chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	4067941	4068288	4068115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	253084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	4697251	4697504	4697378	Y	NA	AJAP1	NPHP4	IMR90	Hi-C	24141950	AJAP1	15288	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	4729528	4729775	4729656	Y	AJAP1	AJAP1	NA	NA	NA	NA	AJAP1	16736	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	6359789	6360186	6359999	Y	NPHP4,THAP3,THAP3	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	40754	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8173446	8173525	8173493	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	89078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	113720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	117846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	103496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	9504221	9504505	9504342	Y	SPSB1	NA	SPSB1,H6PD,MIR34A,SLC25A33,TMEM201,PIK3CD	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	93036	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	9856786	9856983	9856885	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	25601	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	11410602	11410834	11410718	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	79339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	12406013	12406127	12406056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	117889	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	12546528	12546819	12546674	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	128918	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	12717632	12717976	12717808	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	41895	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	13917058	13917313	13917229	Y	PRDM2,PDPN	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	107380	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	69226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	TMEM82,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	16292565	16293101	16292653	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	7526	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	NA	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSG1	58979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.00324214150838
chr1	19283819	19283997	19283911	Y	NA	IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	2639	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	19699727	19700097	19699843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	62907	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	19778785	19779174	19779108	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	30892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	21664947	21665143	21665070	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	4854	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	23977708	23977880	23977794	Y	NA	RPL11	NA	NA	NA	NA	RPL11	38389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	24581337	24581604	24581474	Y	NA	NA	MYOM3,GRHL3,C1orf201,RCAN3,NIPAL3,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL3	62208	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	GRHL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	36521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	25095502	25095845	25095665	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	25654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	25292573	25292807	25292707	Y	SYF2,C1orf63,RUNX3	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC4	222725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	26634832	26635080	26634851	Y	NA	SH3BGRL3,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	UBXN11	7774	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	26677301	26677628	26677413	Y	CATSPER4,ZNF683	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	993	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS6KA1	26383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	27112764	27112917	27112859	Y	WDTC1,SLC9A1,ZNF683,RPS6KA1,ZDHHC18,ARID1A	PIGV,ZDHHC18	NA	NA	NA	NA	PIGV	801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	27244420	27244792	27244551	Y	NA	GPN2,NUDC,GPATCH3,C1orf172	NA	NA	NA	NA	GPATCH3	19463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	28189568	28190269	28189912	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	34279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	28238886	28239222	28239086	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	RPA2	35	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	29517304	29517322	29517313	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	10805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr1	31944306	31944695	31944578	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63894	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	63068	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33433896	33434020	33433958	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	5610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33457914	33458607	33458311	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29628	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	34628613	34629024	34628705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJB5	589624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	59995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	36592352	36592554	36592389	Y	NA	ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	TRAPPC3	20544	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	38308355	38308564	38308401	Y	ZC3H12A,SNIP1,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	14728	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	39193613	39193736	39193672	Y	NA	RP11-334L9.1	NA	NA	NA	NA	RP11-334L9.1	21010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	39286039	39286251	39286145	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4	NA	NA	NA	NA	RRAGC	37244	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	39607620	39607869	39607817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	62632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	40860574	40860824	40860661	Y	NFYC,NFYC,CAP1,PPT1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP2	52052	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	156237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	50653	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	44941668	44941887	44941849	Y	C1orf228,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	72802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	15049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	46639254	46639547	46639393	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	509	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	47055088	47055141	47055115	Y	NA	MKNK1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	25374	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	109837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	52110368	52110491	52110430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	69517	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	53403571	53403705	53403636	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	SCP2	12670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	54875187	54875373	54875227	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	1779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	55677745	55677788	55677767	Y	NA	USP24	NA	NA	NA	NA	USP24	998	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	60209079	60209290	60209185	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	69168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	62605206	62605403	62605332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L1TD1	53100	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	6.6720702358473
chr1	62726098	62726337	62726314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	56748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	65549780	65550082	65549919	Y	JAK1,LEPROT,LEPROT,LEPR	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	18360	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	66709580	66709765	66709653	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	678805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	66800202	66800555	66800228	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	588015	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	67494221	67494361	67494358	Y	SLC35D1,MIER1	SLC35D1	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	23421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	68647153	68647165	68647159	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	49638	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	69328818	69329064	69328941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	367914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	69441381	69441536	69441435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	480477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	39652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	73859450	73859778	73859467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	290975	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	75694572	75694736	75694622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	493300	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	388957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	78703686	78703842	78703764	Y	NEXN	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	260827	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	772913	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	79668598	79668618	79668608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	1225739	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	81240939	81241123	81241017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	944255	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	81344955	81344988	81344971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	840390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	82798183	82798427	82798305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	612805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	83153203	83153587	83153396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	967825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	83288583	83288596	83288590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	1103205	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	84083536	84083914	84083802	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	457831	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	84896355	84896549	84896476	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	RPF1	46393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	85046655	85046705	85046680	Y	NA	CTBS	CTBS	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CTBS	8492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	85411395	85411772	85411584	Y	NA	MCOLN2	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	49024	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	89339924	89340210	89340169	Y	PKN2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	15417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	90751537	90751564	90751551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	292866	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	92255921	92256250	92256086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	113642	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182409	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	65397	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA4	56757	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr1	94557832	94558157	94557998	Y	NA	ABCA4	NA	NA	NA	NA	ABCA4	26531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94560274	94560395	94560335	Y	NA	ABCA4	NA	NA	NA	NA	ABCA4	24293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94581772	94581927	94581850	Y	NA	ABCA4	NA	NA	NA	NA	ABCA4	2761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	NA	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	54183	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	95464838	95464926	95464881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	71575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	96502437	96502585	96502484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	407901	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	101774729	101775525	101775307	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	DPH5	285085	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	103424078	103424427	103424253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	641886	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	273605	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	108634261	108634637	108634400	Y	NA	NA	VAV3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A24	106834	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	110360957	110361372	110361052	Y	NA	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	78573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	110537379	110537528	110537454	Y	GSTM5,AHCYL1	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	12071	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	111188051	111188448	111188135	Y	LRIF1,CD53	NA	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	CD53	225327	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	111745467	111745610	111745539	Y	CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	310	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	111764327	111764759	111764457	Y	CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	DENND2D	C1orf88,DRAM2,CEPT1,RAP1A,CHI3L2,WDR77	IMR90	Hi-C	24141950	DENND2D	19170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	112015702	112015900	112015801	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	25704	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	113046545	113046667	113046606	Y	WNT2B	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	109742	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	113086746	113087141	113086830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	72654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	114576701	114577036	114576869	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	OLFML3	56638	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	114997819	114998047	114997990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	53734	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	115615204	115615232	115615217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGF	263625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	116192575	116192950	116192828	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	10001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	1070	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	183723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNU1-92P	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-92P	9471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	13108	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	SF3B4	33719	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	S100A6	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	154728745	154728994	154728977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	130270	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	155568911	155569221	155569066	Y	ASH1L	ASH1L,RP11-29H23.6	FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-29H23.6	9858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	157373072	157373269	157373181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	266806	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	158294240	158294398	158294321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	333177	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	NCSTN,COPA,VANGL2	NA	NA	NA	NA	COPA	21158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	30441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160767869	160768231	160767963	Y	SLAMF6,CD48,USF1,TSTD1,PPOX,ARHGAP30,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	60832	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	162370681	162370944	162370765	Y	SH2D1B	C1orf226	NA	NA	NA	NA	C1orf226	35983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	162458137	162458480	162458371	Y	NOS1AP,NOS1AP	UHMK1	NOS1AP,ATF6,C1orf226,SH2D1B,DDR2	IMR90	Hi-C	24141950	UHMK1	6561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	163588435	163588629	163588532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUF2	354069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	164174347	164174632	164174490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	149372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	164389251	164389388	164389267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	65247	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	166989020	166989359	166989155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-277B15.1	140715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	167461792	167462175	167462164	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	58829	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	167722412	167722527	167722511	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	33983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	168251156	168251300	168251228	Y	NA	TBX19	NA	NA	NA	NA	TBX19	2878	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	168382983	168383105	168383068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	134705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	168440429	168440721	168440575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	192151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	C1orf105,PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	172727569	172727695	172727632	Y	NA	NA	LOC100506023,PRDX6,RC3H1,TNFSF4,CENPL,DARS2,ZBTB37	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	316339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	172735732	172735977	172735894	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,CENPL,DARS2,ZBTB37,PRDX6,SLC9A11,LOC730159,ANKRD45,KLHL20	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	324502	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	172814602	172814764	172814686	Y	TNFSF4	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	403372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	SERPINC1	NA	NA	NA	NA	SERPINC1	25224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	175548819	175548945	175548926	Y	TNR	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	340166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	176244494	176244887	176244692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	69710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	177903071	177903284	177903119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	157580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	244190	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	178414274	178414285	178414280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	278015	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	180494187	180494417	180494302	Y	NA	ACBD6	XPR1,MR1,KIAA1614,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	24098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	181096103	181096331	181096188	Y	NA	IER5	KIAA1614,IER5,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	40465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	182168169	182168391	182168280	Y	NA	NA	CACNA1E	IMR90	Hi-C	24141950	GLUL	190950	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	182654224	182654561	182654393	Y	NA	NA	RGS8	IMR90	Hi-C	24141950	RGS16	82681	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	182682922	182683008	182682965	Y	DHX9	NA	RGS8,RNASEL	IMR90	Hi-C	24141950	RGS16	111379	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	183578502	183578873	183578650	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	24019	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	183811794	183811833	183811814	Y	NCF2,NCF2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	206978	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	183846576	183846867	183846649	Y	NMNAT2,RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	171944	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	184129300	184129941	184129508	Y	NA	NA	C1orf21	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	110489	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	184161714	184161954	184161834	Y	NA	NA	C1orf21	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	142903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	185308384	185308771	185308525	Y	FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	23923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	186052629	186052877	186052681	Y	HMCN1,PDC	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	289948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	186090860	186091020	186090873	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	251805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	186623829	186624230	186624111	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	280939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	186947742	186948198	186947923	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	604852	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	187677375	187677585	187677480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	1334485	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	193226500	193227132	193226836	Y	RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	137353	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	194724030	194724097	194724064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	1634883	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	733835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53	NA	NA	NA	NA	C1orf53	38520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	200068069	200068443	200068256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	308741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	200338364	200338762	200338563	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	38422	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	26357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136965	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	201639932	201640262	201640169	Y	PTPN7	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	156007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	17076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	28811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	202823240	202823502	202823372	Y	NA	KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF	PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-480I12.5	5246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	203061576	203061925	203061715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIA4	67950	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	203541292	203541507	203541407	Y	NA	NA	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	52182	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	89056	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	20577	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	204435094	204435487	204435401	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	26365	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	204675739	204675945	204675909	Y	NA	NA	LRRN2,NFASC	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MDM4	192228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK18	61145	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK18	53541	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK18	50434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	207025140	207025456	207025298	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL19	NA	IL20	IMR90	Hi-C	24141950	MAPKAPK2	168851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	207585605	207585767	207585684	Y	CR2	CR2	C4BPA,PFKFB2,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	39808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	207823430	207823599	207823565	Y	CR1L	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	99803	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	208387951	208388224	208388088	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	27441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	209538127	209538433	209538258	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR205HG	61732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	209557331	209557442	209557421	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	42723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	209577571	209577627	209577601	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	22538	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	211780151	211780642	211780410	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1	K562	ChIA-PET	22265404	SLC30A1	30067	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	215164018	215164287	215164098	Y	NA	NA	KCNK2,CENPF,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	121941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	216826283	216826325	216826308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	482772	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	217105953	217106090	217106023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	203007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	218757146	218757164	218757156	Y	NA	NA	LOC728463,RRP15,TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	300517	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	220393912	220394294	220394186	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	30618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	221143804	221143903	221143854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	185703	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	221612801	221613016	221612980	Y	DUSP10,DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	MARC1	654700	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	221869897	221870257	221870077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-378J18.3	890910	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-378J18.3	844568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	223892678	223892997	223892836	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	5383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	10.4529100361608
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	226366367	226366621	226366494	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	5810	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	226592689	226592838	226592760	Y	PSEN2,PARP1	PARP1,RP11-118H4.1	NA	NA	NA	NA	PARP1	942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	226841860	226842030	226841923	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf95	107359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf95	156364	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr1	228633222	228633907	228633608	Y	TRIM11,TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9653	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr1	228634060	228634141	228634103	Y	TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9419	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.33927725943203
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	228913817	228914177	228914048	Y	RHOU	RHOU	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	44993	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	228917012	228917506	228917078	Y	RHOU	RHOU	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	48188	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr1	228945464	228945740	228945561	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	76640	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	228973832	228974198	228974019	Y	RHOU	NA	RHOU,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	105008	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	229294087	229294570	229294323	Y	RHOU	NA	RHOU,RAB4A,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	65435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	229296726	229296995	229296861	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	68074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr1	229527864	229528146	229528005	Y	NA	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	NUP133	113957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	229546837	229547142	229546975	Y	C1orf96,ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	94961	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	230887462	230887658	230887571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	111227	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	232671774	232671885	232671830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-74P	294048	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	10.0081053537709
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	234001133	234001179	234001156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	253383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	234471096	234471421	234471259	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	19466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	234559176	234559516	234559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	51837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	234669721	234669929	234669823	Y	NA	NA	LOC100506795	K562	ChIA-PET	22265404	TARBP1	56872	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	TOMM20	103302	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	236764383	236764568	236764551	Y	NA	HEATR1	NA	NA	NA	NA	HEATR1	1236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	237207715	237208218	237207860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	251105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	237509665	237509877	237509771	Y	RYR2	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	553055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	238817061	238817213	238817137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	1514242	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	241775803	241776227	241776010	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	21005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr1	242068662	242068804	242068733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXO1	59393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3C	52027	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	244354917	244355201	244355058	Y	ZNF238,ZNF238	NA	AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	258235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	245057262	245057513	245057307	Y	NA	HNRNPU-AS1,HNRNPU	EFCAB2,HNRNPU,C1orf101,COX20,SMYD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPU	31418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	245544255	245544624	245544440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	227968	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	246749077	246749442	246749258	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	21331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	1241708	1242051	1241875	Y	NA	LINC00200	NA	NA	NA	NA	LINC00200	38000	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3526849	3527147	3526890	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	298326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3528683	3528786	3528735	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	296687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3938329	3938538	3938435	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	112856	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3948614	3948936	3948805	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	123141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	162525	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	4034997	4035363	4035214	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	209524	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	5528772	5529321	5529050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	76258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	78123	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.4480468238982
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	83121	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.56167960062694
chr10	5553514	5553674	5553594	Y	NA	NA	FAM208B,NET1,CALML3,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	101000	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.4	80389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	6075776	6076312	6076144	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	52638	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	6116806	6117095	6116962	Y	IL2RA,RBM17,RBM17	RBM17	IL2RA,LOC399715,RBM17	IMR90	Hi-C	24141950	RBM17	11855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	6836289	6836715	6836468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	651408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	123471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	7583796	7584039	7583868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	122922	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8088862	8088888	8088874	Y	ITIH5,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	2616	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	8103293	8103465	8103334	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	9726	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	10052	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8145104	8145382	8145246	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	51537	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	8323100	8323293	8323190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	229533	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	314604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	8446683	8447080	8446823	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	353116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8449374	8449568	8449443	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	355807	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	8899367	8899664	8899620	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	805800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	10914098	10914350	10914196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	737403	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	12823373	12823670	12823432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	315779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN,CCDC3	NA	NA	NA	NA	CCDC3	3289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	13747807	13748143	13748006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	120880	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	14099317	14099548	14099433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	402593	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	14217181	14217543	14217379	Y	FRMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	284598	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	14446040	14446232	14446114	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	55909	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	14458446	14458565	14458455	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A,MIR1265,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	43576	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	14697070	14697400	14697259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	117496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	15306901	15307170	15307036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	98209	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	15575568	15575839	15575704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM171A1	164507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	17429922	17430093	17430002	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	2987	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	20115618	20116154	20115807	Y	PLXDC2	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	12450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	21716825	21717072	21716945	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	104022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	22265792	22265961	22265887	Y	NA	DNAJC1	NA	NA	NA	NA	DNAJC1	24737	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	2418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	24523625	24523951	24523689	Y	KIAA1217	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	486646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	24745312	24745555	24745448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	265042	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	25733571	25733934	25733774	Y	GPR158	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	429984	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	25975342	25975493	25975374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	671755	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	26770961	26771542	26771263	Y	APBB1IP,ABI1	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	45829	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29184035	29184352	29184192	Y	BAMBI	NA	LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	219764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29402195	29402366	29402340	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	293965	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29586238	29586541	29586376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	109790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29966336	29966345	29966343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	270005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	29978009	29978233	29978173	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	281678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	305875	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	30347334	30347749	30347345	Y	KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	54674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	30420005	30420278	30420142	Y	NA	KIAA1462	MTPAP	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	17582	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	35195075	35195256	35195166	Y	NA	SS18L2P1	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	32937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	35258130	35258295	35258186	Y	CREM,CREM	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	95992	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	42400063	42400397	42400233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00839	568594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	787592	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	859888	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	47093518	47093811	47093665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872870	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	893194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	48483912	48484204	48484137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF488	130888	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	48591812	48592143	48591972	Y	ZNF488	NA	SYT15	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	238788	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	49564940	49565014	49564977	Y	NA	NA	ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	52242	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	49598208	49598504	49598305	Y	NA	NA	MAPK8,ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	85510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	50392979	50393162	50393101	Y	NA	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	1468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	NA	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM21A	212192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21A	256303	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	54463812	54464030	54463937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1006457	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	54471417	54471775	54471523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1014062	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	54737961	54738286	54738123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1280606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	54774491	54774616	54774570	Y	MBL2	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1317136	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	728672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	63747685	63748213	63747937	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	88626	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	64441011	64441399	64441189	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	121117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	64875678	64875783	64875732	Y	NA	NRBF2	ZNF365,ADO,NRBF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRBF2	15267	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	65404259	65404424	65404342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	125136	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	68690818	68690961	68690956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	951466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	69040041	69040437	69040395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	601990	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	69466144	69466519	69466384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	175908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	71228522	71228843	71228683	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	19293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	71769073	71769400	71769235	Y	NA	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	41152	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	72082681	72083053	72082867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	79082	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	CDH23	30336	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	73398011	73398245	73398040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	133010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	73790594	73790943	73790840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAP	181468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	73946489	73946835	73946688	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	26952	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	74323187	74323566	74323386	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	60333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	74917588	74917679	74917634	Y	NA	NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	8245	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr10	79596032	79596523	79596221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	87855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	79731077	79731252	79731165	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46699	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	330741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	82245417	82245911	82245608	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	33495	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	85720473	85720520	85720497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	176676	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	86363925	86364033	86363979	Y	NA	RPS3AP5	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	45726	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	89802399	89802689	89802412	Y	NA	NA	RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	99140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	91056148	91056487	91056304	Y	FAS,IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	NA	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT6P	63564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	95201631	95201931	95201645	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	38143	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	95513454	95513618	95513536	Y	FRA10AC1,LGI1	NA	LGI1,O3FAR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FRA10AC1	53125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	97302511	97302656	97302624	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	16515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	TCTN3	188354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	97687985	97688127	97688056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD1-AS1	159868	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	98032542	98032692	98032630	Y	ZNF518A,BLNK	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF518A	145070	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	98044443	98044614	98044529	Y	CC2D2B	NA	LOC728558,CC2D2B,DNTT,BLNK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF518A	156971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	98468328	98468564	98468493	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	RPL13AP5	39481	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	92115	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	225493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	105466638	105466810	105466737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	209153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114570405	114570790	114570582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25C19.3	134827	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114594508	114594817	114594706	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	113192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114745782	114746117	114745950	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	37773	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	114940720	114940897	114940795	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	115251940	115252325	115252226	Y	NA	NA	GUCY2GP,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	184617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	169474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	122836934	122837187	122837105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	54050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	125188443	125188580	125188505	Y	C10orf88	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	276650	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	126354654	126355022	126354738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	75816	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	126382372	126382711	126382460	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	48127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	127822846	127823186	127823128	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	239738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr10	133836748	133836839	133836756	Y	STK32C,DPYSL4,JAKMIP3	BNIP3	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	43313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	133873763	133873900	133873849	Y	JAKMIP3	NA	BNIP3	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	80328	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134225356	134225596	134225555	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	16684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134352832	134353219	134353024	Y	NA	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	3508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134358302	134358585	134358462	Y	PWWP2B,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	8978	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134364689	134365427	134365071	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	15365	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	TTC40	72615	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	655302	655449	655380	Y	SIRT3,NLRP6,CDHR5,CHID1	IRF7,EPS8L2,TMEM80,DEAF1	NA	NA	NA	NA	EPS8L2	36989	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	738048	738285	738171	Y	PKP3,SIGIRR	EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5	NA	NA	NA	NA	TALDO1	7044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	2213244	2213359	2213302	Y	NA	IGF2	NA	NA	NA	NA	IGF2	44411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	2238430	2238670	2238577	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	ASCL2	51512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	6290237	6290402	6290320	Y	NA	FAM160A2,CCKBR,PRKCDBP	NA	NA	NA	NA	CCKBR	11271	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	7600846	7601278	7601083	Y	NA	NA	CYB5R2	IMR90	Hi-C	24141950	PPFIBP2	68317	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	7624372	7624649	7624458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	71804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	7636630	7636941	7636786	Y	PPFIBP2,OR5P3	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	59512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	9014981	9015367	9015174	Y	NA	TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	8229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	10063724	10063946	10063792	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	249808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	10525473	10525590	10525553	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5,EIF4G2	MTRNR2L8,RNF141	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	3133	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	12875265	12875499	12875382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	181296	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr11	16055828	16056182	16056005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	576497	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	17961947	17962284	17962116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	70425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	18646989	18647318	18647154	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	7020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	22956858	22957229	22957044	Y	NA	NA	LUZP2	IMR90	Hi-C	24141950	SVIP	107013	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	23079827	23079841	23079834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	229982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	126840	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	30144763	30144990	30144959	Y	MPPED2,C11orf46	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	1244397	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	31838721	31838861	31838791	Y	NA	RCN1	NA	NA	NA	NA	RCN1	6782	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	NA	NA	NA	NA	NA	ELF5	142227	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	35066599	35067152	35066916	Y	NA	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	APIP	130553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	NA	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM44	106674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	211883	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	46357390	46357755	46357681	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	DGKZ	4935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	47891173	47891544	47891408	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160	PTPRJ,FNBP4	IMR90	Hi-C	24141950	NUP160	23066	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	55197801	55197813	55197807	Y	SPRYD5,OR5D16,OR5W2,OR5L2,OR5D18,OR4A16,OR5D14,OR4S2,OR4P4,OR4C6,OR4C16,OR4C15,OR4C11	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-100N3.2	1304125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	57333685	57333973	57333758	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	41033	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	58942854	58942992	58942911	Y	OR4D6,OR5A2,OR5A1	FAM111A,DTX4	NA	NA	NA	NA	DTX4	5951	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	58967466	58967980	58967724	Y	OR4D6,PATL1,MPEG1	DTX4	NA	NA	NA	NA	DTX4	30563	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	60930012	60930347	60930224	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	47272	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	64205023	64205244	64205073	Y	CDC42BPG,RPS6KA4	NA	NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,PYGM	IMR90,K562,H1ESC,HELA,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	RPS6KA4	80403	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr11	64206746	64206963	64206855	Y	NA	NA	NRXN2,SLC22A12	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA4	82126	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	64987523	64987676	64987600	Y	NA	CAPN1,POLA2	NA	NA	NA	NA	POLA2	39557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.33765618867784
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	14950	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	66687548	66687652	66687598	Y	CARNS1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	36195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	67103841	67103862	67103852	Y	NA	ANKRD13D,SSH3,POLD4	NA	NA	NA	NA	POLD4	18581	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	68273880	68274272	68274031	Y	NA	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	47694	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	195423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	110169	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	71780398	71780482	71780403	Y	IL18BP,IL18BP	LRTOMT,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	8900	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72343411	72343720	72343689	Y	PDE2A	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	158924	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72487947	72488068	72488008	Y	NA	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	14576	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	74171904	74172163	74171977	Y	SPCS2,RNF169,C2CD3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	4611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	75270235	75270345	75270334	Y	NA	GDPD5,SERPINH1	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	756	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr11	75945169	75945568	75945242	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	25389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	77837663	77837947	77837805	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1	NA	NA	NA	NA	ALG8	10759	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	9.34089833018622
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr11	78029499	78029864	78029682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	97530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	78089939	78090271	78090187	Y	GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	37123	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	78131805	78132171	78132034	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	4411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	78134473	78134617	78134544	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	7079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	79149040	79149340	79149145	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	865121	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	82418428	82418611	82418439	Y	FAM181B	RP11-742N3.1,FAM181B	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	19857	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	85874366	85874506	85874420	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	EED	79080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	86792626	86792948	86792684	Y	NA	TMEM135	NA	NA	NA	NA	TMEM135	45740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	87776599	87776699	87776649	Y	NA	NA	GRM5,CTSC	IMR90	Hi-C	24141950	RAB38	129936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	93227642	93227915	93227778	Y	NA	RP11-288E14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-288E14.2	38719	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	94383983	94384336	94384252	Y	NA	NA	AMOTL1	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	53261	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	95838694	95838939	95838802	Y	FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	182215	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	96001743	96002080	96001866	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	72264	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	102798566	102798847	102798707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	162097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP4	223325	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CASP4	252725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	108417188	108417527	108417358	Y	NA	EXPH5	NA	NA	NA	NA	EXPH5	44938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	108519095	108519272	108519184	Y	NA	DDX10	ATM,ACAT1,NPAT	IMR90	Hi-C	24141950	DDX10	14480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	108741188	108741366	108741295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	207436	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	112941331	112941794	112941502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	111334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	201112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	114377967	114377980	114377974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO2	69859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	115795812	115796179	115795995	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	422137	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	115927374	115927450	115927387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	553699	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	116458442	116458607	116458525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	183097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF259	133906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	145469	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.33927725943203
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	119664135	119664331	119664233	Y	NA	NA	TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	66341	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	122059856	122060218	122060121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	464165	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	122940079	122940521	122940200	Y	NA	RPL34P23,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	8141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	123077641	123077822	123077735	Y	NA	CLMP	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	13652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr11	123173564	123173848	123173613	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	109575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	123327975	123328380	123328056	Y	NA	NA	CLMP,HSPA8	IMR90	Hi-C	24141950	SCN3B	195572	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	123613702	123613859	123613783	Y	OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	3319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	124458771	124459153	124459140	Y	OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1	NA	NA	NA	NA	TBRG1	31579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr11	126566153	126566254	126566159	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	342618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	1444786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	128590332	128590660	128590581	Y	ETS1,FLI1,FLI1	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	1172825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	835517	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr11	134688539	134688830	134688760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLB1L2	488771	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1261364	1261638	1261529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	163689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	293074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1428527	1428661	1428594	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	272670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	189971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	1876861	1877254	1877034	Y	NA	RPS4XP14	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	11684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	2307539	2307834	2307597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	195838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	2724856	2725100	2724978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX3P4	176361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	3180278	3180396	3180348	Y	NA	TSPAN9	TSPAN9	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN9	4125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	3700577	3700596	3700587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	171389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6178640	6178845	6178761	Y	TNFRSF1A	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	125242	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6278115	6278307	6278240	Y	TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	28574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6288535	6288780	6288632	Y	CD9,VWF	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	18101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6332021	6332332	6332117	Y	LPAR5	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	25140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,NOP2	NA	NA	NA	NA	NOP2	12114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	7040569	7040832	7040702	Y	NA	SPSB2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	8943	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr12	7978463	7978836	7978682	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	62908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8119309	8119505	8119404	Y	CLEC6A,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC2A3	32438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.11687491823712
chr12	8136037	8136329	8136183	Y	NA	SLC2A3,FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXJ2	46970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	8969039	8969453	8969246	Y	NA	NA	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	95039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	10281058	10281708	10281406	Y	CD69,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,OLR1,CLEC7A	CLEC1A,CLEC7A,OLR1	NA	NA	NA	NA	CLEC7A	201	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	11486966	11487331	11487130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	164794	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	11838255	11838510	11838381	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	37467	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	11884596	11884909	11884601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	83808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	150199	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	12532834	12533375	12533099	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,BCL2L14,LOH12CR1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	24821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	12545388	12545784	12545562	Y	DUSP16,CDKN1B,APOLD1,LOH12CR1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	37375	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	12605511	12605890	12605533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	97498	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	13347729	13348002	13347866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	152511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	180920	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	15409824	15410065	15409954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	297162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	19534179	19534194	19534187	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	20785	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	19557871	19558201	19558036	Y	NA	AEBP2	AEBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	2892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	19932429	19932596	19932501	Y	NA	RP11-405A12.2	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.2	6044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	24532352	24532504	24532427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	567889	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	24770497	24770857	24770809	Y	NA	NA	SOX5,MIR920,BCAT1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAT1	329536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	24861258	24861655	24861631	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	238738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	25151034	25151427	25151311	Y	LRMP,C12orf77	RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	32596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	25537800	25538060	25537930	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	135930	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	26440996	26441185	26441046	Y	NA	NA	BHLHE41,ITPR2,SSPN	IMR90	Hi-C	24141950	BHLHE41	164936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	26626326	26626794	26626426	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	350266	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	29360104	29360380	29360183	Y	NA	NA	FAR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	60068	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	30575373	30575740	30575557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	271180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	31523933	31524084	31523973	Y	DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	45941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	31909925	31910440	31910295	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	29817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	32059556	32059920	32059668	Y	AMN1,H3F3C,C12orf35	RP11-428G5.2	AMN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-428G5.2	39348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	46571353	46571525	46571439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	90275	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A4	250232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	49203713	49203966	49203840	Y	NA	ADCY6,CACNB3,DDX23	NA	NA	NA	NA	CACNB3	1611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	50936330	50936621	50936410	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	39562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	51322260	51322312	51322286	Y	DIP2B	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	7005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT6	100623	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	100565	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr12	52243040	52243117	52243080	Y	SCN8A,ACVRL1,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	100334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	52249721	52249808	52249784	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	93643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	NA	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	80143	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	52889322	52889458	52889391	Y	KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-641A6.9	251102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53368990	53369278	53369065	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	27252	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	13701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP7,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	54949338	54949510	54949424	Y	NA	PPP1R1A	NA	NA	NA	NA	PPP1R1A	30933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	6.44966789465239
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	57746067	57746152	57746110	Y	NA	NA	R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	76636	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,MARS	NA	NA	NA	NA	MARS	11561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	58094555	58094631	58094593	Y	NA	OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31	NA	NA	NA	NA	OS9	8817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	62680768	62680820	62680794	Y	NA	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	28649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	75708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	63091878	63091979	63091882	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	97346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	65528086	65528453	65528315	Y	NA	LEMD3	WIF1,TBC1D30,LEMD3,FLJ41278	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD3	32898	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	66034360	66034755	66034412	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-118B13.1	394260	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	66606907	66607172	66607042	Y	IRAK3	TMBIM4,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	19842	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	69316243	69316419	69316405	Y	RAP1B,CPM,CPM	CPM	NA	NA	NA	NA	CPM	46931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	69403025	69403359	69403177	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	39675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	69460304	69460567	69460397	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	96954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	71770650	71771010	71770955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFC3H1	288495	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	77005504	77005696	77005596	Y	OSBPL8	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	53915	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	77166025	77166335	77166180	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	10657	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	77670807	77670928	77670868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F7	213447	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	79566745	79567141	79566931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	515736	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	79608943	79609085	79609014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	473792	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	278360	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	157259	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	75556	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	82349340	82349900	82349591	Y	CCDC59	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	400684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	82362285	82362429	82362357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	388155	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	82468212	82468399	82468268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	282185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	83791458	83791842	83791650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	248348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr12	92955380	92955568	92955421	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	365539	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	97476361	97476644	97476503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	177360	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	99277133	99277249	99277231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	240214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	104274396	104274663	104274530	Y	NA	NT5DC3,HSP90B1	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	41421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr12	104999582	105000032	104999671	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	EID3	304065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	108727976	108728516	108728378	Y	SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	178446	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	111866764	111867021	111866784	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	25012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	116958826	116959052	116958939	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	LINC00173,MED13L,MIR4472-2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf49	214823	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	120486152	120486402	120486307	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	66904	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr12	122155083	122155323	122155204	Y	NA	MORN3,TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	6425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	19.793808366347
chr12	122952702	122952803	122952758	Y	CLIP1,HCAR1	CLIP1,ZCCHC8	LOC100507066,CLIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC8	30715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	123964050	123964332	123964151	Y	PITPNM2,RILPL1	RILPL2,SNRNP35	NA	NA	NA	NA	SNRNP35	23862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	183456	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	98406	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	124985154	124985447	124985301	Y	DHX37	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	64688	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125077156	125077714	125077510	Y	UBC	NCOR2	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	27021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125167246	125167625	125167326	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	117111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	128055090	128055285	128055188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	406418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr13	20986336	20986694	20986525	Y	GJB2,GJB6	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	111302	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	IL17D	NA	NA	NA	NA	IL17D	32564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	23458655	23458830	23458775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	189942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	23485782	23486124	23485811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	217069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	RP11-309I15.1	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-309I15.1	23257	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	26948386	26948578	26948482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK8	122110	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	27728821	27729155	27728988	Y	USP12	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	14878	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	27734553	27734882	27734861	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	9151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	29460778	29461116	29460949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTUS2	135632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	29631407	29631751	29631579	Y	NA	MTUS2	NA	NA	NA	NA	MTUS2	34659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	31371316	31371638	31371482	Y	NA	NA	ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USPL1	181486	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	31585731	31585921	31585826	Y	NA	NA	USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPH1	148604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	31623581	31623925	31623587	Y	NA	NA	TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HSPH1	110600	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	32719251	32719642	32719447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	167969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	194618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr13	38101314	38101456	38101387	Y	POSTN	NA	NA	NA	NA	NA	ALG5	528916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	41059784	41060179	41060032	Y	MRPS31,FOXO1	NA	TTL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS31	283130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	41202839	41203181	41203053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS31	140128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS31	113512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	42228867	42229175	42229114	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	345526	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC122	313581	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	170685	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	74402	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	49458465	49458772	49458590	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	89276	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	100338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	51243019	51243169	51243094	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	238645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	52505834	52506318	52505967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	77312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	60291553	60291921	60291728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	444200	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	66687218	66687393	66687306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2039074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	67633828	67634032	67633930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2985684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	69285358	69285440	69285385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	2961759	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	73118273	73118475	73118375	Y	PIBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	157356	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	73742042	73742346	73742194	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	21319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	945822	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	76967658	76967689	76967675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	490851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	77548213	77548408	77548323	Y	NA	RPL7P44,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	5643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr13	78427899	78428170	78428083	Y	NA	NA	EDNRB	IMR90	Hi-C	24141950	SLAIN1	157876	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	SLITRK1	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	26122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.44642575314401
chr13	91369763	91370108	91369936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	627966	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	91709082	91709307	91709247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	288767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	91863944	91864030	91864005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	134044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr13	94644641	94644702	94644672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	601809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	95925874	95926219	95926059	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	25468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	97143722	97143959	97143730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	439986	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	99629306	99629403	99629355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	107476	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	99974545	99974749	99974637	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	108533	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	102403781	102404089	102404035	Y	NALCN	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	336938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	103557671	103557972	103557679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	62477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	104663923	104664083	104664030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	1168729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr13	106777477	106777605	106777541	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	440907	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	109329023	109329148	109329088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	460296	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	AL162497.1	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL162497.1	45982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	208817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	110965035	110965206	110965124	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	7539	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	111044675	111045176	111044974	Y	COL4A1,COL4A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	87179	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	111464605	111464817	111464711	Y	NA	NA	ING1,CARS2,CARKD,RAB20,ANKRD10,LINC00346,COL4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD10	100599	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	112729016	112729315	112729166	Y	SOX1	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	511166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	112816287	112816588	112816375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	423893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	106764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	MCF2L-AS1	23862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	113946276	113946648	113946334	Y	NA	LAMP1	LAMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LAMP1	2908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	114893588	114893901	114893716	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	2185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	114908513	114908833	114908657	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	12427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr13	114927536	114927629	114927597	Y	RASA3	RASA3	RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	31450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	NA	NA	NA	NA	NA	RNASE1	118316	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASE1	117743	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	23056506	23056666	23056661	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	24014427	24014724	24014635	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	8492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1G2	128484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	NA	PCK2	106942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	25164584	25164990	25164642	Y	TINF2,CIDEB,LTB4R,CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	CTSG	121118	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	25312812	25313037	25312925	Y	CMA1,CTSG,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	CTSG	269346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	959401	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	32477016	32477383	32477087	Y	NA	NA	NUBPL	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP5	65937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	33993605	33993755	33993680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	935807	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	34479811	34480147	34480032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	449415	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	34844314	34844466	34844419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	85096	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	45592379	45592731	45592576	Y	PRPF39	PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FKBP3	9791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	47843045	47843295	47843249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	174738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	50213261	50213687	50213459	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	18639	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	51992800	51993196	51992853	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	38982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NA	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	93107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	54640534	54640974	54640637	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	BMP4	217055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	57307919	57308194	57308095	Y	OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	425532	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	57424216	57424296	57424257	Y	OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	309430	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61803783	61804036	61803882	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	16247	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61811731	61812149	61812030	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	24195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61855306	61855686	61855500	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	67770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61937176	61937384	61937282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	149640	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61948602	61948733	61948613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	161066	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61960753	61960767	61960760	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	173217	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181585	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	65524481	65524844	65524562	Y	PLEKHG3	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	42569	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	69997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	65705173	65705467	65705275	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	137760	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	68005927	68006205	68006064	Y	MPP5,TMEM229B,PLEKHH1	TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	7471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	68420679	68421053	68420830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	136183	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	167180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	15840	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	69361596	69361764	69361692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	82393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	69400981	69401191	69401073	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	42966	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	69417007	69417266	69417043	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	26891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	70575518	70575625	70575572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-486O13.2	76215	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	70737226	70737562	70737394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A3	83439	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	71132254	71132379	71132336	Y	TTC9	TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	25750	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	73595262	73595380	73595321	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	5746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75033495	75033781	75033700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	74615	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75638580	75638649	75638615	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	TMED10	2685	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75719293	75719395	75719344	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-293M10.2	4719	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75750758	75751180	75750884	Y	PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	FOS	7281	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	75768536	75769006	75768683	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	9429	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	76076330	76076878	76076479	Y	BATF,FLVCR2,FLVCR2	FLVCR2,RP11-507E23.1,TTLL5,C14orf1	NA	NA	NA	NA	RP11-507E23.1	15781	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	117353	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	77444143	77444725	77444469	Y	NA	RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.1	11117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	TMEM63C	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	3216	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	77780620	77780713	77780667	Y	NA	GSTZ1,POMT2	NA	NA	NA	NA	GSTZ1,POMT2	4514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	79880226	79881040	79880569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	971060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	80241894	80242194	80242045	Y	DIO2	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	609906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	81220509	81220785	81220647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	203076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	81439745	81439770	81439758	Y	CEP128,TSHR	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	15884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	81484958	81485153	81484991	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	61097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2,RP11-299L17.3	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	85869762	85869890	85869826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	2588119	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	88428642	88428978	88428810	Y	GPR65	GALC	NA	NA	NA	NA	GALC	29031	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	89257931	89258017	89257974	Y	NA	EML5,TTC8	NA	NA	NA	NA	EML5	835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	89630928	89631154	89631021	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	342431	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	89933895	89934174	89934034	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	149319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	90083771	90084428	90084236	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	90975200	90975474	90975336	Y	NA	NA	LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CALM1	114354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91090658	91091172	91090732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	189651	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	112929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	93018523	93018873	93018560	Y	NA	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	40405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	93310569	93310815	93310655	Y	MOAP1,KIAA1409,C14orf142,C14orf109,C14orf109,BTBD7,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA5	51993	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	94808145	94809286	94808819	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	IFI27L2	213555	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	95677984	95678067	95678026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	55637	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	RP11-1070N10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.3	33663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG2B	88473	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	97875296	97875460	97875409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	613655	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	208740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	160315	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	128705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	100503802	100504130	100503983	Y	NA	NA	EVL,DEGS2,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	120370	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	100539339	100539601	100539490	Y	WARS,EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	84899	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	100545432	100545867	100545549	Y	YY1,EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	78633	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	12951	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	100900581	100900857	100900682	Y	WARS,WARS	RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	29645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	102050999	102051149	102051091	Y	NA	DIO3	NA	NA	NA	NA	DIO3	25311	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	102662808	102663069	102662945	Y	TECPR2,HSP90AA1,WDR20	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA1	58772	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.78083980031347
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	5331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	316486	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	2283754	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	20570096	20570220	20570180	Y	NA	NA	REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	2261175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	21925957	21925972	21925965	Y	OR4N4,OR4M2	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	905423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	26854717	26854952	26854835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	746400	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	27143884	27143956	27143920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	1035567	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	27668360	27668703	27668532	Y	GABRG3	NA	NA	NA	NA	NA	APBA2	1458926	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM189A1	161595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG5	230833	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	33742285	33742304	33742295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	587073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	525416	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	35989992	35990298	35990145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	711504	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	36897694	36898088	36897999	Y	C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	27882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	37047885	37048196	37047991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	60464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	38823791	38823961	38823868	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	31815	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	39593792	39594300	39594108	Y	THBS1	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THBS1	276980	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	39722195	39722553	39722498	Y	THBS1,C15orf54	NA	C15orf53,FSIP1,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THBS1	148727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40180090	40180249	40180216	Y	NA	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	44098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40365860	40366125	40365905	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	32968	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	PLCB2,C15orf52	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40781674	40781798	40781689	Y	BAHD1	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	20514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	40803219	40803626	40803467	Y	RHOV,BMF	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3,MGA	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	42091432	42091661	42091502	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	JMJD7,PLA2G4B	26622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	47659982	47660177	47660079	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	185684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr15	48033960	48034201	48034081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEF2	434513	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	49785048	49785439	49785238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	125738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	50890405	50890451	50890426	Y	USP8,SPPL2A,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	86561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51358266	51358334	51358300	Y	GLDN	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	37139	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51369900	51370046	51369953	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	25427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51385997	51386103	51386050	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	9370	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51515990	51516083	51516067	Y	SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	112724	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51535974	51536234	51536151	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	92573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	30192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51608963	51609320	51609267	Y	CYP19A1	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	19487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	51628727	51629122	51629096	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	52349753	52350120	52349937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEO1	87750	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr15	59144484	59144794	59144639	Y	LIPC	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	10580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	60547541	60548010	60547775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2	145072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-219B17.1	495550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	62042724	62043095	62042895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	307577	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	62949406	62949470	62949438	Y	LACTB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1069G10.1	224763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64043759	64043975	64043867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	80166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64166922	64167102	64167012	Y	NA	HERC1	DAPK2,HERC1	IMR90	Hi-C	24141950	HERC1	42781	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64310077	64310418	64310248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK2	51814	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64919514	64919887	64919625	Y	NA	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	36336	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	37654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	65135268	65135743	65135404	Y	TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	3180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	65189466	65189943	65189728	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	NA	SPG21	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHO2	57378	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr15	65403116	65403434	65403296	Y	ANKDD1A,PDCD7	PDCD7	UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD7	20740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4	178417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67287183	67287436	67287310	Y	NA	NA	SMAD3,IQCH,LOC100506686,SKOR1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	66665	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	85931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	67716264	67716618	67716446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	94788	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70006588	70006856	70006758	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	263465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70053152	70053574	70053296	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	310029	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70392397	70392607	70392502	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70435216	70435495	70435418	Y	TLE3	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	46701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	72265573	72265641	72265607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	138958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	31957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	74683456	74683642	74683549	Y	SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B	CYP11A1,SEMA7A	NA	NA	NA	NA	CYP11A1	25375	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	CYP11A1,SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr15	74943465	74943852	74943659	Y	NA	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	42781	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	75338663	75338960	75338803	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	75406798	75406983	75406894	Y	SIN3A,SIN3A,CLK3,CSK,C15orf39	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf39	79001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	76353098	76353448	76353273	Y	NA	NRG4	NA	NA	NA	NA	NRG4	2962	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	76658083	76658321	76658202	Y	NA	ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	31018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	78327089	78327489	78327356	Y	TBC1D2B	TBC1D2B	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	40577	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761I4.3	435623	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	82117732	82117868	82117800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFTUD1	435236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	82170277	82170527	82170385	Y	NA	NA	EFTUD1	IMR90	Hi-C	24141950	EFTUD1	382577	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	82340231	82340454	82340397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFTUD1	212650	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	83539816	83540191	83540033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHAMM	63436	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	83761220	83761490	83761347	Y	TM6SF1	BTBD1	BTBD1,MIR4515	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTBD1	27114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	83869144	83869263	83869183	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	SH3GL3	4170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr15	84256275	84256758	84256443	Y	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL3	142295	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	85516737	85517139	85516966	Y	NA	PDE8A	ALPK3,PDE8A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE8A	4532	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	85951741	85952026	85951782	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	29939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	86130202	86130404	86130208	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	205857	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	86846270	86846590	86846430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	510009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	87227426	87227675	87227551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	891165	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	88697338	88697352	88697347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK3	100647	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90517862	90518059	90517946	Y	AP3S2,SEMA4B,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	WDR93,ZNF710,IDH2,MESP1,C15orf38-AP3S2,CIB1,C15orf58,SEMA4B	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF710	24565	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	ZNF774,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	91373774	91374197	91373967	Y	IQGAP1,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	6757	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	7081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	91773472	91773865	91773669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC068831.10	209623	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	92497568	92497970	92497770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	102643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	93347056	93347810	93347183	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	93779330	93779873	93779589	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	148897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	93820840	93821077	93820958	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	190407	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	94749757	94750344	94749943	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	22423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	96807705	96807805	96807755	Y	NA	NA	LOC400456	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	59362	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	1490	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr15	97129304	97129480	97129390	Y	NA	NA	NR2F2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-522B15.3	233838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	NA	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SYNM	74859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	100040568	100040700	100040632	Y	MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	25198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr16	369599	369830	369715	Y	NA	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	30843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	381616	381944	381764	Y	NHLRC4,HAGHL,AXIN1	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	18729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	GNG13	10100	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	1179495	1179558	1179527	Y	NA	NA	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	SOX8	149687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	2737269	2737470	2737353	Y	NA	ERVK13-1,KCTD5	NA	NA	NA	NA	KCTD5	6793	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS30P	4601	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.44642575314401
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205	NA	NA	NA	NA	ZNF205	41802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	3309129	3309539	3309316	Y	MMP25,NAT15,NAT15,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV	ZNF200,ZNF263,ZNF75A,TIGD7	NA	NA	NA	NA	ZNF263	2204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	5085449	5085725	5085546	Y	NA	ALG1,NAGPA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	3307	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	6415499	6415992	6415721	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1269690	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	6420461	6420698	6420580	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1274652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	6423893	6424234	6424064	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1278084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	8232837	8233487	8232942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	480053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	10549193	10549271	10549232	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	123284	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	11306394	11306605	11306470	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1	RMI2,SOCS1	SOCS1,CLEC16A,RMI2,PRM3,PRM2,TNP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RMI2	34871	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11644813	11645143	11645061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	83094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A,BCAR4	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	BCAR4,RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	BCAR4,RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	12553349	12553483	12553416	Y	CPPED1,RUNDC2A	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	342391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	14396583	14397514	14397260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	233405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	15069619	15069687	15069631	Y	PDXDC1	PDXDC1	NA	NA	NA	NA	PDXDC1	3171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	158595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	15801967	15802265	15802154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDE1	66843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	15979661	15979785	15979715	Y	NA	FOPNL,RPL15P20	NA	NA	NA	NA	FOPNL	697	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	17265522	17265904	17265644	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	296834	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	17270464	17270719	17270563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	292019	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	17510902	17511071	17510985	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	51667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	19822629	19822921	19822772	Y	NA	NA	GPRC5B	IMR90	Hi-C	24141950	GPRC5B	72568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	21656930	21657029	21656972	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	NA	NA	NA	NA	NA	METTL9	50391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	22229382	22229580	22229448	Y	NA	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	13779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	22767811	22767852	22767832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P3	320775	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	23855109	23855743	23855120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	168132	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	26721789	26721801	26721795	Y	NA	NA	C16orf82	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	556314	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	28103790	28104177	28103984	Y	APOBR,XPO6,SBK1	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	117064	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	28169506	28169747	28169662	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	51494	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	28496890	28497119	28497100	Y	NA	APOBR,CLN3	NA	NA	NA	NA	APOBR	6851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	28545865	28546104	28546001	Y	EIF3CL,EIF3C,SULT1A1,SPNS1,APOBR,IL27	APOBR,CLN3,NUPR1,CCDC101	NA	NA	NA	NA	NUPR1	2391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	SPN,QPRT,C16orf54	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	BCL7C	18052	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	31264985	31265278	31265093	Y	STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM	NA	NA	NA	NA	NA	FUS	75554	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	34377841	34378195	34377988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2494762	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr16	34441880	34442279	34442062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2558801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	53865846	53866045	53865946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	129971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	55740914	55740956	55740934	Y	SLC6A2,SLC6A2	NA	NA	NA	NA	NA	CES1P1	51504	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	57518028	57518100	57518073	Y	DOK4	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	1139	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	58445622	58445902	58445848	Y	NA	NDRG4	NA	NA	NA	NA	NDRG4	48848	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	62714655	62714827	62714741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3725600	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	67150652	67150777	67150712	Y	LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70	C16orf70,FBXL8,TRADD,HSF4	NA	NA	NA	NA	C16orf70	8791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	67186810	67187094	67186952	Y	NA	C16orf70,FBXL8,TRADD,HSF4,NOL3,KIAA0895L,E2F4,ELMO3	NA	NA	NA	NA	FBXL8	4740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	53949	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr16	70427697	70427795	70427768	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	43345	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	70909910	70910012	70909961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	76846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	71046758	71046771	71046763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	213694	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125700	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	73031148	73031384	73031285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	60213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	75031065	75031181	75031127	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	137	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr16	78564720	78564924	78564822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	433410	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	79040745	79040971	79040807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	909435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	122048	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81392292	81392329	81392311	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	45735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81660645	81660993	81660973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	109709	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	81954337	81954551	81954444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDR42E1	88542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	82226148	82226756	82226513	Y	PLCG2,MPHOSPH6	MPHOSPH6	HSD17B2	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	24317	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	485308	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	83835897	83836084	83835978	Y	NA	HSBP1	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	3364	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr16	85387544	85387685	85387655	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	328169	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr16	85570517	85570742	85570617	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	150937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	85678973	85679150	85679027	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	42529	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	86541340	86541581	86541457	Y	FOXF1	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	45260	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	88544681	88544835	88544758	Y	ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	26956	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	88686245	88686708	88686493	Y	ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	28852	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	10.4529100361608
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	88839973	88840262	88840126	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	9357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	19.1266013427622
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	1107024	1107388	1107281	Y	NA	ABR	ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	22927	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	1134847	1135025	1134980	Y	WDR81,WDR81,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	ABR	ABR,CRK,YWHAE,INPP5K,LOC100306951,PITPNA,SCARF1,RILP	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	4532	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.89123043553383
chr17	1149347	1149718	1149533	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	19032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	1267059	1267122	1267091	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	34550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	2075592	2075724	2075696	Y	HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	128953	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	457619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	TRPV3	NA	NA	NA	NA	TRPV3	5583	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4081215	4081519	4081370	Y	UBE2G1,C17orf85,P2RX1,ATP2A3,ZZEF1	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	36753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	5243236	5243614	5243425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABEP1	59678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	5813088	5813344	5813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	139534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	6938707	6938851	6938779	Y	NA	RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	1313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	7236036	7236269	7236153	Y	POLR2A,ACAP1	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,ACAP1,KCTD11,TNK1	NA	NA	NA	NA	ACAP1	1579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.89285150628802
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8597334	8597547	8597441	Y	NA	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	65255	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	8600572	8600969	8600801	Y	MYH10	NA	MYH10,RPL26,RNF222	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	68493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8760227	8760351	8760304	Y	PIK3R5,PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	106678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8761203	8761507	8761409	Y	PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	105522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	8869986	8870720	8870441	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	2957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	233065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	9267283	9267598	9267441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	210310	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	9875435	9875567	9875515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	284512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	11874981	11875002	11874992	Y	DNAH9	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	ZNF18	23825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	13102362	13102729	13102546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAC2	182858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	13463603	13463645	13463626	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	39599	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	14206970	14207459	14207274	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	4570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	15225977	15226377	15226177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMP22	59334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	20755696	20755942	20755820	Y	NA	RP11-344E13.3,CCDC144NL	NA	NA	NA	NA	RP11-344E13.3	13804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	21360373	21360746	21360457	Y	NA	NA	USP22,MAP2K3,KCNJ12,C17orf51	IMR90	Hi-C	24141950	C17orf51	114976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	21908682	21908761	21908685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	432960	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	61.1606438286002
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.33765618867784
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr17	25793795	25793989	25793936	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	12125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	25813907	25813958	25813933	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	32237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr17	25891638	25891876	25891756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	109968	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.11525384748293
chr17	26578258	26578420	26578387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	90506	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27582372	27582571	27582447	Y	NA	NUFIP2	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	36565	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27766880	27767142	27766912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	51200	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	29115484	29115559	29115508	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	34235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	ADAP2,TEFM	NA	NA	NA	NA	ADAP2	18981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	119610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	29909272	29909544	29909457	Y	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	192630	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	32074096	32074264	32074180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM98	821168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	32349488	32349675	32349661	Y	ACCN1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	936874	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	32546346	32546705	32546474	Y	NA	NA	CCL2,CCL8,CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	739844	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	32726028	32726450	32726214	Y	CCL2,CCL7,CCL8,CCL1	NA	ACCN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	560099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	32979074	32979302	32979236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	307247	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12	NA	NA	NA	NA	SLFN12	29106	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	34327568	34327611	34327604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDM1	71791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	34445265	34445574	34445394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDM1	189488	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	35208602	35208822	35208707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	95353	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS7	65535	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	36721617	36722002	36721810	Y	ARHGAP23,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	38181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	36947324	36947688	36947677	Y	NA	PCGF2,PSMB3,PIP4K2B,CWC25,MIR4727	NA	NA	NA	NA	PIP4K2B	6691	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	38475638	38476939	38476599	Y	WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	12194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A	NA	NA	NA	NA	TOP2A	28874	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	38759098	38759390	38759213	Y	CCR7	CCR7,SMARCE1	KRT14,KRT42P,KRT26,KRT28,CCR7,TOP2A,IGFBP4,KRT33A,KRT33B	IMR90	Hi-C	24141950	CCR7	39374	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	39692337	39692600	39692431	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT19	KRT15,KRT19,KRT13,KRT36	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19	9777	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	39832714	39833014	39832798	Y	RAB5C,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1	EIF1,GAST	SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF1	10123	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	40517094	40517456	40517393	Y	NA	STAT3	NA	NA	NA	NA	STAT3	21130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.89123043553383
chr17	42347402	42347673	42347539	Y	UBTF,SLC4A1,SLC25A39	NA	NA	NA	NA	NA	UBTF	50408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	42416163	42416367	42416282	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	GRN	4247	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr17	45343380	45343597	45343479	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	MYL4	67568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	45797441	45797832	45797646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	72599	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	45953013	45953226	45953169	Y	NA	MRPL10,LRRC46,SCRN2,SP6,SP2	SCRN2,MRPL10,LRRC46,SP6,SP2,CDK5RAP3	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	18290	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	46767725	46768126	46768067	Y	NA	HOXB13	NA	NA	NA	NA	HOXB13	36414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	47960332	47960723	47960647	Y	NA	NA	DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,TAC4,FLJ45513,DLX4,PDK2,ITGA3,LOC284080	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DLX4	83611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	47966905	47967224	47967101	Y	DLX4,DLX3,TAC4	NA	LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLX4	77110	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	48421685	48421964	48421826	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1	NA	NA	NA	NA	XYLT2	232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	53047778	53047982	53047880	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	COX11	3632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	55456674	55456859	55456690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	125462	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	55938337	55938724	55938439	Y	SUPT4H1,CUEDC1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12920	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	55993641	55993992	55993778	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	36692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	56359005	56359460	56359241	Y	MPO	NA	NA	NA	NA	NA	MKS1	64039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	56441767	56441894	56441848	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	13313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	57932450	57932798	57932624	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	15823	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	57975372	57975465	57975395	Y	NA	TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	RPS6KB1	6925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	58475654	58476033	58475933	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	USP32,PPM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP32	21798	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	252614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	60256998	60257133	60257064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	253621	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	52970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	60938326	60938715	60938420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	235564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	61456495	61456666	61456581	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	65073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	62101615	62101802	62101721	Y	NA	C17orf72,ICAM2	NA	NA	NA	NA	ICAM2	5621	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	63550809	63551200	63551034	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	4565	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	65471645	65472025	65471701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	100070	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	65619223	65619512	65619368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	92437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66193656	66193741	66193699	Y	NA	AMZ2	NA	NA	NA	NA	AMZ2	47974	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	21088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	37556	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	66456929	66457226	66456998	Y	NA	WIPI1,PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	WIPI1	5275	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	68310261	68311057	68310836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	147447	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	69590205	69590225	69590215	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	24894	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	70878609	70878955	70878782	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	207896	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	70892078	70892260	70892135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	194591	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	70975015	70975329	70975170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	111522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	71286924	71287020	71286972	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	19294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	71476918	71477129	71477067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	161099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	34258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	99725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	73309965	73310187	73310156	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	3223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	73456096	73456218	73456157	Y	KIAA0195	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	20856	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	74186019	74186269	74186124	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	34618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3,RNF157	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF157	13768	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr17	74764385	74764732	74764559	Y	NA	JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	SRSF2	32929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	74993480	74993636	74993537	Y	NA	NA	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00338,SEC14L1	87162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	37940	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75386259	75386377	75386341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111608	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75422359	75422648	75422577	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	147708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75461366	75461740	75461543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	186715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75692874	75693017	75692949	Y	NA	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	221163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	39759	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	76361692	76362147	76361865	Y	NA	SOCS3,PGS1	PGS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	7534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	76649052	76649341	76649203	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	127038	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	76767876	76768189	76768026	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	8190	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	77840735	77840854	77840795	Y	NA	CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	29507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	78864265	78865139	78864341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	98259	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80183373	80183743	80183482	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	21450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP14	145162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr18	999057	999295	999176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	188510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	382273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	1503663	1503683	1503673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	693116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr18	2848392	2848824	2848619	Y	EMILIN2	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	3364	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	2888759	2889155	2888912	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	43731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	3798477	3798752	3798615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	388871	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	830894	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P27	565211	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr18	6187863	6188007	6187935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	273007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	6556939	6557309	6557113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	95925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	LAMA1	NA	NA	NA	NA	LAMA1	513	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA1	157741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	8689782	8689966	8689874	Y	NA	NA	NDUFV2,RAB12,CCDC165,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	82339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9082770	9083125	9082859	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2	ANKRD12,RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,PPP4R1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	17503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9094792	9095105	9094897	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDUFV2	5523	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	9643596	9643835	9643765	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	30358	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	9645725	9646120	9645908	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	32487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9849459	9849859	9849589	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	62140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	9856185	9856287	9856251	Y	RALBP1,PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	55712	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	11733869	11734165	11734017	Y	NA	NA	MPPE1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP1B	115230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	12839100	12839985	12839163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	87657	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	15197632	15197837	15197824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	1472970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	19759263	19759580	19759296	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	11859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	20291430	20291660	20291501	Y	NA	NA	GATA6,CABLES1	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	84564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	NPC1	172477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	25362505	25362612	25362523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	1127140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr18	28830890	28831119	28831005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSC2	150512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	33071303	33071471	33071398	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	4484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	43307603	43307620	43307613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	237620	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	43841732	43842044	43841747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	62728	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	46184656	46184773	46184715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	121239	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	46213796	46213995	46213850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	150379	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	48127515	48127723	48127619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKA1	228150	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME2	101604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	48737977	48738244	48738154	Y	ME2	MEX3C	MEX3C	K562	ChIA-PET	22265404	MEX3C	4430	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	51964164	51964175	51964170	Y	NA	NA	CCDC68	IMR90	Hi-C	24141950	POLI	170390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	53332836	53333181	53332979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	949745	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	54745075	54745213	54745144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	355704	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	55448232	55448442	55448350	Y	NA	ATP8B1	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	19891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	55929917	55930363	55930116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	220318	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	143017	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	127914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	56394566	56394962	56394680	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	57948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	57274287	57274609	57274551	Y	CCBE1	NA	NA	NA	NA	NA	CCBE1	88003	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr18	59371386	59371621	59371504	Y	NA	NA	RNF152	IMR90	Hi-C	24141950	RPL30P14	300948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	67612583	67612746	67612665	Y	CD226	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	258435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	67625128	67625312	67625237	Y	CD226	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	245869	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	67815165	67815405	67815286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	55776	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	68020113	68020138	68020126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	65976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr18	74089053	74089202	74089130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	115944	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	280798	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	75697384	75697771	75697683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1129514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	75803264	75803274	75803269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1024011	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	76403093	76403331	76403224	Y	ATP9B	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	423954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr18	77723013	77723575	77723504	Y	HSBP1L1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	452	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	954903	955312	954982	Y	KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	25862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	1895445	1895653	1895520	Y	OAZ1,DOT1L,CSNK1G2	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	BTBD2,CSNK1G2,KLF16	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAMP4	7560	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	2974450	2974580	2974523	Y	NFIC,TLE2,TLE2	ZNF77	NA	NA	NA	NA	ZNF77	31481	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	3222791	3223093	3222942	Y	NA	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	39230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	4063699	4063930	4063813	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	1013	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	28662	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	4677231	4677531	4677381	Y	NA	TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9	NA	NA	NA	NA	C19orf10	8849	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	4744883	4745173	4745028	Y	NA	DPP9,FEM1A	DPP9,UHRF1,MIR7-3HG,ARRDC5,PLIN3	IMR90	Hi-C	24141950	DPP9	22198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	5966194	5966581	5966386	Y	CAPS	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	9572	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	58264	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	10989126	10989500	10989238	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	8937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	10992105	10992492	10992295	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	11916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	NA	NA	NA	NA	NA	SPC24	61647	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	NA	NA	NA	NA	NA	SPC24	61306	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.33927725943203
chr19	14241315	14241555	14241521	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	4213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	15974006	15974442	15974280	Y	NA	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	36235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	15975239	15975290	15975265	Y	OR10H2,OR10H3	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	37468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	16229373	16229857	16229589	Y	NA	RAB8A	NA	NA	NA	NA	RAB8A	8934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	17866765	17867157	17866984	Y	NA	MAP1S,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	36480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18430446	18430898	18430653	Y	ARRDC2,IL12RB1,IFI30,LRRC25	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	1186	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	21153124	21153332	21153228	Y	NA	ZNF85,ZNF430	NA	NA	NA	NA	ZNF430	48094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	23425915	23426300	23426108	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	4892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	28151266	28151630	28151530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1550818	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	28798664	28798976	28798820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	903472	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	31969365	31969618	31969490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	864882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	32754044	32754196	32754068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	80304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	32842918	32843112	32843016	Y	ZNF507	ZNF507	NA	NA	NA	NA	ZNF507	8418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	34760936	34761338	34761013	Y	LSM14A,KIAA0355	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	17494	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	35812312	35812429	35812332	Y	HPN,LGI4,USF2,MAG,FFAR2,U2AF1L4,FFAR3,FFAR1	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	54431	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	36241217	36241384	36241301	Y	MAG,LRFN3	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	LIN37	3955	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr19	36863070	36863255	36863179	Y	NA	LINC00665,ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	4846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4,NCCRP1	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	39801345	39801461	39801375	Y	NA	SAMD4B	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	29575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	39810585	39810976	39810672	Y	CLC,LRFN1	SAMD4B	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	20060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	39849240	39849632	39849436	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36	MED29,PAF1	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD4B	18204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	40413949	40414284	40414119	Y	SUPT5H,SUPT5H	CTC-471F3.4	NA	NA	NA	NA	CTC-471F3.4	33350	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	40447509	40447978	40447857	Y	SERTAD1,ZNF546,FCGBP	PSMC4	LEUTX	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-471F3.4	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	40543471	40543758	40543711	Y	SPTBN4,ZNF546,ZNF780B	ZNF780B	NA	NA	NA	NA	ZNF780B	16358	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41170823	41170969	41170914	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	23908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	41849661	41849907	41849784	Y	HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	4909	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19	NA	NA	NA	NA	RPS19	17587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	41226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	44066872	44067293	44067141	Y	ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5	NA	NA	NA	NA	XRCC1	15332	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	44249305	44249426	44249352	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	7716	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	45224647	45224919	45224783	Y	CEACAM16,CLASRP	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	24043	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	46930732	46931099	46930913	Y	NA	CCDC8	CCDC8,LOC100506012	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC8	15891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	46975956	46976146	46976053	Y	NA	PNMAL2	NA	NA	NA	NA	PNMAL2	21609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	47299930	47299995	47299963	Y	NA	SLC1A5	FKRP,STRN4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A5	10079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHK2	68389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	49690208	49690571	49690516	Y	NA	HRC,TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	31210	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	50317454	50317522	50317488	Y	PTH2	AP2A1,FUZ,MED25,PTOV1	NA	NA	NA	NA	FUZ	1111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	51221435	51221859	51221691	Y	KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	SHANK1,CLEC11A	NA	NA	NA	NA	SHANK1	728	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48,KLK15	NA	NA	NA	NA	KLK15	786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	51465501	51465788	51465642	Y	SYT3,SYT3,LOC342918,ACPT,KLK14,IGLON5,ETFB,C19orf75,KLK4	KLK6,KLK8	NA	NA	NA	NA	KLK6	5141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	51909569	51909701	51909635	Y	NA	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	41897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR2	60512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	FPR2	NA	NA	NA	NA	FPR2	23463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52243692	52243874	52243842	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	FPR2	NA	NA	NA	NA	FPR2	9405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52292213	52292705	52292413	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR3,FPR1,FPR2	FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	12658	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52307277	52307570	52307532	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	1914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52323338	52323678	52323420	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	17975	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ERVV-2,ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	MIR526B,MIR519B	NA	NA	NA	NA	MIR526B	27421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3,NLRP12	NA	NA	NA	NA	AC008753.3	11697	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NLRP12,MYADM	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	MYADM	97766	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.00324214150838
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	54936601	54936866	54936734	Y	NA	TTYH1,LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	TTYH1	12208	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	56169893	56170373	56169939	Y	NA	ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	U2AF2	6381	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF671	18379	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	19719	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58781089	58781297	58781193	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	ZNF8	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF8	7021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	AC079779.4	109520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	857378	857399	857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	181939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	1115244	1115256	1115249	Y	SNTG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	439805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	31991	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	2686059	2686257	2686158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	693396	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	3508183	3508316	3508315	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	13191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	3699787	3700199	3700016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC11	59361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	5650103	5650571	5650382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX11	180228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	7520502	7520525	7520514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	464979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	8674863	8675482	8675139	Y	ID2	NA	LOC100506274,LINC00299,ID2,LOC339788	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	141493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	8676767	8677094	8676914	Y	NA	NA	LOC100506274,LINC00299,ID2,LOC339788	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	139881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	9955950	9956409	9956221	Y	TAF1B,GRHL1	TAF1B	RRM2,GRHL1,TAF1B,ODC1,ADAM17,CYS1,KLF11,HPCAL1,YWHAQ	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	25074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.22564448270329
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr2	10153127	10153217	10153171	Y	NA	KLF11	NA	NA	NA	NA	KLF11	27759	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr2	11094315	11094675	11094498	Y	C2orf50,KCNF1	KCNF1	FLJ33534,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	KCNF1	44252	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	11253048	11253286	11253167	Y	NA	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	40038	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	12466136	12466597	12466183	Y	TRIB2	NA	LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	388418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16052794	16053077	16052931	Y	NBAS	RP11-120J4.1,MYCN,MYCNOS	NA	NA	NA	NA	MYCN	25609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16054729	16054969	16054864	Y	NA	RP11-120J4.1,MYCN,MYCNOS	NA	NA	NA	NA	MYCN	23717	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16067860	16068250	16068057	Y	NA	MYCN,MYCNOS	NA	NA	NA	NA	MYCN	10436	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.11687491823712
chr2	16152892	16153059	16152979	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	72521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16421806	16421992	16421870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	341435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr2	16489272	16489649	16489463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	355950	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16493094	16493437	16493362	Y	MYCN	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	352162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	16827046	16827326	16827275	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	18273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	16837187	16837623	16837438	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	7976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	332509	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	23783139	23783161	23783150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	177051	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NA	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	131763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	27072631	27072808	27072721	Y	CCDC164,MAPRE3,DPYSL5	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	4016	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	27988549	27989353	27988873	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	3231	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr2	29026080	29026331	29026243	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	53574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	30211433	30211491	30211462	Y	NA	NA	ALK	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL5	156316	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	69638	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	38023099	38023324	38023154	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	59488	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	38099080	38099316	38099096	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT,PRKD3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	135469	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	38212559	38212760	38212660	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	243950	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	38405386	38405542	38405477	Y	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	51168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	39443973	39444333	39444109	Y	SOS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	94487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	39445610	39445829	39445673	Y	SOS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	96124	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	42245014	42245155	42245121	Y	PKDCC	PKDCC	LOC388942,C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	28005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	43150049	43150433	43150383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	114253	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	1038	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	43614262	43614508	43614389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	162514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	43666042	43666391	43666188	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	154794	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	43745392	43745589	43745491	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	K562	ChIA-PET	22265404	THADA	75596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	46662046	46662321	46662184	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,LOC388946,ATP6V1E2,RHOQ,PIGF,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1E2	105375	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	46689045	46689341	46689164	Y	TTC7A,MCFD2,RHOQ	NA	EPAS1,PRKCE,PIGF,CRIPT,ATP6V1E2,RHOQ,LOC388946,SOCS5,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP6V1E2	78355	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	46697283	46697543	46697390	Y	TTC7A,MCFD2,RHOQ	NA	PRKCE,RHOQ,PIGF,EPAS1,TTC7A,LOC388946,ATP6V1E2,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1E2	70153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	46797577	46797967	46797772	Y	NA	ATP6V1E2,CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	29881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	48584014	48584658	48584325	Y	FBXO11,FOXN2	FOXN2,RNU4-49P	NA	NA	NA	NA	RNU4-49P	18049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	35289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	56276359	56276680	56276532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	127085	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	752963	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	60661623	60661756	60661690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	319609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	201709	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	61428317	61428371	61428344	Y	USP34,AHSA2	AHSA2	NA	NA	NA	NA	AHSA2	25764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	63601034	63601048	63601041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	212695	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	8.22888662421167
chr2	64015274	64015563	64015419	Y	PELI1,UGP2	WDPCP	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	37414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64368431	64369198	64368837	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64439546	64439941	64439735	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	69958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64440103	64440511	64440295	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	70515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	65047032	65047202	65047180	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A	NA	SERTAD2,LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	70893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65166338	65166539	65166535	Y	NA	SLC1A4	LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A4	47072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	68994240	68994671	68994448	Y	FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	APLF	301547	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	69091781	69092116	69091950	Y	BMP10	NA	NA	NA	NA	NA	APLF	399088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	361580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	AAK1	NA	NA	NA	NA	AAK1	47083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	70226418	70226806	70226612	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1-AS1	22007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1-AS1	49081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr2	72849954	72850312	72850133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	200858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	72936183	72936496	72936380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	114674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	74153090	74153262	74153147	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	1137	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	75063027	75063135	75063034	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	3919	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	75498571	75498680	75498627	Y	NA	NA	TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	TACR1	73745	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	81430794	81430886	81430840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1042533	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	83744068	83744130	83744079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	941039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	85160217	85160224	85160221	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	29468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	85483180	85483288	85483234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	70260	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	86129642	86129982	86129887	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	15505	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	SNORD94,IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	SNORD94	27224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	88803075	88803473	88803273	Y	FOXI3,C2orf51	NA	C2orf51	IMR90	Hi-C	24141950	FOXI3	52944	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	97012594	97012961	97012778	Y	ASTL	SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	13069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	97565299	97565614	97565457	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	30805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99085276	99085461	99085369	Y	NA	INPP4A	COA5,UNC50	IMR90	Hi-C	24141950	INPP4A	25959	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99213145	99213306	99213215	Y	INPP4A	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	COA5	9672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99268200	99268767	99268592	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	45158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99287467	99287477	99287472	Y	CNGA3	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	58112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99307845	99308079	99307957	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	37510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99374660	99374852	99374788	Y	INPP4A,UNC50,MGAT4A	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	29071	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	99453667	99453923	99453920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	108078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	100124156	100124186	100124170	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	19659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	100685193	100685529	100685389	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	346589	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	124173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	101220085	101220198	101220126	Y	NA	PDCL3	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	PDCL3	42933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	102549846	102550051	102549852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	128953	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	103126279	103126523	103126442	Y	IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	107643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	103886134	103886446	103886290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018880.2	351642	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	105461382	105461873	105461636	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	190568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	105466558	105467231	105466773	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	185210	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	105664202	105664255	105664229	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	11761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	106490273	106490537	106490399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	130919	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	109229262	109229375	109229308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	80405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	111817819	111818113	111817910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	56842	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	20941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	114644100	114644364	114644199	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	115944602	115944633	115944617	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	27682	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	120041416	120041980	120041717	Y	DBI	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	62032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	120222602	120222796	120222714	Y	NA	TMEM37	NA	NA	NA	NA	TMEM37	37125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	126490577	126490865	126490721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC023347.1	573222	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	127840546	127840814	127840619	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	22117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	128165400	128165641	128165534	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	21359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	128266210	128266439	128266348	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	16023	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	128470034	128470252	128470136	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	13437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr2	128927207	128927481	128927321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT1	80433	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	261568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	133640372	133640755	133640626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	468225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	136933902	136934303	136934241	Y	UBXN4	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	192232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.67044916509311
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	144769205	144769351	144769311	Y	GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	318784	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	148279824	148280174	148279855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	285741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	148311228	148311623	148311426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	254292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	148388064	148388488	148388310	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	177427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	152735616	152735825	152735663	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	52610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	153309848	153310421	153310088	Y	CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	120097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	153354098	153354480	153354204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	164347	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	662369	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	158712267	158712700	158712451	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	17674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	158736746	158736790	158736768	Y	NA	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	6372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	159853491	159853713	159853657	Y	NA	TANC1	NA	NA	NA	NA	TANC1	30345	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	159994086	159994676	159994284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	146634	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	161141907	161142179	161141926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	120214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	161244338	161244737	161244615	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	17656	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	3839	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	163376672	163376691	163376681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	203322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	164553215	164553632	164553445	Y	NA	FIGN	NA	NA	NA	NA	FIGN	36890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	165801450	165801783	165801617	Y	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	103261	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	1046802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	169347125	169347251	169347173	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	36753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	174889919	174890381	174890067	Y	NA	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	61489	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr2	174896632	174897390	174896767	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1,CDCA7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	68202	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	176210828	176210945	176210887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G3	163493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,AC074286.1,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	179866335	179866441	179866388	Y	NA	CCDC141	NA	NA	NA	NA	CCDC141	46372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	180585338	180585678	180585637	Y	ZNF385B,ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	284162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	183897957	183897991	183897974	Y	NA	NCKAP1,DUSP19	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	3595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	187194208	187194220	187194214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	154663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	188347584	188347786	188347681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	80701	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	189957665	189957918	189957859	Y	COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	84687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	SLC40A1,ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC40A1	31433	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	NA	NA	NA	NA	NA	AC019178.2	63630	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBCH	130946	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	191861492	191861699	191861596	Y	STAT1	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5199	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	191876125	191876480	191876302	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	7206	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	191921929	191922344	191922217	Y	STAT4	STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	38243	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	192430419	192430599	192430542	Y	NA	NA	TMEFF2,OBFC2A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	322508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYO1B	392614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	437071	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	454645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	197069769	197070011	197069899	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	30542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	197350890	197351252	197351119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECW2	105164	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	HECW2,CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECW2	9764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	198105096	198105429	198105213	Y	ANKRD44	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	68468	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	200450287	200450618	200450446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	263278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	200912605	200912617	200912611	Y	NA	NA	SPATS2L,KCTD18	IMR90	Hi-C	24141950	TYW5	94146	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	201794314	201794594	201794537	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1	PPIL3,NIF3L1,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	31809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	201922447	201922672	201922559	Y	NA	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3	ORC2	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB3	11484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	202102159	202102434	202102342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	56555	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	203231501	203231745	203231624	Y	NA	BMPR2	BMPR2,NOP58	IMR90	Hi-C	24141950	BMPR2	7914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	427543	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	GPR1	NA	NA	NA	NA	GPR1	3982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1B	379665	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	208749045	208749238	208749090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD5	116758	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	208839036	208839224	208839180	Y	CREB1,FZD5,PIKFYVE,PLEKHM3	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	49060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	208883092	208883191	208883110	Y	PTH2R,C2orf80	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	5093	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	211032670	211033036	211032982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPE	167381	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	215971469	215971483	215971476	Y	NA	ABCA12	NA	NA	NA	NA	ABCA12	29668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	216222058	216222324	216222191	Y	FN1	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	47518	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	216614389	216614747	216614614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	282072	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	259767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	315416	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr2	219972742	219972853	219972823	Y	NA	NA	LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH	IMR90	Hi-C	24141950	NHEJ1	50734	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009502.1	1254525	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	223776983	223777159	223777060	Y	SGPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	53331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	224666540	224666974	224666854	Y	AP1S3	AP1S3	NA	NA	NA	NA	AP1S3	33770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	225734569	225734902	225734735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	286459	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	225862598	225862777	225862689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	414488	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr2	228713173	228713709	228713566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	132445	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	229407284	229407450	229407381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	726551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	230195622	230196428	230195761	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	61621	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232032893	232033210	232033082	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	28050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232186573	232186872	232186798	Y	PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	71382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	233252147	233252689	233252515	Y	NA	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPP	10903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	233489337	233489574	233489364	Y	NA	EFHD1	NA	NA	NA	NA	EFHD1	20570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	233807501	233807636	233807561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	68346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	233949093	233949523	233949288	Y	DGKD,ATG16L1,INPP5D	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	73111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	235231865	235232186	235231915	Y	ARL4C	NA	SPP2,ARL4C,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	171511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	235335674	235336048	235335859	Y	ARL4C	NA	SPP2,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	67649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	236586407	236586717	236586603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	185674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	237764752	237765407	237765371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	238173251	238173336	238173294	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	180791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	RAB17	116821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	239997480	239997793	239997637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	323555	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	240134215	240134581	240134421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	186767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	177053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	175512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124677	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	241796889	241797214	241796939	Y	GPR35,AGXT	KIF1A,AGXT	NA	NA	NA	NA	AGXT	8682	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr2	242710043	242710405	242710079	Y	NA	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	38049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	623492	623974	623709	Y	NA	TCF15,SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8040	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	NA	NA	NA	NA	NA	ANGPT4	71669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	1307828	1308261	1308086	Y	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	62868	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3348660	3349006	3348744	Y	FASTKD5,UBOX5,GFRA4	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	37266	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3394210	3394590	3394400	Y	OXT,AVP	C20orf194	C20orf194,ATRN	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf194	7938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	4423594	4423998	4423801	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	240884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	4895704	4895880	4895792	Y	NA	SNORA31	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA31	48074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	5899454	5899753	5899716	Y	NA	TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	29429	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	466137	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	9065873	9065924	9065899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	1067397	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	64410	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	11159709	11159935	11159829	Y	NA	NA	JAG1,C20orf94,LOC339593	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	534695	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	13036502	13036844	13036725	Y	NA	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	48875	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	13379016	13379145	13379075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	238442	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	13427146	13427424	13427285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	190163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr20	18034343	18034358	18034351	Y	NA	OVOL2	NA	NA	NA	NA	OVOL2	3474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	18779270	18779601	18779408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	212733	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	18896761	18896816	18896789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	294474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	19194656	19195454	19194994	Y	NA	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	3366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	19890524	19890778	19890583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	104982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	19917960	19918777	19918135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	76983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	20605285	20605597	20605591	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	85534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	22905662	22905881	22905772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	423492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	23117564	23117783	23117655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	211590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	23685014	23685057	23685036	Y	CST9	NA	NA	NA	NA	NA	CST3	67904	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	24451680	24451884	24451790	Y	TMEM90B	NA	NA	NA	NA	NA	CST7	475982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	30305141	30305549	30305422	Y	PLAGL2,HCK	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	4243	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	34018897	34019177	34019037	Y	MYH7B	CEP250	NA	NA	NA	NA	CEP250	21808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	34658286	34658599	34658390	Y	EPB41L1	NA	LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	112892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	35305263	35305453	35305359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	67028	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr20	35305679	35305903	35305811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	66578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	35723463	35723698	35723601	Y	NA	RBL1	NA	NA	NA	NA	RBL1	1275	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	36339461	36339780	36339670	Y	GHRH,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	19053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	38908222	38908337	38908279	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	407543	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	42137465	42137802	42137552	Y	NA	L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	L3MBTL1	3145	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	8.67369130660149
chr20	42809563	42809791	42809669	Y	FITM2,JPH2	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	JPH2	4427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr20	45324546	45324927	45324721	Y	TP53RK	SLC13A3,TP53RK,SLC2A10	SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	TP53RK	8128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	46067688	46067974	46067774	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60627	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	46067997	46068157	46068096	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60444	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr20	46162026	46162326	46162051	Y	NA	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NCOA3	33425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47040513	47040840	47040677	Y	NA	NA	SULF2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00494	53820	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47372882	47372931	47372907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	69489	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47388875	47389197	47389190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	53223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	169893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr20	48317822	48318037	48318021	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10378	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48367008	48367399	48367310	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	B4GALT5,SNRPFP1	B4GALT5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRPFP1	22629	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48467762	48467975	48467793	Y	NA	SLC9A8	NA	NA	NA	NA	SLC9A8	40512	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48532841	48533167	48533004	Y	SPATA2,SPATA2	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	2761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48644508	48644680	48644594	Y	B4GALT5,SLC9A8,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	SNAI1	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	46972	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48707582	48707967	48707775	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	22529	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48869312	48869682	48869455	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	NA	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	63936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48922474	48922671	48922573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	117098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	49133154	49133451	49133362	Y	CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	8263	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	6860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	50033542	50033860	50033623	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	143510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr20	51345703	51345959	51345831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	526856	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	288294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SUMO1P1	134858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	7995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	7042	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	52542599	52542948	52542719	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	52503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	52547344	52547891	52547567	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	57248	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	55403523	55403730	55403625	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	201165	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr20	55434478	55434638	55434557	Y	NA	NA	TFAP2C	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2C	232120	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	56550215	56550469	56550425	Y	NA	NA	ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	332026	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	58225793	58225841	58225817	Y	ZNF831,PHACTR3,PHACTR3,CDH26,PHACTR3	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	287511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	58552421	58552506	58552458	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3	PPP1R3D	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	39069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	142529	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	58957250	58957289	58957270	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	296355	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	60103711	60103923	60103817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	278229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	61787415	61787725	61787555	Y	COL20A1,BHLHE23	NA	HAR1B,HAR1A,LOC63930,FLJ16779,DIDO1,C20orf11,BHLHE23,MIR124-3,NKAIN4,BIRC7,ARFGAP1,COL20A1,KCNQ2	IMR90	Hi-C	24141950	YTHDF1	57861	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	61808489	61808992	61808551	Y	STMN3,NKAIN4,KCNQ2,EEF1A2,COL20A1,CHRNA4	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	36594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	61899212	61899429	61899321	Y	NA	ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	2708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr21	11095741	11096142	11095942	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE	68022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	TPTE	146795	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	15546243	15546620	15546432	Y	NA	RBM11	NA	NA	NA	NA	RBM11	39831	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	15810858	15811228	15811061	Y	SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	57053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	15962241	15962603	15962321	Y	NRIP1,SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	208436	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	16288986	16289227	16289075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	146094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	16345757	16346184	16346094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	89137	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	16662871	16663259	16663022	Y	NA	NA	SAMSN1,NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	227550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	16796519	16796652	16796581	Y	NA	NA	SAMSN1	IMR90	Hi-C	24141950	USP25	303692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	17790629	17790733	17790681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	135540	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	28207147	28207505	28207325	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	8223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	460235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr21	28804215	28804390	28804303	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	467383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	28955057	28955188	28955121	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	618225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	30037436	30037730	30037586	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	217963	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr21	30274097	30274402	30274148	Y	NA	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	18404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.78246087106766
chr21	30603394	30603504	30603466	Y	USP16,BACH1,BACH1	BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	39002	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	32556885	32557051	32556941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	372507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	32654582	32654950	32654771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	274608	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr21	32727234	32727499	32727493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	202059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	32865746	32866005	32865892	Y	TIAM1	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	63553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	33303378	33303399	33303389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUNK	59750	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	35010521	35010538	35010530	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	ITSN1	2168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36418469	36418852	36418527	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433028	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	36947639	36947807	36947723	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	427158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	37222964	37223324	37223144	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	151641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr21	38151764	38151954	38151859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	184858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr21	39112163	39112449	39112332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	376071	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	39120305	39120635	39120470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR4	370819	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	39618516	39618880	39618566	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	DSCR8	126971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	40211972	40212276	40212079	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	36741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr21	43214290	43214658	43214474	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	29024	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	43372239	43372638	43372317	Y	C2CD2	C2CD2	NA	NA	NA	NA	C2CD2	240	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	ERVH48-1	12229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr21	44573696	44574026	44573784	Y	NA	U2AF1	HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	47999	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr21	46274069	46274460	46274264	Y	KRTAP12-4,UBE2G2,SUMO3	SUMO3,PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	17292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	46302248	46302499	46302417	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10496	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	47008132	47008435	47008135	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	AL133493.2	3133	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	6.22726555345748
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	19427862	19428165	19428014	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	5059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	20911751	20912048	20911845	Y	PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	63551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	23338343	23338736	23338580	Y	NA	NA	RTDR1,GNAZ,ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNAZ	71804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	23520668	23520822	23520745	Y	NA	RTDR1,RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	777	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	24767148	24767407	24767278	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	102282	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	24870306	24870552	24870389	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	78919	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	28536034	28536328	28536157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	221912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	29206791	29206989	29206921	Y	EMID1,CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	XBP1	K562	ChIA-PET	22265404	CTA-292E10.6	12120	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	30178140	30178286	30178234	Y	NA	ZMAT5,UQCR10	NA	NA	NA	NA	UQCR10	16782	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	13948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	33052745	33052826	33052803	Y	RFPL2,RFPL3,TIMP3,SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	142861	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	33091404	33091880	33091552	Y	TIMP3,SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	103807	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	33176423	33176673	33176603	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	19014	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	35772921	35773272	35773050	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	1082	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36621171	36621450	36621368	Y	NA	APOL2	NA	NA	NA	NA	APOL2	12550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	36828742	36828858	36828800	Y	NA	MYH9,TXN2	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	46679	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	37261378	37262019	37261471	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	CTA-833B7.2,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CTA-833B7.2	2464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	37669607	37669944	37669799	Y	LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,CYTH4	RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	31119	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	38137969	38138286	38138127	Y	TRIOBP	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	46958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	39231993	39232165	39232069	Y	NA	SUN2,DNAL4,NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	NPTXR	5822	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	39277533	39277801	39277644	Y	NA	NPTXR,CBX6	CBX6,APOBEC3A,APOBEC3H,APOBEC3G,CBX7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBX6	11214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	39462078	39462341	39462224	Y	NA	APOBEC3F	NA	NA	NA	NA	APOBEC3F	27469	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	40347638	40347876	40347797	Y	GRAP2	FAM83F	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83F	41077	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	60396	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	41416837	41417114	41416960	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	40942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	42307585	42307642	42307614	Y	TOB2,SHISA8	SHISA8,TNFRSF13C,CENPM	NA	NA	NA	NA	SHISA8	928	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	43004784	43005250	43005076	Y	SERHL2	RRP7B,POLDIP3,RNU12,CYB5R3	NA	NA	NA	NA	POLDIP3	3718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	43130388	43130736	43130634	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	15084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	44542524	44542650	44542613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	149433	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	45879926	45880282	45880095	Y	NA	FBLN1	FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	FBLN1	15836	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46370456	46370600	46370533	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	409	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARA	63160	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	46988577	46988710	46988625	Y	NA	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	18668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	47498045	47498267	47498202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	341527	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	47498614	47499010	47498804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	342096	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr22	47579960	47580142	47580051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	423442	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50680113	50680250	50680180	Y	SELO	SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	1171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr22	50979060	50979802	50979496	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	3042	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	2199191	2199396	2199294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090043.1	563262	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	488335	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	3975411	3975745	3975578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	367243	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	17769	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	5037242	5038218	5038020	Y	BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	18441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	5239354	5239686	5239551	Y	NA	EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	12023	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1346366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	6741976	6742157	6742067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1514645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	9289090	9289417	9289259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD3	113109	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	74190	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMM41	198358	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	12584271	12584371	12584321	Y	NA	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	12142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.44642575314401
chr3	13455554	13455885	13455702	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	3924	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	271895	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	14817078	14817479	14817226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	169612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	14848047	14848355	14848186	Y	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	138736	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	15330325	15330412	15330355	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	50463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	15335582	15336799	15336677	Y	NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	44076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	15338366	15338748	15338633	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	42127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	15780032	15780074	15780052	Y	SH3BP5,EAF1	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	119204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	17193194	17193470	17193300	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	639661	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	791481	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	824779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	18366679	18366900	18366790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	117409	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	18403160	18403568	18403352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	80741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr3	23127365	23127541	23127536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	114970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	27396607	27396872	27396740	Y	NA	NEK10	NA	NA	NA	NA	NEK10	12079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr3	28165429	28165788	28165609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	115287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	29214475	29214634	29214556	Y	NA	NA	RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	ZCWPW2	825838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	30723230	30723490	30723363	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	77236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	30794572	30794739	30794667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	148578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	31967720	31967825	31967773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	53438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	32474497	32474641	32474574	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	43334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.11525384748293
chr3	32929924	32929958	32929941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM71	72414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	34403408	34403869	34403595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	565564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	35105790	35105810	35105799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	1267946	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA1	103725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	41040807	41041115	41040961	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	193213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	42078040	42078206	42078049	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	24746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	42752817	42753092	42752955	Y	NA	CCDC13-AS1	NA	NA	NA	NA	CCDC13-AS1	18975	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	42889474	42889730	42889711	Y	CCBP2	HIGD1A,KRBOX1	NA	NA	NA	NA	KRBOX1	40499	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	111255	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	43935699	43936111	43935927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	204613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	46553469	46553539	46553504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	179655	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	47327082	47327178	47327130	Y	NA	KLHL18,KIF9	NA	NA	NA	NA	KIF9	4141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	47485746	47485855	47485805	Y	NA	SCAP	NA	NA	NA	NA	SCAP	30761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	49389809	49389972	49389904	Y	ARIH2,DALRD3,RHOA,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	GPX1	4061	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,AMT,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	53286308	53286764	53286678	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	1304	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	54784810	54784817	54784814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	630236	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	55398457	55398867	55398717	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC66	1190322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	56769464	56769764	56769614	Y	CCDC66	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	54199	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	186035	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	38852	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	58469083	58469272	58469182	Y	NA	KCTD6	NA	NA	NA	NA	KCTD6	6569	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	59939589	59939967	59939778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	905779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	61548977	61549431	61549203	Y	NA	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	3734	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	62052710	62052952	62052831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	249696	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	62427415	62427809	62427798	Y	FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	74410	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	64563963	64564300	64564067	Y	ADAMTS9	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-14D22.2	134811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	68324657	68324668	68324662	Y	FAM19A1	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	621619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	68954073	68954327	68954200	Y	NA	FAM19A4	NA	NA	NA	NA	FAM19A4	25434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	70374369	70374738	70374554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	587783	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR27	334912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	107533	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	72395827	72396075	72396000	Y	RYBP	NA	SHQ1,RYBP,GXYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	97994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	72936024	72936237	72936180	Y	RYBP,EBLN2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	74641204	74641330	74641267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-413E6.1	1030974	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	80630991	80631014	80631005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	816026	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	87038753	87038992	87038799	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	87320619	87320795	87320725	Y	CHMP2B	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	46198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	87336210	87336427	87336319	Y	NA	NA	CGGBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP2B	61789	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	108948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	227565	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	101843193	101843415	101843276	Y	ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	298358	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	106932717	106932735	106932725	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	24804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	107711874	107712477	107712307	Y	CD47	NA	MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	95395	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	27731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	111833246	111833569	111833411	Y	BTLA,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30064	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	112093198	112093568	112093374	Y	CD200	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	184988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	112354601	112355057	112354782	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	11320	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	114798123	114798367	114798245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	1024663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	117050913	117051371	117051328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	307368	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	118561016	118561389	118561159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	396561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	119281143	119281770	119281614	Y	ARHGAP31,TMEM39A,CD80,ADPRH	ADPRH	NA	NA	NA	NA	ADPRH	14345	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	119345181	119345394	119345269	Y	GSK3B,ARHGAP31,ADPRH	ADPRH,RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	7603	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	119436291	119436418	119436355	Y	C3orf15,NR1I2	COX17	NA	NA	NA	NA	COX17	41990	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	119866352	119866515	119866428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	54610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	119876721	119876867	119876800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	64979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	120279186	120279582	120279384	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	33574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	121798487	121798500	121798494	Y	PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A2	187551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	122476470	122476801	122476636	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	33870	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123093901	123094149	123094025	Y	ADCY5,ADCY5	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22A	175127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123157928	123157935	123157932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	144097	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123762181	123762190	123762188	Y	NA	NA	KALRN,ROPN1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	83617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	123824591	123825032	123824690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	146027	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	126680194	126680270	126680232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	259131	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	133132587	133132784	133132642	Y	SRPRB,TMEM108	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	157790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	134874627	134874847	134874784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB1	559984	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	137844377	137844651	137844514	Y	NA	DBR1	NA	NA	NA	NA	DBR1	47140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	138442687	138442826	138442751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	108954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	139824639	139824888	139824698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	172612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	270282	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr3	141397804	141398070	141397938	Y	NA	NA	RASA2,ATP1B3,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	56976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	142130035	142130079	142130067	Y	NA	XRN1	NA	NA	NA	NA	XRN1	34825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	143162621	143163181	143162827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	402192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	212477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	143363444	143363621	143363553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	201752	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	363387	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	147072976	147073090	147073034	Y	NA	ZIC1,ZIC4	NA	NA	NA	NA	ZIC1	36119	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	149225388	149225682	149225672	Y	RNF13	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	14941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	108725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	149901549	149901792	149901671	Y	NA	NA	PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFN2	134974	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	150001972	150002287	150002130	Y	NA	NA	TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D2	121835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	150086629	150086866	150086749	Y	NA	TSC22D2	RNF13,PFN2,TSC22D2,SERP1,EIF2A,LOC646903	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	37256	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	150482569	150482635	150482602	Y	NA	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	3305	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	150714222	150714233	150714228	Y	CLRN1	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	87251	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	150982940	150983386	150983145	Y	P2RY14	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	49354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	150990274	150990572	150990423	Y	NA	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	42168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	151016558	151016712	151016648	Y	MED12L,P2RY12,GPR87	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	16028	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr3	151065337	151065743	151065553	Y	CLRN1,P2RY14,GPR87,P2RY13,P2RY12	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	32597	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	151066126	151066377	151066226	Y	MED12L,GPR87,P2RY12	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	33386	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	152236739	152236782	152236761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	277122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	154782785	154783047	154782891	Y	NA	NA	MME	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1P10	242549	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	155281187	155281565	155281523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	179291	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	60098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	159183407	159183504	159183456	Y	SCHIP1,IQCJ,SCHIP1	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	372146	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	159532172	159532274	159532246	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	23376	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16377	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	168616433	168616445	168616439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	804670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	404521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	180190	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	292977	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	170957638	170957941	170957717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	218256	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr3	171146057	171146176	171146159	Y	NA	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	30021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171282661	171283015	171282831	Y	PLD1,FNDC3B	NA	SLC2A2,TNIK,EIF5A2,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	TNIK	106464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	153044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	177297513	177297662	177297588	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	384252	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	177315732	177315915	177315819	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	402471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	808122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	178786594	178786786	178786690	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1281	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	738842	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	182264358	182264360	182264359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	244928	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	182930008	182930187	182930076	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	38845	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	184249397	184249637	184249517	Y	HTR3D,HTR3E	EPHB3	VPS8,CHRD,THPO,POLR2H,EPHB3	IMR90	Hi-C	24141950	EPHB3	27935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	186200833	186200839	186200836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB11	82353	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	186901070	186901277	186901226	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	4374	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187574248	187574709	187574377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL6	112733	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr3	187636889	187637150	187637085	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	175374	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187690684	187690704	187690694	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	178368	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187704282	187704692	187704483	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	164380	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP	NA	NA	NA	NA	LPP	14435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP	NA	NA	NA	NA	LPP	32241	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	115185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	188312026	188312153	188312088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	442954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	188537744	188538118	188537883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	668672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	188661502	188661787	188661650	Y	NA	NA	LPP,LPP-AS2,BCL6,LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	TP63	685418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	189544866	189545241	189545054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	197661	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	189776297	189776673	189776524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	60080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	191018915	191018927	191018921	Y	NA	CCDC50	NA	NA	NA	NA	CCDC50	25939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	191160044	191160233	191160139	Y	PYDC2	NA	FGF12	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC50	115178	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	191620991	191621297	191621143	Y	PYDC2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	576125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	193615675	193615806	193615778	Y	NA	NA	LOC647323	IMR90	Hi-C	24141950	HES1	236128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	194269976	194270037	194269999	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,FLJ34208,LRRC15,CPN2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	32703	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	194341751	194341921	194341813	Y	NA	TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1	NA	NA	NA	NA	AC046143.3	9731	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	194824432	194824598	194824501	Y	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	165298	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUC4	105908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	195531239	195531516	195531404	Y	NA	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	195854063	195854320	195854202	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	47003	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr3	196437709	196437842	196437776	Y	NA	CEP19,PAK2	NA	NA	NA	NA	CEP19	545	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr3	197840450	197840806	197840557	Y	LRCH3,IQCG	AC073135.3	LMLN,ANKRD18DP	IMR90	Hi-C	24141950	AC073135.3	5467	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	640356	640557	640503	Y	ZNF141,ZNF721,TMEM175,CPLX1,PDE6B	MYL5,ATP5I,MFSD7	NA	NA	NA	NA	MYL5	24812	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	873387	873975	873731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAK	50186	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	2389037	2389223	2389089	Y	LOC402160	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	72724	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	96887	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	4272259	4272533	4272507	Y	ZBTB49	TMEM128,LYAR,ZBTB49	NA	NA	NA	NA	LYAR	17363	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	4692859	4693117	4692937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18	150786	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	6809071	6809294	6809183	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	27969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	7510082	7510101	7510091	Y	SORCS2	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS2	317817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	7648496	7648718	7648592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	290935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	7654451	7654682	7654596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	284971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	9980867	9981172	9981022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	135401	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	10001685	10001951	10001818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	114622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	10174837	10175145	10174991	Y	NA	NA	WDR1,CLNK	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	58264	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	201297	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	15149271	15149619	15149486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	146973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	22745096	22745194	22745147	Y	NA	CDC42P6	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	17523	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	26214365	26214515	26214442	Y	NA	NA	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	51288	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	26449466	26449471	26449469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D19	126588	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	26479198	26479263	26479231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D19	96796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	27085890	27086000	27085963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STIM2	228590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	38663074	38663393	38663234	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	KLF3	424	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	96893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	43686	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40684955	40685070	40685013	Y	NA	NA	RBM47,NSUN7	IMR90	Hi-C	24141950	RBM47	54063	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40722899	40723292	40723210	Y	RBM47	NA	CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	92007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	40747894	40747905	40747900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	117002	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	42819226	42819612	42819419	Y	ATP8A1,GRXCR1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	828737	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	53985720	53986039	53985931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	244203	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	56453376	56453745	56453528	Y	NA	CLOCK,PDCL2	NA	NA	NA	NA	PDCL2	2634	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	57459098	57459424	57459263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOPX	86641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	62161520	62161812	62161666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	96544	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	62697127	62697420	62697274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	57559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	65033615	65033630	65033623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	260997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr4	66734101	66734181	66734134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	223663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	75945312	75945392	75945352	Y	PARM1	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	89007	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr4	76487136	76487403	76487267	Y	NA	THAP6,RCHY1	NA	NA	NA	NA	RCHY1	49162	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	77367704	77367795	77367750	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	13451	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	78774382	78774627	78774448	Y	CNOT6L	CNOT6L,MRPL1	MRPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL1	7047	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	79555155	79555549	79555412	Y	BMP2K	NA	FRAS1,BMP2K	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA3	84482	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	83659208	83659576	83659392	Y	SCD5	NA	NA	NA	NA	NA	SCD5	58434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	83681282	83681423	83681411	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	36587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	26035	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	84555283	84555459	84555372	Y	NA	NA	FAM175A	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT9	100216	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	84887961	84887976	84887969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	432894	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	87626625	87626818	87626720	Y	PTPN13	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	227336	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	306518	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	90220460	90220760	90220686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115D19.1	249747	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	292131	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	92218724	92218762	92218742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	1461258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	93104192	93104578	93104286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2022184	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	100741664	100741845	100741755	Y	RG9MTD2,LAMTOR3,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	5674	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	103365427	103365811	103365619	Y	NA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,BDH2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	15012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	103485535	103485935	103485588	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	65049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	103605742	103606270	103606017	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	73881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B1,SLC9B2	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	28580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	105978597	105978838	105978729	Y	TET2,TET2	NA	TET2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TET2	86194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr4	105980538	105980953	105980680	Y	TET2,TET2	NA	TET2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TET2	84079	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr4	109047956	109048357	109048341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	139086	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	110921404	110921451	110921428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAR1	186738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	111023992	111024272	111024132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	94083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	113547591	113547910	113547748	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	LARP7	8210	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	113668186	113668486	113668348	Y	NA	RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	10358	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	114711770	114711906	114711870	Y	NA	CAMK2D	ANK2,CAMK2D	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2D	30687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	115340014	115340032	115340023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	658931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	122703678	122703696	122703687	Y	NA	EXOSC9,CCNA2	NA	NA	NA	NA	EXOSC9	16776	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	123072095	123072295	123072185	Y	NA	KIAA1109	NA	NA	NA	NA	KIAA1109	607	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	123776087	123776259	123776177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT6	65864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	124401120	124401258	124401189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	85170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	127560832	127561219	127561186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	981207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	127657029	127657204	127657094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	885222	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	129244714	129244881	129244798	Y	NA	PGRMC2	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	36730	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	129847015	129847068	129847042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	165404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	139315146	139315301	139315233	Y	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	153643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	140017684	140017800	140017744	Y	RAB33B,ELF2	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	78572	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	141712099	141712307	141712229	Y	TBC1D9,ZNF330	TBC1D9	TBC1D9,UCP1	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D9	36825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	142984215	142984339	142984277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	782246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	146546923	146547210	146547042	Y	ZNF827	MMAA	NA	NA	NA	NA	MMAA	9508	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr4	148654665	148655045	148654996	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	3451	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	148701443	148701938	148701779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	50229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	150977820	150977939	150977880	Y	NA	NA	DCLK2	IMR90	Hi-C	24141950	LRBA	956940	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	153023305	153023605	153023314	Y	NA	NA	SH3D19,FBXW7,RPS3A,PET112	IMR90	Hi-C	24141950	PET112	343130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	109080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	154350468	154350645	154350573	Y	KIAA0922	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	34853	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	158219771	158220072	158219781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRB	224562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	159169271	159169555	159169414	Y	TMEM144	TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	48515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	159731152	159732543	159732097	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	42862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	164688247	164688444	164688347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	602174	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.3	585367	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	168818156	168818524	168818473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60	419434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169420329	169420517	169420424	Y	NA	PALLD,DDX60L	NA	NA	NA	NA	PALLD	4112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169658786	169659496	169659136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	201849	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169662986	169663338	169663111	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	206049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	170026437	170026753	170026620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	97011	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	173917824	173917970	173917931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	169934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7	NA	NA	NA	NA	GALNT7	24912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	176340534	176340934	176340734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	644051	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	180541933	180542234	180542084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	2177800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	2084030	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	183353287	183353302	183353295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	288885	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	183397757	183397986	183397872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	333355	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	183439666	183439879	183439717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	375264	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	184042355	184042696	184042526	Y	NA	WWC2	NA	NA	NA	NA	WWC2	23909	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	184390171	184390713	184390483	Y	NA	CDKN2AIP,ING2	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	26427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	185235186	185235665	185235518	Y	NA	NA	IRF2,LOC728175	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	158069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	185393561	185393895	185393573	Y	ACSL1,CASP3,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	185770455	185770749	185770632	Y	IRF2,ACSL1	NA	LOC731424	K562	ChIA-PET	22265404	CASP3	201792	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	186037213	186037356	186037285	Y	NA	SLC25A4	LOC100506229,ACSL1,KIAA1430,SLC25A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A4	25039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	186730607	186731122	186730955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	257184	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr4	186818044	186818172	186818109	Y	SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	170134	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	187622574	187622751	187622592	Y	FAT1	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	187810272	187810501	187810328	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	164396	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.33603511792365
chr4	188076030	188076363	188076230	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	430154	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	TRIML2,TRIML1,RP11-366H4.1	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIML2	587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr4	189101565	189101968	189101694	Y	TRIML2	TRIML1,RP11-366H4.1	TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-366H4.1	22346	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.11687491823712
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	52473	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	601191	601577	601476	Y	PLEKHG4B,SLC9A3,CEP72	CEP72	SLC9A3,CEP72	IMR90	Hi-C	24141950	CEP72	8810	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr5	757060	757343	757251	Y	TPPP	NA	ZDHHC11,SLC9A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	65550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	64078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.44642575314401
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	SLC6A19	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC6A19	16619	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	1200004	1200495	1200211	Y	NA	SLC6A19	NA	NA	NA	NA	SLC6A19	294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	392414	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.67044916509311
chr5	6927514	6927543	6927527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	296058	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	7397224	7397590	7397441	Y	C5orf49,ADCY2	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	2903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	SNHG18	137329	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	10634343	10634413	10634378	Y	MARCH6,ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	71901	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	14114865	14115129	14114997	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	TRIO	26682	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr5	16698370	16698703	16698671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	83203	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	16898106	16898497	16898302	Y	MYO10	MYO10	NA	NA	NA	NA	MYO10	35875	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	93865	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	17426571	17426730	17426631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P10	73838	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	24549413	24549679	24549546	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	639086	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	277622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	34717862	34718081	34717968	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	63520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	35405015	35405048	35405025	Y	NA	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRLR	176221	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	35884312	35884698	35884400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	265365	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	36030784	36031024	36030904	Y	UGT3A2	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	119039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	36425659	36425959	36425758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	178498	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	36614653	36614946	36614866	Y	LMBRD2,RANBP3L,SLC1A3,SLC1A3	SLC1A3	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	10196	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	38538245	38538619	38538432	Y	LIFR	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	17044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39178902	39179192	39179129	Y	RICTOR	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	93438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39185861	39186166	39186014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	86464	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	39186669	39186768	39186720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	85862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39194499	39195200	39195005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	77430	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39215442	39215743	39215646	Y	RICTOR,FYB	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	56887	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	39429352	39429540	39429446	Y	NA	C9,DAB2	DAB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C9	6382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	41446274	41446654	41446465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD3	62076	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	42949793	42950117	42950048	Y	ZNF131,C5orf39	NA	LOC648987,LOC153684	IMR90	Hi-C	24141950	SEPP1	64299	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	45492621	45492641	45492631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	685594	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	53886377	53886761	53886569	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	74788	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	53886788	53887029	53886875	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	75199	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	54015316	54015702	54015509	Y	NA	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	203727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	54715918	54716192	54716055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	108337	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	56862650	56862941	56862783	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	394875	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	478796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	8.00648428301676
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	907340	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	60615240	60615598	60615385	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NDUFAF2,C5orf43	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM6	10502	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	61843905	61844215	61843940	Y	NA	CKS1B	NA	NA	NA	NA	CKS1B	37596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	67367322	67367390	67367356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	142158	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	67643475	67643635	67643573	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	133927	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	71852331	71852540	71852377	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	237858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	73729339	73729731	73729599	Y	NA	NA	RGNEF	IMR90	Hi-C	24141950	HEXB	204117	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	77178463	77178819	77178704	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	15859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	77765293	77765351	77765322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	110954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	77827534	77827604	77827573	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	173195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	77835986	77836955	77836241	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	181647	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	77945760	77945963	77945862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	117881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	HOMER1,RP11-342F17.2	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-342F17.2	20277	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	79440817	79441220	79441029	Y	ZFYVE16,FAM151B,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	108678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	80263371	80263585	80263478	Y	NA	RASGRF2,CTC-459I6.1	NA	NA	NA	NA	CTC-459I6.1	8645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	80394008	80394030	80394018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-459I6.1	139282	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	82224684	82224708	82224696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	146609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	82608517	82608916	82608727	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	236835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	86619927	86620237	86620117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58222	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	90355365	90355552	90355477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	321624	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	90604425	90604632	90604611	Y	NA	NA	GPR98,ARRDC3,LOC100129716	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARRDC3	72544	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	95178953	95179190	95179087	Y	GLRX,ELL2	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22244	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	95227563	95227763	95227704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	67942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	96152147	96152486	96152312	Y	LNPEP,ERAP1	ERAP1	ERAP1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ERAP1	10344	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	97645408	97646168	97645558	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	26280	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	100177018	100177251	100177133	Y	ST8SIA4,ST8SIA4	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA4	59719	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	100225667	100225935	100225778	Y	NA	ST8SIA4	NA	NA	NA	NA	ST8SIA4	11035	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	112585066	112585229	112585152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	262151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	114749513	114749705	114749609	Y	FEM1C	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	118985	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	114881094	114881387	114881239	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	2503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	115157919	115158169	115158044	Y	LOC644100	AP3S1,ATG12	NA	NA	NA	NA	AP3S1	17009	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,CTB-118N6.2	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	116109784	116110093	116109939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	59855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	116157975	116158326	116158148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	108046	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	116228958	116228967	116228963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	179029	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	118257403	118257748	118257576	Y	NA	PTMAP2	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	49743	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	118609146	118609633	118609193	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	6759	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr5	118836565	118836574	118836570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	50427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	119994126	119994308	119994217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	1207988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	122322384	122322589	122322416	Y	NA	PPIC	NA	NA	NA	NA	PPIC	47847	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	123996464	123996708	123996619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	146218	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	57802	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	125701796	125702121	125701959	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	7972	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	125754063	125754221	125754117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	60239	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	126087846	126088015	126087939	Y	NA	LMNB1	MEGF10,LMNB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNB1	22300	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	131604535	131604860	131604707	Y	NA	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	13171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	131810095	131810374	131810235	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	14116	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	133775971	133776293	133776132	Y	NA	CDKN2AIPNL	PHF15,SKP1,UBE2B,CDKN2AIPNL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	30382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	135022581	135022649	135022615	Y	NA	NA	SLC25A48,CXCL14	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL14	109612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	136374592	136374995	136374792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	713044	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	303483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	317510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138319677	138319832	138319813	Y	DNAJC18,LRRTM2	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	287609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138541195	138541588	138541435	Y	NA	NA	SIL1,HSPA9,CTNNA1,LRRTM2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MATR3	65853	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.00162107075419
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	138786651	138786712	138786682	Y	NA	SPATA24,DNAJC18	NA	NA	NA	NA	DNAJC18	8471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	140894023	140894210	140894163	Y	NA	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	40443	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	140899669	140900070	140899720	Y	PCDH12,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	46089	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142105384	142105400	142105392	Y	FGF1	ARHGAP26	ARHGAP26,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP26	42549	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142182965	142183820	142183151	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	35016	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142221928	142222177	142222053	Y	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	73979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142406567	142406756	142406640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	258618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142535933	142536319	142536126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	173851	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	143073364	143073384	143073375	Y	KCTD16	NA	ARHGAP26,KCTD16,HMHB1,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	260287	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1	553700	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO38	297393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148185507	148185821	148185751	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	18335	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148510344	148510723	148510652	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABLIM3	8323	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148763077	148763238	148763158	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L,MIR143HG	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	21014	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	148836415	148836621	148836572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	52163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	149063374	149063774	149063380	Y	NA	PPARGC1B	CSF1R,PDE6A,PPARGC1B,ARHGEF37,HMGXB3,TIGD6,SLC26A2	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1B	44087	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	150142965	150143377	150143063	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	DCTN4,C5orf62	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	DCTN4	6294	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	150267218	150267533	150267276	Y	IRGM	ZNF300	NA	NA	NA	NA	ZNF300	15012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	150461516	150462400	150461744	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	8738	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	150902961	150903053	150903007	Y	FAT2	FAT2	NA	NA	NA	NA	FAT2	43452	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	151801718	151801905	151801770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-12O2.1	474586	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	152235967	152235979	152235973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-12O2.1	908835	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	153743049	153743076	153743063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	80441	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	HAND1	107503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr5	156471573	156471840	156471835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	96040	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	156700202	156700407	156700238	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	9113	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	157817633	157817942	157817746	Y	NA	NA	EBF1,LOC285626,IL12B	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	533450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF145	143144	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	159714411	159714605	159714509	Y	NA	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	31151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	160729591	160729939	160729797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	882762	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	167704511	167704517	167704515	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	12139	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf58	252905	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	171039588	171039891	171039740	Y	NA	NA	FBXW11	IMR90	Hi-C	24141950	FGF18	194928	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	171089829	171089844	171089837	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	FGF18	245169	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	171556306	171556459	171556365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	56931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	172225425	172225974	172225664	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	29227	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	172729503	172729731	172729610	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	24775	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	173205115	173205307	173205218	Y	CPEB4	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	107976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	173312606	173312854	173312733	Y	CPEB4	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	429	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	173764742	173765021	173764892	Y	NA	NA	HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	384515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.22564448270329
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	174670280	174670302	174670292	Y	NA	NA	DRD1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN1	231763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	175014406	175014419	175014414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFXN1	112341	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1191	439455	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	NA	NA	NA	NA	COL23A1	18566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	12.0097264245251
chr5	179398044	179398477	179398178	Y	RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	65185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	179453285	179453637	179453562	Y	RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	43481	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	179465387	179465429	179465409	Y	MAML1,MGAT4B,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	31689	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	179510185	179510353	179510296	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	13067	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	179859627	179859895	179859761	Y	NA	CTC-573N18.1	NA	NA	NA	NA	CTC-573N18.1	6664	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	TRIM41,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM41	12696	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	567084	567274	567179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	123843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	1388566	1388906	1388736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	77891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	4189159	4189278	4189216	Y	C6orf201,C6orf146	RP3-400B16.2	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-400B16.2	1809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr6	4302281	4302425	4302353	Y	CDYL	RP3-527G5.1	CDYL,RPP40,PPP1R3G,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-527G5.1	42846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	6702168	6702420	6702249	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	403410	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	6928196	6928339	6928298	Y	RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	177491	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	9710906	9711148	9711028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	706744	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	40395	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	MAK	NA	NA	NA	NA	MAK	11369	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	ERVFRD-1	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	34082	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	11263609	11264019	11263885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	116562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11277425	11277816	11277607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	102765	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11354196	11354778	11354541	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	25803	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11428073	11428442	11428380	Y	NA	NEDD9	NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	47492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11460602	11460937	11460641	Y	LOC221710,ERVFRD-1,NEDD9	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	75001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	11975838	11976169	11975921	Y	TMEM170B,HIVEP1	HIVEP1	ADTRP,HIVEP1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	30826	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	13383914	13384048	13383981	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1,GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	57099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	14596764	14596944	14596823	Y	CD83	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	480892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	14739279	14739644	14739323	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	504883	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	14837546	14837947	14837747	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	406580	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15022090	15022421	15022413	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222106	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15148655	15149132	15148915	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	95395	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15199575	15199598	15199586	Y	NA	JARID2,JARID2-AS1	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	44929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	189818	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	15474239	15474654	15474451	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	186635	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	15589107	15589675	15589446	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	71614	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	16215873	16216103	16215954	Y	MYLIP	GMPR	GMPR,JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GMPR	20708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	171367	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	21258987	21259049	21259040	Y	NA	NA	CDKAL1	IMR90	Hi-C	24141950	SOX4	332923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.11687491823712
chr6	21808482	21808727	21808539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	216510	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	120066	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	25174209	25174610	25174347	Y	C6orf62	NA	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	102696	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	25178778	25179206	25179010	Y	C6orf62	NA	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	98100	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	25193718	25194203	25194002	Y	NA	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	83103	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	26219063	26219301	26219164	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AE	3898	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27637197	27637397	27637297	Y	OR2B6,OR2B2	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2AI	136502	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2AI	133547	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	67542	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr6	27720726	27720895	27720796	Y	NA	NA	HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AI	53004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27745023	27745278	27745151	Y	OR2B6,OR2B2	HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	28621	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AI	13566	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	28102608	28102781	28102677	Y	ZSCAN16	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	12270	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.89123043553383
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	28782096	28782213	28782183	Y	ZSCAN12,GPX6,SCAND3,OR2J3,OR14J1,OR2W1,OR2B3,TRIM27	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	22570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	30477053	30477329	30477202	Y	PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1	NA	NA	NA	NA	HLA-E	21809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	30774085	30774428	30774395	Y	NA	NA	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	63754	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	30811913	30812084	30812025	Y	NA	DDR1	FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	30114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	30897391	30897411	30897401	Y	NA	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	23372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	31276281	31276390	31276356	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	30187	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	20028	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD2	37463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	34060373	34060777	34060697	Y	LEMD2,LEMD2	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	124439	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	34341997	34342182	34342078	Y	HMGA1	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	16269	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	34760607	34760986	34760926	Y	UHRF1BP1	SNRPC,UHRF1BP1	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1	2750	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	SLC26A8,MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN1A	13302	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	36660058	36660307	36660143	Y	FGD2,PXT1,STK38,SRSF3	CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	17753	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	36755507	36755765	36755636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf89	81881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	37095912	37096089	37096014	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	39890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	39195802	39196179	39195967	Y	KCNK5	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	576	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	41008417	41008606	41008512	Y	UNC5CL,TSPO2,TSPO2	APOBEC2,NFYA	NA	NA	NA	NA	APOBEC2	10437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	41506487	41506686	41506561	Y	NFYA,TREML4,TREM1,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	5478	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	42011738	42011769	42011754	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	4326	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	42081758	42081907	42081849	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	26450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	42390239	42390257	42390249	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	27532	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	43767552	43768173	43767868	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	31631	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	158490	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	90272	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	44598266	44598445	44598361	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	245004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	45297606	45298153	45297881	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	45537	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	45557969	45558292	45558091	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	214279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	45649659	45650055	45649841	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	305969	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	45919439	45919785	45919549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC5	126347	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	47074438	47074572	47074520	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF21	201069	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	48005638	48005954	48005856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	354038	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	48013349	48013528	48013439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	361749	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	52972904	52973327	52973040	Y	NA	ICK,GCM1	NA	NA	NA	NA	GCM1	38300	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	53329907	53330283	53330016	Y	NA	NA	GCM1	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	117960	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	56103224	56103241	56103234	Y	COL21A1	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	714532	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	56226991	56227307	56227149	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	590466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BEND6	5740	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	57325457	57325813	57325552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	147854	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	57381063	57381299	57381127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	203460	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	58773660	58773770	58773718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	519091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	64150073	64150241	64150156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	79425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.66882809433892
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	67062209	67062219	67062214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2718484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	69073987	69074006	69073998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	1430997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	69557739	69558046	69557893	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	946957	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	166369	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	73504067	73504420	73504243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1L	429073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	73833038	73833304	73833144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1L	100189	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1L	65595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	73981759	73981798	73981779	Y	NA	KHDC1L,RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	10821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	80207886	80208176	80208031	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	36999	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	80638393	80638474	80638434	Y	ELOVL4	NA	NA	NA	NA	NA	TTK	73130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	83590354	83590694	83590676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	184691	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	83745270	83745402	83745336	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	29983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	84570320	84570549	84570344	Y	NA	CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	2958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	84917634	84917758	84917696	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	17595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	87144768	87144816	87144792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P27	349916	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGA	368897	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	89746839	89747007	89746941	Y	NA	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	41463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	89747040	89747487	89747303	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	IMR90	Hi-C	24141950	PNRC1	40983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	101593141	101593339	101593267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	265893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	104462253	104462528	104462438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	843266	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	106442094	106442641	106442261	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89554	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	106582399	106582514	106582457	Y	AIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	50204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	109755732	109756057	109756030	Y	CD164	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	SMPD2	3909	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	109852596	109852917	109852757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB24	50156	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	110094103	110094197	110094150	Y	CD164,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIG4	83604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	110215629	110215882	110215756	Y	SMPD2,MICAL1,AKD1,FIG4	NA	FIG4	IMR90	Hi-C	24141950	FIG4	205130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	111730761	111730999	111730880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	71715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	112078631	112078983	112078811	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	113672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	112523729	112524008	112523937	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	116997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	113968348	113968516	113968463	Y	NA	NA	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MARCKS	208025	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	114126430	114126653	114126571	Y	MARCKS	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	49888	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	116708579	116708861	116708730	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	71672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	116786414	116786618	116786522	Y	DSE,FAM26F,ZUFSP	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	5881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	118008335	118008695	118008355	Y	NA	NUS1	NA	NA	NA	NA	NUS1	13670	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	118241546	118241910	118241839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	76228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	119131601	119131904	119131835	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	81480	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	119661427	119661533	119661480	Y	MAN1A1	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	7393	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	121396728	121397112	121396920	Y	C6orf170	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	357726	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	318120	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	318584	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	130030425	130030727	130030721	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	1055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	131671156	131671520	131671462	Y	NA	NA	AKAP7	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP7	216350	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	132406911	132407089	132407028	Y	NA	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP1	IMR90,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	136398	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	134430650	134430940	134430795	Y	SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	159342	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	134987118	134987554	134987416	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH8A1	281706	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	135235486	135235616	135235552	Y	NA	ALDH8A1	NA	NA	NA	NA	ALDH8A1	33644	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH8A1	74799	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	135859214	135859375	135859362	Y	PDE7B	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	AHI1	42300	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	135908025	135908402	135908230	Y	PDE7B	NA	NA	NA	NA	NA	AHI1	91111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	136688131	136688248	136688227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	79142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	136716338	136716450	136716395	Y	MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	107349	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	136789939	136790352	136790100	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	79605	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	137517813	137517908	137517861	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	20678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	138053118	138053503	138053361	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	132848	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	138075692	138075815	138075736	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	110536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	138148087	138148219	138148190	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	38132	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	138290142	138290398	138290268	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	103791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178549	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	139213986	139214343	139214165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	93055	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	139577047	139577438	139577243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	116319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	139923737	139923853	139923795	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	229980	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	140210036	140210207	140210122	Y	NA	RP5-899B16.1	CITED2,LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-899B16.1	36049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	141171716	141171869	141171793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-899B16.1	997729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	143918177	143918387	143918274	Y	NA	NA	PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	PHACTR2	62195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	151328	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	627330	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	148524085	148524387	148524236	Y	NA	NA	SASH1,SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	67053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	148978169	148978518	148978333	Y	SASH1	NA	UST	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	386729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	149571086	149571460	149571281	Y	NA	TAB2	TAB2,PPIL4	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	33309	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	150075680	150075936	150075837	Y	SUMO4	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	6879	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	150576036	150576243	150576102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	69656	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	150919820	150920210	150920015	Y	NA	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	821	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	151042844	151043065	151042880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	123845	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	151074633	151074860	151074746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	109825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	151248402	151248558	151248480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	63717	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	152495125	152495413	152495269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	461523	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr6	152889271	152889451	152889361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	67485	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	153132437	153132820	153132584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO5	169894	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	153919839	153920046	153919943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475C16.1	317971	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	154753926	154754309	154754118	Y	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP8	141134	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	155179611	155179904	155179758	Y	NA	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	127152	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	155510213	155510600	155510317	Y	SCAF8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	65258	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157285008	157285408	157285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	187945	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	159362401	159362637	159362519	Y	NA	NA	EZR,SYTL3,MIR3918,RSPH3	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	56582	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	159507236	159507417	159507327	Y	TAGAP	NA	RSPH3	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	88017	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	159525207	159525384	159525309	Y	EZR,EZR,TAGAP	NA	TAGAP,RSPH3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSPH3	105988	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	162691567	162691813	162691690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	998474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	162831157	162831249	162831203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	1001783	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	163606625	163606682	163606645	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	226350	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	163746157	163746288	163746242	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	86744	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	163776294	163776859	163776538	Y	QKI	NA	DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	56173	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	48834	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	167001220	167001407	167001338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	247141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	167468441	167468774	167468681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCR6	54521	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	168198261	168198623	168198456	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	26979	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.44642575314401
chr6	168813720	168814071	168813897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	588118	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.33603511792365
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	169361499	169361602	169361564	Y	NA	NA	PHF10,WDR27,C6orf70,TCTE3,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	738557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr6	169472384	169472934	169472739	Y	NA	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	627225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	366062	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	184582	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	409137	409513	409244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	148420	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	508552	508748	508658	Y	ADAP1	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	49185	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	627421	627837	627508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	69488	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	655576	655910	655797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	97643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	949099	949177	949151	Y	ZFAND2A,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	34910	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1115228	1115262	1115245	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	33016	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1274384	1274791	1274446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	75989	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1407991	1408135	1408052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	89003	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	1598591	1598955	1598779	Y	NA	MAFK,PSMG3	NA	NA	NA	NA	PSMG3	9686	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2111827	2112126	2111988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	158752	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2364831	2365125	2365016	Y	SNX8,LFNG	EIF3B,SNX8	KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B,MAFK,TMEM184A	IMR90	Hi-C	24141950	EIF3B	26596	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2750956	2751140	2751041	Y	LFNG,LFNG,CARD11	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	81371	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2773642	2774144	2773933	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	99111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2795099	2795530	2795383	Y	LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	77725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2812534	2812892	2812775	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	60363	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2827851	2827916	2827884	Y	NA	AC006028.11	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	45339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	5488496	5488516	5488506	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	25451	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	5638553	5639025	5638653	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	8114	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	7140103	7140511	7140281	Y	C1GALT1	NA	C1GALT1,LOC100131257,COL28A1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1GALT1	54054	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	7481152	7481527	7481340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIOS	122976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	7911710	7911812	7911761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	94613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	7984284	7984579	7984481	Y	GLCCI1	GLCCI1	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	GLCCI1	21846	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	8016516	8016759	8016566	Y	GLCCI1	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	10091	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	8173918	8174349	8174085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	125514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	11745887	11746284	11746085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	502583	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	12582030	12582229	12582042	Y	NA	NA	SCIN	IMR90	Hi-C	24141950	VWDE	140463	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	12622868	12623180	12622963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	101301	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	12624573	12625024	12624751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	99457	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	13512547	13512927	13512737	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	788066	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	976278	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	14042792	14042945	14042854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	1318311	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	16095120	16095542	16095311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	363405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	17139132	17139382	17139242	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	196864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	75754	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	19024350	19024628	19024489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	130667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	20227353	20227778	20227635	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1	NA	NA	NA	NA	MACC1	27249	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	20323624	20323835	20323730	Y	MACC1	ITGB8	MACC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITGB8	44490	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,LINC01162	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22011633	22011901	22011770	Y	NA	CDCA7L	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	27931	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22583746	22583765	22583754	Y	NA	EEF1A1P6	KLHL7,KLHL7-AS1,TOMM7,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	34128	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22589401	22589537	22589455	Y	NA	EEF1A1P6	KLHL7,KLHL7-AS1,TOMM7,FAM126A,LOC100506178,IL6,SNORD93,IGF2BP3	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	39783	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	82092	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22687053	22687419	22687223	Y	IL6	NA	LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	76084	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22851635	22851773	22851763	Y	NA	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	8697	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	23084280	23084501	23084407	Y	NA	FAM126A	SNORD93,LOC100506178,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	FAM126A	32531	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	132005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	24795767	24795828	24795792	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11416	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	24823380	24823654	24823545	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	16136	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	24882463	24882674	24882596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	75219	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	26346471	26347292	26346975	Y	CBX3,SNX10,SNX10,SNX10	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	16930	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	26477083	26477150	26477118	Y	CBX3	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.4	62762	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	26489472	26489611	26489541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.4	75151	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	27642128	27642466	27642297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBADH	58148	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	28195097	28195228	28195166	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23134	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	28243549	28243770	28243627	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	25187	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	28471608	28471631	28471619	Y	CREB5,CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	134668	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	29163209	29163338	29163275	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	3319	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr7	29288404	29288769	29288539	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	55337	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	30211441	30211675	30211604	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	110248	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	33598181	33598239	33598235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	431325	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	34795612	34795823	34795780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	495935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	215061	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	36938916	36939307	36939244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	511182	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	37156989	37157298	37157171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	329554	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	37255343	37255621	37255439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	231231	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	37287550	37288249	37288116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	198603	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	37487081	37487482	37487160	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1	ELMO1	NA	NA	NA	NA	ELMO1	229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	37506764	37506892	37506828	Y	NA	ELMO1	NA	NA	NA	NA	ELMO1	19912	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	40952368	40952631	40952468	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	964732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	45947887	45948101	45948023	Y	NA	IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	11372	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	177388	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	48031393	48031616	48031481	Y	HUS1	HUS1,SUN3	HUS1	K562	ChIA-PET	22265404	HUS1	14215	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	50431442	50431665	50431622	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	84423	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	50695565	50695835	50695829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	163324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	50859334	50859716	50859525	Y	NA	GRB10	NA	NA	NA	NA	GRB10	175	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	55035120	55035446	55035284	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	49268	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR-AS1	67943	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1796107	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	64327072	64327294	64327184	Y	NA	ZNF273	NA	NA	NA	NA	ZNF273	1256	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	66040596	66040908	66040816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD7	50960	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	70206735	70207047	70206891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	1144830	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	71617695	71618099	71617906	Y	CALN1	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	678678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	73180066	73180446	73180256	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4	NA	NA	NA	NA	CLDN3	2154	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	73232134	73232500	73232295	Y	NA	CLDN3,CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	CLDN4	20262	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	73785571	73785673	73785623	Y	CLIP2	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	80447	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	75599122	75599360	75599199	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	22617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	75920543	75920716	75920673	Y	NA	HSPB1	HSPB1	IMR90	Hi-C	24141950	HSPB1	9145	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	76052692	76053023	76052931	Y	NA	ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	27857	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	77344619	77344946	77344783	Y	RSBN1L	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L	20859	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	838141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	81233474	81233832	81233648	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	GNAI1	1472203	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	84119513	84119698	84119606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	447863	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	84165433	84165798	84165584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	401763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	318893	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	86561279	86561598	86561380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	125417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	87389107	87389401	87389254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DBF4	114130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	90033847	90034185	90034017	Y	STEAP2	CLDN12	NA	NA	NA	NA	CLDN12	22812	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	90861359	90861732	90861539	Y	NA	FZD1	NA	NA	NA	NA	FZD1	30051	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	91324942	91325270	91325105	Y	LRRD1,MTERF	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	182764	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	92227351	92227620	92227450	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	9643	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	92340516	92340848	92340839	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	122808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	92574319	92574346	92574333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	110411	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI2	286796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	93686304	93686593	93686441	Y	NA	NA	TFPI2,GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	54610	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	93926616	93927074	93926886	Y	SGCE,COL1A2	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	CASD1	209457	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	247295	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	95835254	95835261	95835258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	114198	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	98189463	98189580	98189522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	161083	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	100143295	100143664	100143516	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	8461	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101062164	101062286	101062177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	99060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	101600316	101600568	101600442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	143357	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101789481	101789757	101789558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	212562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	29.1347066965332
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	102056938	102057102	102057040	Y	ORAI2	ORAI2,ALKBH4,LRWD1	NA	NA	NA	NA	ORAI2	14451	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	102071349	102071499	102071491	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	54	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	102773056	102773346	102773244	Y	NA	RPL19P12,NAPEPLD	ARMC10	IMR90	Hi-C	24141950	RPL19P12	7040	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	102941984	102942200	102942104	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	6115	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	106206962	106207238	106207108	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	92204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	391947	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	111627210	111627406	111627307	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	217060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	112383831	112384204	112384019	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	44443	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	112414156	112414445	112414299	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	14202	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	119435371	119435694	119435534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	109735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	20758	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	124811194	124811507	124811351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	127425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	127862070	127862227	127862161	Y	IMPDH1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	119735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	128094514	128094949	128094639	Y	LEP,C7orf68	IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B	NA	NA	NA	NA	RP11-155G14.6	523	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr7	129010616	129010786	129010717	Y	NA	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	37425	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.77921872955928
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	132441115	132441141	132441128	Y	NA	NA	FLJ40288	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD3	323707	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	133143604	133143829	133143693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	145437	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	225554	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr7	134514825	134515095	134514960	Y	STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	87822	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr7	135809318	135809401	135809360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	149217	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	136635462	136635508	136635485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	975361	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	137346296	137346315	137346306	Y	PTN	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	338498	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	138643234	138643648	138643551	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	20416	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	138645726	138646137	138646013	Y	SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	17927	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	4.67044916509311
chr7	140372003	140372139	140372071	Y	NA	ADCK2,DENND2A,NDUFB2	NA	NA	NA	NA	DENND2A	210	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	141679454	141679850	141679687	Y	OR9A4,CLEC5A,TAS2R38	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	243333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	144462107	144462147	144462127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	69341	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	145492630	145492774	145492702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	961142	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	146086153	146086538	146086171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	1554665	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58429	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	149323228	149323272	149323250	Y	NA	ZNF767	NA	NA	NA	NA	ZNF767	3385	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	150063162	150063570	150063276	Y	GIMAP2	LRRC61,ACTR3C,ZNF775	NA	NA	NA	NA	REPIN1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	150363010	150363297	150363193	Y	LOC100128542	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00996	234268	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	151502324	151502720	151502638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	69407	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	87147	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	153645622	153645864	153645639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	1146930	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	154746550	154746681	154746616	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	46113	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	157072331	157072686	157072549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	158243394	158243763	158243659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	251757	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	6481206	6481441	6481325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	82289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	8935191	8935379	8935249	Y	NA	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	71705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	10305932	10306275	10305955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	389119	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	10873844	10874251	10874241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	178450	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	12829725	12829793	12829759	Y	NA	KIAA1456	NA	NA	NA	NA	KIAA1456	28574	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	13122971	13123135	13123062	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	248032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	534277	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	354858	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	19495004	19495703	19495326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	176948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	19956829	19957079	19956916	Y	ATP6V1B2	NA	LPL	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	95799	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	20182767	20183137	20182952	Y	NA	LZTS1	ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	23293	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	23844518	23844653	23844586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-148P	88018	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	24155243	24155623	24155554	Y	ADAM28	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-148P	222572	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL2	63758	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	29561597	29561859	29561693	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP4	355412	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	30820542	30820686	30820610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	68631	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	135724	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-84O15.1	1203648	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	3.11363277672874
chr8	36108720	36108918	36108819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150O12.3	1346458	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	37751458	37752024	37751766	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2961	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	38422408	38422610	38422509	Y	NA	RNF5P1	LETM2,FGFR1,C8orf86,RNF5P1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF5P1	34108	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	38531693	38532032	38531863	Y	NA	NA	C8orf86,FGFR1,RNF5P1,PPAPDC1B,DDHD2,WHSC1L1,LETM2	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	51672	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	39964053	39964403	39964231	Y	NA	NA	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT4	788949	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	41015718	41016076	41015872	Y	SFRP1	NA	SFRP1	IMR90	Hi-C	24141950	SFRP1	148940	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	41528710	41528983	41528929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT6	96004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	41757818	41757921	41757853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	149587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	42072486	42072556	42072531	Y	NA	NA	AP3M2,IKBKB	IMR90	Hi-C	24141950	IKBKB	54264	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	42356471	42356680	42356560	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	38389	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	42377318	42377512	42377415	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	17557	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	49638531	49638925	49638704	Y	NA	EFCAB1	NA	NA	NA	NA	EFCAB1	6945	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	54605815	54605949	54605850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	148169	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.11525384748293
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	61917184	61917283	61917226	Y	CLVS1	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	327847	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	63051600	63051694	63051612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	426445	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	63803943	63804216	63804070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	145514	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	64799410	64799591	64799501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	720298	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	65284864	65285259	65285053	Y	BHLHE22	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	424059	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	69744780	69745024	69744928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	1490868	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	69834272	69834684	69834491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	1479356	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	164370	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	72143679	72143939	72143809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LACTB2	564270	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	75576382	75576715	75576543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	61903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-594N15.2	110204	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	80859511	80859794	80859653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	80730	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	81050951	81051119	81051010	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	90348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	81615108	81615487	81615408	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	219254	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	87173146	87173201	87173174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	179766	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	87358801	87359051	87358932	Y	NA	WWP1	NA	NA	NA	NA	WWP1	5834	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	87475103	87475472	87475288	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	19587	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	90797084	90797193	90797178	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	29109	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	90899646	90899998	90899819	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	12089	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	90987349	90987665	90987516	Y	RIPK2,OSGIN2	NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	25791	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	19568	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	103910563	103910945	103910847	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AZIN1	6471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	105409050	105409327	105409190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	189925	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	679867	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr8	121628287	121628559	121628462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	172645	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	122163182	122163617	122163305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-369K17.1	239877	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	123957674	123957774	123957724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	94889	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	124363606	124363931	124363783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2	62659	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	125649664	125650232	125649981	Y	ZNF572,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	88498	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	127445250	127445715	127445335	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	122923	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	563256	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	129152052	129152429	129152207	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	131195	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	129659601	129660006	129659683	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	638744	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	130557757	130558027	130557844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	469348	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131467153	131467172	131467163	Y	NA	ASAP1	ASAP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASAP1	13247	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	131477918	131478265	131477983	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	24012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	PHF20L1	277218	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	134190473	134190743	134190608	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	NA	TG,SLA,PHF20L1	IMR90	Hi-C	24141950	NDRG1	121522	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	135512580	135513062	135513051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	210230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	136247051	136247262	136247121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	220438	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	141804565	141804680	141804623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	205635	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	142255319	142255549	142255470	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	60855	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	143837804	143838151	143837954	Y	NA	RP11-706C16.7	NA	NA	NA	NA	RP11-706C16.7	4383	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	144072877	144073072	144072963	Y	LYPD2,C8orf31	LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	24327	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	144300737	144301128	144300944	Y	GPIHBP1	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	26152	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	2136727	2137024	2136876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	123385	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	2281532	2281772	2281628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	268190	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	2657497	2657645	2657571	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	37663	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	4759281	4759577	4759429	Y	NA	AK3,RCL1	JAK2,KIAA1432	IMR90	Hi-C	24141950	AK3	19238	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	4892272	4892588	4892430	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	43981	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	5552355	5552554	5552455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	74471	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	5777401	5777564	5777483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	53553	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	5965964	5966267	5966115	Y	NA	KIAA2026,RANBP6	NA	NA	NA	NA	KIAA2026	39634	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	6926338	6926600	6926461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	207475	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	7829724	7830044	7829884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	353404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	10530768	10530969	10530965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1441892	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	10563880	10564197	10564091	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1475004	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1976149	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	458662	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	14229495	14229796	14229646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	461673	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	368559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	14427879	14427964	14427922	Y	NFIB	NA	LURAP1L,NFIB,MPDZ,FLJ41200	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC21	263505	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	16508530	16508711	16508621	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	360130	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	16662784	16663109	16662968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	205732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	138963	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	19642332	19642566	19642449	Y	SLC24A2	NA	NA	NA	NA	NA	ACER2	235407	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	20927571	20927855	20927623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	307029	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	21817235	21817446	21817291	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	16693	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	23622735	23622745	23622740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	201590	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	23639161	23639473	23639317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	184862	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	26265141	26265461	26265258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	588285	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	27352450	27352737	27352522	Y	IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	175042	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	93582	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	27591202	27591627	27591327	Y	C9orf72,C9orf72	C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	19338	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	112022	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.33441404716946
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	35907858	35908401	35908282	Y	OR2S2,OR13J1,HRCT1	NDUFA5P4	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P4	34667	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	36294075	36294254	36294162	Y	OR13J1,OR2S2	NA	RNF38,CLTA,GNE	IMR90	Hi-C	24141950	CLTA	105222	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	68377347	68377469	68377407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	75906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	6.89447257704221
chr9	71456308	71456453	71456394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	63344	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	71476577	71476832	71476704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	83613	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	71991675	71991950	71991811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	257466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	72561735	72561997	72561908	Y	NA	NA	APBA1,MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,C9orf135,TRPM3,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	PTAR1	188860	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	72669308	72669598	72669510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	202339	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	73715626	73715840	73715770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	486677	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	73749210	73749614	73749539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	452903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	75549526	75549619	75549601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	215054	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	77948563	77948787	77948675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	247104	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	82439057	82439445	82439215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	254369	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	87326939	87327108	87327024	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	373267	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	87470234	87470516	87470442	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	516562	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	88544402	88544561	88544480	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	9500	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	88588670	88588806	88588674	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	34609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	90171863	90172233	90171972	Y	CTSL1,DAPK1	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	33646	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	90386290	90386442	90386322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	201226	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr9	90425634	90425952	90425875	Y	CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	161716	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NXNL2	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	NXNL2	22617	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	92754925	92755310	92755118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	536997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	95536839	95537017	95536928	Y	NA	BICD2,ANKRD19P	BICD2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BICD2	11745	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	95973709	95973758	95973734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NINJ1	79139	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	97520794	97521111	97520953	Y	C9orf3	C9orf3	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	33811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	85934	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	98583076	98583344	98583210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	322945	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	101944014	101944235	101944097	Y	ALG2	ALG2,SEC61B	ERP44,INVS,TEX10,NR4A3	IMR90	Hi-C	24141950	ALG2	38003	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	102646895	102646933	102646914	Y	NA	STX17	NA	NA	NA	NA	STX17	19982	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	105733718	105733730	105733724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	1120811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	107814689	107815137	107814792	Y	NA	NA	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	126171	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	108621964	108622364	108622354	Y	NA	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	167139	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	110837049	110837188	110837119	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	542378	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	112230117	112230469	112230293	Y	NA	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	28121	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	112793164	112793205	112793171	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	7526	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	113044793	113045024	113044909	Y	NA	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	27873	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	114805021	114805139	114805071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	130549	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	114812315	114812544	114812429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123144	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	115892263	115892507	115892365	Y	SNX30,RGS3,SLC31A2	SLC31A2	NA	NA	NA	NA	SLC31A2	18715	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	116250853	116251013	116250930	Y	NA	RGS3	NA	NA	NA	NA	RGS3	45842	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	KIF12	130602	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	299790	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	117691412	117691904	117691627	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	319926	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	982466	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	118704303	118704501	118704353	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	743080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	740556	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	120507373	120507587	120507563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1059792	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	122060480	122060822	122060651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1279626	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	122670497	122670869	122670683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	669579	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	123304240	123304451	123304346	Y	NA	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	35997	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	5.78246087106766
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	126002195	126002288	126002252	Y	OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	26567	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	126003896	126004111	126004004	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	24744	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	126895140	126895472	126895256	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	122413	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	127329970	127330135	127330093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	88611	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	127356039	127356231	127356145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	62515	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	124602	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	129232894	129233686	129233447	Y	ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	141036	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	131788763	131789149	131789046	Y	SH3GLB2	SH3GLB2,FAM73B	NA	NA	NA	NA	SH3GLB2	181	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	132512351	132512751	132512561	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	132514052	132514155	132514104	Y	NA	PTGES,TOR1B	NA	NA	NA	NA	PTGES	726	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	132535885	132536300	132536143	Y	FNBP1,USP20,USP20,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTGES	22559	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	133893104	133893441	133893273	Y	NA	NA	AIF1L	IMR90	Hi-C	24141950	AIF1L	76422	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134144427	134144727	134144559	Y	NUP214,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	5207	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.55681638836437
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	134460892	134461019	134460973	Y	FAM78A,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	56237	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134537317	134537597	134537547	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	75864	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134576377	134576829	134576707	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	36632	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134582403	134582762	134582583	Y	NA	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	30699	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	134913456	134913470	134913463	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	39825	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136017634	136018138	136017813	Y	GTF3C4,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	19163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136019465	136020353	136020023	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	16948	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136710457	136710861	136710661	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	107380	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	136753303	136753756	136753577	Y	C9orf7,VAV2	NA	SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	VAV2	101970	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	137259692	137260046	137259796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	52748	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	138851660	138852030	138851974	Y	UBAC1	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	139608163	139608561	139608378	Y	EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3141	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	139608810	139609132	139608936	Y	SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3788	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,MIR3621	NA	NA	NA	NA	MIR3621	39570	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,MIR3621	NA	NA	NA	NA	MIR3621	38118	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	MIR3621	37331	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	7.56167960062694
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	1.11201170597455
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	0	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	9509355	9509595	9509475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	80020	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	12988805	12989184	12988832	Y	TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	2043	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	13711501	13711681	13711616	Y	ATXN3L,RAB9A	RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	6257	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	15874387	15874556	15874498	Y	ZRSR2,AP1S2	AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	3333	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	17415371	17415448	17415410	Y	NA	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	23828	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	19643767	19644028	19643952	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	259691	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	19741660	19741797	19741748	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	161922	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	22346680	22346767	22346724	Y	NA	NA	PHEX	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	389989	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	22909771	22909782	22909777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	770597	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	22914204	22914355	22914279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	766024	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	23916832	23916979	23916884	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	7078	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	37605291	37605973	37605549	Y	CYBB	NA	NA	NA	NA	NA	XK	62279	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	39794971	39795100	39795036	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	149581	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	40026389	40026850	40026635	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7732	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chrX	43503580	43504080	43503735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	896167	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	511159	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	45666059	45666529	45666404	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42391	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	45767495	45767762	45767629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	58575	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	46773328	46773680	46773526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP2	78953	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	48345811	48346195	48345963	Y	WAS,RBM3,PQBP1,PQBP1,PQBP1,OTUD5	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	FTSJ1	13270	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	48525968	48526196	48526082	Y	RBM3,TFE3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1,WAS	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	25749	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XAGE2B	105049	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chrX	53083409	53083784	53083564	Y	NA	TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	25765	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	58024306	58024678	58024425	Y	NA	KRT8P17	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	15186	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	58236536	58236802	58236614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	227416	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	64464605	64464940	64464771	Y	ZC4H2,ZC3H12B	NA	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	212012	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	73352212	73352497	73352336	Y	NA	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	39228	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.88960936477964
chrX	93615949	93615975	93615962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	2321687	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	95940743	95941133	95941025	Y	DIAPH2	DIAPH2	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	3081	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	96454742	96455056	96454899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	517080	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	96641794	96641810	96641802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	704132	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	96701855	96702106	96701982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	764193	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	100670556	100670756	100670646	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	9273	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	58680	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM41	235155	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.44480468238982
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.66720702358473
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	110566693	110566855	110566742	Y	PAK3,DCX,DCX,DCX	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN6	54942	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	114849502	114849636	114849587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	56001	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	117635665	117635786	117635726	Y	DOCK11	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	7804	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	2.2240234119491
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	131625337	131625543	131625484	Y	MBNL3	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2C	273866	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	134567184	134567298	134567231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	85286	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	140904151	140904173	140904162	Y	MAGEC3	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEC2	386903	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	147597431	147597520	147597476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U40455.1	319033	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	150071015	150071211	150071113	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	5726	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	PNMA5	NA	NA	NA	NA	PNMA5	32915	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	153308986	153309188	153309114	Y	NA	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25555	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrX	154365480	154365529	154365504	Y	NA	MTCP1	NA	NA	NA	NA	MTCP1	8683	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAGE	T3M-3	hg19	FANTOM5	0.22240234119491