chr1 840753 841210 840812 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 51479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 1744250 1744609 1744432 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 34354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 2190530 2190674 2190620 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 48371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 2246556 2246763 2246722 Y SKI NA NA NA NA NA MORN1 74383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 2254081 2254230 2254152 Y HES5 NA NA NA NA NA MORN1 66916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 3594206 3594277 3594248 Y MEGF6,WRAP73,TP73,TP73 TP73,WRAP73 NA NA NA NA WRAP73 26881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 3634737 3634863 3634787 Y WRAP73,TP73 NA NA NA NA NA WRAP73 67412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 7.77090689184805 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 6088225 6088518 6088328 Y TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 37692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 6803995 6804151 6804092 Y NA DNAJC11,RP11-312B8.1,CAMTA1 CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312B8.1 38752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.49144087023929 chr1 7947650 7947935 7947793 Y TNFRSF9 UTS2 CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9 IMR90 Hi-C 24141950 UTS2 36078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 7950902 7950918 7950910 Y TNFRSF9,SLC45A1 UTS2 CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9 IMR90 Hi-C 24141950 UTS2 39330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 187673 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA RERE 376474 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 8520924 8521286 8521014 Y NA NA NA NA NA NA RERE 354416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 9111078 9111104 9111091 Y RERE SLC2A5 NA NA NA NA SLC2A5 35433 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 9241165 9241560 9241362 Y NA RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 902 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 9700704 9700713 9700707 Y PIK3CD PIK3CD NA NA NA NA PIK3CD 9077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 9760502 9760837 9760631 Y NA NA NA NA NA NA PIK3CD 50712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 9840833 9841244 9840865 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 41340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 9960528 9960713 9960585 Y NA CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1 NA NA NA NA CTNNBIP1 7681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 12193120 12193399 12193251 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 31661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 12210430 12211346 12210689 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 13714 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 12233600 12234159 12233938 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 8540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 12240401 12240902 12240499 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 15341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 12243852 12244671 12244387 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 18792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 386389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 13949833 13950153 13949906 Y PRDM2,PDPN NA NA NA NA NA PRDM2 74540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 14638404 14638703 14638561 Y NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 284497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 15247273 15247627 15247450 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 229401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 15587144 15587415 15587307 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1 NA NA NA NA NA TMEM51 110116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 NA NA NA NA NA PLEKHM2 78362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16209325 16209770 16209445 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 36683 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 16339773 16339933 16339866 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 39146 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16770590 16770683 16770636 Y NA NECAP2 NA NA NA NA NECAP2 5423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 17454855 17455288 17455072 Y PADI4 PADI2 PADI2,PADI1,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 10907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 22066009 22066225 22066117 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 41874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 22345590 22345859 22345703 Y ZBTB40,CDC42 LINC00339,CDC42 NA NA NA NA LINC00339 3822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 22366226 22366841 22366516 Y USP48,ZBTB40 LINC00339,CDC42 CDC42 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 10279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 23035382 23035536 23035449 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 50 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 24063897 24064210 24064053 Y PNRC2,RPL11 RPL11,TCEB3,PITHD1 RPL11 IMR90 Hi-C 24141950 TCEB3 3435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 24229023 24229388 24229190 Y NA FUCA1,RP11-4M23.4 NA NA NA NA FUCA1 36239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 25021969 25022194 25022082 Y NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 47654 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 25357149 25357829 25357484 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 67537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 25360165 25361177 25360621 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 70553 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 25425738 25426059 25426056 Y NA NA RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 130934 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 25665993 25666367 25666180 Y RUNX3,FAM54B,C1orf63 TMEM50A,C1orf63 NA NA NA NA C1orf63 3289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 26615527 26615997 26615758 Y FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 26616527 26617019 26616745 Y ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 12860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS6KA1 26383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR1976 67804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR1976 68309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27982664 27982914 27982811 Y EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 13815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 27985480 27985709 27985578 Y EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 11020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 28152962 28153213 28153036 Y NA PPP1R8,SCARNA1 NA NA NA NA PPP1R8 2076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28189568 28190269 28189912 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,SCARNA1,RPA2 NA NA NA NA SCARNA1 30656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr1 28195628 28196024 28195738 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,XKR8,C1orf38 PPP1R8,SCARNA1,RPA2 NA NA NA NA SCARNA1 36716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28268335 28268431 28268383 Y NA RPA2,SMPDL3B NA NA NA NA SMPDL3B 8831 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28437697 28438098 28437903 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 24490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 28439074 28439949 28439426 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 25867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28462161 28462385 28462304 Y FAM76A,STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR EYA3 EYA3,LOC653566 IMR90 Hi-C 24141950 EYA3 48954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 31216468 31217229 31216636 Y LAPTM5 LAPTM5 NA NA NA NA LAPTM5 11438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31220962 31221590 31221236 Y NA LAPTM5 NA NA NA NA LAPTM5 7077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31231730 31232072 31231886 Y NA LAPTM5 NA NA NA NA LAPTM5 3063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31256585 31256865 31256664 Y NA LAPTM5 MECR,LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM5 27918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 31950057 31950263 31950160 Y NA RP11-439L8.3 SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 19578 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 RP11-439L8.3 SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 13359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA RP11-439L8.3 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 45318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32253647 32254040 32253861 Y LCK BAI2 NA NA NA NA BAI2 25153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32423598 32423720 32423682 Y PTP4A2 PTP4A2 SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 15141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 33089029 33089046 33089038 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 25458 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 36283726 36283900 36283813 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 50158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 36715455 36715834 36715645 Y EIF2C1,EIF2C3 THRAP3 NA NA NA NA THRAP3 27438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 39547903 39548129 39548060 Y BMP8A,MACF1 MACF1 NA NA NA NA MACF1 2915 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 40283075 40283206 40283146 Y PABPC4,RLF,MFSD2A BMP8B MYCL1 K562 ChIA-PET 22265404 BMP8B 30542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1,RP1-118J21.5 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 40561233 40561752 40561648 Y SMAP2,RLF NA NA NA NA NA PPT1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr1 42204580 42205516 42204895 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 378986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 42325828 42326208 42326056 Y NA NA NA NA NA NA FOXJ3 473340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 43407355 43407700 43407616 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 14830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 6760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 44299891 44300630 44300422 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 109593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 44380893 44381202 44381004 Y SLC6A9,B4GALT2,ARTN RP11-7O11.3,IPO13 NA NA NA NA RP11-7O11.3 29021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC24 40653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 44692988 44693156 44693052 Y ATP6V0B DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 15861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 45376274 45376331 45376304 Y NA CCNB1IP1P1 NA NA NA NA CCNB1IP1P1 45898 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 47102400 47102701 47102616 Y NA MKNK1,ATPAF1 NA NA NA NA MKNK1 21885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 47677583 47677805 47677734 Y PDZK1IP1,TAL1 TAL1 NA NA NA NA TAL1 18087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 49902417 49902596 49902507 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 609090 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 52044179 52044304 52044242 Y NA OSBPL9 OSBPL9 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL9 3328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 53020482 53020832 53020657 Y BTF3L4,PRPF38A,ZYG11B,FAM159A,ZCCHC11 ZCCHC11,GPX7 NA NA NA NA ZCCHC11 3323 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7 NA NA NA NA GPX7 26603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 53102510 53103405 53103215 Y CC2D1B,PRPF38A,ZCCHC11,FAM159A GPX7 NA NA NA NA GPX7 36466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 55009665 55009918 55009852 Y NA ACOT11 NA NA NA NA ACOT11 3735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 55431735 55431939 55431831 Y NA NA TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 80844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 56680724 56680992 56680925 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 427982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 58713977 58714213 58714095 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 193825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 59008745 59009101 59008916 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 NA NA NA NA DAB1 1305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 TACSTD2 9073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 59734755 59734992 59734874 Y NA FGGY HSD52,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 25318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 59986893 59986899 59986896 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 226583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 60015651 60015887 60015758 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 255341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA HOOK1 133662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 173305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 61549054 61549253 61549232 Y NA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 167929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 201637 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 65238542 65238722 65238632 Y NA RAVER2 NA NA NA NA RAVER2 29764 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 65307822 65308022 65307967 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 99044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 65398951 65399446 65399123 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 30741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 65731337 65731853 65731407 Y DNAJC6 DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 19435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 65775838 65775991 65775933 Y PDE4B,DNAJC6 NA NA NA NA NA DNAJC6 63936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 66277656 66278058 66277920 Y LEPROT,LEPR,LEPROT PDE4B NA NA NA NA PDE4B 21459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 66445029 66445195 66445112 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 188832 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 66594490 66594759 66594629 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 338293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 66714465 66714786 66714643 Y PDE4B NA NA NA NA NA PDE4B 458268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 66736293 66736539 66736358 Y PDE4B,PDE4B NA NA NA NA NA TCTEX1D1 479603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 66859299 66859884 66859497 Y PDE4B NA NA NA NA NA TCTEX1D1 356258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 66904732 66904991 66904859 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 TCTEX1D1 311151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA TCTEX1D1 185795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 68639460 68639856 68639657 Y NA NA NA NA NA NA WLS 56947 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 68647153 68647165 68647159 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 49638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 70507902 70508588 70508230 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 160715 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 75102878 75102994 75102935 Y NA NA NA NA NA NA TYW3 93842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 75168986 75169131 75169081 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 27705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 76541670 76541922 76541777 Y ST6GALNAC3 ST6GALNAC3 NA NA NA NA ST6GALNAC3 3266 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 76730126 76730314 76730220 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 191722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 77842116 77842473 77842156 Y NA NA NA NA NA NA AK5 96380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 77879256 77879430 77879369 Y NA NA NA NA NA NA AK5 133520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 81240939 81241123 81241017 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 944255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 81941853 81942198 81942026 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 243180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 84284633 84284926 84284781 Y NA NA NA NA NA NA TTLL7 177907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 85614354 85614436 85614429 Y NA NA NA NA NA NA SYDE2 50293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 85991291 85991622 85991523 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 50311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 86603097 86603550 86603341 Y NA COL24A1 NA NA NA NA COL24A1 17076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 86805161 86805335 86805245 Y SH3GLB1 NA NA NA NA NA ODF2L 54688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 87166281 87166485 87166383 Y NA SH3GLB1 CLCA1,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 1774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 87355999 87356364 87356182 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 21743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 88292387 88292883 88292561 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 500236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 89188530 89188764 89188647 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 40625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 89459818 89459853 89459836 Y NA CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA RBMXL1 3175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 89581205 89581610 89581506 Y NA GBP2 NA NA NA NA GBP2 32529 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 89594590 89594813 89594736 Y GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2 GBP2 NA NA NA NA GBP2 19326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 89739985 89740544 89740197 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 GBP5 NA NA NA NA GBP5 3441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 89942348 89942369 89942360 Y NA LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 46026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 90077145 90077551 90077320 Y ZNF326,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 19080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 90100291 90100368 90100330 Y NA LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 3660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 90137741 90138074 90137909 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 41110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 90153439 90153806 90153511 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 56808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 90167146 90167167 90167157 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 70515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 90189523 90189798 90189645 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 92892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 90190139 90190909 90190374 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 93508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 90223174 90223447 90223368 Y NA NA LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8D 61126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 90947023 90947038 90947031 Y NA NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 368169 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 92549605 92549624 92549615 Y NA BTBD8 NA NA NA NA BTBD8 5743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 92981474 92981835 92981655 Y NA GFI1 NA NA NA NA GFI1 31041 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA GFI1 53229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 93660433 93660767 93660600 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 16148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 94224546 94224929 94224684 Y DNTTIP2 NA MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 85459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95003688 95004160 95004042 Y NA F3 NA NA NA NA F3 1196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 104232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95186895 95187156 95187037 Y NA NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 96681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95258204 95258621 95258355 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,LOC729970 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 25216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 95263833 95264301 95264195 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 19536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 95484238 95484316 95484279 Y NA NA NA NA NA NA ALG14 52185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 97594209 97594479 97594411 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 408988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 98100424 98100708 98100566 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 91167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 100555117 100555459 100555393 Y NA SASS6 NA NA NA NA SASS6 41052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 100827551 100827774 100827683 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 18967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 100905821 100906168 100905941 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 97237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 107891659 107891745 107891700 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 294392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108132692 108133060 108132878 Y NTNG1,NTNG1,VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 372706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108285182 108285397 108285331 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 220369 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108347574 108347600 108347587 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 158166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108483614 108484145 108483967 Y VAV3 VAV3 NA NA NA NA VAV3 21621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108595998 108596525 108596457 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 90232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108661190 108661332 108661267 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 80139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 108673419 108673672 108673564 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 67799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 109133637 109134097 109133761 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 32926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 109515208 109515609 109515409 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA CLCC1 11097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 109842394 109842833 109842649 Y NA PSRC1,MYBPHL NA NA NA NA MYBPHL 4830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 109938897 109939079 109938975 Y TMEM167B,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 110355223 110355262 110355244 Y NA NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 72839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 110438276 110438910 110438607 Y NA CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 11954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 111162611 111162919 111162771 Y RBM15,CD53,KCNA3,KCNA2 NA NA NA NA NA KCNA3 52736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 111514711 111514719 111514715 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 10010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 DENND2D NA NA NA NA DENND2D 310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 111764327 111764759 111764457 Y CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2 DENND2D C1orf88,DRAM2,CEPT1,RAP1A,CHI3L2,WDR77 IMR90 Hi-C 24141950 DENND2D 19170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77,C1orf162 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 C1orf162,RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 112163412 112163797 112163622 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 112196411 112196803 112196596 Y C1orf183,RAP1A NA NA NA NA NA DDX20 99064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 112387705 112387905 112387746 Y KCND3 NA NA NA NA NA FAM212B 91259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA RP5-965F6.2,CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 113574968 113575168 113575068 Y NA RP11-31F15.2,LRIG2 CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-31F15.2 38559 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 113675675 113676049 113675887 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 33567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 114373858 114374002 114373930 Y HIPK1,PHTF1,RSBN1 RP5-1073O3.2,RSBN1,PTPN22 NA NA NA NA RSBN1 20760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 116087444 116087828 116087621 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 94746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 116694646 116694883 116694753 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 177527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 117047053 117047428 117047164 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 NA NA NA NA NAP1L4P1 27286 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 117424835 117425013 117424940 Y PTGFRN PTGFRN PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 25666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 117533270 117533527 117533328 Y CD58,CD101 CD101 NA NA NA NA CD101 8855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 117619913 117620299 117620136 Y CD101 TTF2,TRIM45 NA NA NA NA TTF2 18988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 118176414 118176771 118176700 Y NA FAM46C NA NA NA NA FAM46C 29858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 119401140 119401399 119401296 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 279620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 120380695 120381105 120381020 Y NA NA NA NA NA NA PHGDH 180274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 120530218 120530524 120530431 Y NOTCH2,FCGR1B,ZNF697 NA NA NA NA NA NOTCH2 79716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA FCGR1B 551145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 144009977 144010738 144010098 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 134070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 43743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA SEC22B 69671 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145189239 145189416 145189322 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B IMR90 Hi-C 24141950 NOTCH2NL 17703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 145437595 145437817 145437681 Y CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 1126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 145526126 145526326 145526236 Y PDE4DIP,ITGA10 RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ANKRD35,PIAS3 NA NA NA NA PEX11B 11874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 145627337 145627622 145627480 Y NA NUDT17,POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 18301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 147120817 147121145 147120987 Y NA ACP6 NA NA NA NA ACP6 19473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 147790636 147790862 147790749 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 14024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PFN1P12 110116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA ARNT NA NA NA NA ARNT 46401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 151892722 151892912 151892811 Y NA THEM4 THEM4,S100A10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 THEM4 12438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 152001678 152001977 152001894 Y S100A10,S100A11 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 16406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 153358841 153359368 153359086 Y S100A9,S100A12,S100A4,S100A8 S100A9,S100A12,S100A8 NA NA NA NA S100A8 2296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A5,S100A4 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 153704694 153704943 153704839 Y NA INTS3 NA NA NA NA INTS3 6151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 153818420 153818667 153818544 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 74784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 154392646 154393050 154392862 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 16977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 154405619 154406249 154405788 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR IL6R NA NA NA NA IL6R 29950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 154914634 154915296 154915191 Y RUSC1-AS1,RUSC1,RUSC1,CLK2,ADAR,KCNN3,KCNN3,PMVK PMVK,PBXIP1,PYGO2,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 7167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 156251648 156251762 156251690 Y RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44 BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA TMEM79 922 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 156462474 156462813 156462575 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 5807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 156464458 156464805 156464586 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 3815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 156966343 156966626 156966486 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 46536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 157082632 157083078 157082974 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 23188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 157373072 157373269 157373181 Y NA NA NA NA NA NA ETV3 266806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 158075201 158075434 158075415 Y NA NA NA NA NA NA CD1D 72303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA CD1D LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 CD1D 28048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 158255393 158256068 158255695 Y NA NA NA NA NA NA CD1D 107656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 158994687 158995148 158994758 Y OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A IFI16 NA NA NA NA IFI16 26929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 159852272 159852569 159852526 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 159961374 159961617 159961522 Y SLAMF8,SLAMF9 PIGM NA NA NA NA PIGM 38166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 160242090 160242278 160242184 Y NA RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19 NA NA NA NA DCAF8 10642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 160316870 160317108 160317002 Y SLAMF7,CD48,TAGLN2,NCSTN NCSTN,COPA NA NA NA NA COPA 5680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 160345693 160345986 160345917 Y NA NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA VANGL2 22390 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161037907 161038726 161038256 Y FCGR3A,FCGR3A,CD48,CD244,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,USF1,ARHGAP30,NIT1,PFDN2 NA NA NA NA ARHGAP30 147 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 161050902 161051096 161051032 Y PVRL4 USF1,ARHGAP30,NIT1,PFDN2,DEDD NA NA NA NA ARHGAP30 13142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161155098 161155533 161155366 Y FCGR3A,FCGR3A,CD48,LY9,USF1,ARHGAP30,PPOX UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 9361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161155908 161155971 161155957 Y HSPA6,CD48,SLAMF7,CD244,USF1,ARHGAP30,FCGR2A,FCER1G UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 8923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161324130 161324422 161324290 Y NA SDHC NA NA NA NA SDHC 42083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.62642321619576 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A FCGR2A NA NA NA NA FCGR2A 27388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 161706477 161706712 161706625 Y HSPA6,FCRLB,ATF6 FCRLA,DUSP12,ATF6 DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP12 10836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 161973588 161973892 161973770 Y FCGR2A,FCGR3A,OLFML2B OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 17752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 166942789 166943132 166943053 Y NA ILDR2 NA NA NA NA ILDR2 70 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167398939 167399085 167399047 Y CD247 NA NA NA NA NA CREG1 121919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167419889 167420655 167420276 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 100349 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167442775 167443139 167443045 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 77865 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167520671 167521013 167520898 Y CREG1 NA NA NA NA NA CREG1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167586596 167587245 167587123 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 RCSD1 RCSD1 IMR90 Hi-C 24141950 RCSD1 10085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 167602083 167602470 167602201 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 RCSD1 NA NA NA NA RCSD1 4753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 167635730 167635903 167635817 Y NA RCSD1 NA NA NA NA RCSD1 38400 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 169229816 169229911 169229864 Y NA NA NA NA NA NA NME7 105294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 170589334 170589575 170589455 Y NA NA METTL11B,KIFAP3,GORAB IMR90 Hi-C 24141950 GORAB 90064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 170794960 170795269 170795115 Y FMO3 NA KIFAP3,METTL11B IMR90 Hi-C 24141950 GORAB 295690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 171652961 171653360 171653094 Y NA PFN1P1 NA NA NA NA PFN1P1 14882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 172418117 172418641 172418353 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 6887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 172445364 172445579 172445472 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 34134 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 172507125 172507604 172507262 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 95895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 172667452 172667583 172667527 Y C1orf9,C1orf9,FASLG NA FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 256222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 172903010 172903534 172903241 Y TNFSF18,TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 270918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 174365403 174365798 174365601 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 238855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 175094142 175094504 175094323 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 65631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 175159885 175160247 175160001 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 175290630 175291019 175291015 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 130495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 176174471 176174980 176174673 Y RFWD2 NA NA NA NA NA RFWD2,RP11-195C7.1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 177178348 177178736 177178542 Y NA NA NA NA NA NA RP1-35C21.1 139986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 177903071 177903284 177903119 Y NA NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 101801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 178901109 178901308 178901215 Y NA NA NA NA NA NA FAM20B 91631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 178903778 178903964 178903860 Y NA NA NA NA NA NA FAM20B 88975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr1 179108920 179109313 179109132 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 60408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 179726041 179726329 179726185 Y TDRD5,FAM163A FAM163A NA NA NA NA FAM163A 15743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 179734817 179735116 179734826 Y FAM163A FAM163A NA NA NA NA FAM163A 24519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 179997226 179997609 179997386 Y TOR1AIP1,CEP350 NA NA NA NA NA CEP350 75353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 180100723 180101052 180100780 Y NA QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 20917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr1 180389473 180389640 180389557 Y NA NA LHX4,LOC100527964 IMR90 Hi-C 24141950 ACBD6 80449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181031700 181031837 181031769 Y IER5 STX6,MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 23801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181032056 181032215 181032129 Y IER5 STX6,MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 23423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181459512 181459699 181459606 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1E 79274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr1 182118170 182119053 182118696 Y RNASEL,GLUL,GLUL NA GLUL K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 240288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 182228341 182228499 182228429 Y NA NA GLUL K562 ChIA-PET 22265404 GLUL 130842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 182228543 182228906 182228715 Y RNASEL,GLUL,GLUL NA GLUL K562 ChIA-PET 22265404 GLUL 130435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 182682922 182683008 182682965 Y DHX9 NA RGS8,RNASEL IMR90 Hi-C 24141950 NPL 73420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 183161027 183161375 183161120 Y NA NA NA NA NA NA LAMC1 170432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA SMG7 189897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr1 183865521 183866190 183865847 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 152621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 184700299 184700688 184700567 Y NA EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 21359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 184794829 184794875 184794854 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 72782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 184820980 184820991 184820986 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 98933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 184836042 184836526 184836376 Y EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA FAM129A 105156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 184885517 184885894 184885706 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 55788 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 185032022 185032401 185032047 Y SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2 RNF2 NA NA NA NA RNF2 19526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 185396511 185396758 185396681 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA NA NA NA NA IVNS1ABP 112050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 186627866 186627981 186627924 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 PTGS2 NA NA NA NA PTGS2 19578 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 186799738 186800031 186799804 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 3653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 186818504 186818763 186818666 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 22419 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 186935248 186935528 186935344 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 139163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 187235320 187235513 187235392 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 439235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 191536543 191536778 191536610 Y NA NA NA NA NA NA RGS18 588809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 192485848 192486563 192486155 Y RGS2,RGS1 NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 56294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 192500254 192500504 192500353 Y RGS1 RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 42353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 192578246 192578789 192578443 Y TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2 RGS1 UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 35389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 192914637 192914772 192914747 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA TROVE2 111780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA TROVE2 110765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 193655157 193655512 193655302 Y NA NA CDC73,B3GALT2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC73 566010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 198633275 198633927 198633600 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 27474 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 198647552 198647977 198647839 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 41751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 45129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 198712497 198712942 198712717 Y PTPRC NA NA NA NA NA PTPRC 106696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 198745813 198746101 198745919 Y NA NA NA NA NA NA PTPRC 140012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 198979759 198979985 198979807 Y NA NA NA NA NA NA PTPRC 373958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.86976831889145 chr1 199151722 199151828 199151775 Y NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-104D3.2 202441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 200481491 200481643 200481567 Y NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 104307 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA DDX59 146638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 201494461 201494578 201494476 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 17877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 201605860 201605966 201605934 Y NA NAV1 IPO9,NAV1,PHLDA3,CSRP1,RPS10P7 IMR90 Hi-C 24141950 NAV1 15449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 202131734 202131905 202131820 Y PTPN7,PTPN7 ARL8A,PTPN7 NA NA NA NA PTPN7 3018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 202219033 202219251 202219134 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 89857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 202249421 202249522 202249480 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 59586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 203061576 203061925 203061715 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 3794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1,MYBPH NA NA NA NA MYBPH 41695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 203258547 203259334 203258830 Y RABIF,KLHL12,BTG2 RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2 NA NA NA NA RP11-134P9.3 4267 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 203294160 203294623 203294393 Y RABIF,KLHL12,BTG2 RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 21541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 203561987 203562359 203562082 Y BTG2,ZC3H11A ATP2B4 ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 31330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 203643182 203643803 203643474 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 49493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R15B 122540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 204422279 204422591 204422449 Y NA PPP1R15B,PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 39261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 204430759 204431008 204430941 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 30844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 204434923 204435081 204435020 Y SOX13,PPP1R15B,PIK3C2B PIK3C2B,MDM4 NA NA NA NA PIK3C2B 26771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA NA CDK18 61145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 205474556 205474866 205474575 Y NA CDK18 NA NA NA NA CDK18 2833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 205638319 205638508 205638401 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 9079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 206260548 206260903 206260855 Y C1orf186 NA AVPR1B IMR90 Hi-C 24141950 IKBKE 380888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 206677196 206677895 206677559 Y NA IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4 NA NA NA NA RASSF5 984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 206736469 206736632 206736474 Y NA RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA RP11-534L20.4 36221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 206921953 206922243 206922101 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 65664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 209283288 209283447 209283368 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 156121 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 209585617 209585757 209585708 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA NA NA NA NA ATP5G2P1 146049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 209938931 209939742 209939534 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74 TRAF3IP3,C1orf74 NA NA NA NA TRAF3IP3 11554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 TRAF3IP3,C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 210710406 210710636 210710520 Y NA NA NA NA NA NA HHAT 210810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 211022379 211022675 211022565 Y KCNH1 NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 322144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 211590216 211590571 211590445 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 36071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 211780151 211780642 211780410 Y NA SLC30A1 SLC30A1 K562 ChIA-PET 22265404 SLC30A1 30067 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.62642321619576 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 212429433 212429795 212429457 Y LPGAT1,PPP2R5A,ATF3,PPP2R5A PPP2R5A DTL IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 27084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 212484976 212485048 212485012 Y NA PPP2R5A,RP11-384C4.3 TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-384C4.3 4116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 212896080 212896217 212896149 Y NA BATF3 NA NA NA NA BATF3 24753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 212926000 212926318 212926233 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 36806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 213443269 213443475 213443372 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 220680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 213500745 213500914 213500832 Y RPS6KC1 NA PROX1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KC1 278156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 214163432 214163790 214163677 Y NA PROX1 NA NA NA NA PROX1 8908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 218996564 218996649 218996607 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 348537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 219262446 219262621 219262479 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 82565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 64973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 220399770 220399931 220399853 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 24981 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 220868801 220868862 220868831 Y C1orf115,MOSC2,MOSC1 C1orf115 NA NA NA NA C1orf115 7614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221048646 221048850 221048821 Y NA HLX NA NA NA NA HLX 849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221049992 221050390 221050089 Y HLX HLX NA NA NA NA HLX 293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 221050798 221050949 221050931 Y HLX HLX NA NA NA NA HLX 1099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221219642 221220032 221219744 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 169943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 221872429 221872689 221872559 Y DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 40829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221877654 221878134 221877871 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 35384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221881394 221881826 221881629 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 31692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 221899063 221899285 221899220 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 14233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 221951076 221951724 221951309 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 37558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 222152569 222152616 222152593 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 239051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr1 222814663 222814910 222814786 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 25235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 222829045 222829186 222829145 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 39617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224026476 224026743 224026681 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 4931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.28421668645668 chr1 224356788 224356993 224356891 Y WDR26,TP53BP2,FBXO28 RP11-365O16.1,DEGS1 NA NA NA NA RP11-365O16.1 4415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224528791 224528972 224528907 Y NA NVL,CNIH4 FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26 IMR90 Hi-C 24141950 NVL 12702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224633276 224633598 224633406 Y NA CNIH3,WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 10541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 224811590 224812043 224811760 Y NA NA NA NA NA NA WDR26 188855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226063760 226064118 226063778 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 NA NA NA NA TMEM63A 3951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226086980 226087330 226087189 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 9752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226187685 226188168 226187763 Y TMEM63A,H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 59384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226189681 226190319 226189910 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 57233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226190534 226190731 226190643 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 56821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 226288544 226288864 226288784 Y C1orf55,H3F3A H3F3A C1orf55,H3F3A,ACBD3 IMR90 Hi-C 24141950 H3F3A 40992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 226867580 226868182 226867972 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 6812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr1 226896121 226896509 226896380 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB 28515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 228398942 228399222 228399120 Y TRIM17,GJC2 IBA57 NA NA NA NA IBA57 47426 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 228848738 228848880 228848809 Y NA RHOU NA NA NA NA RHOU 19944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 228917012 228917506 228917078 Y RHOU RHOU RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 48188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229074291 229074557 229074548 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 205467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229163343 229163424 229163384 Y NA NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 241351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229326926 229327085 229327016 Y RHOU NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 77690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229690998 229691240 229691190 Y ABCB10 NUP133,RP4-613A2.1,ABCB10 NUP133 K562 ChIA-PET 22265404 ABCB10 1202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 229692979 229693368 229693287 Y NUP133,TAF5L,ABCB10 ABCB10 NA NA NA NA ABCB10 537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 230220475 230220731 230220560 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28939 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 230289705 230290142 230289903 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 98169 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 230407650 230408034 230407910 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 216114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 231665787 231666093 231665981 Y EXOC8,C1orf124,TSNAX RP11-295G20.2,TSNAX NA NA NA NA TSNAX 3388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 231860737 231860947 231860816 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 100176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 232073278 232073500 232073389 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 312717 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 232117893 232118046 232117970 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 357332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 232466294 232466418 232466356 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 499515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 232726243 232726385 232726324 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 239548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr1 233250723 233251216 233250828 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 166372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 45442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 234736336 234736615 234736485 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 6656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 49383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA LINC01132 LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01132 45575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 1054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234891292 234891478 234891345 Y IRF2BP2 LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 33503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 50362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr1 234910767 234910877 234910832 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 52978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 234911340 234911676 234911469 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 53551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr1 234911701 234911949 234911811 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 53912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234914073 234914641 234914410 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 56284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 234977482 234978011 234977829 Y IRF2BP2 NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01132 119693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 234985592 234985878 234985823 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 117931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 234987212 234987644 234987394 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 116165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235011316 235011428 235011382 Y NA NA LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,RBM34 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 92381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235012060 235012373 235012284 Y IRF2BP2,ARID4B NA LINC00184,IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,RBM34 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 91436 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 235068890 235069050 235068971 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.1 34759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235080718 235080947 235080875 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.1 22862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 235090546 235090894 235090695 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 12915 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235091073 235091332 235091158 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 12477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 235091427 235091813 235091690 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 11996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 235094853 235095190 235094881 Y RBM34,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 8619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 6954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 5739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 235108272 235108467 235108376 Y IRF2BP2,RBM34,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.1 4463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 3148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235114050 235115068 235114636 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 235151923 235152024 235152010 Y ARID4B RP11-443B7.1,RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 37372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 235615040 235615273 235615157 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT2 50508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 23634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 235842870 235843206 235843038 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 30816 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 235850857 235851038 235851012 Y LYST,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 38803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 235927486 235927702 235927520 Y NA NA NA NA NA NA GNG4 115432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 236022018 236022676 236022299 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 236026265 236026446 236026400 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 18494 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236026992 236027471 236027217 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 17469 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 236027883 236028291 236028094 Y NA LYST NA NA NA NA LYST 16649 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 236101998 236102489 236102172 Y LYST NA LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 57058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236105368 236105579 236105474 Y NA NA LYST,NID1,GNG4 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 60428 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 236109486 236110063 236109737 Y LYST NA LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 64546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 236116403 236116669 236116517 Y LYST NA LYST,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 71463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236118323 236118637 236118427 Y LYST NA LYST,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 73383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 236135691 236135959 236135881 Y GPR137B NA LYST IMR90 Hi-C 24141950 NID1 90503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236147814 236148198 236148007 Y GPR137B NA NA NA NA NA NID1 78264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236162583 236163199 236162893 Y GPR137B NA NA NA NA NA NID1 63263 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236179538 236179652 236179595 Y NA NID1 NA NA NA NA NID1 46810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 236447659 236448000 236447830 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 4340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 237029172 237029469 237029246 Y NA NA NA NA NA NA MTR 72562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 237206585 237207004 237206623 Y ACTN2,RYR2 NA NA NA NA NA RPL35P1 63948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 239186851 239187187 239187019 Y NA NA NA NA NA NA CHRM3 360678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 241163854 241163966 241163910 Y RGS7 RP11-435F13.2 NA NA NA NA RP11-435F13.2 3760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 241693216 241693255 241693236 Y KMO FH NA NA NA NA FH 12155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 241714901 241715765 241715555 Y KMO FH NA NA NA NA FH 33840 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 243853401 243853550 243853530 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 158831 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 28.5969373620008 chr1 243894639 243895081 243894755 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 117300 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 243923195 243923609 243923504 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 88772 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244417754 244418100 244418029 Y AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS NA LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 195336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244439620 244440012 244439977 Y NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 173424 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244466323 244466598 244466461 Y NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 146838 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244486299 244486688 244486462 Y AKT3,AKT3,ADSS NA SDCCAG8,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 126748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244535063 244535306 244535184 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 78130 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr1 245082176 245082355 245082237 Y EFCAB2 EFCAB2 SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 48652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 245217556 245217830 245217613 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB2 86549 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 245810793 245811072 245810933 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 494506 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246183399 246183819 246183679 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 484795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246730569 246731007 246730621 Y AHCTF1,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 2823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 246749077 246749442 246749258 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 21331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246751015 246751281 246751184 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 23269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247553531 247554143 247553893 Y AHCTF1,NLRP3,NLRP3 NLRP3 AHCTF1,ZNF496 IMR90 Hi-C 24141950 NLRP3 23315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr1 247570274 247570994 247570679 Y AHCTF1,NLRP3,NLRP3 NLRP3 NA NA NA NA NLRP3 6464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 247574986 247575390 247575076 Y AHCTF1,NLRP3,NLRP3 NLRP3 NA NA NA NA NLRP3 2068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 249099326 249099454 249099407 Y NA MIR3124,SH3BP5L,ZNF672 NA NA NA NA MIR3124 19122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 916611 916806 916707 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 58758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 3762746 3763172 3762857 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 62301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 3846443 3847038 3846804 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 20970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 3915881 3916422 3916098 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 90408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA NA NA NA NA NA AKR1E2 121038 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 258098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 258928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 5339443 5339719 5339664 Y NA NA AKR1E2,tAKR,AKR1CL1,UCN3,AKR1C2 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 263897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA ASB13 201893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 5770570 5770836 5770703 Y NA FAM208B NA NA NA NA FAM208B 45769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6075776 6076312 6076144 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17 NA NA NA NA NA RBM17 52638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 6110274 6110558 6110524 Y GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,IL2RA,RBM17,RBM17 RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 RBM17 18392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6182474 6182743 6182618 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 2138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6190431 6190630 6190601 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 5550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6193489 6193806 6193647 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 8608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6240292 6240352 6240319 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 55411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6389510 6390540 6390147 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 204629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 6438616 6439009 6438869 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA LOC399715,IL2RA,PFKFB3,RBM17,FBXO18,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 181254 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 6970148 6970192 6970158 Y SFMBT2,SFMBT2 NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCQ 349885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 7223481 7223753 7223543 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT2 227697 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7275320 7275743 7275581 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT2 175707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7285969 7286078 7285998 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT2 165372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7300945 7301168 7301056 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA SFMBT2 150282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7356268 7356516 7356367 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA SFMBT2 94934 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA SFMBT2 89100 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 7518032 7518150 7518125 Y SFMBT2,SFMBT2 RP5-1031D4.2 NA NA NA NA RP5-1031D4.2 6128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7526564 7526721 7526650 Y SFMBT2,SFMBT2,TAF3,KIN RP5-1031D4.2 NA NA NA NA RP5-1031D4.2 14660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 7902237 7902611 7902424 Y NA TAF3 NA NA NA NA TAF3 43770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 9139521 9139818 9139671 Y NA NA TAF3 IMR90 Hi-C 24141950 TAF3 1281054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 11205067 11205773 11205317 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 159808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr10 11208955 11209315 11209006 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 163696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 166168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 11220579 11221039 11220795 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 175320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 11222222 11222709 11222492 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 176963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr10 11301422 11301770 11301497 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 256163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 11856360 11856525 11856473 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC3 73995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 12002775 12003103 12002939 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 80066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 12306536 12306777 12306588 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 70393 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 12307693 12308050 12307912 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 71550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 12313010 12313140 12313022 Y UPF2,UPF2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 76341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 13754952 13755339 13755135 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 128025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 14099317 14099548 14099433 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 402593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 14601403 14601956 14601622 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 99262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 100178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr10 14701782 14702188 14701951 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FAM107B 112708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 15179834 15179919 15179877 Y NA RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 28773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 16481463 16481634 16481561 Y NA PTER NA NA NA NA PTER 4521 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 16548527 16548808 16548668 Y NA NA NA NA NA NA PTER 71585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 17254796 17255338 17255153 Y VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 CUBN,TRDMT1,VIM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRDMT1 12743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 22242936 22243341 22243231 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA RN7SKP37 22864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 22817226 22817294 22817260 Y EBLN1 NA NA NA NA NA PIP4K2A 184190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 22922432 22922728 22922682 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 78756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 23344774 23344811 23344800 Y NA MSRB2 NA NA NA NA MSRB2 37624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 23346565 23346888 23346727 Y NA MSRB2 COMMD3-BMI1,SPAG6 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB2 35547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 24298317 24298326 24298320 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1217 316642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 24917417 24917574 24917542 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 93023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 25640550 25640656 25640570 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 336963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 27032794 27033066 27033024 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 48206 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 27130056 27130389 27130223 Y NA ABI1 NA NA NA NA ABI1 17627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr10 27608918 27609295 27609159 Y ABI1,MASTL,ACBD5 NA PDSS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ACBD5 79859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 28622853 28623578 28623396 Y NA MPP7 MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 MPP7 1438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 28690854 28692148 28691839 Y NA NA NA NA NA NA MPP7 69439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 29717478 29717845 29717536 Y NA PTCHD3P1 NA NA NA NA PTCHD3P1 21147 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 30742798 30743130 30743073 Y NA MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 21932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 30818244 30819051 30818562 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 97378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr10 31025766 31026097 31025992 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 292769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 31106973 31107176 31107079 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZNF438,KIF5B,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 211690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 31289701 31290078 31290005 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 28788 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-472N13.3 101593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 31993148 31993429 31993299 Y NA RP11-472N13.3 ZEB1,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-472N13.3 887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-472N13.3 54556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 32639699 32640002 32639940 Y NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 25724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 33950849 33951084 33950928 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 327659 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 34569605 34569879 34569742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 381150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 35739762 35740277 35740119 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA CCNY 205809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 37371734 37371985 37371860 Y NA NA NA NA NA NA NAMPTL 560572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 42391693 42392005 42391916 Y NA NA NA NA NA NA LINC00839 576986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 43470671 43470827 43470727 Y NA NA RET MCF7 ChIA-PET 22265404 RET 99648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 7.56368270806544 chr10 43471158 43471309 43471213 Y NA NA RET MCF7 ChIA-PET 22265404 RET 99166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 44046358 44046416 44046387 Y NA ZNF239 NA NA NA NA ZNF239 21650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 44185624 44185942 44185694 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 43320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 44289212 44289448 44289386 Y NA HNRNPA3P1 NA NA NA NA HNRNPA3P1 5347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr10 45463684 45463996 45463754 Y ALOX5,RASSF4 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 8262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 45464299 45464380 45464314 Y ZNF22,C10orf25 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 7878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF488 696953 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 49678205 49678472 49678354 Y NA NA NA NA NA NA MAPK8 165507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 50012425 50012991 50012650 Y NA NA NA NA NA NA WDFY4 121504 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr10 51514684 51514849 51514767 Y NA RP11-109G10.2,NCOA4 NA NA NA NA RP11-109G10.2 15723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 51515594 51515677 51515640 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2,NCOA4 NA NA NA NA RP11-109G10.2 14895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 52300578 52300747 52300601 Y FAM21A NA NA NA NA NA SGMS1 82176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 52329586 52329716 52329651 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 53207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 54317967 54318032 54318000 Y NA NA LOC100506939,DKK1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-556E13.1 195137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 54329490 54329893 54329885 Y NA NA LOC100506939,DKK1,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-556E13.1 183276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556E13.1 146049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 60673526 60673673 60673610 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 402626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 61997048 61997297 61997111 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 332634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 62307595 62307995 62307795 Y ANK3 NA NA NA NA NA CDK1 228094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 64300187 64300318 64300222 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 262198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 64519625 64519765 64519706 Y NRBF2,EGR2,EGR2 ADO ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 ADO 42751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 65026237 65026642 65026597 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 135187 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 65388414 65388608 65388512 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 109291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 66085994 66086251 66086123 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 424989 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 66294853 66295258 66294869 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 633848 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 67968655 67969045 67968849 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 1673382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 68753444 68753641 68753546 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 888786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 839175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 118097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70805220 70805884 70805439 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 39978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 70816608 70816807 70816704 Y SRGN SRGN KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 29055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70817174 70817630 70817194 Y NA SRGN KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 28232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.83364739997837 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 70825489 70826129 70825820 Y HK1,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 19733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70832840 70833011 70832951 Y DDX21,SRGN SRGN,VPS26A SRGN K562 ChIA-PET 22265404 SRGN 12851 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 70833673 70834029 70833881 Y SRGN SRGN,VPS26A SRGN K562 ChIA-PET 22265404 SRGN 11833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70849672 70851282 70850023 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A SRGN,VPS26A NA NA NA NA SRGN 3810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 70853829 70854114 70853839 Y NA SRGN,VPS26A NA NA NA NA SRGN 7967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 71198445 71198595 71198514 Y NA TSPAN15 HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSPAN15 10634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 71239136 71239503 71239234 Y NA TSPAN15 NA NA NA NA TSPAN15 29907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 71577107 71577330 71577210 Y NA COL13A1 NA NA NA NA COL13A1 17463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1,CALM2P2 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 72124245 72124646 72124446 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA LRRC20 15736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 72239929 72240682 72240087 Y KIAA1274 NA NA NA NA NA EIF4EBP2 77794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 72253805 72253950 72253868 Y NA NA NA NA NA NA EIF4EBP2 91670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 73357359 73357803 73357564 Y C10orf105 NA NA NA NA NA C10orf54 173452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 73357811 73358216 73358107 Y PSAP,C10orf54 NA NA NA NA NA C10orf54 173039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 73454502 73454799 73454537 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 76456 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 73954988 73955333 73955161 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 18454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr10 74068319 74068595 74068530 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ASCC1,ANAPC16 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDIT4 36641 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 74271285 74271561 74271407 Y DDIT4,DNAJB12,CBARA1 NA NA NA NA NA MICU1 112338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 74991679 74992005 74991988 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 14615 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 75179357 75179732 75179545 Y ZMYND17 ANXA7,RP11-345K20.2 NA NA NA NA RP11-345K20.2 722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 75716399 75716797 75716501 Y FUT11,NDST2 PLAU,VCL CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VCL 39075 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 75931649 75931916 75931783 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 22689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 75987927 75988078 75987990 Y KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK NA NA NA NA NA ADK 78967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 77189888 77190112 77189953 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 30224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 77300831 77301201 77300915 Y NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 57797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 77533067 77533251 77533127 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 174069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 77664306 77664573 77664408 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 305308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 77803071 77803442 77803222 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 444073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 78066711 78066848 78066773 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 707713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 78163731 78164099 78163833 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 804733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr10 80015725 80016226 80016048 Y RPS24 NA NA NA NA NA RPS24 224207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 80897644 80897901 80897807 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 70852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 80990068 80990387 80990161 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 114838 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81004480 81004949 81004783 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 100276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr10 81008258 81008603 81008380 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 96622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 81027575 81027693 81027634 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 77532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81030651 81030992 81030820 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 74233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81048115 81048599 81048253 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 56626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81078771 81079085 81078950 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81091409 81091966 81091732 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81105192 81105332 81105235 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 81698656 81698964 81698816 Y ANXA11 MBL1P,SFTPD NA NA NA NA MBL1P 36002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 81946319 81946704 81946639 Y ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 16624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 82237584 82237869 82237663 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 25662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 82245417 82245911 82245608 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA TSPAN14 33495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 82246029 82246351 82246262 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA TSPAN14 34107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 82247433 82247863 82247773 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA TSPAN14 35511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr10 82253401 82253904 82253623 Y NA TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 39794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 34918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 32690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 82296466 82296516 82296492 Y NA RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 2768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 84982994 84983300 84983050 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P8 855885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 86093705 86094297 86093848 Y NA NA NA NA NA NA CDHR1 141295 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 86104605 86104727 86104619 Y NA NA NA NA NA NA CDHR1 152195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 87704584 87704927 87704756 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 419323 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr10 89826660 89827052 89826872 Y KLLN,PTEN NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 123401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 89896518 89896551 89896536 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 193259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 89912666 89913039 89912909 Y NA NA KLLN,PTEN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 209407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 90145688 90145942 90145819 Y LIPK NA NA NA NA NA RNLS 196345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 90608310 90608527 90608426 Y LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA ANKRD22 1048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 90612844 90613292 90613035 Y IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 ANKRD22,STAMBPL1 NA NA NA NA ANKRD22 3269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 90689067 90689322 90689158 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 51576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 90753757 90754132 90754032 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 5343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 91056885 91057091 91056998 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 IFIT2,IFIT3 IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFIT2 2621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 91199827 91200195 91200013 Y NA IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 27484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 91254599 91254682 91254639 Y NA NA NA NA NA NA IFIT5 82256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 91462035 91462111 91462091 Y NA KIF20B NA NA NA NA KIF20B 2668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 92928766 92928934 92928784 Y NA PCGF5 RPP30 IMR90 Hi-C 24141950 PCGF5 48974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 93301292 93301692 93301492 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3C 89119 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 93697836 93698042 93697939 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 16310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr10 94460544 94460634 94460589 Y CYP26C1 HHEX NA NA NA NA HHEX 14599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 97048077 97048324 97048201 Y SORBS1 PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97308667 97309047 97308880 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 10124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97311589 97311866 97311827 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 7305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97521944 97522167 97522133 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA ENTPD1 52408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97597277 97597813 97597744 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA ENTPD1 127741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97687985 97688127 97688056 Y NA NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 69873 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 98468328 98468564 98468493 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 9707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 99165908 99166118 99166051 Y C10orf12,ARHGAP19,FRAT1,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RRP12 6781 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr10 99167112 99167183 99167148 Y NA RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RRP12 7985 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 101942179 101942274 101942224 Y CWF19L1,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 3817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 101944283 101944461 101944347 Y DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 1630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 102501164 102501306 102501235 Y NA NA NA NA NA NA FAM178A 169020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 102792815 102793017 102792917 Y NA C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA SFXN3 3824 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 103124787 103125187 103124970 Y NA BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 103656859 103657173 103657045 Y NA NA MGEA5,LOC100289509,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNIP2 55182 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 104238092 104238376 104238328 Y NA CUEDC2,TMEM180,ACTR1A,SUFU NA NA NA NA TMEM180 18943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 104359512 104359806 104359659 Y ACTR1A,C10orf26 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 42447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 104364219 104364413 104364273 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 37840 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr10 104533606 104534005 104533917 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32,C10orf26 NA NA NA NA NA SFXN2 61311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 104545681 104545915 104545784 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 66065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 104683249 104683568 104683410 Y NA CNNM2 NA NA NA NA CNNM2 7199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 104956992 104957240 104957082 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 5936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 105230970 105231363 105231243 Y NT5C2,CALHM2 CALHM2 CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5 IMR90 Hi-C 24141950 CALHM2 20310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 156809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 105610087 105610227 105610144 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 65736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 106082205 106082621 106082398 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 13541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 111971920 111972386 111972091 Y ADD3,MXI1,SMNDC1 MXI1 NA NA NA NA MXI1 6557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 112174147 112174523 112174256 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 112263780 112264181 112263965 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 8184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 112432258 112432673 112432308 Y PDCD4 NA PDCD4,LOC282997 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 106809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 114292106 114292272 114292196 Y ZDHHC6,VTI1A NA NA NA NA NA VTI1A 87350 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 114707857 114707918 114707888 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 91 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 115141716 115142302 115141804 Y TCF7L2 NA VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2 IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 294640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 116582671 116583074 116582920 Y NA FAM160B1 NA NA NA NA FAM160B1 3168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 117021659 117021668 117021663 Y ATRNL1 NA NA NA NA NA TRUB1 325707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 SLC18A2 NA NA NA NA SLC18A2 29792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA SLC18A2 NA NA NA NA SLC18A2 47730 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 94093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 121154195 121154697 121154651 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 145523 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 121154797 121155146 121155008 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 145074 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 121249100 121249168 121249139 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 51052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 121277481 121277683 121277593 Y EIF3A,RGS10 RGS10 NA NA NA NA RGS10 22537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 121415317 121415432 121415359 Y GRK5,BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 6435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 121544240 121544543 121544312 Y NA NA MCMBP IMR90 Hi-C 24141950 MCMBP 105525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 122836934 122837187 122837105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 54050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr10 123494191 123494316 123494254 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 191511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 123707273 123707432 123707353 Y PLEKHA1,BTBD16 ATE1-AS1,ATE1,NSMCE4A,TACC2 NA NA NA NA ATE1 20957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 124249700 124250033 124249857 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 117488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 125151623 125152081 125151906 Y HMX3,BUB3 NA NA NA NA NA BUB3 239830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126029584 126030073 126029818 Y CHST15 NA HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 75472 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126212520 126212862 126212532 Y NA RPS10P18 NA NA NA NA RPS10P18 35373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126336359 126336702 126336537 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 94136 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126346022 126346943 126346570 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 83895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126349618 126349650 126349637 Y NA NA NA NA NA NA FAM53B 81188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 126373894 126374059 126373997 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 56779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126429723 126430192 126430042 Y FAM53B FAM53B,METTL10 NA NA NA NA FAM53B 646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126490996 126491131 126491100 Y NA METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM175B 2642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 126748587 126748846 126748786 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 126749775 126749930 126749890 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 97809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 127577281 127577575 127577428 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 34 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 127824574 127824998 127824837 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 241466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 127825166 127825330 127825256 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 242058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 128351863 128352142 128352116 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 239836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 129862087 129863410 129862652 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 59239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 129948422 129948582 129948473 Y NA MKI67 FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 25773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 129985931 129986341 129986216 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 63282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 130590720 130590941 130590831 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 668071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 131669190 131669455 131669323 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 90650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 131688064 131688242 131688188 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 71863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 133836748 133836839 133836756 Y STK32C,DPYSL4,JAKMIP3 BNIP3 BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 43313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 134142326 134142616 134142473 Y NA STK32C,LRRC27 LRRC27 K562 ChIA-PET 22265404 STK32C 735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 134234707 134235257 134234764 Y STK32C,PWWP2B PWWP2B,C10orf91 C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf91 20574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 4510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr10 134266616 134267060 134266753 Y LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92 C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 10785 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 134364689 134365427 134365071 Y INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 15365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.10836275673922 chr10 134373708 134374041 134373810 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 24384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 134385594 134385710 134385631 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 36270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 134388036 134388182 134388143 Y JAKMIP3,DPYSL4,C10orf92 INPP5A NA NA NA NA INPP5A 38712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 134388737 134389185 134389009 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 39413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr10 134401859 134402261 134402219 Y PWWP2B,INPP5A NA NA NA NA NA INPP5A 52535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr10 134430075 134430311 134430209 Y INPP5A NA NA NA NA NA INPP5A 80751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 135048867 135049308 135048949 Y TUBGCP2,ADAM8 UTF1 NA NA NA NA UTF1 7089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr10 135071993 135072118 135072056 Y TUBGCP2,ADAM8 UTF1,ZNF511 NA NA NA NA UTF1 30215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 UTF1,ZNF511 NA NA NA NA UTF1 30957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr10 135107749 135108037 135107982 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 11942 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,RP11-326C3.12,IFITM3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM3 30340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 1568333 1568421 1568379 Y BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 22729 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 23329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 2286743 2287171 2286814 Y LSP1 TSPAN32,C11orf21 NA NA NA NA TSPAN32 34056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 2465201 2465287 2465244 Y INS TSSC4,KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 1287 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 2468354 2468468 2468407 Y C11orf21,TSPAN32,TSSC4,KCNQ1 TSSC4,KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 4440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 2502121 2502438 2502223 Y KCNQ1 KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 38207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 2705021 2705206 2705044 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 14018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 3180503 3180713 3180608 Y ART1 OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 5256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 3190882 3191107 3191009 Y NA OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 4913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 3859822 3860019 3859941 Y NUP98,STIM1,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA RHOG 194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 3860220 3860837 3860518 Y NA PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA RHOG 7 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 4476733 4477061 4476821 Y TRIM21 NA NA NA NA NA TRIM21 63807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 4480806 4481003 4480874 Y TRIM21 NA NA NA NA NA TRIM21 67880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 6564206 6564247 6564227 Y NA NA NA NA NA NA RRP8 58603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 6667820 6668268 6668018 Y OR6A2,DCHS1 RRP8,ILK,TAF10,RP11-732A19.9,TPP1,MRPL17 NA NA NA NA TPP1 29128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 6723829 6724231 6724032 Y NA MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 21197 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 6765949 6766297 6766123 Y DCHS1,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 NA TRIM3,NLRP14,SYT9 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL17 63317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 8607763 8607778 8607771 Y ASCL3,STK33 STK33 NA NA NA NA STK33 6058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 8857868 8857938 8857900 Y NA NA NA NA NA NA AKIP1 72748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 8935621 8935992 8935713 Y RPL27A AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B NA NA NA NA AKIP1 4935 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9017468 9017784 9017768 Y NA TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 5812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9023312 9023663 9023569 Y ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3 TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 9636768 9636900 9636824 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 43540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 9824167 9824574 9824403 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 140543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 10063724 10063946 10063792 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2 249808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA RNF141 58883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 10627707 10627864 10627812 Y NA NA NA NA NA NA RNF141 66930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr11 10644942 10645095 10645021 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,RNF141 NA NA NA NA NA RNF141 84165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 10862862 10862982 10862965 Y NA SNORD97,EIF4G2,ZBED5 NA NA NA NA ZBED5 15361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 11641691 11641934 11641813 Y GALNTL4 NA NA NA NA NA USP47 219036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 14306265 14306627 14306419 Y NA NA NA NA NA NA RRAS2 77425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 14916687 14916856 14916788 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 4889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 15821579 15821866 15821680 Y NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 810813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 16055828 16056182 16056005 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 576497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 17099866 17100401 17100030 Y NA SNORD14A,RPS13 NA NA NA NA RPS13 2532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 17335831 17335998 17335921 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ11 72880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA AC084117.3 1256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 22185064 22185249 22185097 Y NA ANO5 NA NA NA NA ANO5 27473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 27231187 27231325 27231258 Y NA NA LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 152090 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 27481800 27481840 27481820 Y NA LGR4,LIN7C NA NA NA NA LGR4 10482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 28010741 28010769 28010755 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 100161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 31450770 31450827 31450799 Y PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DNAJC24 61383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 31630096 31630156 31630127 Y PAX6 NA NA NA NA NA ELP4 100799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 31838721 31838861 31838791 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA PAX6 1212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 32093292 32093302 32093297 Y PAX6 NA RCN1,ELP4,IMMP1L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PAX6 255783 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 32442373 32442742 32442611 Y NA WT1-AS,WT1 NA NA NA NA WT1-AS 12322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 33898611 33898980 33898798 Y LMO2 LMO2 NA NA NA NA LMO2 12856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 33914546 33914772 33914727 Y LMO2 LMO2 NA NA NA NA LMO2 2710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 34084271 34084310 34084291 Y NA CAPRIN1,NAT10 NA NA NA NA CAPRIN1 13041 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 34676467 34676782 34676555 Y ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF NA NA NA NA NA CAT 217995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 35061713 35062540 35061871 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 95039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 35068839 35069139 35069034 Y CD44 NA CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 88440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 35079507 35079746 35079696 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 77833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 35088540 35088910 35088827 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 68669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 35094290 35094666 35094566 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 62913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 52068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 35109319 35109885 35109545 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 47694 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 35180596 35180888 35180668 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 22179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 36406780 36407137 36406963 Y TRAF6,PRR5L NA NA NA NA NA COMMD9 97781 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 37809838 37809966 37809929 Y NA NA NA NA NA NA RAG2 1192009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 43779324 43779404 43779364 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 120957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 44123492 44123510 44123502 Y NA ACCS,EXT2 NA NA NA NA EXT2 8393 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 44590064 44591217 44590888 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 6087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 46963806 46964041 46963934 Y NA LRP4,C11orf49 NA NA NA NA C11orf49 7566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD NA NA NA NA NR1H3 14842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 47414531 47414922 47414826 Y MADD,MADD,MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 11761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 47414965 47416043 47415133 Y MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 10640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr11 47421735 47422128 47421819 Y MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3 SLC39A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 4555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 47872031 47872166 47872095 Y OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 3924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 48034964 48035405 48035033 Y OR4X1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 34851 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 48063635 48064268 48063917 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 63522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 48163334 48163507 48163430 Y OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 163221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 57173815 57174163 57173968 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 PRG3,PRG2,SLC43A3 NA NA NA NA PRG2 17685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 PRG2,SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr11 57232201 57232685 57232388 Y NA SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 6179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 58399673 58399754 58399714 Y OR9Q2,OR1S2,OR1S1,OR10Q1,OR10W1,OR5B3,OR5B2,OR5B12 NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 55028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 58991962 58992424 58992241 Y FAM111A,MPEG1,PATL1,OSBP MPEG1 NA NA NA NA MPEG1 13538 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 59278449 59278607 59278583 Y MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1 NA NA NA NA NA OSBP 103010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 60679748 60680120 60679877 Y CD5,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3 NA NA NA NA TMEM109 402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr11 61456345 61456647 61456520 Y CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 10440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 61792928 61793609 61793204 Y DAGLA,FTH1 NA FADS3,FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 59796 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 62164133 62164439 62164244 Y NA NA NA NA NA NA ASRGL1 61213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 63269910 63269971 63269941 Y RTN3,MARK2,LGALS12 LGALS12,RARRES3 NA NA NA NA LGALS12 1585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 63837811 63837961 63837886 Y NA RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 36369 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-21A7A.2 57125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.21197484863053 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 63954598 63954956 63954814 Y FERMT3,CCDC88B,OTUB1 MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,VEGFB NA NA NA NA STIP1 3854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 64267191 64267548 64267420 Y RASGRP2 NA NRXN2,RASGRP2,PYGM,SLC22A12 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA4 142571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 64916686 64916783 64916734 Y NRXN2,C11orf85 TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1,RNU2-23P,CAPN1 SYVN1,CAPN1,SPDYC MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNU2-23P 3631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.62642321619576 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 65852297 65852657 65852298 Y TMEM151A,CNIH2 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 16463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 66185542 66185902 66185739 Y NA SLC29A2,MRPL11,PELI3 NA NA NA NA MRPL11 46307 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 67039199 67039528 67039325 Y TBC1D10C,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 7318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,TBC1D10C,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 67253659 67253853 67253760 Y PTPRCAP,NUDT8,AIP CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA AIP 5147 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 67909547 67909914 67909680 Y CHKA CHKA NA NA NA NA CHKA 22636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 68049630 68050030 68049692 Y NA C11orf24,LRP5 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 12161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 68596165 68596440 68596230 Y MTL5,CPT1A CPT1A NA NA NA NA CPT1A 13438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 68623126 68623609 68623402 Y MTL5,CPT1A CPT1A,MRPL21,IGHMBP2 CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPT1A 13248 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 NA NA NA NA MRGPRF 88 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr11 68832799 68833131 68832982 Y IGHMBP2,MRGPRD,TPCN2 TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 18434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 71209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 72449101 72449742 72449392 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 52902 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 72452508 72452870 72452656 Y STARD10,ATG16L2,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 49774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 72498496 72498726 72498679 Y STARD10 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 3918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 72915825 72916228 72915957 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT IMR90 Hi-C 24141950 P2RY2 11115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr11 72985787 72986008 72985881 Y FCHSD2,RELT,RELT,P2RY6 P2RY6,ARHGEF17 NA NA NA NA P2RY6 12237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr11 73097153 73097443 73097265 Y FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 11844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 73706184 73706513 73706422 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UCP2 13832 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 74906257 74906584 74906454 Y SPCS2,NEU3,ARRB1,SLCO2B1 NA NA NA NA NA ARRB1 154289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75051761 75052000 75051847 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 8873 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 75060567 75060771 75060596 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75060875 75061139 75061045 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 2 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75081024 75081153 75081089 Y NEU3 ARRB1,RPS3,SNORD15B ARRB1,SLCO2B1,GDPD5,RPS3 IMR90 Hi-C 24141950 ARRB1 20151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75186595 75186756 75186708 Y NA KLHL35,GDPD5 RPS3 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL35 46921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 163545 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 75945169 75945568 75945242 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 25389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 75946917 75947052 75946991 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 27137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 76483483 76483778 76483631 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSKU 7517 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 78000759 78000964 78000861 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 102891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 78003105 78003596 78003355 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 105237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 78060066 78060579 78060413 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 66815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 78144030 78144327 78144179 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 16636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 82610096 82610395 82610239 Y PCF11,ANKRD42,RAB30 C11orf82 NA NA NA NA C11orf82 1079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 82961020 82961401 82961211 Y NA RP11-727A23.1,CCDC90B NA NA NA NA CCDC90B 34049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 84316632 84316642 84316637 Y DLG2 NA NA NA NA NA TMEM126B 1020987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 85047149 85047448 85047300 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 290181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 85845984 85846086 85845986 Y EED,PICALM,PICALM NA PICALM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PICALM 67060 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 85852808 85853091 85852963 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 73884 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 85873395 85873578 85873505 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED,CCDC83 IMR90 Hi-C 24141950 EED 80008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 85913184 85913318 85913234 Y PICALM,PICALM EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 40268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 86229748 86229843 86229795 Y NA NA NA NA NA NA ME3 151835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 86262463 86262643 86262563 Y FZD4 NA NA NA NA NA ME3 119035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 86841159 86841223 86841164 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 94273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 87871692 87871803 87871780 Y NA RAB38 NA NA NA NA RAB38 34832 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr11 88909137 88909241 88909198 Y TYR NA NA NA NA NA FOLH1B 460442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 89937153 89937335 89937244 Y NA CHORDC1 NA NA NA NA CHORDC1 17197 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 94315162 94315340 94315237 Y NA FUT4 NA NA NA NA FUT4 40145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 94317425 94317695 94317494 Y PANX1,ANKRD49,FUT4 FUT4 NA NA NA NA FUT4 42408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 94987550 94987767 94987639 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 23845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 95098655 95098797 95098720 Y NA NA NA NA NA NA SESN3 134950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 95890101 95890693 95890420 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 183651 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 96024131 96024308 96024240 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 50036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 102450928 102451243 102451066 Y BIRC3,BIRC2,TMEM123 NA NA NA NA NA TMEM123 111813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 102678364 102678503 102678434 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D5 282441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 107846158 107846176 107846168 Y NA SLC35F2,RAB39A,CUL5 NA NA NA NA CUL5 31283 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 109208614 109208734 109208674 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 674862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 109358669 109358908 109358789 Y NA NA DDX10 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 603179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 109965770 109966113 109965869 Y RDX,FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 3683 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 110367857 110368312 110368149 Y ZC3H12C,RDX,FDX1 NA FDX1,POU2AF1,LOC100132078,C11orf53,BTG4,ARHGAP20 IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 69250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 111560054 111560414 111560322 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 74737 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 111824557 111824693 111824689 Y NA NA NA NA NA NA DLAT 68845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 112833069 112833192 112833175 Y NCAM1 NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 3072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 113020811 113021147 113020979 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 162012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 17089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 113950793 113951339 113951236 Y TMPRSS5,ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 22478 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 113962450 113962640 113962545 Y NA ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 34135 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 92348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 88293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr11 115345794 115346124 115345959 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 27551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 116481606 116481842 116481724 Y NA NA NA NA NA NA BUD13 159862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 116852232 116852440 116852371 Y SIK3 NA NA NA NA NA AP000936.1 52327 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 117050933 117051273 117050997 Y SIDT2 PAFAH1B2,SIDT2,PCSK7 NA NA NA NA SIDT2 3484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117699961 117700395 117700269 Y IL10RA FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 44987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117822049 117822355 117822234 Y UBE4A,MPZL3,MLL,IL10RA,CD3G,CD3E,CD3D,AMICA1 IL10RA FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,LOC100526771 IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 32708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117841460 117841624 117841571 Y AMICA1,AMICA1,IL10RA IL10RA FXYD6-FXYD2,IL10RA,DSCAML1,TMPRSS13,LOC100526771 IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 13439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117881559 117881948 117881858 Y AMICA1,MPZL3,AMICA1,IL10RA IL10RA NA NA NA NA IL10RA 26496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 117882756 117883280 117883084 Y NA IL10RA NA NA NA NA IL10RA 27693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D AMICA1,MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 118806138 118806167 118806153 Y NA BCL9L PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9L 11821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 119124696 119124715 119124706 Y NA CBL NA NA NA NA CBL 49944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 142361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr11 120078906 120079218 120079100 Y NA OAF,POU2F3 LOC100499227,TMEM136,POU2F3 IMR90 Hi-C 24141950 OAF 257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 120083069 120083545 120083438 Y GRIK4,ARHGEF12,OAF OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 3594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 122100461 122100655 122100524 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 423728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 122614600 122615453 122614815 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 90217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 123293400 123293723 123293427 Y NA AP000783.1 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 5335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 124514246 124514548 124514258 Y OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1,SPA17,SIAE NA NA NA NA TBRG1 23514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA ESAM 38702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 126181564 126181596 126181580 Y SRPR FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 9351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 126188574 126188806 126188644 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 16361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr11 126191145 126191518 126191332 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 18932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 126210041 126210184 126210131 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 128141404 128141667 128141550 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA KCNJ1,ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 313786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 128366966 128367159 128367092 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 88294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 128445940 128446213 128446123 Y FLI1,FLI1 ETS1 NA NA NA NA ETS1 9240 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 128584156 128584534 128584279 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 29726 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 129512959 129513316 129513039 Y BARX2 NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 250169 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 129781322 129781453 129781412 Y APLP2 NFRKB NA NA NA NA NFRKB 17837 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 129942098 129942391 129942179 Y PRDM10 TCEB2P2,APLP2 NA NA NA NA APLP2 4366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 130767172 130767510 130767285 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr11 132126404 132126546 132126474 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 1342000 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 289742 289883 289807 Y SLC6A12 NA NA NA NA NA CCDC77 206556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 NA NA NA NA NA CCDC77 197951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 52557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 726826 727017 726943 Y CCDC77,KDM5A,WNK1 RP11-218M22.1,NINJ2 NA NA NA NA RP11-218M22.1 11040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 1217560 1217684 1217622 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 119885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 1261364 1261638 1261529 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 163689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 1511133 1511360 1511261 Y ERC1 NA NA NA NA NA FBXL14 189971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 1925056 1925234 1925157 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP14 59879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 2403977 2404382 2404036 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 292276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 356114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 3913952 3914004 3913978 Y NA EFCAB4B NA NA NA NA EFCAB4B 41967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 4406037 4406342 4406147 Y PARP11,CCND2 CCND2,C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 22029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 4758958 4759134 4759102 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 2697 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 4938668 4939292 4938830 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA9 182407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 5589537 5589706 5589616 Y NA NA NA NA NA NA CD9 717175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 6276820 6277298 6277162 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 29583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 6339954 6340271 6340062 Y VAMP1,TAPBPL,IFFO1 CD9 NA NA NA NA CD9 33073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 44613 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 16636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 8112195 8112747 8112462 Y NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 25324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr12 8813796 8814159 8813977 Y MFAP5 RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 18037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 9236028 9236753 9236097 Y KLRG1 A2M NA NA NA NA A2M 30072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP A2M NA NA NA NA A2M 42107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 9491229 9491519 9491373 Y NA NA C12orf33,LOC144571 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP4 100302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 9804148 9804385 9804240 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4 NA NA NA NA RP11-705C15.4 5543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA CLEC7A,OLR1 NA NA NA NA OLR1 16283 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11806275 11806670 11806607 Y BCL2L14,ETV6 ETV6 NA NA NA NA ETV6 5487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11893113 11893308 11893155 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 92325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11911642 11913422 11912121 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 110854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11918792 11919487 11919193 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 11926847 11927297 11927011 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 126059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11950553 11950830 11950618 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 149765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11962012 11962232 11962094 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 161224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 11987514 11987811 11987531 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 186726 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 11989252 11989963 11989497 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 188464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 12016846 12017194 12017120 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 216058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 12589911 12590246 12590074 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 81898 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 12599819 12600045 12599926 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 91806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 12883612 12883681 12883638 Y APOLD1 GPR19,CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 17620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 13251023 13251431 13251083 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 55805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 14735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 15105208 15105676 15105381 Y WBP11,ARHGDIB ARHGDIB NA NA NA NA ARHGDIB 6986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 15110831 15110963 15110879 Y NA ARHGDIB ERP27 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGDIB 1699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 15782024 15782386 15782102 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6K23.1 191563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 16817876 16817986 16817888 Y LMO3 NA NA NA NA NA LMO3 56348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 19914510 19914683 19914597 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 177772 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 22195948 22196249 22196127 Y NA CMAS NA NA NA NA CMAS 859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 NA NA NA NA NA BCAT1 426587 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 25004985 25005042 25005012 Y BCAT1 NA NA NA NA NA BCAT1 95351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 25008843 25009219 25009048 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 91174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 25058340 25058627 25058484 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 41766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.10836275673922 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 556099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 26626326 26626794 26626426 Y FGFR1OP2 NA NA NA NA NA ITPR2 357337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 26805266 26805775 26805502 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 178356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 28736432 28736928 28736707 Y NA NA PTHLH,CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-967K21.1 395133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 29312653 29312987 29312866 Y NA FAR2 FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 12617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 29581721 29581917 29581813 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 49599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 31754010 31754391 31754188 Y DENND5B,METTL20 DENND5B DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 11979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 31789524 31789538 31789533 Y NA DENND5B DENND5B,METTL20 IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 47493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 31985707 31986073 31985876 Y AMN1,H3F3C H3F3C NA NA NA NA H3F3C 42532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 32059556 32059920 32059668 Y AMN1,H3F3C,C12orf35 RP11-428G5.2 AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-428G5.2 39348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 33048688 33048837 33048763 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 39539251 39539539 39539453 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 240019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr12 40457263 40457286 40457275 Y NA RPL30P13,SLC2A13 NA NA NA NA RPL30P13 3106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 41264985 41265046 41264997 Y CNTN1 NA NA NA NA NA CNTN1 180741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 42537125 42537342 42537234 Y NA GXYLT1 NA NA NA NA GXYLT1 444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr12 45703000 45703363 45703138 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 95176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 46956105 46956322 46956188 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 180643 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 49449678 49450138 49449974 Y CCDC65,DHH PRKAG1,RHEBL1 NA NA NA NA RHEBL1 11670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 50900445 50901076 50900765 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 3677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 52418719 52418897 52418793 Y NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4103 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80 NA NA NA NA KRT80 5203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 52596076 52596423 52596243 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 12292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr12 52815165 52815335 52815250 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 231381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4B 129602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 53969356 53969561 53969448 Y NA ATF7 NA NA NA NA ATF7 48638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 54012118 54012371 54012242 Y PFDN5 ATF7 NA NA NA NA ATF7 5828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 54698103 54698502 54698288 Y NFE2,NFE2 CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 NA NA NA NA COPZ1 5117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 54700865 54701198 54701063 Y NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPZ1 7879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 54777021 54777369 54777117 Y NA GPR84,ZNF385A,ITGA5 NA NA NA NA ZNF385A 5713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 55350184 55350446 55350287 Y NCKAP1L,KIAA0748,KIAA0748 NA NA NA NA NA PPP1R1A 369741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 55435077 55435406 55435254 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R1A 454634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 56729298 56729459 56729406 Y NA RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2 NA NA NA NA PAN2 3461 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 56876109 56876291 56876201 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 3907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.38307811350007 chr12 57073427 57073817 57073648 Y NA BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 6342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NA NA NA NA NA SHMT2 51635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 57751585 57751906 57751872 Y R3HDM2 NA INHBC IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 70882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 57986482 57986782 57986634 Y R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25 DCTN2,PIP4K2C,ARHGEF25,B4GALNT1 NA NA NA NA PIP4K2C 3525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,TSPAN31,AGAP2 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 58134915 58135263 58135010 Y ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,DDIT3,MBD6,MARCH9,AGAP2 OS9,TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,CYP27B1,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA AGAP2 975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 RP11-620J15.1,RP11-620J15.2 NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA RP11-620J15.2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 59542738 59542911 59542783 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A7 444937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 60943768 60943906 60943837 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A7 955920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 62525889 62526278 62526197 Y MON2,FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 125841 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 62609319 62609899 62609601 Y C12orf61,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 42220 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 62658681 62658957 62658715 Y C12orf61,USP15 USP15,FAM19A2 NA NA NA NA USP15 6562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 62727827 62728150 62727887 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A2 56896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 64574864 64574988 64574911 Y NA C12orf66 NA NA NA NA C12orf66 39088 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 65063507 65064284 65063678 Y C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 61214 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D30 89909 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 66662420 66662780 66662489 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1,HELB NA NA NA NA HELB 31545 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 67361974 67362194 67362149 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 98748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 68761038 68761163 68761116 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 36877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr12 69401246 69401453 69401353 Y RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 37896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 70558769 70558849 70558809 Y NA NA NA NA NA NA CNOT2 75925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 70940880 70941156 70941028 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 81020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 72728711 72729061 72728940 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 62024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 76026406 76026738 76026572 Y NA NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRR1 122990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 76214541 76214932 76214815 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 210780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 77377580 77377874 77377727 Y NA NA ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 E2F7 79486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr12 79759610 79759960 79759786 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 322917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 81271643 81271697 81271669 Y LIN7A NA NA NA NA NA ACSS3 57897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 83269676 83269939 83269806 Y TMTC2 NA NA NA NA NA TMTC2 191017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 89638373 89638597 89638553 Y POC1B,DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,DUSP6 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 106451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 90115396 90115765 90115565 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 14319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 90127113 90127954 90127635 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 26036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 90256648 90256905 90256732 Y POC1B,POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 155571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 91900299 91900534 91900371 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 636815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 91960245 91960524 91960307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 576825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 91972476 91973067 91972734 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 564282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 92415461 92415779 92415694 Y NA NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 121570 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 92464901 92465146 92464998 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 72203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 92501411 92501848 92501769 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 35501 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 92987343 92988147 92987837 Y EEA1,BTG1 NA DCN,LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 332960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 94190374 94190467 94190421 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 121223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 94241673 94241891 94241710 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 172522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 94598751 94598891 94598845 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 58252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 95266728 95267097 95266941 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA12 128449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 98186256 98186389 98186323 Y NA NA NA NA NA NA TMPO 720901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 102283097 102283236 102283152 Y NA DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 13968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 102892301 102892634 102892501 Y NA NA NA NA NA NA NUP37 380399 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH NA NA NA NA NA NUP37 397706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 102930045 102930144 102930098 Y NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 NUP37 418143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 104199621 104199645 104199634 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 33330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 104872178 104872670 104872343 Y HCFC2,EID3,CHST11 CHST11 NA NA NA NA CHST11 25105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 104999582 105000032 104999671 Y TXNRD1,TXNRD1,CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 152509 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 105030278 105030644 105030428 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 183205 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 105066347 105066673 105066397 Y TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 219274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 105101205 105101513 105101338 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 249009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 108699402 108699607 108699511 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA WSCD2 178154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 108761286 108761499 108761386 Y SSH1,CORO1C,SELPLG,SELPLG NA CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 145463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 109010746 109010939 109010889 Y USP30,SSH1,CMKLR1,SELPLG,SELPLG RP11-689B22.2,SELPLG NA NA NA NA RP11-689B22.2 9524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG NA NA NA NA UNG 37197 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 110315331 110315497 110315413 Y MYO1H,GLTP GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 796 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 111028698 111029042 111028796 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 9573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 111043428 111043840 111043517 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1 PPTC7,TCTN1 GPN3,FAM216A,RAD9B,PPTC7,C12orf76,TCTN1,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC IMR90 Hi-C 24141950 TCTN1 5992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 112363158 112363241 112363200 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK5 85376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 116590030 116590409 116590220 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 122734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 116718485 116718754 116718617 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 5342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 117032027 117032578 117032232 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA LINC00173 62800 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 117039313 117039620 117039517 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC00173 70086 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 120179533 120179605 120179597 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 75975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 121634517 121635169 121634888 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 P2RX4 P2RX4 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX4 10491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 23540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 122227826 122228273 122227974 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 11036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr12 123872201 123872612 123872414 Y NA hsa-mir-8072,SBNO1,SETD8,RILPL2 NA NA NA NA SETD8 5881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 123964050 123964332 123964151 Y PITPNM2,RILPL1 RILPL2,SNRNP35 NA NA NA NA SNRNP35 23862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 124486134 124486345 124486231 Y NA ZNF664,CCDC92 NA NA NA NA CCDC92 30756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 124511422 124511512 124511486 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 56044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA CCDC92 419959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr12 124926476 124926613 124926576 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 438601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 338709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125246325 125246717 125246520 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 118497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC,RPL22P19 NA NA NA NA UBC 1042 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125405622 125405939 125405923 Y UBC SCARB1,UBC,RPL22P19 NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 5708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC,RPL22P19 NA NA NA NA RPL22P19 5917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 5636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr12 125479851 125480155 125479863 Y NA DHX37,BRI3BP NA NA NA NA BRI3BP 3605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 126408218 126408496 126408357 Y NA NA NA NA NA NA AACS 860293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA NA NA NA NA NA FBRSL1 159436 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr12 133065143 133065512 133065289 Y NA FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 1006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA GJB2 71493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA GJB2 62937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21241518 21241702 21241584 Y NA NA NA NA NA NA IFT88 102933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21405905 21405971 21405953 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 59808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21632492 21632727 21632640 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 21893563 21893874 21893643 Y NA MIPEPP3 ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEPP3 23285 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 22009901 22010336 22010211 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 21173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 22583629 22583981 22583861 Y EFHA1 NA NA NA NA NA FGF9 340107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.38307811350007 chr13 22688764 22689136 22688963 Y NA NA NA NA NA NA FGF9 445242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 23720936 23721336 23721062 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 14623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA NA MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SACS 127281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 25856268 25856641 25856378 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA MTMR6 3506 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 26084741 26084815 26084778 Y NA NA NA NA NA NA NUPL1 211079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 26118734 26119070 26118902 Y FAM123A,ATP8A2 NA NA NA NA NA NUPL1 245072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr13 28615672 28615941 28615791 Y PAN3 NA NA NA NA NA FLT3 56788 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 28660576 28660679 28660628 Y FLT3 FLT3,PAN3-AS1,PAN3 NA NA NA NA FLT3 12050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 28902249 28902665 28902587 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P3 115599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 28997275 28997445 28997347 Y PAN3,POMP NA NA NA NA NA FLT1 69820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 29024743 29024974 29024943 Y NA FLT1 NA NA NA NA FLT1 42291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 29393233 29393586 29393301 Y MTUS2 NA FLT3,PAN3,PAN3-AS1,FLT1,SLC46A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC46A3 102126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 30808946 30809107 30809021 Y KATNAL1 NA NA NA NA NA PRDX2P1 59177 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 30867525 30867802 30867626 Y KATNAL1 PRDX2P1,KATNAL1 NA NA NA NA PRDX2P1 482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC00426,LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00426 20402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC00426,LINC01058,UBE2L5P KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 31151476 31151709 31151594 Y C13orf26,USPL1 HMGB1,USPL1 TEX26-AS1,LINC00426,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 HMGB1 38025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 31775014 31775311 31775185 Y HSPH1 HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 2941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 32689338 32689467 32689381 Y NA NA NA NA NA NA FRY 85901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 32690357 32690648 32690536 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 86920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 32691995 32692202 32692106 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 88558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr13 34527456 34527530 34527492 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 137270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 36992146 36992544 36992307 Y SPG20,SPG20 SPG20,CCNA1 NA NA NA NA CCNA1 11423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 40272314 40272449 40272352 Y NA COG6 NA NA NA NA COG6 44550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 41558714 41559024 41558959 Y C13orf15,FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA SUGT1P3 64804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 41574237 41574406 41574394 Y FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA WBP4 59004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 41586512 41586699 41586606 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 46711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 41958200 41958754 41958408 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 74859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 42162855 42163294 42163201 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 279514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 42705100 42705257 42705170 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 139032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 DGKZP1 SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 2172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 44620658 44620684 44620670 Y ENOX1 NA NA NA NA NA DGKZP1 80098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 44740455 44740696 44740576 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 199895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 44887042 44887399 44887172 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 261884 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 45941510 45941762 45941695 Y COG3,TPT1 TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30 NA NA NA NA TPT1 28005 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 46736375 46736487 46736423 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 47519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 46744966 46745134 46745049 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 38872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr13 46747616 46748160 46748034 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 35846 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 46750972 46751177 46751169 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 32829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr13 46752144 46752602 46752461 Y C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 31404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 46869807 46870189 46870040 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA LRRC63 85724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 46978118 46978313 46978267 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 KIAA0226L KIAA0226L IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0226L 32012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA NUDT15 130996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 48730170 48730306 48730224 Y RCBTB2,RB1,LPAR6,ITM2B,MED4 POLR2KP2 NA NA NA NA POLR2KP2 23500 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49153192 49153804 49153517 Y FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 ITM2B,RB1 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 47823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49305362 49305702 49305475 Y ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2,FNDC3A CYSLTR2,PSME2P2 NA NA NA NA CYSLTR2 26411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49455753 49455899 49455811 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 92149 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49458465 49458772 49458590 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3A 89276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49615947 49616340 49616144 Y SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 67899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 49688107 49688286 49688182 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 131761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 50216185 50216584 50216280 Y CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 ARL11,EBPL NA NA NA NA ARL11 15750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 51209543 51210059 51209810 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 51288107 51288409 51288197 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 193405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 3335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 51491068 51491415 51491243 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 8220 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 52505834 52506318 52505967 Y NA NA NA NA NA NA ALG11 78216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 53336765 53337066 53336916 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 111921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 58887491 58887889 58887651 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1848232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 60580804 60581154 60581101 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 154967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 60635732 60636010 60635830 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 100111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 71865235 71865608 71865409 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 381591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 71905168 71905271 71905222 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 341928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 73011619 73011852 73011740 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 263979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 73742042 73742346 73742194 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 68919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 76638720 76639058 76638889 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 446150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 76788256 76788273 76788264 Y NA NA KCTD12 IMR90 Hi-C 24141950 LMO7 595686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 77599424 77599520 77599503 Y NA RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3 NA NA NA NA FBXL3 94 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 81048022 81048142 81048082 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 134936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 87776313 87776722 87776395 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4221352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 92940642 92941183 92940919 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 230545 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 93947360 93947697 93947394 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 70265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 94762314 94762622 94762468 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 483889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 95877314 95877344 95877329 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 74343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 96262046 96262201 96262124 Y DZIP1 DZIP1 NA NA NA NA DZIP1 32756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 96424038 96424083 96424061 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 96645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 99874246 99874352 99874282 Y NA UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3 NA NA NA NA H2AFZP3 8234 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 99934075 99934613 99934350 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 23046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 21650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA GPR183 NA NA NA NA GPR183 33863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 100026921 100028247 100027781 Y UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA GPR183 69262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 100154383 100154610 100154487 Y GPR183 TM9SF2 NA NA NA NA TM9SF2 2712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 100760491 100760725 100760608 Y NA PCCA,RPL15P18 NA NA NA NA PCCA 21222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 102691942 102692330 102692296 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 555023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 102784457 102784806 102784790 Y FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 462547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 103205925 103205941 103205933 Y NA TPP2 NA NA NA NA TPP2 41412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 105475297 105475668 105475644 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1742844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 105791770 105791914 105791835 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1426598 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 105792553 105792815 105792695 Y DAOA NA NA NA NA NA ARGLU1 1425697 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 108918601 108918948 108918826 Y TNFSF13B,LIG4,ABHD13 LIG4,ABHD13,TNFSF13B NA NA NA NA TNFSF13B 17013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 110039921 110040112 110039986 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 365503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 110042212 110042565 110042393 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 363050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 110055406 110055637 110055557 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 349978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 110306752 110306910 110306889 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 98705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr13 110443694 110443751 110443735 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 MYO16,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 6779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 110787215 110787446 110787333 Y RAB20 NA NA NA NA NA COL4A2 168713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr13 111172874 111173635 111173314 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 38445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 113393010 113393289 113393150 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 50367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 171523 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 113808289 113808746 113808533 Y NA NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 51806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr13 114124603 114124675 114124639 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 18592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114445132 114445240 114445183 Y RASA3 NA NA NA NA NA GAS6-AS1 71363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114459608 114459701 114459670 Y NA NA NA NA NA NA GAS6-AS1 56902 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114809032 114809271 114809129 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 86815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr13 114832815 114833231 114833102 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 62855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114834440 114834743 114834634 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 61343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr14 20516120 20516206 20516163 Y NA NA NA NA NA NA TTC5 255947 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 20895931 20896136 20896054 Y RNASE3,RNASE6,TEP1,TMEM55B,PNP TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP NA NA NA NA TEP1 16343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE6 NA NA NA NA RNASE6 41403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA RNASE2,METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 21540493 21540634 21540528 Y RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40 ARHGEF40,ZNF219 NA NA NA NA ARHGEF40 4064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 21577986 21578258 21578000 Y NA ARHGEF40,ZNF219 NA NA NA NA ZNF219 7105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 22757693 22757837 22757724 Y NA NA NA NA NA NA TRDJ2 165844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 22896809 22896968 22896893 Y NA TRDJ2 NA NA NA NA TRDJ2 26713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.86976831889145 chr14 22898076 22898384 22898211 Y NA TRDJ2 NA NA NA NA TRDJ2 25297 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 23058743 23059118 23058931 Y REM2 DAD1,ABHD4 NA NA NA NA DAD1 2568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 24712544 24712898 24712739 Y DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2 TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA NA NA NA NA TINF2 2664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 24747075 24747483 24747259 Y DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2 NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA,DHRS1,LTB4R NA NA NA NA RABGGTA 8130 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 34774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 25338694 25338734 25338714 Y NA NA NA NA NA NA STXBP6 178769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 26884947 26885117 26884976 Y NOVA1 NA NA NA NA NA NOVA1 179843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 29533740 29533892 29533834 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 576624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 30318632 30318957 30318868 Y NA NA NA NA NA NA PRKD1 340147 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 31408112 31408404 31408271 Y NA NA NA NA NA NA COCH 66392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 31455672 31455729 31455709 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 36583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 31559968 31560471 31560185 Y SCFD1,GPR33,STRN3 NA NA NA NA NA STRN3 66361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 31698850 31699225 31699035 Y STRN3 HECTD1 AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 23840 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 32472672 32472966 32472819 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 70354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 33106586 33106949 33106623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 154580 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP RPS19P3,SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 35274619 35275001 35274810 Y PPP2R3C,BAZ1A NA NA NA NA NA RP11-73E17.2 66548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 35755529 35755685 35755573 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 9690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 35755957 35756376 35756177 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 10118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 192573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 37445830 37445969 37445900 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 194102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 39890491 39890736 39890687 Y NA FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 8968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 45110347 45110407 45110377 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 254091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 45160440 45160781 45160566 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 203717 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 45714299 45714525 45714379 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 6218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 48030000 48030393 48030347 Y MDGA2,MDGA2 NA NA NA NA NA RPL13AP2 361693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50465888 50466432 50466066 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 108078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA SOS2 167466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 51144322 51144826 51144405 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,NIN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 11273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 41219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 51393835 51393896 51393861 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 15558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 51434779 51434836 51434798 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 25325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 52074354 52074735 52074485 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 216178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52329207 52329783 52329305 Y NA GNG2 NA NA NA NA GNG2 38294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52378269 52378599 52378273 Y NA NA NA NA NA NA C14orf166 75594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52733578 52733826 52733624 Y NA PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 45197 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52778296 52778738 52778457 Y GNG2,PTGER2 PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 285 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 52790756 52791260 52791155 Y NA PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 11733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 55589903 55590059 55589993 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 NA LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 DLGAP5 66337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 57725682 57725794 57725735 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 59002332 59002438 59002384 Y NA NA NA NA NA NA TIMM9 110000 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 59800555 59800809 59800631 Y GPR135 NA NA NA NA NA DAAM1 147191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 60168972 60169358 60169165 Y NA NA NA NA NA NA JKAMP 219811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 61939634 61940081 61939867 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 152098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 61946614 61946719 61946667 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 159078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 181993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 62061169 62061631 62061310 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 98600 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 62070604 62070799 62070701 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 89432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 62298450 62298645 62298529 Y NA COX4I1P1 PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 1363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 62454456 62454478 62454466 Y SYT16 NA SYT16 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 157369 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 65140427 65140812 65140646 Y SYNE2,ZBTB1,PLEKHG3,MAX,CHURC1 PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG3 28008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 65172114 65172865 65172414 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 3294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 65175295 65175757 65175503 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 6475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr14 65293635 65294075 65293719 Y NA NA NA NA NA NA CHURC1 85004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.90113857295661 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 65959136 65959304 65959206 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 83826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 66912712 66912753 66912717 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 59372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 68281633 68281808 68281770 Y PLEK2,ZFYVE26 ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA ZFYVE26 326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68634149 68634509 68634347 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 252404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68831089 68831428 68831316 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 55485 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 68943032 68943562 68943135 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 56119 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 69171999 69172408 69172198 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 88782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69509891 69509993 69509976 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 65734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69510270 69510546 69510495 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 69516483 69516670 69516577 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 72326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69533449 69533600 69533523 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 84267 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69576488 69576915 69576681 Y NA DCAF5 NA NA NA NA DCAF5 40952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69598076 69598493 69598218 Y NA DCAF5 NA NA NA NA DCAF5 19374 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr14 69913588 69913836 69913761 Y NA NA NA NA NA NA ERH 50244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 70803999 70804244 70804143 Y NA COX16 NA NA NA NA COX16 20204 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71158950 71159205 71159125 Y NA NA NA NA NA NA MED6 93566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71348625 71348857 71348689 Y MED6,PCNX PCNX PCNX IMR90 Hi-C 24141950 PCNX 23265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71349940 71350165 71350035 Y MED6,PCNX PCNX NA NA NA NA PCNX 21957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71353477 71353744 71353597 Y MED6,PCNX PCNX MAP3K9 IMR90 Hi-C 24141950 PCNX 18378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 71425019 71425182 71425094 Y NA NA NA NA NA NA PCNX 52897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 11927 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 71865475 71866239 71865922 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA SIPA1L1 80309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 73657191 73657481 73657337 Y NA PAPLN NA NA NA NA PAPLN 44724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 14952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 74210197 74210586 74210513 Y ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 12864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 74220065 74220506 74220203 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 2944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 2246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 75649674 75650038 75649826 Y FOS TMED10 TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMED10 8340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 75688633 75689211 75688968 Y DLST,FOS TMED10,RP11-293M10.2 PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 34903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 75716219 75717010 75716484 Y YLPM1,NEK9,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 TMED10,LOC731223,NEK9,ZC2HC1C,FOS,BATF,JDP2,RPS6KL1,EIF2B2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 7104 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 75741549 75742051 75741730 Y NEK9,JDP2,FLVCR2,BATF,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 LOC731223 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 1426 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 75750758 75751180 75750884 Y PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA FOS 7281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 75765697 75765964 75765861 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 6590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 75768536 75769006 75768683 Y NA RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 9429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 76564687 76564726 76564707 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 117353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 78059840 78060228 78060134 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 20888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 78121399 78121579 78121501 Y NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 40283 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 78129695 78129950 78129826 Y NA SPTLC2,ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 42413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 78144886 78145071 78144891 Y NA ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 27292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 79432037 79432160 79432099 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 725303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 80084258 80084404 80084331 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 1339457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 80241894 80242194 80242045 Y DIO2 NA NA NA NA NA CEP128 1181667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 81533491 81533857 81533699 Y TSHR NA NA NA NA NA RP11-114N19.3 100901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.55893204321752 chr14 81868469 81868528 81868519 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA SEL1L 129677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 88776834 88776938 88776886 Y NA NA NA NA NA NA SPATA7 72330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 89630928 89631154 89631021 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 342431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 89739645 89739700 89739695 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 343793 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 89742753 89743028 89742926 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 340465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 312768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 187276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 89953485 89953641 89953575 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 129852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 90083286 90083622 90083526 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 90465200 90465384 90465297 Y NA EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA TDP1 45917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 90909944 90910315 90910244 Y NA CALM1 CALM1,TTC7B MCF7 ChIA-PET 22265404 CALM1 49098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91071271 91071425 91071348 Y TTC7B,RPS6KA5,CALM1 NA NA NA NA NA TTC7B 209398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91096658 91097052 91096895 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 183771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91269936 91270352 91270297 Y NA TTC7B,CTD-3035D6.2 NA NA NA NA TTC7B 10471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 91393752 91394149 91393951 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3035D6.2 101280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91488828 91489143 91489063 Y NA C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA C14orf159 35534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91528012 91528136 91528074 Y SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 3032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91583338 91583593 91583462 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA5 58358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91696123 91696361 91696283 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 NA NA NA NA NA RPS6KA5 171143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91791698 91791809 91791759 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 90379 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 91871606 91872159 91871897 Y TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 10029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 92942274 92942423 92942327 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 RIN3 IMR90 Hi-C 24141950 RIN3 35695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 93030823 93030949 93030917 Y ATXN3,LGMN NA NA NA NA NA RIN3 52705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 93051108 93051475 93051361 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA RIN3 72990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 93540322 93540650 93540529 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 40015 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 93540905 93541183 93541053 Y MOAP1,KIAA1409,C14orf109,C14orf109,BTBD7,ITPK1 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 39482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 94429127 94429289 94429187 Y SERPINA1 NA NA NA NA NA OTUB2 61386 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 94860948 94861396 94861133 Y SERPINA1 NA SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R4 250483 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95064751 95064770 95064761 Y SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3 NA NA NA NA NA GSC 169792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33663 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95953953 95954283 95953996 Y TCL1A RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 C14orf49,SNHG10,GLRX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1070N10.3 26190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 95961978 95962170 95962099 Y CLMN RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 18303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 95981456 95981771 95981695 Y NA RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 97282222 97282363 97282293 Y NA VRK1 NA NA NA NA VRK1 20581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 98676573 98676976 98676755 Y NA NA CMTM7 MCF7 ChIA-PET 19890323 BCL11B 1058885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 99423594 99423887 99423722 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 311974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 99503090 99503470 99503396 Y CCNK NA NA NA NA NA BCL11B 232391 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 99541568 99541835 99541702 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 194026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 100138998 100139105 100139062 Y HHIPL1 CYP46A1 NA NA NA NA CYP46A1 9536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA EVL EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 EVL 28047 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 100545432 100545867 100545549 Y YY1,EVL NA NA NA NA NA EVL 109646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 NA NA NA NA NA YY1 68980 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 100807709 100808060 100808026 Y WDR25,WDR25,WARS,WARS SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 22905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 101147038 101147458 101147200 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 42584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 102277268 102277494 102277347 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 51133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 102281379 102281594 102281451 Y PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 55244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.18060459456537 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 102836975 102837187 102837062 Y NA CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 9675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 102977207 102977381 102977329 Y AMN ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 3071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 103828242 103828602 103828384 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 EIF5,MARK3 NA NA NA NA MARK3 21127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 103867345 103867626 103867486 Y NA MARK3 NA NA NA NA MARK3 17616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 103884711 103885085 103884989 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 MARK3 NA NA NA NA MARK3 34982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 103929089 103929460 103929098 Y NA NA NA NA NA NA CKB 57988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr14 105290315 105290696 105290451 Y GPR132 AKT1 NA NA NA NA AKT1 30227 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 105527058 105527513 105527190 Y PLD4,GPR132 CDCA4,GPR132 NA NA NA NA GPR132 2269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr14 105536057 105536658 105536303 Y CRIP1,GPR132 GPR132 NA NA NA NA GPR132 6275 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA IGHV1-3 783208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 21914435 21914569 21914482 Y OR4N4 NA NA NA NA NA TUBGCP5 916826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 22897960 22898211 22898128 Y CYFIP1,CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 7955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr15 29266500 29266713 29266607 Y NA NA NA NA NA NA APBA2 138871 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 30128383 30128423 30128398 Y NA NA NA NA NA NA CHRFAM7A 555629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 31215782 31215951 31215851 Y FAN1,FAN1,MTMR10 FAN1 NA NA NA NA FAN1 21727 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 31645647 31645937 31645817 Y NA KLF13 NA NA NA NA KLF13 28589 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 31697812 31698002 31697895 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 80754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 33299476 33299841 33299744 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 394131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 34531616 34532056 34531745 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A6 96205 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 34625973 34627107 34626354 Y NA SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA SLC12A6 1154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 35502627 35502996 35502807 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 86645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 35803904 35804280 35804092 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 214263 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 36547085 36547100 36547092 Y C15orf41 NA NA NA NA NA C15orf41 322712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 139725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 39342673 39342985 39342799 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1,C15orf53,THBS1,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 486897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 39619186 39619513 39619323 Y NA NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 251767 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 40397293 40397725 40397605 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B,PAK6 NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 40601054 40601299 40601247 Y BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2 ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2 PAK6 K562 ChIA-PET 22265404 PLCB2 2918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 40669843 40670190 40669979 Y GPR176,PAK6,DISP2 C15orf52,DISP2,IVD NA NA NA NA DISP2 21407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA NA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 106045 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.38307811350007 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 42723209 42723609 42723409 Y NA NA NA NA NA NA SNAP23 57822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 42786035 42786158 42786098 Y SNAP23 SNAP23 NA NA NA NA SNAP23 4604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 42833928 42834273 42834101 Y NA LRRC57,HAUS2,STARD9 NA NA NA NA LRRC57 4727 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 43757406 43757566 43757505 Y NA TP53BP1 NA NA NA NA TP53BP1 43360 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 44965907 44966042 44965975 Y PATL2 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 12031 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 45002253 45002823 45002529 Y NA SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 578 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 45004703 45005017 45004887 Y CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 45016631 45017046 45016657 Y SPG11,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA TRIM69 2140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 45340934 45341315 45341066 Y SPG11,B2M,SPATA5L1 SORD NA NA NA NA SORD 27632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 48884454 48884907 48884660 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 51139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 49268018 49268116 49268067 Y NA SHC4 NA NA NA NA SHC4 14377 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 49785048 49785439 49785238 Y NA NA NA NA NA NA DTWD1 125738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 50010526 50010792 50010622 Y NA NA C15orf33,GALK2,DTWD1,ATP8B4 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2647E9.1 73651 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 50201915 50201939 50201930 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647E9.1 117472 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr15 50335306 50335619 50335473 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 136774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 50347446 50348347 50347721 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 124046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.62642321619576 chr15 50350203 50350407 50350311 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 121986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 50352002 50352368 50352185 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 120025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 50357050 50357264 50357080 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 115129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 50357587 50357856 50357722 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 114537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 50358473 50358749 50358576 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 113644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr15 50373381 50373578 50373480 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 98815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 50399831 50400157 50400014 Y USP8,GABPB1,ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 72236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr15 50400309 50400464 50400394 Y ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 71929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 50400519 50400943 50400861 Y ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 71450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr15 50408630 50408976 50408933 Y USP8,HDC,GABPB1,ATP8B4 NA NA NA NA NA SLC27A2 63417 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr15 50426655 50427246 50427087 Y USP8,GABPB1 SLC27A2,ATP8B4 ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC27A2 45147 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 50427574 50427814 50427745 Y NA SLC27A2,ATP8B4 ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC27A2 44579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 51872747 51872927 51872852 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 40103 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 51909690 51910017 51909879 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 3013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 51912435 51913121 51913004 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 NA NA NA NA NA DMXL2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 51921191 51921424 51921391 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 51921715 51922068 51922003 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr15 51964465 51964685 51964575 Y MAPK6,DMXL2 NA TMOD2,LYSMD2,DMXL2,SCG3 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL2 51435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 52438848 52438958 52438938 Y NA CTD-2184D3.5,GNB5 NA NA NA NA GNB5 42608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55514036 55514211 55514088 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 26771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55514866 55515077 55514981 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 27601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 55543162 55543346 55543241 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A NA NA NA NA NA RSL24D1 55897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 57946197 57946519 57946360 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 63966 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 58402084 58402260 58402225 Y NA NA ALDH1A2 K562 ChIA-PET 22265404 POLR2M 519853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 59530226 59530327 59530289 Y BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA FAM81A 132565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 59691731 59691910 59691811 Y NA FAM81A,MYO1E MYO1E,LDHAL6B,FAM81A IMR90 Hi-C 24141950 MYO1E 28632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 60547541 60548010 60547775 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2 145072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 62574155 62574333 62574245 Y NA NA NA NA NA NA TLN2 106392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 63738462 63738717 63738588 Y HERC1,RAB8B,USP3 NA CA12,USP3,APH1B,LOC100130855,FBXL22,LACTB,RAB8B,HERC1 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 56076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 63792570 63793348 63792650 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 1445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 64060591 64060833 64060743 Y USP3,HERC1,DAPK2 NA NA NA NA NA HERC1 63308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64889442 64889914 64889565 Y ZNF609 NA NA NA NA NA OAZ2 103566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 NA NA NA NA NA OAZ2 72252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 65174333 65174776 65174649 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 42245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 NA NA NA NA NA PLEKHO2 53563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 66111254 66111589 66111443 Y DPP8,DPP8,DENND4A DENND4A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 28623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 66967847 66967978 66967897 Y NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 24588 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 66971406 66971462 66971434 Y NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 21104 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 67385827 67386130 67385989 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 31726 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RPS24P16 79620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 32338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 67867550 67867820 67867663 Y NA MAP2K5 NA NA NA NA MAP2K5 34503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 68176779 68177152 68176934 Y NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 68265864 68265976 68265920 Y NA NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 78541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 68641532 68641916 68641757 Y NA NA NA NA NA NA FEM1B 73391 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 68852393 68852527 68852460 Y CORO2B NA NA NA NA NA SPESP1 256033 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 69114506 69114876 69114758 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA ANP32A 3270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 70051353 70051726 70051572 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 308230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 70052375 70052953 70052736 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 309252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 70556541 70556924 70556803 Y TLE3 NA LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 168026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 70592913 70593206 70593078 Y NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 204398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 73077755 73078078 73077900 Y ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 1568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 73435699 73435965 73435801 Y NEO1,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 93648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 74683456 74683642 74683549 Y SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 41166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 74695295 74695591 74695423 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 29217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 75073348 75073866 75073498 Y ARID3B,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75075558 75076065 75075775 Y ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 3160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 75081771 75082003 75081872 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 9373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75339281 75339878 75339595 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 25385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75400106 75401427 75400997 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf39 84557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75402190 75402344 75402306 Y PPCDC NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 83640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 75445545 75445830 75445694 Y SIN3A,SIN3A,CSK,C15orf39 C15orf39 PPCDC,C15orf39 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf39 40154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 75939210 75939595 75939262 Y NA SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 76218014 76218024 76218019 Y NA FBXO22 NA NA NA NA FBXO22 23814 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 76455838 76456047 76455943 Y NA NA NA NA NA NA C15orf27 105660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 76901664 76901845 76901842 Y SCAPER NA NA NA NA NA ISL2 274599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 77280831 77281103 77280976 Y PSTPIP1 PSTPIP1 PSTPIP1,TSPAN3,RCN2 IMR90 Hi-C 24141950 PSTPIP1 2597 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 77340153 77340443 77340173 Y PSTPIP1 TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 33883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 80244748 80245013 80244865 Y ST20-MTHFS,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 16775 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 81315785 81316530 81316214 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 24490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 81607386 81607689 81607446 Y MESDC1,IL16,IL16,STARD5 STARD5,RP11-761I4.3 NA NA NA NA STARD5 6835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 83681404 83681605 83681512 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 3011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 83731534 83731663 83731576 Y WHAMM,BTBD1 BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA BTBD1 2443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 83761220 83761490 83761347 Y TM6SF1 BTBD1,TM6SF1 BTBD1,MIR4515 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM6SF1 12669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 196466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 85951204 85951442 85951357 Y AKAP13,PDE8A,AKAP13 AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 29402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 86020857 86021180 86020870 Y KLHL25 NA NA NA NA NA AKAP13 99055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 86126699 86127744 86127307 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 204897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 143317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr15 86267980 86268030 86268003 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68231 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 88553503 88553782 88553643 Y NTRK3 NA NA NA NA NA NTRK3 244217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 89148971 89149164 89149068 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 13363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 89795623 89795958 89795791 Y NA FANCI NA NA NA NA FANCI 10443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90223736 90224077 90223949 Y NA PEX11A NA NA NA NA PEX11A 7937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90547619 90547737 90547660 Y ANPEP,IQGAP1,ZNF710 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 4995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 5294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 90563245 90563669 90563337 Y ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 20621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 31996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr15 90577561 90577868 90577654 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 34937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 90578178 90578635 90578479 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 35554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90578762 90579351 90578884 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 36138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 90602725 90603219 90603002 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 40517 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 91808048 91808189 91808119 Y FES,FES NA NA NA NA NA VPS33B 244215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92400491 92400865 92400640 Y SLCO3A1 SLCO3A1 NA NA NA NA SLCO3A1 5566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92404418 92404854 92404606 Y SLCO3A1 SLCO3A1 NA NA NA NA SLCO3A1 9493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 92409805 92409861 92409833 Y NA SLCO3A1 NA NA NA NA SLCO3A1 14880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92461389 92461789 92461546 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 66464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92481402 92481730 92481524 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 86477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92486330 92486707 92486433 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92490454 92490951 92490737 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 95529 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 92497568 92497970 92497770 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 102643 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 93131436 93131762 93131609 Y RGMA,C15orf32,FAM174B NA NA NA NA NA HMGN1P38 121215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 93779330 93779873 93779589 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 354804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 94739822 94739990 94739899 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 32777 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 94746622 94746847 94746732 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 25920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 94749757 94750344 94749943 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 22423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 95370202 95370491 95370347 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 597435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 96959733 96960000 96959734 Y NA NA LOC145820 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2-AS1 91143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 97037762 97038044 97037995 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2-AS1 169172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr15 98047383 98047776 98047510 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 413008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 98400609 98400736 98400673 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 60048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 98964843 98965105 98964974 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 225095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 99111126 99111513 99111430 Y NA NA IGF1R IMR90 Hi-C 24141950 IGF1R 78687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 99394824 99395158 99395067 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 204624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 99489789 99490246 99490040 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 146174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 99864304 99864757 99864539 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 68467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS17 228628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101265417 101265591 101265495 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-66B24.2 122175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101665058 101665158 101665065 Y CHSY1 RP11-424I19.2 CHSY1,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-424I19.2 41577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101667775 101667985 101667844 Y CHSY1 RP11-424I19.2 CHSY1,SELS,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-424I19.2 38750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101711330 101711507 101711419 Y NA RP11-424I19.2 NA NA NA NA RP11-424I19.2 4595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101723592 101723961 101723926 Y NA RP11-424I19.2 NA NA NA NA RP11-424I19.2 16857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 RP11-424I19.2,CHSY1 NA NA NA NA RP11-424I19.2 34877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr15 101745424 101745566 101745486 Y TM2D3,CHSY1 RP11-424I19.2,CHSY1 NA NA NA NA RP11-424I19.2 38689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 101748030 101748406 101748268 Y TM2D3,CHSY1 RP11-424I19.2,CHSY1 NA NA NA NA RP11-424I19.2 41295 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 37961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 1519780 1519909 1519802 Y SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 3672 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 2175102 2175363 2175212 Y NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2 SNORD60,TRAF7 NA NA NA NA SNORD60 27743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 2407421 2407607 2407514 Y NA ABCA3 NA NA NA NA ABCA3 18674 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 20841 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 3512084 3512361 3512129 Y OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1 ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1 NA NA NA NA NAA60 20473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 4102835 4103049 4102865 Y CORO7 NA NA NA NA NA ADCY9 61137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr16 4713771 4714092 4713866 Y CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1 MGRN1,NUDT16L1 NA NA NA NA NUDT16L1 27603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 6353433 6353832 6353638 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1207624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 6423893 6424234 6424064 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1278084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 7473619 7473766 7473686 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1239774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 10962462 10962962 10962665 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 6093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 10965041 10965252 10965110 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 3803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 10965393 10965955 10965450 Y NA CIITA NA NA NA NA CIITA 3100 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 10982517 10982862 10982662 Y NUBP1,SOCS1,CLEC16A,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 13462 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 11654480 11655021 11654741 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 73216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 11692306 11692793 11692487 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF NA NA NA NA LITAF 35444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 11955170 11955449 11955310 Y NA RSL1D1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 11728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 12088692 12088866 12088774 Y LITAF,LITAF,SNN,TXNDC11,ZC3H7A,RUNDC2A RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 20098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 12541943 12542343 12542144 Y RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 353531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 14621757 14621928 14621847 Y NA NA NA NA NA NA PARN 102657 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr16 17257893 17258025 17257960 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 304713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 17267039 17267537 17267379 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 295201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 17328915 17329184 17329121 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 233554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 17435762 17436100 17436052 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 126638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 17436977 17437203 17437056 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 125535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr16 17453655 17453984 17453792 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 108754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 98914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr16 17474516 17474881 17474733 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 87857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 17476901 17477384 17477246 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 85354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 17494575 17494921 17494771 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 67817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 17499199 17499488 17499485 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 63250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 20271496 20271863 20271666 Y NA NA PDILT IMR90 Hi-C 24141950 ACSM3 347702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 20917792 20918142 20917892 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 DNAH3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D3 8086 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 20922860 20922979 20922921 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 13154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 14693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 21375136 21375337 21375232 Y DNAH3,CRYM,METTL9 NA NA NA NA NA CRYM-AS1 64966 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23516061 23516396 23516252 Y PRKCB,GGA2 GGA2,UBFD1 NA NA NA NA GGA2 14920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 23693851 23693869 23693860 Y NA PALB2,DCTN5,PLK1 NA NA NA NA PLK1 6874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23868974 23869227 23869116 Y NA PRKCB NA NA NA NA PRKCB 23652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23869264 23869516 23869360 Y GGA2 PRKCB NA NA NA NA PRKCB 23942 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23871062 23871733 23871381 Y GGA2,PRKCB PRKCB NA NA NA NA PRKCB 25740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 23962345 23962550 23962469 Y GGA2 NA NA NA NA NA PRKCB 117023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 24077587 24077959 24077773 Y PRKCB NA NA NA NA NA PRKCB 232265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 24879548 24879926 24879737 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 140532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 25774256 25774559 25774449 Y HS3ST4 NA NA NA NA NA HS3ST4 72909 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 25976718 25976856 25976787 Y HS3ST4 NA NA NA NA NA HS3ST4 275371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 26721789 26721801 26721795 Y NA NA C16orf82 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 556314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 27297334 27297620 27297361 Y NA NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 19219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 27417796 27418436 27417849 Y NA IL21R NA NA NA NA IL21R 6313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 28108728 28108802 28108745 Y APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 112439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 29702683 29703007 29702845 Y NA SPN,QPRT NA NA NA NA QPRT 30083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA DCTPP1 10853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 30545067 30545182 30545127 Y ZNF764 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA ZNF747 894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.97338041078275 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 31005740 31006063 31006002 Y ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4 ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 11221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 31139989 31140736 31140371 Y ARMC5,PRR14,FBRS,PHKG2,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,FUS NA NA NA NA PRSS8 4347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM ITGAM NA NA NA NA ITGAM 4033 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr16 31363199 31364642 31363515 Y ARMC5,STX4,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS,PYCARD,ITGAM,ITGAX NA NA NA NA NA ITGAX 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 31880759 31881790 31880862 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 KIAA0664L3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF267 1289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 31888684 31889219 31888998 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 33948799 33949141 33948910 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2065720 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 33971109 33971442 33971126 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2088030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 46792369 46792477 46792422 Y MYLK3 NA MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 ORC6 70814 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 47526942 47527306 47527022 Y PHKB PHKB,ITFG1 NA NA NA NA ITFG1 30882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 48466132 48466242 48466189 Y N4BP1,SIAH1 SIAH1 MIR548AE2,SIAH1,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 14071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 50313130 50313496 50313255 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 35082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr16 50315764 50316400 50316123 Y SNX20,NOD2,CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7 ADCY7 PAPD5,BRD7,ADCY7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCY7 37716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 51909181 51909528 51909355 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 231514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 52854151 52854308 52854232 Y NA NA NA NA NA NA RP11-297L17.6 166935 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 53095278 53095286 53095282 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 8333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 54088509 54088778 54088657 Y NA NA NA NA NA NA RP11-324D17.1 213880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 54114585 54114959 54114772 Y NA NA NA NA NA NA RP11-324D17.1 187699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 54415438 54415695 54415567 Y NA NA NA NA NA NA IRX3 96763 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 54961070 54961275 54961203 Y NA IRX5 NA NA NA NA CRNDE 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 55470004 55470350 55470300 Y NA MMP2 SLC6A2,CES1P1 IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 48392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 55470362 55470729 55470665 Y NA MMP2 SLC6A2,CES1P1 IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 48750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 55471492 55471915 55471743 Y NA MMP2 SLC6A2,CES1P1 IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 49880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 55472998 55473439 55473339 Y NA NA SLC6A2,CES1P1 IMR90 Hi-C 24141950 MMP2 51386 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 55868028 55868350 55868125 Y NA CES1 NA NA NA NA CES1 2779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 56813469 56813757 56813613 Y NA NA MIR138-2 IMR90 Hi-C 24141950 NUP93 51452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 57073128 57073339 57073201 Y FAM192A,NLRC5 NA NA NA NA NA CPNE2 51110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr16 57573031 57573089 57573067 Y GPR114 CCDC102A,GPR114 NA NA NA NA GPR114 1244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 GPR97,CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr16 62230179 62230192 62230186 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 2927823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 66554316 66555209 66554867 Y CMTM1,CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 29238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 66557840 66558108 66558016 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 26339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 66558803 66559094 66558929 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 25353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 CA7,NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr16 67278684 67278969 67278832 Y C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,LRRC29,LRRC29,FHOD1 LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1,PLEKHG4 NA NA NA NA FHOD1 592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 68113537 68113949 68113713 Y SLC7A6OS,RLTPR,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3 NFATC3 NA NA NA NA NFATC3 2705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 68129095 68129275 68129185 Y NA NFATC3 NA NA NA NA NFATC3 12441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA PRMT7 76081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 NA NA NA NA NA ZFP90 256221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA CHTF8 91850 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 CHTF8 30917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr16 70356792 70356812 70356803 Y NA AARS,DDX19B,DDX19A NA NA NA NA DDX19A 21920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 70464772 70465160 70465031 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 5980 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 70530551 70530780 70530688 Y NA FUK,COG4,SF3B3,SNORD111B NA NA NA NA COG4 24688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 70980057 70980287 70980181 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 146993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 237648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.97338041078275 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 238992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 72237360 72237779 72237529 Y AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38 NA HPR,PMFBP1,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 111030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 545548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 73188153 73188327 73188262 Y ZFHX3 NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 1061823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNL4B 1080124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 73422243 73422602 73422423 Y NA NA NA NA NA NA PSMD7 906071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 74539925 74540002 74539964 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 99010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 74672577 74672957 74672890 Y NA GLG1,RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 25822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 74991657 74991945 74991906 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA ZNRF1 38983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 75101005 75101352 75101179 Y NA LDHD NA NA NA NA LDHD 47317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 75483148 75483204 75483176 Y NA CFDP1,TMEM170A,CHST6 NA NA NA NA TMEM170A 14191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 75618166 75618518 75618190 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA GABARAPL2 19917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 77708958 77709175 77709081 Y NA NUDT7 CLEC3A,WWOX,VAT1L IMR90 Hi-C 24141950 NUDT7 45236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 78565966 78565983 78565974 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 434656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 78776344 78776829 78776566 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 645034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 776970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr16 79204818 79205140 79204967 Y MAF NA NA NA NA NA WWOX 1073508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 80697320 80697330 80697325 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 124689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr16 81514966 81515415 81515191 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 38191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 81557764 81558419 81558110 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 80989 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81666319 81666849 81666608 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 103853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr16 81832236 81832757 81832339 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 61534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr16 81850932 81851457 81851113 Y CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 80230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 81865379 81865629 81865509 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 94677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,TAF1C NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 84390991 84391238 84391128 Y OSGIN1,COTL1 NA ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TAF1C 172322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 84676809 84677221 84677048 Y KIAA1609 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 84677292 84677600 84677448 Y NA COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 84726179 84726324 84726251 Y KIAA0513,COTL1 KLHL36,USP10 USP10,KIAA1609,COTL1,KLHL36,CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP10 5260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85569070 85569366 85569223 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 152313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85569816 85569916 85569832 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 151763 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 85603305 85603679 85603564 Y KIAA0182 NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 118000 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr16 85608106 85608214 85608158 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 113465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85617282 85617663 85617577 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 104016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85734545 85734806 85734797 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 12866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85904396 85904814 85904496 Y COX4I1,IRF8 IRF8 IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 25595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 85969764 85970393 85969905 Y COX4I1,IRF8 IRF8 NA NA NA NA IRF8 39355 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr16 86016233 86016516 86016392 Y COX4I1,IRF8 NA COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 85824 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr16 87814047 87814397 87814161 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 16449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 87875229 87875683 87875262 Y CA5A SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 25411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 88536108 88536349 88536245 Y ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 18383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,SNAI3,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.55893204321752 chr16 88860126 88860280 88860179 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 7341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 6.73478597293498 chr16 88866491 88866710 88866640 Y ACSF3,CBFA2T3 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 911 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 88955496 88955935 88955760 Y NA TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA GALNS 34118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA CBFA2T3 TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 CBFA2T3 49455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 89045543 89045751 89045645 Y CBFA2T3 CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 3931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr16 89181535 89182183 89181777 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3 ACSF3 NA NA NA NA ACSF3 28752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 7.66729479995675 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 89601012 89601134 89601078 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68,CPNE7 NA NA NA NA RPL13 23931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 38982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 998903 999111 999033 Y PITPNA,INPP5K,CRK,ABR NA NA NA NA NA TIMM22 100546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1100738 1101160 1100939 Y SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 29155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1459043 1459790 1459643 Y CRK,INPP5K,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA NA NA NA NA PITPNA 4320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1533068 1533815 1533453 Y CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 2888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1626372 1626653 1626476 Y CRK,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA MIR22HG 7904 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1926126 1926449 1926286 Y NA RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA RTN4RL1 190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 1974774 1975359 1974921 Y SCARF1,HIC1,HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 31447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2074761 2075171 2074968 Y NA NA NA NA NA NA SRR 129506 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2614073 2614260 2614119 Y KIAA0664 NA NA NA NA NA RAP1GAP2 64090 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2717801 2718168 2718053 Y MNT,METTL16,RAP1GAP2 RAP1GAP2 NA NA NA NA RAP1GAP2 39451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 2751152 2751369 2751257 Y PAFAH1B1,RAP1GAP2 NA NA NA NA NA RAP1GAP2 72802 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4065011 4065373 4065306 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20549 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4340340 4340644 4340492 Y NA SPNS3 NA NA NA NA SPNS3 5357 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4386875 4387235 4387089 Y NA SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 12898 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4430442 4430571 4430507 Y ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2 SPNS2,MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 26355 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 6614362 6614643 6614518 Y SLC16A13,SLC16A11,ASGR2,ASGR2,ASGR1,SLC13A5 SLC13A5,XAF1 MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100 IMR90 Hi-C 24141950 SLC13A5 243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 6814987 6815378 6815170 Y DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 98290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 6851869 6852198 6852047 Y XAF1,GABARAP,RNASEK NA NA NA NA NA AC027763.2 61470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 7784207 7784538 7784352 Y POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2 KDM6B,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA CHD3 1586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 8321205 8321455 8321300 Y PIK3R5,PER1,VAMP2,C17orf59,CTC1,NDEL1 KRBA2,RPL26,NDEL1 CCDC42,RPL26,RNF222 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDEL1 6756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 8865882 8866269 8866223 Y NA PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 9921805 9922130 9921895 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 237949 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 9953965 9954309 9954075 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 205770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 14508636 14508878 14508796 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA RPS18P12 97973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr17 15895023 15895192 15895111 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 5502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 16191035 16191327 16191109 Y TRPV2 NA CENPV IMR90 Hi-C 24141950 CENPV 63643 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 16319642 16320463 16320033 Y NA UBB,TRPV2 NA NA NA NA TRPV2 2786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 18679 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr17 17208754 17209324 17209000 Y PLD6,COPS3,COPS3,NT5M COPS3,NT5M NA NA NA NA NT5M 4105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 17319893 17320013 17319952 Y FLCN RPL13P12 NA NA NA NA RPL13P12 34567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr17 17725605 17725781 17725666 Y NA SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 12544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr17 18825562 18825708 18825647 Y FAM83G,TRIM16L NA NA NA NA NA FAM83G 80409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 19366628 19366739 19366668 Y ULK2 SLC47A1 ULK2,AKAP10,B9D1,EPN2,SLC47A2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 29959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 20690369 20690534 20690439 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 4411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 21029344 21029732 21029473 Y MAP2K3,MAP2K3,KCNJ18,C17orf103 DHRS7B NA NA NA NA DHRS7B 4667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr17 21187096 21187372 21187243 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 1112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 25680204 25680481 25680340 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr17 25800672 25801019 25800756 Y WSB1,KSR1 KSR1 NA NA NA NA KSR1 19002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 25856308 25856397 25856353 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 74638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 25858035 25858294 25858209 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 76365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 25859435 25859718 25859540 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 77765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr17 26578258 26578420 26578387 Y NA NA NA NA NA NA TMEM97 65701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 27189702 27189769 27189736 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 9746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 27766880 27767142 27766912 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 51200 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 28033249 28033691 28033498 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 85324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 28037853 28038223 28038205 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 89928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 28070496 28070746 28070685 Y SSH2,EFCAB5 NA NA NA NA NA CORO6 122571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 28431711 28432027 28431733 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 8512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 28672650 28672985 28672901 Y NSRP1,CPD,CPD CPD NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 30938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 39038 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 1490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 29641803 29641965 29641879 Y ADAP2,EVI2B,EVI2A EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 2673 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 175492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 30335785 30336145 30335965 Y NA NA NA NA NA NA SUZ12 73748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 31177798 31177958 31177878 Y CDK5R1 MYO1D NA NA NA NA MYO1D 24237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 32569579 32570323 32569761 Y CCL8,CCL7 CCL2 CCL11 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 9981 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 32714202 32714519 32714358 Y CCL2,CCL7,CCL8,CCL1 CCL1 ACCN1,CCT6B,ZNF830,NLE1 IMR90 Hi-C 24141950 CCL1 25952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 33378276 33378529 33378387 Y SLFN5,SLFN12L,ZNF830,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 35809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 33673458 33673662 33673550 Y ZNF830,RFFL,SLFN14,SLFN11,SLFN5 SLFN11 NA NA NA NA SLFN11 25058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA NA NA NA NA NA SLFN11 87988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 34459822 34460202 34459986 Y NA CCL3,CCL4 CCL4,CCL16,CCL14-CCL15,CCL14 IMR90 Hi-C 24141950 CCL4 30839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 36859229 36859333 36859332 Y NA C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 462 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 36907984 36908100 36908042 Y NA MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B NA NA NA NA PSMB3 995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 37323832 37324052 37323944 Y NA RPL19 NA NA NA NA RPL19 30484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 RPL19 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 37749329 37749495 37749400 Y CACNB1,THRA,TCAP STARD3 NA NA NA NA STARD3 41823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 38226807 38227182 38226872 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 38475638 38476939 38476599 Y WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 12194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 38477236 38480096 38479169 Y IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 13792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 38480180 38480741 38480429 Y IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 16736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr17 38494956 38495329 38495143 Y NA RARA NA NA NA NA RARA 31512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 38703564 38704159 38703879 Y SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7 CCR7 NA NA NA NA CCR7 15565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 41242207 41242334 41242271 Y NA BRCA1,NBR2 NA NA NA NA BRCA1 33166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 41428275 41428596 41428403 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 45731 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr17 42425585 42425836 42425708 Y TMUB2,TMUB2,GRN SLC25A39,GRN,FAM171A2,ITGA2B NA NA NA NA GRN 4971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 44268679 44268848 44268762 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 298931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 44271977 44272219 44272147 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 302229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 45021726 45021957 45021796 Y NA GOSR2 NA NA NA NA GOSR2 23243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 45814660 45814782 45814773 Y OSBPL7,MRPL10,TBX21 TBX21 OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46 IMR90 Hi-C 24141950 TBX21 6050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 45983662 45984115 45983847 Y CDK5RAP3 SP2,AC003665.1,PNPO PNPO IMR90 Hi-C 24141950 SP2 12146 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 46043736 46043949 46043771 Y PRR15L AC003665.1,PNPO,CDK5RAP3 NA NA NA NA CDK5RAP3 560 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 46217226 46217562 46217317 Y CDK5RAP3,SKAP1 CBX1,SNX11 NA NA NA NA SNX11 38507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB4,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr17 46664992 46665342 46665097 Y NA HOXB4,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 9519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr17 47467973 47468124 47468044 Y ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 22122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 47468290 47468719 47468487 Y ZNF652,ZNF652 RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 21527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 47816909 47817569 47817208 Y ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 32533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr17 48504874 48504976 48504927 Y NA LRRC59,ACSF2,RSAD1 NA NA NA NA ACSF2 3355 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 49210436 49210615 49210551 Y SPAG9 SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 SPAG9,NME1-NME2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPAG9 14210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 49774236 49774449 49774447 Y CA10,CA10,CA10 NA NA NA NA NA UTP18 438347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 54857525 54857918 54857805 Y NA NA NA NA NA NA DGKE 51542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 54995280 54995673 54995559 Y NA TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 5881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 55456674 55456859 55456690 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 125462 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 55655246 55655454 55655378 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 269963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 55712522 55712748 55712677 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 212669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 56310140 56310517 56310331 Y SUPT4H1 LPO,MKS1,MPO MKS1 K562 ChIA-PET 22265404 MKS1 15174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 56311025 56311130 56311081 Y NA LPO,MKS1,MPO MKS1 K562 ChIA-PET 22265404 MKS1 16059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 56359005 56359460 56359241 Y MPO MPO,BZRAP1,MIR142 NA NA NA NA MPO 2709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr17 56362029 56362418 56362266 Y SRSF1,MPO,BZRAP1 MPO,BZRAP1,MIR142,MIR4736 NA NA NA NA MPO 5733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr17 56410599 56410851 56410735 Y RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 56412418 56413089 56412537 Y SRSF1,MPO,MTMR4,BZRAP1,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.38307811350007 chr17 56417498 56417914 56417645 Y MTMR4,HSF5 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 6115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 57001683 57001915 57001793 Y SEPT4,PPM1E,GDPD1 NA NA NA NA NA PPM1E 170453 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 57046055 57046358 57046140 Y SEPT4 NA NA NA NA NA AC099850.1 135601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 70718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 80172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 57881973 57882438 57882250 Y NA NA NA NA NA NA TUBD1 85866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 NA NA NA NA NA TUBD1 85622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 58468371 58468697 58468395 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 29134 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 58470515 58470600 58470558 Y RNFT1 USP32 NA NA NA NA USP32 27231 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 59232853 59233252 59232919 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 242005 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 60649611 60649792 60649701 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MRC2 52970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 60707692 60707749 60707711 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 4930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 60728042 60728375 60728101 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 25280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 61243701 61244044 61243838 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 277695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 61538235 61538385 61538330 Y NA CYB561,ACE CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYB561 16496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 61748394 61748578 61748486 Y NA LIMD2 NA NA NA NA LIMD2 27954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 61920991 61921115 61921104 Y NA PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P NA NA NA NA SMARCD2 2566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62169387 62169789 62169751 Y MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 ICAM2,C17orf72 IMR90 Hi-C 24141950 ERN1 36390 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62196117 62196293 62196169 Y NA ERN1,SNORD104 ICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 ERN1 9886 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62408874 62409016 62408933 Y ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62409604 62410133 62409977 Y ICAM2,ERN1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 62981858 62982486 62982198 Y DDX5,CEP95,GNA13 AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 12164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 62982515 62982842 62982748 Y DDX5,CEP95,GNA13 AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 12821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 63035715 63036037 63035950 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 14920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 63175905 63176048 63175964 Y RGS9 NA NA NA NA NA GNA13 124948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 64518890 64518971 64518949 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 222136 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 398750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 65254064 65254307 65254144 Y HELZ HELZ,SNORA8 HELZ MCF7 ChIA-PET 22265404 SNORA8 11278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 65418011 65418377 65418257 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 46436 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 65477756 65478333 65478203 Y HELZ,PSMD12 NA NA NA NA NA PITPNC1 106181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 65780558 65780827 65780693 Y NA BPTF BPTF IMR90 Hi-C 24141950 BPTF 38813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 68291356 68291999 68291689 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 128542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 68292093 68292495 68292301 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 129279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 68340579 68340874 68340665 Y KCNJ2 NA NA NA NA NA KCNJ2 177765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70167914 70168310 70168112 Y NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32P33 453060 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70245372 70245384 70245378 Y NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32P33 375986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 43063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 70706379 70706638 70706553 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 85009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70779461 70779663 70779556 Y CPSF4L NA NA NA NA NA RPL32P33 158091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70878609 70878955 70878782 Y CPSF4L NA NA NA NA NA SLC39A11 207896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 70892078 70892260 70892135 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 194591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 71024945 71025268 71025108 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 61583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 71064440 71064923 71064668 Y CPSF4L SLC39A11 NA NA NA NA SLC39A11 21928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 71139042 71139706 71139380 Y NA SSTR2,COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SSTR2 19445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 71476918 71477129 71477067 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 161099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 71496173 71496542 71496358 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 141686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 71603632 71603970 71603800 Y NA SDK2 NA NA NA NA SDK2 34258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 72247418 72247796 72247504 Y NA RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2 NA NA NA NA TTYH2 39765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 72458870 72459093 72458877 Y TMEM104,SLC9A3R1,RAB37,RAB37,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A GPRC5C,CD300A NA NA NA NA CD300A 1462 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 72627955 72628575 72628190 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF RAB37 GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 RAB37 36142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 72734256 72734824 72734605 Y DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37 CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 7967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 72776079 72776526 72776246 Y CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 5457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 73291742 73292218 73291951 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA SLC25A19 8151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 73319762 73319905 73319788 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 6352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA GALR2,EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 74213607 74213973 74213891 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 6914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 74233896 74234348 74234226 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 74836829 74837207 74837140 Y UBE2O,MGAT5B MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 25331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 75086431 75086552 75086490 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 5633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 237797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 39759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 12.122614751283 chr17 75955923 75956319 75956134 Y TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 41743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76125814 76126042 76125869 Y TNRC6C,PGS1,TMC6,TMC8,TMC6 TMC8,TMC6,SYNGR2 NA NA NA NA TMC6 446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 76320464 76321292 76320695 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 NA NA NA NA SOCS3 32866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr17 76325206 76325964 76325662 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 28194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 76379911 76380778 76380428 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 7190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76384421 76384943 76384751 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 11700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76595465 76595710 76595593 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1,PGS1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 180669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.83364739997837 chr17 77778301 77778701 77778443 Y CBX2,CBX8,CBX4 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.73003530808707 chr17 77990350 77990422 77990386 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 17225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr17 78431372 78431666 78431608 Y GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11 ENDOV NA NA NA NA ENDOV 44407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 78512968 78513399 78513135 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPL32P31 604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 78552032 78552241 78552117 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 35413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr17 78793273 78793673 78793356 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 169725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79046413 79046604 79046526 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 39465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79302293 79302557 79302318 Y NA SLC38A10 NA NA NA NA TMEM105 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 13779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 15311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 17338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA TMEM105 57934 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 79363961 79364269 79364114 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 61487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 68280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr17 79450324 79450444 79450386 Y NA RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 27645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 79789691 79790066 79789800 Y NA FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 513 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr17 79886802 79887109 79886903 Y NA ANAPC11,ALYREF,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1 NA NA NA NA MAFG-AS1 3097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr17 80104775 80104822 80104796 Y NA NA NA NA NA NA FASN 50567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 80494129 80494268 80494139 Y NA FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 18540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF NA NA NA NA NA TBCD 109423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr17 80845276 80845458 80845382 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 137336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr17 81012071 81012294 81012223 Y NA B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA B3GNTL1 4385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr17 81147237 81149188 81147763 Y METRNL NA METRNL,B3GNTL1,TBCD MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 111670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr17 81150899 81151424 81151082 Y METRNL NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 115332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 323417 323617 323527 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 57367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 2549022 2549121 2549072 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 20387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 2653655 2653795 2653729 Y NA CBX3P2 NA NA NA NA SMCHD1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 2845344 2845539 2845389 Y EMILIN2 EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 316 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 2848392 2848824 2848619 Y EMILIN2 EMILIN2 LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 EMILIN2 3364 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 2851086 2851429 2851256 Y EMILIN2 EMILIN2 LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 EMILIN2 6058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 2854165 2854304 2854234 Y NA EMILIN2 LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 EMILIN2 9137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3177957 3178349 3178175 Y EMILIN2,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA MYL12A 67130 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 3179850 3179998 3179924 Y EMILIN2,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA MYL12A 65481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3305401 3305555 3305478 Y MYL12B,TGIF1 MYL12B DLGAP1,TGIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 45494 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 3741003 3741403 3741194 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 331397 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 4355972 4356212 4356102 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 946366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 5463205 5463732 5463541 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 164967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 5475227 5475629 5475415 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 153070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 5542461 5543034 5542604 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 85665 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 5629750 5630120 5629929 Y NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 1051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 6355893 6356010 6355962 Y ARHGAP28,L3MBTL4 NA NA NA NA NA L3MBTL4 57226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 7273554 7273981 7273852 Y NA SNORA48 PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 SNORA48 25170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9082770 9083125 9082859 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2 ANKRD12,RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,PPP4R1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 17503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9755700 9755941 9755783 Y RAB31 RAB31 TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 49538 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9762577 9762794 9762699 Y RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 56415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9772005 9772203 9772065 Y VAPA,RAB31 NA NA NA NA NA RAB31 65843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9899069 9899359 9899167 Y NA VAPA NA NA NA NA VAPA 12640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 10544333 10544521 10544427 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 20431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 10852460 10852708 10852534 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 328558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 13281490 13281817 13281654 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 292129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 13566903 13567274 13567096 Y RNMT,C18orf19,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 157385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 19279600 19279639 19279620 Y NA ABHD3,MIB1 NA NA NA NA ABHD3 3127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 20811230 20811702 20811444 Y NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8 NA NA NA NA NA CABLES1 98702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 22859742 22859981 22859862 Y NA NA NA NA NA NA SS18 809200 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 29080100 29080413 29080257 Y NA DSG2 NA NA NA NA DSG2 4094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 29665661 29665831 29665728 Y NA RNF138 NA NA NA NA RNF138 3987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 31336306 31336396 31336375 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 1218496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32289089 32289403 32289194 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 265489 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32300943 32301117 32301030 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 253775 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32399644 32399985 32399810 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 154907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32414940 32415436 32415021 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 139456 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32439346 32439714 32439476 Y ZNF397,ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 115178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32643962 32643991 32643977 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 89070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 34406593 34406898 34406790 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 34532943 34533308 34533124 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 125785 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 35230475 35230627 35230551 Y CELF4 NA NA NA NA NA TPGS2 823317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 36903724 36904130 36903931 Y NA RPL7AP66 NA NA NA NA RPL7AP66 9509 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 38446239 38446490 38446414 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1086681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 42686338 42686675 42686545 Y NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 858565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr18 43266827 43267110 43266932 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 278130 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 237620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 43381768 43381900 43381886 Y NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPG5 163340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA RNF165 73895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 102317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 44394118 44394485 44394384 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 100970 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 44487034 44487390 44487355 Y NA KATNAL2,PIAS2 NA NA NA NA KATNAL2 8065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 45479794 45480168 45480059 Y SMAD2,SMAD2 SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 24279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 46130104 46130567 46130233 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 66687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46297484 46297823 46297654 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 177258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46307580 46307886 46307760 Y SMAD7 NA NA NA NA NA SMAD7 167195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46345038 46345364 46345209 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 129717 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 125048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46395153 46395782 46395694 Y SMAD7 NA NA NA NA NA SMAD7 79299 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46423062 46423579 46423314 Y SMAD7 NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 51502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46428346 46428737 46428479 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 46344 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr18 46582084 46582553 46582428 Y SMAD7,DYM NA NA NA NA NA SMAD7 107003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46598750 46599196 46598974 Y DYM NA NA NA NA NA SMAD7 123669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 47357197 47357543 47357370 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 18867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 48737977 48738244 48738154 Y ME2 MEX3C MEX3C K562 ChIA-PET 22265404 MEX3C 4430 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 53072982 53073437 53073370 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 256581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 54140840 54141163 54141035 Y NA NA TCF4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR7 175411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 55881305 55881780 55881408 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 384083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 56096279 56096485 56096382 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 169378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 NA NA NA NA NA MALT1 201305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 56672148 56672229 56672220 Y NA NA NA NA NA NA SEC11C 132480 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 57552932 57553277 57553219 Y PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 K562 ChIA-PET 22265404 PMAIP1 11903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 57572110 57572452 57572282 Y PMAIP1 PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 6930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60118389 60118639 60118544 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 69601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60173605 60173906 60173662 Y KIAA1468,ZCCHC2 ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 14334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr18 60456322 60456424 60456373 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 75650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60544702 60545081 60544795 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 164030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60767363 60767723 60767547 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 217638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 60805787 60806310 60806122 Y VPS4B,SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 179051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60827006 60827299 60827155 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 158062 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60857192 60857346 60857314 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 128015 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60864454 60864795 60864596 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 120566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60873001 60873358 60873117 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 112003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60941193 60941490 60941349 Y BCL2 BCL2 NA NA NA NA BCL2 43871 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60966877 60967061 60966974 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 18300 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60973604 60973976 60973940 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 11385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 60984165 60984609 60984519 Y BCL2 BCL2,KDSR NA NA NA NA BCL2 752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 61642248 61642613 61642430 Y NA HMSD,SERPINB8 NA NA NA NA SERPINB8 7089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 65434285 65434424 65434346 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 252068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 66366333 66366541 66366437 Y NA CCDC102B,TMX3 NA NA NA NA CCDC102B 13905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 66759442 66759620 66759531 Y NA NA NA NA NA NA TMX3 378907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 66808041 66808227 66808134 Y CCDC102B,DOK6 NA NA NA NA NA TMX3 427506 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 67862254 67862313 67862284 Y NA RTTN NA NA NA NA RTTN 8868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 68339860 68340193 68340064 Y RTTN NA NA NA NA NA SOCS6 385723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 72258105 72258532 72258201 Y CNDP2,ZNF407 ZNF407 NA NA NA NA ZNF407 4574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 72501282 72501640 72501447 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 238176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 72695045 72695604 72695384 Y NA NA NA NA NA NA ZADH2 223699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr18 72919000 72919372 72919172 Y NA TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 72919537 72919929 72919697 Y ZADH2 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 234 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74179507 74179930 74179654 Y ZNF516 ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 25216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74230733 74230810 74230772 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 ZNF516,LOC284276 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-17M16.1 25256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74276166 74276377 74276252 Y ZNF516 NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 70689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr18 74277589 74278024 74277906 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 72112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr18 74285559 74285989 74285816 Y ZNF516 NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 80082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74732491 74732837 74732665 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 199928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 235028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74773141 74773504 74773389 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 240578 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 74775208 74775557 74775363 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 242645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 74818309 74818676 74818510 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 285746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74829789 74830209 74830033 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr18 74837664 74837983 74837939 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 305101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 74840150 74840705 74840388 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 307587 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 74921028 74921148 74921053 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 388465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr18 77165685 77166189 77165921 Y ATP9B,CTDP1,CTDP1,NFATC1,NFATC1 NFATC1 NA NA NA NA NFATC1 11829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 77276635 77277001 77276820 Y ATP9B,NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 122779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 77385208 77385599 77385374 Y PQLC1,ADNP2,NFATC1,NFATC1,CTDP1 NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 52202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr18 77442917 77443176 77442992 Y PQLC1,ADNP2,NFATC1,CTDP1,CTDP1 CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 5116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 77551694 77552094 77551810 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 113893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr18 77552344 77552827 77552464 Y NA NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 114543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2 NA NA NA NA MIER2 33 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA SHC2 22677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 16632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 678997 679265 679214 Y HCN2,PALM POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM NA NA NA NA FSTL3 4605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1,PRTN3,ELANE,CFD NA NA NA NA AZU1 560 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 15.5418137836961 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 PRTN3,ELANE,CFD,MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr19 1856794 1856864 1856840 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 1857160 1857480 1857446 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 1895445 1895653 1895520 Y OAZ1,DOT1L,CSNK1G2 REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 BTBD2,CSNK1G2,KLF16 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCAMP4 7560 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 1942586 1943099 1942836 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 2162744 2162943 2162860 Y CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr19 2167436 2167667 2167594 Y CSNK1G2,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 4972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 2394369 2394570 2394516 Y NA TIMM13 NA NA NA NA TIMM13 31322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 2888802 2889178 2888846 Y NA ZNF555,ZNF57 NA NA NA NA ZNF57 9718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 2950130 2950295 2950189 Y NA ZNF77,TLE6 THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF77 7161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr19 3133345 3133760 3133513 Y FZR1,GNA15 GNA11,GNA15,S1PR4,NCLN NA NA NA NA GNA15 431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 3344211 3344472 3344340 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC NFIC NFIC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 NFIC 13089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 3552794 3553085 3553017 Y GNA15,C19orf28 FZR1,HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 17690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 3683675 3684043 3683874 Y NA PIP5K1C,TJP3 NA NA NA NA PIP5K1C 14434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4052414 4052757 4052628 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12186 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4061996 4062359 4062178 Y NA ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4541647 4541771 4541674 Y ZBTB7A,CCDC94,TICAM1,KDM4B,SEMA6B LRG1,SEMA6B NA NA NA NA LRG1 3161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4568924 4569300 4569153 Y TICAM1,KDM4B,SEMA6B LRG1,SEMA6B NA NA NA NA SEMA6B 11104 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 4677231 4677531 4677381 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9 NA NA NA NA C19orf10 8849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 5139337 5139604 5139434 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P34 136141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 5287522 5287818 5287647 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 11777 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 5968660 5968756 5968716 Y PSPN,SLC25A41,TMEM146,PRR22,NRTN,RFX2,ACSBG2 RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7397 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.38307811350007 chr19 6067299 6067617 6067410 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 91146 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6087956 6088249 6088075 Y PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2 NA RANBP3,LOC100128568 IMR90 Hi-C 24141950 RFX2 109334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6108691 6108922 6108748 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6518032 6518368 6518308 Y RFX2,CD70,TNFSF9 DENND1C,TUBB4A,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 10642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 6579838 6580006 6579922 Y NA CD70 NA NA NA NA CD70 22108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6674780 6675150 6675080 Y DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 TNFSF14 NA NA NA NA TNFSF14 6181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 VAV1 NA NA NA NA VAV1 31722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 7266028 7266415 7266222 Y NA INSR NA NA NA NA INSR 25630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7402747 7403030 7402887 Y FCER2 NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 54969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7440359 7440731 7440482 Y NA ARHGEF18 INSR,ARHGEF18 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 17268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7445572 7445841 7445694 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 12158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7456481 7456588 7456536 Y LRRC8E,ARHGEF18 ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 1411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 7701239 7701460 7701364 Y NA CAMSAP3,XAB2,STXBP2,RETN,C19orf59,TRAPPC5 NA NA NA NA STXBP2 1472 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 RETN,C19orf59,TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 46913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM,PRAM1 NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8580278 8580518 8580443 Y PRAM1,MYO1F PRAM1,ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 3230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 8582725 8583114 8583112 Y NA PRAM1,ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 5677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8605873 8606246 8606065 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F PRAM1,ZNF414,MYO1F NA NA NA NA ZNF414 28825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8607140 8607451 8607227 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F PRAM1,ZNF414,MYO1F NA NA NA NA ZNF414 30092 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8632767 8632960 8632806 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 7501 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8634080 8634404 8634151 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 6057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8635978 8636196 8636014 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 4265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 8638437 8638868 8638608 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 1593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8640627 8640983 8640707 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 8749433 8750038 8749788 Y PRAM1,MYO1F NA NA NA NA NA ADAMTS10 75813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 28141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA RPS4XP22 NA NA NA NA RPS4XP22 8773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 9937602 9937876 9937738 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA UBL5 1034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 10535896 10536533 10536178 Y C19orf66,ICAM1,ICAM3,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 23682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 10862011 10862152 10862080 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 DNM2 NA NA NA NA DNM2 35256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,C19orf38,CARM1 NA NA NA NA C19orf38 4006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 11878639 11879058 11878901 Y NA ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440 NA NA NA NA ZNF441 2824 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 12957682 12957886 12957783 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,HOOK2,DNASE2,GCDH NA NA NA NA MAST1 14917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13048278 13048689 13048364 Y MAN2B1 GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA CALR 886 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13138013 13138252 13138133 Y TNPO2,TNPO2,MAST1,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 33591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13140737 13141121 13140967 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 36315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 13975574 13976059 13975671 Y CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 38955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14097142 14097697 14097482 Y CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA DCAF15,RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 18154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr19 14126359 14126500 14126444 Y NANOS3,IL27RA RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 10508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14190971 14191218 14191036 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97 EEF1DP1,SAMD1,PRKACA NA NA NA NA SAMD1 8630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 14276845 14277176 14277145 Y NA PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 31077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 14485924 14486626 14486057 Y NA CD97,DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 2687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 14661096 14661426 14661346 Y NA TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 19448 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14724948 14725249 14725079 Y PRKACA,CD97,PKN1,ZNF333,EMR3 NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 44074 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 17442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F8 223588 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 16229373 16229857 16229589 Y NA RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 8934 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 16230487 16230565 16230516 Y TPM4 RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 10048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 16251738 16251778 16251758 Y NA RAB8A,HSH2D,FAM32A NA NA NA NA HSH2D 8900 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 16279649 16279838 16279744 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 HSH2D,FAM32A,AP1M1 NA NA NA NA FAM32A 14353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 16394356 16394632 16394513 Y NWD1,KLF2 KLF2 EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 38996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 16442138 16442160 16442149 Y NA KLF2 NA NA NA NA KLF2 8510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 16453203 16453340 16453316 Y NWD1,MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 16557779 16558043 16557912 Y RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1 EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 22853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 16779311 16779659 16779460 Y NA MED26,TMEM38A NA NA NA NA TMEM38A 9373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 17220741 17221250 17221017 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 36150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 MAP1S NA NA NA NA MAP1S 36681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 17961350 17961505 17961471 Y FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3 JAK3,RPL18A PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2 IMR90 Hi-C 24141950 JAK3 4470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.00475066484791 chr19 18134654 18135106 18134872 Y MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1 NA NA NA NA NA MAST3 71497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 LRRC25,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 LRRC25,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 LRRC25,SSBP4 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 18625662 18626077 18625893 Y UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL ELL,FKBP8,KXD1 NA NA NA NA ELL 4860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 18793678 18793914 18793817 Y PDE4C KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 1191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 19027750 19028071 19027900 Y MAU2 GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3 NA NA NA NA COPE 135 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 19078398 19078892 19078760 Y ELL,GATAD2A,HOMER3 DDX49,HOMER3 NA NA NA NA HOMER3 28328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 19083211 19083621 19083297 Y ELL,RFXANK,MAU2,GATAD2A,HOMER3,HOMER3,HOMER3,HOMER3 HOMER3 NA NA NA NA HOMER3 33141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 19573019 19573301 19573248 Y MAU2,GATAD2A,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 51244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 21678211 21678382 21678297 Y ZNF430,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 727 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 23855421 23855665 23855541 Y NA ZNF675 NA NA NA NA ZNF675 12357 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 27739791 27740195 27739990 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1962253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 28219787 28220540 28220091 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1481908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 28241688 28242434 28242171 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1460014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 28270762 28271411 28271062 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1431037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 28508249 28508335 28508293 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1194113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 29109267 29109431 29109349 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 593017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 33740333 33740640 33740371 Y NA SLC7A10 CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A10 25577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr19 33750621 33750673 33750623 Y CEBPA SLC7A10,CEBPA CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A10 35865 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 33758042 33758138 33758096 Y CEBPA SLC7A10,CEBPA LOC80054,CEBPA,PEPD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPA 33332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr19 33759449 33759718 33759650 Y CEBPA SLC7A10,CEBPA CEBPA,LOC80054,PEPD,CEBPG,CHST8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEBPA 31752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 33764887 33765213 33765153 Y CEBPG,CEBPA CEBPA CEBPA,LOC80054,CHST8,PEPD MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEBPA 26257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 33784292 33784447 33784359 Y CEBPG,CEBPA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 7023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 33789888 33790286 33790087 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 1184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr19 35557782 35557965 35557875 Y MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4 NA NA NA NA NA GRAMD1A 74094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 35763394 35763606 35763496 Y U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2 LSR,USF2 NA NA NA NA USF2 5513 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 36100762 36101128 36100979 Y FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,CD22,FFAR1,ZBTB32,U2AF1L4,NFKBID,IGFLR1,HCST HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 HAUS5 K562 ChIA-PET 22265404 HAUS5 518 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 36274503 36274656 36274589 Y GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33 NA NA NA NA ARHGAP33 11069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62 NA NA NA NA ALKBH6 16199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 37894729 37894877 37894831 Y NA ZNF527 NA NA NA NA ZNF527 34766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 37942009 37942313 37942161 Y ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569 ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 14174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 38539064 38539251 38539168 Y ZNF571 NA NA NA NA NA SIPA1L3 143196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 38539760 38540070 38539905 Y RASGRP4,ZNF571 NA NA NA NA NA SIPA1L3 143892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 MAP4K1,EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 39627416 39627544 39627474 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 13006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 39755176 39755398 39755266 Y ZFP36 NA NA NA NA NA GMFG 75614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40229628 40229757 40229693 Y CLC CLC NA NA NA NA CLC 2960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40466097 40466407 40466254 Y ZNF546,FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA PSMC4 8505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40751869 40752087 40752041 Y NA AKT2 NA NA NA NA AKT2 37356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,C19orf47 NA NA NA NA C19orf47 28888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 40969437 40969789 40969613 Y BLVRB SERTAD1,SERTAD3 NA NA NA NA BLVRB 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41254580 41254859 41254762 Y SHKBP1,ADCK4 ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA SNRPA 38 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41816681 41817091 41817051 Y NA CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 2587 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM4 93129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 42289644 42289819 42289732 Y NA CEACAM6 NA NA NA NA CEACAM6 36759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,CD79A,ARHGEF1 NA NA NA NA CD79A 385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 42913594 42913985 42913852 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 85833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 42924318 42924497 42924408 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 96557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 44257292 44257551 44257463 Y NA SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 44781587 44781871 44781729 Y ZNF404,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZFP112,ZNF233,ZNF233,ZNF235 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 25328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45953262 45953678 45953446 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 15575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 163936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,PTGIR NA NA NA NA PTGIR 15820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS1 61844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 47814150 47814595 47814332 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,C5AR1,DHX34 NA NA NA NA C5AR1 22870 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 47950200 47950556 47950503 Y SLC8A2 KPTN NA NA NA NA KPTN 34969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 48629286 48629473 48629353 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 17212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 49836983 49837445 49837293 Y SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37 CD37,CTC-301O7.4,DKKL1 NA NA NA NA CD37 555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 50860908 50861268 50861186 Y PNKP,VRK3,NR1H2 NR1H2,KCNC3,NAPSB,POLD1 NA NA NA NA NAPSB 14884 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,NAPSB,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr19 51111018 51111676 51111369 Y NA LRRC4B,C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 39026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 51224129 51224276 51224235 Y C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA CLEC11A 310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 51898753 51899047 51898851 Y SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1 ETFB,NKG7,SIGLEC10 NA NA NA NA SIGLEC10 20010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 51972517 51972837 51972747 Y NA SIGLEC12 NA NA NA NA SIGLEC12 30206 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 52068853 52069119 52068985 Y SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175 SIGLEC6,ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 3432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 52302339 52303044 52302768 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR2,FPR1 NA NA NA NA FPR1 2319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NLRP12,MYADM NA NA NA NA MYADM 6258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 54885175 54886148 54885583 Y VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1,TTYH1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 5010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 54886806 54887123 54887067 Y VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1,TTYH1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 6641 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr19 54889557 54890145 54890010 Y NA LAIR1,TTYH1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 9392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 55370952 55371292 55371014 Y TMEM150B,PPP1R12C,LAIR1,LENG8,LAIR2,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,KIR3DL3,KIR2DS4,FCAR FCAR NA NA NA NA FCAR 12412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 55387041 55387235 55387157 Y TMEM150B,PPP6R1,PPP1R12C,LENG8,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR FCAR NA NA NA NA FCAR 3337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 55540419 55540558 55540460 Y SHISA7,KIR2DL3,NCR1 RDH13 NA NA NA NA RDH13 40101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14 NA NA NA NA NAT14 36839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 87982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 56795373 56795512 56795477 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 81956 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 56831287 56831644 56831534 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 45824 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 56833034 56833496 56833435 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 43972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr19 56835887 56836393 56836023 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NLRP5,ZNF787 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF542 41075 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr19 58317986 58318160 58318072 Y NA ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 6121 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF814,ZNF417 NA NA NA NA ZNF814 384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 1715466 1715652 1715559 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 30972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 6995226 6995443 6995338 Y NA RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 8494 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 6998422 6998819 6998665 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 5118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 8369680 8369964 8369925 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 351958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 8372169 8372224 8372194 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 349698 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 8439017 8439275 8439185 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 282647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 8676767 8677094 8676914 Y NA AC011747.4 LOC100506274,LINC00299,ID2,LOC339788 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 44828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 8686801 8687006 8686925 Y ID2 AC011747.4 LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.4 34916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 10471190 10471549 10471320 Y HPCAL1,HPCAL1 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 30175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 10540655 10540950 10540779 Y KLF11,KLF11,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 45680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 12835431 12835800 12835719 Y NA TRIB2 MIR4262,LPIN1,TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 19215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 12959326 12959589 12959403 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 104311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 14851119 14851133 14851127 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 80309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 15570627 15571117 15570982 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 128337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 15594564 15594826 15594695 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 104628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 16609809 16610016 16609913 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 235583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 16807698 16808010 16807940 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 37589 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 19562818 19563058 19562929 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 6404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 20386283 20386578 20386422 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 36616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 20624612 20624982 20624777 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 20706791 20707147 20707052 Y HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 61956 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 20795362 20795521 20795453 Y HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 53328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 24495048 24495317 24495183 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 60064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 24535588 24535972 24535848 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA RPL36AP13 19409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NCOA1 CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 25508945 25509154 25508991 Y DNAJC27,DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 54305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 26225947 26226220 26226028 Y RAB10 KIF3C,RAB10 RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 22329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28179877 28180142 28179961 Y FOSL2,RBKS,BRE,BRE NA NA NA NA NA RBKS 67912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28181257 28181638 28181448 Y C2orf16 NA NA NA NA NA RBKS 69292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28582195 28582710 28582283 Y NA FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA FOSL2 30605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 28583371 28583537 28583468 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29778 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28583784 28584228 28583975 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28589661 28589896 28589794 Y FOSL2 FOSL2,AC104695.3 BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSL2 23419 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 28686781 28687104 28687013 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 PLB1 BRE,RBKS,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLB1 8769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 28823106 28823354 28823205 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA PLB1 145094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 29223437 29223646 29223521 Y NA NA C2orf71 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP4 94925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 29751731 29752252 29752234 Y ALK NA NA NA NA NA CLIP4 433160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 36189102 36189392 36189167 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 391677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37308622 37308977 37308800 Y NA HEATR5B NA NA NA NA HEATR5B 508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 37851755 37851898 37851787 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 111713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37864248 37864629 37864487 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 98982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 37868257 37868517 37868387 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 95094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 37995727 37996117 37995888 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 32116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 38315585 38315885 38315608 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYP1B1 19159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 38405386 38405542 38405477 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 51168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 38599092 38599284 38599189 Y FAM82A1 ATL2 NA NA NA NA ATL2 3143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 39340813 39341200 39341198 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 8286 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 40264573 40264733 40264653 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 260166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 40506084 40506414 40506221 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 329779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 40509736 40509978 40509875 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 326215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 40677210 40677858 40677371 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 158335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 41736624 41736708 41736667 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 536452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 42157961 42158315 42158139 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 114845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43020336 43020977 43020619 Y HAAO HAAO NA NA NA NA HAAO 2603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 43186488 43186945 43186694 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 168755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43241761 43242055 43241896 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 209693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 43245528 43245689 43245593 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 206059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43336478 43336881 43336648 Y OXER1 NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 114867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43354941 43355119 43354996 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 96629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 43355395 43355512 43355444 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 96236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43359752 43360119 43360054 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 91629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 43437815 43438151 43437904 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 13597 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43440136 43440508 43440361 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 11240 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 43560766 43560944 43560854 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 109018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 43567873 43568259 43568066 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 116125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 43818575 43818651 43818610 Y NA THADA,PLEKHH2 NA NA NA NA THADA 2534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 44007303 44007575 44007439 Y NA DYNC2LI1 NA NA NA NA DYNC2LI1 8125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 45870946 45871356 45871039 Y NA SRBD1,PRKCE PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCE 5128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 46554101 46554217 46554159 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 35295 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 46993562 46993962 46993767 Y NA NA NA NA NA NA SOCS5 69471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47197841 47198107 47197954 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 30847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47210404 47210621 47210509 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 43410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47298687 47298930 47298712 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47299215 47299677 47299496 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 47569796 47569847 47569822 Y NA EPCAM EPCAM,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 EPCAM 450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 48718676 48719233 48718981 Y NA STON1 NA NA NA NA STON1 35289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 50267276 50267578 50267576 Y NA NA NA NA NA NA STON1 1512754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 50631357 50631742 50631589 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 1876835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 54285444 54285567 54285472 Y NA NA SPTBN1,EML6,PSME4 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 89467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 54845847 54845943 54845895 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 164425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 55346891 55347057 55346962 Y NA RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 9134 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA EFEMP1 NA NA NA NA EFEMP1 36481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 57657043 57657316 57657246 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 475470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 58347874 58348075 58347917 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 118432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60327078 60327537 60327382 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 282203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr2 60333178 60333514 60333308 Y BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 276226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60693527 60693793 60693660 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 83787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 60694019 60694324 60694172 Y BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 84279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 60696747 60696946 60696847 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 81756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60742807 60743148 60742962 Y REL BCL11A NA NA NA NA BCL11A 35554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60756305 60756611 60756498 Y REL BCL11A NA NA NA NA BCL11A 22091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60757053 60757301 60757153 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 21401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 60775877 60776167 60775994 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 2535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 61095090 61095322 61095155 Y REL REL NA NA NA NA REL 11334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA NA NA NA NA NA REL 58707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 61385752 61386084 61385930 Y REL C2orf74,AHSA2 NA NA NA NA C2orf74 15509 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chr2 62342790 62343015 62342903 Y NA NA NA NA NA NA B3GNT2 78233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 62492233 62492490 62492397 Y B3GNT2 NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 70985 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 63287182 63287416 63287280 Y OTX1 OTX1 NA NA NA NA OTX1 11990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 63411576 63411965 63411771 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 136384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 63514058 63514136 63514097 Y WDPCP NA NA NA NA NA OTX1 238866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64368431 64369198 64368837 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 58 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64545580 64545811 64545713 Y PELI1,SERTAD2,AFTPH NA LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 175992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65081925 65082185 65082093 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 AC007880.1 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 AC007880.1 6575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 AC007880.1 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 AC007880.1 1498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65089781 65090129 65089916 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 AC007880.1 SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007880.1 1021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 65849750 65849939 65849914 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 191979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 68544914 68545935 68545552 Y CNRIP1 PLEK NA NA NA NA CNRIP1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 68593534 68593956 68593557 Y C1D,PPP3R1,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25,APLF,PLEK CNRIP1,PLEK NA NA NA NA PLEK 3229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 68618184 68618675 68618350 Y C1D,PPP3R1,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25,APLF,PLEK PLEK NA NA NA NA PLEK 27879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 68654356 68654764 68654592 Y FBXO48,APLF,PLEK FBXO48,APLF NA NA NA NA FBXO48 37626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 68917276 68917507 68917390 Y PPP3R1,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25,PROKR1 ARHGAP25 PROKR1,APLF,ARHGAP25,BMP10,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 12543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 68997602 68997807 68997698 Y PLEK,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ARHGAP25 92869 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69056301 69056845 69056525 Y PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ARHGAP25 151568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69091781 69092116 69091950 Y BMP10 NA NA NA NA NA ARHGAP25 187048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 230867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69390293 69390547 69390355 Y ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA GFPT1 221835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69578985 69578997 69578991 Y NA GFPT1 NA NA NA NA GFPT1 33385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69857892 69858266 69858093 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 11291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 69997386 69997753 69997552 Y PCBP1,MXD1 NA NA NA NA NA GMCL1 57021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70161598 70161791 70161659 Y PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70170844 70171172 70170945 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 16225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70266434 70266774 70266735 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 45811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70273102 70273420 70273221 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 39165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70296121 70296604 70296392 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA PCBP1 15981 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 70331843 70331986 70331900 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 3491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 73318348 73318566 73318457 Y NA SFXN5 NA NA NA NA SFXN5 17601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 73337911 73338195 73338053 Y NA SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 74264843 74264997 74264882 Y NA NA TET3,ACTG2,DGUOK,STAMBP,MOB1A,BOLA3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 54584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 74412696 74412729 74412713 Y LBX2,TET3,MOBKL1B,MTHFD2 BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2 SLC4A5,MOB1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOB1A 8671 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 74446656 74447054 74446868 Y NA MOB1A,MTHFD2 NA NA NA NA MTHFD2 22967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 74804828 74804964 74804881 Y MOBKL1B,DOK1 AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 24011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 74968770 74968998 74968973 Y TLX2,HK2 AC007387.2 HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007387.2 10948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85057054 85057454 85057405 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 73295 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85632531 85633066 85632892 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG NA NA NA NA NA RETSAT 52788 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA NA NA NA NA NA MAT2A 91003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 85814700 85815022 85814855 Y VAMP5 GGCX,VAMP8,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68 NA NA NA NA RNF181 5826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 17095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 86102907 86103036 86102912 Y NA ST3GAL5 NA NA NA NA ST3GAL5 11101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 86225783 86226050 86225999 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 86244386 86244592 86244524 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 86686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 88353539 88354148 88353800 Y KRCC1 RNU2-63P,KRCC1 NA NA NA NA KRCC1 291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 92309033 92309202 92309197 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 3319871 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 96830596 96830784 96830751 Y DUSP2 DUSP2,STARD7 NA NA NA NA DUSP2 21417 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 97012594 97012961 97012778 Y ASTL SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 13069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 97211723 97211896 97211824 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,CNNM3,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 11243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 97579294 97579390 97579355 Y NA SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 44800 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 99125275 99125485 99125370 Y INPP4A NA NA NA NA NA INPP4A 65958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 99173119 99173416 99173284 Y INPP4A COA5,UNC50 UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 COA5 49562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 102058393 102058806 102058576 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 RFX8 NA NA NA NA RFX8 30359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 104425071 104425142 104425107 Y NA NA NA NA NA NA AC018880.2 186983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 106406623 106406870 106406731 Y TGFBRAP1,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 47269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 106412674 106413002 106412675 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 53320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 106414093 106414226 106414159 Y C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 54739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 106415106 106415442 106415380 Y NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 55752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 106416912 106417146 106416970 Y C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 57558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 109648298 109648660 109648428 Y LIMS1,RANBP2 NA MALL,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF3 95144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 109855106 109855410 109855221 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF3 111302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 110016494 110016637 110016500 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF3 272690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 112391711 112391985 112391831 Y NA NA ACOXL,BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 248282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 113341105 113341247 113341152 Y POLR1B POLR1B,CHCHD5,AC079922.2 NA NA NA NA CHCHD5 1288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 113398370 113398650 113398523 Y NA AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 2784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 113448371 113448563 113448450 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 46937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 48605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 113869431 113870096 113869786 Y NA IL1RN,PSD4 NA NA NA NA IL1RN 6640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PSD4 219528 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 114644100 114644364 114644199 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 1173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 114653014 114653311 114653090 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 7477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 115897297 115897567 115897434 Y DPP10,DPP10,DPP10 DPP10-AS1 NA NA NA NA DPP10-AS1 19353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.04087158376099 chr2 115944602 115944633 115944617 Y DPP10,DPP10,DPP10 DPP10-AS1 NA NA NA NA DPP10-AS1 27682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr2 116027974 116028021 116027995 Y DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10-AS1 111054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 116515030 116515203 116515120 Y NA NA NA NA NA NA DPP10-AS1 598110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 118737562 118738119 118738029 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 31590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 118738362 118738806 118738651 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 30903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 121355369 121355762 121355569 Y NA NA LOC84931,EPB41L5,RALB,INHBB IMR90 Hi-C 24141950 INHBB 253650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA AC013399.3 440491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 122275440 122275469 122275455 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 10988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 122456992 122457582 122457167 Y CLASP1 TSN NA NA NA NA TSN 35097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 127772292 127772580 127772500 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 90351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 127824493 127824859 127824771 Y MAP3K2,IWS1,BIN1 BIN1 NA NA NA NA BIN1 38072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 127844543 127844919 127844728 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 18012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 129248071 129248194 129248123 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 173920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA AC079776.4 494673 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 ARHGEF4 PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ARHGEF4 36669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 134918787 134918994 134918859 Y NA MGAT5 MGAT5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 43233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136217422 136217690 136217556 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB3 69116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136314098 136314477 136314288 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA R3HDM1 27073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136404449 136404849 136404497 Y R3HDM1 NA NA NA NA NA UBXN4 92340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 136765824 136766130 136765891 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 AC093391.2,DARS NA NA NA NA DARS 24154 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136870879 136871100 136870977 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 2635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136893434 136894485 136893919 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 19699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 136973752 136974110 136973839 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 100017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 137080106 137080340 137080182 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 206371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 138059421 138059750 138059540 Y NA NA NA NA NA NA THSD7B 538306 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 139260506 139260990 139260920 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 3135 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 140168949 140169074 140169000 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 911578 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 142314861 142315203 142315061 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 1317864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 143628214 143628759 143628425 Y NA KYNU NA NA NA NA KYNU 4308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 143960130 143960313 143960221 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 113199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 143962821 143963156 143962989 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA ARHGAP15 115890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 143964493 143964873 143964522 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 117562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 144013747 144014085 144013828 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 166816 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 144020720 144020920 144020801 Y KYNU,ARHGAP15 NA NA NA NA NA ARHGAP15 173789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 144122210 144122385 144122298 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 275279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 144160000 144160383 144160097 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA ARHGAP15 313069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 144214116 144214255 144214186 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA ARHGAP15 367185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 144470370 144470652 144470511 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 617483 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 144476408 144476703 144476621 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 611432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 144488458 144488893 144488487 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 599242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr2 144998671 144998982 144998736 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 89153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145214152 145214623 145214350 Y GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 65524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 145215157 145215664 145215657 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 64483 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145338212 145338608 145338410 Y NA NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 58065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145362861 145363070 145363016 Y ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 82714 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145418039 145419056 145418771 Y GTDC1,ZEB2 NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 137892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145420866 145421073 145420998 Y ZEB2 NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 140719 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 145459514 145460320 145459781 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 179367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 145463257 145463471 145463306 Y ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 183110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 146450569 146451281 146450882 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 357771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA EPC2 127533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 149645940 149646152 149646140 Y KIF5C NA NA NA NA NA EPC2 245931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 150440132 150440521 150440417 Y NA AC144449.1,MMADHC NA NA NA NA AC144449.1 1189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.69391438917399 chr2 152757130 152757527 152757465 Y CACNB4,CACNB4,CACNB4 NA NA NA NA NA ARL5A 74124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 152846412 152846712 152846699 Y NA NA NA NA NA NA CACNB4 106881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 152896580 152896660 152896620 Y NA NA NA NA NA NA CACNB4 56933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 152905302 152905591 152905486 Y NA CACNB4 NA NA NA NA CACNB4 48002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 152930991 152931406 152931212 Y NA CACNB4 NA NA NA NA CACNB4 22187 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr2 157293916 157294289 157294044 Y NA GPD2 NA NA NA NA GPD2 4114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA CYTIP 275468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 NA NA NA NA NA CYTIP 225368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 158325372 158325693 158325539 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 17780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 17177 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 158736746 158736790 158736768 Y NA ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 6372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 158970320 158970633 158970479 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 239946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 160208394 160208612 160208503 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 67084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 160353770 160354019 160353895 Y MARCH7,CD302 AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 36003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 162094289 162094955 162094372 Y NA NA NA NA NA NA PSMD14 67594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 162817649 162818074 162817753 Y IFIH1 NA NA NA NA NA EIF3EP2 124695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 162943490 162943739 162943601 Y FAP,DPP4 EIF3EP2 DPP4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3EP2 721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 163376672 163376691 163376681 Y NA NA NA NA NA NA GCA 203322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 164425693 164425701 164425698 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 164821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 166631165 166631444 166631305 Y NA GALNT3,AC009495.2 NA NA NA NA GALNT3 17748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 166649551 166649790 166649651 Y GALNT3 GALNT3,AC009495.2 NA NA NA NA AC009495.2 190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 166796102 166796135 166796119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 168633177 168633438 168633308 Y NA NA NA NA NA NA STK39 469213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 168822360 168822564 168822456 Y NA NA NA NA NA NA STK39 280087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 168977927 168978148 168978038 Y NA NA NA NA NA NA STK39 124503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 169347125 169347251 169347173 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 36753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 169402356 169402715 169402396 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 91984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 173061382 173062264 173061777 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 95754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 173316258 173316587 173316571 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 26176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 173908830 173909139 173908955 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 308409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 174886492 174886884 174886848 Y SP3 NA CIR1,SP3,ZAK,OLA1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 58062 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 174896632 174897390 174896767 Y SP3,SP3 NA SP3,OLA1,CDCA7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 68202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 85165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 177419249 177419407 177419328 Y NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01117 81031 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 178146003 178146401 178146169 Y HNRNPA3,NFE2L2,NFE2L2 MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 27265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 243912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 180871045 180871158 180871103 Y NA CWC22 NA NA NA NA CWC22 1205 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 182170258 182170790 182170550 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 149139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 182311485 182311704 182311492 Y NA ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 8225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 182335506 182336039 182335664 Y ITGA4 ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 15577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 182367881 182368047 182367964 Y ITGA4 ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 47952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 188463858 188463880 188463868 Y TFPI TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 1064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 190954965 190955117 190955035 Y C2orf88 NA C2orf88,HIBCH,TMEM194B,MFSD6,OSGEPL1,PMS1,INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf88 212630 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 191324757 191324843 191324828 Y NA NA NA NA NA NA MFSD6 53676 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 191984586 191984681 191984634 Y NA NA NA NA NA NA AC067945.4 100334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 192069255 192069475 192069372 Y STAT4 MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 38436 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 192436242 192436430 192436383 Y OBFC2A NA TMEFF2,OBFC2A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 328331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 454645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 194142383 194142416 194142400 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 2034472 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 196425923 196426330 196426251 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 12371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 196523919 196524096 196523991 Y SLC39A10 NA NA NA NA NA SLC39A10 85218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 197023417 197023933 197023871 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 15294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 197075977 197076359 197076177 Y STK17B STK17B NA NA NA NA STK17B 36750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 197099483 197099689 197099603 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 60256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 197104380 197104716 197104446 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 65153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 197686451 197686687 197686569 Y PGAP1,C2orf66 GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 24002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 197934773 197935033 197934860 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 144253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 198024213 198024664 198024538 Y SF3B1,COQ10B NA NA NA NA NA ATP5G2P3 101171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 198029302 198029554 198029323 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 96281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 200209653 200209909 200209897 Y SATB2,SATB2,SATB2 NA NA NA NA NA SATB2 124080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 200328214 200328741 200328463 Y SATB2,SATB2,SATB2 SATB2 NA NA NA NA SATB2 5248 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 201397001 201397079 201397012 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 14494 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 201978583 201978718 201978642 Y CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 16486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 202522160 202522705 202522330 Y NA NA NA NA NA NA ALS2 121207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 203341668 203341778 203341723 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 102009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA ABI2 120687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 207663978 207664088 207664013 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 35707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 208176046 208176541 208176319 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF7 146055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 208609048 208609450 208609191 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 22837 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 208883092 208883191 208883110 Y PTH2R,C2orf80 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 210429278 210429418 210429290 Y MAP2,MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 142496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 211470804 211470937 211470808 Y NA NA NA NA NA NA LANCL1 130428 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 212769634 212769960 212769797 Y NA NA NA NA NA NA AC013404.1 607720 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 212897670 212897774 212897723 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 503791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213185826 213186073 213186055 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 215492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213242050 213242407 213242229 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 159158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213339164 213339568 213339278 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 61997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213340230 213340572 213340527 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 60993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213400949 213401339 213401014 Y ERBB4 ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 213401643 213402097 213401658 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 78 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 216223263 216223304 216223303 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 217357637 217357999 217357758 Y NA RPL37A,AC098820.3 RPL37A IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 2913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 217929014 217929457 217929116 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 370766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 217936161 217936583 217936312 Y NA NA DIRC3,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 377913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 218113105 218113304 218113205 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP5 554857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 218783465 218783740 218783603 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 81978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 218799602 218799844 218799683 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 65874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 219177286 219177625 219177456 Y NA AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA TMBIM1 21977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 219198042 219198221 219198149 Y CXCR2,ARPC2,ARPC2,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 TMBIM1,AC021016.7,AC021016.6,SLC11A1 NA NA NA NA AC021016.7 18577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 219235108 219235675 219235453 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ARPC2,ARPC2,GPBAR1,USP37,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 AC021016.7,AC021016.6,SLC11A1,CTDSP1 NA NA NA NA AC021016.6 4550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,SLC11A1,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 AC021016.6,SLC11A1,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A NA NA NA NA NA WNT6 50971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr2 219774108 219774202 219774159 Y USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1 NA NA NA NA NA WNT6 51564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 219972742 219972853 219972823 Y NA NA LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH IMR90 Hi-C 24141950 NHEJ1 50734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA NA NA NA NA NA SGPP2 116205 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 224325508 224325708 224325596 Y WDFY1 NA SCG2,AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 375036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 224751909 224752110 224752042 Y WDFY1 NA NA NA NA NA AP1S3 51165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 225340678 225341017 225340847 Y NA NA NA NA NA NA FAM124B 75876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 225621293 225621621 225621457 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 173183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 225878647 225879031 225878803 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 26131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 225895000 225895240 225895124 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 9922 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 226867162 226867478 226867316 Y NA NA IRS1,COL4A4,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 794997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 226979861 226980232 226980018 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 682243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 226983188 226983709 226983518 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 678766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 227525366 227525547 227525486 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 136928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 227849549 227849707 227849645 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 151252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 230138474 230138658 230138545 Y PID1 PID1 PID1 IMR90 Hi-C 24141950 PID1 4473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 230195622 230196428 230195761 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 61621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 230200066 230200350 230200159 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 66065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 231299753 231300176 231299905 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 21096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 231523854 231524330 231524235 Y GPR55,SP110,SP140,SP140L,CAB39 NA CAB39 K562 ChIA-PET 22265404 CAB39 51230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 231533310 231533654 231533603 Y SP110,SP140 CAB39 CAB39 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 41906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 231636017 231636396 231636213 Y NA BANF1P3 NA NA NA NA BANF1P3 47899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 231822084 231822525 231822233 Y GPR55 NA NA NA NA NA C2orf72 77680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232032893 232033210 232033082 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 28050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232042131 232042529 232042280 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 18731 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232046537 232047112 232046768 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 14148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 232186573 232186872 232186798 Y PTMA NA NA NA NA NA AC017104.6 64815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 232256793 232257091 232256822 Y PTMA,NMUR1,B3GNT7 AC017104.6,B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 1163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 AC017104.6,B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr2 232470282 232470477 232470427 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 77076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA NMUR1 85186 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 232532385 232532510 232532473 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 233563344 233563704 233563468 Y NA GIGYF2 NA NA NA NA GIGYF2 3335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 233946973 233947142 233947080 Y INPP5D INPP5D NA NA NA NA INPP5D 24296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 233951283 233951765 233951418 Y GIGYF2,DGKD,ATG16L1,INPP5D INPP5D NA NA NA NA INPP5D 28606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 234139282 234139520 234139401 Y NEU2,INPP5D,USP40 ATG16L1,SCARNA5 GIGYF2,KCNJ13,C2orf82,NGEF,INPP5D,ATG16L1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG16L1 22585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 235198516 235198843 235198584 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 204854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 88346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 509498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 237512810 237512898 237512837 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 479057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 238080117 238080402 238080307 Y COL6A3 NA COL6A3,MLPH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 87657 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 238586570 238586965 238586752 Y MLPH,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 52351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 238598036 238598427 238598303 Y ESPNL,UBE2F,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 63817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA KLHL30,FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr2 239290977 239291159 239291031 Y NA ASB1 NA NA NA NA ASB1 42224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240134215 240134581 240134421 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 186549 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240143817 240143953 240143885 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 177177 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240144687 240145031 240144830 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 176099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr2 240179337 240179507 240179411 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 141623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr2 240186875 240187303 240186998 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 133827 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240210840 240211190 240211015 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 109940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240321591 240321797 240321685 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA HDAC4 243 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 240422771 240422958 240422804 Y HDAC4 NA NDUFA10,LOC150935,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 101423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr2 241395144 241395496 241395485 Y NA GPC1 NA NA NA NA GPC1 22056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 242702443 242702859 242702736 Y ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH,NEU4 NA NA NA NA D2HGDH 30449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr2 243028160 243028467 243028224 Y ATG4B AC093642.5 NA NA NA NA AC093642.5 317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA RP5-1103G7.4 5116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 823028 823308 823133 Y FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 10670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA NA FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 112837 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 38535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 1470188 1470635 1470521 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,NSFL1C,SIRPB2 NSFL1C NA NA NA NA SIRPB2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1548183 1548579 1548480 Y SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,SIRPB2 NA NA NA NA NA SIRPB1 50128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1838179 1838365 1838258 Y SIRPB2,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 34789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 1869680 1870159 1869931 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 2995 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 1883804 1884142 1883973 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 10650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 2202667 2202961 2202765 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA SIRPA,TGM3 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 122410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 2671963 2672026 2672004 Y NA NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 NA NA NA NA EBF4 439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 2851057 2851398 2851292 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 8227 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 3170247 3170648 3170474 Y NA FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA DDRGK1 12683 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 3690593 3690860 3690838 Y NA NA NA NA NA NA C20orf27 56174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 3692087 3692444 3692172 Y RNF24,RNF24,PANK2,PANK2 NA NA NA NA NA C20orf27 54590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 4063526 4063882 4063813 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 4794672 4795153 4795057 Y SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2 RASSF2 NA NA NA NA RASSF2 7138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr20 4970261 4970448 4970382 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 18491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 5070783 5071219 5071039 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 34053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 5628590 5628895 5628813 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 38918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 5639559 5639832 5639740 Y PROKR2,GPCPD1,TRMT6 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 49887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 9040584 9040977 9040781 Y PLCB4 PLCB4 PLCB1,PLCB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLCB4 6433 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 10197196 10197344 10197281 Y SNAP25 NA NA NA NA NA MKKS 215526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 10447085 10447351 10447236 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 34215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 10472654 10473100 10472965 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 59784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 10486121 10486184 10486148 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 73251 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 10532947 10533172 10533034 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 91842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 10838051 10838409 10838189 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 213037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 13211702 13211926 13211792 Y TASP1,ISM1 ISM1 NA NA NA NA ISM1 11284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 13846581 13846836 13846730 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 83049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 15888913 15889317 15889175 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 662761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 19194656 19195454 19194994 Y NA SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 3366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 19213558 19213957 19213665 Y SLC24A3 SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 22268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 19848562 19849136 19848901 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 112210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 19983799 19983958 19983881 Y NA NAA20 NA NA NA NA NAA20 11802 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA RALGAPA2 257819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 20586775 20587103 20586803 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 104028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 20714961 20715479 20715201 Y RALGAPA2 RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 23830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr20 23031353 23032100 23031620 Y GZF1,THBD,CD93 THBD NA NA NA NA THBD 2975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 23123782 23124035 23123853 Y NA NA LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 95404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 108207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 23140057 23140426 23140138 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 111679 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr20 23206035 23206305 23206209 Y THBD,CD93,GZF1,CST3 NA THBD,CD93 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 123068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 29637104 29637239 29637172 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 27247 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30105267 30105465 30105369 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 5036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30439389 30439785 30439556 Y DEFB121,TTLL9 NA NA NA NA NA PDRG1 98110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30646515 30646916 30646613 Y BCL2L1,PLAGL2,C20orf112,HCK HCK,TM9SF4 NA NA NA NA HCK 8524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 30793339 30793589 30793452 Y HCK,TM9SF4,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 5 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 30796713 30797081 30796897 Y NA PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA POFUT1 3030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 31170393 31170766 31170763 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 31192929 31193228 31193169 Y PLAGL2,MAPRE1,DNMT3B C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 22053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 31214876 31215264 31215015 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 44000 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 32425244 32425406 32425325 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 28134 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 32966378 32966977 32966403 Y GGT7 ITCH,CDC42P1 NA NA NA NA ITCH 17337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH,CDC42P1 NA NA NA NA CDC42P1 1169 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 33699049 33699250 33699220 Y TRPC4AP,EDEM2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 20375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 34093619 34093844 34093641 Y NA RP3-477O4.14,ERGIC3 NA NA NA NA RP3-477O4.14 16811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 34330989 34331372 34331294 Y SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39 ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA RBM39 2755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 34379775 34380017 34379908 Y SPAG4,RBM39,PHF20 RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 21879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 35102828 35103254 35103050 Y NA NA NA NA NA NA RP5-977B1.7 96540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35112957 35113192 35113075 Y TGIF2 NA NA NA NA NA RP5-977B1.7 86602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 35239893 35239986 35239939 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24,SLA2 NA NA NA NA C20orf24 7756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr20 35489284 35489554 35489419 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 88692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35723463 35723698 35723601 Y NA RBL1 NA NA NA NA RBL1 1275 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35873841 35874236 35874039 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35923453 35923684 35923588 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 7412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 35976271 35976569 35976418 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 5183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 36008343 36008504 36008424 Y SAMHD1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 37255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 36693519 36693713 36693616 Y RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA RPRD1B 33571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 36927231 36927507 36927350 Y BPI BPI NA NA NA NA BPI 40680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr20 37435049 37435642 37435193 Y RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B PPP1R16B NA NA NA NA PPP1R16B 2701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 37504064 37504454 37504244 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 FAM83D NA NA NA NA FAM83D 48501 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr20 39126761 39127835 39127266 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 188045 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 39135119 39135769 39135457 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 180111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39382987 39383112 39383050 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 67107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39620099 39620424 39620302 Y MAFB,TOP1 TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 35034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 39661985 39662084 39662008 Y NA TOP1 NA NA NA NA TOP1 6527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39771751 39772110 39771932 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 8151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 39939044 39939335 39939233 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 4977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 40210012 40210373 40210193 Y NA CHD6 NA NA NA NA CHD6 34760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 40657200 40657318 40657259 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 412067 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 41113750 41113899 41113824 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 868617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 41641358 41641720 41641455 Y L3MBTL1 NA NA NA NA NA SRSF6 442848 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 42137465 42137802 42137552 Y NA L3MBTL1 NA NA NA NA L3MBTL1 3145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr20 42381187 42381490 42381296 Y C20orf111 NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 87433 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 43123975 43124199 43124088 Y C20orf111,STK4,ADA,SERINC3 RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG NA NA NA NA TTPAL 21449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 43869504 43869693 43869682 Y DBNDD2,SLPI SLPI NA NA NA NA SLPI 11512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 44622132 44622355 44622242 Y CD40,ZNF335 ZNF335,MMP9,SLC12A5 ZNF335,MMP9,SLC12A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 MMP9 13192 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 44627049 44627270 44627179 Y PCIF1,CD40,ZNF335 ZNF335,MMP9,SLC12A5 MMP9 MCF7 ChIA-PET 22265404 MMP9 8277 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 45006307 45006609 45006393 Y PCIF1,ZNF335 SLC35C2 NA NA NA NA SLC35C2 15264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 45181612 45181958 45181851 Y CD40,C20orf123 ZNF334 NA NA NA NA ZNF334 41414 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 45324546 45324927 45324721 Y TP53RK TP53RK,SLC2A10 SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 TP53RK 8128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 46627599 46627830 46627732 Y NCOA3 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 498998 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 46700957 46701130 46701044 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 572356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 47339273 47339687 47339536 Y PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 102733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr20 47376585 47377468 47377050 Y STAU1,PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 64952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47390467 47391044 47390713 Y STAU1,PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 51376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 47393475 47393771 47393686 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 48649 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 47397993 47398168 47398081 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 44252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47407398 47407765 47407606 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 34655 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47439402 47439940 47439658 Y ZNFX1,STAU1,PREX1 PREX1 NA NA NA NA PREX1 2480 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47443501 47443751 47443699 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 1081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47448597 47449155 47448831 Y PREX1,ZNFX1 PREX1 PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 PREX1 6177 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47544338 47544681 47544534 Y DDX27 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 7911 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47784409 47784640 47784548 Y PREX1,ZNFX1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 18264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48313235 48313496 48313350 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 14919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr20 48341215 48341776 48341326 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 SLC9A8 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNRPFP1 2603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48344165 48344359 48344242 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 ZNFX1-AS1,B4GALT5,SLC9A8 IMR90 Hi-C 24141950 SNRPFP1 20 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48381625 48382070 48381853 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 37246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 48383666 48383949 48383788 Y ZNFX1,B4GALT5,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 39287 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48384741 48385230 48384965 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 48411231 48411773 48411549 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,ZNFX1,ZNFX1-AS1,PTGIS,RNF114 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 15477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 48619796 48620156 48619863 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 22260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 48838079 48838414 48838219 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB,RP11-290F20.3 PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 32703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 48887193 48887486 48887291 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB RP11-290F20.3 PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 5170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 49641280 49641578 49641516 Y NA KCNG1 NA NA NA NA KCNG1 3614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 50027410 50027791 50027676 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 149579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 50040722 50041122 50041004 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 136248 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 50134591 50134950 50134771 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 42420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 50141744 50142683 50142582 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 34687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.00475066484791 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 67789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr20 52238141 52238435 52238216 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 13695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52268867 52269118 52269044 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 44421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 52271592 52271787 52271702 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 47146 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52367753 52368082 52368002 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 143307 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr20 52392953 52393088 52393021 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 168507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52446362 52446831 52446771 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 52550838 52551665 52551067 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 270721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 54997703 54998108 54997901 Y NA AURKA,CSTF1,CASS4 NA NA NA NA CASS4 12535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 56010646 56011025 56010972 Y NA RBM38 NA NA NA NA RBM38 46183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 56027077 56027304 56027131 Y NA HMGB1P1 MIR5095 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1P1 34779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr20 56203164 56203608 56203205 Y RBM38,ZBP1 NA NA NA NA NA PMEPA1 80984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 58395685 58395999 58395791 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 110711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 58536301 58536377 58536339 Y NA SYCP2,PPP1R3D NA NA NA NA PPP1R3D 22949 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 58621223 58621546 58621377 Y PHACTR3,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197 NA NA NA NA C20orf197 7434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr20 58629735 58630279 58629955 Y PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197 NA NA NA NA C20orf197 755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 58631661 58631838 58631749 Y PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197 NA NA NA NA C20orf197 2681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 58632319 58632618 58632585 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197 NA NA NA NA C20orf197 3339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 58680257 58680439 58680367 Y PPP1R3D,C20orf177,CDH26,C20orf197 NA C20orf197 MCF7 ChIA-PET 22265404 C20orf197 51277 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 58957250 58957289 58957270 Y NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf197 328270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr20 58964846 58965478 58965226 Y NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf197 335866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 60752490 60752668 60752546 Y GTPBP5 PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 35668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 60875997 60876347 60876165 Y GATA5,CABLES2 ADRM1 NA NA NA NA ADRM1 848 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 61185365 61185586 61185478 Y DPH3P1,OGFR C20orf166-AS1 NA NA NA NA C20orf166-AS1 38632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA C20orf166-AS1 NA NA NA NA C20orf166-AS1 45872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf166-AS1 54146 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.69391438917399 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61306804 61307048 61306918 Y OGFR SLCO4A1,NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 31141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61317452 61317806 61317666 Y DPH3P1,OGFR,SLCO4A1 SLCO4A1,NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 20383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 33351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr20 61419308 61419499 61419452 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 14688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61585167 61585546 61585389 Y NA DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA SLC17A9 3115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61585554 61585775 61585703 Y SLC17A9 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA SLC17A9 3502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 61687989 61688195 61688101 Y NA HAR1B NA NA NA NA HAR1B 43476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 62545436 62545544 62545492 Y NA DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1 NA NA NA NA RNU1-134P 7128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,SAMD10,PRPF6 NA NA NA NA SAMD10 3 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 62709200 62709458 62709264 Y GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1 ZNF512B,SOX18,TCEA2 NA NA NA NA RGS19 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 62726888 62727073 62727008 Y NA ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA RGS19 17565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr20 62739506 62739724 62739570 Y NA RGS19 NA NA NA NA RGS19 30183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 11090314 11090328 11090319 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 1123729 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 15442714 15442952 15442833 Y NA AP001347.6 NA NA NA NA AP001347.6 44972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 17054611 17055027 17054700 Y USP25 USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr21 17104761 17105053 17104812 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 4417 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 17672058 17672352 17672205 Y NA NA NA NA NA NA USP25 571714 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA NA NA NA NA NA USP25 577786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 19151902 19152070 19151981 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 37633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 23793949 23794126 23794048 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 985322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 26932540 26932977 26932658 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 27941974 27942311 27942142 Y APP CYYR1 NA NA NA NA CYYR1 1292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30274097 30274402 30274148 Y NA N6AMT1 NA NA NA NA N6AMT1 18404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.55893204321752 chr21 30390843 30391016 30390919 Y NA LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 NA NA NA NA RWDD2B 1144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30451583 30451905 30451778 Y USP16,BACH1,BACH1,C21orf7 CCT8 NA NA NA NA CCT8 7465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30472474 30472512 30472479 Y USP16,BACH1,BACH1 CCT8 NA NA NA NA CCT8 28356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30675702 30676052 30675894 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 111310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 464653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 32654582 32654950 32654771 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 274608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 32714682 32715016 32714813 Y SCAF4 NA NA NA NA NA AP000251.3 214542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 32862869 32863036 32862944 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 66522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 32868770 32868927 32868849 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 60631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34408839 34409098 34408898 Y IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1 OLIG1 NA NA NA NA OLIG1 31352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34571192 34571326 34571223 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,OLIG2,OLIG1,IFNAR2 IFNAR2 GCFC1-AS1,GCFC1,IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,C21orf54,GART,CRYZL1 IMR90,H1ESC,GM12878,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 28880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 34736733 34736848 34736790 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNAR1,IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 36354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34773380 34773606 34773471 Y OLIG2,OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 35891449 35891717 35891494 Y NA KCNE1 NA NA NA NA KCNE1 8876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 KCNE1 NA NA NA NA KCNE1 34906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36174477 36174817 36174756 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 189036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 36217934 36218360 36217961 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 232493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 234432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 238290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 36227422 36227493 36227482 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 241981 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 272470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36263020 36263336 36263172 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 277579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 36281882 36282257 36282001 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 296441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36351037 36351195 36351156 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 365596 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36356108 36356416 36356285 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 370667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 438201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36724513 36724822 36724668 Y NA NA RUNX1,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 650143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36848062 36848516 36848174 Y NA NA RUNX1,LOC100506385,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 526449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 36936186 36936505 36936342 Y NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 438460 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr21 37304517 37304946 37304672 Y NA NA CLIC6,LOC100506385,LINC00160,RUNX1,RCAN1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 70019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr21 37670543 37670742 37670650 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 19745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 38189032 38189251 38189142 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 119599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 38825760 38825986 38825873 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 89668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 40302730 40303085 40302947 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 127499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 40331056 40331378 40331206 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 155825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 40389005 40389356 40389205 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 164421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 40689481 40689668 40689601 Y BRWD1 BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 40742482 40742667 40742571 Y NA HMGN1,WRB BRWD1,BRWD1-IT2,WRB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WRB 7503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 41696342 41696651 41696581 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 841077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 42485232 42485526 42485376 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 52202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 44074543 44074777 44074593 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 2797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 44819081 44819261 44819206 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 25747 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 44819332 44820064 44819633 Y PKNOX1,SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 24944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr21 44831891 44832268 44832005 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 12740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 45528208 45528453 45528331 Y NA PWP2,C21orf33,AP001055.6 NA NA NA NA PWP2 3037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 45543595 45544017 45543789 Y KRTAP10-6,TRPM2 PWP2,C21orf33,AP001055.6 NA NA NA NA C21orf33 7470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 45577373 45578052 45577512 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 NA NA NA NA AP001055.6 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr21 45587301 45587635 45587415 Y PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33,AP001055.6 C21orf33 K562 ChIA-PET 22265404 AP001055.6 9342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 45614142 45614593 45614385 Y NA AP001055.6,ICOSLG AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP001055.6 36183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 45616099 45616530 45616288 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG AP001055.6,ICOSLG AIRE,PFKL,C21orf33,PWP2,ICOSLG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP001055.6 38140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr21 45627966 45628150 45628090 Y NA ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 30699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 45774954 45775325 45775130 Y NA C21orf2,TRPM2 NA NA NA NA TRPM2 6908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46294509 46294819 46294590 Y ITGB2 PTTG1IP,ITGB2-AS1 NA NA NA NA PTTG1IP 2757 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP,ITGB2-AS1 NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 46298625 46298957 46298811 Y ITGB2 PTTG1IP,ITGB2-AS1 PTTG1IP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTTG1IP 6873 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 46302910 46303253 46303082 Y KRTAP10-1,KRTAP10-5,KRTAP10-6,KRTAP10-8,KRTAP10-11,KRTAP12-2,KRTAP12-1,ITGB2 PTTG1IP,ITGB2-AS1,ITGB2 PTTG1IP MCF7 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 11158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46387960 46388437 46388173 Y POFUT2,ITGB2 ITGB2-AS1,ITGB2,FAM207A NA NA NA NA FAM207A 30035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46389792 46390113 46389960 Y POFUT2,ITGB2 ITGB2,FAM207A NA NA NA NA FAM207A 31867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 46749941 46750271 46750188 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 44128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 47974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 47724911 47725263 47725135 Y PRMT2 MCM3AP,YBEY,C21orf58,PCNT NA NA NA NA C21orf58 16526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 48003626 48004009 48003657 Y S100B,PRMT2 S100B,PRMT2 NA NA NA NA S100B 19112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr21 48042238 48042469 48042310 Y DIP2A,PRMT2 S100B,PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRMT2 10610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5,CECR1 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 11800 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 18162976 18163469 18163294 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L13 53355 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 18251941 18252335 18252187 Y CECR2,BCL2L13,BID,BID BID,LINC00528 NA NA NA NA BID 3201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 18280978 18281337 18281098 Y BID,BID BID,LINC00528 NA NA NA NA LINC00528 22890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19043288 19043502 19043327 Y NA NA NA NA NA NA DGCR2 64465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19072724 19073088 19073012 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 34879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.83364739997837 chr22 19433007 19433028 19433018 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 196 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19564748 19565059 19564792 Y CLDN5 NA HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC45 99766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19749283 19749521 19749403 Y NA SEPT5,TBX1 NA NA NA NA TBX1 7057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 GNB1L 34052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 19983308 19983423 19983389 Y NA ARVCF NA NA NA NA ARVCF 18908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 20199029 20199266 20199148 Y NA NA NA NA NA NA RTN4R 69503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 20911751 20912048 20911845 Y PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15 NA NA NA NA NA MED15 63551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr22 22417614 22417915 22417690 Y PPM1F NA TOP3B,LOC96610 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TOP3B 82401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 23413714 23413937 23413833 Y NA GNAZ NA NA NA NA GNAZ 3174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL1 56163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A NA NA NA NA NA SPECC1L 60431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 24747750 24748005 24747878 Y NA NA NA NA NA NA ADORA2A 63842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 24756229 24756614 24756466 Y NA NA NA NA NA NA ADORA2A 55233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 24907169 24907526 24907423 Y GGT1 SNRPD3 NA NA NA NA SNRPD3 41945 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 NA PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM211B 95277 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 25815594 25815803 25815685 Y ADRBK2,LRP5L LRP5L,CRYBB2P1 MYO18B,CRYBB2P1,LRP5L,SEZ6L,KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 16250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA TTC28 235661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29206791 29206989 29206921 Y EMID1,CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1 K562 ChIA-PET 22265404 CTA-292E10.6 12120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29207861 29207973 29207910 Y EMID1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1,CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTA-292E10.6 13190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29280564 29280869 29280661 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 2984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29591621 29591757 29591669 Y EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 8083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 29598879 29599169 29599017 Y EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 671 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr22 29601085 29601300 29601289 Y NA EMID1 NA NA NA NA EMID1 1245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr22 29603016 29603222 29603044 Y NA EMID1 NA NA NA NA EMID1 3176 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 31030399 31030736 31030505 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18 NA NA NA NA SLC35E4 760 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 31626331 31627201 31626769 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 20106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 33240240 33240586 33240349 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 44553 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 34062900 34062913 34062907 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 35993 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 34073272 34073505 34073390 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 25401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 34249918 34249944 34249938 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 151012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr22 34682646 34682665 34682656 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 583740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 36847830 36847945 36847861 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB TXN2 NA NA NA NA TXN2 28132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 37258335 37258758 37258531 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NCF4 3305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr22 37670721 37670896 37670794 Y SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,CYTH4 RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH4 5172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 37675587 37675874 37675731 Y TRIOBP RAC2,CYTH4 NA NA NA NA CYTH4 194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 37986436 37986718 37986607 Y CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1 CDC42EP1,LGALS2,GGA1,SH3BP1 NA NA NA NA LGALS2 9813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 38057516 38057596 38057556 Y NA SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP NA NA NA NA PDXP 4782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 38434638 38434982 38434731 Y NA PICK1 BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1 IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 15336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 38653163 38653507 38653358 Y NA TMEM184B MAFF IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184B 13533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 38750839 38750902 38750852 Y NA CSNK1E NA NA NA NA CSNK1E 41625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 39696256 39696487 39696398 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 17907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 39890901 39891082 39890968 Y ATF4 ATF4,RPS19BP1 SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 ATF4 22618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr22 42008568 42008780 42008674 Y NA PMM1,XRCC6 NA NA NA NA XRCC6 6343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42073632 42073949 42073667 Y TOB2 C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 8994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42485778 42486189 42485966 Y CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32 NAGA,FAM109B,NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA NDUFA6 819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 42527695 42528060 42527840 Y CYP2D6 NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA OLA1P1 24738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42696005 42696062 42696030 Y SEPT3,NFAM1 NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NFAM1 130339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42826560 42827010 42826707 Y POLDIP3,ARFGAP3,TCF20,NFAM1 NFAM1,CTA-126B4.7 NA NA NA NA NFAM1 159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 42832192 42832354 42832264 Y POLDIP3,ARFGAP3,NAGA,TCF20,NFAM1 NFAM1,CTA-126B4.7 WBP2NL,TCF20,LOC388906,SERHL,MEI1 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-126B4.7 163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 42835802 42836124 42835869 Y POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1 NFAM1,CTA-126B4.7 MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-126B4.7 3773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr22 43269385 43269620 43269503 Y NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 17273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 43327460 43327806 43327638 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA ARFGAP3 75348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 43415245 43415535 43415390 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 6094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 44321391 44321759 44321599 Y PNPLA3 PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5 NA NA NA NA PNPLA3 3772 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 44417424 44417686 44417555 Y PARVB PARVB NA NA NA NA PARVB 24333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 44541394 44541995 44541679 Y NA PARVG NA NA NA NA PARVG 24841 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 45000105 45000487 45000214 Y NA NA NA NA NA NA PRR5 62106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 45635319 45635444 45635382 Y NA KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 669 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 45900177 45900595 45900449 Y FBLN1 FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 4059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 46004834 46005031 46004922 Y C22orf26 NA NA NA NA NA ATXN10 60647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr22 46392166 46392677 46392532 Y C22orf26 WNT7B C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU IMR90 Hi-C 24141950 WNT7B 21157 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr22 46462776 46462894 46462836 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 46989093 46989561 46989508 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 19184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr22 46995028 46995247 46995155 Y TBC1D22A,CERK GRAMD4 CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 25119 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr22 50154074 50154212 50154143 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 64948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50242140 50242406 50242374 Y MLC1,HDAC10 BRD1,ZBED4 ZBED4,BRD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZBED4 3084 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr22 50414821 50415138 50414874 Y BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA PIM3 62660 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50449135 50449422 50449263 Y TUBGCP6,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA MLC1 72909 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50622526 50622601 50622565 Y NA PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 182 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr22 50815545 50815813 50815668 Y MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 35812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50976397 50976540 50976449 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 7388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr22 50979060 50979802 50979496 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 10051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr22 51026472 51026838 51026655 Y MOV10L1,FAM116B,RABL2B,MAPK8IP2,MAPK8IP2 SYCE3,CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA NA NA NA NA CHKB-CPT1B 7078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr22 51109040 51109307 51109069 Y SHANK3 ARSA,SHANK3 SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHANK3 1536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 3202241 3202572 3202332 Y NA TRNT1,CRBN NA NA NA NA CRBN 16822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 4780474 4780964 4780800 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 146013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 5181258 5181597 5181446 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 19353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 5182623 5182897 5182737 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 20718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 6398384 6398410 6398397 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1171053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 7836263 7836282 7836272 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 705111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 8435443 8435709 8435689 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 105684 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 8529087 8529361 8529226 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 12032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 8533422 8533759 8533554 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 7634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 9197454 9197478 9197466 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 193997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 10593561 10593984 10593868 Y NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 232699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 11314967 11316155 11315793 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 2972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 11581408 11581480 11581447 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 178740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 12395386 12395555 12395486 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 68519 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 12398616 12399008 12398699 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 71749 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 12723455 12723677 12723573 Y RAF1 RAF1 TMEM40,RAF1,MKRN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAF1 19730 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr3 13062449 13062850 13062655 Y RPL32,NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 49767 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 13455554 13455885 13455702 Y NUP210 NUP210 NA NA NA NA NUP210 3924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43,AC093495.4 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr3 14246419 14246703 14246618 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 28136 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr3 14419300 14419574 14419395 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 22502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 14444961 14445761 14445267 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 2885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 NA NA NA NA NA NR2C2 271895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15329162 15329412 15329246 Y NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 NA NA NA NA NA SH3BP5 51463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15541087 15541411 15541231 Y ANKRD28,CAPN7,SH3BP5,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ NA NA NA NA NA METTL6 61014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 15847096 15847637 15847448 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 51641 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 16342509 16342839 16342720 Y OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 37803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 16402746 16402862 16402794 Y DAZL,DAZL NA NA NA NA NA OXNAD1 98040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 16552919 16553213 16553144 Y NA RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 664422 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 701153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr3 17674085 17674191 17674137 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 810118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18013789 18014053 18013921 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 470256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18022713 18023080 18023018 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 461229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 18024656 18024931 18024818 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 459378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 18140643 18140862 18140682 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 343447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18210791 18210985 18210888 Y TBC1D5,TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 273324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 18415394 18415659 18415606 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 68650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18430720 18430774 18430747 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 53535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18453300 18453576 18453481 Y NA TBC1D5,AC144521.1,SATB1 NA NA NA NA TBC1D5 30733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 18485117 18485365 18485120 Y NA TBC1D5,AC144521.1,SATB1 NA NA NA NA SATB1 37 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.65779347026092 chr3 18571233 18571621 18571333 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 86153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 95162 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 18598150 18598373 18598222 Y SATB1 NA NA NA NA NA SATB1 113070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 18782585 18783290 18782757 Y SATB1 NA NA NA NA NA SATB1 297505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 703289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA EFHB 607005 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 20082717 20083237 20083200 Y RAB5A,KAT2B KAT2B NA NA NA NA KAT2B 3202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 20200050 20200329 20200065 Y NA SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 25455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 21755607 21755966 21755787 Y ZNF385D NA NA NA NA NA HMGB1P5 665344 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23201434 23201636 23201539 Y UBE2E2 UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 40875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23206478 23206499 23206488 Y NA UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 36012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23432118 23432366 23432242 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 189607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 23946487 23946815 23946592 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA RPL15 9221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 26146440 26146612 26146495 Y TOP2B,NGLY1 NA NA NA NA NA NGLY1 316910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 26758769 26758926 26758778 Y LRRC3B NA NA NA NA NA SLC4A7 764985 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 30389148 30389362 30389271 Y TGFBR2 NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 256632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 31167632 31167644 31167638 Y NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 404486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 31267763 31268179 31268080 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 303951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 31268600 31269021 31268879 Y NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 303109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 33081513 33081785 33081661 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 8158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 33190938 33191178 33190994 Y NA CRTAP NA NA NA NA CRTAP 37467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 33639579 33639904 33639592 Y CLASP2 NA NA NA NA NA CLASP2 117944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 33833188 33833699 33833464 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP CLASP2,CRTAP IMR90 Hi-C 24141950 PDCD6IP 4145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 34403408 34403869 34403595 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 565564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 35105790 35105810 35105799 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1267946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 37221290 37221535 37221382 Y NA LRRFIP2 LRRFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 1645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 41158856 41159369 41159156 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 74959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 41886280 41886299 41886290 Y NA NA NA NA NA NA ULK4 115623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 42601905 42602046 42601976 Y NA SS18L2,NKTR,SEC22C NA NA NA NA SS18L2 19286 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 43368782 43368949 43368860 Y NA SNRK NA NA NA NA SNRK 42778 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 101913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 44972207 44972481 44972421 Y NA EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA EXOSC7 42252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 45147419 45147607 45147508 Y TMEM158,CDCP1 CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 38307 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 45594952 45595331 45595047 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 66 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 46035131 46035483 46035399 Y CCR5,SACM1L,CXCR6,FYCO1 NA NA NA NA NA FYCO1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 46139244 46140413 46139465 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 103928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr3 46142288 46142781 46142495 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,CCR1 IMR90 Hi-C 24141950 CCR1 105106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 46342726 46342910 46342767 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR2 NA SLC6A20,CCR9,CCR3,CCR5,LOC100132146,FYCO1 IMR90 Hi-C 24141950 CCR2 50315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 46354449 46354761 46354695 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 CCR2 CCR3,CCR9,CCR2,CCR5,LTF IMR90 Hi-C 24141950 CCR2 38464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 46427756 46428118 46427902 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 CCR2 CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR2 34531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA NA NA NA NA NA ALS2CL 132975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 46971519 46971826 46971651 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 47347 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47026763 47026874 47026817 Y KLHL18,NBEAL2 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA CCDC12 5263 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47134411 47134793 47134602 Y SETD2 NA NA NA NA NA SETD2 68664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47176804 47177094 47176949 Y PRSS45,PRSS42 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 26363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 49275888 49276379 49276160 Y USP4,RHOA,AMIGO3,ARIH2,DALRD3 NA NA NA NA NA KLHDC8B 68844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 49286239 49286578 49286497 Y ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4 NA NA NA NA NA KLHDC8B 79195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 49382516 49382833 49382703 Y ARIH2,DALRD3,UBA7,RHOA,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 6371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr3 49425171 49425361 49425266 Y ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7 USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1 NA NA NA NA TCTA 22278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 50040739 50040850 50040788 Y SEMA3B NA NA NA NA NA RBM6 65299 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 50243484 50243685 50243589 Y HYAL1,SLC38A3 SLC38A3,GNAI2 NA NA NA NA SLC38A3 2805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr3 50280308 50280577 50280437 Y RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,IFRD2 NA NA NA NA GNAI2 18584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 50370591 50370860 50370724 Y RBM6,SEMA3B,RASSF1 IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 5551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 50377372 50377700 50377536 Y NA IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 50627976 50628161 50628029 Y RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 50983523 50983672 50983598 Y NA NA NA NA NA NA DOCK3 272851 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 51720527 51720790 51720691 Y VPRBP TEX264 NA NA NA NA TEX264 25818 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 52057960 52058232 52058077 Y NA ABHD14B,RPL29,DUSP7 DUSP7,POC1A,ALAS1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29 30002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 52219997 52220195 52220128 Y ALAS1,ALAS1 POC1A,ALAS1,TLR9 RPL29,DUSP7,POC1A,ALAS1,WDR82,PPM1M,DNAH1,BAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ALAS1 9907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr3 52235110 52235291 52235183 Y PBRM1,PBRM1,GLYCTK,DNAH1 POC1A,ALAS1,TLR9,RP5-1157M23.2,TWF2 NA NA NA NA ALAS1 5008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 52531917 52532418 52532268 Y TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1 NISCH,NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 34652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 53106812 53106929 53106871 Y TMEM110,SFMBT1 SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 53203443 53203654 53203536 Y PBRM1,GLT8D1,DCP1A,PRKCD RFT1,PRKCD NA NA NA NA PRKCD 15418 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 55363946 55364201 55364163 Y WNT5A NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 705704 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 706329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 56357076 56357316 56357186 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 231873 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 56818012 56818198 56818042 Y CCDC66,C3orf63,ARHGEF3 NA NA NA NA NA FAM208A 102747 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 57664290 57664400 57664342 Y NA RP11-755B10.3 NA NA NA NA RP11-755B10.3 12532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 57968397 57968639 57968468 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 23488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 58336517 58336871 58336595 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 58339773 58340193 58340113 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 23166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.76615622700014 chr3 58400417 58400633 58400461 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 16951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 60018233 60018421 60018327 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 984423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 60777295 60777669 60777482 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 457464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 61579072 61579152 61579112 Y PTPRG PTPRG NA NA NA NA PTPRG 33829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 61728117 61728514 61728321 Y NA RPL10AP6 NA NA NA NA RPL10AP6 1337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 62311824 62311884 62311857 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP6 585044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7,ATXN7 NA NA NA NA ATXN7 41 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 64033481 64033828 64033688 Y NA PSMD6 PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 25823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 65006245 65006269 65006257 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 334569 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 66295672 66296073 66295873 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 178387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 66500646 66500979 66500813 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 48708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 66533474 66533812 66533569 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 15875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 66543351 66543557 66543448 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 6130 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 69345659 69345717 69345688 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 213564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 69555585 69555706 69555646 Y NA FRMD4B NA NA NA NA FRMD4B 34028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 70085218 70085447 70085333 Y NA NA NA NA NA NA MITF 298632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71149356 71149810 71149695 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 481330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71439009 71439199 71439166 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 191941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71493467 71493739 71493621 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 137401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 71588104 71588187 71588146 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 42953 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 71634476 71634568 71634542 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 3336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71664332 71664660 71664495 Y EIF4E3 FOXP1 FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 33192 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 71829095 71829466 71829305 Y FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 GPR27,EIF4E3,PROK2 NA NA NA NA PROK2 2891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 71833463 71833613 71833538 Y FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 GPR27,EIF4E3,PROK2 NA NA NA NA PROK2 1106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 71855877 71856161 71855976 Y FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 PROK2 SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 PROK2 23520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 72151192 72151670 72151441 Y RYBP,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 138046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 72263935 72263948 72263940 Y NA LINC00877 SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 25768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 72386025 72386536 72386317 Y NA NA SHQ1,GXYLT2,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00877 96309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 72397214 72397486 72397325 Y RYBP NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 96583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 72445751 72445968 72445860 Y NA RYBP NA NA NA NA RYBP 48101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA NA NA NA NA NA CCDC75P1 467172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 78867121 78867519 78867219 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 947446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 87101402 87101690 87101545 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 172731 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 97211520 97211837 97211678 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 269528 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 97240765 97240783 97240774 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 240582 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 97700858 97701029 97700931 Y OR5K3,OR5AC2,MINA,MINA MINA MINA MCF7 ChIA-PET 22265404 MINA 11557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 98044011 98044208 98044126 Y NA NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 195702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 55645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 56078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL6 60181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 DCBLD2 6644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA FILIP1L 248529 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 246544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 243874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 210845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA FILIP1L TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 48101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 101555569 101555949 101555674 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 10734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 101620912 101621401 101621096 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 76077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1560628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr3 105549302 105549342 105549320 Y CBLB CBLB NA NA NA NA CBLB 37054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 107843189 107843582 107843382 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 35317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 112216852 112217043 112216929 Y BTLA BTLA NA NA NA NA BTLA 444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 112274528 112274888 112274746 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 3668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 112577470 112577712 112577653 Y NA NA CD200R1L,CD200R1 IMR90 Hi-C 24141950 GTPBP8 130053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 113416036 113416177 113416128 Y SIDT1 KIAA2018,NAA50,ATP6V1A,RP11-271C24.2 NA NA NA NA KIAA2018 2543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F17.1 71167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 114813239 114813371 114813303 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 50747 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163092 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 117050913 117051371 117051328 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 307368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 117175008 117175053 117175027 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 431463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 119230547 119230943 119230634 Y NA TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 15168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E1 61796 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 120463141 120463503 120463258 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 3301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 121713958 121714176 121714068 Y HCLS1,EAF2,CD86 NA NA NA NA NA CD86 58037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 121786804 121787238 121787039 Y HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86 CD86 NA NA NA NA CD86 14591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 121952272 121952870 121952518 Y NA NA NA NA NA NA CSTA 89221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr3 121966391 121966530 121966436 Y GOLGB1,EAF2,CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,DTX3L,CSTA NA NA NA NA NA CSTA 75561 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122151664 122151964 122151814 Y NA WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122463361 122463618 122463490 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 47053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122486684 122487080 122486948 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 23591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122493180 122493752 122493620 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 16919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122787344 122787648 122787385 Y SEMA5B,PDIA5 PDIA5 NA NA NA NA PDIA5 3435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 122988091 122988383 122988237 Y NA NA NA NA NA NA SEC22A 69317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr3 124964412 124964802 124964608 Y NA NA SLC12A8 IMR90 Hi-C 24141950 HEG1 191610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA RP11-124N2.1 91582 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 126249002 126249358 126249248 Y ZXDC,UROC1,CHST13 CHST13 NA NA NA NA CHST13 7876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 126259496 126259659 126259567 Y ZXDC CHST13 NA NA NA NA CHST13 18370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 126939428 126939807 126939619 Y NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 233991 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 126940272 126940448 126940345 Y NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 234835 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 239994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 240445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 15.0237533242396 chr3 127448420 127448704 127448528 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 58642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 127539467 127539812 127539513 Y MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 149689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 127886942 127887322 127887108 Y NA EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA RUVBL1 16185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4,GATA2 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATA2 6492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 128310952 128311168 128311056 Y DNAJB8,RAB7A,GATA2,GATA2,GATA2 NA EEFSEC,GATA2,LOC90246 IMR90 Hi-C 24141950 RPN1 86750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 128327283 128327483 128327387 Y GATA2,GATA2,GATA2 NA NA NA NA NA RPN1 70435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chr3 128565439 128565717 128565506 Y KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 30722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 128573463 128573773 128573618 Y DNAJB8,C3orf27 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 22666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr3 129180710 129180864 129180787 Y IFT122 MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 23742 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 129311648 129311919 129311783 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 11742 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 129313710 129313984 129313815 Y H1FOO PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 9677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 131096350 131096447 131096399 Y NA NUDT16 NA NA NA NA NUDT16 2068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 132002464 132002523 132002494 Y NA RPL7P16,CPNE4,ACPP NA NA NA NA CPNE4 210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 134262801 134263184 134262890 Y CEP63,CEP63,CEP63 NA NA NA NA NA EPHB1 51459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 136427457 136427837 136427826 Y STAG1 STAG1 NA NA NA NA STAG1 41383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 138465994 138466395 138466194 Y NA NA NA NA NA NA PIK3CB 85385 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 138581550 138581663 138581597 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr3 138594717 138594956 138594896 Y NA PIK3CB NA NA NA NA PIK3CB 42937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 141131755 141132151 141131882 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 71738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 141240287 141240651 141240396 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 36398 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 142225702 142226031 142225867 Y NA NA NA NA NA NA XRN1 60798 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 145164438 145164687 145164563 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 375839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 145416082 145416315 145416265 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 124211 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 147016506 147016766 147016597 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 755855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 149180653 149180836 149180808 Y RNF13 RP11-278L15.6 HPS3,TM4SF18,TM4SF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 29611 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 NA NA NA NA NA PFN2 108725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA NA NA NA NA NA PFN2 97933 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 150478267 150478712 150478564 Y TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2 SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 150983738 150984063 150983889 Y P2RY14 P2RY14 NA NA NA NA P2RY14 10192 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 151065337 151065743 151065553 Y CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12 P2RY13 NA NA NA NA P2RY13 20001 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 151589492 151589804 151589672 Y NA SUCNR1 NA NA NA NA SUCNR1 61 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 151593609 151593922 151593765 Y NA SUCNR1 NA NA NA NA SUCNR1 4178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 151902781 151903065 151902923 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 56552 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr3 151970606 151970904 151970617 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1 10989 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 151974707 151975007 151974858 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 10337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 151975130 151975682 151975593 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 9662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 151976173 151976628 151976408 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 151993494 151994006 151993570 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 44692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 152374942 152375112 152375027 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 175624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 155442955 155443143 155443049 Y NA PLCH1 C3orf33 IMR90 Hi-C 24141950 PLCH1 17713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 157008618 157008892 157008755 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550I24.2 117606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 158070419 158070585 158070503 Y MFSD1 NA NA NA NA NA RP11-538P18.2 216270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 40739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 159922333 159922625 159922477 Y KPNA4 C3orf80 IQCJ-SCHIP1,C3orf80,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf80 18798 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 161139893 161140384 161140069 Y NA NA NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 B3GALNT1 318721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 161731102 161731436 161731432 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT1 909930 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 161835888 161836193 161836058 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT1 1014716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 163153271 163153291 163153281 Y NA NA NA NA NA NA B3GALNT1 2332099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 164729324 164729626 164729510 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 2640145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 167238631 167239058 167238915 Y NA NA NA NA NA NA WDR49 130713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA EIF5A2 258584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171494715 171495344 171494835 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 NA NA NA NA PP13439 30370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 171531632 171532210 171532036 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 PLD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PLD1 4892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171542633 171542898 171542814 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 FNDC3B,PLD1,TMEM212 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 15893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171693285 171693478 171693411 Y FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 61940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 171702956 171703059 171703008 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 52359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 171792323 171792831 171792493 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 36905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171859893 171860698 171860535 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 104475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 171897555 171897878 171897648 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 142137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 172229975 172230511 172230380 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 8786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 172325180 172325357 172325227 Y NA NA TNFSF10 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 85883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 172344996 172345137 172345044 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 81871 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 172423916 172424228 172424139 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 2780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 177079124 177079508 177079413 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 165863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 177979552 177979945 177979765 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 808122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr3 179049621 179049719 179049674 Y NA ZNF639,MFN1 NA NA NA NA ZNF639 10842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 179122098 179122379 179122239 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 44999 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 179161841 179162229 179161903 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 5149 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 179550123 179550276 179550202 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 181580 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 179659956 179660305 179660211 Y PEX5L NA NA NA NA NA PEX5L 92536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA PEX5L 65262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr3 180473227 180473381 180473285 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 110548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 181367894 181368046 181367970 Y SOX2 NA NA NA NA NA DNAJC19 662332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 NA NA NA NA NA DNAJC19 712583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 181473928 181474194 181474085 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 768366 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 182928659 182929484 182928893 Y ATP11B,DCUN1D1,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 39548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 182930008 182930187 182930076 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 38845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 182978108 182978472 182978157 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 9076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 183024720 183025033 183024891 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA B3GNT5 55688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 183231092 183231442 183231267 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 40035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 183740259 183740413 183740311 Y KLHL6,FAM131A ABCC5,EEF1A1P8 ABCC5,EIF2B5,ALG3,ECE2,CAMK2N2,VWA5B2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P8 3131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 184301316 184301494 184301488 Y NA EPHB3 NA NA NA NA EPHB3 23744 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 184504548 184504615 184504585 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 23316 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 89948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 185533882 185534105 185533994 Y NA IGF2BP2 SENP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2BP2 6739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 185903032 185903219 185903142 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 76925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 185956078 185956394 185956322 Y NA NA NA NA NA NA DGKG 121632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 186746012 186746360 186746185 Y RTP1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 187673173 187673416 187673302 Y RTP2,BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 195656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188002342 188002742 188002584 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 132497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188035801 188035961 188035890 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 165956 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188506419 188506821 188506595 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 156607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188537744 188538118 188537883 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 125310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr3 188539862 188540160 188539984 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 123268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188666473 188667138 188666837 Y NA TPRG1-AS1 LPP,BCL6,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 TPRG1-AS1 3045 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 188668723 188669229 188668886 Y NA TPRG1-AS1 LPP,BCL6,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPRG1-AS1 5295 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 189025742 189026175 189025816 Y TP63 NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 362314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 189134489 189134632 189134561 Y TP63 NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 471061 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 190335085 190335347 190335197 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 105245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr3 191049369 191049653 191049414 Y NA CCDC50 NA NA NA NA CCDC50 4503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 192605604 192605670 192605648 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 194048965 194049014 194048990 Y NA NA NA NA NA NA ATP13A3 168079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 195153778 195154174 195153996 Y NA ACAP2 NA NA NA NA ACAP2 7633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 195258657 195259038 195258847 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 9171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2-AS1 NA NA NA NA TNK2-AS1 5044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2-AS1 NA NA NA NA TNK2-AS1 755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 195871770 195871934 195871856 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 64710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 195946209 195946432 195946330 Y UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19 NA NA NA NA NA PCYT1A 66396 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr3 195946520 195946837 195946671 Y LRRC33,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 65991 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr3 196068097 196068272 196068177 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A,TM4SF19 TCTEX1D2 NA NA NA NA TCTEX1D2 24927 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 196351343 196351605 196351435 Y LRRC33 LINC01063,PIGX WDR53,FBXO45,SENP5,UBXN7,LRRC33 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01063 5853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 196351868 196352093 196351934 Y LRRC33 LINC01063,PIGX SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01063 5365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 196370086 196370426 196370273 Y PCYT1A,UBXN7,RNF168,SENP5,LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 5440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr3 196377844 196378239 196377963 Y NA LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 13198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196378860 196378951 196378906 Y LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 14214 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196389876 196389952 196389914 Y LRRC33 LINC01063,PIGX,CEP19 NA NA NA NA PIGX 25230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196694427 196694825 196694642 Y NA NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 197056302 197056596 197056442 Y KIAA0226,DLG1 DLG1 MFI2-AS1,MFI2,DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 32131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 197254564 197254715 197254640 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 43479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 43553 43799 43797 Y ZNF141 NA ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF141 285804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 683740 684022 683889 Y GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 13515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 74577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 2788784 2789423 2789092 Y NA TNIP2,SH3BP2 SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SH3BP2 3327 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 2802562 2803388 2803116 Y ZFYVE28,LOC402160,HTT,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 9812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 3374732 3375130 3374899 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 81977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 3389642 3390154 3389980 Y HTT,RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 96887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 3709851 3710272 3710103 Y NA NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 55803 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 4855584 4855774 4855697 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 3619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 5587454 5587568 5587511 Y NA NA NA NA NA NA EVC2 121707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6912537 6913143 6912820 Y KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 3568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6918330 6918775 6918508 Y KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 9361 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6919401 6919899 6919549 Y MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 10432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6927054 6927600 6927345 Y KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 18085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 6927759 6928245 6928119 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 18790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 6964947 6965065 6964958 Y CCDC96 NA NA NA NA NA TBC1D14 55978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 7637304 7637463 7637384 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 302190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 7649791 7650390 7650086 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 289263 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 7674956 7675119 7675023 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 264534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 8411022 8411421 8411226 Y NA ACOX3 NA NA NA NA ACOX3 29029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr4 12125393 12125532 12125432 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST1 696004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 690843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 13193944 13194185 13194064 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 138853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 13483063 13483398 13483224 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15235793 15235968 15235850 Y CPEB2,FBXL5,BST1 NA PROM1,C1QTNF7,FBXL5,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 233495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15422456 15422482 15422468 Y C1QTNF7 CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 47007 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15651682 15652058 15651870 Y NA FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 29227 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15660440 15660677 15660613 Y CD38,FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 20608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 26707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 15773062 15773366 15773182 Y FBXL5,CD38 RP11-115L11.1 CC2D2A,CD38 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 41812 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 21895049 21895394 21895392 Y NA NA NA NA NA NA KCNIP4 53028 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 22676419 22676434 22676427 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 51139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 23299933 23300259 23300096 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 572360 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 23946258 23946539 23946320 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 637634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 24975738 24976056 24975826 Y DHX15,CCDC149,CCDC149 CCDC149 NA NA NA NA CCDC149 3770 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chr4 24980412 24980568 24980490 Y DHX15,CCDC149,CCDC149 CCDC149 NA NA NA NA CCDC149 586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr4 26090058 26090547 26090383 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 72530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 26198985 26199293 26199235 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 35908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 26214365 26214515 26214442 Y NA NA RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 51288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 26219568 26220289 26219918 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 56491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 26275280 26275493 26275371 Y RBPJ,RBPJ NA NA NA NA NA RBPJ 112203 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr4 26289394 26289659 26289610 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 126317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 26290055 26290515 26290382 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 126978 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 26994323 26994529 26994430 Y STIM2 NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 134102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 27362567 27362929 27362697 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 502346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 37759790 37760114 37760015 Y RELL1,TBC1D1 NA RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM2 66141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr4 37887233 37887434 37887366 Y TBC1D1 TBC1D1 NA NA NA NA TBC1D1 3274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38069769 38070051 38069856 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 109713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38080568 38081008 38080843 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38496068 38496343 38496206 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 167474 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38530760 38531092 38530874 Y TLR6,TLR1,KLF3 NA FLJ13197,KLF3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF3 132725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38674773 38675062 38674906 Y KLF3 KLF3 NA NA NA NA KLF3 10956 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38697805 38697826 38697816 Y NA KLF3 NA NA NA NA KLF3 33988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38836297 38836387 38836342 Y NA TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 20051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 1315 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chr4 39354929 39355678 39355646 Y NA RFC1 WDR19 IMR90 Hi-C 24141950 RFC1 10317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 40533771 40533999 40533881 Y NA NA NA NA NA NA RBM47 96893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 40556143 40556529 40556261 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 74363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr4 40564357 40564512 40564451 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 66380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 40578690 40579499 40579160 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 51393 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 40674578 40674731 40674666 Y RBM47 RBM47 RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 43686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 41130759 41131325 41130803 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 85406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 41936193 41936441 41936268 Y TMEM33 TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 1056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 44727575 44727855 44727678 Y KCTD8,GNPDA2 GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 48130124 48130516 48130320 Y TXK NA NA NA NA NA TEC 139365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 48131569 48131907 48131778 Y TXK NA NA NA NA NA TEC 137974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 53890542 53890886 53890882 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 164085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 54780399 54780822 54780654 Y CHIC2 NA LNX1,SCFD2,PDGFRA,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 148035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 54825725 54826062 54825894 Y GSX2 NA RPL21P44,SCFD2,LNX1,FIP1L1,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 102795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 55080110 55080272 55080192 Y CHIC2 PDGFRA SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 12992 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 55379564 55379871 55379718 Y NA NA SRD5A3 IMR90 Hi-C 24141950 KIT 142214 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 56813479 56813845 56813653 Y NA CEP135 NA NA NA NA CEP135 442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 62769366 62769586 62769476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 129798 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 43336 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA STAP1 65216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 68538149 68538306 68538215 Y NA UBA6,UBA6-AS1 NA NA NA NA UBA6 26591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 10425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 74597645 74598094 74597764 Y ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 6129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 74600882 74601361 74601097 Y ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL8 2862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 76487136 76487403 76487267 Y NA THAP6,RCHY1 NA NA NA NA RCHY1 49162 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 76623783 76624179 76623867 Y RCHY1,G3BP2,G3BP2 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 23530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 76750745 76750859 76750802 Y NA NA NA NA NA NA USO1 102968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 78014068 78014466 78014356 Y CCNG2 CCNI SHROOM3,CCNG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCNI 18910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 78715844 78716194 78716176 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 22575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 79521197 79521480 79521236 Y NA LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 43577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 79579251 79579554 79579361 Y BMP2K LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 14194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 80131303 80131759 80131432 Y NA NA NA NA NA NA LINC01088 240401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 80900549 80900754 80900650 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 143854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 80979830 80980309 80980136 Y ANTXR2 NA NA NA NA NA ANTXR2 64299 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.17585392971746 chr4 81048415 81048773 81048660 Y ANTXR2,PRDM8 ANTXR2 PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR2 3807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 84033440 84033690 84033502 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 22538 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr4 84130014 84130163 84130089 Y NA NA COPS4,COQ2,PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 73786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 85820969 85821357 85821323 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 64181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 85868944 85869302 85869263 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 16236 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 87177601 87177837 87177745 Y MAPK10,MAPK10 NA NA NA NA NA MAPK10 335447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 87615730 87616123 87615813 Y PTPN13,SLC10A6 NA NA NA NA NA PTPN13 102262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 87626625 87626818 87626720 Y PTPN13 NA NA NA NA NA PTPN13 113157 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 87882810 87883321 87882982 Y KLHL8,AFF1,AFF1 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 13534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 87894121 87894618 87894307 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 24845 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 88038562 88038726 88038648 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 120740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 88441557 88441872 88441810 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 99823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 88943044 88943294 88943160 Y NA SPP1,RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA PKD2 16224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 89099576 89099877 89099636 Y HERC6,HERC5 NA PKD2 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG2 50597 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 90439232 90439404 90439379 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 318062 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 696530 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 96345355 96345692 96345542 Y UNC5C NA NA NA NA NA UNC5C 122665 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 96466701 96466894 96466857 Y NA UNC5C NA NA NA NA UNC5C 1463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 99124941 99125231 99125094 Y RAP1GDS1 NA RAP1GDS1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1GDS1 55304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 99853675 99854028 99853903 Y EIF4E,EIF4E EIF4E NA NA NA NA EIF4E 3887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 100743158 100743523 100743354 Y RG9MTD2,H2AFZ,DDIT4L,DAPP1 DAPP1 NA NA NA NA DAPP1 7168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 101269712 101269900 101269796 Y LAMTOR3 NA NA NA NA NA DDIT4L 159773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 102093748 102093766 102093752 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 173171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 102173679 102174077 102173884 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 92860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 102243269 102243535 102243491 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 23402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 103360468 103360812 103360586 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 103937289 103937350 103937320 Y NA SLC9B1 NA NA NA NA SLC9B1 1546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 104302340 104302484 104302413 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 184774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 106188694 106188879 106188779 Y NA NA NA NA NA NA TET2 123662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 106383790 106383988 106383871 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 9250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 107597706 107597974 107597859 Y AIMP1 NA NA NA NA NA TBCK 357054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 109044329 109044618 109044592 Y LEF1,LEF1 LEF1-AS1 NA NA NA NA LEF1-AS1 42063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 109047956 109048357 109048341 Y NA LEF1-AS1 NA NA NA NA LEF1-AS1 38324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 110320309 110320596 110320490 Y LRIT3 SEC24B,SEC24B-AS1 OSTC,AGXT2L1,COL25A1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 32332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 110361567 110361723 110361645 Y NA SEC24B,SEC24B-AS1 NA NA NA NA SEC24B-AS1 8594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 110604562 110604565 110604563 Y NA CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 18174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA RP11-115A14.1 21210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 111553099 111553258 111553149 Y PITX2,PITX2 PITX2 NA NA NA NA PITX2 8021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 331434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 113209682 113209927 113209792 Y LARP7,LARP7,C4orf21,AP1AR,TIFA,ALPK1 ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 4623 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 113547591 113547910 113547748 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA LARP7 8210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 113668186 113668486 113668348 Y NA RP11-119H12.1,RPL7AP30 NA NA NA NA RP11-119H12.1 10358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 114894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 114104327 114104616 114104364 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RNU1-138P 234863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 49946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 114711770 114711906 114711870 Y NA CAMK2D ANK2,CAMK2D IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2D 30687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 114758655 114758927 114758807 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 77572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 1677259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 119857071 119857382 119857110 Y SYNPO2 NA NA NA NA NA SEC24D 99233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 120962747 120963053 120963021 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NA NA NA NA RP11-679C8.2 23060 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA NUDT6 48967 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 124521229 124521410 124521292 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 205279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 124538169 124538584 124538401 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 222219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 36151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 129305373 129305758 129305535 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 97389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 129847015 129847068 129847042 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 165404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 130505538 130505741 130505620 Y C4orf33 NA NA NA NA NA SCLT1 492774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 139250529 139250714 139250650 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 89026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 139313832 139314247 139314105 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 152329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 139326439 139326794 139326543 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 164936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 139814320 139814623 139814472 Y NA NA SLC7A11,LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 120320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140110155 140110499 140110369 Y CCRN4L,ELF2 ELF2 ELF2,NAA15,C4orf49,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 13783 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140737173 140737338 140737263 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 152251 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr4 140886001 140886373 140886187 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 186965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 140891718 140892054 140891918 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 181284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141014112 141014221 141014167 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141020500 141020888 141020694 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 52450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141071159 141071540 141071326 Y NA MAML3 NA NA NA NA MAML3 1798 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 142026323 142026393 142026368 Y RNF150 NA NA NA NA NA RNF150 105638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 142347756 142348088 142347922 Y NA NA NA NA NA NA ZNF330 207715 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 143186679 143186969 143186824 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 579616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 143337797 143338156 143337961 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 428429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 144280232 144280410 144280287 Y USP38,SMARCA5,GAB1 GAB1 NA NA NA NA GAB1 24317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 146815736 146815927 146815832 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 41860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 147196519 147196807 147196609 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 101682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 148677279 148677473 148677309 Y NA ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 26065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 151769111 151769151 151769130 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 165728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 152406480 152406763 152406721 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 78112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA MIR4453 189856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 153599392 153599746 153599719 Y FBXW7,ARFIP1,TMEM154 TMEM154 NA NA NA NA TMEM154 75 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA TLR2 72171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 154577062 154577591 154577315 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 43061 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 39810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 154584497 154584872 154584724 Y NA TLR2 NA NA NA NA TLR2 35780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 156388113 156388229 156388171 Y NA NA GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 91991 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 157894352 157894618 157894485 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 3806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 159740045 159740169 159740127 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 51755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 159746098 159746434 159746194 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 57808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 159861509 159861775 159861668 Y PPID,FNIP2,RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 173219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 160199508 160199928 160199727 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 511218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 164085826 164086168 164085931 Y NAF1 NA NA NA NA NA NAF1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 164414222 164414415 164414319 Y TKTL2,C4orf43 NA NA NA NA NA NPY1R 150238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 200219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 166298963 166299290 166298992 Y NA CPE NA NA NA NA CPE 18617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 166315734 166315907 166315821 Y NA CPE NA NA NA NA CPE 35388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 166966668 166966941 166966822 Y NA NA NA NA NA NA CPE 686322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 169424974 169425451 169425373 Y DDX60,DDX60L DDX60L NA NA NA NA DDX60L 31486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 170788484 170788546 170788528 Y MFAP3L NA NA NA NA NA C4orf27 111380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 174106562 174106852 174106704 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 17759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 175262329 175262358 175262344 Y NA NA NA NA NA NA FBXO8 58914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 175525435 175525643 175525538 Y CEP44 NA NA NA NA NA FBXO8 322020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 178362238 178362457 178362307 Y NA AGA NA NA NA NA AGA 581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 178469887 178470022 178469954 Y NA NA NA NA NA NA AGA 108230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 180979740 180980372 180979835 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2084030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 183730445 183730610 183730498 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 106479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 184376829 184376946 184376888 Y CLDN24 CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 13085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 184387095 184387281 184387201 Y C4orf41,CDKN2AIP CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 23351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr4 184391190 184391347 184391268 Y CDKN2AIP CDKN2AIP,ING2 CDKN2AIP IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 27446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 277975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 185303433 185303616 185303580 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 90118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr4 185455694 185456195 185455840 Y IRF2 NA IRF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2 61960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 185573558 185573933 185573744 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 4895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 186730607 186731122 186730955 Y NA NA NA NA NA NA TLR3 257184 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr4 187679181 187679543 187679362 Y NA FAT1 LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 33305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 366173 366499 366337 Y NA NA NA NA NA NA AHRR 63882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 372694 372970 372922 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 68288 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.38782877834798 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.2480957675436 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 448605 448866 448667 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 486422 486571 486496 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA CTD-2228K2.5 15209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP NA NA NA NA NA CEP72 61186 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 1110480 1111164 1110500 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 330 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 1498250 1498484 1498297 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 23608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 6373242 6373393 6373318 Y NA MED10 NA NA NA NA MED10 3314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.45531995132622 chr5 7250846 7251033 7250922 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 486842 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 9681641 9681655 9681648 Y NA NA TAS2R1 IMR90 Hi-C 24141950 SNHG18 137329 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 10578225 10578424 10578340 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 15783 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 10607952 10608169 10608061 Y MARCH6,ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 45510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 10632197 10632744 10632366 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 69755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 14582921 14583040 14582953 Y FAM105A FAM105A NA NA NA NA FAM105A 3037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 14593853 14594225 14594048 Y NA FAM105A NA NA NA NA FAM105A 13969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 14600164 14600334 14600249 Y FAM105B FAM105A NA NA NA NA FAM105A 20280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 14809867 14810211 14810035 Y FAM105A,FAM105B RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 13358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 16855522 16855861 16855692 Y NA CTB-55B8.1 NA NA NA NA CTB-55B8.1 44889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 17118695 17119132 17119047 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 54988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 17255490 17256325 17255691 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 87400 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 17317191 17317354 17317270 Y NA RN7SKP133 BASP1,LOC285696,LOC401177 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RN7SKP133 26371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 18403562 18403676 18403619 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2023M8.1 340606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 24272966 24273308 24273185 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 536282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr5 34037436 34037722 34037670 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 31216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA NA NA NA NA NA UGT3A2 209576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 32421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 38672702 38672722 38672712 Y NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 66246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 39177066 39177486 39177327 Y RICTOR NA NA NA NA NA FYB 95144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 39469449 39469725 39469587 Y NA C9,DAB2 DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 9047 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 40386604 40386824 40386669 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 290776 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 40405418 40405726 40405516 Y PTGER4,CARD6 NA NA NA NA NA PTGER4 271874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 40486540 40486993 40486708 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 190607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 40487144 40487367 40487248 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 190233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 64299 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.97338041078275 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 43009341 43009652 43009530 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 6879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 43010298 43010802 43010620 Y GHR,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 5729 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 4127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 44943814 44943963 44943889 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 136787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 45492621 45492641 45492631 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 685594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 49653216 49653308 49653301 Y PARP8 NA NA NA NA NA EMB 83774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 49660016 49660402 49660209 Y NA NA NA NA NA NA EMB 76680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 52155124 52155267 52155195 Y NA CTD-2207L17.1 NA NA NA NA CTD-2207L17.1 42471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 52745223 52745242 52745233 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS4 109221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2081C10.1 180211 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 54033914 54034212 54034128 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 222325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 55711184 55711637 55711363 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 87262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 55969082 55969325 55969253 Y MAP3K1 NA MAP3K1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K1 140076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 57840171 57840400 57840271 Y GAPT NA NA NA NA NA GAPT 54909 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 1114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 26296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 58426345 58426806 58426483 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 92757 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 532882 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 59041159 59041490 59041319 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 707571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 59070253 59070532 59070393 Y PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 736665 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 59171284 59171310 59171298 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 644637 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 632058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 60571773 60571988 60571884 Y ZSWIM6 NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 54112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 60736184 60736544 60736365 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 50486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA CENPK 145831 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 64796548 64796879 64796719 Y PPWD1,CENPK NA NA NA NA NA CENPK 60119 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 65878342 65878574 65878477 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 11602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr5 68823946 68824105 68824026 Y NA OCLN NA NA NA NA OCLN 37827 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 71790679 71790815 71790747 Y NA ZNF366 NA NA NA NA ZNF366 10739 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 71800879 71801269 71800999 Y NA ZNF366 NA NA NA NA ZNF366 285 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 72218346 72218584 72218427 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 31224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 73114160 73114455 73114328 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 254649 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 76527343 76527617 76527432 Y S100Z PDE8B NA NA NA NA PDE8B 23069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 77231954 77232009 77231997 Y NA NA OTP IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 69350 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 77589539 77589820 77589680 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 118627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 78204289 78204572 78204406 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 75338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 78429598 78429944 78429771 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 99917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 78857059 78857243 78857149 Y PAPD4 HOMER1,PAPD4 NA NA NA NA PAPD4 48700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 79768084 79768333 79768119 Y NA FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24 NA NA NA NA FAM151B 13455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 43441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 NA NA NA NA NA ZCCHC9 112242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 80989989 80990372 80990282 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 55244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 81045433 81045821 81045530 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr5 81148608 81149026 81148707 Y SSBP2 CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 81469981 81470152 81470091 Y NA NA NA NA NA NA RPS23 102244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 82602437 82602831 82602659 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 230755 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 82664842 82665072 82664989 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 293160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 398188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA NA NA NA NA NA TMEM167A 398492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 87967371 87967797 87967486 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 209348 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88030090 88030417 88030349 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 146728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88120689 88121105 88120942 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 56040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88125046 88125161 88125149 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 51984 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88177466 88177636 88177509 Y NA MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88567403 88567611 88567458 Y NA NA MEF2C IMR90 Hi-C 24141950 MEF2C 369481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 88753859 88754177 88753972 Y NA NA NA NA NA NA MEF2C 555937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 90458384 90458975 90458686 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA LUCAT1 149244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 90514939 90515247 90515096 Y ARRDC3 NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LUCAT1 92972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 90765478 90765836 90765795 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 88302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 93323557 93323685 93323621 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 121719 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 93769266 93769440 93769342 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD32 182612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 95178953 95179190 95179087 Y GLRX,ELL2 GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 186609 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 95633075 95633361 95633245 Y GLRX NA ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 225610 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr5 100113377 100113868 100113542 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 123102 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 100177018 100177251 100177133 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 59719 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 100213080 100213240 100213164 Y ST8SIA4,ST8SIA4 ST8SIA4 NA NA NA NA ST8SIA4 23730 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 102544271 102544391 102544342 Y NA C5orf30 NA NA NA NA C5orf30 48012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 103325138 103325355 103325247 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 428644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 108071450 108071807 108071776 Y FER FER FER IMR90 Hi-C 24141950 FER 9716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 108170397 108170414 108170406 Y FER NA NA NA NA NA FER 88874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 108992541 108993001 108992730 Y MAN2A1 MAN2A1 NA NA NA NA MAN2A1 30066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 109763228 109763435 109763276 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 308402 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 110298484 110298499 110298492 Y NA NA SLC25A46,TSLP IMR90 Hi-C 24141950 TSLP 105261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 111018976 111019194 111019085 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 172688 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 111110231 111110436 111110341 Y NA NA NA NA NA NA STARD4 263943 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 111181854 111182145 111181999 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 312078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 111266983 111267229 111266991 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 226994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 111734624 111734920 111734701 Y APC EPB41L4A NA NA NA NA EPB41L4A 18093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 112585948 112586168 112586156 Y MCC NA NA NA NA NA MCC 236359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 112629156 112629538 112629463 Y NA NA NA NA NA NA MCC 192989 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 112972519 112972723 112972621 Y NA NA NA NA NA NA YTHDC2 125139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 113760627 113760889 113760758 Y NA NA NA NA NA NA KCNN2 65985 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 115236990 115237113 115237051 Y NA NA NA NA NA NA ATG12 61435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 117225308 117225657 117225375 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP2 1081834 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118605337 118605637 118605457 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 2950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 118609146 118609633 118609193 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 6759 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 118627745 118627943 118627845 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 25358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118664608 118664762 118664738 Y DMXL1,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 62221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118670685 118671156 118670901 Y TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 68298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 118678067 118678220 118678144 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 75680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118698549 118698602 118698556 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 87536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118703348 118703546 118703439 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 82592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 118725501 118725774 118725509 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA HSD17B4 60364 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 119593850 119594100 119594016 Y NA NA NA NA NA NA CTC-507E12.1 579958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 121402997 121403353 121403172 Y LOX,LOX LOX NA NA NA NA LOX 8627 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 122765811 122765999 122765906 Y NA CEP120 CEP120 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEP120 8525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126094157 126094598 126094339 Y LMNB1,LMNB1 RP11-434D11.4,LMNB1 LMNB1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-434D11.4 15580 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126199771 126199925 126199848 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 89456 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126307935 126308247 126308163 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 56253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126308404 126308764 126308593 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 55736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 129387025 129387306 129387155 Y CHSY3 NA NA NA NA NA CHSY3 148860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 130592761 130592914 130592850 Y NA CDC42SE2 CDC42SE2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42SE2 13575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 130824249 130824445 130824350 Y FNIP1 NA NA NA NA NA RAPGEF6 144484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr5 131641002 131641297 131641050 Y NA SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 11994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 131774835 131775712 131775188 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.5 14429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 131802496 131802987 131802660 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 3748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 131810095 131810374 131810235 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 3360 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 132557094 132557415 132557255 Y NA NA NA NA NA NA HSPA4 171440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 133330374 133330645 133330542 Y NA C5orf15,VDAC1 C5orf15 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 8179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA MIR3661 18431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 133880902 133881116 133881009 Y PCBD2,CDKL3,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 101363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 134602658 134602833 134602747 Y NA NA H2AFY,LOC340073,CATSPER3 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 130771 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 134791969 134792408 134792068 Y H2AFY TIFAB H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 TIFAB 5880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr5 135943812 135943901 135943857 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 247416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA HNRNPA0 NA NA NA NA HNRNPA0 11776 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 137794140 137794412 137794334 Y FAM13B,NME5,FAM53C,LRRTM2,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 4767 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 138436608 138436808 138436708 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 170633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 21887 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA,IGIP NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 139629538 139629745 139629587 Y NA NA NA NA NA NA PFDN1 50961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 139988781 139989053 139988891 Y HBEGF,ANKHD1,EIF4EBP3,SRA1,APBB3,SLC35A4,CD14,CD14 SLC35A4,APBB3,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655 NA NA NA NA APBB3 17444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 140983787 140984197 140984031 Y PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 12425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 141394614 141394984 141394650 Y PCDH12 PCDH12,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 4008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 141395225 141395941 141395831 Y DIAPH1,KIAA0141,PCDH12,GNPDA1 PCDH12,GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 4619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 141992944 141993173 141993092 Y FGF1,FGF1 NA NA NA NA NA ARHGAP26 154776 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142042808 142043187 142042997 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 104762 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142138072 142138365 142138219 Y ARHGAP26 ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 9584 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 142177810 142178601 142178297 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 29861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr5 142182965 142183820 142183151 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 35016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142356404 142356953 142356617 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 208455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142384131 142384662 142384553 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 236182 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142415813 142416201 142415818 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 267864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 142819954 142820205 142820015 Y NA NR3C1 NA NA NA NA NR3C1 6877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 148187476 148187823 148187533 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 16333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 148540754 148540865 148540805 Y ABLIM3 ABLIM3 AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 21708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 148738164 148738422 148738235 Y PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L NA NA NA NA PCYOX1L 2594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149172151 149172518 149172335 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1B 64290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149319494 149320025 149319793 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 18275 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 149445526 149445798 149445671 Y SLC26A2,HMGXB3,CD74,CD74 CSF1R NA NA NA NA CSF1R 45137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150142965 150143377 150143063 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 DCTN4,C5orf62 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DCTN4 6294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150150667 150150946 150150807 Y NA DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 13996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA NA NA NA NA NA TNIP1 67497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150468607 150468833 150468706 Y RBM22,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 2305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150474739 150475397 150475230 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 3601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150593680 150594043 150593885 Y DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 3969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150594261 150594451 150594361 Y TNIP1,CCDC69,ANXA6 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 4550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 150625199 150625215 150625207 Y NA GM2A,CCDC69 ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC69 23493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr5 151307213 151307514 151307357 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 157120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 151470527 151470867 151470697 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 320434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 151801718 151801905 151801770 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 651625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 151943818 151943842 151943829 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 793725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL4 69987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 157284724 157285025 157284835 Y NIPAL4,ADAM19 CLINT1 LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr5 158632432 158632664 158632544 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 2397 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 159720972 159721325 159721087 Y PWWP2A,SLU7,CCNJL RP11-34P1.2,CCNJL FABP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-34P1.2 37712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 160754027 160754417 160754191 Y NA NA NA NA NA NA GABRB2 219633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 162507124 162507145 162507136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 355187 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 163767017 163767182 163767164 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 838897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 164442746 164442751 164442749 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 1011565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 164615750 164616137 164615944 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 838179 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr5 166427113 166427459 166427286 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 972797 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 167212148 167212412 167212280 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 504244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 169082703 169082936 169082819 Y DOCK2 DOCK2 NA NA NA NA DOCK2 20452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 169083177 169083346 169083258 Y DOCK2 DOCK2 NA NA NA NA DOCK2 20926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 169301637 169301901 169301769 Y NA NA NA NA NA NA DOCK2 239386 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 169308907 169309212 169309070 Y DOCK2,LCP2 NA NA NA NA NA DOCK2 246656 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 169699018 169699635 169699461 Y KCNMB1,LCP2 LCP2 NA NA NA NA LCP2 23596 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 169717491 169717845 169717740 Y NA LCP2 NA NA NA NA LCP2 5386 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 169727677 169727933 169727842 Y KCNMB1,LCP2 LCP2 NA NA NA NA LCP2 4446 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 169733349 169733836 169733608 Y NA LCP2,KCNIP1 LCP2,KCNIP1,C5orf58 IMR90 Hi-C 24141950 LCP2 10118 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 170289548 170289859 170289780 Y NA RANBP17 NA NA NA NA RANBP17 2674 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 171298269 171298393 171298371 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 133484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 171388246 171388386 171388315 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 43491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 171560333 171560981 171560496 Y UBTD2,STK10 NA NA NA NA NA STK10 52409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 171839597 171840252 171839919 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 39275 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr5 172202171 172203025 172202666 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 5973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 172257827 172258390 172258174 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 172262088 172262814 172262509 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 2810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 172922247 172922290 172922269 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 119373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 173199242 173199802 173199475 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 113481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 173205115 173205307 173205218 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 107976 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 175098063 175098392 175098192 Y HRH2 RN7SKP148,HRH2 NA NA NA NA HRH2 15030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 175111905 175112078 175111992 Y NA HRH2 NA NA NA NA HRH2 28872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 175116445 175116962 175116612 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 33412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 175118111 175118311 175118228 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 35078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176337374 176337559 176337468 Y NA HK3 NA NA NA NA HK3 13041 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 HK3 NA NA NA NA HK3 35229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176361465 176361828 176361647 Y NA HK3 NA NA NA NA HK3 37132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176421508 176421945 176421807 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 25689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 176422952 176423155 176423071 Y HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 24479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176782864 176783054 176782988 Y NA MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 26 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr5 176855088 176855271 176855220 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 16175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DOK3,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 177815431 177815872 177815717 Y CLK4 NA NA NA NA NA HNRNPAB 185923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr5 177904382 177904800 177904603 Y NA NA NA NA NA NA COL23A1 110756 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 13.5731840377613 chr5 177910614 177910888 177910852 Y AGXT2L2,COL23A1,CLK4 NA NA NA NA NA COL23A1 104668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 178729378 178729778 178729559 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 40653 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 179453285 179453637 179453562 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 43481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 179476258 179476557 179476475 Y MAML1,LTC4S RNF130 NA NA NA NA RNF130 20561 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 179496781 179497164 179497079 Y HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA RNF130 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 179604412 179604725 179604569 Y RASGEF1C RASGEF1C NA NA NA NA RASGEF1C 29428 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA CTB-129O4.1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 298712 298948 298810 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 9082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 389797 389927 389882 Y NA IRF4 NA NA NA NA IRF4 58 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA IRF4 82949 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 2763022 2763072 2763047 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 2790944 2791090 2791014 Y NA WRNIP1,SERPINB1 SERPINB1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 27296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 9108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 3685850 3685982 3685964 Y NA NA SLC22A23,PSMG4 IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 64278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 4447290 4447339 4447314 Y NA NA CDYL IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 257054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 4603647 4603982 4603794 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 100411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 4778036 4778769 4778420 Y CDYL NA NA NA NA NA CDYL 73643 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 5513756 5514022 5513872 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 254479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 5671479 5671687 5671530 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 412202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 5991588 5991674 5991631 Y NRN1 NA NA NA NA NA F13A1 327572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6407628 6407920 6407729 Y LY86 NA NA NA NA NA F13A1 88382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 6469397 6469651 6469485 Y LY86 NA NA NA NA NA LY86 116690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6592115 6592710 6592545 Y LY86 LY86 NA NA NA NA LY86 5774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA LY86 71337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6660040 6660205 6660116 Y NA NA NA NA NA NA LY86 73699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 100799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 6702168 6702420 6702249 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 115827 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 6712780 6713068 6712936 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 126439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6713207 6713532 6713382 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 126866 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 6717376 6717439 6717378 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 131035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 6718281 6718608 6718369 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,DSP,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 131940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 163743 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 6807115 6807400 6807321 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 220774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6876146 6876412 6876208 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 229418 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6881907 6882296 6882232 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 223534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr6 6886373 6886682 6886449 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6890950 6891223 6891087 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 214607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 6928196 6928339 6928298 Y RREB1,RREB1 NA NA NA NA NA RREB1 177491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 6940785 6941121 6940953 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 164709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 7112981 7113125 7113000 Y RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 7151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 7480187 7480515 7480351 Y DSP NA DSP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CAGE1 92211 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7591248 7591486 7591394 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 2816 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 7915829 7915944 7915887 Y SNRNP48 NA NA NA NA NA TXNDC5 108702 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 9156165 9156451 9156310 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 722371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 10084518 10084797 10084586 Y NA NA LOC100506207,LOC100130275,TFAP2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 333095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 10719904 10720278 10720060 Y NA PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA TMEM14C 870 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 10970926 10971179 10971053 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 71368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 11170049 11170298 11170253 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 127502 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 11331718 11332104 11332092 Y NA NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 48477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 11350374 11351151 11350648 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 29430 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 11414036 11414330 11414188 Y TMEM170B,LOC221710,NEDD9 NEDD9 NEDD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 33455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 11552792 11552815 11552805 Y NEDD9,HIVEP1,TMEM170B TMEM170B NA NA NA NA TMEM170B 16854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 11732067 11732789 11732417 Y NEDD9,NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 196129 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 13261181 13261379 13261243 Y NA RNU1-11P NA NA NA NA RNU1-11P 48893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 13454706 13455038 13454979 Y RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 30856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr6 14638705 14639298 14639002 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 522833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14657070 14657479 14657115 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 541198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr6 14659204 14659944 14659341 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 543332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14661271 14661715 14661503 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 545399 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14721191 14721587 14721406 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 522940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 14728163 14728500 14728264 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 516027 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14732820 14733791 14733202 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 510736 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14865991 14866350 14866175 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 378177 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14910842 14911169 14911097 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 333358 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr6 14922104 14922958 14922362 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 321569 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 14929648 14930020 14929845 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 314507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 15063756 15063967 15063834 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 180560 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 15066743 15067555 15067031 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 176972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 15313668 15313748 15313709 Y DTNBP1,JARID2 NA NA NA NA NA JARID2 69141 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2 121083 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 15535179 15535578 15535319 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 125711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 15901378 15901471 15901425 Y DTNBP1,MYLIP NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 225885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 16690098 16690263 16690180 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 69106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 16729304 16729629 16729584 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 29740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 17447404 17447614 17447509 Y NA NA NA NA NA NA CAP2 55957 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 17712711 17712926 17712817 Y NA NUP153 FAM8A1,NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 8055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 18263099 18263635 18263391 Y RNF144B,DEK DEK NA NA NA NA DEK 45 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 18341418 18341503 18341461 Y NA RNF144B RNF144B MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF144B 25276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 18412355 18412775 18412483 Y NA RNF144B NA NA NA NA RNF144B 45576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 19147287 19147423 19147355 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 655560 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 20174199 20174610 20174442 Y MBOAT1 MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 36060 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 24659946 24660207 24660006 Y TDP2,C6orf62 TDP2,ACOT13 NA NA NA NA TDP2 5054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 24743523 24743742 24743610 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24459 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 24951869 24952437 24952321 Y ALDH5A1,KIAA0319,KIAA0319,TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 22210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 25006784 25007291 25007025 Y TDP2,C6orf62 PPIAP29,FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 32137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 25007534 25007864 25007632 Y TDP2,C6orf62 PPIAP29,FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 32374 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 54475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 25168126 25168486 25168327 Y C6orf62 NA CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 108820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 25179629 25179893 25179701 Y C6orf62 NA CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 97413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.07699250267406 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 26034352 26034599 26034546 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H2AB 2556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr6 26283996 26284379 26284279 Y NA HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H4H 234 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 15427 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 13643 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 27203038 27203420 27203229 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 26015 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27416333 27416557 27416445 Y NA ZNF184 NA NA NA NA ZNF184 22340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27637652 27637706 27637685 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 27780866 27781094 27780996 Y ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL NA NA NA NA HIST1H2BM 44 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 27838810 27838848 27838829 Y NA HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H4L 441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 28180543 28180884 28180590 Y NA ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 44127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN3 99262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 123961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 28885422 28885544 28885424 Y NA HCG14,TRIM27 NA NA NA NA TRIM27 4222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 30477053 30477329 30477202 Y PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1 NA NA NA NA HLA-E 21809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.07699250267406 chr6 31761868 31762215 31762042 Y LY6G5C VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52 NA NA NA NA VARS 138 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr6 32577297 32577935 32577770 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DQA1 16021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 32986611 32987175 32986859 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 11222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 12219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 NA NA NA NA NA LEMD2 117255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 33872922 33873175 33873050 Y PHF1 NA NA NA NA NA LEMD2 118009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 34150537 34150894 34150814 Y HMGA1 CYCSP55 C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYCSP55 34322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 34631608 34631780 34631736 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 30856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 34663389 34663600 34663462 Y NA C6orf106,RP3-375P9.2 NA NA NA NA C6orf106 753 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 35595279 35595514 35595405 Y FKBP5,FKBP5 NA NA NA NA NA RP3-340B19.2 73629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 35685740 35686068 35685867 Y NA FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 8292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 35693475 35694027 35693643 Y PPARD,FKBP5,FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 NA NA NA NA NA BRPF3 75780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 36277211 36277557 36277384 Y C6orf222 NA NA NA NA NA ETV7 76607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 ETV7,KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 36399958 36400295 36400126 Y NA ETV7,KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 8249 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 36821118 36821514 36821315 Y NA CPNE5,C6orf89,PPIL1 CPNE5 IMR90 Hi-C 24141950 CPNE5 15340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 37018897 37019476 37019424 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 FGD2 CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 FGD2 47475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 37457670 37457932 37457800 Y FTSJD2 CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 7766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41153851 41154204 41154120 Y TREML4,TREM1,NFYA TREM2,TREML2 NA NA NA NA TREML2 12728 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41239404 41240112 41239982 Y NFYA,TREML1,TFEB,TREML2,TREML4,TREM1 TREM1 NA NA NA NA TREM1 12345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA TREM1 89271 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41506487 41506686 41506561 Y NFYA,TREML4,TREM1,TFEB FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 5478 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41608113 41608435 41608156 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 93562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 41675584 41675662 41675651 Y TREM1,TFEB TFEB NA NA NA NA TFEB 26335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 41938271 41938604 41938519 Y TFEB NA NA NA NA NA BYSL 51345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42283764 42284050 42283900 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 100161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42300744 42300888 42300812 Y UBR2 NA NA NA NA NA TRERF1 116901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr6 42301407 42301678 42301543 Y NA NA NA NA NA NA TRERF1 116111 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42361929 42362135 42362048 Y NA NA NA NA NA NA TRERF1 55654 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 42371710 42371838 42371791 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 45951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 3619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA ATP6V0CP3,TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 44628436 44628745 44628591 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 275174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 44894432 44894504 44894470 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 449186 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43974 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45299904 45300369 45300004 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45306825 45307168 45307007 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 36522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 45326054 45326100 45326076 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 17590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 45404651 45404813 45404715 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 60961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 47004647 47005009 47004828 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 270632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 47074438 47074572 47074520 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF21 201069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 NA NA NA NA NA CD2AP 175280 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 47831581 47831627 47831604 Y NA NA NA NA NA NA CD2AP 388056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 49302208 49302375 49302292 Y NA NA NA NA NA NA MUT 126529 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 52241741 52241853 52241800 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 17522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 52255288 52255470 52255373 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 27636 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 52416960 52417092 52417044 Y GSTA5,PAQR8 TRAM2 NA NA NA NA TRAM2 22621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 53199994 53200715 53200310 Y FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 11232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr6 53489073 53489386 53489175 Y NA GCLC KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 9305 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 53838542 53838554 53838548 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 181247 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 54056382 54056519 54056473 Y MLIP NA NA NA NA NA LRRC1 399087 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 56103224 56103241 56103234 Y COL21A1 NA NA NA NA NA BEND6 714532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BEND6 5740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 57216540 57216887 57216780 Y NA PRIM2 NA NA NA NA PRIM2 38937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 57267458 57267955 57267680 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 89855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 65227331 65227644 65227620 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 883606 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 66637182 66637579 66637401 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2293457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 68606503 68606727 68606631 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 736532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 69630519 69630829 69630559 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 287260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 69830081 69830467 69830149 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 486822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 70505414 70505608 70505498 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 72010402 72010735 72010435 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 13896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 72051718 72051897 72051837 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 55212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr6 73330314 73330844 73330342 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr6 73333516 73333763 73333694 Y KCNQ5 KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 3996 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 73335940 73336259 73335964 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 6420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 73354930 73355043 73354987 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 73355182 73355469 73355282 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 73378236 73378609 73378395 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 48716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 73504067 73504420 73504243 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ5 174547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 73813476 73813625 73813551 Y KCNQ5 NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 157313 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 73861458 73861626 73861542 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 109312 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 73975471 73975797 73975634 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 4533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MB21D1,MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 60647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 74307690 74308056 74307857 Y KHDC1 NA NA NA NA NA SLC17A5 53822 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 75997264 75997445 75997280 Y NA COX7A2,TMEM30A NA NA NA NA TMEM30A 4580 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 85705228 85705597 85705413 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 452212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 85834833 85835082 85834958 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 322727 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 86174491 86174911 86174693 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 16682 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 88160287 88160298 88160293 Y NA C6orf165,SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 18043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 88183289 88183642 88183572 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 4948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 88466651 88466901 88466810 Y AKIRIN2 NA RNGTT,AKIRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 56724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 89744158 89744669 89744587 Y UBE2J1,RRAGD,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 43801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 89758081 89758394 89758222 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 30076 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 90596283 90596734 90596349 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 58670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 93036003 93036032 93036018 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1741239 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 97681036 97681361 97681334 Y NA MMS22L NA NA NA NA MMS22L 47732 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 99276652 99276809 99276736 Y POU3F2 NA NA NA NA NA FBXL4 117040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 101211686 101211775 101211752 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 115473 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 104320591 104320783 104320687 Y NA NA NA NA NA NA HACE1 985011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 105061628 105062008 105061974 Y LIN28B,HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 243786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 105477997 105478373 105478087 Y NA NA NA NA NA NA LIN28B 75074 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 106258484 106259193 106259052 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 273002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 106321206 106321605 106321290 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 210590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 106442094 106442641 106442261 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2 NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 109100819 109101213 109100913 Y FOXO3 NA NA NA NA NA ARMC2 66406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 109158885 109159026 109158956 Y NA ARMC2 NR2E1,FOXO3,LINC00222,ARMC2,SESN1,LACE1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 8593 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 109288163 109288636 109288487 Y FOXO3,SMPD2,MICAL1 ARMC2-AS1 NA NA NA NA ARMC2-AS1 44857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 111180623 111180918 111180752 Y CDK19,SLC16A10,AMD1,AMD1 CDK19,AMD1 CDK19,AMD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMD1 13055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 111194680 111194889 111194745 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 AMD1 NA NA NA NA AMD1 707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 112116190 112116657 112116390 Y NA NA NA NA NA NA FYN 75998 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 113807395 113807724 113807542 Y MARCKS NA LOC285758,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 368817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 113950596 113950759 113950671 Y MARCKS NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 225782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 113983357 113983757 113983497 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 192784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 114015292 114015315 114015304 Y NA NA MARCKS MCF7 ChIA-PET 22265404 MARCKS 161226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 332115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 116476913 116476984 116476947 Y TSPYL4 NA NA NA NA NA NT5DC1 56901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 117003694 117003845 117003770 Y TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA KPNA5 3344 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 119661427 119661533 119661480 Y MAN1A1 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 7393 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA GJA1 357726 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 121399720 121399938 121399829 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 354900 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1 NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 125599408 125599745 125599577 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 21537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 130004742 130004922 130004817 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 24448 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr6 130008447 130008678 130008538 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 20692 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 331043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 134085872 134085913 134085879 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 185395 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 134609640 134610343 134609803 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 26907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 135410048 135410230 135410163 Y NA HBS1L AHI1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 11964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr6 135601929 135602188 135602098 Y MYB NA NA NA NA NA MYB 101476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 135647254 135647460 135647355 Y MYB,AHI1 NA NA NA NA NA MYB 146801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 136293369 136293422 136293396 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 315567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 136434966 136435173 136435049 Y BCLAF1 NA NA NA NA NA BCLAF1 173816 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 136983395 136983458 136983427 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K5 128198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 138151863 138152166 138152043 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 34185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 138523816 138523995 138523837 Y NA KIAA1244 NA NA NA NA KIAA1244 42758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139300314 139300341 139300327 Y NHSL1 REPS1 NA NA NA NA REPS1 7057 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139304978 139305148 139305081 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 2250 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 139351818 139352158 139351992 Y CCDC28A,C6orf115,HECA REPS1 NA NA NA NA REPS1 44420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 139618175 139618262 139618221 Y NA TXLNB,RP11-12A2.1 REPS1,HECA,TXLNB IMR90 Hi-C 24141950 TXLNB 6899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139656661 139656994 139656829 Y NA TXLNB,RP11-12A2.1,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12A2.1 161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139659063 139659241 139659118 Y HECA TXLNB,RP11-12A2.1,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12A2.1 1908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 139763356 139763495 139763425 Y C6orf115 NA LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 69599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 139947909 139948079 139947994 Y NA NA CITED2 K562 ChIA-PET 22265404 CITED2 254152 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 391847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 141804737 141805118 141804969 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661249 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143141084 143141442 143141235 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 122896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143171849 143172301 143172148 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 92037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143174967 143175237 143175142 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 89101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 143248323 143248614 143248469 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 15724 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143329201 143329459 143329330 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 50174 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 143918177 143918387 143918274 Y NA NA PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 PHACTR2 62195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 144376148 144376476 144376440 Y NA PLAGL1,SF3B5 NA NA NA NA PLAGL1 7259 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 144479104 144479443 144479274 Y NA STX11,TPT1P4 NA NA NA NA STX11 9441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 144668159 144668272 144668217 Y PLAGL1,STX11 NA NA NA NA NA UTRN 63322 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr6 149802955 149803363 149803024 Y LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,ZC3H12D NA NA NA NA NA PPIL4 61811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 150286198 150286452 150286311 Y ULBP1 ULBP2,ULBP1,RAET1K NA NA NA NA ULBP1 3055 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 150482510 150482848 150482609 Y NA PPP1R14C NA NA NA NA PPP1R14C 20298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 150963010 150963101 150963056 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 44011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 154505237 154505477 154505359 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 170449 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 154589736 154589946 154589797 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 85980 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 154623242 154623554 154623472 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 52372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 154676071 154676546 154676403 Y NA IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 145 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 18.2357281728701 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 NA TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 128853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 155193821 155194059 155193913 Y NA NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 141362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 155739222 155739872 155739692 Y CLDN20 NA NA NA NA NA TFB1M 105595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 156571786 156572058 156571922 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 525005 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 157158909 157159282 157158999 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 61846 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 157174408 157174845 157174627 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 77345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 157411919 157412211 157412008 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 314856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 159477039 159477499 159477296 Y TAGAP TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 12855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 159484182 159484547 159484203 Y TAGAP TAGAP NA NA NA NA TAGAP 19998 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 159513696 159514062 159513864 Y DYNLT1,TAGAP TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 49512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 159540030 159540244 159540218 Y TAGAP NA NA NA NA NA TAGAP 75846 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 159542385 159542836 159542696 Y NA NA NA NA NA NA TAGAP 78201 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 160136031 160136425 160136369 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8192 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 160137124 160138386 160137829 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 6231 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 160402732 160403272 160403091 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 14601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 161394419 161394560 161394490 Y NA MAP3K4 AGPAT4,MAP3K4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K4 16199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 161549553 161550030 161549828 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 138794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 161571430 161571737 161571637 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 121356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 163833338 163833600 163833428 Y QKI QKI NA NA NA NA QKI 306 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr6 164137885 164138154 164138024 Y NA NA NA NA NA NA QKI 304853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 164365039 164365367 164365292 Y NA NA QKI IMR90 Hi-C 24141950 QKI 532007 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 331217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 166754936 166755437 166755076 Y SFT2D1 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 166901571 166901917 166901742 Y SFT2D1,RNASET2 NA NA NA NA NA SFT2D1 147492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 166964478 166964522 166964502 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 210399 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 167038809 167038976 167038893 Y RPS6KA2 NA NA NA NA NA RPS6KA2 278963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 167395299 167395692 167395496 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA RP1-167A14.2 14861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 167411692 167411848 167411735 Y RNASET2,GPR31 RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 1022 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 168100191 168100503 168100332 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 125099 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 169314330 169314429 169314380 Y NA NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 785730 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr6 170363631 170364652 170364054 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 TCTE3 213976 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 170403251 170403438 170403365 Y TCTE3,FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 194353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 119028 119765 119436 Y NA AC093627.10 FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 27832 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 129626 129879 129753 Y NA AC093627.10 NA NA NA NA AC093627.10 17718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 508827 509102 508987 Y ADAP1 PDGFA NA NA NA NA PDGFA 48831 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 658155 658418 658267 Y COX19 NA NA NA NA NA PDGFA 100222 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 968255 968622 968448 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 24421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 1037816 1038118 1037953 Y NA ADAP1,COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 24581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 1500451 1500958 1500750 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA AC102953.4 2878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 1945683 1945719 1945693 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 325159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2058424 2058871 2058630 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 212007 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2276986 2277172 2277058 Y LFNG,SNX8 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA FTSJ2 2668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2550421 2551074 2550672 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 2551232 2551336 2551252 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 1069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2569854 2570215 2570046 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19691 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 2812534 2812892 2812775 Y SNX8,LFNG,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 60363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 3350976 3351346 3351174 Y NA SDK1 NA NA NA NA SDK1 11896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 4755132 4755354 4755253 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 73744 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 5379232 5379531 5379399 Y NA NA NA NA NA NA SLC29A4 67232 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 5710055 5710429 5710241 Y WIPI2,WIPI2,TNRC18,FBXL18,USP42,RNF216,EIF2AK1 NA NA NA NA NA FSCN1 79616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 5761606 5761918 5761762 Y USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 57452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 6425136 6425343 6425226 Y CCZ1,USP42 RAC1 NA NA NA NA RAC1 12982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 6676235 6676334 6676285 Y NA C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 1282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7249464 7249811 7249639 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 54899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7346319 7346471 7346390 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 151754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7984284 7984579 7984481 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21846 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 7996944 7997264 7997104 Y NA GLCCI1 LOC729852,GLCCI1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLCCI1 9161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 8171530 8172177 8171751 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 127686 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 8215934 8216623 8216095 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 83240 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 11860647 11861050 11860853 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 8774 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 13368007 13368354 13368181 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 643526 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 16095120 16095542 16095311 Y NA NA NA NA NA NA ANKMY2 587900 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 17049089 17049358 17049209 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 257929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 17081003 17081300 17081099 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 254946 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 17409796 17409963 17409863 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 72815 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 17664691 17664931 17664811 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 313193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 17729678 17729968 17729803 Y AHR NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 248156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 18393162 18393507 18393335 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 268590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 438932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB NA NA NA NA NA RPL21P75 198690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 20515457 20515666 20515582 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 RPL23P8 349279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 20582388 20582432 20582424 Y ITGB8 NA NA NA NA NA RPL23P8 282513 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 RPL23P8 27126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 22122992 22123068 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 139290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 22711367 22711465 22711416 Y NA NA LOC100506178,FAM126A,SNORD93,IL6,TOMM7 IMR90 Hi-C 24141950 IL6 52038 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 22861021 22861212 22861181 Y NA TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 551 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA NUPL2 126928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 24803089 24803421 24803235 Y DFNA5,DFNA5 DFNA5 DFNA5,OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 DFNA5 3823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 24818395 24818855 24818677 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11151 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 24882463 24882674 24882596 Y NA NA NA NA NA NA DFNA5 75219 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 25002827 25003181 25002973 Y C7orf31,OSBPL3 OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 16072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 25659927 25660160 25660060 Y NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf31 441952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.55893204321752 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 26007044 26007425 26007148 Y HNRNPA2B1 NA NA NA NA NA NFE2L3 182435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 26140883 26141586 26141235 Y SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3 NA NA NA NA NFE2L3 48274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.62642321619576 chr7 26333342 26333901 26333652 Y SNX10,SNX10,CBX3,SNX10 AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 3801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 26344916 26345429 26345290 Y SNX10,SNX10,CBX3,SNX10 AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 15375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 26361230 26361345 26361289 Y SNX10,SNX10,SNX10 AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 31689 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 27176942 27177056 27176971 Y HOXA3,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA4,HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11 NA NA NA NA HOXA4 8524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 27206716 27206932 27206874 Y HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10 HOXA4,HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13 NA NA NA NA HOXA10-AS 478 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 28191527 28192056 28191751 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 26306 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 23488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 29995785 29995993 29995963 Y NA SCRN1 NA NA NA NA SCRN1 31912 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 30005426 30005693 30005606 Y NA SCRN1 NA NA NA NA SCRN1 22212 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 30211441 30211675 30211604 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 110248 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 30369303 30369603 30369448 Y NA ZNRF2,AC006978.6 NA NA NA NA AC006978.6 39384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 31728088 31728512 31728258 Y C7orf16 NA NA NA NA NA LSM5 804383 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 33708733 33708947 33708840 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 541877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 34529792 34529930 34529861 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 694004 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 36231676 36232185 36231885 Y HERPUD2,EEPD1 EEPD1 NA NA NA NA EEPD1 40918 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 36574030 36574714 36574417 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 146296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA AOAH 81186 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 37156989 37157298 37157171 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 329554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 37255343 37255621 37255439 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 231231 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 37358703 37358798 37358755 Y GPR141,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 128054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 37394321 37394728 37394476 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 92124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 37471044 37471434 37471239 Y NA ELMO1 NA NA NA NA ELMO1 15418 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 37729641 37730111 37730020 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 GPR141,EPDR1 NA NA NA NA EPDR1 8195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr7 37731277 37731583 37731449 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 GPR141,EPDR1 NA NA NA NA EPDR1 9831 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 38272460 38272983 38272698 Y TARP TRGJP1 NA NA NA NA TRGJP1 40936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 38285257 38285450 38285342 Y TARP TRGJP1 NA NA NA NA TRGJP1 28469 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 38426501 38426719 38426610 Y NA TRGV5,TRGV3 NA NA NA NA TRGV3 29738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 41921124 41921832 41921468 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 180418 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43801940 43802267 43802061 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 5661 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4,AC004951.5 NA NA NA NA AC004951.5 30881 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 44297372 44297806 44297600 Y NA NA NA NA NA NA YKT6 58805 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 44435204 44435581 44435393 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 69860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 46972513 46972753 46972628 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 647403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47517591 47517776 47517700 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 102380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47554592 47554957 47554775 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 65199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 47709189 47709374 47709294 Y UPP1,UPP1,HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 89033 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50306514 50306844 50306594 Y IKZF1,FIGNL1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 34876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50321209 50321522 50321293 Y NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 20198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 50346944 50347066 50347038 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 5224 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50347154 50347793 50347470 Y NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 5434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50350065 50350197 50350095 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 8345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50361175 50361592 50361449 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 19455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50369478 50369764 50369583 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 27758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50423546 50423751 50423603 Y NA NA NA NA NA NA IKZF1 81826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 50424101 50424707 50424349 Y IKZF1 NA NA NA NA NA IKZF1 82381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 50428255 50428613 50428317 Y IKZF1 NA NA NA NA NA IKZF1 86535 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL NA NA NA NA NA GRB10 511403 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 55014473 55014960 55014850 Y EGFR NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 SEC61G 188806 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 55543241 55543436 55543358 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95245 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 55615946 55616205 55616135 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 22476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-340I6.8 1389471 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 67069957 67070055 67070006 Y NA NA NA NA NA NA PMS2P4 304063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 73156679 73157033 73156789 Y NA STX1A,ABHD11 NA NA NA NA ABHD11 5482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 73323660 73323965 73323813 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR27 68795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 73625323 73625613 73625399 Y LIMK1,LAT2 EIF4H,LAT2,RFC2 NA NA NA NA LAT2 13341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 73631936 73632436 73632119 Y LAT2 EIF4H,LAT2,RFC2 NA NA NA NA LAT2 19954 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 LAT2,RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 73705467 73705815 73705641 Y NA RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 3662 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75247024 75247489 75247190 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 91546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75253450 75253956 75253637 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 97972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 75354773 75355120 75354947 Y NA HIP1 NA NA NA NA HIP1 11160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75675722 75675985 75675853 Y NA STYXL1,MDH2 NA NA NA NA MDH2 353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 76874732 76875015 76874923 Y NA FGL2 NA NA NA NA FGL2 47589 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 77086113 77086340 77086227 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 NA PTPN12,PION,PHTF2,CCDC146 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN12 78252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr7 78786871 78787189 78787030 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 293009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 80355972 80356402 80356123 Y NA NA NA NA NA NA CD36 359081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA CD36 363668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 81475817 81476043 81475927 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 595071 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 81582871 81583219 81583134 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 487895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 81590210 81590492 81590289 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 480622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 84717663 84717972 84717818 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 96199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 86534596 86534997 86534797 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 152018 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 87984321 87984701 87984565 Y STEAP4 NA NA NA NA NA SRI 130013 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 90224046 90224366 90224206 Y STEAP2 AC002456.2 CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63 IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 AC002456.2 301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 90236421 90236455 90236438 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 11754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 90250368 90250899 90250569 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 25701 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 92262528 92262734 92262631 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 92264263 92264527 92264407 Y SAMD9 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 46555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 92273770 92274019 92273895 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 56062 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 92392967 92393205 92393086 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 70592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 93511378 93511666 93511551 Y BET1,TFPI2 TFPI2,GNG11 NA NA NA NA TFPI2 6637 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 95835254 95835261 95835258 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 114198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 96227712 96227722 96227717 Y NA NA NA NA NA NA SHFM1 109481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 96748066 96748124 96748095 Y NA ACN9 NA NA NA NA ACN9 4164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 98383358 98383761 98383522 Y NA NA NA NA NA NA TRRAP 89795 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1,PILRA PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PILRA 194 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 99969754 99970252 99970079 Y OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1,PILRA NA NA NA NA PILRA 6601 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 4.04087158376099 chr7 101361034 101362207 101361111 Y CUX1,CUX1 NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 94752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101596326 101596693 101596419 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 139367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 SH2B2 NA NA NA NA SH2B2 3096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 SH2B2 NA NA NA NA SH2B2 3573 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 3.41919903241314 chr7 102452256 102452586 102452421 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 64838 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 104601504 104601791 104601630 Y SRPK2,MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 49700 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 104842983 104843396 104843385 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 191492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 105123568 105123582 105123575 Y NA PUS7,RINT1 NA NA NA NA PUS7 37132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 105447208 105447599 105447347 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 67451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 105455089 105455224 105455200 Y NAMPT,ATXN7L1 NA NA NA NA NA ATXN7L1 59826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 110326819 110326998 110326909 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 873575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 325972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 111156714 111156954 111156834 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 43619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 111627210 111627406 111627307 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 217060 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 111671285 111671420 111671354 Y IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 173046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 111720320 111721594 111721184 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 122872 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 112062066 112062509 112062349 Y DOCK4,ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1 IFRD1 NA NA NA NA IFRD1 1043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 113724652 113724941 113724845 Y FOXP2 FOXP2 NA NA NA NA FOXP2 270 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 114301114 114301124 114301119 Y FOXP2 NA NA NA NA NA MDFIC 259085 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 114408811 114408841 114408826 Y NA NA NA NA NA NA MDFIC 151368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 114571241 114571658 114571396 Y MDFIC MDFIC NA NA NA NA MDFIC 11032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 116035470 116035688 116035648 Y NA NA CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV2 110036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 116483555 116483740 116483606 Y CAPZA2 CAPZA2 MET,TES IMR90 Hi-C 24141950 CAPZA2 34431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 117863844 117864014 117863854 Y ANKRD7 NAA38 NA NA NA NA NAA38 41758 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 118520575 118520914 118520745 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 698489 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA KCND2 627716 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 119692917 119693243 119693083 Y NA NA NA NA NA NA KCND2 218479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 121951914 121952318 121952125 Y NA NA NA NA NA NA AASS 169580 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 122466235 122466438 122466337 Y NA NA NA NA NA NA CADPS2 58375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 123284312 123284364 123284338 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 88003 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 123410612 123410856 123410679 Y NA WASL WASL MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WASL 23491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 124419446 124419631 124419539 Y NA GPR37 NA NA NA NA GPR37 15765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 127775885 127775901 127775893 Y NA NA SND1,MIR129-1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 206061 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 174034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 128093966 128094206 128094043 Y NA IMPDH1,HILPDA,METTL2B NA NA NA NA RP11-155G14.6 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.7975264810653 chr7 129005588 129005946 129005786 Y AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 42265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 129084265 129084564 129084426 Y AHCYL2,FAM40B RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 36054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 129095634 129096008 129095821 Y NA RP11-305M3.2 NA NA NA NA RP11-305M3.2 47423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 129540244 129540548 129540396 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 50241 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 132656149 132656423 132656408 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 108425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 225554 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 135664784 135664953 135664862 Y CNOT4 MTPN NA NA NA NA MTPN 4683 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 137379258 137379404 137379341 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 305409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 137942214 137942717 137942409 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 38512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 138249829 138249954 138249896 Y NA NA NA NA NA NA TRIM24 106750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 138250447 138250496 138250473 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA TRIM24 107368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 139425752 139426584 139426362 Y TBXAS1,JHDM1D TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA TBXAS1 48266 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 139555360 139555974 139555461 Y JHDM1D,TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 79783 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141287085 141287318 141287296 Y TAS2R5 AGK NA NA NA NA AGK 38096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147 NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141644604 141644810 141644796 Y TAS2R38,CLEC5A NA NA NA NA NA CLEC5A 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141648757 141649893 141649555 Y CLEC5A,TAS2R38 CLEC5A NA NA NA NA CLEC5A 3950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141679454 141679850 141679687 Y OR9A4,CLEC5A,TAS2R38 CLEC5A NA NA NA NA CLEC5A 34647 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA CLEC5A 159832 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 142246179 142246560 142246372 Y EPHB6 TRBV7-3,TRBV6-4 EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 TRBV7-3 564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 142903045 142903353 142903245 Y NA GSTK1 NA NA NA NA GSTK1 35833 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 142956760 142956899 142956833 Y NA GSTK1,CASP2 EPHA1,LOC285965,CASP2 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 17574 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 143073510 143073687 143073600 Y NA FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA AC093673.5 1901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 144462107 144462147 144462127 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 69341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 145860816 145861156 145860986 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1329328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 146573041 146573429 146573238 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 1702064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 148001615 148001815 148001749 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 273678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr7 150691752 150691942 150691795 Y GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542 KCNH2,ATG9B,ABCB8 NA NA NA NA KCNH2 18349 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 151453235 151453789 151453377 Y SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 118338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 151492605 151492996 151492874 Y NA NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 79131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 151501020 151501412 151501247 Y PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 70715 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 151535790 151536675 151536139 Y PRKAG2 PRKAG2-AS1,PRKAG2 NA NA NA NA PRKAG2-AS1 35452 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 151622915 151623433 151623313 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA LOC100505483,PRKAG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 50705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr7 151806252 151806472 151806362 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 85493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P3 66552 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 25886 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr7 152111667 152111916 152111792 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 20064 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr7 152330696 152330805 152330751 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 40445 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 155137693 155138087 155137815 Y NA AC008060.7 INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC008060.7 34684 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 155383034 155383540 155383287 Y RBM33 NA LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 51605 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr7 155386367 155386555 155386456 Y RBM33 RBM33,AC009403.2 LMBR1,RBM33,LOC100132707 IMR90 Hi-C 24141950 RBM33 48590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 155986656 155986792 155986706 Y NA NA LMBR1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF32 444183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 156409241 156409518 156409427 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA RNF32 21457 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 157094771 157094925 157094848 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 31150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 582547 582966 582856 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 103140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 671634 671846 671694 Y ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 14260 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 1414853 1414992 1414933 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 286952 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 1452379 1452383 1452381 Y KBTBD11 NA NA NA NA NA CLN8 249561 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 1694921 1695309 1695098 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1 CLN8,ARHGEF10,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 6635 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 1897074 1897760 1897667 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 22284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 21.3440909296093 chr8 1898205 1898424 1898394 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 21620 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr8 2583747 2584096 2583960 Y NA GS1-57L11.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA GS1-57L11.1,RP11-134O21.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 7178 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 60983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 6394489 6394505 6394499 Y AGPAT5,ANGPT2 NA NA NA NA NA MCPH1 132376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 6400051 6400348 6400277 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 137938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 6405382 6405492 6405403 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 143269 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 6663567 6663735 6663651 Y NA XKR5 NA NA NA NA XKR5 27431 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 8742026 8742246 8742225 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 6909 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 8878847 8879137 8878870 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 21190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 8935191 8935379 8935249 Y NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 71705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 9764051 9764441 9764391 Y MSRA LINC00599 NA NA NA NA LINC00599 3175 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 9791185 9791439 9791249 Y MSRA LINC00599 LOC157627,MSRA IMR90 Hi-C 24141950 LINC00599 30309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 10267879 10268236 10267884 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 358101 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 24343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 11036366 11036550 11036458 Y MTMR9,XKR6 XKR6 NA NA NA NA XKR6 20325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 11734631 11734824 11734746 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 9674 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 11754568 11755261 11754938 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 29611 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 13486765 13487175 13486959 Y NA NA DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf48 64413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 15443006 15443379 15443076 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 170282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 16898778 16899115 16898947 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 112423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 17355613 17356072 17355737 Y NA SLC7A2 NA NA NA NA SLC7A2 3016 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 17385893 17386107 17386000 Y SLC7A2,SLC7A2 SLC7A2,PDGFRL NA NA NA NA SLC7A2 33296 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 18704322 18704730 18704574 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 235510 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA INTS10 138871 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 19797796 19798054 19797934 Y LPL LPL NA NA NA NA LPL 40568 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 20059971 20060332 20060110 Y ATP6V1B2 ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 7093 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 21817623 21817860 21817686 Y NA DOK2,XPO7 NA NA NA NA XPO7 42443 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 22103553 22103662 22103605 Y NA MIR320A,POLR3D NA NA NA NA POLR3D 2936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 22222955 22223268 22223121 Y EPB49,SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 22395519 22395867 22395693 Y PPP3CC RP11-382J24.2,SORBS3 NA NA NA NA SORBS3 4632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 22840134 22840430 22840185 Y BIN3,TNFRSF10B RHOBTB2 BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB2 2500 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 23456198 23456355 23456282 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 NA NA NA NA NA SLC25A37 71880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 23832365 23832575 23832443 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-148P 100096 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 24155243 24155623 24155554 Y ADAM28 ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 5690 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 24176460 24176602 24176560 Y ADAM28 ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 26907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 24243913 24244131 24243977 Y ADAM28,ADAMDEC1 ADAMDEC1 NA NA NA NA ADAMDEC1 4115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NA NA NA NA NA DOCK5 240520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 25096912 25097126 25097024 Y DOCK5 NA NA NA NA NA DOCK5 56674 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 25242857 25243137 25242939 Y NA NA KCTD9 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD9 70855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 26162518 26162881 26162571 Y NA PPP2R2A NA NA NA NA PPP2R2A 15511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 26433425 26433611 26433473 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 63634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr8 26468935 26469319 26469207 Y DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 99144 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 27200806 27201031 27200919 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 33807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 27208490 27208766 27208628 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 41491 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 27209291 27209793 27209526 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 42292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 27221120 27221544 27221428 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 54121 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 27229377 27229823 27229549 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 62378 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 27232540 27232742 27232661 Y NA NA NA NA NA NA PTK2B 65541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 27236352 27236561 27236406 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 69353 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 27547704 27547787 27547746 Y NA NA NA NA NA NA SCARA3 58319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 28352811 28353080 28352947 Y HMBOX1,HMBOX1,FZD3 FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 3082 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 29198749 29199265 29198931 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 6920 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 29558749 29558970 29558858 Y KIF13B NA NA NA NA NA DUSP4 352564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 29705863 29706038 29705974 Y MBOAT4 NA NA NA NA NA TMEM66 232685 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 29914930 29915195 29915084 Y NA TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA TMEM66 23528 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 29948448 29949236 29948548 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 1678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 30506010 30506203 30506101 Y NA GTF2E2 NA NA NA NA GTF2E2 7565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 30666266 30666462 30666364 Y NA PPP2CB NA NA NA NA PPP2CB 3368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 32174217 32174584 32174401 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 1154356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 32508172 32508500 32508337 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 820440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 33287156 33287526 33287341 Y NA FUT10 NA NA NA NA FUT10 41414 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 33743518 33743769 33743644 Y MAK16 RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 27777 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr8 37679848 37680132 37679943 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 25290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 37738160 37738666 37738484 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 16319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 37739186 37739703 37739509 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 15282 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 37749222 37749683 37749580 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 5302 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 37757888 37758317 37758017 Y WHSC1L1,RAB11FIP1 RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 37992032 37992208 37992120 Y NA ASH2L,BAG4,LSM1 NA NA NA NA ASH2L 31272 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38223626 38223954 38223916 Y DDHD2,DDHD2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 13836 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38226082 38226528 38226264 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 11262 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38790614 38790631 38790622 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 33861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 39767656 39767843 39767773 Y IDO1 NA NA NA NA NA ADAM9 915268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 41462271 41462436 41462354 Y NA AGPAT6,RP11-360L9.4 NA NA NA NA RP11-360L9.4 28384 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 41819161 41819283 41819222 Y POLB NA NA NA NA NA KAT6A 88225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 41851790 41851810 41851800 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 55698 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 42370484 42370865 42370805 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 24204 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 47885401 47885427 47885415 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 181314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 48293270 48293403 48293337 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 209768 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 48294076 48294490 48294332 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 208681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 67961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 48580617 48580970 48580793 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 68678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 50082521 50082569 50082532 Y NA RP11-10H3.1 NA NA NA NA RP11-10H3.1 3423 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 51955527 51955681 51955664 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 854054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 53379796 53380092 53379874 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA FAM150A 95975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 54396239 54396755 54396564 Y NA NA NA NA NA NA RP11-162D9.3 308108 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 55065365 55066496 55065716 Y ATP6V1H,ATP6V1H MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 19595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 55125016 55125190 55125101 Y ATP6V1H,ATP6V1H NA NA NA NA NA MRPL15 79246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 55181508 55181691 55181664 Y ATP6V1H,ATP6V1H NA NA NA NA NA MRPL15 135738 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 56068878 56069211 56068948 Y XKR4 NA NA NA NA NA TGS1 614490 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56684291 56684685 56684461 Y NA TGS1,TMEM68 NA NA NA NA TMEM68 325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 56791431 56791783 56791438 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 1059 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 56831577 56831790 56831640 Y NA LYN NA NA NA NA LYN 41205 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56842990 56843446 56843124 Y LYN NA NA NA NA NA LYN 52618 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56887750 56888682 56888353 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 96387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56891091 56891632 56891326 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 93437 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 56903187 56904166 56903812 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 80903 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 56919174 56919348 56919316 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 65721 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 58122731 58123025 58122849 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 218328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 58314676 58315001 58314766 Y NA NA NA NA NA NA IMPAD1 410273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 59040948 59041341 59041285 Y SDCBP NA NA NA NA NA FAM110B 135880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 59491466 59491801 59491581 Y UBXN2B,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 27983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 59710658 59710976 59710817 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 140255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 60042677 60043119 60042763 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA TOX 12910 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 60149243 60149529 60149369 Y NA NA NA NA NA NA TOX 119476 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 61664874 61665035 61664955 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 75537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA AC022182.1 CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 AC022182.1 29878 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA AC022182.1 CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 AC022182.1 30164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 63934936 63935021 63934979 Y NA GGH NA NA NA NA GGH 14709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 66738971 66739362 66739211 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 13195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 66749896 66750187 66749927 Y PDE7A PDE7A NA NA NA NA PDE7A 2370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 66863902 66864441 66863992 Y RRS1,PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 111345 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 66893726 66894034 66893791 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 AC084082.3 128868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 13095 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 67626224 67626609 67626278 Y SGK3,VCPIP1,SGK3 VCPIP1,C8orf44,SGK3 NA NA NA NA SGK3 3571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 67668655 67668834 67668702 Y ADHFE1,SGK3,SGK3 SGK3,PTTG3P NA NA NA NA PTTG3P 9406 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 69717744 69718003 69717874 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 1026343 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 70787574 70787763 70787675 Y SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1 RP11-159H10.3 NA NA NA NA RP11-159H10.3 43228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 71031909 71031920 71031915 Y NA RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA RP11-152C15.1 17495 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 71106642 71106934 71106707 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 92228 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC MSC NA NA NA NA MSC 15790 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 105543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 73819735 73820065 73819911 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 99034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 74453012 74453349 74453181 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 204594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 74792402 74792821 74792506 Y NA UBE2W,GYG1P1 NA NA NA NA UBE2W 3257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 77464469 77464479 77464474 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 126975 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 77529546 77529917 77529736 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 61537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 79663656 79664006 79663831 Y NA NA NA NA NA NA IL7 51752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 79675234 79675631 79675433 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40127 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 81938706 81938999 81938911 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 83304 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 82042673 82043029 82042906 Y PAG1 PAG1,RP11-1149M10.2 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 20370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 86378354 86378674 86378384 Y LRRCC1,CA2 CA2 NA NA NA NA CA2 4273 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 86542715 86542978 86542892 Y NA NA NA NA NA NA CA2 168634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 86853135 86853591 86853380 Y NA NA CA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP6V0D2 143961 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 90797084 90797193 90797178 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 29109 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 90838382 90838725 90838688 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RIPK2 70407 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 90849173 90849652 90849503 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 62435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 91064955 91065319 91065136 Y NA NA NA NA NA NA NBN 51499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 91944929 91945085 91945007 Y NECAB1 NA NA NA NA NA TMEM55A 106207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 93587171 93587290 93587231 Y NA NA RUNX1T1,FLJ46284 IMR90 Hi-C 24141950 FAM92A1 1121499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 94592602 94592618 94592610 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 116171 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 95089628 95089913 95089904 Y NA NA GEM,CDH17,RAD54B IMR90 Hi-C 24141950 KB-1247B1.1 123367 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 95433210 95433488 95433370 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 51849 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 95786265 95786660 95786406 Y RAD54B,KIAA1429 INTS8 NA NA NA NA INTS8 36879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 96858613 96858793 96858703 Y NA NA LOC100616530 IMR90 Hi-C 24141950 GDF6 312227 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 96903752 96903767 96903760 Y NA NA LOC100616530,UQCRB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDF6 267253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97142722 97142923 97142823 Y NA GDF6 NA NA NA NA GDF6 28097 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97171094 97171453 97171221 Y GDF6 GDF6 NA NA NA NA GDF6 74 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97173806 97174188 97174149 Y NA GDF6 NA NA NA NA GDF6 2786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97174234 97174570 97174431 Y GDF6 GDF6 NA NA NA NA GDF6 3214 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97319675 97319761 97319753 Y NA MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 47732 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 97632961 97633353 97633157 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 129382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97866979 97867264 97866987 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 363400 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 97870778 97871083 97870857 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 367199 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97873455 97873860 97873757 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 369876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 97946037 97946045 97946041 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 442458 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3 NA NA NA NA STK3 247 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 100461450 100461455 100461453 Y NA NA NA NA NA NA VPS13B 437956 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 101338082 101338542 101338349 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A RNF19A SPAG1,ANKRD46,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 7904 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 101773934 101774280 101774106 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 40897 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 101913945 101914105 101914022 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 49511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chr8 102110720 102110996 102110973 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF706 105425 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 102449376 102449720 102449428 Y GRHL2 NA NACAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NACAP1 77354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA NA NA NA NA NA NACAP1 141782 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 NA NA NA NA NA NACAP1 144968 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 102879018 102879156 102879087 Y NCALD,NCALD NA NA NA NA NA RRM2B 370190 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103209350 103209650 103209520 Y KLF10,KLF10 RRM2B,KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 39696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103580180 103580591 103580344 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA NA NA NA NA KLF10 85539 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103597495 103597662 103597589 Y UBR5 NA UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 68468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103639654 103639717 103639685 Y NA KLF10 UBR5,ODF1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 26413 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA KB-1732A1.1 NA NA NA NA KB-1732A1.1 6885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 104457896 104458033 104457972 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA SLC25A32 32479 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 104553511 104553813 104553575 Y NA RP11-5A11.1 NA NA NA NA RP11-5A11.1 15804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 104792192 104792465 104792329 Y RIMS2 NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 222575 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 105034041 105034154 105034124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 464424 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-395G23.3 516340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-395G23.3 402217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 107485450 107485801 107485626 Y NA NA NA NA NA NA OXR1 204977 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 107574222 107574472 107574244 Y OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 133769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 107770186 107770567 107770447 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 61945 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 108317294 108317670 108317585 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 609053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 108322581 108322730 108322655 Y ANGPT1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 614340 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 109132004 109132262 109132106 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 313300 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 111947421 111947490 111947466 Y NA NA NA NA NA NA EBAG9 1397481 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 113719309 113719645 113719477 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 667253 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 114266349 114266595 114266472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 120303 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 115322659 115322858 115322759 Y NA NA NA NA NA NA CSMD3 875331 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 116454411 116454736 116454628 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 365163 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 117476077 117476257 117476175 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 300485 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 117744101 117744355 117744228 Y NA UTP23,EIF3H NA NA NA NA UTP23 32387 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 117891197 117891487 117891378 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA RAD21 6092 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 119319913 119320138 119320129 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 197821 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119469054 119469434 119469101 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 162800 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119781554 119781682 119781618 Y NA RPS26P35 TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 9114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 119917519 119917835 119917587 Y NA TNFRSF11B NA NA NA NA TNFRSF11B 44604 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121396509 121396604 121396557 Y NA NA NA NA NA NA MTBP 59036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121442839 121443137 121442988 Y NA MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MTBP 12503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121456351 121456697 121456524 Y SNTB1,MTBP,MRPL13 MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MRPL13 709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 121619256 121619602 121619580 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 163614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121628287 121628559 121628462 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 172645 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121737162 121737328 121737239 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 86185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121815954 121816374 121816244 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 7139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 121839869 121840146 121840008 Y NA SNTB1 SNTB1 IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 16356 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 122598745 122598874 122598810 Y NA NA NA NA NA NA RP11-369K17.1 675440 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 123801301 123801636 123801353 Y ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 9668 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 123811167 123811696 123811506 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 19534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 123882951 123883328 123883140 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 91318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 124407044 124407322 124407183 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 19268 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 124816728 124816894 124816751 Y NA FAM91A1 NA NA NA NA FAM91A1 38032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 125249599 125249607 125249603 Y NA NA TMEM65,FER1L6 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 87435 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125341304 125341312 125341308 Y NA TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 41621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125466570 125466668 125466619 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 5522 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125640439 125640642 125640477 Y NA NA NA NA NA NA TATDN1 90740 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125683084 125683301 125683193 Y MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 55429 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 125764120 125764533 125764318 Y ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 MTSS1 MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTSS1 25390 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126112372 126112753 126112532 Y TRIB1,NSMCE2 NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA KIAA0196 10290 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126187320 126187484 126187432 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85238 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 126232781 126233016 126232896 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130699 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126245115 126245425 126245196 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 143033 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126296437 126296656 126296547 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 143907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126335524 126335526 126335525 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 105037 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 126353679 126353867 126353799 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 86696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126541064 126541373 126541286 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 100501 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126649729 126649959 126649891 Y TRIB1 NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 209166 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 126710957 126711330 126711190 Y TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 270394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 127325042 127325066 127325054 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 243054 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 127844573 127844851 127844712 Y FAM84B NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 275935 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 127963308 127963680 127963494 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 394670 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 544207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 574368 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128579214 128579541 128579451 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 166139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128910613 128910985 128910818 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 105834 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128948050 128948240 128948055 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 72617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 128993662 128993919 128993808 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.07699250267406 chr8 129062971 129063389 129063062 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 42114 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 129115789 129116244 129116059 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94932 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129279863 129280046 129279972 Y NA NA MYC,MIR1208 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-25P 259006 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 129609920 129610230 129610055 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 589063 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129684580 129684880 129684731 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 663723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 129706266 129706412 129706340 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 685409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 129942288 129942645 129942469 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 747840 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 130222982 130222992 130222987 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 467493 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130249950 130250353 130250013 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 440132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130279904 130280064 130280038 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 410421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr8 130284402 130285105 130284786 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 405380 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 130285758 130286324 130285998 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 404161 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130289872 130290097 130289985 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 400388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130315048 130315337 130315217 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 375148 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130323839 130324175 130323987 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 366310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130354241 130354379 130354310 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 336106 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130461810 130462206 130462131 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 228279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130490796 130491097 130490948 Y FAM49B NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 199388 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130491194 130491466 130491330 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 199019 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130503275 130503416 130503346 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 187069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130527330 130527562 130527488 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 162923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130548053 130548359 130548185 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 142126 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130549847 130550267 130550199 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 140218 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130550763 130551187 130550985 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 139298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 130555161 130555312 130555221 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 135173 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 130556592 130556854 130556850 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 133631 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130557757 130558027 130557844 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 132458 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 130558328 130558659 130558367 Y FAM49B NA NA NA NA NA CCDC26 131826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 130559153 130559435 130559226 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 131050 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr8 130560066 130560288 130560191 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 130197 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 130566236 130566665 130566321 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 123820 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.932508827021766 chr8 130566808 130567296 130566886 Y FAM49B NA NA NA NA NA CCDC26 123189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.69391438917399 chr8 130594185 130594451 130594334 Y FAM49B NA NA NA NA NA CCDC26 96034 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr8 130594464 130594915 130594680 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 95570 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 130595168 130595596 130595537 Y NA NA NA NA NA NA CCDC26 94889 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130678534 130678960 130678774 Y FAM49B CCDC26 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC26 11525 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130975001 130975392 130975263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 51983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130983929 130984348 130984047 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 43027 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 130985487 130986077 130985841 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 41298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131007390 131007737 131007622 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 19638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131058084 131058195 131058140 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 131259857 131260132 131260043 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 232482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131271729 131272058 131271952 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 244354 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 268648 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131296989 131297286 131297259 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 269614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 327107 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 132658196 132658445 132658435 Y HHLA1 NA NA NA NA NA EFR3A 255890 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 133519987 133520123 133520064 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 165715 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 133599837 133600072 133599955 Y TMEM71 NA NA NA NA NA LRRC6 85766 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 133933038 133933436 133933099 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 147420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134042764 134043310 134043004 Y TMEM71,PHF20L1,TG NA NA NA NA NA SLA 69988 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 134065338 134065765 134065507 Y TMEM71,PHF20L1,TG,SLA SLA NA NA NA NA SLA 47533 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 134090070 134090677 134090415 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 SLA NA NA NA NA SLA 22621 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr8 134094333 134095052 134094858 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 SLA NA NA NA NA SLA 18246 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 134104989 134105333 134105063 Y ST3GAL1,TG SLA NA NA NA NA SLA 7965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 134131797 134131957 134131879 Y TG SLA NA NA NA NA SLA 18499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134258134 134258466 134258300 Y PHF20L1,NDRG1 NA NA NA NA NA NDRG1 53799 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr8 134315401 134315895 134315622 Y ST3GAL1 NDRG1,CTC-458A3.1 TG,NDRG1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 3136 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134403538 134403742 134403629 Y ST3GAL1 NA TG,WISP1,PHF20L1,NDRG1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 CTC-458A3.1 67298 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134415744 134416227 134416033 Y SLA,ST3GAL1 NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-458A3.1 79504 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134510785 134510981 134510865 Y SLA NA NA NA NA NA ST3GAL1 71202 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134532639 134533046 134532970 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 49137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134552406 134552812 134552641 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 29371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 134592913 134593176 134593079 Y ST3GAL1 ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 10730 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 135035920 135036152 135036031 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1,ZFAT,ZFAT-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 453737 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 135695599 135695940 135695747 Y NA ZFAT NA NA NA NA ZFAT 27352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.13973301080438 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 140716297 140716707 140716660 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 749971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 140830815 140831120 140830968 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 635558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 141212639 141212826 141212733 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 253852 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 142099604 142099791 142099736 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 25586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 142105625 142105840 142105724 Y EIF2C2,SLC45A4,PTP4A3,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 19537 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 142129714 142130013 142129874 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 4337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3,RP11-809O17.1 NA NA NA NA RP11-809O17.1 25680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 142216641 142216829 142216751 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA RP11-809O17.1 78581 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 142244468 142244827 142244553 Y DENND3,PTP4A3,SLC45A4 NA SLC45A4 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC45A4 71577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 142550661 142551112 142550824 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P38 83486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 143282498 143282660 143282564 Y TSNARE1 LINC00051 NA NA NA NA LINC00051 4781 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA LINC00051 75931 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 143403466 143403590 143403541 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 79011 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 143405050 143405259 143405133 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 77342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 BAI1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAI1 5207 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr8 143534907 143535056 143534986 Y CYP11B2,TSNARE1 BAI1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAI1 6116 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 143553509 143553834 143553672 Y NA BAI1 NA NA NA NA BAI1 24718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 10133 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 144272609 144273113 144272936 Y NA NA NA NA NA NA ZFP41 54167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.96862974593484 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.346957194587 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,FAM83H NA NA NA NA ZNF707 20695 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr8 145129247 145129547 145129402 Y GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOSC4 1982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 447782 447949 447838 Y DOCK8,DOCK8 KANK1 NA NA NA NA KANK1 20342 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 614528 614756 614656 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 146237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 631583 631920 631840 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 163292 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr9 642151 642448 642253 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 173860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 749759 749963 749884 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 281468 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 825642 825932 825803 Y NA NA DOCK8,DMRT1 IMR90 Hi-C 24141950 KANK1 357351 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 2465114 2465154 2465134 Y NA NA VLDLR,FLJ35024 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 154680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 2657497 2657645 2657571 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 37663 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 2839342 2839735 2839533 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 2506 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 3450123 3450354 3450276 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 73650 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 3507863 3508210 3507917 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15794 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 3578891 3579091 3578989 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 54168 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 4855592 4855625 4855609 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 7301 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 5446001 5446185 5446074 Y NA CD274 INSL6,CD274,PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 2318 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 5569434 5569709 5569569 Y CD274,KIAA1432 NA NA NA NA NA KIAA1432 57316 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 5583347 5583481 5583453 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 43544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 5627107 5627559 5627241 Y CD274,RANBP6,KIAA2026,KIAA1432 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 82 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr9 6926338 6926600 6926461 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 207475 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 7976350 7976664 7976497 Y NA NA NA NA NA NA RPL4P5 500030 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 12421960 12422048 12422006 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 855541 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 13568572 13568946 13568596 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 290983 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 13860061 13860338 13860200 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 NFIB 536644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr9 14958123 14958476 14958300 Y NA LDHAP4 NA NA NA NA LDHAP4 37791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 14992180 14992514 14992235 Y NA NA NA NA NA NA LDHAP4 71848 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr9 15926060 15926268 15926072 Y NA NA NA NA NA NA PSIP1 417043 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 16192245 16192373 16192308 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 532439 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 16729817 16729878 16729869 Y BNC2 RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 5005 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 19231297 19231777 19231673 Y PLIN2 NA DENND4C IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 84009 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 19322727 19322852 19322790 Y NA NA NA NA NA NA RPS6 55400 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 68078 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 20784777 20784885 20784831 Y IFNW1 NA NA NA NA NA MLLT3 164235 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 20821674 20822013 20822003 Y IFNA5,IFNA21 NA NA NA NA NA MLLT3 201132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 IFNB1 MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 IFNB1 20451 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 21817235 21817446 21817291 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 16693 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 21984231 21984381 21984318 Y NA CDKN2A,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 8919 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 26921358 26921728 26921543 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 23309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 27564817 27564968 27564873 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 6896 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 29825337 29825639 29825488 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 861464 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 31347195 31347362 31347281 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 516972 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 33017262 33017602 33017524 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 APTX 5564 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 33629887 33630165 33630026 Y NA ANXA2P2 NA NA NA NA ANXA2P2 7664 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 34630838 34631031 34630927 Y ENHO,CNTFR,CNTFR,KIAA1045,DNAJB5 CNTFR,DCTN3,SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA SIGMAR1 4775 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 110762 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 86547 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1,CD72 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr9 36037997 36038326 36038187 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 3567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36039800 36039974 36039887 Y OR2S2,RECK RECK NA NA NA NA RECK 5370 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36128009 36128400 36128037 Y GLIPR2 GLIPR2 NA NA NA NA GLIPR2 6332 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36140543 36140881 36140681 Y GLIPR2 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA GLIPR2 5811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 37930298 37930375 37930337 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 130864 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 38074399 38074817 38074731 Y NA SHB DCAF10,MCART1,SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 7189 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 38478725 38478769 38478747 Y ANKRD18A NA NA NA NA NA IGFBPL1 56281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 68433806 68433981 68433894 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 19394 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr9 71393578 71393897 71393631 Y FAM122A FAM122A NA NA NA NA FAM122A 614 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 71791709 71792066 71791753 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 57500 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 73724844 73724973 73724909 Y NA NA NA NA NA NA RPL35AP21 477544 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 74515794 74516103 74515949 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 8323 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 75200734 75200878 75200827 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 222571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr9 79191243 79191544 79191412 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 6512 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 79207752 79208113 79207774 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 23021 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 80637884 80638322 80638164 Y NA GNAQ NA NA NA NA GNAQ 6052 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 82226280 82226508 82226439 Y TLE4 TLE4 NA NA NA NA TLE4 41592 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 262542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 86051693 86051979 86051837 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 99482 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 86088348 86088544 86088498 Y NA NA NA NA NA NA FRMD3 62917 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 87374322 87374598 87374427 Y NTRK2,NTRK2,NTRK2 NA NA NA NA NA RMI1 780696 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 88598937 88598983 88598960 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 44876 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 91538614 91539111 91538717 Y SECISBP2,S1PR3,C9orf47 NA LOC286238,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 65251 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 91791946 91792374 91791976 Y NA SHC3 NA NA NA NA SHC3 264 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 92142091 92142330 92142203 Y NA SEMA4D SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 31046 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 93602327 93602707 93602517 Y SYK,SYK SYK NA NA NA NA SYK 40258 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 93959484 93959867 93959681 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 162328 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 94249438 94249755 94249665 Y NA NA NA NA NA NA NFIL3 65294 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 94671066 94671340 94671201 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC1 204326 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 95168954 95169114 95169066 Y OGN NA NA NA NA NA NOL8 83036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 95732704 95733017 95732861 Y NINJ1,C9orf89,FGD3 FGD3 NA NA NA NA FGD3 24971 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 95882095 95882646 95882428 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 11924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 97969652 97969878 97969805 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 108113 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3153 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 99313149 99313340 99313245 Y NA NA HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 66772 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 100841115 100841498 100841123 Y C9orf156 NANS,TRIM14 NA NA NA NA NANS 24094 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 102181485 102181604 102181570 Y NR4A3 NA NA NA NA NA SEC61B 199139 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 102342109 102342552 102342442 Y NR4A3 NA NA NA NA NA RP11-554F20.1 237619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 104248590 104248780 104248669 Y C9orf125 RP11-490D19.6,RNF20 NA NA NA NA RP11-490D19.6 19869 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 107769025 107769996 107769532 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 80507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 107954000 107954398 107954183 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A1 50505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 109073182 109073440 109073264 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 549938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 109647843 109648061 109647872 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 24465 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 111059370 111059669 111059458 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 327444 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 111482488 111482546 111482517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 95375 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 204314 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 112813346 112813601 112813470 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 203319 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 112878723 112879133 112878887 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 137787 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 114811444 114811737 114811486 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 123951 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 115110736 115110930 115110781 Y NA PTBP3,HSDL2 NA NA NA NA PTBP3 16789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 115624285 115624808 115624606 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 113167 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chr9 115625683 115626114 115625766 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 114565 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 117720208 117721654 117720651 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA LOC100505478,DFNB31,C9orf91,TNFSF15,TNFSF8,TNC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 348722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chr9 120487715 120488143 120488025 Y TLR4 TLR4 NA NA NA NA TLR4 23105 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 123652168 123652528 123652495 Y NA PSMD5,PHF19 PHF19 IMR90 Hi-C 24141950 PHF19 14562 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 123672151 123672562 123672479 Y FBXW2,TRAF1,TRAF1,TRAF1 PHF19 NA NA NA NA PHF19 34545 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 123834049 123834395 123834258 Y TRAF1,TRAF1,CNTRL CNTRL CNTRL,TRAF1 IMR90 Hi-C 24141950 CNTRL 746 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 124121200 124121289 124121241 Y NA STOM GSN IMR90 Hi-C 24141950 STOM 9242 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 124131208 124131276 124131236 Y NA STOM GSN MCF7 ChIA-PET 22265404 STOM 677 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 124134922 124135274 124134953 Y NA STOM GSN MCF7 ChIA-PET 22265404 STOM 4391 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 126200869 126200875 126200873 Y RABGAP1,GPR21,DENND1A NA NA NA NA NA STRBP 172014 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 126959399 126959957 126959825 Y DENND1A NA DENND1A,NEK6 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 57928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 126964717 126965059 126964872 Y NA NA DENND1A,NEK6,LOC100129034,PSMB7 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 52826 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 127001580 127001742 127001674 Y DENND1A,NEK6,NEK6 NEK6 NEK6,DENND1A IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 16143 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 127110676 127110867 127110772 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 64856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 127356875 127357120 127357108 Y NA NA NA NA NA NA MIR181A2HG 61626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 128396600 128396979 128396804 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 70534 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 128408655 128409172 128408692 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 58341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 128597374 128597723 128597549 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 89750 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 129232894 129233686 129233447 Y ZBTB34 NA NA NA NA NA LMX1B 141036 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 129483874 129484165 129483990 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 81120 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130307843 130308200 130307973 Y SLC2A8,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 31068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130308766 130308904 130308855 Y NA FAM129B NA NA NA NA FAM129B 30364 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130543227 130543280 130543253 Y TOR2A,SH2D3C TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS NA NA NA NA CDK9 2678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130545388 130545786 130545583 Y NA TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS NA NA NA NA CDK9 172 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 130624524 130625072 130624605 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,SLC25A25,CDK9 ENG,AK1,ST6GALNAC6 NA NA NA NA ENG 9489 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130788612 130788994 130788712 Y CDK9,SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A FAM102A,SLC25A25,NAIF1 SLC25A25,NAIF1,FAM102A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC25A25 39486 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 131545917 131546049 131545985 Y NA ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114 NA NA NA NA TBC1D13 1434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132107111 132107275 132107178 Y C9orf78,C9orf106 C9orf106,RP11-65J3.1 IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,ASB6,METTL11A,PPP2R4 H1ESC,HELA,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 RP11-65J3.1 14532 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132141110 132141440 132141368 Y NA RP11-65J3.1 LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 RP11-65J3.1 48531 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.86501765404353 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132385793 132386123 132385875 Y C9orf106,TOR1B,PRRX2 ASB6 NA NA NA NA ASB6 16321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132429420 132429769 132429595 Y C9orf50,PRRX2 ASB6 NA NA NA NA ASB6 26976 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132598761 132599163 132598839 Y NA TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78 NA NA NA NA C9orf78 2619 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.07224183782615 chr9 132807262 132807460 132807345 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 3789 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 132963704 132964128 132963904 Y NCS1 NCS1 NA NA NA NA NCS1 30847 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 134114047 134114338 134114158 Y NA FAM78A,PPAPDC3 NA NA NA NA FAM78A 35596 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134128008 134128436 134128111 Y RAPGEF1,QRFP,FAM78A FAM78A,PPAPDC3 NA NA NA NA FAM78A 21498 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.48669020539138 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A FAM78A,PPAPDC3 NA NA NA NA FAM78A 17773 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr9 134148574 134148792 134148687 Y FAM78A FAM78A,PPAPDC3 NA NA NA NA FAM78A 1142 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr9 134460892 134461019 134460973 Y FAM78A,RAPGEF1 NA NA NA NA NA UCK1 56237 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 134531700 134532321 134531936 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 81140 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134553923 134554245 134554041 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 59216 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134581500 134581783 134581703 Y RAPGEF1 RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 31678 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 134773213 134773507 134773412 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 159752 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 135059697 135059990 135059854 Y NA NTNG2 SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 24363 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 135088716 135088744 135088730 Y NA NA NA NA NA NA NTNG2 53382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 136800116 136800268 136800192 Y C9orf7 NA NA NA NA NA VAV2 55458 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 137040428 137040559 137040494 Y SARDH,SARDH,RXRA WDR5,RNU6ATAC NA NA NA NA RNU6ATAC 12742 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 137233458 137233505 137233466 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 26514 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 137264490 137265116 137264820 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 57546 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.27946602160876 chr9 137266309 137266655 137266544 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 59365 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 137288067 137288421 137288149 Y BRD3,RXRA NA NA NA NA NA RXRA 81123 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chr9 139428258 139428617 139428423 Y NACC2,CARD9,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 9697 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 139434156 139434495 139434364 Y FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 3819 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 7230 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 139513037 139513494 139513208 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7,ABCA2 NA MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT2 66381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 14.0912444972178 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chr9 140274735 140275080 140274933 Y CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 40634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chrX 4628683 4629054 4628903 Y NA NA NA NA NA NA RP11-555H23.1 594115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 9309120 9309320 9309226 Y TBL1X,TBL1X NA TBL1X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 120015 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 9929375 9929481 9929417 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 52121 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 12969061 12969258 12969197 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TLR8,TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 21969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TLR8,TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chrX 12974854 12975280 12975169 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 15947 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 12980169 12980547 12980403 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 10680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 12991564 12992257 12991938 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 337 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 13097151 13097463 13097240 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA NA NA NA NA TMSB4X 105924 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 13108770 13109761 13109358 Y TLR8,TMSB4X NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 117543 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 13128879 13129151 13129129 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 137652 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 13677260 13677535 13677469 Y RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA TCEANC 8035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 18445170 18445478 18445437 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 3467 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 128434 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 19792866 19793266 19793149 Y RPS6KA3,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 110453 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 22007452 22007864 22007637 Y NA NA NA NA NA NA SMS 50761 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 22013670 22013825 22013692 Y NA NA NA NA NA NA SMS 56979 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 23390523 23390925 23390723 Y PTCHD1 NA NA NA NA NA PRDX4 289454 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 24187705 24188069 24187889 Y NA ZFX NA NA NA NA ZFX 22415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 24497982 24498378 24498262 Y NA PDK3 NA NA NA NA PDK3 16644 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 30439457 30439475 30439466 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 113742 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 30656549 30656998 30656672 Y GK,CXorf21 FTLP2,GK GK IMR90 Hi-C 24141950 FTLP2 10134 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 37614393 37614669 37614509 Y CYBB CYBB NA NA NA NA CYBB 22595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 37661122 37661884 37661509 Y CYBB CYBB,DYNLT3 NA NA NA NA CYBB 23858 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 38079037 38079366 38079180 Y SRPX SRPX NA NA NA NA SRPX 341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN7 79634 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 38722596 38722667 38722632 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 63911 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 38728212 38728276 38728250 Y MID1IP1 NA NA NA NA NA MID1IP1 69527 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 38729564 38730030 38729639 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 70879 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 38738910 38739411 38739092 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 80225 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chrX 39719669 39720024 39719856 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 74279 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 39865489 39865898 39865566 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 168684 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 39963356 39963613 39963579 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 70969 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 39964528 39964690 39964611 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 69892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 40017598 40017727 40017669 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 16855 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 40031344 40032243 40032130 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 2339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.76140556215223 chrX 40398385 40398889 40398561 Y NA ATP6AP2 NA NA NA NA ATP6AP2 39257 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 40693990 40694519 40694253 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 70718 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 41097774 41098084 41098012 Y USP9X,GPR82,DDX3X NA NA NA NA NA DDX3X 92567 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 41190836 41191010 41190932 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 185 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 41308972 41309137 41309059 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 118321 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA EFHC2 311830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 32007 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 44173548 44173763 44173665 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 27155 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 45647781 45648040 45647909 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43251 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 45665386 45665505 45665456 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 43415 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 46338861 46339028 46338937 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 40712 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 46495805 46496079 46496076 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 64586 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1,CFP NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 WAS,SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 48794892 48795256 48795094 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,WDR45,TFE3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5 NA NA NA NA OTUD5 18392 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 48938465 48938570 48938518 Y NA TFE3,PRAF2,WDR45,GPKOW NA NA NA NA PRAF2 8735 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.725284643239152 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chrX 53740949 53741249 53741172 Y KDM5C,PHF8 HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 29276 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 53741584 53742291 53741941 Y KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8 HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 29911 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 2.59030229728268 chrX 53744165 53744436 53744325 Y NA HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 32492 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.24334510269569 chrX 56756944 56757158 56757051 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA RP11-622K12.1 3252 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 56791132 56791384 56791234 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA UQCRBP1 29122 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.4505692864783 chrX 62772082 62772285 62772184 Y NA RP11-357C3.3 NA NA NA NA RP11-357C3.3 6666 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 63554308 63554471 63554461 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 58862 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 64464605 64464940 64464771 Y ZC4H2,ZC3H12B NA NA NA NA NA ZC4H2 212012 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 64815346 64815780 64815481 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9089 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 64894043 64894537 64894384 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 87786 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 64926114 64926664 64926355 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 119857 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 65207808 65208088 65207980 Y MSN RP6-159A1.3,MIR223,VSIG4 NA NA NA NA RP6-159A1.3 9505 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.621672551347844 chrX 65214786 65214961 65214865 Y MSN RP6-159A1.3,MIR223,VSIG4 NA NA NA NA RP6-159A1.3 2632 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 65217824 65218221 65218055 Y MSN RP6-159A1.3,MIR223,VSIG4 MSN K562 ChIA-PET 22265404 RP6-159A1.3 231 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 65225187 65225542 65225503 Y NA RP6-159A1.3,MIR223,VSIG4 NA NA NA NA RP6-159A1.3 7594 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 65233150 65233304 65233208 Y MSN RP6-159A1.3,MIR223,VSIG4 NA NA NA NA MIR223 3408 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 67905691 67905742 67905716 Y STARD8 STARD8 NA NA NA NA STARD8 40183 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.55418137836961 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.518060459456537 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 146638 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4,CXorf65 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 13891 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 71314849 71315044 71314940 Y CXCR3 NA NA NA NA NA PIN4 84159 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 71322073 71322349 71322283 Y CXCR3 NA NA NA NA NA PIN4 76854 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 71341349 71341530 71341428 Y FLJ44635 NA NA NA NA NA PIN4 57673 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA CITED1 110877 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 72786594 72786762 72786676 Y NAP1L2,CDX4,CHIC1 CHIC1 NA NA NA NA CHIC1 5558 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 73756739 73756964 73756863 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75488 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 73833460 73833840 73833652 Y NA RLIM NA NA NA NA RLIM 1008 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 74958533 74958836 74958643 Y ZDHHC15,MAGEE2 TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 5913 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 77306835 77307068 77306952 Y NA PGK1 NA NA NA NA PGK1 11617 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 77589072 77589352 77589220 Y ATP7A,CYSLTR1 CYSLTR1 NA NA NA NA CYSLTR1 8024 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA CYSLTR1 327783 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 14.7129170485656 chrX 79918713 79919107 79919058 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 144080 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 96701855 96702106 96701982 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 764193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 100640143 100640167 100640158 Y NA TIMM8A,BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4 NA NA NA NA BTK 960 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX3 82233 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 102880714 102880758 102880737 Y PLP1,PLP1 TCEAL3,TCEAL1 NA NA NA NA TCEAL1 874 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 106917022 106917635 106917444 Y NA PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 47285 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 106917807 106918338 106918010 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 48070 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 106919078 106919623 106919349 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 49341 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 5.69866505402191 chrX 106922076 106922520 106922399 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 52339 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 106928255 106928525 106928381 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 58518 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 1.03612091891307 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 113028207 113028379 113028299 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 946164 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 113170298 113170599 113170449 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 1088255 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 115004721 115004876 115004807 Y NA NA NA NA NA NA EEF1GP5 69590 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 117635665 117635786 117635726 Y DOCK11 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 7804 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 118819274 118819809 118819515 Y UBE2A,UBE2A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 5524 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 123606177 123606254 123606218 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 514115 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.828896735130459 chrX 128915135 128915622 128915382 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 SASH3 NA NA NA NA SASH3 3180 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 129245756 129246153 129246006 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 3065 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1,RAB33A ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 3706 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 129308130 129308357 129308196 Y ELF4,ELF4 AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 4507 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 131615038 131615178 131615106 Y MST4,MST4,MBNL3 MBNL3 NA NA NA NA MBNL3 6818 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 132089755 132090160 132089782 Y NA HS6ST2 NA NA NA NA HS6ST2 3263 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 134096434 134096824 134096629 Y NA MOSPD1 FAM127C IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD1 49137 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 135252733 135252893 135252813 Y FHL1,FHL1 NA NA NA NA NA MAP7D3 83748 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 139847313 139847514 139847421 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 421796 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 150018859 150019330 150019048 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 45959 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.310836275673922 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA PNMA3 95010 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA ARHGAP4 31602 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 153771434 153771677 153771549 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2110 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 153960284 153960420 153960353 Y TKTL1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 17438 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307 chrX 154028913 154029459 154029253 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1 DKC1,MPP1 NA NA NA NA MPP1 17823 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.207224183782615 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,BRCC3 NA NA NA NA FUNDC2 3870 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.41444836756523 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE SKM-1 hg19 FANTOM5 0.103612091891307