734407 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 75982 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 57874517 57874643 57874579 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 117484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 58585428 58585740 58585446 Y NA NA NA NA NA NA ACOX2 64382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 60308394 60308706 60308548 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 926427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 61579072 61579152 61579112 Y PTPRG PTPRG NA NA NA NA PTPRG 33829 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 61728117 61728514 61728321 Y NA RPL10AP6 NA NA NA NA RPL10AP6 1337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 62311824 62311884 62311857 Y NA C3orf14,PTPRG-AS1 NA NA NA NA C3orf14 9176 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 62590103 62590230 62590174 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 237098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 64991801 64992000 64991901 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 320125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 66533474 66533812 66533569 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 15875 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 71389278 71389380 71389331 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 241760 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 72322807 72323018 72322913 Y NA NA RYBP,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00870 124399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 73835686 73835988 73835837 Y NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 163595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 75199894 75200047 75199971 Y NA NA NA NA NA NA FAM86DP 282214 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 816026 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 9.41324473019181 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr3 85011127 85011790 85011174 Y NA CADM2 NA NA NA NA CADM2 4995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 85094285 85094567 85094426 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 88153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 576950 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 81078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA FILIP1L TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 48101 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr3 101825381 101825701 101825541 Y NA NA LOC152225,FAM55C,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 280546 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 101843193 101843415 101843276 Y ZPLD1 NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 298358 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 101875301 101875563 101875428 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 330466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 106782352 106782425 106782408 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 LINC00882 175063 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 106839867 106840135 106840037 Y NA NA NA NA NA NA LINC00882 117353 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 107348544 107348833 107348648 Y NA NA NA NA NA NA BBX 108761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 112994855 112995215 112995035 Y NA NA NA NA NA NA BOC 67005 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 114261968 114262342 114261973 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 488508 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 117118935 117118948 117118939 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 375390 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 117441757 117441996 117441951 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 272099 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 119315385 119315520 119315495 Y TMEM39A,POGLUT1,CD80,ADPRH,COX17 ADPRH,RP11-190C22.1 NA NA NA NA ADPRH 19270 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 120040705 120041102 120040904 Y NA LRRC58 NA NA NA NA LRRC58 25084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 121539764 121539854 121539811 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 12072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 124186688 124187264 124187025 Y KALRN NA NA NA NA NA UMPS 259949 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 NA NA NA NA NA CHCHD6 300013 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 128947996 128948470 128948199 Y MBD4,KIAA1257,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP CNBP KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 47231 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 129436791 129437287 129437073 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 113130 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 134286307 134286601 134286455 Y CEP63,CEP63,CEP63 EPHB1 NA NA NA NA EPHB1 28042 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 134357896 134357929 134357912 Y NA EPHB1 NA NA NA NA EPHB1 43253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 138080636 138080776 138080706 Y NA MRAS NA NA NA NA MRAS 16097 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 139715933 139715982 139715958 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 63906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 139824639 139824888 139824698 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 172612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 139909278 139909663 139909338 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 257251 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr3 141131172 141131505 141131226 Y SLC25A36,RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 72384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 142164400 142165110 142164972 Y XRN1 NA NA NA NA NA XRN1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 143853302 143853504 143853403 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 164662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 145164438 145164687 145164563 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 375839 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 147140808 147141337 147141213 Y NA ZIC1,ZIC4 NA NA NA NA ZIC4 18161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA RP11-71N10.1 NA NA NA NA RP11-71N10.1 8084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 148332840 148332859 148332850 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 374269 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 148585310 148585526 148585462 Y CPA3 NA NA NA NA NA GYG1 121602 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149225388 149225682 149225672 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 14941 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149339543 149339560 149339552 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 112941 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 150348986 150349006 150348996 Y CLRN1 SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 29971 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 151974707 151975007 151974858 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 10337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 156149618 156149810 156149747 Y NA NA NA NA NA NA SSR3 121163 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 156959494 156959508 156959501 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550I24.2 68482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 157249695 157249901 157249798 Y VEPH1 NA C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1 IMR90 Hi-C 24141950 PTX3 97117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 165533635 165533716 165533676 Y BCHE BCHE NA NA NA NA BCHE 19544 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171146057 171146176 171146159 Y NA TNIK NA NA NA NA TNIK 30021 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 171897555 171897878 171897648 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 142137 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 173873395 173873401 173873398 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 219633 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 174987266 174987320 174987290 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 447138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 175204149 175204623 175204405 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 229835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 177293593 177293900 177293627 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 380332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 178423779 178424120 178423952 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 363947 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 178671519 178671916 178671775 Y NA NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 116151 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 179122098 179122379 179122239 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 44999 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 181537254 181537571 181537413 Y NA NA NA NA NA NA SOX2 109540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 182978108 182978472 182978157 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 9076 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 184655907 184656134 184656021 Y VPS8 NA NA NA NA NA VPS8 127976 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 187682660 187682900 187682757 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 186172 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 188139673 188140134 188139816 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 269828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 188276216 188276468 188276344 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1 386535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 188324508 188324886 188324659 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1 338117 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 188475500 188475699 188475599 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1 187304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 191160044 191160233 191160139 Y PYDC2 NA FGF12 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 115178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 191620991 191621297 191621143 Y PYDC2 NA NA NA NA NA CCDC50 576125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 192332888 192333028 192332958 Y FGF12 NA NA NA NA NA MB21D2 300922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 194253479 194253627 194253544 Y ATP13A3 ATP13A3,TMEM44-AS1 TMEM44,ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 36386 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 194850291 194850713 194850430 Y PPP1R2,LSG1 NA NA NA NA NA XXYLT1 139183 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 194925332 194925664 194925571 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 64232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 194973636 194973680 194973658 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 16216 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 195073897 195074088 195073990 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 84001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 195153778 195154174 195153996 Y NA ACAP2 NA NA NA NA ACAP2 7633 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 195264699 195265107 195264994 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 3102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 195430866 195431240 195430948 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R2 162657 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 8913 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 196105226 196105537 196105382 Y PCYT1A NA NA NA NA NA UBXN7 51808 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 196784656 196784743 196784700 Y CEP19,PIGX,PAK2 MFI2 NA NA NA NA MFI2 29969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr3 196855650 196855726 196855688 Y NA NA NA NA NA NA MFI2 100963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 873387 873975 873731 Y NA NA NA NA NA NA GAK 50186 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 2174695 2175024 2174860 Y NA NA NAT8L,C4orf48 IMR90 Hi-C 24141950 POLN 66824 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 2802562 2803388 2803116 Y ZFYVE28,LOC402160,HTT,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 9812 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 3463022 3463837 3463465 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 68449 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr4 6172675 6172972 6172793 Y NA NA NA NA NA NA WFS1 96604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 7978189 7978377 7978271 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 38536 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 8614691 8614733 8614712 Y NA CPZ NA NA NA NA CPZ 22304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 9605717 9605843 9605777 Y NA NA NA NA NA NA RP11-448G15.1 400263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr4 13250215 13250573 13250395 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 82465 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 17495942 17496188 17496050 Y MED28,LAP3 QDPR NA NA NA NA QDPR 15669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 20445202 20445303 20445235 Y KCNIP4 NA NA NA NA NA SLIT2 192319 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 20521707 20522059 20521739 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 173846 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 20627000 20627372 20627197 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 68533 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 21568981 21569135 21569128 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 873076 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 26343884 26344230 26344058 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 180807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 26347905 26348036 26347971 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 184828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 26522760 26523014 26522887 Y NA NA RBPJ,CCKAR,TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D19 53045 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 26888311 26888739 26888468 Y NA STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 28090 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.19377946202936 chr4 33723904 33724162 33724014 Y NA NA NA NA NA NA RP11-734I18.1 1726885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 38205649 38205886 38205830 Y NA NA FAM114A1,TLR6,KLF3,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 PTTG2 245593 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 39913580 39913628 39913604 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 63948 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 41573569 41573937 41573753 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 213945 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB,SPATA18 NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr4 56323586 56323848 56323646 Y NA NA NA NA NA NA TMEM165 63462 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 57831930 57832208 57832081 Y NA POLR2B,NOA1 NA NA NA NA POLR2B 9680 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 58192382 58192585 58192405 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP7 217831 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 62495437 62495478 62495458 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 144090 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 65448348 65448419 65448384 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 153721 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 73999620 73999782 73999700 Y NA NA NA NA NA NA COX18 66148 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA NA IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CXCL1 139312 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 74881912 74882135 74882023 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 CXCL5,CXCL3 NA NA NA NA CXCL5 19416 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 75409847 75410209 75409849 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MTHFD2L 431956 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 77275383 77275784 77275690 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 78469 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 77505994 77506531 77506183 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 151741 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 77522680 77522954 77522817 Y SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 168427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 77545422 77545888 77545544 Y SCARB2 NA NA NA NA NA SHROOM3 191169 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 82413860 82414069 82413959 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA PRKG2 279642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 83680712 83680815 83680808 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37195 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 83912303 83912539 83912423 Y NA LIN54,COPS4 NA NA NA NA LIN54 19540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 85868944 85869302 85869263 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 16236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 87880821 87880990 87880863 Y NA AFF1 NA NA NA NA AFF1 26667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 89377235 89377564 89377513 Y HERC6,HERC5 HERC5 NA NA NA NA HERC5 967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 90174156 90174307 90174302 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 52854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 90391330 90391567 90391434 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 164169 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 91039777 91039927 91039866 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 282311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 99344407 99344641 99344524 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 163872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 99937707 99938078 99937893 Y NA METAP1 NA NA NA NA METAP1 22936 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 101329645 101329884 101329805 Y EMCN NA NA NA NA NA H2AFZ 460100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 101440272 101440596 101440446 Y NA NA NA NA NA NA EMCN 358687 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 102131266 102131303 102131283 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 135634 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 102237823 102238346 102238192 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 28591 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 108561367 108561423 108561395 Y NA NA NA NA NA NA PAPSS1 78185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 110125324 110125640 110125483 Y NA NA NA NA NA NA COL25A1 96173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 110320309 110320596 110320490 Y LRIT3 SEC24B,SEC24B-AS1 OSTC,AGXT2L1,COL25A1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 32332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 111041485 111041815 111041651 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL6 76540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 111549500 111549935 111549649 Y PITX2 PITX2 NA NA NA NA PITX2 11344 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 113547591 113547910 113547748 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA LARP7 8210 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr4 114369024 114369155 114369101 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 311928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 114554794 114555018 114554909 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 126065 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 114730352 114730805 114730660 Y NA CAMK2D NA NA NA NA CAMK2D 49269 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 121812608 121812671 121812657 Y NA PRDM5 NA NA NA NA PRDM5 29354 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 123776087 123776259 123776177 Y NA FGF2 NA NA NA NA FGF2 30224 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 124521229 124521410 124521292 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 205279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 124764674 124764868 124764687 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 448724 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 127487763 127488061 127487932 Y NA NA NA NA NA NA INTU 1054365 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 127560832 127561219 127561186 Y NA NA NA NA NA NA INTU 981207 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 128403085 128403258 128403257 Y NA NA NA NA NA NA INTU 139168 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 138249748 138250114 138249931 Y NA NA NA NA NA NA RPS23P2 117127 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 138260702 138260710 138260707 Y NA NA NA NA NA NA RPS23P2 106531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr4 138585739 138585945 138585825 Y PCDH18 NA PCDH18 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH18 134091 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 140334690 140334958 140334824 Y ELF2 RAB33B NA NA NA NA RAB33B 37428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr4 140897225 140897350 140897279 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 175988 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 140982751 140983079 140982915 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 90259 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 141011416 141011614 141011507 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 61724 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 143206374 143206633 143206590 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 559952 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 143404343 143404364 143404354 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 362221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 143485027 143485245 143485038 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 281340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 146674591 146674889 146674740 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 137176 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 146833675 146833816 146833746 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 23971 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 148951514 148951899 148951701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 300300 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 149364278 149364693 149364534 Y NR3C2 NR3C2 NA NA NA NA NR3C2 428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 149467274 149467593 149467420 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 103424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 152048107 152048440 152048274 Y LRBA,LRBA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 29382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153180891 153181284 153181088 Y NA NA PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 273969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153412522 153412921 153412842 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 42332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153877923 153878050 153877976 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 22419 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 154154502 154154721 154154529 Y TRIM2,TRIM2 NA NA NA NA NA TRIM2 83008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154176673 154176745 154176706 Y NA NA NA NA NA NA MND1 87056 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA RNF175 130906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154562795 154563024 154562959 Y TLR2 NA NA NA NA NA RNF175 116363 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154685841 154686040 154685896 Y NA RNF175,SFRP2 NA NA NA NA RNF175 6454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 154711839 154712367 154712106 Y SFRP2 RNF175,SFRP2 NA NA NA NA SFRP2 3567 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 157718385 157718680 157718607 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 171866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 157868046 157868334 157868214 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr4 157893618 157893834 157893797 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 3072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 158219771 158220072 158219781 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 224562 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 159082542 159083127 159082686 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B NA NA NA NA RP11-597D13.9 6777 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 159085222 159085591 159085435 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B NA NA NA NA RP11-597D13.9 4313 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 159112760 159112996 159112870 Y TMEM144 RP11-597D13.9,FAM198B NA NA NA NA FAM198B 20290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 161769764 161769816 161769790 Y NA NA NA NA NA NA FNIP2 2081474 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 162371144 162371411 162371278 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1714662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 162615770 162615950 162615860 Y FSTL5 NA NA NA NA NA NAF1 1470123 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 RP11-366M4.2,NACA3P,TRIM61 NA NA NA NA TRIM61 14196 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169716186 169716224 169716221 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 213202 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 172774003 172774328 172774166 Y GALNTL6 GALNTL6 NA NA NA NA GALNTL6 42598 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 174106562 174106852 174106704 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 17759 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 174435467 174435730 174435599 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 13650 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 5078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 174470601 174470612 174470607 Y NA HAND2 NA NA NA NA HAND2 21221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 175402841 175403033 175402937 Y NA NA NA NA NA NA FBXO8 199426 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 176796113 176796315 176796215 Y NA NA NA NA NA NA WDR17 188670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 183439666 183439879 183439717 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 375264 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 184888585 184888733 184888700 Y STOX2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 18098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 40301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 187622574 187622751 187622592 Y FAT1 FAT1 NA NA NA NA FAT1 23125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr4 189361062 189361328 189361166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219G10.1 91884 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 189365489 189365865 189365533 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219G10.1 96311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 190606825 190607040 190606933 Y FRG1 RNU1-51P NA NA NA NA RNU1-51P 21828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA TPPP 85938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.02568580613308 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 1102623 1102762 1102676 Y TPPP,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 7388 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 1103805 1104368 1103973 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 5782 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.86615408561449 chr5 11283783 11284165 11283974 Y NA NA NA NA NA NA DAP 524399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 14742718 14742956 14742837 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 53553 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 17196578 17196835 17196707 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 132871 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 20470673 20471013 20470843 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 868929 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 32164142 32164348 32164245 Y ZFR GOLPH3 NA NA NA NA GOLPH3 8108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 33770516 33770851 33770752 Y NA NA NA NA NA NA AMACR 235369 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 33834348 33834761 33834680 Y NA NA NA NA NA NA AMACR 171459 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 36425659 36425959 36425758 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3L 125443 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 36681914 36682309 36681923 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A3 77457 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 38446340 38446486 38446390 Y EGFLAM NA NA NA NA NA MIR3650 109177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA C9 NA NA NA NA C9 27507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 40388555 40388624 40388591 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 288976 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 42505068 42505257 42505244 Y NA NA NA NA NA NA GHR 83189 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 44663713 44663769 44663741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-53O19.1 143110 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 45793437 45793825 45793631 Y NA NA NA NA NA NA HCN1 99184 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 50149268 50149286 50149277 Y NA NA NA NA NA NA PARP8 189535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 54751142 54751459 54751301 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 73070 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 54777886 54777973 54777929 Y SKIV2L2 RNF138P1 NA NA NA NA RNF138P1 46556 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 640970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 57953324 57953469 57953397 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 199237 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58343486 58343717 58343566 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 589399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 605797 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58365928 58366326 58366127 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 611841 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58408556 58408894 58408726 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 654469 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 666059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 667032 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 998657 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 59042319 59042506 59042428 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 773441 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 59057056 59057135 59057102 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 758812 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 65097290 65097569 65097365 Y ERBB2IP,SGTB NA NA NA NA NA SGTB 80428 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr5 66641373 66641711 66641542 Y NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 343592 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr5 71804159 71804292 71804254 Y ZNF366 NA NA NA NA NA MRPS27 189686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 3.02568580613308 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 73209063 73209467 73209267 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 349552 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.68949849434052 chr5 73330710 73331077 73330894 Y NA NA FAM169A,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRA2 471199 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 74355814 74356040 74355964 Y ANKRD31,FAM169A RP11-229C3.2 NA NA NA NA RP11-229C3.2 9146 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 74800476 74800595 74800536 Y NA POLK,COL4A3BP NA NA NA NA POLK 4986 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 77825252 77825732 77825631 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 170913 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 77832292 77832355 77832327 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 177953 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 77837654 77837953 77837804 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 183315 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 77940704 77941073 77940964 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 122771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 78612719 78612843 78612781 Y JMY CTC-451P13.1 NA NA NA NA CTC-451P13.1 33978 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 80216788 80217158 80217017 Y NA RASGRF2 RASGRF2,MSH3 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRF2 37333 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 80260404 80260721 80260547 Y NA RASGRF2 NA NA NA NA RASGRF2 5913 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 43441 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 80564528 80564843 80564784 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 30536 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 ACOT12 NA NA NA NA ACOT12 19653 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 81149415 81149815 81149554 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 41796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 87553177 87553334 87553293 Y NA TMEM161B-AS1,TMEM161B NA NA NA NA TMEM161B-AS1 9378 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C CTC-467M3.1,LINC00461 NA NA NA NA CTC-467M3.1 12867 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 93013083 93013343 93013254 Y NA NPM1P27 NA NA NA NA NPM1P27 4030 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 2102 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX,C5orf27 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 95207014 95207210 95207113 Y ELL2 C5orf27 NA NA NA NA C5orf27 21078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr5 100175986 100176458 100176300 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 60512 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 102626566 102626737 102626652 Y NA C5orf30 NA NA NA NA C5orf30 34163 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 106724874 106725113 106725059 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 279483 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 106803890 106804202 106804046 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 200394 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 109207541 109207704 109207623 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 184474 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 115157919 115158169 115158044 Y LOC644100 CDO1,AP3S1,ATG12 NA NA NA NA CDO1 7268 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 115855956 115855969 115855965 Y NA CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 40289 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 118368421 118368671 118368600 Y TNFAIP8,TNFAIP8,DMXL1 DTWD2,DMXL1 TNFAIP8,DMXL1 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL1 2796 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 118679433 118679692 118679586 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 77046 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 123966351 123966687 123966497 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 115813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 126307935 126308247 126308163 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 56253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 131800033 131800450 131800090 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 NA NA NA NA IRF1 24040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 131835833 131835962 131835893 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF1 11343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr5 133455254 133455613 133455348 Y NA TCF7 NA NA NA NA TCF7 6852 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr5 134527149 134527274 134527245 Y NA NA CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 158646 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 135347789 135348106 135347904 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 14478 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 136930873 136930924 136930899 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 1144 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 137810438 137810840 137810496 Y NA REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 11259 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 182646 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 317510 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139090940 139091124 139091019 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 66056 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139629538 139629745 139629587 Y NA NA NA NA NA NA PFDN1 50961 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 139691635 139691999 139691907 Y HBEGF PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 10929 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 140888509 140888855 140888756 Y PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 34929 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,PCDH12,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 141706626 141706892 141706857 Y NA AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA SPRY4 2606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 141769483 141770003 141769555 Y NA NA SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 65463 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 148540754 148540865 148540805 Y ABLIM3 ABLIM3 AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 21708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 148664180 148664379 148664280 Y NA AFAP1L1 NA NA NA NA AFAP1L1 14746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 149660183 149660270 149660234 Y NA NA NA NA NA NA ARSI 56600 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 149838456 149838698 149838517 Y SYNPO,ZNF300,SLC6A7 RPS14,NDST1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 11137 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 149985154 149985492 149985203 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 6512 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 151088912 151089056 151088970 Y SLC36A3 SPARC NA NA NA NA SPARC 24186 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 153008472 153008835 153008712 Y NA NA NA NA NA NA MFAP3 407631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA SGCD 423306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr5 155906894 155907163 155907007 Y NA NA NA NA NA NA SGCD 611540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 159471418 159471693 159471487 Y SLU7 TTC1 NA NA NA NA TTC1 37298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 166427113 166427459 166427286 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 972797 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 167639977 167640074 167640026 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 76582 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 168287563 168287715 168287633 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 246246 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B NA NA NA NA NA KCNIP1 373945 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA FGF18 NA NA NA NA FGF18 33433 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 172127299 172127478 172127433 Y NEURL1B CTB-79E8.3 NA NA NA NA CTB-79E8.3 45583 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 178165468 178165782 178165663 Y NA ZNF354A JPH2 MCF7 ChIA-PET 19890323 ZNF354A 9765 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 7.73230817122899 chr5 178323440 178323622 178323554 Y NA ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2 NA NA NA NA ZFP2 2545 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 178698075 178698460 178698284 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS2 71971 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 179386785 179386995 179386917 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA TBC1D9B 53926 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 179476258 179476557 179476475 Y MAML1,LTC4S RNF130 NA NA NA NA RNF130 20561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA MAPK9 907 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 180527494 180527529 180527504 Y NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-338M12.5 89395 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 13382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 12696 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 304014 304108 304058 Y HUS1B DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 14384 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA IRF4 82949 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 1641578 1641903 1641733 Y NA FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 32897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 3351823 3351920 3351872 Y TUBB2B,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 103336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 3389811 3390490 3390264 Y SERPINB6,SLC22A23,C6orf145 NA NA NA NA NA SLC22A23 64766 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 4603647 4603982 4603794 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 100411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 5266800 5267044 5266922 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 7523 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 5296297 5296648 5296345 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 37020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 5996432 5996750 5996575 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 8450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 447821 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 6879215 6879409 6879309 Y RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 226421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 7157997 7158379 7158000 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 52167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 7392474 7392879 7392481 Y NA SSR1,RIOK1,CAGE1 NA NA NA NA CAGE1 4498 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 10589491 10589864 10589781 Y NA NA NA NA NA NA PAK1IP1 103064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 11459328 11459680 11459376 Y NA NA NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 76258 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 11931418 11931784 11931557 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 75211 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 11975838 11976169 11975921 Y TMEM170B,HIVEP1 HIVEP1 ADTRP,HIVEP1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 30826 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 12291396 12291672 12291434 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 220670 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 13630387 13630831 13630754 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 16828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 14640701 14640843 14640773 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 524829 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 55397 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2 121083 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 15474239 15474654 15474451 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 186635 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 15554239 15554360 15554316 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 106929 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 16322882 16323237 16323091 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 86071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 16399265 16399639 16399452 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 162454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 16607418 16607798 16607611 Y NA NA NA NA NA NA ATXN1 151924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 16668776 16668955 16668866 Y NA NA NA NA NA NA ATXN1 90767 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 18833535 18833568 18833552 Y NA NA NA NA NA NA DEK 570481 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 21925228 21925506 21925404 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 333256 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 23416144 23416318 23416203 Y NA NA LINC00340,SOX4 IMR90 Hi-C 24141950 MRS2 984835 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 23656570 23656900 23656609 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 744253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 24302656 24303033 24302868 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 98120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 24323980 24324360 24324286 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 NA NA NA NA NA MRS2 76793 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 25007534 25007864 25007632 Y TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 32887 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP29 120066 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 25630252 25630438 25630350 Y SCGN NA NA NA NA NA HIST1H2AA 94352 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 26283996 26284379 26284279 Y NA HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H4H 234 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 28099505 28099599 28099552 Y OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30604064 30604457 30604261 Y NA MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18 NA NA NA NA PTMAP1 4655 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30703511 30703691 30703651 Y NA PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 NA NA NA NA FLOT1 4819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30774085 30774428 30774395 Y NA NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 63754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 30910531 30910726 30910623 Y NA GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 36512 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,LY6G6D,DDAH2,CLIC1 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA ATF6B 17851 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 32912229 32912629 32912303 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,RGL2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,B3GALT4,HLA-DMB,HLA-DOA,HLA-DMA,BRD2,BRD2 BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2 21808 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 33792376 33792455 33792405 Y CUTA,C6orf1 LEMD2 IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 37463 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 NA NA NA NA NA LEMD2 117255 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 35279423 35279720 35279457 Y FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6 DEF6,PPARD NA NA NA NA DEF6 15828 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 35311267 35311540 35311417 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD DEF6,PPARD NA NA NA NA PPARD 2932 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 35569141 35569999 35569809 Y FKBP5,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,FKBP5,FKBP5,ZNF76,DEF6 RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 47491 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 37051169 37051555 37051360 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2 NA CPNE5,PIM1,C6orf89,PPIL1,FGD2,TBC1D22B,MTCH1,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 84424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 37098455 37099411 37099295 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 36568 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 37155093 37155653 37155211 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 19114 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 37366071 37366087 37366081 Y NA RNF8 NA NA NA NA RNF8 46323 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 37424991 37425195 37425093 Y NA CCDC167 CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC167 40503 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 37673124 37673343 37673226 Y NA MDGA1 MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 MDGA1 8042 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 39787581 39787781 39787659 Y NA DAAM2 NA NA NA NA DAAM2 29439 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 41214844 41215190 41215026 Y NFYA,TFEB,TREML2,TREM1 TREML2 NA NA NA NA TREML2 47912 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA FOXP4 170391 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 78093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42259187 42259201 42259195 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 75584 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42361929 42362135 42362048 Y NA NA NA NA NA NA TRERF1 55654 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 3619 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA ATP6V0CP3,TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42898508 42898648 42898552 Y NA C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6 NA NA NA NA CNPY3 3570 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 42944777 42944970 42944923 Y NA CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 43085846 43085863 43085854 Y NA PTK7 NA NA NA NA PTK7 43840 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 43635973 43636240 43636108 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 17288 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 43701754 43702119 43701846 Y TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA TMEM63B,MRPS18A,LOC100132354,CAPN11,XPO5,POLH,RSPH9,VEGFA,C6orf223,MRPL14,SLC29A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFA 33802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44043583 44043857 44043624 Y SLC35B2 TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 48794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44050434 44050837 44050619 Y NA TMEM63B,MRPL14 MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 41814 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44169709 44170051 44169929 Y NA SLC29A1,HSP90AB1 NA NA NA NA SLC29A1 15191 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 44185571 44185900 44185742 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 329 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 44186277 44186510 44186378 Y SLC29A1 SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 1035 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44634916 44635472 44635214 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 281654 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 44924205 44924374 44924290 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 419316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 44949602 44949944 44949774 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 393746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43974 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 45317803 45318343 45317888 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 25347 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 45557969 45558292 45558091 Y NA NA RUNX2,CDC5L,SUPT3H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 214279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 46158707 46159070 46158867 Y ENPP5 NA NA NA NA NA ENPP4 62977 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 51262552 51262854 51262561 Y NA NA NA NA NA NA RPS17P5 439177 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA NA NA NA NA NA RPS17P5 451885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 52389241 52389494 52389368 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 50219 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 52972904 52973327 52973040 Y NA ICK NA NA NA NA ICK 48304 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 53165916 53166137 53165996 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 45810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 53205102 53205427 53205266 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 6520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 57322945 57323108 57323027 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 145342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 68906654 68906666 68906660 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 436593 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 69073987 69074006 69073998 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 269253 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 69353902 69354407 69354113 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 10643 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 69431654 69431887 69431658 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 88395 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 73524800 73525128 73524864 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 445810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 74194767 74195136 74194952 Y NA MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 25466 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 75452130 75452155 75452143 Y NA NA CD109 IMR90 Hi-C 24141950 COL12A1 461612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 81044945 81045591 81045323 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 230581 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 82444623 82444816 82444722 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 15675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 83737150 83737334 83737242 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 38051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 84601276 84601399 84601338 Y NA RIPPLY2,CYB5R4 NA NA NA NA CYB5R4 33914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 89577904 89578284 89578094 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 93064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 90059850 90060767 90060332 Y RNGTT,PNRC1,UBE2J1,RRAGD NA NA NA NA NA UBE2J1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 90782420 90782788 90782672 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 221839 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 94127729 94128504 94127840 Y NA EPHA7 NA NA NA NA EPHA7 464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 99901572 99901766 99901669 Y NA RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 30365 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC,PRDM13 NA NA NA NA PRDM13 837 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 100584000 100584312 100584155 Y NA NA SIM1,ASCC3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 391840 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 105540278 105540291 105540285 Y HACE1,LIN28B BVES NA NA NA NA BVES 42758 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 330995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 107216864 107217098 107216981 Y NA NA NA NA NA NA C6orf203 130309 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 108972074 108972278 108972175 Y FOXO3 NA NA NA NA NA FOXO3 93036 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 111739300 111739614 111739444 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 63100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 111902540 111902626 111902591 Y REV3L TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 22855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112110273 112110463 112110418 Y NA NA NA NA NA NA FYN 82192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112110533 112110931 112110911 Y NA NA NA NA NA NA FYN 81724 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112163238 112163349 112163330 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 29306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112428707 112428734 112428721 Y LAMA4 TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 21975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112523729 112524008 112523937 Y LAMA4 NA NA NA NA NA LAMA4 50133 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112544295 112544605 112544462 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 29536 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 112824431 112824764 112824616 Y NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 250290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 113104974 113105145 113105060 Y NA NA FLJ34503,HDAC2,MARCKS,LOC285758 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 530833 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 113388033 113388045 113388040 Y NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 788496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 116345065 116345141 116345103 Y NA FRK NA NA NA NA FRK 34780 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 116701798 116702097 116701822 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL1 102732 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 119029991 119030657 119030634 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 CEP85L NA NA NA NA CEP85L 753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 123074884 123075101 123074982 Y NA SMPDL3A NA NA NA NA SMPDL3A 33214 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 128058228 128058450 128058362 Y THEMIS NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 303447 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA LAMA2 NA NA NA NA LAMA2 48235 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr6 131146297 131146332 131146315 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L2 236130 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 131386975 131387183 131387097 Y EPB41L2,EPB41L2 EPB41L2 EPB41L2,AKAP7 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 4513 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.35331118254795 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 138014873 138015216 138015162 Y NA NA IL20RA IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 171135 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 138086356 138086546 138086429 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 99805 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 139304978 139305148 139305081 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 2250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 139656661 139656994 139656829 Y NA TXLNB,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 36763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 140926275 140926589 140926526 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1232518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 144222980 144223299 144223160 Y NA NA PLAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 LTV1 60499 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 144279957 144280354 144280096 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 117476 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 144283195 144283286 144283251 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 120714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 147831138 147831275 147831225 Y SAMD5 SAMD5 NA NA NA NA SAMD5 3075 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 148443958 148444368 148444103 Y NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 147072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 148535046 148535159 148535103 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 56281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 148830845 148831563 148831298 Y UST NA NA NA NA NA UST 234901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 149469483 149469749 149469661 Y ZC3H12D,TAB2,PPIL4 NA NA NA NA NA TAB2 68028 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 151365804 151366060 151365928 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 52605 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 152583976 152584217 152584151 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 372719 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 153411582 153411939 153411751 Y MTRF1L RGS17 NA NA NA NA RGS17 38445 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 155850166 155850642 155850364 Y NA NA NA NA NA NA TFB1M 216539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 156836023 156836113 156836068 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 260950 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 159890219 159890368 159890294 Y NA NA FNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 WTAP 254249 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr6 160381061 160381401 160381142 Y SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R IGF2R IGF2R,TCP1,MRPL18,PNLDC1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 6730 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 161450213 161450498 161450260 Y NA MAP3K4 NA NA NA NA MAP3K4 39454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 161650248 161650386 161650340 Y AGPAT4 AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 42707 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 161865712 161865782 161865740 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 172619 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 162572071 162572234 162572145 Y NA NA NA NA NA NA PARK2 574569 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 166364914 166365167 166365041 Y T PDE10A NA NA NA NA PDE10A 32924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 166711154 166711571 166711225 Y PRR18 PRR18,SFT2D1 NA NA NA NA PRR18 8365 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 168408262 168408655 168408498 Y NA NA SMOC2,KIF25 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 182660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 169586350 169586754 169586684 Y NA NA WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 65385 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA THBS2 175763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr6 170491997 170492052 170492021 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 105509 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.52140483844423 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C NA NA NA NA FAM20C 562 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 950197 950303 950276 Y NA GET4 NA NA NA NA GET4 36008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 1013884 1014155 1013955 Y NA COX19 NA NA NA NA COX19 649 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 1883097 1883273 1883258 Y NA NA NA NA NA NA PSMG3 274456 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 2145561 2145831 2145692 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 125047 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 2548551 2548955 2548724 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE LFNG K562 ChIA-PET 22265404 LFNG 1208 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 2843425 2843709 2843567 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 29546 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 3490744 3491107 3491069 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 151664 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 3885202 3885340 3885271 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 546122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12,RADIL NA NA NA NA RADIL 7663 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 5488496 5488516 5488506 Y NA TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 25451 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 7759003 7759285 7759121 Y NA RPA3,RPL23AP51 NA NA NA NA RPA3 2765 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 7804088 7804477 7804243 Y NA RPA3,RPL23AP51 NA NA NA NA RPL23AP51 23922 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 8168743 8169144 8168949 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA GLCCI1 162318 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 8663784 8663976 8663856 Y NXPH1 NA NA NA NA NA GLCCI1 657359 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 11211603 11211773 11211701 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 200104 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 11745887 11746284 11746085 Y NA NA NA NA NA NA THSD7A 123540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 12622868 12623180 12622963 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 101301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 13085757 13085829 13085793 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 361276 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 13372875 13373192 13373034 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 648394 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 14702275 14702543 14702458 Y NA NA NA NA NA NA DGKB 309859 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 18540943 18541343 18541016 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 416371 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 18583507 18583829 18583636 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 458935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 19147118 19147950 19147488 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 7345 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 22484182 22484549 22484368 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 65069 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 22485088 22485297 22485116 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 64321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 23168039 23168122 23168081 Y NA KLHL7-AS1,KLHL7 NA NA NA NA KLHL7 24686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 23853769 23853785 23853777 Y NPY NA NA NA NA NA CCDC126 218771 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 24950753 24950942 24950870 Y CYCS,OSBPL3 NA NA NA NA NA OSBPL3 68311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 27907829 27908035 27907932 Y NA NA NA NA NA NA TAX1BP1 130879 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 122955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 23067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 29217860 29218383 29218096 Y CHN2,CPVL CPVL CHN2 IMR90 Hi-C 24141950 CPVL 14684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 30204020 30204306 30204163 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 117617 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 33598181 33598239 33598235 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 431325 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 35757759 35757862 35757813 Y SEPT7 HERPUD2,AC018647.3 SEPT7 IMR90 Hi-C 24141950 AC018647.3 5115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 35767397 35767554 35767480 Y HERPUD2 HERPUD2,AC018647.3 SEPT7 IMR90 Hi-C 24141950 AC018647.3 14753 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NPM1P18 NA NA NA NA NPM1P18 12836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 37630466 37630784 37630541 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 EPDR1 90662 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 39454182 39454306 39454268 Y POU6F2 NA NA NA NA NA YAE1D1 149669 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 41099054 41099343 41099161 Y NA NA LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 CDK13 1111418 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 44674941 44675231 44675112 Y PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 30770 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 44884505 44884603 44884554 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA H2AFV 1079 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 45019224 45019585 45019470 Y OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G SNHG15,CCM2 NA NA NA NA SNHG15 4975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 47367058 47367181 47367120 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 252975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 50461623 50461903 50461710 Y FIGNL1,IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 54185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 55134555 55134962 55134733 Y NA EGFR NA NA NA NA EGFR 49841 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1467054 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA RP5-942I16.1,AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 69213443 69213490 69213467 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 151538 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 69215481 69215818 69215531 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 153576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 73078661 73079023 73078813 Y NA MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 NA NA NA NA WBSCR22 16332 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 73631936 73632436 73632119 Y LAT2 EIF4H,RFC2 NA NA NA NA RFC2 34338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 73785571 73785673 73785623 Y CLIP2 NA NA NA NA NA GTF2IRD1 80447 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 73983073 73983199 73983128 Y NA NA GTF2I IMR90 Hi-C 24141950 GTF2I 86795 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 77561991 77562080 77562036 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 135869 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 78048924 78048941 78048933 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 622802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 78062254 78062456 78062355 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 636132 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 78613277 78613663 78613470 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 466535 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 79803492 79803786 79803598 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 42221 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 80337478 80337851 80337650 Y NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 211824 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 80512986 80513276 80513113 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 36399 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163603 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 81234371 81234711 81234707 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 88207618 88207818 88207718 Y NA NA NA NA NA NA SRI 353310 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90033847 90034185 90034017 Y STEAP2 CLDN12 NA NA NA NA CLDN12 22812 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90224046 90224366 90224206 Y STEAP2 AC002456.2 CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63 IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 AC002456.2 301 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90250368 90250899 90250569 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 25701 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90305838 90306207 90306023 Y NA NA NA NA NA NA AC002456.2 81171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92048303 92048393 92048348 Y LRRD1 GATAD1 NA NA NA NA GATAD1 26374 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92264263 92264527 92264407 Y SAMD9 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 46555 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 92271612 92271814 92271678 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53904 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 94769120 94769288 94769204 Y NA NA NA NA NA NA AC002429.5 72356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON2 NA NA NA NA PON2 32135 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 95835254 95835261 95835258 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 114198 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 100434359 100434559 100434459 Y SAP25,EPHB4 SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 11238 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 101022292 101022423 101022358 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 59188 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA SH2B2 150424 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 SH2B2 NA NA NA NA SH2B2 3573 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 8.5727764507104 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 SH2B2 NA NA NA NA SH2B2 4806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 102056938 102057102 102057040 Y ORAI2 ORAI2,ALKBH4,LRWD1 NA NA NA NA ORAI2 14451 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 102941984 102942200 102942104 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 6115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 106452481 106452693 106452586 Y NA NA PIK3CG IMR90 Hi-C 24141950 CCDC71L 153039 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 107190959 107191312 107191306 Y NA DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA DUS4L 10617 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 402356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 111832262 111832632 111832471 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 11834 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 114637628 114638014 114637704 Y NA NA NA NA NA NA MDFIC 77419 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 116223147 116223399 116223366 Y CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,MET,CAV2,CAV1 GM12878,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 CAV1 60308 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 117027196 117027213 117027205 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 434808 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 117863844 117864014 117863854 Y ANKRD7 NAA38 NA NA NA NA NAA38 41758 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 120703433 120703512 120703470 Y NA NA NA NA NA NA ING3 114630 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 121008996 121009049 121009023 Y NA FAM3C NA NA NA NA FAM3C 25369 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 123284312 123284364 123284338 Y NA LMOD2 NA NA NA NA LMOD2 9497 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 128094514 128094949 128094639 Y LEP,C7orf68 IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B NA NA NA NA RP11-155G14.6 523 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 128500948 128501348 128501123 Y NA FLNC,ATP6V1F,KCP NA NA NA NA ATP6V1F 68 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 128549999 128550078 128550039 Y NA ATP6V1F,KCP NA NA NA NA KCP 1226 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 129014301 129014725 129014533 Y AHCYL2,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 33486 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 129095634 129096008 129095821 Y NA RP11-305M3.2,RNU1-72P NA NA NA NA RNU1-72P 26337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 130005430 130005716 130005580 Y TMEM209 CPA1 NA NA NA NA CPA1 12464 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 CPA1 NA NA NA NA CPA1 4274 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 216343 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 158985 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 131630256 131630418 131630337 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 389280 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 411440 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 157108 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 149872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 134677531 134677740 134677636 Y AGBL3 AGBL3 NA NA NA NA AGBL3 8272 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49 NA NA NA NA C7orf49 17282 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 135395183 135395352 135395286 Y NA C7orf73 NA NA NA NA C7orf73 49939 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 136635462 136635508 136635485 Y NA NA NA NA NA NA CHRM2 84046 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 137544616 137544738 137544677 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 140075 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 138650306 138650635 138650366 Y SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 13429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 139584364 139584758 139584561 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 108787 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 140024684 140024714 140024699 Y NA NA NA NA NA NA SLC37A3 77519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 140398687 140398980 140398834 Y NA ADCK2,DENND2A,NDUFB2 NA NA NA NA NDUFB2 10110 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 141652372 141652537 141652433 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 216251 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 141679454 141679850 141679687 Y OR9A4,CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 243333 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 142823985 142823994 142823990 Y NA NA NA NA NA NA GSTK1 115192 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 142956760 142956899 142956833 Y NA GSTK1,CASP2 EPHA1,LOC285965,CASP2 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 17574 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 143155352 143155545 143155483 Y NA NA NA NA NA NA ZYX 79179 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 145492630 145492774 145492702 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 318679 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 148424586 148424815 148424779 Y NA CUL1 NA NA NA NA CUL1 31580 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 148553939 148554320 148554152 Y CUL1,EZH2,EZH2 EZH2 NA NA NA NA EZH2 25093 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.52140483844423 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 148824928 148825234 148824952 Y NA ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF398 3420 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 149112304 149112563 149112312 Y ZNF862 NA NA NA NA NA ZNF746 80345 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 150482077 150482267 150482158 Y GIMAP8,GIMAP2,GIMAP5,SMARCD3,SMARCD3,SLC4A2,AGAP3,TMEM176B,TMEM176B,TMEM176A TMEM176A,TMEM176B NA NA NA NA TMEM176A 13224 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 150944094 150944397 150944255 Y NA ABCF2,CHPF2,SMARCD3 NA NA NA NA CHPF2 16519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr7 150944441 150944847 150944697 Y ASB10,SMARCD3 ABCF2,CHPF2,SMARCD3 NA NA NA NA CHPF2 16866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr7 151452177 151452367 151452235 Y SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 119760 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 151806252 151806472 151806362 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 85493 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.17665559127398 chr7 152365221 152365384 152365303 Y MLL3 XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 5866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 153573062 153573453 153573116 Y NA NA NA NA NA NA ACTR3B 1118228 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 154730644 154730988 154730877 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 61806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 155137693 155138087 155137815 Y NA NA INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INSIG1 50207 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.8575921502368 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 158387429 158387829 158387629 Y WDR60 NA PTPRN2 K562 ChIA-PET 22265404 NCAPG2 107691 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr7 158452829 158453067 158452948 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 42453 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 1897074 1897760 1897667 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 22284 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr8 1910279 1910380 1910330 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 9664 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 2418829 2418999 2418939 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 498785 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 8878847 8879137 8878870 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 21190 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 10305932 10306275 10305955 Y NA NA NA NA NA NA SOX7 389082 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 10823160 10823372 10823178 Y PRSS55,C8orf74 NA NA NA NA NA PINX1 127766 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 11755941 11756161 11756072 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 30984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 13329086 13329400 13329354 Y DLC1 DLC1 NA NA NA NA DLC1 41767 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 16219402 16219917 16219607 Y MSR1 NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 791621 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 16504194 16504460 16504327 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 507078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 16613104 16613477 16613307 Y NA NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 398061 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 381363 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 17355613 17356072 17355737 Y NA SLC7A2 NA NA NA NA SLC7A2 3016 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 18585215 18585382 18585299 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 354858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 19414490 19414802 19414647 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 245362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA INTS10 138871 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr8 23629548 23629865 23629707 Y NA NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 STC1 80455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 24202539 24202611 24202545 Y ADAM28,ADAMDEC1 NA NA NA NA NA RNU1-148P 269868 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 12839 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 28934607 28934767 28934687 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 23155 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 29097584 29097960 29097935 Y HMBOX1,HMBOX1,KIF13B KIF13B NA NA NA NA KIF13B 20681 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 29914930 29915195 29915084 Y NA TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA TMEM66 23528 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr8 30907025 30907279 30907152 Y LOC100507341,TEX15,PURG PURG,WRN NA NA NA NA WRN 17708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 32642880 32643214 32643047 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 685726 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.35331118254795 chr8 36441429 36441454 36441442 Y NA NA NA NA NA NA RP11-962G15.1 193228 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 367645 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 37005639 37005772 37005739 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 370957 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37643587 37643772 37643645 Y NA PROSC,GPR124 NA NA NA NA GPR124 3878 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 37656576 37656905 37656741 Y GOT1L1 PROSC,GPR124,BRF2 NA NA NA NA GPR124 16867 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37678678 37679141 37678937 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 26281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37679848 37680132 37679943 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 25290 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 37755287 37755548 37755453 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 302 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37889292 37889604 37889448 Y NA EIF4EBP1 NA NA NA NA EIF4EBP1 3433 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 38219963 38220671 38220346 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 17119 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 38223626 38223954 38223916 Y DDHD2,DDHD2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 13836 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 38757431 38758061 38757845 Y C8orf86,TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 678 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 38762883 38763134 38762941 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 6130 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 39163297 39163513 39163405 Y NA NA NA NA NA NA ADAM9 310909 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 39797063 39797940 39797610 Y NA NA NA NA NA NA C8orf4 211049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 39855903 39856119 39855979 Y NA NA NA NA NA NA C8orf4 152870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 41570603 41570760 41570682 Y NA NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 136716 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 41649689 41649828 41649744 Y NKX6-3 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 215802 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 173635 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 41867551 41867895 41867722 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 39613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 41894654 41895622 41895417 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 11886 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 42567868 42568024 42567945 Y IKBKB,IKBKB NA NA NA NA NA THAP1 128444 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 47903412 47903538 47903475 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 163203 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 47914802 47915044 47914853 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 151697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA OPRK1 94554 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 55071691 55071823 55071748 Y ATP6V1H,ATP6V1H MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 25921 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 56684291 56684685 56684461 Y NA TGS1,TMEM68 NA NA NA NA TMEM68 325 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 57360424 57360919 57360645 Y SDR16C5,PENK,PENK NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 138025 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 58122731 58123025 58122849 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 218328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 60136019 60136081 60136050 Y NA NA NA NA NA NA TOX 106252 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 60866647 60866655 60866651 Y NA NA NA NA NA NA CA8 325316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 60873102 60873331 60873244 Y NA NA NA NA NA NA CA8 318640 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA AC022182.1 CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 AC022182.1 29878 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 67055533 67055834 67055559 Y NA TRIM55 CRH IMR90 Hi-C 24141950 TRIM55 18402 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 704433 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 69733623 69733785 69733704 Y C8orf34 NA NA NA NA NA SULF1 643074 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 69749844 69750162 69750003 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 626697 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 69902361 69902629 69902513 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 474230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 70397333 70397695 70397418 Y NA SULF1 NA NA NA NA SULF1 20474 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 71084923 71085298 71085131 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 70509 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 71106642 71106934 71106707 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 92228 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 71129648 71130032 71129927 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 115234 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 71158637 71159069 71158929 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 144223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 72772671 72773228 72772951 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 17968 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 72843451 72843829 72843757 Y NA NA NA NA NA NA MSC 88748 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 105543 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 73799378 73799441 73799410 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 119658 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 74282734 74282969 74282907 Y NA NA STAU2,LOC100128126,RDH10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 76710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 984 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 77731385 77731402 77731393 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 137872 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 79597617 79597771 79597694 Y PKIA,FAM164A NA NA NA NA NA PKIA 171243 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 79678624 79678939 79678782 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 252250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81671131 81671440 81671286 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 275277 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 81962809 81963138 81963038 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 59165 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 82019096 82019493 82019305 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 2810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 82044899 82045275 82045238 Y PAG1 PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 22596 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 85136696 85136911 85136758 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120I21.2 313748 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 85472216 85472229 85472220 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 545153 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 86853135 86853591 86853380 Y NA CTA-392E5.1 CA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTA-392E5.1 3201 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 87475103 87475472 87475288 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 19587 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 90740659 90741027 90740842 Y NA RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 90845997 90846144 90846052 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 65943 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 96086597 96087380 96086897 Y PLEKHF2 NA NA NA NA NA PLEKHF2 56652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 97319675 97319761 97319753 Y NA MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 47732 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 97873455 97873860 97873757 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 369876 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 97921371 97921579 97921475 Y PGCP NA NA NA NA NA TSPYL5 366597 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 98051049 98051098 98051078 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL5 237078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 98454033 98454434 98454234 Y NA NA PTDSS1,SDC2,CPQ,TSPYL5 IMR90 Hi-C 24141950 TSPYL5 165857 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 98841899 98841938 98841919 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 33344 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 99658802 99659210 99659171 Y NA NA NA NA NA NA STK3 293845 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 101773934 101774280 101774106 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 40897 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 102149452 102149813 102149564 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66608 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 102185716 102186115 102186035 Y NA ZNF706 YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 30306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NACAP1 NA NA NA NA NACAP1 16484 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 NA NA NA NA NA NACAP1 144968 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103027017 103027024 103027019 Y NA NA NA NA NA NA NCALD 108111 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 75666 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 91462 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103806867 103807011 103806958 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 67517 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 103825525 103825897 103825586 Y NA KB-1507C5.2 NA NA NA NA KB-1507C5.2 48631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 105087342 105087776 105087510 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 511476 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 105374220 105374445 105374333 Y TM7SF4 NA NA NA NA NA LRP12 224807 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 106411260 106411358 106411309 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 82340 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 106511726 106511821 106511774 Y ZFPM2 NA NA NA NA NA ZFPM2 182806 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 253244 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 107740443 107740789 107740616 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 32202 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 107870700 107870850 107870776 Y NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 TAGLN2P1 162459 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 107972770 107973116 107972943 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 264529 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 111381887 111381916 111381903 Y NA NA NA NA NA NA EBAG9 831947 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 113064401 113064537 113064469 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1322361 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 114445563 114445724 114445576 Y CSMD3 CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 1604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 116858854 116859170 116859022 Y TRPS1 TRPS1 NA NA NA NA TRPS1 38955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 117484091 117484236 117484201 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 292506 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 246648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 117883999 117884137 117884073 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA MIR3610 902 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 119419771 119420080 119419851 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 212154 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 120995010 120995163 120995088 Y DEPTOR NA NA NA NA NA COL14A1 74856 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 121821026 121821194 121821110 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 2319 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 124889263 124889525 124889394 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 110567 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 125683084 125683301 125683193 Y MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 55429 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126083515 126083743 126083629 Y NA NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA NSMCE2 18178 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126283499 126283849 126283769 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 156714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 126984156 126984525 126984411 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 543593 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 127387635 127388005 127387836 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 180115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr8 127844573 127844851 127844712 Y FAM84B NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 275935 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 574368 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 128883085 128883449 128883196 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 78306 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 128973364 128973763 128973565 Y MYC RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 47094 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 129942288 129942645 129942469 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 921431 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130279904 130280064 130280038 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 747311 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130284402 130285105 130284786 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 742270 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130551362 130551920 130551554 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 475455 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130556592 130556854 130556850 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 470521 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130564282 130564581 130564416 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 462794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130566808 130567296 130566886 Y FAM49B NA NA NA NA NA FAM49B 460079 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130604361 130604767 130604632 Y FAM49B NA NA NA NA NA FAM49B 422608 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130703284 130703457 130703434 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM49B 323918 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 130716318 130716614 130716466 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 310761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 306817 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 150545 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131114299 131114376 131114317 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 86924 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131148484 131148822 131148654 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 121109 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 188477 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131289962 131290145 131290029 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 163761 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 131526425 131526622 131526501 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 72519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 134131797 134131957 134131879 Y TG NA NA NA NA NA NDRG1 180308 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 134141328 134141671 134141507 Y TG NA NA NA NA NA NDRG1 170594 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 135512580 135513062 135513051 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 210230 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 135697258 135697603 135697427 Y NA ZFAT NA NA NA NA ZFAT 25689 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 136936407 136936454 136936431 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 468707 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 139884641 139884932 139884771 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1581746 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 141073642 141073994 141073818 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 392684 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 142403963 142404243 142404183 Y PTP4A3 GPR20,PTP4A3 FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 3870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 GPR20,PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA GPR20,PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 142425618 142425919 142425790 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 25525 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,MAPK15,FAM83H NA NA NA NA MAPK15 2759 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr8 145071465 145071788 145071627 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH NA NA NA NA GRINA 9239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.51284290306654 chr8 146058579 146058595 146058588 Y ARHGAP39 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 7730 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 8495779 8496144 8495966 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 215167 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr9 8675420 8675557 8675548 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 35754 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 8676177 8676347 8676262 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 34964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 8771816 8771826 8771822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 60505 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 8823206 8823493 8823475 Y NA RP11-75C9.1 NA NA NA NA RP11-75C9.1 32637 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 9842303 9842691 9842629 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 753427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 10027810 10028140 10027960 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 582583 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 10572313 10572444 10572379 Y NA PTPRD NA NA NA NA PTPRD 38279 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 13034069 13034552 13034397 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-3L8.3 221725 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 14263032 14263410 14263221 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 51674 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 43525 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr9 16100753 16101130 16100880 Y NA NA C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 575072 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16203449 16203717 16203596 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 521095 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16256007 16256104 16256054 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 468708 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16521914 16522385 16522163 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 202427 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16729817 16729878 16729869 Y BNC2 RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 5005 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 20356496 20357005 20356641 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 263537 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 27367250 27367471 27367384 Y IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 160308 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B NA NA NA NA MOB3B 36337 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 32453982 32454272 32454141 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 70050 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 33350411 33350624 33350531 Y NA NA NA NA NA NA NFX1 61902 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 33629887 33630165 33630026 Y NA ANXA2P2 NA NA NA NA ANXA2P2 7664 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 34375136 34375287 34375212 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 285 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 34886249 34886595 34886399 Y NA NA ATP8B5P,KIAA1045,VCP IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB5 101043 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 82515 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 37324373 37324708 37324405 Y PAX5,ZCCHC7,ZBTB5,FBXO10 NA NA NA NA NA GRHPR 95955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr9 71259918 71260255 71260087 Y NA NA PIP5K1B IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 58320 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 72390890 72391274 72391082 Y NA PTAR1 LOC100507299,SMC5,C9orf135 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 18015 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 72653472 72653608 72653542 Y NA MAMDC2 MAMDC2 IMR90 Hi-C 24141950 MAMDC2 2889 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 72871058 72871439 72871223 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 498 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.84903021485911 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 74167536 74167704 74167695 Y NA RPL35AP21 NA NA NA NA RPL35AP21 34813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 143739 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 75580383 75580516 75580515 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 112842 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 75612572 75612897 75612823 Y NA NA ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 80461 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 87370377 87370471 87370425 Y NA NA NA NA NA NA NTRK2 88911 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 88298792 88299000 88298900 Y AGTPBP1 NA NA NA NA NA AGTPBP1 55944 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 90495541 90495819 90495680 Y CDK20 NA NA NA NA NA CDK20 91849 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 91022048 91022386 91022218 Y NA SPIN1 NA NA NA NA SPIN1 20714 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 91096507 91096802 91096655 Y NA NA NA NA NA NA SPIN1 95173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 94668024 94668724 94668369 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 41720 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 95288173 95288480 95288343 Y NA NA NA NA NA NA IPPK 142067 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 95878926 95879215 95879071 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 15355 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 96044305 96044695 96044445 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 149735 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chr9 97505796 97506082 97505939 Y NA C9orf3 NA NA NA NA C9orf3 18813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 97711275 97711380 97711332 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 224292 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 97963794 97964178 97964017 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 113813 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 98744078 98744248 98744144 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 107819 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 98932290 98932679 98932485 Y NA EIF4BP3 FBP1,FANCC,LOC100507346,PTCH1,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 26001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 107983498 107983520 107983511 Y NA SLC44A1 SLC44A1,ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 21383 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 110254619 110254916 110254689 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 NA NA NA NA KLF4 3856 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 111003656 111003963 111003923 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 383150 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 111034300 111034792 111034481 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 352321 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 111759404 111759745 111759575 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 14064 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 113646742 113646840 113646791 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 152141 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 115440529 115440762 115440646 Y NA NA NA NA NA NA SNX30 70356 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 118914445 118914679 118914506 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 362 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 120507373 120507587 120507563 Y NA TLR4 NA NA NA NA TLR4 42763 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.8575921502368 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 126468286 126468378 126468332 Y STRBP,STRBP NA NA NA NA NA DENND1A 222053 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 128395270 128395491 128395304 Y PPP6C,HSPA5,GAPVD1 NA NA NA NA NA MAPKAP1 72022 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 128651913 128652195 128652163 Y FAM125B NA NA NA NA NA PBX3 144289 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 131007254 131007504 131007363 Y URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA SWI5 28154 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chr9 132349858 132350089 132350073 Y NA NA LOC100506190,IER5L,C9orf50 MCF7 ChIA-PET 22265404 ASB6 52355 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132705367 132705623 132705495 Y C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 97850 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132793561 132793711 132793627 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 9762 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 132802902 132803300 132803100 Y ASB6,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chr9 133619181 133619471 133619230 Y NA ABL1 NA NA NA NA ABL1 31848 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 133722867 133723250 133723071 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 ABL1 135534 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.672374623585129 chr9 134258707 134258891 134258799 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 8589 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 135226317 135226646 135226576 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 1726 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 135991045 135991361 135991245 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 45940 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 136022907 136023306 136022967 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 13995 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 136292897 136293168 136293034 Y SLC2A6,RALGDS REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA REXO4 11733 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 136821729 136822115 136821856 Y NA VAV2 NA NA NA NA VAV2 33611 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 137667512 137667789 137667676 Y OLFM1,OLFM1 NA NA NA NA NA COL5A1 135892 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 139606234 139606418 139606254 Y LCNL1,FUT7,CLIC3,C9orf142,ABCA2,KIAA1984 AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 1212 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 139892330 139892637 139892567 Y EGFL7,EGFL7,C9orf142,ABCA2 PTGDS,C9orf142,ABCA2,NPDC1 NA NA NA NA C9orf142 7460 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 3263317 3263504 3263415 Y NA MXRA5 NA NA NA NA MXRA5 635 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 11460430 11460509 11460495 Y AMELX NA NA NA NA NA MSL3 313769 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 13138325 13138351 13138340 Y NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 147098 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 14584256 14584543 14584400 Y NA NA NA NA NA NA FANCB 304648 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 15493209 15493485 15493347 Y NA PIR NA NA NA NA PIR 16202 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 17856457 17856771 17856610 Y NA RAI2 NA NA NA NA RAI2 20686 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chrX 19815616 19815777 19815695 Y RPS6KA3,SH3KBP1,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 87942 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 23295249 23295513 23295381 Y NA NA NA NA NA NA PRDX4 384866 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 32058894 32059178 32059036 Y NA NA NA NA NA NA TBCAP1 998334 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chrX 39865489 39865898 39865566 Y BCOR,BCOR AC092198.1 NA NA NA NA AC092198.1 631 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.18521752665167 chrX 39866067 39866462 39866265 Y BCOR,BCOR AC092198.1 NA NA NA NA AC092198.1 67 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR AC092198.1 BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AC092198.1 5171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA AC092198.1 BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AC092198.1 5970 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA AC092198.1 BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AC092198.1 6810 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chrX 39950207 39950578 39950448 Y NA NA NA NA NA NA AC092198.1 83678 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 39972723 39972902 39972813 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 61680 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40442125 40442334 40442230 Y MED14,ATP6AP2 ATP6AP2 NA NA NA NA ATP6AP2 3979 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 73147 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 41538171 41538545 41538500 Y CASK NA NA NA NA NA CASK 242171 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA NA NA NA NA NA FUNDC1 231336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 49108550 49108714 49108667 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 15592 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA SMC1A 18996 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 62965283 62965341 62965311 Y NA ARHGEF9 NA NA NA NA ARHGEF9 38085 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 63554308 63554471 63554461 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 58862 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 68851851 68852116 68851941 Y PJA1,EDA EDA NA NA NA NA EDA 17940 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA CITED1 110877 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM NA JPX IMR90 Hi-C 24141950 FTX 160589 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chrX 97610823 97610891 97610857 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1673161 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 99672872 99672953 99672909 Y NA PCDH19 NA NA NA NA PCDH19 9601 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chrX 102880714 102880758 102880737 Y PLP1,PLP1 TCEAL3,TCEAL1 NA NA NA NA TCEAL1 874 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 103120032 103120203 103120118 Y TCEAL1,ZCCHC18,RAB9B RAB9B NA NA NA NA RAB9B 34874 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 105809036 105809195 105809116 Y NA CXorf57 NA NA NA NA CXorf57 43965 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 4.53852870919962 chrX 106922076 106922520 106922399 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 52339 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 118903267 118903661 118903468 Y RHOXF1,AKAP14 RPL39 NA NA NA NA RPL39 19945 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 122943908 122944167 122944003 Y NA XIAP STAG2 K562 5C 22955621 XIAP 47407 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 123606177 123606254 123606218 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 514115 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 124193844 124193851 124193848 Y NA NA NA NA NA NA RP1-161N10.1 142336 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 124338810 124338926 124338869 Y NA RP1-161N10.1 NA NA NA NA RP1-161N10.1 2623 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.34474924717026 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.504280967688847 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 1.00856193537769 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 129966535 129966828 129966682 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 68380 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 130013053 130013179 130013116 Y NA ENOX2 NA NA NA NA ENOX2 22029 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 131615038 131615178 131615106 Y MST4,MST4,MBNL3 MBNL3 NA NA NA NA MBNL3 6818 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 132089755 132090160 132089782 Y NA HS6ST2 NA NA NA NA HS6ST2 3263 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.840468279481412 chrX 133847905 133848292 133848163 Y NA NA LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM122C 80527 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 134567184 134567298 134567231 Y NA LINC00086 NA NA NA NA LINC00086 13316 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 NA NA NA NA NA MTM1 201173 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 2.68949849434052 chrX 152648727 152649001 152648990 Y SLC6A8,ZNF275 NA NA NA NA NA ZNF275 51114 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 152742295 152742894 152742640 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 HAUS7,ATP2B3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TREX2 8250 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 152753051 152753292 152753194 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 BGN MCF7 ChIA-PET 22265404 BGN 5105 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.336187311792565 chrX 152997863 152998070 152997986 Y TMEM187,RENBP,MECP2,IRAK1,ARHGAP4,ABCD1 SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3,SRPK3 NA NA NA NA ABCD1 9540 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE RMS-YM hg19 FANTOM5 0.168093655896282