chr1 839741 840250 839788 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 52439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 840753 841210 840812 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 51479 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 855764 856157 855856 Y NA NOC2L,KLHL17 NA NA NA NA NOC2L 36532 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr1 2246556 2246763 2246722 Y SKI NA NA NA NA NA MORN1 74383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 22237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.12455080164566 chr1 3227700 3227783 3227742 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 141207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 136124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 3374928 3375314 3374967 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 5938 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 6350184 6350543 6350407 Y ZBTB48,GPR153,ACOT7 GPR153 NA NA NA NA GPR153 31149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 7331930 7332127 7331990 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 488546 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr1 8445817 8446112 8445964 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 69931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 8858188 8858497 8858477 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 17205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 8875055 8875165 8875110 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 537 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 9318130 9318195 9318182 Y NA H6PD,SPSB1 NA NA NA NA H6PD 25296 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.77045900137139 chr1 10556105 10556527 10556365 Y NA PEX14,DFFA CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 DFFA 25522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 10927237 10927380 10927309 Y CASZ1 NA PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 72530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 11415566 11415939 11415808 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 84303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 12614115 12614248 12614183 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 325991 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 14992426 14992802 14992486 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 69226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 16669074 16669169 16669123 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 7780 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.48516280347418 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.95728520383988 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 74993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 19701557 19701789 19701674 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 64737 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 19780234 19780551 19780381 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 29515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 21401731 21402159 21402110 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 3485 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 21475659 21476054 21476002 Y EIF4G3,EIF4G3 EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 25323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 22106565 22106957 22106761 Y NA USP48 NA NA NA NA USP48 1142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 22468030 22468558 22468270 Y NA NA NA NA NA NA CDC42 90910 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 23357547 23357765 23357628 Y NA KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 13606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.42940760420559 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 26616527 26617019 26616745 Y ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 12860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA DHDDS 20518 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 27021406 27021810 27021509 Y NA ARID1A NA NA NA NA ARID1A 882 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.24258140173709 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B RP11-344H11.4,TRNP1 NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 27897947 27898332 27898153 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 30610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 27901397 27901604 27901422 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 27338 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 29104880 29105053 29104930 Y NA YTHDF2 NA NA NA NA YTHDF2 43747 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 29137630 29137906 29137764 Y NA NA NA NA NA NA EPB41 73697 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 29224369 29224479 29224424 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 12766 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 30503990 30504255 30504120 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 875353 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 31180963 31181332 31181148 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 198276 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.12455080164566 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,HDAC1 NA NA NA NA HDAC1 23004 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 33089029 33089046 33089038 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 25458 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 36283726 36283900 36283813 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 50158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 38312444 38312820 38312535 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 10472 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 39633654 39634014 39633702 Y BMP8A NA NA NA NA NA MACF1 88666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 40851431 40851768 40851472 Y CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 42909 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 246145 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 42385609 42385954 42385889 Y FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 NA NA NA NA NA HIVEP3 113642 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 44380893 44381202 44381004 Y SLC6A9,B4GALT2,ARTN RP11-7O11.3,IPO13 NA NA NA NA RP11-7O11.3 29021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC24 40653 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 45195062 45195154 45195109 Y RNF220 RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55,RPS15AP11 NA NA NA NA RNU5D-1 220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA ZSWIM5 ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM5 22934 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 46632893 46633236 46633065 Y NA PIK3R3 NA NA NA NA PIK3R3 6924 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 48936089 48936471 48936227 Y NA RNU4-61P,SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 51102056 51102361 51102067 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 321574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 51298202 51298577 51298390 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 125358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 51454917 51455119 51455049 Y NA FAF1,CDKN2C NA NA NA NA CDKN2C 30500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 51475380 51475551 51475487 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 50963 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 52029722 52030067 52029870 Y NA EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL9 10784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 52628189 52628583 52628480 Y NA ZFYVE9 NA NA NA NA ZFYVE9 22143 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 53753056 53753164 53753096 Y NA LRP8 NA NA NA NA LRP8 38578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 59183945 59184311 59184005 Y NA MYSM1 FGGY,HOOK1,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 MYSM1 20181 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 59524373 59524568 59524471 Y NA NA FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 235742 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 61662774 61662930 61662815 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 333843 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 61768031 61768305 61768169 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 420790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 62057030 62057430 62057230 Y NA NA NFIA,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 131665 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 62773248 62773553 62773401 Y NA NA NA NA NA NA USP1 126415 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 65381647 65381826 65381744 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 48361 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 65527577 65527856 65527728 Y NA RP4-535B20.1 AK4 K562 ChIA-PET 22265404 RP4-535B20.1 3564 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 66277656 66278058 66277920 Y LEPROT,LEPR,LEPROT PDE4B NA NA NA NA PDE4B 21459 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P4 133511 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 61288 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 75043793 75044067 75043929 Y NA NA NA NA NA NA TYW3 152769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 75590785 75591155 75591084 Y SLC44A5 NA NA NA NA NA CRYZ 393693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 76197113 76197244 76197179 Y NA ACADM NA NA NA NA ACADM 9077 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 76581893 76581954 76581924 Y NA ST6GALNAC3 NA NA NA NA ST6GALNAC3 43489 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 77713696 77713788 77713742 Y NA PIGK PIGK,AK5,ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 30581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 77842116 77842473 77842156 Y NA NA NA NA NA NA PIGK 159001 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 772913 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 82146044 82146302 82146156 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 39076 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr1 82901959 82902073 82902016 Y NA NA NA NA NA NA RP11-147G16.1 177142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 82913618 82913898 82913758 Y NA NA NA NA NA NA RP11-147G16.1 188801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr1 83269398 83269776 83269625 Y NA NA NA NA NA NA RP11-147G16.1 544581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 83971166 83971473 83971320 Y TTLL7 NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 353233 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 83991462 83991619 83991541 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 333087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 84083536 84083914 84083802 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 240792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 203892 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 84289999 84290187 84290093 Y TTLL7,SAMD13,SAMD13,PRKACB RP11-475O6.1 NA NA NA NA RP11-475O6.1 34519 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 87689823 87690165 87689994 Y HS2ST1,LMO4 NA LOC339524,LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 101986 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 91793812 91793887 91793849 Y NA NA NA NA NA NA HFM1 74539 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 92164446 92164626 92164554 Y NA NA NA NA NA NA CDC7 200038 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 93032261 93032386 93032324 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-59P 132105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 93386726 93386941 93386863 Y NA FAM69A NA NA NA NA FAM69A 38116 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 94216472 94216879 94216807 Y NA NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 93509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 65079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 94992236 94992413 94992325 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 110303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98169222 98169385 98169304 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 159965 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98334223 98334553 98334370 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 50052 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98373500 98373836 98373707 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 10769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98408796 98409171 98408982 Y NA DPYD DPYD,MIR137HG IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 24191 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98425688 98426065 98426013 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 41083 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 98437572 98437739 98437700 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 52967 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98459458 98459857 98459685 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 53562 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 98479796 98480152 98480044 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 33267 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98497100 98497277 98497188 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 16142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98499783 98500490 98500262 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 12929 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 98512823 98513144 98512962 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 275 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 5127 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1070A16.1 67841 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 31459 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 98677142 98677181 98677162 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 2839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 98693625 98693976 98693800 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 19322 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 99102587 99102610 99102599 Y NA SNX7 NA NA NA NA SNX7 22626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 100820585 100820838 100820683 Y HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 12001 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 100918231 100918546 100918401 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 109647 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 103424078 103424427 103424253 Y NA NA NA NA NA NA COL11A1 147625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 103475785 103476234 103476049 Y COL11A1 NA NA NA NA NA COL11A1 95818 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 103572619 103572906 103572682 Y COL11A1 COL11A1 NA NA NA NA COL11A1 567 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr1 106883678 106884013 106883845 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 713254 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 107767992 107768000 107767996 Y NA NA NA NA NA NA NTNG1 87363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 109133120 109133338 109133232 Y STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 32409 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 109156863 109156955 109156909 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 45193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 110895542 110895785 110895664 Y NA RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA RBM15 16414 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 111178912 111179243 111179089 Y RBM15,CD53 NA KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMTOR5-AS1 255471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 116321345 116321551 116321511 Y NA NA CASQ2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 138771 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 117082797 117083071 117083005 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 8083 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C NA NA NA NA NA MAN1A2 245744 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 120180868 120181132 120181082 Y NBPF7,ZNF697 GAPDHP33,ZNF697,PHGDH NA NA NA NA ZNF697 7264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 121154332 121154613 121154395 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 104530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 144987154 144987391 144987382 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 44482 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 57405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6 LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 145627337 145627622 145627480 Y NA NUDT17,POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 18301 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 145640932 145641287 145641091 Y NBPF10 POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 31896 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 146694437 146694614 146694526 Y NA PDIA3P1,CHD1L NA NA NA NA CHD1L 17677 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 146764405 146764804 146764606 Y NA NA NA NA NA NA CHD1L 52114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA RP11-403I13.5 NA NA NA NA RP11-403I13.5 13012 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 154728745 154728994 154728977 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 130270 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 155066604 155066635 155066620 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA1 31301 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 156480721 156480806 156480764 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 12101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 157111103 157111381 157111197 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 4837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 160537909 160538272 160538136 Y ATP1A4,CD48,SLAMF6,CD84 NA NA NA NA NA VANGL2 169533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 161002043 161002401 161002222 Y NA F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA TSTD1 4379 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.47864260191994 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr1 162216729 162216804 162216767 Y NOS1AP NA NA NA NA NA NOS1AP 179165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 164389251 164389388 164389267 Y NA NA NA NA NA NA HMGB3P6 65247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 165674774 165675083 165674866 Y NA ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 8674 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 166102836 166102913 166102873 Y NA NA NA NA NA NA RP11-9L18.2 141921 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 167135568 167135867 167135776 Y NA RP11-277B15.1 CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-277B15.1 5494 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 167474776 167475202 167475007 Y NA CREG1 NA NA NA NA CREG1 45802 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 172631926 172632270 172632095 Y C1orf9,C1orf9,FASLG NA NA NA NA NA PIGC 220696 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 172804293 172804464 172804387 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 393063 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 172828423 172828792 172828524 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,PRDX6,ZBTB37 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 417193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 173433461 173433670 173433598 Y NA PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 10735 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 173529523 173529864 173529609 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 85118 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 174503176 174503233 174503205 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 376628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 179153644 179153909 179153868 Y NA ABL2 NA NA NA NA ABL2 42910 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 182070634 182071001 182070793 Y NA NA CACNA1E IMR90 Hi-C 24141950 RGS16 500542 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 182176105 182176350 182176203 Y NA NA CACNA1E IMR90 Hi-C 24141950 RGS16 395193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 183936673 183936825 183936737 Y APOBEC4 NA NA NA NA NA TSEN15 81986 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 185389591 185389741 185389658 Y NA NA NA NA NA NA IVNS1ABP 105130 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 11.921090609234 chr1 185830907 185831026 185830956 Y HMCN1 NA NA NA NA NA HMCN1 129224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 186567965 186567976 186567970 Y NA NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 225075 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 186584580 186584711 186584687 Y PTGS2,PLA2G4A,TPR NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 241690 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 190286298 190286417 190286358 Y FAM5C NA NA NA NA NA RP11-547I7.2 159264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 190678395 190678750 190678573 Y FAM5C NA NA NA NA NA RP11-547I7.2 232714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 191624673 191624706 191624690 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 1058607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 193226500 193227132 193226836 Y RGS2 NA NA NA NA NA B3GALT2 72716 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 193427775 193428193 193427976 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 273991 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 193509739 193509943 193509807 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 355955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 194047687 194047732 194047710 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 893903 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 196867253 196867632 196867443 Y ZBTB41,F13B,CFHR3 NA NA NA NA NA ASPM 246192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 197747792 197747875 197747834 Y NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 4966 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 200076437 200076447 200076441 Y NR5A2 NA NA NA NA NA ZNF281 300737 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 200321353 200321596 200321470 Y DDX59,ZNF281 NA NA NA NA NA ZNF281 55588 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 200457893 200457983 200457938 Y NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 80709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 202961586 202961702 202961644 Y NA ADIPOR1,CYB5R1,TMEM183A,PPFIA4 NA NA NA NA TMEM183A 12812 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 205179753 205180065 205179802 Y NA DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA DSTYK 1026 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 208135157 208135309 208135233 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 52410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 54165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 209591220 209591436 209591361 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 NA MIR205HG IMR90 Hi-C 24141950 ATP5G2P1 151652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 209820544 209820823 209820626 Y G0S2,LAMB3 G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 G0S2 25942 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr1 211753366 211753524 211753445 Y TRAF5 SLC30A1 NA NA NA NA SLC30A1 3282 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 212113260 212113497 212113379 Y NA NA NA NA NA NA INTS7 93387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 218338759 218338973 218338866 Y NA NA ESRRG IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 117656 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 219497403 219497406 219497405 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 EPRS 720594 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 EPRS 720164 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 219633560 219633803 219633682 Y NA NA NA NA NA NA EPRS 584197 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 64973 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 220938923 220939177 220939050 Y NA MARC2 NA NA NA NA MARC2 19356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 221048646 221048850 221048821 Y NA NA NA NA NA NA MARC2 129079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.60971360511984 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 WDR26 NA NA NA NA WDR26 24317 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 225780677 225780772 225780725 Y NA NA NA NA NA NA ENAH 58072 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 226063760 226064118 226063778 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 NA NA NA NA TMEM63A 3951 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 226842752 226843521 226843149 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 17247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 227730002 227730151 227730029 Y NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 228686214 228686407 228686300 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 13452 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.06879560237707 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 229166537 229166799 229166668 Y RAB4A,C1orf96 NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 237976 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 229409656 229409997 229409713 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A NA NA NA NA RAB4A 4834 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 229601636 229601883 229601761 Y NA NUP133,RP4-613A2.1 NA NA NA NA NUP133 40220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 230061007 230061186 230061097 Y ACTA1 NA NA NA NA NA GALNT2 130350 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 230643766 230644066 230643893 Y NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 COG2 132169 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr1 241693216 241693255 241693236 Y KMO FH NA NA NA NA FH 12155 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 241790752 241791037 241791008 Y NA OPN3 NA NA NA NA OPN3 47641 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 243654647 243654885 243654744 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 237327 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 246317158 246317459 246317368 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351155 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 246948292 246948613 246948340 Y NA NA NA NA NA NA SCCPDH 62943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr1 247537279 247537425 247537333 Y NA ZNF496 AHCTF1,ZNF496 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 44131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 3870489 3871262 3871176 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 45016 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 458335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 6237775 6238114 6237949 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 52894 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 6339022 6339139 6339081 Y NA NA NA NA NA NA PFKFB3 154141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 6516020 6516190 6516056 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PRKCQ 104073 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 10674223 10674364 10674239 Y CELF2,CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 160579 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 10831008 10831167 10831105 Y NA SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 3776 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 10839185 10839573 10839228 Y CELF2 SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 4242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 10914098 10914350 10914196 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 79155 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 10953472 10953723 10953520 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 118529 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 10960675 10960888 10960781 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 125732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 11054573 11055101 11054777 Y CELF2,CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 219630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 11061356 11061896 11061544 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 226413 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 11077382 11077525 11077432 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 242439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 11112343 11112864 11112373 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 277400 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 11192105 11192722 11192260 Y CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 357162 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 11205067 11205773 11205317 Y CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 370124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 376484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 11220579 11221039 11220795 Y CELF2 NA NA NA NA NA SFTA1P 385636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 11652835 11653073 11652954 Y CELF2,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 1082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 13200624 13201003 13200885 Y NA MCM10 NA NA NA NA MCM10 551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 14039311 14039587 14039450 Y FRMD4A NA NA NA NA NA PRPF18 412384 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 15179834 15179919 15179877 Y NA RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 28773 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 17280857 17281170 17281014 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM NA NA NA NA VIM 12599 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 17467799 17468377 17468085 Y STAM,ST8SIA6 NA NA NA NA NA PTPLA 188999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 20118701 20118910 20118781 Y NA PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 15533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 21430870 21431276 21431139 Y NEBL,C10orf113 NEBL NA NA NA NA NEBL 29840 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-275N1.1 77370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 94412 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 22919359 22919855 22919730 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 81629 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 24993053 24993414 24993236 Y GPR158,ARHGAP21 ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 17183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 27032794 27033066 27033024 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 48206 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 28725980 28726021 28726001 Y NA NA NA NA NA NA WAC 93401 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 31107978 31108144 31108047 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZNF438,KIF5B,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 210722 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 31109229 31109540 31109356 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 209326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 31289701 31290078 31290005 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 28788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.12455080164566 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 35028968 35029134 35029048 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 73119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 43761301 43761565 43761418 Y RASGEF1A NA NA NA NA NA CSGALNACT2 129367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 43936251 43936518 43936384 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 22065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 45374285 45374680 45374305 Y NA NA NA NA NA NA RASSF4 78175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 188277 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF488 696953 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 49847565 49847971 49847911 Y NA NA NA NA NA NA MAPK8 334867 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 54069854 54070012 54069944 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 2044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54208151 54208375 54208306 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 19918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54212715 54213183 54212814 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15110 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 138802 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54438333 54438755 54438445 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 210040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54466498 54466779 54466584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 238205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 243124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 54484465 54484478 54484473 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 256172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 714505 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 61997048 61997297 61997111 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 332634 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 63839926 63839992 63839961 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 180867 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 63859069 63859192 63859131 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 167274 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 64009597 64009980 64009923 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 16486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 106321 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68690818 68690961 68690956 Y NA LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 7054 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr10 68710552 68710810 68710582 Y LRRTM3 LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 26788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68718064 68718186 68718126 Y LRRTM3 LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 34300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 68721315 68721864 68721513 Y LRRTM3 LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 37551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68755189 68755293 68755241 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 71425 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 68796734 68796983 68796808 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 112970 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 68802112 68802301 68802189 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 118348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 118776 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68843787 68844099 68844033 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM3 160023 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 68863979 68864150 68864009 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 180215 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA3 69390 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA3 69953 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 69822197 69822546 69822385 Y NA HERC4 NA NA NA NA HERC4 10559 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 71568355 71568510 71568433 Y NA NA NA NA NA NA C10orf35 180348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 73887320 73887439 73887380 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC16 86348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 73946489 73946835 73946688 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 26952 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 74991679 74992005 74991988 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 14615 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 75348138 75348289 75348214 Y NA NA FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L IMR90 Hi-C 24141950 PPP3CB 94356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 75386298 75386455 75386385 Y NA NA NA NA NA NA AGAP5 69184 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 75653245 75653472 75653359 Y NA CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 13463 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr10 78857417 78857654 78857522 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 826724 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 79526031 79526385 79526077 Y NA NA KCNMA1,POLR3A,DLG5 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 157993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 79545596 79545879 79545660 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 138499 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr10 80337535 80337763 80337650 Y ZMIZ1 NA RPS24,ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 489029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 82215085 82215437 82215324 Y TSPAN14,SH2D4B FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 3163 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 82290071 82290345 82290209 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN14 78149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.36713220338275 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr10 89867228 89867664 89867376 Y PTEN NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 163969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 89934548 89934906 89934582 Y NA NA PTEN,CFL1P1,KLLN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 231289 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 90527399 90527667 90527447 Y ANKRD22,LIPN NA NA NA NA NA STAMBPL1 109824 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30,ANKRD1 NA NA NA NA ANKRD1 2278 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr10 94608884 94609046 94608952 Y NA EXOC6 NA NA NA NA EXOC6 19949 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 95128871 95128891 95128880 Y CYP26C1 NA NA NA NA NA RP11-624L12.1 86556 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 99307029 99307251 99307137 Y NA PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 PI4K2A 34880 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27,SFRP5 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 101942179 101942274 101942224 Y CWF19L1,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 3817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 102140082 102140467 102140275 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 8710 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA PAX2 PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 PAX2 4377 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.19334640402273 chr10 102490692 102490976 102490862 Y NA PAX2 NA NA NA NA PAX2 2384 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 102831127 102831150 102831139 Y NA PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA KAZALD1 11529 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 103453403 103453880 103453587 Y LDB1,BTRC,MGEA5 FBXW4 NA NA NA NA FBXW4 351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 103591495 103591519 103591507 Y BTRC,KCNIP2,KCNIP2 MGEA5 NA NA NA NA MGEA5 14799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr10 104683249 104683568 104683410 Y NA CNNM2 NA NA NA NA CNNM2 7199 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 105302775 105302952 105302862 Y NA NA NA NA NA NA PDCD11 148370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 105452274 105452407 105452303 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 223556 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 105630915 105631032 105630972 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 44931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 105805832 105806162 105806026 Y NA COL17A1 NA NA NA NA COL17A1 37598 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 105941427 105941470 105941449 Y SORCS3,WDR96 WDR96 NA NA NA NA WDR96 48650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 112668861 112669237 112669049 Y PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 7795 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 114818562 114818849 114818630 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 110553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 116776820 116777128 116776974 Y NA NA ATRNL1 IMR90 Hi-C 24141950 TRUB1 80868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 126397729 126397974 126397834 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 32864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 797 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 127576777 127576887 127576832 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 127819995 127820181 127820087 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 236887 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 128268326 128268334 128268330 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 323644 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA NA NA NA NA NA DOCK1 355319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 129851192 129851341 129851267 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 71308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 134266616 134267060 134266753 Y LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92 NA NA NA NA NA PWWP2B 57944 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 UTF1,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA UTF1 32913 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr10 135205459 135205597 135205554 Y C10orf92 PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA MTG1 1 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 341474 341670 341587 Y NA IFITM2,IFITM3,B4GALNT4 RIC8A,SIRT3,BET1L,IFITM3,IFITM1,IFITM5,PSMD13,IFITM2,NLRP6,ATHL1,PTDSS2,SIGIRR,ANO9,B4GALNT4,PKP3,RNH1 IMR90 Hi-C 24141950 IFITM3 15937 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 1412454 1412793 1412702 Y NA BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 3325 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 1879618 1879880 1879749 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP39 67835 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 2598295 2598461 2598377 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 120763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 2619837 2620105 2619972 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 99119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195 NA NA NA NA ZNF195 45291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 6564206 6564247 6564227 Y NA NA NA NA NA NA RRP8 58603 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 8166799 8166849 8166831 Y NA RIC3 NA NA NA NA RIC3 21753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 8857868 8857938 8857900 Y NA NA NA NA NA NA AKIP1 72748 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 9781782 9782109 9781859 Y NA NA NA NA NA NA SWAP70 98158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 9907928 9908258 9908093 Y NA NA SWAP70,LOC440028,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 SWAP70 224304 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 11326137 11326382 11326218 Y NA NA NA NA NA NA ZBED5 447794 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 13184094 13184485 13184290 Y NA NA LOC100506305,RASSF10,TEAD1 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 111714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 14600110 14600431 14600207 Y CYP2R1,PSMA1,PDE3B NA NA NA NA NA PSMA1 60220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 17036768 17036996 17036882 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7 NA NA NA NA PLEKHA7 2778 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA E2F8 388814 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 29214488 29214817 29214653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 492326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 31165521 31165554 31165538 Y IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DCDC1 223803 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 31317361 31317619 31317485 Y NA NA NA NA NA NA DCDC1 71738 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 33742880 33743486 33743237 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 12505 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 35051463 35051997 35051695 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 106420 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 37350813 37350846 37350830 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 736762 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 44221715 44221986 44221792 Y NA NA NA NA NA NA EXT2 106616 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 46085573 46085592 46085583 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 55393 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 87257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 46444740 46444848 46444831 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 44434 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 46497144 46497389 46497267 Y NA NA NA NA NA NA MDK 96838 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 47867685 47867881 47867783 Y OR4X1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 58967466 58967980 58967724 Y OR4D6,PATL1,MPEG1 DTX4 NA NA NA NA DTX4 30563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 59323878 59323962 59323920 Y NA NA NA NA NA NA OSBP 57655 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 60499458 60499898 60499803 Y MS4A6E,MS4A14,MS4A5,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 107646 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr11 61484059 61484366 61484213 Y CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,DAGLA,FTH1 DAGLA NA NA NA NA DAGLA 38154 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 62143612 62143665 62143638 Y NA ASRGL1,RCC2P6 NA NA NA NA RCC2P6 6994 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 62267714 62268111 62267986 Y NA RP11-864I4.4 NA NA NA NA RP11-864I4.4 43360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 63288306 63288408 63288365 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G16 93947 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.84577480530269 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65342581 65342818 65342732 Y TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1 LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA EHBP1L1 1072 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.24258140173709 chr11 65583188 65583268 65583228 Y NA MUS81,CFL1 NA NA NA NA MUS81 39329 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 66221780 66221966 66221875 Y RBM4 RP11-867G23.10,MRPL11,PELI3,DPP3,CTD-3074O7.5 PELI3,DPP3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL11 10243 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr11 67143202 67143472 67143423 Y CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 4147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 69089155 69089700 69089444 Y MRGPRD NA CCND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TPCN2 274790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr11 70144122 70144421 70144277 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 29316 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 70371334 70371589 70371462 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 128740 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA NA NA NA NA NA RNF121 66878 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 70390 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 72068743 72068761 72068752 Y NA NA NA NA NA NA CLPB 74931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 71209 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 75883349 75883640 75883491 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIR 206375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 NA NA NA NA NA PRKRIR 169769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIR 169115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78003105 78003596 78003355 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 105237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78025089 78025245 78025191 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 102149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78060066 78060579 78060413 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 66815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 78144030 78144327 78144179 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 16636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 82610096 82610395 82610239 Y PCF11,ANKRD42,RAB30 C11orf82 NA NA NA NA C11orf82 1079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 82918019 82918384 82918270 Y PCF11,ANKRD42 ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1 NA NA NA NA RP11-727A23.1 3663 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF,CCDC89 NA NA NA NA CCDC89 24171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 90822237 90822333 90822285 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 808509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 93253925 93254245 93254149 Y SLC36A4,C11orf75 RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 12389 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 95163190 95163241 95163211 Y NA NA NA NA NA NA ENDOD1 342216 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 102425840 102426191 102426016 Y NA NA BIRC2,TMEM123,MMP7,MMP20 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 86725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 103801275 103801290 103801283 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 231817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 104128696 104129051 104128955 Y NA NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 PDGFD 95589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 105052298 105052756 105052424 Y NA NA NA NA NA NA CARD16,CASP1 82140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 105061488 105061502 105061495 Y NA NA NA NA NA NA CARD16,CASP1 91330 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 105090888 105091203 105091058 Y CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA NA NA NA NA CARD16,CASP1 120730 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr11 105516722 105517118 105516920 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA RNU4-55P 176242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 105674568 105674985 105674652 Y KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 RNU4-55P NA NA NA NA RNU4-55P 18375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 107818531 107818875 107818638 Y NA RP11-832N8.1,SLC35F2,RAB39A NA NA NA NA RAB39A 21302 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 108519095 108519272 108519184 Y NA DDX10 ATM,ACAT1,NPAT IMR90 Hi-C 24141950 DDX10 14480 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA USP28 201112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 115927374 115927450 115927387 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 553699 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 116884410 116884712 116884644 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 20055 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 118562658 118562793 118562724 Y FOXR1 NA BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDB1 87503 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 118806138 118806167 118806153 Y NA MIR4492,BCL9L PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9L 11821 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 118811049 118811291 118811217 Y NA MIR4492,BCL9L PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9L 16732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 119565806 119566154 119565980 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 31640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 121324755 121324861 121324769 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 3843 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 122052220 122052515 122052369 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 471868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 122587982 122588633 122588143 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 63599 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 123173564 123173848 123173613 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 241626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 124333152 124333516 124333336 Y NA NA OR10G9 IMR90 Hi-C 24141950 TBRG1 157216 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 124458771 124459153 124459140 Y OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1 NA NA NA NA TBRG1 31579 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3 NA NA NA NA RP11-677M14.3 41863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr11 125904022 125904031 125904027 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 27199 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 125976647 125976803 125976705 Y NA CDON HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 45417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr11 126337982 126338153 126338089 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 114447 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 128445940 128446213 128446123 Y FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA NFRKB 1317272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 128586554 128587109 128586817 Y FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA NFRKB 1176376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 128927593 128927968 128927781 Y NA NA NA NA NA NA NFRKB 835517 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA NFRKB 749854 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 129102482 129102753 129102618 Y NA NA NA NA NA NA NFRKB 660732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 130743628 130743895 130743754 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 40509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 132940132 132940357 132940242 Y OPCML NA NA NA NA NA IGSF9B 884523 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 133920876 133920983 133920947 Y B3GAT1,SPATA19,JAM3 RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA JAM3 15837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr11 133940508 133940868 133940637 Y NA RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA JAM3 3688 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 133969165 133969269 133969217 Y IGSF9B JAM3 NA NA NA NA JAM3 32345 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr11 134688539 134688830 134688760 Y NA NA NA NA NA NA B3GAT1 408727 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,LPCAT3 NA NA NA NA LPCAT3 19454 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.49168300502842 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 9491229 9491519 9491373 Y NA NA C12orf33,LOC144571 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP4 100302 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 376135 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 11951921 11952163 11952067 Y ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 151133 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 11962012 11962232 11962094 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 161224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 13292095 13292429 13292230 Y NA GSG1 EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 GSG1 37476 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 14410616 14411017 14410842 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 105593 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA DERA 492147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 16817876 16817986 16817888 Y LMO3 NA NA NA NA NA RP11-1018J11.1 322074 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 17520560 17520632 17520596 Y NA RP11-871F6.2 NA NA NA NA RP11-871F6.2 30701 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 19534179 19534194 19534187 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 20785 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 19557871 19558201 19558036 Y NA AEBP2 AEBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 2892 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 20746479 20746810 20746645 Y LST-3TM12 NA NA NA NA NA PYROXD1 841739 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 22482741 22482768 22482755 Y NA NA NA NA NA NA CMAS 285633 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 23746822 23747228 23747075 Y SOX5 NA NA NA NA NA ETNK1 970813 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 23779855 23779927 23779875 Y SOX5 NA NA NA NA NA ETNK1 1003846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 NA NA NA NA NA BCAT1 426587 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 24873069 24873359 24873202 Y NA NA SOX5,LINC00477 IMR90 Hi-C 24141950 BCAT1 227034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.83273440219422 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA NA NA NA NA NA RASSF8 157301 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 27726864 27727242 27727000 Y STK38L,PPFIBP1 NA NA NA NA NA PPFIBP1 52500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 29194633 29194954 29194755 Y NA NA CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 337168 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 31754010 31754391 31754188 Y DENND5B,METTL20 DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20 DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 11979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.83925460374846 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 32881013 32881116 32881065 Y NA RP11-278C7.1,YARS2 NA NA NA NA RP11-278C7.1 2692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr12 39539251 39539539 39539453 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 240019 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 41706432 41706786 41706551 Y PDZRN4 NA NA NA NA NA CNTN1 622188 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 42958967 42958984 42958976 Y NA PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 23173 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 42984702 42985091 42984897 Y GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1 PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 2545 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 43506983 43507174 43507167 Y ADAMTS20 NA NA NA NA NA RP11-25I15.1 436057 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 46798246 46798498 46798428 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 22784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr12 46886273 46886657 46886465 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 110811 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C,COL2A1 TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 COL2A1 825 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA COL2A1 NA NA NA NA COL2A1 35013 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 48579978 48580344 48580161 Y OR8S1,OR10AD1 ASB8,C12orf68 NA NA NA NA C12orf68 4612 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,FKBP11 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 19761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr12 49822830 49822961 49822896 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2 64463 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 50019010 50019299 50019155 Y FMNL3 NA NA NA NA NA PRPF40B 59009 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 50100082 50100376 50100305 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA FMNL3 134 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 51551925 51552239 51552062 Y NA TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 12687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 51835468 51835599 51835503 Y POU6F1,SCN8A,SLC4A8 NA NA NA NA NA GALNT6 50817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 52241099 52241559 52241297 Y NA NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101892 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr12 52242460 52242886 52242778 Y SLC4A8,ANKRD33 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 100565 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 52419301 52419935 52419633 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 52617951 52618303 52618240 Y NA NA NA NA NA NA C12orf44 156921 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 67222 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 53892109 53892322 53892185 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC-AS1 113 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 54400493 54400742 54400596 Y HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 90 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54400746 54401119 54400931 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr12 54413422 54413659 54413446 Y ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10978 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 54752421 54752649 54752549 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 58595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 55806634 55807051 55806823 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 266279 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 9.08835620703978 chr12 57407966 57408056 57408000 Y NA ZBTB39 NA NA NA NA ZBTB39 9736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 57462088 57462242 57462164 Y R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6 TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 17604 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 57855378 57855667 57855523 Y NA R3HDM2,GLI1,MARS NA NA NA NA GLI1 3460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 58262646 58262949 58262748 Y KIF5A,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1,AVIL RP11-620J15.1,CTDSP2 CTDSP2 K562 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 24124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 62609319 62609899 62609601 Y C12orf61,USP15 USP15 NA NA NA NA USP15 42220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61 NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 65012959 65013250 65013088 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 10666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 65074143 65074354 65074186 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 71850 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2,RP11-366L20.2 NA NA NA NA HMGA2 22022 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 66292016 66292293 66292025 Y NA RP11-366L20.2,RP11-366L20.3 NA NA NA NA RP11-366L20.2 18069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 66311039 66311339 66311117 Y HMGA2 RP11-366L20.2,RP11-366L20.3 NA NA NA NA RP11-366L20.3 28920 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB NA NA NA NA NA HELB 65035 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 67275619 67275719 67275669 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 185223 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 67392180 67392257 67392219 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 68685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 70633612 70633702 70633681 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 1072 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 72691947 72692219 72692098 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TBC1D15 460460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 75838282 75838452 75838367 Y NA NA NA NA NA NA GLIPR1L2 55432 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 78238066 78238311 78238190 Y NA NAV3 NA NA NA NA NAV3 15381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 78398192 78398473 78398333 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 175507 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 78412779 78412965 78412883 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 190094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 80907201 80907494 80907379 Y NA NA NA NA NA NA PTPRQ 109427 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 85793012 85793355 85793084 Y NA NA NA NA NA NA LRRIQ1 364920 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 88810675 88811028 88810796 Y NA NA NA NA NA NA KITLG 161600 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 89632867 89633143 89633005 Y NA NA POC1B,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 111905 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 89737833 89738159 89738081 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 6889 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 89960420 89960675 89960548 Y NA POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNT4,POC1B-GALNT4 42381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 90175016 90175190 90175077 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 NA C12orf37,LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 73939 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 90918093 90918302 90918198 Y NA NA NA NA NA NA LUM 585306 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 91737863 91738211 91738037 Y C12orf12 NA EPYC,DCN,PLEKHG7 IMR90 Hi-C 24141950 DCN 162963 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 94179016 94179409 94179114 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 109865 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 94601562 94601834 94601710 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA RBMS2P1 214911 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 94696122 94696451 94696433 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 120294 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 95411707 95411975 95411841 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 16161 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 95492031 95492186 95492111 Y NA NR2C1 NA NA NA NA NR2C1 26552 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 95939436 95939751 95939594 Y NA USP44 NA NA NA NA USP44 3515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 96627063 96627293 96627178 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 40903 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 96642925 96643253 96643074 Y CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 56765 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 99250809 99251297 99251146 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 213890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 99528528 99528859 99528694 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA APAF1 491609 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 99786605 99786971 99786790 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA UHRF1BP1L 747655 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 103355002 103355125 103355058 Y NA NA NA NA NA NA NUP37 843100 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 105062941 105063154 105062961 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 215868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 106401702 106402025 106401865 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 129786 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 106423903 106423941 106423922 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 107870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 110735237 110735389 110735298 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 18676 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA HMGA1P3 1049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 111015565 111016027 111015682 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 3098 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 116975193 116975459 116975296 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 NA NA NA NA LINC00173 5966 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 120451614 120452059 120451867 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 101247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 120912483 120912692 120912652 Y NA COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 6830 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 122771781 122771848 122771815 Y NA VPS33A NA NA NA NA VPS33A 22713 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 123218047 123218405 123218295 Y CLIP1,RSRC2,HCAR2,HCAR3,VPS37B,C12orf65 DENR NA NA NA NA DENR 16916 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA CCDC92 419959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 124939391 124939634 124939467 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 425580 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 125034286 125034471 125034389 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 330743 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr12 125331273 125331577 125331425 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 33637 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr12 125534116 125534467 125534247 Y NA AACS AACS K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AACS 13458 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 125565000 125565015 125565008 Y AACS AACS NA NA NA NA AACS 17075 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 127770941 127771084 127771022 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 122269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 130947882 130948028 130947955 Y NA NA NA NA NA NA FZD10-AS1 303081 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 20744892 20745400 20745185 Y PSPC1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 11704 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr13 21632492 21632727 21632640 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 21893563 21893874 21893643 Y NA MIPEPP3 ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEPP3 23285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 22688764 22689136 22688963 Y NA NA NA NA NA NA FGF9 445242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 23720936 23721336 23721062 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 14623 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 23815337 23815738 23815537 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P6 109024 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 26562971 26563100 26563036 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 231691 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 28882388 28882716 28882654 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P3 95738 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 29106089 29106574 29106395 Y NA NA FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF4A1P7 64396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 32347687 32348021 32347892 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 539590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 272945 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 40064271 40064571 40064449 Y NA NA NA NA NA NA LHFP 111094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 42422497 42422720 42422629 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 421569 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 42721459 42721826 42721635 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 122463 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 46869807 46870189 46870040 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA COX17P1 192808 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 18138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 50783828 50784088 50783957 Y NA NA DLEU2,DLEU7 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DLEU2 85972 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 52505834 52506318 52505967 Y NA NA NA NA NA NA ALG11 78216 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 60570337 60570455 60570340 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 165666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 64563606 64563820 64563696 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 84324 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 64589476 64589676 64589576 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 58468 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 64596462 64596642 64596562 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 51502 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr13 67044057 67044469 67044407 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 757999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 67081521 67081801 67081799 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 720667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 67146133 67146492 67146404 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 655976 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 67168022 67168413 67168283 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 634055 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 67204176 67204298 67204237 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 598170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 67442728 67443117 67443041 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 359351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr13 67457681 67458008 67457948 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 344460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 340742 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr13 67568177 67568566 67568563 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 233902 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 127240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 23.2520282180109 chr13 67722025 67722418 67722226 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 80050 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 67730122 67730387 67730193 Y PCDH9 NA NA NA NA NA PCDH9 72081 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 10.6227540082283 chr13 69259676 69259922 69259838 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 1457208 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.1310710031999 chr13 69260181 69260548 69260436 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 1457713 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr13 69285358 69285440 69285385 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 1482890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 76710919 76711181 76711051 Y NA NA NA NA NA NA UCHL3 589300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 77899332 77899971 77899636 Y KCTD12,FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 80934191 80934539 80934365 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 21105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 80936113 80936309 80936180 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 23027 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 81018473 81018771 81018618 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 105387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 81084769 81085090 81084930 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 171683 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 81436860 81437248 81437054 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 523774 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 92874267 92874578 92874398 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 876193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 95620867 95621252 95621220 Y NA NA CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 SOX21-AS1 257897 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA CALM2P4 271218 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 99628165 99628894 99628676 Y DOCK9 NA NA NA NA NA UBAC2-AS1 222070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 99930007 99930140 99930028 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 63995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 100399124 100399585 100399214 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 142205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 101310141 101310446 101310274 Y TMTC4 TMTC4 NA NA NA NA TMTC4 14901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 102341558 102341578 102341569 Y NA NA NA NA NA NA NALCN 274715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 527101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 514704 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr13 111978531 111978724 111978632 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 213625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 112711940 112712042 112711992 Y NA SNORD44 NA NA NA NA SNORD44 7548 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr13 113597069 113597276 113597160 Y MCF2L MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 MCF2L-AS1 23862 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 114809032 114809271 114809129 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 86815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr13 114890433 114890784 114890662 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 5302 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr14 21564675 21565076 21564876 Y NA ARHGEF40,NDRG2,ZNF219 NA NA NA NA ZNF219 5805 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 22025629 22026018 22025838 Y NA METTL3,SALL2 NA NA NA NA SALL2 22279 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 31055388 31055443 31055417 Y NA G2E3,SCFD1 NA NA NA NA G2E3 29059 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 32950745 32951147 32950873 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 859 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr14 33950978 33951281 33951079 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 548839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 34176402 34176558 34176443 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 753004 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 35575000 35575033 35575017 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA PPP2R3C 14690 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 35800965 35801124 35801022 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA PSMA6 55126 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 37196978 37197084 37197041 Y NA NA NA NA NA NA PAX9 72205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 37468951 37469405 37469233 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 170666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 LRFN5 NA NA NA NA LRFN5 365 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr14 42158111 42158422 42158211 Y LRFN5 NA NA NA NA NA LRFN5 83338 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 42297588 42297942 42297766 Y LRFN5 NA NA NA NA NA LRFN5 222815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50213261 50213687 50213459 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 18639 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50237132 50237443 50237218 Y KLHDC2 KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 4806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50256678 50256775 50256761 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 24352 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.36061200182852 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 51830897 51831022 51831007 Y TRIM9 NA NA NA NA NA FRMD6 122796 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 51975090 51975414 51975252 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 21272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 52332665 52333559 52333252 Y PTGER2,PTGDR,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 120634 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 54137471 54137744 54137539 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD1 519471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 55375075 55375158 55375100 Y LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 GCH1 NA NA NA NA GCH1 7505 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 57424216 57424296 57424257 Y OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 309430 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 274422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr14 57725682 57725794 57725735 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7932 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 59556321 59556627 59556473 Y NA NA DACT1,KIAA0586 IMR90 Hi-C 24141950 DAAM1 96737 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 59768078 59768328 59768116 Y RTN1,DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 114714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 60629133 60629293 60629144 Y NA DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 5281 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 61188472 61188761 61188676 Y PPM1A SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 305 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 61652622 61652735 61652681 Y NA NA SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT5 206546 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 62032593 62032996 62032785 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 127235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 62298450 62298645 62298529 Y NA COX4I1P1 PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 1363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 65512172 65512469 65512321 Y NA NA NA NA NA NA MAX 54944 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 65546452 65546770 65546602 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 20643 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 67416708 67417057 67416792 Y GPHN NA NA NA NA NA MPP5 288769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68319804 68320176 68320100 Y NA ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA RAD51B 35308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68320437 68320759 68320587 Y ZFYVE26 ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA RAD51B 35941 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 68529528 68529897 68529655 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 245032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr14 68903483 68903615 68903549 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 16570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 68961774 68962026 68961864 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 74861 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 69238585 69238703 69238646 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 22487 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr14 69867695 69867997 69867846 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA ERH 4351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 69913588 69913836 69913761 Y NA NA NA NA NA NA ERH 50244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 71711284 71711362 71711294 Y NA NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 73804 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 71811948 71812060 71812004 Y NA SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 25417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 73826978 73827275 73827127 Y ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43 NA NA NA NA NA NUMB 101073 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 75037027 75037351 75037159 Y NA NA NA NA NA NA NPC2 78147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 2790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 75963682 75963938 75963768 Y C14orf1,BATF NA TMED10,NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 JDP2 71263 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 76032638 76033032 76032887 Y FOS,BATF,FLVCR2 FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 9928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 10455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.77697920292562 chr14 77505083 77505447 77505354 Y TMEM63C,TMED8,KIAA1737 IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 12049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr14 78059840 78060228 78060134 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 20888 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 80972596 80972697 80972671 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 120496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 81375179 81375565 81375372 Y STON2,CEP128 CEP128 NA NA NA NA CEP128 48296 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 81440226 81440497 81440374 Y CEP128,TSHR CEP128 NA NA NA NA CEP128 16365 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 81503760 81504107 81503844 Y TSHR NA NA NA NA NA CEP128 79899 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr14 83623464 83623477 83623471 Y NA NA NA NA NA NA RP11-11K13.1 362899 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 84176891 84176909 84176900 Y NA NA NA NA NA NA RP11-11K13.1 916326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 85881762 85881957 85881956 Y FLRT2 NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 112375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.60971360511984 chr14 85978533 85978728 85978633 Y FLRT2 RP11-497E19.1,FLRT2 NA NA NA NA RP11-497E19.1 15604 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 10.5047234081369 chr14 85979706 85979846 85979775 Y FLRT2 RP11-497E19.1,FLRT2 NA NA NA NA RP11-497E19.1 14486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.6589486028342 chr14 86066316 86066619 86066414 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 71828 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 86073952 86074255 86074109 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 79464 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 88884161 88884478 88884321 Y NA SPATA7 NA NA NA NA SPATA7 34893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 89739645 89739700 89739695 Y NA CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 16238 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 89771520 89771819 89771727 Y FOXN3,FOXN3 CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 15582 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 91022350 91022704 91022530 Y TTC7B,CALM1 NA NA NA NA NA CALM1 161504 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 91069038 91069054 91069046 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 208192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 129226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 93121718 93122010 93121905 Y ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 91037 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 93193771 93194035 93193928 Y MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 19012 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 93539735 93540013 93539874 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 40652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7,UNC79 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 95724003 95724377 95724190 Y DICER1,DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 59866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 98628838 98629187 98628997 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 1316029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 99283105 99283111 99283108 Y NA NA C14orf64 IMR90 Hi-C 24141950 SETD3 662105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 100478682 100479045 100478865 Y NA NA EVL IMR90 Hi-C 24141950 DEGS2 145455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 128705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 100497913 100498157 100498035 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 126343 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 DEGS2 NA NA NA NA DEGS2 8868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.72122400365703 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr14 100952760 100952992 100952839 Y NA NA NA NA NA NA BEGAIN 98758 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 101020509 101020866 101020628 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 30884 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 101049817 101049857 101049837 Y DLK1,BEGAIN BEGAIN WDR25,MEG3,BEGAIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BEGAIN 1893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 102050999 102051149 102051091 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 174986 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102173765 102174142 102173896 Y NA NA PPP2R5C,DYNC1H1,LINC00239 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R5C 51993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102292259 102292630 102292392 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 66124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.54743820429701 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102819515 102819720 102819663 Y WDR20,TRAF3,RCOR1,TECPR2,CINP,CINP MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 NA NA NA NA CINP 7533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102868139 102868468 102868196 Y HSP90AA1,RCOR1,TECPR2 CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 40839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 103097343 103097523 103097412 Y NA RCOR1 NA NA NA NA RCOR1 40345 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr14 103993761 103994083 103993826 Y NA CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P NA NA NA NA TRMT61A 240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 104228992 104229118 104229080 Y NA XRCC3,ZFYVE21 NA NA NA NA ZFYVE21 48925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 104601589 104601707 104601649 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 1353 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr14 106857348 106857526 106857389 Y NA NA NA NA NA NA LINC00221 78919 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 20500145 20500389 20500187 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 2043700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 1996448 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 1973869 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 20590692 20590758 20590725 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1953331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1946869 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 20612710 20612766 20612738 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1931323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 637959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA RP11-680F8.1 57328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 31598782 31598890 31598869 Y NA KLF13 OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 18168 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 33083952 33084023 33083988 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 75777 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 2271 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 36349026 36349361 36349194 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 193097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr15 36355561 36355727 36355644 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 186731 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr15 36404848 36405114 36404981 Y C15orf41 NA NA NA NA NA RP11-184D12.1 137344 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr15 36502579 36502898 36502738 Y NA RP11-184D12.1 NA NA NA NA RP11-184D12.1 39560 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr15 36910960 36911073 36911017 Y MEIS2,C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 41148 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA MEIS2 184054 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 38918767 38918902 38918845 Y NA NA FAM98B,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 174439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40337433 40337595 40337464 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 8044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40385571 40385715 40385643 Y BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 13378 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 40803219 40803626 40803467 Y RHOV,BMF CHST14 NA NA NA NA CHST14 42059 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA NA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 106045 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 42220921 42221174 42221042 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 41602 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 43152474 43152861 43152772 Y STARD9,TTBK2 NA NA NA NA NA TTBK2 58146 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 43361299 43361456 43361377 Y TP53BP1 UBR1,RPS3AP47 NA NA NA NA UBR1 34855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47 NA NA NA NA RPS3AP47 8323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 44431053 44431468 44431357 Y NA NA NA NA NA NA FRMD5 53982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 45784407 45784611 45784453 Y C15orf48,SQRDL,PLDN SLC30A4 NA NA NA NA SLC30A4 28394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 45929603 45930187 45929917 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 8257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 49268018 49268116 49268067 Y NA SHC4 NA NA NA NA SHC4 14377 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 49488021 49488225 49488024 Y NA GALK2,COPS2 NA NA NA NA COPS2 42163 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 52330351 52330361 52330356 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2184D3.1 55131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 55928441 55928509 55928475 Y NA PYGO1 NA NA NA NA PYGO1 49296 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 57302684 57303020 57302852 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 93863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 57529031 57529296 57529123 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 320210 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 59467791 59468085 59467937 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 72514 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 61406057 61406438 61406248 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 636680 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 61505182 61505193 61505186 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 735805 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 63786470 63786486 63786478 Y RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 8307 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 63803463 63803731 63803481 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 8670 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 64722485 64722825 64722650 Y NA KIAA0101,TRIP4,ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 28116 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 66866083 66866388 66866213 Y NA LCTL ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 LCTL 9766 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 66972187 66972410 66972299 Y NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 20156 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr15 69087536 69088004 69087836 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 20556 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA THAP10 6013 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 72897243 72897463 72897311 Y SENP8,SENP8,MYO9A,TMEM202 NA NA NA NA NA BBS4 79064 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 73137238 73137524 73137381 Y NA NA NEO1 IMR90 Hi-C 24141950 ADPGK 61051 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 73538661 73539057 73538860 Y NEO1 NA NA NA NA NA NEO1 196610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 75288966 75289325 75289146 Y CPLX3,ULK3,SCAMP5 SCAMP5,RPP25,PPCDC NA NA NA NA PPCDC 24571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 75449127 75449383 75449255 Y NA C15orf39 PPCDC,SCAMP5 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 36601 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr15 77055500 77055901 77055892 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 139884 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA TBC1D2B 255769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr15 78362503 78362904 78362579 Y IREB2,DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 5162 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 78754081 78754185 78754133 Y ACSBG1 IREB2 NA NA NA NA IREB2 26308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 80697752 80697924 80697805 Y ARNT2 ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 3060 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA ARNT2 186521 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 81317366 81317544 81317456 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 26071 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 82398110 82398459 82398277 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 61628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83412156 83412209 83412183 Y NA AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA RP11-752G15.6 5107 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 83603228 83603538 83603384 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 49123 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83712711 83713060 83712967 Y NA C15orf40,BTBD1 C15orf40 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD1 21046 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83731534 83731663 83731576 Y WHAMM,BTBD1 BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA BTBD1 2443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 83869308 83869629 83869461 Y SH3GL3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 85141478 85141773 85141626 Y NA ZSCAN2,EGLN1P1 NA NA NA NA ZSCAN2 444 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 85628969 85629268 85629119 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 107298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 86166895 86167159 86167083 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 169102 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 86231326 86231343 86231335 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 104918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 89795623 89795958 89795791 Y NA RLBP1,FANCI NA NA NA NA FANCI 10443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1,TTLL13 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 90958026 90958305 90958134 Y ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 28576 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 91373203 91373629 91373444 Y IQGAP1,UNC45A,FES,FES,FES NA NA NA NA NA MAN2A2 69819 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr15 93819308 93819572 93819440 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 394782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 94830973 94831315 94831184 Y MCTP2 NA MCTP2,NMUR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CTD-3049M7.1 218924 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 96703320 96703585 96703453 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 163582 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr15 96884534 96884884 96884709 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 10044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr15 96890448 96891058 96890571 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 15958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 25697 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 191210 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101733484 101734132 101733815 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 56005 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101739961 101740273 101740216 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 49864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA VIMP 8032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr15 101999244 101999620 101999441 Y NA NA NA NA NA NA PCSK6 63785 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 357702 358064 357991 Y SOLH ARHGDIG,PDIA2,AXIN1 NA NA NA NA PDIA2 26550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 1166792 1167154 1166886 Y NA CACNA1H CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1H 34087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 37961 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 HS3ST6,NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 13288 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 2041117 2041468 2041266 Y MAPK8IP3,EME2,SPSB3 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2 NA NA NA NA SYNGR3 3456 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 2407421 2407607 2407514 Y NA ABCA3 NA NA NA NA ABCA3 18674 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA TBC1D24 4456 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr16 2924940 2925188 2925019 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLYWCH2 5999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.24910160329133 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.83273440219422 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 3512084 3512361 3512129 Y OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1 ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1 NA NA NA NA NAA60 20473 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 4021311 4021627 4021472 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 92584 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.06879560237707 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr16 4343991 4344084 4344046 Y NA TFAP4 CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 22915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 5110961 5110972 5110967 Y NA ALG1,NAGPA,C16orf89,FAM86A NA NA NA NA C16orf89 3139 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 5617634 5617654 5617644 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 471825 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 8985326 8985575 8985451 Y NA CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 24460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr16 10596760 10596940 10596850 Y EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 75615 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 11670817 11671132 11670939 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 57105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 12049208 12049600 12049404 Y NA GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166B2.1 18900 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 12541943 12542343 12542144 Y RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 353531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 16242630 16242651 16242642 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 81701 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 17411483 17411608 17411498 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 1087131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 14693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 21622558 21622759 21622643 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 16019 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr16 22227582 22228085 22227763 Y EEF2K EEF2K NA NA NA NA EEF2K 11979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 24263992 24264018 24264005 Y NA NA NA NA NA NA RBBP6 282996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 24269313 24269595 24269474 Y NA NA NA NA NA NA RBBP6 277419 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 24619135 24619479 24619307 Y SLC5A11 NA TNRC6A,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 72121 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 25103942 25104115 25104053 Y NA LCMT1 SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 LCMT1 16935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 26016185 26016314 26016250 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 748933 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 33952793 33953560 33953111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 34441880 34442279 34442062 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2558801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 47348245 47348526 47348436 Y NA NA NA NA NA NA PHKB 144508 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 49888231 49888307 49888269 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 209545 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 49892592 49892787 49892690 Y ZNF423 NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 205065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 51187930 51188326 51188194 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 413969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 51188531 51188838 51188764 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 414570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 51704772 51704784 51704778 Y LOC388276 HNRNPA1P48 SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 27105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 53465709 53465843 53465769 Y NA RBL2 NA NA NA NA RBL2 46 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 53947888 53947948 53947918 Y NA NA NA NA NA NA FTO 212013 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 57680678 57681373 57680764 Y NA CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 45332 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 58160772 58161211 58161024 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 143 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 66087157 66087293 66087245 Y NA NA NA NA NA NA TK2 497154 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 CA7,NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 12.8653354099654 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA FAM96B 5020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 67250789 67251131 67250954 Y NA KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1 NA NA NA NA LRRC29 7820 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 67345616 67346198 67345888 Y RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4 PLEKHG4,KCTD19,LRRC36 NA NA NA NA KCTD19 12468 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 67435763 67435871 67435819 Y NA ZDHHC1 NA NA NA NA ZDHHC1 12865 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA HAS3,CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 16053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 69556739 69556897 69556827 Y HAS3,TERF2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 40100 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.77045900137139 chr16 70464772 70465160 70465031 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 5980 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 70564094 70564236 70564165 Y NA COG4,SF3B3,SNORD111B NA NA NA NA SNORD111B 2682 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 71731364 71731710 71731537 Y NA PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 24894 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr16 72965555 72965897 72965813 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 125700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr16 75420812 75420988 75420900 Y NA CFDP1 CTRB1,BCAR1,CTRB2 IMR90 Hi-C 24141950 CFDP1 44395 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 75683626 75683906 75683817 Y NA ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA KARS 3085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 77824907 77825111 77825009 Y NA NA NA NA NA NA NUDT7 70496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 78199099 78199491 78199298 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 67789 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 776970 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 80401381 80401567 80401473 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 CDYL2 434659 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 81585647 81585896 81585798 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 108872 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 81817758 81818047 81817850 Y PLCG2 PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 47056 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 84130238 84130438 84130330 Y NA MBTPS1,HSDL1,DNAAF1 NA NA NA NA MBTPS1 18073 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA FAM92B 58441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.95076500228564 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 FAM92B 120061 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 85268297 85268637 85268360 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 FAM92B 124183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 86337289 86337465 86337447 Y NA NA NA NA NA NA MTHFSD 249376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 87359959 87360279 87360119 Y NA C16orf95 NA NA NA NA C16orf95 10937 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 87574851 87574952 87574886 Y C16orf95,ZCCHC14,JPH3 NA ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,MAP1LC3B,FBXO31,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 JPH3 58489 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 88082514 88082829 88082672 Y NA NA NA NA NA NA BANP 101664 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 88865592 88865963 88865778 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 1658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 89066514 89066746 89066599 Y CBFA2T3 CBFA2T3 ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 CBFA2T3 24902 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.36713220338275 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr16 89992380 89992810 89992683 Y NA MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA TUBB3 6580 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 200517 200885 200707 Y RPH3AL NA NA NA NA NA RPS4XP17 357902 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 1107024 1107388 1107281 Y NA ABR ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK IMR90 Hi-C 24141950 ABR 22927 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 457619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 3289388 3289823 3289641 Y SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA NA NA NA NA NA SHPK 247793 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 11.6850294090512 chr17 4614568 4615368 4615020 Y MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16 NA NA NA NA ARRB2 2784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA ZFP3,AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 6821400 6821836 6821600 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 66220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 6829755 6829811 6829784 Y NA NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX12P2 74575 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 6925152 6925653 6925481 Y PLSCR3,C17orf49,BCL6B RNASEK,C17orf49,SLC16A13 NA NA NA NA C17orf49 9338 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 7607455 7607852 7607490 Y NA WRAP53,TP53,EFNB3 NA NA NA NA EFNB3 935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.1868262024685 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.12455080164566 chr17 8029074 8029494 8029268 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 3664 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 13.573519010514 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 9267283 9267598 9267441 Y NA NA NA NA NA NA STX8 210310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 10220640 10220911 10220834 Y GAS7,MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 60561 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 10237288 10237551 10237420 Y MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 77209 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 13463603 13463645 13463626 Y HS3ST3A1 NA NA NA NA NA COX10-AS1 507167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 134195 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 14206970 14207459 14207274 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 236157 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 15160656 15161352 15160970 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 5291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 15860629 15861165 15860792 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 14398 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 16310492 16310776 16310647 Y NA UBB,TRPV2 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 6080 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr17 17204544 17204774 17204670 Y NA COPS3 NA NA NA NA NT5M 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 17601204 17601406 17601306 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 18417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 18153652 18153819 18153756 Y NA LLGL1,FLII NA NA NA NA FLII 6411 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 18804175 18804500 18804326 Y PRPSAP2 NA NA NA NA NA PRPSAP2 62777 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 18825562 18825708 18825647 Y FAM83G,TRIM16L NA NA NA NA NA PRPSAP2 84164 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 19834604 19834673 19834639 Y NA AKAP10 NA NA NA NA AKAP10 44983 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 20012372 20012672 20012482 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 101715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 20057823 20057990 20057893 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 147166 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr17 21908682 21908761 21908685 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 432960 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.1310710031999 chr17 26929593 26929935 26929764 Y TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119 PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100 NA NA NA NA SPAG5 5296 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27299558 27299805 27299699 Y NA PHF12,SEZ6 NA NA NA NA PHF12 22769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27367295 27367696 27367449 Y TAOK1 SEZ6 NA NA NA NA SEZ6 35837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1 NA NA NA NA GIT1 47040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr17 30335785 30336145 30335965 Y NA NA NA NA NA NA SUZ12 73748 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 32692859 32693331 32693135 Y CCL2,CCL7,CCL8 NA NA NA NA NA CCL2 112555 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 35236064 35236105 35236085 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA IMR90 Hi-C 24141950 AATF 68070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 36073088 36073441 36073335 Y ACACA,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 71595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 36899884 36899982 36899923 Y SOCS7,FBXO47,C17orf98 MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA PCGF2 4088 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 37010933 37011093 37011014 Y FBXO47,C17orf98 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA RPS20P35 1366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 37969952 37970167 37970075 Y FBXL20,CDK12,WIPF2,IKZF3,CASC3 NA NA NA NA NA MIEN1 84912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 38480180 38480741 38480429 Y IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 16736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 38496652 38496786 38496719 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA RARA NA NA NA NA RARA 33208 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 38754802 38755132 38754943 Y NA SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 47628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 40628029 40628344 40628111 Y NA ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 19167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 41441650 41441788 41441734 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 32539 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,ADAM11 NA NA NA NA DBF4B 14005 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA MAP3K14 268397 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 43919032 43919225 43919129 Y STH NA NA NA NA NA MAPT 50523 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 44213270 44213366 44213318 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 243522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 44261899 44262225 44262045 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 292151 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.42288740265135 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 45352964 45353080 45353020 Y WNT9B NA NA NA NA NA CDC27 88176 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 53430 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 46168455 46168716 46168586 Y NA NFE2L1,CBX1,SNX11 NA NA NA NA CBX1 8167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 46291488 46291927 46291575 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 112769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS1,HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 46767725 46768126 46768067 Y NA RP11-357H14.17,HOXB13 NA NA NA NA HOXB13 36414 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 47425065 47425127 47425096 Y MYST2,ZNF652,ZNF652 RP11-1079K10.3,ZNF652 NA NA NA NA RP11-1079K10.3 11400 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 48066634 48067004 48066930 Y NA DLX4 NA NA NA NA DLX4 22300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,SGCA,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 49142836 49143005 49142922 Y NA NA NA NA NA NA SPAG9 53221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 52328438 52328710 52328574 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 495207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 53654184 53654435 53654393 Y NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 156831 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 55056156 55056413 55056229 Y NA COIL,SCPEP1 NA NA NA NA SCPEP1 2690 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 57837481 57837783 57837612 Y YPEL2,VMP1,RNFT1,CA4 NA NA NA NA NA PTRH2 54494 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 57975372 57975465 57975395 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 6925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 59532462 59532698 59532510 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 133865 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 61127299 61127625 61127462 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 394114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 61282907 61283291 61283099 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 238448 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 62958497 62958860 62958615 Y NA LRRC37A3,AMZ2P1 NA NA NA NA AMZ2P1 10834 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 64499082 64499411 64499095 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 202328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 65394789 65395150 65395019 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 23214 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 67577769 67578023 67578007 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 168930 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 67599219 67599477 67599295 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 190380 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 67900401 67900565 67900472 Y NA NA NA NA NA NA AC004562.1 55283 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr17 68153518 68153744 68153613 Y NA KCNJ2 NA NA NA NA KCNJ2 9070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 68340579 68340874 68340665 Y KCNJ2 NA NA NA NA NA KCNJ2 177765 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 68361449 68361732 68361545 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 198635 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 69617489 69617539 69617508 Y NA LOC124685 LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 2370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 70423161 70423493 70423326 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 197877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 70499253 70499546 70499535 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 121824 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 70924179 70924389 70924230 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 162462 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 71227425 71227646 71227536 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA C17orf80 1053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 71603632 71603970 71603800 Y NA SDK2 NA NA NA NA SDK2 34258 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr17 72865540 72865567 72865553 Y NA FDXR NA NA NA NA FDXR 1589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 73337527 73337917 73337722 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A19 53936 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 73351805 73351921 73351820 Y NA GRB2 NA NA NA NA GRB2 47869 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr17 74213607 74213973 74213891 Y NA RNF157 NA NA NA NA RNF157 20481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 74836829 74837207 74837140 Y UBE2O,MGAT5B MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 25331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 75199050 75199385 75199187 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 75266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC6 171692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 10.1506316078626 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 76384421 76384943 76384751 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 11700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 77776510 77776898 77776679 Y CCDC40 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 3028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 78352228 78352499 78352367 Y GAA,RNF213 ENDOV NA NA NA NA ENDOV 34466 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 78962835 78962976 78962910 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA CHMP6 422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 79368790 79369424 79369000 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 101443 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr17 80060759 80061000 80060880 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 6551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80296831 80297318 80297085 Y NA TEX19 SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX19 17805 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr17 80655375 80655626 80655561 Y RAB40B,FN3K RAB40B,FN3KRP,FN3K NA NA NA NA RAB40B 771 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 323417 323617 323527 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 57367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr18 999057 999295 999176 Y NA NA NA NA NA NA YES1 188510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr18 1192820 1193070 1192907 Y NA NA NA NA NA NA YES1 382273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 2883493 2883567 2883531 Y NA NA NA NA NA NA LPIN2 127746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 8140065 8140370 8140233 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 467073 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 8689782 8689966 8689874 Y NA NA NDUFV2,RAB12,CCDC165,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 82339 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 9705290 9705640 9705469 Y NA RAB31 NA NA NA NA RAB31 522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 9771568 9771961 9771765 Y RAB31 NA NA NA NA NA RAB31 65406 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 20072671 20072686 20072680 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 303538 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 26745136 26745536 26745463 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 989726 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 28823621 28824065 28823663 Y NA NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC1 82802 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 29232383 29232901 29232639 Y NA B4GALT6 NA NA NA NA B4GALT6 30898 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 32436094 32436130 32436112 Y DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 118762 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr18 34258485 34258689 34258587 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 148380 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 39755452 39755827 39755639 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 222281 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 39779486 39779881 39779578 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 246315 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 39944791 39945165 39944818 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 411620 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 42914302 42914490 42914372 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 630750 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 44386287 44386347 44386318 Y HDHD2 NA NA NA NA NA KATNAL2 109108 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 45353824 45354074 45353943 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 101441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 45379355 45379691 45379492 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 75824 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 46213796 46213995 46213850 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 150379 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 46733107 46733359 46733209 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 252358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 47628723 47629107 47629104 Y NA NA NA NA NA NA CCDC11 161785 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 48616016 48616044 48616031 Y NA NA NA NA NA NA SMAD4 123606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 53072982 53073437 53073370 Y NA NA NA NA NA NA WDR7 1243137 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 55104670 55104954 55104730 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 3753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr18 55248353 55248745 55248703 Y NA FECH,NARS NA NA NA NA FECH 3259 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 55258100 55258458 55258279 Y NEDD4L,NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 6096 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 55382886 55383034 55382958 Y NA NA NA NA NA NA NARS 95441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 55768514 55768737 55768683 Y NEDD4L NA NA NA NA NA NARS 481069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 56117134 56117320 56117186 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 148543 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr18 60281779 60281962 60281874 Y ZCCHC2 NA KDSR,PHLPP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 93539 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 63434118 63434346 63434234 Y CDH7 CDH7 NA NA NA NA CDH7 18630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr18 63496695 63496713 63496704 Y NA NA NA NA NA NA CDH7 81207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 64968652 64968919 64968666 Y NA NA CCDC102B,TMX3 IMR90 Hi-C 24141950 DSEL 213298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 65623585 65623778 65623682 Y NA NA LOC643542,DSEL IMR90 Hi-C 24141950 DSEL 441368 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 68196083 68196104 68196093 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 241946 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 71777290 71777591 71777505 Y NA FBXO15,TIMM21 NA NA NA NA FBXO15 35509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 74556264 74556608 74556436 Y NA ZNF236 NA NA NA NA ZNF236 23701 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 74780891 74781094 74780990 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 248328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 74810011 74810388 74810104 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 277448 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 75115540 75115770 75115653 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 582977 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 77276635 77277001 77276820 Y ATP9B,NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 122779 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr18 77682652 77682872 77682762 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 26792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2 NA NA NA NA MIER2 33 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 604629 604764 604680 Y THEG BSG,HCN2,POLRMT NA NA NA NA HCN2 16736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 951651 951841 951690 Y NA R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 27870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 1213863 1214369 1213961 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 21657 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr19 1453873 1454140 1454045 Y C19orf26,MUM1,APC2 DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 17515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 1672372 1672532 1672504 Y NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 21768 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 1725719 1725877 1725796 Y C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 75115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 2549602 2550221 2549903 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 75482 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 2621859 2622002 2621918 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B,TLE2 NA NA NA NA NA GNG7 78705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 2695163 2695542 2695477 Y LINGO3,GNG7 GNG7,DIRAS1,SLC39A3 NA NA NA NA GNG7 5165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 2974450 2974580 2974523 Y NFIC,TLE2,TLE2 ZNF77,TLE6 NA NA NA NA TLE6 864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 3428769 3429112 3428821 Y TLE2,NFIC NA NA NA NA NA DOHH 69826 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4063699 4063930 4063813 Y NA ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 1013 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4123124 4123351 4123249 Y MATK,ZFR2,ATCAY MAP2K2 NA NA NA NA MAP2K2 998 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4375126 4375688 4375404 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22856 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 5287522 5287818 5287647 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 11777 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 5322399 5322569 5322473 Y PTPRS RPL32P34,PTPRS NA NA NA NA PTPRS 16245 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 5339517 5339797 5339748 Y HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 703 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA C3,GPR108,TRIP10,VAV1 NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 7266028 7266415 7266222 Y NA INSR NA NA NA NA INSR 25630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 7437354 7437833 7437574 Y ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 20166 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 8605873 8606246 8606065 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 28825 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 8607140 8607451 8607227 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 30092 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 9402141 9402360 9402251 Y NA NA NA NA NA NA ZNF266 141894 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA NA NA NA NA NA ZNF266 123323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 9979709 9980000 9979855 Y ZNF177,ZNF846,OLFM2 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 35776 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 10304383 10304612 10304534 Y TYK2,KRI1,ILF3 S1PR2,DNMT1 PPAN-P2RY11,EIF3G MCF7 ChIA-PET 22265404 S1PR2 35336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 10529596 10529758 10529677 Y NA TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 17382 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 10581724 10581982 10581852 Y NA KEAP1,S1PR5 NA NA NA NA KEAP1 30435 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 12065633 12065838 12065735 Y NA ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2 NA NA NA NA CTD-2006C1.2 30594 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 12889371 12889726 12889619 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10584 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 12929124 12929310 12929217 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA MAST1 13455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.77045900137139 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 13975574 13976059 13975671 Y CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 38955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 13995440 13995781 13995611 Y NA CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 19233 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 14467223 14467368 14467308 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 21945 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 14474119 14474280 14474154 Y ZNF333,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15033 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 14570486 14570855 14570729 Y OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1 DDX39A,PKN1,GIPC1 NA NA NA NA PKN1 28621 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F11 95558 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 18722417 18722765 18722581 Y GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L UBA52,C19orf60,TMEM59L,CRLF1,KLHL26 NA NA NA NA CRLF1 5866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 19410078 19410150 19410102 Y NA HAPLN4,TM6SF2,MAU2,SUGP1 NA NA NA NA MAU2 19340 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 20747496 20747853 20747738 Y NA ZNF737 NA NA NA NA ZNF737 881 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 21891969 21892260 21892094 Y ZNF100 NA NA NA NA NA ZNF100 56170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 23971294 23971621 23971458 Y NA ZNF681,RPSAP58 NA NA NA NA RPSAP58 27487 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28197525 28198373 28198039 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1504075 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28232001 28232276 28232191 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1470172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28234447 28234748 28234598 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1467700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28244004 28244439 28244017 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1458009 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28252920 28253113 28253061 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28274249 28275061 28274473 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1427387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 28279937 28280239 28280146 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1422209 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 29196051 29196136 29196055 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 506312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 30718140 30718340 30718240 Y NA NA NA NA NA NA URI1 305589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1,UPK1A-AS1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 UPK1A-AS1 31058 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62 NA NA NA NA CLIP3 2729 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 36648389 36648571 36648491 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 19912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 37923813 37923829 37923821 Y NA ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 32658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF570,ZNF569,ZNF793 NA NA NA NA ZNF570 3160 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1,SPINT2 NA NA NA NA DPF1 773 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 39919610 39919819 39919723 Y NA PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 4769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 40930264 40930817 40930514 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD1 332 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr19 40942693 40943017 40942855 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 5595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 42710307 42710321 42710316 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 11971 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr19 42964614 42965000 42964807 Y CEACAM8,DEDD2 NA CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8 IMR90 Hi-C 24141950 MEGF8 136853 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,ZNF283 NA NA NA NA SMG9 29923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 44773096 44773391 44773244 Y LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 33808 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 45943163 45943490 45943268 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 25763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.83273440219422 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 46437050 46437156 46437068 Y NA IRF2BP1,MYPOP,NOVA2 NANOS2 IMR90 Hi-C 24141950 MYPOP 33188 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 46930027 46930174 46930086 Y NA PNMAL1 CCDC8,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 PNMAL1 42646 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,DACT3 NA NA NA NA DACT3 19419 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 47220951 47221042 47220998 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 2567 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr19 47874632 47874802 47874721 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA DHX34 24094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 47961170 47962467 47962382 Y SLC8A2 MEIS3,SLC8A2,KPTN NA NA NA NA SLC8A2 10958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 48016569 48017036 48016994 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA SLC8A2,KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 72 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 48167427 48167718 48167620 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 46882 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 48832028 48832343 48832234 Y CARD8,IZUMO1,EMP3 EMP3,CCDC114,TMEM143,SYNGR4 NA NA NA NA CCDC114 8877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.78349940447986 chr19 49151515 49151640 49151575 Y NA SPHK2,RPL18,DBP,CA11 NA NA NA NA CA11 3946 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 49482691 49482925 49482812 Y NA DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 11642 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 50413852 50414197 50414025 Y LOC645971,NR1H2 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62 NA NA NA NA ATF5 15762 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 50825197 50825861 50825498 Y NA NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA NR1H2 5049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr19 50839026 50839389 50839371 Y ACPT,SYT3,LOC342918,KCNC3 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA KCNC3 4254 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 50860908 50861268 50861186 Y PNKP,VRK3,NR1H2 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 24193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1,SPIB NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr19 50993276 50993671 50993522 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 51003635 51004295 51004006 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 8315 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 51059089 51059663 51059341 Y KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9639 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chr19 51221435 51221859 51221691 Y KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 SHANK1 NA NA NA NA SHANK1 728 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,AC008753.6,PRKCG NA NA NA NA AC008753.6 3374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr19 54548907 54549052 54548979 Y NLRP12,NLRP12,VSTM1 NA NA NA NA NA NDUFA3 54984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 55540419 55540558 55540460 Y SHISA7,KIR2DL3,NCR1 RDH13,EPS8L1 NA NA NA NA RDH13 40101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55546101 55546409 55546255 Y NA RDH13,EPS8L1 NA NA NA NA RDH13 34250 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55600172 55600429 55600236 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA EPS8L1 18784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA TNNT1,SYT5 NA NA NA NA SYT5 10159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55794552 55795020 55794712 Y NA PPP6R1,HSPBP1,BRSK1 NA NA NA NA BRSK1 3112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA TMEM238 12795 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.1868262024685 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 57349423 57349757 57349684 Y ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA PEG3 339 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA ZIM2 1047 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551,ZNF154 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF154 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr19 58480028 58480253 58480224 Y NA ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF256 22985 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 58911739 58912056 58911822 Y NA A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 131799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 934141 934402 934285 Y NA NA TPO,MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 258702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 2686059 2686257 2686158 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 693396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 3106532 3106816 3106764 Y NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 272837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA RNASEH1-AS1 20224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 8384896 8385029 8384953 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 431946 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 11623935 11624324 11624249 Y NA E2F6 GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 19638 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 12596433 12596805 12596535 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 258210 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 15199994 15200355 15200088 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 429184 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 15445260 15445596 15445428 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 253858 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 15815563 15815811 15815751 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 86261 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 18066155 18066219 18066212 Y MSGN1 NA NA NA NA NA SMC6 86646 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 LAPTM4A,RP11-644K8.1 NA NA NA NA RP11-644K8.1 89 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20421306 20421667 20421468 Y NA SDC1 NA NA NA NA SDC1 1527 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20674316 20674523 20674398 Y NA RHOB RHOB,HS1BP3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOB 29481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20817015 20817334 20817182 Y RHOB,GDF7 HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 31515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 20825545 20825949 20825765 Y RHOB HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 22900 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 23631132 23631189 23631161 Y NA KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 25044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 24213695 24213947 24213707 Y NA NA NA NA NA NA C2orf44 56498 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 25096617 25097268 25096771 Y NA ADCY3 NA NA NA NA ADCY3 43440 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 25438901 25439135 25438983 Y PTRHD1,ADCY3 NA NA NA NA NA DNMT3A 124324 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 27069178 27069486 27069284 Y NA DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 27432989 27433207 27433072 Y NA SLC5A6,CAD NA NA NA NA SLC5A6 619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 28077414 28077634 28077524 Y ZNF513,ZNF513,RBKS BRE,RBKS MRPL33 IMR90 Hi-C 24141950 BRE 33174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 28936560 28936756 28936619 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 35750 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 28953773 28954089 28953931 Y NA PPP1CB,SPDYA PLB1,PPP1CB IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 18417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 29349196 29349466 29349333 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 30625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 29746427 29746759 29746593 Y ALK NA NA NA NA NA CLIP4 427856 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 36189102 36189392 36189167 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 391677 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 36700444 36700711 36700553 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 119375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 37139828 37140219 37140054 Y NA NA NA NA NA NA STRN 51396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 38146886 38147198 38147079 Y NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 183275 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 38409612 38409978 38409795 Y NA RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 46732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 40676536 40676854 40676845 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 THUMPD2 672129 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 41963199 41963639 41963355 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 430851 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 42105680 42106005 42105944 Y PKDCC NA NA NA NA NA EML4 288485 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 318920 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 43396497 43396745 43396689 Y OXER1,ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 55003 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 43530162 43530544 43530351 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 78414 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 43532812 43532954 43532932 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 81064 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 43746950 43747270 43747109 Y ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2 K562 ChIA-PET 22265404 THADA 73915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 44601254 44601363 44601309 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA CAMKMT 14165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 44805618 44805736 44805677 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 218529 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45160125 45160245 45160184 Y SIX3 RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 4093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45160746 45160936 45160765 Y SIX3 RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 3402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 2863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45164223 45164580 45164499 Y NA SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45164818 45165169 45165126 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 480 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8 NA NA NA NA SIX3-AS1 9485 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 45870946 45871356 45871039 Y NA SRBD1,PRKCE PRKCE,EPAS1,RHOQ,SRBD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCE 5128 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 45968952 45969144 45969027 Y PRKCE NA NA NA NA NA PRKCE 92468 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 46857387 46857788 46857588 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA PIGF 15129 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 46928465 46928698 46928588 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 4374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 47499706 47499760 47499719 Y C2orf61 NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 70453 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 50951878 50951957 50951935 Y NA NA NA NA NA NA STON1 2197356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 54285444 54285567 54285472 Y NA NA SPTBN1,EML6,PSME4 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 89467 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 54714209 54714329 54714214 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 32787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 61917397 61917646 61917558 Y NA NA FAM161A,XPO1 IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 153636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr2 63023345 63023597 63023471 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 124359 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA PELI1 NA NA NA NA PELI1 16815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA PELI1 NA NA NA NA PELI1 1426 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64552666 64552842 64552755 Y PELI1,SERTAD2,AFTPH NA PELI1,AFTPH,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 183078 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64927379 64927577 64927485 Y SLC1A4,RAB1A,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 48562 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 65782552 65782570 65782560 Y NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED2 124781 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 66801899 66802241 66801940 Y MEIS1 NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 143297 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 68428934 68429266 68429100 Y NA WDR92,PNO1 NA NA NA NA PNO1 45958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 68966770 68967047 68966940 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 271263 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 70331843 70331986 70331900 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 4160 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 70608938 70609447 70609175 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 81716 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 70823866 70823963 70823915 Y TGFA NA NA NA NA NA ADD2 169394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 71228347 71228418 71228366 Y ANKRD53 TEX261 TEX261 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TEX261 8272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 73774930 73775287 73775109 Y NA NA NA NA NA NA ALMS1 164044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 77317962 77318191 77318070 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM4 500254 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 77343577 77343605 77343592 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA LRRTM4 474840 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 77377674 77377853 77377764 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA LRRTM4 440592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 77432935 77433201 77433068 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA LRRTM4 385244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 77536393 77536550 77536540 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA LRRTM4 281895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 77555136 77555510 77555330 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM4 262935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 77606353 77606491 77606425 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM4 211954 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 81820947 81821308 81821128 Y NA NA NA NA NA NA AC098817.3 1221947 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 85185071 85185576 85185382 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 10640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA IMMT,MRPL35 NA NA NA NA IMMT 32286 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 88913679 88914090 88914022 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 11004 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2696548 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2752348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2872873 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 92309033 92309202 92309197 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 3245709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 96077364 96077399 96077382 Y NA FAHD2A NA NA NA NA FAHD2A 10895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 97012594 97012961 97012778 Y ASTL SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 13069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 99072105 99072338 99072215 Y TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 12788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 99723014 99723348 99723222 Y TSGA10 C2orf15,LIPT1,TSGA10 NA NA NA NA C2orf15 32600 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 100026434 100026453 100026444 Y NA NA NA NA NA NA TXNDC9 71269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 102380179 102380656 102380455 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 68867 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 102854655 102855173 102854991 Y IL1R1 NA NA NA NA NA MFSD9 496174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 103390349 103390733 103390541 Y NA MFSD9,TMEM182 NA NA NA NA TMEM182 38982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 105461382 105461873 105461636 Y GPR45,POU3F3 NA NA NA NA NA MRPS9 190568 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 106412674 106413002 106412675 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 53320 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 109506497 109506716 109506551 Y LIMS1,CCDC138,EDAR NA NA NA NA NA CCDC138 105284 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 112699155 112699419 112699287 Y NA MERTK NA NA NA NA MERTK 45099 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 114014908 114015299 114015271 Y NA NA NA NA NA NA RABL2A 367507 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 122297511 122297730 122297621 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 11054 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 127103428 127103674 127103551 Y NA AC023347.1 NA NA NA NA AC023347.1 39341 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 127915404 127915435 127915422 Y NA NA CYP27C1,BIN1,MAP3K2 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC3 134317 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 128136277 128136580 128136554 Y NA MAP3K2 CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 7461 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 131058181 131058640 131058440 Y NA AC068137.13,IMP4,CCDC115 NA NA NA NA AC068137.13 8786 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293213 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 132182653 132182963 132182773 Y NA NA NA NA NA NA MZT2A 65353 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 133011418 133011623 133011538 Y NA NA NA NA NA NA AC093838.4 763032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 135054765 135054954 135054860 Y MGAT5 NA NA NA NA NA MGAT5 179211 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 136217422 136217690 136217556 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB3 69116 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 138825307 138825392 138825350 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 431876 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 140168949 140169074 140169000 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 911578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 141284265 141284563 141284414 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 1602707 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 142222584 142223129 142223081 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 664141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 142789500 142789791 142789646 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 97479 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 145215157 145215664 145215657 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 64483 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 150644765 150645076 150644921 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 202435 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 150971624 150972028 150971707 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 421497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 153302279 153302595 153302384 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 112528 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 153599082 153599296 153599189 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA PRPF40A 26571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 155569761 155570004 155569789 Y NA KCNJ3 NA NA NA NA KCNJ3 16950 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 157257270 157257340 157257305 Y NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 32462 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 158102968 158103210 158103130 Y NA NA NR4A2,GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 CYTIP 240263 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 159994086 159994676 159994284 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 146634 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 160208394 160208612 160208503 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 67084 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 NA NA NA NA NA PSMD14 67138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 162843897 162844111 162844002 Y IFIH1 NA NA NA NA NA EIF3EP2 98658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 164486140 164486494 164486462 Y NA NA NA NA NA NA KCNH7 792900 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 170777121 170777463 170777246 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 95153 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 172287168 172287529 172287349 Y TLK1 DCAF17,METTL8 NA NA NA NA DCAF17 1198 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 172792873 172793084 172792979 Y NA HAT1 NA NA NA NA HAT1 15915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 173544545 173544661 173544603 Y NA NA PDK1,RAPGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 125221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 173876038 173876102 173876070 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 341446 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 173941754 173942308 173942062 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 275240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 125918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 175753579 175753941 175753870 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 171074 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 179736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 177518737 177518933 177518835 Y NA LINC01117,LINC01116 HOXD10,HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD9,HOXD4,MIR10B IMR90 Hi-C 24141950 LINC01116 18078 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 243912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 180724883 180725244 180725071 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 144596 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 186645587 186645801 186645694 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 703082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr2 187685541 187685848 187685695 Y NA NA NA NA NA NA FAM171B 128843 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 15336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr2 188389811 188390126 188390006 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 38361 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 188463858 188463880 188463868 Y TFPI TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 189957665 189957918 189957859 Y COL3A1,COL5A2 NA NA NA NA NA COL5A2 84687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 189988166 189988248 189988206 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 54357 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 190014709 190015152 190014914 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 27453 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr2 190073490 190073745 190073639 Y NA COL5A2 COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 30885 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 190235497 190235832 190235693 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68327 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 191443312 191443866 191443668 Y NA TMEM194B TMEM194B MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM194B 45864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 678870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 196978368 196978631 196978575 Y NA DNAH7 NA NA NA NA DNAH7 46832 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 58422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr2 204676480 204676691 204676598 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 278347 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 204813975 204814305 204814050 Y CD28,CTLA4,ICOS NA NA NA NA NA RAPH1 415842 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 207669258 207669658 207669463 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 40987 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 210259105 210259242 210259184 Y NA MAP2 NA NA NA NA MAP2 27540 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 210377827 210378108 210377968 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 91045 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 210429278 210429418 210429290 Y MAP2,MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 142496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 210442932 210443275 210443104 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 156150 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 210547424 210547820 210547680 Y MAP2,MAP2,UNC80 NA NA NA NA NA MAP2 260642 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 210580281 210580584 210580403 Y NA NA NA NA NA NA RPE 284705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr2 212287677 212288073 212287850 Y NA NA NA NA NA NA LANCL1 947301 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 212906311 212906509 212906411 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 495056 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 213168681 213168967 213168824 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 232598 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr2 213185826 213186073 213186055 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 215492 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr2 213242050 213242407 213242229 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 159158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr2 213275825 213276172 213276170 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 125393 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr2 213323461 213323863 213323827 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 77702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 213339164 213339568 213339278 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 61997 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 213340230 213340572 213340527 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 60993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 213352343 213352729 213352575 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 48836 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 213400949 213401339 213401014 Y ERBB4 ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr2 213401643 213402097 213401658 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 78 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.24258140173709 chr2 213402193 213402489 213402443 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr2 213770329 213770669 213770422 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 368764 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 93874 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 216005120 216005365 216005243 Y BARD1,ABCA12 NA NA NA NA NA ATIC 169175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr2 219844869 219844996 219844902 Y NA CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 22492 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 FARSB 691645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 348025 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 223709158 223709348 223709234 Y SGPP2 ACSL3 ACSL3,MOGAT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 14304 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 224452508 224452858 224452683 Y SCG2 SCG2 NA NA NA NA SCG2 12363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 104129 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 225010758 225010857 225010808 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 108722 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 225878647 225879031 225878803 Y DOCK10 NA NA NA NA NA CUL3 430537 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr2 230015685 230015803 230015793 Y PID1 NA NA NA NA NA DNER 561471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 45708 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 233252147 233252689 233252515 Y NA NA NA NA NA NA CHRND 136014 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA NA NA NA NA NA USP40 142070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 236453392 236453640 236453439 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 52659 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 236908752 236909098 236908877 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 164992 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA IQCA1 68798 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr2 238586570 238586965 238586752 Y MLPH,LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 52351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 240200846 240201180 240201020 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 119950 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 241719064 241719393 241719333 Y KIF1A KIF1A NA NA NA NA KIF1A 38332 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr2 242698564 242698745 242698671 Y THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 26570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr2 242791150 242791474 242791404 Y NA AC131097.3 NA NA NA NA AC131097.3 30040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 709042 709425 709354 Y NA NA CSNK2A1,RSPO4,SRXN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRXN1 77028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 NA NA NA NA NA PSMF1 62937 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SNPH 62868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 2329862 2330147 2330005 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 119352 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 2671963 2672026 2672004 Y NA NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 NA NA NA NA EBF4 439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 2978820 2979208 2979015 Y NA MRPS26 NA NA NA NA MRPS26 45383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 3377596 3377907 3377772 Y C20orf194 C20orf194 NA NA NA NA C20orf194 8365 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 3414987 3415118 3415088 Y C20orf194,PANK2 C20orf194,ATRN ATRN,C20orf194 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf194 28715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 3538229 3538411 3538318 Y NA NA NA NA NA NA ATRN 88542 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 5037420 5037933 5037775 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 SLC23A2 SLC23A2,C20orf30 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 48481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 5610913 5611049 5610981 Y NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 21241 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 5739573 5739619 5739595 Y PROKR2 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10534 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 7918618 7918644 7918642 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 79832 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 8847341 8847863 8847607 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 199547 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 9032235 9032553 9032394 Y NA PLCB4 PLCB1,PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 14857 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 10477280 10477577 10477381 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 64410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 10838051 10838409 10838189 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 213037 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 11159709 11159935 11159829 Y NA NA JAG1,C20orf94,LOC339593 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 534695 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 11831025 11831188 11831107 Y BTBD3 BTBD3 NA NA NA NA BTBD3 38183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 16562251 16562551 16562401 Y NA KIF16B KIF16B K562 ChIA-PET 22265404 KIF16B 10173 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 NAA20 190788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 21486506 21486611 21486559 Y NA NA NA NA NA NA XRN2 204564 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 24934359 24934890 24934516 Y CST7,C20orf3 NA NA NA NA NA ENTPD6 239439 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 25838960 25839094 25839045 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 163483 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30538610 30538727 30538660 Y DUSP15,DUSP15,DUSP15,TTLL9 PDRG1,XKR7 NA NA NA NA PDRG1 715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 30699679 30699866 30699769 Y BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 4370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 31171182 31171312 31171248 Y DNMT3B,C20orf203 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 306 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr20 34018897 34019177 34019037 Y MYH7B CEP250 NA NA NA NA CEP250 21808 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 34197138 34197351 34197252 Y NA SPAG4 NA NA NA NA SPAG4 4463 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCAND1 107196 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 35633884 35634240 35634054 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 55638 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 35851515 35851770 35851561 Y SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1 RPN2 NA NA NA NA RPN2 46702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 14724 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 37501358 37501511 37501425 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA FAM83D 51444 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 39787054 39787387 39787188 Y NA PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 23454 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr20 42847207 42847559 42847248 Y NA OSER1-AS1,GDAP1L1 NA NA NA NA OSER1-AS1 9607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 43239191 43239604 43239345 Y C20orf111,STK4,ADA ADA NA NA NA NA ADA 39270 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 43709360 43709760 43709560 Y NA NA NA NA NA NA STK4 116245 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,TP53TG5,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA TP53TG5,PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 16091 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 47443501 47443751 47443699 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 1081 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 116481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 6423 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 168565 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.36713220338275 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA SALL4 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52196593 52196861 52196746 Y TSHZ2,ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27585 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 NA NA NA NA NA ZNF217 255975 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 52481702 52482101 52481977 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 257256 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52483715 52484176 52483911 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 259269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52514730 52515023 52514955 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 290284 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.19334640402273 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 57228113 57228577 57228221 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 3623 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr20 58459134 58459312 58459218 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177 SYCP2 NA NA NA NA SYCP2 47398 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 61639302 61639436 61639344 Y TCFL5,DIDO1,BHLHE23 NA NA NA NA NA DIDO1 71998 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.1868262024685 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,SAMD10,PRPF6 NA NA NA NA SAMD10 3 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1207929 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 15962241 15962603 15962321 Y NRIP1,SAMSN1 NA NA NA NA NA HSPA13 208436 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 17457434 17457504 17457454 Y NA LINC00478 NA NA NA NA LINC00478 16592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 17656088 17656430 17656111 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 17660204 17660286 17660245 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 5115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 23041 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 17681993 17682347 17682285 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 26904 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 17745935 17746301 17746052 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 90846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 17790629 17790733 17790681 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 119410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 17882685 17882787 17882770 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 27356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 2257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 14130 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 17958916 17959192 17958984 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 48773 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 49257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 50524 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.31137700411416 chr21 18121896 18122026 18121962 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 211753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 18183173 18183582 18183385 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 273030 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 18266996 18267114 18267057 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 356853 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.13759120475414 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 20089064 20089357 20089211 Y NA AL109763.2 NA NA NA NA AL109763.2 40964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 21370888 21371541 21371452 Y NA NA NA NA NA NA AP001171.1 257592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 21905336 21905625 21905481 Y NA NA NA NA NA NA AP001171.1 276203 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 22469408 22469563 22469502 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 100775 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 23121365 23121760 23121563 Y NA NA NA NA NA NA AF241725.6 64716 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 23538013 23538045 23538029 Y NA NA NA NA NA NA AF241725.6 481364 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 23765891 23766156 23766020 Y NA NA NA NA NA NA AF241725.6 709242 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 29660800 29661042 29660922 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 594651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 30191610 30191885 30191792 Y C21orf7 NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 63808 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.07531580393131 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1,SNORA81 NA NA NA NA SNORA81 7931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 130159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr21 35959381 35959645 35959576 Y NA RCAN1 NA NA NA NA RCAN1 25796 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 36850560 36850920 36850765 Y RUNX1 NA RUNX1,LOC100506385,CLIC6,CBR1,LOC100133286,SETD4 IMR90 Hi-C 24141950 CBR1 589319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr21 38434187 38434580 38434547 Y NA PIGP,TTC3 NA NA NA NA PIGP 8890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 38628157 38628175 38628166 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 10087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 40860443 40860729 40860586 Y NA LCA5L,SH3BGR NA NA NA NA SH3BGR 44662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 43647963 43648761 43648270 Y C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 30164 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr21 44988675 44988868 44988840 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 88506 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 45023085 45023419 45023272 Y TRAPPC10,PDXK,CSTB,U2AF1 NA NA NA NA NA HSF2BP 53955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 45237788 45238060 45237872 Y TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3 CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 30394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 45593647 45593841 45593744 Y NA C21orf33 PWP2,ICOSLG IMR90 Hi-C 24141950 C21orf33 42160 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr21 47365117 47365541 47365289 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 34110 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 NA NA NA NA NA PRMT2 59185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.54743820429701 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 19749283 19749521 19749403 Y NA SEPT5,TBX1 NA NA NA NA TBX1 7057 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 19983834 19983932 19983883 Y NA ARVCF NA NA NA NA ARVCF 18399 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74,SCARF2 NA NA NA NA SCARF2 17370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr22 20848736 20849050 20848893 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 536 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.42288740265135 chr22 22186398 22186549 22186531 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 33421 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 22478098 22478432 22478244 Y CCDC116,YPEL1,ZNF280B NA NA NA NA NA TOP3B 142885 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 17.9406512138967 chr22 23273991 23274497 23274122 Y IGLL5 NA MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAZ 136043 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 24080371 24080411 24080401 Y NA GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1 NA NA NA NA ZNF70 10868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 24752898 24753006 24752951 Y UPB1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 88032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 28797071 28797274 28797258 Y PITPNB,XBP1,CCDC117 NA NA NA NA NA HSCB 338745 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 28879777 28880035 28879909 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 255984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF NA NA NA NA NA GATSL3 74510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 30652191 30652351 30652329 Y RNF215,GAL3ST1 GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 31265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 30808332 30808723 30808528 Y NA SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA RNF215 7037 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 33862454 33862588 33862512 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 236318 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 34167018 34167152 34167086 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 68112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 34682646 34682665 34682656 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 583740 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 RBFOX2 272624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYH9 33299 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.47864260191994 chr22 41839332 41839605 41839469 Y TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 1422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr22 42096331 42096684 42096508 Y CHADL,WBP2NL,MEI1 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA NHP2L1 11823 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 42146037 42146298 42146082 Y SEPT3,C22orf46 CCDC134 NA NA NA NA CCDC134 48385 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 43269385 43269620 43269503 Y NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 17273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 45016324 45016531 45016433 Y PARVG,PARVG,PRR5 PRR5 NA NA NA NA PRR5 46062 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 45254258 45254434 45254345 Y PHF21B NA NA NA NA NA PHF21B 149446 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B PHF21B NA NA NA NA PHF21B 145 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 46159997 46160538 46160082 Y NA NA NA NA NA NA ATXN10 94319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA NA NA NA NA NA RP6-109B7.3 72901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA NA NA NA NA NA RP6-109B7.3 72139 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.77045900137139 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 47848340 47848433 47848387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 176990 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 50414821 50415138 50414874 Y BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA PIM3 62660 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 50608010 50608409 50608105 Y MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 850 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 50710173 50710402 50710310 Y MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11 TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2 NA NA NA NA MAPK11 2977 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr22 50784754 50785397 50785059 Y PPP6R2 PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 5021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr22 50982591 50982963 50982680 Y NA LMF2,NCAPH2,SCO2,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA SYCE3 16371 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 108002 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 6398384 6398410 6398397 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1171053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 10265421 10265646 10265492 Y BRPF1,VHL,IRAK2,TATDN2,GHRL TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 22061 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 10463285 10463437 10463347 Y LOC401052,C3orf24 NA NA NA NA NA SEC13 102423 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 12131259 12131529 12131269 Y NA NA NA NA NA NA SYN2 87383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 12621651 12621927 12621686 Y RPL32 MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 25138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 13102024 13102205 13102123 Y NA IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 10412 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 16412988 16413154 16413037 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 108282 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 16556249 16556592 16556372 Y DPH3,RFTN1 NA NA NA NA NA OXNAD1 251543 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 1073606 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 17661435 17661830 17661633 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 822479 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 18598150 18598373 18598222 Y SATB1 RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 19985 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 19009565 19009751 19009662 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 431400 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.06879560237707 chr3 27984483 27984771 27984759 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA EOMES 222277 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 29660758 29661082 29660950 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 340285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 32453477 32453643 32453560 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 22314 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 33081513 33081785 33081661 Y NA NA NA NA NA NA TMPPE 54508 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 37218637 37218971 37218954 Y DCLK3,TRANK1,C3orf35 LRRFIP2 MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 4209 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 40348191 40348315 40348238 Y NA EIF1B NA NA NA NA EIF1B 860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 42085178 42085330 42085254 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 31884 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 87790 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 43458781 43458976 43458878 Y NA NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 66396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 44643970 44644223 44644141 Y ZNF445,ZNF660,ZNF35,ZNF197 ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 19590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA NA NA NA NA NA NBEAL2 418954 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 46989533 46989702 46989634 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 29471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 47845454 47845505 47845480 Y DHX30 SMARCC1,DHX30 NA NA NA NA DHX30 3055 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 49425171 49425361 49425266 Y ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7 USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1 NA NA NA NA TCTA 22278 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F,RP11-493K19.3 NA NA NA NA RP11-493K19.3 3192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 50983523 50983672 50983598 Y NA NA NA NA NA NA MIR4787 273012 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 52347800 52348029 52347876 Y GPR62 GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA WDR82 27764 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 56818012 56818198 56818042 Y CCDC66,C3orf63,ARHGEF3 NA NA NA NA NA FAM208A 102747 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 57564978 57565360 57565163 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 16587 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 59526553 59526908 59526731 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 492743 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 66022863 66023161 66022996 Y MAGI1 MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 354 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 66279224 66279373 66279285 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 161939 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 69790676 69790712 69790690 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 4090 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 71447361 71447554 71447492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 183586 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 71509041 71509324 71509198 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 121816 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 71863099 71863325 71863212 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E3 61175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 76160921 76161072 76160934 Y NA NA NA NA NA NA ROBO2 207075 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 76778043 76778075 76778059 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 296874 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 76950761 76950890 76950828 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 469592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 79245619 79245877 79245748 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 569088 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 79366624 79366716 79366670 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 448249 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 79455772 79456088 79455911 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 358877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 79461669 79462063 79461996 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 352902 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 79674571 79674688 79674630 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 140277 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 79786804 79786811 79786808 Y NA ROBO1 NA NA NA NA ROBO1 28154 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 80239226 80239506 80239338 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 424261 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 83266585 83266839 83266721 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 1457273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 85071263 85071596 85071400 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 65131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 85318532 85318917 85318639 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 312400 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 85802065 85802290 85802178 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 795933 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 87101402 87101690 87101545 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 172731 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 97200440 97200579 97200496 Y EPHA6 NA NA NA NA NA ARL6 280786 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 98044011 98044208 98044126 Y NA NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 195702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 108948 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 402239 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 393031 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 390361 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 194588 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr3 100088429 100088702 100088566 Y NA NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA LNP1 29335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 105486064 105486421 105486242 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 99975 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 113502348 113502517 113502411 Y KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NAA50,ATP6V1A,RP11-271C24.2,GRAMD1C NA NA NA NA RP11-271C24.2 38093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 117004639 117004922 117004781 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 261094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 122151664 122151964 122151814 Y NA WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 122648361 122648742 122648615 Y NA NA LOC100129550 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5B 96710 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 125053590 125053890 125053754 Y NA NA NA NA NA NA SNX4 183151 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA ZXDC 65895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 127886942 127887322 127887108 Y NA EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA RUVBL1 16185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 128214371 128214730 128214426 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-475N22.4 8316 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 129167159 129167354 129167260 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 10191 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 133631190 133631374 133631292 Y SRPRB RAB6B NA NA NA NA RAB6B 18510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 136466232 136466235 136466234 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 2985 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 136492102 136492187 136492145 Y NA STAG1 NCK1,IL20RB IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 22882 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 143853302 143853504 143853403 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 164662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 146745799 146745822 146745813 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 485148 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr3 147137005 147137222 147137047 Y ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1 NA NA NA NA NA RP11-71N10.1 518569 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 147140808 147141337 147141213 Y NA NA NA NA NA NA RP11-71N10.1 514454 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 147142201 147142415 147142327 Y ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1 NA NA NA NA NA RP11-71N10.1 513376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA RP11-71N10.1 NA NA NA NA RP11-71N10.1 8084 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 148585310 148585526 148585462 Y CPA3 NA NA NA NA NA GYG1 121602 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 149153999 149154253 149154126 Y RNF13 NA GYG1,TM4SF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 56194 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 151978363 151978615 151978373 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 6729 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 158827452 158827795 158827624 Y NA NA NA NA NA NA MFSD1 379465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 159765726 159765787 159765757 Y NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 SCHIP1 210076 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 163736054 163736213 163736134 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 1817047 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 165215973 165216343 165216172 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 336917 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 165217698 165218028 165217864 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 335232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 171820468 171820770 171820540 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 65050 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 171897555 171897878 171897648 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 142137 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 172344996 172345137 172345044 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 81871 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 172377276 172377377 172377327 Y NA NCEH1 NA NA NA NA NCEH1 49631 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 173197299 173197871 173197356 Y NLGN1 NA NA NA NA NA NLGN1 85225 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 173457450 173457753 173457673 Y NA NA NA NA NA NA NLGN1 345376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 173580437 173580663 173580550 Y NLGN1 NA NA NA NA NA NLGN1 468363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 173767282 173767499 173767320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 325535 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 173789505 173789779 173789642 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 303255 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 174949564 174949783 174949705 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 37102 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr3 174949841 174950235 174950187 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 36650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 27.6191604213936 chr3 174984866 174985269 174985168 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 1616 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr3 174987266 174987320 174987290 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr3 174988288 174988312 174988303 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 1403 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr3 174991972 174992412 174992335 Y NA NAALADL2-AS2 NA NA NA NA NAALADL2-AS2 5087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 175150931 175151331 175151195 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2-AS2 164046 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 175204149 175204623 175204405 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2-AS2 217264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 176080356 176080644 176080432 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 645898 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 177979552 177979945 177979765 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 808122 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr3 179182237 179182507 179182372 Y NA GNB4 GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 14859 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 179471930 179472312 179472121 Y NA NA NA NA NA NA USP13 103387 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 181329651 181329904 181329778 Y NA NA NA NA NA NA SOX2 97810 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 181367894 181368046 181367970 Y SOX2 NA NA NA NA NA SOX2 59668 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 181414061 181414442 181414162 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 13272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 8912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr3 181419160 181419816 181419173 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 7898 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 181422063 181422170 181422118 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 5544 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 181436210 181436850 181436775 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 8496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 181438058 181438556 181438099 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 10344 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 14555 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.48516280347418 chr3 181443678 181444149 181443742 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 15964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 7.67198900594267 chr3 181473928 181474194 181474085 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 46214 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 183024720 183025033 183024891 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 119533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 184078263 184078665 184078465 Y NA EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD NA NA NA NA POLR2H 757 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 186746012 186746360 186746185 Y RTP1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99738 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 187086881 187087203 187087089 Y BCL6,RTP4 NA NA NA NA NA RPL39L 190185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 188103161 188103345 188103235 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 233316 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 188826947 188827206 188827077 Y NA NA BCL6,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 957102 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 190581013 190581092 190581053 Y NA GMNC NA NA NA NA GMNC 27126 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 191049369 191049653 191049414 Y NA CCDC50 NA NA NA NA CCDC50 4503 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 191160044 191160233 191160139 Y PYDC2 NA FGF12 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 115178 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 194212902 194213208 194212990 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 3885 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA TMEM44 10497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 195034615 195034891 195034753 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 44719 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 196047617 196047878 196047747 Y NA PCYT1A,TCTEX1D2 NA NA NA NA TCTEX1D2 4447 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 330052 330352 330160 Y NA ZNF732,ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 449 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 1796551 1796852 1796752 Y NA FGFR3 NA NA NA NA FGFR3 3517 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 2389037 2389223 2389089 Y LOC402160 ZFYVE28 NA NA NA NA ZFYVE28 29167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 4577048 4577566 4577357 Y NA STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 34975 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA JAKMIP1 23303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr4 6311062 6311148 6311105 Y NA WFS1 NA NA NA NA WFS1 41486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 6511373 6511666 6511520 Y PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA PPP2R2C 51661 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr4 10724626 10724928 10724698 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 267592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 16544160 16544423 16544292 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 287982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 21523815 21524208 21524014 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 827910 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 28761802 28762128 28761877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1901581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr4 34183539 34183770 34183747 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2060361 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 34995876 34996042 34995959 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1248089 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1220976 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr4 35027106 35027343 35027234 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1216788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.31137700411416 chr4 35107542 35107966 35107823 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1136165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 9.32441740722264 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 38084338 38084956 38084492 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 124282 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 38102941 38103486 38103298 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 142885 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr4 39933245 39933555 39933419 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 44021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 40050527 40050740 40050634 Y NA N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 5706 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 40943410 40943552 40943502 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 273179 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 40994779 40995404 40995184 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 221327 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 40997224 40997582 40997567 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 219149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 41148833 41148910 41148907 Y LIMCH1,LIMCH1 NA NA NA NA NA APBB2 67821 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 41886373 41886653 41886561 Y PHOX2B TMEM33 PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM33 48484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 41999139 41999467 41999284 Y NA SLC30A9 NA NA NA NA SLC30A9 8650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 47121817 47122010 47121920 Y NA NA NA NA NA NA COX7B2 212565 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 48125578 48125743 48125738 Y TEC NA NA NA NA NA TEC 144138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 54137122 54137385 54137364 Y SCFD2 NA NA NA NA NA SCFD2 92857 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 55250871 55251023 55250942 Y KIT NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 157607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 57313900 57314193 57314047 Y NA PPAT,PAICS,SRP72 NA NA NA NA PAICS 13993 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 62068799 62069364 62069049 Y LPHN3 LPHN3 NA NA NA NA LPHN3 3823 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 66376802 66376924 66376863 Y NA NA NA NA NA NA RP11-807H7.1 156755 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 66516104 66516284 66516196 Y NA RP11-807H7.1,EPHA5 NA NA NA NA RP11-807H7.1 17395 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr4 66533536 66533932 66533732 Y EPHA5 EPHA5 NA NA NA NA RP11-807H7.1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA NA NA NA NA NA EPHA5 426377 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 75886600 75886871 75886736 Y PARM1 NA NA NA NA NA THAP6 550285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 77367704 77367795 77367750 Y NA NA NA NA NA NA SCARB2 234658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SEPT11 356995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 79264997 79265051 79265025 Y NA NA NA NA NA NA BMP2K 430445 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 87960081 87960248 87960138 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 90805 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 88310144 88310324 88310202 Y AFF1,HSD17B11 HSD17B11,NUDT9 NA NA NA NA HSD17B11 214 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 88463051 88463413 88463109 Y NA NA NA NA NA NA NUDT9 121317 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 88943044 88943294 88943160 Y NA SPP1,RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA PKD2 16224 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 89534713 89535020 89534799 Y PPM1K,HERC3 NA NA NA NA NA NAP1L5 82366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 96466701 96466894 96466857 Y NA UNC5C NA NA NA NA UNC5C 1463 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 99344407 99344641 99344524 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 163872 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 102173679 102174077 102173884 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 93358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 105980538 105980953 105980680 Y TET2,TET2 NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 84079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 106188694 106188879 106188779 Y NA NA NA NA NA NA TET2 123662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA RP11-115A14.1 21210 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA AP1AR 417774 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 114894 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 114367129 114367387 114367298 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 27650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 530460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 484131 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr4 120093482 120093688 120093586 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 38054 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 124272958 124273104 124273084 Y NA SPRY1 LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 42846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr4 124538169 124538584 124538401 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 222219 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 124709037 124709145 124709084 Y SPRY1 NA NA NA NA NA SPRY1 393087 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 127603303 127603442 127603412 Y NA NA NA NA NA NA INTU 938984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 127610256 127610572 127610414 Y NA NA NA NA NA NA INTU 931854 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 127828532 127828546 127828541 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 713880 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 128059787 128060054 128059921 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 482372 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 36151 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 181709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 133292934 133293335 133293044 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 775135 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 140334690 140334958 140334824 Y ELF2 RAB33B NA NA NA NA RAB33B 37428 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 142347756 142348088 142347922 Y NA NA NA NA NA NA RP11-362F19.1 95984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 148951514 148951899 148951701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 300300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 149467274 149467593 149467420 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 816060 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 152081643 152081851 152081838 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 62918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 157866755 157867028 157866930 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 23518 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 158815027 158815407 158815217 Y NA NA NA NA NA NA RP11-597D13.9 274497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 158954591 158954700 158954643 Y NA NA FAM198B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-597D13.9 135204 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 159085222 159085591 159085435 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA RP11-597D13.9 4313 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 159095291 159095702 159095508 Y FAM198B,FAM198B RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA FAM198B 2821 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 159169271 159169555 159169414 Y TMEM144 TMEM144 NA NA NA NA TMEM144 48515 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 160191202 160191310 160191258 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 502912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 174112816 174113032 174112924 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 24013 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 174399518 174399676 174399543 Y NA NA NA NA NA NA SAP30 110398 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 174958102 174958199 174958151 Y NA NA NA NA NA NA CEP44 244629 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 175263937 175264166 175264013 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 60522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 183418367 183418505 183418425 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 353965 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 183439666 183439879 183439717 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 375264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr4 183481652 183481875 183481779 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 355214 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr4 183536176 183536411 183536208 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 300678 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 183568083 183568352 183568218 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 268737 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 184150030 184150375 184150203 Y NA NA NA NA NA NA WWC2 131584 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC11 140467 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr4 187762182 187762435 187762391 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 116306 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 190197516 190197817 190197669 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 194302 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.12455080164566 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.42288740265135 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.36713220338275 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 10626840 10627122 10626983 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 64398 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 11487050 11487322 11487183 Y NA NA NA NA NA NA DAP 727666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 11524882 11524979 11524955 Y CTNND2 NA NA NA NA NA DAP 765498 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 46389 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 20447344 20447494 20447490 Y CDH18 NA NA NA NA NA RP11-774D14.1 162455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 20572032 20572378 20572205 Y NA RP11-774D14.1 NA NA NA NA RP11-774D14.1 37571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 24283282 24283641 24283411 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 525949 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 25456035 25456404 25456210 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 267270 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 28048294 28048556 28048426 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 2859529 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr5 30694167 30694547 30694365 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 357125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 32241208 32241310 32241259 Y NA CTD-2186M15.1 NA NA NA NA CTD-2186M15.1 21170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 34715239 34715402 34715248 Y NA NA NA NA NA NA RAI14 60897 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 34877157 34877486 34877355 Y NA TTC23L,BRIX1,RAD1 NA NA NA NA BRIX1 35995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 37776965 37777327 37776998 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 399651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 644037 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 648818 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 40378402 40378773 40378595 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 375304 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 40480472 40480786 40480623 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 273291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 42465969 42466319 42466144 Y GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR GHR NA NA NA NA GHR 44090 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 42468582 42468751 42468671 Y NA GHR NA NA NA NA GHR 46703 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 44440190 44440314 44440194 Y NA NA NA NA NA NA FGF10 52382 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 52636023 52636219 52636115 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 138020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 53969444 53970118 53969706 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 157855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 54120977 54121197 54121092 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 309388 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 182396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 55966831 55967044 55966902 Y NA NA MAP3K1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K1 142357 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 56468272 56468727 56468348 Y MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1 GPBP1 NA NA NA NA GPBP1 497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 605797 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 58421119 58421626 58421279 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 667032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 58422372 58422713 58422580 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 949119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 60258688 60258981 60258835 Y NA ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 19732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 64821420 64821488 64821458 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 35510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 67272998 67273055 67273003 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 236493 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 71761986 71762350 71762256 Y ZNF366 NA NA NA NA NA MRPS27 147513 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 76926862 76927205 76927123 Y NA WDR41 NA NA NA NA WDR41 12426 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 77589539 77589820 77589680 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 960 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 77940704 77941073 77940964 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 122771 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 78013975 78014102 78013987 Y NA LHFPL2 ARSB,SCAMP1,LHFPL2 IMR90 Hi-C 24141950 LHFPL2 49742 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 43441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 102021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 81469981 81470152 81470091 Y NA NA NA NA NA NA RPS23 102244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 236835 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA HAPLN1 208021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C NA NA NA NA NA TMEM161B 607789 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 90686186 90686389 90686288 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 9010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 91015868 91016069 91015978 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 338692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 91949366 91949620 91949441 Y NA NA NA NA NA NA CTC-529L17.2 72341 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 92221738 92222106 92221922 Y NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-529L17.2 199777 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr5 92678371 92678771 92678494 Y NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 238272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 92760867 92761238 92761060 Y NA NA NA NA NA NA NR2F1 155805 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 92932600 92932748 92932677 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 15557 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr5 92932960 92933102 92933051 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 15917 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 16.1701922125253 chr5 92935260 92935353 92935337 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 18217 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 92937296 92937457 92937384 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 20253 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 23097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 93323557 93323685 93323621 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 121719 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 93900444 93900820 93900632 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD32 51232 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 95507678 95508048 95507916 Y NA NA ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 350923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 95904696 95905047 95904872 Y NA CAST PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 45725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 103048573 103048840 103048666 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 152079 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 106822252 106822471 106822392 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 182125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 106862612 106863005 106862809 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 141591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 109891768 109891977 109891873 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 179860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 110298484 110298499 110298492 Y NA NA SLC25A46,TSLP IMR90 Hi-C 24141950 WDR36 126915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 112585066 112585229 112585152 Y NA NA NA NA NA NA MCC 237298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 113030376 113030581 113030479 Y NA NA NA NA NA NA YTHDC2 182996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 115070693 115071068 115070974 Y CDO1 NA NA NA NA NA CDO1 79583 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4,RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA CTC-507E12.1 NA NA NA NA CTC-507E12.1 2429 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 119837700 119837812 119837711 Y PRR16 PRR16 NA NA NA NA PRR16 39727 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 126367022 126367218 126367207 Y NA MARCH3,C5orf63 NA NA NA NA MARCH3 2522 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 131810095 131810374 131810235 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 NA NA NA NA IRF1 14116 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr5 132404436 132404641 132404539 Y LEAP2 ZCCHC10,HSPA4 NA NA NA NA HSPA4 18782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA NA NA NA NA NA SEC24A 118284 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 136930873 136930924 136930899 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 1144 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 137785775 137785891 137785836 Y WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2 REEP2,EGR1 NA NA NA NA REEP2 13069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr5 138319677 138319832 138319813 Y DNAJC18,LRRTM2 NA NA NA NA NA AC034243.1 232679 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 141209314 141209613 141209459 Y NA PCDH1 PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 47198 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr5 141576686 141576854 141576770 Y PCDH1 NA FGF1,GNPDA1,NDFIP1,SPRY4,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 90616 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 147024840 147025034 147024978 Y DPYSL3,JAKMIP2 NA NA NA NA NA SPINK5 378212 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 147201124 147201544 147201446 Y JAKMIP2 NA NA NA NA NA SPINK5 201702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 346281 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 148869266 148869383 148869317 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 59624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 149838456 149838698 149838517 Y SYNPO,ZNF300,SLC6A7 CD74,RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 11137 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 150006488 150006837 150006695 Y SYNPO,MYOZ3 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 27846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 150379028 150379237 150379195 Y SYNPO,RBM22,TNIP1 NA ANXA6,C5orf62,ZNF300,ZNF300P1,TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNIP1 91901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 150938646 150939048 150938843 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A1 124039 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 153569046 153569266 153569156 Y NA GALNT10 NA NA NA NA GALNT10 756 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 153990009 153990256 153990067 Y NA NA GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 100206 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 161528591 161528706 161528649 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 1333626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 276566 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA NA ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-5 50605 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 173237626 173237876 173237751 Y NA NA BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 75407 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 173369010 173369228 173369031 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 55727 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 173738914 173739193 173739170 Y HMP19 NA BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 410343 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 175930554 175930566 175930560 Y RNF44 RNF44 NA NA NA NA RNF44 32460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr5 177541057 177541427 177541157 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 2613 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 179398044 179398477 179398178 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA TBC1D9B 65185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr5 180527494 180527529 180527504 Y NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-338M12.5 89395 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr5 180615428 180615595 180615512 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 1329 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 3072108 3072295 3072201 Y NA RIPK1,BPHL NA NA NA NA RIPK1 9883 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 5287917 5288162 5288028 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 28640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 5296297 5296648 5296345 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 37020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 10589491 10589864 10589781 Y NA NA NA NA NA NA PAK1IP1 103064 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 12277553 12277959 12277761 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 NA NA NA NA EDN1 10637 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 13462093 13462464 13462300 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1 NA NA NA NA GFOD1 23430 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr6 14312400 14312611 14312511 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 196528 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 14711169 14711813 14711625 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 532714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 14758684 14758801 14758713 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 485726 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 16439523 16439703 16439580 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA MYLIP 312167 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 18150871 18151234 18151053 Y NUP153,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NA NA NA NA TPMT 2071 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 20642705 20642902 20642804 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 110017 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 21667588 21667834 21667745 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 75616 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 21740205 21740397 21740265 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 148233 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.77045900137139 chr6 21808482 21808727 21808539 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 216510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 22073995 22074367 22074183 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 482023 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 24228927 24229160 24229097 Y NA NA NA NA NA NA DCDC2 127120 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 24302656 24303033 24302868 Y NA NA NA NA NA NA DCDC2 53247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 24341517 24341649 24341583 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 14631 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 24348668 24348920 24348794 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 7360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0319 59707 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 25050592 25050945 25050684 Y C6orf62 FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 10354 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 25458860 25459089 25458879 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 181554 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.07531580393131 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.89500980301705 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr6 27637652 27637706 27637685 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136003 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 31530961 31531387 31531305 Y HLA-B,STK19,CLIC1,TNF,LST1 DDX39B,NFKBIL1 NA NA NA NA NFKBIL1 18314 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.95076500228564 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1 NA NA NA NA ATF6B 21753 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 32787339 32787575 32787566 Y TAP1,PSMB8 TAP2,PSMB9,TAP1 NA NA NA NA TAP2 16982 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 12219 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 33401049 33401362 33401206 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 16955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 34099261 34099385 34099317 Y GRM4 NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 85831 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 34150537 34150894 34150814 Y HMGA1 CYCSP55 C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYCSP55 34322 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 34341997 34342182 34342078 Y HMGA1 NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 16269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 37745135 37745338 37745265 Y NA ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 39937 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 39279620 39279758 39279742 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 84394 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 39329332 39329605 39329533 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 134106 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 40132230 40132456 40132336 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 207658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA FOXP4 170391 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 41412168 41412234 41412201 Y FRS3 NA FOXP4,TFEB,NCR2,PGC,TOMM6,PRICKLE4,USP49,MDFI IMR90,HELA,GM12878,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 99930 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 41686086 41686432 41686391 Y NA TFEB NA NA NA NA TFEB 15565 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 42372266 42372455 42372353 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 45334 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 42515662 42516014 42516002 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 13786 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 43058034 43058580 43058415 Y NA CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 16028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 43242978 43243220 43243076 Y GNMT,KLC4,SLC22A7,CRIP3 NA SLC22A7,CRIP3,ZNF318 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF318 91996 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 43244173 43244568 43244268 Y NA NA SLC22A7,CRIP3,ZNF318 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF318 90648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 43332066 43332081 43332075 Y NA ZNF318 NA NA NA NA ZNF318 3135 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 44039522 44039890 44039644 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 52761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 44044328 44044673 44044418 Y C6orf223,NFKBIE TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 47978 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 44050434 44050837 44050619 Y NA TMEM63B,MRPL14 MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 41814 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 29370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 47550559 47550935 47550672 Y NA NA NA NA NA NA CD2AP 107034 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P5 396291 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 52247517 52247853 52247539 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 23298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 52339756 52339820 52339788 Y NA NA NA NA NA NA EFHC1 56650 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 54604535 54604549 54604543 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 947240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 64150073 64150241 64150156 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 79425 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr6 64308595 64308777 64308676 Y NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 34948 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 69390302 69390390 69390344 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 47043 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 69802983 69803339 69803007 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 459724 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 69803382 69803773 69803578 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 460123 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 69896068 69896326 69896076 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 552809 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 70505414 70505608 70505498 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 411 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 72051718 72051897 72051837 Y NA NA NA NA NA NA OGFRL1 55212 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 72055906 72056381 72056246 Y NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR30A 54943 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 72103028 72103231 72103130 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 8093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 72188537 72188902 72188719 Y NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 60065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 72683550 72683736 72683643 Y RIMS1 NA NA NA NA NA LINC00472 555078 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 72845513 72845515 72845514 Y NA NA NA NA NA NA LINC00472 717041 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 73330314 73330844 73330342 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 640094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 73975471 73975797 73975634 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 4533 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 76092789 76092908 76092839 Y NA NA NA NA NA NA TMEM30A 100105 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 79753259 79753564 79753411 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 32389 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 80638393 80638474 80638434 Y ELOVL4 ELOVL4 NA NA NA NA ELOVL4 16823 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 81197510 81197656 81197595 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 383146 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 81430793 81430891 81430869 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 616429 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 81550162 81550525 81550226 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 735798 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 81662295 81662532 81662438 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 797959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.29833660100568 chr6 83756669 83757034 83756938 Y PGM3,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 18351 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 89820061 89820318 89820190 Y NA PNRC1,SRSF12,PM20D2 NA NA NA NA SRSF12 5482 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 91134952 91135221 91135020 Y NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K7 159543 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94014369 94014515 94014442 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 112750 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 94018186 94018578 94018382 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 108687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94037616 94037704 94037660 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 89561 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94127729 94128504 94127840 Y NA EPHA7 NA NA NA NA EPHA7 464 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 94443419 94443467 94443447 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 316154 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94496305 94496344 94496330 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 369040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94502513 94502885 94502788 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 375248 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94545083 94545465 94545274 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 417818 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 94548457 94548785 94548621 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 421192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 94860177 94860339 94860258 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 732912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr6 95324557 95324827 95324692 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 698592 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 105477997 105478373 105478087 Y NA NA NA NA NA NA LIN28B 75074 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 105958594 105958887 105958782 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 109635 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 106258484 106259193 106259052 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 273002 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 106414871 106415086 106414985 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 117109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 106589360 106589531 106589446 Y NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 57165 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 106643011 106643217 106643065 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 110816 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 110094407 110094557 110094483 Y NA NA NA NA NA NA FIG4 83908 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 110415658 110415810 110415734 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 83397 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 110606267 110606424 110606326 Y WASF1,CDC40 NA NA NA NA NA CDC40 106923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 111612312 111612528 111612438 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919 RP11-428F8.2,KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 33761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 111675383 111675464 111675424 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1919 96832 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 111730761 111730999 111730880 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 71715 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 111776910 111777281 111777179 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 25433 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 112173257 112173622 112173448 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 19033 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 112471062 112471110 112471086 Y NA NA NA NA NA NA TUBE1 64330 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 116708158 116708375 116708238 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA FAM26F 72158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 117819510 117819668 117819589 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 46530 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 117914764 117915043 117914904 Y NA GOPC NA NA NA NA GOPC 6648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 119121596 119121907 119121854 Y NA NA NA NA NA NA ASF1A 91477 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 119129812 119130192 119130083 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA ASF1A 83192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 119166679 119167065 119166872 Y NA ASF1A NA NA NA NA ASF1A 46319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 121398601 121398951 121398918 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 355887 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 121530032 121530291 121530288 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 224547 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.06879560237707 chr6 121759226 121759877 121759689 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 4388 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr6 121843500 121843932 121843669 Y GJA1 NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 70233 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 122016612 122016787 122016747 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 243345 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 122172452 122172679 122172567 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-18P 358115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 122253904 122254092 122253993 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-18P 276702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr6 122373442 122373685 122373622 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-18P 157109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.42940760420559 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1 NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 124126884 124127258 124127027 Y NA NA NA NA NA NA CLVS2 811768 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 125420389 125420754 125420652 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 17441 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 126068034 126068254 126068125 Y HEY2 NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 32053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 129661219 129661453 129661336 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 367917 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 136312028 136312251 136312140 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 296738 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 137227679 137227915 137227797 Y NA NA NA NA NA NA PEX7 85962 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 137517813 137517908 137517861 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 20678 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 138045007 138045495 138045466 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1244 435563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140299062 140299512 140299364 Y NA NA CITED2,HECA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 605305 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140400470 140400745 140400517 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 706713 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 140762502 140762813 140762587 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 1068745 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140807335 140807614 140807478 Y NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1113578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140860203 140860346 140860259 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1166446 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140893217 140893627 140893519 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1199460 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 140929042 140929323 140929183 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1235285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 141300848 141301178 141301014 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1165189 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 141722933 141723109 141722991 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 743258 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr6 142648297 142648491 142648394 Y NA GPR126 NA NA NA NA GPR126 27306 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr6 143124343 143124671 143124507 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 139667 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 143223836 143224147 143224035 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 40191 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 143286973 143287055 143287014 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 22635 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 143516746 143517148 143516792 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 137113 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 144007310 144007644 144007477 Y NA NA NA NA NA NA PHACTR2 151328 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 144931961 144932452 144932213 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 327124 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 149069640 149070024 149069807 Y UST UST NA NA NA NA UST 3176 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 153411582 153411939 153411751 Y MTRF1L RGS17 NA NA NA NA RGS17 38445 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 154753926 154754309 154754118 Y CNKSR3 NA NA NA NA NA CNKSR3 75484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 29481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157097774 157098131 157097933 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 711 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157137665 157137911 157137871 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 40602 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157174408 157174845 157174627 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 77345 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157299126 157299275 157299174 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 202063 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr6 157936149 157936334 157936215 Y SNX9 NA NA NA NA NA ZDHHC14 135984 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 159195572 159195684 159195582 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 42760 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 159383408 159383511 159383422 Y NA RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35708 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 160136031 160136425 160136369 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8192 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 160137124 160138386 160137829 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 6231 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 161183008 161183335 161183172 Y LPA NA NA NA NA NA MAP3K4 227424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 163098494 163098513 163098505 Y PARK2,PACRG,PACRG PACRG,PARK2 NA NA NA NA PACRG 47651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 163826910 163827186 163827117 Y QKI QKI NA NA NA NA QKI 5846 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 163840967 163841346 163841003 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 7935 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 163950759 163951099 163950781 Y NA NA NA NA NA NA QKI 117727 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RNASET2 253061 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 170461964 170462067 170462016 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 135494 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 90518 90816 90667 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100153 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 650155 650947 650502 Y COX19 NA NA NA NA NA PDGFA 92222 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 946891 947297 947190 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 32702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 1616013 1616182 1616098 Y ELFN1 MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 TFAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 7372 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 1708705 1709030 1708796 Y NA ELFN1 MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 ELFN1 16725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 1709256 1709641 1709356 Y NA ELFN1 MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 ELFN1 16114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 1965570 1966023 1965918 Y NA NA NA NA NA NA ELFN1 239815 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 2058997 2060327 2059312 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA MAD1L1 210551 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 2063741 2064015 2063879 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 206863 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 2657383 2657705 2657445 Y IQCE,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11880 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 2990961 2991263 2991178 Y LFNG NA NA NA NA NA GNA12 109003 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 3885202 3885340 3885271 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 796048 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 4133088 4133284 4133186 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 548104 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 4607963 4608203 4608083 Y NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 73185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 5571351 5571818 5571666 Y WIPI2,ACTB FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 19922 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.00652020155424 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 7996944 7997264 7997104 Y NA GLCCI1 LOC729852,GLCCI1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLCCI1 9161 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 8482629 8482725 8482675 Y NXPH1 NA NA NA NA NA ICA1 182312 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 11606918 11607025 11606951 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 595419 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 12758831 12759023 12758905 Y ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34350 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 12759260 12759464 12759402 Y NA ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34779 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 13057101 13057487 13057331 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 332620 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 14042792 14042945 14042854 Y NA ETV1 NA NA NA NA ETV1 13742 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 15957269 15957287 15957277 Y NA NA NA NA NA NA AC005550.4 231266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 566066 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 413550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 18575593 18575869 18575740 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 451021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 22130088 22130317 22130208 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 146386 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 22742975 22743282 22743130 Y NA NA FAM126A,LOC100506178 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM7 117188 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA NUPL2 126928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA NUPL2 128594 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr7 24229401 24229422 24229412 Y NA NA NA NA NA NA MPP6 381465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 24381432 24381799 24381595 Y NPY NA NA NA NA NA MPP6 229088 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 25934373 25934595 25934484 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10,HOXA5,HOXA-AS3,HOXA7,HOXA6,LOC441204,MIR196B,HOTTIP,HOXA13,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA2,HOXA1,HOXA3,HOTAIRM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 255265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 30005426 30005693 30005606 Y NA AC007285.6,SCRN1 NA NA NA NA AC007285.6 20523 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 34529792 34529930 34529861 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 694004 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 36331807 36331936 36331811 Y NA NA NA NA NA NA ANLN 95479 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 36787487 36788062 36787733 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P18 68502 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 36849242 36849408 36849406 Y ELMO1 NPM1P18 NA NA NA NA NPM1P18 7156 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 37389897 37390051 37389974 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 96801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 37630466 37630784 37630541 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 EPDR1 90662 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 40611677 40611985 40611889 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 624041 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 56034549 56034772 56034661 Y NA GBAS,MRPS17 NA NA NA NA MRPS17 17037 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP12 202538 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA GUSBP12 437130 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 64733908 64734317 64734037 Y NA NA NA NA NA NA ZNF92 102395 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 69393144 69393376 69393212 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 331239 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 70639540 70639901 70639689 Y NA WBSCR17 NA NA NA NA WBSCR17 44385 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 75267820 75268040 75267850 Y POR NA NA NA NA NA HIP1 98240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 75701168 75701283 75701226 Y NA STYXL1,MDH2 NA NA NA NA MDH2 25799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA ZP3 NA NA NA NA ZP3 27857 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 78062254 78062456 78062355 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 636132 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 80441834 80442054 80441993 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 107621 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 80550378 80550824 80550614 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 703 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 80840847 80841237 80841156 Y SEMA3C NA NA NA NA NA SEMA3C 291172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 83662977 83663317 83663147 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 456723 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 83865799 83865921 83865847 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 254119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 83866816 83867276 83866988 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 252764 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 83877672 83877869 83877747 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 242171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 83885987 83886081 83886034 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 233959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 84119513 84119698 84119606 Y NA SEMA3A NA NA NA NA SEMA3A 342 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 84717663 84717972 84717818 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 96199 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 84814304 84814737 84814457 Y NA SEMA3D NA NA NA NA SEMA3D 133 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 85450448 85450904 85450654 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 636277 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 85576189 85576390 85576289 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 762018 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 86601476 86601934 86601661 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 85081 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 88207618 88207818 88207718 Y NA NA NA NA NA NA SRI 353310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 92290698 92291011 92290856 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 72990 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 180994 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 94140158 94140537 94140353 Y CASD1 CASD1 NA NA NA NA CASD1 3627 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 94799053 94799326 94799190 Y PPP1R9A,PPP1R9A NA NA NA NA NA RNU4-16P 73514 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 98557558 98557720 98557639 Y KPNA7 NA NA NA NA NA MIR3609 80285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 100342957 100343164 100343095 Y NA POP7 NA NA NA NA POP7 41281 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.24258140173709 chr7 101930729 101931104 101930861 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 71215 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 402356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110470494 110470759 110470627 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 258303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110651753 110651984 110651824 Y LRRN3 NA NA NA NA NA LRRN3 77078 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110732834 110733321 110733005 Y NA LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 3772 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110753766 110754103 110753883 Y LRRN3 LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 24704 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110778024 110778148 110778086 Y NA LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 48962 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 79348 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr7 110849154 110849473 110849333 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 120092 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 127806 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 145495 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 227672 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr7 111745442 111745761 111745634 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 98705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 111814530 111814935 111814850 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 29531 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 113233852 113234207 113234027 Y NA NA NA NA NA NA LINC00998 477184 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 116804623 116804954 116804811 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 212235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 117863844 117864014 117863854 Y ANKRD7 NAA38 NA NA NA NA NAA38 41758 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 1212450 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 120703433 120703512 120703470 Y NA NA NA NA NA NA ING3 114630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 120884704 120884786 120884745 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 149632 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 123080180 123080550 123080382 Y NA NA NA NA NA NA IQUB 92581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 125279639 125279913 125279647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-420H19.3 340707 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.42940760420559 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 128915299 128915657 128915368 Y NA NA NA NA NA NA AHCYL2 52435 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 128958632 128958719 128958676 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 89492 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.95728520383988 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 129960010 129960125 129960069 Y NA NA NA NA NA NA TMEM209 114400 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130530611 130530821 130530670 Y NA NA MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 65248 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA MIR29A LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR29A 9931 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 130873403 130873921 130873619 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA AC009362.2 51428 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 276122 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 149872 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 134798847 134799175 134799011 Y NA NA NA NA NA NA C7orf49 54372 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49 NA NA NA NA C7orf49 17282 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 139782179 139782472 139782326 Y NA PARP12 NA NA NA NA PARP12 20658 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 139930411 139930852 139930521 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 168890 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 143589612 143589642 143589628 Y OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A FAM115A NA NA NA NA FAM115A 7649 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 145847092 145847701 145847439 Y CNTNAP2 CNTNAP2 NA NA NA NA CNTNAP2 35639 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 145973417 145973757 145973587 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 161964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 146054322 146054858 146054524 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA CNTNAP2 242869 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 146086153 146086538 146086171 Y NA NA NA NA NA NA CNTNAP2 274700 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.47864260191994 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 149232526 149232604 149232565 Y SSPO ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 39618 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 149413428 149413754 149413591 Y NA KRBA1 NA NA NA NA KRBA1 3556 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.95728520383988 chr7 150363010 150363297 150363193 Y LOC100128542 GIMAP2,GIMAP1 NA NA NA NA GIMAP2 17488 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 150944441 150944847 150944697 Y ASB10,SMARCD3 ABCF2,CHPF2,SMARCD3 NA NA NA NA CHPF2 16866 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 151480048 151480422 151480235 Y PRKAG2,GALNTL5 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 91705 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.83273440219422 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr7 154746550 154746681 154746616 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 46113 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 156792805 156792864 156792835 Y NA MNX1 NA NA NA NA MNX1 8481 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 1750336 1750494 1750412 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 19648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 6405382 6405492 6405403 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 143269 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 8247461 8247709 8247494 Y NA NA NA NA NA NA MFHAS1 501446 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 8701542 8701893 8701762 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 47262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 10191869 10192038 10191953 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 282091 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 10193189 10193473 10193425 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 283411 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 11036366 11036550 11036458 Y MTMR9,XKR6 XKR6 NA NA NA NA XKR6 20325 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 NA NA NA NA NA NEIL2 64175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 16219402 16219917 16219607 Y MSR1 NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 791621 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 19956829 19957079 19956916 Y ATP6V1B2 NA LPL IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 95799 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 22301187 22301546 22301465 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,RP11-582J16.3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 23308133 23308499 23308237 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 LOXL2,ENTPD4 NA NA NA NA ENTPD4 4709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 24206605 24207043 24206844 Y ADAM28,ADAMDEC1 NA NA NA NA NA RNU1-148P 273934 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.47864260191994 chr8 28565617 28566294 28565942 Y EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 8636 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 28884105 28884486 28884217 Y HMBOX1,HMBOX1 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 26966 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.06879560237707 chr8 31040746 31040774 31040760 Y NA NA NA NA NA NA WRN 151429 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 32642880 32643214 32643047 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 685726 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 33265826 33266145 33265940 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 62795 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 33291442 33291793 33291639 Y MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41 FUT10,MAK16 NA NA NA NA FUT10 37147 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 1203648 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.18030600091426 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA NA KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 174787 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 37451616 37451672 37451643 Y NA NA ZNF703 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF703 99597 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 37515943 37516241 37516204 Y GOT1L1 ZNF703 KCNU1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 35028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 37738160 37738666 37738484 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 16319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 38217250 38217535 38217393 Y NA WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 20255 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 38219963 38220671 38220346 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 17119 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 38781974 38782296 38782041 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 25221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 173635 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 42072486 42072556 42072531 Y NA NA AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-231D20.2 54159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 48350721 48350922 48350822 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 276228 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 48579999 48580070 48580036 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 69578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 53288358 53288826 53288682 Y ST18 NA NA NA NA NA RB1CC1 367577 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 54659884 54660111 54659998 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 94007 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 54720057 54720661 54720376 Y ATP6V1H,ATP6V1H ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA ATP6V1H 33457 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 108243 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 58122348 58122589 58122430 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-513O17.2 69100 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 58122731 58123025 58122849 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-513O17.2 69483 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 59717237 59717517 59717381 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 7594 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 38258 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 59821707 59822062 59821885 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-50P 96596 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 69923 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 59980234 59980420 59980383 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 49179 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 60010619 60010999 60010857 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 18600 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 66742209 66742357 66742281 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 10200 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 68147841 68148210 68148008 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 105702 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 90572 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chr8 69765670 69765946 69765808 Y NA RP11-865I6.2 SULF1,C8orf34,LOC100505718 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-865I6.2 2672 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 279380 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 70404093 70404306 70404271 Y NA SULF1 NA NA NA NA SULF1 27234 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 71188678 71189062 71188836 Y NA NA NA NA NA NA NCOA2 124978 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 73333960 73334345 73334224 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 457630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 73733862 73734193 73733971 Y KCNB2 NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 57782 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 74581626 74581813 74581790 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 76130 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 75748881 75749089 75748985 Y NA PI15 NA NA NA NA PI15 14109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 77469082 77469378 77469240 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 122076 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 80659403 80659613 80659502 Y NA HEY1 NA NA NA NA HEY1 18485 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 80701258 80701483 80701350 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 23160 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 81015641 81015664 81015650 Y ZBTB10 NA NA NA NA NA MRPS28 75117 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 81041762 81041917 81041834 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 99550 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 90912887 90913271 90913166 Y NA OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 800 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 96180882 96181195 96181039 Y PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 36850 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 96903752 96903767 96903760 Y NA NA LOC100616530,UQCRB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDF6 267253 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 97171094 97171453 97171221 Y GDF6 GDF6 NA NA NA NA GDF6 74 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 98038035 98038331 98038307 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL5 249845 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 98843281 98843693 98843349 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 31589 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 101475207 101475346 101475256 Y YWHAZ,YWHAZ,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 94666 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 12356 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 106172584 106172814 106172681 Y NA NA ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 156106 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 108336572 108336625 108336598 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 628331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 113791450 113791716 113791698 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 595182 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 114058689 114058941 114058782 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 327957 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 5.54743820429701 chr8 114257291 114257677 114257549 Y CSMD3 NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 129221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 114422111 114422275 114422193 Y CSMD3 RP11-709P2.1,CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 25053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 114445563 114445724 114445576 Y CSMD3 CSMD3 NA NA NA NA CSMD3 1604 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr8 115233906 115233914 115233910 Y NA NA NA NA NA NA CSMD3 786578 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 1112249 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 116189630 116189772 116189672 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 630127 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 116441706 116441935 116441732 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 377964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 4.36713220338275 chr8 116474696 116474834 116474765 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 345065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 117366472 117366785 117366629 Y NA NA LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 409957 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 117664096 117664364 117664167 Y RAD21 NA NA NA NA NA UTP23 112378 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 118894000 118894167 118894051 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 227925 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 123050237 123050548 123050394 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 1002115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 123141624 123141882 123141720 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 910781 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 123832581 123832902 123832741 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 219761 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 81977 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 124407044 124407322 124407183 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 19268 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 124731207 124731322 124731265 Y NA FAM91A1 NA NA NA NA FAM91A1 47374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 124965382 124965556 124965469 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 186686 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 126187682 126188060 126187888 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85600 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA MYC 646138 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 438397 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 129062971 129063389 129063062 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 42114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 129162104 129162535 129162406 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 141247 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 130150064 130150272 130150167 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 877103 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr8 130176726 130177115 130176951 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 850260 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr8 130178393 130178758 130178576 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 848617 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 130184913 130184979 130184946 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 842396 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chr8 130222982 130222992 130222987 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 804383 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 130595168 130595596 130595537 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 431779 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 130703284 130703457 130703434 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM49B 323918 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 188477 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 133918146 133918614 133918311 Y TG NA NA NA NA NA PHF20L1 132528 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 135493726 135493930 135493821 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 229362 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 135519293 135519998 135519930 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 203294 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 135984758 135985124 135984941 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 261466 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 140115684 140115926 140115805 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1350752 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr8 142975914 142976309 142976112 Y NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 TSNARE1 506292 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 143532398 143532722 143532656 Y LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA BAI1 3607 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 BAI1 BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAI1 5207 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 143758809 143759081 143758941 Y NA JRK NA NA NA NA JRK 2305 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 26152 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 144328155 144328364 144328211 Y NA ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA ZFP41 875 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 GRINA NA NA NA NA GRINA 35424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr8 146085419 146085616 146085518 Y NA ZNF7,COMMD5,ZNF250 NA NA NA NA COMMD5 8298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 1665313 1665337 1665325 Y NA NA NA NA NA NA VLDLR 954497 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 2657497 2657645 2657571 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 37663 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 2839342 2839735 2839533 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 2506 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 447114 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 4743341 4743721 4743569 Y NA AK3,RCL1 NA NA NA NA AK3 3298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 5493502 5493936 5493824 Y KIAA1432,C9orf46,CD274 NA NA NA NA NA KIAA1432 133089 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 5895206 5895407 5895334 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 64089 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr9 9758146 9758159 9758153 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 669270 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 13034069 13034552 13034397 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-3L8.3 221725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 13248843 13249002 13248988 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 28587 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 13502665 13502870 13502768 Y NA NA NA NA NA NA RP11-536O18.1 58175 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 13568572 13568946 13568596 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-536O18.1 124082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 13588231 13588522 13588334 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-536O18.1 143741 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 167427 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 14233168 14233395 14233282 Y NFIB NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 81689 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 14263032 14263410 14263221 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 51674 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 43525 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chr9 14353468 14353873 14353760 Y NFIB RP11-120J1.1,NFIB NA NA NA NA RP11-120J1.1 38384 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 14395378 14395755 14395567 Y NA NFIB NA NA NA NA NFIB 1227 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 16508530 16508711 16508621 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 216101 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr9 22040932 22041035 22040938 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 30778 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 22080061 22080293 22080228 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 69907 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 26500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chr9 29825337 29825639 29825488 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 861464 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 31966420 31966696 31966558 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 415922 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 32443270 32443461 32443367 Y TOPORS,DDX58 NA NA NA NA NA ACO1 60652 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 33017262 33017602 33017524 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 APTX 5564 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 112022 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 36154326 36154976 36154382 Y TLN1,GLIPR2 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA GLIPR2 19594 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 36166552 36166755 36166690 Y CREB3,TLN1 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA CLTA 22098 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.47864260191994 chr9 72731610 72732001 72731807 Y MAMDC2 NA NA NA NA NA SMC5 139936 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 75511457 75511847 75511682 Y NA RP11-151D14.1 NA NA NA NA RP11-151D14.1 24432 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA RP11-151D14.1 NA NA NA NA RP11-151D14.1 31775 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151D14.1 62501 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr9 75562890 75563230 75563163 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151D14.1 75865 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 75580383 75580516 75580515 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151D14.1 93358 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 59.8415142463529 chr9 75602878 75603123 75602991 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 90235 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 81471083 81471392 81471194 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 532827 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 84270722 84271111 84271084 Y NA TLE1,RP11-154D17.1 NA NA NA NA TLE1 31109 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 86044941 86045010 86044976 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 275499 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 87655610 87656099 87655899 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 698845 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 90402747 90402992 90402850 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA CDK20 184676 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 93879711 93879721 93879717 Y NA NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 242474 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 95168954 95169114 95169066 Y OGN NA NA NA NA NA NOL8 83036 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chr9 97273853 97274253 97274073 Y NA NA NA NA NA NA HIATL1 139020 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 97288097 97288106 97288102 Y FBP1,FBP1 NA NA NA NA NA HIATL1 153264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 98075518 98075673 98075591 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 2318 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 99981870 99981915 99981891 Y NA ZNF322P1,RP11-498P14.5 NA NA NA NA RP11-498P14.5 17067 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 FOXE1 FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 FOXE1 47272 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 104248590 104248780 104248669 Y C9orf125 RNF20 NA NA NA NA RNF20 45353 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 107510718 107511248 107511059 Y ABCA1,NIPSNAP3A NIPSNAP3A,NIPSNAP3B NA NA NA NA NIPSNAP3A 2749 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 108272295 108272828 108272406 Y TMEM38B FKTN NA NA NA NA FKTN 45583 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3919 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 109647843 109648061 109647872 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 24465 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 109932773 109933133 109932953 Y NA NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110285 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 110271317 110271411 110271364 Y NA RP11-438P9.1 NA NA NA NA RP11-438P9.1 23260 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 112813346 112813601 112813470 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 203319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 115294232 115294441 115294354 Y NA KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 46748 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 115995182 115995346 115995289 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26 NA NA NA NA SLC31A1 13374 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 120884663 120884980 120884821 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 1437082 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 121918529 121918824 121918789 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1421624 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 122135998 122136186 122136092 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1204262 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 123834475 123834791 123834714 Y TRAF1,TRAF1 CNTRL CNTRL,TRAF1,MEGF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTRL 350 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA NA TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 RBM18 84196 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 126002195 126002288 126002252 Y OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP STRBP NA NA NA NA STRBP 26567 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 126232587 126232866 126232722 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 203732 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 126597388 126597650 126597587 Y DENND1A NA NA NA NA NA DENND1A 92781 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 127424345 127424738 127424542 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 5599 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 127523126 127523289 127523221 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 8300 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 6.60971360511984 chr9 128433867 128434078 128433973 Y NA MAPKAP1 NA NA NA NA MAPKAP1 33435 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 70706 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132535885 132536300 132536143 Y FNBP1,USP20,USP20,TOR1B TOR1B,TOR1A PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 27132 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132769657 132769989 132769916 Y NA FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 33484 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 133312784 133313088 133312936 Y NA NA EXOSC2,ASS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FUBP3 139264 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 133619181 133619471 133619230 Y NA ABL1 NA NA NA NA ABL1 31848 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 133721974 133722320 133722184 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FIBCD1 90353 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.71470380210279 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 134544388 134544718 134544626 Y FAM78A,PRRC2B,MED27 NA NA NA NA NA RAPGEF1 68743 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 135088716 135088744 135088730 Y NA NA NA NA NA NA NTNG2 53382 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 136019465 136020353 136020023 Y NA RALGDS NA NA NA NA RALGDS 16948 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chr9 137285570 137286195 137285918 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 78626 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chr9 138540539 138540770 138540645 Y NA NA GLT6D1,KCNT1 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf116 148959 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP1 130717 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 139427472 139428022 139427637 Y NACC2,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 10292 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,MIR3621 NA NA NA NA MIR3621 39570 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,MIR3621 NA NA NA NA MIR3621 38118 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 MIR3621 37331 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 8.73426440676551 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chr9 140132594 140132714 140132654 Y LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 951 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA NRARP 25355 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 1367285 1367756 1367429 Y P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA NA NA NA NA NA SLC25A6 141861 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chrX 1479744 1480128 1479953 Y NA SLC25A6 NA NA NA NA SLC25A6 29489 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 1524384 1524716 1524554 Y CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL SLC25A6,ASMTL NA NA NA NA SLC25A6 14767 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 2301315 2301326 2301321 Y NA NA NA NA NA NA ZBED1 115682 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chrX 9477403 9477544 9477474 Y FAM9B,TBL1X,LOC100288814 TBL1X NA NA NA NA TBL1X 48068 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 12969061 12969258 12969197 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 21969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 12973247 12973307 12973277 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 17920 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 13108770 13109761 13109358 Y TLR8,TMSB4X FAM9C TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM9C 47969 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 15493209 15493485 15493347 Y NA PIR NA NA NA NA PIR 16202 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 15787454 15787695 15787561 Y NA ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 18900 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 2.83273440219422 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 112388 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA NA NA NA NA NA MAP7D2 239597 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 21962010 21962116 21962060 Y NA SMS NA NA NA NA SMS 5319 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA GK 991137 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 36331773 36331854 36331814 Y NA NA NA NA NA NA RPS15AP40 59444 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.708183600548555 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 40017598 40017727 40017669 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 16855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 40693990 40694519 40694253 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 70718 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 40970140 40970504 40970321 Y NA USP9X NA NA NA NA USP9X 27252 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 41594711 41594837 41594774 Y NA NA NA NA NA NA CASK 185879 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA FUNDC1 511159 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA NA NA NA NA NA FUNDC1 231336 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 45666628 45666834 45666726 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42086 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 45667037 45667329 45667199 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41591 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 46148096 46148185 46148140 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 36895 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 46435390 46435934 46435628 Y RP2,ZNF674,CHST7 ZNF674,CHST7 NA NA NA NA CHST7 4171 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 50229435 50229583 50229509 Y SHROOM4 NA NA NA NA NA CCNB3 264071 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 3.30485680255992 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.590153000457129 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 273914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.06227540082283 chrX 68851851 68852116 68851941 Y PJA1,EDA EDA NA NA NA NA EDA 17940 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 69618819 69619019 69618919 Y IGBP1 NA NA NA NA NA PDZD11 110455 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.88848960146281 chrX 69666219 69666233 69666226 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 157855 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NLGN3 NA NA NA NA NLGN3 39172 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 72786594 72786762 72786676 Y NAP1L2,CDX4,CHIC1 CHIC1 NA NA NA NA CHIC1 5558 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 74033137 74033450 74033294 Y NA NA NA NA NA NA KIAA2022 109832 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 74143858 74143903 74143869 Y KIAA2022 KIAA2022 NA NA NA NA KIAA2022 576 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 77226253 77226302 77226278 Y NA NA NA NA NA NA ATP7A 62059 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.65242840127996 chrX 85404728 85405017 85404880 Y DACH2 NA NA NA NA NA CHM 104162 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA ARMCX1 NA NA NA NA ARMCX1 9960 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.41636720109711 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA BHLHB9 89887 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 102880714 102880758 102880737 Y PLP1,PLP1 TCEAL3,TCEAL1 NA NA NA NA TCEAL1 874 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235155 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.82621420063998 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 115004721 115004876 115004807 Y NA NA NA NA NA NA EEF1GP5 69590 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.944244800731406 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 128915135 128915622 128915382 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 NA NA NA NA NA ZDHHC9 60263 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1 ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 130013053 130013179 130013116 Y NA ENOX2 NA NA NA NA ENOX2 22029 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 130722581 130722843 130722721 Y NA NA NA NA NA NA MST4 432450 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 133282434 133282722 133282577 Y NA NA NA NA NA NA CCDC160 86355 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 1.53439780118854 chrX 133307362 133307774 133307418 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 61303 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chrX 133320992 133321049 133321007 Y NA CCDC160 NA NA NA NA CCDC160 48028 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 133374426 133374733 133374578 Y NA CCDC160 NA NA NA NA CCDC160 5349 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.354091800274277 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 148684727 148685116 148684922 Y NA TMEM185A NA NA NA NA TMEM185A 26452 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852 chrX 149737740 149738101 149737940 Y MTMR1,MTM1 MTM1 NA NA NA NA MTM1 2671 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.472122400365703 chrX 153084450 153084610 153084498 Y NA SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45 NA NA NA NA PDZD4 9410 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.118030600091426 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE SW-13 hg19 FANTOM5 0.236061200182852