Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 101576784 101579708 101577822 Y SLC30A7,SLC30A7,S1PR1 NA SLC30A7,EXTL2 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 85422 2 chr1 101643730 101645612 101644778 N NA NA S1PR1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 152368 3 chr1 101774193 101776857 101775455 Y S1PR1 NA NA NA NA NA DPH5 282831 4 chr1 101872496 101877076 101874864 N NA NA NA NA NA NA DPH5 381134 5 chr1 101900303 101903831 101901784 N NA NA NA NA NA NA DPH5 408941 6 chr1 102943477 102945953 102944528 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 1122625 7 chr1 103023790 103034229 103029544,103031948,103027735 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RNPC3 1034349 8 chr1 105407248 105413495 105410818 N NA NA NA NA NA NA AMY2A 1247249 9 chr1 105473544 105478280 105476252 N NA NA NA NA NA NA AMY2A 1313545 10 chr1 106603863 106606868 106604959 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 992399 11 chr1 108585730 108587874 108586857 N NA NA VAV3 IMR90 Hi-C 24141950 VAV3 78185 12 chr1 108591501 108596960 108593655 N NA NA NA NA NA NA VAV3 83956 13 chr1 108620589 108623856 108622414 N NA NA NA NA NA NA VAV3 113044 14 chr1 111097900 111100236 111099149 N NA NA SLC6A17,KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 HBXIP 147354 15 chr1 111327937 111331386 111329803 N NA NA KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 LRIF1 175180 16 chr1 111755495 111766280 111757959,111762633,111763532 N,Y,N NA;CD53,CEPT1,DENND2D,CHI3L2;NA NA WDR77,OVGP1,C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2,CHI3L2,CHIA IMR90 Hi-C 24141950 DRAM2 72657 17 chr1 11412447 11414871 11413385 N NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79192 18 chr1 115332393 115334566 115332694 N NA CSDE1 NA NA NA NA CSDE1 31722 19 chr1 115640916 115643051 115641932 N NA NA SYCP1,CASQ2,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 CSDE1 340245 20 chr1 117419395 117423572 117422054 N NA NA PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TTF2 179377 21 chr1 118318994 118321598 118320388 N NA NA NA NA NA NA WDR3 150774 22 chr1 120758356 120762483 120762210 N NA NA NA NA NA NA FAM72B 76522 23 chr1 121100504 121144130 121100660,121130314 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EMBP1 116780 24 chr1 121199480 121201738 121200635 N NA NA NA NA NA NA EMBP1 59172 25 chr1 13855157 13858398 13856717 N NA NA NA NA NA NA MIIP 1775858 26 chr1 14013179 14015042 14014047 N NA NA PRDM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DNAJC16 1838310 27 chr1 143671762 143676603 143673434 N NA NA NA NA NA NA FAM72D 236540 28 chr1 145394410 145398240 145397955,145395655 N,N NA;NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40222 29 chr1 145968111 145971552 145969515 N NA NA NA NA NA NA GPR89A 141008 30 chr1 145989507 145996058 145991587 N NA NA NA NA NA NA GPR89A 162404 31 chr1 146237718 146239349 146239097 N NA NA NA NA NA NA GPR89A 410615 32 chr1 146372508 146400301 146373544 N NA NA NA NA NA NA CHD1L 313990 33 chr1 146543081 146545774 146544600 N NA NA PRKAB2 IMR90 Hi-C 24141950 CHD1L 168517 34 chr1 146553652 146558488 146556427 N NA NA CHD1L,LOC728989,PRKAB2,FMO5 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CHD1L 155803 35 chr1 147509913 147512993 147511239 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 109407 36 chr1 147734427 147736999 147736001 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 333921 37 chr1 147748763 147795141 147751298,147753191,147759017,147776644,147781177,147790704 N,N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GPR89B 348257 38 chr1 147805233 147809570 147807030 Y NA NA NA NA NA NA GPR89B 404727 39 chr1 147859275 147863527 147860942 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 458769 40 chr1 147873153 147876449 147874729 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 472647 41 chr1 148239750 148243023 148241316 N NA NA NA NA NA NA NBPF16 496419 42 chr1 148246443 148249290 148248368 N NA NA NA NA NA NA NBPF16 490152 43 chr1 149136831 149139201 149138108 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BF 260028 44 chr1 149153284 149160209 149157274 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BF 239020 45 chr1 149222472 149226561 149224404,149223520 N,N NA;NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 HIST2H2BF 172668 46 chr1 149512718 149516442 149514432 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 59820 47 chr1 150877031 150878875 150877652 N NA SETDB1 ARNT,GOLPH3L,SETDB1,CERS2,HORMAD1,ENSA,CTSK,FAM63A,CTSS,RPRD2 IMR90 Hi-C 24141950 SETDB1 19940 48 chr1 158117114 158122792 158119633 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 IFI16 856890 49 chr1 15929035 15929860 15929310 N NA DDI2 DDI2,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 14093 50 chr1 15936447 15940555 15937042 N NA DDI2 DDI2,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 3398 51 chr1 161358061 161365314 161359933 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 73895 52 chr1 161367926 161371990 161369407 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83760 53 chr1 161390811 161392699 161391971 N NA NA APOA2,TOMM40L,NDUFS2 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 106645 54 chr1 161412996 161414263 161413338 N NA NA NDUFS2,DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 128830 55 chr1 165343764 165347273 165345821 Y NA NA LOC400794,LMX1A,LRRC52,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH9A1 320627 56 chr1 166458323 166460639 166459301 N NA NA NA NA NA NA TADA1 385015 57 chr1 16838921 16843362 16840955 N NA NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP2 71754 58 chr1 17219664 17224184 17222308 N NA NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHB 156481 59 chr1 17229268 17233133 17231516 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHB 147532 60 chr1 172787275 172789813 172788419 N NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf9 285015 61 chr1 17508061 17509210 17508530 N NA NA NBPF1,SDHB,PADI2,PADI1,PADI3,PADI4 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 127396 62 chr1 177350506 177360539 177360379 N NA NA ASTN1 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 1151392 63 chr1 177557295 177563334 177563177 N NA NA ASTN1 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 948597 64 chr1 177608955 177609241 177608987 N NA NA NA NA NA NA C1orf220 902690 65 chr1 177685637 177702529 177701526 N NA NA ASTN1 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 809402 66 chr1 178610571 178617691 178614998 N NA NA RALGPS2,C1orf220,ANGPTL1,FAM20B,MIR4424 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 98640 67 chr1 181093440 181094101 181093908 N NA IER5 NA NA NA NA IER5 35802 68 chr1 181096490 181099602 181098101 Y MR1,IER5 IER5 KIAA1614,IER5,STX6,ACBD6,MR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 38852 69 chr1 181103361 181106018 181104133 N NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 45723 70 chr1 181995880 182000478 181998975 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360863 71 chr1 182227057 182229736 182228665 Y RNASEL,GLUL,GLUL NA GLUL K562 ChIA-PET 22265404 GLUL 131605 72 chr1 182267286 182269571 182268731 N NA NA GLUL K562 ChIA-PET 22265404 GLUL 91770 73 chr1 185662368 185664596 185663280 N NA NA IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 375907 74 chr1 187039433 187042994 187042078 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 694543 75 chr1 187165302 187166264 187165460 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 820412 76 chr1 187351495 187365881 187351654 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1006605 77 chr1 187953822 187956979 187955048 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1608932 78 chr1 187972989 188000389 187975644,187979143,187981579 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C1orf27 1628099 79 chr1 188038435 188098146 188038597 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1693545 80 chr1 188124900 188185417 188125058 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1780010 81 chr1 188192472 188396650 188332054,188321423,188213723,188193117,188210371 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA C1orf27 1847582 82 chr1 192215237 192217621 192216644 N NA NA NA NA NA NA RGS2 560548 83 chr1 192484167 192488147 192486091 Y RGS2,RGS1 NA RGS2,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 290022 84 chr1 192507617 192509631 192508573 N NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 268538 85 chr1 192532964 192536949 192534807 N NA NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 241220 86 chr1 192577636 192580168 192578453 Y TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2 NA UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS2 198001 87 chr1 194434848 194440507 194437628 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1343760 88 chr1 194441314 194444764 194443593 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1350226 89 chr1 194484550 194724721 194490173,194504725,194582130,194616692,194668328,194695127,194674512,194698225,194699482,194702309,194709397,194722398,194716807 N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TBXAS1 MCF7 ChIA-PET 19890323 CDC73 1393462 90 chr1 194735723 194781855 194777212,194738067,194779777 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CDC73 1644635 91 chr1 194783341 194834733 194795313,194786677,194802500,194819226,194804072,194805712 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CDC73 1692253 92 chr1 194835272 194875144 194837914 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1744184 93 chr1 194927393 195037905 194927606 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1836305 94 chr1 198524919 198530639 198526248 Y PTPRC NA PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 375919 95 chr1 198558976 198570031 198567474,198563265 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100131234 336527 96 chr1 198588961 198592439 198590593 Y NEK7,PTPRC NA NA NA NA NA LOC100131234 314119 97 chr1 198994601 199010704 199010504,198997298 N,N NA;NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 88043 98 chr1 199069125 199072345 199070497 N NA NA PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 162567 99 chr1 199129288 199134473 199130964 N NA NA NA NA NA NA LOC100131234 222730 100 chr1 199141901 199145088 199142783 Y NA NA NA NA NA NA LOC100131234 235343 101 chr1 199149977 199153403 199151593 N NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 243419 102 chr1 199185845 199192965 199187364,199190932 N,N NA;NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 279287 103 chr1 199836488 199838112 199836923 N NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 KIF14 751750 104 chr1 199900408 199903310 199901358 N NA NA NA NA NA NA KIF14 686552 105 chr1 200210239 200213530 200212096 N NA NA NA NA NA NA KIF14 376332 106 chr1 200270062 200272414 200271058 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 KIF14 317448 107 chr1 20203002 20205474 20203886 N NA NA NA NA NA NA TMCO4 76592 108 chr1 203540102 203540803 203540619 N NA NA ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 LAX1 193481 109 chr1 204474966 204476907 204475955 N NA MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8600 110 chr1 211380313 211382049 211381311 N NA NA HHAT,RCOR3 IMR90 Hi-C 24141950 RCOR3 50659 111 chr1 212728499 212733705 212732376 Y NA NA ATF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM206 140232 112 chr1 218645141 218648904 218646845 N NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP15 186512 113 chr1 221241390 221243819 221242920 N NA NA HLX IMR90 Hi-C 24141950 RAB3GAP2 795547 114 chr1 222049709 222052671 222050802 Y DUSP10,DUSP10 NA NA NA NA NA AIDA 833193 115 chr1 222628023 222629844 222628998 N NA NA DUSP10,HHIPL2,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 AIDA 256020 116 chr1 222638143 222639544 222638825 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AIDA 246320 117 chr1 222662317 222662977 222662578 N NA NA NA NA NA NA AIDA 222887 118 chr1 222944717 222947953 222946383,222944920 N,N NA;NA DISP1 NA NA NA NA DISP1 40478 119 chr1 224178197 224212589 224180390 Y NA NA NA NA NA NA NVL 305302 120 chr1 224645087 224664234 224645248 N NA NA FBXO28,CNIH4,WDR26 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNIH4 100492 121 chr1 224684474 224686905 224685950 N NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 CNIH4 139879 122 chr1 225631334 225635148 225632736,225634629 N,N NA;NA NA TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRP9 330367 123 chr1 226297792 226300578 226298275 N NA H3F3A ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 47384 124 chr1 229826229 229833606 229829706,229832385,229826445 N,N,N NA;NA;NA NA TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 NUP133 182141 125 chr1 232733163 232737325 232734942 N NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 349045 126 chr1 234629677 234632900 234631786 N NA NA LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf31 120463 127 chr1 234900845 234910508 234908263 Y IRF2BP2 NA LOC100506810,IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,TOMM20,RBM34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 381748 128 chr1 234976675 234980131 234978612 Y IRF2BP2 NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 312125 129 chr1 235050958 235053141 235051899 N NA NA LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506810,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 239115 130 chr1 235061970 235063274 235062670 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 228982 131 chr1 235089080 235100956 235091144,235098818 Y,N IRF2BP2,ARID4B,ARID4B;NA NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 191300 132 chr1 235109983 235118266 235116762 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 173990 133 chr1 235146681 235150028 235147475 N NA NA LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 142228 134 chr1 236283074 236286025 236284041 Y NA GPR137B LGALS8,LGALS8-AS1,EDARADD,HEATR1,MTR,ERO1LB IMR90 Hi-C 24141950 GPR137B 19807 135 chr1 238662292 238662782 238662540 N NA NA NA NA NA NA MTR 1703711 136 chr1 23902121 23906260 23904474 N NA E2F2,ID3 ID3,MDS2,E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 15836 137 chr1 23922006 23930207 23925679 N NA ID3 ID3,ASAP3,E2F2,MDS2,TCEB3,HNRNPR,TCEA3,LOC100506963,ZNF436,RPL11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ID3 35721 138 chr1 23936273 23949238 23938746,23946200 N,N NA;NA ID3 HNRNPR,ASAP3,E2F2,TCEB3,ZNF436,TCEA3,ID3,MDS2,RPL11 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 49988 139 chr1 24245407 24247396 24246677 N NA PNRC2 GALE,HMGCL,SRSF10,LOC100506963,PITHD1 K562 ChIA-PET 22265404 PNRC2 38905 140 chr1 242945186 242949535 242947635 N NA NA NA NA NA NA CEP170 469173 141 chr1 24357621 24359813 24357804 N NA NA NA NA NA NA SRSF10 50668 142 chr1 244317785 244319070 244318322 N NA NA SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF238 103224 143 chr1 244462000 244463597 244462641 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 151839 144 chr1 244482259 244484456 244483087 Y AKT3,AKT3,ADSS NA SDCCAG8,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 130980 145 chr1 245114617 245118226 245116259 N NA EFCAB2 EFCAB2,HNRNPU IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 15058 146 chr1 246861345 246870821 246862510 Y SCCPDH SCCPDH SCCPDH MCF7 ChIA-PET 22265404 SCCPDH 16557 147 chr1 249178811 249181897 249180242 N NA ZNF672,ZNF692,PGBD2 PGBD2,ZNF692 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGBD2 18545 148 chr1 249184976 249188166 249186470 N NA ZNF692,PGBD2 PGBD2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PGBD2 12276 149 chr1 25030859 25033548 25031951 N NA CLIC4 SRRM1,CLIC4,RUNX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 38212 150 chr1 25323579 25325185 25324251 N NA NA RUNX3 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 233828 151 chr1 26944779 26962064 26946653 N NA NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 60458 152 chr1 28639850 28644287 28641744 N NA MED18 MED18 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED18 11226 153 chr1 31954815 31958298 31956298 Y PEF1 NA SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,ZCCHC17,PEF1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PEF1 152540 154 chr1 32408823 32412050 32410113 N NA NA KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS1 67441 155 chr1 32446980 32454393 32447968,32450867,32453451 N,N,N NA;NA;NA KHDRBS1 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,KPNA6,BAI2,COL16A1,TMEM39B,CCDC28B,IQCC,TXLNA IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS1 25098 156 chr1 37547806 37551421 37549972 N NA NA GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 468482 157 chr1 40263076 40284301 40265063,40283095 Y,Y NA;PABPC4,RLF,MFSD2A NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1,NT5C1A,TRIT1,MYCL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPIE 58559 158 chr1 41831028 41854654 41832559 N NA NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507178 350766 159 chr1 4236682 4242316 4237803 N NA NA NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100133612 419714 160 chr1 44533451 44536444 44534515 N NA NA SLC6A9,DMAP1,RNF220,CCDC24 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC24 76171 161 chr1 46007489 46013163 46009725,46010645 Y,N IPP,GPBP1L1,TOE1,TESK2;NA CCDC163P,MMACHC,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AKR1A1 3292 162 chr1 52034219 52036988 52035301 N NA OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 45558 163 chr1 53819325 53837605 53832149,53826205,53833837 N,N,N NA;NA;NA LRP8 GLIS1,LRP8,FLJ40434,YIPF1,LOC100507564,MAGOH,TMEM48 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP8 25504 164 chr1 53838640 53865354 53841594,53843132,53839637,53848149,53858015,53851920,53856197 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA LRP8 LRP8,FLJ40434,YIPF1,LOC100507564,MAGOH,TMEM48,GLIS1,C1orf123,DMRTB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP8 44819 165 chr1 54939289 54944022 54941923 Y NA NA TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 67197 166 chr1 54952582 54955702 54954400 N NA NA TCEANC2,SSBP3,TMEM59,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,C1orf177,YIPF1,DIO1,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 80490 167 chr1 564342 570425 567627 N NA NA NA NA NA NA LINC00115 192477 168 chr1 5763869 5775322 5773534 N NA NA NA NA NA NA NPHP4 277211 169 chr1 59484952 59489994 59486064 N NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 JUN 235167 170 chr1 63182941 63196235 63183098 N NA NA DOCK7,ANGPTL3,USP1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG4C 53542 171 chr1 64168146 64172111 64169469,64171112 N,N NA;NA NA ROR1,PGM1,UBE2U IMR90 Hi-C 24141950 PGM1 109199 172 chr1 64178830 64181115 64180152 N NA NA ROR1,PGM1,UBE2U IMR90 Hi-C 24141950 PGM1 119883 173 chr1 66865883 66869863 66868079 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 520715 174 chr1 66907219 66912796 66911307 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 477782 175 chr1 68708029 68708727 68708479 N NA NA LOC100289178,WLS IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 557169 176 chr1 74057965 74060501 74059333 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1138335 177 chr1 77165336 77166817 77166026 Y NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 518315 178 chr1 79906434 79909241 79907378 N NA NA NA NA NA NA IFI44 790957 179 chr1 8013411 8018009 8014350 N NA PARK7 NA NA NA NA PARK7 3705 180 chr1 82859841 82863337 82861298 N NA NA NA NA NA NA RPF1 2081583 181 chr1 83042503 83046218 83043944 N NA NA NA NA NA NA RPF1 1898702 182 chr1 83168769 83172101 83170750 N NA NA NA NA NA NA RPF1 1772819 183 chr1 90221324 90230643 90223330,90228696 Y,N NA;NA NA LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8C 122680 184 chr1 91304916 91317570 91316774 N NA NA NA NA NA NA CDC7 648834 185 chr1 91340441 91358405 91356763 N NA NA NA NA NA NA CDC7 607999 186 chr1 91612234 91612597 91612472 N NA NA NA NA NA NA CDC7 353807 187 chr1 92034479 92043292 92037781,92042166,92035468 Y,N,N NA;NA;NA NA TGFBR3,HSP90B3P,EPHX4,CDC7,RPAP2,GLMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC7 68075 188 chr1 9233802 9242690 9241917 N NA NA SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENO1 294651 189 chr1 94156519 94159413 94158229 N NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNTTIP2 185349 190 chr1 94212934 94217618 94216290 N NA NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 DNTTIP2 127144 191 chr1 9485416 9490595 9489098 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CD 221195 192 chr10 102416206 102450945 102434825,102444585,102448177 N,N,N NA;NA;NA NA PAX2,FAM178A,HIF1AN IMR90 Hi-C 24141950 HIF1AN 120565 193 chr10 105118988 105120100 105119701 N NA USMG5,PDCD11 NA NA NA NA USMG5 36170 194 chr10 108235538 108312891 108308944 N NA NA NA NA NA NA SFR1 2353722 195 chr10 11442369 11444630 11443431 N NA NA CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 DHTKD1 666304 196 chr10 115020792 115022777 115021438 N NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 310783 197 chr10 115032427 115034075 115033238 Y CASP7,TCF7L2 NA TECTB,GUCY2GP,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 322418 198 chr10 115784217 115786485 115784994 N NA NA NHLRC2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf118 147879 199 chr10 116558038 116562701 116561363 Y NA NA AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 TRUB1 135251 200 chr10 116684491 116686771 116685809 N NA TRUB1 TRUB1 IMR90 Hi-C 24141950 TRUB1 11181 201 chr10 11720034 11729440 11727208 N NA NA USP6NL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHTKD1 381494 202 chr10 120152981 120157556 120154526 N NA NA EMX2OS,EMX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM204A 51142 203 chr10 121306577 121309180 121307358,121307338 N,N NA;NA TIAL1 RGS10,TIAL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TIAL1 47361 204 chr10 125297244 125300052 125298017 N NA NA IKZF5,ACADSB IMR90 Hi-C 24141950 BUB3 383484 205 chr10 125973084 125975651 125974314 Y CHST15 NA CPXM2,CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 CHST15 121154 206 chr10 126035120 126037458 126036678 N NA NA HMX3,CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 70087 207 chr10 126042705 126044903 126043712 N NA NA CHST15,OAT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OAT 62642 208 chr10 129985083 129987105 129985934 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 60615 209 chr10 134327613 134329167 134328803 N NA NA INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf125 842362 210 chr10 135460702 135464953 135460823,135463496 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MTG1 253081 211 chr10 18031381 18038847 18034407 N NA NA NA NA NA NA STAM 345257 212 chr10 1900099 1903236 1901144 N NA NA NA NA NA NA ADARB2-AS1 331274 213 chr10 1914368 1921506 1918644,1916444 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ADARB2-AS1 345543 214 chr10 19242007 19245457 19244066 N NA NA NA NA NA NA ARL5B 293694 215 chr10 19287330 19293569 19292410 N NA NA NA NA NA NA ARL5B 339017 216 chr10 1964995 1966905 1965749 N NA NA NA NA NA NA ADARB2-AS1 396170 217 chr10 1978859 1983305 1980714 N NA NA NA NA NA NA ADARB2-AS1 410034 218 chr10 22516930 22522135 22518420 N NA NA COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3-BMI1 83177 219 chr10 23827490 23831341 23829536 N NA NA NA NA NA NA COMMD3-BMI1 1222178 220 chr10 26108914 26111254 26110042 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 616012 221 chr10 26189686 26192471 26191211 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 534795 222 chr10 26623005 26629062 26624561 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 98204 223 chr10 27579138 27583427 27580617 N NA ACBD5,LOC387646 ACBD5 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC387646 37903 224 chr10 27642853 27644642 27643796 N NA NA NA NA NA NA LOC387646 101618 225 chr10 28590441 28593057 28591815 N NA NA MPP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC220906 228226 226 chr10 28657384 28658773 28658001 N NA NA MKX,ARMC4,MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 LOC220906 162510 227 chr10 28753385 28755610 28753819 N NA NA NA NA NA NA LOC220906 65673 228 chr10 30380524 30381117 30380782 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 257150 229 chr10 30450269 30451586 30450778 N NA NA MTPAP,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 186681 230 chr10 30503672 30506290 30504796 N NA NA KIAA1462,SVIL,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 131977 231 chr10 30507846 30510824 30509229 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 127443 232 chr10 30992310 30996114 30994723 N NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 354043 233 chr10 31420412 31424814 31423242 N NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 183210 234 chr10 31891093 31893617 31892600 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 283069 235 chr10 31994973 31997897 31996753 N NA NA ZEB1,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 386949 236 chr10 32044875 32051395 32049167 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZEB1-AS1 436851 237 chr10 32476960 32478675 32477497 N NA NA EPC1,KIF5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 157438 238 chr10 32649193 32669732 32667759,32667235,32654699 N,N,N NA;NA;NA EPC1 EPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 13080 239 chr10 32731461 32737076 32735059 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 95348 240 chr10 33268814 33270892 33269589 Y C10orf68 NA ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 632701 241 chr10 3525248 3529536 3527283 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 297937 242 chr10 35391986 35392805 35392274 N NA NA NA NA NA NA EPC1 2755873 243 chr10 36108579 36112520 36110872 N NA NA NA NA NA NA ZNF33A 2187058 244 chr10 3790220 3790723 3790612 N NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 36750 245 chr10 3976615 3979027 3977539 N NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 149142 246 chr10 4171839 4174676 4173111 Y KLF6 NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF6 344366 247 chr10 43853624 43860892 43857834 N NA HNRNPF FXYD4,HNRNPF,ZNF487P MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HNRNPF 43804 248 chr10 43914565 43918430 43916049 N NA HNRNPF ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPF 9869 249 chr10 44811593 44813545 44812435 N NA NA TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,CXCL12,HNRNPA3P1 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf10 660785 250 chr10 45824645 45826701 45825375 N NA NA NA NA NA NA C10orf25 328175 251 chr10 47634232 47642693 47640361 N NA NA LOC643650,GPRIN2,PPYR1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP9 573031 252 chr10 48572734 48574424 48573577 N NA NA GPRIN2,GDF10 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP9 357010 253 chr10 50977942 50982624 50979357 N NA NA NA NA NA NA ERCC6 230795 254 chr10 52410340 52414240 52413305 N NA SGMS1 SGMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGMS1 26603 255 chr10 54195589 54198042 54197221 N NA NA LOC100506939,DKK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSTF2T 736234 256 chr10 5611254 5613540 5612370 N NA NA CALML5,NET1,ASB13 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 113261 257 chr10 58380512 58383765 58382251 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 259478 258 chr10 58391810 58395917 58394013 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 270776 259 chr10 6110223 6112524 6110765 N NA IL2RA IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 IL2RA 5890 260 chr10 69521978 69525433 69524557 N NA NA NA NA NA NA HERC4 309670 261 chr10 69607930 69613889 69609254 Y NA NA SIRT1,HERC4,MYPN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HERC4 221214 262 chr10 6967473 6972700 6970037 N NA NA SFMBT2,LOC100507127 IMR90 Hi-C 24141950 KIN 857290 263 chr10 74018606 74023665 74020677 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,DDIT4 DNAJB12 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DDIT4 10012 264 chr10 74056317 74059769 74057537 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 22640 265 chr10 7461342 7520528 7503113,7486631,7509063,7511728,7514123,7517631 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA PRKCQ,LOC439949,LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 KIN 309462 266 chr10 7521422 7537743 7523133,7527010,7536739 Y,N,N SFMBT2;NA;NA NA NA NA NA NA KIN 292247 267 chr10 7548002 7555747 7550928,7550420,7554612 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KIN 274243 268 chr10 76497551 76500977 76499513 N NA NA ADK,KAT6B,DUPD1,DUSP13,SAMD8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT6B 85194 269 chr10 80061699 80064052 80063029 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 268181 270 chr10 82006184 82007981 82006989 N NA NA NA NA NA NA FAM213A 167758 271 chr10 82454205 82459567 82457785 N NA NA NA NA NA NA SH2D4B 156547 272 chr10 89824935 89831524 89826876 Y KLLN,PTEN NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 KLLN 201741 273 chr10 89872152 89879809 89873846 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS,CFL1P1,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLLN 248958 274 chr10 91646884 91666219 91648171,91658958 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIF20B 185517 275 chr10 92218380 92224506 92220737 N NA NA NA NA NA NA RPP30 407203 276 chr10 92351719 92354761 92352838,92352335 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RPP30 276948 277 chr10 92705616 92708579 92706919 N NA NA PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 RPP30 73907 278 chr10 94515102 94518023 94516557 Y MARCH5,HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF11 162277 279 chr10 95033652 95038619 95035333 Y NA NA NA NA NA NA FRA10AC1 423710 280 chr10 97883125 97886378 97884537 N NA LOC728558,ZNF518A LOC728558,CCNJ K562 ChIA-PET 22265404 ZNF518A 3094 281 chr10 98044982 98055098 98047772,98053345 N,N NA;NA BLNK,DNTT LOC728558,CC2D2B,DNTT,BLNK,OPALIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNTT 8987 282 chr10 981540 985940 981698 N NA GTPBP4 LARP4B,GTPBP4,DIP2C,IDI2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 GTPBP4 48409 283 chr10 98499433 98579249 98500900,98523838 N,N NA;NA PIK3AP1,LCOR PIK3AP1,SLIT1,TLL2,ARHGAP19-SLIT1,LCOR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCOR 12768 284 chr11 104575460 104577053 104576691 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1826 1315901 285 chr11 109840915 109845303 109842109 N NA NA NA NA NA NA DDX10 1305099 286 chr11 109853809 109857014 109855830 Y ZC3H12C NA ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 DDX10 1317993 287 chr11 110196874 110207950 110199352 N NA NA C11orf53,RDX IMR90 Hi-C 24141950 POU2AF1 1042207 288 chr11 111306503 111308564 111307627 Y POU2AF1 LOC100132078 LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20,C11orf88,C11orf93,MIR4491,POU2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100132078 17592 289 chr11 112150930 112152620 112151561 N NA NA BCO2,PTS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTS 53842 290 chr11 119454767 119456485 119455582 N NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 NLRX1 415327 291 chr11 121237271 121239119 121238078 N NA NA SORL1,SC5DL IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 83793 292 chr11 122450393 122453249 122451773 N NA NA CRTAM,C11orf63,SC5DL,SORL1,HSPA8,UBASH3B IMR90 Hi-C 24141950 UBASH3B 73149 293 chr11 122874194 122874478 122874346 N NA NA C11orf63 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 58423 294 chr11 123133307 123137033 123134929 N NA NA CLMP,HSPA8,CRTAM,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 200406 295 chr11 123137612 123140768 123138929 N NA NA CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 204711 296 chr11 123171290 123173336 123172273 N NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 223192 297 chr11 123228038 123229874 123229171 N NA NA GRAMD1B,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 166654 298 chr11 128160720 128162759 128161975 Y NA NA ETS1,FLI1,LOC100507392 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 401052 299 chr11 128477114 128484943 128480576,128483615 N,N NA;NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 78868 300 chr11 128489563 128495991 128490969,128494507 N,N NA;NA NA ETS1,FLI1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 67820 301 chr11 128531457 128534828 128533204 N NA FLI1,LOC100507392 KCNJ1,LOC100507392,FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 28983 302 chr11 129115383 129153090 129130912,129138314,129149951,129140656 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507392 549465 303 chr11 129181459 129188755 129184753 N NA NA ARHGAP32,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507392 615541 304 chr11 129193311 129196882 129194174,129193777 N,N NA;NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507392 627393 305 chr11 13014306 13022154 13020627 N NA NA LOC100506305,RASSF10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BTBD10 462684 306 chr11 130307243 130310983 130308557 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM10 434513 307 chr11 13064493 13068153 13065978 N NA NA LOC100506305,ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 BTBD10 416685 308 chr11 134849814 134867353 134856121,134864866 N,N NA;NA NA NA NA NA NA THYN1 726554 309 chr11 13942905 13948318 13946116 N NA NA NA NA NA NA BTBD10 458067 310 chr11 14915842 14918422 14916760 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 2091 311 chr11 14924911 14936168 14926915 N NA CYP2R1 PSMA1,INSC IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 11160 312 chr11 15318857 15322108 15320478 N NA NA SOX6,C11orf58,PLEKHA7 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 405106 313 chr11 15528599 15530705 15529471 N NA NA NA NA NA NA CYP2R1 614848 314 chr11 17211690 17242648 17229580 N NA PIK3C2A PIK3C2A,NUCB2,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C2A 20336 315 chr11 22111570 22129789 22112860 N NA NA NA NA NA NA FANCF 517598 316 chr11 2387133 2390087 2388992 N NA TSSC4 C11orf21,CD81,CDKN1C,SLC22A18AS,SLC22A18,TRPM5 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC4 33436 317 chr11 3273882 3278374 3276980 N NA NA NA NA NA NA ZNF195 122078 318 chr11 3320308 3323992 3323214 N NA NA NA NA NA NA ZNF195 76460 319 chr11 33916065 33918276 33917598 N NA NA NA NA NA NA CAPRIN1 154954 320 chr11 34446791 34448913 34447588 N NA CAT ABTB2,ELF5,CAT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAT 11559 321 chr11 354560 360268 355840 N NA IFITM2 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM2 46453 322 chr11 39288946 39290157 39289601 N NA NA NA NA NA NA RAG2 2669117 323 chr11 43030096 43033016 43031829 N NA NA NA NA NA NA API5 300489 324 chr11 43084226 43089172 43087620 N NA NA NA NA NA NA API5 244333 325 chr11 4337815 4338846 4338014 N NA NA NA NA NA NA RRM1 221891 326 chr11 43664624 43675266 43665773 N NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 26877 327 chr11 45094204 45096789 45095351 N NA NA NA NA NA NA PEX16 842885 328 chr11 45100317 45101636 45100773 N NA NA NA NA NA NA PEX16 838038 329 chr11 45424483 45425655 45424900 N NA NA CHST1,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 PEX16 514019 330 chr11 46263391 46267243 46265022 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF21A 120406 331 chr11 47212279 47213825 47213301 N NA ARFGAP2,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARFGAP2 13603 332 chr11 47412931 47418863 47414130,47416453 N,N NA;NA SPI1,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPI1 12804 333 chr11 47938688 47942221 47939648 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 68631 334 chr11 60808517 60810650 60809848 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA CD5,VPS37C,SLC15A3,TMEM132A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM109 127146 335 chr11 64214136 64220735 64215801 Y OTUB1,FERMT3,SF1,SF1,RASGRP2,RASGRP2,EHD1,CCDC88B NA SLC22A12,NRXN2,SLC22A11,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 87511 336 chr11 64248321 64256391 64255742 N NA NA NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,MAP4K2,SF1,EHD1,SLC22A11,PYGM IMR90,H1ESC,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 SLC22A11 66707 337 chr11 64265113 64269204 64267043 N NA NA NRXN2,RASGRP2,PYGM,SLC22A12,SLC22A11 IMR90,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 SLC22A11 53894 338 chr11 65253014 65257509 65255578 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7724 339 chr11 65258545 65261483 65260053 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3750 340 chr11 67514119 67522596 67515021 N NA NA NA NA NA NA GSTP1 163053 341 chr11 6762921 6769008 6767728 N NA NA TRIM3,NLRP14,SYT9 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL17 58289 342 chr11 69816393 69820707 69818595 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19 IMR90 Hi-C 24141950 FADD 228562 343 chr11 72858056 72865969 72865364,72861078 Y,N FCHSD2;NA FCHSD2 FCHSD2,MIR4692,STARD10,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,ARHGEF17 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FCHSD2 4913 344 chr11 72899578 72901866 72900522 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,ARHGEF17,P2RY2,P2RY6,ARAP1,STARD10 IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 FCHSD2 46435 345 chr11 73489170 73492278 73490623 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6639 346 chr11 75263571 75267259 75265725 Y SERPINH1 NA RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3 153036 347 chr11 75945813 75947756 75946755 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf30 208313 348 chr11 85912489 85915175 85913468 N NA EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 40631 349 chr11 9383874 9387572 9386102 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 18597 350 chr11 94986305 94988925 94987656 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 22059 351 chr11 95068734 95071355 95070764 N NA NA SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 SESN3 104488 352 chr11 95447203 95451239 95449190 Y FAM76B NA SESN3,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 71715 353 chr11 9633935 9640352 9635333 N NA WEE1 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 38707 354 chr12 1068359 1077267 1076439 N NA RAD52,ERC1 NA NA NA NA RAD52 9496 355 chr12 110516539 110519097 110517711 Y GIT2,RAD9B,C12orf76 IFT81 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 IFT81 43043 356 chr12 111836201 111838873 111837540 N NA NA SH2B3 K562 ChIA-PET 22265404 BRAP 284917 357 chr12 112553338 112555756 112554527 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 NAA25 6703 358 chr12 113486842 113491953 113490346 Y DTX1 DTX1 NA NA NA NA DTX1 3709 359 chr12 115941519 115943017 115942258 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 771974 360 chr12 11632532 11667457 11665826 N NA NA PRR4,PRH1-PRR4,CSDA,BCL2L14 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 135331 361 chr12 117072156 117074821 117073448 N NA NA MED13L,FBXW8,MAP1LC3B2,LINC00173 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1LC3B2 74970 362 chr12 117096796 117097581 117097534 N NA NA MED13L,LINC00173,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1LC3B2 99610 363 chr12 118561545 118563893 118563494 N NA PEBP1 TAOK3 IMR90 Hi-C 24141950 PEBP1 9977 364 chr12 120024000 120027123 120025959 N NA NA NA NA NA NA PRKAB1 78638 365 chr12 120728355 120733005 120730508 N NA SIRT4 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT4 7119 366 chr12 120733706 120735307 120735019 N NA SIRT4 PXN,LOC100506649,RAB35,GCN1L1,RPLP0,SIRT4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT4 4817 367 chr12 121483420 121486257 121484532 N NA C12orf43 SPPL3 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf43 29120 368 chr12 121497205 121499489 121498718 N NA C12orf43 SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,HNF1A-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf43 42905 369 chr12 122123812 122126391 122124930 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 24267 370 chr12 125197149 125199685 125198392 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 UBC 199902 371 chr12 125350542 125356586 125353826 Y NA UBC NA NA NA NA UBC 43001 372 chr12 125405239 125407515 125406087 N NA UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 5652 373 chr12 126915187 126917705 126916710 N NA NA NA NA NA NA DHX37 1441520 374 chr12 127448284 127452531 127451709 N NA NA NA NA NA NA DHX37 1974617 375 chr12 128176034 128180469 128177364,128179087 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DHX37 2702367 376 chr12 13014319 13020094 13014844 N NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 48039 377 chr12 131184840 131191506 131188033 N NA NA NA NA NA NA SFSWAP 1004129 378 chr12 131237161 131240811 131239206 N NA NA NA NA NA NA SFSWAP 954824 379 chr12 131723218 131725706 131724460 N NA NA LOC116437 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 469929 380 chr12 133001231 133018309 133016316,133014243 Y,N FBRSL1;NA NA P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGAM5 269084 381 chr12 133019639 133025184 133021703 Y POLE,DDX51,FBRSL1 NA LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGAM5 262209 382 chr12 14309120 14311738 14310607,14310420 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATF7IP 206873 383 chr12 14391670 14394035 14392890 N NA NA ATF7IP,GUCY2C,PLBD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 124576 384 chr12 14407983 14410513 14409737 N NA NA PLBD1,ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 108098 385 chr12 1710310 1712340 1710881 N NA NA FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DCP1B 401337 386 chr12 18101969 18103362 18102793 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 1489246 387 chr12 18251535 18257427 18254562 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 1335181 388 chr12 18290519 18294492 18292420 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 1298116 389 chr12 18317799 18319672 18318943 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 1272936 390 chr12 22253829 22255922 22254850 N NA NA ST8SIA1,KIAA0528 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0528 441530 391 chr12 22311882 22318497 22313511,22312278,22316955 N,N,N NA;NA;NA NA ST8SIA1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0528 378955 392 chr12 25167769 25169677 25168006 N NA LRMP NA NA NA NA LRMP 35504 393 chr12 25516110 25519418 25518120 N NA NA LOC100506451,RASSF8,KRAS,IFLTD1,LYRM5,CASC1 IMR90 Hi-C 24141950 LYRM5 167960 394 chr12 25536195 25540983 25539226 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYRM5 188045 395 chr12 25612022 25614442 25612840 N NA NA RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302 IMR90 Hi-C 24141950 LYRM5 263872 396 chr12 29147678 29150380 29148904 N NA NA NA NA NA NA ERGIC2 383763 397 chr12 29298222 29323877 29302288,29311665 N,N NA;NA NA FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 210266 398 chr12 31330733 31334302 31332977 N NA NA NA NA NA NA LOC100506660 103952 399 chr12 31904218 31905029 31904800 N NA H3F3C NA NA NA NA H3F3C 40146 400 chr12 32047345 32055644 32049699,32052850,32050398 N,N,N NA;NA;NA NA AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 56709 401 chr12 4225643 4228903 4227653 N NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 201456 402 chr12 4250101 4253304 4252256 Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 177055 403 chr12 4272938 4275312 4273831 N NA NA NA NA NA NA C12orf5 155047 404 chr12 4501154 4502879 4501753 Y NA NA NA NA NA NA C12orf5 70795 405 chr12 46775332 46790929 46777231,46781776 N,N NA;NA SLC38A2 SLC38A1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC38A2 8687 406 chr12 46805675 46815939 46805836 N NA SLC38A2 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A2 39030 407 chr12 47753370 47756681 47755056 N NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100233209 143144 408 chr12 49623391 49630534 49628385 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28331 409 chr12 53737883 53739988 53738899 N NA PFDN5,C12orf10,AAAS,SP1 MAP3K12,TARBP2,PCBP2,PFDN5,ESPL1,SP1,RARG,C12orf10,SP7,AAAS,AMHR2,PRR13,LOC100652999,ATF7,NPFF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AAAS 22471 410 chr12 53763939 53770080 53765117 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 3899 411 chr12 54144304 54145718 54145063 N NA CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 22997 412 chr12 55384228 55386541 55385576 N NA KIAA0748 NA NA NA NA KIAA0748 5772 413 chr12 57817494 57823092 57821219 N NA INHBC R3HDM2,SHMT2,NDUFA4L2,STAC3,INHBE,GLI1,INHBC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INHBC 5451 414 chr12 58595640 58598872 58597707 N NA NA NA NA NA NA XRCC6BP1 260195 415 chr12 59988601 59996737 59990357 N NA NA NA NA NA NA XRCC6BP1 1653156 416 chr12 67405990 67413648 67413000 N NA NA NA NA NA NA CAND1 249413 417 chr12 67418107 67466502 67462921 N NA NA CAND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 196559 418 chr12 68023439 68025549 68024355 N NA NA NA NA NA NA CAND1 360378 419 chr12 68350317 68351903 68351141 N NA NA NA NA NA NA MDM1 374258 420 chr12 68405482 68408235 68406703 N NA NA NA NA NA NA MDM1 317926 421 chr12 68757381 68760052 68759005 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 31220 422 chr12 68946603 68948193 68947243 N NA NA NA NA NA NA RAP1B 56426 423 chr12 69488095 69490862 69489415 N NA NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPSF6 142455 424 chr12 69721825 69726919 69724442 N NA YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 26613 425 chr12 70319949 70324044 70321133 N NA NA PTPRB,PTPRR,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 BEST3 226753 426 chr12 74980794 74983199 74981355 N NA ATXN7L3B NA NA NA NA ATXN7L3B 49243 427 chr12 8036103 8039264 8037504 N NA SLC2A3 SLC2A14 IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A3 49628 428 chr12 80823151 80823920 80823405 N NA NA NA NA NA NA PPP1R12A 493916 429 chr12 8111846 8118029 8112706 Y NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC2A3 22954 430 chr12 8121357 8129649 8124536 N NA SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 32465 431 chr12 8177584 8181267 8179320 Y NA NA PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP1 53540 432 chr12 90256397 90258411 90257008 N NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 206553 433 chr12 91225824 91230024 91227258 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 1175980 434 chr12 91247657 91254069 91248964,91252321 N,N NA;NA NA ATP2B1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 1197813 435 chr12 92540518 92545413 92541585 N NA LOC256021 NA NA NA NA LOC256021 4071 436 chr12 92599672 92604091 92602513 N NA NA LOC256021 K562 ChIA-PET 22265404 LOC256021 63225 437 chr12 92755503 92759260 92757700 N NA NA NA NA NA NA LOC256021 219056 438 chr12 92855359 92857261 92856095 N NA NA NA NA NA NA LOC256021 318912 439 chr12 92897550 92905913 92899413 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC256021 361103 440 chr12 92931537 92936394 92934425 Y BTG1 NA NA NA NA NA LOC256021 395090 441 chr12 92986730 92988513 92987829 Y EEA1,BTG1 NA DCN,LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 LOC256021 450283 442 chr12 93337909 93345933 93338070 N NA NA EEA1,UBE2N,LOC643339,NUDT4 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT4 425768 443 chr12 94033537 94035558 94034547 N NA CRADD SOCS2,LOC144481,CRADD IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 35593 444 chr12 94287374 94291703 94288659 N NA NA CRADD,SOCS2,LOC144481,MRPL42 IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 216223 445 chr12 96463259 96466058 96464730 N NA NA ELK3,CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 ELK3 122149 446 chr12 96481618 96526131 96502468,96491047,96503909 Y,N,N NA;NA;NA NA ELK3,PCDH15,FAM194B,CDK17 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 ELK3 62076 447 chr12 97385781 97391806 97388536 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 84780 448 chr12 97396811 97401082 97398888 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 95810 449 chr12 97415905 97422220 97419043 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 114904 450 chr12 97431147 97434790 97432486 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 130146 451 chr12 97440521 97443594 97442540 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 139520 452 chr12 97662917 97663686 97663376 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 361916 453 chr13 105635609 105638528 105637219 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1581986 454 chr13 105791217 105793180 105792413 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1427334 455 chr13 107332035 107341182 107337036,107333207 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ARGLU1 111521 456 chr13 107637123 107641045 107639229 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 416609 457 chr13 110316790 110322617 110322103 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 CARS2 1035863 458 chr13 110346545 110385590 110377900,110357611,110382565,110352696 N,N,N,Y NA;NA;NA;NA NA MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CARS2 972890 459 chr13 110694410 110700091 110695076,110697220 N,N NA;NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 CARS2 658389 460 chr13 112260897 112263935 112262622 N NA NA SPACA7,SOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 693481 461 chr13 112309596 112312047 112310736 N NA NA SOX1,SPACA7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 742180 462 chr13 20158057 20162021 20161216 N NA MPHOSPH8 NA NA NA NA MPHOSPH8 45767 463 chr13 20363868 20370072 20369505 N NA PSPC1 PSPC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSPC1 6709 464 chr13 20466435 20467275 20467019 N NA ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 28659 465 chr13 21647849 21652282 21649779 Y NA NA LATS2,SAP18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SAP18 62371 466 chr13 21791395 21795710 21793028 N NA MRP63,SKA3 NA NA NA NA SKA3 40654 467 chr13 21871078 21923647 21919077,21891697,21872257 N,N,N NA;NA;NA NA ZDHHC20,EFHA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SKA3 120337 468 chr13 22189707 22191973 22191204 N NA EFHA1 EFHA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 EFHA1 11352 469 chr13 22539304 22541587 22540336 N NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA1 360949 470 chr13 24949378 24951212 24950004 N NA NA NA NA NA NA PARP4 135736 471 chr13 28056524 28062616 28057361 N NA MTIF3 ATP5EP2,GSX1,CDX2 IMR90 Hi-C 24141950 MTIF3 31785 472 chr13 28362779 28364576 28363708 N NA NA NA NA NA NA POLR1D 167899 473 chr13 29078894 29081159 29079781 N NA NA POMP,FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 POMP 151982 474 chr13 29209969 29214952 29212857 N NA POMP FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POMP 18189 475 chr13 30961819 30965756 30963436 N NA LINC00426 LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 13783 476 chr13 30967241 30971360 30969720 Y USPL1 LINC00426 LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 19205 477 chr13 30981139 30985822 30983686 N NA LINC00426 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 33103 478 chr13 31109182 31148669 31146818,31122401,31128360 N,N,N NA;NA;NA USPL1 KATNAL1,HMGB1,TEX26,LINC00426,USPL1,TEX26-AS1,ALOX5AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USPL1 43161 479 chr13 31263190 31265851 31264815 N NA NA HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 71360 480 chr13 31412528 31414829 31412846 N NA NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 220698 481 chr13 32056913 32057853 32057552 N NA NA NA NA NA NA HSPH1 320796 482 chr13 33375918 33378802 33376660 N NA NA PDS5B IMR90 Hi-C 24141950 PDS5B 215354 483 chr13 34359097 34363009 34361458 N NA RFC3 NBEA IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 29197 484 chr13 34366079 34370403 34368901 N NA RFC3 NBEA IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 21803 485 chr13 34735639 34737734 34736704 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 343433 486 chr13 38477163 38487385 38479539,38482300 N,N NA;NA NA TRPC4 IMR90 Hi-C 24141950 UFM1 436557 487 chr13 38516452 38612680 38587562,38567840,38577890,38518068 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA UFM1 311262 488 chr13 38649533 38680915 38670352,38649810 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UFM1 243027 489 chr13 38754288 38758341 38755013 N NA NA NA NA NA NA UFM1 165601 490 chr13 40895256 40901104 40899931 N NA NA NA NA NA NA FOXO1 339630 491 chr13 44544476 44546188 44545721 N NA NA NA NA NA NA NUFIP1 1017425 492 chr13 44713873 44719266 44716299 N NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUFIP1 844347 493 chr13 44846321 44850355 44848931 N NA NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUFIP1 713258 494 chr13 46775792 46788912 46786011 N NA LCP1 CPB2,LOC100509894 IMR90 Hi-C 24141950 LCP1 19333 495 chr13 46868781 46872187 46870128 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA KIAA0226L 89448 496 chr13 46976421 46981082 46978937 N NA KIAA0226L KIAA0226L IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0226L 14786 497 chr13 47103066 47105387 47104620 N NA NA LRCH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0226L 141431 498 chr13 48070979 48073792 48072392 N NA NA NA NA NA NA MED4 595448 499 chr13 48408732 48410987 48410073 N NA NA NA NA NA NA MED4 258253 500 chr13 49115846 49117660 49117006 N NA RCBTB2 RCBTB2,CYSLTR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCBTB2 8530 501 chr13 49144462 49148632 49145956,49145797,49148382 Y,Y,Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2;FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2;FNDC3A,RB1,LPAR6,CYSLTR2,RCBTB2 RCBTB2 RB1,LPAR6,RCBTB2,ITM2B IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 37146 502 chr13 51085412 51089638 51086916 N NA NA DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 339258 503 chr13 51166741 51170506 51168810,51168970 Y,N RNASEH2B;NA NA DLEU1,DLEU2,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 420587 504 chr13 51257114 51260735 51259218 N NA NA NA NA NA NA ST13P4 510960 505 chr13 51420515 51422494 51420890 N NA NA NA NA NA NA INTS6 604781 506 chr13 51463596 51470158 51464135,51466723 N,N NA;NA NA DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 INTS6 557117 507 chr13 54602675 54605233 54603850 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 1375844 508 chr13 56545643 56545965 56545829 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 3318812 509 chr13 59930097 59933093 59931041 N NA NA DIAPH3 IMR90 Hi-C 24141950 DIAPH3 805026 510 chr13 59980672 59981075 59980825 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 757044 511 chr13 62779717 62805711 62783862,62804755 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TDRD3 1809126 512 chr13 73742172 73742467 73742357 N NA NA NA NA NA NA KLF5 109030 513 chr13 77967952 77970086 77969441 N NA NA NA NA NA NA MYCBP2 66775 514 chr13 78051706 78053315 78052555 N NA NA NA NA NA NA MYCBP2 150529 515 chr13 80880549 80882666 80881791 N NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 32420 516 chr13 80973118 80974961 80973706 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 58032 517 chr13 84677115 84679942 84678616 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 3762029 518 chr13 84710276 84712651 84711666 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 3795190 519 chr13 86960480 86961093 86960630 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 6045394 520 chr13 87054234 87056022 87054993 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 6139148 521 chr13 88758118 88761070 88759895 N NA NA NA NA NA NA TGDS 6487441 522 chr13 89348333 89372804 89370505,89360114,89357073,89366051 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TGDS 5875707 523 chr13 89530364 89606237 89540701,89572342,89572448,89585225 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TGDS 5642274 524 chr13 93770802 93771657 93771137 N NA NA GPC6 IMR90 Hi-C 24141950 TGDS 1476854 525 chr13 95200255 95203439 95201587 Y NA TGDS NA NA NA NA TGDS 45072 526 chr14 100653275 100662162 100659392,100653403 Y,N NA;NA NA DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EVL 121524 527 chr14 100671488 100682764 100680665 N NA NA DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EVL 139737 528 chr14 101576800 101579828 101578257 N NA NA LINC00523,DIO3OS,MEG8,MIR1247,DIO3 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1H1 851037 529 chr14 101584256 101597181 101587510 N NA NA LINC00523,DIO3OS,MEG8,MIR1247,DIO3,MIR127,MIR433,MIR337,MIR432,MIR665,RTL1,MIR136,MIR493,MIR431,MIR412,MIR541,MIR409,MIR410,MIR369,MIR656 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1H1 833684 530 chr14 102062166 102064302 102063013 N NA NA MEG8,LINC00523 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1H1 366563 531 chr14 104352293 104353878 104352858 N NA C14orf2 PPP1R13B,LOC145216 MCF7 ChIA-PET 22265404 C14orf2 34025 532 chr14 104856888 104862562 104858242,104860782 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SIVA1 356908 533 chr14 105549961 105565248 105559971 N NA NA BTBD6,BRF1,AHNAK2,JAG2,NUDT14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MGC23270 262423 534 chr14 106143994 106149715 106145844,106148412 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 279074 535 chr14 106282247 106329617 106284941,106283410,106328084 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 417327 536 chr14 106610188 106612844 106610919 N NA NA NA NA NA NA TEX22 745268 537 chr14 106852390 106856667 106854300,106855198 N,N NA;NA NA LINC00221 K562 ChIA-PET 22265404 TEX22 987470 538 chr14 106918607 106936275 106929300,106932142,106935273 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 1053687 539 chr14 107033562 107060472 107042308,107047743,107034634 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 1168642 540 chr14 107129770 107131781 107130983 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1264850 541 chr14 107169253 107181761 107170193,107176717 N,N NA;NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 TEX22 1304333 542 chr14 107241624 107269412 107256108 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1376704 543 chr14 107281713 107288131 107285752 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1416793 544 chr14 19547245 19550028 19548416 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1224125 545 chr14 19639616 19643503 19641182 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1130650 546 chr14 19652592 19695672 19652757 N NA NA NA NA NA NA TTC5 1078481 547 chr14 19932177 19935919 19934184 N NA NA NA NA NA NA TTC5 838234 548 chr14 20024017 20026539 20024885 N NA NA NA NA NA NA TTC5 747614 549 chr14 22390806 22395179 22392524 N NA NA NA NA NA NA METTL3 411349 550 chr14 22862944 22867336 22865696 N NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1,RBM23,MRPL52,MMP14,LRP10,REM2,AJUBA IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 190807 551 chr14 22883151 22891117 22884765,22887960,22888057 N,N,N NA;NA;NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 167026 552 chr14 22950865 22966563 22952913 N NA NA SLC7A7,DAD1,MMP14,OXA1L IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 91580 553 chr14 32671322 32673909 32672648 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 124827 554 chr14 35807808 35815052 35811004 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA PSMA6 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMA6 46234 555 chr14 35835342 35840351 35838183 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIA 33609 556 chr14 39018346 39022450 39018727 N NA NA SSTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC23A 549987 557 chr14 49626407 49629221 49627807 N NA NA NA NA NA NA RPS29 423873 558 chr14 50328187 50337108 50329606,50328907,50334979 Y,Y,Y NA;NA;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 8648 559 chr14 51325275 51327982 51327054 N NA NA ATL1,NIN,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 TMX1 378904 560 chr14 52312387 52315070 52313917 N NA GNG2 GNG2,FRMD6,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 GNG2 11952 561 chr14 52640954 52644178 52642765 N NA NA NA NA NA NA C14orf166 184726 562 chr14 52686095 52693036 52688985 N NA NA TXNDC16,C14orf166,GPR137C,ERO1L IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 229867 563 chr14 53683222 53688914 53684487 N NA NA PSMC6 IMR90 Hi-C 24141950 GNPNAT1 424836 564 chr14 58390683 58398598 58395099,58396863 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ACTR10 268235 565 chr14 58408275 58412075 58410266 N NA NA NA NA NA NA ACTR10 254758 566 chr14 58638604 58640654 58639659 N NA ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26179 567 chr14 60429015 60432759 60432383 N NA NA DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 125870 568 chr14 60796933 60800028 60798245 N NA NA C14orf39,SIX6,TMEM30B IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 238304 569 chr14 65360277 65361999 65360862 N NA CHURC1-FNTB SPTB,PLEKHG3,RAB15,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 19080 570 chr14 65671081 65676495 65673020 N NA NA LOC645431,FUT8 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 101854 571 chr14 65695755 65698140 65696737 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 126528 572 chr14 65747185 65749941 65749115 Y FNTB NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645431 129394 573 chr14 65752626 65758393 65754296 N NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC645431 120942 574 chr14 69093817 69104474 69095412,69100274 N,N NA;NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 158486 575 chr14 69126213 69158062 69150987,69135941,69155769 N,N,N NA;NA;NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 104898 576 chr14 71781199 71834979 71834884,71787687 N,N NA;NA NA SIPA1L1,PCNX,LOC145474,SNORD56B IMR90 Hi-C 24141950 MED6 713815 577 chr14 75702484 75706191 75704212 N NA FOS TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 39290 578 chr14 75712698 75716855 75714381 Y NEK9,FOS FOS TMED10,PGF,NEK9,FOS,LOC731223,ZC2HC1C,BATF,JDP2,RPS6KL1,EIF2B2 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 28626 579 chr14 75723118 75727389 75725882 N NA FOS TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOS 18092 580 chr14 75799294 75803288 75801061 Y FOS,JDP2,FLVCR2,BATF NA NEK9,TMED10,JDP2,BATF,FLVCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 53813 581 chr14 75807063 75809433 75807918 Y FOS,FLVCR2,FLVCR2,BATF NA JDP2,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 61582 582 chr14 77421541 77423442 77422681 N NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 71592 583 chr14 77465695 77467649 77467084 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 27385 584 chr14 77504845 77508494 77506272 N NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 9811 585 chr14 78430949 78434434 78432559 N NA NA NA NA NA NA SNW1 203452 586 chr14 78528764 78529367 78528926 N NA NA NA NA NA NA SNW1 301267 587 chr14 86399904 86434488 86401013 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3986601 588 chr14 86576271 86634498 86632962 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3786591 589 chr14 86654194 86706552 86703093 N NA NA LOC283585 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB11 3714537 590 chr14 86784839 86789342 86786695 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3631747 591 chr14 86798780 86801527 86800918 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3619562 592 chr14 86811758 86815588 86813851 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3605501 593 chr14 86822412 86825533 86824062 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3595556 594 chr14 87253208 87255208 87254387 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 3165881 595 chr14 87851857 87853805 87852991 N NA NA NA NA NA NA EFCAB11 2567284 596 chr14 90168818 90169941 90169033 N NA NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB11 251148 597 chr14 90185785 90189204 90187568 Y FOXN3,FOXN3,TDP1 NA EFCAB11,LOC400236,FOXN3,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB11 231885 598 chr14 90847258 90851754 90849651,90850245 N,N NA;NA C14orf102,CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11573 599 chr14 92201176 92204416 92202879 N NA NA NA NA NA NA SMEK1 224532 600 chr14 95834912 95840911 95837619 N NA LINC00341 NA NA NA NA LINC00341 35516 601 chr14 96203519 96230364 96205230 N NA TCL1A TCL1A,TCL1B,LOC100507043 IMR90 Hi-C 24141950 TCL1A 22986 602 chr14 97571136 97575403 97572844 N NA NA NA NA NA NA VRK1 307452 603 chr14 97679754 97688528 97686042 N NA NA NA NA NA NA VRK1 416070 604 chr14 97924532 97927819 97925225 N NA NA VEZT MCF7 ChIA-PET 19890323 VRK1 660848 605 chr14 98635945 98641351 98639003,98638082 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCNK 1306388 606 chr14 98653734 98658313 98656013 Y NA NA NA NA NA NA CCNK 1289426 607 chr14 99439015 99440103 99439527 Y NA NA NA NA NA NA CCNK 507636 608 chr14 99491033 99493999 99493017 Y NA NA NA NA NA NA CCNK 453740 609 chr15 100015608 100018920 100017148 N NA NA MEF2A,LRRC28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 1123525 610 chr15 100046622 100054942 100047805,100052214 N,N NA;NA NA MEF2A,LRRC28,TTC23 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 1087503 611 chr15 101373281 101374809 101374058 N NA NA ALDH1A3,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 230526 612 chr15 20174413 20180515 20178013 N NA NA NA NA NA NA NIPA2 2853912 613 chr15 25016816 25021434 25018320 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA PAR-SN 205707 614 chr15 26326450 26329214 26327524 Y NA NA LOC100128714,ATP10A,LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 642275 615 chr15 26719197 26721323 26720472 N NA NA NA NA NA NA UBE3A 1035022 616 chr15 27865605 27870252 27868651 N NA NA NA NA NA NA HERC2P9 1029336 617 chr15 29878144 29885091 29881083 N NA NA NA NA NA NA HERC2P9 978556 618 chr15 30760351 30795504 30763250 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP11B 123375 619 chr15 31726179 31728936 31728066 N NA NA KLF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAN1 530103 620 chr15 38941470 38947465 38944497 N NA NA RASGRP1,FAM98B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM98B 195142 621 chr15 38971045 38976120 38975316 Y RASGRP1 NA RASGRP1,FAM98B,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM98B 224717 622 chr15 40406475 40409615 40408151 N NA BUB1B SRP14,LOC100131089,BMF,BUB1B,PAK6,PLCB2,ANKRD63 IMR90 Hi-C 24141950 BUB1B 43595 623 chr15 41911839 41917068 41913505 N NA MGA RTF1,RPAP1,TYRO3,MGA,MAPKBP1,SPTBN5,EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 35542 624 chr15 53417237 53422490 53418553,53421007 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM214A 446417 625 chr15 55586624 55586938 55586782 N NA PIGB NA NA NA NA PIGB 24195 626 chr15 56760017 56763178 56760822 N NA MNS1 NA NA NA NA MNS1 2682 627 chr15 60357118 60360134 60358866 N NA NA NA NA NA NA GTF2A2 407381 628 chr15 60419148 60421303 60420141 N NA NA BNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 NARG2 350041 629 chr15 62678619 62684179 62682690,62678869 N,N NA;NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 325955 630 chr15 63728104 63730337 63729207 N NA NA FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,APH1B,RAB8B,LACTB IMR90 Hi-C 24141950 APH1B 158355 631 chr15 65183885 65189547 65186305,65187174 Y,Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21;ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16 NA SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 PIF1 66047 632 chr15 65196857 65198092 65197858 N NA NA SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 PIF1 79019 633 chr15 65586373 65589723 65588398 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 7355 634 chr15 65595147 65598587 65596897 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 16129 635 chr15 66107936 66110182 66109785 N NA NA SLC24A1,DENND4A,PPP1R2,C15orf44 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 RAB11A 51615 636 chr15 66659752 66663676 66662681 N NA TIPIN RPL4,SNORD18C,SNORD18B,SNORD16,SNAPC5,ZWILCH IMR90 Hi-C 24141950 TIPIN 10698 637 chr15 66909284 66911017 66910093 Y SMAD3,MAP2K1 NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 ZWILCH 111853 638 chr15 68235981 68240631 68238911 N NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 105941 639 chr15 68777296 68779060 68778883 N NA NA CORO2B,ITGA11,MIR548H4,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 FEM1B 207155 640 chr15 70599845 70601237 70600251 N NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 854686 641 chr15 70610488 70614429 70612538 N NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPLP1 865329 642 chr15 72927626 72935660 72929311 N NA NA CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 ADPGK 140466 643 chr15 74386197 74394543 74392640 N NA NA NA NA NA NA UBL7 358986 644 chr15 75280552 75282722 75281320 N NA PPCDC LMAN1L,RPP25,SCAMP5 IMR90 Hi-C 24141950 PPCDC 33205 645 chr15 77192587 77198997 77197753 N NA NA ETFA IMR90 Hi-C 24141950 HMG20A 514246 646 chr15 78233169 78237631 78236970 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR61 354309 647 chr15 79121709 79139160 79123159 N NA MORF4L1 NA NA NA NA MORF4L1 26012 648 chr15 79151261 79153900 79152789 Y IREB2 MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11272 649 chr15 80036163 80038111 80037010 N NA NA NA NA NA NA MTHFS 151516 650 chr15 85871112 85875981 85873601 N NA NA AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL25 462208 651 chr15 86491569 86495677 86493531 N NA NA NA NA NA NA KLHL25 153380 652 chr15 86552396 86555434 86553136 N NA NA NA NA NA NA KLHL25 214207 653 chr15 88942379 88948826 88945802 Y NA NA NA NA NA NA MRPL46 61807 654 chr15 89483276 89485990 89483955 N NA MFGE8 NA NA NA NA MFGE8 26613 655 chr15 91382246 91384428 91383040 N NA NA CRTC3,BLM,FURIN,FES IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN2A2 62992 656 chr15 93361823 93366000 93363740 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 60073 657 chr15 93372511 93377287 93375322 Y NA LOC100507217 LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 48786 658 chr15 93778655 93779151 93778885 N NA NA NA NA NA NA CHD2 335104 659 chr15 93795179 93800006 93797475 N NA NA NA NA NA NA CHD2 351628 660 chr15 94405410 94408020 94406195 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 433410 661 chr15 94772318 94819692 94774736,94779646,94807022,94781890 N,N,N,N NA;NA;NA;NA MCTP2 MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 21738 662 chr15 96276714 96278878 96277662 N NA NA NR2F2,LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 1435284 663 chr15 98687625 98696221 98690193,98693959 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LINS 2446224 664 chr15 98700755 98709702 98702664,98707388 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LINS 2432743 665 chr15 99142737 99144940 99143767 N NA NA NA NA NA NA LINS 1997505 666 chr16 10390397 10392213 10391686 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 87699 667 chr16 10957319 10966422 10962563,10959879,10962631 Y,N,Y NUBP1,SOCS1,CIITA;NA;NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 4633 668 chr16 11599091 11602309 11600513 N NA NA CLEC16A,LITAF,SNN,TXNDC11,ZC3H7A,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC11 234339 669 chr16 11698349 11699053 11698643 N NA NA LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNDC11 137595 670 chr16 11714517 11718384 11716394 N NA NA CLEC16A,TXNDC11,PRM2,PRM1,LITAF,SNN,BCAR4,ZC3H7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNDC11 118264 671 chr16 11723308 11725028 11724009 N NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC11 111620 672 chr16 12028260 12040856 12037099 N NA SNX29 SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 SNX29 29746 673 chr16 12713073 12713802 12713727 N NA NA SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 SNX29 642471 674 chr16 13483052 13486323 13484308 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 527691 675 chr16 13518228 13521748 13519893 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 492266 676 chr16 13621759 13625122 13623600 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 388892 677 chr16 14796443 14819664 14797474 N NA NA NA NA NA NA BFAR 69775 678 chr16 14835464 14858602 14836572 N NA NA NA NA NA NA NOMO1 69041 679 chr16 15203179 15204496 15203882 N NA RRN3 NA NA NA NA RRN3 15021 680 chr16 15478275 15485158 15484540 N NA NA NA NA NA NA KIAA0430 251865 681 chr16 16671082 16679512 16671914 N NA NA NA NA NA NA PKD1P1 259616 682 chr16 16711755 16713944 16712249 N NA NA NA NA NA NA PKD1P1 300289 683 chr16 17124726 17126008 17125734 N NA NA NA NA NA NA PKD1P1 713260 684 chr16 21565780 21567367 21566282 Y DNAH3 SLC7A5P2 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A5P2 34015 685 chr16 21855299 21880099 21860660,21879773,21855677 N,N,N NA;NA;NA RRN3P1 NA NA NA NA RRN3P1 24804 686 chr16 21892289 21918933 21918464 N NA UQCRC2 NA NA NA NA UQCRC2 45676 687 chr16 21938754 21943533 21941824,21938873 N,N NA;NA UQCRC2 NA NA NA NA UQCRC2 21076 688 chr16 22206517 22208599 22207115 Y NA NA POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLR3E 100142 689 chr16 23837556 23839886 23838112 Y GGA2 NA PRKCB K562 ChIA-PET 22265404 PLK1 147355 690 chr16 25071485 25073939 25072396 Y SLC5A11 NA LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 ZKSCAN2 194916 691 chr16 25076486 25094641 25078199 N NA NA LCMT1,LOC100506655,TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZKSCAN2 174214 692 chr16 26616219 26618360 26617283 N NA NA HS3ST4 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 661753 693 chr16 26623396 26629033 26625895 Y NA NA HS3ST4 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 651080 694 chr16 28277015 28278200 28277834 N NA SBK1 CCDC101,SBK1 IMR90 Hi-C 24141950 SBK1 25640 695 chr16 28288907 28289829 28289197 N NA SBK1 CCDC101,SBK1,XPO6,IL27,APOBR,NUPR1,SULT1A2,SULT1A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SBK1 14011 696 chr16 28464861 28467358 28466341 N NA EIF3C,CLN3 NA NA NA NA EIF3C 27086 697 chr16 2916442 2919722 2918388 N NA NA PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TCEB2 89145 698 chr16 29655401 29659049 29657183 N NA SPN,QPRT SPN K562 ChIA-PET 22265404 SPN 15251 699 chr16 30642433 30650622 30645815 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF785,ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 11619 700 chr16 30815956 30822992 30816919,30819760 N,N NA;NA RNF40,ZNF629 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 17433 701 chr16 30824723 30829384 30825779 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 26200 702 chr16 32177568 32181318 32180599 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 292489 703 chr16 32197499 32199151 32197570 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 312420 704 chr16 32625498 32628982 32626811 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 740419 705 chr16 32924587 32926932 32926265 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1039508 706 chr16 33939636 33940159 33939990 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2054557 707 chr16 35143902 35146324 35145086 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 3258823 708 chr16 4189936 4191856 4190622 N NA NA CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507501 111934 709 chr16 4328766 4361053 4338973,4344790,4357751 N,N,Y NA;NA;CORO7 LOC100507501,TFAP4,PAM16 TFAP4,CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,LOC100507501,HMOX2,NMRAL1,DNAJA3 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TFAP4 5765 710 chr16 48656298 48659229 48657567 N NA N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 12178 711 chr16 49472520 49478089 49476156 N NA NA NA NA NA NA N4BP1 828400 712 chr16 49891526 49894493 49893269 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 SNX20 820771 713 chr16 51463997 51467621 51465848 N NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX20 748733 714 chr16 51489407 51494136 51491923 N NA NA NA NA NA NA SNX20 774143 715 chr16 51602580 51605160 51603636 N NA NA NA NA NA NA SNX20 887316 716 chr16 51627764 51630545 51629197 N NA NA NA NA NA NA SNX20 912500 717 chr16 54406438 54409393 54407805 N NA NA FTO IMR90 Hi-C 24141950 IRX3 86060 718 chr16 54488650 54493209 54491072 N NA NA FTO IMR90 Hi-C 24141950 IRX3 168272 719 chr16 54507526 54510741 54509095 N NA NA NA NA NA NA IRX3 187148 720 chr16 57333306 57334929 57334179 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSPRY1 113065 721 chr16 58879293 58881032 58879527 N NA NA NA NA NA NA GOT2 111047 722 chr16 59099602 59102496 59101335 N NA NA NA NA NA NA GOT2 331356 723 chr16 65794806 65799728 65797682 N NA NA LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 642699 724 chr16 65800471 65804977 65803305 N NA NA LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505865 637450 725 chr16 65865840 65869102 65867082 N NA NA NA NA NA NA LOC100505865 573325 726 chr16 68503323 68505251 68504338 N NA NA PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 68410 727 chr16 68562597 68568881 68564071 N NA ZFP90 CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 4780 728 chr16 72620218 72645680 72637327,72644611 N,N NA;NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 492603 729 chr16 72667134 72672361 72672023 Y NA NA NA NA NA NA DHX38 539519 730 chr16 72687373 72726097 72698967,72722734 N,N NA;NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 559758 731 chr16 73186715 73190719 73187466 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 1059100 732 chr16 77708981 77718171 77715334 N NA NUDT7 CLEC3A,WWOX,VAT1L IMR90 Hi-C 24141950 NUDT7 38218 733 chr16 79800707 79806766 79804314,79801748 N,N NA;NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 CMC2 1233736 734 chr16 79874615 79880748 79879239 N NA NA NA NA NA NA CMC2 1159754 735 chr16 81465589 81468887 81467060 N NA CMIP NA NA NA NA CMIP 9888 736 chr16 84673901 84675577 84674774 N NA NA KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1C 453225 737 chr16 84676193 84678723 84677546 Y NA NA KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1C 455517 738 chr16 85345210 85349003 85347172 N NA NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 373585 739 chr16 85491161 85530547 85495375,85514501,85510657 N,N,N NA;NA;NA NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548,FAM92B,KIAA0513 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 192041 740 chr16 85581813 85637931 85593768,85631811,85589177 N,N,N NA;NA;NA NA GINS2,KIAA0182,LINC00311,LOC400548,FAM92B,KIAA0513,LOC727710,C16orf74,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 84657 741 chr16 85865523 85867723 85866836 N NA COX4I1 NA NA NA NA COX4I1 32350 742 chr16 85976684 85980841 85979032 Y NA NA COX4I1,IRF8,COX4NB IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1 143511 743 chr16 86015971 86018063 86017358 Y IRF8 NA COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1 182798 744 chr16 86690753 86712038 86691001 N NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 78638 745 chr16 87091964 87105900 87093873,87098488 N,N NA;NA NA FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf95 245126 746 chr16 87810269 87816255 87812233,87814423 N,N NA;NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 10671 747 chr16 87832648 87842069 87840522 N NA KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 33050 748 chr16 89047183 89056043 89049698 N NA NA CBFA2T3,ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC2L 123677 749 chr16 89057331 89061461 89058934 N NA NA CBFA2T3,ACSF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAPPC2L 133825 750 chr16 90147725 90150803 90148793 N NA NA GAS8,DBNDD1,PRDM7,LOC100130015 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CENPBD1 108485 751 chr16 9171297 9174948 9173049 N NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 10589 752 chr16 9243623 9249410 9243780 N NA NA NA NA NA NA C16orf72 58086 753 chr17 12374715 12391900 12389255 N NA NA FLJ34690,MYOCD,ELAC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF18 474026 754 chr17 12392800 12397204 12395388 N NA NA MYOCD,ELAC2,FLJ34690 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF18 492111 755 chr17 12398434 12404587 12401088 N NA NA MYOCD,ELAC2,FLJ34690 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF18 497745 756 chr17 13520346 13520830 13520603 N NA NA COX10 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 451889 757 chr17 14507272 14509688 14508587 N NA NA NA NA NA NA HS3ST3B1 302766 758 chr17 15013302 15015073 15013997 N NA NA NA NA NA NA TRIM16 571120 759 chr17 15800489 15802586 15801332 N NA NA ADORA2B IMR90 Hi-C 24141950 ZNF286A 197598 760 chr17 16891051 16893498 16891721 N NA NA MPRIP,FLCN IMR90 Hi-C 24141950 FLCN 247004 761 chr17 17305532 17310042 17307782 N NA NA PEMT IMR90 Hi-C 24141950 MED9 70258 762 chr17 17316558 17318964 17317302 N NA NA NA NA NA NA MED9 61336 763 chr17 18963937 18969554 18965083,18967587 N,N NA;NA GRAP NA NA NA NA GRAP 13601 764 chr17 19014522 19018042 19014538,19016107 N,N NA;NA GRAPL NA NA NA NA GRAPL 12740 765 chr17 19089977 19092661 19091201 N NA NA NA NA NA NA GRAPL 59195 766 chr17 20431942 20442385 20435532,20434932 N,N NA;NA NA NA NA NA NA USP22 503967 767 chr17 20517671 20519783 20519271 N NA NA NA NA NA NA USP22 426569 768 chr17 20810504 20812980 20811998 N NA NA USP22 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 133372 769 chr17 20997327 21005305 21004671,21002978 N,N NA;NA DHRS7B C17orf51,USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 24936 770 chr17 21176751 21182540 21179204 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 NA MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM11 58843 771 chr17 25362590 25364248 25363488 N NA NA NA NA NA NA WSB1 256858 772 chr17 25669326 25684373 25680970 Y NA WSB1 WSB1,MIR4522,KSR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 48220 773 chr17 25782249 25796167 25783367 N NA NA KSR1,TBC1D3P5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WSB1 161143 774 chr17 2677066 2681224 2679688 N NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 180143 775 chr17 28993471 29003546 28995211 N NA NA NA NA NA NA CRLF3 148232 776 chr17 30409047 30413320 30411316 N NA NA NA NA NA NA LRRC37B 60892 777 chr17 30423098 30427764 30424733 N NA NA RHOT1,SUZ12 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC37B 74943 778 chr17 34126655 34129964 34128715 N NA TAF15 AP2B1,RASL10B,C17orf50,MMP28 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF15 6524 779 chr17 36177668 36181397 36179992 N NA NA HNF1B,SYNRG,DDX52,DUSP14,LOC284100 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D3 102563 780 chr17 36441546 36443452 36442425 N NA LOC440434,MRPL45 NA NA NA NA MRPL45 9537 781 chr17 37173960 37177086 37174839 N NA NA PLXDC1,LOC100131347,FLJ43826,FBXO47,CACNB1,FBXL20,LOC100505576,RPL19,ARL5C IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505576 92539 782 chr17 37773199 37775657 37774310 N NA STARD3,TCAP PPP1R1B K562 ChIA-PET 22265404 STARD3 17676 783 chr17 38737552 38740301 38738767 N NA NA KRT14,CCR7,KRT42P,KRT222,KRT26,KRT27,RARA,WIPF2,CDC6,GJD3,TOP2A,IGFBP4,TNS4,KRT24,KRT25,KRT28,KRT9,EIF1,SMARCE1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMARCE1 63802 784 chr17 39819963 39824870 39822855 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20257 785 chr17 41399166 41402073 41400645 N NA NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100130581 64193 786 chr17 41795219 41803397 41797981 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5,ARL4D,PYY IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 171457 787 chr17 42618179 42621402 42619936 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 13410 788 chr17 42703772 42707652 42705489 N NA NA GPATCH8,C17orf104,ITGA2B,DBF4B,RUNDC3A,FZD2,CCDC43 IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 68960 789 chr17 44314438 44315805 44314928 N NA KANSL1 NA NA NA NA KANSL1 11698 790 chr17 44327905 44331630 44329680 N NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 KANSL1 25165 791 chr17 44333263 44338319 44336504,44337205 N,N NA;NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 KANSL1 30523 792 chr17 44342604 44347875 44344328 Y NA KANSL1,LRRC37A KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC37A 24622 793 chr17 45129343 45141123 45135266 N NA NA NPEPPS IMR90 Hi-C 24141950 CDC27 125542 794 chr17 46717331 46730188 46727518,46724663 N,N NA;NA NA HOXB8,HOXB9,COPZ2,CBX1,SNX11,SKAP1,HOXB6,HOXB-AS3,HOXB7,MIR3185,PRAC,HOXB13,HOXB-AS5,TTLL6,CALCOCO2,CDK5RAP3,ATP5G1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5G1 239960 795 chr17 46754764 46764837 46755881 N NA NA TTLL6,SKAP1,MIR3185,HOXB13,UBE2Z,IGF2BP1,HOXB6,HOXB-AS3,HOXB9,MIR196A1,CALCOCO2,HOXB8,HOXB-AS5,PRAC,ATP5G1,SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5G1 205311 796 chr17 47500539 47501821 47501417 N NA PHB ZNF652,SPOP,FAM117A,KAT7 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 8297 797 chr17 51182998 51183868 51183603 N NA NA NA NA NA NA MBTD1 1845571 798 chr17 53653081 53655510 53654591 N NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 STXBP4 606955 799 chr17 54813184 54816980 54815352 N NA NA C17orf67 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM25 174429 800 chr17 54825480 54830585 54828663 N NA NA NA NA NA NA TRIM25 160824 801 chr17 55798489 55809984 55801608,55804191 N,N NA;NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 117449 802 chr17 55815773 55830662 55826939 N NA NA MSI2,AKAP1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 96771 803 chr17 55857668 55861745 55860121 N NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 65688 804 chr17 58195147 58197933 58197248 N NA HEATR6 NA NA NA NA HEATR6 38855 805 chr17 58203329 58213518 58207060,58212101 N,N NA;NA HEATR6 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 47037 806 chr17 58220024 58222309 58220866 N NA NA HEATR6,PPM1D,USP32,APPBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 HEATR6 63732 807 chr17 62918166 62936158 62919311,62933205 Y,N NA;NA LRRC37A3,AMZ2P1 LRRC37A3,RGS9,GNA13 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC37A3 3263 808 chr17 62979637 62984143 62980873,62982409 N,Y NA;DDX5,CEP95,GNA13 AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 7934 809 chr17 63095515 63106799 63096437 N NA GNA13 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 42595 810 chr17 63110273 63114432 63112123 N NA NA AMZ2P1,RGS9,GNA13 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 57353 811 chr17 63116548 63120843 63119539 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 63628 812 chr17 65253553 65256873 65254162 Y HELZ NA HELZ MCF7 ChIA-PET 22265404 PSMD12 105848 813 chr17 66014814 66018798 66016155 Y NA KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13050 814 chr17 67314874 67325124 67323632 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K6 85714 815 chr17 67564225 67569256 67565773 N NA NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 153387 816 chr17 67601451 67606008 67603485 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 190613 817 chr17 67830803 67834438 67832620 N NA NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2-AS1 331105 818 chr17 6828207 6830248 6829743 N NA NA ALOX12P2,ASGR1,SLC13A5,LOC100506713 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506713 85405 819 chr17 6841452 6845454 6843867 N NA NA LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506713 70199 820 chr17 74106286 74106964 74106940 N NA NA NA NA NA NA TEN1-CDK3 130988 821 chr17 74841350 74844902 74842706 N NA NA MFSD11,SEC14L1,SRSF2,METTL23 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 107857 822 chr17 74986823 74997418 74992964 N NA NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 253330 823 chr17 75953236 75972481 75954628 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351,FLJ45079,TK1,SEPT9,LOC100131096 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131096 135399 824 chr17 76587540 76590360 76588583 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 TIMP2 331112 825 chr17 77825793 77827996 77826714 N NA CBX4 NA NA NA NA CBX4 12580 826 chr17 7892356 7894693 7893615 N NA NA CHD3,EFNB3,DNAH2,KDM6B,CNTROB,KCNAB3,TRAPPC1,GUCY2D,ALOX15B,LOC284023 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTROB 56914 827 chr17 79309402 79320090 79318134 N NA NA ACTG1,SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C17orf89 96291 828 chr18 10014984 10018000 10016181 N NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 101029 829 chr18 10032121 10039284 10032925 N NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 118166 830 chr18 10283810 10286556 10285240 N NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 239317 831 chr18 11565238 11566844 11566286 N NA NA NAPG,PIEZO2 IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 1039365 832 chr18 12066581 12067730 12067067 N NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 CEP76 634973 833 chr18 12211704 12212344 12212011 N NA NA NA NA NA NA CEP76 490359 834 chr18 14904758 14908806 14907284 N NA NA NA NA NA NA LOC644669 417112 835 chr18 14935524 14942852 14937059 N NA NA NA NA NA NA LOC644669 383066 836 chr18 2048955 2051904 2050202 N NA NA NA NA NA NA METTL4 519585 837 chr18 23111912 23114239 23113400 N NA NA ZNF521 IMR90 Hi-C 24141950 SS18 556372 838 chr18 24288863 24292392 24290746 Y TAF4B NA TAF4B IMR90 Hi-C 24141950 SS18 618252 839 chr18 2842146 2842735 2842310 N NA NA EMILIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 169210 840 chr18 28782415 28784375 28783356 N NA NA NA NA NA NA B4GALT6 480311 841 chr18 3014397 3018797 3016783 Y TGIF1,TGIF1,MYL12A,SMCHD1,EMILIN2,LPIN2 LPIN2 LPIN2,MYOM1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LPIN2 2452 842 chr18 30382341 30385831 30383192,30383716 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RNF138 710523 843 chr18 31388169 31390793 31389619 N NA NA NA NA NA NA ZNF397 1430201 844 chr18 32752655 32756932 32754584 N NA NA NA NA NA NA ZNF397 64062 845 chr18 39506405 39509808 39508956 N NA PIK3C3 NA NA NA NA PIK3C3 25391 846 chr18 39511986 39516197 39513928 N NA PIK3C3 PIK3C3 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C3 19002 847 chr18 39516922 39522059 39518013,39521172 N,N NA;NA PIK3C3 PIK3C3 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C3 13140 848 chr18 42087029 42088906 42088048 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 1458399 849 chr18 43747547 43750743 43748122 N NA C18orf25 C18orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C18orf25 3245 850 chr18 51772336 51774666 51773580 Y NA POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 21183 851 chr18 53648566 53649872 53649188 N NA NA TXNL1,TCF4 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 656048 852 chr18 57472929 57473671 57473468 N NA NA CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 93521 853 chr18 57636940 57640416 57640071 N NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 69748 854 chr18 60171804 60174473 60173721 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA1468 317280 855 chr18 60316988 60322605 60319129,60320735 N,N NA;NA NA ZCCHC2,PHLPP1,BCL2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1468 462464 856 chr18 60369162 60371654 60369938 N NA NA PHLPP1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1468 514638 857 chr18 60741080 60742818 60742121,60741688 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BCL2 243795 858 chr18 62379177 62381961 62380701 N NA NA NA NA NA NA VPS4B 1289425 859 chr18 62660086 62662907 62661425 N NA NA NA NA NA NA VPS4B 1570334 860 chr18 62723714 62726642 62725293 N NA NA NA NA NA NA VPS4B 1633962 861 chr18 63404055 63406166 63404941 N NA NA NA NA NA NA VPS4B 2314303 862 chr18 65084472 65086512 65085405 N NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 1295841 863 chr18 65122166 65124753 65123185 N NA NA NA NA NA NA TMX3 1257600 864 chr18 65944914 65945958 65945514 N NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 TMX3 436395 865 chr18 6826176 6828792 6826733 N NA NA LOC100130480 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC165 1888577 866 chr18 70785723 70788566 70787025 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 1027180 867 chr18 71432664 71439287 71434405 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 376459 868 chr18 71442612 71446901 71444810 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 368845 869 chr18 71449396 71453842 71451429 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 361904 870 chr18 71613871 71617171 71615028 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 198575 871 chr18 72063939 72069206 72065772 N NA NA NA NA NA NA CNDP2 94294 872 chr18 72872451 72874280 72873664 N NA TSHZ1 ZNF407,TSHZ1,ZADH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSHZ1 48430 873 chr18 73366039 73371986 73367570,73371165 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TSHZ1 443329 874 chr18 73977128 73978751 73977841 N NA NA NA NA NA NA LOC100131655 555500 875 chr18 74919912 74925894 74921022 N NA NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131655 385661 876 chr18 77614802 77616018 77615187 Y KCNG2 NA KCNG2,CTDP1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4A 132514 877 chr18 8704044 8711448 8710569,8705207 N,N NA;NA CCDC165 CCDC165,NDUFV2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC165 5921 878 chr18 8910298 8914724 8912796 Y NA NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 187904 879 chr18 9016290 9017796 9017301 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 84832 880 chr18 9432639 9437467 9434052 N NA NA ANKRD12,TWSG1,CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 295888 881 chr19 12604690 12608518 12606241 N NA ZNF709 ZNF709,ZNF823,ZNF491,ZNF441,ZNF439,ZNF433,ZNF878,ZNF788,ZNF844,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF44,ZNF563,ZNF442,ZNF443,ZNF564,ZNF440 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF709 9058 882 chr19 13292214 13294937 13292727 N NA STX10,IER2 CACNA1A,IER2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER2 30932 883 chr19 13841032 13844279 13842541 N NA CCDC130,MRI1,C19orf53 CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 14474 884 chr19 14354926 14367278 14359556 N NA NA LOC100507373 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507373 106962 885 chr19 14404571 14407193 14406173 N NA NA NA NA NA NA CD97 84763 886 chr19 14463941 14465335 14464829 N NA CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 26621 887 chr19 14482844 14488251 14486752 N NA CD97,DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 3705 888 chr19 16112148 16113381 16112889 N NA NA NA NA NA NA RAB8A 109109 889 chr19 1667364 1669734 1668967 N NA NA TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90 Hi-C 24141950 UQCR11 61881 890 chr19 1700827 1703328 1701646 N NA NA TCF3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3,ONECUT3,RPS15,DAZAP1,ADAMTSL5,PLK5,MEX3D,MBD3,UQCR11 IMR90 Hi-C 24141950 UQCR11 95344 891 chr19 18200625 18204393 18202502 N NA MAST3 MAST3 K562 ChIA-PET 22265404 MAST3 4210 892 chr19 1896747 1898311 1897349 N NA REXO1,SCAMP4 KLF16,SCAMP4,MKNK2 K562 ChIA-PET 22265404 SCAMP4 7062 893 chr19 20160904 20166772 20163033 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF90 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF90 22031 894 chr19 20340831 20350050 20349026 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 62808 895 chr19 20959667 20994781 20960293,20977878 N,N NA;NA NA ZNF486 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF85 111278 896 chr19 21450847 21452094 21451924 N NA NA NA NA NA NA ZNF708 60118 897 chr19 21745432 21753735 21752119 N NA NA ZNF714 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF429 56995 898 chr19 21786651 21788688 21787718 N NA NA NA NA NA NA ZNF429 98214 899 chr19 22062963 22072476 22063205,22070999 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF100 112533 900 chr19 23257249 23316061 23258218,23302825,23310349,23300034 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF724P 117111 901 chr19 2459686 2464655 2462226 N NA TIMM13,LMNB2,GADD45B LMNB2,GADD45B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 LMNB2 2728 902 chr19 28775885 28786101 28784282 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 491037 903 chr19 28787764 28790249 28788654 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 502916 904 chr19 30214038 30219902 30215382 Y NA NA NA NA NA NA POP4 116868 905 chr19 34624074 34627715 34625400 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35637 906 chr19 42025617 42029137 42028344 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 53394 907 chr19 42034291 42049930 42037998 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 32601 908 chr19 42050765 42068389 42052675,42061727,42055803,42059121 Y,N,N,N HNRNPUL1,CCDC97,B9D2,CEACAM21,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1;NA;NA;NA CEACAM21 C19orf69,ATP5SL,LOC100505495,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 14142 909 chr19 44204917 44206375 44205284 N NA NA SMG9,LYPD5,PLAUR,IRGC,KCNN4 IMR90 Hi-C 24141950 SMG9 52767 910 chr19 44710242 44713771 44711581 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 2920 911 chr19 48101788 48105898 48103740 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 83273 912 chr19 54898305 54902415 54900646 N NA LAIR1 NA NA NA NA LAIR1 21584 913 chr19 56636684 56640117 56638884 N NA NA ZNF787 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPN1 450123 914 chr19 57476274 57476717 57476439 N NA NA NA NA NA NA ZNF264 226151 915 chr19 7400608 7404964 7400862,7402443,7400881 N,N,N NA;NA;NA NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 55035 916 chr19 7411403 7413424 7412257 N NA ARHGEF18 ZNF557,INSR IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 46575 917 chr19 7886760 7888339 7887541 N NA NA NA NA NA NA TIMM44 120369 918 chr19 8249634 8263495 8251877,8256876,8260064,8262001 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA FBN3,TIMM44,CERS4,ELAVL1,CCL25 IMR90 Hi-C 24141950 CD320 109745 919 chr19 8410933 8412686 8411785 N NA CD320,KANK3 NA NA NA NA KANK3 2787 920 chr19 9891079 9898438 9896879 N NA ZNF846,FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA ZNF846 11669 921 chr2 105274111 105276015 105275103 Y NA NA LOC100506421 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS9 378468 922 chr2 105503980 105507156 105505845 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 147327 923 chr2 105591410 105594780 105593331 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 59703 924 chr2 108530692 108531928 108531486 N NA NA NA NA NA NA GCC2 533649 925 chr2 109647222 109655220 109648083 N NA NA MALL,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 244003 926 chr2 110494524 110498031 110494990 N NA NA NA NA NA NA BUB1 937653 927 chr2 114307200 114310369 114309618 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L1 50539 928 chr2 114449796 114451912 114450915 N NA NA NA NA NA NA SLC35F5 62488 929 chr2 11513903 11515522 11514842 Y NA NA ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 90775 930 chr2 11820564 11870508 11821936 N NA NA GREB1,NTSR2,LPIN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GREB1 146322 931 chr2 118939974 118945821 118943580 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 93924 932 chr2 120989101 120991146 120990047 N NA NA RALB,EPB41L5 IMR90 Hi-C 24141950 PTPN4 471894 933 chr2 121333029 121338094 121336761,121334530 N,N NA;NA NA LOC84931 IMR90 Hi-C 24141950 PTPN4 815822 934 chr2 121353405 121355785 121354656 N NA NA LOC84931,EPB41L5,RALB,INHBB IMR90 Hi-C 24141950 PTPN4 836198 935 chr2 122560290 122562209 122561671 N NA TSN TSN IMR90 Hi-C 24141950 TSN 47169 936 chr2 124642838 124679861 124672700,124669810 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TSN 2129717 937 chr2 128127028 128149581 128145580 N NA NA IWS1,ERCC3,MAP3K2,MIR4783,PROC,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 IWS1 134506 938 chr2 130631793 130636785 130635294 N NA NA NA NA NA NA MZT2B 302716 939 chr2 130700166 130702957 130701267 N NA NA NA NA NA NA MZT2B 236544 940 chr2 130968899 130971560 130971418 N NA MZT2B NA NA NA NA MZT2B 29398 941 chr2 131554059 131556488 131555469 N NA NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IMP4 453570 942 chr2 131576925 131578633 131577662 N NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 IMP4 476436 943 chr2 131591777 131671750 131656224,131595158,131622714,131608945 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 IMP4 491288 944 chr2 132080722 132091697 132087917,132084423 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC401010 110770 945 chr2 132142531 132143549 132143293 N NA NA NA NA NA NA LOC401010 58918 946 chr2 132428395 132431145 132430104 N NA NA NA NA NA NA LOC150776 178009 947 chr2 133022079 133029864 133025434 Y NA ANKRD30BL GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD30BL 6537 948 chr2 133057589 133060091 133058576 N NA ANKRD30BL NA NA NA NA ANKRD30BL 42047 949 chr2 136802636 136806825 136804357 N NA NA BDNF-AS1 MCF7 ChIA-PET 19890323 DARS 59414 950 chr2 136887668 136896319 136889682,136894217 Y,Y UBXN4,CXCR4,CXCR4;UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 11943 951 chr2 136920454 136952805 136933420,136923962,136921356 N,N,N NA;NA;NA CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 44729 952 chr2 136961903 136976011 136963853,136969538 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA CXCR4 86178 953 chr2 136989533 136999754 136990534,136996607 N,Y NA;UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 113808 954 chr2 137132460 137136406 137134906 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 256735 955 chr2 137138293 137141692 137139931 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 262568 956 chr2 139216728 139219016 139218220 N NA NA LOC399715 MCF7 ChIA-PET 19890323 CXCR4 2341003 957 chr2 142942413 142946215 142943582 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 940684 958 chr2 145304126 145309245 145305610 N NA ZEB2 NA NA NA NA ZEB2 26168 959 chr2 146168069 146171669 146169309 N NA NA NA NA NA NA ZEB2 890111 960 chr2 149310345 149312083 149310768 N NA NA KIF5C,ORC4 IMR90 Hi-C 24141950 EPC2 90477 961 chr2 152170760 152170963 152170806 N NA NMI RIF1,NMI IMR90 Hi-C 24141950 NMI 24330 962 chr2 15280661 15283337 15282367 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 418117 963 chr2 156119913 156120695 156120530 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP6 2545506 964 chr2 156339437 156340619 156340105 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP6 2765030 965 chr2 157257081 157257850 157257492 N NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDSUB1 2885386 966 chr2 158324872 158326553 158325820 N NA NA NA NA NA NA WDSUB1 1816683 967 chr2 158753481 158755253 158754306 N NA NA ACVR1,PKP4 IMR90 Hi-C 24141950 WDSUB1 1387983 968 chr2 160932980 160934737 160933605 N NA NA ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 MARCH7 363970 969 chr2 168148098 168149849 168149167 N NA NA NA NA NA NA CERS6 1162910 970 chr2 171608165 171610076 171608875 N NA NA NA NA NA NA DCAF17 680685 971 chr2 174736901 174741006 174739471 N NA NA OLA1,LOC285084,CIR1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 89424 972 chr2 177336047 177339041 177337512 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,MIR10B,HOXD4,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD3,MTX2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1715 469029 973 chr2 177418095 177420975 177418915 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1715 551077 974 chr2 178029071 178030770 178029559 N NA HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 46652 975 chr2 179922323 179924989 179923534 N NA NA NA NA NA NA FKBP7 578968 976 chr2 182257195 182262455 182259146 N NA NA NA NA NA NA ITGA4 59164 977 chr2 182272959 182278757 182275941 N NA ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 42862 978 chr2 183751802 183753522 183752679 N NA NA NA NA NA NA DNAJC10 170803 979 chr2 184471847 184472951 184472291 N NA NA NA NA NA NA NUP35 482764 980 chr2 186807138 186824957 186824227 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 525928 981 chr2 186956943 186970843 186970577 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 380042 982 chr2 186995481 187000338 187000155 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 350547 983 chr2 187011508 187056508 187018040,187056109 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZC3H15 294377 984 chr2 188463616 188464478 188464065 N NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H15 1112731 985 chr2 194116339 194119720 194117983 N NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1573541 986 chr2 194139362 194145752 194142234,194144409 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1596564 987 chr2 194211134 194213383 194212495 N NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1668336 988 chr2 194768463 194772490 194769330,194772432 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC39A10 1749042 989 chr2 196275630 196283921 196278431 Y NA NA SLC39A10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 237611 990 chr2 196334311 196337478 196336083 N NA NA SLC39A10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC39A10 184054 991 chr2 196349925 196353437 196351918 Y NA NA DNAH7,SLC39A10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 168095 992 chr2 196395455 196408687 196398203 N NA NA SLC39A10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC39A10 112845 993 chr2 196424573 196429240 196425439 Y NA NA SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 92292 994 chr2 204479439 204480816 204480140 N NA NA RAPH1,CYP20A1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 ALS2CR8 702461 995 chr2 214089973 214096045 214092237,214094866 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IKZF2 73640 996 chr2 214097662 214105393 214100732 N NA NA ABCA12,IKZF2,BARD1,SPAG16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKZF2 81329 997 chr2 21477518 21479876 21479107 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 454691 998 chr2 21723641 21725552 21724778 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 700814 999 chr2 217469667 217473483 217471613 N NA NA DIRC3,MARCH4,RPL37A,IGFBP2,TNS1,PKI55 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 106147 1000 chr2 217483146 217488243 217483859 N NA NA DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL37A 119626 1001 chr2 218876718 218887712 218885628,218882623 N,N NA;NA NA TNS1 IMR90 Hi-C 24141950 AAMP 247181 1002 chr2 22442530 22446191 22444058 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 1419703 1003 chr2 224490466 224494874 224491200 N NA NA KCNE4,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL44 327247 1004 chr2 22504635 22507431 22506025 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 1481808 1005 chr2 226894672 226897327 226895721 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD1 803344 1006 chr2 228624903 228625660 228625345 N NA NA MFF IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 288015 1007 chr2 229585012 229589204 229586727 N NA NA NA NA NA NA AGFG1 1248124 1008 chr2 231465708 231468629 231467459 Y GPR55,SP110,SP110,SP140,SP140L,SP100,SP100 NA SP140,SP110,CAB39,SP100,SP140L IMR90 Hi-C 24141950 SP100 184837 1009 chr2 231523575 231525011 231524288 Y GPR55,SP110,SP140,SP140L,CAB39 NA CAB39 K562 ChIA-PET 22265404 SP100 242704 1010 chr2 232332202 232342815 232334770,232337495 N,N NA;NA NCL,LINC00471 ARMC9,NCL,SNORA75,SNORD20,LINC00471,NMUR1,C2orf57 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NCL 2997 1011 chr2 232415674 232436026 232419458,232422746 N,N NA;NA LINC00471 C2orf57,PDE6D,ARMC9,SNORD20,NCL,SNORA75,LINC00471,NMUR1,PTMA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00471 36624 1012 chr2 232501247 232501697 232501397 N NA NA PTMA,PDE6D,COPS7B IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 71538 1013 chr2 232504750 232511558 232507784,232509864 N,N NA;NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61677 1014 chr2 232524922 232555800 232525805,232536643,232546209,232549279,232527261,232552105 N,Y,N,Y,Y,Y NA;DIS3L2,PTMA;NA;NA;DIS3L2;NPPC PTMA COPS7B,PTMA,PDE6D IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 17435 1015 chr2 235354461 235356126 235355190 Y ARL4C NA SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 HJURP 591249 1016 chr2 237452828 237457245 237454745 N NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 536839 1017 chr2 238510401 238514043 238512481 Y LRRFIP1 NA LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 516317 1018 chr2 238863755 238868105 238865732 N NA NA ILKAP,UBE2F-SCLY,RAMP1,RBM44,LRRFIP1,PER2,HES6,LOC643387,LOC151174,KLHL30,ESPNL IMR90 Hi-C 24141950 LOC643387 272222 1019 chr2 239543723 239547597 239545053 N NA NA LOC151171,TRAF3IP1,HDAC4,MIR4440 IMR90 Hi-C 24141950 LOC643387 403396 1020 chr2 239674288 239696907 239685104 N NA NA TRAF3IP1,LOC151171,NDUFA10,ASB1,TWIST2,FLJ43879,HDAC4,MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 LOC643387 533961 1021 chr2 240672879 240675367 240673569 N NA NA NA NA NA NA MYEOV2 400397 1022 chr2 24711436 24754874 24713912 N NA NA CENPO,NCOA1,ADCY3,EFR3B,PTRHD1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 128039 1023 chr2 27645186 27646259 27645435 N NA ZNF513,KRTCAP3 PPM1G,NRBP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 KRTCAP3 18974 1024 chr2 30559156 30561271 30560137 Y YPEL5 NA LCLAT1,LBH IMR90 Hi-C 24141950 LBH 104759 1025 chr2 30642125 30647083 30644944 N NA NA LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 187728 1026 chr2 31044955 31047492 31046682 N NA NA SRD5A2,CAPN13,GALNT14 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 590558 1027 chr2 33863141 33863952 33863302 N NA FAM98A NA NA NA NA FAM98A 38779 1028 chr2 34019504 34020962 34019892 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 195142 1029 chr2 34083313 34086644 34085238 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 258951 1030 chr2 34357127 34359544 34357277,34359436 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM98A 532765 1031 chr2 36286612 36288681 36287001 N NA NA NA NA NA NA CRIM1 294689 1032 chr2 37760864 37764118 37763251 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA C2orf56 302090 1033 chr2 37960811 37964032 37962262 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf56 502037 1034 chr2 3826948 3829079 3828192 N NA NA NA NA NA NA RPS7 204095 1035 chr2 387065 396264 394159 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 122196 1036 chr2 400583 401546 401445 N NA NA NA NA NA NA ACP1 135714 1037 chr2 40076945 40081866 40079117 N NA NA SLC8A1,LOC100128590,THUMPD2 IMR90 Hi-C 24141950 THUMPD2 70529 1038 chr2 40096962 40100224 40098633 N NA NA NA NA NA NA THUMPD2 90546 1039 chr2 4151005 4153756 4152670 N NA NA NA NA NA NA RPS7 528152 1040 chr2 4169372 4184320 4182946 N NA NA NA NA NA NA RPS7 546519 1041 chr2 4249271 4249944 4249609 N NA NA NA NA NA NA RPS7 626418 1042 chr2 42766663 42771032 42767349 N NA NA MTA3,OXER1,HAAO IMR90 Hi-C 24141950 COX7A2L 178307 1043 chr2 429796 431092 430514 N NA NA NA NA NA NA ACP1 164927 1044 chr2 43034020 43038875 43038069 N NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 414870 1045 chr2 43173932 43216017 43178466,43188130,43191998 N,N,N NA;NA;NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 237728 1046 chr2 4330086 4355883 4331867,4340522,4347150 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RPS7 707233 1047 chr2 445549 449413 446913 N NA NA NA NA NA NA ACP1 180680 1048 chr2 45360406 45364447 45362050 N NA NA SIX2,SRBD1,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 473986 1049 chr2 45367492 45378502 45372102 N NA NA SRBD1,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 459931 1050 chr2 48337846 48341737 48338902 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1R21 326171 1051 chr2 48371823 48373810 48373347 Y FOXN2 NA FOXN2,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R21 294098 1052 chr2 49456642 49457408 49456888 N NA NA NA NA NA NA PPP1R21 788734 1053 chr2 55325987 55329142 55327457 N NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 48253 1054 chr2 55338055 55340889 55339586 N NA NA C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 60321 1055 chr2 56234338 56238770 56236441 N NA NA PNPT1,EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PNPT1 313327 1056 chr2 57822499 57829059 57826599 N NA NA NA NA NA NA VRK2 444718 1057 chr2 57841865 57851515 57844658 N NA NA NA NA NA NA VRK2 422262 1058 chr2 57979876 57998738 57985246 N NA NA FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 VRK2 275039 1059 chr2 58197714 58202494 58200928 N NA NA VRK2 IMR90 Hi-C 24141950 VRK2 71283 1060 chr2 5865009 5866814 5866334 N NA NA SOX11 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7 2242156 1061 chr2 58653403 58659852 58655250 N NA NA FANCL IMR90 Hi-C 24141950 FANCL 184888 1062 chr2 59820796 59823461 59822078 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 957172 1063 chr2 60112372 60116825 60114112 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 663808 1064 chr2 60129569 60133340 60133184 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 647293 1065 chr2 60317183 60333309 60329692,60326211,60323462 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA BCL11A 447324 1066 chr2 60343065 60357818 60343691 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 422815 1067 chr2 60577048 60581811 60579257 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 198822 1068 chr2 60624291 60629531 60627650 N NA NA BCL11A IMR90 Hi-C 24141950 BCL11A 151102 1069 chr2 60939240 60939794 60939709 N NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 43571 1070 chr2 61897694 61898758 61898178 N NA NA XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 132276 1071 chr2 61985701 61995512 61991489 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 85766 1072 chr2 62404087 62411278 62408807 N NA B3GNT2 COMMD1,B3GNT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 B3GNT2 11984 1073 chr2 62637339 62642610 62638360 N NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 214077 1074 chr2 64455158 64456711 64455772 N NA NA PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 208944 1075 chr2 64630509 64632505 64631326 N NA NA PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 248541 1076 chr2 64891130 64893461 64892936 N NA SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 10084 1077 chr2 64957067 64959531 64958096 N NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 76021 1078 chr2 64975909 64981470 64978350 Y CEP68 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 94863 1079 chr2 64993725 64996738 64995511 Y SERTAD2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 112679 1080 chr2 65066698 65068995 65067224 Y SLC1A4,RAB1A NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 146584 1081 chr2 65079133 65081120 65080140 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 134459 1082 chr2 65091171 65093716 65092481 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 121863 1083 chr2 65171834 65175258 65173482 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 40321 1084 chr2 65662196 65670272 65663366 N NA NA SPRED2,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR2 207367 1085 chr2 68646510 68649525 68647580 N NA FBXO48,APLF NA NA NA NA FBXO48 44865 1086 chr2 68941171 68943123 68942307 N NA ARHGAP25 GKN2,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 18790 1087 chr2 69134122 69137386 69135706 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 172209 1088 chr2 6920466 6921953 6921534 N NA NA NA NA NA NA ID2 1900160 1089 chr2 75830849 75834509 75832420 N NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 39400 1090 chr2 76528785 76538864 76534499,76537751 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MRPL19 654876 1091 chr2 76540320 76573194 76546875 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 666411 1092 chr2 76617002 76668819 76635117,76647924,76618765,76622857 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MRPL19 743093 1093 chr2 76671669 76730147 76672573 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 797760 1094 chr2 8037793 8040406 8039523 N NA NA ID2,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 781707 1095 chr2 83412539 83414994 83413444 N NA NA NA NA NA NA TMSB10 1717769 1096 chr2 85115391 85118572 85117970,85116119 N,Y NA;C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10,DNAH6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB10 14191 1097 chr2 85120993 85123429 85122043 N NA TMSB10 DNAH6,TMSB10 IMR90 Hi-C 24141950 TMSB10 9334 1098 chr2 8518805 8522293 8520667 N NA NA LINC00299,LOC100506274,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 299820 1099 chr2 85643481 85649215 85645661,85647854 N,N NA;NA NA ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 ELMOD3 61638 1100 chr2 8617056 8619354 8617966 N NA NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 202759 1101 chr2 8654619 8656377 8655612 N NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 165736 1102 chr2 8684204 8686767 8685346 N NA NA LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 135346 1103 chr2 89451367 89453821 89452616 N NA NA NA NA NA NA KRCC1 1096119 1104 chr2 898824 919046 905772 N NA NA SNTG2,MYT1L,TPO,LOC339822 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 221385 1105 chr2 91873606 91876433 91875287 N NA NA NA NA NA NA KRCC1 3518358 1106 chr2 92204196 92205515 92204805 N NA NA NA NA NA NA MRPS5 3582239 1107 chr2 941046 943368 942046 N NA NA NA NA NA NA TMEM18 263607 1108 chr2 96540906 96612821 96611833 N NA NA NA NA NA NA LOC729234 63478 1109 chr2 96641745 96659897 96657701 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 16402 1110 chr2 96977272 96984776 96983673 N NA TMEM127,CIAO1,SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH SNRNP200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNRNP200 5965 1111 chr2 97191409 97195266 97193203 N NA NA ITPRIPL1,LOC285033,NCAPH,SNRNP200,NEURL3,KANSL3,CNNM4,FER1L5 IMR90 Hi-C 24141950 NCAPH 189925 1112 chr2 97713355 97718159 97714343 N NA FAHD2B NA NA NA NA FAHD2B 42423 1113 chr2 97995625 98000762 97999131,97997622 N,N NA;NA LOC100506123 NA NA NA NA LOC100506123 47396 1114 chr2 98038785 98044242 98039744 N NA LOC100506123 NA NA NA NA LOC100506123 46807 1115 chr2 98625940 98629955 98627314 N NA TMEM131 TMEM131,VWA3B,ZAP70 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM131 13586 1116 chr2 98641564 98644373 98643274 N NA TMEM131 TMEM131,VWA3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM131 29210 1117 chr2 99373684 99377506 99374730 Y INPP4A,UNC50,MGAT4A NA NA NA NA NA UNC50 148642 1118 chr2 99387326 99389105 99388581 N NA NA MGAT4A MCF7 ChIA-PET 22265404 UNC50 162284 1119 chr20 11430769 11435507 11432844 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf94 1014818 1120 chr20 11437540 11442759 11439746 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf94 1021589 1121 chr20 16138484 16140818 16139538 N NA NA NA NA NA NA SNRPB2 569791 1122 chr20 1781888 1785517 1784445 N NA NA SIRPA,LOC100289473,PDYN,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507495 475901 1123 chr20 18099112 18100723 18099641 N NA CSRP2BP NA NA NA NA CSRP2BP 22145 1124 chr20 20723768 20725933 20724310 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 30502 1125 chr20 2155432 2163329 2159959 N NA NA PDYN,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SNRPB 288170 1126 chr20 21602722 21605054 21603775 N NA NA NA NA NA NA XRN2 318780 1127 chr20 21612180 21615200 21613450 N NA NA NA NA NA NA XRN2 328238 1128 chr20 22695212 22698494 22697556 N NA NA THBD,NXT1,SSTR4 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 632879 1129 chr20 24007114 24009886 24008051 Y NA NA NA NA NA NA NAPB 604958 1130 chr20 24269477 24271529 24270235 N NA NA FLJ33581 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 767289 1131 chr20 24719174 24721420 24719937 N NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 317398 1132 chr20 24734721 24738195 24736164 N NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 300623 1133 chr20 29523434 29525139 29524367 N NA NA NA NA NA NA FRG1B 86740 1134 chr20 31259430 31262471 31261039 N NA NA C20orf112,COMMD7,DNMT3B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POFUT1 463734 1135 chr20 32801223 32805027 32804107 N NA NA AHCY,ITCH,NCOA6,ASIP,DYNLRB1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 101138 1136 chr20 34650319 34653936 34652711 Y NA NA LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C20orf4 170511 1137 chr20 35597534 35599008 35598133 N NA NA NA NA NA NA KIAA0889 109258 1138 chr20 36096026 36099236 36098039 N NA NA SRC,RPRD1B,VSTM2L,GHRH,BPI,MANBAL,NNAT,BLCAP,CTNNBL1,RPN2 IMR90 Hi-C 24141950 MANBAL 177975 1139 chr20 39559018 39561877 39560196 N NA NA NA NA NA NA DHX35 1968037 1140 chr20 39619556 39622302 39620292 Y MAFB,TOP1 NA TOP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHX35 2028575 1141 chr20 39942473 39948297 39946442 N NA NA PLCG1,ZHX3,EMILIN3,LPIN3,IQGAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 SRSF6 2138207 1142 chr20 4004465 4005601 4005183 N NA NA CDC25B,PANK2,MIR103B2,RNF24,SMOX,HSPA12B,CENPB,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PANK2 134979 1143 chr20 4018018 4020522 4018872 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 NA RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 PANK2 148532 1144 chr20 40320048 40324404 40321987,40323408 N,N NA;NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SRSF6 1762100 1145 chr20 4065689 4067062 4066320 N NA NA RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228,CDC25B,C20orf29,SMOX,ADRA1D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PANK2 196203 1146 chr20 46042963 46050318 46044206 N NA NA ZMYND8,NCOA3,SULF2,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 57489 1147 chr20 46096731 46097881 46097484 Y NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2,LOC100131496 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 32720 1148 chr20 46902949 46910352 46904994,46908170 N,N NA;NA NA SULF2,LINC00494 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSE1L 752431 1149 chr20 47058253 47065283 47060356 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 CSE1L 597500 1150 chr20 48188522 48190879 48189624 N NA NA KCNB1,PTGIS,SLC9A8,B4GALT5,ZNFX1-AS1,ZNFX1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNFX1-AS1 293807 1151 chr20 48205582 48208736 48206910 N NA NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNFX1-AS1 310867 1152 chr20 48656305 48659043 48657868 N NA NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,SNAI1,RNF114,SLC9A8 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 56792 1153 chr20 48798772 48801015 48800422 N NA NA TMEM189-UBE2V1,PTPN1,RNF114,SNAI1,UBE2V1,LOC284751,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1 66278 1154 chr20 49098069 49101863 49100219 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 25028 1155 chr20 49648883 49656313 49651005 N NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOCS3 73520 1156 chr20 52223719 52227777 52226516 N NA ZNF217 SUMO1P1,ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 24083 1157 chr20 52237301 52241778 52240079,52238377 Y,Y ZNF217;ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 37665 1158 chr20 52258093 52261358 52259786 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 58457 1159 chr20 52293166 52298001 52294734,52296628 Y,N NA;NA NA BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 93530 1160 chr20 52352275 52359080 52353495,52356153 N,N NA;NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 152639 1161 chr20 52366782 52370011 52368094 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 167146 1162 chr20 52445065 52447722 52446381 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 245429 1163 chr20 52455544 52457335 52456210 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 255908 1164 chr20 52530064 52534897 52531676 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289605 1165 chr20 5625371 5628033 5626674 N NA NA GPCPD1,C20orf196,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 103010 1166 chr20 5638843 5641840 5640132 N NA NA C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 89203 1167 chr20 61193268 61205293 61202192 N NA NA C20orf166,RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100652730 202915 1168 chr20 61416733 61418730 61417286 N NA LOC100652730,C20orf20 SLCO4A1,LOC100127888,NTSR1,LOC100652730 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100652730 8525 1169 chr20 61779188 61789569 61782294 N NA NA HAR1B,HAR1A,LOC63930,FLJ16779,DIDO1,C20orf11,BHLHE23,MIR124-3,NKAIN4,BIRC7,ARFGAP1,COL20A1,KCNQ2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC17A9 195189 1170 chr20 6603252 6606622 6604841 N NA NA NA NA NA NA CRLS1 616513 1171 chr20 7695994 7699296 7697195 N NA NA NA NA NA NA PLCB1 414000 1172 chr21 10492763 10493164 10492961 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 5262345 1173 chr21 15398794 15432740 15402023,15399678 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 322769 1174 chr21 15808647 15809667 15808912 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 53138 1175 chr21 16046178 16050952 16048754 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 290669 1176 chr21 16053199 16067231 16057860,16064447 N,Y NA;HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA HSPA13 297690 1177 chr21 16116745 16137775 16135632,16130261 N,Y NA;NA NA SAMSN1 K562 ChIA-PET 22265404 HSPA13 361236 1178 chr21 16704637 16730158 16725858 N NA NA NRIP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 USP25 372338 1179 chr21 16743300 16760322 16759859,16757184 N,N NA;NA NA LOC388813 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 342174 1180 chr21 16876503 16918680 16883813,16911362 N,N NA;NA NA ABCC13,HSPA13 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 183816 1181 chr21 16959664 17005417 16959825 N NA NA HSPA13 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 97079 1182 chr21 18510437 18513017 18512238 N NA NA NA NA NA NA USP25 1407941 1183 chr21 19813435 19817492 19816268 N NA NA NA NA NA NA USP25 2710939 1184 chr21 19819023 19837867 19822090,19830353,19834777 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA USP25 2716527 1185 chr21 23956499 23959718 23958278 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 3020083 1186 chr21 24156360 24161187 24161024 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 2818614 1187 chr21 24191026 24195937 24193657 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 2783864 1188 chr21 24292209 24310685 24309083 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 2669116 1189 chr21 24330704 24340752 24332207 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 2639049 1190 chr21 24383913 24388112 24386629 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 2591689 1191 chr21 25241348 25262405 25260303 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1717396 1192 chr21 25317899 25343152 25325086,25329995,25341595,25319230 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA MRPL39 1636649 1193 chr21 25416937 25420643 25418905 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1559158 1194 chr21 25423729 25424432 25424246 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 1555369 1195 chr21 26606630 26608415 26607379 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 371386 1196 chr21 27188293 27193552 27190675 N NA NA CYYR1 IMR90 Hi-C 24141950 GABPA 81035 1197 chr21 32937069 32955256 32937376 N NA NA TIAM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOD1 76679 1198 chr21 34303253 34305840 34305021 N NA NA C21orf62,OLIG1,C21orf54,SON,IFNGR2 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 C21orf49 158842 1199 chr21 34586233 34589443 34588323 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR1,TMEM50B,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,IL10RB,CRYZL1 IMR90,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 12788 1200 chr21 36575156 36580981 36577871 N NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385,MIR802 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 153561 1201 chr21 36597983 36605728 36599862 Y NA NA RUNX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 176388 1202 chr21 36610430 36614027 36612525 Y NA NA RUNX1,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 188835 1203 chr21 36770939 36772932 36772871 N NA NA CLIC6,RUNX1,LINC00160,MIR802 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 349344 1204 chr21 36875169 36877375 36877357,36876063 N,N NA;NA NA RUNX1,LINC00160,LOC100506385,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 453574 1205 chr21 36899841 36902694 36901341 N NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 478246 1206 chr21 38932553 38938155 38936251 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 192694 1207 chr21 40147713 40150780 40149483 N NA LINC00114 LINC00114,ETS2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00114 2312 1208 chr21 40233220 40235697 40234320 N NA NA LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00114 87819 1209 chr21 40355769 40359339 40357470 N NA NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 PSMG1 196101 1210 chr21 40375467 40378122 40376985 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 177318 1211 chr21 41340317 41344066 41342127 N NA NA PCP4 IMR90 Hi-C 24141950 WRB 588104 1212 chr21 42439163 42442351 42441132,42440793 N,N NA;NA NA DSCAM,DSCAM-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MX2 291599 1213 chr21 42461246 42465661 42463400 N NA NA DSCAM IMR90 Hi-C 24141950 MX2 268289 1214 chr21 42484494 42486735 42485130 N NA NA NA NA NA NA MX2 247215 1215 chr21 43606944 43609796 43608499 N NA NA ABCG1,TFF3,TFF2,RSPH1 IMR90 Hi-C 24141950 UMODL1 123876 1216 chr21 44780004 44782944 44781834 N NA NA HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA,LINC00313,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 252316 1217 chr21 46741435 46743503 46742837 Y NA NA COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 447617 1218 chr21 46969315 46972163 46970639 N NA NA SLC19A1,LOC100129027,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf56 632210 1219 chr21 47050441 47053691 47052253 N NA NA PCBP3,LOC100129027,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 C21orf56 550682 1220 chr21 47393395 47394638 47393735 N NA NA COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 C21orf56 209735 1221 chr21 48041240 48047918 48042417 Y DIP2A,PRMT2 PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRMT2 7589 1222 chr22 16199880 16203574 16201853 N NA NA NA NA NA NA BCL2L13 1917911 1223 chr22 17697187 17701621 17700092 N NA NA NA NA NA NA BCL2L13 419864 1224 chr22 17848628 17914676 17874182,17849956 N,Y NA;NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L13 206809 1225 chr22 19649303 19652890 19651628 N NA NA CDC45,HIRA,SEPT5,GP1BB,TBX1,UFD1L,TXNRD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC45 181889 1226 chr22 22383863 22386796 22385258 N NA TOP3B VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 46716 1227 chr22 23052567 23055807 23054671 N NA NA ZNF280B,ZNF280A IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 400104 1228 chr22 23268784 23273174 23271192 Y NA NA MIR650 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 616321 1229 chr22 23801904 23803768 23802759 N NA NA NA NA NA NA IGLL1 118727 1230 chr22 27888402 27890409 27888959 N NA NA PITPNB,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 424846 1231 chr22 28006564 28014765 28008341 N NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 300490 1232 chr22 28065596 28068238 28066749 N NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 247017 1233 chr22 29809560 29812605 29811274 N NA AP1B1 THOC5 IMR90 Hi-C 24141950 AP1B1 24988 1234 chr22 31458313 31463708 31460080 N NA SMTN OSBP2,TUG1,MORC2,LIMK2,SMTN,INPP5J IMR90 Hi-C 24141950 SMTN 13574 1235 chr22 35020906 35023082 35021286 N NA NA NA NA NA NA TOM1 672186 1236 chr22 35921266 35925794 35923174 N NA NA RASD2,MCM5,TRIM37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 APOL6 118630 1237 chr22 37247821 37251085 37249246 N NA NCF4 IFT27,CSF2RB,CACNG2,EIF3D,NCF4,LOC100506241,TEX33,KCTD17 IMR90 Hi-C 24141950 NCF4 5945 1238 chr22 41413599 41420897 41417897 N NA NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBX1 66248 1239 chr22 42838519 42844891 42840252 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 NA MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP7A 70938 1240 chr22 46391786 46394721 46393557 Y C22orf26 NA C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381,MIRLET7BHG IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CN5H6.4 297836 1241 chr22 46987518 47013512 46989479,47000406,47010093 Y,N,N TBC1D22A,CERK,GRAMD4;NA;NA NA GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D22A 145006 1242 chr22 47144533 47146453 47145362 Y TRMU,CERK,TBC1D22A TBC1D22A CERK,TBC1D22A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 12065 1243 chr22 48492064 48498557 48494728 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1333546 1244 chr22 49487235 49492396 49488756 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 558794 1245 chr22 49745873 49749295 49746290,49747881 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C22orf34 301895 1246 chr22 49763374 49767157 49765287 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 284033 1247 chr22 50054013 50066176 50058245,50062043 N,N NA;NA C22orf34 C22orf34 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C22orf34 2823 1248 chr3 101616346 101620488 101617803 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 FAM55C 118317 1249 chr3 104227475 104231161 104229347 N NA NA NA NA NA NA FAM55C 2729446 1250 chr3 104627011 104629847 104628226 N NA NA ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 FAM55C 3128982 1251 chr3 105924011 105925526 105924710 N NA NA NA NA NA NA CD47 1884409 1252 chr3 105964828 105989052 105975403 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CD47 1820883 1253 chr3 106100060 106107050 106105114 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CD47 1702885 1254 chr3 106121515 106123839 106122843 N NA NA ALCAM,CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CD47 1686096 1255 chr3 107147504 107152739 107150643 N NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 657196 1256 chr3 108011196 108014029 108012291 N NA NA NA NA NA NA CD47 201261 1257 chr3 110400970 110402134 110401705 N NA NA NA NA NA NA ABHD10 1295694 1258 chr3 111029651 111031407 111030525 N NA NA NA NA NA NA ABHD10 666421 1259 chr3 111392349 111404183 111393446 N NA NA CD96,PHLDB2,ZBED2 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD10 293645 1260 chr3 112019184 112024440 112022576 N NA SLC9A10 CD200,SLC9A10,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A10 6110 1261 chr3 112414125 112416526 112415398 N NA NA CD200R1L,CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 133230 1262 chr3 118435996 118437592 118436619 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 522160 1263 chr3 122381288 122381891 122381889 N NA PARP14 PARP15,DTX3L,PARP9,PARP14 IMR90 Hi-C 24141950 PARP14 17781 1264 chr3 123750492 123753435 123751933 N NA NA KALRN IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 70237 1265 chr3 125975984 125979828 125978389 N NA NA CCDC37,ZXDC,ALDH1L1,KLF15 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100125556 340540 1266 chr3 125982258 126002426 125986105,125994367 N,N NA;NA NA ALDH1L1,KLF15,ZXDC,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100125556 346814 1267 chr3 126004481 126012346 126008429 N NA NA KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100125556 369037 1268 chr3 126024467 126027711 126025936 N NA NA ALDH1L1,KLF15,CCDC37,ZXDC IMR90 Hi-C 24141950 LOC100125556 389023 1269 chr3 126700529 126702454 126701826 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 277411 1270 chr3 126906010 127008063 126935738,126937463,126959900,126943052,126946069,126932412 N,N,N,N,Y,N NA;NA;NA;NA;MCM2;NA NA CHCHD6,NUP210P1,CHST13 IMR90 Hi-C 24141950 TPRA1 301505 1271 chr3 128387809 128404989 128399816,128403246 N,N NA;NA RPN1,RAB7A RAB7A,ACAD9,LOC653712,RPN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPN1 18090 1272 chr3 128416544 128419821 128417529 N NA RPN1,RAB7A RAB7A,LOC653712,RPN1,KIAA1257 IMR90 Hi-C 24141950 RAB7A 25158 1273 chr3 129065169 129066751 129066074 N NA H1FX NA NA NA NA H1FX 30049 1274 chr3 132119977 132122039 132120300 N NA DNAJC13 ACPP IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC13 14514 1275 chr3 13492448 13495017 13493378 Y NA NA IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL32 609367 1276 chr3 136916574 136918226 136916739 N NA NA NA NA NA NA IL20RB 239867 1277 chr3 138536070 138545987 138544910 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 FAIM 208528 1278 chr3 138550281 138555482 138553808 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 FAIM 222739 1279 chr3 138566507 138567986 138566808 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 FAIM 238965 1280 chr3 138633181 138635956 138634672 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAIM 305639 1281 chr3 138969081 138971224 138970474 N NA NA FOXL2,BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS22 91637 1282 chr3 138978059 138981966 138979503 N NA NA FOXL2,BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS22 80895 1283 chr3 139038043 139040069 139039229 N NA MRPS22 FOXL2,BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS22 22792 1284 chr3 141404299 141406741 141405685 N NA NA RASA2,ATP1B3,RNF7,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNF7 50310 1285 chr3 142895542 142898215 142897301 N NA NA CHST2,SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 U2SURP 175170 1286 chr3 144173535 144174778 144173855 N NA NA NA NA NA NA C3orf58 482895 1287 chr3 144802954 144805976 144803993 N NA NA NA NA NA NA C3orf58 1112314 1288 chr3 150536657 150538201 150537206 N NA NA NA NA NA NA SELT 215591 1289 chr3 151232518 151258969 151255604 N NA NA MIR548H2 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 726860 1290 chr3 151279622 151284666 151282271 N NA NA NA NA NA NA MBNL1 701163 1291 chr3 151295067 151305534 151298345,151302405 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MBNL1 680295 1292 chr3 151909648 151912618 151911468 N NA NA MBNL1,LOC401093 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBNL1 73211 1293 chr3 151913698 151925189 151922062,151914596 N,N NA;NA NA MBNL1,LOC401093 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBNL1 60640 1294 chr3 152313148 152315272 152314019 Y NA NA NA NA NA NA LOC401093 325733 1295 chr3 152938577 152941531 152939779 N NA NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC401093 951162 1296 chr3 152953024 152953906 152953517 N NA NA NA NA NA NA LOC401093 965609 1297 chr3 154401380 154403313 154402051 N NA NA NA NA NA NA DHX36 359094 1298 chr3 155084408 155087146 155085661 N NA NA PLCH1 IMR90 Hi-C 24141950 MME 286972 1299 chr3 155705519 155707641 155705836 N NA NA NA NA NA NA GMPS 117194 1300 chr3 156890845 156909350 156892850 N NA NA CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSR3 617872 1301 chr3 156916349 156927491 156916619 N NA NA PTX3,VEPH1,C3orf55,CCNL1,RARRES1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSR3 643376 1302 chr3 156932769 156944257 156933234 N NA NA VEPH1,PTX3 IMR90 Hi-C 24141950 SSR3 659796 1303 chr3 158754427 158758120 158756378 N NA NA NA NA NA NA LXN 363945 1304 chr3 162238592 162245681 162243602 N NA NA NA NA NA NA NMD3 1299493 1305 chr3 162309086 162320796 162314894,162316565,162319222 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA NMD3 1369987 1306 chr3 162762780 162765019 162763980 N NA NA NA NA NA NA NMD3 1823681 1307 chr3 163526467 163528628 163527612 N NA NA NA NA NA NA NMD3 2587368 1308 chr3 16882635 16885149 16883790 N NA NA TBC1D5 IMR90 Hi-C 24141950 OXNAD1 575968 1309 chr3 169456407 169457026 169456709 N NA MYNN NA NA NA NA MYNN 33827 1310 chr3 171530553 171533385 171532103 Y FNDC3B,PLD1 NA PLD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 FNDC3B 224033 1311 chr3 171694688 171699438 171695938,171698507 N,Y NA;NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 57980 1312 chr3 176613315 176615682 176614454 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 299366 1313 chr3 177037976 177040942 177039353 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 122928 1314 chr3 177074528 177080284 177076712,177079155 Y,Y TBL1XR1;NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 159480 1315 chr3 177314634 177316587 177315686 N NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 399586 1316 chr3 177601388 177601667 177601502 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 686340 1317 chr3 177645646 177646894 177646195 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 730598 1318 chr3 179223970 179226675 179225767 N NA NA GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 54033 1319 chr3 17941945 17949417 17947566,17943640 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TBC1D5 157705 1320 chr3 17950605 17954175 17953180 N NA NA NA NA NA NA TBC1D5 166365 1321 chr3 18019399 18041429 18021859,18024689,18028060 N,Y,N NA;TBC1D5;NA NA SATB1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D5 235159 1322 chr3 183292871 183299637 183294368,183297691 N,N NA;NA KLHL6 MCF2L2,YEATS2,KLHL6,KLHL24 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL6 19372 1323 chr3 183303937 183307016 183305310 N NA KLHL6 MCF2L2,KLHL6,YEATS2,LAMP3,LOC100505687,KLHL24 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL6 30438 1324 chr3 183308690 183310928 183309971 N NA KLHL6 LOC100505687,KLHL6,LAMP3,MCF2L2,YEATS2 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL6 35191 1325 chr3 184181487 184186328 184184343 N NA NA POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 POLR2H 100293 1326 chr3 184189260 184193060 184190990 Y HTR3D,FAM131A NA POLR2H,CHRD,THPO IMR90 Hi-C 24141950 POLR2H 108066 1327 chr3 184393969 184398503 184394933,184397082 N,N NA;NA MAGEF1 EPHB3 IMR90 Hi-C 24141950 MAGEF1 31333 1328 chr3 185278947 185281481 185279769 N NA SENP2 LIPH,TMEM41A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SENP2 22550 1329 chr3 187635650 187638640 187637048 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 172137 1330 chr3 187652695 187654791 187653744 N NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 189182 1331 chr3 187674962 187678603 187676536 N NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 193060 1332 chr3 187683109 187689117 187686292 N NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 182546 1333 chr3 187698890 187701712 187700074 N NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 169951 1334 chr3 187716028 187720522 187717816 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LOC100131635,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 151141 1335 chr3 188691234 188694631 188692840 N NA NA LOC100131635,RTP2,LPP,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 819358 1336 chr3 189109615 189115630 189112589 Y TP63 NA NA NA NA NA LPP-AS2 1237739 1337 chr3 190410947 190417187 190415007 N NA NA IL1RAP,LEPREL1 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 2539071 1338 chr3 19137433 19138916 19138052 N NA NA NA NA NA NA SGOL1 1088808 1339 chr3 193774848 193776867 193776166 N NA NA LOC647323 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 412101 1340 chr3 195356201 195361635 195357062 N NA NA NA NA NA NA PPP1R2 85977 1341 chr3 195654935 195662575 195661227 N NA NA MIR570,MUC4,SDHAP2,TNK2,MUC20 IMR90 Hi-C 24141950 TFRC 146457 1342 chr3 195823038 195825891 195823550 N NA TFRC LOC401109,TFRC,PCYT1A,LRRC33 IMR90 Hi-C 24141950 TFRC 14006 1343 chr3 195844220 195845331 195844833 N NA TFRC TFRC,LRRC33,LOC401109,C3orf43,MIR570,MUC20,SDHAP2,PCYT1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFRC 35188 1344 chr3 195846161 195848768 195847552 N NA TFRC TFRC,LRRC33,LOC401109,C3orf43,MIR570,MUC20,SDHAP2,PCYT1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFRC 37129 1345 chr3 197182200 197186332 197183365 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLG1 156753 1346 chr3 23699794 23704932 23700923 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1,RPL15,NKIRAS1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 142452 1347 chr3 23803752 23806754 23804578 Y NA UBE2E1 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 40630 1348 chr3 25212806 25213278 25212965 N NA NA NA NA NA NA TOP2B 492510 1349 chr3 25943806 25946909 25945547 N NA NA NA NA NA NA OXSM 112243 1350 chr3 26058222 26063533 26060147 N NA NA TOP2B Erythroid progenitor 3C 19696202 OXSM 226659 1351 chr3 26142966 26165981 26147248,26159502 N,N NA;NA NA NA NA NA NA OXSM 311403 1352 chr3 26489774 26493912 26491485 N NA NA NA NA NA NA OXSM 658211 1353 chr3 26554772 26557052 26556302 N NA NA NA NA NA NA OXSM 723209 1354 chr3 27673459 27677547 27674720 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 175214 1355 chr3 28212387 28214600 28213695 N NA NA NA NA NA NA CMC1 68524 1356 chr3 28831990 28834298 28833331 N NA NA NA NA NA NA CMC1 548866 1357 chr3 29181213 29184278 29182490 N NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 CMC1 898089 1358 chr3 31250367 31276284 31255848,31261149,31268473,31264888,31274169 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 298207 1359 chr3 32065938 32069852 32068217 N NA NA OSBPL10,ZNF860,STT3B,GPD1L IMR90 Hi-C 24141950 CMTM6 474551 1360 chr3 33487059 33489625 33487925 N NA NA UBP1 K562 ChIA-PET 22265404 GLB1 348365 1361 chr3 34057118 34060330 34058996,34059973 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 217055 1362 chr3 35525569 35528438 35526885 N NA NA NA NA NA NA ARPP21 155411 1363 chr3 39692248 39693581 39692405 N NA NA NA NA NA NA RPSA 244044 1364 chr3 43286621 43290710 43288233 N NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 NKTR 644474 1365 chr3 44529840 44554721 44545935,44552185 N,N NA;NA NA C3orf77,ZNF445 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1143 248452 1366 chr3 51786448 51791450 51788483 N NA NA IQCF6 IMR90 Hi-C 24141950 TEX264 81226 1367 chr3 525413 527576 526169 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2641024 1368 chr3 532255 535882 534647 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2632718 1369 chr3 561929 623935 564857,562675,586371,599726 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRNT1 2544665 1370 chr3 58569931 58572489 58571263 Y PXK,FAM107A NA NA NA NA NA RPP14 277959 1371 chr3 59190550 59194503 59192565 N NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 RPP14 898578 1372 chr3 59242484 59245166 59243765 N NA NA NA NA NA NA RPP14 950512 1373 chr3 59436372 59438294 59437325 Y NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 RPP14 1144400 1374 chr3 626648 633556 626808 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2535044 1375 chr3 67946676 67950876 67948517 N NA NA NA NA NA NA TMF1 1150608 1376 chr3 67962601 67969436 67967006 N NA NA NA NA NA NA TMF1 1132048 1377 chr3 67996876 68000733 67998735 N NA NA NA NA NA NA TMF1 1100751 1378 chr3 69695723 69699088 69697051 N NA NA MITF IMR90 Hi-C 24141950 ARL6IP5 561633 1379 chr3 72358620 72361070 72359402 N NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 134704 1380 chr3 73142809 73145557 73144012 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R2 96690 1381 chr3 73159604 73161158 73159889 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 113485 1382 chr3 73260279 73263226 73261783 N NA NA NA NA NA NA PPP4R2 214160 1383 chr3 74851284 74854371 74852570 N NA NA NA NA NA NA FAM86DP 629895 1384 chr3 75429603 75446041 75433596 N NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 38225 1385 chr3 76432054 76434886 76432994 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 597799 1386 chr3 80025528 80027821 80026692 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1783129 1387 chr3 82127116 82131689 82129278 N NA NA NA NA NA NA GBE1 316166 1388 chr3 82136909 82140676 82138113 N NA NA NA NA NA NA GBE1 325959 1389 chr3 82854094 82855585 82854731 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1043144 1390 chr3 88482067 88484483 88482955 N NA NA NA NA NA NA CGGBP1 283051 1391 chr3 917799 932881 918694 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2235719 1392 chr3 94224252 94226590 94225749 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 442185 1393 chr3 98915707 98920458 98918461 N NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL6 464135 1394 chr4 103389911 103392224 103391175 N NA NA SLC9B1,NFKB1,CENPE,BDH2,MANBA IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A8 123501 1395 chr4 104336161 104339980 104337266 N NA NA NA NA NA NA CENPE 216595 1396 chr4 106262235 106265992 106264736 N NA NA NA NA NA NA PPA2 129235 1397 chr4 108238521 108241733 108240473 N NA NA NA NA NA NA PAPSS1 399686 1398 chr4 10965036 10967278 10966119 N NA NA NA NA NA NA RAB28 2518711 1399 chr4 11099505 11101864 11101044 N NA NA NA NA NA NA RAB28 2384125 1400 chr4 111625429 111627118 111626459 N NA NA NA NA NA NA RRH 876279 1401 chr4 113013509 113032422 113031083 N NA NA AP1AR,TIFA,C4orf32,NEUROG2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP1AR 120473 1402 chr4 11471308 11474822 11473439 Y NA NA CLNK IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 2011167 1403 chr4 115066892 115071079 115068661 N NA NA NA NA NA NA C4orf21 1508741 1404 chr4 119511670 119560024 119529801,119512835 N,N NA;NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 46550 1405 chr4 122996452 122999635 122999459 N NA NA TRPC3 IMR90 Hi-C 24141950 BBS7 204800 1406 chr4 123071512 123086834 123073927 N NA NA KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 BBS7 279860 1407 chr4 124363445 124366952 124365091 N NA SPRY1 SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 45489 1408 chr4 124424877 124428836 124426800 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 106921 1409 chr4 124429540 124430188 124430086 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 111584 1410 chr4 124519892 124523050 124521292 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 201936 1411 chr4 124939688 124941064 124940261 N NA NA SPATA5,LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 621732 1412 chr4 12635562 12639568 12638047 N NA NA NA NA NA NA RAB28 846421 1413 chr4 12641806 12642380 12642108 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 843609 1414 chr4 126707419 126708258 126707774 N NA NA NA NA NA NA PLK4 2093758 1415 chr4 12702378 12706406 12704645 N NA NA NA NA NA NA RAB28 779583 1416 chr4 12723927 12727313 12725972 N NA NA LOC285547,LOC285548,NKX3-2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 758676 1417 chr4 129628961 129632291 129630636 N NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 98488 1418 chr4 131445659 131446794 131446084 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 1430830 1419 chr4 13762155 13763880 13762338 N NA NA NA NA NA NA RAB28 276166 1420 chr4 139778292 139782023 139780421 N NA NA LOC641364,SLC7A11 IMR90 Hi-C 24141950 NAA15 440653 1421 chr4 140342697 140349128 140348236 N NA RAB33B RAB33B,SETD7,ELF2,NAA15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB33B 25833 1422 chr4 141157740 141160535 141159275 N NA NA MAML3,MGST2,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129858 134011 1423 chr4 141163617 141165690 141164656 Y MAML3 NA MAML3,SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129858 128856 1424 chr4 141170858 141175621 141173895 N NA NA MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129858 118925 1425 chr4 144756051 144757389 144756458 N NA NA NA NA NA NA SMARCA5 321435 1426 chr4 145100601 145117056 145102728,145106456,145110511 N,N,N NA;NA;NA NA ANAPC10,ABCE1 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA5 665985 1427 chr4 145258109 145260853 145259554 N NA NA NA NA NA NA ABCE1 758303 1428 chr4 145494477 145497685 145495560 N NA NA NA NA NA NA ABCE1 521471 1429 chr4 145825236 145828235 145827696 N NA NA NA NA NA NA ABCE1 190921 1430 chr4 146297246 146299418 146298048 N NA NA NA NA NA NA SMAD1 103533 1431 chr4 147978097 147980052 147978592 N NA NA NA NA NA NA SLC10A7 534974 1432 chr4 149754977 149757217 149756263 N NA NA NA NA NA NA PRMT10 1149697 1433 chr4 152942261 152949849 152945845 N NA NA PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 260086 1434 chr4 152999404 153004166 153001266 N NA NA FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 317229 1435 chr4 153018651 153030224 153022071,153024464 N,N NA;NA NA FBXW7,SH3D19,RPS3A,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 336476 1436 chr4 153112662 153116820 153113739 N NA NA PET112 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 339352 1437 chr4 156558597 156562327 156561136 N NA GUCY1A3 NA NA NA NA GUCY1A3 25535 1438 chr4 159198922 159201836 159200099 N NA NA NA NA NA NA C4orf46 391366 1439 chr4 160116910 160158505 160117068 N NA RAPGEF2 FNIP2,PPID,ETFDH,C4orf45,RAPGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 30493 1440 chr4 160302072 160304625 160303937 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 113074 1441 chr4 16122926 16126607 16125102 N NA NA PROM1 IMR90 Hi-C 24141950 CD38 342995 1442 chr4 163342417 163342814 163342617 N NA NA NA NA NA NA NAF1 745259 1443 chr4 166532962 166535206 166533771 N NA NA NA NA NA NA MSMO1 284144 1444 chr4 16927222 16929989 16928704 N NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 LAP3 648938 1445 chr4 171340274 171342954 171341701 N NA NA NA NA NA NA C4orf27 661181 1446 chr4 171417556 171420316 171418810 N NA NA NA NA NA NA C4orf27 738463 1447 chr4 171944821 171949150 171946574 N NA NA NA NA NA NA C4orf27 1265728 1448 chr4 171951350 171953308 171952587 N NA NA NA NA NA NA C4orf27 1272257 1449 chr4 172596941 172599407 172598164 N NA NA NA NA NA NA GALNT7 1490497 1450 chr4 174275217 174278394 174276760 N NA HMGB2,SAP30 HMGB2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SAP30 13699 1451 chr4 180756730 180759252 180757708 N NA NA NA NA NA NA AGA 2393073 1452 chr4 181314768 181316999 181315644 N NA NA NA NA NA NA DCTD 2521631 1453 chr4 183746030 183748603 183747479 N NA NA NA NA NA NA DCTD 90027 1454 chr4 184319097 184320920 184319861 N NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 44869 1455 chr4 185188190 185190678 185189328 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728175 84452 1456 chr4 185455407 185461543 185458778 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 59681 1457 chr4 186885664 186890312 186887083 N NA NA SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 222362 1458 chr4 189356620 189362783 189357933,189361327 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 1031516 1459 chr4 18938275 18943237 18940464 N NA NA NA NA NA NA LCORL 914792 1460 chr4 189547761 189548683 189547978 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 845616 1461 chr4 189581256 189584554 189582254 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 809745 1462 chr4 189659414 189663318 189661352 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 730981 1463 chr4 189799418 189802835 189800447 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 591464 1464 chr4 18999058 19002832 19000647 N NA NA NA NA NA NA LCORL 975575 1465 chr4 19050787 19056662 19053519 N NA NA NA NA NA NA LCORL 1027304 1466 chr4 190551452 190553469 190552630 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 157153 1467 chr4 190577181 190581989 190579003 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 182882 1468 chr4 190589476 190592703 190591500 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 195177 1469 chr4 19060119 19066489 19064572 N NA NA NA NA NA NA LCORL 1036636 1470 chr4 19074470 19078240 19075998 N NA NA NA NA NA NA LCORL 1050987 1471 chr4 19095681 19099023 19097527 N NA NA NA NA NA NA LCORL 1072198 1472 chr4 190967936 190972045 190971024 N NA NA NA NA NA NA FRG1 105962 1473 chr4 19694632 19697831 19696379 N NA NA SLIT2 IMR90 Hi-C 24141950 PACRGL 1004205 1474 chr4 19851640 19855314 19853893 N NA NA NA NA NA NA PACRGL 846722 1475 chr4 19879933 19883626 19881640 N NA NA NA NA NA NA PACRGL 818410 1476 chr4 19992620 19996297 19995010 N NA NA NA NA NA NA PACRGL 705739 1477 chr4 22608193 22613608 22609191,22610022 N,N NA;NA NA GPR125 IMR90 Hi-C 24141950 GPR125 90521 1478 chr4 23001676 23004774 23003194 N NA NA NA NA NA NA GPR125 484004 1479 chr4 23092356 23094260 23093497 N NA NA NA NA NA NA GPR125 574684 1480 chr4 23604945 23605444 23605270 N NA NA NA NA NA NA DHX15 980740 1481 chr4 24658988 24659941 24659666 N NA NA CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 72804 1482 chr4 26459006 26461145 26460221 N NA NA TBC1D19,CCKAR,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D19 124401 1483 chr4 26806010 26811514 26809146 N NA NA NA NA NA NA STIM2 50799 1484 chr4 26812373 26835601 26828389,26814003,26824390,26828555 N,N,N,N NA;NA;NA;NA STIM2 TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 STIM2 26712 1485 chr4 26836898 26842071 26840027 N NA STIM2 NA NA NA NA STIM2 20242 1486 chr4 3538466 3541753 3538748 N NA NA NA NA NA NA FAM86EP 415395 1487 chr4 36256295 36261056 36257904 N NA ARAP2 ARAP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARAP2 10316 1488 chr4 38318665 38323194 38320645 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLR10 461417 1489 chr4 38323761 38325080 38324837 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLR10 459531 1490 chr4 38328768 38332344 38330756 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1 IMR90 Hi-C 24141950 TLR10 452267 1491 chr4 3914099 3918976 3915378 N NA FAM86EP NA NA NA NA FAM86EP 38172 1492 chr4 40301515 40312630 40303873,40308664 Y,N PDS5A,N4BP2,RHOH;NA NA N4BP2,LOC344967,RHOH,RBM47,NSUN7,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOH 102988 1493 chr4 40723772 40725752 40724841 Y RBM47 NA CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOH 525245 1494 chr4 42717572 42720403 42719221 N NA NA NA NA NA NA ATP8A1 58450 1495 chr4 42819454 42819734 42819625 N NA NA NA NA NA NA ATP8A1 160332 1496 chr4 4944066 4947537 4945882 N NA NA STX18,STK32B,LOC100507266 IMR90 Hi-C 24141950 CYTL1 73660 1497 chr4 5037313 5049368 5038447,5046997 N,N NA;NA CYTL1,STK32B STK32B,EVC2,EVC IMR90 Hi-C 24141950 STK32B 4159 1498 chr4 54567268 54570711 54568754 N NA NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 323448 1499 chr4 54612839 54616440 54614717 N NA NA SCFD2,LNX1 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 314375 1500 chr4 55806994 55810044 55807905 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 876179 1501 chr4 57622830 57626257 57624236 N NA NA PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 NOA1 217569 1502 chr4 57736124 57738645 57737852 N NA NA THEGL,SPINK2,REST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOA1 105181 1503 chr4 5928767 5930625 5929614 N NA NA NA NA NA NA MAN2B2 646277 1504 chr4 5957033 5959719 5958377 N NA NA CRMP1,PPP2R2C,JAKMIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MAN2B2 617183 1505 chr4 68296036 68300626 68300371 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 110630 1506 chr4 74572285 74584262 74574641 N NA NA MTHFD2L,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 439567 1507 chr4 74983421 74986483 74984840 N NA MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2,PF4V1,CXCL5,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 37346 1508 chr4 76105558 76107294 76106179 N NA NA NA NA NA NA RCHY1 332346 1509 chr4 78280876 78282769 78281751 N NA NA CXCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCNG2 202519 1510 chr4 79641385 79643182 79642503 N NA NA BMP2K K562 ChIA-PET 22265404 MRPL1 857580 1511 chr4 82481659 82485356 82483450 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA HNRNPD 809793 1512 chr4 82568674 82571254 82570262 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 723895 1513 chr4 83945009 83950047 83947060 N NA COPS4 LIN54,COPS4,LOC100499177,THAP9,COQ2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPS4 6192 1514 chr4 84136562 84163123 84139005,84162676 Y,N THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8;NA NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 100651 1515 chr4 88803504 88808447 88806582 N NA HSP90AB3P NA NA NA NA HSP90AB3P 4548 1516 chr4 89241240 89242867 89242098 N NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 35352 1517 chr4 89465845 89468963 89467720 N NA HERC3 HERC3 IMR90 Hi-C 24141950 HERC3 44684 1518 chr4 9043007 9050971 9043508,9045385 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ACOX3 600555 1519 chr4 9122056 9172316 9141989,9155320,9165759,9165925 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ACOX3 679604 1520 chr4 9603097 9610127 9606578 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 1160645 1521 chr4 9745745 9750568 9748303 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 1303293 1522 chr4 9751934 9754389 9753019 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 1309482 1523 chr4 9766618 9770802 9770494 N NA NA SLC2A9 IMR90 Hi-C 24141950 ACOX3 1324166 1524 chr5 100081779 100083207 100082612 N NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 155780 1525 chr5 100115278 100117494 100116226 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 121493 1526 chr5 1003717 1005648 1005020 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC11 152616 1527 chr5 101231417 101234511 101233836 N NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 992430 1528 chr5 102728372 102730549 102729294 N NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 263115 1529 chr5 105888942 105889683 105889158 N NA NA NA NA NA NA FBXL17 1828116 1530 chr5 112018612 112021510 112020427 N NA APC APC IMR90 Hi-C 24141950 APC 21692 1531 chr5 1132150 1136277 1133905 N NA NA BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZDHHC11 281049 1532 chr5 115693855 115705517 115695604 N NA NA COMMD10,SEMA6A IMR90 Hi-C 24141950 COMMD10 273128 1533 chr5 118021842 118024947 118023819 N NA NA NA NA NA NA DMXL1 382137 1534 chr5 123087484 123093821 123089579,123092324 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CEP120 328198 1535 chr5 123120131 123122604 123121561 N NA NA NA NA NA NA CEP120 360845 1536 chr5 123142077 123152598 123146661,123145095,123150255 N,N,N NA;NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CEP120 382791 1537 chr5 123210241 123212253 123211150 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CEP120 450955 1538 chr5 123391100 123395250 123392732 N NA NA NA NA NA NA CEP120 631814 1539 chr5 123496891 123500113 123498727 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 580692 1540 chr5 124236523 124251035 124238675,124242443,124242607,124246840,124248654 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 155718 1541 chr5 124253590 124278447 124257188 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 172785 1542 chr5 124312205 124337834 124332313,124316535 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 231400 1543 chr5 124338974 124344525 124341439 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 258169 1544 chr5 124346725 124350571 124348340 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 265920 1545 chr5 124535497 124537277 124536129 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 454692 1546 chr5 124745883 124749671 124747974 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 665078 1547 chr5 124930122 124931671 124930508 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 849317 1548 chr5 126564101 126567327 126565273 N NA NA MEGF10,LMNB1,C5orf63 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC1 285982 1549 chr5 128103938 128107509 128105004 N NA NA FBN2 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ33630 685172 1550 chr5 137415638 137417423 137416215 N NA FAM13B NA NA NA NA FAM13B 46836 1551 chr5 138897232 138899053 138897695 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 41698 1552 chr5 139086806 139098641 139089897 N NA NA CXXC5,UBE2D2,DNAJC18 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2D2 146055 1553 chr5 139124439 139141450 139126380 N NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5,NRG2,CYSTM1,PSD2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2D2 183688 1554 chr5 141394882 141396313 141395550 Y DIAPH1,KIAA0141,PCDH12,GNPDA1 NA GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0141 91497 1555 chr5 141773526 141774721 141774213 N NA NA SPRY4,FGF1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 68906 1556 chr5 142970672 142974834 142972480,142973642 N,N NA;NA NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 155595 1557 chr5 142984146 142998990 142985586 N NA NA NR3C1,ARHGAP26,HMHB1,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 169069 1558 chr5 143170564 143185852 143172012,143180980 N,N NA;NA HMHB1 NR3C1,ARHGAP26,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 HMHB1 5874 1559 chr5 148186831 148190621 148188137,148190612 N,N NA;NA NA SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO38 423285 1560 chr5 149538551 149540367 149539533 N NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 3129 1561 chr5 149832576 149835847 149833861 N NA CD74,RPS14 NDST1,MYOZ3,SYNPO IMR90 Hi-C 24141950 RPS14 3257 1562 chr5 149858082 149860434 149859380 N NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,NDST1,RBM22,TCOF1 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 27240 1563 chr5 1535557 1538144 1536691 Y SLC12A7,LPCAT1 NA LPCAT1,SLC6A3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MRPL36 261812 1564 chr5 154781845 154784044 154782906 N NA NA PPP1R2P3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL22 461212 1565 chr5 156305467 156308524 156307220 N NA PPP1R2P3 NA NA NA NA PPP1R2P3 27918 1566 chr5 156309094 156312048 156310499 N NA PPP1R2P3 NA NA NA NA PPP1R2P3 31545 1567 chr5 157018589 157021240 157020032 N NA NA SOX30,FNDC9,CYFIP2,NIPAL4,ADAM19,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 THG1L 137083 1568 chr5 157504659 157512451 157506512 N NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 218476 1569 chr5 157588026 157656897 157603257,157622828,157625881,157628181 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 301843 1570 chr5 157670936 157686954 157671163 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 384753 1571 chr5 157701142 157865428 157747729,157863856,157704663,157826005,157858440,157817619,157710294,157753003,157801934 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA EBF1,LOC285626,IL12B IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 414959 1572 chr5 157937081 157942469 157939267 N NA NA NA NA NA NA EBF1 584319 1573 chr5 163341519 163344985 163343265 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 411288 1574 chr5 163545716 163548751 163546987 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 615485 1575 chr5 163679140 163756068 163681636,163723902,163728821 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 748909 1576 chr5 164064997 164288543 164065159 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1134766 1577 chr5 164489729 164509725 164489890 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 1559498 1578 chr5 164607996 164680375 164610420,164608318,164616144 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 1677765 1579 chr5 165018330 165036291 165018798,165018949 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 2088099 1580 chr5 165209327 165210361 165209671 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 2279096 1581 chr5 166178083 166179701 166178341 N NA NA NA NA NA NA RARS 1733762 1582 chr5 170937392 170938536 170938101 N NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 122684 1583 chr5 171146191 171149618 171148657 N NA NA FGF18,FBXW11 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 331483 1584 chr5 172142644 172146522 172144090 N NA NA RPL26L1,LOC100268168,ERGIC1,DUSP1,ATP6V0E1,C5orf41,BNIP1,STC2,NEURL1B,NKX2-5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUSP1 51681 1585 chr5 172167363 172170383 172169162 N NA DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 27820 1586 chr5 172213484 172223793 172216275,172220684 Y,N C5orf41,DUSP1;NA DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 15281 1587 chr5 172232485 172235554 172234381 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 25669 1588 chr5 172846731 172848187 172847680 N NA NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP1 275286 1589 chr5 172921220 172921569 172921330 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP1 349775 1590 chr5 173115430 173118059 173117138 N NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BNIP1 543985 1591 chr5 17316858 17319883 17318160 N NA NA BASP1,LOC285696,LOC401177 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYO10 380473 1592 chr5 17436262 17437735 17437009 N NA NA LOC401177 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 499877 1593 chr5 175863422 175865955 175864093 N NA NOP16,FAF2 FAF2,RNF44,EIF4E1B,SNCB,CDHR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAF2 9401 1594 chr5 178954621 178958483 178957807 N NA NA RUFY1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPH1 92239 1595 chr5 180523975 180524866 180524309 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 125397 1596 chr5 180528371 180529573 180529084 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120690 1597 chr5 18704477 18747659 18746014 N NA NA NA NA NA NA MYO10 1768092 1598 chr5 23012113 23017661 23013562 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1552524 1599 chr5 24170288 24172487 24171368 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2710699 1600 chr5 2568325 2570941 2569567 N NA NA NA NA NA NA NDUFS6 766829 1601 chr5 27457848 27460334 27458615 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 4071948 1602 chr5 28439090 28443182 28441973 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 3089100 1603 chr5 28466476 28470377 28468471 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 3061905 1604 chr5 28546162 28550582 28547842,28546499 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DROSHA 2981700 1605 chr5 33363460 33367372 33364744 N NA NA NPR3 IMR90 Hi-C 24141950 TARS 73526 1606 chr5 34177879 34185464 34184570,34178113 N,N NA;NA NA C1QTNF3-AMACR,SLC45A2,AMACR,RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 AMACR 169659 1607 chr5 34304670 34307977 34304949 N NA NA NA NA NA NA AMACR 296450 1608 chr5 35248848 35250399 35249649 N NA NA PRLR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRIX1 333028 1609 chr5 35478250 35480795 35479408 N NA NA CAPSL,PRLR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL7R 376196 1610 chr5 36392179 36395971 36393444 N NA NA NA NA NA NA SKP2 240034 1611 chr5 36400706 36406028 36404303 N NA NA SLC1A3 IMR90 Hi-C 24141950 SKP2 248561 1612 chr5 36710679 36727014 36724956 N NA NA SLC1A3,NIPBL,LOC646719 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC646719 149782 1613 chr5 3857124 3858059 3857898 N NA NA NA NA NA NA IRX1 260956 1614 chr5 40377059 40380374 40378933 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 375698 1615 chr5 40404289 40412317 40406923,40410315 N,Y NA;PTGER4,PRKAA1 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 343755 1616 chr5 40439868 40444064 40441852 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 312008 1617 chr5 40605174 40607464 40606202 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 148608 1618 chr5 42944438 42968483 42951731,42962280 N,N NA;NA NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 LOC648987 50430 1619 chr5 43561028 43579314 43577731 N NA C5orf34,NNT NNT,PAIP1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NNT 23477 1620 chr5 4374632 4378405 4375543 N NA NA NA NA NA NA IRX1 778464 1621 chr5 43771493 43774194 43773014 N NA NA NA NA NA NA NNT 168702 1622 chr5 4574757 4578187 4576293 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 844620 1623 chr5 49796436 49799298 49797754 N NA NA NA NA NA NA EMB 59202 1624 chr5 5343824 5353893 5348375 N NA NA ADAMTS16 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0947 68914 1625 chr5 53940909 53944256 53942527 N NA NA SNX18,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 DHX29 659265 1626 chr5 54048262 54053000 54052414,54049875 N,N NA;NA NA SNX18,HSPB3,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 DHX29 550521 1627 chr5 542199 545794 544320 Y NA NA SLC9A3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EXOC3 98865 1628 chr5 55345726 55349114 55347061 Y NA NA ANKRD55,IL6ST,MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 SKIV2L2 742150 1629 chr5 55964542 55966893 55965971 N NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 502882 1630 chr5 55981451 55983500 55982583 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 486275 1631 chr5 56029668 56034740 56032637 N NA NA MAP3K1 MCF7 ChIA-PET 22265404 GPBP1 435035 1632 chr5 56325859 56326907 56326824 N NA NA SETD9,MIER3 HELA,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 GPBP1 142868 1633 chr5 60572727 60574845 60573499 N NA NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf43 114425 1634 chr5 61162629 61165041 61163809 N NA NA NA NA NA NA DIMT1 534687 1635 chr5 6278798 6281008 6280846 N NA NA NA NA NA NA MED10 97631 1636 chr5 64397294 64400541 64398902 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 332539 1637 chr5 66511144 66512643 66511862 Y NA NA MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIK3R1 998941 1638 chr5 66540640 66543121 66541659 N NA NA PIK3R1,CD180,MAST4 IMR90,CD4 T,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,22270183,22265404 PIK3R1 968463 1639 chr5 67336568 67338982 67337735 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 172602 1640 chr5 68337774 68340193 68339198 N NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 49583 1641 chr5 70989444 70995721 70990050,70993510 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MCCC2 106329 1642 chr5 71851196 71854268 71852626 N NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 PTCD2 234996 1643 chr5 71871114 71873533 71872239 N NA NA TNPO1,PTCD2,ZNF366 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 238885 1644 chr5 74285815 74286580 74286136 N NA NA NA NA NA NA NSA2 222712 1645 chr5 766891 773372 769998 N NA NA ZDHHC11,SLC9A3,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC11 77729 1646 chr5 77146800 77150745 77148868 N NA NA TBCA IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 74615 1647 chr5 77230964 77234194 77232053 N NA NA OTP IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 158779 1648 chr5 79564527 79567277 79565119 N NA NA THBS4,SERINC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 136561 1649 chr5 79654115 79656022 79655068 N NA ZFYVE16 CMYA5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFYVE16 47816 1650 chr5 81073551 81076691 81075496 N NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 26479 1651 chr5 81145495 81185598 81148163,81152811 N,N NA;NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATG10 82246 1652 chr5 82043634 82046512 82044698 N NA NA XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM167A 326760 1653 chr5 82116072 82118071 82117059 N NA NA NA NA NA NA TMEM167A 255201 1654 chr5 8632685 8666320 8634016 N NA NA LOC729506 IMR90 Hi-C 24141950 FASTKD3 763535 1655 chr5 87797332 87799805 87798713 N NA NA NA NA NA NA LOC100505894 232633 1656 chr5 88563274 88572787 88564467,88567384,88571457 N,N,N NA;NA;NA NA MEF2C IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505894 998575 1657 chr5 88608485 88611636 88610283 N NA NA NA NA NA NA LOC100505894 1043786 1658 chr5 89407211 89408910 89408007 N NA NA NA NA NA NA CETN3 296693 1659 chr5 8951513 8955175 8952850 N NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 FASTKD3 1082363 1660 chr5 89596254 89599026 89597198 N NA NA NA NA NA NA CETN3 106577 1661 chr5 95168745 95173686 95170672 N NA GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 10168 1662 chr5 96527483 96548445 96528498 N NA RIOK2 FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 RIOK2 8478 1663 chr5 97799376 97801520 97800674 N NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CHD1 460718 1664 chr5 97927458 97930146 97928924 N NA NA NA NA NA NA CHD1 332092 1665 chr5 98367911 98370381 98369094 N NA NA LOC100289230,CHD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC100289230 103073 1666 chr5 98870972 98872666 98871417 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 606134 1667 chr5 99381557 99390719 99382022,99389211 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 848268 1668 chr6 104629099 104630535 104630020 N NA NA NA NA NA NA PREP 1220464 1669 chr6 105087105 105089458 105088324 N NA NA NA NA NA NA PREP 761541 1670 chr6 105148065 105155139 105153149 N NA NA HACE1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 695860 1671 chr6 105900284 105902885 105901401 N NA PREP ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 49285 1672 chr6 106034344 106036954 106035303 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 183345 1673 chr6 106300463 106303359 106300947 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 449464 1674 chr6 106323228 106325366 106324254 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 448329 1675 chr6 106348816 106351667 106350597 N NA NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 422028 1676 chr6 106438555 106444342 106440472,106442598 Y,Y PRDM1;PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 329353 1677 chr6 110339955 110343361 110342103 N NA NA FIG4,AKD1 IMR90 Hi-C 24141950 WASF1 157846 1678 chr6 110360360 110362158 110361171 N NA NA FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24 IMR90 Hi-C 24141950 WASF1 139049 1679 chr6 110888523 110890705 110889480 N NA NA CDK19,RPF2,AMD1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK19 245707 1680 chr6 111174058 111186990 111174220 N NA CDK19,AMD1 CDK19,AMD1,GTF3C6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMD1 8997 1681 chr6 112363464 112365353 112364688 N NA C6orf225,TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 C6orf225 43321 1682 chr6 112808132 112811326 112809585 N NA NA NA NA NA NA TUBE1 399381 1683 chr6 125665605 125669564 125667876 N NA NA HEY2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA7 432743 1684 chr6 125683866 125686790 125684435 N NA NA HEY2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA7 415517 1685 chr6 126964509 126965693 126965102 N NA NA TRMT11 IMR90 Hi-C 24141950 CENPW 303256 1686 chr6 127696768 127699865 127696932 N NA NA C6orf174 IMR90 Hi-C 24141950 CENPW 1035515 1687 chr6 130068261 130070590 130069195 N NA NA ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 1313872 1688 chr6 131665332 131711808 131686853,131702378,131703869,131698596,131689771,131709676 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA AKAP7 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP7 208506 1689 chr6 132315214 132330185 132320786,132316504 N,N NA;NA NA LOC100507254,CTGF,MOXD1,STX7 IMR90,H1ESC,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MED23 365851 1690 chr6 132332213 132348444 132333204,132339378,132340447 N,N,N NA;NA;NA NA LOC100507254,CTGF,STX7,ENPP1 IMR90,H1ESC,HELA,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 MED23 382850 1691 chr6 132387220 132393261 132388622,132391629 N,N NA;NA NA LOC100507254,ENPP1,CTGF IMR90,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 MED23 437857 1692 chr6 132436389 132438735 132437485 N NA NA LOC100507254,CTGF,STX7,ENPP1 IMR90,HELA,K562,GM12878,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 STX7 395602 1693 chr6 134735463 134737564 134736578 N NA NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 638472 1694 chr6 134952776 134955420 134954288 N NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HBS1L 420616 1695 chr6 135405461 135411691 135407967 N NA HBS1L HBS1L,MYB,AHI1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HBS1L 29425 1696 chr6 135422725 135429419 135424285,135427118 N,N NA;NA HBS1L HBS1L,AHI1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 46689 1697 chr6 135433526 135441258 135438126 N NA NA AHI1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 57490 1698 chr6 135449663 135451302 135450258 N NA NA AHI1,MYB IMR90 Hi-C 24141950 MYB 51151 1699 chr6 137627543 137630284 137628769 N NA NA IFNGR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR1 86976 1700 chr6 137673771 137691082 137674680 N NA NA IL22RA2 IMR90 Hi-C 24141950 IFNGR1 133204 1701 chr6 137833515 137835764 137834733 N NA NA NA NA NA NA IFNGR1 292948 1702 chr6 138224907 138227543 138226086 N NA TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 36326 1703 chr6 138240639 138251860 138248053 N NA NA PERP,TNFAIP3,IFNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 52058 1704 chr6 13844656 13845441 13845003 N NA NA NA NA NA NA NOL7 229097 1705 chr6 138714456 138716447 138715702 N NA NA HEBP2 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC28A 378210 1706 chr6 139643078 139647894 139645229 N NA TXLNB,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA IMR90 Hi-C 24141950 TXLNB 29870 1707 chr6 14074933 14077196 14075660 Y RANBP9,CD83 NA DTNBP1,RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 NOL7 459374 1708 chr6 141802988 141807289 141805122 N NA NA NA NA NA NA VTA1 661121 1709 chr6 14209832 14213644 14211471 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOL7 594273 1710 chr6 14354015 14356509 14355283 N NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 NOL7 738456 1711 chr6 14451949 14455353 14453177 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 791174 1712 chr6 144535629 144538513 144537528 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 LTV1 371121 1713 chr6 14728460 14731252 14729766 N NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 515275 1714 chr6 148622632 148623603 148623061 N NA NA SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 1015833 1715 chr6 14897127 14899470 14898357 N NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 347057 1716 chr6 14902491 14905271 14903611 N NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 341256 1717 chr6 14909372 14912458 14911097 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 334069 1718 chr6 150780884 150781364 150781202 N NA NA PLEKHG1,IYD IMR90 Hi-C 24141950 PCMT1 710053 1719 chr6 15106333 15110209 15108652 N NA NA JARID2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 136318 1720 chr6 151999345 152005954 152002997 N NA ESR1 ESR1,C6orf97 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ESR1 5677 1721 chr6 156187735 156296015 156294969 N NA NA NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 552118 1722 chr6 156333559 156336793 156334583 N NA NA MIR4466,ARID1B,NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 697942 1723 chr6 156407134 156604058 156485271,156590069,156562240,156489054,156503630,156475658,156495736,156582911,156600768 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 ARID1B 495006 1724 chr6 156608329 156611552 156609834 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 487512 1725 chr6 157006317 157010910 157008165 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88154 1726 chr6 158648925 158660560 158658970,158653148 N,N NA;NA NA TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2H5 59546 1727 chr6 159289171 159294321 159290825 N NA EZR OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZR 48715 1728 chr6 159475878 159478586 159477198 Y TAGAP TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 9694 1729 chr6 159527627 159529264 159528430 N NA NA NA NA NA NA TAGAP 61443 1730 chr6 164100704 164103693 164101577 N NA NA NA NA NA NA SFT2D1 2652298 1731 chr6 164132584 164134902 164133641 N NA NA NA NA NA NA SFT2D1 2621089 1732 chr6 167503802 167511711 167508518 Y RNASET2,GPR31,CCR6 NA NA NA NA NA SFT2D1 747811 1733 chr6 170251552 170252970 170252148 N NA NA PSMB1,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf70 99831 1734 chr6 170448246 170452396 170451111 N NA NA DLL1,LINC00574 IMR90 Hi-C 24141950 FAM120B 163448 1735 chr6 175657 190123 182386,186494 N,N NA;NA NA IRF4,DUSP22,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 101978 1736 chr6 21586173 21591569 21588497 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2403 1737 chr6 22954382 22956182 22955356 N NA NA LINC00340,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1360410 1738 chr6 234024 237949 236534 N NA NA DUSP22,IRF4,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 54152 1739 chr6 23440666 23441755 23440865 N NA NA SOX4,LINC00340,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 MRS2 961398 1740 chr6 24976853 24998027 24997037,24977101,24984390 Y,N,N TDP2;NA;NA NA FAM65B,CMAHP IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 140024 1741 chr6 25001890 25008650 25007041 Y TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 129401 1742 chr6 25016751 25029788 25027560 Y NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 108263 1743 chr6 25031971 25043439 25041864,25035685 N,N NA;NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 94612 1744 chr6 26568584 26570218 26569186 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,HIST1H2AE,HIST1H2BG,ABT1,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D K562 ChIA-PET 22265404 ABT1 26953 1745 chr6 26571233 26573419 26571877 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 23752 1746 chr6 27154605 27159624 27156598 N NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 39968 1747 chr6 27200233 27201791 27200572 N NA NA LOC100507173,OR2B2,ZNF184,LOC100131289,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 85596 1748 chr6 27203268 27204402 27203430 N NA NA OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 88631 1749 chr6 27444740 27448603 27447169 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 3843 1750 chr6 27469555 27472174 27470778 N NA ZNF184 PRSS16,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BJ,HIST1H2BK,HIST1H2AH,MIR3143,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2BM,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4K,HIST1H3I,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2BO,HIST1H3J,HIST1H2AM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 28658 1751 chr6 27485564 27488124 27487176 N NA ZNF184 LOC100131289,HIST1H2BJ,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2AH,MIR3143,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF184 44667 1752 chr6 27638074 27639207 27638396 N NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131289 90316 1753 chr6 27720082 27721530 27720946 N NA LOC100131289 HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289,POM121L2,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2AM,HIST1H2BO,HIST1H3I,HIST1H4L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131289 7993 1754 chr6 27978425 27981240 27979499 N NA NA GPX6 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF165 67242 1755 chr6 28573315 28576047 28574773 N NA NA NA NA NA NA ZSCAN12 205771 1756 chr6 28615303 28618410 28616383 N NA NA SCAND3,ZSCAN12 IMR90 Hi-C 24141950 ZSCAN12 247759 1757 chr6 28695572 28698248 28697057 N NA NA ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 193520 1758 chr6 28710376 28710911 28710811 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 180857 1759 chr6 28748353 28751832 28751621,28749715 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TRIM27 139936 1760 chr6 28834223 28837196 28834843 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 54572 1761 chr6 28842874 28850206 28844702,28849158 N,N NA;NA TRIM27 TRIM27 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 41562 1762 chr6 28908363 28909714 28909141 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 16595 1763 chr6 28983345 28985315 28984442 N NA NA TRIM27,LOC401242 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRIM27 91577 1764 chr6 3051893 3055598 3054068 N NA RIPK1 MYLK4,WRNIP1,DKFZP686I15217,NQO2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIPK1 21460 1765 chr6 3063069 3068024 3064092 N NA RIPK1 NQO2,LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 9034 1766 chr6 31416707 31423441 31421482 N NA MICA,HCP5,HCG26,MICB NA NA NA NA HCP5 7516 1767 chr6 32438408 32443593 32440660 N NA HLA-DRA HLA-DRB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DRA 30789 1768 chr6 32447828 32452702 32450529 N NA HLA-DRA,HLA-DRB5 HLA-DRB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DRA 40209 1769 chr6 32569272 32574465 32571907 Y NA HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 11659 1770 chr6 32575581 32579620 32577727 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 17968 1771 chr6 32656541 32659191 32658187 N NA HLA-DQB1 NA NA NA NA HLA-DQB1 22075 1772 chr6 32984602 32988801 32986995 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA BRD2,HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 7213 1773 chr6 32995162 32999446 32997398,32995786 Y,N HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA;NA HLA-DOA,HLA-DPB1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1,BRD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLA-DOA 17773 1774 chr6 33332145 33334102 33332692 N NA TAPBP,ZBTB22,DAXX,KIFC1,PHF1 KIFC1,DAXX,WDR46,TAPBP,PFDN6,RGL2,ZBTB22,PHF1,SYNGAP1,ZBTB9 IMR90 Hi-C 24141950 KIFC1 25211 1775 chr6 33869493 33873914 33872701 N NA NA LOC100507584 K562 ChIA-PET 22265404 MNF1 189989 1776 chr6 33881320 33883464 33882650 N NA NA MLN,LEMD2,GRM4,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 MNF1 201816 1777 chr6 34190527 34193644 34192157 N NA HMGA1 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1 10933 1778 chr6 3620629 3625646 3624464 N NA NA SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 395923 1779 chr6 36517512 36519819 36518577 N NA STK38,SRSF3 STK38,SRSF3 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK38 2265 1780 chr6 36633383 36638504 36635208 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A NA CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 71293 1781 chr6 37038249 37042726 37039779,37042365 N,N NA;NA NA FGD2,PIM1,TMEM217,PPIL1,C6orf89,CPNE5,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D22B 182822 1782 chr6 37068218 37072496 37070570 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D22B 153052 1783 chr6 37481696 37486425 37483636 N NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 13996 1784 chr6 40606595 40610623 40608677 N NA NA LRFN2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 429565 1785 chr6 40666551 40674660 40669617,40671226 N,N NA;NA NA APOBEC2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 365528 1786 chr6 40676670 40682327 40679329 N NA NA APOBEC2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 357861 1787 chr6 40686447 40688949 40687756 N NA NA APOBEC2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 351239 1788 chr6 41591667 41597946 41594038 N NA MDFI NCR2,FOXP4,MDFI,TFEB,PGC IMR90 Hi-C 24141950 MDFI 8249 1789 chr6 44040065 44042710 44041233 N NA NA POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1,XPO5,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL14 52481 1790 chr6 4446843 4449770 4447583 N NA NA CDYL IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 425274 1791 chr6 44594053 44596398 44594997 Y AARS2 NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 238802 1792 chr6 44705879 44707531 44706597 N NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 350628 1793 chr6 4481245 4484984 4482719 N NA NA CDYL IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 459676 1794 chr6 45789182 45791404 45789989 N NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 1433931 1795 chr6 47381501 47383170 47382423 N NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 62355 1796 chr6 5025354 5029537 5026558 N NA NA LYRM4,RPP40,CDYL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FARS2 232047 1797 chr6 52171334 52174826 52173002 N NA MCM3 PAQR8 IMR90 Hi-C 24141950 MCM3 21752 1798 chr6 53222137 53226389 53224280,53226065 Y,N NA;NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 8160 1799 chr6 55773529 55775909 55774138,55774147 N,N NA;NA NA HMGCLL1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 1135475 1800 chr6 56758240 56759637 56758490 N NA NA PRIM2,DST,RAB23,BEND6,ZNF451,BAG2,KIAA1586 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 151747 1801 chr6 5826598 5834569 5831763,5827443 N,N NA;NA NA LY86-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NRN1 173064 1802 chr6 5864057 5876326 5866929,5869640 N,N NA;NA NA FARS2,F13A1,LY86-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NRN1 131307 1803 chr6 5894026 5938659 5897015,5894266 N,N NA;NA NA FARS2,F13A1 IMR90 Hi-C 24141950 NRN1 68974 1804 chr6 63006724 63010586 63009400 N NA NA NA NA NA NA PHF3 1345845 1805 chr6 63075509 63079763 63077752 N NA NA NA NA NA NA PHF3 1276668 1806 chr6 63921409 63923071 63922765 N NA NA NA NA NA NA PHF3 433360 1807 chr6 6690574 6704059 6701350 N NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 101640 1808 chr6 6709095 6715486 6714004 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 120161 1809 chr6 68589735 68602154 68598579,68601056 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1904895 1810 chr6 68717544 68719912 68718513 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1787137 1811 chr6 68748225 68838315 68748974,68750265,68807494,68755622,68837769 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1668734 1812 chr6 6906572 6906905 6906737 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 200925 1813 chr6 69264278 69270793 69269136 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1236256 1814 chr6 69282654 69287956 69286162 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1219093 1815 chr6 6942554 6944232 6943324 N NA NA NA NA NA NA RREB1 163598 1816 chr6 708910 712923 711241 Y DUSP22,EXOC2 NA NA NA NA NA IRF4 317171 1817 chr6 71060923 71064777 71063459 N NA NA NA NA NA NA FAM135A 58330 1818 chr6 7480554 7481629 7481210 N NA NA DSP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RIOK1 90492 1819 chr6 78494254 78496533 78495540 N NA NA NA NA NA NA PHIP 1291478 1820 chr6 81600221 81602435 81601478 N NA NA NA NA NA NA BCKDHB 783877 1821 chr6 81675864 81681123 81677456 N NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 859520 1822 chr6 82775892 82778143 82776918 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 179305 1823 chr6 89251875 89274604 89259062 N NA NA NA NA NA NA RNGTT 398744 1824 chr6 91064550 91066309 91065113 N NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 57923 1825 chr6 91081050 91098591 91084108,91085650,91094073 N,N,N NA;NA;NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 74423 1826 chr6 93393702 93402233 93397021,93398296 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2096795 1827 chr6 93797351 93799798 93798567 N NA NA NA NA NA NA MANEA 2225575 1828 chr6 93884355 93889134 93887682,93885967 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MANEA 2136239 1829 chr7 101381984 101390869 101384475,101387068 Y,N NA;NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 68315 1830 chr7 104574739 104578093 104576346 N NA NA MLL5,LOC100216545,LOC723809,LOC100216546,LHFPL3,SRPK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100216546 53519 1831 chr7 10681592 10684561 10683386 N NA NA NA NA NA NA NDUFA4 295252 1832 chr7 112030991 112033260 112032081 N NA NA DOCK4,ZNF277,IFRD1 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf53 87648 1833 chr7 116222679 116224675 116223481 N NA NA TES,MET,CAV2,CAV1 GM12878,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 NAA38 1599411 1834 chr7 117949669 117953307 117951703 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 125583 1835 chr7 121072936 121075585 121074030 N NA NA NA NA NA NA ING3 482119 1836 chr7 121076982 121083016 121078619,121081092 N,N NA;NA NA FAM3C K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ING3 486165 1837 chr7 1226704 1235681 1228518 N NA C7orf50,ZFAND2A C7orf50,ZFAND2A,MICALL2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 26849 1838 chr7 127775437 127780084 127776216 N NA NA SND1,MIR129-1,PAX4,LEP IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 167732 1839 chr7 134450366 134453698 134452390 N NA NA BPGM,CALD1 IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 118835 1840 chr7 140354520 140357301 140356576 N NA NDUFB2,LOC100134713 DENND2A,MKRN1,LOC100134713,NDUFB2,ADCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFB2 39180 1841 chr7 141629 151111 149355 N NA NA FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 COX19 864124 1842 chr7 142011033 142014770 142013481 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L6 359361 1843 chr7 142026821 142030010 142028373 N NA NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L6 344121 1844 chr7 142044184 142046969 142045550 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L6 327162 1845 chr7 144602747 144612391 144606605 N NA NA NA NA NA NA FAM115A 1003469 1846 chr7 145653103 145655978 145654008 N NA NA NA NA NA NA FAM115A 2053825 1847 chr7 148634857 148639669 148638463 Y NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EZH2 53416 1848 chr7 149636438 149674466 149672293,149646547,149658665 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA KRBA1 224290 1849 chr7 150364893 150366898 150365785 Y ACTR3C,GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,LOC100128542,GIMAP5,GIMAP2,GIMAP1 GIMAP2 NA NA NA NA GIMAP2 15896 1850 chr7 150371796 150375546 150373897 Y GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP5,GIMAP2,GIMAP1 GIMAP2 NA NA NA NA GIMAP2 7248 1851 chr7 151632491 151634517 151633453 N NA NA NA NA NA NA NUB1 593644 1852 chr7 152270689 152271581 152270801 N NA NA LOC100128822,XRCC2,FABP5P3,MLL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 XRCC2 101669 1853 chr7 152416752 152418122 152416911 N NA XRCC2 MLL3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC2 43502 1854 chr7 152443578 152446062 152444946 N NA NA MLL3,ACTR3B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XRCC2 70328 1855 chr7 154995738 154999981 154997293 N NA NA INSIG1,LOC202781,PAXIP1 K562 ChIA-PET 22265404 LOC202781 200595 1856 chr7 155142454 155174013 155154588,155164459 N,N NA;NA NA INSIG1,LOC100128264,HTR5A,PAXIP1,LOC100132707,LOC202781,CNPY1,DPP6 IMR90 Hi-C 24141950 RBM33 263190 1857 chr7 158960431 158985991 158983832 N NA NA VIPR2,PTPRN2 IMR90 Hi-C 24141950 NCAPG2 462911 1858 chr7 158988309 158993996 158990040 N NA NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 NCAPG2 490789 1859 chr7 1705883 1734656 1707308,1709325 Y,Y NA;NA NA MAD1L1,KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1908 96174 1860 chr7 17273184 17275346 17273967 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 479833 1861 chr7 20833205 20838975 20837743 Y SP8 NA SP8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP4 628714 1862 chr7 21299630 21304365 21301813 N NA NA NA NA NA NA SP4 163324 1863 chr7 21391464 21393358 21392426 N NA NA NA NA NA NA SP4 74331 1864 chr7 22121856 22123770 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 136314 1865 chr7 22924823 22927097 22925673 N NA NA SNORD93,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 TOMM7 62402 1866 chr7 2547518 2549721 2548698 Y LFNG,LFNG NA LFNG K562 ChIA-PET 22265404 NUDT1 265661 1867 chr7 25492616 25495626 25494974 N NA NA NA NA NA NA C7orf31 272799 1868 chr7 25640790 25644360 25642657 N NA NA NA NA NA NA C7orf31 420973 1869 chr7 25659368 25660753 25659983 Y NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf31 439551 1870 chr7 25891120 25892742 25891981 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA2B1 347671 1871 chr7 25895135 25899438 25896727 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 340975 1872 chr7 2886465 2887575 2887256 N NA NA GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 NUDT1 604608 1873 chr7 2910358 2915215 2910449,2913628 N,N NA;NA NA AMZ1,GNA12,FOXK1,KIAA0415 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUDT1 628501 1874 chr7 3133534 3136198 3134701 N NA NA SDK1,CARD11 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT1 851677 1875 chr7 32448329 32450971 32450070 N NA NA NA NA NA NA LSM5 83899 1876 chr7 33853837 33855403 33854480 N NA NA BBS9,BMPER IMR90 Hi-C 24141950 RP9 704835 1877 chr7 37825671 37827806 37826758 N NA NA NA NA NA NA EPDR1 132357 1878 chr7 38356501 38373927 38370654 N NA NA STARD3NL,LOC100506776 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STARD3NL 138693 1879 chr7 401134 403761 402523 N NA NA NA NA NA NA COX19 611474 1880 chr7 43109944 43114475 43111975 N NA NA HECW1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL32 138005 1881 chr7 47227052 47228629 47227684 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 790593 1882 chr7 50251623 50254736 50252746 N NA NA NA NA NA NA IKZF1 89642 1883 chr7 50304796 50310322 50307396 N NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 34056 1884 chr7 50319764 50324589 50321690 Y NA IKZF1 IKZF1 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF1 19789 1885 chr7 53931680 53935194 53934550 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 891745 1886 chr7 5593477 5599359 5595862,5597973 Y,N CCZ1,ACTB;NA FBXL18,ACTB RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 23245 1887 chr7 5608673 5610968 5610361 N NA ACTB RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 38441 1888 chr7 56955271 56963448 56957967,56961541 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CHCHD2 781084 1889 chr7 56977463 56981305 56978903 N NA NA NA NA NA NA CHCHD2 803276 1890 chr7 6117438 6122796 6121206 N NA NA EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AIMP2 68556 1891 chr7 63123686 63128162 63126108 N NA NA NA NA NA NA LOC649395 765909 1892 chr7 63141323 63151296 63143132,63147131 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC649395 742775 1893 chr7 64035036 64036711 64035388 N NA ZNF680 NA NA NA NA ZNF680 11531 1894 chr7 64939558 64944590 64940910 N NA NA ZNF92 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF92 100790 1895 chr7 65885983 65888308 65886126 N NA LINC00174 ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 20588 1896 chr7 65923236 65924869 65924355 N NA NA LINC00174,CRCP,ASL,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 57841 1897 chr7 65955157 65969313 65958631 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 89762 1898 chr7 68894444 68897058 68895638 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 166848 1899 chr7 6929982 6936320 6931226 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1 285926 1900 chr7 7195582 7202604 7196968,7198950 N,N NA;NA C1GALT1 COL28A1 IMR90 Hi-C 24141950 C1GALT1 19642 1901 chr7 74694163 74697057 74696459 N NA NA NA NA NA NA GTF2IRD2B 185816 1902 chr7 75762162 75763577 75763006 N NA NA MDH2,SRRM3,STYXL1,POR IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 84769 1903 chr7 75773640 75779695 75778857 N NA NA MDH2,SRRM3,STYXL1,HSPB1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 96247 1904 chr7 75793898 75797826 75795956 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 116505 1905 chr7 75993328 75995554 75993826 Y NA YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 4986 1906 chr7 76579448 76582970 76580257 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 27169 1907 chr7 79734317 79738531 79736454 N NA NA NA NA NA NA TMEM60 2306570 1908 chr7 7983210 7985434 7984620 N NA NA RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729852 302868 1909 chr7 81418392 81422794 81421396 N NA NA NA NA NA NA TMEM60 3990645 1910 chr7 81473807 81477448 81475740 N NA NA NA NA NA NA TMEM60 4046060 1911 chr7 82307542 82308279 82308256 N NA NA NA NA NA NA DMTF1 4473398 1912 chr7 84808494 84817327 84815608 N NA NA NA NA NA NA DMTF1 1964350 1913 chr7 84858663 84860743 84860087 N NA NA NA NA NA NA DMTF1 1920934 1914 chr7 85634792 85637590 85636436 N NA NA NA NA NA NA DMTF1 1144087 1915 chr7 90210220 90268995 90250761,90226292,90252329,90254107 Y,N,N,N NA;NA;NA;NA NA CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CLDN12 177572 1916 chr7 92600240 92637011 92610334,92611849,92600563 N,N,N NA;NA;NA NA CDK6,FAM133B,RBM48 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDK6 134299 1917 chr8 101346998 101350253 101349139 N NA NA NA NA NA NA POLR2K 184159 1918 chr8 101505816 101508272 101507232 N NA NA RNF19A,GRHL2,SPAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANKRD46 63740 1919 chr8 103595328 103600062 103595683,103598473 N,N NA;NA NA UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBR5 170411 1920 chr8 103674102 103678571 103675064 N NA NA AZIN1,UBR5,KLF10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 197826 1921 chr8 1038395 1042446 1039331 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 5221623 1922 chr8 103989725 104026603 104010270,103991484 N,N NA;NA ATP6V1C1 ATP6V1C1,AZIN1,CTHRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1C1 6645 1923 chr8 111067600 111070775 111068716 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 515671 1924 chr8 111143126 111147155 111145363 N NA NA NA NA NA NA EBAG9 591197 1925 chr8 11734648 11736533 11735492 Y CTSB NA CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A,GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 BLK 383127 1926 chr8 118450561 118457817 118451911,118455792 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MED30 75148 1927 chr8 125209163 125211542 125210212 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRMT12 251506 1928 chr8 129465043 129467327 129465234 N NA NA NA NA NA NA PVT1 658264 1929 chr8 130177035 130188239 130185375,130179051 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PVT1 1370256 1930 chr8 130279148 130284878 130284709 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 1472369 1931 chr8 130361980 130394635 130363544,130394236 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PVT1 1555201 1932 chr8 130416340 130464484 130461681,130459346 N,N NA;NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 PVT1 1609561 1933 chr8 130512356 130571891 130551644,130568478,130548712,130559283,130564398 Y,Y,N,Y,Y NA;NA;NA;NA;NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 1705577 1934 chr8 130592184 130607288 130595274,130596644,130605257 Y,Y,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PVT1 1785405 1935 chr8 135730341 135734292 135732183 N NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 1146158 1936 chr8 136036828 136040595 136038451 N NA NA NA NA NA NA ST3GAL1 1452645 1937 chr8 136065351 136070279 136067353 N NA NA NA NA NA NA ST3GAL1 1481168 1938 chr8 136079475 136083902 136080933 N NA NA NA NA NA NA ST3GAL1 1495292 1939 chr8 142273680 142277656 142276314 N NA NA PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 154351 1940 chr8 144271501 144274299 144272640 Y NA NA NA NA NA NA ZNF696 99260 1941 chr8 145908600 145913486 145911336,145911329 N,N NA;NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF251 67484 1942 chr8 15273755 15303863 15274999 N NA NA NA NA NA NA CNOT7 1800524 1943 chr8 15362008 15373865 15362192 N NA NA NA NA NA NA CNOT7 1730522 1944 chr8 16135845 16151016 16150325 N NA NA NA NA NA NA CNOT7 953371 1945 chr8 16288365 16317402 16314535,16316079,16310499 N,N,N NA;NA;NA NA MSR1,TUSC3 IMR90 Hi-C 24141950 CNOT7 786985 1946 chr8 16401679 16426570 16405221,16409093,16423309,16403947 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 CNOT7 677817 1947 chr8 16460005 16463856 16461159 N NA NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 CNOT7 640531 1948 chr8 18908197 18944026 18942470,18930971 N,N NA;NA NA PSD3,LOC100128993,SH2D4A,CSGALNACT1,INTS10 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 1110678 1949 chr8 18951655 18955310 18953542 Y NA NA LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 1099394 1950 chr8 20537668 20538635 20538009 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 482964 1951 chr8 2118485 2123703 2122335 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 4140366 1952 chr8 2161446 2163576 2162910 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 4100493 1953 chr8 2487067 2500610 2500445 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 3763459 1954 chr8 2519032 2617738 2591180,2586303 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100287015 3646331 1955 chr8 26114662 26116770 26115722 N NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 32237 1956 chr8 26297341 26300371 26298497 N NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3L 56818 1957 chr8 265218 268725 267481 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 5995344 1958 chr8 28257086 28261414 28258803,28260349 Y,N HMBOX1,HMBOX1;NA NA ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELP3 306502 1959 chr8 29355092 29357912 29356966 N NA NA LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 582737 1960 chr8 29384750 29388637 29387271 N NA NA C8orf75,DUSP4,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 552012 1961 chr8 29886083 29887421 29886841 N NA NA C8orf75,HMBOX1,KIF13B,DUSP4,LOC286135 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 53228 1962 chr8 37132292 37134178 37133284 N NA NA ERLIN2,ZNF703 IMR90 Hi-C 24141950 PROSC 485923 1963 chr8 37257899 37261647 37259546,37261115 N,N NA;NA NA KCNU1,ZNF703,LOC728024,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PROSC 358454 1964 chr8 38501171 38503972 38502511 N NA NA FGFR1,C8orf86,WHSC1L1,LETM2,RNF5P1,BAG4,TACC1,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 LETM2 257212 1965 chr8 39947 41555 40471 N NA NA NA NA NA NA LOC100287015 6222514 1966 chr8 41995510 42000732 41998072 Y NA NA KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT6A 86005 1967 chr8 42507940 42513227 42511783 N NA NA SLC20A2,VDAC3,C8orf40,KAT6A,DKK4,CHRNB3,PLAT,AP3M2,POLB,CHRNA6,RNF170 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf40 111642 1968 chr8 52873605 52876222 52874931 N NA NA NA NA NA NA PCMTD1 61870 1969 chr8 52919939 52921145 52921116 N NA NA PCMTD1 IMR90 Hi-C 24141950 PCMTD1 108204 1970 chr8 53642327 53646658 53642489 N NA RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 15301 1971 chr8 54448334 54450786 54449165 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 305064 1972 chr8 54569044 54571520 54570502 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 184330 1973 chr8 55420796 55422331 55421497 N NA NA NA NA NA NA MRPL15 373015 1974 chr8 55669290 55673042 55671021 N NA NA NA NA NA NA MRPL15 621509 1975 chr8 55930033 55933290 55931691 N NA NA NA NA NA NA TGS1 752501 1976 chr8 55936954 55940105 55938871 N NA NA NA NA NA NA TGS1 745686 1977 chr8 57610021 57613446 57611850 N NA NA NA NA NA NA CHCHD7 485706 1978 chr8 58657519 58659442 58658470 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 664381 1979 chr8 58714447 58715545 58715021 N NA NA NA NA NA NA UBXN2B 608278 1980 chr8 60059002 60061663 60060408 N NA NA NA NA NA NA NSMAF 486598 1981 chr8 60068612 60068785 60068619 N NA NA NA NA NA NA NSMAF 496208 1982 chr8 60212820 60215411 60213643 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 NSMAF 640416 1983 chr8 60571028 60572279 60571189 N NA NA NA NA NA NA NSMAF 998624 1984 chr8 60968551 60970855 60969704 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 620469 1985 chr8 61556940 61567865 61564695,61566521 N,N NA;NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 23459 1986 chr8 61820288 61832098 61822256,61824979,61829222 N,Y,Y NA;NA;CHD7 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 228964 1987 chr8 61976526 61997766 61977122 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 385202 1988 chr8 66852473 66866612 66864244,66860890,66858632 Y,N,N RRS1,PDE7A;NA;NA NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 98504 1989 chr8 727650 747005 735938,740014,741913,744012 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC100287015 5517064 1990 chr8 74972261 74974902 74973568 N NA NA STAU2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM70 83884 1991 chr8 75108159 75125088 75111567 N NA NA NA NA NA NA TMEM70 219782 1992 chr8 75482275 75485422 75483893 N NA NA NA NA NA NA TMEM70 593898 1993 chr8 81288766 81291140 81289840 Y ZBTB10 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 107308 1994 chr8 81343768 81345932 81344706 N NA NA NA NA NA NA ZBTB10 52516 1995 chr8 81455916 81462513 81456217,81457823 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZBTB10 57468 1996 chr8 81789088 81790483 81789917 N NA NA NA NA NA NA PAG1 233820 1997 chr8 82036059 82058360 82047265,82053853,82042864 N,N,Y NA;NA;PAG1 PAG1 PAG1,ZBTB10 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 11756 1998 chr8 82064260 82076946 82066420 N NA PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 39957 1999 chr8 82965130 82967854 82966237 N NA NA NA NA NA NA SNX16 210609 2000 chr8 84207081 84210590 84208426 N NA NA NA NA NA NA SNX16 1452560 2001 chr8 84228228 84231625 84230312 N NA NA NA NA NA NA SNX16 1473707 2002 chr8 86975052 86977961 86976263 N NA NA NA NA NA NA LRRCC1 955729 2003 chr8 8958458 8963079 8958620 N NA NA ERI1,TNKS,LOC157273 IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 98144 2004 chr8 98609125 98611426 98610646 N NA NA MATN2,MTDH,HRSP12,C8orf47,LAPTM4B,RPL30,PTDSS1,SDC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL30 446392 2005 chr8 98651722 98653550 98652395 N NA NA NA NA NA NA RPL30 404268 2006 chr9 100805997 100811211 100807809 N NA NANS C9orf156,ANP32B K562 ChIA-PET 22265404 NANS 7748 2007 chr9 102057608 102060313 102058920 N NA NA NR4A3,STX17,INVS,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC61B 73038 2008 chr9 103173094 103175632 103174071 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 57835 2009 chr9 105966290 105968961 105967319 N NA NA NA NA NA NA SMC2 887580 2010 chr9 107079040 107080365 107079744 N NA NA NA NA NA NA SMC2 222499 2011 chr9 107752717 107754916 107753785 N NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC286367 216084 2012 chr9 110018158 110020101 110018341 N NA RAD23B ZNF462,RAD23B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAD23B 25416 2013 chr9 114596511 114597731 114596672 N NA NA UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84 IMR90 Hi-C 24141950 HSDL2 544458 2014 chr9 116451493 116459295 116452830 N NA NA WDR31,BSPRY,ZNF618,COL27A1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE3 278464 2015 chr9 116531062 116541355 116535333,116538271 N,N NA;NA NA ZNF618,AMBP IMR90 Hi-C 24141950 POLE3 358033 2016 chr9 116554576 116557428 116556109 N NA NA ZNF618,AMBP,COL27A1,ORM2,AKNA,ORM1 IMR90 Hi-C 24141950 POLE3 381547 2017 chr9 123832184 123836708 123834326 Y TRAF1,TRAF1,CNTRL CNTRL CNTRL,TRAF1,MEGF9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTRL 13866 2018 chr9 124285912 124287147 124286426 N NA NA GGTA1P,DAB2IP,TTLL11,RAB14 IMR90 Hi-C 24141950 CNTRL 435338 2019 chr9 126063378 126069242 126067217,126063682 N,N NA;NA NA RABGAP1,STRBP,MIR600HG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR600HG 185622 2020 chr9 126071194 126075841 126073991 N NA NA STRBP IMR90 Hi-C 24141950 MIR600HG 193438 2021 chr9 126088026 126104938 126102295,126089172 N,N NA;NA NA STRBP,RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,CRB2,DENND1A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR600HG 210270 2022 chr9 126977713 126980516 126979163 Y DENND1A,NEK6,NEK6 NA DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129034 135236 2023 chr9 127004019 127007773 127005076 N NA NA NEK6,DENND1A IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129034 107979 2024 chr9 129335316 129337006 129335558 N NA NA FAM125B,NRON,LMX1B IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 230279 2025 chr9 129546264 129548959 129547824 N NA ZBTB43 LMX1B,ZBTB43 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 18326 2026 chr9 12971670 12974141 12973059 N NA NA NA NA NA NA SNAPC3 2448641 2027 chr9 130006731 130010668 130009244,130007545 N,N NA;NA NA RALGPS1,GARNL3,SLC2A8,ZNF79,RPL12,LRSAM1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF79 175985 2028 chr9 131421510 131429617 131427989,131421942 N,N NA;NA WDR34,SET WDR34 K562 ChIA-PET 22265404 WDR34 2381 2029 chr9 132142983 132148744 132146022 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 LOC100506190 102195 2030 chr9 132174090 132178023 132176083 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 72916 2031 chr9 132219134 132229515 132221905 N NA LOC100506190 PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190,PRRX2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 21424 2032 chr9 134242225 134251168 134248908 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 54309 2033 chr9 137106859 137108512 137107604 N NA NA BRD3,RNU6ATAC,RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 SURF2 883438 2034 chr9 137184625 137187143 137185880 N NA NA RXRA MCF7 ChIA-PET 22265404 SURF2 961204 2035 chr9 137374872 137386313 137380571,137383321,137376412 N,N,N NA;NA;NA NA COL5A1,RNU6ATAC,WDR5 IMR90 Hi-C 24141950 SURF2 1151451 2036 chr9 137392763 137399159 137394003 N NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 SURF2 1169342 2037 chr9 138174984 138176548 138175673,138175684 N,N NA;NA NA PAEP,OLFM1,LOC100506599,LOC100130954 IMR90 Hi-C 24141950 DNLZ 1081693 2038 chr9 139147984 139154894 139149990 N NA NA QSOX2,LHX3,C9orf69 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DNLZ 103347 2039 chr9 139595109 139596376 139595768 N NA SNHG7,LCN6 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNHG7 26260 2040 chr9 19229066 19266375 19230917,19234564,19230411 N,N,N NA;NA;NA NA DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6 113860 2041 chr9 20064573 20067057 20065688 N NA NA KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 ACER2 655648 2042 chr9 2233260 2236291 2234548 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 217918 2043 chr9 2240883 2244877 2242251 N NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020,SMARCA2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA2 225541 2044 chr9 2287780 2294877 2292304,2290836 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SMARCA2 272438 2045 chr9 24931175 24934845 24932456 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 1957981 2046 chr9 2875296 2876505 2876066 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 31166 2047 chr9 31345850 31348483 31347239 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 1177839 2048 chr9 36413148 36447050 36421418,36446559,36418043 N,N,N NA;NA;NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 11953 2049 chr9 36482114 36490380 36487818 N NA NA RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 80919 2050 chr9 36503258 36505905 36504139 N NA NA RNF38 IMR90 Hi-C 24141950 MELK 66954 2051 chr9 36764499 36768405 36766132 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 191640 2052 chr9 42247058 42260169 42251325 N NA NA NA NA NA NA MCART1 4342708 2053 chr9 44243263 44248097 44245730 N NA NA NA NA NA NA MCART1 6338913 2054 chr9 44867370 44868955 44867846 N NA NA NA NA NA NA MCART1 6963020 2055 chr9 45439793 45486160 45439892,45441827 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MCART1 7535443 2056 chr9 46379795 46381932 46380838 N NA NA NA NA NA NA MCART1 8475445 2057 chr9 66454543 66462455 66458196 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642236 1991920 2058 chr9 66473145 66474286 66474086 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642236 1980089 2059 chr9 66551979 66555231 66553169,66553572 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 1899144 2060 chr9 6679382 6696519 6681320,6687848 Y,N UHRF2,KDM4C;NA NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM4C 61122 2061 chr9 66832117 66839393 66838735 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642236 1614982 2062 chr9 66965034 66965564 66965445 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1488811 2063 chr9 6702016 6708892 6702538,6704280 N,N NA;NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 48749 2064 chr9 67295763 67303017 67297636,67301623 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 1151358 2065 chr9 6750021 6751671 6751096 N NA KDM4C KDM4C K562 ChIA-PET 22265404 KDM4C 5970 2066 chr9 68298773 68306234 68299270 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 148141 2067 chr9 70205662 70211671 70211513 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 278506 2068 chr9 70641282 70657553 70645998 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 151105 2069 chr9 73032669 73037658 73034861 Y SMC5,KLF9 NA TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMC5 158791 2070 chr9 74406998 74412139 74410454 Y FAM108B1,TMEM2 TMEM2 NA NA NA NA TMEM2 23198 2071 chr9 76951402 76954626 76953591 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 613176 2072 chr9 78033049 78034829 78033640 N NA NA NA NA NA NA OSTF1 329651 2073 chr9 80711326 80713609 80712462 N NA NA NA NA NA NA CEP78 137382 2074 chr9 80815347 80818394 80816240 N NA CEP78 NA NA NA NA CEP78 32597 2075 chr9 82424789 82430173 82428235 N NA NA NA NA NA NA TLE4 237911 2076 chr9 82430999 82437372 82432676,82435265 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TLE4 244121 2077 chr9 82695874 82705541 82697312,82703414 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TLE4 508996 2078 chr9 83838324 83840631 83839274 N NA NA NA NA NA NA TLE4 1651446 2079 chr9 83986747 83989853 83987845 N NA NA NA NA NA NA TLE4 1799869 2080 chr9 85371600 85382794 85377313,85380510 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIF27 1153548 2081 chr9 85405122 85406962 85406404 N NA NA NA NA NA NA KIF27 1129380 2082 chr9 89189127 89193441 89191079 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC6 219725 2083 chr9 89199554 89202873 89200529 N NA NA GAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 230152 2084 chr9 90689221 90692510 90691511 N NA NA SPIN1,NXNL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GAS1 1127117 2085 chr9 90806852 90815694 90808793,90812543 N,N NA;NA NA NXNL2,SPIN1,LOC286238,MIR4289,S1PR3,SHC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKS2 1110419 2086 chr9 90858466 90861288 90859047 N NA NA NXNL2 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 1064825 2087 chr9 90875668 90879717 90877688 N NA NA NXNL2,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 1046396 2088 chr9 90880493 90882325 90881499 N NA NA NXNL2,S1PR3,SHC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKS2 1043788 2089 chr9 90932792 90942400 90934265,90939005 N,N NA;NA NA LOC392364,NXNL2,DAPK1,SPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 983713 2090 chr9 90952626 90958439 90954984 N NA NA NXNL2,SPIN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKS2 967674 2091 chr9 92150404 92152398 92151381 N NA NA SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SECISBP2 216992 2092 chr9 92459958 92462214 92461115 N NA NA UNQ6494 IMR90 Hi-C 24141950 SECISBP2 526546 2093 chr9 92918199 92928709 92924718,92925464 N,N NA;NA NA SYK IMR90 Hi-C 24141950 SECISBP2 984787 2094 chr9 92950617 92952899 92951473 N NA NA SYK,LOC286370,LOC340515,DIRAS2 IMR90 Hi-C 24141950 SECISBP2 1017205 2095 chr9 93557009 93559422 93558626 N NA NA SYK MCF7 ChIA-PET 22265404 AUH 564784 2096 chr9 93724299 93730432 93726343 N NA NA ROR2,LOC100129316,AUH,SYK,NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 393774 2097 chr9 93733168 93743059 93734460,93737486,93741695 N,Y,N NA;NA;NA NA ROR2,LOC100129316,AUH,MIR3910-2,MIR3910-1 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 381147 2098 chr9 95531929 95534695 95532709 N NA BICD2 BICD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BICD2 4846 2099 chr9 96646695 96678170 96673029,96675619 N,N NA;NA NA MIR4291,WNK2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM120A 432522 2100 chr9 97417547 97420001 97418686 N NA NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 68950 2101 chrX 10346688 10349892 10348130 N NA NA MID1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1X 915353 2102 chrX 11101232 11101769 11101613 N NA NA CLCN4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3 674509 2103 chrX 112131109 112134427 112132627 N NA NA NA NA NA NA ALG13 1206763 2104 chrX 115008506 115010838 115009465 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 3359373 2105 chrX 115064870 115067848 115066655 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 3302363 2106 chrX 119618876 119621700 119619855 N NA NA LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 MCTS1 116044 2107 chrX 119882093 119884824 119883206 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 118088 2108 chrX 122896135 122900769 122899110 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 29231 2109 chrX 123349359 123353741 123351523 Y SH2D1A NA NA NA NA NA STAG2 254884 2110 chrX 125605601 125607690 125606224 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2511126 2111 chrX 128810298 128813778 128813773,128812426 N,N NA;NA NA XPNPEP2 IMR90 Hi-C 24141950 SASH3 100114 2112 chrX 129114937 129131090 129123532,129116442 N,N NA;NA NA BCORL1,UTP14A,XPNPEP2,ZDHHC9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UTP14A 74840 2113 chrX 12966638 12977561 12975079,12971173,12969222,12976325 Y,N,Y,N TMSB4X,TLR7,TLR8;NA;TMSB4X,TLR7,TLR8;NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 15665 2114 chrX 13021962 13025725 13024061 N NA TMSB4X TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 28736 2115 chrX 13095991 13099972 13097423 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA NA NA NA NA TMSB4X 102765 2116 chrX 13102092 13111612 13105161,13110862 N,Y NA;TLR7,TLR8,TMSB4X NA TMSB4X,FAM9C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB4X 108866 2117 chrX 13490510 13494164 13492253 N NA NA NA NA NA NA TCEANC 177143 2118 chrX 135989432 136061509 136033267,135991909,136058614 N,N,N NA;NA;NA RBMX RBMX,ARHGEF6,CD40LG K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBMX 26493 2119 chrX 139892870 139904559 139903187 N NA NA NA NA NA NA ATP11C 978423 2120 chrX 14514768 14516448 14515615 N NA NA NA NA NA NA FANCB 374736 2121 chrX 147391491 147393835 147392890 N NA NA NA NA NA NA IDS 1193049 2122 chrX 147461643 147463576 147462852 N NA NA NA NA NA NA IDS 1123308 2123 chrX 149714998 149717258 149715827 N NA MTM1 MAMLD1,MTM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTM1 19789 2124 chrX 152418903 152421780 152419857 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP4 769934 2125 chrX 152425286 152429073 152426571 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP4 762641 2126 chrX 153400787 153403679 153402520 N NA NA MECP2,HCFC1,RENBP,NAA10,TKTL1,RPL10,DNASE1L1,FLNA,MTCP1NB IMR90,K562,HELA,H1ESC,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 IRAK1 115445 2127 chrX 16006580 16008444 16007806 N NA NA NA NA NA NA ZRSR2 198006 2128 chrX 1664130 1668107 1665920 N NA P2RY8 NA NA NA NA P2RY8 8093 2129 chrX 16899827 16902208 16901086 N NA RBBP7 RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 11293 2130 chrX 18692391 18695835 18693142,18695181 Y,N PHKA2,CDKL5;NA NA NA NA NA NA PHKA2 306645 2131 chrX 22046778 22047385 22046932 N NA NA NA NA NA NA MBTPS2 189122 2132 chrX 22715555 22719405 22717051 N NA NA NA NA NA NA MBTPS2 857899 2133 chrX 30606478 30609806 30607906 N NA CXorf21 NA NA NA NA CXorf21 10445 2134 chrX 33586823 33654047 33652457,33609852 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CXorf21 2990790 2135 chrX 33702275 33759039 33723772,33720393,33744318,33744966,33739351 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CXorf21 3106242 2136 chrX 33889762 33892193 33889920 N NA NA NA NA NA NA CXorf21 3293729 2137 chrX 357530 359610 358632 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 1151429 2138 chrX 3638383 3641172 3640319 N NA NA PRKX IMR90 Hi-C 24141950 P2RY8 1982346 2139 chrX 3785818 3803002 3799478 N NA NA NA NA NA NA P2RY8 2129781 2140 chrX 3824179 3841601 3837900 N NA NA NA NA NA NA P2RY8 2168142 2141 chrX 38736562 38742872 38738726 N NA NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 75877 2142 chrX 39002075 39006968 39003765 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 341390 2143 chrX 39546793 39549150 39547982 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 886108 2144 chrX 39630521 39632610 39631801 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 969836 2145 chrX 39645672 39647458 39646344 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 984987 2146 chrX 39795357 39799053 39796594 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 1134672 2147 chrX 39870131 39875569 39873901 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MID1IP1 1209446 2148 chrX 41132253 41137868 41135774 N NA NA DDX3X,USP9X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASK 644419 2149 chrX 42144054 42146049 42144352 N NA NA NA NA NA NA CASK 361767 2150 chrX 42794087 42795249 42795213 N NA NA NA NA NA NA CASK 1011800 2151 chrX 42800622 42805013 42803036 Y NA NA NA NA NA NA CASK 1018335 2152 chrX 45629724 45631890 45630529 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 674734 2153 chrX 47373035 47374096 47373607 N NA ZNF41 CDK16,USP11,UBA1,ARAF,SYN1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 30690 2154 chrX 48516586 48519582 48517231 N NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 35549 2155 chrX 48594080 48597561 48595898 N NA SUV39H1 SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUV39H1 38949 2156 chrX 52003260 52006338 52005017 Y NA NA NA NA NA NA FAM156A 919984 2157 chrX 53798318 53799841 53798630 N NA NA NA NA NA NA HUWE1 84645 2158 chrX 54663628 54667934 54665864 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 106984 2159 chrX 55815989 55833652 55816146 N NA NA NA NA NA NA RRAGB 71879 2160 chrX 55933794 55953030 55951639,55935112 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RRAGB 189684 2161 chrX 64062520 64065493 64063394 N NA NA NA NA NA NA ZC4H2 189131 2162 chrX 64408018 64411855 64408272 N NA NA NA NA NA NA ZC4H2 153394 2163 chrX 65145065 65147440 65146427 N NA NA VSIG4 K562 ChIA-PET 22265404 MSN 257554 2164 chrX 65292278 65293940 65293613 N NA NA NA NA NA NA MSN 404767 2165 chrX 67000326 67002485 67000890 N NA NA NA NA NA NA PJA1 1382880 2166 chrX 68113057 68116217 68114615 N NA NA PJA1 IMR90 Hi-C 24141950 PJA1 269148 2167 chrX 70240922 70256686 70255566,70246525 N,N NA;NA NA SNX12 IMR90 Hi-C 24141950 FOXO4 59313 2168 chrX 72985906 72987916 72986589 N NA NA NA NA NA NA JPX 176243 2169 chrX 73136513 73138731 73137372 N NA JPX JPX,XIST,FTX IMR90 Hi-C 24141950 JPX 25428 2170 chrX 75362078 75369356 75365355,75368944,75363194 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RLIM 1527617 2171 chrX 75370465 75372743 75371608 N NA NA NA NA NA NA RLIM 1536004 2172 chrX 78391549 78396101 78394511 Y P2RY10,GPR174 GPR174 NA NA NA NA GPR174 30368 2173 chrX 78512503 78539379 78514703 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA GPR174 86034 2174 chrX 86958157 86959370 86958984 N NA NA NA NA NA NA CHM 1655591 2175 chrX 89712676 89714993 89713353 N NA NA NA NA NA NA FAM133A 3214019 2176 chrX 9307190 9310202 9309147 Y TBL1X,TBL1X NA TBL1X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 121133 2177 chrX 985616 988021 987358 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 523018 2178 chrX 99410382 99413668 99411511 N NA NA NA NA NA NA CSTF2 661680 2179 chrY 1614245 1617950 1615933 N NA P2RY8 NA NA NA NA P2RY8 8208 2180 chrY 3416856 3418699 3417773 N NA NA NA NA NA NA CD99 857628 2181 chrY 3903724 3905883 3904060 N NA NA NA NA NA NA CD99 1344496 2182 chrY 8979384 8979692 8979534 N NA NA NA NA NA NA CD99 6420156 2183 chrY 935616 938005 937121 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 531419