Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 100053983 100058093 100056587 N NA NA NA NA NA NA PALMD 53338 2 chr1 100058851 100061723 100059985 N NA PALMD NA NA NA NA PALMD 49708 3 chr1 100063517 100067462 100065409 N NA PALMD NA NA NA NA PALMD 43969 4 chr1 100102790 100107541 100104545 Y NA PALMD NA NA NA NA PALMD 3890 5 chr1 101061501 101064174 101063014 N NA NA NA NA NA NA VCAM1 121022 6 chr1 101766043 101769297 101767701 N NA NA SLC30A7 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR1 63738 7 chr1 101874752 101877130 101875917 N NA NA NA NA NA NA S1PR1 172447 8 chr1 109621692 109623941 109622828 N NA WDR47,TAF13,TMEM167B WDR47,SCARNA2 K562 ChIA-PET 22265404 TAF13 3068 9 chr1 112930941 112933520 112931900 N NA CTTNBP2NL CTTNBP2NL,WNT2B,MIR4256,ST7L,CAPZA1,RHOC,MOV10,PPM1J IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTTNBP2NL 5280 10 chr1 113391835 113397540 113392748 N NA NA FAM19A3,PPM1J,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A1 101435 11 chr1 113408143 113409980 113409156 N NA NA FAM19A3,PPM1J,RHOC,AKR7A2P1,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A1 88995 12 chr1 115708213 115711432 115709554 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 384905 13 chr1 117420165 117423807 117421583 N NA PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28882 14 chr1 118319015 118321567 118320444 N NA NA NA NA NA NA WDR3 150805 15 chr1 120684040 120689439 120686449 N NA NA NA NA NA NA NOTCH2 71723 16 chr1 121102037 121143971 121104270 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 196003 17 chr1 143671085 143674798 143673432 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 240950 18 chr1 144533030 144535966 144534090 Y PDE4DIP NA PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NBPF9 78993 19 chr1 145073806 145076458 145075266,145075530 N,N NA;NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 19949 20 chr1 145394965 145398016 145397954,145395691 N,N NA;NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40446 21 chr1 145398874 145400024 145399319 N NA TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,RBM8A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 38438 22 chr1 145967296 145970964 145969525 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 83428 23 chr1 147147453 147150592 147148677 N NA ACP6 BCL9 IMR90 Hi-C 24141950 ACP6 4819 24 chr1 147265725 147268024 147266850 N NA NA NA NA NA NA ACP6 123091 25 chr1 147509041 147512003 147511300 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 108535 26 chr1 148240078 148243522 148241316 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 214230 27 chr1 148246285 148249016 148248323 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 220437 28 chr1 149222136 149226070 149224372 N NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 HIST2H2BF 173159 29 chr1 149512304 149516419 149514403 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 59843 30 chr1 151445086 151447118 151445929 Y C1orf56,RIIAD1,OAZ3 POGZ RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 13145 31 chr1 152019479 152021529 152020601 N NA S100A11 NA NA NA NA S100A11 9968 32 chr1 156473096 156474741 156474693 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 2567 33 chr1 158968547 158971386 158969307 N NA IFI16 NA NA NA NA IFI16 8296 34 chr1 159622542 159625149 159623765 N NA NA NA NA NA NA DUSP23 125610 35 chr1 161368131 161370825 161369363 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83965 36 chr1 162595764 162598575 162596587 N NA DDR2 NA NA NA NA DDR2 3653 37 chr1 162842357 162845793 162843935 N NA NA C1orf110,RGS4,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 81861 38 chr1 16501158 16503927 16502677 Y C1orf64 EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 18576 39 chr1 165344377 165346288 165345524 N NA NA LRRC52,LOC400794 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 253822 40 chr1 165566288 165568992 165567555 N NA MGST3 RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 31118 41 chr1 16824955 16826889 16826122 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 57788 42 chr1 16838537 16842855 16840957 N NA NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP2 71370 43 chr1 16846340 16848537 16847141 N NA NA CROCC,CROCCP3,NBPF1,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 79173 44 chr1 17214308 17216872 17216126 N NA CROCC CROCC,MST1P2,NBPF1,MIR3675,CROCCP2,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 31573 45 chr1 17220943 17224366 17222296 N NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 24079 46 chr1 17229510 17233300 17231513 Y PADI4,PADI2 CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15145 47 chr1 172850959 172856408 172853974 N NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 163695 48 chr1 172860376 172869280 172863448,172867829 Y,N TNFSF4,C1orf9,C1orf9,FASLG;NA NA LOC100506023,TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 150823 49 chr1 172873509 172882004 172878838,172875900 Y,N TNFSF18;NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 138099 50 chr1 172902543 172906802 172904220 N NA NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 113301 51 chr1 172912868 172919907 172917508 N NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 100196 52 chr1 172922477 172927876 172925299 N NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 92227 53 chr1 181102891 181105938 181104819 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 45253 54 chr1 183148490 183151254 183149839 N NA LAMC2 LAMC1,LAMC2,NMNAT2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 3920 55 chr1 184120737 184123187 184121904 N NA NA C1orf21,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 99926 56 chr1 185341255 185344793 185343203 Y NA NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 54794 57 chr1 187993995 187998558 187996909 Y NA NA NA NA NA NA PTGS2 1344436 58 chr1 188011329 188014592 188013066 N NA NA NA NA NA NA PTGS2 1361770 59 chr1 188674207 188677534 188676091 N NA NA NA NA NA NA PTGS2 2024648 60 chr1 192072309 192076821 192074124 N NA NA NA NA NA NA RGS2 701348 61 chr1 192231803 192234072 192232700 N NA NA NA NA NA NA RGS2 544097 62 chr1 204475794 204476628 204476256 N NA PIK3C2B,MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8879 63 chr1 206119931 206131048 206130892 N NA FAM72A NA NA NA NA FAM72A 7863 64 chr1 208114909 208116859 208115525 N NA NA CD34 IMR90 Hi-C 24141950 CD46 189526 65 chr1 208135168 208142996 208136540 N NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD46 209785 66 chr1 209118052 209120246 209118693 N NA NA NA NA NA NA PLXNA2 700387 67 chr1 209995596 209998448 209997023 Y NA C1orf74,DIEXF TRAF3IP3,IRF6,DIEXF,SYT14,C1orf74 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DIEXF 2864 68 chr1 218670576 218674118 218672778 N NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 151900 69 chr1 219473991 219480412 219477401 N NA NA RRP15,LOC728463,TGFB2,LYPLAL1 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 126799 70 chr1 219494989 219499422 219498211 N NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 147797 71 chr1 219500820 219505318 219503169 N NA NA RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 153628 72 chr1 220905368 220907360 220906138 N NA C1orf115,MARC2 C1orf115,MARC2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MARC2 14316 73 chr1 222638232 222639481 222638827 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AIDA 246383 74 chr1 22270091 22273064 22270804 N NA HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 6341 75 chr1 224179027 224212618 224180400 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 89173 76 chr1 224644369 224647076 224645280 N NA WDR26 FBXO28,CNIH4,WDR26 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR26 22368 77 chr1 224684643 224688090 224686541 N NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 62642 78 chr1 224690311 224692528 224691461 Y NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 68310 79 chr1 224728502 224733394 224730226 N NA NA CNIH3,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 106501 80 chr1 225950590 225952461 225951302 N NA SRP9,EPHX1 ENAH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRP9 13054 81 chr1 226189375 226191458 226190291 Y H3F3A,C1orf55 C1orf55 NA NA NA NA C1orf55 2309 82 chr1 227615081 227618860 227617077 N NA NA CDC42BPA,PSEN2,C1orf95,ITPKB,ADCK3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42BPA 109255 83 chr1 234792183 234794186 234793148 Y NA IRF2BP2 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 46912 84 chr1 234906912 234909492 234908288 Y IRF2BP2 NA LOC100506810,IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,TOMM20,RBM34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 161641 85 chr1 235052345 235055632 235054136 N NA NA LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506810,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 236624 86 chr1 235121838 235125004 235122999 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 167252 87 chr1 235132108 235134889 235133266 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 157367 88 chr1 235183160 235185028 235183989 Y NA NA LINC00184,LOC100506795,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 107228 89 chr1 23550468 23553239 23551692 N NA HTR1D KDM1A,LUZP1,LOC729059,HTR1D,HNRNPR,E2F2,LYPD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 HTR1D 29246 90 chr1 244892745 244894980 244893472 N NA NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 PPPDE1 76393 91 chr1 245126651 245129157 245127682 N NA EFCAB2 EFCAB2,HNRNPU,HNRNPU-AS1,COX20 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 4127 92 chr1 25045220 25048512 25046778 N NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 23248 93 chr1 25050514 25053480 25051803 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18280 94 chr1 26248908 26250431 26249681 N NA STMN1 STMN1,PAFAH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STMN1 15915 95 chr1 26945621 26950504 26947274 N NA NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72018 96 chr1 30180847 30183882 30182384 N NA NA PTPRU,MECR,LOC100129196,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 MECR 623393 97 chr1 31627054 31629415 31627900 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 88490 98 chr1 32408690 32411286 32410350 N NA PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A2 4702 99 chr1 33435886 33439905 33438624 Y KIAA1522,ADC NA NA NA NA NA AK2 62607 100 chr1 41835367 41852040 41848487 N NA NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 SLFNL1 347940 101 chr1 45731564 45733477 45732206 N NA LOC400752 ZSWIM5,UROD,HECTD3,BTBD19,PLK3,TCTEX1D4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400752 36105 102 chr1 564340 570425 567494 N NA NA NA NA NA NA LINC00115 192477 103 chr1 59548920 59551591 59549982 N NA NA FGGY,LOC100131060,HSD52,JUN,MIR4711 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 299135 104 chr1 61422525 61428814 61423906,61427052 N,N NA;NA NA NFIA,INADL IMR90 Hi-C 24141950 NFIA 114132 105 chr1 61514914 61518773 61516424 Y NA NFIA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 24173 106 chr1 61522024 61523726 61523085 N NA NFIA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 19220 107 chr1 62070838 62073806 62072331 N NA NA INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 117289 108 chr1 66903055 66906072 66904698 N NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 SGIP1 93753 109 chr1 67933079 67935843 67933837 N NA SERBP1 IL12RB2,IL23R,SERBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERBP1 36956 110 chr1 68083315 68085517 68084590 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 65343 111 chr1 68849432 68851464 68850544 N NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 111335 112 chr1 74058089 74060303 74059470 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1138533 113 chr1 79296249 79298940 79297533 N NA NA NA NA NA NA ELTD1 173555 114 chr1 8013406 8016378 8014351 N NA PARK7 NA NA NA NA PARK7 5336 115 chr1 80323420 80327135 80325414 N NA NA NA NA NA NA ELTD1 850925 116 chr1 8154180 8159563 8156468 N NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 132466 117 chr1 8179688 8183994 8181399 N NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 157974 118 chr1 82166826 82171535 82169363 N NA NA NA NA NA NA LPHN2 94547 119 chr1 8241345 8244000 8242439 N NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 219631 120 chr1 85064265 85067379 85065295 N NA CTBS GNG5,CTBS,PRKACB,MCOLN2,RPF1,C1orf180,UOX,LPAR3 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 24102 121 chr1 85067938 85070698 85069364 N NA CTBS PRKACB,CTBS,MCOLN2,RPF1,GNG5,C1orf180,UOX,LPAR3,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 27775 122 chr1 86071379 86074877 86073187 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 24935 123 chr1 87160907 87163027 87161906 N NA SH3GLB1 CLCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GLB1 7226 124 chr1 88149734 88151881 88150675 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 HS2ST1 769399 125 chr1 9459394 9463544 9461080 N NA NA SLC25A33,SPSB1,H6PD IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 164531 126 chr1 94783722 94794817 94785113,94790828 Y,N NA;NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 80415 127 chr1 9488045 9489921 9489058 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 193182 128 chr1 9500685 9502728 9501791 N NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,TMEM201,PIK3CD IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 205822 129 chr1 95248769 95250762 95249437 N NA NA ABCD3,F3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 CNN3 141973 130 chr1 98786974 98808028 98789085,98793346,98802261 Y,N,N NA;NA;NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 LOC729987 110707 131 chr1 98809043 98813469 98810490 N NA NA NA NA NA NA LOC729987 132776 132 chr1 98852763 98856269 98854255 N NA NA MIR137HG,MIR2682 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729987 176496 133 chr10 106098804 106101240 106099791 N NA ITPRIP ITPRIP,GSTO1,GSTO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 5141 134 chr10 10913196 10915687 10914230 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 131572 135 chr10 112157450 112159827 112158936 N NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92743 136 chr10 115141327 115142959 115141976 Y TCF7L2 NA VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2 IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 295976 137 chr10 115785424 115787708 115786562 N NA NA NHLRC2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf118 146656 138 chr10 11854695 11857138 11856242 N NA C10orf47 NA NA NA NA C10orf47 8259 139 chr10 126603491 126608710 126605699 N NA ZRANB1 ZRANB1,CTBP2,METTL10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZRANB1 21982 140 chr10 130844094 130846160 130845175 N NA NA EBF3,MGMT IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 919626 141 chr10 15426123 15429290 15427982 N NA NA FAM171A1,NMT2,FAM188A IMR90 Hi-C 24141950 NMT2 215428 142 chr10 17256180 17259519 17258398 N NA TRDMT1,VIM CUBN,TRDMT1,VIM IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VIM 10739 143 chr10 17551147 17555744 17554655 N NA NA CUBN,ST8SIA6,PTPLA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAM 130380 144 chr10 17568374 17569923 17569711 Y VIM NA PTPLA IMR90 Hi-C 24141950 STAM 116201 145 chr10 21580385 21583918 21581961 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 C10orf140 230693 146 chr10 21623446 21625098 21624498 N NA NA MLLT10,C10orf140 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf140 189513 147 chr10 21651540 21655916 21653235 N NA NA C10orf140 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf140 158695 148 chr10 21657207 21660604 21658872 N NA NA C10orf140,MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf140 154007 149 chr10 22517451 22519636 22518491 N NA LOC100130992 COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100130992 21365 150 chr10 30236949 30239749 30238346 N NA NA SVIL,KIAA1462,MTPAP,MAP3K8,MIR604 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 108739 151 chr10 30380525 30381563 30380701 N NA KIAA1462 KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 32037 152 chr10 30932309 30938331 30934355 N NA NA MAP3K8,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 209359 153 chr10 31072063 31076569 31073621 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 244297 154 chr10 31984591 31988762 31986898 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 229008 155 chr10 31994946 31999045 31996826 N NA NA ZEB1,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 218725 156 chr10 32043257 32050651 32049174 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167119 157 chr10 32640701 32669336 32654744,32667177 N,N NA;NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 4588 158 chr10 32733693 32736827 32735464 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 97580 159 chr10 32799429 32802672 32800758 N NA NA NA NA NA NA EPC1 163316 160 chr10 33249706 33258262 33251020 Y NA ITGB1 ITGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 2413 161 chr10 33268797 33273463 33271079 N NA ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 21504 162 chr10 33292480 33295819 33294531 N NA ITGB1 ITGB1,C10orf68 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 45187 163 chr10 3493852 3496662 3494924 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 278819 164 chr10 3507338 3512584 3510594 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 292305 165 chr10 3514134 3515524 3514815 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 299101 166 chr10 36459751 36464299 36461124 N NA NA NA NA NA NA FZD8 529389 167 chr10 36777263 36780752 36779080 N NA NA FZD8 IMR90 Hi-C 24141950 FZD8 846901 168 chr10 3846277 3850471 3847949 N NA KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 18804 169 chr10 3851931 3853634 3852640 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 24458 170 chr10 3870377 3872316 3871542 N NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42904 171 chr10 3892958 3895574 3894260 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 65485 172 chr10 3927588 3932023 3929681 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 100115 173 chr10 4283520 4286463 4286003 N NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 433799 174 chr10 43914897 43917328 43916033 N NA HNRNPF ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPF 10201 175 chr10 4745215 4749877 4746561 N NA LOC100216001 LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100216001 24953 176 chr10 4786767 4823077 4821131,4813137 N,Y NA;NA AKR1E2 KLF6,LOC100216001,LOC338588,PITRM1,PFKP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AKR1E2 45325 177 chr10 4844193 4848486 4846970 N NA AKR1E2 KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1E2 19916 178 chr10 52037712 52038247 52037979 Y SGMS1 NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21A 210028 179 chr10 54202629 54204873 54203336 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 128588 180 chr10 54337391 54340147 54338888 N NA NA LOC100506939,DKK1,PRKG1 IMR90 Hi-C 24141950 DKK1 263350 181 chr10 5589357 5591100 5590294 Y NET1,CALML3 NA NA NA NA NA NET1 134839 182 chr10 63594673 63599050 63596335 N NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 61963 183 chr10 6763075 6765876 6763951 N NA NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC439949 140688 184 chr10 69523010 69525376 69524148 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 119051 185 chr10 69608946 69612419 69609577 N NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 32008 186 chr10 70820239 70823525 70821274 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24303 187 chr10 73647474 73650709 73648674 N NA PSAP PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,CDH23,ASCC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 36392 188 chr10 74056315 74059766 74057417 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 22638 189 chr10 75724883 75727496 75726061 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 30376 190 chr10 78581995 78582845 78582453 N NA NA NA NA NA NA POLR3A 1206453 191 chr10 80199460 80220101 80217757 N NA NA RPS24,LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 405942 192 chr10 94514717 94522148 94516637,94520498 N,Y NA;NA NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 65036 193 chr11 103397406 103405618 103400593,103404126 N,N NA;NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 434462 194 chr11 103455549 103460473 103458480 N NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 492605 195 chr11 103478094 103481945 103480290 N NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 515150 196 chr11 103501155 103506100 103503682 N NA NA NA NA NA NA DCUN1D5 538211 197 chr11 104979998 104982387 104981198 N NA CASP1 NA NA NA NA CASP1 7840 198 chr11 108903976 108906577 108904895 N NA NA DDX10 IMR90 Hi-C 24141950 DDX10 368160 199 chr11 10951301 10954462 10952714 N NA NA EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 71681 200 chr11 109939660 109941933 109940328 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C K562 ChIA-PET 22265404 ZC3H12C 22154 201 chr11 110233006 110234818 110233970 N NA NA RDX MCF7 ChIA-PET 22265404 RDX 65569 202 chr11 114210351 114212212 114211262 N NA NNMT REXO2,FAM55D,FAM55A,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 NNMT 43816 203 chr11 114229059 114231703 114229947 N NA C11orf71,RBM7 NA NA NA NA C11orf71 39436 204 chr11 114234882 114239207 114237813 N NA C11orf71,RBM7 NNMT,REXO2,RBM7,C11orf71 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf71 31932 205 chr11 119454812 119456370 119455400 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 RNF26 249602 206 chr11 12101977 12103289 12102289 N NA NA MICAL2 IMR90 Hi-C 24141950 DKK3 71060 207 chr11 12105705 12128601 12108987,12112066 N,N NA;NA NA MICAL2,DKK3,MICALCL,TEAD1,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK3 74788 208 chr11 128022499 128024932 128023687 N NA NA KCNJ1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 538879 209 chr11 128210840 128214269 128212944 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 349542 210 chr11 13236358 13239307 13237893 N NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD10 245531 211 chr11 134818145 134820578 134819120 N NA NA NA NA NA NA ACAD8 694711 212 chr11 17226233 17237196 17230222 N NA PIK3C2A NUCB2,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C2A 34879 213 chr11 27954386 27957424 27956152 N NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 172322 214 chr11 28722585 28744290 28725248 N NA NA BDNF,BDNF-AS1,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 592787 215 chr11 29139212 29144454 29141825 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 1009414 216 chr11 29329747 29349422 29331786 N NA NA BDNF-AS1,BDNF,MIR610,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf46 995227 217 chr11 33958142 33959601 33958966 Y NA NA LMO2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAPRIN1 113629 218 chr11 38011166 38014130 38012455 N NA NA NA NA NA NA TRAF6 1479303 219 chr11 40349866 40352414 40350932 Y NA NA NA NA NA NA API5 2981091 220 chr11 43664640 43675479 43665746 N NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 26664 221 chr11 46257548 46266696 46264990,46259701 Y,N NA;NA NA PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF21A 114563 222 chr11 47212624 47213824 47213274 N NA ARFGAP2,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARFGAP2 13948 223 chr11 47414959 47418381 47416475 N NA SLC39A13,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 11665 224 chr11 47925939 47928382 47927412 N NA NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 55882 225 chr11 57042847 57046638 57044772 Y UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 45775 226 chr11 57771071 57774013 57772302 Y NA NA NA NA NA NA TMX2-CTNND1 291076 227 chr11 65243056 65247552 65245038 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17681 228 chr11 65256276 65262472 65261469,65261443 Y,Y CDC42EP2;CDC42EP2 MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2761 229 chr11 72887364 72889601 72888810 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARHGEF17,STARD10,MIR4692,P2RY2,ARAP1 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 34221 230 chr11 73489087 73492372 73490404 N NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6545 231 chr11 75268705 75270976 75269783 N NA SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 2125 232 chr11 75945770 75947063 75946728 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 144817 233 chr11 76298735 76301171 76299622 N NA NA C11orf30,LRRC32,GUCY2E IMR90 Hi-C 24141950 LRRC32 80620 234 chr11 76339099 76342714 76341087 N NA LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 39077 235 chr11 76533113 76536883 76534856 Y GDPD4 TSKU,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 35034 236 chr11 85884759 85886461 85885428 Y NA NA PICALM,CCDC83,EED,C11orf73 IMR90 Hi-C 24141950 EED 69345 237 chr11 85912894 85914633 85913482 N NA EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 41173 238 chr11 86429299 86432741 86430989 Y PRSS23 ME3 PRSS23,ME3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ME3 45621 239 chr11 86447394 86455760 86448884,86452430 N,N NA;NA NA PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 55731 240 chr11 87078705 87081391 87079747 N NA NA NA NA NA NA TMEM135 329819 241 chr11 89338592 89342416 89340209 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 614116 242 chr11 9384669 9387085 9386012 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 19084 243 chr11 9589613 9592214 9590783 N NA WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 3014 244 chr11 9633513 9637159 9635260 N NA WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 38285 245 chr11 9647209 9649885 9648442 Y NA SWAP70 SWAP70,ZNF143,SBF2,WEE1,ADM IMR90 Hi-C 24141950 SWAP70 35743 246 chr12 10402682 10406180 10402840 N NA GABARAPL1 NA NA NA NA GABARAPL1 37193 247 chr12 105349466 105353089 105352159 N NA C12orf45 CHST11,SLC41A2,TXNRD1,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf45 27009 248 chr12 105820497 105823326 105821864 N NA NA NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 96083 249 chr12 105825422 105830289 105827759 N NA NA NUAK1,CKAP4 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 101008 250 chr12 105836310 105841340 105839066 N NA NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf75 111896 251 chr12 105859159 105900113 105860794,105864127,105879462,105874095 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NUAK1,TCP11L2,CKAP4 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 134745 252 chr12 105980291 105987048 105981129 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 255877 253 chr12 106422858 106425318 106424470 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 CKAP4 216395 254 chr12 115790143 115793440 115792196 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 921551 255 chr12 116818670 116821880 116820256 N NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 103679 256 chr12 120727501 120730728 120729949 N NA PXN PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PXN 23927 257 chr12 122028565 122030106 122028841 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B,ANAPC5,CAMKK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM2B 9645 258 chr12 123846542 123854370 123846981,123850183 N,N NA;NA SBNO1,SETD8 SBNO1,RILPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SBNO1 11554 259 chr12 123929538 123931760 123930675 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RILPL2 8274 260 chr12 14412478 14414214 14413327 N NA NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 104397 261 chr12 20097843 20100805 20099294 N NA NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 PDE3A 421374 262 chr12 21568217 21572013 21569696 N NA PYROXD1 NA NA NA NA PYROXD1 18525 263 chr12 25536960 25540841 25539232 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 133106 264 chr12 26426601 26428802 26427826 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506451 314226 265 chr12 28341504 28344887 28344028 N NA NA KLHDC5,CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 KLHDC5 408317 266 chr12 29298357 29307943 29302241 N NA NA FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 68655 267 chr12 30199429 30202101 30200812 N NA NA NA NA NA NA IPO8 646828 268 chr12 32606043 32610878 32607983 Y NA FGD4 FGD4,DNM1L,BICD1 IMR90 Hi-C 24141950 FGD4 44163 269 chr12 42325750 42327666 42326802 N NA NA PDZRN4 IMR90 Hi-C 24141950 GXYLT1 211007 270 chr12 43350191 43357098 43352160 N NA NA PRICKLE1 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE1 366619 271 chr12 43361625 43365705 43363530 N NA NA PRICKLE1 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE1 378053 272 chr12 43659855 43664172 43661780 N NA NA PRICKLE1,YAF2 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 488424 273 chr12 43669665 43674107 43671599 N NA NA PRICKLE1,YAF2,PPHLN1 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 478489 274 chr12 43684651 43688551 43686673 N NA NA PRICKLE1,GXYLT1,PPHLN1,ZCRB1 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 464045 275 chr12 46768974 46790005 46784762,46779278 N,N NA;NA SLC38A2 SLC38A1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC38A2 2329 276 chr12 46824724 46842200 46825948,46834174,46839559 N,N,N NA;NA;NA NA SLC38A2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 58079 277 chr12 46883429 46889594 46885976,46888206,46883844 N,Y,N NA;NA;NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 116784 278 chr12 47481378 47482560 47482234 N NA AMIGO2 AMIGO2 K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO2 7644 279 chr12 49276434 49278524 49277569 Y NA DDX23,RND1,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 16781 280 chr12 49623570 49630020 49628388,49626745 Y,N LMBR1L,TUBA1A;NA TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28845 281 chr12 52519270 52522330 52520763 N NA NA NR4A1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf44 55512 282 chr12 53266559 53269126 53268114 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 73529 283 chr12 53763828 53766669 53765138 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 7310 284 chr12 54819870 54828394 54821937,54826726 N,N NA;NA ZNF385A,ITGA5 ZNF385A,ITGA5,CBX5,HNRNPA1,NFE2,GTSF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGA5 6820 285 chr12 58258126 58260515 58259028 N NA AVIL,CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 17379 286 chr12 58286954 58292059 58287717,58290662 N,N NA;NA CTDSP2,LOC100506844 CTDSP2,TSFM,AVIL,CDK4,METTL21B,CYP27B1,METTL1,MARCH9,TSPAN31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506844 37888 287 chr12 58818249 58822160 58819507 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LOC100506844 488302 288 chr12 58950191 58952684 58951352 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 361578 289 chr12 59988740 59996259 59990417 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 674478 290 chr12 6247154 6251615 6250825 N NA VWF VWF,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 VWF 13318 291 chr12 6273573 6283936 6281081,6276609 Y,Y NA;VAMP1,TNFRSF1A VWF,CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 25546 292 chr12 6286295 6299678 6288706,6290899 Y,N CD9,VWF;NA CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 9804 293 chr12 65175151 65177396 65175796 N NA GNS,TBC1D30 NA NA NA NA GNS 21925 294 chr12 65925937 65928190 65927366 N NA NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 MSRB3 253514 295 chr12 65995689 66017214 65997030 N NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 201026 296 chr12 66023042 66031750 66025559,66031746,66028773 Y,N,Y NA;NA;NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 186490 297 chr12 66040944 66045618 66043011 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 172622 298 chr12 66046962 66052208 66049971 N NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 166032 299 chr12 76115261 76117711 76116652 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 209843 300 chr12 76370937 76374051 76372536 N NA NA OSBPL8,PHLDA1,KRR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 51505 301 chr12 76652412 76686143 76653567,76660801 N,N NA;NA NA NAP1L1,PHLDA1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 BBS10 56079 302 chr12 77347445 77348135 77347588 N NA NA E2F7 IMR90 Hi-C 24141950 E2F7 111225 303 chr12 77513542 77515717 77514535 N NA NA E2F7 IMR90 Hi-C 24141950 E2F7 54182 304 chr12 8178007 8180310 8178981 N NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 5049 305 chr12 8839307 8842097 8840583 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8421 306 chr12 88691861 88695947 88693597 N NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 155788 307 chr12 89290163 89292569 89291509 N NA NA TMTC3,CEP290,KITLG IMR90 Hi-C 24141950 KITLG 315913 308 chr12 90340889 90342800 90341779 N NA NA LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 291045 309 chr12 90591766 90594748 90593423 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 541922 310 chr12 90622288 90624612 90623405 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 572444 311 chr12 90719489 90723484 90722046 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 669645 312 chr12 90936280 90938385 90937816,90937589 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP2B1 886436 313 chr12 91774657 91776776 91775616 N NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC256021 759671 314 chr12 94033541 94035437 94034705 N NA NA SOCS2,LOC144481,CRADD IMR90 Hi-C 24141950 MRPL42 172275 315 chr12 95751474 95753392 95752449 N NA NA PLXNC1,NR2C1,FGD6,VEZT IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 114430 316 chr12 96025504 96029900 96027869 N NA NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 NTN4 154636 317 chr12 96446846 96449233 96447843 N NA NA ELK3,CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 ELK3 138974 318 chr12 96536683 96538906 96537749 N NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 49301 319 chr12 96557745 96560892 96559308 N NA ELK3 LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 ELK3 27315 320 chr12 96812168 96817518 96814748 N NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDK17 17802 321 chr12 96818226 96823930 96821316,96822981 N,N NA;NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 23860 322 chr12 96828788 96834468 96830374,96832558 Y,N CDK17;NA CDK17 LTA4H,ELK3,CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 34422 323 chr12 96836995 96853749 96839549,96842265 Y,Y NEDD1,NEDD1,CDK17;NA CDK17 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 42629 324 chr12 96881980 96918002 96894971,96883197,96904317 N,N,N NA;NA;NA NA ELK3,CDK17,LTA4H,AMDHD1,CCDC38,HAL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDK17 87614 325 chr13 106807431 106810419 106808943 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 EFNB2 376969 326 chr13 107000766 107003293 107002146 N NA NA NA NA NA NA EFNB2 184095 327 chr13 111606064 111609385 111607741 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 38648 328 chr13 21648564 21651234 21649998,21649795 N,Y NA;NA LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 12842 329 chr13 21652532 21655636 21653459 N NA LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 16810 330 chr13 24647816 24650912 24649013 N NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 83949 331 chr13 30968616 30971130 30969344 N NA NA LINC00426,KATNAL1,USPL1,HMGB1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 68951 332 chr13 31145704 31147729 31147240 N NA USPL1 HMGB1,TEX26-AS1,KATNAL1,LINC00426 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 44101 333 chr13 31618607 31620970 31620096 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 115147 334 chr13 32212426 32214969 32213501 N NA NA RXFP2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GALTL 438314 335 chr13 33543330 33545074 33543916 N NA NA STARD13,KL IMR90 Hi-C 24141950 PDS5B 382766 336 chr13 34724957 34732743 34727813,34730721 Y,Y NA;NA NA NA NA NA NA RFC3 332751 337 chr13 34735207 34737633 34736452 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 343001 338 chr13 40391716 40394791 40393231 N NA NA NA NA NA NA COG6 161952 339 chr13 40435341 40440515 40437876 N NA NA NA NA NA NA COG6 205577 340 chr13 40447896 40458593 40450531,40456290 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA COG6 218132 341 chr13 40465353 40472004 40468640 N NA NA NA NA NA NA COG6 235589 342 chr13 44714226 44717834 44716302 N NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 260400 343 chr13 44879640 44882621 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 267411 344 chr13 45287637 45289119 45288426 Y KCTD4 NA NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 136936 345 chr13 45329316 45331330 45330476 N NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 178615 346 chr13 50984127 50986903 50985703 N NA NA DLEU7,DLEU2,DLEU1,TRIM13 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 284450 347 chr13 51102813 51105578 51103665 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613,CTAGE10P,ST13P4,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASEH2B 378236 348 chr13 51255524 51260568 51259325 N NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 223246 349 chr13 56545643 56545965 56545824 N NA NA NA NA NA NA PCDH17 1659824 350 chr13 57433540 57440456 57435306,57438851 N,N NA;NA NA ATRNL1 MCF7 ChIA-PET 19890323 PCDH17 765333 351 chr13 64731692 64734437 64733195 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 3761101 352 chr13 64807040 64809900 64808592 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 3836449 353 chr13 64812483 64815399 64813705 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 3841892 354 chr13 65296765 65299834 65298045 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 4326174 355 chr13 71825534 71827358 71826487 N NA NA NA NA NA NA DACH1 613972 356 chr13 73741912 73742473 73742195 Y NA NA NA NA NA NA DIS3 385568 357 chr13 77295907 77300665 77298975 N NA NA KCTD12,LMO7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD12 159875 358 chr13 77302745 77305736 77304486 Y NA NA LMO7,KCTD12 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD12 154804 359 chr13 80508710 80513173 80511013,80512265 Y,N NA;NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401913 360 chr13 80863809 80864829 80864259 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 50257 361 chr13 90465904 90466824 90466064 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1533250 362 chr13 98300262 98302235 98301013 N NA NA NA NA NA NA RAP2A 213787 363 chr14 100674856 100681500 100680735 N NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 23602 364 chr14 101563515 101565872 101564421 N NA NA MIR485,MIR496,MIR382,MIR487A,MIR668,MIR377,MIR323B,MIR134,MIR655,MIR154,LINC00523,DIO3OS IMR90 Hi-C 24141950 MEG8 202408 365 chr14 105146153 105149510 105147596 N NA INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 6433 366 chr14 105543028 105546409 105544978 N NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 55603 367 chr14 105557837 105564458 105559800 N NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 70412 368 chr14 19652485 19653558 19652753 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1120595 369 chr14 21080861 21082723 21082125 N NA NA KLHL33,TMEM55B,PARP2,RPPH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASE4 69649 370 chr14 22382211 22385843 22382297,22384268 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL3 402754 371 chr14 23157645 23160044 23158638 Y SLC7A7 NA DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10,MRPL52,MMP14,RBM23 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 75687 372 chr14 23181063 23183754 23182534 N NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1,RBM23 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 51977 373 chr14 23207564 23208536 23207851 N NA OXA1L SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 27195 374 chr14 26673630 26674795 26674291 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1761623 375 chr14 35146484 35148605 35147555 N NA SNX6,CFL2 NA NA NA NA CFL2 35424 376 chr14 38757622 38762948 38759745 N NA CLEC14A CLEC14A IMR90 Hi-C 24141950 CLEC14A 32047 377 chr14 38778000 38781133 38780178 N NA NA NA NA NA NA CLEC14A 52425 378 chr14 38871293 38875687 38873383 N NA NA NA NA NA NA CLEC14A 145718 379 chr14 47042562 47045133 47043610 N NA NA NA NA NA NA MIS18BP1 1319957 380 chr14 50328207 50331194 50328902 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 8668 381 chr14 50334200 50335981 50334975 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 METTL21D,SOS2,ARF6,C14orf182,NEMF,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 14661 382 chr14 51325539 51327654 51327084 N NA NA ATL1,NIN,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 PYGL 83594 383 chr14 51860808 51865485 51862652 N NA NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMX1 153922 384 chr14 51908362 51910712 51909513 N NA NA FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2 IMR90 Hi-C 24141950 TMX1 201476 385 chr14 55568454 55571527 55569615 N NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 24408 386 chr14 55573825 55575681 55574918 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 20254 387 chr14 61643546 61648297 61645296 N NA NA SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 140218 388 chr14 61649180 61651905 61650387 N NA NA SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 136610 389 chr14 61652978 61657957 61655185 N NA NA SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 130558 390 chr14 65695523 65698031 65696755 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 126296 391 chr14 65709518 65714599 65710868 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 140291 392 chr14 69160819 69163701 69162183 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ACTN1 282382 393 chr14 69278314 69283110 69281610 Y DCAF5 NA RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTN1 162973 394 chr14 71786467 71790286 71787403 N NA NA SIPA1L1,PCNX IMR90 Hi-C 24141950 MED6 719083 395 chr14 73107631 73111109 73110148 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 249700 396 chr14 75103180 75106568 75104984 N NA LTBP2 KIAA0317,LTBP2,NPC2,ISCA2,FCF1,YLPM1 IMR90 Hi-C 24141950 LTBP2 24146 397 chr14 75445546 75451076 75447818 N NA PGF,EIF2B2 NEK9,MLH3,ZC2HC1C,PROX2,DLST,RPS6KL1,PGF,EIF2B2,ACYP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2B2 18536 398 chr14 75453383 75454572 75454132 N NA PGF,EIF2B2 MLH3,ZC2HC1C,NEK9,PGF,EIF2B2,ACYP1,RPS6KL1,DLST IMR90 Hi-C 24141950 EIF2B2 15040 399 chr14 77383803 77386619 77385569 N NA NA IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANGEL1 104520 400 chr14 77421701 77427589 77422633,77425786 N,N NA;NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 67445 401 chr14 77497996 77509245 77500050,77504587,77506591 Y,Y,N VASH1,C14orf166B,IRF2BPL;NA;NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1,IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BPL 2962 402 chr14 78107357 78109036 78108189 N NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 24247 403 chr14 85936757 85940663 85938317 N NA NA FLRT2 IMR90 Hi-C 24141950 FLRT2 55825 404 chr14 85981377 85984233 85983309 N NA FLRT2 NA NA NA NA FLRT2 12255 405 chr14 90847789 90852080 90849634,90850219 N,N NA;NA C14orf102,CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11247 406 chr14 91574172 91577756 91576007 N NA RPS6KA5,C14orf159 C14orf102,RPS6KA5,C14orf159,CCDC88C IMR90 Hi-C 24141950 C14orf159 2601 407 chr14 99439014 99439933 99439528 Y NA NA NA NA NA NA CCNK 507806 408 chr15 100025873 100028242 100026813 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 77891 409 chr15 23126541 23128999 23127941 N NA NIPA1 NA NA NA NA NIPA1 39698 410 chr15 25017302 25019442 25018338 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA PAR-SN 207699 411 chr15 35013106 35015801 35014524 Y NA NA AQR,GJD2,ACTC1 IMR90 Hi-C 24141950 AQR 246194 412 chr15 35596459 35600377 35598870 N NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 315962 413 chr15 38363552 38366620 38365236 N NA NA SPRED1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED1 178432 414 chr15 39117324 39123470 39121109 N NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 370996 415 chr15 39133568 39139667 39136271 N NA NA FSIP1,THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 387240 416 chr15 39157492 39162464 39160512 N NA NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 380421 417 chr15 39173733 39180533 39177859 N NA NA FSIP1,THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 362352 418 chr15 39282140 39291351 39287835 N NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 251534 419 chr15 39397972 39412176 39402757,39410857 N,N NA;NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 130709 420 chr15 39415307 39425646 39420446,39422857,39422957,39424193 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 117239 421 chr15 39429954 39435625 39432535 Y C15orf54 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 107260 422 chr15 39462342 39467410 39464655 N NA NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf54 75475 423 chr15 39520520 39526194 39522849,39523803 Y,N NA;NA C15orf54 C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 16691 424 chr15 39591202 39594907 39593574 N NA C15orf54 C15orf53,C15orf54,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf54 48317 425 chr15 39647975 39659126 39650841,39656454 Y,N THBS1;NA NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf54 105090 426 chr15 39765252 39768168 39767043 N NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 105112 427 chr15 41912995 41915070 41913926 N NA MGA TYRO3,MAPKBP1,MGA IMR90 Hi-C 24141950 MGA 37540 428 chr15 42770700 42785360 42783391 N NA ZFP106,SNAP23 LRRC57,HAUS2,VPS39,TMEM87A,SNAP23,ZFP106 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAP23 2144 429 chr15 46208899 46213062 46211898 N NA NA NA NA NA NA SQRDL 281643 430 chr15 52272853 52276177 52274245 N NA LEO1,MAPK6 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 8895 431 chr15 57097438 57099125 57098164 N NA NA LOC283663,ZNF280D,TCF12 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280D 71651 432 chr15 57629017 57632183 57630299 N NA LOC283663,CGNL1 CGNL1,TCF12,GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283663 36454 433 chr15 57878136 57881144 57879401 N NA GCOM1 GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 GCOM1 2958 434 chr15 62410348 62412686 62411559 N NA C2CD4B NA NA NA NA C2CD4B 44796 435 chr15 62463786 62468025 62465556 N NA C2CD4B C2CD4B K562 ChIA-PET 22265404 C2CD4B 6304 436 chr15 63186493 63191861 63188403 N NA NA TLN2,RAB8B,TPM1,APH1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPM1 142977 437 chr15 63219827 63222236 63221156 N NA NA TPM1,TLN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPM1 112602 438 chr15 63388644 63390974 63389689 N NA NA LACTB,RAB8B IMR90 Hi-C 24141950 TPM1 53806 439 chr15 65184847 65191350 65186290,65189695 Y,Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21;OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 NA SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHO2 50765 440 chr15 65595711 65598848 65596898 Y DENND4A NA PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLPX 118148 441 chr15 66111286 66112298 66111891 N NA DENND4A,RAB11A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 26655 442 chr15 66661773 66663065 66662507 N NA TIPIN,MAP2K1 NA NA NA NA TIPIN 12719 443 chr15 66908947 66915874 66909977 N NA NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 78800 444 chr15 66937668 66941868 66939597 N NA NA SMAD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 52806 445 chr15 67132054 67151710 67135135 N NA NA SMAD6,SNAPC5,ZWILCH,LCTL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 137380 446 chr15 67305440 67307982 67306296 N NA NA SMAD3,IQCH,LOC100506686,SKOR1,AAGAB IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 50213 447 chr15 67340163 67342489 67341281 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD3 15706 448 chr15 68548609 68550749 68549576 N NA CLN6,FEM1B ITGA11,FEM1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FEM1B 19392 449 chr15 70766260 70768671 70767226 N NA NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 287179 450 chr15 72928438 72933032 72929315 N NA NA CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 ADPGK 143094 451 chr15 74391553 74394272 74392618 N NA NA NA NA NA NA PML 104539 452 chr15 75253290 75256348 75254323 N NA COX5A,RPP25 CLK3,EDC3,CYP1A2,CSK,C15orf17,COX5A,RPP25,SCAMP5,C15orf39,COMMD4,NEIL1 IMR90 Hi-C 24141950 RPP25 3515 453 chr15 78235091 78237749 78236984 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 132245 454 chr15 78613651 78615740 78614804 N NA WDR61 WDR61,DNAJA4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR61 21711 455 chr15 79151640 79153896 79152764 Y IREB2 ADAMTS7,MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11276 456 chr15 81330986 81332773 81331776 N NA MESDC2,MESDC1 MIR4514,MESDC2,MESDC1,C15orf26,IL16 IMR90 Hi-C 24141950 MESDC1 37691 457 chr15 83760797 83762754 83761381 Y TM6SF1 BTBD1,TM6SF1 BTBD1,MIR4515 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM6SF1 13570 458 chr15 93250248 93252850 93252136 N NA NA SLCO3A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 51217 459 chr15 93256661 93258725 93257788 N NA NA SLCO3A1,FAM174B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM174B 57630 460 chr15 93362223 93365454 93363738 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 60619 461 chr15 95126536 95129707 95128331 N NA NA NA NA NA NA LOC400456 740622 462 chr15 95149636 95152444 95150742 N NA NA NA NA NA NA LOC400456 717885 463 chr15 95212386 95218955 95215219 Y NA NA NA NA NA NA LOC400456 651374 464 chr15 95225723 95228713 95227282 N NA NA NA NA NA NA LOC400456 641616 465 chr15 95243986 95246662 95245074 N NA NA NA NA NA NA LOC400456 623667 466 chr15 95381984 95387057 95384614 N NA NA NA NA NA NA LOC400456 483272 467 chr15 95717734 95721774 95719558 N NA NA NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400456 148555 468 chr15 95907807 95913955 95911620,95908992 N,N NA;NA LOC400456 NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400456 37478 469 chr15 96098632 96102541 96100576 N NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400456 228303 470 chr15 96211508 96214096 96212771 N NA NA NR2F2,LOC400456 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400456 341179 471 chr15 99981814 99984078 99982795 N NA NA LYSMD4,MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 122055 472 chr15 99993858 99997324 99995332 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 108809 473 chr16 14150300 14153547 14151628 N NA MKL2 MKL2,ERCC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL2 11649 474 chr16 14796065 14798113 14797495 N NA NA NA NA NA NA BFAR 69397 475 chr16 14835531 14837726 14836617 N NA NA NA NA NA NA BFAR 108863 476 chr16 22199708 22205924 22203265 N NA NA UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLR3E 102817 477 chr16 22206745 22208302 22207103 Y NA NA POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLR3E 100439 478 chr16 25077324 25080390 25078205 N NA LCMT1 LCMT1,LOC100506655,TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 42657 479 chr16 25116279 25119349 25118269 N NA LCMT1 ARHGAP17,LCMT1,ZKSCAN2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 3698 480 chr16 29167776 29169697 29168551 Y SPNS1 NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 81613 481 chr16 2917323 2919339 2918158 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 13857 482 chr16 29301180 29303459 29302458 N NA NA SNX29P2 IMR90 Hi-C 24141950 BOLA2B 162826 483 chr16 30643929 30647349 30645780 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF785,ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 14892 484 chr16 30816205 30823158 30816915 N NA RNF40 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF40 43272 485 chr16 30825087 30827112 30825850 Y NA NA ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF40 52154 486 chr16 3237471 3238539 3238052 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 46918 487 chr16 57333285 57334615 57334168 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 54247 488 chr16 58484189 58491802 58485999,58490036 N,N NA;NA NA GINS3,CCDC113,PRSS54,NDRG4 IMR90 Hi-C 24141950 SETD6 57581 489 chr16 59511640 59514287 59512933 N NA NA NA NA NA NA GOT2 743394 490 chr16 59664207 59670424 59666374,59669288 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GOT2 895961 491 chr16 66391881 66396312 66393236 N NA CDH5,LOC100505865 CDH11,BEAN1,CMTM2 IMR90 Hi-C 24141950 CDH5 4213 492 chr16 69431363 69433924 69432255 N NA TMED6,TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 11489 493 chr16 72323961 72327245 72325600 N NA NA NA NA NA NA DHX38 196346 494 chr16 73101453 73104046 73102769 N NA ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 8919 495 chr16 74086211 74086858 74086349 N NA NA HPR,HP IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 243815 496 chr16 77489609 77492444 77491241 N NA ADAMTS18 NA NA NA NA ADAMTS18 20598 497 chr16 77615714 77621838 77619479 Y ADAMTS18 NA CLEC3A,ADAMTS18,VAT1L IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS18 146703 498 chr16 77627515 77632743 77629202 N NA NA VAT1L,CLEC3A IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS18 158504 499 chr16 80231313 80233107 80231857 N NA NA NA NA NA NA CDYL2 605068 500 chr16 80964219 80973656 80966629,80972087 N,Y NA;CENPN NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 CMC2 66846 501 chr16 84559293 84561819 84560763 N NA KIAA1609 KIAA1609,COTL1,USP10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1609 21005 502 chr16 84564860 84567149 84566150 N NA KIAA1609 KIAA1609,COTL1,USP10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1609 26572 503 chr16 85253257 85257287 85254251 N NA NA LOC400548 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00311 59277 504 chr16 86694724 86696500 86695565 N NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 82609 505 chr16 86712915 86716580 86714429 N NA NA FOXL1,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 100800 506 chr16 86774484 86776891 86775067 N NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 162369 507 chr16 86916832 86919884 86918316 N NA NA FOXL1,MTHFSD,FOXC2,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 304717 508 chr16 86955285 86967606 86957520,86964023 N,N NA;NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 343170 509 chr16 86984169 86987041 86985594 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 372054 510 chr16 88297064 88299789 88298786 N NA NA BANP,ZNF469,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 220225 511 chr17 18963956 18969131 18965058,18967603 N,N NA;NA GRAP NA NA NA NA GRAP 13620 512 chr17 18973099 18975555 18973811,18973823 N,N NA;NA GRAP NA NA NA NA GRAP 22763 513 chr17 19014424 19017022 19014660,19016084 N,N NA;NA GRAPL NA NA NA NA GRAPL 13760 514 chr17 19090060 19092778 19091161 N NA EPN2 NA NA NA NA EPN2 47912 515 chr17 19350627 19354581 19352280 N NA NA EPN2,B9D1,SLC47A2,ALDH3A1,ALDH3A2,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 69132 516 chr17 25678439 25682577 25680917 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 57333 517 chr17 25710133 25712341 25711510 N NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 89027 518 chr17 28666496 28668618 28667735 N NA BLMH,CPD BLMH,NSRP1,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,TMIGD1,CPD,GOSR1,SUZ12P IMR90 Hi-C 24141950 CPD 37324 519 chr17 32568769 32571750 32569514 N NA CCL2 CCL11 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 10546 520 chr17 36007429 36010449 36008750 Y NA SYNRG,DDX52 SYNRG,DDX52,HNF1B,LOC284100 IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 3936 521 chr17 41398439 41401627 41400643 N NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 34545 522 chr17 41667434 41670842 41669337 N NA NA LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 DHX8 106100 523 chr17 41796473 41800698 41798002 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5,ARL4D,PYY IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 55670 524 chr17 43414900 43417851 43415567 N NA MAP3K14 MAP3K14,LOC100133991,HEXIM1,FMNL1,ARHGAP27,TEX34 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K14 20486 525 chr17 43418379 43420733 43419270 N NA MAP3K14 LOC100133991,HEXIM1,MAP3K14,FMNL1,TEX34 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K14 23965 526 chr17 43448047 43450536 43449211 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP27 52476 527 chr17 44342956 44345188 44344339 Y NA LRRC37A KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC37A 27309 528 chr17 46079404 46081103 46079986 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA CDK5RAP3 30975 529 chr17 47500332 47501578 47501417 N NA PHB ZNF652,SPOP,FAM117A,KAT7 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 8090 530 chr17 51183014 51183869 51183624 N NA NA NA NA NA NA UTP18 1845117 531 chr17 53653668 53655159 53654454 N NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 154327 532 chr17 57501325 57506708 57505203 N NA NA YPEL2,GDPD1,PRR11 IMR90 Hi-C 24141950 DHX40 136178 533 chr17 58191187 58199568 58197769 N NA HEATR6,LOC653653 NA NA NA NA LOC653653 10907 534 chr17 58207149 58207430 58207274 N NA LOC653653 C17orf64 IMR90 Hi-C 24141950 LOC653653 26869 535 chr17 58208911 58213473 58212675 N NA LOC653653 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC653653 28631 536 chr17 58648088 58652305 58648534,58650786 N,N NA;NA APPBP2,PPM1D USP32,APPBP2,PPM1D IMR90 Hi-C 24141950 PPM1D 25239 537 chr17 6080895 6084587 6082472 Y WSCD1 NA NA NA NA NA FAM64A 263148 538 chr17 6093320 6095988 6094946 N NA NA WSCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM64A 251747 539 chr17 6127452 6128334 6127765 N NA NA WSCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM64A 219401 540 chr17 6134897 6136565 6135580 N NA NA NA NA NA NA FAM64A 211170 541 chr17 61356699 61362497 61357246 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 161225 542 chr17 6159764 6162546 6160981 N NA NA WSCD1,LOC339166 IMR90 Hi-C 24141950 FAM64A 185189 543 chr17 62700140 62700841 62700306 N NA SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 41754 544 chr17 62717414 62722044 62720558 N NA NA SMURF2,LOC146880 IMR90 Hi-C 24141950 LOC146880 56073 545 chr17 63117404 63120640 63119567 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 64484 546 chr17 66015064 66018086 66016177 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13762 547 chr17 67312574 67324748 67323685 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA10 71618 548 chr17 72977519 72980214 72978299 N NA CDR2L,ICT1 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3513 549 chr17 74352563 74354780 74354397 N NA QRICH2,PRPSAP1,SPHK1 NA NA NA NA PRPSAP1 2333 550 chr17 76928715 76932874 76930024 N NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2,USP36,LOC100507410,C1QTNF1,LGALS3BP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TIMP2 7243 551 chr17 79309554 79322644 79318104 N NA SLC38A10 ACTG1,SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A10 40458 552 chr18 10056936 10058672 10057888 Y NAPG,RAB31,VAPA NA APCDD1,NAPG,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 348708 553 chr18 10268857 10272252 10270366 N NA NA PIEZO2,APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 253621 554 chr18 10288870 10291553 10290472 Y NAPG,VAPA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 234320 555 chr18 11946672 11950648 11947671 Y CHMP1B NA IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBB6 357609 556 chr18 19926264 19930916 19928607 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 176848 557 chr18 20136185 20141844 20140004 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 386769 558 chr18 2303701 2305777 2304547 N NA NA NA NA NA NA METTL4 265712 559 chr18 23096879 23099175 23098184 N NA NA ZNF521 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF521 164665 560 chr18 2514675 2517439 2516076 N NA NA NA NA NA NA METTL4 54050 561 chr18 25422891 25425030 25423947 N NA NA NA NA NA NA SS18 1752280 562 chr18 26741428 26746075 26744810 N NA NA NA NA NA NA B4GALT6 2518611 563 chr18 2842150 2842735 2842310 N NA NA EMILIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 169210 564 chr18 37548711 37552789 37550273 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1982410 565 chr18 37944781 37949543 37947258 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1585656 566 chr18 42086611 42089367 42088005 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 1457938 567 chr18 43354696 43358158 43355515 N NA NA SLC14A1,EPG5,SIGLEC15 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 189147 568 chr18 43382435 43384927 43383121 N NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPG5 162378 569 chr18 47249644 47251657 47250235 Y NA NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 88594 570 chr18 514708 517840 515884 N NA COLEC12 COLEC12,CLUL1 IMR90 Hi-C 24141950 COLEC12 13979 571 chr18 53445480 53448839 53447126 N NA NA TCF4,MIR4529 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 857081 572 chr18 56455649 56457820 56456843 N NA NA ZNF532,LOC390858,NEDD4L,ALPK2,MALT1,GRP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF532 72241 573 chr18 57548486 57554669 57549555,57553220 N,Y NA;PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 12523 574 chr18 57637121 57639206 57637131 N NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 69929 575 chr18 59269188 59273251 59269198,59272367 N,N NA;NA NA PIGN,RNF152 IMR90 Hi-C 24141950 RNF152 287053 576 chr18 59368574 59370449 59369779 N NA NA PIGN,RNF152 IMR90 Hi-C 24141950 RNF152 189855 577 chr18 59658743 59661471 59659863 N NA NA NA NA NA NA RNF152 98439 578 chr18 59664733 59667305 59666308 N NA NA NA NA NA NA RNF152 104429 579 chr18 68087648 68090832 68089176 N NA NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 131511 580 chr18 68702895 68706344 68704279 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 746758 581 chr18 68714037 68718565 68715279 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 757900 582 chr18 71356423 71359678 71358138 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 456068 583 chr18 9015737 9018944 9017564 Y ANKRD12 NA CCDC165,NDUFV2,ANKRD12,RALBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV2 83684 584 chr18 9618792 9620949 9619644 N NA PPP4R1 PPP4R1,RAB31,VAPA K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP4R1 4192 585 chr19 13841237 13844574 13842516 N NA CCDC130,MRI1,C19orf53 CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 14179 586 chr19 16393802 16396410 16394557 Y NWD1,KLF2 KLF2 EPS15L1,AP1M1,KLF2,CALR3 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 39241 587 chr19 24214546 24224985 24216626 N NA ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 44991 588 chr19 2459971 2464249 2462666 N NA TIMM13,GADD45B LMNB2,GADD45B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 GADD45B 11874 589 chr19 2948754 2951720 2950425 N NA ZNF57,ZNF77 THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF77 3785 590 chr19 35485014 35486901 35486021 N NA ZNF792,GRAMD1A,SCN1B NA NA NA NA GRAMD1A 4345 591 chr19 37707377 37710684 37709093 N NA ZNF585B,ZNF383 ZNF585B,ZNF383 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF585B 5926 592 chr19 37807951 37810423 37808918 N NA HKR1 NA NA NA NA HKR1 15157 593 chr19 42054417 42060826 42055617 N NA LOC100505495 LOC100505495,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505495 47863 594 chr19 45090528 45092966 45091945 N NA NA PVR,CEACAM16,TOMM40,BCAM,IGSF23,MIR4531,CEACAM19,CBLC IMR90 Hi-C 24141950 PVR 54132 595 chr19 45108144 45112196 45111242 N NA PVR NA NA NA NA PVR 34902 596 chr19 4573251 4576881 4575531 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B SEMA6B EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA6B 13480 597 chr19 4633554 4635717 4634730 Y CCDC94,SEMA6B,TICAM1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 3810 598 chr19 46633154 46636656 46635966 N NA NA NOVA2,IGFL3,IGFL2,DKFZp434J0226,IGFL1,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC61 134815 599 chr19 47362416 47372204 47363644 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1,ARHGAP35 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP2S1 8213 600 chr19 48101731 48105777 48102438,48103741 Y,Y NA;GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 83216 601 chr19 486491 491586 489125 N NA TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 15911 602 chr19 50871607 50873199 50872336 N NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA NR1H2 6481 603 chr19 52049063 52052344 52050676 N NA ZNF175 SIGLEC5,ZNF175,CEACAM18,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF175 22187 604 chr19 53399394 53401925 53400716 N NA ZNF468,ZNF320,ZNF321P ZNF468,ZNF160 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF320 4795 605 chr19 54350483 54353746 54352452 N NA MYADM CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7 HELA,K562,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MYADM 15865 606 chr19 56824016 56828421 56826411 N NA NA NA NA NA NA ZNF542 51047 607 chr19 788097 790770 789549 Y NA PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 6622 608 chr19 9895450 9897581 9896838 N NA ZNF846,FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA ZNF846 16040 609 chr2 102679549 102682341 102680599 N NA NA IL1R1,IL1RL2,IL1R2,IL1RL1,IL18R1 IMR90 Hi-C 24141950 IL18R1 296756 610 chr2 102757565 102759977 102758680 N NA NA IL1R2,IL1RL1,IL1RL2,MAP4K4,IL1R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL18R1 219120 611 chr2 111072141 111075689 111074079 N NA NA NA NA NA NA LOC151009 66424 612 chr2 118942635 118945128 118943671 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 96585 613 chr2 122935822 122938375 122937273 N NA NA NA NA NA NA TSN 422701 614 chr2 128126685 128147900 128145586 N NA MAP3K2 IWS1,ERCC3,MAP3K2,MIR4783,PROC,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 25880 615 chr2 12958574 12960364 12959408 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 101576 616 chr2 132438837 132451793 132442560,132440376 N,N NA;NA C2orf27A NA NA NA NA C2orf27A 28271 617 chr2 133104179 133107824 133104953 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 88637 618 chr2 134335504 134340867 134337963 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 670963 619 chr2 134574109 134577817 134575723 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 434013 620 chr2 134598201 134601159 134599670 N NA NA NCKAP5,GPR39 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 410671 621 chr2 136995064 136998108 136996522 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 119339 622 chr2 139023476 139026501 139025189 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 232849 623 chr2 143624767 143627330 143625952 Y KYNU NA KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 ZEB2 1650628 624 chr2 145106480 145109263 145108394,145107614 N,N NA;NA NA ARHGAP15,ZEB2,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZEB2 168695 625 chr2 150589705 150592976 150591219 N NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 145375 626 chr2 150996695 151001022 150998788 N NA NA RND3,RBM43,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 343187 627 chr2 151280995 151283781 151282200 N NA NA MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 60428 628 chr2 157192987 157200862 157198335 N NA NR4A2 GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR4A2 3700 629 chr2 157257253 157257887 157257750 N NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 34078 630 chr2 161060116 161066838 161062161,161064774 N,Y NA;NA NA ITGB6,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 140990 631 chr2 161084566 161086592 161086275 Y NA NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 165440 632 chr2 161932307 161935655 161934025 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 57811 633 chr2 161979001 161981370 161979944 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 12096 634 chr2 169202969 169204101 169203595 N NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 98864 635 chr2 173111766 173120117 173118096,173113875 Y,Y NA;ITGA6 NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA6 172197 636 chr2 177283281 177285759 177284594 N NA NA NA NA NA NA MTX2 149158 637 chr2 177310786 177312464 177311451 N NA NA HOXD-AS1,HOXD3,HOXD1,MTX2,MIR10B,HOXD4,HOXD-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 176663 638 chr2 177417685 177419368 177418918 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 LOC375295 82934 639 chr2 178028382 178034190 178030426,178033098 Y,N NFE2L2;NA HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 43232 640 chr2 182669191 182672421 182670604 N NA NA PPP1R1C,SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 84051 641 chr2 182674664 182679182 182676501,182679039 N,N NA;NA NA SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 77290 642 chr2 18478273 18496649 18479887,18482118 N,N NA;NA NA KCNS3 IMR90 Hi-C 24141950 GEN1 543096 643 chr2 187407454 187410947 187409190 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43843 644 chr2 188127648 188131684 188129239 N NA NA NA NA NA NA CALCRL 181337 645 chr2 188166106 188169306 188167439 N NA NA NA NA NA NA CALCRL 143715 646 chr2 188182127 188186744 188184682 N NA NA NA NA NA NA CALCRL 126277 647 chr2 188438573 188441848 188440247 N NA TFPI TFPI,GULP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFPI 19354 648 chr2 190073214 190076900 190075613 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 28609 649 chr2 190232496 190237614 190235053 N NA NA COL5A2,GULP1,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68545 650 chr2 190270906 190273804 190272081 N NA WDR75 COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B,WDR75,DIRC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR75 32355 651 chr2 190477260 190479762 190478098 N NA SLC40A1,ASNSD1 SLC40A1,WDR75,ASNSD1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC40A1 31723 652 chr2 192730311 192732922 192731832 N NA SDPR TMEFF2 IMR90 Hi-C 24141950 SDPR 18305 653 chr2 204548829 204551341 204550678 N NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 148771 654 chr2 204973856 204981422 204975258,204979127 N,N NA;NA NA NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 429094 655 chr2 205402060 205404234 205403437 N NA PARD3B PARD3B,NRP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARD3B 6282 656 chr2 207287119 207289214 207288301 N NA ADAM23 ADAM23 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM23 19154 657 chr2 20764768 20781160 20773618,20769116,20779171 N,Y,Y NA;RHOB,GDF7;NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69704 658 chr2 20781920 20785914 20784375 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 64950 659 chr2 208197529 208202418 208199677 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 166915 660 chr2 208258082 208261029 208259719 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 133587 661 chr2 216368472 216371918 216369628,216369952 N,N NA;NA NA LOC646324 IMR90 Hi-C 24141950 FN1 67681 662 chr2 216714115 216717625 216715375 N NA LOC646324 LOC646324,ATIC,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646324 5856 663 chr2 217969670 217972214 217970659 Y NA NA IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 606150 664 chr2 218855961 218866511 218858899 N NA TNS1 TNS1,RUFY4 IMR90 Hi-C 24141950 TNS1 47165 665 chr2 222643458 222646881 222644907 N NA NA NA NA NA NA EPHA4 206448 666 chr2 232346756 232349225 232348044 N NA NCL NA NA NA NA NCL 17551 667 chr2 232506220 232508916 232507601 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 64319 668 chr2 232525313 232528700 232527095 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 44535 669 chr2 232529304 232533188 232531206 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 40047 670 chr2 23602745 23604923 23603993 N NA NA KLHL29 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATAD2B 545013 671 chr2 237796509 237799177 237798024 N NA NA IQCA1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 194907 672 chr2 237854252 237857008 237855752 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 137076 673 chr2 238523479 238526595 238525507 N NA LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,RAB17,UBE2F-SCLY IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 9629 674 chr2 24712144 24722265 24713477 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1,ADCY3,EFR3B IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 85081 675 chr2 34329413 34331339 34330434 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 505051 676 chr2 38081531 38083787 38082666 N NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 182205 677 chr2 38333130 38334677 38334044 N NA NA FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 433804 678 chr2 42368495 42370113 42369246 N NA EML4 EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 26377 679 chr2 43021981 43024256 43023166 N NA NA NA NA NA NA MTA3 226310 680 chr2 43035359 43038844 43038225 N NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 239688 681 chr2 43105542 43108414 43107234 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 309871 682 chr2 43143365 43146499 43144729 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 307246 683 chr2 43150064 43153766 43151729 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 299979 684 chr2 43401018 43403472 43401664 Y OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2 NA ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 50273 685 chr2 43404503 43407384 43406245 Y OXER1 ZFP36L2,LOC100129726 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 46361 686 chr2 45361171 45362969 45361983 N NA NA SIX2,SRBD1,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 475464 687 chr2 45487950 45492083 45490404 N NA NA UNQ6975,SRBD1,SIX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRBD1 346350 688 chr2 46917144 46919222 46918247 N NA SOCS5 SOCS5,PIGF,TTC7A,LOC388948,LOC100134259,MCFD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS5 6877 689 chr2 47569255 47574109 47572254 N NA NA EPCAM,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 MSH2 56154 690 chr2 48337980 48340293 48338932 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXN2 201502 691 chr2 49456648 49457315 49456885 N NA NA NA NA NA NA PPP1R21 788740 692 chr2 54642500 54644557 54643781 N NA NA ACYP2,C2orf73,SPTBN1 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 444523 693 chr2 55328157 55331178 55329637 N NA NA C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 50423 694 chr2 55337765 55341211 55339504 N NA NA C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 60031 695 chr2 55997853 56000628 55999597,55999610 N,N NA;NA NA MIR216A,MIR216B,MIR217,EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 76842 696 chr2 56005471 56009969 56007024 N NA NA MIR216A,MIR216B,MIR217,EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 84460 697 chr2 57405484 57410588 57407851 N NA NA NA NA NA NA VRK2 863189 698 chr2 58265608 58267815 58266599 N NA VRK2 NA NA NA NA VRK2 5962 699 chr2 61989459 61993163 61991518 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 122643 700 chr2 62531324 62533304 62532152 Y B3GNT2 NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 108062 701 chr2 63925443 63927439 63926124 N NA NA UGP2,VPS54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDH1 109700 702 chr2 63961307 63964315 63963835,63963153 N,N NA;NA NA UGP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGP2 103783 703 chr2 64290154 64293047 64291718 N NA VPS54 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 43940 704 chr2 64487042 64489052 64488063 Y PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA PELI1 115437 705 chr2 64493507 64496283 64495343 N NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 121902 706 chr2 64956009 64959134 64958104 N NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 74963 707 chr2 64993398 64997340 64995684 Y SERTAD2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 112352 708 chr2 65057540 65059947 65058679 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 176494 709 chr2 65085880 65087860 65086781 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 CEP68 195635 710 chr2 68097249 68100737 68099274 Y NA NA MEIS1,C1D IMR90 Hi-C 24141950 C1D 189422 711 chr2 69134568 69137431 69135729 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO48 440178 712 chr2 69909031 69912632 69910575 N NA AAK1 AAK1,ANXA4,NFU1,GMCL1,GFPT1 IMR90 Hi-C 24141950 AAK1 38054 713 chr2 73401661 73405123 73403747 N NA SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMYD5 36243 714 chr2 74212081 74219839 74213039 N NA NA DGUOK,TET3,C2orf78,STAMBP,BOLA3,MOB1A,MTHFD2,BOLA3-AS1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DGUOK 58128 715 chr2 83330113 83332442 83331331 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1354144 716 chr2 85644389 85649255 85645694 N NA CAPG ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 CAPG 3192 717 chr2 85968635 85970543 85969494 N NA ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 10366 718 chr2 90070612 90070882 90070767 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1005193 719 chr2 96656652 96659822 96657659 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 16477 720 chr20 10332359 10335693 10334155 N NA NA NA NA NA NA MKKS 79173 721 chr20 11757414 11760238 11758747 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 111239 722 chr20 19737280 19743570 19738208 N NA NA SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1,LOC100130264 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIN2 123595 723 chr20 19795032 19802103 19797133 N NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RIN2 65062 724 chr20 20711742 20713711 20712432 N NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 18476 725 chr20 20723405 20725958 20724525,20724272 N,Y NA;RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 30139 726 chr20 22696067 22699294 22697805 N NA NA SSTR4,LOC200261,THBD IMR90 Hi-C 24141950 THBD 331007 727 chr20 22775507 22778036 22777314 N NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 252265 728 chr20 22841662 22844395 22842539 N NA NA NA NA NA NA THBD 185906 729 chr20 23124289 23129929 23126242,23128881 Y,N THBD,CD93,GZF1,CST3;NA NA LOC200261,CD93,THBD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD93 57312 730 chr20 23238339 23239841 23239302 Y CD93 NA THBD,CD93 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 91532 731 chr20 23250171 23251467 23251010 N NA NA NA NA NA NA NXT1 79906 732 chr20 2503488 2507417 2506376 N NA ZNF343 TMC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF343 13710 733 chr20 25824535 25825264 25824722 N NA NA NA NA NA NA ZNF337 147066 734 chr20 32801273 32804975 32804054 N NA NA AHCY,ITCH,NCOA6,ASIP,DYNLRB1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 101188 735 chr20 34651538 34654413 34652905 Y NA LOC647979 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC647979 12656 736 chr20 38215525 38218801 38217069 N NA NA NA NA NA NA DHX35 624544 737 chr20 43320431 43323054 43321798 Y WISP2,KCNK15 ADA LOC100505783,HNF4A,TTPAL,PKIG,ADA,LOC79015,RIMS4,KCNK15,WISP2,YWHAB,SERINC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADA 40055 738 chr20 4488172 4490418 4489083 N NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 LOC728228 314435 739 chr20 48662219 48665419 48663732 Y NA NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,SLC9A8,SNAI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 62706 740 chr20 48781554 48783983 48782782 N NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,CEBPB TMEM189-UBE2V1,SNAI1,RNF114,UBE2V1,PTPN1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM189-UBE2V1 11219 741 chr20 51106724 51112418 51107360,51110376 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP9A 721816 742 chr20 52238788 52240888 52240054 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 39152 743 chr20 52443600 52447609 52445738 N NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 243964 744 chr20 52956268 52958055 52957306 N NA NA PFDN4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PFDN4 131766 745 chr20 61334760 61336403 61335395 N NA NA C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C20orf20 91402 746 chr21 10492520 10493163 10492961 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 5262346 747 chr21 17053564 17057128 17055479 N NA USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45368 748 chr21 29654644 29657461 29656191 N NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 254179 749 chr21 30003269 30011529 30009387,30006401,30005129 Y,Y,Y NA;NA;NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00161 91629 750 chr21 36576194 36579343 36577704 Y NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 315207 751 chr21 38710154 38713088 38711487 N NA DYRK1A DYRK1A,DSCR3,TTC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 26771 752 chr21 38728960 38732099 38730935 Y NA DYRK1A DSCR3,DYRK1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 7760 753 chr21 38932631 38937804 38936283 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 192772 754 chr21 40363649 40366530 40364856 Y ERG NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 186418 755 chr21 46783380 46789840 46784537 N NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 35257 756 chr21 47393004 47395516 47393811 N NA NA COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 C21orf56 208857 757 chr21 48106894 48109733 48108632 N NA NA NA NA NA NA PRMT2 51387 758 chr22 19563833 19565693 19564650 N NA NA HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLDN5 50973 759 chr22 23862784 23865856 23863699 N NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 GUSBP11 193754 760 chr22 27815790 27818468 27817098 N NA NA MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 496787 761 chr22 28121574 28123626 28122646 N NA NA NA NA NA NA PITPNB 191629 762 chr22 32375313 32376290 32375775 N NA YWHAH NA NA NA NA YWHAH 34834 763 chr22 32713016 32728881 32727459 N NA NA NA NA NA NA C22orf28 79393 764 chr22 35862600 35865048 35863891 N NA NA RASD2,MB IMR90 Hi-C 24141950 MCM5 66484 765 chr22 36460411 36463339 36462064 N NA RBFOX2 RBFOX2,APOL3,APOL6,MCM5,MB,APOL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBFOX2 35826 766 chr22 37940535 37944162 37942425 N NA CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12309 767 chr22 39570717 39575251 39574362 N NA NA PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PDGFB 65706 768 chr22 39678434 39680725 39679223 N NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB,SNORD83A,SNORD83B,RNU86,RPL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 34945 769 chr22 41046806 41048698 41047817 Y NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 14116 770 chr22 46390684 46395676 46393211 N NA LOC100271722 C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381,MIRLET7BHG IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100271722 45072 771 chr22 51093419 51096911 51094855 N NA ARSA,SHANK3 SHANK3,PPP6R2,SBF1,SYCE3,MIOX,ADM2,ARSA,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2 IMR90 Hi-C 24141950 SHANK3 16159 772 chr3 100753912 100756829 100755316 Y NA ABI3BP ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 41578 773 chr3 100783835 100786612 100785056 Y ABI3BP NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 71501 774 chr3 100789905 100792548 100791317 N NA NA NA NA NA NA ABI3BP 77571 775 chr3 105071729 105074944 105072696 N NA ALCAM ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 10613 776 chr3 106461880 106466481 106464437 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 BBX 775302 777 chr3 107149711 107152089 107150772 N NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 89694 778 chr3 110131150 110135596 110133348 N NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 655419 779 chr3 110244834 110246984 110246066 N NA NA PVRL3-AS1,PVRL3 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 544031 780 chr3 111392678 111397695 111393455 N NA NA CD96,PHLDB2,ZBED2 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 53632 781 chr3 112108345 112111546 112110198 Y CD200 NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 CD200 56429 782 chr3 112414126 112416390 112415145 N NA NA CD200R1L,CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 54149 783 chr3 117340313 117342403 117341207 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 1617349 784 chr3 120276549 120279845 120278667 N NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 35283 785 chr3 123750137 123753457 123751971 N NA NA KALRN IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 69882 786 chr3 128397789 128401602 128399918 N NA RPN1,RAB7A RAB7A,RPN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPN1 28070 787 chr3 138551384 138555418 138554040 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 73183 788 chr3 138580716 138582832 138581738 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 102515 789 chr3 138633651 138636314 138634492 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 155450 790 chr3 141424552 141428605 141426843 N NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 28446 791 chr3 146024517 146027668 146026358 N NA NA PLSCR4,PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 55551 792 chr3 146030355 146034095 146031802 Y PLSCR4 NA PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 61389 793 chr3 146342379 146343847 146343109 N NA NA NA NA NA NA PLSCR1 79751 794 chr3 14843437 14846676 14845563 N NA FGD5 NA NA NA NA FGD5 13793 795 chr3 149056181 149061090 149058269 N NA TM4SF18,TM4SF1 TM4SF18,WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF1,TM4SF4,COMMD2 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF18 4633 796 chr3 149103475 149106548 149104707 N NA TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1,HLTF,HPS3,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 7907 797 chr3 149112280 149114827 149113682 Y NA TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 16712 798 chr3 150017761 150019937 150018895 N NA NA TSC22D2,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 106851 799 chr3 150087474 150091928 150088894 N NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34860 800 chr3 152313124 152315041 152314061 Y NA NA NA NA NA NA LOC401093 325709 801 chr3 152855939 152857724 152856618 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 22305 802 chr3 153331712 153333826 153332559 Y NA NA NA NA NA NA RAP2B 451683 803 chr3 154786791 154790028 154788380 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 DHX36 744505 804 chr3 156891457 156895443 156892843 N NA CCNL1 CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCNL1 12975 805 chr3 156921615 156924438 156922914 N NA CCNL1 PTX3,VEPH1,C3orf55,CCNL1,RARRES1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCNL1 43133 806 chr3 16099142 16103916 16101993 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 GALNTL2 112268 807 chr3 170441896 170448722 170444487,170448017 Y,N CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2;NA NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 139323 808 chr3 170461384 170473695 170463747,170472380 N,N NA;NA NA SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 114350 809 chr3 170518298 170522374 170520413 N NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 65671 810 chr3 172309805 172315344 172313324 N NA NA TNFSF10,FNDC3B,NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 68508 811 chr3 174154325 174164090 174158328 N NA NA NAALADL2,NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 NLGN1 1038081 812 chr3 176380766 176383098 176381923 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 531950 813 chr3 177062491 177064487 177063264 N NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 147443 814 chr3 177074292 177079358 177075865,177078566 N,N NA;NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 159244 815 chr3 179244024 179246071 179244889 Y NA ACTL6A GNB4,ACTL6A IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 34637 816 chr3 184242238 184244473 184243159 N NA NA CHRD,PSMD2,ECE2,EIF4G1,CLCN2,POLR2H,FAM131A,THPO,EPHB3,VPS8 IMR90 Hi-C 24141950 POLR2H 161044 817 chr3 190061872 190064894 190063219 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 981980 818 chr3 194749881 194753545 194751827 N NA NA XXYLT1,LOC100507391,FAM43A,LSG1,PPP1R2 IMR90 Hi-C 24141950 XXYLT1 238350 819 chr3 196354725 196361110 196359128 N NA NA SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2,LRRC33,CEP19 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR53 59312 820 chr3 197182522 197185839 197183370 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLG1 157075 821 chr3 197191340 197195844 197193253 N NA NA DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 165893 822 chr3 20520315 20523476 20521962 N NA NA NA NA NA NA SGOL1 292591 823 chr3 25191532 25194824 25193551 N NA NA NA NA NA NA RARB 274930 824 chr3 27573546 27577590 27575612 Y NA NA AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 75301 825 chr3 27631591 27633544 27632835 N NA NA SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 133346 826 chr3 27673606 27677758 27674738 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 175361 827 chr3 30268029 30270975 30269698 Y NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 377019 828 chr3 30329848 30336297 30331074,30333924 N,N NA;NA NA RBMS3,TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 311697 829 chr3 30382584 30391286 30384486,30388501 N,N NA;NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 256708 830 chr3 30578300 30581947 30580962 N NA NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 66047 831 chr3 30584336 30587866 30586433 Y TGFBR2 NA TGFBR2,RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 60128 832 chr3 39678908 39682363 39680435 N NA NA MYRIP,RPSA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYRIP 168940 833 chr3 42513248 42516659 42515068 Y NA NA TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SS18L2 115639 834 chr3 43286986 43291479 43289355 N NA SNRK ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 36525 835 chr3 44550173 44554591 44552177 N NA ZNF445 ZNF445 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF445 31011 836 chr3 45208351 45210523 45209154 Y LIMD1 NA LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOSC7 190610 837 chr3 57944202 57946705 57945363 N NA FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 47422 838 chr3 57954244 57959814 57955765 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 34313 839 chr3 68708086 68708403 68708296 N NA NA NA NA NA NA C3orf64 354371 840 chr3 70296256 70298885 70297508 N NA NA NA NA NA NA FRMD4B 860826 841 chr3 78188951 78191274 78190169 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 2704685 842 chr3 7916984 7919762 7918259 N NA NA NA NA NA NA LINC00312 693706 843 chr3 80237211 80241182 80239393 Y ROBO1 NA NA NA NA NA GBE1 1569768 844 chr3 80782993 80785690 80783923 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1025260 845 chr3 81153885 81156759 81155133 N NA NA NA NA NA NA GBE1 654191 846 chr3 82127484 82131328 82129714 N NA NA NA NA NA NA GBE1 316534 847 chr3 82133389 82136407 82134628 N NA NA NA NA NA NA GBE1 322439 848 chr3 9358390 9359469 9358784 N NA THUMPD3 RAD18,CAV3,OXTR,SRGAP3 IMR90 Hi-C 24141950 THUMPD3 45248 849 chr3 97539648 97550903 97540800 N NA NA GABRR3,CPOX,MINA IMR90 Hi-C 24141950 ARL6 56053 850 chr3 98688755 98692489 98690711 N NA NA DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 68222 851 chr3 98847045 98849474 98848068 Y DCBLD2 NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 226512 852 chr4 101453419 101455086 101454374 N NA EMCN NA NA NA NA EMCN 14169 853 chr4 10181148 10184820 10182881 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 62575 854 chr4 113003780 113006549 113005067 N NA NA NA NA NA NA C4orf32 60004 855 chr4 114935248 114938578 114936704 N NA ARSJ NA NA NA NA ARSJ 34370 856 chr4 11544302 11548668 11546441 N NA NA NA NA NA NA ZNF518B 1085270 857 chr4 11744585 11747301 11745873 N NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1285553 858 chr4 11748603 11751316 11750027 N NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF518B 1289571 859 chr4 11904191 11909331 11906479 N NA NA NA NA NA NA ZNF518B 1445159 860 chr4 122631816 122634775 122632915 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 13669 861 chr4 123717587 123721034 123719464 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 26829 862 chr4 124429878 124430192 124430082 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 111922 863 chr4 124906215 124909394 124907579 Y NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 588259 864 chr4 125348612 125357253 125350750,125354338 N,N NA;NA NA ANKRD50 MCF7 ChIA-PET 22265404 ANKRD50 276634 865 chr4 12641830 12642380 12642108 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 843609 866 chr4 126659961 126662419 126661113 N NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 FAT4 422394 867 chr4 129388618 129390577 129389702 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 340202 868 chr4 129437058 129441259 129438680 N NA NA PHF17,LARP1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF17 289520 869 chr4 129473111 129476214 129474436 N NA NA LARP1B,PGRMC2,PHF17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF17 254565 870 chr4 133910910 133916054 133914009 N NA NA NA NA NA NA PCDH10 154416 871 chr4 133919053 133922582 133921132 N NA NA NA NA NA NA PCDH10 147888 872 chr4 135505014 135508856 135507436 N NA NA NA NA NA NA PCDH10 1434544 873 chr4 137288523 137292020 137290486 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 1871483 874 chr4 139655254 139657563 139656715 N NA NA LOC641364,LOC641365,SLC7A11 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 279380 875 chr4 140338361 140347136 140340801 N NA RAB33B RAB33B,SETD7,ELF2,NAA15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB33B 27825 876 chr4 140577597 140579836 140578726 N NA MGST2 SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MGST2 7086 877 chr4 141172177 141175901 141173910 N NA NA MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAML3 96944 878 chr4 144756186 144757025 144756496 N NA NA NA NA NA NA GUSBP5 275561 879 chr4 145499003 145506991 145501141,145504497 N,N NA;NA NA HHIP IMR90 Hi-C 24141950 HHIP 60157 880 chr4 145511953 145514453 145512823 N NA NA HHIP IMR90 Hi-C 24141950 HHIP 52695 881 chr4 147978145 147979397 147978625 N NA NA NA NA NA NA SLC10A7 535022 882 chr4 149754601 149757640 149756484 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 390929 883 chr4 153164260 153167173 153165203 Y NA NA FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 136491 884 chr4 153175727 153181542 153180377,153176761 Y,N NA;NA NA PET112,FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 122122 885 chr4 155946991 155948332 155947734 N NA NA NA NA NA NA PLRG1 475406 886 chr4 158940482 158943118 158941887 N NA NA FAM198B,GRIA2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM198B 151084 887 chr4 158952782 158955915 158954570 N NA NA FAM198B IMR90 Hi-C 24141950 FAM198B 138287 888 chr4 163342399 163342814 163342599 N NA NA NA NA NA NA NAF1 745259 889 chr4 168816059 168819680 168818497 Y NA NA NA NA NA NA DDX60 420278 890 chr4 168823261 168825525 168824583 N NA NA NA NA NA NA DDX60 414433 891 chr4 169980373 169982561 169981185 N NA CBR4 SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 48905 892 chr4 174276567 174277551 174276873 N NA HMGB2,SAP30 HMGB2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SAP30 14542 893 chr4 177304022 177305498 177304839 N NA NA VEGFC,NEIL3 IMR90 Hi-C 24141950 SPCS3 62932 894 chr4 180059317 180059598 180059458 N NA NA NA NA NA NA AGA 1695660 895 chr4 185456689 185460118 185458762 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 60963 896 chr4 187764847 187767176 187766055 N NA NA FAT1,LOC339975 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDLIM3 1308135 897 chr4 19776621 19779513 19778182 N NA NA NA NA NA NA SLIT2 475722 898 chr4 19983285 19986326 19984966 N NA NA SLIT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLIT2 268909 899 chr4 20043735 20045673 20044573 N NA NA NA NA NA NA SLIT2 209562 900 chr4 25467598 25470229 25469080 N NA NA SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC4 88750 901 chr4 28355878 28357793 28356664 N NA NA NA NA NA NA STIM2 1493565 902 chr4 38319547 38321389 38320623 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 344401 903 chr4 40317897 40320875 40318998 N NA NA N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC344967 259078 904 chr4 40674260 40675647 40674797 N NA NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APBB2 540988 905 chr4 42341500 42344132 42342179 N NA NA NA NA NA NA SLC30A9 348977 906 chr4 44149106 44153184 44152376 N NA NA NA NA NA NA GUF1 527249 907 chr4 55807033 55810177 55808356 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 KDR 181585 908 chr4 56038002 56056023 56039519,56043301,56053029 N,N,N NA;NA;NA KDR NA NA NA NA KDR 46240 909 chr4 68287431 68300552 68300377 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 110704 910 chr4 70628553 70655572 70630189,70652411,70639376 N,N,N NA;NA;NA SULT1B1 NA NA NA NA SULT1B1 2123 911 chr4 70664203 70668525 70666600 N NA SULT1B1 NA NA NA NA SULT1B1 37773 912 chr4 73836337 73838724 73837461 N NA NA NA NA NA NA COX18 96748 913 chr4 74525881 74529486 74527490 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,RASSF6,CXCL2,ANKRD17,IL8,PF4V1,CXCL3,CXCL6,PPBPL2,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 76737 914 chr4 74569104 74572315 74570414 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33908 915 chr4 75541726 75552285 75543858,75550178 N,Y NA;NA NA EREG,EPGN,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2L 517897 916 chr4 75555145 75560756 75558049 Y EREG,AREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 531316 917 chr4 78773762 78776690 78775698 Y NA CNOT6L,MRPL1 MRPL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL1 7115 918 chr4 84069866 84073142 84071835 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 33955 919 chr4 89152106 89153151 89152588 N NA NA PPM1K IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 52737 920 chr4 89454161 89456346 89455268 Y NA PIGY NA NA NA NA PIGY 9206 921 chr4 90237366 90239488 90238311 Y GPRIN3 NA NA NA NA NA TIGD2 203398 922 chr4 90409056 90439449 90414063,90419157,90410550 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC644248 318103 923 chr4 90469622 90476334 90471187 N NA NA NA NA NA NA LOC644248 281218 924 chr4 90806113 90812415 90810691 Y MMRN1 LOC644248,MMRN1 NA NA NA NA MMRN1 3637 925 chr5 102089841 102137321 102093823,102107317,102091421 N,N,N NA;NA;NA NA PAM,PPIP5K2,GIN1 IMR90 Hi-C 24141950 PAM 64206 926 chr5 119486605 119489680 119488382 Y NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 698467 927 chr5 119780804 119783294 119781906 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 992666 928 chr5 123933605 123936543 123935451 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 144262 929 chr5 124743604 124749715 124747706 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 662799 930 chr5 124819139 124822682 124821003 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 738334 931 chr5 127148476 127150620 127149619 N NA NA PRRC1,FLJ33630 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ33630 268146 932 chr5 127197660 127200454 127199702 N NA NA PRRC1,FLJ33630,SLC12A2 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ33630 218312 933 chr5 132117316 132119653 132118081 N NA KIF3A,SEPT8 SEPT8,RAD50,IL4,SHROOM1,LOC553103,SLC22A4,IL5,CCNI2,SOWAHA,AFF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SEPT8 4249 934 chr5 132174369 132176508 132175641 N NA UQCRQ NA NA NA NA UQCRQ 25811 935 chr5 133801039 133803569 133802112 N NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 53441 936 chr5 135952431 135952778 135952750 N NA NA NA NA NA NA SMAD5 483895 937 chr5 135954286 135956995 135955589 N NA NA NA NA NA NA SMAD5 485750 938 chr5 138874162 138877729 138875785 N NA ECSCR,TMEM173 DNAJC18,SPATA24,UBE2D2,SLC23A1,MATR3,PAIP2,ECSCR,TMEM173 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM173 11819 939 chr5 138896337 138899334 138897672 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM173 33994 940 chr5 139485866 139490165 139487297 N NA PURA,IGIP NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3543 941 chr5 14010562 14013375 14011841 N NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 130454 942 chr5 14034272 14038361 14036326 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 105468 943 chr5 141404006 141405536 141404679 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 11386 944 chr5 141735327 141739178 141736169 N NA SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 30707 945 chr5 146913726 146917473 146915382 Y DPYSL3 DPYSL3 DPYSL3,STK32A,LOC153469 IMR90 Hi-C 24141950 DPYSL3 24107 946 chr5 148291857 148294695 148293274 N NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 85701 947 chr5 148939919 148943879 148941286,148942829 N,N NA;NA CSNK1A1,ARHGEF37 AFAP1L1,GRPEL2,MIR143HG,IL17B,PCYOX1L,CSNK1A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSNK1A1 8912 948 chr5 151077731 151079952 151078919 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 11116 949 chr5 152416304 152417011 152416871 N NA NA NA NA NA NA FAM114A2 1001486 950 chr5 159591591 159598359 159592805,159596757 Y,N NA;NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2,C5orf54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 45139 951 chr5 159876072 159878853 159878102 N NA C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA PTTG1 27207 952 chr5 159896187 159898815 159897718 N NA PTTG1 NA NA NA NA PTTG1 47322 953 chr5 162990986 162996003 162993669 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 60755 954 chr5 163129934 163136831 163133006 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 199703 955 chr5 163182687 163189991 163186567 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 252456 956 chr5 163192813 163196387 163194624 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 262582 957 chr5 163200355 163203436 163202160 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 270124 958 chr5 169561726 169565099 169563276 N NA NA SLIT3,KCNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM196B 153982 959 chr5 17020677 17021977 17021327 N NA NA MYO10,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 84292 960 chr5 172921168 172921448 172921333 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 122218 961 chr5 173208365 173210363 173209213 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 104968 962 chr5 178956481 178959003 178957803 N NA RUFY1 RUFY1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RUFY1 18559 963 chr5 180523756 180524922 180524307 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 125341 964 chr5 180528670 180529569 180529079 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120694 965 chr5 18287046 18287326 18287204 N NA NA LOC285696,BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 BASP1 1069296 966 chr5 34243412 34246431 34244688 N NA NA NA NA NA NA AMACR 235192 967 chr5 34304677 34306178 34304817 N NA NA NA NA NA NA AMACR 296457 968 chr5 34582296 34590706 34583473,34586092,34587998 Y,N,Y NA;NA;NA NA RAI14,TTC23L,RAD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 65727 969 chr5 34607975 34611574 34609415 N NA RAI14 RAI14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 44859 970 chr5 34620651 34623887 34622036 N NA RAI14 RAI14,TTC23L,BRIX1,RAD1,DNAJC21 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 32546 971 chr5 34627061 34629317 34628173 N NA RAI14 RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 27116 972 chr5 39519007 39522240 39520508 N NA NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 93672 973 chr5 39524389 39529184 39526658 N NA NA DAB2,C9 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 99054 974 chr5 39540845 39545563 39543242 N NA NA DAB2,C9,FYB,PRKAA1,TTC33,RPL37,CARD6 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 115510 975 chr5 40332557 40335113 40333554 N NA NA NA NA NA NA PTGER4 344919 976 chr5 42948667 42962517 42951311 N NA NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 LOC648987 56396 977 chr5 54285074 54289053 54287398 N NA ESM1 HSPB3,ESM1,GZMK,CDC20B,GZMA,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 ESM1 3660 978 chr5 55645014 55650077 55646565 Y NA NA MAP3K1,IL6ST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL6ST 354193 979 chr5 56677749 56681017 56679369 N NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 207974 980 chr5 56729392 56733980 56731765,56732812 Y,N NA;NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 259617 981 chr5 56735779 56739850 56737894 N NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 266004 982 chr5 56782348 56787805 56784457 Y GPBP1,ACTBL2 NA ACTBL2,PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 312573 983 chr5 57073173 57077440 57075456 N NA NA GPBP1,PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 603398 984 chr5 57129164 57132694 57131167 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 623272 985 chr5 57534331 57538234 57536876 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 217732 986 chr5 57539344 57543157 57541729 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 212809 987 chr5 57553376 57556941 57555624 N NA NA PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK2 199025 988 chr5 60609340 60611528 60610100 N NA ZSWIM6 NDUFAF2,C5orf43,ZSWIM6 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 16572 989 chr5 64396384 64400834 64398893 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 331629 990 chr5 69139063 69142913 69140799 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 178159 991 chr5 69695688 69705875 69697544 N NA GTF2H2B NA NA NA NA GTF2H2B 5322 992 chr5 70014314 70018463 70015925 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 178027 993 chr5 70406787 70413783 70410861 N NA GTF2H2 NA NA NA NA GTF2H2 43290 994 chr5 70584111 70587272 70585378 N NA NA NA NA NA NA BDP1 164170 995 chr5 71851196 71856818 71853383 N NA ZNF366 TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF366 47947 996 chr5 71859404 71861500 71860328 N NA NA TNPO1,PTCD2,ZNF366 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF366 56155 997 chr5 71892102 71898061 71893302,71895962 N,N NA;NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF366 88853 998 chr5 76085058 76088696 76086616 Y F2R NA IQGAP2,NCRUPAR,F2R,F2RL1 IMR90 Hi-C 24141950 F2R 73190 999 chr5 81074148 81076319 81075068 N NA NA SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC9 476746 1000 chr5 81146887 81149265 81147970 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS23 424970 1001 chr5 86415292 86417886 86416929 N NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 146184 1002 chr5 86489895 86492968 86491545 N NA NA RASA1,MIR4280 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 71102 1003 chr5 87318881 87319164 87319023 N NA NA NA NA NA NA TMEM161B 245501 1004 chr5 90574931 90578294 90576957 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 97870 1005 chr5 92496631 92500713 92498391 N NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ42709 416240 1006 chr5 92584346 92586876 92585589 N NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ42709 330077 1007 chr5 92608822 92611438 92610178 N NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ42709 305515 1008 chr5 95169016 95172254 95170663 N NA GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 10439 1009 chr5 95871839 95874856 95873278 Y LNPEP,CAST,CAST NA ELL2,PCSK1,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 122885 1010 chr5 95900265 95905137 95902437 N NA NA PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 CAST 92604 1011 chr5 95919081 95952997 95920571,95937039,95920128 N,N,N NA;NA;NA CAST C5orf27,ELL2,PCSK1,SPATA9,GLRX,CAST,RIOK2,ERAP1,LIX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAST 44744 1012 chr5 96880427 96883283 96881614 N NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 RIOK2 361422 1013 chr5 97173141 97178643 97176631,97174444 N,N NA;NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RIOK2 654136 1014 chr5 97442592 97447612 97442980,97445029 N,Y NA;NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 657387 1015 chr5 97643403 97644631 97643726 Y NA NA RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 RGMB 460368 1016 chr5 99381548 99390176 99382945,99388538,99385092 Y,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM174A 480948 1017 chr6 100675305 100678703 100676971 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 650521 1018 chr6 100714902 100718935 100717302 N NA NA NA NA NA NA ASCC3 610289 1019 chr6 100743766 100747283 100745012 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 581941 1020 chr6 100792551 100796100 100794611 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 533124 1021 chr6 104216210 104218888 104217524 N NA NA NA NA NA NA HACE1 1088906 1022 chr6 105151608 105154203 105153210,105153156 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HACE1 153591 1023 chr6 106346953 106349241 106348375 N NA NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 424454 1024 chr6 112293605 112296154 112294666 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN NA FYN,TRAF3IP2,TRAF3IP2-AS1,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 112597 1025 chr6 113122563 113124373 113123545 N NA NA FLJ34503,LAMA4,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 546735 1026 chr6 113423548 113425978 113424688 N NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 752549 1027 chr6 113878543 113882043 113880332 N NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 296484 1028 chr6 11654502 11657841 11655792 N NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 354883 1029 chr6 121835734 121839516 121836758 N NA NA NA NA NA NA GJA1 78989 1030 chr6 121840461 121845351 121842952 N NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 GJA1 83716 1031 chr6 12322402 12326479 12324977 N NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 31873 1032 chr6 12482497 12487043 12485034 N NA NA EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 191968 1033 chr6 12489336 12492457 12490855 N NA NA HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 198807 1034 chr6 12527018 12530345 12528997 N NA NA EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 236489 1035 chr6 12534887 12541426 12538030 N NA NA EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 244358 1036 chr6 12545108 12547995 12546332 Y NA NA EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 254579 1037 chr6 12566403 12570152 12568076 N NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 275874 1038 chr6 12571735 12576116 12573538 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 281206 1039 chr6 12583585 12588314 12585833 N NA NA EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 293056 1040 chr6 127151390 127154204 127152853 N NA NA RSPO3 IMR90 Hi-C 24141950 RNF146 433623 1041 chr6 127208614 127211690 127210213 N NA NA NA NA NA NA RNF146 376137 1042 chr6 130327641 130331497 130329613 N NA L3MBTL3 L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL3 8231 1043 chr6 132379933 132387610 132385017,132382007 N,Y NA;NA NA LOC100507254,CTGF,ENPP1 IMR90,K562,HELA,GM12878,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 LOC100507254 67508 1044 chr6 132406971 132409951 132408814 N NA LOC100507254 CTGF,LOC100507254,ENPP1 IMR90,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 LOC100507254 45167 1045 chr6 134739396 134743609 134742262 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 466088 1046 chr6 134870763 134874449 134871881 N NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 501587 1047 chr6 13844657 13845426 13844960 N NA NA NA NA NA NA NOL7 229098 1048 chr6 139889465 139892119 139890314 N NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 193680 1049 chr6 140666643 140670100 140667855 N NA NA CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 970858 1050 chr6 140858082 140860881 140859235 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1162297 1051 chr6 140891958 140894873 140893479 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1196173 1052 chr6 141298973 141302089 141301058 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1166321 1053 chr6 141881968 141885396 141883500 N NA NA CITED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 VTA1 583014 1054 chr6 144536216 144538480 144537649 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 STX11 64562 1055 chr6 144604236 144610197 144607356 N NA UTRN UTRN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UTRN 2676 1056 chr6 148591952 148594450 148593440 N NA NA SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 69279 1057 chr6 148649872 148653435 148651205 Y SASH1 SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 10294 1058 chr6 1554259 1556263 1555252 N NA NA MYLK4,LOC100508120,EXOC2,GMDS IMR90 Hi-C 24141950 FOXC1 54418 1059 chr6 156487013 156490776 156488784 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 608288 1060 chr6 156667656 156670237 156669052 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 428827 1061 chr6 157006806 157009967 157008257 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 89097 1062 chr6 158651217 158660034 158652683,158658856 N,N NA;NA NA TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2H5 61838 1063 chr6 15922526 15923845 15923217 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 205472 1064 chr6 159290005 159291898 159290506 N NA NA OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DYNLT1 224201 1065 chr6 163774225 163777978 163776461 Y QKI NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 57697 1066 chr6 164836479 164837694 164837061 N NA NA NA NA NA NA QKI 1000804 1067 chr6 168098861 168101744 168100353 Y NA NA NA NA NA NA FGFR1OP 686045 1068 chr6 18369689 18373358 18371531 N NA RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 14223 1069 chr6 21586135 21590952 21589029 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 3020 1070 chr6 22447381 22450406 22448724 N NA NA NA NA NA NA LINC00340 780706 1071 chr6 22826669 22829937 22828747 N NA NA LINC00340,SOX4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00340 1159994 1072 chr6 22879420 22886737 22881218,22884604 N,N NA;NA NA CDKAL1,LINC00340,SOX4,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00340 1212745 1073 chr6 24742593 24744422 24743845 N NA C6orf62,GMNN GMNN,FAM65B,KIAA0319,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 23190 1074 chr6 2575266 2579810 2577103 N NA NA C6orf195,GMDS,MYLK4,LOC100508120,FOXC1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 185856 1075 chr6 26571660 26573320 26572243 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 23851 1076 chr6 27203179 27203889 27203353 Y NA NA OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 88542 1077 chr6 27445957 27448356 27446940 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 5060 1078 chr6 28710155 28710541 28710272 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 181227 1079 chr6 30482521 30485361 30484214 N NA HLA-E,PRR3,GNL1 HLA-E,PPP1R10,MRPS18B,ABCF1,PRR3,GNL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 25338 1080 chr6 30714652 30721933 30716128,30720334 Y,Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3;TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1,MDC1,C6orf136,DHX16,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 2325 1081 chr6 30780448 30783461 30782437 N NA NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 68121 1082 chr6 30844997 30846345 30845668 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA GTF2H4 29632 1083 chr6 32221623 32224688 32223335 N NA NA HLA-DOB,C6orf10,HCG23,ATF6B,BTNL2,NOTCH4,AGER,PBX2,TNXB IMR90 Hi-C 24141950 PBX2 63660 1084 chr6 35698467 35702211 35699789 N NA NA ARMC12 MCF7 ChIA-PET 22265404 SRPK1 186746 1085 chr6 37104518 37107313 37105472 N NA NA PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2,TBC1D22B,MTCH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM217 118100 1086 chr6 3796096 3800350 3797413 N NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,PRPF4B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 43850 1087 chr6 3803637 3805204 3804195 N NA FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL,PXDC1,PSMG4,PRPF4B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 44428 1088 chr6 3825339 3827819 3826370 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21813 1089 chr6 3888718 3915000 3912989 N NA FAM50B SLC22A23,FAM50B,BPHL,RIPK1,TUBB2B,SLIT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 FAM50B 39086 1090 chr6 42514900 42516182 42515342 N NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 15578 1091 chr6 47381492 47383604 47382746 Y NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 61921 1092 chr6 48793203 48796350 48794960 N NA NA NA NA NA NA MUT 634691 1093 chr6 54154663 54157915 54156181 N NA NA NA NA NA NA LRRC1 494885 1094 chr6 55888494 55891668 55889631 N NA NA COL21A1 IMR90 Hi-C 24141950 DST 616026 1095 chr6 56225775 56228108 56226877 N NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 DST 279586 1096 chr6 56234130 56236841 56235414 N NA NA DST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DST 270853 1097 chr6 56690136 56718028 56716410,56705995 N,N NA;NA NA DST,BAG2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 182442 1098 chr6 56730601 56734772 56733893 N NA NA PRIM2,BAG2,DST,BEND6,ZNF451 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 176612 1099 chr6 56756668 56759479 56758313 N NA NA PRIM2,BAG2,BEND6,ZNF451,DST,RAB23,KIAA1586 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 151905 1100 chr6 6723440 6726229 6724697 N NA NA RREB1,CAGE1,DSP IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 381601 1101 chr6 6810708 6813811 6811915 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 294019 1102 chr6 709625 713678 711246 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 16516 1103 chr6 72187533 72190144 72188925 N NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 57085 1104 chr6 77993254 78002877 78001667 N NA NA NA NA NA NA HTR1B 170243 1105 chr6 78069295 78078564 78077039 N NA NA NA NA NA NA HTR1B 94556 1106 chr6 79046203 79066850 79066687 N NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 510339 1107 chr6 79296340 79318330 79314816,79309477 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 258859 1108 chr6 81231523 81235215 81233268 N NA NA BCKDHB,FAM46A IMR90 Hi-C 24141950 TTK 517201 1109 chr6 85201031 85203131 85202272 N NA NA NA NA NA NA KIAA1009 263696 1110 chr6 85324911 85330173 85328458 N NA NA NA NA NA NA TBX18 143726 1111 chr6 85359091 85364552 85362841 N NA NA NA NA NA NA TBX18 109347 1112 chr6 86110332 86116157 86114098 N NA NA NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX14 187472 1113 chr6 93254191 93257122 93255798 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1957284 1114 chr7 100432828 100435952 100434431 Y SAP25,EPHB4 EPHB4,SLC12A9,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 7685 1115 chr7 100893025 100896385 100895652 N NA ZNHIT1,PLOD3,CLDN15,FIS1 NA NA NA NA FIS1 4654 1116 chr7 104583258 104587518 104584876,104585786 Y,Y MLL5;MLL5 LOC100216546 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216546 44094 1117 chr7 106177973 106184482 106179290,106183265 N,N NA;NA NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 117152 1118 chr7 106229286 106233400 106231233,106231126 N,N NA;NA NA CCDC71L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 68234 1119 chr7 106248713 106251378 106250083 N NA NA CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 CCDC71L 50256 1120 chr7 106356032 106359950 106358869 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031 NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 54398 1121 chr7 106413623 106419896 106415846 N NA NA CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 111989 1122 chr7 112030353 112033233 112032111 N NA IFRD1 DOCK4,ZNF277,IFRD1 IMR90 Hi-C 24141950 IFRD1 29966 1123 chr7 115930634 115970345 115968022,115957056 N,Y NA;NA NA CAV2,CAV1,MET,ST7,WNT2,CAPZA2,TES IMR90,H1ESC,HELA,MCF7,K562 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 TES 80087 1124 chr7 115977689 115982203 115981089 N NA NA CAV2,CAV1,CAPZA2,TES,MET IMR90 Hi-C 24141950 TES 127142 1125 chr7 115991696 115999869 115994825 N NA NA CAV2,CAV1,TES,MET,ST7,ST7-AS2 IMR90,H1ESC,GM12878,HELA,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 CAV2 139786 1126 chr7 116079588 116085022 116082033 Y NA NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 CAV2 54633 1127 chr7 116104027 116107326 116106054 N NA CAV2 TES,MET,CAV2,CAV1 IMR90,GM12878,HELA,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 CAV2 32329 1128 chr7 116253275 116256272 116254877 N NA NA MET,TES,ST7,ST7-AS2,CAPZA2 IMR90,HELA,GM12878,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 MET 56187 1129 chr7 124995152 124998608 124996165 N NA NA NA NA NA NA POT1 425115 1130 chr7 12753749 12757165 12755506 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 27297 1131 chr7 128168599 128178741 128172292 N NA NA METTL2B,IMPDH1,HILPDA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL2B 51816 1132 chr7 129608395 129611510 129610135 N NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 15595 1133 chr7 134297305 134300704 134298481 N NA BPGM AKR1B10,AKR1B1,AKR1B15,BPGM,CALD1 IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 30827 1134 chr7 134974908 134978579 134976841 N NA NA NUP205 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf49 119330 1135 chr7 135442136 135444921 135443277 N NA NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 94915 1136 chr7 135771046 135772989 135771722 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 108842 1137 chr7 146838 151163 149361 N NA FAM20C FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 41806 1138 chr7 148637157 148639457 148638479 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDIA4 86325 1139 chr7 15169405 15172548 15170775 N NA NA NA NA NA NA MEOX2 553760 1140 chr7 154996326 155000274 154997847 N NA NA INSIG1,LOC202781,PAXIP1 K562 ChIA-PET 22265404 INSIG1 89212 1141 chr7 20600409 20602174 20601615 N NA NA NA NA NA NA ITGB8 229684 1142 chr7 21356849 21359606 21358225 N NA NA NA NA NA NA SP4 108083 1143 chr7 22122444 22124130 22123017 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 136902 1144 chr7 22689969 22693006 22691709 N NA NA LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 IL6 73760 1145 chr7 23512712 23515397 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,RPS2P32 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 2717 1146 chr7 25895215 25898017 25896730 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293830 1147 chr7 26140519 26142401 26141137 Y SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3 NA NA NA NA NFE2L3 49446 1148 chr7 2902358 2904586 2903476 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 GNA12 GNA12,AMZ1,FOXK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GNA12 18399 1149 chr7 33763311 33779065 33766002 N NA NA BMPER,BBS9 IMR90 Hi-C 24141950 RP9 614309 1150 chr7 33846398 33849385 33847779 N NA NA BBS9,BMPER IMR90 Hi-C 24141950 RP9 697396 1151 chr7 33853439 33856170 33854449 N NA NA BBS9,BMPER IMR90 Hi-C 24141950 RP9 704437 1152 chr7 37519388 37521537 37520458 N NA NA NA NA NA NA STARD3NL 696271 1153 chr7 39633529 39636116 39634997 N NA YAE1D1,LOC646999,RALA NA NA NA NA LOC646999 12970 1154 chr7 405725 407226 406324 N NA NA NA NA NA NA PDGFA 152255 1155 chr7 41226017 41230807 41228439 N NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 511899 1156 chr7 45028275 45032587 45030370 N NA SNHG15,CCM2 NA NA NA NA SNHG15 2016 1157 chr7 50893552 50895861 50894680 N NA GRB10 GRB10,COBL IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 32393 1158 chr7 52336135 52339408 52337869 N NA NA NA NA NA NA GRB10 1474976 1159 chr7 52994264 52997981 52996410 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 1828958 1160 chr7 53185918 53189067 53187394 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 1637872 1161 chr7 53285649 53287941 53287034 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 1538998 1162 chr7 5593690 5597947 5595956 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 23458 1163 chr7 5613769 5615543 5614715 N NA ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 16893 1164 chr7 6119980 6121835 6121123 N NA EIF2AK1 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 21120 1165 chr7 65957130 65962935 65958632 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 80563 1166 chr7 66054719 66059032 66057399 N NA LOC493754,KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC493754 11221 1167 chr7 66143503 66152040 66147090 N NA KCTD7 ASL,CRCP,KCTD7,RABGEF1,LOC493754 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD7 49635 1168 chr7 7215007 7217313 7216591 N NA C1GALT1 C1GALT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1GALT1 4933 1169 chr7 73686240 73688526 73686974 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 15279 1170 chr7 75795078 75797148 75795962 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 117685 1171 chr7 75993345 75994336 75993852 Y NA YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 5003 1172 chr7 81255997 81258805 81257428 N NA NA HGF IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D1 814226 1173 chr7 82223536 82225179 82224518 N NA NA CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D1 150505 1174 chr7 84265569 84269258 84267504 Y NA NA SEMA3A IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D1 2192538 1175 chr7 84329867 84332600 84331172 N NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 2256836 1176 chr7 84811147 84817156 84815590 N NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 1871858 1177 chr7 90223787 90243300 90226253 N NA NA CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 95412 1178 chr7 90297848 90314991 90298051 N NA CDK14 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 CDK14 23721 1179 chr7 91209306 91209761 91209462 N NA NA NA NA NA NA MTERF 300255 1180 chr7 93586734 93589474 93587801 N NA GNG11,BET1 NA NA NA NA GNG11 35718 1181 chr7 93777627 93781111 93779593 N NA NA GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 143937 1182 chr7 93805050 93808228 93806889 N NA NA TFPI2,GNG11,GNGT1,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 171360 1183 chr7 93809930 93813998 93812924 Y NA NA TFPI2,GNGT1,GNG11,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 176240 1184 chr7 93929673 93931976 93930777 N NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 CASD1 207194 1185 chr7 94003680 94005914 94004415 N NA NA NA NA NA NA CASD1 133256 1186 chr7 96017431 96019601 96018344 N NA NA SLC25A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A13 65972 1187 chr7 97718969 97719572 97719218 N NA LMTK2 LMTK2 IMR90 Hi-C 24141950 LMTK2 16625 1188 chr8 101799796 101803272 101802030 N NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 65481 1189 chr8 102137240 102140591 102139158 N NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 77369 1190 chr8 103800258 103803219 103801509 Y NA NA UBR5,KLF10,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 73178 1191 chr8 104279782 104282707 104281538 N NA NA BAALC,SLC25A32,C8orf56,FZD6,CTHRC1,DCAF13,LOC100499183,RIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 CTHRC1 101036 1192 chr8 107094164 107097125 107095364 N NA NA NA NA NA NA OXR1 185281 1193 chr8 11733649 11737342 11735120 N NA CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A,GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 8003 1194 chr8 118740990 118745266 118743454 N NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 208025 1195 chr8 124477098 124481643 124478727 Y NA NA FBXO32,ANXA13,FAM91A1,ZHX1-C8ORF76,KLHL38,FER1L6 IMR90 Hi-C 24141950 ATAD2 68393 1196 chr8 125859504 125862094 125860155 N NA NA MTSS1,TATDN1,ZNF572,LOC157381,NDUFB9,SQLE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTSS1 118774 1197 chr8 127836739 127838058 127837191 N NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 266028 1198 chr8 128235992 128238834 128237722 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 509481 1199 chr8 129187563 129191590 129189223 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 380784 1200 chr8 130171934 130173531 130172659 N NA NA NA NA NA NA FAM49B 855366 1201 chr8 130695974 130699157 130697978 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM49B 329740 1202 chr8 130718182 130722860 130720420 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 306037 1203 chr8 131661520 131664437 131662783 N NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 205614 1204 chr8 131739104 131740742 131739859 N NA NA ASAP1,EFR3A IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 283198 1205 chr8 134401515 134404190 134403274 N NA NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 91968 1206 chr8 13486772 13490421 13487710 N NA NA DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf48 62420 1207 chr8 141473368 141476028 141474930 Y NA CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CHRAC1 45369 1208 chr8 142031077 142034277 142032714 N NA NA PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 104443 1209 chr8 16460706 16463785 16461675 N NA NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 420962 1210 chr8 16477697 16480457 16479416 Y NA NA NA NA NA NA EFHA2 404290 1211 chr8 16567298 16571447 16570048 Y NA NA NA NA NA NA EFHA2 313300 1212 chr8 16572586 16576968 16575095 N NA NA NA NA NA NA EFHA2 307779 1213 chr8 16604381 16617986 16607090,16613506 N,N NA;NA NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA2 266761 1214 chr8 1693027 1695238 1693883 Y CLN8 NA ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGEF10 76911 1215 chr8 20537661 20538453 20538144 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 482957 1216 chr8 21492704 21495152 21493318 N NA NA NA NA NA NA FAM160B2 451562 1217 chr8 26115857 26117648 26116674 N NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 31359 1218 chr8 26122537 26126282 26124252 N NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 22725 1219 chr8 26308152 26317380 26308787 N NA NA BNIP3L,DPYSL2,PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 54103 1220 chr8 26322321 26324758 26323224 N NA PNMA2,DPYSL2 NA NA NA NA PNMA2 46725 1221 chr8 29521842 29524120 29522928 Y KIF13B NA C8orf75,LOC286135,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 313575 1222 chr8 29608182 29611860 29609996 N NA NA C8orf75 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM66 328789 1223 chr8 29626963 29629409 29628129 N NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 311240 1224 chr8 32781008 32784778 32783355 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 545886 1225 chr8 32961420 32964645 32962687 N NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 FUT10 366019 1226 chr8 37001126 37004024 37002338 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERLIN2 590073 1227 chr8 37418581 37420973 37419716 N NA NA ZNF703,KCNU1,ERLIN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERLIN2 173124 1228 chr8 37938029 37945078 37939590,37943590 Y,N NA;NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 17933 1229 chr8 39975269 39978532 39976901 N NA C8orf4 C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 32455 1230 chr8 41996226 41999767 41998741 N NA NA KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLAT 65427 1231 chr8 49425851 49428180 49427419 N NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 504856 1232 chr8 53379042 53381116 53379866 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 245910 1233 chr8 55123511 55125839 55124878 N NA NA SOX17 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL15 75730 1234 chr8 55245835 55251833 55250499 N NA NA NA NA NA NA SOX17 118662 1235 chr8 55292436 55296699 55294614 N NA NA NA NA NA NA SOX17 73796 1236 chr8 55465805 55467954 55467021 N NA NA NA NA NA NA SOX17 95310 1237 chr8 59635713 59638732 59636821 N NA NA NA NA NA NA NSMAF 63309 1238 chr8 61562511 61567807 61564496 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 23517 1239 chr8 70095935 70098189 70096844 N NA NA SULF1,LOC100505718 IMR90 Hi-C 24141950 SULF1 280670 1240 chr8 74282302 74284407 74283133 N NA NA STAU2,LOC100128126,RDH10,RPL7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDH10 75465 1241 chr8 80694102 80697899 80696112 N NA HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 14004 1242 chr8 80705016 80707115 80706059 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 24918 1243 chr8 81455917 81457196 81456207 N NA NA NA NA NA NA ZBTB10 57469 1244 chr8 81830139 81832321 81830748 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 360397 1245 chr8 8483899 8486483 8485042 N NA NA SGK223,MFHAS1,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 244642 1246 chr8 8929960 8934580 8932631 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERI1 69646 1247 chr8 8938081 8941983 8940264 N NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 77767 1248 chr8 93520084 93523481 93521952 N NA NA RUNX1T1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1T1 404630 1249 chr8 94891377 94893985 94892714 Y NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 35098 1250 chr8 96111772 96114387 96112815 N NA NA MIR3150A,MIR3150B,C8orf38,C8orf69 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C8orf38 74558 1251 chr8 97398379 97400758 97399242 N NA NA SDC2,CPQ IMR90 Hi-C 24141950 PTDSS1 124212 1252 chr9 103173366 103175559 103174069 Y NA C9orf30-TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf30-TMEFF1 28629 1253 chr9 105966290 105968965 105967408 N NA NA NA NA NA NA SMC2 887576 1254 chr9 110398514 110402632 110400163 N NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF4 146467 1255 chr9 116380418 116384989 116383482 N NA NA NA NA NA NA POLE3 207389 1256 chr9 116411744 116414563 116413116 N NA NA C9orf43,RGS3,ALAD,RNF183,WDR31,CDC26,SLC31A1,PRPF4,POLE3,HDHD3,BSPRY IMR90 Hi-C 24141950 ZNF618 223999 1257 chr9 116415867 116418388 116417443 N NA NA C9orf43,RGS3,ALAD,WDR31,CDC26,SLC31A1,PRPF4,POLE3,HDHD3,BSPRY,RNF183 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF618 220174 1258 chr9 116436265 116439023 116437905 Y BSPRY,ZNF618 NA RGS3,POLE3,C9orf43 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF618 199539 1259 chr9 125109099 125110450 125109364 Y NA PTGS1 TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 PTGS1 22779 1260 chr9 128169443 128171685 128170804 N NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 145332 1261 chr9 129335316 129336049 129335455 N NA NA FAM125B,NRON,LMX1B IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 231236 1262 chr9 130763093 130765228 130764248 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS NA FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPM2 62330 1263 chr9 132174577 132177806 132175460 N NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 73133 1264 chr9 132221169 132224726 132223179 Y C9orf106,TOR1B LOC100506190 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 26213 1265 chr9 132242396 132247068 132245614 N NA LOC100506190 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 3871 1266 chr9 134247225 134250034 134248945 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 55443 1267 chr9 13567357 13570312 13568604 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 316992 1268 chr9 13704392 13709095 13706885 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 454027 1269 chr9 139533855 139546149 139541001,139543494 Y,N NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7;NA AGPAT2 MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT2 35762 1270 chr9 14028841 14031748 14030368 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 661732 1271 chr9 18356866 18361689 18359158 N NA NA ADAMTSL1,FAM154A IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 112390 1272 chr9 18392506 18395459 18393757 N NA NA ADAMTSL1,FAM154A IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 78620 1273 chr9 18436247 18439767 18438383 N NA ADAMTSL1 FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 34312 1274 chr9 19229466 19235245 19230639 N NA NA DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 55504 1275 chr9 21574118 21578231 21576665 N NA MIR31HG MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 14421 1276 chr9 21678744 21690164 21684124,21681817 N,Y NA;NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 112471 1277 chr9 22415343 22417803 22416860 N NA DMRTA1 NA NA NA NA DMRTA1 29037 1278 chr9 26241667 26245864 26243936 Y NA NA NA NA NA NA C9orf82 646962 1279 chr9 26258002 26267014 26261127,26265439 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA C9orf82 625812 1280 chr9 31346116 31347729 31347240 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 1036872 1281 chr9 35774726 35776762 35775546 N NA CREB3,TLN1,GBA2,RGP1,NPR2,HINT2 TPM2,TLN1,GBA2,CREB3,RGP1,MSMP,C9orf128,HINT2,SPAG8,TMEM8B,OR13J1,FP588 IMR90 Hi-C 24141950 NPR2 15644 1282 chr9 39811970 39819784 39816057 N NA NA NA NA NA NA LOC653501 347444 1283 chr9 40625964 40634980 40632566 N NA NA NA NA NA NA ZNF658 157132 1284 chr9 41430974 41435832 41433891 N NA NA NA NA NA NA MGC21881 519244 1285 chr9 41823743 41826741 41825146 N NA NA NA NA NA NA MGC21881 128335 1286 chr9 41862207 41864400 41863068 N NA NA NA NA NA NA MGC21881 90676 1287 chr9 4423806 4426205 4425307 N NA NA SLC1A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A1 64222 1288 chr9 44242826 44247303 44245470 N NA NA NA NA NA NA CNTNAP3B 557941 1289 chr9 44538491 44541348 44539899 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 448888 1290 chr9 45088849 45091740 45090331 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 98613 1291 chr9 45433264 45512994 45441815 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 443028 1292 chr9 46209816 46213102 46211558 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 1219580 1293 chr9 5268166 5270438 5269316 N NA NA C9orf46 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 180065 1294 chr9 5497967 5502922 5500136 Y NA CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 7623 1295 chr9 5606325 5609671 5608739 N NA KIAA1432 JAK2,RCL1,INSL6,CD274 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1432 19448 1296 chr9 5843197 5845511 5844519,5844083 N,Y NA;NA ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 10116 1297 chr9 65577446 65608264 65578711 N NA NA NA NA NA NA AQP7P1 1681228 1298 chr9 66454539 66458974 66458552 N NA NA NA NA NA NA AQP7P1 830518 1299 chr9 66552352 66564250 66553870 N NA NA NA NA NA NA AQP7P1 725242 1300 chr9 6679644 6685851 6681140 Y UHRF2,KDM4C NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 71790 1301 chr9 70642922 70651925 70646412 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 204914 1302 chr9 72589792 72593215 72591364 Y NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,PTAR1,TJP2 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 214916 1303 chr9 73032769 73037781 73034251 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 3196 1304 chr9 73094487 73096899 73095625 N NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF9 64914 1305 chr9 74918971 74921772 74920227 N NA NA TMC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 58391 1306 chr9 75584908 75587477 75586518 N NA ALDH1A1 NA NA NA NA ALDH1A1 16675 1307 chr9 75610048 75614282 75612600 Y NA ALDH1A1 ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 41815 1308 chr9 75745984 75748953 75747350 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 17828 1309 chr9 81625958 81630238 81628269 N NA NA NA NA NA NA TLE4 556640 1310 chr9 84002692 84006766 84005110 N NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 296830 1311 chr9 91390066 91394602 91391563 N NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,S1PR3,NXNL2,CKS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPIN1 386769 1312 chr9 96901005 96903165 96902172 N NA NA NA NA NA NA PTPDC1 107929 1313 chrX 106918962 106921908 106920327 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MID2 147176 1314 chrX 107268437 107270690 107269572 N NA NA MID2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD10 64184 1315 chrX 112641633 112645005 112643504 N NA NA NA NA NA NA ALG13 1717287 1316 chrX 114601746 114603560 114602549 Y NA NA PLS3 IMR90 Hi-C 24141950 PLS3 191617 1317 chrX 117349233 117351689 117349910 N NA NA NA NA NA NA WDR44 128347 1318 chrX 119618859 119620946 119619856 N NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 15655 1319 chrX 125605601 125607623 125606223 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2511126 1320 chrX 12967171 12969674 12968450 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 23552 1321 chrX 12973430 12976303 12974561 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16923 1322 chrX 13136211 13140395 13138304 N NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 142985 1323 chrX 13240963 13243648 13242472 N NA NA TMSB4X,LOC100133123 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB4X 247737 1324 chrX 13304551 13308990 13305621 N NA NA TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMSB4X 311325 1325 chrX 13414334 13418952 13415945 N NA NA FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB9A 288288 1326 chrX 13434184 13438650 13437002 N NA NA NA NA NA NA RAB9A 268590 1327 chrX 13444569 13449000 13446722 N NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB9A 258240 1328 chrX 149252066 149254918 149253204 N NA NA MAMLD1,LOC100272228 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100272228 145300 1329 chrX 152752404 152754600 152753551 N NA TREX2,HAUS7,BGN BGN MCF7 ChIA-PET 22265404 BGN 5747 1330 chrX 18692788 18694299 18693088 N NA NA NA NA NA NA EIF1AX 1465667 1331 chrX 21943509 21945451 21944675 N NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 13264 1332 chrX 25958279 25961943 25959703 N NA NA NA NA NA NA POLA1 1246215 1333 chrX 26805546 26810208 26807480 N NA NA NA NA NA NA POLA1 2093482 1334 chrX 26931353 26941883 26933450,26940723 N,N NA;NA NA NA NA NA NA POLA1 2219289 1335 chrX 27324408 27328011 27327038 N NA NA NA NA NA NA POLA1 2612344 1336 chrX 27582643 27588924 27584330 N NA NA NA NA NA NA POLA1 2870579 1337 chrX 40868938 40869687 40869053 N NA NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 75201 1338 chrX 42612146 42614228 42612890 N NA NA NA NA NA NA CASK 829859 1339 chrX 42804773 42807899 42806457 N NA NA NA NA NA NA CASK 1022486 1340 chrX 42854632 42858554 42856253 N NA NA NA NA NA NA CASK 1072345 1341 chrX 45337247 45341767 45338990 N NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf36 277101 1342 chrX 45362855 45368746 45365612 N NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf36 302709 1343 chrX 45373174 45376470 45374765 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf36 313028 1344 chrX 45567720 45577493 45570116,45575274 N,N NA;NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf36 507574 1345 chrX 45631414 45650499 45648698 Y NA NA NA NA NA NA CXorf36 571268 1346 chrX 46183581 46188003 46186389 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 118621 1347 chrX 47674371 47677330 47675516 N NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 18971 1348 chrX 48532454 48537631 48534960 N NA NA NA NA NA NA WDR13 76574 1349 chrX 50960719 50961268 50960856 N NA NA NA NA NA NA SHROOM4 403675 1350 chrX 54664840 54667691 54666069 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 108196 1351 chrX 62517373 62519468 62517638 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 51750 1352 chrX 64815702 64817386 64816684 N NA NA MSN IMR90 Hi-C 24141950 LAS1L 61016 1353 chrX 64819550 64823681 64821472 Y MSN NA MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 63830 1354 chrX 73135561 73138345 73137346 N NA JPX JPX,XIST,FTX IMR90 Hi-C 24141950 JPX 25814 1355 chrX 75364376 75366819 75364957 N NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 25952 1356 chrX 9977195 9981197 9978981 Y NA WWC3 SHROOM2,WWC3 IMR90 Hi-C 24141950 WWC3 2598 1357 chrY 7324554 7328755 7326599 N NA NA NA NA NA NA PRKY 182541 1358 chrY 8979384 8979691 8979536 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1837371