chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	TNFRSF18,TNFRSF4,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	2925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.28037620572016
chr1	2989176	2989511	2989234	Y	PRDM16	LINC00982,PRDM16	NA	NA	NA	NA	PRDM16	5444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3165725	3166065	3165768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM16	181993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3231111	3231335	3231228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	137655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3231556	3231634	3231595	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	137356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	3232812	3232866	3232839	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	136124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	3267475	3267612	3267544	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	101378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3325555	3326143	3325876	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	42847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	3582035	3582407	3582251	Y	WRAP73,TP73	RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	14710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3594206	3594277	3594248	Y	MEGF6,WRAP73,TP73,TP73	TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	26881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	3844625	3844991	3844786	Y	WRAP73,TP73,CEP104,DFFB	C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	29768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	4736270	4736533	4736402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	921413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	6034742	6034859	6034801	Y	NA	NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	15674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	6566323	6566594	6566485	Y	NA	PLEKHG5,NOL9	NA	NA	NA	NA	PLEKHG5	11527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	7551468	7551846	7551701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	277483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	7947650	7947935	7947793	Y	TNFRSF9	NA	CAMTA1,VAMP3,PER3,UTS2,TNFRSF9	IMR90	Hi-C	24141950	PARK7	64416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	8215795	8215905	8215839	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	131427	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	8875055	8875165	8875110	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	RP11-558F24.4	NA	NA	NA	NA	RP11-558F24.4	14889	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10057852	10058069	10058032	Y	NA	RBP7,UBE4B	NA	NA	NA	NA	RBP7	2588	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	10127211	10127315	10127266	Y	KIF1B	UBE4B	NA	NA	NA	NA	UBE4B	36321	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10585199	10585569	10585453	Y	NA	NA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	54616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10695291	10695734	10695495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	158973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	10700424	10700580	10700499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	154127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10757179	10757344	10757262	Y	CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	97363	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10766390	10766837	10766608	Y	ANGPTL7,CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	87870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr1	10851136	10851604	10851471	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	3103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	14027926	14028325	14027982	Y	PRDM2,PRDM2,PRDM2	PRDM2	NA	NA	NA	NA	PRDM2	3233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	14992426	14992802	14992486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	69226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	15585400	15585822	15585467	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	13632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16030221	16030623	16030258	Y	NA	PLEKHM2	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	21394	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA2	8439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	19283819	19283997	19283911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	56544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	19699727	19700097	19699843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	62907	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	21618792	21618804	21618798	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	51193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	21664947	21665143	21665070	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	4854	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	21895072	21895699	21895173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	61214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	22233375	22233592	22233478	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	22271031	22271143	22271087	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	9241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	22275479	22275551	22275510	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	13689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	23035382	23035536	23035449	Y	NA	EPHB2	NA	NA	NA	NA	EPHB2	50	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	23123668	23124069	23123697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	88336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	23570880	23571232	23570959	Y	LOC729059	NA	LUZP1,HTR1D	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	68579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	24063897	24064210	24064053	Y	PNRC2,RPL11	RPL11,TCEB3,PITHD1	RPL11	IMR90	Hi-C	24141950	TCEB3	3435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	24968619	24968979	24968799	Y	RUNX3,SRRM1	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	12412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	25095502	25095845	25095665	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	25654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	26249033	26249281	26249192	Y	EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1	MIR3917,STMN1	STMN1,PAFAH2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STMN1	17551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	26617206	26617304	26617268	Y	SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	13539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.33009659155062
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.82318250789794
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	28011929	28012287	28012105	Y	NA	IFI6,FAM76A	STX12,FAM76A,PPP1R8,WASF2,IFI6	IMR90	Hi-C	24141950	IFI6	15200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4,SYNC	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33463690	33463885	33463767	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	35404	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	34543968	34544295	34544132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	607722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	35294449	35294485	35294467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP3	98701	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	149935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	39598118	39598362	39598293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53130	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	40848967	40849502	40849291	Y	MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	40445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	41178788	41178979	41178866	Y	ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC	RIMS3,NFYC	KCNQ4	IMR90	Hi-C	24141950	NFYC	23468	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	41962532	41962651	41962593	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	14188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	15790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	44428103	44428423	44428269	Y	SLC6A9,RNF220,IPO13	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	5249	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	46712372	46712767	46712489	Y	NSUN4	POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	RAD54L	1012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	160001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	51198410	51198537	51198468	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	45475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	51215461	51215472	51215465	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	28540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	1576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	17715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	51383145	51383423	51383398	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	FAF1	40512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	51442122	51442408	51442227	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	17705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	124050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	53403571	53403705	53403636	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	SCP2	12670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	53482500	53482782	53482682	Y	NA	PODN	NA	NA	NA	NA	PODN	43072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	31319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54810685	54810861	54810859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	66291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	54875187	54875373	54875227	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	1779	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr1	54965120	54965643	54965198	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	87968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	55650535	55650650	55650593	Y	NA	USP24	NA	NA	NA	NA	USP24	28136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	55725974	55726130	55726052	Y	NA	USP24	USP24,LOC100507634,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	47188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	56795630	56795935	56795823	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	1116844	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	57024882	57025247	57025166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP24	1346096	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	58002362	58002542	58002370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB1	1007864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	59509588	59509786	59509693	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	250524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	60009140	60009290	60009214	Y	CYP2J2	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	248830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	60036299	60036428	60036353	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	275989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	60140214	60140519	60140375	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	379904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61516303	61516687	61516329	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	187372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr1	61662774	61662930	61662815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	333843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61707460	61707670	61707565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	378529	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61768031	61768305	61768169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	420790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	63022251	63022602	63022448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	122283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	NA	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	CFL1P3	109881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	65364183	65364439	65364282	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	65748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	RP4-535B20.1	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	RP4-535B20.1	3564	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	65639675	65639734	65639705	Y	NA	AK4	NA	NA	NA	NA	AK4	28443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	66736293	66736539	66736358	Y	PDE4B,PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	652031	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	68640572	68640736	68640689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	68647153	68647165	68647159	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	49638	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	68663588	68663867	68663728	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	32936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	70877943	70877992	70877968	Y	CTH	CTH	NA	NA	NA	NA	CTH	3042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	72108174	72108241	72108208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	563167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	72493439	72493635	72493537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	948432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	73859450	73859778	73859467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ3	802093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	75628708	75628719	75628713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	431616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	76436424	76436782	76436603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	101622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	78298815	78299027	78298921	Y	NA	NA	NEXN	IMR90	Hi-C	24141950	FAM73A	55506	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	79950404	79950778	79950591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-887A10.1	1048662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	80339305	80339338	80339322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-887A10.1	660102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	80973840	80974001	80973921	Y	NA	RP5-887A10.1	NA	NA	NA	NA	RP5-887A10.1	25439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.37981697738107
chr1	81240939	81241123	81241017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-887A10.1	241499	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	81344955	81344988	81344971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	327265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr1	81354544	81354946	81354833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	317307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr1	81392291	81392542	81392410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	279711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	81398342	81398354	81398348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	273899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	81507423	81507779	81507601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	164474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	81608226	81608235	81608231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	64018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	81692088	81692450	81692146	Y	NA	RP3-445O10.1	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	19835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	81773648	81773921	81773744	Y	NA	LPHN2	NA	NA	NA	NA	LPHN2	3803	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.59252668800823
chr1	81927696	81927980	81927837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN2	157851	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	81941853	81942198	81942026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN2	172008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	82026431	82026771	82026601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	158607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	82103600	82103612	82103605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	81766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr1	82146044	82146302	82146156	Y	NA	ST13P20	NA	NA	NA	NA	ST13P20	39076	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr1	82168687	82169067	82168779	Y	NA	ST13P20	NA	NA	NA	NA	ST13P20	16311	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	83069152	83069462	83069307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	883774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	83530346	83530531	83530439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	1011214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	420931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	84410654	84410770	84410712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	130975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	7476	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	85614354	85614436	85614429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf52	108919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	NA	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf52	79768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf52	55440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	85695505	85695602	85695542	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	C1orf52	27753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	85950230	85950550	85950520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	91383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	87311891	87312243	87312067	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	SEP15	65864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	87359712	87359873	87359793	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	18234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	88150561	88150732	88150650	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	358410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	89167079	89167239	89167155	Y	GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	19174	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	89188530	89188764	89188647	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	40625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	89594590	89594813	89594736	Y	GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2	NA	NA	NA	NA	NA	GBP3	108013	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	92031978	92032064	92032021	Y	NA	RP11-91I11.1	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91I11.1	31664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	119515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	92668364	92668570	92668467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP2	93952	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	93170902	93171289	93171144	Y	NA	RNU4-59P	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	6411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	152203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94309612	94309956	94309784	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	MIR760	432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94332093	94332098	94332096	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	DNTTIP2	11376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94429275	94429464	94429371	Y	GCLM	NA	ABCA4,ARHGAP29	IMR90	Hi-C	24141950	GCLM	56309	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	114649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	95221261	95221551	95221307	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	CNN3	169283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	95256087	95256223	95256110	Y	NA	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	CNN3	134611	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	509289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX7	518774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	100915125	100915584	100915294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	106541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	104525002	104525023	104525013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364B6.2	88609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	105668101	105668429	105668265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364B6.2	1054469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	107684770	107685020	107684841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	87503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	107767992	107768000	107767996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	170725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	108441090	108441173	108441132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	300298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	45193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	SCARNA2	53090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	111186366	111186880	111186713	Y	NA	KCNA3	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	KCNA3	28775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	111230020	111230418	111230220	Y	LRIF1,CD53	KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	14365	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	111251861	111252073	111251987	Y	LRIF1,CD53	KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	36206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	DRAM2	48396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	112015702	112015900	112015801	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	25704	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.90467717029629
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	115025085	115025405	115025244	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	26376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	116291091	116291334	116291215	Y	CASQ2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	108517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	116321345	116321551	116321511	Y	NA	NA	CASQ2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	138771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	119450998	119451282	119451141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX15	78897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	119668351	119668628	119668490	Y	WARS2	RP11-418J17.1,WARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	12391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	142538903	142539547	142539454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	1605261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	145042783	145043227	145042898	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22B	50993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	GPR89B	53452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P,CA14	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	150231710	150231944	150231778	Y	ECM1,CA14	ANP32E,RNU2-17P,CA14,C1orf54,APH1A,C1orf51,MRPS21	NA	NA	NA	NA	CA14	4156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT	74139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	152626575	152626861	152626670	Y	NA	NA	LCE2B	IMR90	Hi-C	24141950	HMGN3P1	256522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	153702935	153703414	153703046	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	4392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	154166147	154166533	154166338	Y	NUP210L,TDRD10,CHRNB2,C1orf189	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	1023	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	154584095	154584221	154584156	Y	NA	CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	14254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	154587281	154587469	154587375	Y	NA	CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	11006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155052148	155052357	155052334	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	17924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	86518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155568911	155569221	155569066	Y	ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6	FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-29H23.6	9858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	155757099	155757186	155757142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GON4L	70005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	158370656	158370973	158370778	Y	CD1B,CD1E,OR6N1,OR6K3,OR10T2,OR10K1	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	225111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	158789355	158789655	158789435	Y	PYHIN1,IFI16,MNDA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	178103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	158808262	158808538	158808444	Y	IFI16	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	159220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.9364514468642
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	106847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	162518132	162518252	162518187	Y	HSD17B7,SH2D1B,UHMK1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	11071	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	163588435	163588629	163588532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS5	298858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	164289956	164290255	164290071	Y	NA	HMGB3P6	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	33749	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	164736884	164737252	164737025	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	214063	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	165345662	165345996	165345868	Y	NA	NA	LRRC52,LOC400794	IMR90	Hi-C	24141950	RXRG	66437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	167135568	167135867	167135776	Y	NA	RP11-277B15.1	CD247,POU2F1,GPA33	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-277B15.1	5494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	167458424	167459120	167459000	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	61884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	167461792	167462175	167462164	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	58829	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	167586596	167587245	167587123	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	NA	RCSD1	IMR90	Hi-C	24141950	CREG1	65592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	168467604	168467716	168467660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	219326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351971	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173370600	173370810	173370705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	73595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173384654	173384941	173384742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	59464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173392092	173392451	173392272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	51954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	176024233	176024593	176024503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	135122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	176244494	176244887	176244692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	69710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	178550500	178550885	178550674	Y	RALGPS2	NA	C1orf220,MIR4424,RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B	IMR90	Hi-C	24141950	RALGPS2	141415	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	178986906	178987226	178987066	Y	NA	FAM20B	RALGPS2,C1orf220,FAM20B,RASAL2,C1orf49,ABL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM20B	5713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	179734817	179735116	179734826	Y	FAM163A	NA	NA	NA	NA	NA	TOR1AIP2	109822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	180251899	180252130	180252121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	129930	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	182116340	182116866	182116523	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	242475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	75584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	184724887	184725142	184725036	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	2840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	184758240	184758595	184758304	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	36193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	185032022	185032401	185032047	Y	SWT1,SWT1,IVNS1ABP,RNF2	RNF2	NA	NA	NA	NA	RNF2	19526	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	186445429	186445441	186445438	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	102539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	186623829	186624230	186624111	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	280939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	186975833	186976078	186975958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	632943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	2396896	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	190678395	190678750	190678573	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	2004563	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	192733103	192733287	192733192	Y	RGS13	MIR4426,RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	42882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	192914637	192914772	192914747	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	71522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	193448401	193448721	193448536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	359254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	194258819	194259202	194259053	Y	NA	NA	CDC73,B3GALT2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC73	1169672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	196867253	196867632	196867443	Y	ZBTB41,F13B,CFHR3	NA	NA	NA	NA	NA	ASPM	246192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr1	198431538	198431860	198431694	Y	NA	NA	NEK7,PTPRC	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	307445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	198591244	198591462	198591360	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	467151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	513772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	200448306	200448569	200448314	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2,ZNF281	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF281	71122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	200831452	200831819	200831500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	124766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	202216987	202217221	202217073	Y	UBE2T	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	91887	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	203723839	203723956	203723897	Y	NA	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	38826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	203965652	203965916	203965843	Y	NA	NA	ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13	IMR90	Hi-C	24141950	SOX13	74327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK18	61145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	205442172	205442546	205442359	Y	CNTN2,TMEM81	CDK18	KLHDC8A,NUAK2,MIR135B,LOC284576,LEMD1,CDK18	IMR90	Hi-C	24141950	CDK18	29177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	206961206	206961566	206961310	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	IL10,DYRK3,MAPKAPK2,IL19,FAIM3,EIF2D,IL20	IMR90	Hi-C	24141950	MAPKAPK2	104917	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	207823430	207823599	207823565	Y	CR1L	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	99803	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	209570810	209570947	209570869	Y	NA	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	131242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	G0S2	NA	NA	NA	NA	G0S2	15739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	209934463	209934573	209934515	Y	LAMB3,G0S2	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	21331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	211210840	211210858	211210848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	133961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	211964831	211965131	211964981	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	36983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	212723252	212723516	212723384	Y	BATF3,ATF3	ATF3	ATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	13160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	213160414	213160619	213160568	Y	VASH2	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	ANGEL2	26549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	213500745	213500914	213500832	Y	RPS6KC1	NA	PROX1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KC1	278156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	219263975	219264292	219264207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	219722653	219722988	219722821	Y	NA	NA	RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	377467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	220359525	220359939	220359742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	64973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	220671702	220671851	220671777	Y	MARK1	MARK1	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	MARK1	27717	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	221050798	221050949	221050931	Y	HLX	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	1099	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	221135331	221135824	221135593	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	85632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	222767372	222767396	222767384	Y	NA	RP11-378J18.3,TAF1A,MIA3	NA	NA	NA	NA	TAF1A	6097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	17.3203863662025
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	224633276	224633598	224633406	Y	NA	WDR26	WDR26,FBXO28,CNIH4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	10541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226430284	226430401	226430343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	57853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	226867580	226868182	226867972	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	56842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226878935	226879345	226879207	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	45679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.19888154332181
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	111200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	228878269	228878481	228878411	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	205507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	228917012	228917506	228917078	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RNF187	244250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	230289705	230290142	230289903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	98169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	230978470	230978520	230978495	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	24815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	108200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	232356410	232356670	232356613	Y	NA	NA	SIPA1L2,TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	DISC1	595849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	233250723	233251216	233250828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	166372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	234548581	234548830	234548706	Y	NA	RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	41242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	234668851	234669143	234668986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	56002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	234692762	234692816	234692790	Y	NA	NA	LOC100506795,TARBP1,IRF2BP2,LOC100506810,TOMM20,RBM34,ARID4B	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	50455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	234887087	234887295	234887193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	143816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	SNORA14B,TOMM20	NA	NA	NA	NA	SNORA14B	21508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	235468267	235468477	235468372	Y	NA	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	20188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	235468552	235468724	235468640	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	19941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	237029172	237029469	237029246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	72562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	240565334	240565372	240565353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-467I20.3	232980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	241441480	241441685	241441535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FH	239376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243428005	243428394	243428166	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	10685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243561226	243561616	243561338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	143906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	243637125	243637295	243637255	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	219805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr1	243641103	243641443	243641320	Y	CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	223783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243654647	243654885	243654744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	237327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243781710	243782079	243781895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	230302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243806306	243806448	243806376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	205933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243853401	243853550	243853530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	158831	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243876652	243876733	243876693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	135648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	118396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243894639	243895081	243894755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	117300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr1	244011895	244012034	244011933	Y	NA	AKT3	LOC339529	IMR90	Hi-C	24141950	AKT3	347	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	42384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	10.2347737618469
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	40898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	38427	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr1	244358533	244358670	244358632	Y	ZNF238	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278H7.4	104205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	244373439	244373613	244373526	Y	NA	NA	AKT3,ZNF238,SDCCAG8,LOC339529	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278H7.4	119111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr1	244417754	244418100	244418029	Y	AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS	NA	LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278H7.4	163426	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	244439620	244440012	244439977	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	173424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	244459696	244459909	244459803	Y	NA	NA	SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	153527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	150337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr1	244517098	244517541	244517376	Y	ADSS	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	95895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	244525463	244525578	244525509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	87858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	245082176	245082355	245082237	Y	EFCAB2	EFCAB2	SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	48652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	728552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	246129057	246129404	246129358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	539210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	246316735	246316955	246316845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	246456441	246456840	246456713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	211774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	247038123	247038250	247038187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	55030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	247325578	247326237	247325673	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	37125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	587865	588161	588097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	145522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	652657	652929	652820	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	80754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	3568141	3568290	3568192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	257183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	3782727	3783283	3782915	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	74599	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	6051095	6051553	6051345	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	77397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	7227327	7227801	7227548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	223649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	7275320	7275743	7275581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	175707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	7277177	7277507	7277289	Y	ITIH2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	173943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr10	7667725	7668107	7668024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	159883	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	9139521	9139818	9139671	Y	NA	NA	TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	TAF3	1281054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	10413071	10413088	10413080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1238665	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	12987890	12988351	12988184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	151098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM107B	367438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	172933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	15386960	15387149	15387011	Y	NMT2	FAM171A1	NA	NA	NA	NA	FAM171A1	23912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	20126415	20126499	20126449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1180081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	21795346	21795467	21795386	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	25627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	21799318	21799715	21799601	Y	C10orf113	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	21379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.67402135040658
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	25211297	25211494	25211421	Y	NA	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	28039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr10	26979611	26980015	26979930	Y	MASTL,ABI1,PDSS1	PDSS1	PDSS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDSS1	4573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	27027283	27027887	27027754	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	27130056	27130389	27130223	Y	NA	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	17627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr10	29615988	29616104	29616046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	80227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	30859701	30859874	30859760	Y	MAP3K8,ZNF438,ZNF438	NA	LOC729668	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	138835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	31205866	31205987	31205927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1	399437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	33291145	33291309	33291227	Y	NA	ITGB1	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	1411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	33813070	33813283	33813158	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	189880	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	34421241	34421398	34421321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	529631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	35098240	35098611	35098558	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	3642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.5,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	42400063	42400397	42400233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	565291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	42737855	42738010	42737875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	227678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	RET,CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	RET	30420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr10	43818292	43818511	43818402	Y	NA	NA	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPF	84103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	44973584	44973727	44973656	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,ZNF32-AS3	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL12	93643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	45374285	45374680	45374305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF4	78175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	45870250	45870628	45870301	Y	FAM21C,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH8	217726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	82137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	52082649	52082859	52082782	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	52300578	52300747	52300601	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	82176	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	54737961	54738286	54738123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1280606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	59607173	59607244	59607231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	418450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	60727421	60727594	60727472	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	456521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	62307595	62307995	62307795	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	228094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63150806	63151275	63151001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM26	59933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63208013	63208392	63208203	Y	ARID5B,TMEM26	TMEM26	NA	NA	NA	NA	TMEM26	2816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63225634	63225799	63225694	Y	ARID5B	TMEM26	ARID5B,TMEM26	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM26	14426	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63596779	63597177	63597154	Y	NA	NA	RHOBTB1,C10orf107,ARID5B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID5B	61882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63657527	63657737	63657668	Y	ARID5B	ARID5B	C10orf107,ARID5B	IMR90	Hi-C	24141950	ARID5B	1322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63658924	63659147	63659031	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr10	63697389	63697783	63697593	Y	NA	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	38330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr10	63697847	63698199	63697988	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	38788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr10	63703432	63703559	63703511	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	44373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	77361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr10	63753079	63753613	63753266	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	94020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63779948	63780456	63780395	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	120889	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63803306	63803648	63803427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	144247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr10	63805040	63805237	63805084	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	145981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63805800	63806070	63805931	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	146741	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	63806320	63806697	63806416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	147261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr10	63807017	63807353	63807186	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	147958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	63979384	63979550	63979547	Y	NA	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	46916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	64004719	64005076	64004899	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	21390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	35827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	66294853	66295258	66294869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	633848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr10	70807891	70808112	70808012	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	37750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	72117206	72117607	72117506	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	LRRC20	22775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr10	73288216	73288446	73288322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH23	133525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr10	73313455	73313899	73313820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH23	158764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	73887320	73887439	73887380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	60260	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	74544491	74544662	74544597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCU	94602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	74850921	74850988	74850953	Y	ANXA7,ECD	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	3744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	74991679	74992005	74991988	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	14615	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	75337715	75337998	75337857	Y	CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54	NA	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	83933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	75408900	75409185	75408963	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	AGAP5	NA	NA	NA	NA	AGAP5	46454	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	75625574	75625826	75625627	Y	CAMK2G,KIAA0913	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	6517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	76633406	76633470	76633438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	50066	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF503	388581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	78858331	78858440	78858373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	825938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79268227	79268357	79268284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	416021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79559143	79559449	79559282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	124929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	81071549	81071690	81071644	Y	ZMIZ1,ZCCHC24,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	81105192	81105332	81105235	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	85609014	85609374	85609152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	229811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	86152070	86152317	86152175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	165882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	88183544	88183868	88183698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	59294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	88471893	88472403	88472354	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42004	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	90704546	90704848	90704768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	336674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	91010610	91010883	91010698	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	30639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	91056148	91056487	91056304	Y	FAS,IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	3225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	91073442	91073645	91073541	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3	IMR90	Hi-C	24141950	IFIT3	12006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	91096041	91096297	91096218	Y	IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1	IFIT2,IFIT3,IFIT1B	NA	NA	NA	NA	IFIT3	10390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	91127158	91127607	91127378	Y	NA	IFIT3,IFIT1B,IFIT1,LIPA,IFIT5	LIPA,IFIT2,IFIT1B,SLC16A12,PANK1	IMR90	Hi-C	24141950	IFIT1B	8206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	97809290	97809583	97809571	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	8139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	99167112	99167183	99167148	Y	NA	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RRP12	7985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	100993810	100993952	100993927	Y	NA	HPSE2	NA	NA	NA	NA	HPSE2	191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr10	101048499	101048591	101048547	Y	NA	CNNM1	NA	NA	NA	NA	CNNM1	38265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101105244	101105424	101105335	Y	NA	CNNM1	NA	NA	NA	NA	CNNM1	18388	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101417166	101417530	101417347	Y	NA	SLC25A28,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	101774105	101774391	101774304	Y	NA	DNMBP	CUTC,COX15,ABCC2,DNMBP,DNMBP-AS1,CPN1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMBP	6429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	101873975	101874319	101874110	Y	NA	NA	CPN1,ERLIN1,CHUK	IMR90	Hi-C	24141950	ERLIN1	71772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	102245055	102245685	102245323	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	41144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	103662146	103662497	103662405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGEA5	85450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	103876632	103876931	103876782	Y	NA	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	1279	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	105427179	105427487	105427329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	185814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	106109390	106109845	106109501	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	ITPRIP	13228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	112051912	112052490	112052119	Y	ADD3,MXI1	SMNDC1	NA	NA	NA	NA	SMNDC1	10219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	114385835	114385842	114385839	Y	GPAM,TECTB	NA	NA	NA	NA	NA	VTI1A	181079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	117936217	117936402	117936310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf82	491373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	118922718	118922822	118922754	Y	VAX1	KIAA1598,VAX1	NA	NA	NA	NA	VAX1	26906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	47730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	122844342	122844508	122844416	Y	NA	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	46729	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	122918665	122919069	122918920	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	27428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	123313040	123313152	123313149	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	42820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	123707273	123707432	123707353	Y	PLEKHA1,BTBD16	ATE1-AS1,ATE1,NSMCE4A,TACC2	NA	NA	NA	NA	ATE1	20957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	123763910	123763923	123763917	Y	TACC2	NSMCE4A,TACC2	NA	NA	NA	NA	TACC2	17221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	125188443	125188580	125188505	Y	C10orf88	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	276650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126329186	126329692	126329619	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	101146	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126330634	126331273	126330949	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	99565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126360075	126360476	126360334	Y	LHPP,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	70362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126383553	126383804	126383719	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	47034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126406559	126407126	126406852	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	23712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	126717665	126717735	126717700	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	113953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	127576777	127576887	127576832	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	127587236	127587432	127587340	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	4128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	127919956	127919968	127919963	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	336848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	130019475	130019749	130019593	Y	PTPRE,PTPRE	NA	EBF3	IMR90	Hi-C	24141950	MKI67	96826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	132099901	132100191	132100002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	167238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	133742915	133743140	133742982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	50295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	4120	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	29754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	RP11-432J24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	36029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr10	135329777	135330170	135329974	Y	NA	NA	LOC619207,SYCE1	IMR90	Hi-C	24141950	MTG1	124179	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	268826	269269	268945	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	3118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	ANO9,PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	DRD4	NA	NA	NA	NA	DRD4	5723	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	1768025	1768222	1768084	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	10059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	3021368	3021548	3021402	Y	NA	NAP1L4,RNU1-91P	NAP1L4	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4	9761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	4129900	4130200	4130091	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	15963	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	6435035	6435285	6435179	Y	NA	SMPD1,APBB1	NA	NA	NA	NA	APBB1	3359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	9824167	9824574	9824403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	140543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	309512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	10397619	10397698	10397657	Y	AMPD3	NA	SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	73392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	11899555	11899888	11899585	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	38585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	13468446	13468721	13468666	Y	NA	BTBD10	NA	NA	NA	NA	BTBD10	14123	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	15219194	15219222	15219209	Y	INSC	NA	NA	NA	NA	NA	CALCB	294651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	16121256	16121272	16121264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	511407	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHC	5256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	19440729	19441084	19440796	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	E2F8	179562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	21647694	21647826	21647760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC103801.2	997034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	24448444	24448604	24448524	Y	NA	NA	LOC100500938	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-787P24.1	1025093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	359607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	138674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	31835564	31835985	31835634	Y	NA	RCN1,PAX6	NA	NA	NA	NA	PAX6	1524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr11	31838721	31838861	31838791	Y	NA	RCN1,PAX6	NA	NA	NA	NA	PAX6	1212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	32728667	32728946	32728768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	125323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr11	33074022	33074030	33074026	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	15059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	34084271	34084310	34084291	Y	NA	CAPRIN1,NAT10	NA	NA	NA	NA	CAPRIN1	13041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	35105542	35105874	35105596	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	35395403	35395808	35395629	Y	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	236986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	35880819	35881135	35880959	Y	NA	NA	FJX1,LDLRAD3,PRR5L,COMMD9,TRIM44,PAMR1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAD3	82396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	36052486	36052576	36052531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	88955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	43596990	43597530	43597260	Y	NA	HSD17B12,MIR129-2	NA	NA	NA	NA	MIR129-2	3414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX4	89548	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	44306158	44306224	44306191	Y	ALX4	ALX4	NA	NA	NA	NA	ALX4	23492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	ALX4	NA	NA	NA	NA	ALX4	2390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr11	44359184	44359364	44359336	Y	ALX4	ALX4	EXT2	IMR90	Hi-C	24141950	ALX4	29468	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.56075241144033
chr11	44487107	44487237	44487172	Y	NA	NA	EXT2	IMR90	Hi-C	24141950	CD82	96740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	44592209	44592382	44592320	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	8232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	46085573	46085592	46085583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	55393	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr11	47402161	47402584	47402458	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	NA	NA	NA	NA	SLC39A13	24099	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	48040170	48040457	48040234	Y	NA	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	40057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr11	48125955	48126160	48126043	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	125842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	57371918	57372022	57371970	Y	SLC43A1,SERPING1	UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1	NA	NA	NA	NA	SERPING1	9058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	58991167	58991369	58991315	Y	FAM111A,MPEG1,PATL1	NA	NA	NA	NA	NA	DTX4	54264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.61047279727078
chr11	61786548	61786990	61786612	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3,FADS2,RAB3IL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	53416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	63350815	63351029	63350927	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	48534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr11	63370762	63370914	63370825	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	NA	ATL3	66479	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	45217	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr11	64416675	64417001	64416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN2	71659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	16.0082358839144
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	GAL3ST3,SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	66094685	66094783	66094735	Y	CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248	YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	7528	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	SPTBN2,C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	83	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	68099033	68099353	68099110	Y	NA	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	20956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	68140094	68140551	68140382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	62017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	69296310	69296479	69296388	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	157376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr11	69965939	69966135	69966116	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	43531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	70107513	70107580	70107548	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	7226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1,PHOX2A	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	PHOX2A	NA	NA	NA	NA	PHOX2A	48427	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	73134039	73134350	73134132	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	48730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	78571472	78571494	78571483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	287553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	78823414	78823685	78823657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	539495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	79149040	79149340	79149145	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	865121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	79742394	79742706	79742544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1458475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	79881401	79881554	79881478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1597482	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	80458246	80458570	80458327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1940001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	80935056	80935337	80935195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1463234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	81132350	81132370	81132360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1266201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	81299469	81299692	81299581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1098879	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	81696174	81696306	81696246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	702265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	82270737	82270937	82270817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	127634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	82610096	82610395	82610239	Y	PCF11,ANKRD42,RAB30	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	1079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	83337920	83338003	83337962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	342470	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	83465602	83465658	83465617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	470152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	85451857	85452132	85451995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC89	56537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC89	68592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	85768953	85769276	85769115	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	9648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	86214866	86215096	86214981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	203613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD4	212550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	1294358	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	88340070	88340128	88340099	Y	GRM5	NA	NA	NA	NA	NA	FOLH1B	1029555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	90492070	90492284	90492177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	478342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	91252482	91252645	91252564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	1238754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	91338604	91338624	91338614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	1324876	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	91980380	91980674	91980445	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	948456	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	94043254	94043274	94043263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD49	181521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	95745158	95745721	95745455	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	88679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr11	95746570	95746792	95746680	Y	FAM76B	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	90091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95749380	95749532	95749413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	92901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95778897	95779169	95779022	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	122418	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95801750	95802104	95801927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	145271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95838694	95838939	95838802	Y	FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	182215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95886290	95886343	95886317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	188001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95890101	95890693	95890420	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	183651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95906618	95906816	95906767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	167528	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95940732	95941197	95941091	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	133147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	95991442	95991675	95991614	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	82669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95994127	95994433	95994401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	79911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	95996412	95996766	95996624	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	77578	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	96072423	96072630	96072557	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	1714	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	96104891	96105001	96104961	Y	NA	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	CCDC82	16086	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	103281581	103281752	103281672	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	3196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	104576314	104576795	104576668	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-55P	1116565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	107187292	107187599	107187573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWF19L2	138973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	107555925	107556135	107556030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH8	121453	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	113071638	113071808	113071709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	111443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	114049941	114050567	114050227	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	75942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	114086670	114086890	114086745	Y	ZBTB16,ZBTB16	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	39619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	114288977	114289308	114289144	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	18800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	117879327	117879545	117879418	Y	AMICA1,AMICA1,IL10RA	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS4	66208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	118051304	118051408	118051361	Y	DSCAML1,FXYD6,FXYD6,TMEM25,SCN4B,SCN4B,SCN2B	SCN4B	NA	NA	NA	NA	SCN4B	29701	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	119124696	119124715	119124706	Y	NA	CBL	NA	NA	NA	NA	CBL	49944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	119303432	119303782	119303458	Y	NA	THY1	NA	NA	NA	NA	THY1	9737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	122100461	122100655	122100524	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	190924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	123293400	123293723	123293427	Y	NA	AP000783.1	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	AP000783.1	5335	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	123945702	123946055	123945778	Y	OR8B12,VWA5A	NA	VWA5A,OR8G1,OR8D2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-21P	313067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	124062644	124062948	124062749	Y	OR6X1,OR6M1,OR8D4,OR4D5,OR6T1,OR10G4,OR10G7,VWA5A,OR8D2,OR8B12,OR8A1,OR8D1,OR8B8,TBRG1,OR8G2,OR8G1	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	427784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	124514246	124514548	124514258	Y	OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1,SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	TBRG1	23514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN	NA	NA	NA	NA	NRGN	31147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGN	61146	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	125036511	125036895	125036831	Y	NA	PKNOX2	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	3928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	125145861	125146105	125145988	Y	PKNOX2,FEZ1	NA	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	113278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	125904022	125904031	125904027	Y	NA	CDON,NAP1L1P1	NA	NA	NA	NA	CDON	27199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON,NAP1L1P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L1P1	2454	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	126286483	126286630	126286572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	62948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	126542781	126542871	126542855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	319246	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	127859699	127859802	127859739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	595651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	128096140	128096386	128096280	Y	NA	NA	FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	359067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	128132461	128132807	128132596	Y	NA	NA	KCNJ1,FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	322646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	128149754	128150077	128149906	Y	NA	NA	KCNJ1,FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	305376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr11	129913538	129913657	129913598	Y	APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	PRDM10,LINC00167,APLP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCEB2P2	12423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	131759058	131759559	131759199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	974654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	131924772	131924995	131924886	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1140368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	132227815	132227948	132227882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1443411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	132411283	132411428	132411357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1413452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr11	133620300	133620334	133620319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	204546	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	133874244	133874525	133874385	Y	B3GAT1	IGSF9B,RP11-713P17.3	JAM3,NCAPD3,IGSF9B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-713P17.3	25642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	133940508	133940868	133940637	Y	NA	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	3688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr11	133969165	133969269	133969217	Y	IGSF9B	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	32345	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	726826	727017	726943	Y	CCDC77,KDM5A,WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	WNK1	132742	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1387073	1387485	1387229	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	249572	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1759390	1759637	1759510	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	36103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1769144	1769497	1769318	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	26243	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B,RP5-1096D14.6	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1096D14.6	32445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	2547305	2547477	2547330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX3P4	353984	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	2724856	2725100	2724978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX3P4	176361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	3216295	3216423	3216359	Y	NA	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	31774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	3913952	3914004	3913978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP11	66604	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	4378284	4379414	4378568	Y	PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5	CCND2,C12orf5	PARP11	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	1524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	717175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	LPCAT3	19454	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	9065319	9065715	9065510	Y	PHC1	PHC1,M6PR	M6PR	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	9982493	9982805	9982658	Y	KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	183888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	187978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	56603	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	10336326	10336485	10336379	Y	CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,CLEC7A,OLR1	GABARAPL1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	26572	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	11806275	11806670	11806607	Y	BCL2L14,ETV6	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	5487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	11966137	11966507	11966203	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	165349	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	12221594	12221959	12221771	Y	DUSP16,ETV6,BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	40138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.9364514468642
chr12	12512304	12512319	12512312	Y	NA	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	4291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	12599819	12600045	12599926	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	91806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	GPR19,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	13213632	13213789	13213702	Y	DUSP16	KIAA1467	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	18414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	13817220	13817383	13817356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	469570	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	43092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	46037	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	STRAP	133595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	22195948	22196249	22196127	Y	NA	CMAS	NA	NA	NA	NA	CMAS	859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	22531570	22531607	22531589	Y	ABCC9	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	244402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	24202643	24202921	24202736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	897472	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	426587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	24861897	24862673	24862248	Y	BCAT1	NA	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	BCAT1	237720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	24972596	24972806	24972748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	127587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	25075175	25075409	25075293	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	24984	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr12	26495152	26495452	26495369	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF8	385190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	26512613	26512980	26512754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF8	402651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	27931494	27931809	27931627	Y	MANSC4	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS35	69788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	RP11-993B23.3,PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	3520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	28126453	28126843	28126791	Y	PTHLH,PTHLH	RP11-993B23.3,PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	2815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.59252668800823
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	RP11-993B23.3,PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	4329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	28128658	28128812	28128736	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	RP11-993B23.3,PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	5020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.21682765258436
chr12	28141959	28142165	28142081	Y	NA	RP11-993B23.3,PTHLH	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	18321	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr12	28176067	28176342	28176190	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	52429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	28186002	28186387	28186254	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	PTHLH	62364	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	28221546	28221662	28221604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	62520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr12	28275745	28275985	28275876	Y	NA	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	8197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	28433746	28433796	28433771	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	36600	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	28814319	28814559	28814439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	343923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr12	28945998	28946288	28946143	Y	NA	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	353748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	29317763	29317994	29317897	Y	NA	FAR2	NA	NA	NA	NA	FAR2	17727	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	29555065	29555315	29555211	Y	NA	ERGIC2	IPO8	IMR90	Hi-C	24141950	ERGIC2	22943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	29601520	29601624	29601572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	69398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	29859887	29860252	29860216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	327765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	30975226	30975478	30975347	Y	NA	LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	29249	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	33740370	33740630	33740504	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ALG10	432586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	42734111	42734478	42734288	Y	NA	ZCRB1	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	16191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	44463301	44463607	44463454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	235531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	46398489	46398694	46398592	Y	NA	SCAF11	SCAF11	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAF11	14586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	47057089	47057400	47057270	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	281627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	47864120	47864410	47864280	Y	VDR	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP3	233434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	48227481	48227636	48227559	Y	OR10AD1	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	2566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	49370069	49370445	49370342	Y	NA	ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	RP11-386G11.5	19705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	50100082	50100376	50100305	Y	FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	FMNL3	134	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	50507967	50508334	50508141	Y	NA	SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	31212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	50955219	50955226	50955223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2B	58451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,POU6F1,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	POU6F1	1237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52184760	52184919	52184839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	158532	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	NA	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	80143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52418719	52418897	52418793	Y	NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	52512288	52512603	52512469	Y	NR4A1	NA	GRASP,NR4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C12orf44	51258	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	52596076	52596423	52596243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	135046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	54012118	54012371	54012242	Y	PFDN5	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	5828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	54052823	54053029	54052960	Y	NA	ATF7,ATP5G2	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	16163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr12	54147716	54148178	54147916	Y	ESPL1,HOXC4	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	28187	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	54150655	54151094	54151055	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	31126	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	54254611	54254885	54254855	Y	NA	NA	HOXC13,HOXC12,HOTAIR,LOC100240735,FLJ12825	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNORD81	71522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr12	54384983	54385161	54385072	Y	TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9	HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC9	1518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	54400746	54401119	54400931	Y	NA	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	54415475	54415883	54415632	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	8754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr12	54416528	54417002	54416575	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	7635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	54433983	54434162	54434078	Y	NA	HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	9346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	54444172	54444407	54444311	Y	ATF7,ATP5G2,HOXC12,HOXC11	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	1254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	54446030	54446105	54446068	Y	NA	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	369	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	59435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	59685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	55327074	55327342	55327157	Y	OR6C65,OR6C3,NCKAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1A	346631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10	299381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10	298940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	56193144	56193361	56193252	Y	OR6C3,OR6C75	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	SARNP	16179	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	56275045	56275257	56275151	Y	OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	RNU1-69P	8583	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	56323148	56323586	56323313	Y	PAN2,PAN2,DGKA	DGKA,WIBG,CDK2,PMEL,RAB5B	NA	NA	NA	NA	WIBG	816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	56434218	56434302	56434260	Y	OR6C4,OR10P1	IKZF4,RPS26	NA	NA	NA	NA	RPS26	581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4,GLS2	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	57735992	57736374	57736348	Y	NA	NA	R3HDM2	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	86414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM	NA	NA	NA	NA	RP11-571M6.15	4149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	60014088	60014384	60014181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	701785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	60943768	60943906	60943837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	1631465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	62396688	62396737	62396702	Y	FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	255382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	62608712	62608913	62608868	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	43206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	64718599	64718738	64718727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPOT	77392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	68758255	68758343	68758299	Y	NA	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	MDM2	105678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	69460304	69460567	69460397	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPSF6	170750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	70644560	70644959	70644584	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	9420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	70648828	70649035	70648891	Y	RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	13688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	17530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	76329256	76329552	76329445	Y	NA	NA	KRR1	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	147261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	NAP1L1	NA	NA	NA	NA	NAP1L1	47565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	77166025	77166335	77166180	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	10657	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	78134909	78135174	78135084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F7	677549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	83183951	83184023	83183988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	105292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	11.6781392923638
chr12	85793012	85793355	85793084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRIQ1	364920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	39.364514468642
chr12	86051841	86052071	86051956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF9	176277	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	89552353	89552693	89552524	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,LOC728084,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	192355	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	89960420	89960675	89960548	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNT4,POC1B-GALNT4	42381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	90065189	90065567	90065562	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	35510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	90252652	90252856	90252754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	151575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	91492793	91493056	91492930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	1044293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	91583363	91583659	91583511	Y	NA	NA	EPYC,DCN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-796E2.4	953690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	91960245	91960524	91960307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	576825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	92427755	92427874	92427825	Y	CLLU1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	109475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	92490612	92490822	92490679	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	46527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	92501411	92501848	92501769	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	35501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	93561648	93561951	93561715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	86197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	94241673	94241891	94241710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS2	280083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	95012768	95013068	95012914	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	161004	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	95069867	95070333	95070014	Y	TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	218103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	95198689	95198784	95198750	Y	NA	NA	TMCC3,PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA12	196762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	96311989	96312050	96312020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPF	61283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	96636403	96636783	96636456	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	50243	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	96752607	96752772	96752695	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	39566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	98857984	98858326	98858078	Y	NA	RNU4-41P,TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	48168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	99541793	99542207	99542018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	504874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	52982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	102257924	102257947	102257936	Y	DRAM1	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	102930045	102930144	102930098	Y	NA	NA	PARPBP,IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	NUP37	418143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	105620091	105620351	105620275	Y	APPL2	C12orf75,APPL2	NA	NA	NA	NA	C12orf75	6717	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	107856980	107857227	107857220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PWP1	220282	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr12	109032155	109032517	109032383	Y	NA	NA	ISCU,TMEM119,SELPLG	IMR90	Hi-C	24141950	ISCU	77797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	109058635	109058851	109058743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	64521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG	NA	NA	NA	NA	UNG	37197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	110517549	110517856	110517740	Y	GIT2,RAD9B,C12orf76	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	8058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	110687741	110688014	110687886	Y	TRPV4,ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2A2	28547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111473237	111473713	111473408	Y	CUX2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CC	294493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111870317	111870607	111870392	Y	NA	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	28565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	111939312	111939650	111939575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN2	95830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	158897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	180351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	117025032	117025071	117025052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf49	148804	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	117100450	117100717	117100699	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf49	73158	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	118744725	118745093	118744968	Y	TAOK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P5	62848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	120080327	120080462	120080395	Y	TMEM233	PRKAB1	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	23096	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	121021309	121021477	121021390	Y	NA	POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	4108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	121904317	121904475	121904368	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	NA	RNF34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF34	68473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	122014724	122015549	122015007	Y	NA	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	1148	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.57869852070288
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	122519763	122520228	122519936	Y	ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	5135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	123387713	123388070	123387892	Y	NA	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	8722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	124916261	124916578	124916546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	448636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	124963399	124963744	124963551	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	401470	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125049011	125049349	125049112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	315865	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	4761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	125765176	125765295	125765221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	95794	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	125940224	125940232	125940227	Y	TMEM132B	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	270842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr12	129296403	129296565	129296505	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4,GLT1D1	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	9963	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	129301742	129302776	129302427	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4,GLT1D1	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	3752	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	129325536	129325762	129325610	Y	SLC15A4	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLT1D1	10210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	130570935	130571227	130570972	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	750584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	130947882	130948028	130947955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	373783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38159	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	20771601	20771692	20771689	Y	NA	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	38413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	22107257	22107449	22107379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	75748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	24543608	24543809	24543709	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	82050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	24845538	24846279	24845979	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	238669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	24854044	24854200	24854080	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	230748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	26162153	26162401	26162277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A2	217944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	26475840	26476144	26475975	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	318647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	27166168	27166184	27166175	Y	GPR12,WASF3	WASF3	NA	NA	NA	NA	WASF3	36328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	28700289	28700313	28700301	Y	NA	PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	10330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	29106909	29107160	29107135	Y	NA	NA	FLT1,PAN3,POMP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF4A1P7	63810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	29185905	29186210	29186042	Y	POMP	EIF4A1P7,POMP	FLT1,PAN3,POMP	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	14935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	30812389	30812594	30812492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	55690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	LINC01058,UBE2L5P	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	11592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	201695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	32725009	32725223	32725116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	162388	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	33769448	33769840	33769616	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	152927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	34083894	34084135	34084032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	161127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr13	36648943	36649115	36648997	Y	DCLK1,CCNA1,C13orf38	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC169	220862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	37473939	37474133	37474036	Y	C13orf36,SMAD9	SMAD9,LAMTOR3P1	NA	NA	NA	NA	SMAD9	18769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	37493371	37493714	37493499	Y	C13orf36,RFXAP,SMAD9	SMAD9,LAMTOR3P1	NA	NA	NA	NA	SMAD9	469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr13	40435836	40436127	40435982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	208072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	41627549	41627939	41627788	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WBP4	5471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4	NA	NA	NA	NA	WBP4	18215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42397573	42397928	42397750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	214248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	92924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42849254	42849451	42849396	Y	TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	4965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	42969347	42969590	42969439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	125058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	217093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	143494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	43617981	43618110	43618046	Y	TNFSF11	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	22642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	44237239	44237376	44237308	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	121668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	717	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	44436870	44437053	44436962	Y	ENOX1	CCDC122	NA	NA	NA	NA	CCDC122	14774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	44620658	44620684	44620670	Y	ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZP1	80098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	45548667	45548813	45548740	Y	NA	NUFIP1	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	12805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	45813210	45813281	45813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	100199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	46102041	46102392	46102214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	64981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	46688680	46689111	46688972	Y	ZC3H13,LCP1	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	63786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	46761558	46761874	46761821	Y	SPERT	LRRC63	NA	NA	NA	NA	LRRC63	22209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	49288768	49288781	49288774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSME2P2	54483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	49478351	49478503	49478427	Y	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	69545	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	50209681	50209984	50209832	Y	SETDB2,ARL11	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB1	51962	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	50706824	50707012	50706949	Y	NA	DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	8968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	50796509	50797212	50796853	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	DLEU2	98653	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	100338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51168515	51168827	51168588	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	234616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51415871	51416175	51415964	Y	DLEU7	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	65639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	51508208	51508301	51508255	Y	NA	RNASEH2B,RNASEH2B-AS1	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B-AS1	25360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	152305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	51897423	51897587	51897505	Y	NA	NA	FAM124A,DHRS12	IMR90	Hi-C	24141950	FAM124A	102920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	LECT1	NA	NA	NA	NA	LECT1	24818	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	354332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	63626096	63626398	63626247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	2657505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	67168022	67168413	67168283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	5078786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4785473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	68308495	68308699	68308631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	3938500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	72375972	72376220	72376216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	128773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	172579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	73486233	73486587	73486410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3	131999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	73742042	73742346	73742194	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	21319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	73911808	73911975	73911903	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	148143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr13	73942793	73943059	73942972	Y	KLF5	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	179128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	73970792	73971367	73971051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	207127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr13	73982945	73982960	73982953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	219280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	221949	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.77346212206749
chr13	74184794	74185193	74184838	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	421129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	14.4336553051687
chr13	74276580	74276751	74276632	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	429643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	74339681	74339964	74339912	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	366430	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	75933518	75933672	75933595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	120578	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	76906421	76906696	76906559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	551844	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	77514522	77514674	77514588	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	39377	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	78090399	78090658	78090529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	191214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	79858157	79858217	79858187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM26-AS1	120227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	80267343	80267469	80267406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	214056	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	84515909	84516210	84516058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3602823	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	94216006	94216018	94216012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	196793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	95753354	95753450	95753358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	198237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	95938060	95938332	95938319	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	13355	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	96243281	96243667	96243475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1	51290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	97143722	97143959	97143730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	439986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	98921705	98921995	98921808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	128889	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	99068008	99068369	99068130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	159825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	99867739	99867834	99867779	Y	DOCK9,GPR18,CLYBL,UBAC2,UBAC2	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	1727	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	99880215	99880463	99880360	Y	GPR183	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	14203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	99957500	99957664	99957598	Y	DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	99991522	99991909	99991574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	125510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	100008605	100009044	100008755	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	142593	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	100010340	100010660	100010510	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	141011	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	102731343	102731405	102731389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	515948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	106751889	106752019	106751954	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	466493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	216448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr13	107170805	107171068	107170962	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	47444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	108978746	108978885	108978817	Y	LIG4,ABHD13,TNFSF13B	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	110019	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	108987608	108987753	108987666	Y	FAM155A	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	118881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	110055406	110055637	110055557	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	381278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	110969695	110970088	110969892	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	12199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	110972696	110972889	110972807	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	15200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111013776	111014136	111013979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	56280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111016537	111016818	111016564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	59041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111053318	111053466	111053369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	95822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111096220	111096502	111096363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	115578	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111116620	111116952	111116704	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	95128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	111174336	111174835	111174468	Y	ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	37245	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	111568618	111569036	111568957	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	3202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr13	113312485	113312628	113312557	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	30015	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L,MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	51806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr13	114322811	114323141	114322995	Y	GRK1	NA	NA	NA	NA	NA	TFDP1	85798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	114548051	114548420	114548108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFDP1	311038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr14	22115392	22115940	22115648	Y	RPGRIP1,SALL2	TRAV1-1,TRAV1-2	NA	NA	NA	NA	TRAV1-2	6283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	22467788	22467856	22467822	Y	OR10G3,OR10G2,OR4E2	TRAV17,TRAV18,TRAV20	NA	NA	NA	NA	TRAV18	1489	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr14	22642942	22643303	22643122	Y	NA	TRAV27,TRAV34	SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV27	28993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	22651523	22651525	22651524	Y	NA	TRAV27,TRAV34	SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV34	21893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr14	22656268	22656279	22656271	Y	NA	TRAV27,TRAV34	SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV34	17139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr14	22736761	22737207	22736959	Y	NA	TRAV38-2DV8,TRAV39	OXA1L,SLC7A7	IMR90	Hi-C	24141950	TRAV38-2DV8	9781	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr14	22757693	22757837	22757724	Y	NA	TRAV38-2DV8,TRAV39	NA	NA	NA	NA	TRAV38-2DV8	10705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr14	22760629	22760776	22760704	Y	NA	TRAV38-2DV8,TRAV39	NA	NA	NA	NA	TRAV39	9163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	22773704	22773940	22773876	Y	NA	TRAV38-2DV8,TRAV39	NA	NA	NA	NA	TRAV39	3765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	22807854	22807966	22807896	Y	NA	TRAV39	NA	NA	NA	NA	TRAV39	37915	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	MRPL52,MMP14,LRP10,REM2	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.9364514468642
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	MRPL52,MMP14,LRP10,REM2	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	23322319	23322495	23322408	Y	NA	MRPL52,MMP14,LRP10,REM2	NA	NA	NA	NA	LRP10	16327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	REM2	17334	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	23907435	23907682	23907559	Y	NA	NGDN	NA	NA	NA	NA	NGDN	29215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	24503912	24503926	24503919	Y	NA	LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	15280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	24934340	24934390	24934365	Y	NA	KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	24229	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	932436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	29533740	29533892	29533834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	576624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-829H16.2	71678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	92092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	31559968	31560471	31560185	Y	SCFD1,GPR33,STRN3	NA	NA	NA	NA	NA	STRN3	66361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr14	33776924	33777310	33777048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	824918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	35346506	35346753	35346630	Y	PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	3653	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	37134370	37134658	37134514	Y	NA	PAX9	NA	NA	NA	NA	PAX9	9597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	174581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	37980657	37980979	37980818	Y	SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	315539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	386971	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	402192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	38870563	38870760	38870662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC23A	706090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	42297588	42297942	42297766	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2397884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	44437752	44437871	44437812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	926627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	675222	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr14	50336723	50336992	50336886	Y	RPL36AL,NEMF,C14orf182,SOS2,ARF6	NEMF,ARF6	C14orf182,ARF6,SOS2,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	18802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	50549012	50549388	50549195	Y	RPS29,RPL36AL,DNAAF2,KLHDC1,KLHDC2,NEMF,ARF6,SOS2,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	146888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	50552755	50553092	50552901	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	143184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	51915852	51916182	51915957	Y	NA	FRMD6	FRMD6,LOC283553,GNG2,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	37636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	51975090	51975414	51975252	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	21272	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	52249257	52249424	52249269	Y	GNG2	GNG2	PYGL,TMX1,GNG2,LOC283553,C14orf166,TRIM9,FRMD6	IMR90	Hi-C	24141950	GNG2	41489	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	52499515	52499529	52499523	Y	NA	C14orf166	NA	NA	NA	NA	C14orf166	45322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	53421198	53421586	53421381	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	4045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	54075172	54075431	54075302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHD1	457172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	55073001	55073254	55073103	Y	NA	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	41186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	55094268	55094954	55094583	Y	GMFB,MAPK1IP1L,GCH1	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	62453	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	56045964	56046135	56045995	Y	NA	RPL7AP4,KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	1136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	58766869	58767218	58767044	Y	ARID4A	RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	ARID4A	3766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	60214885	60214948	60214918	Y	RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	JKAMP	265724	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	61652622	61652735	61652681	Y	NA	NA	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	206546	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	61956573	61957255	61956876	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	202976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	63236531	63236843	63236687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOJ	431989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	63894419	63894585	63894502	Y	PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	113507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	64670198	64670275	64670237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	133042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	65324744	65324966	65324847	Y	SPTB	NA	SPTB,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHURC1	54113	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	65748716	65749124	65748896	Y	FNTB	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	126186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	67735210	67735475	67735304	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	29384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr14	68281633	68281808	68281770	Y	PLEK2,ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	ZFYVE26	326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	68409175	68409464	68409327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	124679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	68613334	68613955	68613742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	68882312	68882693	68882503	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	4220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	69019496	69019664	69019580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	73498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	69281323	69281785	69281441	Y	DCAF5	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	20133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	69425235	69425583	69425528	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	18574	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	71838643	71839069	71838909	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	53477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	72377642	72377923	72377783	Y	NA	RGS6	NA	NA	NA	NA	RGS6	19233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	72530304	72530701	72530359	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	RGS6	133148	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	72602663	72602717	72602690	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	RGS6	205507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	73595262	73595380	73595321	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	5746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	77498012	77498283	77498148	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	77505083	77505447	77505354	Y	TMEM63C,TMED8,KIAA1737	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	12049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	78047292	78047714	78047418	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	33402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	81248217	81248588	81248549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	175273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.90467717029629
chr14	84176891	84176909	84176900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	1817579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	86053629	86053936	86053651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	59141	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	310770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	186005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	89953485	89953641	89953575	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	129852	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	90083771	90084428	90084236	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	91583338	91583593	91583462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	58358	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	91827435	91827790	91827659	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	54398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	92451454	92451633	92451538	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	53607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	93477908	93477983	93477972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHGA	90483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	93697718	93697880	93697787	Y	ITPK1,MOAP1	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26279	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	95332963	95333341	95333152	Y	SERPINA12	NA	NA	NA	NA	NA	GSC	98401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	95629499	95629761	95629662	Y	CLMN,DICER1	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	7152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	96125888	96126188	96126030	Y	TCL1A	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG10	126679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	96718007	96718377	96718192	Y	BDKRB1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG2B	109830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr14	99706771	99707240	99707068	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	28621	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	99711955	99712816	99712233	Y	NA	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	23045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	99713782	99713973	99713884	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	21888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	100633368	100633655	100633513	Y	YY1	NA	NA	NA	NA	NA	YY1	68980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102172620	102172772	102172676	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	NA	PPP2R5C,DYNC1H1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R5C	53363	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102281379	102281594	102281451	Y	PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	55244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	11.0220640512198
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr14	102989903	102989915	102989909	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	15767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr14	103272042	103272430	103272157	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	30229	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	123915	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	105265888	105266206	105266005	Y	NA	SIVA1,AKT1	NA	NA	NA	NA	AKT1	5800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4,GPR132	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	105660827	105661024	105660911	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	15167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr14	106029905	106030244	106030075	Y	NA	TMEM121	NA	NA	NA	NA	TMEM121	38965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	106034793	106034954	106034896	Y	NA	TMEM121	NA	NA	NA	NA	TMEM121	43853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	20570096	20570220	20570180	Y	NA	NA	REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1973869	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	25625771	25626455	25625879	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	55673	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr15	27014024	27014086	27014055	Y	GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	95424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	28339947	28339987	28339948	Y	NA	OCA2	NA	NA	NA	NA	OCA2	2517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	29266500	29266713	29266607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBA2	138871	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	30315678	30315833	30315756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	56610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	31591006	31591060	31591034	Y	KLF13	KLF13	OTUD7A,KLF13,LOC283710,MTMR10,TRPM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	25998	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	32384266	32384605	32384436	Y	CHRNA7	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA7	63575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	283258	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	34639079	34639478	34639279	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	NOP10	5701	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	36547085	36547100	36547092	Y	C15orf41	RP11-184D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-184D12.1	4627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	37175924	37176266	37175984	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	67264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	37253162	37253269	37253223	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	136271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	37403099	37403474	37403147	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	LOC100507466,C15orf41,MEIS2	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS2	11595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	38139072	38139239	38139156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED1	403288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	39683457	39683798	39683639	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	389233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	40460566	40460976	40460804	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	9342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	40730551	40730903	40730713	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	22248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	42723209	42723609	42723409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP23	57822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	RPS3AP47	8323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	44220271	44220640	44220456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	53829	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	44524937	44524986	44524960	Y	NA	NA	CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4	IMR90	Hi-C	24141950	CASC4	53941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	45735957	45736208	45736008	Y	SQRDL,PLDN,C15orf48	GATM,SPATA5L1	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	43428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	48033960	48034201	48034081	Y	NA	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	12828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	48311619	48311717	48311668	Y	NA	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	156997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	48545288	48545650	48545469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUT	75558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	48884454	48884907	48884660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP152	216436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	49189398	49189493	49189438	Y	SECISBP2L	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	21315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr15	49268018	49268116	49268067	Y	NA	SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	14377	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	50352002	50352368	50352185	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	267559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	50373381	50373578	50373480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	271947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51169242	51169420	51169339	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404,19890323	AP4E1	29449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51382019	51382273	51382147	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	13200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51481875	51482198	51481995	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	86402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51535974	51536234	51536151	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	140501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	164608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51878196	51878692	51878342	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	34338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	51911355	51912275	51911714	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	52797123	52797448	52797286	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	21799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	MNS1	NA	NA	NA	NA	MNS1	37213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	58431985	58432548	58432046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	549754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	59666396	59666611	59666505	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	MYO1E	3297	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	60867318	60867604	60867466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	97941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	61014572	61014773	61014738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	245195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	61191372	61191904	61191714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	421995	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	484756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	63484209	63484716	63484320	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	4541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	64188807	64189333	64189164	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	64666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	64889442	64889914	64889565	Y	ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	103566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	64932987	64933351	64933169	Y	PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	60129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	65831867	65832220	65831871	Y	NA	DPP8,PTPLAD1	C15orf44	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD1	11111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	66006814	66006895	66006855	Y	NA	RAB11A	SLC24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11A	9497	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	68325695	68325962	68325829	Y	NA	PIAS1	SKOR1,PIAS1	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	18555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	68564990	68565500	68565181	Y	NA	CLN6,FEM1B	CLN6,ANP32A,CORO2B,FEM1B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	2641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	69902643	69902959	69902812	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	159520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	70436319	70436687	70436503	Y	NA	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	47804	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	70827382	70827642	70827515	Y	NA	NA	TLE3,LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	226290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	71144876	71145062	71144944	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	71594937	71595146	71594940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	411813	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	CELF6	90029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	73435699	73435965	73435801	Y	NEO1,HCN4	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	93648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	73538661	73539057	73538860	Y	NEO1	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	196610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	74283683	74283945	74283706	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	1018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	74801015	74801389	74801202	Y	NA	UBL7,ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	30129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	74828638	74828659	74828649	Y	ISLR2,ISLR2	ARID3B	ARID3B	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARID3B	2859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	75075558	75076065	75075775	Y	ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	3160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	75081771	75082003	75081872	Y	ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	9373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	75820261	75820616	75820439	Y	NA	PTPN9	NA	NA	NA	NA	PTPN9	49014	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	75939210	75939595	75939262	Y	NA	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	77049228	77049527	77049378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	146258	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	77675113	77675384	77675318	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	PEAK1	35102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	78110584	78110799	78110731	Y	LINGO1	LINGO1	NA	NA	NA	NA	LINGO1	443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.64224707383868
chr15	78297319	78297621	78297470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	70445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	78365488	78365658	78365582	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	79153464	79153800	79153632	Y	RASGRF1	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	79272176	79272521	79272351	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	32260	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	79381600	79382164	79381699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	141684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	79974651	79974678	79974665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFS	213043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	80259231	80259586	80259565	Y	MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1	C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	ST20	45187	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	80697752	80697924	80697805	Y	ARNT2	ARNT2	NA	NA	NA	NA	ARNT2	3060	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	80712071	80712357	80712214	Y	NA	ARNT2	NA	NA	NA	NA	ARNT2	17379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	81207632	81207924	81207778	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	72295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	81277983	81278007	81277997	Y	NA	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	82117732	82117868	82117800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	218614	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	82202578	82202690	82202619	Y	NA	NA	MEX3B	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	133792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	82302959	82303245	82303102	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	33237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr15	83231949	83232133	83232017	Y	NA	RPS17L	NA	NA	NA	NA	RPS17L	24634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	83821433	83821717	83821575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	53053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	85725231	85725336	85725284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	196466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	86163966	86164265	86164150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	171996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	86246557	86246765	86246709	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	89496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	86267980	86268030	86268003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68231	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	87227426	87227675	87227551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	891165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	89638395	89638800	89638498	Y	ISG20,HAPLN3,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	9705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	91114363	91114916	91114453	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,IQGAP1	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	43206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	CTD-3094K11.1	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	49218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	93424689	93424786	93424732	Y	CHD2	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	93814865	93815040	93814989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	184432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	94717689	94718013	94717847	Y	NA	NA	MCTP2	IMR90	Hi-C	24141950	RGMA	1087256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	94830973	94831315	94831184	Y	MCTP2	NA	MCTP2,NMUR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	RGMA	1200540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	96455471	96455904	96455768	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NR2F2	411263	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.67402135040658
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	1490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr15	96884534	96884884	96884709	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	10044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	96886247	96886633	96886548	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	8833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.28037620572016
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	2972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.54280630217778
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr15	96934309	96934635	96934472	Y	NA	RP11-522B15.3	LOC145820	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-522B15.3	38843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr15	96959733	96960000	96959734	Y	NA	NA	LOC145820	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-522B15.3	64267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	20.9944077166091
chr15	97037762	97038044	97037995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	142296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr15	97129304	97129480	97129390	Y	NA	NA	NR2F2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-522B15.3	233838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	22.3065581988971
chr15	97325630	97326019	97325642	Y	SPATA8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	430164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	97404920	97405127	97405024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	509454	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr15	97731038	97731056	97731047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	729728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	98051851	98052090	98051944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	408694	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	98698078	98698430	98698265	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	53137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	98712881	98713227	98713218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	67940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr15	98964843	98965105	98964974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.1	130437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr15	99223373	99223476	99223421	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	33173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99295015	99295222	99295065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	104815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99358585	99358846	99358731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	168385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	210821	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	99708218	99708283	99708249	Y	NA	NA	SYNM	IMR90	Hi-C	24141950	SYNM	71798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	100914283	100914527	100914405	Y	ADAMTS17	ADAMTS17	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	34073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr15	101677939	101678117	101678028	Y	CHSY1	NA	CHSY1,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	112020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	101790495	101790968	101790609	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	358	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	102023301	102023573	102023437	Y	NA	PCSK6	NA	NA	NA	NA	PCSK6	39832	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr15	102213485	102213850	102213667	Y	NA	TM2D3,TARSL2	NA	NA	NA	NA	TM2D3	22891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	154913	155267	155125	Y	NHLRC4,HBQ1,HBM	RHBDF1,MPG,NPRL3,HBM	NA	NA	NA	NA	MPG	29907	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	C16orf11,PIGQ	NA	NA	NA	NA	C16orf11	29266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	612039	612238	612073	Y	RGS11,ARHGDIG,RHBDL1,GNG13,C16orf11	C16orf11,PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	2757	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	615969	616302	616108	Y	RGS11,NHLRC4	C16orf11,PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	974	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr16	1175604	1175749	1175663	Y	RHBDL1,FBXL16,CACNA1H,BAIAP3,BAIAP3,BAIAP3,SSTR5	CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNA1H	25492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	1210403	1210717	1210625	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	9162	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	31098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	1239202	1239436	1239320	Y	BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	37961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,GNPTG	NA	NA	NA	NA	GNPTG	17732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	1696376	1696557	1696439	Y	NA	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	29700	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	1963457	1963729	1963593	Y	HS3ST6	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9	C16orf73,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	43780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr16	2924940	2925188	2925019	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLYWCH2	5999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr16	3221173	3221513	3221502	Y	NA	ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	43395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	3628962	3629267	3629135	Y	NA	SLX4	NA	NA	NA	NA	SLX4	30332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	3889135	3889287	3889211	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	39440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.51103202560988
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.85495678446584
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	4944877	4945061	4944987	Y	HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI	GLYR1	NA	NA	NA	NA	GLYR1	49534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	6537672	6538042	6537854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1391863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	8931520	8931573	8931545	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	29293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	10746944	10747196	10747087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	74389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	11126143	11126448	11126303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	89798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	13298770	13298922	13298846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	402896	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	15069619	15069687	15069631	Y	PDXDC1	PDXDC1	NA	NA	NA	NA	PDXDC1	3171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	15498743	15498890	15498817	Y	NA	MPV17L,C16orf45	NA	NA	NA	NA	MPV17L	11132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	16055043	16055430	16055122	Y	NDE1,NDE1,ABCC1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	13609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	16131643	16131874	16131759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	90209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	17267039	17267537	17267379	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	1225605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	17270464	17270719	17270563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	1229030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	17857901	17858183	17858087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	941522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	19769577	19769967	19769778	Y	CCP110,GPRC5B,IQCK	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	43799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	20915885	20916169	20915941	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	6179	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	SMG1P1,CDR2	NA	NA	NA	NA	SMG1P1	13235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	22633888	22634263	22634075	Y	NA	NA	SLC7A5P2,OTOA,CRYM,CRYM-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDR2	187402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	24619135	24619479	24619307	Y	SLC5A11	NA	TNRC6A,RBBP6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP6	72121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	24882158	24882362	24882260	Y	SLC5A11	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP17	142625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	25121755	25122029	25121858	Y	SLC5A11	LCMT1	NA	NA	NA	NA	LCMT1	705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	26407533	26407848	26407539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	870267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	27249665	27249878	27249750	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	28237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	28554422	28554737	28554563	Y	SULT1A1,IL27	CLN3,NUPR1,CCDC101	IL27,NUPR1,CCDC101,SULT1A2	IMR90	Hi-C	24141950	NUPR1	5927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	AC002310.7	1728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.05383832778765
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	31005740	31006063	31006002	Y	ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4	ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX1B,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	11221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	31139989	31140736	31140371	Y	ARMC5,PRR14,FBRS,PHKG2,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,FUS	NA	NA	NA	NA	PRSS8	4347	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	34878904	34878918	34878911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2995825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	34973617	34973844	34973726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3090538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	34977722	34977881	34977830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3094643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	46920520	46920743	46920636	Y	NA	GPT2	NA	NA	NA	NA	GPT2	4230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	50758375	50758737	50758558	Y	SNX20,NOD2,CYLD,CYLD	NOD2,CYLD	NA	NA	NA	NA	CYLD	15224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	51182471	51182868	51182589	Y	SALL1,SALL1	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	51183106	51183414	51183179	Y	SALL1,SALL1	NA	NA	NA	NA	NA	SALL1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	51187930	51188326	51188194	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	4652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	54088509	54088778	54088657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	229897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	55740914	55740956	55740934	Y	SLC6A2,SLC6A2	NA	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	200004	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	55869661	55869957	55869814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	328751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	56314617	56314966	56314752	Y	MT3,MT1M,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAO1	91315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	56550060	56550247	56550167	Y	MT3,MT1M,GNAO1,BBS2	BBS2	NA	NA	NA	NA	BBS2	1948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	56882732	56883304	56883026	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD1	80656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	57269711	57269965	57269822	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	7045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	NA	NA	NA	NA	NA	COQ9	56592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	57907227	57907478	57907351	Y	NA	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	12270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	62009181	62009277	62009229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3242920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	62021508	62021884	62021766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3255247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	66659405	66659873	66659770	Y	NA	CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	23628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr16	67047765	67048035	67047886	Y	FBXL8,CES4A	CES4A,CBFB	NA	NA	NA	NA	CBFB	12984	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	67513836	67514185	67514007	Y	C16orf70,LRRC29,LRRC29,PSMB10,ACD,FAM65A,ATP6V0D1	ATP6V0D1,FAM65A	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D1	696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	67581625	67581971	67581838	Y	RLTPR,CTCF	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	12339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr16	68303268	68303682	68303412	Y	THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	6835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr16	69796957	69797361	69797156	Y	EXOSC6,WWP2	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	70716686	70717066	70716876	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	70749058	70749400	70749223	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	31089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	70918380	70918652	70918516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	85316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	70973998	70974194	70974080	Y	VAC14	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	140934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr16	73577859	73577941	73577900	Y	NA	NA	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	486262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	74215797	74215960	74215913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD7	112713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	74599295	74599588	74599442	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	39424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	77511327	77511456	77511406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	242955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	78099598	78099610	78099604	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	31700	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	80786602	80786755	80786668	Y	DYNLRB2,C16orf46	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	49471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	81617620	81618040	81617835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	140845	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	81884934	81885228	81885079	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	114232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	12.0717844370502
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	85368480	85368758	85368593	Y	NA	NA	KIAA0182,GINS2,LOC400548,LINC00311,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	309105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85617282	85617663	85617577	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	104016	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	87878915	87879213	87879066	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	21881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	87986927	87987379	87987279	Y	ZCCHC14,SLC7A5,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	6077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	13.1215048228807
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	89475542	89475927	89475838	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	79042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	89672117	89672737	89672683	Y	NA	RPL13,SNORD68,CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CPNE7	31941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr16	90088262	90088277	90088270	Y	PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	3726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	1046722	1046841	1046786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	83474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	1666519	1666783	1666685	Y	RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	3266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	1926930	1927151	1927006	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr17	2074761	2075171	2074968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	119313	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	2126107	2126815	2126522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	77862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	4615866	4616105	4615999	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	4082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	4748416	4748776	4748678	Y	ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,C17orf87,MINK1,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	13733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13,SLC16A11	NA	NA	NA	NA	MIR497HG	4174	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	7233457	7233867	7233744	Y	WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1	NA	NA	NA	NA	NEURL4	2745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.72374173623704
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	RPL26	15640	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr17	10672260	10672535	10672473	Y	MYH4,SHISA6,PIRT	TMEM220,RP11-963H4.2	ZNF18,MYH3,LOC100289255	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-963H4.2	24400	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	COX10	134195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	15124261	15124470	15124375	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	42173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	12295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	16310492	16310776	16310647	Y	NA	UBB	TRPV2,C17orf76-AS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBB	28380	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	16388389	16388725	16388555	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	4742	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr17	16893867	16894139	16894047	Y	NA	MPRIP	MPRIP,FLCN	IMR90	Hi-C	24141950	MPRIP	49720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17208754	17209324	17209000	Y	PLD6,COPS3,COPS3,NT5M	COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	NT5M	4105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17595288	17595502	17595395	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	12501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17628792	17629315	17629145	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	46005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17644687	17645051	17644950	Y	TOM1L2,LRRC48,LLGL1	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	61900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	18153652	18153819	18153756	Y	NA	LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	FLII	6411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	18204448	18204705	18204595	Y	LRRC48,C17orf39,SMCR8,TOP3A	FLII,TOP3A,SMCR8	NA	NA	NA	NA	TOP3A	11616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3A	52233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3A	58439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	19268894	19269122	19269008	Y	NA	MAPK7,B9D1	NA	NA	NA	NA	MAPK7	9912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	19760986	19761170	19761020	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	8079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	19769871	19770228	19769963	Y	NA	ULK2	NA	NA	NA	NA	ULK2	622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22,AC087393.1	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	AC087393.1,DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.19888154332181
chr17	21360373	21360746	21360457	Y	NA	NA	USP22,MAP2K3,KCNJ12,C17orf51	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	82864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	14.3024402569399
chr17	22069559	22069863	22069667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	593837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	25572576	25572861	25572643	Y	WSB1	WSB1	WSB1,KSR1,MIR4522	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	46241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	26214261	26214593	26214427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	152170	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	27923510	27923655	27923583	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	4438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	28009923	28010244	28010118	Y	SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	61998	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	28041165	28041459	28041338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	93240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	28108459	28108825	28108642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSH2	146469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	29176780	29177123	29176952	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	ATAD5	19792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	79002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	30335785	30336145	30335965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUZ12	73748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	30923806	30924081	30923942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	112169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	31254083	31254387	31254296	Y	NA	TMEM98	NA	NA	NA	NA	TMEM98	1155	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	33824805	33825214	33825002	Y	SLFN5,SLFN12L,CCL5	NA	NA	NA	NA	NA	AP2B1	77851	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	RASL10B	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	RASL10B	10853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	38226807	38227182	38226872	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	38466457	38466702	38466562	Y	IKZF3	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	3013	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	38468655	38468865	38468706	Y	IKZF3,CCR7	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	5211	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	38771553	38771985	38771688	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1,KRT222	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	30775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	38776396	38776659	38776550	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1,KRT222	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	26101	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	38817101	38817471	38817286	Y	NA	SMARCE1,KRT222,KRT24	SMARCE1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT222	1962	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39003172	39003257	39003186	Y	KRTAP2-1,KRT10	KRT28,TMEM99,KRT10,KRT12,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT12	18205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	39012522	39012675	39012596	Y	NA	TMEM99,KRT10,KRT12,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT12	8787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT15	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT15	28317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	32315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	40559988	40560462	40560227	Y	RAMP2,CNP	STAT3,PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	13073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1,AC067852.1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	41324260	41324525	41324381	Y	TMEM106A	BRCA1,NBR2,NBR1,TMEM106A	NA	NA	NA	NA	NBR1	3762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	43034960	43035346	43035098	Y	ADAM11,HIGD1B,DCAKD,ACBD4,GFAP	KIF18B,C1QL1	KIF18B	IMR90	Hi-C	24141950	C1QL1	8093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	43095998	43096402	43096133	Y	NA	NMT1,DCAKD	NA	NA	NA	NA	NMT1	30576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	RPS26P8	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	22736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	43863369	43863507	43863444	Y	CRHR1	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	106241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	RPRML	89541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	45282976	45283116	45283053	Y	NA	CDC27,ITGB3	MYL4	K562	ChIA-PET	22265404	CDC27	18188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	45812231	45812436	45812324	Y	SP2,OSBPL7,MRPL10,TBX21	NA	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL7	84764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	46079914	46080281	46080131	Y	NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	33111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	46083704	46083942	46083828	Y	NA	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	29450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	46217226	46217562	46217317	Y	CDK5RAP3,SKAP1	CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	SNX11	38507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	11438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	10719	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	46647653	46647800	46647722	Y	HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7673	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr17	46648538	46649382	46648794	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	46823615	46823765	46823690	Y	PRAC,TTLL6	HOXB13,CTD-2377D24.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2377D24.4	15162	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	46823953	46824311	46824136	Y	HOXB2,HOXB4,IGF2BP1,PRAC	HOXB13,CTD-2377D24.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2377D24.4	15500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr17	46866476	46866488	46866482	Y	NA	CALCOCO2	MIR3185,HOXB-AS5,HOXB13,PRAC	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO2	39862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr17	48908408	48908498	48908454	Y	NA	TOB1	TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	34841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	49075036	49075414	49075227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG9	120812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	NA	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMD	181370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	53394900	53394943	53394922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	102410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	53457178	53457442	53457269	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	39911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	53497797	53498268	53498065	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55447287	55447561	55447443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	116075	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55456674	55456859	55456690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	125462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55518270	55518753	55518516	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	187058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55700521	55700792	55700709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	224625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	56628647	56628916	56628782	Y	NA	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	SEPT4	12468	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57012711	57013103	57012907	Y	SEPT4	NA	NA	NA	NA	NA	AC099850.1	168856	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57203741	57203833	57203787	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	21459	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr17	57511883	57511981	57511933	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	100879	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57837481	57837783	57837612	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	54494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57844650	57844791	57844732	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	61663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	59449966	59450070	59450027	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	25187	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	59786803	59787088	59786946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	120240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	59802247	59802551	59802410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	135684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	60877951	60878269	60878188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	175189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	270370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	61323201	61323584	61323320	Y	NA	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	198155	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	LIMD2	NA	NA	NA	NA	LIMD2	27954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62101615	62101802	62101721	Y	NA	C17orf72	NA	NA	NA	NA	C17orf72	27904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62134316	62134543	62134430	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf72	60605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62140311	62140756	62140628	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	65423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62292330	62292581	62292520	Y	NA	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	46080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62534383	62534677	62534525	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	32066	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62773066	62773435	62773116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1P	57837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	62985207	62985536	62985392	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	15513	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	63030127	63030512	63030385	Y	NA	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	20445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	63044063	63044405	63044261	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	6552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	63645833	63645846	63645840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	90068	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	64488395	64488515	64488455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	191641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	64646348	64646488	64646431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	312538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	65220181	65220399	65220279	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	19706	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	65477756	65478333	65478203	Y	HELZ,PSMD12	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	106181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	65485462	65485785	65485684	Y	HELZ,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	113887	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr17	66348483	66348670	66348577	Y	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	95160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	66608759	66608986	66608843	Y	FAM20A	NA	ABCA10,ABCA8,ABCA9	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAR1A	102838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	68033950	68033965	68033958	Y	NA	NA	KCNJ16,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	128849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68141797	68141870	68141834	Y	NA	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	20944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	68163875	68164211	68163998	Y	NA	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	1061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	68191235	68191546	68191422	Y	NA	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	28421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	68288690	68288834	68288751	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	125876	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	68291356	68291999	68291689	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	128542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	68309274	68309404	68309357	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	146460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68310261	68311057	68310836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	147447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68340579	68340874	68340665	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	177765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	68340909	68341138	68341108	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	178095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68361449	68361732	68361545	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	198635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68386662	68387012	68386837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	223848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	68436475	68436535	68436505	Y	NA	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	273661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	68505754	68506055	68505905	Y	NA	NA	ABCA6,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	342940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr17	68523657	68524030	68523849	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	360843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	68750412	68750565	68750489	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ2	587598	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	68869215	68869451	68869336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	706401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	69003826	69003862	69003844	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	611257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	69229008	69229023	69229016	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	386096	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	69260870	69260872	69260871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	354247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	69493983	69494025	69494004	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	121094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	69558525	69558657	69558591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	56462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	69590205	69590225	69590215	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	24894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr17	69596730	69596951	69596781	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	18168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	69755219	69755553	69755499	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	140100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr17	69824557	69824843	69824637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005152.3	203390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	70514986	70515384	70515137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	105986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	SSTR2,COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	49762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	73456599	73456615	73456608	Y	NA	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	21359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75086431	75086552	75086490	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	5633	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75111736	75111750	75111743	Y	SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	30938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75170939	75171192	75170955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	90141	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75780253	75780385	75780315	Y	TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	133795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75798844	75799281	75799210	Y	TNRC6C,TMEM235	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	114899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	75802285	75802305	75802295	Y	NA	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	111875	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	14.5648703533975
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	41743	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	76409170	76409735	76409347	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	36449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	76641957	76642289	76642128	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	134090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	76744782	76745072	76745044	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	31307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	76772222	76772447	76772365	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	3932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	77146048	77146259	77146101	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	77027	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	77404221	77404595	77404558	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	335200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr17	78008584	78008924	78008651	Y	TBC1D16,GAA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	CCDC40	149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.067666495093
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	78652497	78652856	78652573	Y	SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	135878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	78853513	78853762	78853623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	109636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	78962835	78962976	78962910	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	422	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	35462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	79313114	79313481	79313281	Y	NA	SLC38A10	SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC38A10	45767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	48906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	50438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	50797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr17	79363961	79364269	79364114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	96614	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	101443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	102227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	103407	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	102135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	79399158	79399431	79399295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	79448388	79448678	79448571	Y	NPB,AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	29411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	4473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,NPB,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80104775	80104822	80104796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASN	50567	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,CD7,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80328282	80328672	80328333	Y	NA	SECTM1,TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	13159	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80655375	80655626	80655561	Y	RAB40B,FN3K	RAB40B,FN3KRP,FN3K	NA	NA	NA	NA	RAB40B	771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	86105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80829054	80829460	80829235	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	121114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr17	80840475	80841074	80840735	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	132535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP14	145162	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	2548368	2548472	2548420	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	21036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	144253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	5542461	5543034	5542604	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	85665	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	5664603	5664871	5664737	Y	ZFP161	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	35904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	6416928	6417109	6417051	Y	L3MBTL4	RPL6P27	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	43905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	448095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr18	10213578	10213746	10213662	Y	VAPA	NA	APCDD1	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	301579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	30712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	12839100	12839985	12839163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	87657	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr18	13220671	13221282	13220939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	231310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	13284469	13284622	13284521	Y	C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	295108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	13313521	13313917	13313675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	324160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	13585802	13586015	13585919	Y	RNMT,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	138644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	18513293	18513512	18513419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	176300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	18515990	18516559	18516297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	173253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	19926493	19926623	19926531	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	179089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	20402088	20402300	20402139	Y	NA	RBBP8	RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	25864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	21091625	21091887	21091629	Y	C18orf8	C18orf8	NA	NA	NA	NA	C18orf8	10152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	21945811	21945986	21945899	Y	NA	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	29858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	22865478	22865571	22865525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	803610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	25623626	25623889	25623758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	1388261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	28720751	28720970	28720841	Y	NA	DSC2,DSC1	NA	NA	NA	NA	DSC1	19849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	28734237	28734361	28734251	Y	DSC3,DSC1	DSC1	NA	NA	NA	NA	DSC1	6458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	DSC1	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC1	46026	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	22.5689882953547
chr18	28823621	28824065	28823663	Y	NA	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC1	82802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	29032478	29032594	29032536	Y	NA	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	6720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	29034115	29034481	29034298	Y	DSC3,DSG3	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	8357	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	29599439	29599921	29599769	Y	RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	68340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	35114898	35115196	35115047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	707740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	35143959	35144425	35144260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	736801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	35230475	35230627	35230551	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	823317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	39878451	39878679	39878560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	345280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	39879381	39879408	39879401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	346210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	39965392	39965594	39965467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	432221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	40289843	40290198	40289863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	756672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	45121488	45121559	45121552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	333956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	45379355	45379691	45379492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	75824	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46213796	46213995	46213850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	150379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46449093	46449527	46449211	Y	SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	25554	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46455103	46455621	46455353	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	19460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46473942	46474323	46474293	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46479420	46479772	46479694	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	4339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	46579464	46579684	46579624	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	104383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	51151759	51152047	51151782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	597111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	51703852	51704220	51704036	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	44938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	53072982	53073437	53073370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	256581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	54327448	54327828	54327638	Y	NA	WDR7,TXNL1	NA	NA	NA	NA	TXNL1	10617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	56232351	56232608	56232443	Y	MALT1	SNORD28	NA	NA	NA	NA	SNORD28	33255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr18	56701404	56701604	56701510	Y	ALPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	103105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	58951957	58952157	58952057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P14	118281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	59766177	59766307	59766242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGN	86044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60827006	60827299	60827155	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	158062	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60827980	60828589	60828438	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	156772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60873001	60873358	60873117	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	112003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	60966877	60967061	60966974	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	18300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	66508189	66508486	66508312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX3	127654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	69872774	69872783	69872780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	1918637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	801802	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	72501282	72501640	72501447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	238176	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr18	72683878	72684340	72684028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234963	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	72695045	72695604	72695384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	223699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	72702422	72702889	72702602	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	216414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	72916177	72916455	72916218	Y	NA	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	2848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	72919000	72919372	72919172	Y	NA	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr18	73628376	73628483	73628456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	576663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	74088486	74089010	74088832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	116136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	74162277	74162639	74162448	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	42507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	32918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	74285559	74285989	74285816	Y	ZNF516	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	80082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	74735151	74735398	74735253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	202588	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	74810011	74810388	74810104	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	277448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	75529879	75530144	75530012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	997316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	76557248	76557304	76557276	Y	NA	NA	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	SALL3	180971	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	76582553	76582919	76582735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	155356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr18	77267643	77267970	77267877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	113787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	77442917	77443176	77442992	Y	PQLC1,ADNP2,NFATC1,CTDP1,CTDP1	CTDP1	NA	NA	NA	NA	CTDP1	5116	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	77554904	77555044	77554983	Y	PQLC1,ADNP2,NFATC1,CTDP1,CTDP1	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	117103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	947564	948104	947641	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf6	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	23783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	996390	996745	996544	Y	HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	WDR18	15216	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	APC2	982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1755338	1755626	1755509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B3	54649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr19	2478921	2479315	2479258	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	4801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr19	2544084	2544261	2544159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2668275	2668465	2668389	Y	SPPL2B,AES,GNG7	GNG7	NA	NA	NA	NA	GNG7	32242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	2775891	2776162	2776129	Y	NA	SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554	NA	NA	NA	NA	SGTA	5207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	2926811	2926963	2926923	Y	NA	ZNF57,ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	ZNF77	16006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3387730	3388119	3388011	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	30169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	NA	NA	NA	NA	NA	DOHH	69826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3551628	3551981	3551925	Y	NA	FZR1,HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	HMG20B	18794	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	3868053	3868449	3868082	Y	NA	ZFR2,ATCAY	NA	NA	NA	NA	ZFR2	1023	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	4785303	4785662	4785510	Y	FSD1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	FEM1A	4066	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	5250100	5250567	5250354	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	25178	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	5322399	5322569	5322473	Y	PTPRS	RPL32P34,PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	16245	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	5804044	5804378	5804211	Y	NA	DUS3L	NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUS3L	14795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	5829202	5829624	5829506	Y	NA	DUS3L	NA	NA	NA	NA	DUS3L	39953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	6105811	6106211	6106011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	91372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	58264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	7266028	7266415	7266222	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	25630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	8593717	8594039	8593972	Y	NA	ZNF414	NA	NA	NA	NA	ZNF414	16669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	2805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	9517572	9518021	9517955	Y	NA	ZNF266	NA	NA	NA	NA	ZNF266	26233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	9758216	9758505	9758322	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	25271	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10024468	10024837	10024779	Y	OLFM2	OLFM2	PIN1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	OLFM2	20391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10349944	10350302	10350123	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM4,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT1	9982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.51103202560988
chr19	10529596	10529758	10529677	Y	NA	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	17382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10983266	10983642	10983440	Y	PDE4A,CARM1	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	CARM1	3077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	10992105	10992492	10992295	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	11916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	11269215	11269426	11269321	Y	SMARCA4,SMARCA4,C19orf39	SPC24,KANK2	NA	NA	NA	NA	SPC24	4731	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ELAVL3,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ELAVL3	3043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	11641329	11641510	11641441	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ECSIT	3340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	11675625	11675958	11675811	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ZNF627	7436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	12890492	12890682	12890617	Y	ZNF44,ZNF564,MAN2B1,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	9628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr19	13023589	13024232	13023881	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	3858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	2714	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13048278	13048689	13048364	Y	MAN2B1	GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	CALR	886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	13133010	13133371	13133241	Y	FBXW9,NFIX	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	28588	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13137197	13137461	13137217	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	32775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13171487	13171654	13171570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	54727	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	13181358	13181806	13181733	Y	NA	TRMT1,NACC1	NA	NA	NA	NA	TRMT1	44575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13597293	13597592	13597549	Y	C19orf57,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC130	242982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	14249278	14249642	14249460	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	3510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	14315596	14315828	14315635	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	14320325	14320686	14320360	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	5326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	14414232	14414293	14414263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN1	99233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	15310768	15311119	15311001	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F12	166050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	16480475	16480862	16480751	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	46847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	16493561	16493905	16493595	Y	KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN1	72943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	18810961	18811220	18811091	Y	NA	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	18474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19005223	19006062	19005586	Y	TMEM59L,KLHL26,CRTC1,SUGP2,SLC25A42,NCAN,HAPLN4,HOMER3,HOMER3,GDF1	GDF1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	CERS1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19370628	19370854	19370732	Y	GDF1,SUGP2,NCAN	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2AP	58395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19562909	19563265	19563209	Y	RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	61280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19705357	19705479	19705434	Y	NA	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	22246	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19711724	19712118	19712001	Y	RFXANK,GATAD2A,GMIP	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	15607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	53433	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	23310606	23310980	23310793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	54594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	23416597	23416606	23416602	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	14586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	27734782	27735200	27734996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1967248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	27739373	27739767	27739570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	28917737	28917979	28917845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	784469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	30207596	30207744	30207670	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	3232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	31843033	31843344	31843257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	991156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	33165229	33165376	33165346	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19	NA	NA	NA	NA	ANKRD27	127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	35932277	35932551	35932349	Y	USF2,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,MLL4,HCST,FFAR2	NA	MAG,FFAR1,FFAR3,LOC100128682,FFAR2,KRTDAP,DMKN	IMR90	Hi-C	24141950	DMKN	70009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	37262228	37262609	37262419	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	2810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	37942009	37942313	37942161	Y	ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569	ZNF570,ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF570	14174	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	WDR87,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	40048579	40048977	40048748	Y	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	EID2B,EID2	DLL3,EID2,EID2B,LGALS16,LGALS17A,CLC,LEUTX,ZNF780A	IMR90	Hi-C	24141950	EID2	19709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	40751869	40752087	40752041	Y	NA	AKT2	NA	NA	NA	NA	AKT2	37356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr19	40942693	40943017	40942855	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	5595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41014841	41015014	41014895	Y	MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SPTBN4	44693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41816681	41817091	41817051	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	2587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42432096	42432209	42432128	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	29333	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chr19	42913594	42913985	42913852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	85833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	42954515	42954747	42954627	Y	CEACAM1,LIPE	NA	CXCL17	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM1	108639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	44555398	44555498	44555444	Y	ZNF155,ZNF223	ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224	NA	NA	NA	NA	ZNF223	1878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	44781587	44781871	44781729	Y	ZNF404,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZFP112,ZNF233,ZNF233,ZNF235	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	25328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	44824668	44825027	44825022	Y	NA	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	17469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45240026	45240191	45240078	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	CBLC	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CBLC	38935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45373382	45373614	45373476	Y	NA	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	18212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	2576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	46398825	46399093	46398978	Y	EML2,EML2	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	MYPOP	4769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	46930027	46930174	46930086	Y	NA	CCDC8,PNMAL1	CCDC8,LOC100506012	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC8	15186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	BBC3	NA	NA	NA	NA	BBC3	43860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	47742856	47743228	47743000	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	8833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	48761702	48761955	48761773	Y	CARD8,CARD8,RASIP1,CYTH2,EMP3,CCDC114	NA	NA	NA	NA	NA	EMP3	60811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	50426616	50426838	50426710	Y	NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	3121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	50835103	50835475	50835356	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	122043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	52734516	52734674	52734594	Y	ZNF610	PPP2R1A,ZNF766	NA	NA	NA	NA	ZNF766	36150	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53128477	53128840	53128754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	54463562	54463897	54463703	Y	NA	CACNG8	NA	NA	NA	NA	CACNG8	397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	CACNG8	NA	NA	NA	NA	CACNG8	949	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr19	55464646	55464913	55464780	Y	EPS8L1,NLRP2,NLRP2	NA	NA	NA	NA	NA	RDH13	115746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	12795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	55962647	55962935	55962813	Y	SYT5,BRSK1,ZNF580,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	8775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	55977615	55977883	55977735	Y	NLRP8,NLRP9,NLRP11,SGK110	ISOC2,ZNF628,NAT14	ISOC2,UBE2S,SSC5D,NAT14	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ISOC2	5905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	56169893	56170373	56169939	Y	NA	ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	U2AF2	6381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	56729112	56729434	56729273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF444	87144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	56798845	56799016	56798855	Y	NLRP11,NLRP8,NLRP5,ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	78452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	66232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	57781316	57781665	57781442	Y	ZSCAN4,ZNF154,ZNF460	ZNF805,ZNF460,ZNF543	NA	NA	NA	NA	ZNF460	7754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF154	1140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	58398826	58399093	58399050	Y	ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418	ZNF587,ZNF814,ZNF417,ZNF418	NA	NA	NA	NA	ZNF814	384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	58501905	58502197	58501915	Y	ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135	ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1	NA	NA	NA	NA	CTD-2368P22.1	9232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZNF135	10951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	58784706	58785064	58784920	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	NA	NA	NA	NA	ZNF8	3254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	58788473	58788748	58788728	Y	NA	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22	NA	NA	NA	NA	ZNF8	155	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	58911739	58912056	58911822	Y	NA	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	932598	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1046711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	7171830	7172101	7171947	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	116307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	7814871	7814997	7814934	Y	NA	NA	LOC100506274,LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	RNF144A	759348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9475782	9475835	9475817	Y	KIDINS220,ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1BP1	85841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	10984211	10984590	10984279	Y	NA	PDIA6	C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDIA6	8108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	11623044	11623914	11623865	Y	NA	E2F6	GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	18747	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	12199688	12199839	12199764	Y	NA	NA	LOC100506474,TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	383967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	14851119	14851133	14851127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	80309	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15113795	15114009	15113902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	342985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	429184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15332010	15332377	15332192	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	367077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15397207	15397542	15397373	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	301912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	18249281	18249546	18249363	Y	NA	NA	KCNS3	IMR90	Hi-C	24141950	SMC6	269772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	23631132	23631189	23631161	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	25044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NA	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	131763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	25136821	25136958	25136890	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	3750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	25676180	25676345	25676260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	112721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	41173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	27574731	27574755	27574743	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,FTH1P3	NA	NA	NA	NA	AC074117.10	2358	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	27877424	27877712	27877568	Y	NA	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	6626	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	SNORD53	NA	NA	NA	NA	SNORD53	25397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	30625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	29803354	29803753	29803678	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	484783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	29870290	29870662	29870408	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL5	497145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	36189102	36189392	36189167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	391677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37432341	37432705	37432523	Y	NA	AC007390.4,CEBPZ	NA	NA	NA	NA	AC007390.4	12461	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37798952	37799136	37799011	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	164475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	37993289	37993401	37993340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	29678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	38099080	38099316	38099096	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT,PRKD3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	135469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	38384417	38384601	38384509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	72109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	38418747	38419129	38419037	Y	NA	RPL7P12	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	37581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	39078847	39079086	39078967	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	39917142	39917449	39917282	Y	TMEM178,TMEM178	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	86958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	40509736	40509978	40509875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	505329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	42333001	42333603	42333353	Y	EML4	NA	EML4,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	59841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	134093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	43530162	43530544	43530351	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	78414	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	43532128	43532543	43532333	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	80380	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	43672480	43672679	43672609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	148506	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	43692800	43693176	43692988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	128009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	45176497	45176546	45176522	Y	NA	AC012354.8	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	45006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	46451921	46452099	46452016	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	46797577	46797967	46797772	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	29881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	47041376	47041664	47041544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	99632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	50378862	50379239	50379186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1624340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	50778633	50778874	50778754	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2024111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	54714209	54714329	54714214	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	32787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	135187	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr2	57034024	57034047	57034036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC85A	624766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	57579954	57580103	57580029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	552683	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	57600725	57600909	57600817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	531877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	57660599	57660912	57660881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	471874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	57707334	57707464	57707399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	425322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	57805621	57805995	57805808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	326791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	57846266	57846542	57846459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	286244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	57861899	57862248	57862095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	270538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	57947710	57947899	57947805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	184887	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.72374173623704
chr2	58049396	58049664	58049530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	83122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr2	58105448	58105884	58105678	Y	NA	VRK2	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	VRK2	26902	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr2	58121629	58121888	58121689	Y	VRK2,VRK2,VRK2	VRK2	NA	NA	NA	NA	VRK2	10898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	58135925	58136279	58136091	Y	VRK2,VRK2,VRK2	VRK2	NA	NA	NA	NA	VRK2	3139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	58266393	58266527	58266430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	133607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	19.1573970414058
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	58707948	58708183	58708069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	55014	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.34804270081317
chr2	58726353	58726421	58726382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	73419	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr2	58767946	58768124	58768017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	115012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	58938057	58938367	58938299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	285123	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	59385638	59385932	59385785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	274416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	59463950	59464234	59464027	Y	NA	NA	POU2F1	MCF7	ChIA-PET	19890323	AC007179.1	196114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	59662882	59663257	59663070	Y	NA	AC007179.1	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	2534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	59795595	59796016	59795805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	135247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.067666495093
chr2	59798198	59798654	59798620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	137850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr2	59955397	59955917	59955602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	295049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	98.9361463645201
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007179.1	323479	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	60694019	60694324	60694172	Y	BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	84279	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr2	60696747	60696946	60696847	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	81756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	67204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60712095	60712413	60712305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	66289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	60732807	60733201	60733004	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	45501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60742807	60743148	60742962	Y	REL	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	35554	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60747849	60747913	60747881	Y	PEX13,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	30789	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	60775877	60776167	60775994	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	2535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	60784320	60784652	60784428	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	5618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr2	60795566	60795727	60795647	Y	KIAA1841,KIAA1841,BCL11A	BCL11A	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	BCL11A	16864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr2	62375163	62375426	62375211	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	45822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	145412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64446399	64446520	64446425	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	76811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	65047032	65047202	65047180	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A	NA	SERTAD2,LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	70893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	65782552	65782570	65782560	Y	NA	NA	SPRED2,ACTR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRED2	124781	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	143315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	67680448	67680810	67680629	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	57997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	68499892	68500037	68499965	Y	NA	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	18523	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	68966258	68966366	68966310	Y	PLEK,FBXO48,APLF	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	271944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	69888349	69888615	69888483	Y	NA	ANXA4,AAK1	NFU1,AAK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AAK1	10866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70145725	70146134	70145771	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.72374173623704
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	71822891	71823089	71822990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF638	321200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr2	72426245	72426403	72426323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	624767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	74778065	74778079	74778072	Y	NA	PCGF1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	2738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	20337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	77536393	77536550	77536540	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	476958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	77606353	77606491	77606425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	407017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	80016891	80017267	80017079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	370994	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	83058262	83058376	83058322	Y	NA	AC098817.3	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	15007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	85362106	85362578	85362371	Y	NA	LSM3P3,TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	3573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	85442728	85442944	85442894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	84195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	86030361	86030633	86030487	Y	SH2D6	NA	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	76901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	86048153	86048345	86048249	Y	ATOH8	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	65792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	86692253	86692485	86692369	Y	NA	KDM3A	NA	NA	NA	NA	KDM3A	26483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	88590567	88590888	88590740	Y	C2orf51	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL2	122732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	92317324	92317742	92317530	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	AC097374.3	3246664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	FER1L5	14466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	99077455	99077668	99077504	Y	TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	18138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	99085276	99085461	99085369	Y	NA	INPP4A	COA5,UNC50	IMR90	Hi-C	24141950	INPP4A	25959	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	99121825	99122251	99122089	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	62508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	101566889	101567103	101566996	Y	NA	RPL31	NA	NA	NA	NA	RPL31	49074	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102058393	102058806	102058576	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF149	135230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102327240	102327383	102327307	Y	NA	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	15928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102332970	102333042	102333006	Y	MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	21658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102339341	102339788	102339615	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	28029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD9	506694	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	102918428	102918763	102918475	Y	IL1RL1	NA	IL1R2,IL1RL1	IMR90	Hi-C	24141950	MFSD9	432584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	103106124	103106483	103106267	Y	IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD9	244864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	106414093	106414226	106414159	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	54739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	111976914	111977297	111977138	Y	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	101959	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	113562551	113562581	113562567	Y	IL1A	CKAP2L,IL1B	CKAP2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	29899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	113837856	113838205	113837994	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	128894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	113924878	113925123	113925003	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2	PAX8-AS1	PSD4	K562	ChIA-PET	22265404	PAX8-AS1	41976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	118982588	118982758	118982695	Y	NA	NA	EN1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG2	138560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr2	118983292	118983393	118983340	Y	NA	NA	EN1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG2	139264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	119076927	119077186	119077054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	232899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	119121251	119121438	119121319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	277223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr2	119311902	119312304	119312144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-19E11.1	278382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.19888154332181
chr2	119426780	119427028	119426904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-19E11.1	163658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	119498698	119498987	119498818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-19E11.1	91699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr2	119576873	119577223	119577048	Y	NA	RP11-19E11.1,EN1	NA	NA	NA	NA	RP11-19E11.1	13463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr2	121585967	121586372	121586071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	94768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	125343251	125343272	125343262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP2	1970467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128165400	128165641	128165534	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	21359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF4	106956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	LYPD1	401477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	133803546	133803723	133803632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	376394	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	135351384	135351397	135351390	Y	TMEM163,ACMSD	NA	NA	NA	NA	NA	CCNT2	322408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	135931129	135931440	135931285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP1	123294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	136404449	136404849	136404497	Y	R3HDM1	NA	NA	NA	NA	NA	UBXN4	92340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	136810072	136810283	136810190	Y	UBXN4,MCM6,DARS	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	63452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	138909425	138909801	138909599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	347467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	142708846	142709417	142709132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	2378718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	143580379	143580549	143580472	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1507586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	NA	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	GTDC1	1461565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	143756654	143756995	143756685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1331140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	145042506	145042521	145042514	Y	GTDC1,GTDC1,GTDC1	GTDC1	NA	NA	NA	NA	GTDC1	45614	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	145418039	145419056	145418771	Y	GTDC1,ZEB2	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	GTDC1	329904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	102882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	149981587	149981830	149981709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	350768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMADHC	219754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.72374173623704
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	152159553	152159620	152159604	Y	TNFAIP6	RBM43,NMI	RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NMI	14982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	152735616	152735825	152735663	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	52610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	152846412	152846712	152846699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB4	106881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	152896580	152896660	152896620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB4	56933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	153263916	153264284	153263950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	74165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	153309848	153310421	153310088	Y	CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	120097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	153356449	153356753	153356698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	166698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	153450651	153451105	153450977	Y	PRPF40A	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	121302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	157293916	157294289	157294044	Y	NA	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	4114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	158273487	158273978	158273849	Y	CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	456396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	158736746	158736790	158736768	Y	NA	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	6372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	159951081	159951241	159951194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANC1	127935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	159994086	159994676	159994284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	146634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	162094289	162094955	162094372	Y	NA	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	4295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	162481875	162482596	162482291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A10	203032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	162482624	162482768	162482667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A10	203781	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	162540076	162540145	162540111	Y	TBR1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A10	261233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	162565636	162565807	162565722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A10	286793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	162727867	162728162	162727919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3EP2	214607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	162770388	162770557	162770473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3EP2	172212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	162836472	162836596	162836537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3EP2	106173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	163477809	163478160	163477991	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	IFIH1	304596	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	164563373	164563497	164563435	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	912861	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	165643142	165643316	165643229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	166784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	166946411	166946569	166946490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	138058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	168994093	168994243	168994234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	108408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	170218108	170218468	170218381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS5	115220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	172628972	172629294	172629196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	87053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	172792873	172793084	172792979	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	15915	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	172957811	172957994	172957904	Y	DYNC1I2,DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	7634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	172958586	172958929	172958756	Y	DYNC1I2,DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	6699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.82318250789794
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	172962291	172962684	172962615	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	2944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	173876038	173876102	173876070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	341446	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	176210828	176210945	176210887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G3	163493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD13,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4	NA	NA	NA	NA	HOXD13	14242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	177423330	177423334	177423332	Y	NA	NA	HOXD1,HOXD-AS1,HOXD-AS2,HOXD8	IMR90	Hi-C	24141950	MTX2	291207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	182177260	182177572	182177395	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E3	347285	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	183371281	183371668	183371558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC10	207331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	184978816	184978913	184978865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBPP2	507969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	188899561	188899722	188899605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P2	211493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	82702	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	191030826	191031069	191031046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBCH	175850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBCH	130946	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	191406346	191406617	191406448	Y	NA	TMEM194B	INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	8898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	191660541	191660565	191660553	Y	NA	NA	STAT1,MFSD6,GLS,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	82988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	191706618	191706816	191706674	Y	GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	36737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	678870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	194212584	194212652	194212618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	2226049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	197327086	197327270	197327178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC150	175008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	198144443	198144693	198144592	Y	NA	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	18608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	198537682	198538053	198537906	Y	NA	RFTN2,MARS2	NA	NA	NA	NA	RFTN2	716	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	199322636	199322639	199322638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	655210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	200450287	200450618	200450446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	116298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	200468498	200468920	200468798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	134509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	32977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	NA	CASP10	58774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr2	203231501	203231745	203231624	Y	NA	BMPR2	BMPR2,NOP58	IMR90	Hi-C	24141950	BMPR2	7914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	203520524	203520862	203520558	Y	NA	FAM117B	NA	NA	NA	NA	FAM117B	22623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	204553496	204553837	204553643	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	CTLA4	176672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	205719293	205719630	205719462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTLA4	988784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTLA4	1105550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	507561	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	208175027	208175372	208175141	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF7	145036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF7	146055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	208259563	208259980	208259919	Y	NA	NA	KLF7	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	132481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	208380269	208380775	208380611	Y	METTL21A,CREB1	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	11686	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	208749045	208749238	208749090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD5	116758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	210046809	210047163	210046986	Y	MAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RPE	818126	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	210547424	210547820	210547680	Y	MAP2,MAP2,UNC80	NA	NA	NA	NA	NA	RPE	317469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	211470804	211470937	211470808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	130398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	213546106	213546425	213546344	Y	IKZF2	NA	NA	NA	NA	NA	ENSAP3	2014026	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	215323953	215324149	215324051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENSAP3	236302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	216224117	216224404	216224261	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	49577	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	216614389	216614747	216614614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	282072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	238872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	217934616	217935002	217934772	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	376368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	218230998	218231217	218231116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	388099	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	218576069	218576235	218576145	Y	NA	DIRC3	NA	NA	NA	NA	DIRC3	43081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	219676094	219676389	219676199	Y	PNKD,SLC11A1,TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	102526	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC108	130238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC108	75991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	224810635	224810927	224810791	Y	AP1S3	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	2531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	393064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	432550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	227286091	227286487	227286171	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	375988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr2	227666599	227666819	227666709	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	4124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	227726085	227726127	227726089	Y	NA	RHBDD1	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	27788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr2	227822351	227822632	227822559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	124054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	227842377	227842834	227842635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	144080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	228950123	228950186	228950154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	615255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	769215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	230435730	230436079	230435905	Y	SLC16A14	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	348939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP110	187940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	231534770	231534898	231534834	Y	C2orf72	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	40662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf72	77680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	232095962	232096104	232096033	Y	NA	ARMC9,AC018738.2	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	22706	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	93034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	233096331	233096791	233096507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	272376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	233252147	233252689	233252515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4E2	160073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	233703407	233703613	233703510	Y	NEU2	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	16367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP40	135151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	235457689	235457991	235457840	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4,SPP2,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	53992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	236842338	236842740	236842449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	231350	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	236886303	236886528	236886416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	187562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	236908752	236909098	236908877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	164992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	238190645	238190921	238190759	Y	NA	NA	MLPH,COL6A3,COPS8,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	198185	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	239290977	239291159	239291031	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	42224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	240250439	240250711	240250592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	70419	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	240850818	240851277	240850917	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	111542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	241771658	241772038	241771862	Y	KIF1A	KIF1A	ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	13933	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	241845496	241845803	241845554	Y	NA	NA	LOC200772,SNED1,MTERFD2	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	87771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr2	241901706	241902029	241901870	Y	SNED1	SNED1	NA	NA	NA	NA	SNED1	34226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	241960934	241960944	241960939	Y	AQP12A,PASK	SNED1,AC005237.4	NA	NA	NA	NA	SNED1	24679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	241995888	241996280	241996083	Y	AQP12A,SNED1	AC005237.4,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	AC005237.4	5253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	AC005237.4,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	242696673	242697059	242696869	Y	ATG4B,D2HGDH	D2HGDH,GAL3ST2	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	17181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH,GAL3ST2	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	15495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr2	242703731	242703954	242703858	Y	ATG4B	D2HGDH,GAL3ST2	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	10286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1333009	1333271	1333126	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	38535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	2090589	2090758	2090698	Y	NA	STK35	NA	NA	NA	NA	STK35	10332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	2193195	2193343	2193274	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	PDYN,TGM3,TGM6	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	112938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	5072801	5072926	5072885	Y	NA	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	32346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	5871543	5871937	5871741	Y	CHGB	RNU1-55P,CHGB	CHGB,TRMT6,MCM8,C20orf196,GPCPD1,LOC149837	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-55P	2842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	5900000	5900262	5900165	Y	GPCPD1,TRMT6	RNU1-55P,CHGB,TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	CHGB	9924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	8380615	8380981	8380808	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	269791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	10197196	10197344	10197281	Y	SNAP25	SNAP25	NA	NA	NA	NA	SNAP25	134	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	10224599	10224683	10224625	Y	NA	SNAP25	NA	NA	NA	NA	SNAP25	27121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	10238596	10238857	10238656	Y	NA	SNAP25	NA	NA	NA	NA	SNAP25	41118	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	10280635	10280887	10280744	Y	PAK7,SNAP25,MKKS	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP25	83157	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	10307719	10307737	10307728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP25	110241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	10447085	10447351	10447236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	177663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	158160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	153264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	147437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	142267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr20	10486121	10486184	10486148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	138830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	10501861	10501978	10501938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	123036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.59252668800823
chr20	10573634	10573815	10573748	Y	NA	NA	JAG1	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	51199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	11098477	11098718	11098579	Y	NA	NA	C20orf94	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	473463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	11159709	11159935	11159829	Y	NA	NA	JAG1,C20orf94,LOC339593	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	534695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	14769224	14769434	14769329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD2	795209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	20391161	20391545	20391351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	299586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	24559225	24559497	24559373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	111390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	112354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr20	29637104	29637239	29637172	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	27247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	30796713	30797081	30796897	Y	NA	TSPY26P,PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	3030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	31687729	31687935	31687834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPIFB2	94323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	34093619	34093844	34093641	Y	NA	ERGIC3	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	33926	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	35633884	35634240	35634054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	55638	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36339461	36339780	36339670	Y	GHRH,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	19053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	36542426	36542653	36542463	Y	NA	VSTM2L	NA	NA	NA	NA	VSTM2L	12927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	37398577	37398739	37398665	Y	NA	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	23492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	37603521	37603525	37603523	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	14579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	37626282	37626666	37626585	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	37340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-52P	805766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	41647538	41647782	41647664	Y	L3MBTL1,PTPRT	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF6	436786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.067666495093
chr20	42379932	42380273	42380130	Y	NA	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	86178	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	42948601	42948866	42948737	Y	NA	FITM2	GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FITM2	10792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	43062949	43062981	43062965	Y	NA	RPL37AP1,TTPAL	NA	NA	NA	NA	RPL37AP1	30501	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	44135747	44136004	44135876	Y	ZNF335	WFDC2	NA	NA	NA	NA	WFDC2	39401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	46523491	46523897	46523893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	110131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	47040513	47040840	47040677	Y	NA	NA	SULF2	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	401580	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	47373433	47373685	47373559	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	68735	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	50665033	50665229	50665099	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	153618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	51611135	51611148	51611142	Y	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	613298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr20	52212842	52213180	52212942	Y	ZNF217	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52213211	52213282	52213247	Y	NA	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52238141	52238435	52238216	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	13695	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr20	52277634	52277772	52277670	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	53188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52353948	52354213	52354172	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	129502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52446362	52446831	52446771	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	255975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	259269	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	52489475	52489586	52489523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	265029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	290284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52527037	52527254	52527085	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	295132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52531977	52532203	52532002	Y	NA	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	290183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	52551883	52552311	52551992	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	270075	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	52570477	52570680	52570623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	251706	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	56157531	56157671	56157617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTCFL	58823	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	ATP5E	NA	NA	NA	NA	ATP5E	47226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	57694611	57694956	57694784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	78647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	57750104	57750489	57750217	Y	ZNF831	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	134140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	61565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	60561621	60561764	60561683	Y	GATA5,CABLES2	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	77102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	61553883	61554120	61553955	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	13184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr20	62054029	62054140	62054138	Y	NA	CHRNA4,KCNQ2	NA	NA	NA	NA	CHRNA4	46276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	62085174	62085706	62085468	Y	BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2	KCNQ2,EEF1A2	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	16287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.98617183269465
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr21	10701810	10702195	10702003	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	735225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1207929	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	15450488	15450803	15450511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001347.6	52746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	15853891	15854146	15854069	Y	SAMSN1,HSPA13	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	100086	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	16886196	16886753	16886663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	213591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	17906222	17906467	17906345	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	3676	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	2257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.9723436653893
chr21	17924273	17924626	17924451	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	14130	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	17947903	17948171	17948037	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	37760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	48773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	49257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	50524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr21	18115504	18115510	18115507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	205361	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18123083	18123468	18123447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	212940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18124043	18124292	18124232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	213900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18147470	18147769	18147614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	237327	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	18169774	18170104	18170053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	259631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18173060	18173407	18173379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	262917	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18175747	18176035	18175864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	265604	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	18183173	18183582	18183385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	273030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr21	18183865	18184137	18183887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	273722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18210216	18210502	18210396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	300073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18212520	18212612	18212566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	302377	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	18443678	18443955	18443817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf37	365253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr21	18706000	18706364	18706182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf37	102844	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18809176	18809383	18809253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf37	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	18810265	18810372	18810318	Y	NA	C21orf37	NA	NA	NA	NA	C21orf37	1057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	18919922	18920266	18920094	Y	CXADR	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	37222	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	19156173	19156308	19156241	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	33395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	23855769	23855794	23855782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	923654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	24819380	24819635	24819508	Y	NA	TUBAP	NA	NA	NA	NA	TUBAP	39932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr21	27855729	27855767	27855735	Y	CYYR1	NA	NA	NA	NA	NA	APP	314283	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	28343155	28343488	28343281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	801709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	29656574	29656747	29656720	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	598946	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.59252668800823
chr21	30607939	30608477	30608249	Y	USP16,BACH1,BACH1	BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	43547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	30669074	30669451	30669267	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	104682	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	342665	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	280780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	31248571	31248641	31248639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	61710	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr21	31310863	31311246	31310901	Y	NA	GRIK1	NA	NA	NA	NA	GRIK1	512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	31352522	31352878	31352598	Y	NA	GRIK1	NA	NA	NA	NA	GRIK1	42171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	31455603	31455795	31455698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN17	81176	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr21	31460569	31460950	31460760	Y	KRTAP19-2,KRTAP15-1,KRTAP13-3,KRTAP19-6,KRTAP19-4,KRTAP27-1,KRTAP25-1,KRTAP23-1,KRTAP19-7,KRTAP13-4,KRTAP13-1	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN17	76021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr21	31781146	31781491	31781278	Y	NA	KRTAP13-2,KRTAP13-1	NA	NA	NA	NA	KRTAP13-1	14754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr21	32654582	32654950	32654771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	274608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	32712004	32712421	32712239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	217137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	32727234	32727499	32727493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	202059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	32862869	32863036	32862944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	66522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	32868770	32868927	32868849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	60631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	32926891	32927175	32926925	Y	NA	AP000251.3,TIAM1	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	2383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr21	32929453	32930069	32929726	Y	TIAM1	TIAM1	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	33670455	33670601	33670551	Y	NA	MIS18A	NA	NA	NA	NA	MIS18A	21075	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	33822696	33822707	33822702	Y	C21orf63,C21orf62	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	59257	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	35508184	35508396	35508291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	64314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	35779126	35779282	35779202	Y	RUNX1,KCNE1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	335256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	882816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	36798542	36798764	36798653	Y	NA	NA	CLIC6,RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	576201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	19644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	37558722	37558993	37558858	Y	NA	DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	31642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	NA	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	AP000704.5	263498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	38151764	38151954	38151859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	184858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	38629602	38630247	38630025	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	8015	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr21	39630445	39631374	39631216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	543857	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	40484017	40484221	40484185	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	69556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	41178013	41178017	41178015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	362232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	41872740	41872794	41872767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	664934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	43431472	43431831	43431677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	59473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	43657721	43658000	43657891	Y	PRDM15,PRDM15,C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	NA	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	C2CD2	285722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	43876618	43876727	43876681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE9A	195019	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44166782	44167013	44166806	Y	UBASH3A,PKNOX1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE9A	95036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44499901	44500036	44499938	Y	NA	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	CBS	4848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	84095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	15770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	22276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44930607	44930875	44930782	Y	PDXK,SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	H2BFS	52195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	45195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44937921	44938237	44938215	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	44833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44939768	44940090	44939875	Y	PDXK	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	42980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	44942511	44942810	44942777	Y	PDXK	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	40260	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	44951247	44951619	44951433	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	31451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr21	44988675	44988868	44988840	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	5605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	45015260	45015643	45015451	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	32190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45018693	45018962	45018883	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	35623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	37534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr21	45023085	45023419	45023272	Y	TRAPPC10,PDXK,CSTB,U2AF1	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	40015	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45065485	45065706	45065596	Y	NA	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	11668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	45154719	45155048	45154820	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	17744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10,H2AFZP1	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	46266361	46266565	46266476	Y	ITGB2	UBE2G2,SUMO3,PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	25187	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	46769779	46770045	46769871	Y	NA	NA	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	53007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	217	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr21	47486622	47486909	47486753	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,COL6A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	29102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	48319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr21	48003626	48004009	48003657	Y	S100B,PRMT2	PRMT2	NA	NA	NA	NA	PRMT2	49070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	177574	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	19074552	19074704	19074618	Y	NA	DGCR2	NA	NA	NA	NA	DGCR2	33263	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.31626842424527
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19476851	19477107	19476979	Y	NA	HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45,CLDN5	NA	NA	NA	NA	CDC45	11869	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19703205	19703405	19703340	Y	NA	SEPT5,TBX1	NA	NA	NA	NA	SEPT5	3218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19749283	19749521	19749403	Y	NA	SEPT5,TBX1	NA	NA	NA	NA	TBX1	7057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	20848736	20849050	20848893	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr22	22290676	22291029	22290778	Y	MAPK1,PPM1F	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	PPM1F	14180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	23415058	23415342	23415197	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	4518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	23552686	23553004	23552762	Y	NA	BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	32795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	23647336	23647705	23647592	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	95208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr22	24234499	24234593	24234547	Y	NA	SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	308	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	24756229	24756614	24756466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	55233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	15543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	24833641	24833901	24833753	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	21794	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211B	361556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	25350277	25350613	25350445	Y	NA	NA	KIAA1671,TMEM211,SGSM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211B	363102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	25587613	25587664	25587639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	211680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	26957082	26957129	26957107	Y	NA	TPST2	NA	NA	NA	NA	TPST2	33552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	28198845	28199237	28199052	Y	NA	MN1	NA	NA	NA	NA	MN1	3359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	29469912	29470391	29470070	Y	XBP1,KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	2846	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	29591621	29591757	29591669	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	8083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	30702453	30702564	30702503	Y	TBC1D10A,SF3A1,CCDC157	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	18471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	SEC14L2	10711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	31343097	31343477	31343430	Y	NA	TUG1	NA	NA	NA	NA	TUG1	21186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	31631095	31631484	31631184	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	24870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	34073272	34073505	34073390	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	25401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	218635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	35528321	35528338	35528332	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	96711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	35674868	35675158	35675013	Y	NA	CTA-714B7.5,HMGXB4,TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	18110	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	35998340	35998679	35998418	Y	TOM1,TOM1,HMOX1,APOL6,MB,MB	NA	NA	NA	NA	NA	MCM5	204284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36396636	36396729	36396643	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	25744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr22	36815362	36815553	36815536	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	33299	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	36924116	36924377	36924195	Y	NA	TXN2,FOXRED2,EIF3D	NA	NA	NA	NA	EIF3D	633	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	37490501	37490532	37490517	Y	NA	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	44722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	24738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	38137969	38138286	38138127	Y	TRIOBP	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	46958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr22	39801832	39802048	39801979	Y	NA	TAB1,MGAT3	NA	NA	NA	NA	TAB1	8086	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	39854172	39854554	39854368	Y	CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3	MGAT3	NA	NA	NA	NA	MGAT3	2823	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	40686331	40686363	40686350	Y	MKL1,GRAP2,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	54144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	41294862	41295130	41294948	Y	NA	ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	43781	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	41416837	41417114	41416960	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	40942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr22	41430686	41430887	41430758	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	27169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	42331053	42331125	42331089	Y	SHISA8	SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3	NA	NA	NA	NA	CENPM	10043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	42527695	42528060	42527840	Y	CYP2D6	NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	OLA1P1	24738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	43275806	43275917	43275862	Y	ARFGAP3	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	23694	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	44140171	44140361	44140266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	65856	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	EFCAB6,SULT4A1	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	12505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	44542524	44542650	44542613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-796I17.5	191617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	45406548	45406895	45406618	Y	NA	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	2668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	45554826	45555155	45554995	Y	KIAA0930	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	2507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	45698064	45698164	45698112	Y	NA	FAM118A	NA	NA	NA	NA	FAM118A	4685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	45820096	45820426	45820265	Y	NA	SMC1B,RIBC2	NA	NA	NA	NA	RIBC2	12524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	45899980	45900171	45900075	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	3862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	45900177	45900595	45900449	Y	FBLN1	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	4059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr22	46159997	46160538	46160082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	94319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	72139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr22	46393370	46393721	46393470	Y	C22orf26	NA	C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP6-109B7.3	53864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46432742	46433091	46432929	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	14494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr22	46441533	46441708	46441621	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr22	46442068	46442299	46442118	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	46443810	46444010	46443935	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	3575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	46444150	46444589	46444370	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	2996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46455003	46455485	46455192	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	C22orf26	6979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr22	46462776	46462894	46462836	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.54280630217778
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46516040	46516252	46516108	Y	NA	MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7B	8474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46928379	46928595	46928487	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	2472	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	46973801	46973805	46973803	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	3892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	47126357	47126654	47126612	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	5504	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	47128172	47128501	47128260	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	3657	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	47364562	47364667	47364649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	208044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	48973025	48973426	48973083	Y	FAM19A5,FAM19A5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	89753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	49009124	49009326	49009225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	125852	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	49317056	49317423	49317233	Y	FAM19A5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	433784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50242140	50242406	50242374	Y	MLC1,HDAC10	BRD1,ZBED4	ZBED4,BRD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBED4	3084	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50549796	50549945	50549869	Y	C22orf41,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1	NA	NA	NA	NA	NA	PANX2	57215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50740463	50740842	50740722	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	3214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr22	50908246	50908896	50908576	Y	IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	2558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	3639816	3640081	3639965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN1	199040	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4571700	4571916	4571754	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	38668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4801058	4801218	4801184	Y	NA	EGOT	NA	NA	NA	NA	EGOT	9784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4861560	4861757	4861659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	65220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	4870336	4870525	4870428	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4870806	4870892	4870849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	4881719	4881745	4881731	Y	ITPR1	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	45232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	4892426	4892911	4892721	Y	BHLHE40	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	34066	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	4940826	4940926	4940856	Y	BHLHE40	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	13849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	5028057	5028369	5028268	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr3	5038569	5038695	5038648	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	18923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	5676006	5676437	5676137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	448675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	7888061	7888231	7888148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	653162	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	8540908	8541201	8541046	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	11535651	11535676	11535665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	223656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	11581408	11581480	11581447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	178740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	12137205	12137457	12137242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYN2	93329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	12621651	12621927	12621686	Y	RPL32	MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	25138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	13111176	13111312	13111239	Y	NUP210,IQSEC1	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	1305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	NA	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHCHD4	227194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	14870333	14870348	14870340	Y	GRIP2	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	116743	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15338366	15338748	15338633	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	42127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15358234	15358387	15358263	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	22488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15599049	15599493	15599306	Y	ANKRD28,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	BTD	41355	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	16024262	16024670	16024542	Y	NA	NA	ANKRD28,GALNTL2,MIR563	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	279809	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	16379697	16380223	16379925	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	16557386	16557712	16557598	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	18728828	18729189	18728942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	150663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	19648890	19649201	19649045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	337316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	20361977	20362317	20362175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL1	136193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	23700744	23701062	23700980	Y	NA	NA	UBE2E2,UBE2E1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	144332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	23752138	23752437	23752199	Y	NA	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	92957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	23991964	23992189	23991965	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	5882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	24211422	24211442	24211432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	225340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	25494741	25494759	25494749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	209639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	26758769	26758926	26758778	Y	LRRC3B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	764985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	EOMES	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	42894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	28050894	28051260	28051082	Y	EOMES,CMC1	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	229815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	28270260	28270429	28270345	Y	NA	CMC1	CMC1	K562	ChIA-PET	22265404	CMC1	10646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	30537430	30537491	30537435	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	108503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	33619018	33619340	33619189	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	138155	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	35686061	35686293	35686199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	1298255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	37221290	37221535	37221382	Y	NA	LRRFIP2	LRRFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	1645	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	TCEA1P2	NA	NA	NA	NA	TCEA1P2	29835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	VILL,PLCD1,DLEC1	NA	NA	NA	NA	PLCD1	3632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	39372633	39372790	39372689	Y	MOBP,CCR8	CCR8	NA	NA	NA	NA	CCR8	3436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	39416078	39416196	39416159	Y	TTC21A,MOBP	CCR8,SLC25A38,RPSA	SLC25A38	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A38	6643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	39547353	39547744	39547364	Y	NA	MOBP	NA	NA	NA	NA	MOBP	40664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42002407	42002746	42002471	Y	ULK4	ULK4	NA	NA	NA	NA	ULK4	485	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42113196	42113588	42113376	Y	CCK	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	59902	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.067666495093
chr3	42725997	42726123	42726060	Y	NA	RP4-613B23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-613B23.1	32117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42752817	42753092	42752955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-613B23.1	58937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	42767085	42767242	42767156	Y	FAM198A,CCK,ZNF662,ZNF662,HHATL	CCDC13	NA	NA	NA	NA	CCDC13	45503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	44599751	44600128	44599940	Y	ZNF167	ZNF852,ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF660	17587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	52060	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	45155178	45155398	45155286	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	44269	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	45240276	45240388	45240335	Y	NA	RPS24P8,TMEM158	NA	NA	NA	NA	TMEM158	25382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	46035131	46035483	46035399	Y	CCR5,SACM1L,CXCR6,FYCO1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	46036343	46036779	46036493	Y	CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	1027	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	46235004	46235238	46235110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	199688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	46274760	46275094	46274895	Y	CCR3,CCR2	NA	SLC6A20,FYCO1,CCR1,CCR3,CCR5,CCR2,CCRL2,LTF	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	239444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	47201175	47201471	47201342	Y	CSPG5,SETD2	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	1986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP,TREX1	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	48990226	48990305	48990298	Y	USP4	ARIH2,P4HTM	NA	NA	NA	NA	P4HTM	35014	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	49105949	49106080	49106015	Y	ARIH2	DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS	NA	NA	NA	NA	QRICH1	23716	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	49968490	49968553	49968522	Y	NA	MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MON1A	2884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1	NA	NA	NA	NA	IFRD2	25817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	50411624	50411893	50411737	Y	NA	TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	TMEM115	16583	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	50480518	50480758	50480638	Y	TMEM115	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D2	58917	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	51720527	51720790	51720691	Y	VPRBP	TEX264,GRM2	NA	NA	NA	NA	GRM2	18296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	52073968	52074235	52074157	Y	GPR62	RPL29,DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	14331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	55223485	55223775	55223588	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	565243	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57051619	57051945	57051783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	59412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	NA	NA	NA	NA	NA	ARF4	55884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57639210	57639572	57639391	Y	SLMAP,FAM116A	NA	NA	NA	NA	NA	ARF4	57263	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57779621	57779638	57779630	Y	FAM116A,SLMAP	SLMAP	NA	NA	NA	NA	SLMAP	40444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57818713	57819025	57818868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMAP	79536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	57957829	57958015	57957905	Y	NA	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	34112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	58336517	58336871	58336595	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	60131975	60132178	60132077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1098165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	62214246	62214436	62214339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	88212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	64200446	64200649	64200513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	192788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	64958590	64958764	64958643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRICKLE2,RP11-14D22.2	529438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	66503172	66503179	66503176	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	46508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	66546176	66546348	66546214	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	3339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	66912764	66912998	66912881	Y	NA	NA	SLC25A26	IMR90	Hi-C	24141950	KBTBD8	133729	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	67050514	67050733	67050633	Y	KBTBD8	KBTBD8	NA	NA	NA	NA	KBTBD8	3787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	67217816	67217984	67217900	Y	NA	NA	FAM19A1,FAM19A4	IMR90	Hi-C	24141950	KBTBD8	171089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr3	67455058	67455415	67455236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	247623	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr3	67925227	67925376	67925302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	125983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	67938562	67938814	67938688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	112545	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	68072115	68072134	68072122	Y	NA	FAM19A1	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	20756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr3	68110938	68111204	68111071	Y	FAM19A1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	59579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	68196316	68196649	68196332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	144957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	68324657	68324668	68324662	Y	FAM19A1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A1	273298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	68954073	68954327	68954200	Y	NA	FAM19A4	NA	NA	NA	NA	FAM19A4	25434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	69795384	69795667	69795492	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	8798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-460N16.1	128502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	70374369	70374738	70374554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-460N16.1	327641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	72539985	72540363	72540053	Y	RYBP	RYBP	LOC201617,RYBP,SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	45916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	72936024	72936237	72936180	Y	RYBP,EBLN2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	72940180	72940555	72940311	Y	GXYLT2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	4956	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	73022372	73022552	73022446	Y	PPP4R2,EBLN2	FTH1P23,PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	21384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	78101827	78101902	78101848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	1620658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	172731	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.80523639863539
chr3	97509307	97509490	97509360	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	98483541	98483706	98483644	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	134827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	246544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	99752092	99752383	99752194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	78974	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	103522825	103523125	103522973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	646021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	104155776	104156155	104156140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	1278972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	498225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	107725103	107725159	107725131	Y	NA	NA	MYH15,CD47,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	82713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	111833246	111833569	111833411	Y	BTLA,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	112145303	112145705	112145529	Y	TMPRSS7	NA	CD200	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	96109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	112955237	112955429	112955333	Y	NA	BOC	NA	NA	NA	NA	BOC	27387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	112960908	112961353	112961141	Y	NA	BOC	NA	NA	NA	NA	BOC	33058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	113293012	113293390	113293190	Y	SPICE1,SIDT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	60978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	113473473	113473635	113473557	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	9607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	114119592	114119835	114119768	Y	ZBTB20,KIAA1407,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	346132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	950987	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	1039779	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	114881783	114882005	114881839	Y	GAP43	NA	ZBTB20	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1407	1108323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	114884211	114884392	114884279	Y	ZBTB20	NA	ZBTB20	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1407	1110751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1240292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1239794	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1184726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	115771171	115771507	115771363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	972038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	116318750	116319086	116319022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	424459	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	117568330	117568637	117568613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	824785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	117708320	117708646	117708547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	964775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119042640	119043071	119042746	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH	ARHGAP31,ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	3033	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119052576	119052960	119052743	Y	NA	ARHGAP31,ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	12969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119071062	119071469	119071190	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	31455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119088312	119088468	119088390	Y	NA	ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	48705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119120015	119120150	119120022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	65527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119130443	119130516	119130480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	55161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119304157	119304311	119304231	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH,COX17	RP11-190C22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	48686	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	120463141	120463503	120463258	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	3301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	121149194	121149225	121149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	61732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	121933818	121933831	121933825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC58	166247	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	122295052	122295483	122295147	Y	CD86,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP15,PARP15,PARP14	DTX3L,PARP9,PARP15	NA	NA	NA	NA	PARP15	603	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	122467278	122467457	122467368	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	43214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	122485125	122485355	122485240	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	25316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	122488258	122488637	122488447	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	22034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	123229622	123229815	123229688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY5	63017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	123553686	123553794	123553787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	124770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	124188163	124188429	124188181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	258784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	125554978	125555354	125555286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	78109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr3	125712652	125712829	125712741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	79189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	126108107	126108472	126108304	Y	NA	KLF15	KLF15,CCDC37,ALDH1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	33822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	126939932	126940049	126939992	Y	NA	NA	NUP210P1,CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	375017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	128967680	128967946	128967799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H1FX-AS1	64289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	129180710	129180864	129180787	Y	IFT122	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	23742	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	129486149	129486279	129486214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	124140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16	41376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	132288543	132288708	132288626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA5	82582	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	132685595	132685662	132685629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP3	246292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	135828343	135828732	135828538	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	85351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	136466232	136466235	136466234	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	2985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK1	52601	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	141032180	141032338	141032258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACPL2	86612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	141047061	141047339	141047200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACPL2	101493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	141130337	141130617	141130393	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	73272	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	141133650	141133961	141133787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	69928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	142164400	142165110	142164972	Y	XRN1	NA	NA	NA	NA	NA	XRN1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	146114612	146114675	146114644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	147646	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	146693286	146693521	146693406	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	726320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	778833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	149533104	149533741	149533325	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	4609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	149592323	149592638	149592448	Y	RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	63828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	15530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	151064162	151064557	151064224	Y	P2RY14,P2RY13	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	262678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	151507223	151507685	151507381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	451932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	151514227	151514622	151514246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	444995	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	152091128	152091426	152091240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	105784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	152313972	152314194	152314081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	328628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPS	119649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156041342	156041527	156041435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	229446	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	3780	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr3	158491929	158492257	158492161	Y	NA	MFSD1,RARRES1	RARRES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RARRES1	43444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	158528713	158528852	158528755	Y	MFSD1	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	80228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	158827452	158827795	158827624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	378967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	159745418	159745477	159745450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	369585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	159765726	159765787	159765757	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1	IMR90	Hi-C	24141950	SMC4	349275	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	159983948	159984179	159984064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	130883	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	100432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	160627332	160627671	160627502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1L	155942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	161579541	161579705	161579678	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	758369	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	167174215	167174493	167174354	Y	SERPINI1,SERPINI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	276234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	168580318	168580660	168580401	Y	NA	NA	FER,EGFEM1P	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	19890323,24141950	GOLIM4	768555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	169051059	169051429	169051244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	327977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	170579509	170579531	170579522	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	6741	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	170613123	170613340	170613232	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	11142	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	170795068	170795319	170795194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	170586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171611345	171611619	171611482	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	143799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171825348	171825521	171825406	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	69930	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171859893	171860698	171860535	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	104475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171878014	171878468	171878150	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	122596	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	199108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	172280796	172281206	172280981	Y	TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NCEH1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	41499	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	172304233	172304595	172304362	Y	TNFSF10,TNFSF10	NA	NCEH1,TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	64936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	172377276	172377377	172377327	Y	NA	NCEH1	NA	NA	NA	NA	NCEH1	49631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	174159946	174160135	174160080	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	5583	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	174652666	174653024	174652845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAALADL2	498303	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	174949564	174949783	174949705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	375484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	175245221	175245455	175245299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	79812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	808122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	179165833	179166212	179166067	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	1166	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181007551	181007872	181007712	Y	SOX2,FXR1,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275H4.1	150402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275H4.1	122160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr3	181132362	181132384	181132378	Y	NA	RP11-275H4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-275H4.1	25890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr3	181329651	181329904	181329778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	97810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr3	181367894	181368046	181367970	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	59668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181414061	181414442	181414162	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	13272	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	8912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.01794610926255
chr3	181419160	181419816	181419173	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	7898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.19888154332181
chr3	181422063	181422170	181422118	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	5544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr3	181436210	181436850	181436775	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	8496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181438058	181438556	181438099	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	10344	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	15.614590739228
chr3	181443678	181444149	181443742	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	15964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	20.9944077166091
chr3	181445730	181446151	181445947	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	18016	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	181446923	181447316	181447121	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	19209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181456298	181456477	181456331	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	28584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181473928	181474194	181474085	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	46214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	8.52897813487243
chr3	181474374	181474552	181474521	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	46660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr3	181474625	181474969	181474797	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	46911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr3	181564319	181564507	181564413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	136605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	181674999	181675167	181675083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-416O18.2	162505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	181857684	181857696	181857690	Y	SOX2	RP11-416O18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-416O18.2	20012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	181876844	181877235	181877011	Y	NA	RP11-416O18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-416O18.2	39172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr3	181900608	181900690	181900647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-416O18.2	62936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	182264358	182264360	182264359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	244928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	182285595	182285736	182285666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	223552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	182311462	182311475	182311469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11B	197813	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	182642205	182642465	182642335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	59276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	183233839	183234504	183234033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	89273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	184301316	184301494	184301488	Y	NA	EPHB3	NA	NA	NA	NA	EPHB3	23744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	184434752	184435124	184434840	Y	NA	MAGEF1	MAGEF1	K562	ChIA-PET	22265404	MAGEF1	6916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	77293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	187690684	187690704	187690694	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	178368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	188400806	188401333	188400989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	530961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	605655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	188535836	188535994	188535916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	665991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	189776297	189776673	189776524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	1268193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	1250919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	189794828	189795104	189794939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	1249762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	194048965	194049014	194048990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	168079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	194587129	194587355	194587232	Y	ATP13A3	NA	XXYLT1,PPP1R2,LOC100507391,FAM43A,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	182507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	194820742	194820949	194820800	Y	PPP1R2,ACAP2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	168947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	194821602	194822296	194821841	Y	PPP1R2,ACAP2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	167600	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	194881062	194881476	194881270	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	108420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	195946209	195946432	195946330	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	66396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	3240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	48171	48447	48418	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	2732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	257243	257573	257339	Y	PDE6B	ZNF732	NA	NA	NA	NA	ZNF732	39537	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	640356	640557	640503	Y	ZNF141,ZNF721,TMEM175,CPLX1,PDE6B	PDE6B,MYL5,ATP5I	NA	NA	NA	NA	PDE6B	22983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	765995	766248	766202	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	7389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	789468	789689	789607	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	15831	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	918576	918805	918690	Y	KIAA1530,PIGG,ZNF721,TMEM175,GAK,DGKQ	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	5356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	10079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	1049620	1049756	1049677	Y	NA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	47896	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1181039	1181331	1181185	Y	DGKQ,RNF212	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	19419	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	15864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	1972677	1973039	1972858	Y	WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	1324	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	2063376	2063744	2063670	Y	FGFR3,NAT8L	C4orf48,NAT8L	NA	NA	NA	NA	NAT8L	4137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	2365260	2365459	2365325	Y	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	52931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	2765898	2766146	2766030	Y	NA	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	9795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	5786154	5786273	5786214	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC	75230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	6172675	6172972	6172793	Y	NA	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	27346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	7228179	7228250	7228215	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	35914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOX3	174241	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr4	13257922	13258131	13258027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	74907	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	50346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	15368371	15368749	15368556	Y	CD38,CPEB2,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	100740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	16226860	16227020	16226938	Y	FGFBP2,TAPT1	TAPT1,RPS21P4	NA	NA	NA	NA	TAPT1	13	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	16750260	16750546	16750403	Y	LDB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	494082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	17059500	17059814	17059657	Y	NA	NA	LDB2	IMR90	Hi-C	24141950	QDPR	452043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	21602576	21603408	21603328	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	906671	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	23299933	23300259	23300096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	572360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	24913671	24913932	24913802	Y	CCDC149	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	65894	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	25536997	25537326	25537166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-302F12.1	141146	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	25815962	25816321	25816294	Y	SEL1L3	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	47061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	26114173	26114191	26114182	Y	SLC34A2	RBPJ	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	48886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	26343884	26344230	26344058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	180807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	26522760	26523014	26522887	Y	NA	NA	RBPJ,CCKAR,TBC1D19,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D19	53045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	26887004	26887397	26887051	Y	STIM2	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	26783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	26888311	26888739	26888468	Y	NA	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	28090	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	27351828	27352038	27351933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	491607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	27362567	27362929	27362697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	502346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	28607417	28607640	28607532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1747196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1502512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1494275	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	36270620	36271063	36270847	Y	ARAP2,DTHD1,DTHD1	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1414935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	37394984	37395138	37395101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	290860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	38083648	38084173	38083860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	123592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	38664467	38664838	38664653	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	38697805	38697826	38697816	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	33301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	39152863	39152994	39152905	Y	NA	WDR19	TLR10,FAM114A1,KLB	IMR90	Hi-C	24141950	WDR19	29030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	40181948	40182292	40182189	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	125502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	40205209	40205567	40205376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	148763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	279160	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	46278614	46278629	46278622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAC1P2	445996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	47121817	47122010	47121920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD8	341726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIN2	190841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	53023897	53024042	53023970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA18	108400	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	53829746	53830111	53829929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	213939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	54780399	54780822	54780654	Y	CHIC2	NA	LNX1,SCFD2,PDGFRA,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	148035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	55267012	55267336	55267213	Y	KIT	NA	KIT	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFRA	173748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	55578146	55578442	55578293	Y	KIT	NA	NA	NA	NA	NA	KIT	56061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr4	57940962	57941225	57941094	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	33326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	75397621	75397842	75397732	Y	NA	NA	EREG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTHFD2L	419730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	76611672	76611775	76611733	Y	RCHY1	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	35934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	76621405	76621540	76621497	Y	RCHY1,THAP6,NUP54,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	26169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	77275383	77275784	77275690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM47E	142190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	78096687	78096796	78096741	Y	NA	CCNG2	NA	NA	NA	NA	CCNG2	20383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	79555155	79555549	79555412	Y	BMP2K	NA	FRAS1,BMP2K	IMR90	Hi-C	24141950	BMP2K	139947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	79671266	79671448	79671350	Y	BMP2K	BMP2K	LOC100505702,FRAS1,ANXA3,BMP2K	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP2K	24048	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	81060901	81061131	81061035	Y	ANTXR2,PRDM8	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	1202309	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	82133438	82133457	82133448	Y	PRKG2	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B	829940	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	83680712	83680815	83680808	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM175A	333790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	87626625	87626818	87626720	Y	PTPN13	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	227336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	87700627	87700837	87700672	Y	PTPN13	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	153317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	87920181	87920277	87920229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	50905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	88130914	88131113	88130991	Y	AFF1,HSD17B11	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	28353	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	88943044	88943294	88943160	Y	NA	RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	16224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	595559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	93104192	93104578	93104286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	118972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	93695522	93695754	93695563	Y	GRID2	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	471972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	99009822	99009923	99009829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	170612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	100272514	100272898	100272713	Y	ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	ADH1C	330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	ADH7	NA	NA	NA	NA	ADH7	28874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	100359199	100359607	100359390	Y	NA	ADH7	NA	NA	NA	NA	ADH7	4305	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	8.79140823133004
chr4	100731573	100731850	100731699	Y	NA	DAPP1	RG9MTD2,LOC256880,DNAJB14,H2AFZ	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DAPP1	4140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	15.4833756909992
chr4	100738800	100739047	100738840	Y	NA	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	2810	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	100739781	100739969	100739850	Y	RG9MTD2,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	3791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	100741664	100741845	100741755	Y	RG9MTD2,LAMTOR3,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	5674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	100772280	100772608	100772341	Y	NA	DAPP1,LAMTOR3	NA	NA	NA	NA	DAPP1	36290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	100781740	100782048	100781826	Y	RG9MTD2,DAPP1	DAPP1,LAMTOR3	NA	NA	NA	NA	LAMTOR3	31599	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	101803653	101803895	101803774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP3CA	463540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	107286785	107287042	107286917	Y	NA	TBCK	NA	NA	NA	NA	TBCK	46133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	107780277	107780572	107780473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCK	539625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	108544740	108545114	108544927	Y	SGMS2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	94494	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	109047956	109048357	109048341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	139086	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	109708197	109708208	109708202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSTC	138457	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.19888154332181
chr4	113095488	113095850	113095539	Y	NA	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	30935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	113672704	113673017	113672851	Y	NA	RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	14876	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	114753908	114754213	114754112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	414429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	115193554	115193741	115193670	Y	ARSJ	NA	ARSJ	IMR90	Hi-C	24141950	UGT8	323870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	484131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	119302775	119303090	119302979	Y	NA	PRSS12	NA	NA	NA	NA	PRSS12	30617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr4	119338638	119338745	119338688	Y	NA	NA	PRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	PRSS12	66480	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr4	119890642	119890944	119890758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24D	132804	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr4	119905071	119905247	119905165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24D	147233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	120432594	120432728	120432661	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	58648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	121812608	121812671	121812657	Y	NA	PRDM5	NA	NA	NA	NA	PRDM5	29354	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	NA	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	BBS12	67445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	125156864	125157155	125157010	Y	NA	NA	SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	TECRP2	225790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	127487763	127488061	127487932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	1054365	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	127544750	127544766	127544759	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	997660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	127607957	127608317	127608138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	934109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	128894970	128895372	128895225	Y	NA	C4orf29,MFSD8	NA	NA	NA	NA	MFSD8	9820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	46164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	129847015	129847068	129847042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	165404	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	133409064	133409406	133409234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	1711497	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	139313832	139314247	139314105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	152329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	139865200	139865393	139865387	Y	NA	NA	SLC7A11	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	69550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140578910	140579141	140579109	Y	NA	MGST2	SCOC,LOC100129858,MGST2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MGST2	5781	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	140727942	140728268	140728103	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	143020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140822968	140823259	140823114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	238046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr4	140850270	140850709	140850607	Y	MAML3,CLGN	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	222629	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140868265	140868315	140868290	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	205023	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140886001	140886373	140886187	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	186965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140891718	140892054	140891918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	181284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	140924986	140925148	140925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	148190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	140967961	140968185	140967999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	105153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr4	140986447	140986603	140986580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	86735	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr4	140992977	140993283	140993131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	80055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.47925774904197
chr4	141013693	141013823	141013696	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	59515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	141014112	141014221	141014167	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	59117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	141019887	141020108	141020058	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	53230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	141079705	141079803	141079754	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	6367	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	141164479	141164682	141164571	Y	MAML3	SCOC	MAML3,MGST2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCOC	11758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr4	141218386	141218686	141218436	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41946	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	141851664	141852028	141851967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	176390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	142064762	142064889	142064826	Y	NA	NA	RNF150	IMR90	Hi-C	24141950	RNF150	67142	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	143072986	143072994	143072990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	932945	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	146815736	146815927	146815832	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	41860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	147192653	147192904	147192792	Y	ZNF827,SLC10A7	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	97816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	148754528	148754793	148754631	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	103314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	149124468	149124612	149124541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	473254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	151316952	151317347	151317150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	617532	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	151564216	151564527	151564372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	370352	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	189693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	42332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	153424227	153424394	153424311	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	30859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	154127862	154128178	154128020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	56368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	83008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	154244307	154244410	154244359	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	19391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	154248193	154248592	154248328	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	15209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF175	130906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	154869368	154869583	154869476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF175	189981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	158815027	158815407	158815217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	775870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	159103850	159104073	159103996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	487204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	159451512	159451881	159451714	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	139396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	159641149	159641258	159641192	Y	NA	ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	1290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	159696369	159696741	159696680	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	8079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	162371144	162371411	162371278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	1714662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	328149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	164471489	164471679	164471583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	385416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	166422422	166422684	166422539	Y	KLHL2,CPE	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	142076	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	167737971	167738147	167738059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	1457625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	170266359	170266712	170266646	Y	NA	NA	CBR4,SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3RF1	76103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	170548136	170548389	170548218	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	16352	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	173917824	173917970	173917931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB2	336306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174106562	174106852	174106704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB2	147424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174285204	174285286	174285258	Y	NA	HMGB2,SAP30,SCRG1	SAP30	K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	3834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30,SCRG1	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SCRG1	11808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	174399518	174399676	174399543	Y	NA	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	46745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174435467	174435730	174435599	Y	HAND2	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	10691	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174439063	174439445	174439212	Y	NA	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	6976	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174620122	174620295	174620211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	66600	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	174667670	174667818	174667761	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	114148	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	175148409	175148685	175148547	Y	NA	RP11-148L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-148L24.1	8860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	175261747	175261928	175261838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	58332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	175262329	175262358	175262344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	58914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	175263937	175264166	175264013	Y	CEP44,CEP44,FBXO8	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	60522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr4	175281816	175282139	175281824	Y	CEP44,CEP44,FBXO8	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	78401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr4	175299709	175299785	175299764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	96294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr4	175501777	175502117	175501960	Y	HPGD	NA	NA	NA	NA	NA	HPGD	59472	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr4	175504028	175504273	175504132	Y	HPGD	NA	NA	NA	NA	NA	HPGD	61723	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	175583765	175584003	175583884	Y	HPGD	NA	NA	NA	NA	NA	HPGD	141460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr4	177459522	177459662	177459586	Y	VEGFC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-87F15.2	219913	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	178362238	178362457	178362307	Y	NA	AGA,RP11-130F10.1	NA	NA	NA	NA	AGA	581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	183536176	183536411	183536208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	300678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr4	184888585	184888733	184888700	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	STOX2	116001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	185393561	185393895	185393573	Y	ACSL1,CASP3,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	LRP2BP,ANKRD37,UFSP2	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	9005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr4	186432179	186432538	186432506	Y	NA	RP11-279O9.4,CCDC110,PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	22228	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	189361062	189361328	189361166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	91884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	190523750	190523781	190523766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	105087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	190568433	190568822	190568628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	60046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr4	190937232	190937266	190937251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	77289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.08561260435555
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	190691	190901	190821	Y	SDHA,LRRC14B	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	25429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	NA	NA	NA	NA	NA	CEP72	61850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP72	62474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP13	105735	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	1092786	1092861	1092788	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	17289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	1110480	1111164	1110500	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	NA	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	72720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	1485196	1485502	1485375	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	36590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	2487787	2487964	2487876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	262281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.47925774904197
chr5	7879383	7879659	7879544	Y	NA	MTRR,C5orf49,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	12233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	8981221	8981557	8981405	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	FASTKD3	1114071	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	10562652	10562841	10562738	Y	ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	13325974	13326290	13326142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	616362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	14817188	14817452	14817373	Y	NA	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	20679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	15917889	15917998	15917895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	545903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	164012	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	17284953	17285194	17285064	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	58531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	23415572	23415664	23415586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1393926	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	24579271	24579548	24579410	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	230042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	CTD-2206G10.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2206G10.2	26639	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	34655418	34655812	34655539	Y	NA	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	1076	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	36358126	36358437	36358252	Y	NA	NA	RANBP3L	IMR90	Hi-C	24141950	SKP2	208035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	40280289	40280658	40280474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGER4	396942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40378402	40378773	40378595	Y	PTGER4	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	298827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40430020	40430156	40430070	Y	PTGER4	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	247444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40672647	40672783	40672699	Y	CARD6,PTGER4	PTGER4	PTGER4	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGER4	4817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40840324	40840492	40840354	Y	NA	PRKAA1,RPL37,CARD6	NA	NA	NA	NA	CARD6	1038	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.9364514468642
chr5	40941168	40941181	40941175	Y	NA	C7	NA	NA	NA	NA	C7	33814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	C7	60585	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	41084074	41084331	41084322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6	175209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	42.5136756261333
chr5	41113994	41114275	41114076	Y	NA	NA	C7,C6	IMR90	Hi-C	24141950	C6	145265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr5	41288648	41289018	41288835	Y	NA	C6	NA	NA	NA	NA	C6	29108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr5	41293580	41293658	41293620	Y	NA	C6	NA	NA	NA	NA	C6	34040	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	41793312	41793500	41793406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	75121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	44331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	18848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	49989954	49990143	49990051	Y	EMB,PARP8	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	686778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	50677492	50677845	50677668	Y	NA	ISL1	NA	NA	NA	NA	ISL1	571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	CTD-2207L17.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2207L17.1	42471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	305999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	53309437	53310024	53309694	Y	ARL15	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	294388	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	53522595	53522810	53522723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	81602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	54433990	54434008	54434000	Y	CDC20B	GPX8	NA	NA	NA	NA	GPX8	19938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	57117655	57118000	57117917	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	636087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	58952543	58952885	58952791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	828655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	59183388	59183889	59183871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	597651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	59505321	59505489	59505391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	276051	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	60239574	60239836	60239702	Y	ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	60258688	60258981	60258835	Y	NA	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	19732	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	61661747	61661797	61661772	Y	NA	DIMT1,IPO11	NA	NA	NA	NA	DIMT1	35969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	64800282	64800511	64800289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	56487	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	CENPK	47046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	64947553	64947709	64947631	Y	NA	CTC-534A2.2,TRIM23	NA	NA	NA	NA	TRIM23	27751	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	66016454	66016847	66016518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	582655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	SREK1	711951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	872829	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	66498749	66498986	66498818	Y	CD180	NA	MAST4	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3R1	1010562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	67069285	67069755	67069460	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	439793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	67627127	67627339	67627232	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	117579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	365928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	68007359	68007647	68007503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	379826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	71804159	71804292	71804254	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	189686	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	71852331	71852540	71852377	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	237858	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	134532	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	72715317	72715478	72715398	Y	NA	FOXD1	FCHO2,TMEM171,TMEM174,FOXD1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	26874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	72880420	72880664	72880571	Y	NA	UTP15,ANKRA2	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	20909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	73439577	73439790	73439675	Y	ENC1	NA	RGNEF,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	HEXB	494058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	73965689	73966079	73965884	Y	NA	HEXB,ENC1	RGNEF	IMR90	Hi-C	24141950	ENC1	30440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	77026226	77026494	77026313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP2	52211	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	77148404	77148543	77148518	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	78686873	78686981	78686927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	108132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80260404	80260721	80260547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	311602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80707651	80707683	80707665	Y	SSBP2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC9	112242	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	80927026	80927304	80927299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	118312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	81074673	81075064	81074862	Y	NA	SSBP2	SSBP2,ZCCHC9,ATG10	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP2	29057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr5	81148608	81149026	81148707	Y	SSBP2	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	81149415	81149815	81149554	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	103799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	81327233	81327622	81327332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	61389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr5	81655341	81655441	81655346	Y	NA	NA	VCAN,ATP6AP1L,XRCC4	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	82945	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	82664842	82665072	82664989	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	100212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	82769870	82770125	82769934	Y	TMEM167A,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	87662538	87662727	87662633	Y	NA	RPS3AP22	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	13047	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	87798983	87799105	87799057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	123209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	CTC-467M3.1,LINC00461	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	12867	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr5	87985071	87985193	87985112	Y	NA	CTC-467M3.1,LINC00461	LINC00461	K562	ChIA-PET	22265404	LINC00461	213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	88120689	88121105	88120942	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	76817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	89940937	89941287	89941029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	117536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	90096928	90097131	90097030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	273527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	90579794	90579971	90579883	Y	ARRDC3	RNU4-90P	ARRDC3,LOC100129716,GPR98	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-90P	15250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	92940140	92940350	92940245	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	23097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	93316390	93316647	93316523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	128757	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	93853995	93854051	93854006	Y	ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	98001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	94412847	94413065	94412956	Y	MCTP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	460538	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95207014	95207210	95207113	Y	ELL2	C5orf27	NA	NA	NA	NA	C5orf27	21078	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95294794	95295285	95294896	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	95360201	95360335	95360279	Y	NA	RP11-254I22.1	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	23484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	RP11-254I22.1	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-254I22.1	19892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95406696	95406840	95406768	Y	NA	RP11-254I22.1	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	22877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	31077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95419074	95419624	95419399	Y	ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	35255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95427654	95427940	95427807	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	43835	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	123859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.44748347247407
chr5	95555701	95555931	95555845	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	171882	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	178922	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95594948	95595289	95595074	Y	ELL2	NA	ELL2,RFESD,GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	PCSK1	172558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	95633075	95633361	95633245	Y	GLRX	NA	ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	PCSK1	134486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr5	95676015	95676411	95676184	Y	ELL2	NA	ELL2,C5orf27,MIR583,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	PCSK1	91436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	95845653	95846023	95845804	Y	NA	CAST	NA	NA	NA	NA	CAST	12948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	95904696	95905047	95904872	Y	NA	CAST	PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	45725	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	95986710	95987017	95986807	Y	CAST,CAST	NA	CAST	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAST	127739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	100414170	100414442	100414306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	545161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	101134919	101134927	101134923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAM	952758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	106822252	106822471	106822392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	893328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	109125780	109125881	109125831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	102713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	111181854	111182145	111181999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	312078	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112020535	112020963	112020695	Y	NA	APC	APC	IMR90	Hi-C	24141950	APC	20232	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112054250	112054372	112054293	Y	NA	APC	NA	NA	NA	NA	APC	13055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112242412	112242755	112242610	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	13481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112585948	112586168	112586156	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	236359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	115421672	115422041	115421857	Y	NA	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	2984	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	116259364	116259561	116259432	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	209435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	117774677	117774715	117774696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	532776	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	118747776	118748171	118748023	Y	NA	HSD17B4	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	37967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	119573403	119573585	119573488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	559511	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	119994126	119994308	119994217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	980234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	121427924	121428247	121427929	Y	NA	LOX	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	15944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	ZNF608	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	2512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	128432436	128432693	128432508	Y	SLC27A6,SLC27A6,ISOC1	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	3992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	130971517	130972046	130971999	Y	NA	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	2588	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL6	84119	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131800033	131800450	131800090	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	6285	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	133432825	133433199	133433076	Y	PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	15203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	56760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	134879348	134879728	134879405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFY	145744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	135335114	135335504	135335269	Y	NA	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	27080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	135405259	135405482	135405390	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	42675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	137172827	137173063	137172946	Y	KLHL3,MYOT	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	84788	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	13069	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM2	81557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	LRRTM2	NA	NA	NA	NA	LRRTM2	39082	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	138290386	138290689	138290535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM2	81329	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	138499803	138499980	138499892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	107461	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	138851930	138852095	138852011	Y	NA	TMEM173	NA	NA	NA	NA	TMEM173	8425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139046727	139046903	139046804	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	21843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	14336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	30772	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	47397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	141138262	141138286	141138277	Y	NA	NA	LOC729080,PCDH12,KIAA0141,RNF14,ARAP3,PCDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FCHSD1	109276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	141844342	141844631	141844489	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	140322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	143073364	143073384	143073375	Y	KCTD16	NA	ARHGAP26,KCTD16,HMHB1,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	260287	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	233809	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	146047313	146047450	146047388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1	222439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	146783633	146784144	146783972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	103475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	146831561	146831956	146831686	Y	PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	146887479	146887544	146887495	Y	DPYSL3	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	75	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	146890135	146890280	146890247	Y	NA	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	2516	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147283651	147283737	147283694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	332396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147343599	147343802	147343701	Y	FBXO38	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	272331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	152028	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	147565828	147566233	147565944	Y	FBXO38	CTC-295J13.3	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	49900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147572374	147572821	147572603	Y	FBXO38	CTC-295J13.3	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	43312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147616301	147616769	147616552	Y	FBXO38	CTC-295J13.3	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	147722722	147723108	147722793	Y	SPINK14,SPINK7	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	38238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	148760371	148760619	148760464	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	24801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	152494885	152495216	152495051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAP3	921250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	153900553	153900872	153900681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	77036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	154313326	154313392	154313358	Y	NA	GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	GEMIN5	2377	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	156045600	156045873	156045736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2P3	229676	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	157669030	157669040	157669036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLINT1	384847	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	158364876	158365080	158364964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	159689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	157712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	158477827	158478227	158478027	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	46542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	158507046	158507207	158507202	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	17562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	158521683	158522288	158522053	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	2481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	159355194	159355367	159355277	Y	NA	ADRA1B	NA	NA	NA	NA	ADRA1B	13404	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	159861130	159861264	159861184	Y	PWWP2A,FABP6	C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	PTTG1	14301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	160156032	160156411	160156222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	309203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	165356768	165356782	165356775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P20	97534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	491436	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	169907314	169907450	169907441	Y	KCNIP1	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	845063	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	171838601	171839062	171838738	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	40465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	171854785	171855084	171854937	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	24443	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr5	172202171	172203025	172202666	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	5973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	172710965	172711353	172711102	Y	NA	STC2	ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	STC2	43153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr5	173391394	173391777	173391587	Y	CPEB4	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	78111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	173941794	173942027	173942024	Y	NA	NA	MSX2	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	207509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr5	176187940	176187958	176187949	Y	NA	UNC5A	CDHR2,UNC5A,HK3	IMR90	Hi-C	24141950	UNC5A	47520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	176421508	176421945	176421807	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	25689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	13315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr5	178257722	178258121	178258094	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	26833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	178326649	178327118	178326669	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2,ZNF454	NA	NA	NA	NA	ZFP2	5754	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	178698075	178698460	178698284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF354C	212659	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	180050392	180050585	180050489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6	130980	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	290595	290748	290658	Y	IRF4,DUSP22	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	293338	293822	293579	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	3708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	320653	321052	320689	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	31023	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	330181	330320	330251	Y	DUSP22	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	40551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	1966788	1967127	1966958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	276799	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	2330490	2330806	2330587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	86508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	2377151	2377429	2377354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	133169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	2543068	2543554	2543252	Y	SERPINB1	NA	GMDS,LOC100508120,C6orf195	IMR90	Hi-C	24141950	WRNIP1	220094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4,TUBB2B	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB2B	18098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	3341734	3342066	3341935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	111770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	126135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	3986661	3986667	3986664	Y	PRPF4B	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	4717932	4718044	4717990	Y	PPP1R3G	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	13539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	4990656	4990905	4990781	Y	NA	RPP40	NA	NA	NA	NA	RPP40	11392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	5204719	5205035	5204877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	54137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	3687	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	6826283	6826384	6826333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	279446	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	10589491	10589864	10589781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	103064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	11270585	11270869	11270602	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	109712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	12242168	12242480	12242308	Y	HIVEP1,EDN1	NA	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	235173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	13184302	13184661	13184471	Y	NA	RNU1-11P	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	27627	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	13373745	13373768	13373757	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	46930	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	13404217	13404579	13404523	Y	GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	77402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	14397488	14397752	14397620	Y	RNF182,RNF182,RNF182	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	281616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	15363396	15363519	15363458	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	116531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	15946473	15946620	15946547	Y	NA	NA	MYLIP	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MYLIP	180736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	351348	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	16980273	16980564	16980440	Y	NA	NA	ATXN1,FLJ23152	IMR90	Hi-C	24141950	CAP2	410883	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	17932767	17932988	17932837	Y	RNF144B,KDM1B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	52866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	17948397	17948663	17948653	Y	NA	KIF13A	NA	NA	NA	NA	KIF13A	37191	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	18263099	18263635	18263391	Y	RNF144B,DEK	DEK	NA	NA	NA	NA	DEK	45	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	18308493	18308879	18308567	Y	NA	DEK	RNF144B	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	45439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	18342517	18342875	18342695	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	23904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	18353568	18353841	18353735	Y	RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	12938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	18436625	18436893	18436744	Y	KDM1B,RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	69846	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	18626849	18627153	18627001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	260070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr6	18741782	18741870	18741788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	375003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	18778775	18778874	18778845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	411996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.56075241144033
chr6	18833535	18833568	18833552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	466756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr6	18836304	18836461	18836383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	469525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	19147287	19147423	19147355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	655560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	19298680	19298958	19298819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	504025	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	19448405	19448469	19448461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	354514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	19449826	19449949	19449869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	353034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	19491602	19491780	19491714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	311203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	19514678	19515039	19515010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	287944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	19691933	19692175	19692049	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	110808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	19805542	19805809	19805569	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP4-625H18.2	2559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	20069175	20069519	20069346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	141151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	20575670	20575691	20575681	Y	NA	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	42982	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	20642705	20642902	20642804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	110017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	21028713	21029000	21028890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	496025	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.36187086811852
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	21738487	21738974	21738702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	146515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	21987708	21987959	21987863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	395736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26223563	26223671	26223616	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H3E	180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	26233560	26233958	26233761	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	344	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr6	27146789	27146995	27146901	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30028	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27261332	27261668	27261500	Y	FKSG83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	75636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	27838810	27838848	27838829	Y	NA	HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H4L	441	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN12P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12P1	15544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN12P1,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZNF192P1	26290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23,COX11P1	NA	NA	NA	NA	COX11P1	44475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	28521433	28521958	28521683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	60031	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	31326609	31326903	31326756	Y	NFKBIL1,PBMUCL1	HLA-B,HCP5,MICA	NA	NA	NA	NA	HLA-B	3644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr6	32099404	32099781	32099616	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5	NA	NA	NA	NA	FKBPL	3336	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	32742286	32742469	32742382	Y	HLA-DRA,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPA1,HLA-DOA,HLA-DMB,BRD2,HLA-DQA2,HLA-DQB2	HLA-DOB	TAP2	IMR90	Hi-C	24141950	HLA-DOB	40356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	32819276	32819643	32819486	Y	HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	10466	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr6	34341997	34342182	34342078	Y	HMGA1	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	16269	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	34760607	34760986	34760926	Y	UHRF1BP1	SNRPC,UHRF1BP1	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1	2750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	144552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	35875551	35875739	35875654	Y	SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1	SRPK1	NA	NA	NA	NA	SRPK1	11380	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	37269905	37270172	37270040	Y	C6orf89,TBC1D22B	TBC1D22B,RNF8	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	46357	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	37673124	37673343	37673226	Y	NA	MDGA1	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	MDGA1	8042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	38844345	38844470	38844408	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	GLO1	175428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	40593868	40594266	40594059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRG1	293175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	41623844	41623904	41623860	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	21224	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	41649853	41650127	41649990	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	47233	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	42348376	42348588	42348501	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	69201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	42371710	42371838	42371791	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	42413186	42413554	42413522	Y	NA	TRERF1	GUCA1B,MRPS10	IMR90	Hi-C	24141950	TRERF1	4235	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	42739653	42739820	42739731	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226	TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	27095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	43058034	43058580	43058415	Y	NA	CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	16028	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	43332066	43332081	43332075	Y	NA	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	3135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	43351423	43351855	43351784	Y	NA	ZNF318,ABCC10	TJAP1,TTBK1,DLK2,POLH,SLC22A7,ABCC10,C6orf108,CUL9,YIPF3,LRRC73,POLR1C,CRIP3,ZNF318,XPO5	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF318	16207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.3	144925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	44040704	44041103	44040711	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	315	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	3939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	44396303	44396427	44396307	Y	NA	CDC5L	NA	NA	NA	NA	CDC5L	43041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	45083481	45083547	45083514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	260143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	45338943	45339150	45338952	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	4540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	45428920	45429031	45428964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	85230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	46291119	46291322	46291276	Y	CLIC5,ENPP4,ENPP5,SLC25A27,RCAN2	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP4	195389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52463140	52463494	52463299	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	23427	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	53454332	53454653	53454605	Y	NA	GCLC	KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	GCLC	25115	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	53734127	53734150	53734138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	76832	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	53925678	53925800	53925739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	268383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	54056382	54056519	54056473	Y	MLIP	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	399087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	55228034	55228050	55228042	Y	HMGCLL1,GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	1570739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57216540	57216887	57216780	Y	NA	PRIM2	NA	NA	NA	NA	PRIM2	38937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57251417	57251660	57251585	Y	KIAA1586	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	73814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57288314	57288720	57288442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	110711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57313567	57313842	57313733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	135964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	62595642	62595933	62595816	Y	KHDRBS2	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1C	1323418	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	62807941	62808170	62808057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1C	1111181	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	64057545	64057895	64057656	Y	NA	NA	PTP4A1,EYS	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1C	138194	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	64220104	64220377	64220211	Y	PTP4A1	PTP4A1	PTP4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTP4A1	9289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	70371691	70371695	70371693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	133308	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	71907627	71907757	71907669	Y	NA	LYPLA1P3	NA	NA	NA	NA	LYPLA1P3	34848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	73861458	73861626	73861542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	109312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	74585822	74585900	74585861	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	CD109	182314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	76467215	76467333	76467230	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	10306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	80207886	80208176	80208031	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	36999	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	82631547	82631830	82631690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IBTK	323641	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	82785578	82785603	82785590	Y	NA	NA	C9orf46	MCF7	ChIA-PET	19890323	IBTK	169868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	84131430	84131508	84131469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGM3	229775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	84601276	84601399	84601338	Y	NA	RIPPLY2,CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	33914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	86655114	86655471	86655235	Y	NA	RNU4-12P	NA	NA	NA	NA	RNU4-12P	45406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	88398633	88398672	88398653	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	11255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	89084006	89084236	89084119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	99298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	89591363	89591365	89591364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	79983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	90066169	90066565	90066367	Y	NA	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	5602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	90527291	90527624	90527395	Y	NA	CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	MDN1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	91060377	91060660	91060482	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	55750	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	92644130	92644239	92644185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	1349366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	94494942	94495122	94494946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	1528297	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	94545083	94545465	94545274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	1477954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	95244699	95244909	95244803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	778510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	95324557	95324827	95324692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	698592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	99886915	99887218	99887074	Y	NA	COQ3,RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	15708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	101862927	101863147	101863037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	535679	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	106567550	106567825	106567690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	203841	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	128449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	106768988	106769157	106769073	Y	NA	ATG5	NA	NA	NA	NA	ATG5	2509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	106970547	106970941	106970751	Y	PRDM1,PRDM1,ATG5	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	104432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	61320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	107047078	107047343	107047210	Y	BEND3	RTN4IP1,QRSL1	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	28030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	107437804	107438343	107438064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	90397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	108943872	108944029	108943998	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	64834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	109755732	109756057	109756030	Y	CD164	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	SMPD2	3909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	109805021	109805195	109805086	Y	SESN1,SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	ZBTB24	2581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	110360700	110361043	110360911	Y	GPR6	NA	FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24	IMR90	Hi-C	24141950	WASF1	138164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	110415658	110415810	110415734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF1	83397	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	110606267	110606424	110606326	Y	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	106923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	110617169	110617340	110617254	Y	C6orf186,WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	117825	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	110677101	110677173	110677119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	177757	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	111758931	111759246	111759206	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	43468	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	111925507	111925888	111925538	Y	REV3L,TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	26	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	114603610	114603654	114603632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	273138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	116767554	116767785	116767590	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	12748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	119210409	119210579	119210468	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	2805	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	119214275	119214495	119214295	Y	C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	119477899	119478044	119477972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM9	223572	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	119896932	119897123	119897095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM9	642605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	121894723	121894832	121894778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	121456	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	125205098	125205436	125205268	Y	NA	NA	HEY2,RNF217,TPD52L1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF217	76255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	125282351	125282561	125282440	Y	NA	RNF217	NA	NA	NA	NA	RNF217	660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	126579500	126579620	126579560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPW	79700	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	127741693	127741944	127741787	Y	RNF146	RP3-403A15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	12837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	128847994	128848227	128848111	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	8124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	129819668	129820116	129819858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	209254	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	130453386	130453776	130453491	Y	L3MBTL3,SAMD3,SAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	120542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	131527646	131527881	131527784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L2	145184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	132554019	132554114	132554024	Y	TAAR5	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP3,ENPP1	IMR90,K562,GM12878,H1ESC,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	STX7	278223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	133057339	133057671	133057545	Y	STX7,VNN1,VNN2,VNN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS12	75909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	380399	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	134845573	134845660	134845628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	208323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	135410048	135410230	135410163	Y	NA	HBS1L	AHI1	IMR90	Hi-C	24141950	HBS1L	11964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	135804002	135804049	135804028	Y	NA	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	LINC00271	12440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	296738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	136702762	136702864	136702842	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	93773	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	136789939	136790352	136790100	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	79605	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	136907576	136907759	136907659	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	37619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137231671	137231914	137231792	Y	NA	SLC35D3	SLC35D3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35D3	9488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	SLC35D3	607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137310723	137310892	137310775	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	53406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137416861	137417114	137416980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	52563	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	137418316	137418442	137418404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	54018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137424160	137424524	137424365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RA	59862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137438439	137438749	137438739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL22RA2	54036	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137469913	137470185	137470040	Y	IFNGR1	IL22RA2	NA	NA	NA	NA	IL22RA2	22600	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137517813	137517908	137517861	Y	NA	IL22RA2,IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	20678	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137530573	137530858	137530641	Y	MAP3K5,IFNGR1	IL22RA2,IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	7728	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137538142	137538256	137538167	Y	NA	IL22RA2,IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137543604	137543841	137543754	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	5018	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	137558937	137559207	137559098	Y	NA	IFNGR1	IFNGR1,OLIG3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFNGR1	20351	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137612569	137612863	137612741	Y	NA	NA	IL22RA2	IMR90	Hi-C	24141950	IFNGR1	73983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137671381	137671752	137671510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	132795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	137678748	137679081	137678969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	140162	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	137988139	137988331	137988320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	198020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.62430096457613
chr6	138005111	138005398	138005281	Y	IFNGR1,TNFAIP3	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	180953	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	138005755	138006075	138006062	Y	NA	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	180276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr6	138036542	138037293	138037021	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	149058	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138045007	138045495	138045466	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	140856	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138047812	138048029	138047906	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	138322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	138048378	138048588	138048468	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	137763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138053118	138053503	138053361	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	132848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138053751	138053959	138053916	Y	PBOV1,TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	132392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138075692	138075815	138075736	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	110536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138085431	138085825	138085756	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	100526	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138096329	138096662	138096455	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	89689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	138098319	138098907	138098655	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	87444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138111354	138111837	138111679	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	74514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr6	138113661	138114081	138114010	Y	OLIG3,TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	72270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138115529	138115913	138115812	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	70438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138121024	138121385	138121171	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	64966	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr6	138148087	138148219	138148190	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	38132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.77346212206749
chr6	138149142	138149492	138149237	Y	OLIG3,TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	36859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138150613	138151141	138151010	Y	OLIG3,TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	35210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138151589	138151844	138151703	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	34507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138153323	138153539	138153451	Y	NA	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	32812	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138164498	138164657	138164583	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	21694	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138184436	138184726	138184672	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	1625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138225639	138226065	138225836	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	39288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138226179	138226660	138226368	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	39828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	138289343	138289531	138289436	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	102992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr6	138290142	138290398	138290268	Y	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	103791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr6	138350085	138350335	138350173	Y	PERP	NA	KIAA1244,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PERP	76313	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138421052	138421264	138421123	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	5384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	46.1876969765399
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	139434485	139434651	139434546	Y	REPS1,HECA	HECA	ECT2L,TXLNB,REPS1	IMR90	Hi-C	24141950	HECA	19598	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	139909356	139909574	139909434	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	215599	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	140367136	140367402	140367364	Y	NA	NA	CITED2,TXLNB,ATP6V0D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	CITED2	673379	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	143022659	143022825	143022711	Y	NA	NA	AIG1,ADAT2,LOC100507489,HIVEP2,LOC153910,PEX3	IMR90	Hi-C	24141950	AIG1	356808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	143140738	143141058	143140895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	238575	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	143178456	143178847	143178800	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	200786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	131420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	143274620	143274763	143274640	Y	NA	NA	HIVEP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AIG1	104870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	144474457	144475387	144474631	Y	PLAGL1,STX11	TPT1P4	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	44715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	145713293	145713590	145713442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	341570	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	145858725	145858739	145858732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2A	196421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	148651197	148651450	148651307	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	59757	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	150200694	150201094	150200866	Y	NA	LRP11,RAET1G	NA	NA	NA	NA	LRP11	16495	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	151037354	151037386	151037370	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	147299	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	153002467	153002857	153002662	Y	NA	NA	SYNE1,MYCT1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO5	299857	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	153919839	153920046	153919943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475C16.1	317971	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154486740	154486949	154486839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	342844	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154566463	154566856	154566632	Y	SCAF8	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	262937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154578208	154578409	154578338	Y	SCAF8	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	251384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154829940	154830043	154829992	Y	NA	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	155306251	155306499	155306375	Y	TIAM2	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	154420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	155593046	155593119	155593050	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	17188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	155649228	155649931	155649893	Y	NA	TFB1M	ARID1B,MIR4466	IMR90	Hi-C	24141950	TFB1M	15601	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	157097774	157098131	157097933	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	711	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	157176246	157176601	157176399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	79183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	157726321	157726550	157726459	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	16083	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr6	159416474	159416597	159416565	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	2622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	159523668	159523966	159523820	Y	TAGAP	NA	TAGAP,RSPH3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSPH3	104449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	160136031	160136425	160136369	Y	IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	8192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	160427336	160427466	160427400	Y	NA	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	39205	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	160837218	160837569	160837394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2R	449087	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	161545851	161546111	161545978	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	135092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	163774373	163774768	163774571	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	58264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	163881453	163881850	163881463	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	48421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	KIF25-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF25-AS1	38625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	168375482	168375653	168375488	Y	NA	KIF25-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF25-AS1	20104	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	170338493	170338711	170338563	Y	TCTE3,FAM120B	NA	SMOC2,LOC154449,DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	188838	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	170449336	170449548	170449442	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	148013	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr7	416236	416525	416371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	141408	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	655576	655910	655797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	97643	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	988760	989207	989097	Y	ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	3836	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	2362962	2363263	2363259	Y	AMZ1	EIF3B,SNX8	KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B	IMR90	Hi-C	24141950	EIF3B	28458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2675785	2676022	2675959	Y	SNX8,LFNG	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	6200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2827851	2827916	2827884	Y	NA	AC006028.11	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	45339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	3146978	3147373	3147117	Y	CARD11	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	265020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5388439	5388783	5388611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC18	74262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr7	5490349	5490801	5490564	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	27304	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.067666495093
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	5718052	5718263	5718155	Y	USP42	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	87613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5740810	5741077	5740967	Y	WIPI2,ACTB,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	78293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	5864046	5864273	5864173	Y	USP42,RNF216	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	44676	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	544048	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	9666155	9666488	9666331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006373.1	332163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	10043571	10043672	10043621	Y	NA	AC006373.1	NA	NA	NA	NA	AC006373.1	44920	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	10061109	10061474	10061239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006373.1	62458	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	10196582	10196962	10196873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006373.1	197931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	10276978	10277222	10277208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8P8	211716	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr7	10279597	10279972	10279867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8P8	208966	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	11499121	11499331	11499225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	487622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	12297328	12297575	12297487	Y	ARL4A	TMEM106B	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	48461	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	12582030	12582229	12582042	Y	NA	NA	SCIN	IMR90	Hi-C	24141950	VWDE	140463	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	NA	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	VWDE	317264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	NA	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	VWDE	318092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	14876245	14876455	14876355	Y	DGKB	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P21	767240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	18017428	18017554	18017491	Y	NA	SNX13	SNX13,HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	39304	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	18427075	18427378	18427152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	448951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	18865089	18865093	18865091	Y	HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	881617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	20477231	20477463	20477293	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	RPL23P8	387482	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	21120779	21120894	21120878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23P8	255834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr7	23061903	23062212	23061975	Y	IL6	FAM126A	LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM126A	10154	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	126928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	23488792	23489118	23488955	Y	KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	18968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.23065581988971
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	25934373	25934595	25934484	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10,HOXA5,HOXA-AS3,HOXA7,HOXA6,LOC441204,MIR196B,HOTTIP,HOXA13,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA2,HOXA1,HOXA3,HOTAIRM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	255265	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	26815721	26816027	26815980	Y	SNX10,SNX10,SKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	216831	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA3	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	27149064	27149414	27149148	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	3668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	27907829	27908035	27907932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	129815	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	27980070	27980278	27980209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	202056	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23488	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	28205904	28206253	28206092	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	12109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	28505826	28505846	28505837	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	287464	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	29951912	29952143	29952027	Y	ZNRF2,C7orf41	NA	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	74073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	30204020	30204306	30204163	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	117617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	30278920	30279116	30278994	Y	ZNRF2	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	42807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	36157611	36157822	36157717	Y	NA	EEPD1	EEPD1,KIAA0895	IMR90	Hi-C	24141950	EEPD1	32936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	36248787	36249072	36248912	Y	EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	EEPD1	58029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	36885113	36885488	36885361	Y	KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	28549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	36998037	36998382	36998290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	141473	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	37403436	37403747	37403647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	83105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	39661947	39662014	39661981	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	865	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	40336838	40336939	40336891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	349202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	40624783	40624915	40624850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	637147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	42174635	42174902	42174765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	100567	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	42258020	42258279	42258155	Y	GLI3	GLI3	NA	NA	NA	NA	GLI3	17190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43714128	43714419	43714274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	81860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	43821678	43821920	43821805	Y	DBNL,BLVRA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	25399	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	44884505	44884603	44884554	Y	NA	H2AFV,PURB	NA	NA	NA	NA	H2AFV	1079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	45178203	45178225	45178213	Y	NA	TBRG4	SNHG15	K562	ChIA-PET	22265404	TBRG4	28557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	45633722	45633912	45633893	Y	ADCY1	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	21983	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	47302239	47302434	47302368	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	317722	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	47554592	47554957	47554775	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	65199	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	48430589	48430763	48430671	Y	HUS1,UPP1,UPP1	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	413411	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	50195743	50196096	50195850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	319992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	50350065	50350197	50350095	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	165891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	50859334	50859716	50859525	Y	NA	GRB10	NA	NA	NA	NA	GRB10	175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	51209970	51210106	51210038	Y	COBL	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	350811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	275608	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	55576915	55577332	55577184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	61349	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	55600079	55600443	55600389	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	38238	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	55600779	55601841	55601199	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	36840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	56606357	56606502	56606382	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-760D2.10	56570	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-760D2.10	976251	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	63775449	63776053	63775748	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	9612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	8.0041179419572
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	69091011	69091330	69091153	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	29106	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	69308115	69308415	69308239	Y	AUTS2,AUTS2	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	246210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	70740469	70740869	70740669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	664375	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	73311055	73311352	73311116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	56190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.75551601280494
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	76384038	76384223	76384049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZP3	359203	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	80559039	80559447	80559284	Y	NA	SEMA3C	SEMA3C	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	9364	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	81234371	81234711	81234707	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	HGF	163043	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	142683	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	92794866	92795133	92795011	Y	SAMD9	NA	CCDC132	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC132	64520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	92847144	92847362	92847311	Y	HEPACAM2	CCDC132	NA	NA	NA	NA	CCDC132	12291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	CALCR,GNGT1	NA	NA	NA	NA	GNGT1	12390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	73514	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	96176969	96177132	96177051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	160071	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	96227712	96227722	96227717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	109481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	96694369	96694759	96694746	Y	NA	DLX5,ACN9	DYNC1I1	IMR90	Hi-C	24141950	DLX5	41960	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	100812004	100812607	100812177	Y	NA	AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	5130	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RP11-132A1.3,RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr7	102056938	102057102	102057040	Y	ORAI2	ORAI2,ALKBH4,LRWD1	NA	NA	NA	NA	ORAI2	14451	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-577H5.1	70924	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	103509686	103510063	103509875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC5	336432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	38459	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	104771634	104771765	104771700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	120143	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	106209189	106209713	106209400	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	89729	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	106767105	106767389	106767258	Y	PIK3CG,HBP1	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	40017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	107952376	107952906	107952758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	195771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	729814	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	391947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	110849154	110849473	110849333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	351100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	RN7SKP187	NA	NA	NA	NA	RN7SKP187	45217	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	92245	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	349468	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	120030311	120030667	120030374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	558136	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	121116174	121116412	121116295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	81756	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr7	121120093	121120403	121120217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	85675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	7.61047279727078
chr7	121126211	121126499	121126344	Y	NA	NA	FAM3C	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	91793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	121150464	121150828	121150695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	116046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	121955592	121955853	121955810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASS	173258	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	123283866	123284127	123283979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5	87557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	124402716	124403225	124402962	Y	GPR37	NA	NA	NA	NA	NA	POT1-AS1	164702	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	125279639	125279913	125279647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	340707	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	126658207	126658487	126658347	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	411491	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	126806014	126806101	126806058	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	263877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	127808367	127808804	127808463	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC4	138207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	128549999	128550078	128550039	Y	NA	ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	49119	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	129010616	129010786	129010717	Y	NA	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	37425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	129410177	129410359	129410300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	160622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPG2	200524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	COPG2	220253	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	216343	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	210462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	206421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	NA	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	204156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	NA	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	202806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	NA	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	196939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	NA	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	190892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	NA	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	190035	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	177366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	158985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	150736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	147972	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	126741	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	130675334	130675529	130675395	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	117326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	130684801	130685194	130685004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	107661	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	130756735	130757090	130757043	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	35765	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	132200048	132200272	132200161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	564576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	94774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	134514825	134515095	134514960	Y	STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	87822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	135708293	135708582	135708438	Y	NA	MTPN	C7orf73	IMR90	Hi-C	24141950	MTPN	48192	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	135748931	135749147	135748963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	88830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	135809318	135809401	135809360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	149217	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	137418965	137419308	137419135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	265505	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	139333682	139334086	139333875	Y	TBXAS1,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	116696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	139354231	139354464	139354322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	120386	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	139358057	139358402	139358214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	116448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	TBXAS1,HIPK2	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	42624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	140336135	140336509	140336322	Y	NA	ADCK2,DENND2A	DENND2A,MKRN1	IMR90	Hi-C	24141950	ADCK2	34444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	140572858	140572991	140572984	Y	BRAF	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	49573	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	141371952	141372250	141372100	Y	CLEC5A	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	27703	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	141501394	141501805	141501703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	65273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	141512676	141512822	141512821	Y	TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	76555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	143856214	143856503	143856359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM115A	258923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	144539832	144539937	144539881	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPK1	8344	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1702064	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	148093179	148093348	148093211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	182145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr7	149112304	149112563	149112312	Y	ZNF862	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF746	80345	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	149191913	149192296	149192075	Y	SSPO,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	149413428	149413754	149413591	Y	NA	KRBA1	NA	NA	NA	NA	KRBA1	3556	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr7	149575159	149575279	149575218	Y	NA	ZNF862,ATP6V0E2,ATP6V0E2-AS1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2-AS1	420	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	149745351	149745623	149745500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2-AS1	169652	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	150944094	150944397	150944255	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16519	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	150944441	150944847	150944697	Y	ASB10,SMARCD3	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16866	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	152111667	152111916	152111792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	259334	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	153105018	153105427	153105361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	650184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	AC008060.7	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008060.7	34684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	156309005	156309294	156309056	Y	RNF32	NA	RNF32,C7orf13,SHH,RBM33,LINC00244,LMBR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF32	121681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	157103071	157103446	157103266	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	22629	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	157664220	157664476	157664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	538145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	157956905	157957265	157957085	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	538255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	158044474	158044782	158044628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	450738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	158387429	158387829	158387629	Y	WDR60	NA	PTPRN2	K562	ChIA-PET	22265404	NCAPG2	107691	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	1762268	1762565	1762495	Y	KBTBD11,ARHGEF10	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	7577	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr8	1765271	1765682	1765322	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	4460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	2263330	2263439	2263406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOM2	272175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	4434678	4434868	4434788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	207986	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	6275449	6275723	6275483	Y	NA	MCPH1,RP11-115C21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	12786	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	6400051	6400348	6400277	Y	NA	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	18582	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	6431105	6431496	6431367	Y	NA	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	12175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	6490542	6490767	6490601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	71612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	6577742	6577949	6577849	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	13864	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	8138822	8139029	8138942	Y	NA	NA	SGK223,CLDN23,MFHAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	102979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	8242841	8243169	8242949	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	8340993	8341010	8341002	Y	NA	NA	SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	98985	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	8742026	8742246	8742225	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	6909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	8883496	8883931	8883840	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	25839	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	10191869	10192038	10191953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	282091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	10192260	10192787	10192448	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	282482	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	10591008	10591121	10591065	Y	RP1L1,SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	104236	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	12615021	12615285	12615099	Y	LONRF1	LONRF1	NA	NA	NA	NA	LONRF1	3439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	12728574	12728753	12728653	Y	KIAA1456	NA	KIAA1456	IMR90	Hi-C	24141950	LONRF1	116992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	12819259	12819311	12819288	Y	LONRF1,KIAA1456	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	207677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	16318498	16318830	16318750	Y	NA	NA	MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	692708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	17194213	17194219	17194216	Y	SLC7A2,SLC7A2	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	91826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	18523718	18524110	18523921	Y	NAT1,NAT1,NAT2	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	416130	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	20182767	20183137	20182952	Y	NA	LZTS1	ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	23293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	22395519	22395867	22395693	Y	PPP3CC	RP11-382J24.2,SORBS3,PDLIM2	NA	NA	NA	NA	SORBS3	4632	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	24647521	24647845	24647683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD9	666147	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	25306430	25306773	25306665	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	7219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	26436602	26437074	26436866	Y	PNMA2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	66811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	27265822	27266045	27265950	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	EPHX2	80251	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	27387404	27387600	27387502	Y	PTK2B,PTK2B,EPHX2	EPHX2	NA	NA	NA	NA	EPHX2	41108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	27694349	27694720	27694534	Y	NA	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	737	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr8	28635981	28636227	28636104	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	79000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	29361220	29361668	29361467	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75,MIR3148,LOC286135,MIR548O2,TMEM66,DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	242579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	29381299	29381477	29381388	Y	NA	NA	C8orf75,MIR3148,DUSP4,LOC286135	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	262658	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	29938783	29938843	29938811	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	TMEM66	60	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	30462940	30463157	30463081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	50611	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	30907025	30907279	30907152	Y	LOC100507341,TEX15,PURG	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	17708	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	31040746	31040774	31040760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	151429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	31861794	31862187	31861910	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	366892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	33051592	33051837	33051715	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	FUT10	277103	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr8	36441429	36441454	36441442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1060148	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	37218787	37219218	37219030	Y	NA	NA	ERLIN2,ZNF703	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF703	332051	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	NA	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF703	174787	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	38077409	38077725	38077419	Y	NA	BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B	DDHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DDHD2	3011	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	38217250	38217535	38217393	Y	NA	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	38296830	38297166	38296953	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	27186	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	39767656	39767843	39767773	Y	IDO1	IDO1,IDO2	NA	NA	NA	NA	IDO1	9862	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	39793797	39793934	39793836	Y	NA	IDO1,IDO2	NA	NA	NA	NA	IDO2	3664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	39797063	39797940	39797610	Y	NA	IDO1,IDO2	NA	NA	NA	NA	IDO2	6930	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	39823878	39824078	39824001	Y	NA	IDO2	NA	NA	NA	NA	IDO2	33745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	39850643	39850769	39850706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDO2	60510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	39855903	39856119	39855979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDO2	65770	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	41733569	41733873	41733722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	173635	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	42072486	42072556	42072531	Y	NA	NA	AP3M2,IKBKB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-231D20.2	54159	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	42377318	42377512	42377415	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	17557	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	43097072	43097415	43097345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	103516	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	46856094	46856491	46856295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	1210250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	47885401	47885427	47885415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	181314	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	47914802	47915044	47914853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	151697	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	67961	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49034400	49034692	49034546	Y	NA	NA	SNAI2,EFCAB1,MCM4	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	115440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49086776	49087078	49086884	Y	NA	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	167816	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49282720	49283033	49282877	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	12117	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49448389	49448771	49448580	Y	NA	NA	SNAI2,MCM4,UBE2V2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	153239	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49467466	49467648	49467542	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	172316	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	49470061	49470124	49470086	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	174911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	53242912	53243261	53243214	Y	ST18	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	413142	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	54414943	54415096	54415020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-463C14.1	208161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	54931181	54931405	54931291	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	1684	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	72587	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	56906988	56907115	56907052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS20	77954	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	59310594	59310634	59310626	Y	SDCBP,UBXN2B	UBXN2B	NA	NA	NA	NA	UBXN2B	11189	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	59983682	59983838	59983818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	258571	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	61150810	61150978	61150896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-163N6.2	276376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	61821464	61821801	61821596	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	232127	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	66893726	66894034	66893791	Y	PDE7A	NA	DNAJC5B	IMR90	Hi-C	24141950	PDE7A	141169	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	67668655	67668834	67668702	Y	ADHFE1,SGK3,SGK3	SGK3,PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	9406	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	68097028	68097398	68097213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	103010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	69902361	69902629	69902513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO5A1	842670	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	72836370	72836680	72836477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	955295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	75576382	75576715	75576543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	61903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	236574	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	76148779	76148868	76148824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	254029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	79000264	79000479	79000281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	425895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	152568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	81699574	81699876	81699725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	303720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	82042673	82043029	82042906	Y	PAG1	NA	PAG1	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	147569	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	82203488	82203770	82203698	Y	PAG1	FABP5,RP11-363E6.3	NA	NA	NA	NA	RP11-363E6.3	11807	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.51103202560988
chr8	86853135	86853591	86853380	Y	NA	CTA-392E5.1	CA2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTA-392E5.1	3201	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr8	86870702	86870997	86870771	Y	NA	CTA-392E5.1	NA	NA	NA	NA	CTA-392E5.1	20768	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr8	87006330	87006549	87006394	Y	NA	ATP6V0D2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D2	8778	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	87014840	87015227	87015062	Y	NA	ATP6V0D2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D2	17288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr8	87047480	87047818	87047606	Y	NA	ATP6V0D2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D2	49928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	87065314	87065412	87065360	Y	NA	PSKH2	NA	NA	NA	NA	PSKH2	33438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.64224707383868
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	90154564	90154929	90154750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	613026	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	93154253	93154609	93154431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A7	934531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	93495936	93496276	93496106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	1212513	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	94410297	94410678	94410357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	298111	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	96960626	96960710	96960668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF6	210310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	97919369	97919918	97919418	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	368258	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	98051049	98051098	98051078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	237078	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	98093424	98093753	98093689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	194423	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	101222720	101222891	101222806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2K	61908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	102879018	102879156	102879087	Y	NCALD,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	370190	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	103486772	103487100	103486937	Y	NA	NA	ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	63703	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	104108865	104109263	104109003	Y	NA	NA	FZD6,CTHRC1,DCAF13	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1639H6.2	77209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	107485450	107485801	107485626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXR1	204977	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	108168455	108168523	108168489	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	460214	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	183721	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	114697406	114697676	114697474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	310508	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	115233906	115233914	115233910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	847008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	1112249	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	116695168	116695449	116695309	Y	NA	NA	EIF3H	IMR90	Hi-C	24141950	TRPS1	124450	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117563877	117563889	117563883	Y	NA	NA	EIF3H	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	212853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117744101	117744355	117744228	Y	NA	UTP23,EIF3H	NA	NA	NA	NA	UTP23	32387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117883999	117884137	117884073	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	MIR3610	902	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	117892449	117892609	117892487	Y	NA	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	7344	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P35	235859	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	194161	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	3478	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	123801301	123801636	123801353	Y	ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	9668	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	123845065	123845251	123845073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	53432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	91318	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	124684984	124685340	124685256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	93356	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	80121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	125468258	125468440	125468349	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	7210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	127829528	127829825	127829677	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	260890	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr8	127844573	127844851	127844712	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	275935	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	127908732	127908971	127908856	Y	NA	NA	MYC,LOC727677,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	320362	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.11738688092346
chr8	127928770	127929133	127928805	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	300200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	127938432	127938773	127938643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	290560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	127950397	127950550	127950437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	278783	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	127963308	127963680	127963494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	265653	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.88673106103374
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	180951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	158704	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	116138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.95439755612675
chr8	128134721	128135121	128135085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	94212	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128167127	128167527	128167484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	61806	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	58021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128176067	128176333	128176204	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	53000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	49512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128185119	128185731	128185383	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	43602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128203137	128203490	128203390	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	25843	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr8	128222835	128223182	128223058	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	6151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr8	128227982	128228299	128228180	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1034	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128239593	128240207	128240123	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10260	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128257606	128258262	128257899	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	28273	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128258299	128258698	128258657	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	28966	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	30067	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	128260594	128261000	128260832	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	31261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr8	128264964	128265070	128265034	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	35631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr8	128265922	128266338	128266337	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	36589	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128277603	128277799	128277701	Y	MYC	CCAT1	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48270	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128308850	128309232	128309041	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	79517	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128309901	128310145	128310009	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	80568	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128311782	128311908	128311845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	82449	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128313576	128313848	128313696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	84243	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128319902	128320220	128320122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	90569	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128333152	128333458	128333317	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	103819	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128403573	128403875	128403698	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CASC8	88509	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128418204	128418600	128418512	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	73784	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128435102	128435271	128435258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASC8	57113	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128465837	128465850	128465844	Y	NA	CASC8	NA	NA	NA	NA	CASC8	26534	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	128511779	128511932	128511856	Y	NA	CASC8	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	19395	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128519696	128520090	128519909	Y	NA	CASC8	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	27312	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128523245	128523266	128523257	Y	NA	CASC8	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	30861	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr8	128563207	128563565	128563386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASC8	70823	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128575770	128576030	128575897	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	83386	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr8	128579214	128579541	128579451	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	86830	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128608525	128608821	128608655	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	116141	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128630700	128630869	128630842	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	114811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr8	128658139	128658542	128658339	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	87138	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	128684085	128684435	128684260	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	61245	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128684618	128684766	128684674	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	60914	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr8	128736210	128736278	128736243	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	9402	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	128993662	128993919	128993808	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	129351022	129351309	129351127	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	330165	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	129553292	129553480	129553386	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	532435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	129659601	129660006	129659683	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	638744	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	130430686	130431090	130430988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	596285	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	130549847	130550267	130550199	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	477108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	131259857	131260132	131260043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	193774	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	132577302	132577394	132577348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	336941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC6	177438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	133846055	133846325	133846220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	60437	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	134094333	134095052	134094858	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	217213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	135352426	135352442	135352435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	370850	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	135697258	135697603	135697427	Y	NA	ZFAT	NA	NA	NA	NA	ZFAT	25689	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	NA	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	119198	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr8	137284207	137284373	137284320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	531469	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141110302	141110773	141110688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	355905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	141555144	141555348	141555233	Y	EIF2C2,CHRAC1	CHRAC1	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	35747	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	141920743	141920803	141920776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	89512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.28037620572016
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	142425618	142425919	142425790	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr8	142741264	142741485	142741355	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P38	274089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	142986268	142986706	142986510	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	495895	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	143449565	143449834	143449726	Y	TSNARE1	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	32767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	143528979	143529299	143529138	Y	TSNARE1	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	BAI1	188	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	143532398	143532722	143532656	Y	LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	BAI1	3607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.0994407716609
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	BAI1	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAI1	5207	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.54280630217778
chr8	144144885	144144985	144144950	Y	GML	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	47486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.54280630217778
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H-AS1	28716	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	144960453	144960673	144960604	Y	C8orf73,TIGD5,FAM83H,PLEC,PLEC,EPPK1	NRBP2,EPPK1	PLEC	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	9821	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr8	145257344	145257608	145257476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHARPIN	96317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr9	614528	614756	614656	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	146237	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	642151	642448	642253	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	173860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	683421	683495	683457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT1	156195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	708345	708423	708359	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT1	131267	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr9	708443	708758	708711	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT1	130932	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	758228	758480	758338	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT1	81210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	969561	969923	969742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	78431	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	2018040	2018611	2018274	Y	SMARCA2	SMARCA2	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	4698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	2839342	2839735	2839533	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	2506	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	447114	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	4510954	4511309	4511045	Y	SLC1A1	SLC1A1	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	22510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	4835219	4835506	4835309	Y	CDC37L1,RCL1	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	12785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	4892272	4892588	4892430	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	43981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	RP11-39K24.14	NA	NA	NA	NA	RP11-39K24.14	9863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	5580709	5581016	5580868	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	46009	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.83701067520329
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	7976350	7976664	7976497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	500030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	12421960	12422048	12422006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYRP1	261391	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	12487595	12487982	12487864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYRP1	195457	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYRP1	95764	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	243037	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr9	13064041	13064558	13064334	Y	NA	NA	MPDZ,NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	213031	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr9	13082855	13083077	13082983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	194512	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	13084176	13084414	13084323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPDZ	193175	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	14213496	14213805	14213615	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	101279	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	14229495	14229796	14229646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	85288	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	14316018	14316353	14316263	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	934	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	7211	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	12.4654295817366
chr9	14343303	14343452	14343378	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	28219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	14343788	14343918	14343814	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	28704	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr9	14344703	14345053	14344877	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	29619	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.14916115749136
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	32909	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	34.7719877806337
chr9	14349817	14350014	14349895	Y	NA	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	34733	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr9	14353468	14353873	14353760	Y	NFIB	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	38384	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr9	14395378	14395755	14395567	Y	NA	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	1227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	14400700	14401012	14400908	Y	ZDHHC21,NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	3718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	14437606	14437932	14437918	Y	NA	NFIB	FLJ41200,NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	40624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.42953736321152
chr9	14438651	14438904	14438893	Y	NA	NFIB	FLJ41200,MPDZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	41669	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	14477951	14478302	14478282	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-408A13.2	51738	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	14533478	14534091	14533689	Y	NFIB	RP11-408A13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-408A13.2	3438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr9	16508530	16508711	16508621	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	216101	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	16515842	16516452	16516406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	208360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	16521914	16522385	16522163	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	202427	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	16526132	16526493	16526417	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	198319	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	16666623	16666991	16666807	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	57821	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	16681430	16681562	16681496	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	43250	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	16709928	16710291	16710201	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	14521	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	16710736	16710820	16710819	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	13992	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	5005	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	16794774	16794903	16794900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	69962	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	16854631	16854704	16854668	Y	NA	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	14137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	102.478952666698
chr9	16917257	16917516	16917383	Y	NA	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	48416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	16985936	16986021	16986007	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	BNC2	117095	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	17018101	17018829	17018153	Y	NA	NA	C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	CNTLN	114151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr9	17520540	17520838	17520658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	387560	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	21653394	21653677	21653536	Y	KLHL9,IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	146865	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	22482961	22483350	22483156	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	38121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	26975716	26975874	26975793	Y	NA	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	30255	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	137667	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	34332110	34332236	34332173	Y	NA	SERPINH1P1,KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	NUDT2	4606	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	34575663	34576052	34575846	Y	ARID3C,KIAA1045,DNAJB5,DNAJB5,C9orf25,ENHO,CNTFR,CNTFR	CNTFR,DCTN3	NA	NA	NA	NA	CNTFR	12069	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	34577617	34577859	34577738	Y	ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR	CNTFR,DCTN3	NA	NA	NA	NA	CNTFR	10262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	34588619	34588889	34588721	Y	NA	CNTFR,DCTN3,SIGMAR1	NA	NA	NA	NA	CNTFR	498	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	4061	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	35603577	35603740	35603659	Y	RECK	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	210	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr9	35798752	35798996	35798852	Y	NA	NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	NPR2	8601	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	36037997	36038326	36038187	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	3567	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	37301679	37301776	37301705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	118887	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	37371196	37371387	37371281	Y	PAX5,ZCCHC7,FBXO10,ZBTB5	GRHPR	NA	NA	NA	NA	GRHPR	49276	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	38385905	38386302	38386104	Y	ALDH1B1	ALDH1B1,IGFBPL1	NA	NA	NA	NA	ALDH1B1	4359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	72725457	72725742	72725656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	146195	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.9682257234321
chr9	73025378	73025559	73025525	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	1981	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	73036465	73036957	73036835	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8925	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	73198481	73198826	73198654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	170941	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	73219456	73219798	73219627	Y	TRPM3,KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	191916	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	75106254	75106475	75106392	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	128091	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	79350296	79350357	79350327	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	165565	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	199070	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	80422497	80422534	80422513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	221840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	81329740	81329936	81329769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	419681	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	81341677	81341857	81341765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	431618	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	84889033	84889227	84889130	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD95	387200	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	88357534	88357780	88357692	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	2590	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	88588670	88588806	88588674	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	34609	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	92142091	92142330	92142203	Y	NA	SEMA4D	SECISBP2,SEMA4D	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA4D	31046	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	94860272	94860642	94860609	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	15024	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	SUSD3,C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	95973709	95973758	95973734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NINJ1	79139	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	96057493	96057765	96057581	Y	ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2	C9orf129	NA	NA	NA	NA	C9orf129	48931	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.70579562697449
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr9	97288097	97288106	97288102	Y	FBP1,FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIATL1	153264	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	97590305	97590486	97590422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	103322	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	97711275	97711380	97711332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	224292	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	98237628	98237804	98237716	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	39535	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	98389369	98389482	98389428	Y	NA	NA	LOC158434	IMR90	Hi-C	24141950	PTCH1	112030	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	98899705	98899808	98899766	Y	CDC14B	EIF4BP3	FBP1,C9orf102,PTCH1,LOC158435,LOC158434,LINC00092,FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	6481	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	99774924	99775195	99775041	Y	C9orf21,TDRD7	HIATL2	NA	NA	NA	NA	HIATL2	1062	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	100144851	100144941	100144896	Y	NA	TDRD7	NA	NA	NA	NA	TDRD7	27291	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	101372669	101373069	101372768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABBR2	96410	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	102355271	102355664	102355460	Y	NR4A3	NA	NR4A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554F20.1	224507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	102569580	102569664	102569622	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	ALG2,SEC61B,NR4A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-554F20.1	10507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr9	106488406	106488545	106488476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	365996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	21184	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	107805641	107805776	107805708	Y	SLC44A1,ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	53579	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	109655091	109655246	109655169	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	31713	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	110401220	110401740	110401394	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	106549	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	110690054	110690216	110690137	Y	KLF4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-438P9.1	395383	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	111241256	111241607	111241441	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	145506	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	111434706	111434941	111434824	Y	NA	RP11-220D10.1	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	47593	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	112238648	112239006	112238827	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	19584	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	112578065	112578653	112578312	Y	PALM2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	319475	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	112793164	112793205	112793171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	223715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	112827300	112827392	112827326	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	189528	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	113119206	113119305	113119256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	102286	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	113570937	113571275	113571156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	554017	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	114292075	114292469	114292256	Y	NA	KIAA0368,ZNF483	NA	NA	NA	NA	ZNF483	6636	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	114790542	114790702	114790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	114809786	114810087	114810015	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	125601	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	115606684	115606763	115606738	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	95566	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	115757286	115757809	115757590	Y	NA	ZNF883	NA	NA	NA	NA	ZNF883	14698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	116011576	116011925	116011593	Y	NA	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	23698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	116648716	116649282	116648886	Y	NA	ZNF618	NA	NA	NA	NA	ZNF618	12154	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	118026005	118026393	118026199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	654519	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	118473939	118474297	118474118	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	973284	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	527426	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	119228607	119228748	119228704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	218833	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	119451109	119451442	119451274	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	3528	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	120175638	120175763	120175745	Y	ASTN2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	728057	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	120506613	120506925	120506749	Y	TLR4	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1059032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	120507373	120507587	120507563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1059792	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	1075775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	122115957	122116135	122116045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1224313	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	122135998	122136186	122136092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1204262	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	122545626	122545879	122545677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	794569	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	123877856	123878087	123877972	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	42715	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	124463473	124463936	124463619	Y	TTLL11,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	136137	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	126780014	126780240	126780127	Y	NA	LHX2	NA	NA	NA	NA	LHX2	18065	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	126780358	126780798	126780587	Y	NA	LHX2	NA	NA	NA	NA	LHX2	18409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chr9	127267013	127267383	127267321	Y	NR5A1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	91290	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127424345	127424738	127424542	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	5599	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	127457265	127457441	127457351	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	38519	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	39752	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	49296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127837483	127837706	127837595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAI	66079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127943373	127943395	127943384	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	6823	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	128433867	128434078	128433973	Y	NA	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	33435	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130308766	130308904	130308855	Y	NA	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	30364	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130717134	130717317	130717253	Y	NA	ST6GALNAC4,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	18371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130834970	130835273	130835056	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	6485	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132114489	132114812	132114671	Y	NA	C9orf106,RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21910	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-65J3.1	83347	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.90467717029629
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-65J3.1	84151	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	NA	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-65J3.1	130507	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-65J3.1	151483	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB6	143897	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	90197	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132429420	132429769	132429595	Y	C9orf50,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	3500	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	132543474	132543670	132543602	Y	FNBP1	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,FAM73B,DOLPP1,IER5L,CRAT,LOC100506190,ASB6,C9orf50,PTGES,METTL11A,USP20,TOR1B,C9orf78,TOR1A,GPR107	IMR90	Hi-C	24141950	TOR1B	19762	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132800329	132800698	132800514	Y	NA	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	2775	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132802902	132803300	132803100	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	173	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.37981697738107
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.16710726675391
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	134498956	134499243	134499097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	94301	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	134511243	134511633	134511541	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	101828	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	136019465	136020353	136020023	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	16948	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	136282042	136282102	136282072	Y	NA	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	878	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	136727885	136728287	136727895	Y	SLC2A6,RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	124808	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	137717068	137717259	137717190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	185448	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	138016639	138016801	138016720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	51371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	139223291	139223329	139223306	Y	NA	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	3359	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	139491076	139491256	139491173	Y	NA	NA	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	52412	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chr9	139513037	139513494	139513208	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7,ABCA2	NA	MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGPAT2	66381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	139540778	139541198	139541031	Y	NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AGPAT2	38677	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	24.1435688741004
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	RNF208	3555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.57458057874568
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chr9	140143070	140143291	140143174	Y	LCNL1,ABCA2,SLC34A3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	9405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chr9	140301767	140302162	140302062	Y	NA	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	13552	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140487255	140487495	140487481	Y	CACNA1B,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7	MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	4313	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1B	80793	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	1513605	1514177	1513885	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	3988	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	2243545	2243844	2243759	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	173164	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	2301315	2301326	2301321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	115682	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.41159125394897
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	9978783	9979047	9978917	Y	NA	WWC3	SHROOM2,WWC3	IMR90	Hi-C	24141950	WWC3	2555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	10851081	10851118	10851099	Y	NA	MID1	NA	NA	NA	NA	MID1	1308	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	11455735	11455931	11455831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMELX	146202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	13282012	13282232	13282116	Y	TLR7	NA	LOC100133123	IMR90	Hi-C	24141950	GPX1P1	113227	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	14917883	14918076	14917977	Y	PIGA,MOSPD2,MOSPD2	FANCB,MOSPD2	NA	NA	NA	NA	MOSPD2	28320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	15695028	15695432	15695331	Y	ZRSR2,AP1S2,PIGA	CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5BP1	3973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	15713039	15713439	15713221	Y	NA	CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5B	8086	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	19580626	19581004	19580815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDHA1	220615	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	22666072	22666114	22666093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	709381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39229399	39229443	39229421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	415947	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	6.16710726675391
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.33009659155062
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39951266	39951579	39951437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	83003	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39963356	39963613	39963579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70969	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	9.44748347247407
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	2.49308591634732
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	5.37981697738107
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.72374173623704
chrX	40005202	40005365	40005305	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	29217	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.31215048228807
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	4.46131163977942
chrX	40016662	40016910	40016734	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	17672	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	40017598	40017727	40017669	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	16855	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	41192009	41192079	41192030	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	1358	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	41335242	41335481	41335291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	144591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	41538171	41538545	41538500	Y	CASK	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	242171	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	43728223	43728397	43728303	Y	NA	MAOB	NA	NA	NA	NA	MAOB	11296	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chrX	43831630	43831930	43831676	Y	NDP	NDP	NA	NA	NA	NA	NDP	880	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	43865290	43865713	43865593	Y	NA	NDP	NA	NA	NA	NA	NDP	34540	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	44012182	44012402	44012292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	181432	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	44927976	44928345	44928046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	197219	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR222	363134	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	227542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	45667037	45667329	45667199	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41591	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	46338861	46339028	46338937	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	40712	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	46436763	46437171	46436936	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	5544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	47221453	47221809	47221639	Y	USP11,ZNF81,SYN1	NA	UBA1,USP11	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF41	118536	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.04972038583045
chrX	47467971	47468313	47468102	Y	NA	ARAF,TIMP1,SYN1,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	SYN1	8939	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	48648070	48648274	48648122	Y	SSX3,SLC38A5,MAGIX,GATA1,HDAC6	HDAC6,PCSK1N	NA	NA	NA	NA	HDAC6	9510	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	48748167	48748450	48748403	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	4745	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	48794332	48794681	48794452	Y	PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18967	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chrX	49139256	49139619	49139438	Y	FOXP3,PPP1R3F	CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	14950	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.28037620572016
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	54207583	54207867	54207725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120C	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	56756944	56757158	56757051	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	RP11-622K12.1	3252	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	196006	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	194076	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chrX	70842464	70842816	70842607	Y	TAF1,OGT,CXCR3	NA	NA	NA	NA	NA	OGT	91531	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	71322073	71322349	71322283	Y	CXCR3	RGAG4	NA	NA	NA	NA	RGAG4	27409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	33360	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	74143858	74143903	74143869	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	230664	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	78006102	78006454	78006278	Y	LPAR4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	612899	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	85145367	85145588	85145476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	154978	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	91036961	91037105	91037026	Y	NA	RNU2-26P	NA	NA	NA	NA	RNU2-26P	13987	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	93614717	93614730	93614724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L3	688150	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	94559694	94559705	94559699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	1377957	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	100634638	100634773	100634713	Y	NA	TIMM8A,RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	RPL36A	9039	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.787290289372839
chrX	106984124	106984148	106984136	Y	TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	34424	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	108983045	108983491	108983273	Y	TMEM164,TMEM164,NXT2,NXT2	ACSL4	ACSL4	K562	ChIA-PET	22265404	ACSL4	8413	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	109085106	109085401	109085292	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	110474	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	109091814	109092062	109091940	Y	NA	NA	ACSL4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSL4	117182	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	109330355	109330526	109330451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	86496	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	110001321	110001364	110001343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK3	184149	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.918505337601646
chrX	117654579	117654738	117654653	Y	LONRF3	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	26718	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	124338810	124338926	124338869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	1246748	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4LP1,MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	3.9364514468642
chrX	128238716	128238747	128238732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	416730	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.39364514468642
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.656075241144033
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1,RAB33A	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	132769856	132769864	132769860	Y	NA	RP3-417G15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-417G15.1	33135	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	132987009	132987182	132987097	Y	GPC3	NA	NA	NA	NA	NA	GPC3	130740	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	133509019	133509280	133509152	Y	PHF6	PHF6	NA	NA	NA	NA	PHF6	3736	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	135940631	135940874	135940833	Y	HTATSF1	RBMX,RP11-308D16.4	NA	NA	NA	NA	RBMX	20049	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	809698	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	145184668	145184874	145184771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK2	287318	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	149737740	149738101	149737940	Y	MTMR1,MTM1	MTM1	NA	NA	NA	NA	MTM1	2671	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.262430096457613
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.524860192915226
chrX	150513089	150513108	150513099	Y	NA	VMA21	NA	NA	NA	NA	VMA21	49879	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNMA3	95010	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.44336553051687
chrX	153093734	153093743	153093739	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	277	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	153265554	153265740	153265647	Y	NA	HCFC1,TMEM187,IRAK1	NA	NA	NA	NA	IRAK1	17691	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	153308986	153309188	153309114	Y	NA	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25555	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	1.18093543405926
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	Ty-82	hg19	FANTOM5	0.131215048228807