Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 100258653 100262553 100259547 N NA NA NA NA NA NA AGL 53087 2 chr1 100299320 100302938 100301839 N NA AGL CDC14A,AGL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGL 12702 3 chr1 104677053 104678454 104677885 N NA NA NA NA NA NA AMY2A 517054 4 chr1 104804847 104806757 104805940 N NA NA NA NA NA NA AMY2A 644848 5 chr1 1067680 1069214 1068189 N NA NA C1orf159,LOC254099,TNFRSF18,SDF4,TNFRSF4,TTLL10,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223,MIR200B,B3GALT6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDF4 98233 6 chr1 108587398 108589405 108588337 N NA NA VAV3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A24 153569 7 chr1 10862600 10866537 10864611 Y NA CASZ1 PEX14,CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 5893 8 chr1 10873464 10876918 10875522 N NA CASZ1 PEX14,CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 16757 9 chr1 109069322 109079571 109076277,109078068 N,N NA;NA NA FAM102B MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPF38B 155361 10 chr1 110309133 110310402 110309714 N NA NA CSF1,EPS8L3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMPD2 146674 11 chr1 111397944 111400645 111399122 N NA NA NA NA NA NA LRIF1 105921 12 chr1 112931699 112936399 112933598 N NA CTTNBP2NL CTTNBP2NL,WNT2B,MIR4256,ST7L,CAPZA1,RHOC,MOV10,PPM1J IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTTNBP2NL 2401 13 chr1 113303868 113308398 113305255 N NA NA FAM19A3,PPM1J,RHOC,LRIG2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOC 53843 14 chr1 113368236 113371498 113369859 N NA NA RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOC 118211 15 chr1 113391271 113397422 113392440 N NA NA FAM19A3,PPM1J,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A1 101553 16 chr1 113603799 113606584 113605509 N NA LRIG2 LRIG2 K562 ChIA-PET 22265404 LRIG2 9247 17 chr1 113788636 113790887 113789622 N NA NA MAGI3 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI3 142588 18 chr1 113795691 113800422 113798480,113796858 N,N NA;NA NA MAGI3 IMR90 Hi-C 24141950 MAGI3 133053 19 chr1 114887699 114890004 114888828 N NA NA SYT6,OLFML3,HIPK1,BCAS2,DENND2C,TRIM33,CSDE1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIM33 163777 20 chr1 115640509 115648026 115642111 N NA NA SYCP1,CASQ2,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 SIKE1 317201 21 chr1 11628006 11631856 11629886 N NA NA PTCHD2,MTOR IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD2 88711 22 chr1 116352010 116355770 116353956 N NA NHLH2 SLC22A15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NHLH2 27977 23 chr1 11649924 11654155 11651811 N NA NA NA NA NA NA MAD2L2 97523 24 chr1 116744490 116747148 116745956 N NA NA NA NA NA NA MAB21L3 90114 25 chr1 116834258 116837784 116835785 N NA NA ATP1A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1A1OS 123460 26 chr1 116863657 116869140 116865750 N NA NA ATP1A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1A1OS 92104 27 chr1 116870887 116875918 116872645 N NA NA ATP1A1,IGSF3,SLC22A15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP1A1OS 85326 28 chr1 116995206 116998899 116997820 N NA ATP1A1OS ATP1A1OS,MAB21L3,ATP1A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP1A1OS 33962 29 chr1 117025170 117033392 117032194,117026396 Y,N ATP1A1,ATP1A1,CD58;NA NA ATP1A1OS,SLC22A15,ATP1A1,MAB21L3,CD58,SLC25A24 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP1A1OS 63926 30 chr1 117395464 117397504 117396532 N NA NA TTF2,PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 IGSF3 185150 31 chr1 117810486 117813008 117811635 N NA NA VTCN1,TTF2,TRIM45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN1A2 97077 32 chr1 117881723 117883548 117882794 N NA MAN1A2 MAN1A2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAN1A2 26537 33 chr1 118133143 118135354 118134582 N NA NA GDAP2,MAN1A2,FAM46C IMR90 Hi-C 24141950 MAN1A2 223058 34 chr1 118319050 118321597 118320445 N NA NA NA NA NA NA WDR3 150775 35 chr1 11949859 11952595 11950608 N NA PLOD1 CLCN6,NPPA,MFN2,PLOD1,NPPB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLOD1 42129 36 chr1 120201204 120205485 120203096 N NA PHGDH ZNF697 IMR90 Hi-C 24141950 PHGDH 48934 37 chr1 120217099 120219399 120218194 N NA PHGDH ZNF697,PHGDH,LOC644242 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHGDH 35020 38 chr1 120228046 120231302 120230141 N NA PHGDH ZNF697,LOC644242,PHGDH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHGDH 23117 39 chr1 120409382 120412279 120411035 N NA NA NBPF7 IMR90 Hi-C 24141950 PHGDH 154963 40 chr1 120677816 120685718 120679308 N NA NA NA NA NA NA NOTCH2 65499 41 chr1 120790163 120823205 120794964,120821877,120798594 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 82829 42 chr1 121136528 121149421 121137825 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 230494 43 chr1 13869910 13872493 13870797 N NA NA NA NA NA NA PRDM2 154242 44 chr1 14219709 14355956 14220247 N NA NA PRDM2,KAZN,LRRC38 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 192974 45 chr1 142618000 142627456 142618713 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 1288292 46 chr1 142653275 142662407 142656793 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 1253341 47 chr1 142886348 142892396 142891035 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 1023352 48 chr1 143152583 143158851 143153141 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 756897 49 chr1 143277844 143285262 143281383 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 630486 50 chr1 143433611 143469344 143467689 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 446404 51 chr1 143645925 143648722 143647349 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 267026 52 chr1 143656396 143659396 143657574 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 256352 53 chr1 143671756 143675743 143673528,143672799 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 240005 54 chr1 144394534 144396693 144395316 N NA NA NA NA NA NA NBPF9 218266 55 chr1 144532265 144535483 144533853 Y PDE4DIP NA PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NBPF9 79476 56 chr1 145053859 145077000 145075650 N NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,PFN1P2,NBPF10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 13867 57 chr1 145394764 145398078 145395585,145397961 N,N NA;NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40384 58 chr1 145968033 145971613 145969548,145969876 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPR89C 84165 59 chr1 145978942 145980294 145979205 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 95074 60 chr1 146008066 146010560 146009152 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 72205 61 chr1 14605300 14708983 14605458 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 578565 62 chr1 146118524 146121344 146119758 N NA NBPF24 NA NA NA NA NBPF24 35759 63 chr1 146126220 146128876 146127793 N NA NBPF24 NA NA NA NA NBPF24 43455 64 chr1 146341197 146344370 146342959 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 258432 65 chr1 146577489 146583724 146578307,146581600 N,N NA;NA NA FMO5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAB2 60405 66 chr1 146790669 146792604 146790759 N NA NA NA NA NA NA CHD1L 76378 67 chr1 146798874 146800208 146799300 N NA NA NA NA NA NA CHD1L 84583 68 chr1 146821906 146824527 146823015 N NA NA NA NA NA NA CHD1L 107615 69 chr1 147509764 147513332 147511259 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 109258 70 chr1 147520647 147521582 147520938 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 103019 71 chr1 147549554 147552349 147550983 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 72252 72 chr1 147660547 147663324 147661595 N NA NBPF24 NA NA NA NA NBPF24 35946 73 chr1 147668436 147670473 147669598 N NA NBPF24 NA NA NA NA NBPF24 43835 74 chr1 147715923 147718991 147718171 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 91322 75 chr1 147733767 147737302 147735661 N NA NA NA NA NA NA NBPF24 109166 76 chr1 147805271 147810122 147807027,147809241 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA NBPF24 180670 77 chr1 147833399 147836423 147834825 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 189425 78 chr1 147859269 147863195 147861036 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 162653 79 chr1 147873024 147885642 147874956 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 140206 80 chr1 148239370 148243292 148241317 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 213522 81 chr1 148246092 148249521 148248280 N NA NA NA NA NA NA NBPF14 220244 82 chr1 148332655 148357690 148356452 N NA NA NA NA NA NA NBPF15 200498 83 chr1 148851323 148868473 148865168,148865155,148857606,148853368 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA LOC645166 59813 84 chr1 148892122 148900507 148892711 N NA LOC645166 NA NA NA NA LOC645166 27779 85 chr1 149134315 149139723 149138391 N NA NA NA NA NA NA LOC645166 206029 86 chr1 149192583 149195417 149194468 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BF 203812 87 chr1 149203976 149206528 149205858 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BF 192701 88 chr1 149215098 149217175 149215977 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BF 182054 89 chr1 149222512 149226397 149223767,149224401 N,N NA;NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 HIST2H2BF 172832 90 chr1 149229681 149242472 149230762 N NA NA LOC388692 IMR90 Hi-C 24141950 HIST2H2BF 156757 91 chr1 149512608 149516483 149514426 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 59779 92 chr1 151444439 151448619 151445911 Y C1orf56,RIIAD1,OAZ3 POGZ,CGN RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D,THEM5 IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562,GM12878 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 POGZ 12498 93 chr1 152018784 152022593 152020693 N NA S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 9273 94 chr1 152427365 152429105 152428032 N NA NA CRNN IMR90 Hi-C 24141950 S100A11 417854 95 chr1 157209410 157212387 157210636 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF11 194248 96 chr1 15921658 15932785 15929609 N NA DDI2 DNAJC16,AGMAT,DDI2,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82,FBLIM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 11168 97 chr1 160882434 160884001 160883355 N NA NA CD244,ITLN2 IMR90 Hi-C 24141950 F11R 107132 98 chr1 161358552 161361229 161359933 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 74386 99 chr1 161367810 161371062 161369399 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83644 100 chr1 161382104 161384472 161382939 N NA NA NA NA NA NA SDHC 97938 101 chr1 161413448 161414010 161413601 N NA NA NDUFS2,DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 129282 102 chr1 162842727 162845690 162844015 N NA NA C1orf110,RGS4,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 82231 103 chr1 162853773 162856452 162855139 N NA NA C1orf110,RGS4,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 93277 104 chr1 162881581 162884635 162883270 N NA NA RGS5,RGS4,NUF2 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 121085 105 chr1 162899314 162902811 162901229 N NA NA RGS4,RGS5,NUF2 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B7 138818 106 chr1 163554458 163556925 163555739 N NA NA NA NA NA NA HSD17B7 793962 107 chr1 163775241 163777404 163776791 N NA NA NA NA NA NA PBX1 751193 108 chr1 164289704 164291412 164290603 N NA NA NA NA NA NA PBX1 237185 109 chr1 16501243 16503980 16502581 Y C1orf64 NA CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSG1 59679 110 chr1 165060959 165064042 165062309 N NA NA NA NA NA NA PBX1 532362 111 chr1 165130733 165133310 165132170 N NA NA LMX1A IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 466800 112 chr1 165342504 165347488 165345460,165343777 N,N NA;NA NA LOC400794,LMX1A,LRRC52,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 252622 113 chr1 165566178 165569452 165567532 N NA MGST3 RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 30658 114 chr1 166458325 166460142 166459285 N NA NA NA NA NA NA TADA1 385512 115 chr1 167131137 167137414 167132239,167135384 N,N NA;NA NA CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 POU2F1 52652 116 chr1 167166774 167169454 167168059 N NA POU2F1 DUSP27,CD247,POU2F1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU2F1 20612 117 chr1 167177102 167182309 167180706 N NA POU2F1 ILDR2,CD247,POU2F1,DUSP27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU2F1 7757 118 chr1 16838963 16843013 16840955 N NA CROCCP3 NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCCP3 19767 119 chr1 168435025 168437056 168436055 N NA NA NA NA NA NA TIPRL 286854 120 chr1 16846340 16848674 16846913 N NA CROCCP3 CROCC,CROCCP3,NBPF1,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 CROCCP3 27144 121 chr1 17220172 17224104 17222307 N NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 24341 122 chr1 17229376 17233141 17231519 Y PADI4,PADI2 CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15304 123 chr1 173991675 173993513 173992878 N NA RC3H1 ZBTB37,RC3H1,GAS5 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 29465 124 chr1 174043315 174046160 174044757 N NA NA LOC100506023,RC3H1 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 81105 125 chr1 175808703 175810226 175809277 N NA NA TNR IMR90 Hi-C 24141950 RFWD2 366144 126 chr1 176382085 176384110 176382245 N NA NA TNR,PAPPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RFWD2 205715 127 chr1 177553620 177555998 177554826 N NA NA NA NA NA NA RASAL2 506866 128 chr1 177619126 177621151 177620242 N NA NA ASTN1 IMR90 Hi-C 24141950 RASAL2 441713 129 chr1 177814338 177844498 177842376 N NA NA ASTN1,FAM5B,SEC16B IMR90 Hi-C 24141950 RASAL2 218366 130 chr1 178990273 178991897 178991187 N NA NA RALGPS2,C1orf220,FAM20B,RASAL2,C1orf49,ABL2 IMR90 Hi-C 24141950 ABL2 206922 131 chr1 179255965 179258994 179257255 N NA SOAT1 SOAT1,ABL2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOAT1 3855 132 chr1 179553082 179558228 179555507 Y TDRD5,TDRD5,TDRD5 NA NA NA NA NA TOR1AIP2 288713 133 chr1 180542640 180544881 180543724 N NA NA XPR1,ACBD6 IMR90 Hi-C 24141950 XPR1 56265 134 chr1 182195707 182199086 182197508 N NA NA NA NA NA NA GLUL 162255 135 chr1 184191074 184193142 184192511 N NA NA C1orf21,EDEM3,TSEN15,RGL1,GLT25D2 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf21 163008 136 chr1 184729403 184732683 184731168 N NA EDEM3 EDEM3 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDEM3 5362 137 chr1 185372125 185375351 185373478 N NA NA NA NA NA NA IVNS1ABP 85664 138 chr1 187728509 187730886 187729558 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1383619 139 chr1 18789280 18792906 18790963 N NA NA IGSF21,KLHDC7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH4A1 436387 140 chr1 188138631 188140600 188139815 N NA NA NA NA NA NA C1orf27 1793741 141 chr1 18924647 18928911 18925922 N NA NA PAX7 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 300382 142 chr1 193272537 193415013 193274736,193395708,193280414 N,N,N NA;NA;NA NA CDC73,B3GALT2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC73 181449 143 chr1 19336099 19341221 19337504 N NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH4A1 106806 144 chr1 193425945 193469671 193426914 N NA NA NA NA NA NA CDC73 334857 145 chr1 193492966 193511144 193494589 N NA NA NA NA NA NA CDC73 401878 146 chr1 196077195 196079396 196078356 N NA NA NA NA NA NA ASPM 1036428 147 chr1 197751666 197753911 197752792 N NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 7043 148 chr1 200269463 200272432 200271536 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 106734 149 chr1 201139207 201141013 201140398 N NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 15575 150 chr1 201234128 201237660 201236211 N NA PKP1 IGFN1,PKP1,LAD1,TNNT2,TNNI1 IMR90 Hi-C 24141950 PKP1 14920 151 chr1 202014396 202017029 202015584 N NA ELF3 ELF3,NAV1,RNPEP,ARL8A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELF3 34706 152 chr1 20203473 20206820 20204841 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2068 153 chr1 203235727 203239169 203237436 N NA BTG2 PPFIA4,ADORA1,ATP2B4,TMEM183A,BTG2,FMOD,LOC401980,MYBPH,CHI3L1,MYOG,CHIT1,LOC730227,PRELP,OPTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTG2 35495 154 chr1 203349506 203351591 203349964 N NA NA FMOD,ATP2B4,CHIT1,PRELP,LAX1,ZC3H11A IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 74842 155 chr1 203376814 203384963 203379846 N NA NA FMOD,BTG2,PRELP IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 102150 156 chr1 203387352 203397384 203396320 N NA NA PRELP,FMOD,ATP2B4,PPFIA4,BTG2,LOC730227 IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 112688 157 chr1 20356434 20363752 20356999,20359104 N,Y NA;PLA2G2A NA VWA5B1,PLA2G2C,UBXN10 IMR90 Hi-C 24141950 OTUD3 147546 158 chr1 204475058 204476901 204475955 N NA MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8606 159 chr1 204789981 204791600 204790839 N NA NFASC MDM4,LRRN2,NFASC IMR90 Hi-C 24141950 NFASC 6182 160 chr1 205424429 205428928 205426313 N NA NA LOC284576,LEMD1,KLHDC8A,MIR135B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELK4 173072 161 chr1 20575271 20578870 20577299 N NA NA VWA5B1,UBXN10,PLA2G2C,LOC339505,MUL1,CAMK2N1 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2N1 233858 162 chr1 20605685 20613043 20607332,20609186 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CAMK2N1 199685 163 chr1 206072591 206122928 206098029,206094536,206121341 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA AVPR1B 101355 164 chr1 206185221 206187535 206186320 N NA AVPR1B NA NA NA NA AVPR1B 36748 165 chr1 206489669 206501844 206491790 N NA SRGAP2 NA NA NA NA SRGAP2 14356 166 chr1 208120005 208127535 208124297,208126287 N,N NA;NA NA CD34 IMR90 Hi-C 24141950 CD46 194622 167 chr1 208134675 208142472 208137094 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD46 209292 168 chr1 208470979 208473458 208472174 N NA NA NA NA NA NA PLXNA2 53314 169 chr1 208614399 208621700 208619848 N NA NA NA NA NA NA PLXNA2 196734 170 chr1 208622642 208625587 208624129 N NA NA NA NA NA NA PLXNA2 204977 171 chr1 208710708 208714269 208712192 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 293043 172 chr1 209161435 209162665 209162353 N NA NA NA NA NA NA PLXNA2 743770 173 chr1 209687484 209692271 209691062 N NA NA NA NA NA NA C1orf74 265619 174 chr1 209698495 209712910 209699849,209701591,209704991 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C1orf74 244980 175 chr1 210464461 210468121 210466035 N NA HHAT SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHAT 33475 176 chr1 211317671 211320819 211319473 N NA NA HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RCOR3 111889 177 chr1 211394253 211397413 211395917 N NA RCOR3 HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RCOR3 35295 178 chr1 211687227 211690369 211688959 N NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61730 179 chr1 211714117 211716893 211715401 N NA SLC30A1 NEK2,RD3,SLC30A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 35206 180 chr1 211805572 211807410 211806701 N NA NA LINC00467,TRAF5,SLC30A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 53473 181 chr1 212727345 212734009 212732375 Y NA NA ATF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSL1 231130 182 chr1 2143654 2146317 2144289 N NA NA SKI,MORN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PANK4 311718 183 chr1 215711802 215714927 215713501 N NA KCTD3 CENPF,KCTD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD3 25808 184 chr1 21744145 21750877 21749503 N NA NBPF3 ECE1,ALPL,RAP1GAP,NBPF3,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 15744 185 chr1 21761729 21764249 21763527 N NA NBPF3 RAP1GAP,ECE1,NBPF3,ALPL IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 2372 186 chr1 218743098 218746618 218744705 N NA NA LOC728463,RRP15,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 284469 187 chr1 220472913 220474703 220473965 N NA RAB3GAP2 RAB3GAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB3GAP2 27070 188 chr1 220904379 220907336 220906117 N NA MARC2 C1orf115,MARC2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MARC2 14340 189 chr1 222018263 222020874 222019443 N NA NA MIA3,DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1A 742401 190 chr1 222637646 222640242 222638811 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 123033 191 chr1 22280869 22285645 22283790 N NA NA RAP1GAP,USP48,LDLRAD2,HSPG2,LINC00339,CDC42,CELA3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00339 66062 192 chr1 223672938 223675848 223674229 N NA NA CAPN8,TLR5,SUSD4 IMR90 Hi-C 24141950 TP53BP2 357826 193 chr1 224178251 224229488 224180394,224228219,224191717 Y,N,N NA;NA;NA NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 72303 194 chr1 224641541 224662129 224642306 N NA WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR26 19540 195 chr1 224689732 224693151 224691146 N NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67731 196 chr1 225070499 225073569 225071728 N NA DNAH14 CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 DNAH14 43787 197 chr1 225633417 225634633 225633788 N NA LBR TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 16860 198 chr1 22583207 22586028 22584357 N NA NA WNT4,EPHA8,C1QB IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 192316 199 chr1 225934138 225935640 225934580 N NA SRP9 NA NA NA NA SRP9 29875 200 chr1 227356 238615 236520 N NA NA NA NA NA NA LOC100133331 85277 201 chr1 22739024 22743090 22740870 Y NA ZBTB40 CDC42,WNT4,C1QC,C1QA,ZBTB40,EPHB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 35254 202 chr1 228056117 228057445 228056597 N NA NA NA NA NA NA C1orf35 233577 203 chr1 228915717 228918658 228917074 Y RHOU NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 240649 204 chr1 228937910 228943569 228941035 N NA NA NUP133,RHOU,ACTA1,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 262842 205 chr1 228987749 228991138 228989770 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 312681 206 chr1 228994993 228998526 228996264 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 319925 207 chr1 229022015 229024589 229023157 N NA NA NUP133,RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 346947 208 chr1 229037694 229041414 229039402 N NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 362626 209 chr1 229192472 229207385 229194863,229206124 N,Y NA;RHOU NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 NUP133 436703 210 chr1 229217941 229253150 229229497,229221377,229226808,229252532 Y,N,N,N RHOU;NA;NA;NA NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 NUP133 390938 211 chr1 229329749 229361385 229329996,229344298,229357685,229358656 N,N,Y,N NA;NA;RAB4A;NA NA RHOU,NUP133,RAB4A,C1orf96 IMR90 Hi-C 24141950 NUP133 282703 212 chr1 229362150 229365452 229363412 N NA NA RHOU,C1orf96,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 NUP133 278636 213 chr1 22955165 22956847 22955916 N NA NA NA NA NA NA ZBTB40 176821 214 chr1 229957027 229959543 229958040 N NA NA URB2,GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT2 243413 215 chr1 229978347 229983517 229980165 N NA NA GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT2 219439 216 chr1 230631444 230659082 230634619 N NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 PGBD5 118053 217 chr1 232799724 232802642 232801093 N NA NA TSNAX-DISC1,PCNXL2,KIAA1383 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 283728 218 chr1 232812941 232815807 232814358 N NA NA TSNAX-DISC1,PCNXL2,KIAA1383,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 270563 219 chr1 232899276 232902505 232900955 N NA NA PCNXL2,TSNAX-DISC1,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 183865 220 chr1 23301622 23303323 23302745 N NA KDM1A ZBTB40,C1QB,EPHB2,KDM1A,LUZP1,HNRNPR,MDS2 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 42618 221 chr1 234027544 234035279 234030439,234033125 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KCNK1 277794 222 chr1 234678716 234682805 234680730 N NA NA LOC100506795,IRF2BP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 62466 223 chr1 234949406 234955380 234953354,234951192 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100506810 89617 224 chr1 235087207 235101199 235098373 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 191057 225 chr1 235104208 235107738 235105655 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 184518 226 chr1 235132000 235135018 235133285 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 157238 227 chr1 238925158 238927645 238926613 N NA NA NA NA NA NA MTR 1966577 228 chr1 23944350 23947011 23946382 N NA NA E2F2,MDS2,ID3,RPL11 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 58065 229 chr1 240849684 240850919 240850386 N NA NA FMN2,GREM2 IMR90 Hi-C 24141950 FH 832166 230 chr1 240904715 240908660 240907038 N NA NA RGS7 IMR90 Hi-C 24141950 FH 774425 231 chr1 24245714 24248378 24246698 N NA PNRC2 GALE,HMGCL,SRSF10,LOC100506963,PITHD1 K562 ChIA-PET 22265404 PNRC2 37923 232 chr1 242831395 242834418 242832947 N NA NA PLD5 IMR90 Hi-C 24141950 CEP170 584290 233 chr1 243048499 243051228 243049537 N NA NA NA NA NA NA CEP170 367480 234 chr1 24344870 24348012 24345461 N NA SRSF10 LOC100506963,CNR2,LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,MIR378F,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,TCEB3,GALE,FUCA1,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF10 37917 235 chr1 244013030 244016802 244014847 N NA AKT3 LOC339529 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 6446 236 chr1 244063691 244068389 244066110 N NA NA SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 57107 237 chr1 244416210 244436837 244417663,244436439,244419439 N,N,N NA;NA;NA NA LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238,ADSS,C1orf100 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 178599 238 chr1 244462088 244464558 244462938 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 150878 239 chr1 24620211 24623068 24621332 N NA NA LOC284632,IL28RA,C1orf201,RCAN3,GRHL3,IL22RA1,NIPAL3,RCAN3AS,MYOM3,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 IL28RA 106446 240 chr1 247802032 247805336 247802806 N NA NA NA NA NA NA ZNF496 306987 241 chr1 249166555 249169653 249168256 N NA SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 ZNF692,PGBD2,MIR3124,SH3BP5L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF692 13240 242 chr1 25030555 25033640 25032220 N NA CLIC4 SRRM1,CLIC4,RUNX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 38120 243 chr1 25336826 25339689 25338891 N NA NA RUNX3 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 219324 244 chr1 25356980 25360980 25358921 N NA NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 198033 245 chr1 25466842 25469771 25468164 N NA NA RUNX3,GRHL3 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 89242 246 chr1 25523733 25526862 25525279 N NA SYF2,C1orf63 RUNX3,SYF2,CLIC4,C1orf63 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 32151 247 chr1 25916124 25927027 25916959 N NA NA TMEM50A,TMEM57,LDLRAP1,MAN1C1,LOC646471,SEPN1,FAM54B,C1orf135,PAQR7,STMN1,PAFAH2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM57 158736 248 chr1 26247962 26251545 26249940,26248518 N,N NA;NA STMN1 STMN1,PAFAH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STMN1 14969 249 chr1 26420729 26423019 26421424 N NA NA PDIK1L,FAM110D,CATSPER4,CNKSR1,ZNF593,AIM1L,PAFAH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNKSR1 80962 250 chr1 26942532 26950084 26947833 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72438 251 chr1 27353042 27355535 27354354 N NA TRNP1 FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRNP1 32847 252 chr1 30322941 30326755 30324700 N NA NA PTPRU,MECR IMR90 Hi-C 24141950 MECR 765487 253 chr1 31156452 31160375 31158360 N NA LOC100129196 NA NA NA NA LOC100129196 31244 254 chr1 31295923 31297984 31297154 N NA NA LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129196 104304 255 chr1 32014377 32016439 32015060 N NA NA FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 PEF1 94399 256 chr1 33180919 33183744 33182434 Y KIAA1522 NA SYNC,S100PBP,YARS,KIAA1522,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP4 64170 257 chr1 33437107 33439683 33438624 Y KIAA1522,ADC NA NA NA NA NA AK2 62829 258 chr1 33444378 33448284 33446957 Y RNF19B NA RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 54228 259 chr1 35726516 35731504 35730683 N NA ZMYM4 ZMYM4,SFPQ K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZMYM4 3064 260 chr1 39190369 39191979 39191292 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 133361 261 chr1 40165499 40168824 40167039 N NA PPIE NT5C1A,HPCAL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPIE 35693 262 chr1 40281138 40284490 40283153 Y PABPC4,RLF,MFSD2A NA MYCL1 K562 ChIA-PET 22265404 TRIT1 64687 263 chr1 41409470 41412128 41410898 N NA NA CITED4,KCNQ4,RIMS3,CTPS,NFYC,LOC100507178,SLFNL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507178 68134 264 chr1 41847609 41858551 41853521,41848437 N,N NA;NA NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 SLFNL1 360182 265 chr1 41905897 41910012 41908734 N NA NA SCMH1 IMR90 Hi-C 24141950 SLFNL1 418470 266 chr1 42433162 42453006 42447103 N NA NA HIVEP3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXJ3 348542 267 chr1 457684 462562 459752 N NA NA NA NA NA NA LOC100133331 133792 268 chr1 47221958 47224581 47223041 N NA KIAA0494 NA NA NA NA KIAA0494 37222 269 chr1 47253407 47256506 47254682 N NA NA NA NA NA NA KIAA0494 68671 270 chr1 47942247 47945430 47943876 N NA NA PDZK1IP1,LOC388630,TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 CMPK1 142778 271 chr1 47973225 47975013 47973975 N NA NA NA NA NA NA CMPK1 173756 272 chr1 48023449 48027723 48024780 N NA NA NA NA NA NA CMPK1 223980 273 chr1 48680077 48682076 48680683 N NA NA SLC5A9 IMR90 Hi-C 24141950 CMPK1 880608 274 chr1 50806966 50810197 50809345 N NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 615739 275 chr1 521277 525840 521604,523807 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100133331 197385 276 chr1 53640652 53643606 53642349 N NA CPT2,C1orf123 PODN,SCP2,ZYG11B,ZYG11A,ECHDC2,SLC1A7,C1orf123,CPT2,MAGOH,LOC100507564,ZCCHC11 IMR90 Hi-C 24141950 CPT2 18495 277 chr1 54952149 54955923 54954050,54953257 Y,N SSBP3,SSBP3;NA NA TCEANC2,SSBP3,TMEM59,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,C1orf177,YIPF1,HEATR8-TTC4,DIO1,HSPB11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 80057 278 chr1 55392335 55394874 55393294 N NA DHCR24 DHCR24,C1orf177,HEATR8-TTC4,TMEM61,BSND IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 39414 279 chr1 5552828 5555659 5554406 N NA NA AJAP1,NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22 704020 280 chr1 56351926 56354446 56353013 N NA NA NA NA NA NA LOC100507634 670845 281 chr1 564343 570425 567619 N NA NA NA NA NA NA LINC00115 192477 282 chr1 5747225 5749853 5748648 N NA NA NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL22 509826 283 chr1 5786233 5789400 5787864 N NA NA NA NA NA NA RPL22 470279 284 chr1 58751732 58758484 58754282,58756933 N,N NA;NA NA DAB1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 253962 285 chr1 59083948 59088087 59085673 N NA TACSTD2 TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TACSTD2 40782 286 chr1 59407169 59409664 59408772 N NA NA FGGY,LOC100131060,JUN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 157384 287 chr1 59534804 59538519 59537193 N NA NA MIR4711,FGGY,JUN,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 JUN 285019 288 chr1 60432161 60434128 60432989 N NA CYP2J2 NA NA NA NA CYP2J2 39738 289 chr1 60953259 60957062 60955681 N NA NA NA NA NA NA CYP2J2 560836 290 chr1 61038039 61040234 61038944 N NA NA NA NA NA NA NFIA 502712 291 chr1 61514603 61525062 61516014,61523063 N,N NA;NA NFIA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 17884 292 chr1 62033922 62036487 62034927 N NA NA NA NA NA NA TM2D1 154608 293 chr1 62100735 62108261 62102650,62106629 N,N NA;NA NA INADL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM2D1 82834 294 chr1 66945602 66949213 66946872 N NA NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35D1 570867 295 chr1 67603163 67606218 67604959 N NA NA SLC35D1,C1orf141,MIER1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35D1 83083 296 chr1 68037036 68040003 68038539 N NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 110857 297 chr1 68111208 68113599 68112383 N NA GADD45A GADD45A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 37261 298 chr1 68772034 68775497 68773407 N NA NA WLS,LOC100289178 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 187302 299 chr1 70032164 70035028 70032892 N NA NA NA NA NA NA LRRC40 636333 300 chr1 70996599 70998340 70998060 N NA NA NA NA NA NA ANKRD13C 176182 301 chr1 71052928 71055586 71053922 N NA NA NA NA NA NA ANKRD13C 232511 302 chr1 71216555 71219503 71217903 N NA NA NA NA NA NA ZRANB2 327469 303 chr1 74138071 74140940 74139801 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1057896 304 chr1 77151483 77155071 77153284 N NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 ST6GALNAC5 178115 305 chr1 79755114 79758487 79756876 N NA NA NA NA NA NA DNAJB4 1284478 306 chr1 80324026 80326614 80325194 N NA NA NA NA NA NA DNAJB4 1853390 307 chr1 8129699 8132355 8130794 N NA NA RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 PARK7 107985 308 chr1 8228392 8231856 8229983 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 PARK7 206678 309 chr1 8241260 8245738 8242672 N NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 219546 310 chr1 8297323 8312251 8298304,8301873,8304502,8310198 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 275609 311 chr1 8317091 8362607 8319748,8326914,8360334 N,N,N NA;NA;NA NA PARK7,ERRFI1,RERE,SLC45A1,TNFRSF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 295377 312 chr1 83503670 83602809 83598491 N NA NA NA NA NA NA SAMD13 1161240 313 chr1 83637870 83650054 83647822 N NA NA NA NA NA NA SAMD13 1113995 314 chr1 8370818 8375582 8372589,8374375 N,N NA;NA NA RERE,TNFRSF9,PARK7,ERRFI1,SLC45A1,PER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARK7 349104 315 chr1 84204999 84232236 84230613 N NA NA NA NA NA NA SAMD13 531813 316 chr1 84484793 84487941 84486025 N NA NA NA NA NA NA SAMD13 276108 317 chr1 84737040 84739800 84737787 N NA SAMD13 LPAR3,DNASE2B,UOX,SAMD13,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 SAMD13 24249 318 chr1 85689499 85692600 85690953 N NA C1orf52,BCL10 SYDE2,WDR63 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1orf52 32755 319 chr1 8880607 8886014 8883216 N NA RERE ERRFI1,RERE,ENO1,ENO1-AS1,SLC2A5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RERE 2908 320 chr1 8888827 8890623 8890235,8889682 N,N NA;NA RERE,ENO1 ERRFI1,RERE,ENO1,ENO1-AS1,SLC2A5 IMR90 Hi-C 24141950 RERE 11128 321 chr1 90839580 90843576 90841477 N NA NA NA NA NA NA ZNF326 378902 322 chr1 91190294 91192688 91191430 N NA NA ZNF644 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF644 295124 323 chr1 91195521 91197525 91196322 N NA NA ZNF644 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF644 290287 324 chr1 91304956 91318629 91317284 N NA NA ZNF644 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF644 169183 325 chr1 9132559 9141028 9135915,9139302 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ENO1 193408 326 chr1 91341668 91358137 91356779 N NA NA NA NA NA NA ZNF644 129675 327 chr1 91556472 91559090 91557746 N NA NA ZNF644 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF644 68660 328 chr1 91626064 91630222 91627379 N NA NA BARHL2,SSH2,ZNF644 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 ZNF644 138252 329 chr1 92050882 92052694 92051789 N NA NA TGFBR3,CDC7,HSP90B3P IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 84478 330 chr1 9230617 9243449 9242203 N NA NA SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENO1 291466 331 chr1 93864046 93867089 93865485 N NA FNBP1L LOC100131564,DR1 IMR90 Hi-C 24141950 FNBP1L 46599 332 chr1 94716136 94731799 94718701 N NA ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 12829 333 chr1 94786185 94792081 94787552,94787489,94789847 N,N,N NA;NA;NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 82878 334 chr1 94792769 94795864 94793925 N NA NA ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCD3 88069 335 chr1 9487526 9490600 9489073 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108928 336 chr1 9494258 9497653 9495925 N NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 101875 337 chr1 95051584 95054413 95053589 N NA NA SLC44A3,F3,ALG14,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCD3 167651 338 chr1 95120659 95126153 95124002 N NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 159748 339 chr1 95140067 95144520 95142459 N NA NA ABCD3,F3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 141381 340 chr1 95166059 95212627 95172949,95167670,95172181,95203311,95200898,95209608,95209759 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA F3,ABCD3,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 73274 341 chr1 95229643 95251984 95249233 Y NA SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 33917 342 chr1 95775180 95778472 95776978 N NA NA NA NA NA NA ALG14 236673 343 chr1 95817534 95819945 95818846 N NA NA NA NA NA NA ALG14 279027 344 chr1 95832278 95842871 95837007,95832746 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ALG14 293771 345 chr1 96353414 96356996 96354876 N NA NA NA NA NA NA ALG14 814907 346 chr1 96605580 96608294 96606258 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 578881 347 chr1 98894822 98896380 98895885 N NA NA NA NA NA NA PALMD 1215051 348 chr10 100068460 100070068 100069279 N NA NA LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PYROXD2 104910 349 chr10 1012699 1017494 1016736 N NA GTPBP4 LARP4B,IDI2-AS1,IDI2,DIP2C,GTPBP4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTPBP4 16855 350 chr10 101332504 101335290 101333787 N NA NKX2-3 NA NA NA NA NKX2-3 39814 351 chr10 101778142 101781684 101779775 N NA NA DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 ERLIN1 164130 352 chr10 102472270 102473879 102473424 N NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 HIF1AN 176629 353 chr10 103050268 103053459 103052391 N NA NA BTRC,FLJ41350,POLL,DPCD,FBXW4,LBX1,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509 IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 60366 354 chr10 105710067 105713442 105711835 N NA OBFC1,SLK SH3PXD2A,OBFC1,SLK,SFR1,WDR96,COL17A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLK 14028 355 chr10 111116816 111119357 111118283 N NA NA NA NA NA NA MXI1 848006 356 chr10 112895308 112898628 112896946 N NA NA NA NA NA NA SHOC2 216007 357 chr10 114118671 114123837 114121397 N NA NA GUCY2GP,ACSL5 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC6 82835 358 chr10 115716646 115722795 115719735 N NA NA ADRB1,NHLRC2,DCLRE1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NHLRC2 102255 359 chr10 115840482 115844136 115842609 N NA NA NHLRC2,DCLRE1A,ADRB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C10orf118 90228 360 chr10 115859710 115861318 115860129 N NA NA NA NA NA NA C10orf118 73046 361 chr10 11834527 11835869 11835069 N NA NA NA NA NA NA USP6NL 180848 362 chr10 119150110 119152892 119151451 N NA PDZD8 PDZD8 K562 ChIA-PET 22265404 PDZD8 15173 363 chr10 119999929 120008531 120001218 N NA NA EMX2OS,EMX2,CASC2,SLC18A2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM204A 93308 364 chr10 120014897 120018176 120016731 N NA NA SLC18A2,EMX2OS,EMX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM204A 83663 365 chr10 120114688 120117511 120116082 N NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 12849 366 chr10 120187544 120189599 120188704 N NA NA EMX2OS,EMX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM204A 85705 367 chr10 121377498 121380032 121378328 N NA TIAL1,BAG3 BAG3,TIAL1,INPP5F,MCMBP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TIAL1 20957 368 chr10 122011561 122014451 122012812 N NA NA NA NA NA NA SEC23IP 359476 369 chr10 122703510 122706809 122705637 N NA NA ATE1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR11 92823 370 chr10 124962360 124988338 124964087 N NA BUB3 BUB3 MCF7 ChIA-PET 22265404 BUB3 48600 371 chr10 126552469 126554341 126553392 N NA NA FAM175B IMR90 Hi-C 24141950 FAM175B 62115 372 chr10 126597142 126603687 126602011 N NA ZRANB1 ZRANB1,CTBP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZRANB1 27005 373 chr10 127032334 127034900 127033512 N NA NA LOC283038,CTBP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTBP2 182710 374 chr10 127143605 127145861 127144609 N NA NA NA NA NA NA FLJ37035 262201 375 chr10 127321077 127323640 127322294 N NA NA CTBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 FLJ37035 84422 376 chr10 128246494 128250862 128247803 N NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DHX32 676610 377 chr10 128268938 128270659 128269651 N NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DHX32 699054 378 chr10 128526378 128529410 128527477 N NA NA NA NA NA NA DHX32 956494 379 chr10 130051862 130055606 130053841 N NA NA NA NA NA NA GLRX3 1879033 380 chr10 130454018 130491321 130489494,130487273,130482688 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA GLRX3 1443318 381 chr10 132029970 132035952 132031114 N NA NA FLJ46300 IMR90 Hi-C 24141950 GLRX3 95331 382 chr10 132523113 132526505 132524613 N NA NA NA NA NA NA GLRX3 588474 383 chr10 133810098 133812945 133811360 N NA NA BNIP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2D 62138 384 chr10 133836009 133838328 133836724 N NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2D 88049 385 chr10 133845391 133879090 133850656,133861965 N,N NA;NA NA BNIP3,PPP2R2D,JAKMIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2D 97431 386 chr10 134328525 134332839 134332327 N NA NA INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PWWP2B 117823 387 chr10 134771579 134776841 134775775 N NA NA TTC40,LOC399829,INPP5A IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP2 349000 388 chr10 135461153 135464191 135462763 N NA NA NA NA NA NA MTG1 253532 389 chr10 135522547 135524647 135523685 N NA NA NA NA NA NA MTG1 314926 390 chr10 13574133 13576401 13574439 N NA BEND7 BEND7,PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 BEND7 29157 391 chr10 13577774 13580536 13578838 N NA BEND7,PRPF18 BEND7,PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 BEND7 32798 392 chr10 14448157 14451324 14449546 N NA NA FRMD4A,FAM107B,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 CDNF 428659 393 chr10 15485085 15488359 15486296 N NA NA ITGA8,FAM188A IMR90 Hi-C 24141950 NMT2 274390 394 chr10 15513357 15515435 15514294 N NA NA ITGA8 IMR90 Hi-C 24141950 NMT2 302662 395 chr10 16291421 16293089 16292415 N NA NA NA NA NA NA FAM188A 388902 396 chr10 19798366 19800247 19799125 N NA NA NA NA NA NA ARL5B 850053 397 chr10 21490126 21584565 21553612,21572955,21582290 N,N,Y NA;NA;NA NA NEBL,DNAJC1,ARMC3,C10orf114,MLLT10,LOC100128511,C10orf140,PIP4K2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C10orf140 230046 398 chr10 21606826 21609861 21608463 N NA NA C10orf114,C10orf140 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf140 204750 399 chr10 22517443 22521068 22518478 N NA LOC100130992 COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100130992 19933 400 chr10 23137430 23140790 23138582 Y PIP4K2A,ARMC3 NA ARMC3,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 MSRB2 243637 401 chr10 23368790 23371403 23370314 N NA MSRB2 SPAG6,DNAJC1,MSRB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSRB2 13024 402 chr10 23793049 23801097 23794904 N NA NA NA NA NA NA MSRB2 408622 403 chr10 26665617 26666896 26666258 N NA NA NA NA NA NA PDSS1 319699 404 chr10 27642492 27644613 27643771 N NA NA NA NA NA NA ACBD5 111424 405 chr10 27770397 27774047 27772374 N NA RAB18 MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 RAB18 19056 406 chr10 28696903 28700784 28699078 N NA NA NA NA NA NA LOC220906 120499 407 chr10 28738489 28748484 28746247 N NA NA LOC220906 IMR90 Hi-C 24141950 LOC220906 72799 408 chr10 29010879 29011862 29011277 N NA NA LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 WAC 189457 409 chr10 29310486 29313026 29311679 N NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 385475 410 chr10 29386626 29392739 29388356 N NA NA BAMBI,LYZL1,WAC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC387647 305762 411 chr10 29394315 29399767 29395260 N NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1,WAC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC387647 298734 412 chr10 29531308 29533847 29532234 N NA NA LYZL1,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 164654 413 chr10 30197465 30199224 30198111 N NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 439043 414 chr10 3023732 3030944 3028703 N NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 184089 415 chr10 30380525 30381117 30380718 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 257150 416 chr10 30841898 30844414 30843263 N NA NA MAP3K8,LOC729668,KIAA1462,MTPAP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTPAP 203631 417 chr10 30871330 30874984 30872888 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA LOC729668 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 233063 418 chr10 3102999 3104753 3103962 N NA NA NA NA NA NA PITRM1 110280 419 chr10 31071651 31075494 31073673 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 433384 420 chr10 31099252 31104105 31100761 N NA NA ZEB1,ZNF438,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 460985 421 chr10 31891146 31894018 31892574 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 283122 422 chr10 32044878 32051980 32049164,32048200 Y,Y ZEB1,KIF5B;ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 165790 423 chr10 32402240 32404723 32403616 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP12 184470 424 chr10 32419277 32421938 32420331 N NA NA EPC1,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 201507 425 chr10 32459067 32463483 32460292 Y NA NA ARHGAP12,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 172630 426 chr10 32520709 32523346 32521956 N NA NA KIF5B,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 112767 427 chr10 32647422 32669831 32649410,32654746,32668117 N,N,N NA;NA;NA EPC1 EPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 11309 428 chr10 32733242 32737056 32735466 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 97129 429 chr10 3290268 3293440 3291338 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 75235 430 chr10 3301527 3305216 3303165 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 86494 431 chr10 33268205 33271668 33269621 Y C10orf68 NA ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRP1 352165 432 chr10 3328408 3332213 3329785 N NA NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 PITRM1 113375 433 chr10 33298377 33301027 33299283 Y NA NA ITGB1,C10orf68,PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 322806 434 chr10 3335492 3339049 3337343 N NA NA NA NA NA NA PITRM1 120459 435 chr10 33443410 33446384 33445036 N NA NA NA NA NA NA NRP1 177449 436 chr10 33710464 33713021 33712035 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 86631 437 chr10 33765885 33769661 33767718 N NA NA NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 142052 438 chr10 33799083 33800148 33799741 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 175250 439 chr10 33809153 33812298 33810481 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 185320 440 chr10 3508168 3531827 3510416,3514841,3524675,3528697 Y,N,Y,Y KLF6;NA;KLF6;NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 293135 441 chr10 35261639 35266709 35262880 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 CUL2 112861 442 chr10 3592929 3600434 3598688 N NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 227039 443 chr10 35972990 35977119 35974619 N NA FZD8 NA NA NA NA FZD8 42628 444 chr10 35977624 35982583 35979531 N NA FZD8 NA NA NA NA FZD8 47262 445 chr10 36065366 36088529 36067171,36072703 N,N NA;NA NA FZD8 MCF7 ChIA-PET 22265404 FZD8 135004 446 chr10 36710344 36714420 36712482 N NA NA FZD8 IMR90 Hi-C 24141950 FZD8 779982 447 chr10 37106188 37107021 37106786 N NA NA FZD8,ACBD5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTRNR2L7 784838 448 chr10 37781811 37784208 37782689 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L7 107651 449 chr10 3786932 3790930 3787846,3790124 N,N NA;NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 36543 450 chr10 38061815 38069398 38066636 N NA NA NA NA NA NA ZNF248 77088 451 chr10 3848020 3853756 3848939,3850459,3852498 Y,Y,Y KLF6;KLF6;KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 20547 452 chr10 3869787 3872710 3871009 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42314 453 chr10 3892910 3897111 3895433 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 65437 454 chr10 3928124 3930841 3929177 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 100651 455 chr10 3976759 3979882 3978525 N NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 149286 456 chr10 3996515 3999765 3998296 N NA NA LOC100216001,KLF6,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 169042 457 chr10 4163068 4164798 4163859 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 335595 458 chr10 4321785 4324595 4323147 N NA NA LOC100216001,LOC338588,PITRM1,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 494312 459 chr10 43264551 43266680 43265290 N NA BMS1 BMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMS1 11274 460 chr10 43539531 43541204 43540301 N NA NA RET MCF7 ChIA-PET 22265404 CSGALNACT2 92730 461 chr10 43831655 43834042 43832822 N NA NA RASGEF1A IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT2 197721 462 chr10 43843074 43847170 43845847 N NA NA RASGEF1A,HNRNPF,BMS1,ZNF487P,FXYD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSGALNACT2 209140 463 chr10 43848429 43852147 43849434 N NA NA HNRNPF,FXYD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CSGALNACT2 214495 464 chr10 43853628 43860277 43857793 N NA NA FXYD4,HNRNPF,ZNF487P MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CSGALNACT2 219694 465 chr10 43914851 43917915 43916064 N NA NA ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF485 183940 466 chr10 4395584 4397487 4396725 N NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1E2 470915 467 chr10 45056417 45059235 45057963 N NA NA ZNF32-AS3,TMEM72-AS1,CXCL12 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf10 415095 468 chr10 45744092 45746545 45745564 N NA NA NA NA NA NA C10orf25 247622 469 chr10 45822562 45830717 45825600 N NA NA NA NA NA NA C10orf25 326092 470 chr10 45853156 45861979 45857680 N NA NA OR13A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND4 306272 471 chr10 46191369 46200907 46193824,46198261 N,N NA;NA ZFAND4 NA NA NA NA ZFAND4 23118 472 chr10 46710591 46716387 46713168 N NA NA NA NA NA NA FAM35B 181254 473 chr10 47056372 47058219 47056970 N NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 GPRIN2 62826 474 chr10 47731232 47740383 47732441 N NA NA NA NA NA NA FAM21B 153640 475 chr10 48047525 48050552 48048931 N NA NA NA NA NA NA FAM21B 153502 476 chr10 48340220 48343235 48341923 N NA NA ZNF488,LOC643650,RBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGAP9 124496 477 chr10 49266012 49320598 49320441 N NA NA NA NA NA NA MAPK8 289089 478 chr10 49494446 49497551 49496012 Y NA NA FRMPD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAPK8 112136 479 chr10 49502599 49505582 49504168 N NA NA FRMPD2 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 104105 480 chr10 49511190 49564389 49514595,49540786 N,N NA;NA MAPK8 FRMPD2,ARHGAP22,MAPK8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK8 45298 481 chr10 50626002 50627887 50627225 N NA NA WDFY4,MIR4294,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC6 119260 482 chr10 51530409 51536578 51531976 N NA NCOA4 MSMB MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA4 28530 483 chr10 51541954 51544444 51543156 N NA NCOA4 NA NA NA NA NCOA4 20664 484 chr10 52026073 52027735 52027047 N NA NA NA NA NA NA AGAP6 277995 485 chr10 5335005 5337893 5336096 N NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 ASB13 370665 486 chr10 54784254 54786376 54785074 N NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1324899 487 chr10 54788508 54792202 54789950 N NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1329153 488 chr10 5550295 5562152 5555395,5552445,5559304 N,N,N NA;NA;NA NA FAM208B,NET1,CALML5,CALML3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB13 146406 489 chr10 5607983 5618265 5610295,5616508 N,N NA;NA NA NET1,CALML5,ASB13 IMR90 Hi-C 24141950 ASB13 90293 490 chr10 5621144 5628189 5625895 N NA NA ASB13,NET1,CALML5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB13 80369 491 chr10 5649492 5654138 5652875 N NA NA NET1,CALML5,CALML3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB13 54420 492 chr10 5655943 5658225 5657413 N NA NA NET1,CALML3,CALML5,ASB13 IMR90 Hi-C 24141950 ASB13 50333 493 chr10 60757372 60764491 60763072,60758963 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 171857 494 chr10 61750229 61752687 61751326 N NA NA CCDC6 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC6 83815 495 chr10 62923515 62925617 62924497 N NA NA NA NA NA NA CDK1 385303 496 chr10 63053205 63055566 63054377 N NA NA ARID5B,C10orf107,RHOBTB1,TMEM26 IMR90 Hi-C 24141950 CDK1 514993 497 chr10 63594299 63601793 63596914,63599882 Y,N NA;NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 59220 498 chr10 6401724 6409216 6404026,6407180 N,N NA;NA NA RBM17,PFKFB3,LOC399715 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD16 469864 499 chr10 65423245 65442340 65424663 N NA NA JMJD1C,LOC84989 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 142122 500 chr10 65471053 65475945 65472654 N NA NA JMJD1C,REEP3,ZNF365,NRBF2,LOC84989 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 REEP3 189930 501 chr10 65558272 65561377 65559146 N NA NA NA NA NA NA REEP3 277149 502 chr10 66332845 66335284 66334024 N NA NA NA NA NA NA REEP3 1051722 503 chr10 69522704 69525425 69524237 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 119002 504 chr10 69607148 69613775 69609322 Y NA SIRT1 SIRT1,HERC4,MYPN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SIRT1 30652 505 chr10 70821018 70822727 70821672 Y DDX21,VPS26A,SRGN NA KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS26A 61181 506 chr10 71932853 71936074 71934086 N NA TYSND1,SAR1A SAR1A K562 ChIA-PET 22265404 SAR1A 2568 507 chr10 73619524 73621646 73620515 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3,SPOCK2,DNAJB12,ASCC1,ANAPC16 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 8442 508 chr10 73647945 73649700 73648937 N NA PSAP PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,CDH23,ASCC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 36863 509 chr10 7474601 7477024 7475612 N NA NA PRKCQ IMR90 Hi-C 24141950 KIN 352966 510 chr10 77535546 77538865 77536675 N NA NA NA NA NA NA ZNF503 374033 511 chr10 79977182 79980157 79978761 N NA NA RPS24,ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 183664 512 chr10 80061194 80064031 80062371 N NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 267676 513 chr10 80165575 80168805 80166950 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 372057 514 chr10 80278197 80282270 80280876 N NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 484679 515 chr10 80286528 80290209 80288421 N NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 493010 516 chr10 80448272 80449948 80449052 N NA NA ZMIZ1,LOC100132987,LOC283050,RPS24 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 377257 517 chr10 80503673 80506448 80505391 N NA NA LOC283050,RPS24,ZMIZ1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 320757 518 chr10 80564336 80566064 80565187 N NA NA ZMIZ1,LOC283050,LOC100132987,RPS24,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 261141 519 chr10 81727279 81746168 81741673 N NA NA SFTPD,LOC100288974,MAT1A IMR90 Hi-C 24141950 FAM213A 92258 520 chr10 8185176 8188246 8186671 N NA NA NA NA NA NA ATP5C1 355083 521 chr10 82799636 82802879 82801283 N NA NA NA NA NA NA C10orf58 632051 522 chr10 84810709 84815175 84812437 N NA NA NA NA NA NA GHITM 1084010 523 chr10 84900710 84903513 84902114 N NA NA NA NA NA NA GHITM 995672 524 chr10 84991128 84996564 84994551 N NA NA NA NA NA NA GHITM 902621 525 chr10 85006866 85009406 85008058 N NA NA NA NA NA NA GHITM 889779 526 chr10 88158557 88165829 88160896 N NA NA WAPAL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WAPAL 115712 527 chr10 88294028 88297167 88295367 N NA WAPAL WAPAL,OPN4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WAPAL 12487 528 chr10 89229620 89260624 89230628 N NA NA NA NA NA NA LOC728190 127305 529 chr10 89890582 89893166 89891797 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 267387 530 chr10 91133184 91134993 91134242 N NA IFIT5 LIPA,IFIT2,IFIT1B,IFIT1,IFIT5 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT5 39332 531 chr10 92921199 92969295 92922702 N NA NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD2 200801 532 chr10 96936965 96947555 96943607 Y SORBS1,SORBS1 NA SORBS1,C10orf129,PDLIM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCTN3 506345 533 chr10 981089 994440 993443,981939 N,N NA;NA LARP4B,GTPBP4 LARP4B,GTPBP4,DIP2C,IDI2-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTPBP4 39909 534 chr10 99582636 99585694 99583711 Y NA GOLGA7B NA NA NA NA GOLGA7B 24301 535 chr10 99597141 99600717 99600168 N NA GOLGA7B GOLGA7B IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA7B 9278 536 chr10 9999622 10002245 9999891 N NA NA NA NA NA NA USP6NL 1651434 537 chr11 102138145 102140523 102139524 N NA BIRC3 YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIRC3 47658 538 chr11 102149432 102152076 102150699 N NA BIRC3 YAP1,BIRC2,MMP20,BIRC3,C11orf70,TMEM123,MMP7 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 36105 539 chr11 102335998 102340074 102336548,102338190 N,N NA;NA TMEM123 BIRC2,TMEM123,MMP7,MMP20 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 12223 540 chr11 102346219 102349125 102347747 N NA TMEM123 TMEM123,MMP20,BIRC2,BIRC3,MMP7,MMP27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM123 22444 541 chr11 10408875 10410968 10409812 N NA NA SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM,CTR9,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 82233 542 chr11 105135499 105136519 105135823 N NA NA NA NA NA NA KIAA1826 756435 543 chr11 106409383 106412099 106411192 N NA NA NA NA NA NA KBTBD3 460918 544 chr11 10950924 10957109 10953365,10956181 N,N NA;NA NA EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC729013 71160 545 chr11 109784166 109787259 109785348 N NA NA NA NA NA NA ZC3H12C 176828 546 chr11 109946287 109948151 109947397 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C MCF7 ChIA-PET 22265404 ZC3H12C 15936 547 chr11 110233031 110235444 110233804 N NA NA RDX MCF7 ChIA-PET 22265404 FDX1 65217 548 chr11 110379016 110382648 110380459 N NA NA POU2AF1,LOC100132078,C11orf53,BTG4,ARHGAP20,FDX1,MIR4491 IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 78355 549 chr11 110967075 110969550 110968105 N NA NA ARHGAP20,FDX1,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 666414 550 chr11 111295917 111299656 111297886 N NA NA POU2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 337513 551 chr11 111305157 111308890 111307662 Y POU2AF1 NA LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20,C11orf88,C11orf93,MIR4491,POU2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 328279 552 chr11 112213666 112225869 112223387,112214225 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTS 116578 553 chr11 112561031 112561361 112561203 N NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 PTS 463943 554 chr11 112751037 112753534 112752356 Y NCAM1 NA NA NA NA NA TTC12 431717 555 chr11 113765173 113768032 113766279 N NA USP28 ZBTB16 IMR90 Hi-C 24141950 USP28 18917 556 chr11 113904606 113915708 113907345,113911734 N,N NA;NA ZBTB16 ZBTB16,HTR3A,NNMT IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB16 14723 557 chr11 114238125 114241053 114239356 N NA C11orf71,RBM7 NNMT,REXO2,RBM7,C11orf71 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf71 30086 558 chr11 114701925 114705034 114703446 N NA NA NA NA NA NA REXO2 391817 559 chr11 114953150 114955210 114954136 N NA NA NA NA NA NA CADM1 420031 560 chr11 116057283 116066390 116064323 N NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 577324 561 chr11 116182042 116185113 116183830 N NA NA NA NA NA NA BUD13 458601 562 chr11 116296711 116300804 116298959 N NA NA NA NA NA NA BUD13 342910 563 chr11 116329150 116332123 116330497 N NA NA NA NA NA NA BUD13 311591 564 chr11 116342358 116344953 116343562 N NA NA NA NA NA NA BUD13 298761 565 chr11 11712792 11714930 11713698 Y NA NA GALNTL4 IMR90 Hi-C 24141950 GALNTL4 69231 566 chr11 118560121 118562234 118560793 N NA NA BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2,RPS25,TRAPPC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDB1 82908 567 chr11 118739010 118741993 118740746 N NA NA BCL9L,CXCR5,DDX6,UPK2,FOXR1,MIR4492 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 77038 568 chr11 119454459 119455931 119455200 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 RNF26 249249 569 chr11 119724152 119728000 119725641 N NA NA NA NA NA NA ARHGEF12 479618 570 chr11 120038603 120041295 120040239 N NA NA PVRL1,POU2F3,TRIM29,LOC649133,OAF IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 166323 571 chr11 12069664 12073852 12072135 N NA NA MICAL2,CTR9,DKK3,USP47,MICALCL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP47 206694 572 chr11 12086988 12090575 12088858 N NA NA MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP47 224018 573 chr11 121106463 121123091 121108547 N NA SC5DL SORL1,SC5DL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SC5DL 40297 574 chr11 121127220 121130298 121128867 N NA SC5DL SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 33090 575 chr11 121137765 121141227 121139379 N NA SC5DL SORL1,SC5DL IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 22161 576 chr11 121296587 121298808 121298122 N NA SORL1 SC5DL,SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 24104 577 chr11 121524639 121527823 121526466 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 201727 578 chr11 121591938 121594285 121593389 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 269026 579 chr11 122450338 122453229 122451730 N NA NA CRTAM,C11orf63,SC5DL,SORL1,HSPA8,UBASH3B IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 479672 580 chr11 123138039 123140705 123139019 N NA NA CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 205138 581 chr11 123149955 123151963 123150592 N NA NA CLMP,LOC341056 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 217054 582 chr11 124586782 124596955 124588047,124595067 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C11orf61 73344 583 chr11 124692283 124695367 124693819 N NA C11orf61 SIAE,SPA17,C11orf61 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf61 21984 584 chr11 124705759 124713799 124709169,124712538 N,N NA;NA C11orf61 SIAE,SPA17,C11orf61,TBRG1,PKNOX2,CCDC15,NRGN,ROBO3,ROBO4,HEPACAM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf61 35460 585 chr11 124992660 124995630 124994205 N NA TMEM218 PKNOX2,ROBO4,HEPACAM,HEPN1,CCDC15,SLC37A2,TMEM218 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM218 19455 586 chr11 125940812 125944013 125942251 N NA CDON CDON,DDX25 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 7625 587 chr11 125948641 125952665 125950194 N NA CDON NA NA NA NA CDON 15454 588 chr11 125960293 125987713 125972704,125962280,125986042,125983664 N,N,Y,Y NA;NA;NA;CDON CDON CDON,FAM118B,RPUSD4,HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 27106 589 chr11 126009659 126012791 126010854 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 RPUSD4 68796 590 chr11 126015799 126017953 126016856 N NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 RPUSD4 63634 591 chr11 127675085 127677840 127675932 N NA NA NA NA NA NA C11orf45 1098286 592 chr11 129115383 129148021 129138547,129146655 N,N NA;NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 53290 593 chr11 129183875 129191471 129186051,129189275 Y,N NA;NA NA ARHGAP32,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 121782 594 chr11 129192976 129197819 129194648 N NA NA ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP32 130883 595 chr11 129632777 129636038 129634310 N NA TMEM45B BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM45B 49703 596 chr11 129911410 129912746 129912075 Y PRDM10,APLP2 LINC00167,PRDM10,APLP2 PRDM10,LINC00167,APLP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APLP2 26970 597 chr11 129930434 129933467 129932044 N NA APLP2 APLP2,PRDM10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APLP2 6249 598 chr11 13016368 13021819 13019085 N NA RASSF10 LOC100506305,RASSF10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RASSF10 9151 599 chr11 130303574 130306102 130304802 N NA ADAMTS15 NA NA NA NA ADAMTS15 12767 600 chr11 130379019 130381979 130380467 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 60150 601 chr11 130404567 130406882 130405483 N NA NA ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 85698 602 chr11 130574469 130577924 130576098 N NA NA ADAMTS8,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 208458 603 chr11 13061080 13067207 13062765,13065829 N,N NA;NA RASSF10 LOC100506305,ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 RASSF10 30110 604 chr11 131065332 131066760 131066112 N NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 278950 605 chr11 131194234 131196091 131194971 N NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 407852 606 chr11 13161135 13163510 13162067 Y NA NA LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF10 130165 607 chr11 13164077 13166320 13165277 N NA NA LOC100506305,TEAD1,RASSF10 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF10 133107 608 chr11 134475585 134480128 134478343 N NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283177 169209 609 chr11 134571718 134574367 134573341 N NA NA NA NA NA NA LOC283177 265342 610 chr11 134578927 134583058 134581578 N NA NA NA NA NA NA LOC283177 272551 611 chr11 134609530 134614566 134612238 N NA NA GLB1L2,IGSF9B,LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283177 303154 612 chr11 134785335 134787590 134786417 N NA NA NA NA NA NA LOC283177 478959 613 chr11 14401406 14404479 14402776 N NA NA RRAS2 IMR90 Hi-C 24141950 COPB1 116962 614 chr11 15380357 15383970 15381877 N NA NA C11orf58 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 466606 615 chr11 15620859 15624347 15622387 N NA NA NA NA NA NA CYP2R1 707108 616 chr11 15670369 15673915 15671861 N NA NA C11orf58,SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 756618 617 chr11 15684553 15686589 15685401 N NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 770802 618 chr11 15913234 15915775 15915041 N NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 844373 619 chr11 16634732 16636438 16635703 N NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 123710 620 chr11 17258741 17264558 17260079 N NA NUCB2 NUCB2,USH1C,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 NUCB2 33728 621 chr11 18070089 18075279 18074692 N NA NA MYOD1,SERGEF IMR90 Hi-C 24141950 SAAL1 52359 622 chr11 18690322 18692028 18691258 N NA SPTY2D1,TMEM86A TSG101 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM86A 28323 623 chr11 18920258 18923913 18922187 N NA NA MRGPRX1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM86A 199907 624 chr11 2230583 2235510 2232475,2234519 N,N NA;NA NA KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 CD81 163037 625 chr11 22939759 23142406 22941462,22944768,23135268 N,N,N NA;NA;NA NA LUZP2 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 88377 626 chr11 23505040 23506366 23505694 N NA NA NA NA NA NA SVIP 653658 627 chr11 24349496 24354373 24349923 N NA NA NA NA NA NA SVIP 1498114 628 chr11 27222313 27224754 27223416 Y NA NA LGR4,LIN7C IMR90 Hi-C 24141950 LGR4 269580 629 chr11 27893869 27896604 27895346 N NA NA METTL15,BDNF,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 METTL15 233194 630 chr11 3190407 3191618 3191205 Y NA NA NA NA NA NA CARS 111726 631 chr11 34022846 34026255 34024187 N NA CAPRIN1 CAPRIN1,LMO2,ABTB2,NAT10 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CAPRIN1 46975 632 chr11 34047399 34050496 34049475 N NA CAPRIN1 LMO2,CAPRIN1,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN1 22734 633 chr11 34620421 34624197 34622525 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18391 634 chr11 34778750 34788167 34779921 N NA NA EHF IMR90 Hi-C 24141950 EHF 136162 635 chr11 34844574 34869586 34847355 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF NA EHF,ELF5,CAT,APIP IMR90 Hi-C 24141950 PDHX 68091 636 chr11 3493769 3499923 3498423 N NA NA NA NA NA NA ZNF195 93317 637 chr11 352384 355166 354071 N NA IFITM3,PKP3 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM3 31470 638 chr11 35922244 35924578 35923264 N NA LDLRAD3 COMMD9,LDLRAD3,FJX1,PRR5L,PAMR1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAD3 41034 639 chr11 35926337 35929251 35927764 N NA LDLRAD3 LDLRAD3,PAMR1,TRIM44 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAD3 36361 640 chr11 37228418 37231589 37229838 N NA NA NA NA NA NA TRAF6 696555 641 chr11 37880410 37881528 37880995 N NA NA NA NA NA NA TRAF6 1348547 642 chr11 41304617 41317818 41316011,41305263 N,N NA;NA NA NA NA NA NA API5 2015687 643 chr11 41408538 41427247 41425933 N NA NA NA NA NA NA API5 1906258 644 chr11 41470099 41482749 41481661 N NA NA NA NA NA NA API5 1850756 645 chr11 42786625 42790466 42788151 N NA NA NA NA NA NA API5 543039 646 chr11 42971836 42974419 42972635 N NA NA NA NA NA NA API5 359086 647 chr11 4337344 4339256 4338014 N NA NA NA NA NA NA RRM1 221420 648 chr11 43664567 43675290 43671569,43665739 N,N NA;NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 26853 649 chr11 44005356 44007841 44006869 N NA NA ALKBH3,LOC100507300 IMR90 Hi-C 24141950 ACCS 79888 650 chr11 44334205 44339773 44338582 N NA NA EXT2,ALX4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXT2 217106 651 chr11 45081794 45086048 45084817 N NA NA SYT13,TSPAN18,PRDM11,CHST1,TP53I11,LOC221122 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 739575 652 chr11 45326730 45328480 45327712 N NA NA TSPAN18,TP53I11,PRDM11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 497143 653 chr11 45353961 45356281 45355107 N NA NA PRDM11,TP53I11,SYT13,TSPAN18 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 469342 654 chr11 45375493 45385572 45376993 N NA NA CHST1,PRDM11,SYT13,EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 440051 655 chr11 45424482 45425655 45424870 N NA NA CHST1,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 399968 656 chr11 45575536 45577874 45576350 N NA NA CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 247749 657 chr11 46263509 46266784 46265019 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF21A 120524 658 chr11 4723757 4728036 4725443 N NA NA OR51E2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM68 94268 659 chr11 4760536 4763399 4762133 N NA NA OR51L1,MMP26 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM68 131047 660 chr11 47936705 47940036 47938130 N NA NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 66648 661 chr11 55825012 55827486 55825627 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 1264927 662 chr11 5592140 5594383 5592803 N NA NA NA NA NA NA FAM160A2 661558 663 chr11 56928086 56930227 56929402 N NA NA LRRC55,APLNR IMR90 Hi-C 24141950 TNKS1BP1 162186 664 chr11 57017031 57021144 57018689 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 71269 665 chr11 57035704 57038756 57036586 N NA NA NA NA NA NA TNKS1BP1 53657 666 chr11 57044004 57046545 57045684 N NA TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 45868 667 chr11 58562008 58565434 58563949 N NA NA NA NA NA NA GLYATL1 129668 668 chr11 58649435 58674811 58673365 N NA GLYATL1 NA NA NA NA GLYATL1 20291 669 chr11 58846330 58870768 58869859 N NA LOC283194,FAM111B,FAM111A LOC283194,FAM111B IMR90 Hi-C 24141950 FAM111B 3890 670 chr11 59304053 59313395 59304904 N NA NA NA NA NA NA PATL1 123116 671 chr11 59448532 59451579 59449137 N NA PATL1 NA NA NA NA PATL1 12021 672 chr11 60808775 60810711 60809863 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA CD5,VPS37C,SLC15A3,TMEM132A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM132A 116862 673 chr11 61356234 61362586 61357768 N NA NA SDHAF2,PPP1R32,LRRC10B,SYT7,RPLP0P2,DAGLA,C11orf9,DKFZP434K028 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1R32 107649 674 chr11 61848396 61851002 61849603 N NA INCENP FADS1,FADS2,FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,FTH1,RAB3IL1,C11orf9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 40443 675 chr11 61879134 61882177 61880123 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9268 676 chr11 62091957 62095258 62094103 N NA NA ASRGL1,SCGB1D1,SCGB2A1,SCGB1D4,SCGB2A2 IMR90 Hi-C 24141950 INCENP 200512 677 chr11 64175585 64179365 64177741 N NA RPS6KA4 RPS6KA4,NRXN2,SLC22A12 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA4 48960 678 chr11 64210618 64222490 64216346 N NA NA SLC22A12,NRXN2,SLC22A11,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 83993 679 chr11 64916607 64917016 64916793 N NA TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1 SYVN1,CAPN1,SPDYC MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SYVN1 14604 680 chr11 65237250 65247085 65245037 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 NEAT1,MALAT1,SCYL1 TIGD3,SCYL1,SLC25A45,FRMD8,NEAT1,MIR612,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 18148 681 chr11 65253034 65261606 65255751,65259773 N,Y NA;SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3627 682 chr11 65589460 65591977 65590837 N NA AP5B1,OVOL1,SNX32,CFL1,MUS81,EFEMP2 TSGA10IP IMR90 Hi-C 24141950 SNX32 9433 683 chr11 66152258 66154746 66153822 N NA RIN1,BRMS1,B3GNT1,SLC29A2 CD248,SPTBN2,RIN1,BRMS1,CNIH2,B3GNT1,YIF1A,TMEM151A,SLC29A2,NPAS4,MRPL11,PELI3,DPP3,ZDHHC24,ACTN3,RBM4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC29A2 12967 684 chr11 67339191 67341049 67340163 N NA NDUFV1 LOC100130987,PITPNM1,AIP,CDK2AP2,CABP2,GSTP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV1 33274 685 chr11 67457163 67457910 67457774 N NA NA ALDH3B2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NDUFV1 82840 686 chr11 67525316 67526388 67525820 N NA FAM86C2P NA NA NA NA FAM86C2P 46419 687 chr11 67611948 67619015 67616197 N NA FAM86C2P NA NA NA NA FAM86C2P 39141 688 chr11 67893367 67899088 67896015 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 4509 689 chr11 68064657 68066190 68065412 N NA C11orf24 SUV420H1,C11orf24,LRP5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 25188 690 chr11 68418218 68421018 68419339 N NA NA GAL,PPP6R3,CPT1A,MRPL21,IGHMBP2,MTL5,TPCN2,MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 PPP6R3 190032 691 chr11 68425560 68428158 68426732 N NA NA GAL,MTL5,CPT1A,MRPL21,IGHMBP2,MRGPRD,PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP6R3 197374 692 chr11 69784681 69786631 69785818 N NA NA ANO1,FADD IMR90 Hi-C 24141950 FADD 262638 693 chr11 70993501 71011804 70995436,70998592 N,N NA;NA NA SHANK2,DHCR7,NADSYN1 IMR90 Hi-C 24141950 SHANK2 57693 694 chr11 71324959 71328704 71326729 N NA NA NA NA NA NA NADSYN1 160742 695 chr11 71454380 71461073 71455519,71456857 N,N NA;NA FAM86C1 NA NA NA NA FAM86C1 37484 696 chr11 71490611 71492655 71491422 N NA FAM86C1 NA NA NA NA FAM86C1 5902 697 chr11 73479812 73483876 73481145 N NA RAB6A,MRPL48 RAB6A,MRPL48,CHCHD8,PAAF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB6A 7611 698 chr11 73489085 73492287 73490639 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6630 699 chr11 75945655 75947726 75946767 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 144154 700 chr11 76117857 76121663 76119448 N NA PRKRIR,C11orf30 DGAT2,UVRAG,PRKRIR,C11orf30 IMR90 Hi-C 24141950 PRKRIR 25977 701 chr11 76546275 76548677 76547905 N NA ACER3 GUCY2E,TSKU,ACER3,B3GNT6 IMR90 Hi-C 24141950 ACER3 23240 702 chr11 79991199 79993503 79992172 N NA NA NA NA NA NA NARS2 1705290 703 chr11 8039546 8041242 8040272 N NA EIF3F TUB IMR90 Hi-C 24141950 EIF3F 30679 704 chr11 80409385 80412209 80410652 N NA NA NA NA NA NA NARS2 2123476 705 chr11 80468448 80470904 80469724 N NA NA NA NA NA NA PRCP 2140653 706 chr11 80630537 80634200 80632611 N NA NA NA NA NA NA PRCP 1977357 707 chr11 82826387 82831733 82830272 N NA RAB30,LOC100506233,PCF11 C11orf82,PCF11,RAB30,LOC100506233 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCF11 36404 708 chr11 82841724 82844525 82843511 N NA PCF11 RAB30,LOC100506233,PCF11 IMR90 Hi-C 24141950 PCF11 23612 709 chr11 82848732 82864665 82850598 N NA PCF11 RAB30,C11orf82,PCF11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCF11 3472 710 chr11 83120107 83128290 83122080 N NA NA DLG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC90B 122730 711 chr11 85870118 85873111 85871752 N NA NA PICALM,EED,CCDC83,C11orf73 IMR90 Hi-C 24141950 EED 82695 712 chr11 89497968 89502336 89500498,89499416 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FOLH1B 105503 713 chr11 89804128 89808519 89805760 N NA NA NA NA NA NA NAALAD2 59299 714 chr11 89980550 89982206 89981513 N NA CHORDC1 CHORDC1 K562 ChIA-PET 22265404 CHORDC1 24018 715 chr11 90095701 90098552 90096820 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 139169 716 chr11 91213223 91216163 91214979 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 1256691 717 chr11 91341011 91343637 91342042 N NA NA NA NA NA NA CHORDC1 1384479 718 chr11 92679966 92683737 92681478 N NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 247358 719 chr11 92697314 92698601 92697798 N NA NA NA NA NA NA SLC36A4 232494 720 chr11 92976202 92977782 92976560 N NA SLC36A4 NA NA NA NA SLC36A4 45107 721 chr11 93047311 93051720 93047813,93050237 N,N NA;NA NA C11orf75 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 116216 722 chr11 93299353 93302015 93300705 N NA C11orf75 NA NA NA NA C11orf75 22807 723 chr11 93354201 93358179 93356513 N NA KIAA1731 CCDC67 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1731 36637 724 chr11 93361905 93366600 93363662,93365142 N,N NA;NA KIAA1731 NA NA NA NA KIAA1731 28216 725 chr11 93376892 93380447 93378836 N NA KIAA1731 SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1731 14369 726 chr11 93382752 93386496 93385233 N NA KIAA1731 SLC36A4,KIAA1731 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1731 8320 727 chr11 93387937 93390877 93389202 N NA KIAA1731 NA NA NA NA KIAA1731 3939 728 chr11 93668130 93669963 93669122 N NA NA MRE11A,PANX1,ANKRD49,HEPHL1,GPR83 IMR90 Hi-C 24141950 VSTM5 84462 729 chr11 9383784 9387589 9386122 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 18580 730 chr11 94390163 94393841 94392499 N NA NA AMOTL1 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 107667 731 chr11 94465360 94466742 94465897 N NA AMOTL1 AMOTL1 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 34766 732 chr11 94473807 94497651 94474536,94492246 N,N NA;NA AMOTL1 AMOTL1,PIWIL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL1 3857 733 chr11 94986159 94989237 94987653 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 21913 734 chr11 95357428 95364157 95359019 N NA NA NA NA NA NA FAM76B 158797 735 chr11 95376401 95387523 95378720,95380546,95384602,95385462 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 135431 736 chr11 95395788 95399129 95397850 N NA NA SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 123825 737 chr11 95435667 95440956 95438152 N NA NA SESN3,SRSF8,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 81998 738 chr11 9589555 9593019 9590746 Y WEE1,WEE1 NA ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF143 107043 739 chr11 9634373 9636389 9635328 N NA NA WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF143 151861 740 chr12 101918818 101921716 101920374 N NA NA NA NA NA NA ARL1 117246 741 chr12 102373281 102377242 102374166,102376213 N,N NA;NA NA PAH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC53 78657 742 chr12 102895858 102899680 102897451 N NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 PARPBP 381902 743 chr12 102908439 102912215 102909758 Y PAH NA NA NA NA NA PARPBP 394483 744 chr12 102925988 102929292 102927879 N NA NA PARPBP,IGF1,DRAM1 IMR90 Hi-C 24141950 PARPBP 412032 745 chr12 103968928 103970999 103969479 N NA NA NA NA NA NA NT5DC3 263976 746 chr12 105333892 105355217 105352189 N NA SLC41A2 TXNRD1,CHST11,SLC41A2,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC41A2 11420 747 chr12 105484951 105487563 105486297 Y NA KIAA1033 C12orf45,ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1033 13929 748 chr12 105848462 105849586 105848998 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL2 218454 749 chr12 106667930 106670162 106668832 N NA TCP11L2 CKAP4,TCP11L2,POLR3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 26419 750 chr12 107507384 107510476 107508720 N NA CRY1 BTBD11 IMR90 Hi-C 24141950 CRY1 19786 751 chr12 108218467 108221415 108220628 N NA NA NA NA NA NA PRDM4 63553 752 chr12 108222371 108242593 108237753,108239997 N,N NA;NA NA PRDM4,ASCL4 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM4 67457 753 chr12 110113947 110121407 110114267,110120274 N,N NA;NA C12orf34 MGC14436,C12orf34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf34 30780 754 chr12 110132928 110136046 110134145 N NA C12orf34 MMAB,MGC14436,C12orf34 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf34 16141 755 chr12 110143296 110146275 110145031 N NA C12orf34 C12orf34 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf34 5912 756 chr12 110706871 110712096 110708451 N NA ATP2A2 ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81,ANAPC7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 6936 757 chr12 111429433 111432124 111431050 N NA CUX2 CUX2 IMR90 Hi-C 24141950 CUX2 39704 758 chr12 115129622 115133090 115130558 N NA TBX3 TBX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBX3 7653 759 chr12 115250538 115252064 115250990 N NA NA NA NA NA NA TBX3 128569 760 chr12 115351308 115354356 115352374 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 229339 761 chr12 115790476 115792761 115792155 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 668507 762 chr12 115889926 115894456 115890513,115893218 N,N NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 767957 763 chr12 115927494 115931097 115929874 N NA NA NA NA NA NA MED13L 783894 764 chr12 116106897 116214403 116201683,116212570,116154242,116119512,116191956,116178614 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA TBX3,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 500588 765 chr12 116252343 116258766 116257627,116255486 N,N NA;NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 456225 766 chr12 116266022 116269965 116268017 N NA NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 445026 767 chr12 116271384 116274726 116273605,116272921 N,N NA;NA NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 440265 768 chr12 116297710 116299787 116298642 N NA NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 415204 769 chr12 116308751 116312777 116310789 N NA NA RBM19,TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 402214 770 chr12 116349402 116359651 116354718 N NA NA RBM19,TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 355340 771 chr12 116755378 116756876 116756396 N NA MED13L MED13L,MIR4472-2,LINC00173,C12orf49 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 40387 772 chr12 116805614 116815329 116806469 N NA NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 90623 773 chr12 117036059 117038811 117037344 N NA NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C12orf49 137032 774 chr12 117073277 117077238 117075072 N NA NA MED13L,FBXW8,MAP1LC3B2,LINC00173 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf49 98605 775 chr12 117094694 117098544 117096547 N NA NA MED13L,LINC00173,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf49 77299 776 chr12 117844165 117847848 117846224 N NA NA NA NA NA NA FBXO21 215865 777 chr12 119040666 119042894 119041741 N NA NA TMEM233 IMR90 Hi-C 24141950 SUDS3 226308 778 chr12 119412150 119415574 119413729 N NA SRRM4 NA NA NA NA SRRM4 3726 779 chr12 120366881 120370780 120368170 N NA NA CIT,TMEM233 IMR90 Hi-C 24141950 CIT 51786 780 chr12 120728392 120732177 120730506 N NA PXN PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PXN 24818 781 chr12 12082642 12085437 12084421 N NA NA LOC338817,ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 279854 782 chr12 120831061 120834098 120832627 N NA COX6A1 SIRT4,PLA2G1B,MSI1,SRSF9,TRIAP1,DYNLL1,GATC,COX6A1 IMR90 Hi-C 24141950 COX6A1 41795 783 chr12 121365564 121368748 121367239 Y NA HNF1A-AS1,HNF1A C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 HNF1A-AS1 41347 784 chr12 12185137 12186927 12186152 N NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP6 232884 785 chr12 122123976 122126259 122124942 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 NA MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM2B 105056 786 chr12 123928972 123933046 123930481 N NA SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9605 787 chr12 12446224 12449094 12447765 N NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 26413 788 chr12 125091560 125095190 125093769 N NA NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 253329 789 chr12 125115861 125118598 125117170 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 229921 790 chr12 125151391 125153526 125152624 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 194993 791 chr12 125176706 125178753 125177803 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 169766 792 chr12 125203499 125206786 125205113 N NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 141733 793 chr12 125213761 125219181 125215005,125217676 N,N NA;NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCARB1 129338 794 chr12 125229444 125239934 125230767,125232085 Y,Y NCOR2,UBC;UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 108585 795 chr12 125531742 125540055 125534261 Y NA AACS AACS,DHX37,BRI3BP K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AACS 9870 796 chr12 126316556 126320054 126317853 N NA NA NA NA NA NA AACS 766631 797 chr12 12736539 12742122 12740040 N NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2,APOLD1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 21091 798 chr12 130569532 130584582 130571074 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA FLJ31485 61641 799 chr12 131072156 131127154 131118067,131124343 N,N NA;NA NA RIMBP2,LOC100190940 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2 69746 800 chr12 131133435 131144834 131143073 N NA NA NA NA NA NA RIMBP2 131025 801 chr12 131199652 131202246 131200882 N NA NA NA NA NA NA RAN 154371 802 chr12 131795965 131797488 131796537 N NA NA NA NA NA NA SFSWAP 398147 803 chr12 132995192 133007261 133005713 N NA NA P2RX2,GALNT9,POLE,FBRSL1,LOC100507055,EP400NL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLE 256684 804 chr12 133014151 133025469 133022834 Y POLE,DDX51,FBRSL1 NA GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2,LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLE 238476 805 chr12 14360140 14362218 14361040 N NA NA GUCY2C IMR90 Hi-C 24141950 ATF7IP 156393 806 chr12 14391765 14394773 14393263 N NA NA ATF7IP,GUCY2C,PLBD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 123838 807 chr12 14863378 14865076 14863968 N NA NA NA NA NA NA H2AFJ 62194 808 chr12 15395889 15398256 15397177 N NA RERG RERG,PTPRO MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RERG 21478 809 chr12 20089774 20091215 20090317 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 497166 810 chr12 20094997 20096150 20096024 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 502389 811 chr12 20140658 20143450 20141718 N NA NA NA NA NA NA AEBP2 548050 812 chr12 21115218 21119264 21116859 N NA NA NA NA NA NA PYROXD1 471274 813 chr12 2131616 2134100 2132664 N NA DCP1B,CACNA1C CACNA1C,LOC100652846,DCP1B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 17939 814 chr12 2143088 2153124 2144271 N NA DCP1B,CACNA1C CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B,LRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1C 9292 815 chr12 2155663 2159860 2158573 N NA DCP1B,CACNA1C MIR3649,CACNA1C,WNT5B,LRTM2,CACNA2D4 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1C 2556 816 chr12 22538006 22538829 22538447 N NA NA NA NA NA NA KIAA0528 158623 817 chr12 25536378 25540228 25538775 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYRM5 188228 818 chr12 25967394 25968018 25967549 N NA NA IFLTD1,MIR4302,LOC100506451,RASSF8 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF8 143946 819 chr12 25976373 25978648 25977878 N NA NA IFLTD1,MIR4302,LOC100506451,RASSF8 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF8 133316 820 chr12 26332150 26334447 26332929 N NA NA ITPR2,BHLHE41,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 54147 821 chr12 26425382 26428847 26427280 N NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 147379 822 chr12 27030787 27031388 27030960 N NA ITPR2 ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 44656 823 chr12 30915440 30919927 30917583 N NA CAPRIN2 CAPRIN2,OVCH1,IPO8,TMTC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CAPRIN2 7992 824 chr12 30921176 30924917 30922883 N NA CAPRIN2 TMTC1,CAPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN2 13728 825 chr12 31002430 31005243 31002734,31004543 N,N NA;NA NA TSPAN11 IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN2 94982 826 chr12 31315942 31317868 31316202 N NA NA NA NA NA NA DDX11 89163 827 chr12 3178155 3180665 3178950 N NA NA TSPAN9 IMR90 Hi-C 24141950 TEAD4 109677 828 chr12 31901668 31904118 31902288 Y C12orf35,AMN1,H3F3C H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 H3F3C 41057 829 chr12 32247170 32249940 32248785 N NA BICD1 METTL20 IMR90 Hi-C 24141950 BICD1 10245 830 chr12 3432358 3475062 3474819 N NA NA PRMT8,CCND2,EFCAB4B,PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 TEAD4 363880 831 chr12 34370462 34372397 34371870 N NA NA NA NA NA NA ALG10 195246 832 chr12 34772481 34773891 34773043 N NA NA NA NA NA NA ALG10 597265 833 chr12 34780059 34782607 34781732 N NA NA NA NA NA NA ALG10 604843 834 chr12 38446347 38449014 38447599 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 261543 835 chr12 38493022 38494794 38493733 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 215763 836 chr12 38516115 38520308 38518446 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 190249 837 chr12 38531818 38534075 38532447 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 176482 838 chr12 38609298 38612298 38611014 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 98259 839 chr12 3864908 3867406 3866583 N NA NA EFCAB4B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PARP11 115202 840 chr12 39391088 39394347 39392993 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 680531 841 chr12 39458040 39459940 39458685 N NA NA NA NA NA NA ALG10B 747483 842 chr12 4139038 4141315 4140569 Y CCND2,PARP11 NA CCND2,PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 156430 843 chr12 46465097 46466947 46466261 N NA NA SCAF11,SLC38A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAF11 80696 844 chr12 47430283 47433932 47432137 N NA NA RPAP3,AMIGO2,FAM113B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 663638 845 chr12 47753557 47755745 47754604 Y NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 344099 846 chr12 47762430 47765891 47764432 N NA NA AMIGO2,SLC38A1,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 333953 847 chr12 49276159 49280379 49277673 N NA DDX23,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDX23 30202 848 chr12 49607783 49610254 49609061 N NA TUBA1A,TUBA1C TUBA1C,TUBA1A,MLL2,TUBA1B,RHEBL1,LMBR1L,DHH,PRPH,KCNH3,FAM186B,MCRS1,FMNL3,TMBIM6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 24922 849 chr12 49625662 49630095 49628397 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28770 850 chr12 52254349 52264093 52262855 Y NA FIGNL2 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL2 28648 851 chr12 5231053 5353759 5277140,5231478 N,N NA;NA NA ANO2,NTF3,VWF,KCNA6 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA9 472789 852 chr12 52520350 52528382 52521410,52524414,52527712 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C12orf44 56592 853 chr12 52532126 52534949 52533466 N NA NA NA NA NA NA C12orf44 68368 854 chr12 5368939 5394870 5369940 N NA NA NTF3,ANO2 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA9 610675 855 chr12 53735615 53740272 53738924 N NA PFDN5,C12orf10,AAAS,SP1 ESPL1,PFDN5,C12orf10,AAAS,CSAD,RARG,MFSD5,SP7,SP1,AMHR2,PCBP2,PRR13,ATF7,NPFF,TARBP2,MAP3K12,LOC100652999 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAAS 20203 856 chr12 53763602 53767515 53764933 N NA AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6464 857 chr12 54143715 54150424 54144798,54148642 N,N NA;NA CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 22408 858 chr12 54173491 54176874 54175288 N NA NA HOXC8,MIR196A2,HOXC9,HOXC12,HOXC13,HOTAIR,HOXC11,HOXC10,FLJ12825,LOC400043,SMUG1,CALCOCO1 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 52184 859 chr12 5417805 5436278 5419067 N NA NA ANO2,NTF3 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA9 659541 860 chr12 54182503 54184795 54183167 N NA NA HOXC12,HOXC10,HOXC13,HOXC9,MIR196A2,HOXC8,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 61196 861 chr12 55078300 55080249 55078902 N NA NA NA NA NA NA COPZ1 359389 862 chr12 55284355 55287049 55285854 N NA NA NA NA NA NA COPZ1 565444 863 chr12 57361623 57365615 57362665 N NA ZBTB39 NA NA NA NA ZBTB39 34682 864 chr12 58257408 58261374 58259010 N NA AVIL,CTDSP2 CTDSP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 16661 865 chr12 58281139 58283842 58282216 N NA CTDSP2,LOC100506844 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 40392 866 chr12 58286600 58292374 58287628,58290610 N,N NA;NA CTDSP2,LOC100506844 CTDSP2,TSFM,AVIL,CDK4,METTL21B,CYP27B1,METTL1,MARCH9,TSPAN31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506844 37573 867 chr12 58371485 58373492 58372075 N NA LOC100506844 NA NA NA NA LOC100506844 41538 868 chr12 58423675 58429776 58428245 N NA NA NA NA NA NA LOC100506844 93728 869 chr12 58485704 58488480 58486853 N NA NA NA NA NA NA LOC100506844 155757 870 chr12 58564893 58566613 58565755 N NA NA NA NA NA NA LOC100506844 234946 871 chr12 58638891 58640693 58640090 N NA NA NA NA NA NA LOC100506844 308944 872 chr12 58695396 58698640 58696490 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506844 365449 873 chr12 58936661 58938219 58937363 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 376043 874 chr12 59159001 59161503 59159960 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 152759 875 chr12 59423247 59427034 59424423 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 108985 876 chr12 59470506 59472506 59471461 N NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 156244 877 chr12 62828202 62829933 62829126 N NA MON2 PPM1H,MON2 IMR90 Hi-C 24141950 MON2 30664 878 chr12 6289860 6292410 6291279 N NA CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 17072 879 chr12 63349509 63354564 63351926 N NA NA PPM1H MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf61 352295 880 chr12 63358075 63363906 63360983 N NA NA PPM1H MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf61 360861 881 chr12 63401540 63403883 63402623 N NA NA NA NA NA NA C12orf61 404326 882 chr12 63686628 63689669 63688181 N NA NA NA NA NA NA DPY19L2 372685 883 chr12 6374943 6377945 6376421 N NA NA CD9,VWF,PLEKHG6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD9 65461 884 chr12 63832234 63836499 63834074 N NA NA NA NA NA NA DPY19L2 225855 885 chr12 6385649 6390277 6387576 N NA NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD9 76167 886 chr12 63889448 63891373 63890279 N NA NA NA NA NA NA DPY19L2 170981 887 chr12 64788025 64792610 64789754 N NA NA SRGAP1,C12orf56,XPOT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBK1 53230 888 chr12 64973315 64979347 64977838 N NA RASSF3 TBK1,RASSF3,MIR548Z,GNS IMR90 Hi-C 24141950 RASSF3 24946 889 chr12 64980612 64985742 64984157 N NA RASSF3 RASSF3,MIR548Z,GNS,TBK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASSF3 18551 890 chr12 65904466 65905854 65905378 N NA NA HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD3 341115 891 chr12 65999856 66002677 66001425 N NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD3 436505 892 chr12 67384927 67463077 67462678 N NA NA CAND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 199984 893 chr12 68977586 68979863 68978704,68978360 N,N NA;NA RAP1B IL26 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 24756 894 chr12 69723336 69726575 69724996 Y LYZ YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 26957 895 chr12 70403250 70409664 70406923 N NA NA NA NA NA NA CNOT2 227110 896 chr12 71554350 71559152 71556289,71557171 N,N NA;NA TSPAN8 NA NA NA NA TSPAN8 2571 897 chr12 71588456 71591327 71589502 N NA TSPAN8 NA NA NA NA TSPAN8 36677 898 chr12 73402446 73403816 73402786 N NA NA NA NA NA NA TBC1D15 1168959 899 chr12 73741434 73743658 73742291 N NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1187893 900 chr12 76177597 76180347 76178595 Y NA NA PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRR1 272179 901 chr12 76281297 76284700 76283052 N NA NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAP1L1 194038 902 chr12 76301803 76304169 76302978 N NA NA NA NA NA NA NAP1L1 174569 903 chr12 76314191 76316965 76315786 N NA NA KRR1,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAP1L1 161773 904 chr12 76485796 76487759 76486411 N NA NAP1L1 NAP1L1,OSBPL8 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L1 7058 905 chr12 77111332 77113501 77112229 N NA ZDHHC17 ZDHHC17 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZDHHC17 44353 906 chr12 77308646 77311697 77309725 N NA CSRP2 CSRP2 IMR90 Hi-C 24141950 CSRP2 35847 907 chr12 78138418 78141976 78140119 Y NA NA NA NA NA NA CSRP2 865619 908 chr12 79938888 79953498 79952565,79948994 N,N NA;NA NA SYT1,PAWR,PPP1R12A,OTOGL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 131292 909 chr12 80423932 80426375 80425526 N NA NA PPP1R12A IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R12A 94697 910 chr12 8112261 8114741 8113519 N NA NA SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 FOXJ2 70618 911 chr12 8122183 8124699 8123418 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 NA SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 60660 912 chr12 8177635 8180955 8179305 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 4404 913 chr12 82916710 82919538 82917897 N NA NA NA NA NA NA TMTC2 161396 914 chr12 83074721 83077932 83076522 N NA TMTC2 TMTC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMTC2 3002 915 chr12 8434977 8439825 8438454 N NA NA NA NA NA NA FAM66C 102172 916 chr12 85837986 85840878 85839333 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 2588390 917 chr12 85862696 85863785 85863173 N NA NA NTS IMR90 Hi-C 24141950 C12orf29 2565483 918 chr12 8843902 8847261 8845389 N NA RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 3257 919 chr12 89605378 89608229 89606444 N NA NA LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 441615 920 chr12 89698360 89700570 89699152 N NA NA LOC728084,POC1B IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 349274 921 chr12 89777131 89780366 89778317 N NA NA POC1B,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 269478 922 chr12 89943435 89953137 89944543 N NA NA C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 96707 923 chr12 90255786 90258203 90256841 Y POC1B,POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 205942 924 chr12 90558523 90561737 90560493 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 508679 925 chr12 90964668 90969485 90966759 N NA NA NA NA NA NA ATP2B1 914824 926 chr12 92038389 92041449 92039960 N NA NA NA NA NA NA EEA1 1281658 927 chr12 94033529 94035499 94034697 N NA CRADD SOCS2,LOC144481,CRADD IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 35652 928 chr12 94279541 94284899 94280596 N NA NA CRADD,SOCS2,LOC144481 IMR90 Hi-C 24141950 CRADD 208390 929 chr12 94927276 94931753 94929544 N NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC144486 73497 930 chr12 95279779 95285289 95283587 N NA NA NA NA NA NA NDUFA12 112222 931 chr12 95821333 95824034 95822405 N NA METAP2 NR2C1 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 43788 932 chr12 96505365 96510038 96506536 N NA NA CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 HAL 115294 933 chr12 96579650 96582448 96580710 N NA NA LTA4H,ELK3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAL 189579 934 chr12 96894226 96896565 96894997 N NA NA ELK3,CDK17,LTA4H,AMDHD1,CCDC38 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 99860 935 chr12 97162779 97165337 97164206 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 135664 936 chr12 98764081 98766552 98765338 N NA NA NA NA NA NA TMPO 142799 937 chr13 100577920 100579383 100578613 N NA NA PCCA,A2LD1,NALCN IMR90 Hi-C 24141950 PCCA 161886 938 chr13 101349891 101357993 101350543 N NA NA ZIC2,ZIC5,TMTC4,NALCN IMR90 Hi-C 24141950 PCCA 608622 939 chr13 101479210 101480999 101480489 N NA NA NALCN IMR90 Hi-C 24141950 PCCA 737941 940 chr13 104532875 104537997 104536256 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1000426 941 chr13 104614656 104632884 104628896,104618348 N,N NA;NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1082207 942 chr13 104646174 104663266 104660073 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1113725 943 chr13 104674899 104678655 104676567 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1142450 944 chr13 104765092 104767551 104766345 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1232643 945 chr13 104780667 104792001 104782748 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1248218 946 chr13 104794127 104799261 104796490 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1261678 947 chr13 104816814 104826025 104818765,104823734,104824458 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 1284365 948 chr13 105791373 105792882 105792191 N NA NA NA NA NA NA EFNB2 1394506 949 chr13 106498670 106502730 106500045 N NA NA NA NA NA NA EFNB2 684658 950 chr13 106747803 106750109 106748771 N NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 EFNB2 437279 951 chr13 107000940 107002625 107001678 N NA NA NA NA NA NA EFNB2 184763 952 chr13 107378760 107382214 107380034 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 158246 953 chr13 107386816 107390852 107389498 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 166302 954 chr13 107404413 107407801 107405490 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 183899 955 chr13 107509948 107513623 107511658 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 289434 956 chr13 107517222 107521143 107517612,107519831 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ARGLU1 296708 957 chr13 107567370 107580132 107570016 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 346856 958 chr13 109960689 109963563 109962643 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 475351 959 chr13 109983156 109986281 109984486 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 452633 960 chr13 110007198 110010041 110008535 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 428873 961 chr13 110062922 110066459 110065014 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 372455 962 chr13 110145036 110154327 110147695,110152652 N,N NA;NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 284587 963 chr13 110160654 110192192 110162459,110190073 N,N NA;NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 246722 964 chr13 110212117 110311120 110221960,110220956,110294880,110248822,110239638,110245268,110296627,110309818,110302317 N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 127794 965 chr13 110316793 110346024 110320297,110344457,110342591,110321880,110337424 N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 92890 966 chr13 110371128 110374483 110373217 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 64431 967 chr13 110461438 110463914 110462221 N NA IRS2 MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 22524 968 chr13 110487492 110490719 110489149 N NA IRS2 MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 48578 969 chr13 110637564 110639449 110638924 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 198650 970 chr13 110650165 110656277 110652221 N NA NA MYO16,IRS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRS2 211251 971 chr13 110675474 110679489 110676749 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 236560 972 chr13 110707274 110709143 110707844 N NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 268360 973 chr13 111247925 111251769 111249920 N NA RAB20,CARKD RAB20,CARKD,CARS2,ING1,LINC00346 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CARKD 16038 974 chr13 111449122 111451504 111449618 N NA NA ING1,CARS2,CARKD,COL4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00346 71151 975 chr13 111460981 111464691 111462442 N NA NA ING1,CARS2,CARKD,LINC00346,RAB20,ANKRD10,COL4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00346 57964 976 chr13 111466596 111469621 111468033 N NA NA ING1,CARS2,CARKD,RAB20,ANKRD10,LINC00346,COL4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00346 53034 977 chr13 111487310 111493197 111489697 N NA LINC00346 NA NA NA NA LINC00346 29458 978 chr13 111633324 111635942 111634480 N NA NA ARHGEF7,LINC00346,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 65908 979 chr13 111656637 111660122 111658492 N NA NA ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 89221 980 chr13 111689467 111691128 111690140 N NA NA ARHGEF7,ING1,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 76496 981 chr13 111717087 111720744 111719782,111718084 N,N NA;NA ARHGEF7 ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 46880 982 chr13 111747644 111748786 111748071 N NA ARHGEF7 ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 18838 983 chr13 112224258 112226908 112225654 N NA NA NA NA NA NA TEX29 251243 984 chr13 112284308 112287408 112285489 N NA NA SPACA7 IMR90 Hi-C 24141950 TEX29 311293 985 chr13 112329846 112331836 112330816 N NA NA NA NA NA NA TEX29 356831 986 chr13 112523488 112527990 112525489 N NA NA NA NA NA NA TEX29 550473 987 chr13 112646692 112649728 112648468 N NA NA NA NA NA NA TEX29 673677 988 chr13 112711208 112717511 112716665 N NA NA NA NA NA NA TEX29 738193 989 chr13 19182928 19192333 19184436 N NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 1015455 990 chr13 19201099 19226192 19202534 N NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 981596 991 chr13 20131610 20134878 20133436 N NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 72910 992 chr13 20174552 20176612 20175294 N NA MPHOSPH8 MPHOSPH8,ZMYM5 MCF7 ChIA-PET 22265404 MPHOSPH8 31176 993 chr13 20832103 20833926 20832629 N NA NA CRYL1,GJB6,IFT88,GJB2,XPO4 IMR90 Hi-C 24141950 CRYL1 266086 994 chr13 20908357 20912340 20910296 N NA NA XPO4,GJB6 IMR90 Hi-C 24141950 CRYL1 187672 995 chr13 21776390 21778757 21777481 N NA MRP63,SKA3 NA NA NA NA SKA3 25649 996 chr13 21815398 21819367 21817734 N NA NA NA NA NA NA SKA3 64657 997 chr13 21834748 21838451 21836458 N NA NA NA NA NA NA SKA3 84007 998 chr13 21894408 21901320 21895831 N NA NA ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 SKA3 143667 999 chr13 22038591 22041575 22040119 N NA NA ZDHHC20 MCF7 ChIA-PET 22265404 EFHA1 136780 1000 chr13 23387696 23389375 23388215 N NA NA NA NA NA NA EFHA1 1209341 1001 chr13 24538446 24545496 24540555,24543974 N,N NA;NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 189365 1002 chr13 24553181 24556487 24553755 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 178374 1003 chr13 24630910 24631239 24631226 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 103622 1004 chr13 24648731 24652615 24650108 N NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 82246 1005 chr13 24679821 24682872 24680853 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 51989 1006 chr13 24922753 24924225 24923404 N NA C1QTNF9 NA NA NA NA C1QTNF9 39037 1007 chr13 24949167 24951028 24949995 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF9 65451 1008 chr13 25244375 25246427 25245466 N NA NA CENPJ,RNF17,ATP12A,TPTE2P1 IMR90 Hi-C 24141950 TPTE2P6 90029 1009 chr13 25591348 25596411 25592732 N NA TPTE2P1 NA NA NA NA TPTE2P1 48741 1010 chr13 25620673 25622754 25621483 Y NA PABPC3 NA NA NA NA PABPC3 47522 1011 chr13 27111315 27117038 27112716 N NA NA NA NA NA NA CDK8 282559 1012 chr13 27412965 27415610 27414473 N NA NA NA NA NA NA RPL21 410082 1013 chr13 27596263 27597665 27596760 N NA NA RASL11A,USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21 228027 1014 chr13 30496688 30500093 30498303 N NA NA HSPH1,KATNAL1,UBL3,LOC440131 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBL3 71868 1015 chr13 30645167 30648580 30646831 N NA NA UBL3 IMR90 Hi-C 24141950 UBL3 220347 1016 chr13 30685998 30690076 30688793 N NA NA UBL3,LOC440131,HMGB1,SLC7A1,USPL1,KATNAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBL3 261178 1017 chr13 30692797 30694733 30693868 N NA NA UBL3,LOC440131,HMGB1,SLC7A1,KATNAL1,LINC00426,LOC728437,MTUS2,USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 UBL3 267977 1018 chr13 30968332 30971093 30969745 Y USPL1 NA LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 68988 1019 chr13 30981212 30984169 30982660 Y NA NA KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 55912 1020 chr13 30993681 30997701 30995924 N NA HMGB1 USPL1,KATNAL1,LINC00426,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 42380 1021 chr13 31370435 31372044 31371067 N NA NA ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USPL1 178605 1022 chr13 31397808 31400389 31398923 N NA NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 205978 1023 chr13 33412157 33414118 33413311 N NA NA KL,PDS5B,STARD13 IMR90 Hi-C 24141950 PDS5B 251593 1024 chr13 33577714 33580636 33578812 N NA NA NA NA NA NA PDS5B 417150 1025 chr13 34308337 34311656 34309724 N NA NA STARD13 IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 80550 1026 chr13 34566105 34577095 34574105 N NA NA NA NA NA NA RFC3 173899 1027 chr13 34908311 34911495 34909998 N NA NA NA NA NA NA RFC3 516105 1028 chr13 34920781 34941821 34922117 N NA NA NA NA NA NA RFC3 528575 1029 chr13 35042699 35046418 35043943 N NA NA NA NA NA NA NBEA 470006 1030 chr13 35322546 35324199 35322964 N NA NA NA NA NA NA NBEA 192225 1031 chr13 35498786 35509826 35508056 N NA NBEA NA NA NA NA NBEA 6598 1032 chr13 36703936 36706236 36705454 N NA NA NA NA NA NA RFXAP 687103 1033 chr13 37117585 37119284 37118152 N NA NA NA NA NA NA RFXAP 274055 1034 chr13 37724108 37725968 37724400 N NA NA POSTN,LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 FAM48A 90258 1035 chr13 37740436 37828593 37740738 N NA NA LINC00547,POSTN IMR90 Hi-C 24141950 FAM48A 106586 1036 chr13 38714887 38721418 38719030 N NA NA NA NA NA NA UFM1 202524 1037 chr13 39197238 39201108 39199010 N NA NA NA NA NA NA UFM1 273296 1038 chr13 42584629 42587930 42586088 N NA KIAA0564 KIAA0564,MTRF1,C13orf15,OR7E37P,LOC100507240,DGKH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0564 49408 1039 chr13 43433434 43436418 43434952 N NA NA ENOX1,FAM216B,EPSTI1,CCDC122 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 587145 1040 chr13 44713919 44718022 44714528,44716287 N,N NA;NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 260093 1041 chr13 44791710 44797154 44793185,44796080 N,N NA;NA NA TSC22D1,SERP2,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 337884 1042 chr13 44847452 44849872 44848690 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 300160 1043 chr13 44878924 44889730 44880953,44884965 Y,N C13orf31,CCDC122,C13orf31;NA NA TSC22D1,LACC1,SERP2,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 260302 1044 chr13 45421312 45425869 45421935,45423565 N,N NA;NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 137744 1045 chr13 45426482 45430507 45428401 N NA NA TSC22D1,LINC00330,NUFIP1,TSC22D1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 133106 1046 chr13 45432257 45435837 45434075 N NA NA TSC22D1,LINC00330,NUFIP1,TSC22D1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 127776 1047 chr13 45438503 45442168 45440782 N NA NA TSC22D1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 121445 1048 chr13 45443475 45446641 45444926 N NA NA TSC22D1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 116972 1049 chr13 45459079 45462744 45461468 N NA NA TSC22D1,LINC00330,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 100869 1050 chr13 46760735 46832450 46785987,46787976 N,N NA;NA NA LCP1,CPB2,LOC100509894 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZC3H13 133841 1051 chr13 50170450 50174614 50171611 N NA RCBTB1 CDADC1,ARL11,RCBTB1,CAB39L,SETDB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCBTB1 10731 1052 chr13 50714073 50717189 50715382,50715208 Y,N NA;NA DLEU2,ST13P4 DLEU7,DLEU2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 14396 1053 chr13 50721843 50726958 50723452 N NA DLEU2,ST13P4 DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 19196 1054 chr13 50929871 50933929 50931952 N NA NA DLEU2,EBPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST13P4 183717 1055 chr13 51000879 51004076 51002490 N NA NA DLEU2,EBPL,GUCY1B2 IMR90 Hi-C 24141950 ST13P4 254725 1056 chr13 51102176 51106257 51103718 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613,CTAGE10P,ST13P4,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P4 356022 1057 chr13 51655534 51658362 51656549 N NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 171720 1058 chr13 51688335 51692298 51690279 N NA NA GUCY1B2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 204521 1059 chr13 51695501 51701591 51697240,51699870 N,N NA;NA NA FAM124A,LINC00282 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 211687 1060 chr13 52115828 52117809 52116584 N NA WDFY2 MIR4703,WDFY2,INTS6,DHRS12,LINC00282 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDFY2 40675 1061 chr13 52824562 52832288 52827083 N NA NA NA NA NA NA THSD1P1 55960 1062 chr13 53332251 53336243 53334429,53332482 N,N NA;NA NA LECT1 IMR90 Hi-C 24141950 SUGT1 105420 1063 chr13 53476261 53479569 53477755 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 249430 1064 chr13 53769434 53773525 53771755 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 542603 1065 chr13 53811563 53814598 53812636 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 584732 1066 chr13 56545644 56545965 56545829 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 3318813 1067 chr13 60840921 60844217 60842148 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 7614090 1068 chr13 64649139 64651971 64650195 N NA NA NA NA NA NA DACH1 7789359 1069 chr13 70962156 70967216 70965971 N NA NA NA NA NA NA DACH1 1474114 1070 chr13 72759743 72762653 72761403 N NA NA NA NA NA NA DACH1 318413 1071 chr13 72766875 72771457 72768741 N NA NA NA NA NA NA DACH1 325545 1072 chr13 73742180 73742451 73742356 N NA NA NA NA NA NA KLF5 109038 1073 chr13 77166390 77167972 77167337 N NA NA NA NA NA NA FBXL3 433359 1074 chr13 78051601 78053781 78052515 N NA NA NA NA NA NA MYCBP2 150424 1075 chr13 80162880 80172036 80164222 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 107621 1076 chr13 80808442 80810797 80809564 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 104289 1077 chr13 81715602 81718397 81716835 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 800516 1078 chr13 82263911 82265346 82264608 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 1348825 1079 chr13 85945552 85948164 85947242 N NA NA NA NA NA NA SLITRK6 425319 1080 chr13 91892475 91896507 91893744 N NA NA MIR17HG K562 ChIA-PET 22265404 TGDS 3352004 1081 chr13 95200219 95203938 95201831 Y NA TGDS NA NA NA NA TGDS 44573 1082 chr13 96054395 96057896 96056175 N NA NA ABCC4,CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 100708 1083 chr13 98526326 98529731 98528102 N NA NA IPO5,FARP1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL2 651752 1084 chr14 100432170 100434960 100433670 N NA NA EML1,EVL IMR90 Hi-C 24141950 EVL 96791 1085 chr14 100655957 100661194 100659520 Y NA DEGS2,YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 29945 1086 chr14 100667609 100682561 100680965 N NA DEGS2,YY1 DEGS2,EVL,YY1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 22541 1087 chr14 101044243 101053519 101053047 N NA NA WDR25,MEG3,BEGAIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR25 201488 1088 chr14 101825221 101827483 101826447 N NA NA MEG8,DIO3OS,DIO3,MIR1247,MEG3 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1H1 603382 1089 chr14 101940499 101944851 101943521 N NA NA NA NA NA NA DYNC1H1 486014 1090 chr14 101971211 101972994 101972052 N NA NA MEG8,DIO3OS IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1H1 457871 1091 chr14 102989757 102992559 102991585 N NA NA ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 66437 1092 chr14 103536875 103538984 103538245 N NA NA CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNFAIP2 53680 1093 chr14 103556698 103559155 103557972 Y NA TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 33509 1094 chr14 103725513 103729842 103726970 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70651 1095 chr14 104757540 104758539 104758098 N NA NA NA NA NA NA TMEM179 312558 1096 chr14 104806634 104809487 104808568 N NA NA KIF26A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM179 261610 1097 chr14 105541788 105571203 105544963,105559673 N,N NA;NA NA AHNAK2,GPR132,BTBD6,BRF1,JAG2,NUDT14 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRF1 144538 1098 chr14 105576311 105578176 105576969 N NA NA BTBD6,BRF1,KIAA0284,PACS2 IMR90 Hi-C 24141950 BRF1 137565 1099 chr14 106025503 106027852 106026708 N NA NA NA NA NA NA TEX22 160583 1100 chr14 106144489 106148312 106147104 N NA NA NA NA NA NA TEX22 279569 1101 chr14 106275762 106291825 106289517 N NA NA NA NA NA NA TEX22 410842 1102 chr14 106455856 106462901 106457971,106461032 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 590936 1103 chr14 106547522 106553303 106549473,106552032 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 682602 1104 chr14 106978394 106981586 106979888 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1113474 1105 chr14 106994830 106997155 106995882 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1129910 1106 chr14 107239764 107272343 107253467,107256609 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEX22 1374844 1107 chr14 107279768 107287489 107280999 N NA NA NA NA NA NA TEX22 1414848 1108 chr14 19856259 19858403 19857763 N NA NA NA NA NA NA TTC5 915750 1109 chr14 21080817 21083709 21082017,21083310 N,N NA;NA NA KLHL33,TMEM55B,PARP2,RPPH1,RNASE4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASE4 68663 1110 chr14 21130491 21135653 21131445 N NA RNASE4 RNASE4,OR6S1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNASE4 16719 1111 chr14 21139650 21144224 21140421 N NA RNASE4 RNASE4,OSGEP,KLHL33 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNASE4 8148 1112 chr14 21316194 21318424 21317146 N NA NA RNASE4 MCF7 ChIA-PET 22265404 METTL17 139541 1113 chr14 22169919 22173671 22171775 N NA NA NA NA NA NA METTL3 190462 1114 chr14 23193702 23194968 23194462 N NA OXA1L OXA1L,SLC7A7,DAD1,ABHD4,MMP14,MRPL52 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 40763 1115 chr14 23706564 23708595 23707088 N NA HOMEZ SLC7A8 IMR90 Hi-C 24141950 HOMEZ 46714 1116 chr14 24081915 24084421 24082860 N NA NA C14orf167 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX2 61057 1117 chr14 25735049 25736922 25736000 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 823042 1118 chr14 25839406 25842103 25840462 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 927399 1119 chr14 25882900 25886382 25884364 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 970893 1120 chr14 25989126 25992324 25990978 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1077119 1121 chr14 26126764 26130942 26128781 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1214757 1122 chr14 26261466 26262612 26262285 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1349459 1123 chr14 26301170 26307251 26305893 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1389163 1124 chr14 26562979 26568608 26566002 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1650972 1125 chr14 26592259 26595788 26594440 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1680252 1126 chr14 26884051 26886206 26885201 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 1972044 1127 chr14 29344356 29347017 29345596 Y FOXG1 NA NA NA NA NA PRKD1 1049882 1128 chr14 29420168 29424185 29422096 N NA NA NA NA NA NA PRKD1 972714 1129 chr14 30830877 30838104 30832726 N NA NA NA NA NA NA G2E3 190225 1130 chr14 32669116 32674587 32671013,32672671 Y,Y NA;ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 122621 1131 chr14 33365072 33367781 33366551 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 818577 1132 chr14 34527533 34531402 34529462 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 400066 1133 chr14 34648021 34650280 34649155 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 281188 1134 chr14 34800719 34803055 34801303 N NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 128413 1135 chr14 35812185 35826184 35821938,35817315,35823214 N,N,N NA;NA;NA NFKBIA PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA,SNX6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIA 47776 1136 chr14 35970770 35975530 35973298 N NA NA RALGAPA1 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 96810 1137 chr14 36723943 36727041 36725835 N NA NA MBIP IMR90 Hi-C 24141950 MBIP 62841 1138 chr14 44588156 44589803 44588864 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 776704 1139 chr14 45862491 45864382 45863383 N NA NA NA NA NA NA MIS18BP1 139886 1140 chr14 50328169 50336591 50329602,50328442,50334991 Y,Y,Y NA;METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 8630 1141 chr14 51325336 51327657 51327044 N NA NA ATL1,NIN,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 SAV1 190313 1142 chr14 52218064 52220540 52220006 N NA NA NA NA NA NA FRMD6-AS1 99602 1143 chr14 53166394 53168905 53167538 N NA PSMC6,STYX ERO1L K562 ChIA-PET 22265404 PSMC6 4991 1144 chr14 55281303 55282732 55281943 Y NA NA GCH1,WDHD1 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS4 211112 1145 chr14 55588626 55591598 55589535 Y NA NA LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 MAPK1IP1L 70264 1146 chr14 55920346 55922341 55921213 N NA NA NA NA NA NA MAPK1IP1L 401984 1147 chr14 56009805 56011045 56010318 N NA NA ATG14,KTN1 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK1IP1L 491443 1148 chr14 56205741 56210492 56207710 N NA NA PELI2 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 374601 1149 chr14 56409907 56415585 56411883 N NA NA NA NA NA NA PELI2 169508 1150 chr14 56553760 56555663 56554710 N NA PELI2 NA NA NA NA PELI2 29430 1151 chr14 57577481 57580146 57579172 N NA NA NA NA NA NA MUDENG 155460 1152 chr14 59648684 59651078 59649897 N NA DAAM1 DAAM1,DACT1,KIAA0586,GPR135 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DAAM1 4321 1153 chr14 60353027 60360329 60356909 N NA RTN1 NA NA NA NA RTN1 15470 1154 chr14 60381193 60414259 60403762,60385819,60388547,60413236 N,N,N,N NA;NA;NA;NA RTN1 NA NA NA NA RTN1 43636 1155 chr14 60427854 60472655 60436187,60470465 N,N NA;NA NA DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 85974 1156 chr14 60688950 60690754 60689718 N NA NA PPM1A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DHRS7 56739 1157 chr14 60847493 60852631 60848988 N NA NA NA NA NA NA DHRS7 215282 1158 chr14 61080173 61085920 61084043 N NA SIX1 TMEM30B IMR90 Hi-C 24141950 SIX1 30235 1159 chr14 61121302 61127556 61124296 N NA SIX1 SLC38A6,SIX1,TRMT5,MNAT1 IMR90 Hi-C 24141950 SIX1 5147 1160 chr14 61682779 61686191 61684894 N NA NA MNAT1,SLC38A6,SIX1,TRMT5,SIX4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM30B 62339 1161 chr14 63644986 63648745 63646377 N NA NA NA NA NA NA PPP2R5E 361334 1162 chr14 64214142 64217345 64215789 N NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 19386 1163 chr14 65166566 65167012 65166941 N NA NA SPTB,ZBTB1,PLEKHG3,RAB15,GPX2,CHURC1-FNTB,PPP1R36,HSPA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB1 195274 1164 chr14 65345480 65348493 65347072 N NA CHURC1-FNTB PLEKHG3,SPTB,CHURC1-FNTB,GPX2,PPP1R36 IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 32586 1165 chr14 65360100 65361965 65360954 N NA CHURC1-FNTB SPTB,PLEKHG3,RAB15,CHURC1-FNTB IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 19114 1166 chr14 65690859 65692765 65691713 Y NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 121632 1167 chr14 65695462 65700770 65697533 N NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 126235 1168 chr14 65720710 65724203 65722444 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 151483 1169 chr14 67905049 67908900 67907057 N NA NA RDH12,PLEKHH1,VTI1B,RDH11,TMEM229B,PIGH,PLEK2,ATP6V1D,EIF2S1,ARG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2S1 78015 1170 chr14 70720718 70723843 70721865 N NA NA ADAM21P1 IMR90 Hi-C 24141950 SYNJ2BP-COX16 159964 1171 chr14 71703997 71705564 71704377 N NA NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 249014 1172 chr14 75720563 75727677 75721378,75725882 N,N NA;NA NA TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMED10 77214 1173 chr14 76733209 76735363 76734307 Y ESRRB NA NA NA NA NA C14orf118 114950 1174 chr14 77383085 77387455 77385372 Y VASH1 NA IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANGEL1 103802 1175 chr14 77420506 77425089 77422970 N NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 69945 1176 chr14 77427200 77430361 77428281,77429821 Y,N NA;NA NA IRF2BPL MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BPL 64673 1177 chr14 77464694 77468378 77466976 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 26656 1178 chr14 77553273 77556366 77554794 Y NA KIAA1737 KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1737 8212 1179 chr14 78101400 78103026 78101964 N NA NA ISM2,AHSA1,SPTLC2,ALKBH1,SLIRP IMR90 Hi-C 24141950 ALKBH1 71330 1180 chr14 78107181 78109698 78108515 N NA NA NA NA NA NA ALKBH1 64658 1181 chr14 78261092 78262090 78261443 N NA SNW1 NA NA NA NA SNW1 33595 1182 chr14 78445959 78449446 78447360 Y NA NA NA NA NA NA SNW1 218462 1183 chr14 78595525 78598484 78597019 N NA NA NA NA NA NA SNW1 368028 1184 chr14 78807109 78828357 78808368 N NA NA NA NA NA NA SNW1 579612 1185 chr14 81900202 81902486 81901960 N NA NA STON2 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L 97719 1186 chr14 81915020 81916673 81915690 N NA NA STON2 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L 83532 1187 chr14 82721474 82724586 82723592 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 721269 1188 chr14 86823087 86825764 86824086 N NA NA NA NA NA NA LOC283587 1665130 1189 chr14 87486498 87488217 87486978 N NA NA NA NA NA NA LOC283587 1002677 1190 chr14 89492849 89496213 89494122 N NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 201871 1191 chr14 89505695 89509738 89507245 N NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 214717 1192 chr14 90168228 90169776 90169034 N NA NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB11 251313 1193 chr14 90831865 90851723 90849259 N NA C14orf102,CALM1 TTC7B,C14orf102,CALM1,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11604 1194 chr14 90975814 90981804 90976735,90976797,90980380 N,N,N NA;NA;NA NA LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 112487 1195 chr14 91293245 91296033 91294614 N NA NA TTC7B,RPS6KA5,CCDC88C,C14orf159 IMR90 Hi-C 24141950 CALM1 429918 1196 chr14 93356416 93363041 93357595 N NA NA MOAP1,C14orf109,CHGA,ITPK1 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA5 95766 1197 chr14 93371423 93375724 93373776 N NA NA NA NA NA NA GOLGA5 110773 1198 chr14 94861487 94863449 94862443 Y SERPINA11,SERPINA1 NA SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 IFI27L1 313848 1199 chr14 94997721 95000542 94998947 N NA NA SERPINA5 IMR90 Hi-C 24141950 IFI27L1 450082 1200 chr14 95154887 95156640 95156004 N NA NA NA NA NA NA DICER1 443200 1201 chr14 95372419 95375269 95374252 N NA NA CLMN IMR90 Hi-C 24141950 DICER1 224571 1202 chr14 95401891 95405428 95403055 N NA NA NA NA NA NA DICER1 194412 1203 chr14 95522062 95523902 95523009 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 75938 1204 chr14 95805292 95808760 95806879 N NA NA GSC,CLMN,DICER1,DICER1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DICER1-AS1 181267 1205 chr14 96207006 96208672 96207608 N NA NA NA NA NA NA LOC100507043 134437 1206 chr14 96262510 96264664 96263950 N NA NA LOC100507043 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507043 78445 1207 chr14 99439017 99440114 99439494 Y NA NA NA NA NA NA CCNK 507625 1208 chr15 100025914 100027438 100026803 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 78695 1209 chr15 101231571 101235986 101233864 Y ASB7,ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,SELS,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 88816 1210 chr15 101261023 101264466 101262128 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB7 118268 1211 chr15 101299038 101302212 101300330 N NA NA LRRK1,ASB7,ALDH1A3 IMR90 Hi-C 24141950 ASB7 156283 1212 chr15 101388674 101409993 101389956 N NA LRRK1 ASB7,LRRK1,ALDH1A3,LINS,SELS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRK1 49467 1213 chr15 20478930 20483537 20481672 N NA NA NA NA NA NA NBEAP1 477943 1214 chr15 20553233 20553888 20553558 N NA NA LOC348120,REREP3,POTEB,CHEK2P2,HERC2P3,NBEAP1,NF1P2,LOC727924,OR4N4 IMR90 Hi-C 24141950 NBEAP1 407592 1215 chr15 20828808 20832813 20831080 N NA NA NA NA NA NA NBEAP1 128667 1216 chr15 20841532 20851025 20848937 N NA NA NF1P2,LOC348120 IMR90 Hi-C 24141950 NBEAP1 110455 1217 chr15 20981219 21011495 21010177,20985905,20995211 N,N,N NA;NA;NA NBEAP1 NBEAP1,POTEB,LOC348120,NF1P2,HERC2P3,REREP3 IMR90 Hi-C 24141950 NBEAP1 19739 1218 chr15 21074733 21084473 21082526 N NA NA NF1P2,LOC348120,NBEAP1,POTEB,CHEK2P2,HERC2P3,OR4N4,LOC727924 IMR90 Hi-C 24141950 LOC348120 61294 1219 chr15 21884889 21888599 21885679 N NA NA NA NA NA NA LOC646214 52140 1220 chr15 22452040 22455587 22453614 N NA NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 377808 1221 chr15 22788553 22791675 22790840 N NA TUBGCP5 NA NA NA NA TUBGCP5 41720 1222 chr15 22796921 22798630 22797389 N NA TUBGCP5 NA NA NA NA TUBGCP5 34765 1223 chr15 23125188 23129309 23128015 N NA NIPA1 NA NA NA NA NIPA1 38345 1224 chr15 23958026 23962096 23959435 N NA NDN NA NA NA NA NDN 25576 1225 chr15 24142227 24143927 24142775 N NA NA NA NA NA NA NDN 209777 1226 chr15 25016995 25020668 25018363 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA PAR-SN 206473 1227 chr15 25725456 25728231 25726759 N NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 41281 1228 chr15 26326310 26329506 26327508 Y NA NA LOC100128714,ATP10A,LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 642135 1229 chr15 27033045 27036180 27035200 N NA NA NA NA NA NA UBE3A 1348870 1230 chr15 27050500 27051927 27051232 N NA NA NA NA NA NA UBE3A 1366325 1231 chr15 29127023 29156541 29131298 N NA NA APBA2 K562 ChIA-PET 22265404 HERC2P9 227435 1232 chr15 29962386 29965129 29963332 N NA NA TJP1 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 149577 1233 chr15 30235683 30264613 30247885,30262676,30260931 N,N,N NA;NA;NA NA TJP1 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 120977 1234 chr15 30336497 30338421 30337518 N NA NA TJP1,FAM189A1,APBA2 IMR90 Hi-C 24141950 TJP1 221791 1235 chr15 31160417 31162870 31161733 N NA FAN1 OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 FAN1 33206 1236 chr15 31555103 31557624 31556481 Y MTMR10,KLF13 NA LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR10 271296 1237 chr15 31696587 31699803 31697963 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR10 412780 1238 chr15 31728318 31735773 31733183 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTMR10 444511 1239 chr15 32162565 32165050 32162997 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 742641 1240 chr15 33584426 33587327 33586364 N NA NA RYR3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 676735 1241 chr15 33595963 33598467 33597030 N NA NA RYR3,TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 688272 1242 chr15 35364132 35384564 35372967,35375365 N,N NA;NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 83635 1243 chr15 35581961 35603411 35601281,35596637 N,N NA;NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 301464 1244 chr15 38363185 38366678 38365177 N NA NA SPRED1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM98B 379650 1245 chr15 39648957 39651682 39650615 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 221598 1246 chr15 39683814 39687661 39686368 N NA NA THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 185619 1247 chr15 39821228 39824840 39823198 N NA THBS1 THBS1,C15orf53,C15orf54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 48440 1248 chr15 39844860 39848868 39846705 N NA THBS1 C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 24412 1249 chr15 42399023 42400928 42400062 N NA PLA2G4F PLA2G4E,PLA2G4D,PLA2G4F,VPS39 IMR90 Hi-C 24141950 PLA2G4F 47911 1250 chr15 42782068 42785504 42783366 N NA ZFP106,SNAP23 NA NA NA NA SNAP23 2000 1251 chr15 43414040 43416347 43415434 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 9375 1252 chr15 43419231 43421439 43420121 N NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 4283 1253 chr15 44542692 44547030 44544415 N NA CASC4 CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4 IMR90 Hi-C 24141950 CASC4 33879 1254 chr15 45102356 45106249 45104433,45105064 N,N NA;NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 B2M 98671 1255 chr15 45184331 45193808 45185825,45191913 N,N NA;NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 SORD 121494 1256 chr15 46073386 46074756 46074374 N NA NA NA NA NA NA PLDN 193969 1257 chr15 46093183 46097245 46094823 N NA NA NA NA NA NA PLDN 213766 1258 chr15 46146328 46149668 46148382 N NA NA NA NA NA NA PLDN 266911 1259 chr15 46249862 46252947 46251368 N NA NA NA NA NA NA PLDN 370445 1260 chr15 46939413 46942570 46940702 N NA NA NA NA NA NA PLDN 1059996 1261 chr15 50436824 50443513 50441604,50439083 N,N NA;NA NA GALK2,GABPB1,SHC4,HDC,LOC100129387 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129387 202858 1262 chr15 52300306 52305896 52301401,52304038 N,N NA;NA LEO1,MAPK6 TMOD3,LEO1,MAPK6,BCL2L10,GNB5,MYO5C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK6 5515 1263 chr15 58030949 58080097 58071626,58033467 N,N NA;NA NA GCOM1 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 362246 1264 chr15 58205787 58208991 58207284 N NA NA NA NA NA NA CGNL1 537084 1265 chr15 58558502 58631319 58624962,58579792,58571825,58622497,58599227,58561672,58630119 N,N,N,Y,N,N,N NA;NA;NA;ADAM10,AQP9;NA;NA;NA NA ADAM10,FAM63B,LIPC,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 410858 1266 chr15 58675583 58678332 58677046 N NA NA LIPC,FAM63B,ADAM10,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 363845 1267 chr15 58683840 58686961 58685069 N NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 355216 1268 chr15 60418648 60420638 60419765 N NA NA BNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA2 269547 1269 chr15 61820111 61821169 61820627 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 531495 1270 chr15 62041541 62042776 62042189 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 309888 1271 chr15 62676961 62725887 62682722 N NA NA TLN2,MGC15885,TPM1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 324297 1272 chr15 62731770 62803896 62778688,62733144 N,N NA;NA NA TLN2,MGC15885,TPM1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 379106 1273 chr15 63683924 63690528 63684969 N NA CA12 APH1B,CA12,LACTB,RAB8B,USP3,FBXL22,LOC100130855 IMR90 Hi-C 24141950 CA12 9849 1274 chr15 63692760 63700723 63695512 N NA CA12 RAB8B,APH1B,USP3,FBXL22,LOC100130855,LACTB,CA12,RPS27L,TPM1,HERC1 IMR90 Hi-C 24141950 CA12 18685 1275 chr15 63728040 63730997 63729192 N NA NA FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,APH1B,RAB8B,LACTB IMR90 Hi-C 24141950 CA12 53965 1276 chr15 63752327 63755965 63755151 N NA USP3 APH1B,USP3,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,CA12,HERC1,LACTB,FAM96A,SNX1,RPS27L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 40745 1277 chr15 63756778 63759962 63758715 N NA USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1,LACTB,RPS27L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 36748 1278 chr15 63764371 63768960 63766028 N NA USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 27750 1279 chr15 65586743 65589594 65588264 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 7725 1280 chr15 65595097 65598377 65596889 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 16079 1281 chr15 66122977 66127444 66125332 N NA DENND4A,RAB11A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11A 34353 1282 chr15 66659483 66664541 66662575 N NA TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNORD18C,SNORD18B,SNORD16,SNAPC5,ZWILCH IMR90 Hi-C 24141950 TIPIN 10429 1283 chr15 66938723 66943197 66939681,66942088 N,N NA;NA NA SMAD6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 51477 1284 chr15 66943721 66956180 66947416,66944894 N,N NA;NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 38494 1285 chr15 66962479 66965765 66963527 N NA SMAD6 SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 28909 1286 chr15 66984597 66986634 66985394 N NA SMAD6 SMAD6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 8040 1287 chr15 67223749 67226674 67224355 N NA NA SKOR1,SMAD3,LOC100506686,IQCH,MAP2K5,AAGAB,SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 229075 1288 chr15 67340361 67341519 67340963 N NA NA SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAGAB 205555 1289 chr15 68154489 68158976 68155978 N NA NA PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 187596 1290 chr15 68169986 68178774 68177479 N NA NA PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686,IQCH,SKOR1 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167798 1291 chr15 68205070 68211145 68208741 N NA NA CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 135427 1292 chr15 68213967 68219496 68216059 N NA NA PIAS1,LOC100506686,IQCH,CLN6,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 127076 1293 chr15 68228584 68232908 68229665 N NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 113664 1294 chr15 68259003 68261913 68260625 Y C15orf61 NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 84659 1295 chr15 68547674 68550970 68549591 N NA CALML4,FEM1B ITGA11,FEM1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FEM1B 19171 1296 chr15 70315399 70317210 70316321 N NA NA C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 73046 1297 chr15 70896323 70898673 70898035 N NA NA UACA,LARP6 IMR90 Hi-C 24141950 THAP10 286099 1298 chr15 72927770 72940526 72929327 N NA BBS4 CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 BBS4 37994 1299 chr15 73946037 73948462 73947163 N NA NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 20284 1300 chr15 74386014 74394205 74392652 N NA NA NA NA NA NA PML 99000 1301 chr15 75021673 75025955 75022025 N NA EDC3,CYP1A1 EDC3,CLK3,CYP1A1,CYP1A2,C15orf17,MPI,COX5A,SCAMP2 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1A1 3796 1302 chr15 75613611 75616663 75614862 N NA COMMD4,NEIL1,MAN2C1 NEIL1,COMMD4 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD4 11711 1303 chr15 76122440 76125638 76124297 N NA UBE2Q2 UBE2Q2,DNM1P35 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2Q2 9984 1304 chr15 77191874 77199205 77197739 N NA SCAPER,RCN2 ETFA IMR90 Hi-C 24141950 SCAPER 15657 1305 chr15 77374887 77376873 77376299 N NA TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 11317 1306 chr15 77859937 77885290 77861565 N NA NA PSTPIP1,TSPAN3,PEAK1 IMR90 Hi-C 24141950 HMG20A 146694 1307 chr15 78233153 78238230 78237008 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 131764 1308 chr15 78723105 78727942 78726645,78725091 N,N NA;NA IREB2 IREB2,WDR61 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IREB2 2576 1309 chr15 79151589 79154062 79152768 Y IREB2 MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11110 1310 chr15 79850770 79855484 79854833 N NA NA KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 TMED3 247279 1311 chr15 80023369 80037924 80037112 N NA NA KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 151703 1312 chr15 80045357 80072890 80069873,80067743,80054207 N,N,N NA;NA;NA NA TMED3,KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 116737 1313 chr15 82116906 82165284 82152442,82163003 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MEX3B 173077 1314 chr15 82260204 82291524 82287510 N NA MEX3B MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 46837 1315 chr15 85707240 85709831 85708453 N NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 183496 1316 chr15 85710676 85713212 85712090 Y NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 186932 1317 chr15 85719252 85722732 85720453 N NA NA ZNF592 IMR90 Hi-C 24141950 PDE8A 195508 1318 chr15 85738133 85756933 85756115 N NA NA NA NA NA NA AKAP13 166938 1319 chr15 85777362 85779434 85778333 N NA NA NA NA NA NA AKAP13 144437 1320 chr15 85872855 85876471 85874530,85872863 Y,N NA;NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47400 1321 chr15 88347986 88351678 88348848 N NA NA NA NA NA NA MRPL46 658955 1322 chr15 89483276 89484991 89484073 N NA NA NA NA NA NA ABHD2 146390 1323 chr15 90488809 90491449 90490278 N NA C15orf38-AP3S2 MESP1,WDR93,IDH2,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf38-AP3S2 32587 1324 chr15 90691351 90694738 90692765 N NA IDH2,SEMA4B IDH2,C15orf38-AP3S2,SEMA4B,IQGAP1,ZNF710,C15orf58,CIB1,TTLL13,MESP1,WDR93,NGRN IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4B 33414 1325 chr15 90703452 90705495 90704125 N NA SEMA4B C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,CIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 22657 1326 chr15 90708200 90710602 90709152 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 17550 1327 chr15 90717350 90721356 90717976 N NA SEMA4B SEMA4B MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA4B 6796 1328 chr15 92079553 92081241 92080158 N NA NA SLCO3A1,SV2B IMR90 Hi-C 24141950 VPS33B 513720 1329 chr15 93202295 93212426 93210605 N NA FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3264 1330 chr15 93237240 93241775 93239591 N NA FAM174B SLCO3A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 38209 1331 chr15 93244644 93254305 93249173,93252515 N,N NA;NA FAM174B SLCO3A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 45613 1332 chr15 93255231 93261445 93257576 N NA NA SLCO3A1,FAM174B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM174B 56200 1333 chr15 93275663 93278887 93277472 N NA NA SLCO3A1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 76632 1334 chr15 93303189 93311742 93310718 N NA NA NA NA NA NA FAM174B 104158 1335 chr15 93361583 93366264 93363704,93366002 Y,Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2;NA NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 59809 1336 chr15 93373217 93376944 93375246 Y NA LOC100507217 LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 49129 1337 chr15 93398263 93402793 93399291 N NA LOC100507217,CHD2 LOC100507217 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507217 23280 1338 chr15 94652783 94655744 94654075 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 185686 1339 chr15 95145718 95149126 95147288 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 304288 1340 chr15 95386681 95390650 95388276,95387273 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MCTP2 545251 1341 chr15 96327827 96329034 96328312 N NA NA NA NA NA NA MCTP2 1486397 1342 chr15 99090243 99092975 99091859 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 99786 1343 chr15 99142584 99145144 99143766 N NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 47617 1344 chr15 99556697 99574651 99558611 N NA NA PGPEP1L,IGF1R MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SYNM 70635 1345 chr15 99597497 99604420 99602249 N NA SYNM IGF1R,PGPEP1L,FAM169B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNM 40866 1346 chr15 99615858 99621732 99619961 N NA SYNM IGF1R,FAM169B,PGPEP1L,TTC23,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNM 23554 1347 chr15 99975079 99976383 99975853 N NA NA LRRC28,LYSMD4,MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 129750 1348 chr16 10921561 10924746 10922950 Y NUBP1,SOCS1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 NUBP1 83863 1349 chr16 11389544 11392894 11391257 N NA SOCS1 SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOCS1 39505 1350 chr16 11395753 11398672 11397387 N NA SOCS1 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS1 45714 1351 chr16 11590170 11592938 11591399 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 240131 1352 chr16 11729536 11731541 11730377 N NA NA CLEC16A,LITAF,TXNDC11,SNN IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC11 105107 1353 chr16 12713077 12713788 12713727 N NA NA SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 GSPT1 702558 1354 chr16 1346362 1348776 1347202 N NA NA UNKL IMR90 Hi-C 24141950 IFT140 313333 1355 chr16 13998448 13999600 13999231 N NA ERCC4 MKL2 IMR90 Hi-C 24141950 ERCC4 14414 1356 chr16 14795280 14800106 14797180,14796419 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BFAR 68612 1357 chr16 15483921 15485220 15484734 N NA MPV17L NA NA NA NA MPV17L 4391 1358 chr16 18417348 18418327 18417906 N NA NA NA NA NA NA RPS15A 383329 1359 chr16 19385061 19410769 19400779,19405106,19408732 N,N,N NA;NA;NA TMC5 SYT17,TMC5 IMR90 Hi-C 24141950 TMC5 11288 1360 chr16 20711715 20720672 20714935,20719058 N,N NA;NA THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 32527 1361 chr16 21231868 21235090 21233562 N NA NA TMEM159,CRYM,CRYM-AS1,ANKS4B IMR90 Hi-C 24141950 NPIPL3 201568 1362 chr16 21854290 21854974 21854917 N NA RRN3P1 NA NA NA NA RRN3P1 23795 1363 chr16 22196510 22204840 22200905,22203350 N,N NA;NA NA UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLR3E 103901 1364 chr16 22206781 22208315 22207128 Y NA NA POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLR3E 100426 1365 chr16 22634632 22637331 22635647 N NA NA SLC7A5P2,OTOA,CRYM,CRYM-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100132247 109788 1366 chr16 23163305 23166437 23164307 N NA NA NA NA NA NA GGA2 355378 1367 chr16 24620556 24624586 24621760 N NA NA TNRC6A,RBBP6,ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 69648 1368 chr16 25076692 25086588 25078208 N NA LOC554206,LCMT1 LCMT1,LOC100506655,TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC554206 33630 1369 chr16 25115668 25120899 25115935,25118495 N,N NA;NA LCMT1 ARHGAP17,LCMT1,ZKSCAN2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 2148 1370 chr16 27184291 27186999 27185878,27185452 N,N NA;NA NA HS3ST4,LOC283888,IL21R,NSMCE1 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 93114 1371 chr16 28288922 28290537 28289452 N NA SBK1 CCDC101,SBK1,XPO6,IL27,APOBR,NUPR1,SULT1A2,SULT1A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SBK1 13303 1372 chr16 28465024 28467040 28466291 N NA EIF3C NA NA NA NA EIF3C 27249 1373 chr16 29038835 29039588 29039164 N NA RRN3P2 SPNS1,NFATC2IP IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 46575 1374 chr16 2916469 2919736 2918238 Y NA ZG16B PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZG16B 36296 1375 chr16 29188475 29190164 29189258 N NA NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 102312 1376 chr16 29272160 29276329 29273165 N NA NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 185997 1377 chr16 29295577 29298191 29296685 N NA NA SNX29P2 IMR90 Hi-C 24141950 SLX1B-SULT1A4 168221 1378 chr16 29502032 29503193 29502973 N NA SLX1B-SULT1A4 NA NA NA NA SLX1B-SULT1A4 35620 1379 chr16 29774479 29780608 29776959 N NA KIF22,PRRT2 ZG16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF22 21426 1380 chr16 29954330 29957670 29955543 N NA ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA,PPP4C,DOC2A,C16orf92,FAM57B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 15681 1381 chr16 30643150 30647991 30645786 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF785,ZNF689,PRR14 PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 14250 1382 chr16 30815988 30834695 30816948,30825788 N,Y NA;NA RNF40,ZNF629 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 17465 1383 chr16 32489735 32491439 32490679 N NA NA NA NA NA NA KIAA0664L3 777801 1384 chr16 33379213 33385771 33381755 N NA NA NA NA NA NA KIAA0664L3 1667279 1385 chr16 33398185 33405395 33398758 N NA NA NA NA NA NA KIAA0664L3 1686251 1386 chr16 34438846 34440070 34439358 N NA NA NA NA NA NA KIAA0664L3 2726912 1387 chr16 34862652 34864223 34863776 N NA NA NA NA NA NA KIAA0664L3 3150718 1388 chr16 4336792 4340374 4339052 N NA TFAP4 CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 13791 1389 chr16 46795617 46797609 46796641 N NA NA MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf87 67465 1390 chr16 47070305 47073567 47072014 N NA NA ABCC12,ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB IMR90 Hi-C 24141950 GPT2 151997 1391 chr16 48656861 48665611 48664474,48657396 N,N NA;NA NA ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1,ITFG1,ABCC12,NETO2 IMR90 Hi-C 24141950 PHKB 1161651 1392 chr16 49967432 49968308 49968158 N NA NA NA NA NA NA CNEP1R1 90881 1393 chr16 52731874 52732858 52732206 N NA NA NA NA NA NA CHD9 356087 1394 chr16 54393908 54395488 54394454 N NA NA FTO,CES5A IMR90 Hi-C 24141950 IRX3 73530 1395 chr16 54453195 54465378 54455765,54459789,54463152 N,N,N NA;NA;NA NA FTO,IRX5,CRNDE,IRX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRX3 132817 1396 chr16 54541839 54544842 54543455 N NA NA NA NA NA NA IRX3 221461 1397 chr16 54572303 54577138 54574897 N NA NA NA NA NA NA IRX3 251925 1398 chr16 56584930 56587500 56585996 Y MT3,GNAO1,BBS2 NA AMFR,NUDT21,MT1B,BBS2,MT2A,MT3,MT1A,MT1JP,MT1DP,MT1M,MT1H,MT1X,MT1IP,MT1G,NUP93 IMR90 Hi-C 24141950 MT1E 72085 1399 chr16 57333230 57335242 57334178 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 54192 1400 chr16 66077086 66079625 66078664 N NA NA NA NA NA NA TK2 504690 1401 chr16 67554131 67556638 67555361 N NA ATP6V0D1,CTCF AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,C16orf48,C16orf86 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V0D1 39042 1402 chr16 68562285 68563890 68562756 N NA ZFP90 CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 9771 1403 chr16 69427254 69432394 69428113,69430806 N,N NA;NA TMED6,TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7380 1404 chr16 69449867 69453405 69451714 N NA TERF2,CYB5B CYB5B,COG8,NIP7,TMED6,TERF2,MIR1538,NFAT5,NQO1,WWP2,NOB1,KCTD16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CYB5B 5093 1405 chr16 72235615 72237283 72236686 N NA NA HPR,PMFBP1,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 DHX38 108000 1406 chr16 72598788 72601810 72600328 N NA NA NA NA NA NA DHX38 471173 1407 chr16 72652195 72663879 72661195 N NA NA NA NA NA NA ZFHX3 428655 1408 chr16 72695167 72701060 72698909 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 391474 1409 chr16 73203525 73206398 73205039 N NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 110991 1410 chr16 73212799 73215404 73214036 N NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 120265 1411 chr16 73592157 73595305 73593842 N NA NA NA NA NA NA ZFHX3 499623 1412 chr16 74133251 74137034 74135112 N NA NA NA NA NA NA PSMD7 193639 1413 chr16 75024533 75028161 75025709 N NA WDR59 ZNRF1,WDR59 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WDR59 5516 1414 chr16 78044096 78047356 78045916,78044335 N,N NA;NA NA VAT1L,NUDT7 IMR90 Hi-C 24141950 MAF 1587266 1415 chr16 79319923 79322304 79321158 N NA NA NA NA NA NA MAF 312318 1416 chr16 79744588 79747802 79746354 N NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 109966 1417 chr16 79789628 79794656 79793106 N NA NA WWOX,MAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAF 155006 1418 chr16 79800468 79807003 79804602,79803356 N,N NA;NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 165846 1419 chr16 79841985 79844683 79843092 N NA NA NA NA NA NA MAF 207363 1420 chr16 80111782 80114594 80113188 N NA NA NA NA NA NA MAF 477160 1421 chr16 80868867 80873774 80871073 N NA NA NA NA NA NA ATMIN 195684 1422 chr16 80906520 80911784 80910308 N NA NA NA NA NA NA ATMIN 157674 1423 chr16 80915206 80920394 80917242 N NA NA NA NA NA NA ATMIN 149064 1424 chr16 80933172 80936275 80934361 N NA NA NA NA NA NA ATMIN 133183 1425 chr16 80942402 80944830 80943833 N NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 ATMIN 124628 1426 chr16 80951566 80959593 80959433 N NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 ATMIN 109865 1427 chr16 80961041 80969145 80966206 N NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 ATMIN 100313 1428 chr16 82362176 82364741 82363599 N NA NA CDH13 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 158347 1429 chr16 83912674 83914175 83913290 N NA NA FBXO18,HSBP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 HSBP1 71081 1430 chr16 84389195 84392350 84390330 N NA ATP2C2 ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2C2 9783 1431 chr16 84394319 84397152 84396127 N NA ATP2C2 ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2C2 4981 1432 chr16 84556000 84558850 84557330 N NA KIAA1609 KIAA1609,COTL1,USP10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1609 17712 1433 chr16 85049460 85056121 85054491 N NA NA USP10,ZDHHC7,KIAA0513 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1609 511172 1434 chr16 85354241 85366967 85355740 Y NA NA FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311,LOC400548 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 278062 1435 chr16 85367514 85371879 85368563 Y NA NA KIAA0182,GINS2,LOC400548,LINC00311,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 273150 1436 chr16 85381922 85387478 85383297 N NA NA LOC727710,KIAA0182,LOC400548,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 257551 1437 chr16 85417591 85419786 85418572 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 225243 1438 chr16 86007501 86010517 86008775 N NA NA COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550,C16orf74,IRF8 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 362472 1439 chr16 87978562 87980834 87979238 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 4204 1440 chr16 89563904 89566063 89564869 N NA SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 8742 1441 chr16 90147917 90150202 90148820 N NA NA GAS8,DBNDD1,PRDM7,LOC100130015 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CENPBD1 108677 1442 chr16 90261823 90294701 90261980 N NA NA NA NA NA NA CENPBD1 222583 1443 chr17 10870448 10872829 10871555 N NA NA SHISA6,DNAH9 IMR90 Hi-C 24141950 C17orf48 269521 1444 chr17 1156838 1159327 1157215 Y NA NA ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAE 144229 1445 chr17 12324424 12327352 12325486 N NA NA MYOCD,FLJ34690 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF18 423735 1446 chr17 13854773 13856761 13855968 N NA NA NA NA NA NA COX10 115958 1447 chr17 16490895 16492242 16491315 N NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 18375 1448 chr17 16920582 16923879 16922116 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 22195 1449 chr17 16933108 16936412 16935819 N NA MPRIP MPRIP,COPS3 IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 9662 1450 chr17 18963946 18971494 18965093,18967599 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EPN2 169196 1451 chr17 18973016 18980677 18973870 N NA NA NA NA NA NA EPN2 160013 1452 chr17 19014621 19018603 19014622,19016108 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EPN2 122087 1453 chr17 19083376 19086030 19084989 N NA NA NA NA NA NA EPN2 54660 1454 chr17 19089961 19095062 19091203,19093711 N,N NA;NA EPN2 NA NA NA NA EPN2 45628 1455 chr17 19099057 19106727 19099891 N NA EPN2 NA NA NA NA EPN2 33963 1456 chr17 19373202 19375162 19374299 N NA NA ULK2,AKAP10,EPN2,SLC47A2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 91707 1457 chr17 19410082 19412611 19411529 Y NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 128587 1458 chr17 19422460 19424506 19423505 N NA NA ALDH3A2,B9D1,SLC47A2,ULK2,ALDH3A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 127558 1459 chr17 19505456 19507118 19506563 N NA ALDH3A2 SLC47A2,ALDH3A2,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH3A2 44946 1460 chr17 20431092 20441501 20435912 N NA NA NA NA NA NA USP22 504851 1461 chr17 20810367 20813257 20812012 N NA NA USP22 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 133095 1462 chr17 21000990 21004273 21002586 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 25968 1463 chr17 21176382 21180894 21179210 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 NA MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM11 58474 1464 chr17 21739534 21742171 21740030 N NA NA NA NA NA NA MTRNR2L1 280266 1465 chr17 21756140 21758089 21756716 N NA NA KCNJ12 IMR90 Hi-C 24141950 MTRNR2L1 264348 1466 chr17 25676200 25682304 25680950 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 55094 1467 chr17 2657806 2659299 2658816 N NA KIAA0664 MIR1253,METTL16 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0664 42879 1468 chr17 26794416 26796493 26795436 N NA NA NA NA NA NA SLC46A1 61186 1469 chr17 27701219 27708444 27706653 N NA TAOK1 MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAOK1 9499 1470 chr17 28666505 28669008 28667811 N NA BLMH,CPD BLMH,NSRP1,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,TMIGD1,CPD,GOSR1,SUZ12P IMR90 Hi-C 24141950 CPD 36934 1471 chr17 28669996 28673365 28671693 N NA CPD NSRP1,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH,TMIGD1,CPD,GOSR1,SUZ12P IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 32577 1472 chr17 28992872 29006533 28994840 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 30093 1473 chr17 30070428 30072693 30071324 N NA NA MIR193A,UTP6,RAB11FIP4,C17orf79,MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 C17orf79 113633 1474 chr17 30408978 30419496 30410953 N NA RHOT1 RHOT1 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 49977 1475 chr17 30427461 30429334 30428846 N NA RHOT1 RHOT1 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 40139 1476 chr17 30451553 30456130 30452396,30454738 N,N NA;NA RHOT1 RHOT1,LRRC37B IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 13343 1477 chr17 31237452 31240978 31239463 N NA TMEM98 MYO1D,ACCN1,TMEM98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM98 13950 1478 chr17 32999528 33003537 33002195 N NA NA RAD51L3-RFFL,C17orf102,TMEM132E,CCT6B IMR90 Hi-C 24141950 CCT6B 284991 1479 chr17 33624393 33627124 33626297 N NA NA SLFN12L IMR90 Hi-C 24141950 SLFN5 54307 1480 chr17 34125291 34130142 34127959 N NA GAS2L2,TAF15 AP2B1,RASL10B,C17orf50,MMP28 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF15 6346 1481 chr17 35012653 35071765 35014345 N NA NA AATF,LHX1,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90 Hi-C 24141950 MRM1 54628 1482 chr17 35077069 35104160 35078364,35088234 N,N NA;NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 119044 1483 chr17 35174952 35177004 35175957 N NA NA AATF,LHX1 IMR90 Hi-C 24141950 AATF 129171 1484 chr17 35212972 35215865 35214532 N NA NA NA NA NA NA AATF 90310 1485 chr17 35286647 35290177 35288871,35289385 N,N NA;NA AATF LHX1,AATF IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AATF 15998 1486 chr17 36161908 36164051 36163041 N NA NA HNF1B,SYNRG,DDX52,LOC284100 IMR90 Hi-C 24141950 HNF1B 56812 1487 chr17 37772620 37775939 37774549 N NA STARD3,TCAP PPP1R1B K562 ChIA-PET 22265404 STARD3 17394 1488 chr17 39803390 39806019 39805241 N NA EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF1 39108 1489 chr17 39820895 39823989 39822334 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 21138 1490 chr17 41396591 41402140 41400646 N NA TMEM106A BRCA1,NBR2,IFI35,RND2,VAT1,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM106A 32697 1491 chr17 41794824 41803582 41797959 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5,ARL4D,PYY IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 52786 1492 chr17 44314527 44315531 44315058 N NA KANSL1-AS1,KANSL1 NA NA NA NA KANSL1 11787 1493 chr17 44327202 44331387 44329699 N NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 KANSL1 24462 1494 chr17 44335841 44340506 44336342,44337755 N,N NA;NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC37A 31991 1495 chr17 44341134 44348429 44344688 N NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC37A 24068 1496 chr17 4468462 4470663 4468987 N NA MYBBP1A SPNS2,SMTNL2,ALOX15 IMR90 Hi-C 24141950 MYBBP1A 9781 1497 chr17 46748202 46750794 46749379 N NA HOXB-AS5 TTLL6,SKAP1,MIR3185,HOXB13,UBE2Z,IGF2BP1,HOXB6,HOXB-AS3,HOXB9,MIR196A1,CALCOCO2,HOXB8,HOXB-AS5,PRAC,ATP5G1,SNX11 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB-AS5 49748 1498 chr17 47500458 47504087 47501855 N NA PHB ZNF652,SPOP,FAM117A,KAT7 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 8216 1499 chr17 47562499 47564578 47563871 N NA NA ZNF652,FAM117A,NGFR,KAT7,SPOP,SLC35B1,DLX3,DLX4 IMR90 Hi-C 24141950 PHB 70257 1500 chr17 47644815 47647542 47645658,47647481 N,Y NA;NA NA ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPOP 107983 1501 chr17 48980482 49006196 48981968,48986830,48992770,48997074 N,N,N,Y NA;NA;NA;UTP18,RSAD1,TOB1 LOC400604,TOB1 TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 35143 1502 chr17 49007225 49009990 49008588 Y NA NA WFIKKN2,LOC400604,TOB1,SPAG9,LINC00483,ANKRD40 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 61886 1503 chr17 51183003 51183868 51183624 N NA NA NA NA NA NA TOM1L1 1794184 1504 chr17 5162153 5167544 5166184,5163782 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF594 66975 1505 chr17 53314407 53317294 53315870 Y HLF NA STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 182047 1506 chr17 53510054 53512063 53511002 N NA MMD MMD,TMEM100,PCTP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 10713 1507 chr17 53522904 53526058 53524328 N NA MMD PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 23563 1508 chr17 53556659 53584508 53579281 N NA NA HLF,MMD IMR90 Hi-C 24141950 MMD 57318 1509 chr17 53592319 53599109 53592488 N NA NA PCTP,TMEM100,HLF IMR90 Hi-C 24141950 MMD 92978 1510 chr17 55290952 55295169 55292873 Y NA MSI2 MSI2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSI2 38762 1511 chr17 55306638 55311207 55309144 N NA MSI2 NA NA NA NA MSI2 22724 1512 chr17 55842848 55846299 55844097 N NA NA MSI2,MSX2P1,OR4D1,AKAP1,RNF126P1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 81134 1513 chr17 55990784 55996950 55995872 N NA NA VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS23 63351 1514 chr17 56020350 56025663 56024347 N NA VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 VEZF1 39952 1515 chr17 56123034 56142322 56138165 Y NA SRSF1 DYNLL2,MRPS23,SRSF1,AKAP1,VEZF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SRSF1 38327 1516 chr17 5659826 5662045 5660808 N NA NA LOC339166,WSCD1 IMR90 Hi-C 24141950 MIS12 269579 1517 chr17 58188218 58202183 58195411 N NA HEATR6 LOC645638,C17orf64 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HEATR6 31926 1518 chr17 58203638 58214106 58212721 N NA HEATR6 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 47346 1519 chr17 59587770 59591761 59588956 N NA NA BRIP1,TBX4,BCAS3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13 550882 1520 chr17 61526705 61533933 61532985 N NA NA NA NA NA NA KCNH6 66762 1521 chr17 62355221 62357169 62356366 N NA TEX2 TEX2,SNORA76,SNORD104,POLG2,ERN1,PECAM1,CD79B,SCN4A,ICAM2,C17orf72 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX2 14568 1522 chr17 62359361 62360919 62360170 N NA TEX2 TEX2,SNORA76,SNORD104,ERN1,PECAM1,SCN4A,CD79B,ICAM2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX2 18708 1523 chr17 62701821 62704256 62703292 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 43435 1524 chr17 6278680 6281803 6280560 N NA NA LOC339166,WSCD1,AIPL1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC17 262419 1525 chr17 6295701 6298390 6296811 N NA NA NA NA NA NA TXNDC17 245832 1526 chr17 62977531 62983122 62981394 Y DDX5,CEP95,LRRC37A3,RGS9,GNA13 AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 5828 1527 chr17 63092497 63100010 63096857 N NA GNA13 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 39577 1528 chr17 63116226 63121047 63119562 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 63306 1529 chr17 63370247 63372825 63371244,63371259 N,N NA;NA NA CEP112,AXIN2,PRKCA IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 317327 1530 chr17 66014814 66018675 66016187 Y NA KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13173 1531 chr17 66487838 66490073 66488270 N NA PRKAR1A ABCA10,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 18037 1532 chr17 66754813 66756493 66755884 N NA NA FAM20A,ABCA10,ABCA9,ABCA8,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 246703 1533 chr17 67276978 67325203 67323389 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K6 85635 1534 chr17 67335307 67341133 67336321,67339422 N,N NA;NA NA KCNJ16,UNK,H3F3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K6 69705 1535 chr17 67362736 67364958 67363809 N NA MAP2K6 FAM20A IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 45880 1536 chr17 67386072 67388816 67387185 N NA MAP2K6 NA NA NA NA MAP2K6 22022 1537 chr17 69106722 69109705 69108249 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 1007456 1538 chr17 69110830 69114518 69112647 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 1002643 1539 chr17 69158012 69161111 69159706 N NA NA NA NA NA NA SOX9 956050 1540 chr17 70025587 70027715 70026733 N NA NA NA NA NA NA SOX9 89446 1541 chr17 70143829 70149897 70147847 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 26668 1542 chr17 70178499 70179781 70179200 N NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 61338 1543 chr17 70346586 70353476 70349149 N NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 229425 1544 chr17 7045818 7047560 7046380 N NA NA CLEC10A,SLC16A13,ASGR2,SLC16A11,MIR497HG,BCL6B,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG4 75809 1545 chr17 71896715 71898814 71898098 N NA NA NA NA NA NA RPL38 300981 1546 chr17 71924489 71928065 71926629 N NA NA NA NA NA NA RPL38 271730 1547 chr17 72177394 72181177 72178821 N NA RPL38 NA NA NA NA RPL38 18618 1548 chr17 74814924 74818710 74816703 N NA NA MGAT5B,MFSD11,SEC14L1,SRSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 81431 1549 chr17 74825842 74829462 74827456 N NA NA MGAT5B,MFSD11,SRSF2,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 92349 1550 chr17 75072026 75074897 75072692 N NA SEC14L1 MGAT5B,SRSF2,MFSD11,METTL23,SEC14L1,JMJD6,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 SEC14L1 9828 1551 chr17 75521670 75525335 75523339,75524689 N,N NA;NA NA LOC100507351,FLJ45079,TNRC6C IMR90 Hi-C 24141950 SEPT9 244178 1552 chr17 75606065 75608429 75606972 N NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT9 328573 1553 chr17 75729422 75732816 75731313 N NA NA TNRC6C IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 267502 1554 chr17 75883312 75885521 75883944 Y TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1 NA NA NA NA NA TNRC6C 114797 1555 chr17 75930347 75932484 75931439 N NA NA LOC100507351,TNRC6C IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 67834 1556 chr17 76928749 76934884 76930264 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2,USP36,LOC100507410,C1QTNF1,LGALS3BP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TIMP2 7277 1557 chr17 77635312 77640709 77639107,77636800 N,N NA;NA NA RBFOX3 IMR90 Hi-C 24141950 CBX2 111268 1558 chr17 77815656 77822122 77818336,77816739 N,Y NA;NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 2443 1559 chr17 78501957 78503569 78502814 N NA RPTOR NA NA NA NA RPTOR 15056 1560 chr17 79308396 79320246 79316721,79318304 Y,Y NA;TMEM105,BAHCC1 SLC38A10 ACTG1,SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A10 39300 1561 chr17 80244629 80246948 80246174 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 13035 1562 chr17 81021436 81024163 81022782 N NA NA TBCD,ZNF750,B3GNTL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ43681 150503 1563 chr17 81121275 81123460 81122364 N NA NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 FLJ43681 51206 1564 chr17 9701107 9703381 9701583,9701956 N,N NA;NA NA NA NA NA NA USP43 152157 1565 chr18 10039907 10043812 10041302 Y APCDD1 NA APCDD1,VAPA,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 125952 1566 chr18 10130651 10133088 10131779 N NA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 216696 1567 chr18 10284220 10286577 10285176 N NA NA APCDD1,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 239296 1568 chr18 12211575 12212696 12211861 N NA NA NA NA NA NA SLMO1 195199 1569 chr18 1390633 1395398 1393364,1392636 N,N NA;NA NA NA NA NA NA YES1 578306 1570 chr18 14428927 14432752 14431424 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 249831 1571 chr18 14934240 14937971 14936182 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 755144 1572 chr18 14946003 14952529 14946929,14950279 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 766907 1573 chr18 15065271 15069326 15066574 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 886175 1574 chr18 15190772 15204215 15198111 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 1011676 1575 chr18 15244725 15247291 15245953 N NA NA NA NA NA NA ANKRD20A5P 1065629 1576 chr18 18746304 18750749 18748432 N NA NA ROCK1 IMR90 Hi-C 24141950 ROCK1 54492 1577 chr18 19623428 19626864 19624817 N NA NA NA NA NA NA MIB1 301883 1578 chr18 19820749 19823257 19822208 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIB1 499204 1579 chr18 19833091 19835323 19834090 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIB1 511546 1580 chr18 20002334 20004265 20003062 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 509030 1581 chr18 20048865 20052779 20051357 N NA NA GATA6,RBBP8 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 460516 1582 chr18 20138120 20140794 20139341 N NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 372501 1583 chr18 21561624 21563636 21562657 Y NA NA TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 LAMA3 292062 1584 chr18 22000613 22003188 22001843 N NA IMPACT NA NA NA NA IMPACT 3421 1585 chr18 24238007 24244378 24239213 N NA NA TAF4B IMR90 Hi-C 24141950 TAF4B 431598 1586 chr18 24323621 24328228 24325485,24327097 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TAF4B 517212 1587 chr18 24335486 24338575 24337410 N NA NA NA NA NA NA TAF4B 529077 1588 chr18 24342758 24346527 24344997 N NA NA NA NA NA NA TAF4B 536349 1589 chr18 26836014 26837029 26836578 N NA NA NA NA NA NA DSC3 1785752 1590 chr18 2842145 2842671 2842309 N NA NA EMILIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 169274 1591 chr18 28763665 28767846 28765650 N NA NA NA NA NA NA DSC2 81277 1592 chr18 28777130 28781870 28779572 N NA NA NA NA NA NA DSC2 94742 1593 chr18 28784550 28788849 28785476,28787084 N,Y NA;DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 102162 1594 chr18 28820513 28823683 28821974 N NA NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 138125 1595 chr18 290358 294872 291949 N NA THOC1 YES1,COLEC12,CLUL1,CETN1 IMR90 Hi-C 24141950 THOC1 22299 1596 chr18 29302508 29307572 29304198 N NA NA NA NA NA NA TRAPPC8 215519 1597 chr18 31360597 31362334 31361545 N NA NA NA NA NA NA WBP11P1 1268971 1598 chr18 31382142 31383927 31383138 N NA NA NA NA NA NA WBP11P1 1290516 1599 chr18 31906490 31913832 31911036 N NA NA NA NA NA NA ZNF397 907162 1600 chr18 33516612 33520226 33519131 N NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 32362 1601 chr18 37375331 37380785 37379704 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 2154414 1602 chr18 37687033 37690602 37689433 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1844597 1603 chr18 40864850 40867116 40866132 N NA SYT4 NA NA NA NA SYT4 7235 1604 chr18 43356625 43364860 43362815,43357757,43361538 N,N,N NA;NA;NA NA SLC14A1,EPG5,SIGLEC15,SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 182445 1605 chr18 43381366 43384885 43383282 N NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPG5 162420 1606 chr18 45676491 45690981 45687923 N NA NA ZBTB7C,MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 374446 1607 chr18 45833052 45835487 45834607 N NA NA ZBTB7C IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 229940 1608 chr18 45882343 45885116 45883666 N NA NA ZBTB7C IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 180311 1609 chr18 46018310 46021870 46020364 N NA CTIF CTIF,DYM IMR90 Hi-C 24141950 CTIF 43557 1610 chr18 46522947 46524830 46523796 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 45866 1611 chr18 47188898 47192246 47190679 N NA NA ACAA2,MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 LIPG 100471 1612 chr18 49181204 49184058 49182793 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 457153 1613 chr18 51760692 51764828 51762570,51762477 N,N NA;NA POLI POLI,MBD2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 POLI 31021 1614 chr18 51771815 51775443 51773802 N NA POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 20406 1615 chr18 51777261 51783346 51780852 N NA POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 12503 1616 chr18 52432769 52436465 52434495 N NA NA CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 59243 1617 chr18 52443627 52446483 52444965 N NA RAB27B CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 49225 1618 chr18 54939006 54941691 54940557 N NA NA WDR7 IMR90 Hi-C 24141950 FECH 312278 1619 chr18 55505742 55507161 55506357 N NA NA NEDD4L,ATP8B1,LOC100505549 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100505549 208208 1620 chr18 56444010 56448654 56446902 N NA NA ALPK2,ZNF532,LOC390858,GRP,NEDD4L,SEC11C IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 105392 1621 chr18 56678956 56682245 56680730 N NA NA ZNF532,LOC390858,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 124880 1622 chr18 567224 570450 568995 N NA NA COLEC12,THOC1,CLUL1 IMR90 Hi-C 24141950 ENOSF1 142212 1623 chr18 56750154 56755655 56752821 N NA NA LOC390858,ALPK2,MALT1,SEC11C,ZNF532,GRP,LMAN1,CPLX4 IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 51470 1624 chr18 56761928 56766862 56763855 N NA SEC11C SEC11C IMR90 Hi-C 24141950 SEC11C 40263 1625 chr18 57636600 57640753 57640086,57637064 N,N NA;NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 LMAN1 610092 1626 chr18 59562552 59566614 59563077 N NA NA RNF152 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIGN 287675 1627 chr18 60086863 60089269 60088197 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2,TNFRSF11A,BCL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1468 232339 1628 chr18 60091594 60093922 60092944 N NA NA PHLPP1,BCL2,ZCCHC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1468 237070 1629 chr18 60741098 60743343 60742046 N NA NA NA NA NA NA KDSR 291163 1630 chr18 61118778 61120676 61119812 N NA VPS4B NA NA NA NA VPS4B 29026 1631 chr18 61518946 61520943 61519428 N NA NA SERPINB10,SERPINB13 IMR90 Hi-C 24141950 VPS4B 429194 1632 chr18 63572085 63575452 63573899,63573267 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DSEL 1608515 1633 chr18 64743635 64745399 64744486 N NA NA NA NA NA NA DSEL 438568 1634 chr18 65075604 65080314 65078360 N NA NA TMX3,LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 DSEL 103653 1635 chr18 65772246 65773811 65772989 N NA NA TMX3 IMR90 Hi-C 24141950 DSEL 588279 1636 chr18 70631632 70634411 70632877 N NA NA NA NA NA NA NETO1 96822 1637 chr18 71355871 71358929 71358254 N NA NA NA NA NA NA TIMM21 456817 1638 chr18 7369607 7372498 7370985 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP28 535175 1639 chr18 74332539 74334601 74333635 N NA NA ZNF516,LOC284276,ZNF407 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131655 199650 1640 chr18 74358030 74358840 74358197 N NA NA NA NA NA NA LOC100131655 175411 1641 chr18 75078499 75081446 75079218 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 542383 1642 chr18 75087722 75089459 75088291 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 551606 1643 chr18 75126067 75131142 75128054 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 589951 1644 chr18 75133234 75255611 75133743,75149103 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA ZNF236 597118 1645 chr18 75387898 75390617 75389303 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 851782 1646 chr18 76004084 76007695 76006540 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 1467968 1647 chr18 76052581 76055242 76053912 N NA NA NA NA NA NA ZNF236 1516465 1648 chr18 76163669 76169075 76167487 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1542578 1649 chr18 76366335 76368656 76367496 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1342997 1650 chr18 76397890 76401010 76399316 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1310643 1651 chr18 76490027 76491326 76490736 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1220327 1652 chr18 76527760 76530750 76529178 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1180903 1653 chr18 76565560 76576455 76574925 Y SALL3 NA SALL3 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 1135198 1654 chr18 76587609 76590159 76589320 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 1121494 1655 chr18 76733768 76735873 76735022 N NA NA NA NA NA NA PQLC1 975780 1656 chr18 77389011 77391821 77390199 N NA NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 319832 1657 chr18 77416519 77419272 77417588 N NA NA ATP9B,NFATC1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 292381 1658 chr18 77615830 77617444 77616636 N NA NA KCNG2,CTDP1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 94209 1659 chr18 8686795 8689677 8688304 N NA NA CCDC165,ANKRD12,NDUFV2,RAB12,PPP4R1,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 412951 1660 chr18 8702901 8705116 8704703 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV2 397512 1661 chr18 88302 92058 90731 N NA NA NA NA NA NA THOC1 176001 1662 chr18 9426725 9429708 9428498 N NA RALBP1 RALBP1,ANKRD12,TWSG1,PPP4R1,CCDC165 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALBP1 45822 1663 chr18 956802 970425 968609 N NA NA NA NA NA NA YES1 144475 1664 chr18 9986801 9989687 9988086 N NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 72846 1665 chr18 9992542 9995652 9994131 N NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 78587 1666 chr19 1176323 1187790 1181225 N NA NA ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIDN 60762 1667 chr19 12604902 12608796 12606229 N NA ZNF709 ZNF709,ZNF823,ZNF491,ZNF441,ZNF439,ZNF433,ZNF878,ZNF788,ZNF844,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF44,ZNF563,ZNF442,ZNF443,ZNF564,ZNF440 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF709 9270 1668 chr19 1323491 1325953 1325310 N NA C19orf24 EFNA2,DAZAP1,MUM1,GAMT,NDUFS7,RPS15 IMR90 Hi-C 24141950 C19orf24 47971 1669 chr19 13729895 13731159 13730827 N NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 127594 1670 chr19 13742087 13746533 13744062 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 112220 1671 chr19 13841039 13843873 13842520 N NA CCDC130,MRI1,C19orf53 CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 14880 1672 chr19 14353968 14361867 14359936 N NA NA LOC100507373 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 130089 1673 chr19 15412311 15415709 15412663 N NA BRD4 AKAP8,AKAP8L,BRD4,SYDE1,ILVBL,NOTCH3 IMR90 Hi-C 24141950 BRD4 21049 1674 chr19 15893312 15895285 15893960 N NA NA NA NA NA NA CYP4F11 150391 1675 chr19 1724283 1728664 1725805 Y C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1,ADAMTSL5 IMR90 Hi-C 24141950 UQCR11 118800 1676 chr19 1896672 1898810 1897534 N NA REXO1,SCAMP4 KLF16,SCAMP4,MKNK2 K562 ChIA-PET 22265404 SCAMP4 6563 1677 chr19 19077771 19080518 19078773 Y ELL,GATAD2A,HOMER3 COPE,DDX49 NA NA NA NA DDX49 47287 1678 chr19 19961876 19963578 19962734 N NA ZNF506,ZNF253,ZNF93 ZNF506,ZNF93 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF253 13136 1679 chr19 19971255 19973517 19972110 N NA ZNF506,ZNF253,ZNF93 ZNF253 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF253 3197 1680 chr19 20072104 20073940 20072949 N NA NA NA NA NA NA ZNF93 60382 1681 chr19 20161222 20166776 20163039 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 10945 1682 chr19 20261641 20264270 20262923 N NA ZNF486 ZNF90 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF486 13753 1683 chr19 20348005 20350951 20349337 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 69982 1684 chr19 20394807 20398131 20397064 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 116784 1685 chr19 20928852 20936005 20933135,20935009,20929794 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF626 84450 1686 chr19 20959643 20991240 20977707,20960291 N,N NA;NA NA ZNF486 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF85 114819 1687 chr19 21181678 21197532 21182659,21188483,21191795 N,N,N NA;NA;NA ZNF430 NA NA NA NA ZNF430 5894 1688 chr19 21656504 21662678 21657558 N NA ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 25759 1689 chr19 21785577 21790855 21787797 N NA NA NA NA NA NA ZNF429 97140 1690 chr19 21798427 21799606 21799061 N NA NA NA NA NA NA ZNF429 109990 1691 chr19 22062962 22073443 22063210,22072328,22066667 N,N,N NA;NA;NA ZNF43 NA NA NA NA ZNF43 28092 1692 chr19 23257174 23302279 23257934,23260903 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF724P 130893 1693 chr19 23440030 23448815 23448285 N NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 6858 1694 chr19 23453299 23463087 23457105,23460551 N,N NA;NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 20127 1695 chr19 24062540 24066996 24065595 N NA ZNF726 NA NA NA NA ZNF726 30688 1696 chr19 24214061 24253007 24216268 N NA ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 16969 1697 chr19 28193334 28248624 28246681 N NA LOC148189 NA NA NA NA LOC148189 36224 1698 chr19 28430008 28433845 28432129 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 145160 1699 chr19 28440833 28444704 28442947 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 155985 1700 chr19 28778822 28783132 28780260,28782214 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC148189 493974 1701 chr19 2951614 2956240 2953338 N NA NA TLE2,ZNF77,NCLN,TLE6,GNA15 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF555 110181 1702 chr19 2967828 2970670 2969333 N NA NA TLE2,TLE6,AES,GNA11,GNA15,NCLN,S1PR4,CELF5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF555 126395 1703 chr19 30335768 30338045 30336405 N NA NA NA NA NA NA POP4 238598 1704 chr19 30601380 30603187 30602302 N NA NA NA NA NA NA POP4 504210 1705 chr19 30714954 30717340 30715794 N NA NA NA NA NA NA POP4 617784 1706 chr19 31120163 31123928 31121573 N NA NA NA NA NA NA POP4 1022993 1707 chr19 31209193 31212511 31210191 Y ZNF536 NA NA NA NA NA POP4 1112023 1708 chr19 32044496 32048541 32046816 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 787973 1709 chr19 32062289 32066082 32064017 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 770432 1710 chr19 32815277 32817397 32816267 N NA ZNF507 NA NA NA NA ZNF507 19117 1711 chr19 3335258 3338628 3336836 N NA NFIC ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIC 20933 1712 chr19 33764449 33767034 33765490 N NA CEBPA CEBPA,LOC80054,CHST8,PEPD MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEBPA 26396 1713 chr19 34058392 34072909 34071349 N NA NA CHST8,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 CEBPG 193817 1714 chr19 34374357 34376539 34375151 N NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 86606 1715 chr19 34624046 34627558 34625402 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35794 1716 chr19 35326048 35351587 35328378,35351444 N,N NA;NA NA ZNF30,SCGB2B2,SCGB2B3P,LOC400685 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF599 61914 1717 chr19 35399969 35414042 35411701,35408433 N,N NA;NA ZNF30,ZNF792 NA NA NA NA ZNF30 3765 1718 chr19 35476078 35478932 35476669 N NA ZNF792 GRAMD1A,SCN1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF792 21125 1719 chr19 36191488 36194951 36193426 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A,IGFLR1,U2AF1L4,PSENEN,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 UPK1A 33773 1720 chr19 36421229 36425653 36422530 N NA NFKBID,LRFN3 NFKBID,HCST MCF7 ChIA-PET 22265404 LRFN3 2369 1721 chr19 37784440 37795194 37785138 N NA HKR1 NA NA NA NA HKR1 30386 1722 chr19 40047962 40050044 40048713 Y PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 SELV,EID2B,EID2 DLL3,EID2,EID2B,LGALS16,LGALS17A,CLC,LEUTX,ZNF780A IMR90 Hi-C 24141950 EID2 17124 1723 chr19 42035101 42048527 42037689 N NA NA CEACAM21,LOC100505495,B3GNT8,C19orf69,ATP5SL IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 89258 1724 chr19 43844426 43847280 43846213 N NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB3 161705 1725 chr19 44178894 44180898 44179736 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 NA PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF428 54880 1726 chr19 44709796 44713310 44711599 Y NA ZNF226,ZNF227 ZFP112,ZNF180 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF227 3381 1727 chr19 45103459 45106351 45105652 N NA PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 40747 1728 chr19 45109766 45111757 45110187 N NA PVR NA NA NA NA PVR 35341 1729 chr19 45944692 45949278 45947215 N NA CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L,LOC100287177,EML2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERCC1 17515 1730 chr19 48074206 48080025 48076475 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 55691 1731 chr19 480756 491656 489055 N NA TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 15841 1732 chr19 48083368 48085673 48085015 N NA NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 64853 1733 chr19 48101611 48105966 48103768 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 83096 1734 chr19 50871442 50873826 50872322 N NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA NR1H2 5854 1735 chr19 52049460 52052019 52050759 N NA ZNF175,FLJ30403 ZNF175,CEACAM18,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF175 22512 1736 chr19 52424111 52425977 52425092 N NA ZNF577,ZNF649,ZNF613 ZNF350,ZNF432,ZNF649,ZNF577,ZNF613,ZNF614 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF613 4711 1737 chr19 53241547 53246127 53244893 N NA ZNF83,ZNF611,ZNF600 ZNF808,ZNF83 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF611 3240 1738 chr19 53811009 53813284 53811946 N NA VN1R2,ZNF845 ZNF677,LOC646508,BIRC8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF845 23718 1739 chr19 5435616 5438196 5436785 N NA NA KDM4B,PTPRS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 94802 1740 chr19 57197264 57199145 57197914 N NA ZNF835 ZNF835,LOC147670 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF835 14141 1741 chr19 57681465 57687981 57683434 N NA ZNF264 ZNF264,ZNF547,ZNF304,ZNF583 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF264 14887 1742 chr19 58175330 58177174 58176108 N NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 16183 1743 chr19 6516238 6517255 6516688 N NA NA TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 CRB3 51978 1744 chr19 8223948 8227819 8226230 Y NA NA FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CD320 145421 1745 chr19 9419118 9421260 9420613 Y NA ZNF559-ZNF177 NA NA NA NA ZNF559-ZNF177 13642 1746 chr19 9893651 9898326 9895448 N NA ZNF846,FBXL12,UBL5 NA NA NA NA ZNF846 14241 1747 chr2 101222251 101223817 101223190 N NA PDCL3 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDCL3 42833 1748 chr2 101301327 101302379 101301877 N NA NA TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 PDCL3 121909 1749 chr2 101853438 101858446 101856115,101854451 N,N NA;NA C2orf29 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf29 10899 1750 chr2 102254171 102256756 102255851 N NA NA RFX8,MAP4K4 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 57409 1751 chr2 102920317 102922971 102921659 N NA NA IL1R2,IL1RL1 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 149915 1752 chr2 105516301 105520350 105518212 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 134133 1753 chr2 105554808 105557893 105556179 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 96590 1754 chr2 105561807 105566000 105564275,105565528 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MRPS9 88483 1755 chr2 105595195 105598089 105596487 N NA NA LOC100506421 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS9 56394 1756 chr2 105758007 105760829 105758097,105760131 N,N NA;NA NA GPR45,MRPS9 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS9 103524 1757 chr2 105790796 105794013 105792587 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 136313 1758 chr2 105800414 105801802 105800979 N NA NA NA NA NA NA TGFBRAP1 144346 1759 chr2 106161033 106165049 106163249 N NA NA C2orf49,FHL2 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 207020 1760 chr2 10631900 10633403 10632769 N NA NA ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 NOL10 196709 1761 chr2 106885581 106887210 106886442 N NA NA UXS1 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 931568 1762 chr2 107103605 107105113 107104346 N NA NA NA NA NA NA C2orf49 1149592 1763 chr2 107158640 107160849 107159539 N NA NA UXS1 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 1204627 1764 chr2 107161695 107165043 107163526 N NA NA NA NA NA NA C2orf49 1207682 1765 chr2 107174689 107180184 107177266 N NA NA LOC285000 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 1220676 1766 chr2 107190989 107195509 107192818 N NA NA LOC285000 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 1236976 1767 chr2 108352883 108358866 108354970,108357121 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GCC2 706711 1768 chr2 108390682 108394846 108391729,108392985 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GCC2 670731 1769 chr2 108834639 108839314 108837500 N NA NA SULT1C4,SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 226263 1770 chr2 108850359 108853685 108852252 N NA NA SULT1C3 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 211892 1771 chr2 109646516 109655151 109648176,109648411 N,Y NA;LIMS1,RANBP2 NA MALL,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 243297 1772 chr2 109661178 109663380 109662208 N NA NA MALL,EDAR,CCDC138,LOC100287216,SH3RF3,SEPT10 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 257959 1773 chr2 10967476 10973280 10972663 N NA PDIA6 ROCK2,C2orf50,PDIA6,FLJ33534,PQLC3,KCNF1,E2F6,MIR4429,GREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 14516 1774 chr2 10975135 10976596 10975588,10975556 N,N NA;NA PDIA6 ROCK2,C2orf50,PDIA6,FLJ33534,PQLC3,E2F6,GREB1,KCNF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 22175 1775 chr2 10983691 10985839 10984310 Y NA PDIA6 C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 30731 1776 chr2 110401344 110404091 110402411 Y NA SOWAHC SEPT10,SOWAHC,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHC 29433 1777 chr2 110447187 110450122 110448628 N NA NA EDAR,SEPT10 IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHC 75276 1778 chr2 110477263 110481094 110479419 N NA NA NA NA NA NA RGPD6 69241 1779 chr2 110494415 110511564 110494710 N NA RGPD6 NA NA NA NA RGPD6 38771 1780 chr2 110650766 110651829 110651737 N NA LIMS3-LOC440895 NA NA NA NA LIMS3-LOC440895 4180 1781 chr2 111071415 111074405 111072842 N NA NA NA NA NA NA LOC151009 67708 1782 chr2 11197 13140 11438 N NA FAM110C NA NA NA NA FAM110C 33448 1783 chr2 112458849 112461121 112460420 N NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 180620 1784 chr2 113371130 113375401 113372242 N NA CHCHD5,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 28033 1785 chr2 113912907 113928879 113914445,113916594,113923041 N,N,N NA;NA;NA PSD4 IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSD4 2681 1786 chr2 114045493 114047692 114046267 N NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PSD4 113933 1787 chr2 114081091 114084598 114082535 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 CBWD2 110670 1788 chr2 114588339 114590152 114588996 N NA NA ACTR3,SLC35F5 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 57385 1789 chr2 114823695 114830157 114825569 N NA NA NA NA NA NA ACTR3 176158 1790 chr2 11529184 11530572 11529794 N NA NA ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 75725 1791 chr2 11618845 11623030 11621621 Y NA E2F6 GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 12548 1792 chr2 118219715 118284978 118282973 N NA NA NA NA NA NA DDX18 287277 1793 chr2 118305955 118322669 118322233 N NA NA CCDC93 H1ESC 5C 22955621 DDX18 249586 1794 chr2 118356974 118386051 118381065 N NA NA NA NA NA NA DDX18 186204 1795 chr2 118942145 118945754 118943569 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 96095 1796 chr2 119065961 119072639 119067789 Y NA NA NA NA NA NA INSIG2 219911 1797 chr2 121198461 121201754 121200675 Y NA NA INHBB MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM185B 217477 1798 chr2 121226837 121233854 121228023,121231641 N,N NA;NA NA LOC84931 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM185B 245853 1799 chr2 121237767 121240263 121238875 N NA NA LOC84931 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM185B 256783 1800 chr2 121382115 121389387 121383913,121387961 N,N NA;NA NA LOC84931,RALB,INHBB IMR90 Hi-C 24141950 TMEM185B 401131 1801 chr2 121493741 121498829 121495158 N NA NA GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM185B 512757 1802 chr2 12538906 12540641 12539685 N NA NA LOC100506474,TRIB2,LPIN1,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 316357 1803 chr2 127251034 127255755 127252912 N NA NA NA NA NA NA BIN1 609148 1804 chr2 127780131 127784857 127783220 N NA NA NA NA NA NA BIN1 80046 1805 chr2 127885129 127887694 127886308 N NA BIN1 ERCC3,BIN1,CYP27C1,IWS1,MYO7B IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 20226 1806 chr2 127900414 127903338 127901617 N NA BIN1 IWS1,BIN1,CYP27C1,ERCC3 IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 35511 1807 chr2 128111435 128147270 128145668,128122609 N,N NA;NA MAP3K2 IWS1,ERCC3,MAP3K2,MIR4783,PROC,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 10630 1808 chr2 129090765 129098395 129091585 N NA NA NA NA NA NA UGGT1 242011 1809 chr2 129104228 129114323 129105666 N NA NA NA NA NA NA UGGT1 255474 1810 chr2 129131388 129140492 129132849,129136871 N,N NA;NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 UGGT1 282634 1811 chr2 129154838 129155473 129155322 N NA NA HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 UGGT1 306084 1812 chr2 129199051 129202695 129200220 N NA NA NA NA NA NA UGGT1 350297 1813 chr2 129698474 129700324 129699409 N NA NA NA NA NA NA UGGT1 849720 1814 chr2 129815112 129818686 129816734 Y NA NA NA NA NA NA RAB6C 918549 1815 chr2 129917299 129919960 129918662 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 817275 1816 chr2 13035576 13038349 13036688 N NA NA LPIN1,MIR4262,TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 178578 1817 chr2 130632407 130636711 130635288 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 100524 1818 chr2 130988650 130989802 130989581 N NA MZT2B NA NA NA NA MZT2B 49149 1819 chr2 131037969 131038716 131038107 N NA NA NA NA NA NA CCDC115 61206 1820 chr2 131250452 131255530 131253393,131251612 N,N NA;NA NA FAM168B Caco2 3C 20360044 IMP4 149963 1821 chr2 131380701 131386213 131382261 N NA NA NA NA NA NA FAM123C 126864 1822 chr2 131577176 131659164 131592299,131594392,131622532 N,N,N NA;NA;NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM123C 64099 1823 chr2 132417060 132422639 132419064,132421813 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C2orf27A 57425 1824 chr2 132438815 132443968 132440367 N NA C2orf27A NA NA NA NA C2orf27A 36096 1825 chr2 132587821 132591464 132588176 N NA NA NA NA NA NA C2orf27A 107757 1826 chr2 133018194 133022816 133019404 N NA ANKRD30BL ANKRD30BL,GPR39 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD30BL 2652 1827 chr2 133102702 133108335 133104997 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 87160 1828 chr2 133108861 133113746 133110677 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 93319 1829 chr2 134429717 134434064 134432428 N NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 577766 1830 chr2 13446853 13612892 13555185,13448995 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TRIB2 589855 1831 chr2 135572594 135575040 135573459 N NA NA TMEM163,ACMSD IMR90 Hi-C 24141950 CCNT2 101352 1832 chr2 13640934 13691441 13643062,13681092,13689323 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TRIB2 783936 1833 chr2 136831445 136834916 136833318,136834023 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DARS 88223 1834 chr2 13699013 13721087 13701027 N NA NA NA NA NA NA TRIB2 842015 1835 chr2 143452572 143454153 143453382 N NA NA KYNU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPOPL 4193222 1836 chr2 148281611 148284706 148283514 N NA NA NA NA NA NA ACVR2A 317864 1837 chr2 14919809 14922789 14921460 N NA NA NA NA NA NA FAM84A 146999 1838 chr2 151183815 151185606 151184505 N NA NA NA NA NA NA MMADHC 739485 1839 chr2 152605071 152624601 152623163 N NA NA ARL5A K562 ChIA-PET 22265404 ARL5A 60408 1840 chr2 156886119 156930313 156930154 N NA NA NA NA NA NA TANC1 2894833 1841 chr2 156998337 157040761 157038890 Y NR4A2 NA NR4A2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TANC1 2784385 1842 chr2 157042187 157113260 157111220 N NA NA NR4A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TANC1 2711886 1843 chr2 157192322 157201155 157198326 N NA NA GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANC1 2623991 1844 chr2 157256622 157258003 157257465 N NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TANC1 2567143 1845 chr2 159704610 159707071 159705546 N NA NA NA NA NA NA TANC1 118075 1846 chr2 159735368 159738141 159736429 N NA NA LY75-CD302,TANC1 IMR90 Hi-C 24141950 TANC1 87005 1847 chr2 160559574 160563675 160562877 N NA MARCH7 BAZ2B,WDSUB1,TANC1,MARCH7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCH7 5335 1848 chr2 16151887 16154014 16152963 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 420117 1849 chr2 164262965 164265329 164264046 N NA NA NA NA NA NA COBLL1 1432599 1850 chr2 166573371 166583858 166583373 N NA NA NA NA NA NA GALNT3 66945 1851 chr2 168147616 168149576 168149179 N NA NA NA NA NA NA STK39 954529 1852 chr2 169202487 169205194 169203652 N NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 98382 1853 chr2 171606158 171610116 171608912 N NA LOC440925 SP5,LOC440925 K562 ChIA-PET 22265404 LOC440925 35081 1854 chr2 172373608 172375234 172373978 N NA NA NA NA NA NA DCAF17 82847 1855 chr2 173036248 173039032 173037060 N NA NA ITGA6,HAT1,DLX2 IMR90 Hi-C 24141950 DLX1 86040 1856 chr2 173238322 173241545 173239636 N NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 PDK1 179234 1857 chr2 174397598 174425727 174398065 N NA NA CIR1,LOC285084,SP9 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 404703 1858 chr2 174434871 174442676 174436315 N NA NA CIR1,OLA1,LOC285084,SP9 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 387754 1859 chr2 174846842 174854556 174849925 N NA SP3 SP3,OLA1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 16412 1860 chr2 174855358 174859859 174856562 Y CIR1,SP3,SP3 SP3 SP3,OLA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 24928 1861 chr2 174861475 174864232 174862684 N NA SP3 SP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 31045 1862 chr2 17515738 17519264 17517983 N NA NA NA NA NA NA GEN1 415913 1863 chr2 176097394 176100411 176098658 N NA NA NA NA NA NA ATP5G3 50904 1864 chr2 176237374 176239225 176238511 N NA NA HOXD13,EVX2,HOXD12 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5G3 190884 1865 chr2 176469672 176472135 176470788 N NA NA NA NA NA NA KIAA1715 394883 1866 chr2 176951487 176953987 176953010 N NA HOXD8 HOXD12,HOXD13 MCF7 ChIA-PET 22265404 HOXD8 40435 1867 chr2 177247536 177250472 177249062 N NA NA NA NA NA NA MTX2 113413 1868 chr2 177256228 177259579 177257944 N NA NA NA NA NA NA MTX2 122105 1869 chr2 177286886 177292356 177289347 N NA NA MTX2,MIR1246,MIR10B,HOXD4 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 152763 1870 chr2 177310281 177313811 177311939 N NA NA HOXD-AS1,HOXD3,HOXD1,MTX2,MIR10B,HOXD4,HOXD-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 176158 1871 chr2 177328632 177331448 177329954 N NA NA HOXD-AS1,MTX2,HOXD1,HOXD4,HOXD3,MIR10B,MIR1246,HOXD8,HOXD-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 194509 1872 chr2 177348813 177353096 177350298 N NA NA MTX2,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD-AS1,HOXD4,MIR10B,HOXD3 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 214690 1873 chr2 177417358 177422210 177418954,177420963 N,N NA;NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 283235 1874 chr2 177607321 177610298 177609085 N NA NA HOXD-AS2,HOXD1,HOXD-AS1,HOXD9,HOXD8,HOXD10,PDE11A IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3 467124 1875 chr2 177899798 177906263 177903729,177902080 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HNRNPA3 171159 1876 chr2 177913976 177917639 177916095 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA3 159783 1877 chr2 177922322 177926103 177924087 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA3 151319 1878 chr2 178010539 178015153 178013296 N NA NA PDE11A,HOXD-AS2,HOXD8,LOC100130691,AGPS IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA3 62269 1879 chr2 178029188 178031379 178029850 N NA HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 46043 1880 chr2 179057853 179119856 179074200,179058776 N,N NA;NA NA MIR548N,RBM45 IMR90 Hi-C 24141950 RBM45 80671 1881 chr2 180136241 180139220 180137464 N NA NA SESTD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF385B 471549 1882 chr2 18142924 18146856 18144309 N NA NA KCNS3 IMR90 Hi-C 24141950 GEN1 207747 1883 chr2 181445575 181455922 181450493 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 389190 1884 chr2 181556288 181651026 181556991 N NA NA UBE2E3 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 194086 1885 chr2 182674894 182677256 182675861 Y SSFA2 NA SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 829782 1886 chr2 183734839 183736413 183736111 N NA NA FRZB,NCKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC10 153840 1887 chr2 184471866 184472951 184472323 N NA NA NA NA NA NA NUP35 482783 1888 chr2 186247846 186251463 186250061 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 1099422 1889 chr2 186289416 186436825 186412095,186290172 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZC3H15 914060 1890 chr2 186952726 186957031 186955876 N NA NA NA NA NA NA ZC3H15 393854 1891 chr2 187408281 187410982 187409142 Y ITGAV,ITGAV NA ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ZC3H15 57396 1892 chr2 188850315 188852716 188851302 N NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 303680 1893 chr2 190074671 190076797 190075629 Y DIRC1 NA COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 229362 1894 chr2 192325473 192328915 192327250 N NA NA MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 STAT1 446497 1895 chr2 193252989 193257905 193255218 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 193345 1896 chr2 193331834 193335867 193333240 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 272190 1897 chr2 193740015 193743707 193741895 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 680371 1898 chr2 194001708 194008895 194007582 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 942064 1899 chr2 194031662 194052831 194035439 N NA NA NA NA NA NA TMEFF2 972018 1900 chr2 19503999 19517777 19505498 N NA NA NA NA NA NA TTC32 583967 1901 chr2 195369020 195370446 195369700 N NA NA NA NA NA NA SLC39A10 1151086 1902 chr2 195880656 195889055 195882810,195887019 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC39A10 632477 1903 chr2 195901122 195904668 195903020 N NA NA NA NA NA NA SLC39A10 616864 1904 chr2 196184787 196188994 196187299 N NA NA SLC39A10 K562 ChIA-PET 22265404 SLC39A10 332538 1905 chr2 196203190 196208456 196205119,196205851 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC39A10 313076 1906 chr2 196233355 196238161 196235403 N NA NA SLC39A10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A10 283371 1907 chr2 19700017 19706144 19704415 N NA NA FLJ12334 IMR90 Hi-C 24141950 TTC32 395600 1908 chr2 19810768 19816722 19815235 N NA NA NA NA NA NA TTC32 285022 1909 chr2 200914427 200917438 200915293 N NA NA SPATS2L,KCTD18 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 93968 1910 chr2 201033990 201036236 201035108 N NA NA SPATS2L IMR90 Hi-C 24141950 SPATS2L 134368 1911 chr2 201122857 201125551 201124465 N NA SPATS2L SPATS2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATS2L 45053 1912 chr2 20273567 20274258 20274068 N NA LAPTM4A WDR35,MATN3,LAPTM4A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 21778 1913 chr2 202844798 202852132 202850644 N NA NA CDK15,NOP58,ALS2,SUMO1,FZD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALS2 198903 1914 chr2 202860109 202863784 202861479 N NA NA ALS2,CDK15,FZD7 IMR90 Hi-C 24141950 ALS2 214214 1915 chr2 20303462 20307276 20304821 N NA NA LAPTM4A,TTC32,WDR35,MATN3,PUM2,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 51673 1916 chr2 20319395 20323429 20321914 N NA NA MATN3,WDR35,SDC1,PUM2,LAPTM4A IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM4A 67606 1917 chr2 20324139 20327905 20326912 N NA NA WDR35,SDC1,PUM2,MATN3,LAPTM4A IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM4A 72350 1918 chr2 20331105 20334295 20332964 N NA NA SDC1,PUM2,LAPTM4A,MATN3,WDR35 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM4A 79316 1919 chr2 203468276 203476812 203470292,203474725 N,Y NA;NA NA ICA1L,FAM117B,WDR12,NBEAL1,ALS2CR8,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 BMPR2 227226 1920 chr2 20367244 20368992 20368302 N NA NA PUM2,SDC1,MATN3 IMR90 Hi-C 24141950 SDC1 56202 1921 chr2 204763808 204766721 204765263 N NA NA CTLA4,RAPH1,NBEAL1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 363750 1922 chr2 204772900 204776361 204774736 N NA NA RAPH1,NBEAL1,ICOS,CYP20A1,CTLA4 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 372842 1923 chr2 204875060 204878191 204876890 N NA NA NA NA NA NA RAPH1 475002 1924 chr2 204973317 204975864 204974526 N NA NA NA NA NA NA PARD3B 434652 1925 chr2 205279680 205282359 205281008 N NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 128157 1926 chr2 205317718 205319912 205318725 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 90604 1927 chr2 20580345 20584245 20581549 N NA NA HS1BP3,PUM2,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM2 53201 1928 chr2 20633161 20636295 20634808 N NA RHOB HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 10540 1929 chr2 206765209 206768725 206767466,206765393 N,N NA;NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 INO80D 182181 1930 chr2 206769586 206775506 206773594 N NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 INO80D 175400 1931 chr2 207736849 207739282 207737983 N NA NA FZD5,MDH1B,PLEKHM3 IMR90 Hi-C 24141950 FASTKD2 106737 1932 chr2 208132856 208135933 208134292 N NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 102242 1933 chr2 208271287 208274697 208272755 N NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 119919 1934 chr2 210232725 210234822 210233790 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 53949 1935 chr2 21053836 21056576 21055429 N NA NA NA NA NA NA HS1BP3 202972 1936 chr2 21138555 21141230 21139907 N NA NA GDF7,C2orf43,APOB IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 287691 1937 chr2 21504110 21505933 21504951 N NA NA NA NA NA NA HS1BP3 653246 1938 chr2 215545429 215549408 215548717 N NA NA NA NA NA NA BARD1 125020 1939 chr2 215570462 215572867 215572250 N NA NA NA NA NA NA BARD1 101561 1940 chr2 215763491 215766341 215764376 N NA NA NA NA NA NA BARD1 89063 1941 chr2 217414640 217422704 217416222,217420099 N,N NA;NA NA DIRC3,IGFBP2,RPL37A,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 51120 1942 chr2 217478922 217487409 217480492,217484705,217486220 N,N,N NA;NA;NA NA DIRC3,PKI55,RPL37A,IGFBP2,IGFBP5,XRCC5,RUFY4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL37A 115402 1943 chr2 217489454 217493465 217491115 N NA NA IGFBP2,DIRC3,RPL37A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL37A 125934 1944 chr2 21855191 21857868 21856661 N NA NA NA NA NA NA HS1BP3 1004327 1945 chr2 21868197 21871238 21869964 N NA NA NA NA NA NA HS1BP3 1017333 1946 chr2 220548257 220551267 220549991 N NA NA INHA,OBSL1,SLC4A3,STK11IP,EPHA4,DES,SPEG,GMPPA,ACCN4 IMR90,HELA,K562,GM12878,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 GMPPA 184670 1947 chr2 221061543 221065603 221064067 N NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 GMPPA 697956 1948 chr2 222827261 222829212 222828630 N NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 390251 1949 chr2 223272229 223274581 223273604 N NA NA NA NA NA NA FARSB 246246 1950 chr2 223655210 223665447 223656773,223661288,223664478 Y,N,N SGPP2;NA;NA NA ACSL3,MOGAT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL3 60285 1951 chr2 224055126 224056993 224055822 N NA NA NA NA NA NA ACSL3 329394 1952 chr2 224083957 224087366 224085190 N NA NA NA NA NA NA ACSL3 358225 1953 chr2 224402415 224405211 224403613 N NA NA NA NA NA NA AP1S3 297108 1954 chr2 225195132 225198538 225196490 N NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 251572 1955 chr2 226239614 226241798 226240754 N NA NA RHBDD1,NYAP2,COL4A4 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 789504 1956 chr2 226894248 226897447 226896112 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 766059 1957 chr2 227513928 227516213 227515022 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147293 1958 chr2 228328369 228332337 228331292 Y NA NA AGFG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFF 136141 1959 chr2 228586850 228588488 228587632 N NA NA NA NA NA NA MFF 394622 1960 chr2 232485132 232487665 232486199 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 85570 1961 chr2 232525002 232529013 232527029 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 44222 1962 chr2 233367357 233368866 233367916 Y ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1 TIGD1,EIF4E2 MIR1471,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 TIGD1 46360 1963 chr2 235076409 235077792 235077430 N NA NA NA NA NA NA TRPM8 250366 1964 chr2 235200045 235202577 235201336 N NA NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 TRPM8 374002 1965 chr2 235371635 235373498 235372797 Y ARL4C NA NA NA NA NA TRPM8 545592 1966 chr2 235540245 235544325 235542656 Y NA NA SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM8 714202 1967 chr2 235583628 235586613 235585366 N NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM8 757585 1968 chr2 235597491 235601589 235599944 N NA NA SH3BP4,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM8 771448 1969 chr2 235795442 235801479 235797036 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 TRPM8 969399 1970 chr2 238378095 238386356 238384676 Y LRRFIP1 MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 9522 1971 chr2 238511672 238513589 238512700 Y LRRFIP1 RAB17 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 RAB17 11903 1972 chr2 240452318 240455834 240454179 N NA NA LOC150935,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 129675 1973 chr2 241176144 241177830 241177155 N NA NA PP14571,GPC1,OTOS,ANKMY1 IMR90 Hi-C 24141950 MYEOV2 100380 1974 chr2 241852452 241853998 241853326 N NA NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 MTERFD2 187749 1975 chr2 241925413 241932961 241931249 N NA NA SNED1,ANO7,PPP1R7 IMR90 Hi-C 24141950 MTERFD2 108786 1976 chr2 243014207 243024638 243023078 N NA LOC728323 LOC728323 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728323 6206 1977 chr2 24621827 24623096 24622504 N NA ITSN2 CENPO,ADCY3,ITSN2,DNAJC27,NCOA1,LOC375190,C2orf84,PTRHD1,EFR3B IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 38430 1978 chr2 24657337 24659379 24658693 N NA NA CENPO,NCOA1,PTRHD1,ADCY3 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 73940 1979 chr2 25933588 25936447 25934934 N NA NA DTNB,ASXL2 IMR90 Hi-C 24141950 ASXL2 164865 1980 chr2 2615872 2619308 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762345 1981 chr2 26250397 26252516 26251122 N NA KIF3C,RAB10 RAB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB10 4213 1982 chr2 2652398 2661288 2660178 N NA NA NA NA NA NA TSSC1 720365 1983 chr2 2663852 2667860 2666626 N NA NA NA NA NA NA TSSC1 713793 1984 chr2 28905122 28907389 28906331 N NA NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 67225 1985 chr2 28937932 28940850 28939554 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 33764 1986 chr2 28955882 28960738 28959151 N NA PPP1CB PLB1,PPP1CB,SLC4A1AP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 13876 1987 chr2 30625189 30626892 30626267 N NA LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 43231 1988 chr2 3095256 3110434 3108424 N NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 271219 1989 chr2 31087450 31089840 31088501 N NA NA CAPN13,YPEL5,XDH IMR90 Hi-C 24141950 EHD3 367040 1990 chr2 31661447 31716161 31712872 N NA XDH CAPN14,XDH,GALNT14,CAPN13,SRD5A2 IMR90 Hi-C 24141950 XDH 23836 1991 chr2 31717876 31720701 31719489 N NA NA NA NA NA NA XDH 80265 1992 chr2 34357128 34359088 34357362 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 532766 1993 chr2 37977611 37978784 37978253 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 78285 1994 chr2 38145471 38155217 38152637 N NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKG2,CYP1B1-AS1,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CDC42EP3 246145 1995 chr2 38322155 38325422 38323581 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDC42EP3 422829 1996 chr2 38335079 38338277 38336919 N NA NA FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 435753 1997 chr2 387183 395675 394153 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 122314 1998 chr2 4027174 4029365 4028395 N NA NA NA NA NA NA RPS7 404321 1999 chr2 40926244 40928684 40927510 N NA NA NA NA NA NA THUMPD2 919828 2000 chr2 42067809 42070093 42068390 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 326397 2001 chr2 42251049 42253172 42252510 N NA NA LOC388942,C2orf91,PKDCC,EML4 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 143318 2002 chr2 42317869 42320980 42319516 N NA NA EML4,C2orf91,LOC388942,PKDCC,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 75510 2003 chr2 42358939 42361804 42360335 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 34686 2004 chr2 42368112 42370156 42368797 N NA EML4 EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 26334 2005 chr2 4292617 4295219 4294098 N NA NA NA NA NA NA RPS7 669764 2006 chr2 43034888 43038891 43036731,43038238 N,N NA;NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG3 313651 2007 chr2 43052980 43061191 43054869 N NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG3 331743 2008 chr2 43102083 43105633 43103590 N NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 348112 2009 chr2 43205022 43208504 43206971 Y HAAO NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 245241 2010 chr2 43420278 43422544 43421467 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2,LOC100129726 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 31201 2011 chr2 436996 439150 438171 N NA NA NA NA NA NA ACP1 172127 2012 chr2 44327801 44334428 44331151 N NA NA PREPL,PPM1B,SLC3A1 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1B 61572 2013 chr2 44336994 44341008 44339428 N NA NA PPM1B,SLC3A1 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1B 54992 2014 chr2 45128510 45130300 45129653 N NA NA CAMKMT,SRBD1 IMR90 Hi-C 24141950 PREPL 539509 2015 chr2 452764 458026 456492 N NA NA NA NA NA NA ACP1 187895 2016 chr2 45498949 45503349 45501133,45500887 N,N NA;NA NA SRBD1,SIX2,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 335084 2017 chr2 45557388 45558665 45558071 N NA NA SIX2,SRBD1,UNQ6975 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 279768 2018 chr2 45852607 45855000 45853926 N NA SRBD1,PRKCE SRBD1,PRKCE,EPAS1,SIX2 IMR90 Hi-C 24141950 SRBD1 14174 2019 chr2 47526725 47527338 47526772 N NA NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPCAM 68949 2020 chr2 47547124 47574727 47572337,47574014,47562477 N,N,N NA;NA;NA EPCAM CALM2,TTC7A,SOCS5,MCFD2,MSH2,EPCAM,C2orf61,MSH6 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPCAM 21560 2021 chr2 47958070 47960074 47958820 N NA NA MSH2,KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 50147 2022 chr2 48337385 48341660 48338930 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXN2 200135 2023 chr2 48461527 48464062 48462050 N NA NA FOXN2,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 77733 2024 chr2 48505205 48508083 48506693 N NA FOXN2 NA NA NA NA FOXN2 33712 2025 chr2 48640808 48644278 48642195 N NA PPP1R21 MSH6,FBXO11,FOXN2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R21 23630 2026 chr2 49456184 49457735 49456894 N NA NA NA NA NA NA STON1-GTF2A1L 699120 2027 chr2 49521138 49524338 49522921 N NA NA NRXN1 IMR90 Hi-C 24141950 STON1-GTF2A1L 764074 2028 chr2 49533004 49536590 49534237 Y NA NA NA NA NA NA STON1-GTF2A1L 775940 2029 chr2 54934725 54939128 54936360 N NA EML6 ACYP2,C2orf73,SPTBN1,PSME4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 EML6 13021 2030 chr2 55360040 55362891 55361716 N NA NA RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 82306 2031 chr2 554716 556738 555697 N NA NA TPO IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 120701 2032 chr2 557362 560196 559022 N NA NA TPO IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 117243 2033 chr2 56675261 56677793 56676680 N NA NA NA NA NA NA PNPT1 754250 2034 chr2 5894501 5897339 5896561 N NA NA LINC00487 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7 2271648 2035 chr2 60939246 60940257 60939850 N NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 43108 2036 chr2 61897262 61899499 61898405 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 131844 2037 chr2 61919988 61923223 61921928 Y NA NA NA NA NA NA XPO1 154570 2038 chr2 61933245 61937380 61935241 Y NA NA USP34,XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 167827 2039 chr2 61989371 61993779 61991528 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 122027 2040 chr2 6206632 6209858 6208605 N NA NA LINC00487 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7 2583779 2041 chr2 62519888 62523011 62521142 N NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 387085 2042 chr2 62532683 62535703 62534267 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 399880 2043 chr2 62650719 62652147 62650795 N NA NA B3GNT2,COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 517916 2044 chr2 62682099 62686990 62684533 N NA NA COMMD1,EHBP1,OTX1,LOC100132215,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 549296 2045 chr2 627411 630427 628798 Y NA TMEM18 FAM150B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 47012 2046 chr2 62750896 62757430 62755009,62753952 N,N NA;NA NA TMEM17,EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 618093 2047 chr2 62857746 62858855 62858390 N NA NA TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD1 724943 2048 chr2 62866868 62872598 62869373 N NA NA NA NA NA NA COMMD1 734065 2049 chr2 63990923 63994172 63992423 N NA NA UGP2 IMR90 Hi-C 24141950 UGP2 73926 2050 chr2 64289673 64292610 64290804 N NA VPS54 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 43459 2051 chr2 64454679 64456537 64455518 N NA NA PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 208465 2052 chr2 64548957 64578459 64550451,64565449 N,N NA;NA NA PELI1,AFTPH,LINC00309,VPS54,LGALSL IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 102868 2053 chr2 64600608 64633339 64628601,64631899 N,N NA;NA LGALSL PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 47988 2054 chr2 64956661 64980314 64978944,64977260 N,N NA;NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 75615 2055 chr2 64993598 64996889 64995482 Y SERTAD2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 112552 2056 chr2 65016194 65018300 65017344 N NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 135148 2057 chr2 65080799 65093865 65092411,65086523 N,Y NA;AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 121714 2058 chr2 65105068 65107697 65106306 N NA NA AFTPH,LOC339807,SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A4 107882 2059 chr2 65731637 65733753 65732744 N NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 71981 2060 chr2 66264 70954 69678 N NA FAM110C NA NA NA NA FAM110C 19676 2061 chr2 6632624 6636035 6634132 N NA NA NA NA NA NA ID2 2186078 2062 chr2 67076837 67079657 67077948 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 544785 2063 chr2 67672456 67674490 67673499 N NA ETAA1 C1D,MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 48014 2064 chr2 67920740 67922962 67921770 N NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 296298 2065 chr2 69517490 69519523 69518439 N NA NA GKN1,ANTXR1 IMR90 Hi-C 24141950 GFPT1 94863 2066 chr2 69890994 69903921 69901247 N NA AAK1 NFU1,AAK1,ANXA4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AAK1 20017 2067 chr2 69911038 69915578 69912834 N NA AAK1 AAK1,ANXA4,NFU1,GMCL1,GFPT1 IMR90 Hi-C 24141950 AAK1 40061 2068 chr2 70783418 70785852 70784512 Y NA NA TGFA K562 ChIA-PET 22265404 ADD2 209523 2069 chr2 71502305 71509873 71503360 N NA PAIP2B,ZNF638 DYSF IMR90 Hi-C 24141950 PAIP2B 48072 2070 chr2 71972865 71975248 71974604 N NA NA NA NA NA NA ZNF638 413980 2071 chr2 72019535 72022835 72020742 N NA NA DYSF,EXOC6B,CYP26B1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF638 460650 2072 chr2 73088792 73091227 73089862 N NA EXOC6B,SPR NA NA NA NA SPR 23285 2073 chr2 73402786 73405056 73404404 N NA SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMYD5 36310 2074 chr2 738388 742341 740208 N NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 60949 2075 chr2 7440602 7445078 7441851 N NA NA NA NA NA NA ID2 1377035 2076 chr2 7498373 7499446 7498993 N NA NA NA NA NA NA ID2 1322667 2077 chr2 7500266 7502641 7501264 N NA NA NA NA NA NA ID2 1319472 2078 chr2 75999414 76001374 76000668 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 125505 2079 chr2 76601383 76607324 76605312 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 727474 2080 chr2 76724769 76730494 76728292 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 850860 2081 chr2 85694594 85696973 85695961 N NA NA GGCX,RNF181,TMEM150A,USP39,SH2D6,CAPG,LOC100630918,MAT2A,VAMP8,VAMP5,SFTPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100630918 69036 2082 chr2 85968172 85971323 85969446 N NA NA ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf68 128993 2083 chr2 8597517 8600716 8597998 N NA NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 221397 2084 chr2 86180755 86183969 86182254 N NA NA POLR1A,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC90784 67022 2085 chr2 8630639 8636207 8633619 N NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 185906 2086 chr2 8638782 8642025 8640823 N NA NA LOC100506274,LOC339788,LINC00299,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 180088 2087 chr2 86597456 86600710 86598785 N NA NA REEP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM3A 67561 2088 chr2 86622991 86624073 86623606 N NA KDM3A REEP1,KDM3A,IMMT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM3A 44198 2089 chr2 8664917 8668017 8666153 N NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 154096 2090 chr2 8679189 8681299 8680287 N NA NA LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 140814 2091 chr2 8702010 8713473 8712254 Y NA NA LINC00299,LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 108640 2092 chr2 8741437 8744714 8743130 Y ID2 NA LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 77399 2093 chr2 87961232 87963659 87962201 N NA NA NA NA NA NA PLGLB2 83947 2094 chr2 9171871 9174318 9172954 N NA NA NA NA NA NA KIDINS220 194116 2095 chr2 91908654 91913084 91911121 N NA NA NA NA NA NA LOC654342 60679 2096 chr2 95871028 95874905 95873146 N NA ZNF514,ZNF2 ZNF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF2 39845 2097 chr2 96185491 96210936 96192526 N NA NA NA NA NA NA PROM2 245290 2098 chr2 96311945 96313795 96312490 N NA NA NA NA NA NA LOC729234 362504 2099 chr2 96346829 96350102 96348479 Y NA NA NA NA NA NA LOC729234 326197 2100 chr2 96649972 96660083 96657623 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 16216 2101 chr2 96985363 96988611 96987279 N NA SNRNP200,NCAPH SNRNP200 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCAPH 12873 2102 chr2 9783458 9786843 9784930 N NA YWHAQ YWHAQ,ADAM17,TAF1B,GRHL1,KLF11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAQ 12352 2103 chr2 9920493 9932021 9931150,9922457 N,Y NA;NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B,ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 51550 2104 chr2 9937318 9939513 9938295 N NA TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,TAF1B,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 44058 2105 chr2 99384800 99389274 99385896,99388374 N,N NA;NA NA MGAT4A MCF7 ChIA-PET 22265404 UNC50 159758 2106 chr2 9947637 9951467 9949265 N NA TAF1B ODC1,RRM2,TAF1B,GRHL1,KLF11,ADAM17,CYS1,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 32104 2107 chr2 9969426 9972060 9970949 N NA TAF1B GRHL1,TAF1B,HPCAL1,KLF11,RRM2,ADAM17,CYS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 11511 2108 chr20 10726675 10729647 10727794 N NA NA NA NA NA NA JAG1 71981 2109 chr20 11666514 11669756 11668124 N NA NA BTBD3 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 201721 2110 chr20 12925930 12929832 12928066 N NA NA SPTLC3 IMR90 Hi-C 24141950 TASP1 689751 2111 chr20 12942241 12984604 12944144 N NA NA SPTLC3 IMR90 Hi-C 24141950 TASP1 634979 2112 chr20 16587450 16589949 16588748 N NA KIF16B KIF16B IMR90 Hi-C 24141950 KIF16B 33371 2113 chr20 16688022 16690724 16688915 N NA SNRPB2 NA NA NA NA SNRPB2 19885 2114 chr20 1725783 1727994 1727541 N NA NA PDYN,LOC100289473 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A-SDCBP2 351967 2115 chr20 1778636 1789246 1783819 N NA NA SIRPA,LOC100289473,PDYN,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 293282 2116 chr20 17853551 17855827 17854741 N NA NA BANF2,RRBP1,DSTN,SNX5,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 93663 2117 chr20 19736752 19816614 19738435,19804678,19764935,19756586,19787862 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1,LOC100130264,NAA20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIN2 50551 2118 chr20 2067384 2070859 2069496 N NA STK35 LOC100289473 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 11669 2119 chr20 20721524 20726412 20724700 N NA RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 28258 2120 chr20 20731359 20734837 20733486 N NA RALGAPA2 C20orf26 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 38093 2121 chr20 20738882 20744088 20742723,20739989 N,N NA;NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 45616 2122 chr20 20744837 20748464 20746517 N NA NA NA NA NA NA RALGAPA2 51571 2123 chr20 20801277 20806402 20802446,20804261,20805766 N,N,N NA;NA;NA NA C20orf26,PLK1S1 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 108011 2124 chr20 20874578 20877755 20875191 N NA NA NA NA NA NA RALGAPA2 181312 2125 chr20 21067414 21076835 21070473,21074921 N,N NA;NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK1S1 29789 2126 chr20 21078227 21081437 21079550 N NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK1S1 25187 2127 chr20 21258782 21260409 21259652 N NA XRN2 PLK1S1,XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 XRN2 23533 2128 chr20 21587158 21590713 21588940 N NA NA NA NA NA NA NKX2-2 92494 2129 chr20 21594506 21613837 21596056,21602610 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NKX2-2 99842 2130 chr20 21792286 21794131 21793223 N NA NA NA NA NA NA NKX2-2 297622 2131 chr20 21882891 21883822 21883435 N NA NA NA NA NA NA NKX2-2 388227 2132 chr20 2224307 2227287 2226295 N NA NA PDYN,TGM3,SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 STK35 141779 2133 chr20 2244189 2254314 2245709 N NA NA TGM3 IMR90 Hi-C 24141950 STK35 161661 2134 chr20 22470019 22473035 22471804 Y FOXA2,FOXA2 NA NA NA NA NA NXT1 858338 2135 chr20 23072077 23074180 23073211 N NA NA CD93,SSTR4,LOC200261 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NXT1 257193 2136 chr20 23079901 23082937 23081149 N NA NA NA NA NA NA NXT1 248436 2137 chr20 23185074 23187500 23186475 N NA NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 143873 2138 chr20 23673047 23678004 23675457 N NA NA CST2 IMR90 Hi-C 24141950 CST3 54473 2139 chr20 23735275 23740420 23737403 N NA NA NA NA NA NA CST3 116701 2140 chr20 23812981 23816578 23814730 N NA NA NA NA NA NA CST3 194407 2141 chr20 24006410 24009459 24008033 Y NA NA NA NA NA NA CST3 387836 2142 chr20 24674432 24676915 24675861 N NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf3 296510 2143 chr20 24909833 24915935 24910655 N NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf3 57490 2144 chr20 25095297 25097667 25096368 N NA NA ACSS1,C20orf3,VSX1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 56479 2145 chr20 25824768 25848581 25824807,25834735,25840751,25842337,25836973,25842371,25844013,25846936,25844040 N,N,N,Y,N,Y,N,N,N NA;NA;NA;ZNF337;NA;ZNF337;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF337 147299 2146 chr20 2788916 2791869 2789809 N NA FAM113A CPXM1 K562 ChIA-PET 22265404 FAM113A 29463 2147 chr20 29518949 29520475 29519329 N NA NA NA NA NA NA FRG1B 91404 2148 chr20 32722330 32726807 32723686 N NA EIF2S2 CHMP4B,EIF2S2,RALY,ACTL10,NECAB3,E2F1,PXMP4,ZNF341 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 22245 2149 chr20 32746232 32747517 32746823 N NA EIF2S2 CHMP4B,ZNF341,PXMP4,EIF2S2,RALY,ASIP,ITCH,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 46147 2150 chr20 32800736 32805349 32804092 N NA NA AHCY,ITCH,NCOA6,ASIP,DYNLRB1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2S2 100651 2151 chr20 32815413 32817451 32816261 N NA NA NA NA NA NA EIF2S2 115328 2152 chr20 34650864 34655011 34652722 Y NA LOC647979,EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC647979 11982 2153 chr20 34680494 34683615 34682154 N NA LOC647979,EPB41L1 LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152,SCAND1,DLGAP4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPB41L1 16733 2154 chr20 35596088 35597585 35596708 N NA NA NA NA NA NA KIAA0889 107812 2155 chr20 36297235 36300312 36298772 Y C20orf132 CTNNBL1 VSTM2L,LOC100287792,RPN2,CTNNBL1,TTI1,LBP IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 22122 2156 chr20 36926972 36929529 36928638 N NA NA NA NA NA NA TGM2 133272 2157 chr20 38913989 38917495 38915739 N NA NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 400381 2158 chr20 39042243 39045503 39043901 N NA NA NA NA NA NA MAFB 272373 2159 chr20 39089179 39092532 39091476 N NA NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 225344 2160 chr20 39096203 39100805 39098087 N NA NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 217071 2161 chr20 39275462 39278187 39277231 N NA MAFB MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 39689 2162 chr20 4004270 4005384 4004726 N NA NA CDC25B,PANK2,MIR103B2,RNF24,SMOX,HSPA12B,CENPB,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 124066 2163 chr20 40277188 40288156 40278817,40283149 N,N NA;NA CHD6 CHD6 MCF7 ChIA-PET 22265404 CHD6 30055 2164 chr20 40320023 40324209 40322016 N NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 72890 2165 chr20 4039946 4042671 4040673 N NA NA RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 86779 2166 chr20 42477817 42479890 42478639 N NA NA TOX2,MYBL2,GTSF1L IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 182108 2167 chr20 44092616 44096302 44094430 N NA PIGT NA NA NA NA PIGT 47909 2168 chr20 44909052 44911607 44910277 N NA NA CDH22 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C2 81457 2169 chr20 45450764 45453655 45452029 N NA NA EYA2,ZMYND8,NCOA3,SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A10 112485 2170 chr20 46121264 46123434 46122235 N NA NCOA3 NA NA NA NA NCOA3 7167 2171 chr20 46605917 46607374 46606686 N NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 475316 2172 chr20 46913527 46916786 46915239 N NA NA SULF2,GPR19,WDR20,SBNO2,CMTM7,PDGFRA,HMHB1,ADAMTSL1,NCOA3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 ARFGEF2 621489 2173 chr20 48781608 48784668 48782760 N NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,CEBPB TMEM189-UBE2V1,SNAI1,RNF114,UBE2V1,PTPN1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM189-UBE2V1 11273 2174 chr20 48788083 48803817 48789004 N NA TMEM189-UBE2V1,CEBPB TMEM189-UBE2V1,SNAI1,RNF114,UBE2V1,PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 3303 2175 chr20 48861683 48864174 48863582 Y NA NA PTPN1,MIR645,CEBPB,FAM65C,LOC284751,PARD6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 54563 2176 chr20 49030589 49034504 49032319 Y NA NA LOC284751,CEBPB,PTPN1,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92387 2177 chr20 49098915 49101494 49100186 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 25397 2178 chr20 49725958 49729700 49727877 N NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 150595 2179 chr20 49732463 49761981 49754799,49759717,49738080 N,N,N NA;NA;NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 157100 2180 chr20 49927045 49930285 49928750 N NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 351682 2181 chr20 50447422 50451960 50450116 N NA SALL4 ATP9A,ZFP64,SALL4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SALL4 28374 2182 chr20 50487843 50489928 50488621 N NA NA NFATC2,ATP9A,SALL4 IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 68795 2183 chr20 50526097 50528920 50527409 N NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 107049 2184 chr20 50533669 50536704 50534890 N NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 114621 2185 chr20 50549462 50552513 50550955 N NA NA SALL4,ATP9A,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 130414 2186 chr20 51109338 51110646 51109883 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 300814 2187 chr20 52132535 52140730 52133889 N NA NA TSHZ2,PTPRG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 ZNF217 58906 2188 chr20 5213844 5217307 5214897 N NA NA NA NA NA NA CDS2 106437 2189 chr20 52237936 52241808 52240071 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 38300 2190 chr20 52258576 52260409 52259502 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 58940 2191 chr20 52276769 52279858 52278242 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,SULF2,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 77133 2192 chr20 52353028 52357993 52355234,52356157 Y,N NA;NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 153392 2193 chr20 52366773 52369558 52367747 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 167137 2194 chr20 52379237 52382028 52380541 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 179601 2195 chr20 52401395 52404380 52403296 N NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 201759 2196 chr20 52442949 52447401 52447390,52445352 N,Y NA;NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 243313 2197 chr20 52516092 52519785 52517726 N NA NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 304717 2198 chr20 52530020 52534689 52531829 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289813 2199 chr20 52816463 52819279 52817720 N NA PFDN4 SULF2,ZNF217,BCAS1,PTPRT,CYP24A1,DOK5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PFDN4 5223 2200 chr20 53308765 53311729 53310260 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 484263 2201 chr20 53598772 53604413 53601046 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 774270 2202 chr20 54209923 54270060 54268882 N NA NA NA NA NA NA FAM210B 663923 2203 chr20 54786514 54788284 54787223 N NA NA NA NA NA NA FAM210B 145699 2204 chr20 55309337 55312516 55310389 N NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 104979 2205 chr20 55645906 55647758 55646654 N NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 MTRNR2L3 287120 2206 chr20 55900886 55902950 55901852 N NA MTRNR2L3 BMP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 MTRNR2L3 31928 2207 chr20 5622099 5625628 5624022 N NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 30427 2208 chr20 56322684 56367621 56338455,56345608,56335657,56323885,56354582,56348539,56360963 N,N,N,Y,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA PMEPA1 PMEPA1,C20orf85,PPP4R1L,ZBP1 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 PMEPA1 36092 2209 chr20 5636743 5639144 5638341 N NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 45071 2210 chr20 56497055 56504024 56499427 N NA NA PMEPA1,C20orf85,CTCFL,ZBP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 210463 2211 chr20 56605217 56608648 56606899 N NA NA ZBP1,C20orf85,PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 318625 2212 chr20 56641511 56648647 56647308 N NA NA ZBP1,PMEPA1,C20orf85,PCK1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 354919 2213 chr20 5683033 5687446 5683938 N NA C20orf196 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 43597 2214 chr20 5693614 5697173 5695490 Y C20orf196 C20orf196 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 33870 2215 chr20 57971655 57978850 57972464,57974256,57977777 N,N,N NA;NA;NA NA EDN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2-ATP5E 353754 2216 chr20 5865582 5866721 5866142 N NA CHGB NA NA NA NA CHGB 25253 2217 chr20 59689477 59693246 59690942 N NA NA LOC284757,C20orf197 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 947620 2218 chr20 59720387 59722638 59721420 N NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 918228 2219 chr20 59736655 59738688 59737465 N NA NA LOC284757,CDH26 IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 902178 2220 chr20 59752513 59762363 59754100 N NA NA LOC284757,CDH26,CDH4,C20orf197,FAM217B IMR90 Hi-C 24141950 TAF4 878503 2221 chr20 61263280 61264950 61263939 N NA NA NA NA NA NA C20orf20 162855 2222 chr20 6683422 6687153 6685023 Y NA NA NA NA NA NA CRLS1 696683 2223 chr20 6687935 6690591 6689155 N NA NA BMP2 IMR90 Hi-C 24141950 CRLS1 701196 2224 chr20 674889 677653 676128 N NA SRXN1 C20orf54 IMR90 Hi-C 24141950 SRXN1 40999 2225 chr20 679831 681980 680731 N NA SRXN1 C20orf54 IMR90 Hi-C 24141950 SRXN1 45941 2226 chr20 7811004 7812290 7811260 N NA NA NA NA NA NA PLCB4 1237411 2227 chr20 792226 793790 793125 N NA C20orf54,FAM110A NA NA NA NA FAM110A 20566 2228 chr20 8074597 8079017 8075263,8076868 N,N NA;NA NA PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 970684 2229 chr20 8105989 8108866 8107013 N NA NA PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 940835 2230 chr21 10162829 10168512 10163593 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 194236 2231 chr21 10199123 10203721 10200087 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 230530 2232 chr21 10492764 10493163 10492964 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 524171 2233 chr21 10596095 10616502 10597943 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 627502 2234 chr21 11168950 11171042 11169695 N NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1200357 2235 chr21 14675655 14679422 14677441 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1076087 2236 chr21 14690755 14693325 14692027 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 1062184 2237 chr21 15065981 15074169 15073051,15068545 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 681340 2238 chr21 15094636 15128372 15095786 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 627137 2239 chr21 15398420 15457082 15399681,15402024 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 298427 2240 chr21 16936243 16938666 16937390 N NA NA NA NA NA NA USP25 163830 2241 chr21 16958029 16960762 16959213 N NA NA HSPA13 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 141734 2242 chr21 17030498 17034034 17032339 N NA NA USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 68462 2243 chr21 17349411 17355839 17350610,17350343 N,N NA;NA NA NA NA NA NA USP25 246915 2244 chr21 18146958 18149032 18147594 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 736192 2245 chr21 18476112 18481154 18478473 N NA NA NA NA NA NA CXADR 404070 2246 chr21 18488238 18488880 18488852 N NA NA NA NA NA NA CXADR 396344 2247 chr21 18531692 18534847 18533531 N NA NA NA NA NA NA CXADR 350377 2248 chr21 19109681 19112332 19110864 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 79371 2249 chr21 21723751 21727497 21725656 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 2532048 2250 chr21 23386643 23437553 23434309 N NA NA NA NA NA NA MRPL39 3542248 2251 chr21 29177152 29179917 29178742 N NA NA NA NA NA NA ADAMTS1 959424 2252 chr21 29627338 29630278 29628864 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 627415 2253 chr21 29680831 29684499 29682770 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 573194 2254 chr21 31594500 31601528 31596051,31599507 N,N NA;NA LINC00307,CLDN8 NA NA NA NA CLDN8 6031 2255 chr21 31605319 31607498 31606483 N NA LINC00307,CLDN8 NA NA NA NA CLDN8 16850 2256 chr21 33503639 33507719 33504954 N NA NA HUNK IMR90 Hi-C 24141950 MIS18A 143657 2257 chr21 34366945 34370070 34369132 N NA NA OLIG1,C21orf54 IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 C21orf49 222534 2258 chr21 34492707 34494842 34494545,34493718 N,N NA;NA NA SYNJ1,OLIG2,OLIG1,C21orf54 GM12878,K562,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 IFNAR2 107389 2259 chr21 34577437 34577914 34577602 N NA IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,C21orf119,URB1,GART,SON,DONSON,CRYZL1 IMR90,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 24317 2260 chr21 36576517 36578904 36577708 Y NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM165B 828768 2261 chr21 36627314 36630564 36628981 N NA NA CLIC6,RUNX1,SETD4,LOC100506385 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SETD4 802255 2262 chr21 36695347 36697551 36696729 N NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 735268 2263 chr21 37955301 37959051 37957347 N NA NA CLDN14,DSCR6,HLCS,CHAF1B,SIM2 IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 112940 2264 chr21 37974706 37976451 37975447 N NA NA CLDN14,HLCS,CHAF1B,SIM2,DOPEY2 IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 95540 2265 chr21 37982180 37989319 37985622,37988194 N,N NA;NA NA CLDN14,CHAF1B,HLCS,SIM2,DSCR6 IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 82672 2266 chr21 38010951 38036483 38034857,38012976 N,N NA;NA SIM2 CLDN14,HLCS,SIM2,DSCR6 IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 35508 2267 chr21 38931258 38937667 38936241 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 191399 2268 chr21 39611532 39614370 39612983 N NA NA KCNJ6,KCNJ15 IMR90 Hi-C 24141950 ERG 419248 2269 chr21 40039115 40041836 40040211 N NA ERG ETS2,ERG,PSMG1,BRWD1 IMR90 Hi-C 24141950 ERG 5497 2270 chr21 40073481 40075835 40074549 N NA ERG ETS2,ERG,BRWD1,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ERG 39863 2271 chr21 40278584 40280472 40279271 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 101353 2272 chr21 40360379 40363195 40361785 Y NA NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 183148 2273 chr21 40454372 40455720 40454833 N NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 99720 2274 chr21 40508855 40511436 40510426 N NA PSMG1 ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 44004 2275 chr21 41057454 41060906 41058944 N NA NA NA NA NA NA PCP4 178441 2276 chr21 41212235 41214279 41212905 N NA PCP4 NA NA NA NA PCP4 25068 2277 chr21 41323632 41332999 41325425 N NA NA NA NA NA NA PCP4 84285 2278 chr21 42257265 42260059 42259048 N NA DSCAM NA NA NA NA DSCAM 38226 2279 chr21 42415238 42419815 42417433 N NA NA NA NA NA NA DSCAM 196199 2280 chr21 42890830 42904033 42892771,42898420,42899299,42902486 N,N,N,N NA;NA;NA;NA TMPRSS2 TMPRSS2,MX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMPRSS2 10745 2281 chr21 42906645 42913914 42908499,42911314 N,N NA;NA TMPRSS2 TMPRSS2,MX1,MX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 26560 2282 chr21 42915199 42917732 42915781 N NA TMPRSS2 MX1,MX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 35114 2283 chr21 42930521 42935117 42932454 N NA NA TMPRSS2,MX1 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 50436 2284 chr21 42938800 42943210 42940956 N NA NA TMPRSS2,MX1,BACE2,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 58715 2285 chr21 42949230 42955680 42952287,42955264,42950902 N,N,N NA;NA;NA NA TMPRSS2,RIPK4,LINC00111,PRDM15 IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS2 69145 2286 chr21 43005501 43036341 43005598,43013641,43021979,43025917,43032475 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA PRDM15,RIPK4,LINC00112,LINC00479,LINC00111,C2CD2,MX1,TMPRSS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00111 63121 2287 chr21 43474926 43479345 43476951,43478910 N,N NA;NA ZNF295 ZNF295,UMODL1,C2CD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF295 44430 2288 chr21 44041948 44045703 44044661 N NA PDE9A PDE9A,WDR4,SLC37A1 IMR90 Hi-C 24141950 PDE9A 28159 2289 chr21 44357503 44385605 44375052,44385446,44370524 N,N,N NA;NA;NA NDUFV3 PKNOX1,CBS,U2AF1,NDUFV3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV3 44125 2290 chr21 44705998 44710052 44707669 N NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 U2AF1 178310 2291 chr21 44714208 44717098 44715424 N NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00313 181005 2292 chr21 44751227 44766672 44753363,44763803 Y,N NA;NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 131431 2293 chr21 45245546 45247818 45246422 N NA CSTB,RRP1,LOC284837 NA NA NA NA LOC284837 13098 2294 chr21 45270411 45281116 45279995 N NA LOC284837 AGPAT3,PDXK,CSTB,TRAPPC10,LOC284837 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC284837 37963 2295 chr21 45594181 45602566 45596245 N NA C21orf33 PWP2,ICOSLG,DNMT3L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 40687 2296 chr21 46740806 46751585 46749756 Y NA POFUT2,LOC642852 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC642852 32839 2297 chr21 46774510 46776338 46775401 N NA NA ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642852 66543 2298 chr21 46975287 46980127 46975901 N NA NA SLC19A1,LOC100129027,PCBP3,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC642852 267320 2299 chr21 46987375 46990777 46988692 N NA NA LOC100129027,PCBP3,COL18A1,SLC19A1,LINC00315,LOC642852,ADARB1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 279098 2300 chr21 47040623 47042416 47041685 N NA NA PCBP3,ADARB1,LOC100129027,LOC642852,LINC00315,POFUT2,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 227459 2301 chr21 47058425 47061748 47061159 N NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 208127 2302 chr21 47098136 47217192 47099027,47214111 N,N NA;NA NA LOC642852,POFUT2,PCBP3,SLC19A1,LOC100129027,ADARB1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 52683 2303 chr21 47392629 47397252 47393740 N NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4411 2304 chr21 48117593 48119834 48118161 N NA NA NA NA NA NA PRMT2 62086 2305 chr21 9539911 9541895 9540623 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 426698 2306 chr21 9685784 9690703 9686763 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 277890 2307 chr21 9694508 9701537 9697877 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 267056 2308 chr21 9864259 9883662 9882009 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 84931 2309 chr22 17398625 17400264 17399980 N NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 IL17RA 165587 2310 chr22 17825860 17847059 17845112,17830214 N,N NA;NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 CECR2 109569 2311 chr22 17848532 17926721 17849845 Y NA CECR2 CECR2,GAB4,CECR7,CECR6 IMR90 Hi-C 24141950 CECR2 29907 2312 chr22 18786976 18790912 18789039 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 102824 2313 chr22 18794361 18800033 18798331 N NA NA NA NA NA NA DGCR6 93703 2314 chr22 18807368 18813440 18810652,18811261,18807476 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA DGCR6 80296 2315 chr22 18816056 18820536 18817665,18819368 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DGCR6 73200 2316 chr22 18828442 18833480 18830070,18832734 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DGCR6 60256 2317 chr22 18838970 18844004 18841951 N NA DGCR6 NA NA NA NA DGCR6 49732 2318 chr22 19530408 19533324 19531715 N NA NA NA NA NA NA CDC45 62994 2319 chr22 19591919 19596928 19593050,19595062 N,N NA;NA NA CLDN5,UFD1L,CLTCL1,HIRA,C22orf39,CDC45,LOC150185,SLC25A1,DGCR14,MRPL40 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT5 105059 2320 chr22 19616664 19617268 19617118 N NA NA CDC45,UFD1L,CLDN5,CLTCL1,SLC25A1,HIRA,DGCR2,DGCR14,TSSK2,LOC150185,TXNRD2,MRPL40,GSC2,C22orf39,GP1BB,SEPT5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT5 84719 2321 chr22 20401707 20409621 20408575,20404436 N,N NA;NA TMEM191B,PI4KAP1 NA NA NA NA PI4KAP1 3012 2322 chr22 20417124 20427465 20424686,20427034 N,N NA;NA TMEM191B,PI4KAP1 NA NA NA NA PI4KAP1 18429 2323 chr22 20617364 20620854 20618330 N NA NA NA NA NA NA ZNF74 127551 2324 chr22 21447509 21448730 21448124 N NA NA BCRP2,CRKL IMR90 Hi-C 24141950 THAP7 91105 2325 chr22 21558636 21561801 21560276 N NA NA NA NA NA NA THAP7 202232 2326 chr22 21588134 21592189 21590186 N NA NA NA NA NA NA TMEM191C 229270 2327 chr22 21597943 21601694 21599577 N NA NA NA NA NA NA TMEM191C 219765 2328 chr22 21608313 21614731 21611919,21612562,21609317 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TMEM191C 206728 2329 chr22 21617327 21619719 21618964 N NA NA NA NA NA NA TMEM191C 201740 2330 chr22 21685326 21691622 21690313 N NA NA NA NA NA NA TMEM191C 129837 2331 chr22 22414848 22417243 22416176 N NA NA TOP3B,LOC96610 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPM1F 107598 2332 chr22 22532004 22537780 22536011 Y NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 114683 2333 chr22 23316710 23318634 23317590 N NA NA RTDR1,GNAZ,IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 BCR 203918 2334 chr22 23774498 23790870 23775630 N NA NA NA NA NA NA CES5AP1 50185 2335 chr22 23861077 23866526 23864129,23864761 Y,N GNAZ,RTDR1,BCR;NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 CES5AP1 136764 2336 chr22 23877298 23893249 23880476,23890466 N,N NA;NA NA BCR,ZDHHC8P1,CES5AP1,IGLL1,GUSBP11,RGL4 IMR90 Hi-C 24141950 CES5AP1 152985 2337 chr22 25349105 25396326 25366029,25349905 Y,Y NA;NA KIAA1671 SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1671 27615 2338 chr22 25671135 25674919 25673121 N NA IGLL3P LRP5L IMR90 Hi-C 24141950 IGLL3P 39305 2339 chr22 25696282 25704598 25697282 N NA IGLL3P ADRBK2 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL3P 9626 2340 chr22 25938602 25942410 25941249 N NA ADRBK2 ADRBK2 IMR90 Hi-C 24141950 ADRBK2 18451 2341 chr22 27768366 27773658 27769483 N NA NA MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 541597 2342 chr22 28081760 28084157 28083157 N NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 231098 2343 chr22 29213157 29269221 29219380,29214696,29261133 Y,N,Y NA;NA;ZNRF3 CCDC117,XBP1 TTC28,TTC28-AS1,ZNRF3,EMID1,XBP1,CCDC117,C22orf31,KREMEN1,CHEK2,HSCB,PITPNB,EWSR1,RHBDD3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XBP1 16597 2344 chr22 30598038 30600013 30598772 N NA NA HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 85603 2345 chr22 32375313 32376366 32375711 N NA NA NA NA NA NA RFPL2 224352 2346 chr22 35020675 35022259 35021183 N NA NA NA NA NA NA ISX 439871 2347 chr22 35619041 35628404 35627211 N NA HMGXB4 HMGXB4,LARGE IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGXB4 25041 2348 chr22 35846777 35851637 35848724,35850234 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MCM5 50661 2349 chr22 35862281 35864836 35863872 N NA NA RASD2,MB IMR90 Hi-C 24141950 MCM5 66165 2350 chr22 35872009 35879324 35875071 N NA NA TOM1,RASD2,MB,RBFOX2,MCM5,APOL6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM5 75893 2351 chr22 36022644 36025191 36023664 N NA MB MB MCF7 ChIA-PET 22265404 MB 3243 2352 chr22 36804538 36808086 36806218 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 20475 2353 chr22 38411380 38415606 38412671 N NA PICK1 SOX10,POLR2F,PICK1,MAFF IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 37656 2354 chr22 38439939 38442102 38440307 N NA PICK1 BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1 IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 11160 2355 chr22 38582448 38584852 38583614 N NA PLA2G6 PLA2G6,PICK1,BAIAP2L2,MAFF,CSNK1E K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2G6 4612 2356 chr22 39318449 39321852 39319914 N NA NA APOBEC3A,CBX7,PDGFB,CBX6,GTPBP1,DNAL4,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G,RPL3,SNORD83A,RNU86,NPTXR,APOBEC3C,APOBEC3D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX6 50191 2357 chr22 39721957 39723990 39722546 N NA RPL3 RNU86,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL3 6287 2358 chr22 39941032 39942591 39941770 N NA SMCR7L,ATF4,RPS19BP1 NA NA NA NA RPS19BP1 12172 2359 chr22 41049723 41052346 41050743 N NA MKL1 ST13,MKL1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17033 2360 chr22 41124633 41132183 41128936 Y NA NA XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A17 83209 2361 chr22 41416393 41423186 41417896 N NA NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EP300 65428 2362 chr22 42833434 42839938 42834141 N NA NA WBP2NL,TCF20,LOC388906,SERHL,MEI1,LOC100132273,NFAM1,NDUFA6,C22orf32,CYP2D6,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP7A 75891 2363 chr22 42856655 42861127 42858301 N NA NA MEI1,TCF20,WBP2NL,NDUFA6,LOC100132273,NAGA,C22orf32,CYP2D6,SERHL,SERHL2,POLDIP3,RRP7B,FAM109B,NFAM1,SEPT3,CYP2D7P1,LOC388906 IMR90 Hi-C 24141950 RRP7A 54702 2364 chr22 43050070 43053440 43051984 N NA POLDIP3 RNU12,POLDIP3,CYB5R3,A4GALT,ARFGAP3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLDIP3 39108 2365 chr22 43162501 43168187 43166125 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3,TTLL1 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGAP3 85221 2366 chr22 43791476 43794704 43793228 N NA NA SCUBE1,EFCAB6,SULT4A1,MPPED1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPO 243956 2367 chr22 44945506 44947945 44946993 N NA NA PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 51501 2368 chr22 45641886 45644462 45642382 Y NA NA LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 FAM118A 60619 2369 chr22 45658558 45661097 45659830 N NA FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM118A 43984 2370 chr22 45662172 45667125 45665033,45664782 Y,N NA;NA FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10,NUP50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM118A 37956 2371 chr22 46033583 46036387 46034921 N NA NA FAM118A,FBLN1,ATXN10,WNT7B IMR90 Hi-C 24141950 FAM118A 328502 2372 chr22 46291751 46294869 46292575 N NA NA ATXN10,WNT7B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100271722 145879 2373 chr22 46970499 46980140 46972982 N NA NA TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TRMU 239201 2374 chr22 47710922 47713360 47711783 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 313958 2375 chr22 48649160 48651892 48650492 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 621842 2376 chr22 48811563 48813026 48812417 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 784245 2377 chr22 48823339 48825429 48824452 N NA NA NA NA NA NA FLJ46257 796021 2378 chr22 49407049 49409752 49408571 N NA NA FAM19A5,LOC284933,LOC100128946 IMR90 Hi-C 24141950 BRD1 808700 2379 chr22 49411277 49415291 49412274 N NA NA FAM19A5,LOC284933,LOC100128946 IMR90 Hi-C 24141950 BRD1 803161 2380 chr22 49764004 49766789 49765248 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 451663 2381 chr22 50116672 50119245 50117905 N NA NA NA NA NA NA BRD1 99207 2382 chr22 50768715 50779653 50769449 Y MOV10L1 PPP6R2 PLXNB2,FAM116B MCF7 ChIA-PET 22265404 PPP6R2 2093 2383 chr3 100200059 100202192 100201269 N NA NA TMEM45A IMR90 Hi-C 24141950 TOMM70A 79817 2384 chr3 104052 105913 105106 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 3062687 2385 chr3 105600271 105602866 105601653 N NA CBLB CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 12384 2386 chr3 10623977 10626848 10625198 N NA NA NA NA NA NA ATP2B2 76709 2387 chr3 106396498 106399455 106397828 N NA NA NA NA NA NA CBLB 808611 2388 chr3 106416135 106420189 106418154 N NA NA NA NA NA NA BBX 821594 2389 chr3 10707133 10709532 10708507 N NA NA SLC6A1,ATP2B2,SLC6A11 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B2 159865 2390 chr3 107146050 107152751 107149010,107151095 Y,N NA;NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 89032 2391 chr3 107211052 107213948 107212405 N NA BBX BBX IMR90 Hi-C 24141950 BBX 27835 2392 chr3 107968626 107971229 107969915 N NA IFT57 MYH15,HHLA2,LOC285205 IMR90 Hi-C 24141950 IFT57 27209 2393 chr3 110093158 110096968 110095226 N NA NA NA NA NA NA PVRL3-AS1 691838 2394 chr3 110472521 110474972 110473796 N NA NA PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3-AS1 313834 2395 chr3 110577214 110580297 110579060 N NA NA PVRL3-AS1,PVRL3 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3-AS1 208509 2396 chr3 110582778 110587068 110584998 N NA NA NA NA NA NA PVRL3-AS1 201738 2397 chr3 110674880 110678244 110676786 N NA NA NA NA NA NA PVRL3-AS1 110562 2398 chr3 111392472 111395024 111393445 N NA NA CD96,PHLDB2 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 56303 2399 chr3 112413928 112416635 112415394 N NA NA CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 133033 2400 chr3 112884155 112887420 112885908 Y NA NA BOC,WDR52,KIAA2018,SIDT1 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf17 145600 2401 chr3 114874058 114876518 114875264 N NA ZBTB20 GAP43,ZBTB20 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB20 7931 2402 chr3 116855144 116865445 116860954,116864222 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZBTB20 1989017 2403 chr3 116994864 116999215 116997148 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 1960537 2404 chr3 117581888 117595877 117592267,117594568 N,N NA;NA NA NA NA NA NA B4GALT4 1363875 2405 chr3 118258572 118259916 118259226 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 699836 2406 chr3 11951587 11954173 11952308 N NA NA NA NA NA NA TAMM41 63235 2407 chr3 119997842 120008916 120004068 N NA NA LRRC58 IMR90 Hi-C 24141950 GSK3B 184578 2408 chr3 120180144 120183731 120181670 N NA NA GSK3B IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 131397 2409 chr3 120273003 120278843 120275154,120276568 N,N NA;NA NDUFB4 FSTL1,LRRC58,GPR156,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 36285 2410 chr3 120283912 120288115 120286166 N NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 27013 2411 chr3 125112895 125115237 125114099 N NA ZNF148 HEG1,SLC12A8,ZNF148,SNX4,MUC13 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF148 18697 2412 chr3 125405066 125408011 125406511 N NA NA MYLK IMR90 Hi-C 24141950 SNX4 166008 2413 chr3 125408750 125411180 125409549,125409424 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SNX4 169692 2414 chr3 125417871 125419013 125418934 N NA NA NA NA NA NA SNX4 178813 2415 chr3 125454446 125456392 125455702 N NA NA NA NA NA NA SNX4 215388 2416 chr3 125931418 125933156 125931966 N NA NA CCDC37,ALDH1L1,ZXDC IMR90 Hi-C 24141950 TXNRD3 440811 2417 chr3 126004486 126007174 126006440 N NA NA KLF15 IMR90 Hi-C 24141950 TXNRD3 366793 2418 chr3 126288077 126293420 126292565 Y NA NA NA NA NA NA TXNRD3 80547 2419 chr3 126792537 126794235 126793201 N NA NA PLXNA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 85100 2420 chr3 126827420 126830413 126828538 N NA NA CHST13,NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 119983 2421 chr3 126856280 126872687 126857575,126860879 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PLXNA1 148843 2422 chr3 126881783 126884894 126883264 N NA NA NA NA NA NA PLXNA1 174346 2423 chr3 12715279 12716688 12716159 N NA RAF1 RAF1,TMEM40 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAF1 9579 2424 chr3 127260742 127262886 127261722 N NA TPRA1 CHST13,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 TPRA1 46682 2425 chr3 128302727 128304611 128303434 N NA NA GATA2,SEC61A1,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,C3orf27 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPN1 65108 2426 chr3 128392448 128401955 128399820 N NA RPN1,RAB7A RAB7A,RPN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPN1 22729 2427 chr3 128416934 128419166 128417424 N NA RPN1,RAB7A RAB7A,LOC653712,RPN1,KIAA1257 IMR90 Hi-C 24141950 RAB7A 25813 2428 chr3 128942551 128946700 128944049,128945484 N,N NA;NA CNBP,COPG1 KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 21753 2429 chr3 128952993 128956300 128954915 N NA COPG1,C3orf37 CNBP,KIAA1257,COPG1,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,C3orf37 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 12153 2430 chr3 129343719 129346350 129345280 N NA NA NA NA NA NA MBD4 184867 2431 chr3 129859417 129865290 129863391 N NA FAM86HP NA NA NA NA FAM86HP 29141 2432 chr3 130475116 130493317 130491601 N NA PIK3R4 ATP2C1,PIK3R4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PIK3R4 9420 2433 chr3 130503804 130522097 130510723,130515505,130519948,130520124 N,N,N,N NA;NA;NA;NA PIK3R4,ATP2C1 ATP2C1,THSD7B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 PIK3R4 38108 2434 chr3 130556997 130564188 130561139,130560049 N,N NA;NA ATP2C1 ATP2C1 K562 ChIA-PET 22265404 ATP2C1 5181 2435 chr3 13154376 13159653 13159051 N NA NA LOC285375,NUP210,HDAC11,IQSEC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32 271295 2436 chr3 131861927 131992813 131951609,131961960,131956988,131978944,131976771,131934748,131899482,131944757,131938320,131864997,131967617,131985399,131986272,131991269 N,Y,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N,N NA;UBA5;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA ACPP CPNE4,ACPP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACPP 43398 2437 chr3 132122856 132125583 132124177 N NA DNAJC13 ACPP IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC13 10970 2438 chr3 133217680 133218501 133218180 N NA NA TOPBP1,BFSP2 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 73933 2439 chr3 13324319 13325671 13325041 N NA NA NUP210,LOC285375,IQSEC1,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC11 196044 2440 chr3 133459492 133462697 133461684 Y NA NA TF IMR90 Hi-C 24141950 TOPBP1 78755 2441 chr3 133807731 133816246 133814776 N NA NA SLCO2A1,C3orf36,RYK IMR90 Hi-C 24141950 RYK 153340 2442 chr3 134097094 134102117 134100825 Y NA AMOTL2 AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL2 3688 2443 chr3 13492028 13494970 13493389 Y NA HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 26745 2444 chr3 138536072 138555422 138553804,138544207 N,N NA;NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 57871 2445 chr3 138633174 138636665 138635134 N NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 154973 2446 chr3 13935762 13938424 13937024 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227947 2447 chr3 139634702 139636841 139635673 N NA NA CLSTN2 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 526180 2448 chr3 141378507 141379599 141378899 N NA NA ATP1B3,RASA2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF7 77452 2449 chr3 141404877 141408183 141405845 N NA RNF7 RASA2,ATP1B3,RNF7,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNF7 48868 2450 chr3 141579019 141581633 141580139 N NA ATP1B3 RASA2,ATP1B3,GRK7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP1B3 13837 2451 chr3 141946888 141949634 141947937 N NA GK5 GK5,XRN1,TFDP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GK5 2439 2452 chr3 14266281 14273010 14266921,14270355 N,N NA;NA XPC,LSM3 LSM3,SLC6A6,XPC MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LSM3 46053 2453 chr3 14284542 14292614 14290695,14285453 N,N NA;NA NA SLC6A6,GRIP2,LSM3,XPC IMR90 Hi-C 24141950 LSM3 64314 2454 chr3 142895513 142898228 142897345 N NA NA CHST2,SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 CHST2 56895 2455 chr3 14314146 14315581 14314835 N NA NA SLC6A6,GRIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LSM3 93918 2456 chr3 14344921 14347226 14345847 N NA NA SLC6A6,GRIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 96880 2457 chr3 145426996 145428563 145427707 N NA NA NA NA NA NA CHST2 2588378 2458 chr3 14656153 14659286 14657364 N NA C3orf19 C3orf19,FGD5,GRIP2,C3orf20,XPC IMR90 Hi-C 24141950 C3orf19 33967 2459 chr3 14663056 14665753 14664767 N NA C3orf19 C3orf19,FGD5,GRIP2,C3orf20,XPC IMR90 Hi-C 24141950 C3orf19 27500 2460 chr3 148167702 148170592 148168783 N NA NA NA NA NA NA HLTF 633749 2461 chr3 148318278 148322176 148320186,148319591 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA HLTF 482165 2462 chr3 148663720 148665863 148664813 N NA NA CPB1,CPA3,HPS3,CP,HLTF,TM4SF18,GYG1 IMR90 Hi-C 24141950 HLTF 138478 2463 chr3 148994096 148996662 148995407 N NA NA HPS3,CP,GYG1,TM4SF18,HLTF IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 98906 2464 chr3 149117631 149121089 149119272 N NA TM4SF1 WWTR1,ANKUB1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 22063 2465 chr3 149866211 149869280 149867743 N NA NA RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646903 177145 2466 chr3 149950625 149952408 149951262 N NA NA TSC22D2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 174380 2467 chr3 149954203 149969025 149956714 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,EIF2A,SERP1,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 157763 2468 chr3 149995923 149998410 149996868 N NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 128378 2469 chr3 150536801 150538217 150537081 N NA NA NA NA NA NA SELT 215735 2470 chr3 15418717 15430171 15428884 N NA METTL6,EAF1 SH3BP5,LOC100505696 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 METTL6 38871 2471 chr3 154928241 154931531 154929313 N NA NA NA NA NA NA SLC33A1 640717 2472 chr3 154949345 154953309 154951241 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 SLC33A1 618939 2473 chr3 155019193 155023716 155020904 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 SLC33A1 548532 2474 chr3 155032352 155035811 155034353 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 SLC33A1 536437 2475 chr3 155705410 155707561 155706014 Y NA NA NA NA NA NA SLC33A1 133162 2476 chr3 156890872 156894531 156892890,156894060 N,N NA;NA NA CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC730091 356021 2477 chr3 159766168 159768561 159767412 N NA NA IQCJ-SCHIP1,IFT80 IMR90 Hi-C 24141950 IFT80 348759 2478 chr3 159769479 159772307 159770815 N NA NA IQCJ-SCHIP1,IFT80 IMR90 Hi-C 24141950 IFT80 345013 2479 chr3 161137307 161141227 161138688 Y NMD3,C3orf57 NA NMD3,PPM1L,B3GALNT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NMD3 198208 2480 chr3 161146725 161148002 161147401 N NA NA NA NA NA NA NMD3 207626 2481 chr3 161292962 161296344 161294791,161294728 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NMD3 353863 2482 chr3 163641645 163644925 163643039 N NA NA NA NA NA NA NMD3 2702546 2483 chr3 167693697 167697629 167695620 N NA NA LOC646168 IMR90 Hi-C 24141950 GOLIM4 115788 2484 chr3 169404525 169405870 169404787 N NA NA MECOM IMR90 Hi-C 24141950 MYNN 84983 2485 chr3 169416588 169418048 169417382 N NA NA MECOM IMR90 Hi-C 24141950 MYNN 72805 2486 chr3 172193978 172195665 172194838 N NA TNFSF10 NCEH1,FNDC3B,TNFSF10,ECT2,GHSR IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 45632 2487 chr3 172251583 172255940 172254522 N NA TNFSF10 TNFSF10,NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 10286 2488 chr3 172465543 172468597 172467682 N NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 3701 2489 chr3 174152973 174183277 174154288,174158695 N,N NA;NA NA NAALADL2,NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 393834 2490 chr3 176928003 176931346 176929933 N NA TBL1XR1 TBL1XR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TBL1XR1 12955 2491 chr3 177017250 177019850 177018018 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 102202 2492 chr3 177076264 177080010 177078184 N NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161216 2493 chr3 177127179 177130540 177128734 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 212131 2494 chr3 177181926 177184217 177183262 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 266878 2495 chr3 177256038 177258851 177257028 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 340990 2496 chr3 177311028 177312176 177311521 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 395980 2497 chr3 177313314 177317322 177315162 N NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 398266 2498 chr3 177335540 177339004 177337314 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 420492 2499 chr3 177801492 177805637 177803391 N NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMB2 448587 2500 chr3 182000890 182004555 182002832 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 506736 2501 chr3 182399540 182401530 182400851 N NA NA SOX2-OT IMR90 Hi-C 24141950 ATP11B 109761 2502 chr3 184241154 184245011 184243380 N NA EPHB3 CHRD,PSMD2,ECE2,EIF4G1,CLCN2,POLR2H,FAM131A,THPO,EPHB3,VPS8 IMR90 Hi-C 24141950 EPHB3 34576 2503 chr3 18487060 18540257 18487466 N NA NA NA NA NA NA LOC339862 431913 2504 chr3 185275154 185278653 185277173 N NA LIPH,SENP2 TMEM41A,LIPH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIPH 4785 2505 chr3 186130529 186133560 186131845 N NA NA LOC344887,DGKG,ETV5,LOC253573 IMR90 Hi-C 24141950 CRYGS 128607 2506 chr3 187127885 187134727 187129912 N NA NA NA NA NA NA BCL6 328786 2507 chr3 187720250 187722624 187721591 N NA NA BCL6,LPP,LOC100131635,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 149039 2508 chr3 188662746 188669749 188665831 N NA NA LPP-AS2,LPP,BCL6,LOC100131635 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 790870 2509 chr3 189070834 189074255 189072804 N NA NA TP63,TPRG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 1198958 2510 chr3 190061615 190065065 190063244 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 NA LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 981809 2511 chr3 190523924 190527430 190525698 N NA NA FGF12 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 519444 2512 chr3 19143939 19147595 19144580 N NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 42422 2513 chr3 193452339 193453986 193452846 N NA NA LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 OPA1 141406 2514 chr3 193507986 193511387 193509586 N NA NA LOC100131551,HES1,LOC647323 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 197053 2515 chr3 193559428 193561497 193560228 N NA NA HES1,LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 OPA1 248495 2516 chr3 193568098 193571374 193570201 N NA NA LOC647323,LOC100131551,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 257165 2517 chr3 193638555 193641948 193639847 N NA NA LOC100131551,LRRC15 IMR90,Breast Hi-C,3C 24141950,19956766 HES1 211983 2518 chr3 193786350 193790217 193788959 N NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 63714 2519 chr3 193817342 193821500 193819547 N NA HES1 HES1,LOC647323 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 32431 2520 chr3 193828706 193831562 193830623 N NA HES1 LOC647323,HES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 22369 2521 chr3 193840929 193850563 193849031 N NA HES1 LOC647323,LOC100131551,HES1 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 3368 2522 chr3 193883782 193886107 193884822 N NA HES1 HES1,LOC100131551 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 29851 2523 chr3 193901166 193903971 193902490 N NA HES1 LOC100131551,LOC647323 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 47235 2524 chr3 193986765 193991060 193989153 Y NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 132834 2525 chr3 194257345 194260113 194258486 N NA NA TMEM44,ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 68377 2526 chr3 194570520 194577570 194574651 N NA NA LOC100507391,PPP1R2,XXYLT1,APOD,LSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 163898 2527 chr3 194580171 194582765 194581600 N NA NA LOC100507391,XXYLT1,LSG1,PPP1R2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 173549 2528 chr3 194590129 194594276 194591932 N NA NA XXYLT1,PPP1R2,LOC100507391,FAM43A,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 183507 2529 chr3 194599807 194603425 194601430 N NA NA XXYLT1,LOC100507391 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 193185 2530 chr3 194704302 194708061 194705984 N NA NA LOC100507391,XXYLT1,LSG1,PPP1R2,FAM43A,ACAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XXYLT1 283834 2531 chr3 194750375 194753203 194751879 N NA NA XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2 IMR90 Hi-C 24141950 XXYLT1 238692 2532 chr3 195344166 195353197 195348713 N NA APOD,SDHAP2 PPP1R2,MUC20,MUC4,APOD,MIR570,SDHAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHAP2 31713 2533 chr3 195360607 195374309 195361883 N NA APOD,SDHAP2 NA NA NA NA SDHAP2 10601 2534 chr3 195745350 195752711 195748818,195748721,195750783 N,N,N NA;NA;NA SDHAP1 SDHAP2,MUC20,MIR570,TFRC,LOC401109,ZDHHC19,OSTalpha IMR90 Hi-C 24141950 SDHAP1 28200 2535 chr3 196254420 196256995 196255527 N NA RNF168,WDR53 UBXN7,MUC20,TFRC,LOC401109,OSTalpha,ZDHHC19,PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19-TCTEX1D2,RNF168,C3orf43,WDR53,CEP19,PAK2,FBXO45 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 23781 2536 chr3 196354595 196363208 196359576 N NA NA SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2,LRRC33,CEP19 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR53 59182 2537 chr3 197182025 197186520 197183605 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLG1 156578 2538 chr3 20063828 20067146 20065517 N NA NA KAT2B K562 ChIA-PET 22265404 RAB5A 75256 2539 chr3 20588406 20590362 20588779 N NA NA NA NA NA NA SGOL1 360682 2540 chr3 22161354 22163831 22162907 N NA NA NA NA NA NA UBE2E1 1683553 2541 chr3 23152970 23158243 23154668 N NA NA NA NA NA NA UBE2E1 689141 2542 chr3 23170028 23172447 23171228 N NA NA UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 674937 2543 chr3 23203542 23206262 23204537 N NA NA UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 641122 2544 chr3 23776261 23779354 23777429 N NA NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 68030 2545 chr3 25332397 25334155 25333215 N NA NA NA NA NA NA TOP2B 371633 2546 chr3 25730986 25736051 25732426 N NA TOP2B NGLY1,MIR4442,TOP2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP2B 25198 2547 chr3 26824602 26826265 26825014 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 671980 2548 chr3 27625055 27629139 27627115 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 126810 2549 chr3 27673321 27679756 27674682 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 175076 2550 chr3 28828658 28831502 28830317 N NA NA NA NA NA NA AZI2 438040 2551 chr3 32070239 32072798 32071330 N NA ZNF860,OSBPL10 OSBPL10,STT3B,GPD1L IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL10 46897 2552 chr3 34223973 34226825 34225106 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 383910 2553 chr3 34682851 34683822 34683008 N NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 842788 2554 chr3 3719869 3762105 3761116,3727607 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CRBN 498468 2555 chr3 3940354 3952198 3950512 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 392790 2556 chr3 3978897 4005611 4004751 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 339377 2557 chr3 40731093 40734064 40732525 N NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF621 164717 2558 chr3 42516902 42519884 42518481 Y NA VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VIPR1 10907 2559 chr3 4258685 4261053 4260275 N NA NA NA NA NA NA SETMAR 83935 2560 chr3 4285802 4297110 4295138 N NA SETMAR NA NA NA NA SETMAR 47878 2561 chr3 43299985 43300855 43300298 N NA SNRK HIGD1A,CCDC13,ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 27149 2562 chr3 43934506 43936887 43935928 Y NA NA NA NA NA NA ABHD5 202131 2563 chr3 44523169 44558212 44545941,44552166 N,N NA;NA ZNF445,ZNF167 ZNF445,C3orf77 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF445 4007 2564 chr3 45207791 45210774 45209204 Y LIMD1 CDCP1 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCP1 19877 2565 chr3 45612527 45615932 45613774 N NA LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 20391 2566 chr3 46528921 46531774 46530336 N NA NA LRRC2,LOC100132146 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC12 486496 2567 chr3 49497348 49503410 49499748 N NA RHOA,TCTA,NICN1 DAG1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NICN1 30591 2568 chr3 50552503 50554344 50553301 N NA NA CACNA2D2 IMR90 Hi-C 24141950 HEMK1 52565 2569 chr3 51787353 51789309 51788476 N NA NA IQCF6 IMR90 Hi-C 24141950 TEX264 82131 2570 chr3 5295246 5299343 5296446 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 65887 2571 chr3 53177157 53181062 53179587 N NA RFT1 RFT1,PRKCD,TKT IMR90 Hi-C 24141950 RFT1 12687 2572 chr3 53182517 53185913 53184422 N NA RFT1 RFT1,TKT,PRKCD IMR90 Hi-C 24141950 RFT1 18047 2573 chr3 53392526 53399290 53397675 N NA DCP1A DCP1A K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DCP1A 10872 2574 chr3 5345165 5353800 5346708,5351148 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EDEM1 115806 2575 chr3 53510582 53514181 53512425 N NA CACNA1D CACNA1D IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1D 14850 2576 chr3 53522793 53526268 53523960 N NA CACNA1D CACNA1D MCF7 ChIA-PET 22265404 CACNA1D 2763 2577 chr3 5384165 5391338 5386018,5386054,5388417,5389116 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA EDEM1 154806 2578 chr3 5426065 5432842 5427900 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 196706 2579 chr3 5466872 5472663 5468216,5472355 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EDEM1 237513 2580 chr3 5529412 5533648 5531242 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 300053 2581 chr3 5537768 5558406 5539682 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 308409 2582 chr3 5592070 5629524 5604977,5606958,5593460,5613824 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA GRM7 IMR90 Hi-C 24141950 EDEM1 362711 2583 chr3 5684590 5737657 5686606 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 455231 2584 chr3 57202323 57205076 57204363 N NA NA ASB14,APPL1 IMR90 Hi-C 24141950 APPL1 56689 2585 chr3 57955954 57959896 57958265 N NA FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 34231 2586 chr3 58448808 58451208 58449425 N NA PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,PDHB,KCTD6,ACOX2 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 26615 2587 chr3 58570189 58572050 58570998 Y PXK,FAM107A ACOX2 NA NA NA NA ACOX2 47260 2588 chr3 58655480 58661064 58656928 N NA NA NA NA NA NA ACOX2 132551 2589 chr3 59234171 59236626 59235506 N NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 ACOX2 711242 2590 chr3 59304392 59307677 59306061 N NA NA NA NA NA NA ACOX2 781463 2591 chr3 59502113 59506415 59503508 N NA NA NA NA NA NA ACOX2 979184 2592 chr3 59525082 59530464 59529175,59527253 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ACOX2 1002153 2593 chr3 59589732 59593868 59592152 N NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 ACOX2 1066803 2594 chr3 6013355 6014288 6013597 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 783996 2595 chr3 6106817 6147221 6108984 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 877458 2596 chr3 61534013 61536124 61534506 N NA NA PTPRG IMR90 Hi-C 24141950 ID2B 574268 2597 chr3 63625569 63633220 63630546,63627350 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATXN7 217013 2598 chr3 64430179 64432358 64431118 N NA NA LOC100507062,ATXN7,PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 421059 2599 chr3 64473649 64476890 64475164 Y NA NA ENPP1,LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2,LOC100507062,PSMD6,ADAMTS9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950,22265404 PSMD6 464529 2600 chr3 6531070 6540553 6532229 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1301711 2601 chr3 66619557 66623886 66622687 N NA NA SLC25A26,LRIG1 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 68712 2602 chr3 66627487 66629658 66628475 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 76642 2603 chr3 66651880 66654763 66653610 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 101035 2604 chr3 66742700 66746239 66744158 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 191855 2605 chr3 66879288 66882080 66880794 N NA NA LRIG1,SLC25A26 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 328443 2606 chr3 67039195 67041705 67040893 N NA NA KBTBD8 MCF7 ChIA-PET 22265404 LRIG1 488350 2607 chr3 67979263 67982069 67980756 N NA NA NA NA NA NA SUCLG2 274225 2608 chr3 68684905 68686556 68686031 N NA NA NA NA NA NA TMF1 414928 2609 chr3 68987049 68987829 68987675 N NA NA NA NA NA NA TMF1 113655 2610 chr3 69482299 69484462 69483255 N NA FRMD4B NA NA NA NA FRMD4B 46869 2611 chr3 70119804 70123040 70121567 N NA NA NA NA NA NA FRMD4B 684374 2612 chr3 70786012 70788931 70787260 N NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 564980 2613 chr3 70851266 70854630 70853218 N NA NA FOXP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FOXP1 499281 2614 chr3 72326660 72330848 72328824 N NA NA RYBP,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 164926 2615 chr3 72346421 72349266 72347769 N NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 146508 2616 chr3 72359350 72360878 72359901 Y RYBP NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 134896 2617 chr3 72365918 72369343 72367860 N NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 126431 2618 chr3 72384818 72389039 72386283 Y NA NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 106735 2619 chr3 72741183 72743505 72742368 N NA NA LOC201617,PROK2,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 245409 2620 chr3 73714778 73717353 73715962 N NA PDZRN3 PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 40706 2621 chr3 73796516 73799305 73797896 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 122444 2622 chr3 73801387 73805839 73803294 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 127315 2623 chr3 73852100 73857121 73854226 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 178028 2624 chr3 73861188 73919201 73877203,73862733 N,N NA;NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 187116 2625 chr3 74638893 74663644 74643665,74663090 N,N NA;NA NA CNTN3 IMR90 Hi-C 24141950 CNTN3 68550 2626 chr3 74691210 74695336 74693035 N NA NA NA NA NA NA CNTN3 120867 2627 chr3 75409925 75411971 75411055 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 422284 2628 chr3 75652881 75655101 75654687 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 179154 2629 chr3 76483851 76485947 76484623 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 649596 2630 chr3 80581656 80631282 80630745 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1179668 2631 chr3 80676662 80872871 80685255,80816972,80820111,80745735 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GBE1 938079 2632 chr3 82854096 82856226 82854830 N NA NA NA NA NA NA GBE1 1043146 2633 chr3 84933473 84935794 84934731 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 2340619 2634 chr3 8696666 8699187 8698091 N NA NA C3orf32,RAD18 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00312 83198 2635 chr3 8724258 8727024 8725764 N NA NA NA NA NA NA LINC00312 110790 2636 chr3 8736972 8740480 8738887 N NA NA NA NA NA NA LINC00312 123504 2637 chr3 87399476 87402988 87401199 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 123063 2638 chr3 87407304 87410629 87409166 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 130891 2639 chr3 8751166 8754083 8752010 N NA NA NA NA NA NA LINC00312 137698 2640 chr3 87781970 87784936 87782938 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 403326 2641 chr3 87929566 87931165 87930214 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 257097 2642 chr3 9385887 9396694 9395002 N NA THUMPD3,LOC440944,SETD5 RAD18,THUMPD3,SETD5,LOC440944 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THUMPD3 8023 2643 chr3 94224252 94226540 94225577 N NA NA NA NA NA NA NSUN3 442397 2644 chr3 94241907 94244954 94243602 N NA NA NA NA NA NA NSUN3 460052 2645 chr3 94365437 94369730 94367861 N NA NA NA NA NA NA NSUN3 583582 2646 chr3 98039274 98046108 98044007 N NA NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 195802 2647 chr3 999212 1001013 1000127 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 2167587 2648 chr4 10174304 10176897 10175570 N NA NA WDR1,CLNK K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 55731 2649 chr4 104342653 104345822 104344376 N NA NA NA NA NA NA BDH2 321629 2650 chr4 105887116 105889733 105888441 N NA NA TET2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TET2 178109 2651 chr4 106415926 106416223 106416003 N NA PPA2 NA NA NA NA PPA2 20699 2652 chr4 108451780 108454648 108453183 N NA NA PAPSS1 IMR90 Hi-C 24141950 PAPSS1 186771 2653 chr4 108649618 108651503 108650358 N NA PAPSS1 PAPSS1 IMR90 Hi-C 24141950 PAPSS1 8199 2654 chr4 108719133 108722148 108721412 N NA SGMS2 SGMS2 IMR90 Hi-C 24141950 SGMS2 23573 2655 chr4 109188634 109217646 109213625 N NA NA LOC641518,LEF1,HADH IMR90 Hi-C 24141950 LEF1 98522 2656 chr4 1122832 1129329 1124944 N NA SPON2 RNF212,TMED11P,KIAA1530,SPON2,CTBP1,C4orf42,MAEA,FAM53A,SLBP IMR90 Hi-C 24141950 SPON2 37670 2657 chr4 112299246 112301537 112299527 N NA NA NA NA NA NA AP1AR 851358 2658 chr4 113033423 113036015 113034390 N NA NA AP1AR,C4orf32,NEUROG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP1AR 116880 2659 chr4 113626560 113627730 113627247 N NA NA NA NA NA NA LARP7 68440 2660 chr4 114327234 114329589 114328421 N NA NA NA NA NA NA CAMK2D 353494 2661 chr4 11456205 11462175 11456918 N NA NA NA NA NA NA ZNF518B 997173 2662 chr4 115207876 115209976 115208824 N NA NA ARSJ,ANK2 IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2D 524793 2663 chr4 115513181 115516121 115515029 N NA NA UGT8 K562 ChIA-PET 22265404 CAMK2D 830098 2664 chr4 119511582 119559406 119512805,119529802 N,N NA;NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 47168 2665 chr4 120336870 120353613 120353071 N NA LOC645513 NA NA NA NA LOC645513 22325 2666 chr4 123071899 123087348 123073497 N NA KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 4410 2667 chr4 124306511 124309593 124307556 N NA SPRY1 SPATA5,LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 8363 2668 chr4 124417016 124419476 124418323 N NA NA LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 99060 2669 chr4 124425405 124430622 124426997,124429804 N,N NA;NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 107449 2670 chr4 124466223 124468636 124467347 N NA NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 148267 2671 chr4 124475624 124477464 124476486 N NA NA SPRY1,LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 157668 2672 chr4 125824095 125826767 125825336 N NA NA ANKRD50 MCF7 ChIA-PET 22265404 ANKRD50 190208 2673 chr4 125918663 125921963 125919872 N NA NA NA NA NA NA ANKRD50 284776 2674 chr4 125928511 125931453 125930044 N NA NA NA NA NA NA ANKRD50 294624 2675 chr4 12641806 12642380 12642108 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 843609 2676 chr4 127489916 127492898 127491250 N NA NA NA NA NA NA PLK4 1309118 2677 chr4 129231781 129261822 129232816 N NA PGRMC2 PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PGRMC2 21797 2678 chr4 129472651 129476297 129474736 N NA NA LARP1B,PGRMC2,PHF17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF17 254482 2679 chr4 129553963 129558696 129556916 N NA NA PGRMC2,LARP1B,PHF17 IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 172083 2680 chr4 129580502 129590994 129581662 N NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 139785 2681 chr4 129657084 129660590 129658480 N NA NA PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 70189 2682 chr4 130735105 130780166 130775263,130767351 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PHF17 1004326 2683 chr4 132895921 132900196 132897420 N NA NA NA NA NA NA PHF17 3165142 2684 chr4 134377450 134380512 134378932 N NA NA NA NA NA NA PHF17 4646671 2685 chr4 134967071 134968242 134967475 N NA NA NA NA NA NA ELF2 5092364 2686 chr4 136459103 136460597 136459566 N NA NA NA NA NA NA ELF2 3600009 2687 chr4 137036950 137040168 137038716 N NA NA NA NA NA NA ELF2 3020438 2688 chr4 138800918 138804307 138802900 N NA NA NA NA NA NA ELF2 1256299 2689 chr4 139255183 139257216 139255844 N NA NA NA NA NA NA ELF2 803390 2690 chr4 139817842 139821100 139819239 N NA NA SLC7A11,LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 239506 2691 chr4 139829241 139835362 139833071 N NA NA SLC7A11,LOC641365,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 225244 2692 chr4 13991565 13994118 13993000 N NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1L 362237 2693 chr4 140554464 140555216 140555075 N NA MGST2 SCOC,LOC100129858,MAML3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST2 31706 2694 chr4 141367623 141371417 141369804 N NA CLGN NA NA NA NA CLGN 18808 2695 chr4 146254372 146256438 146255195 N NA NA NA NA NA NA OTUD4 153540 2696 chr4 146296781 146300112 146298629 N NA NA NA NA NA NA OTUD4 195949 2697 chr4 146865876 146868335 146867110 N NA ZNF827 ZNF827,MMAA IMR90 Hi-C 24141950 ZNF827 6269 2698 chr4 147054787 147057572 147056106 N NA LSM6 NA NA NA NA LSM6 39263 2699 chr4 148037236 148042296 148039347 N NA NA EDNRA,ARHGAP10,PRMT10 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 496243 2700 chr4 148077933 148080544 148079462 N NA NA EDNRA,TMEM184C,ARHGAP10 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM184C 457995 2701 chr4 149568705 149571782 149569867 N NA NA NA NA NA NA PRMT10 963425 2702 chr4 15145782 15148760 15147630 N NA NA NA NA NA NA CPEB2 141484 2703 chr4 15149661 15153246 15151701 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 145363 2704 chr4 151954857 151959510 151956665 Y NA LRBA LRBA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRBA 18208 2705 chr4 153015440 153017533 153016398 N NA NA FBXW7,SH3D19 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 286131 2706 chr4 153628257 153631309 153629718 N NA NA TMEM154 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARFIP1 69803 2707 chr4 153964860 153988329 153986109 N NA NA ARFIP1,FHDC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM2 85941 2708 chr4 154041291 154043149 154042579 N NA TRIM2 KIAA0922,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM2 31121 2709 chr4 1541762 1544509 1543411 N NA NA KIAA1530 IMR90 Hi-C 24141950 CRIPAK 156422 2710 chr4 1545383 1557768 1546886,1550704 N,N NA;NA NA KIAA1530 IMR90 Hi-C 24141950 CRIPAK 160043 2711 chr4 155878358 155881558 155880374 N NA NA NA NA NA NA PLRG1 406773 2712 chr4 156019964 156023129 156021099 N NA NA NA NA NA NA MAP9 274993 2713 chr4 156027010 156028865 156028168 N NA NA NA NA NA NA MAP9 269257 2714 chr4 156322980 156325620 156324351 N NA MAP9 CTSO,ACCN5,GUCY1A3,GUCY1B3,TDO2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 24858 2715 chr4 156364335 156376645 156366400,156376116 N,N NA;NA NA GUCY1B3,GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 MAP9 66213 2716 chr4 156443663 156446445 156444697 N NA NA GUCY1B3,GUCY1A3 IMR90 Hi-C 24141950 GUCY1A3 141417 2717 chr4 156452705 156455023 156453880 N NA NA GUCY1A3,GUCY1B3 IMR90 Hi-C 24141950 GUCY1A3 132839 2718 chr4 156491090 156494887 156492618 N NA NA NA NA NA NA GUCY1A3 92975 2719 chr4 15765116 15769588 15767863 N NA NA CD38,FGFBP2,BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM200B 81764 2720 chr4 158837293 158847053 158838414,158841659 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM198B 247149 2721 chr4 158912466 158920038 158914367,158916174,158916229,158918018 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA FAM198B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM198B 174164 2722 chr4 159198935 159207123 159200116 N NA NA NA NA NA NA TMEM144 67534 2723 chr4 159968791 159969810 159969549 N NA NA C4orf45 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 219188 2724 chr4 160897223 160898787 160898248 N NA NA NA NA NA NA RAPGEF2 708225 2725 chr4 163342399 163342818 163342619 N NA NA NA NA NA NA NAF1 745255 2726 chr4 165922022 165924015 165923594 N NA C4orf39 NA NA NA NA C4orf39 43922 2727 chr4 166111459 166115153 166113437 N NA NA KLHL2 K562 ChIA-PET 22265404 TMEM192 77435 2728 chr4 166117758 166122506 166121126 N NA NA NA NA NA NA TMEM192 83734 2729 chr4 168184793 168188291 168186842 N NA NA NA NA NA NA CBR4 1743177 2730 chr4 170229680 170232178 170230819 N NA SH3RF1 SH3RF1,NEK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3RF1 37431 2731 chr4 170234176 170238163 170236072 N NA SH3RF1 SH3RF1,NEK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3RF1 41927 2732 chr4 174536294 174538397 174537267 N NA NA NA NA NA NA SAP30 244201 2733 chr4 175315934 175324419 175317913,175322328 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FBXO8 110532 2734 chr4 176361023 176363667 176362393 N NA NA NA NA NA NA SPCS3 877423 2735 chr4 180474210 180475399 180475023 N NA NA NA NA NA NA SPCS3 3233120 2736 chr4 182424020 182427715 182426131 N NA NA NA NA NA NA CDKN2AIP 1938074 2737 chr4 182429473 182430340 182430085 N NA NA NA NA NA NA CDKN2AIP 1935449 2738 chr4 184328045 184330946 184328582 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 34843 2739 chr4 184479548 184481627 184480217 N NA NA RWDD4 IMR90 Hi-C 24141950 ING2 53328 2740 chr4 184491961 184494355 184492685 N NA NA RWDD4 IMR90 Hi-C 24141950 ING2 65741 2741 chr4 184508526 184510425 184509493 N NA NA CDKN2AIP,ING2,RWDD4 IMR90 Hi-C 24141950 RWDD4 69906 2742 chr4 184516149 184519105 184517527 N NA NA RWDD4 IMR90 Hi-C 24141950 RWDD4 61226 2743 chr4 185208277 185212413 185209194 N NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 183313 2744 chr4 185408018 185411303 185408857 N NA IRF2 IRF2 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 12292 2745 chr4 185456795 185460405 185458778 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 61069 2746 chr4 185831304 185833689 185832607 N NA NA ENPP6,ACSL1,LOC731424,LOC100506229 IMR90 Hi-C 24141950 MLF1IP 176018 2747 chr4 185903789 185906667 185905253 N NA NA LOC100506229,MLF1IP,ACSL1,SLC25A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 157750 2748 chr4 185908088 185911413 185910269 N NA NA MLF1IP,ACSL1,LOC100506229,SLC25A4,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 153004 2749 chr4 185920101 185928465 185926253 N NA NA LOC100506229 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 135952 2750 chr4 186919571 186921780 186920561 N NA SORBS2 SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 SORBS2 41701 2751 chr4 186941546 186944300 186942769 N NA TLR3 SORBS2,PDLIM3,CCDC110,KIAA1430 IMR90 Hi-C 24141950 TLR3 46009 2752 chr4 186949998 186952339 186951243 N NA TLR3 SORBS2,HELT,TLR3 IMR90 Hi-C 24141950 TLR3 37970 2753 chr4 186971101 186972198 186971745 N NA TLR3 SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 TLR3 18111 2754 chr4 187727452 187729644 187728583 N NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ38576 614808 2755 chr4 188130187 188132248 188131025 N NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ38576 1017543 2756 chr4 188506313 188509039 188508138 N NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ38576 1393669 2757 chr4 189220122 189223026 189221445 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 1171273 2758 chr4 189659600 189663319 189663067 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 730980 2759 chr4 190968667 190972354 190970849 N NA NA NA NA NA NA FRG1 106693 2760 chr4 2020937 2024588 2023647 N NA WHSC2,NAT8L POLN,NAT8L,WHSC2,C4orf48 IMR90 Hi-C 24141950 WHSC2 9975 2761 chr4 26142251 26144785 26143249 N NA NA RBPJ,TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 176547 2762 chr4 26239909 26241548 26240724 N NA NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 79784 2763 chr4 27060463 27063867 27062333 N NA NA NA NA NA NA STIM2 198150 2764 chr4 27102055 27103937 27102827 N NA NA NA NA NA NA STIM2 239742 2765 chr4 27322756 27325307 27323986 N NA NA NA NA NA NA STIM2 460443 2766 chr4 297422 312966 299336 N NA ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 18630 2767 chr4 3287988 3295134 3293936 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 20740 2768 chr4 3538467 3540212 3538866 N NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 4243 2769 chr4 3828923 3830365 3829477 N NA NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 126783 2770 chr4 38319704 38323463 38320502 N NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342327 2771 chr4 38335138 38338189 38336685 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 327601 2772 chr4 38451080 38454789 38452060 N NA NA NA NA NA NA KLF3 211001 2773 chr4 38528910 38533183 38531600 N NA NA FLJ13197,KLF3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF3 132607 2774 chr4 39577 42605 41010 N NA ZNF718 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF718 10672 2775 chr4 40019508 40024054 40022492 N NA N4BP2,LOC344967 NA NA NA NA N4BP2 34470 2776 chr4 40190682 40195345 40192609 N NA NA NA NA NA NA LOC344967 131863 2777 chr4 40323510 40326126 40324955 Y NA NA N4BP2,LOC344967,CHRNA9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC344967 264691 2778 chr4 40396500 40399957 40397686 N NA NA NSUN7,CHRNA9,RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 231926 2779 chr4 40663166 40667148 40665251 N NA RBM47 RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 31283 2780 chr4 40668326 40670127 40668981 N NA RBM47 RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 36443 2781 chr4 41223631 41225532 41224425 N NA APBB2,UCHL1 NA NA NA NA APBB2 6996 2782 chr4 41319432 41324885 41321395 N NA LIMCH1 LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 LIMCH1 37919 2783 chr4 4168094 4169270 4169145 N NA NA NA NA NA NA TMEM128 80664 2784 chr4 42709130 42713683 42711408 N NA NA NA NA NA NA ATP8A1 50008 2785 chr4 45120664 45123951 45122362 N NA NA NA NA NA NA GNPDA2 392052 2786 chr4 45132040 45134260 45133118 N NA NA NA NA NA NA GNPDA2 403428 2787 chr4 45149966 45154816 45151201 N NA NA NA NA NA NA GNPDA2 421354 2788 chr4 46569197 46571870 46569536 N NA NA NA NA NA NA NFXL1 1344763 2789 chr4 4753497 4755837 4754462 N NA NA LYAR,STX18,LOC100507266,MIR378D1 IMR90 Hi-C 24141950 STX18 209722 2790 chr4 48291180 48294570 48291882 N NA SLAIN2 NA NA NA NA SLAIN2 49043 2791 chr4 4852592 4856375 4855318 N NA NA MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 STX18 308817 2792 chr4 48954963 48959035 48956792 N NA OCIAD2,CWH43 OCIAD2,FRYL,OCIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 CWH43 29230 2793 chr4 49276741 49280986 49277492 N NA NA NA NA NA NA CWH43 288476 2794 chr4 5034252 5036490 5035228 Y NA NA STK32B,EVC2 IMR90 Hi-C 24141950 STX18 490477 2795 chr4 54508760 54514396 54511521 N NA NA LNX1,FIP1L1,SCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 51036 2796 chr4 54518409 54521260 54519725 N NA NA LNX1,SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 60685 2797 chr4 54567507 54570366 54568940 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 LNX1 109783 2798 chr4 54956231 54959506 54958088 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 25416 2799 chr4 55228359 55230456 55229413 N NA NA KIT IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 297544 2800 chr4 57738757 57741967 57740655 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2,REST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 REST 32075 2801 chr4 57749980 57755599 57751130 N NA REST REST IMR90 Hi-C 24141950 REST 18443 2802 chr4 5956968 5960047 5958383 N NA NA CRMP1,PPP2R2C,JAKMIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRFAP1 682398 2803 chr4 61241951 61245469 61243948 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 3396842 2804 chr4 65487681 65491169 65489279 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 2920087 2805 chr4 66899403 66902450 66901011 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 1508806 2806 chr4 6747716 6750503 6749236 N NA MRFAP1L1,CNO KIAA0232,LOC100129931,TADA2B,TBC1D14,MRFAP1L1,S100P IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNO 29874 2807 chr4 6752174 6754713 6753350 N NA MRFAP1L1,CNO LOC100129931,TADA2B,KIAA0232,TBC1D14,MRFAP1L1,S100P IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNO 34332 2808 chr4 6761980 6765301 6763607 N NA CNO LOC100129931,TADA2B,KIAA0232,TBC1D14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNO 44138 2809 chr4 68009771 68020877 68018611 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 390379 2810 chr4 68264193 68273960 68267014,68269193 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CENPC1 137296 2811 chr4 68295789 68300634 68300306 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 110622 2812 chr4 69147140 69148365 69147733 N NA NA NA NA NA NA YTHDC1 67459 2813 chr4 69231859 69236202 69234656 N NA YTHDC1 YTHDC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 YTHDC1 16035 2814 chr4 69559128 69560272 69559748 N NA NA NA NA NA NA YTHDC1 343304 2815 chr4 69597381 69623627 69598799,69614772,69610691 Y,N,N UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3;NA;NA NA NA NA NA NA YTHDC1 381557 2816 chr4 69729456 69732336 69730525 N NA NA NA NA NA NA YTHDC1 513632 2817 chr4 69769560 69773457 69771149 N NA NA TMPRSS11E MCF7 ChIA-PET 22265404 YTHDC1 553736 2818 chr4 7150547 7152923 7151780 N NA FLJ36777 SORCS2,AFAP1-AS1,AFAP1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ36777 45444 2819 chr4 73840465 73842649 73840624 N NA NA ADAMTS3 IMR90 Hi-C 24141950 COX18 92823 2820 chr4 74171761 74186778 74172343 N NA ANKRD17 RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD17 47259 2821 chr4 74531097 74532830 74531189 N NA RASSF6 CXCL2,RASSF6,IL8,CXCL3,CXCL5,PPBP,CXCL1 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 44757 2822 chr4 74541424 74544282 74542451 N NA NA CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,PF4 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 55084 2823 chr4 74547515 74549772 74548829 N NA NA CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,IL8,CXCL1,CXCL6,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 61175 2824 chr4 74757831 74762814 74758485,74761379 N,N NA;NA NA RASSF6,IL8,CXCL6,PF4V1,PF4,PPBP,CXCL5,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 271491 2825 chr4 74763626 74766417 74765252 Y IL8,CXCL6,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1 NA RASSF6,IL8,CXCL6,PF4V1,PF4,PPBP,CXCL5,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 277286 2826 chr4 75642389 75646570 75642611 N NA NA EREG IMR90 Hi-C 24141950 BTC 73312 2827 chr4 76230124 76233231 76231899 N NA NA PARM1 IMR90 Hi-C 24141950 RCHY1 206409 2828 chr4 77331174 77344530 77336637,77342565 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM47E 195981 2829 chr4 77752709 77754954 77753378 N NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 64048 2830 chr4 78066002 78069947 78067903 Y CCNI,CCNG2 CCNG2 CCNI MCF7 ChIA-PET 22265404 CCNG2 8410 2831 chr4 80518606 80521272 80520073 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 473205 2832 chr4 80571284 80576108 80573610,80572350 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANTXR2 418369 2833 chr4 80733250 80737218 80735575 N NA NA NA NA NA NA ANTXR2 257259 2834 chr4 8175941 8179706 8176850 N NA SH3TC1 ABLIM2,SH3TC1,ACOX3 IMR90 Hi-C 24141950 SH3TC1 21354 2835 chr4 8195541 8197703 8196211 N NA SH3TC1 SH3TC1 K562 ChIA-PET 22265404 SH3TC1 3357 2836 chr4 82298777 82300168 82299801 N NA NA BMP3 IMR90 Hi-C 24141950 RASGEF1B 92893 2837 chr4 8503971 8506762 8506143 N NA NA METTL19,GPR78 IMR90 Hi-C 24141950 ACOX3 61519 2838 chr4 8534761 8539880 8536147,8538982 N,N NA;NA NA GPR78 IMR90 Hi-C 24141950 ACOX3 92309 2839 chr4 88329205 88332277 88331169 N NA HSD17B11,NUDT9 NUDT9 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT9 11451 2840 chr4 88666988 88668551 88667832 N NA NA NA NA NA NA HSP90AB3P 144444 2841 chr4 89235872 89255716 89241347 N NA PPM1K HERC6 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1K 29984 2842 chr4 89458697 89467469 89460690 N NA HERC3 HERC3,FAM13A,NAP1L5,FAM13A-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 HERC3 46178 2843 chr4 9043521 9044727 9043680 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 601069 2844 chr4 9102727 9108167 9104437 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 660275 2845 chr4 9147859 9154538 9153510 N NA NA NA NA NA NA ACOX3 705407 2846 chr4 94810762 94813701 94812150 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 315058 2847 chr4 95067610 95070660 95069162 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 58099 2848 chr4 95330949 95333615 95332003 N NA NA PDLIM5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMARCAD1 202190 2849 chr4 95349423 95351430 95350389 N NA NA PDLIM5 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCAD1 220664 2850 chr4 9691090 9703016 9692626,9693467 N,N NA;NA NA NA NA NA NA WDR1 415557 2851 chr4 9733301 9735371 9733941 N NA NA NA NA NA NA WDR1 383202 2852 chr4 97445153 97446196 97445773 N NA NA NA NA NA NA BMPR1B 1766025 2853 chr4 9751324 9754260 9752736 N NA NA NA NA NA NA WDR1 364313 2854 chr4 99692517 99695173 99693454 N NA NA TSPAN5,RAP1GDS1 IMR90 Hi-C 24141950 METAP1 221615 2855 chr5 1003139 1005407 1004533 N NA NA NA NA NA NA SLC12A7 106765 2856 chr5 101117986 101120560 101119170 N NA NA NA NA NA NA GIN1 1335282 2857 chr5 102088931 102098470 102093826,102090542 N,N NA;NA NA PAM,PPIP5K2 IMR90 Hi-C 24141950 GIN1 357372 2858 chr5 102662630 102665398 102664202 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 68188 2859 chr5 102763133 102765850 102764321 N NA NA C5orf30 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf30 168691 2860 chr5 102779140 102782210 102780375 N NA NA C5orf30 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C5orf30 184698 2861 chr5 10536367 10541146 10539109 N NA NA ROPN1L,MARCH6,ANKRD33B,DAP IMR90 Hi-C 24141950 DAP 220241 2862 chr5 105593910 105596659 105595309 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 2999468 2863 chr5 108790190 108792221 108791152 N NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 44515 2864 chr5 108988428 108993710 108990050 N NA NA NA NA NA NA PJA2 242753 2865 chr5 111928627 111931661 111929933 N NA NA NA NA NA NA SRP19 265224 2866 chr5 113284575 113289961 113286865,113288655 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KCNN2 408055 2867 chr5 113324487 113326915 113325896 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 371101 2868 chr5 113454261 113457209 113455873 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 240807 2869 chr5 113482408 113485912 113484142 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 212104 2870 chr5 113652207 113678412 113653622,113668358 N,N NA;NA KCNN2 KCNN2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNN2 19604 2871 chr5 113900159 113903508 113901726 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 202143 2872 chr5 114036109 114040353 114038490 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 338093 2873 chr5 114104086 114106746 114105256 N NA NA NA NA NA NA KCNN2 406070 2874 chr5 114283060 114286862 114284850 N NA NA NA NA NA NA TRIM36 229381 2875 chr5 114682161 114683385 114682690 N NA NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 PGGT1B 83592 2876 chr5 117215177 117217998 117216664 N NA NA NA NA NA NA DMXL1 1189086 2877 chr5 117864582 117869275 117865696,117867186 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DMXL1 537809 2878 chr5 117972439 117979575 117974086 N NA NA NA NA NA NA DMXL1 427509 2879 chr5 118370763 118375504 118372649,118373416 N,N NA;NA DMXL1 TNFAIP8,DMXL1 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL1 31580 2880 chr5 118387785 118400723 118399871 N NA DMXL1 DMXL1,TNFAIP8,DTWD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMXL1 6361 2881 chr5 1185488 1187099 1186135 N NA NA LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13,SLC6A3,LPCAT1,LOC728613 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 73316 2882 chr5 119285585 119288658 119287200 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 497447 2883 chr5 119333643 119337185 119334878 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 545505 2884 chr5 119342185 119345998 119343542 N NA NA NA NA NA NA HSD17B4 554047 2885 chr5 119793164 119794895 119793961 N NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B4 1005026 2886 chr5 12109463 12113137 12110630 N NA NA NA NA NA NA DAP 1348076 2887 chr5 123596720 123600611 123598988 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 480194 2888 chr5 123687865 123690058 123688930 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 390747 2889 chr5 124222472 124226193 124224385 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 141667 2890 chr5 124240761 124246353 124242324,124244466 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 159956 2891 chr5 124257618 124259741 124258588 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 176813 2892 chr5 124313600 124319302 124315069,124317692 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF608 232795 2893 chr5 124331933 124335248 124333363 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 251128 2894 chr5 124346039 124350487 124348601 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 265234 2895 chr5 124531430 124533291 124532412 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 450625 2896 chr5 125337090 125339458 125338114 N NA NA NA NA NA NA ALDH7A1 591624 2897 chr5 125687709 125692424 125689997 N NA NA GRAMD3,ALDH7A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH7A1 238658 2898 chr5 125854226 125857528 125855892 N NA NA GRAMD3 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH7A1 73554 2899 chr5 126532441 126537999 126533355 N NA NA NA NA NA NA C5orf63 123257 2900 chr5 126563460 126581965 126565316 N NA NA MEGF10,LMNB1,C5orf63 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf63 154276 2901 chr5 127090230 127092936 127092004 N NA NA FLJ33630,SLC12A2 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC1 236921 2902 chr5 127161862 127165120 127163271 N NA NA SLC12A2 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ33630 253646 2903 chr5 127220099 127222309 127221052 N NA NA SLC12A2,FLJ33630 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ33630 196457 2904 chr5 127881826 127884064 127882616 N NA NA NA NA NA NA SLC12A2 462343 2905 chr5 130231717 130234771 130233424 N NA NA NA NA NA NA HINT1 266263 2906 chr5 132505759 132508100 132506408 N NA NA NA NA NA NA HSPA4 118097 2907 chr5 133261312 133264491 133262878 N NA C5orf15 FSTL4 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf15 39915 2908 chr5 133388867 133391139 133389768 N NA VDAC1 TCF7 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 48043 2909 chr5 133771691 133774386 133772891 N NA CDKN2AIPNL SKP1,CDKL3,UBE2B,CDKN2AIPNL,SAR1B,PHF15,SEC24A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 24093 2910 chr5 133800521 133803829 133801908 N NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 52923 2911 chr5 134461336 134471308 134462584 N NA NA PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 91372 2912 chr5 134503626 134527237 134504460,134524077 N,N NA;NA NA PITX1,H2AFY,PCBD2,CATSPER3,LOC340073,TXNDC15 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 133662 2913 chr5 134823384 134826118 134824633 Y NA NA NA NA NA NA PITX1 453420 2914 chr5 134843833 134845403 134844582 N NA NA NA NA NA NA PITX1 473869 2915 chr5 1363802 1365988 1364542 N NA NA NA NA NA NA SDHAP3 228658 2916 chr5 136847901 136852544 136849097,136851674 N,N NA;NA SPOCK1 SPOCK1 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 12883 2917 chr5 136856382 136860478 136858205 N NA SPOCK1 SPOCK1 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 21364 2918 chr5 137943756 137947108 137945430 N NA HSPA9 CTNNA1,SIL1,PAIP2,SLC23A1,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA9 32438 2919 chr5 138051470 138057618 138052528 N NA CTNNA1 CTNNA1,MATR3,SIL1,HSPA9,LRRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNA1 31489 2920 chr5 138060162 138062778 138061102 N NA CTNNA1 CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2,HSPA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNA1 26329 2921 chr5 138896124 138899564 138897668 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 41187 2922 chr5 13986098 14013752 14011328,14010224 Y,N NA;NA DNAH5 TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 41509 2923 chr5 14015862 14017894 14016784 N NA NA TRIO IMR90 Hi-C 24141950 DNAH5 71273 2924 chr5 140418542 140421104 140419913 N NA NA PCDHA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 53133 2925 chr5 140463877 140466925 140464379 N NA PCDHB2,PCDHB3,PCDHB4,PCDHB5 PCDHB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 7312 2926 chr5 141089468 141092851 141091205 N NA ARAP3 RNF14,PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,KIAA0141,PCDH12 IMR90 Hi-C 24141950 ARAP3 27668 2927 chr5 14130519 14135619 14132562 N NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 8210 2928 chr5 141403286 141406120 141404715 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 10666 2929 chr5 141570654 141573949 141571853 N NA NA NDFIP1,FGF1,GNPDA1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 178034 2930 chr5 141599961 141602722 141600957 N NA NA FGF1,SPRY4,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 207341 2931 chr5 141627448 141631611 141628691 N NA NA FGF1,NDFIP1,SPRY4,GNPDA1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 234828 2932 chr5 141734988 141739689 141736391 Y ARHGAP26 NA NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 342368 2933 chr5 141766049 141768309 141766697 N NA NA SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 373429 2934 chr5 141787772 141790553 141788872 N NA NA SPRY4,FGF1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 359739 2935 chr5 141886968 141888820 141887808 N NA NA SPRY4,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 261472 2936 chr5 141930064 141932368 141931199 N NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP26 217924 2937 chr5 142091867 142093556 142092995 N NA NA GNPDA1,NDFIP1,SPRY4,FGF1,ARHGAP26,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 56736 2938 chr5 142131690 142135106 142133034 N NA ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 15186 2939 chr5 143407814 143408092 143407942 N NA NA NR3C1,YIPF5,KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 142186 2940 chr5 143490467 143495880 143494458 N NA NA ARHGAP26,HMHB1,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 54398 2941 chr5 145807324 145810214 145808369 Y POU4F3 NA LARS IMR90 Hi-C 24141950 RBM27 224161 2942 chr5 14639020 14640908 14639694 Y NA FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 FAM105B 23875 2943 chr5 147215029 147219542 147217745 N NA NA JAKMIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SPINK5 223993 2944 chr5 147326218 147401442 147326720 N NA SPINK5 NA NA NA NA SPINK5 42093 2945 chr5 148186597 148194834 148188167,148193008 N,N NA;NA ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 11322 2946 chr5 148283174 148286647 148285322,148284106 N,N NA;NA NA AFAP1L1,SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 77018 2947 chr5 148287577 148290224 148289079 N NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 81421 2948 chr5 148504163 148511493 148508852,148505224 Y,N NA;NA ABLIM3 ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2,PCYOX1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABLIM3 9561 2949 chr5 148844810 148853276 148851384 N NA NA CSNK1A1,PCYOX1L,IL17B,MIR143HG,ARHGEF37 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1A1 77731 2950 chr5 14976409 14979101 14977586 N NA NA ANKH,FAM105B,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 104522 2951 chr5 14982931 14985523 14983969 N NA NA ANKH,FAM105B,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 111044 2952 chr5 149832863 149835251 149833689 N NA RPS14 NDST1,MYOZ3,SYNPO IMR90 Hi-C 24141950 RPS14 3544 2953 chr5 15008205 15011164 15009714 N NA NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 136318 2954 chr5 150792789 150797925 150794292 N NA SLC36A1 FAT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A1 29238 2955 chr5 150804897 150808203 150806273 N NA SLC36A1 FAT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A1 18960 2956 chr5 151597048 151599747 151598411 N NA NA NA NA NA NA G3BP1 445572 2957 chr5 153497382 153500937 153498618 N NA NA GALNT10,FLJ38109,MFAP3 IMR90 Hi-C 24141950 MFAP3 78863 2958 chr5 15355654 15360988 15356869 N NA NA FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 483767 2959 chr5 15482503 15485150 15483918 N NA NA FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 610616 2960 chr5 155213537 155235975 155214651 N NA NA PPP1R2P3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL22 892904 2961 chr5 155416020 155418902 155417131 N NA NA SGCD IMR90 Hi-C 24141950 MRPL22 1095387 2962 chr5 155581458 155584318 155582899 N NA NA SGCD IMR90 Hi-C 24141950 MED7 985603 2963 chr5 156397576 156400816 156399412 N NA NA NA NA NA NA MED7 169105 2964 chr5 157339032 157342079 157340091 N NA NA CLINT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLINT1 52849 2965 chr5 158546578 158549972 158547417 N NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF145 87089 2966 chr5 158969317 158972248 158971818 N NA NA ADRA1B,LOC285627 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 279228 2967 chr5 160295701 160299131 160297387 N NA NA NA NA NA NA PTTG1 446836 2968 chr5 16333402 16338079 16335552 N NA NA NA NA NA NA ZNF622 127815 2969 chr5 164025419 164029570 164025542 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 1138276 2970 chr5 165049355 165051599 165050431 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 2162212 2971 chr5 165057357 165059206 165057918 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 2170214 2972 chr5 165207794 165210575 165209298 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 2320651 2973 chr5 165211984 165219125 165213648 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 2324841 2974 chr5 165302531 165308163 165303622 N NA NA NA NA NA NA NUDCD2 2415388 2975 chr5 165488607 165490777 165489902 N NA NA NA NA NA NA RARS 2422686 2976 chr5 165501092 165503472 165501936 N NA NA NA NA NA NA RARS 2409991 2977 chr5 165957306 165958001 165957447 N NA NA NA NA NA NA RARS 1955462 2978 chr5 166178096 166180012 166178232 N NA NA NA NA NA NA RARS 1733451 2979 chr5 167714410 167716993 167715413 N NA NA NA NA NA NA RARS 196470 2980 chr5 170762402 170764790 170763889 Y NA NPM1 KCNIP1,GABRP,RANBP17 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 49918 2981 chr5 17077010 17080731 17078150 N NA NA MYO10,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 MYO10 140625 2982 chr5 170937392 170938861 170937916 N NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 122684 2983 chr5 171958620 171963119 171960272 N NA NA NEURL1B,ATP6V0E1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 235084 2984 chr5 171973543 171977433 171975465 N NA NA NEURL1B,NKX2-5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 220770 2985 chr5 171979797 171994479 171981136,171982959,171986293,171992071 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NEURL1B,NKX2-5,RPL26L1,LOC100268168,ERGIC1,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 203724 2986 chr5 172664896 172666110 172665573 N NA NA NA NA NA NA STC2 90396 2987 chr5 172846556 172848627 172847281 N NA NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 90050 2988 chr5 173115382 173118851 173116434 N NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 71716 2989 chr5 173191820 173197238 173194313 N NA NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 118093 2990 chr5 173294195 173296849 173295300 N NA CPEB4 CPEB4,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 18482 2991 chr5 173298193 173300576 173299428 N NA CPEB4 CPEB4,BOD1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CPEB4 14755 2992 chr5 173733151 173740541 173738852 N NA NA BOD1,HMP19 IMR90 Hi-C 24141950 HMP19 260427 2993 chr5 173886912 173890846 173888656 N NA NA MIR4634,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 HMP19 414188 2994 chr5 173915061 173922933 173915877,173920006 N,N NA;NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 HMP19 442337 2995 chr5 173929537 173957664 173931119,173949861 N,N NA;NA NA MSX2,MIR4634,FLJ16171 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMP19 456813 2996 chr5 173988285 173989636 173989139 N NA NA MIR4634,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 HMP19 515561 2997 chr5 174804129 174807290 174805641 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 CPLX2 416320 2998 chr5 176152254 176163748 176152793 N NA NA UNC5A,UIMC1,HK3 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN17 77866 2999 chr5 176168768 176187850 176170291 N NA NA UIMC1,HK3,UNC5A,EIF4E1B,ZNF346,CDHR2 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN17 94380 3000 chr5 177001964 177007271 177003171 N NA FAM193B,TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA TMED9 11942 3001 chr5 1771225 1774848 1772823 N NA MRPL36,NDUFS6 NDUFS6,IRX4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL36 25108 3002 chr5 177349802 177387961 177375194,177352059,177366489 N,N,N NA;NA;NA LOC728554 N4BP3,NHP2,RMND5B IMR90 Hi-C 24141950 LOC728554 47540 3003 chr5 178941152 178948169 178946906 N NA RUFY1 ADAMTS2,COL23A1,AGXT2L2 IMR90 Hi-C 24141950 RUFY1 29393 3004 chr5 180291935 180299160 180293520,180296442 N,N NA;NA LOC100859930,ZFP62 ZFP62,MGAT1,BTNL9,TRIM7,LOC729678,LOC100859930,BTNL8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP62 3649 3005 chr5 180523866 180524892 180524302 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 125371 3006 chr5 180528472 180529803 180529074 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120460 3007 chr5 180537182 180540525 180538882 N NA NA BTNL8,MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 109738 3008 chr5 180541876 180543423 180542524 N NA NA BTNL8,MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 106840 3009 chr5 180885608 180905225 180887845,180891158 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TRIM52 197489 3010 chr5 18739032 18747362 18746079 N NA NA NA NA NA NA MYO10 1802647 3011 chr5 20301197 20305445 20301379 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1154144 3012 chr5 21339411 21341880 21341041 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 117709 3013 chr5 23324101 23325814 23325048 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 1864512 3014 chr5 24370401 24373436 24370728 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 2910812 3015 chr5 24650217 24651705 24650721 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 3190628 3016 chr5 24653523 24657252 24654042 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 3193934 3017 chr5 29466361 29471186 29469843,29467789 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DROSHA 2061096 3018 chr5 29482900 29489514 29485357 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 2042768 3019 chr5 31637440 31692213 31638829,31684874 N,N NA;NA NA PDZD2 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf22 105067 3020 chr5 3187248 3189268 3188085 N NA NA NA NA NA NA IRX4 1304368 3021 chr5 32191682 32195751 32193892 N NA GOLPH3 MTMR12,GOLPH3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GOLPH3 17257 3022 chr5 32329294 32333257 32331708 N NA MTMR12 ZFR,GOLPH3,MTMR12,SUB1 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR12 16180 3023 chr5 3325065 3326847 3325551 N NA NA NA NA NA NA IRX4 1442185 3024 chr5 34135631 34151282 34147765 N NA C1QTNF3-AMACR NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 10998 3025 chr5 34153867 34213461 34178186,34211656 N,N NA;NA C1QTNF3-AMACR C1QTNF3-AMACR,SLC45A2,AMACR,RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 C1QTNF3-AMACR 29234 3026 chr5 34244947 34247416 34246303,34245758 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 120314 3027 chr5 34304677 34305802 34305061 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 180044 3028 chr5 34420721 34424737 34422578 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 296088 3029 chr5 34464518 34469140 34466821 N NA NA AMACR,SLC45A2,C1QTNF3-AMACR,TTC23L,RAI14,BRIX1,RAD1 IMR90 Hi-C 24141950 C1QTNF3-AMACR 339885 3030 chr5 34485949 34490352 34487664,34487674 N,N NA;NA NA TTC23L,RAI14,BRIX1,RAD1,DNAJC21,C1QTNF3-AMACR IMR90 Hi-C 24141950 C1QTNF3-AMACR 361316 3031 chr5 34574718 34578119 34577172 N NA NA RAI14,TTC23L,RAD1 IMR90 Hi-C 24141950 RAD1 337661 3032 chr5 35235665 35239720 35238109 N NA PRLR PRLR IMR90 Hi-C 24141950 PRLR 4842 3033 chr5 36366068 36368441 36367252 N NA NA NA NA NA NA NADKD1 123810 3034 chr5 36743593 36747007 36745237 N NA NA LOC646719,NIPBL MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC646719 129789 3035 chr5 3740734 3742712 3741629 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 1680095 3036 chr5 38612757 38616340 38614436 N NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 56009 3037 chr5 38635776 38638625 38636931 N NA NA LIFR,EGFLAM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 79028 3038 chr5 38658981 38662393 38660618 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 102233 3039 chr5 38690663 38695086 38693129 N NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 133915 3040 chr5 39603038 39610461 39605449 N NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 528537 3041 chr5 39623228 39648787 39624914,39633303,39633445 N,N,N NA;NA;NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 548727 3042 chr5 39655056 39658892 39656835 N NA NA PTGER4,TTC33,PRKAA1 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 580555 3043 chr5 39676480 39680545 39678981 N NA NA TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 601979 3044 chr5 39712308 39715661 39713809 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 637807 3045 chr5 39827995 39829473 39828503 N NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 753494 3046 chr5 39862849 39865370 39864255 N NA NA NA NA NA NA RICTOR 788348 3047 chr5 40305251 40308887 40307304 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 371145 3048 chr5 40375535 40377720 40376519 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 302312 3049 chr5 40645080 40647856 40646421 N NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 32176 3050 chr5 40648779 40651515 40650102 N NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 28517 3051 chr5 40894400 40899205 40896136 N NA NA C6,PLCXD3 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37 59013 3052 chr5 42857287 42860747 42858683 N NA SEPP1 NA NA NA NA SEPP1 45263 3053 chr5 42907491 42909956 42909124 N NA NA LOC648987,LOC153684,LOC100132356 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPP1 95467 3054 chr5 42949452 42951522 42950972 N NA NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 LOC648987 67391 3055 chr5 43105290 43107188 43105708 N NA LOC100132356,ZNF131 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF131 14454 3056 chr5 43566933 43579313 43577615 N NA PAIP1,NNT PAIP1,NNT IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAIP1 9412 3057 chr5 4541220 4544426 4542841 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 878381 3058 chr5 49635794 49644928 49643464 N NA NA NA NA NA NA EMB 92306 3059 chr5 49858874 49861599 49860073 N NA NA NA NA NA NA EMB 121640 3060 chr5 50216116 50222753 50219028 N NA NA NA NA NA NA EMB 478882 3061 chr5 51196 55529 54067,52601 Y,N PLEKHG4B,C5orf55;NA NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 162768 3062 chr5 51785091 51789330 51786901 N NA NA NA NA NA NA ITGA1 294806 3063 chr5 51798261 51799130 51798413 N NA NA NA NA NA NA ITGA1 285006 3064 chr5 52022143 52025734 52023642 N NA NA ITGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA1 58402 3065 chr5 54862835 54871302 54864874,54869677 N,N NA;NA PPAP2A IL6ST,SKIV2L2,PPAP2A,SLC38A9,IL31RA IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2A 31962 3066 chr5 54894917 54900105 54896766 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2A 64044 3067 chr5 55352761 55355879 55354362 N NA NA ANKRD55,MAP3K1,IL6ST IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2A 521888 3068 chr5 55651192 55653800 55652557 N NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 815975 3069 chr5 55716856 55719723 55718091 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPBP1 750052 3070 chr5 55775418 55778157 55777105 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 691618 3071 chr5 55911405 55914085 55912448 N NA NA MAP3K1,SETD9 IMR90,H1ESC,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 GPBP1 555690 3072 chr5 55932100 55938040 55934245,55937059 N,N NA;NA NA MAP3K1 IMR90,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 GPBP1 531735 3073 chr5 56841917 56844973 56843102 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 372142 3074 chr5 57031566 57034647 57033434 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 561791 3075 chr5 57410520 57414980 57412887 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 340986 3076 chr5 57421594 57425563 57423423 N NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 330403 3077 chr5 5768298 5770733 5769336 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 345491 3078 chr5 60893665 60897010 60895337 N NA NA NDUFAF2,ZSWIM6,C5orf64 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf43 435363 3079 chr5 61229479 61232328 61230805 Y NA NA NA NA NA NA KIF2A 369661 3080 chr5 61562612 61565930 61564227 N NA KIF2A KIF2A K562 ChIA-PET 22265404 KIF2A 36059 3081 chr5 62099588 62105083 62100575 N NA NA NA NA NA NA IPO11 391015 3082 chr5 64395893 64400151 64398902 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SREK1IP1 331397 3083 chr5 65655922 65658189 65657074 N NA NA NA NA NA NA SREK1 215837 3084 chr5 66510193 66513751 66511730 Y NA NA MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAST4 618017 3085 chr5 66542891 66548051 66544714 N NA NA PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAST4 650715 3086 chr5 66563443 66565592 66564305 N NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 671267 3087 chr5 66942510 66945094 66944194 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 566490 3088 chr5 67075571 67077013 67076087 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 434571 3089 chr5 67109878 67113151 67111878 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 398433 3090 chr5 67294440 67295886 67294833 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 215698 3091 chr5 67428991 67432379 67430158 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 79205 3092 chr5 67691693 67693297 67692460 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 180109 3093 chr5 67810691 67831798 67829913,67829107 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PIK3R1 299107 3094 chr5 67843967 67846643 67845317 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 332383 3095 chr5 67850009 67851916 67850932 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 338425 3096 chr5 67888069 67890920 67889324 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 376485 3097 chr5 67943519 67946298 67945232 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 431935 3098 chr5 68041545 68044113 68042732 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 345663 3099 chr5 68247437 68250978 68249594 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 138798 3100 chr5 68337639 68340412 68339277 N NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 49364 3101 chr5 6899177 6902438 6900338 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 184459 3102 chr5 69080752 69118867 69085299 N NA NA NA NA NA NA LOC100272216 151724 3103 chr5 69138066 69140395 69139619 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 180677 3104 chr5 69149001 69176681 69150771,69171053 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SERF1A 144391 3105 chr5 69209337 69309852 69273485,69210422,69301766,69260702 N,N,N,N NA;NA;NA;NA SERF1A,SMN2 NA NA NA NA SERF1A 11220 3106 chr5 6927325 6928233 6927551 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 212607 3107 chr5 69694748 69696984 69696325 N NA GTF2H2B NA NA NA NA GTF2H2B 14213 3108 chr5 69698301 69699656 69699076 N NA GTF2H2B NA NA NA NA GTF2H2B 11541 3109 chr5 70013199 70015411 70014710 N NA NA NA NA NA NA SMA5 131650 3110 chr5 70015986 70017932 70016817 N NA NA NA NA NA NA SMA5 134437 3111 chr5 70045697 70053856 70046955 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 142634 3112 chr5 70084101 70185862 70148570,70085458 N,N NA;NA SERF1A,SMN2 NA NA NA NA SERF1A 10628 3113 chr5 70422675 70438446 70436557 N NA NA NA NA NA NA GTF2H2 59178 3114 chr5 70583441 70588141 70584556,70586531 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BDP1 163301 3115 chr5 7070298 7072988 7071331 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 355580 3116 chr5 7094784 7099202 7097476 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 380066 3117 chr5 70982575 70986600 70984861 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 99460 3118 chr5 70987663 70991837 70989973 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 104548 3119 chr5 70993858 70997524 70995796 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 110743 3120 chr5 71042048 71053902 71044442,71048519,71053751 N,N,N NA;NA;NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 158933 3121 chr5 71219153 71223258 71221282 N NA NA NA NA NA NA MCCC2 336038 3122 chr5 7176739 7180818 7179363 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 462021 3123 chr5 7181996 7192650 7191067 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 467278 3124 chr5 7199419 7210745 7209275 N NA NA NA NA NA NA PAPD7 484701 3125 chr5 72453054 72455363 72454374 N NA NA FCHO2,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FCHO2 201246 3126 chr5 72509088 72519441 72512231,72518239 N,N NA;NA NA FOXD1,FCHO2,TMEM174,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 224911 3127 chr5 72558056 72579794 72578181 N NA NA FCHO2,FOXD1,TMEM171 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 164558 3128 chr5 72632674 72636248 72634315 N NA NA FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3,TMEM171 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 108104 3129 chr5 73285214 73287835 73286373 N NA NA HEXB,ENC1,RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ANKRA2 423703 3130 chr5 73293207 73296671 73294868 N NA NA ENC1,RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ANKRA2 431696 3131 chr5 73771308 73773900 73772860 N NA NA RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 163349 3132 chr5 73784745 73800436 73795458,73798625 N,Y NA;NA NA RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 136813 3133 chr5 73861776 73864388 73863456 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 72861 3134 chr5 7389882 7393874 7392459 N NA NA NA NA NA NA C5orf49 457729 3135 chr5 75674857 75676579 75675380 N NA NA IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 438254 3136 chr5 75680994 75685895 75683319 N NA NA NA NA NA NA F2RL1 428938 3137 chr5 764543 771913 770045 N NA NA ZDHHC11,SLC9A3,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC11 79188 3138 chr5 77147235 77149043 77148144 N NA NA TBCA IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 75050 3139 chr5 79564277 79566438 79564921 N NA SERINC5 THBS4,SERINC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERINC5 12379 3140 chr5 79654113 79656592 79655280 N NA ZFYVE16 CMYA5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFYVE16 47246 3141 chr5 81073926 81075775 81075065 N NA NA SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 ATG10 192069 3142 chr5 81137519 81140373 81138876 N NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATG10 127471 3143 chr5 81145742 81150427 81147800 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATG10 117417 3144 chr5 86846327 86851092 86847973 N NA NA NA NA NA NA CCNH 137477 3145 chr5 89368921 89373791 89369366 N NA NA NA NA NA NA CETN3 331812 3146 chr5 90513863 90515984 90515256 N NA NA LOC100129716,ARRDC3,GPR98 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 160180 3147 chr5 90527361 90529469 90528214 N NA NA LOC100129716,ARRDC3,GPR98 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 146695 3148 chr5 90574947 90578525 90576116 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100129716 97639 3149 chr5 92682379 92683722 92683672 N NA NA FLJ42709,NR2F1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM172A 763682 3150 chr5 94652414 94654755 94653754 N NA NA MCTP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC37 235954 3151 chr5 95168683 95173569 95170646 N NA GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 10106 3152 chr5 95322750 95343404 95324586,95333233,95330790 N,N,N NA;NA;NA ELL2 ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 24975 3153 chr5 95491357 95496066 95493389,95494866 N,N NA;NA NA ELL2,GLRX,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 193582 3154 chr5 95534488 95537783 95535620 N NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 236713 3155 chr5 95581947 95585004 95583151 N NA NA ELL2,C5orf27 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 284172 3156 chr5 95665399 95671344 95668095 N NA NA ELL2,C5orf27,MIR583,RHOBTB3,GLRX,CAST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAST 326397 3157 chr5 95672710 95684817 95674508 N NA NA ELL2,C5orf27,MIR583,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 312924 3158 chr5 95962793 95964688 95963577 N NA CAST CAST,ELL2,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAST 33053 3159 chr5 97912195 97914744 97913375 N NA NA NA NA NA NA RGMB 190255 3160 chr5 98367685 98370275 98368941 N NA NA LOC100289230,CHD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC100289230 102847 3161 chr5 98870500 98872664 98871377 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 605662 3162 chr5 99381554 99390555 99382106,99389490 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100289230 1116716 3163 chr5 99982402 99984850 99983544 N NA NA NA NA NA NA LOC100289230 1717564 3164 chr6 100035772 100038530 100037072 N NA CCNC PRDM13 IMR90 Hi-C 24141950 CCNC 19082 3165 chr6 100088043 100092263 100089829 N NA NA NA NA NA NA CCNC 71353 3166 chr6 100239785 100243042 100241368 N NA NA NA NA NA NA CCNC 223095 3167 chr6 100675639 100678523 100676984 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 650701 3168 chr6 100801338 100804522 100802821 N NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 524702 3169 chr6 10098308 10101114 10099436 N NA NA LOC100506207 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130275 311437 3170 chr6 105389542 105402402 105390644 N NA NA NA NA NA NA POPDC3 225456 3171 chr6 105999507 106002969 106001283 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 148508 3172 chr6 106040046 106043822 106042035 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 189047 3173 chr6 106300790 106301787 106301138 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 232408 3174 chr6 106438891 106441227 106440119 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 92968 3175 chr6 106806802 106849750 106808513,106825003,106809893 N,N,N NA;NA;NA ATG5 AIM1,RTN4IP1 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 33107 3176 chr6 108453664 108456408 108455017 N NA NA LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX3 126056 3177 chr6 109059025 109063307 109060672 N NA NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXO3 177999 3178 chr6 109117818 109122237 109119690 N NA NA FOXO3,LINC00222,ARMC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXO3 236792 3179 chr6 109575791 109578894 109577489 N NA NA CD164,CEP57L1,PPIL6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CD164 124868 3180 chr6 109656161 109659263 109658052 N NA CD164 CD164,PPIL6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD164 44499 3181 chr6 110360331 110362408 110361185 N NA NA FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24 IMR90 Hi-C 24141950 WASF1 138799 3182 chr6 110836051 110841117 110837807,110838499 N,N NA;NA NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDK19 295295 3183 chr6 110843717 110860164 110845617,110849854,110849994,110856043 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19,SLC16A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDK19 276248 3184 chr6 110861840 110867205 110864531 Y CDK19 NA GTF3C6,AMD1,RPF2,CDK19,SLC16A10 IMR90 Hi-C 24141950 CDK19 269207 3185 chr6 110874086 110878531 110874263,110876260 N,Y NA;CDK19 NA CDK19,RPF2 IMR90 Hi-C 24141950 CDK19 257881 3186 chr6 111169320 111188568 111170153 N NA CDK19,AMD1 CDK19,AMD1,GTF3C6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMD1 7419 3187 chr6 111272602 111276017 111273735 N NA GTF3C6,RPF2 CDK19,SLC22A16,AMD1,GTF3C6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF3C6 3746 3188 chr6 111389016 111393494 111389821,111392012 N,N NA;NA SLC16A10 NA NA NA NA SLC16A10 15287 3189 chr6 112363292 112365591 112364695 N NA C6orf225 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 C6orf225 43083 3190 chr6 113494458 113495891 113495153 N NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 682636 3191 chr6 11390059 11395653 11393395 Y NEDD9 NA NEDD9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C6orf228 295793 3192 chr6 113916854 113918997 113917834 N NA NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 259530 3193 chr6 113962878 113965944 113964321 N NA NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCKS 212583 3194 chr6 114315903 114320511 114316697 N NA HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 23544 3195 chr6 117274443 117278018 117276325 N NA NA NA NA NA NA RFX6 76067 3196 chr6 117939412 117940741 117940081 N NA GOPC ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 GOPC 15707 3197 chr6 121360743 121367290 121365052 N NA NA MAN1A1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 1353406 3198 chr6 122001071 122001659 122001533 N NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 719037 3199 chr6 123090606 123094555 123092363 N NA SMPDL3A SMPDL3A MCF7 ChIA-PET 22265404 SMPDL3A 15416 3200 chr6 12342866 12344990 12344055 N NA NA TMEM170B,HIVEP1,EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf228 1248600 3201 chr6 131688647 131691319 131689867 N NA NA NA NA NA NA MED23 258044 3202 chr6 131799116 131801761 131800266 N NA NA NA NA NA NA MED23 147602 3203 chr6 132590574 132594171 132592326 N NA NA STX7,CTGF,ENPP1 IMR90,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 STX7 240166 3204 chr6 134702294 134704944 134703201 N NA NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A12 328505 3205 chr6 134720798 134724354 134722246 N NA NA ALDH8A1,SGK1,LOC154092 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A12 347009 3206 chr6 134941567 134944407 134943209 Y NA NA LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 431629 3207 chr6 135174198 135175924 135175213 N NA NA SGK1,LOC154092,TBPL1,HMGA1P7,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 200112 3208 chr6 135382140 135385722 135384083 N NA HBS1L AHI1,HBS1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HBS1L 6104 3209 chr6 13732508 13735109 13733720 N NA NA RANBP9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOL7 116949 3210 chr6 137561755 137564670 137563013 N NA IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 21188 3211 chr6 137597848 137600305 137599380 N NA NA IL20RA,IFNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 IFNGR1 57281 3212 chr6 137890521 137893901 137892133 N NA NA IL22RA2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 294680 3213 chr6 138095744 138100294 138098128 N NA NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 88287 3214 chr6 138124435 138127779 138126007 N NA NA TNFAIP3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP3 60802 3215 chr6 138131469 138134408 138132708 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3,PERP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 54173 3216 chr6 138139715 138149098 138141617,138145624 N,N NA;NA TNFAIP3 TNFAIP3,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 39483 3217 chr6 13844200 13845734 13844961 N NA NA NA NA NA NA NOL7 228641 3218 chr6 138697752 138702392 138699426 N NA NA KIAA1244,PBOV1,PERP,HEBP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1244 214699 3219 chr6 13872565 13876012 13874087 N NA NA DTNBP1,CCDC90A,CD83 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOL7 257006 3220 chr6 139335575 139338017 139336285 N NA REPS1 REPS1,ECT2L,C6orf115 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 REPS1 26177 3221 chr6 139669729 139671844 139670769 N NA CITED2 ECT2L IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 23941 3222 chr6 139723548 139726165 139724787 N NA CITED2 CITED2,TXLNB,LOC645434,LOC100132735 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 27763 3223 chr6 139856868 139860145 139858462 N NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161083 3224 chr6 139907889 139911963 139909396 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 212104 3225 chr6 140782740 140786036 140784221 N NA NA NA NA NA NA CITED2 1086955 3226 chr6 143016643 143019374 143017739 N NA NA AIG1,ADAT2,LOC100507489,HIVEP2,LOC153910,PEX3 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP2 246964 3227 chr6 144535911 144538867 144537741 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 UTRN 74006 3228 chr6 144559244 144602132 144601934 N NA UTRN PLAGL1,UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 10741 3229 chr6 148058676 148218894 148058851 N NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SAMD5 228848 3230 chr6 148453384 148480726 148456097 N NA NA SAMD5,STXBP5,SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 183003 3231 chr6 149460008 149463991 149461880 Y ZC3H12D,TAB2,PPIL4 NA NA NA NA NA TAB2 175445 3232 chr6 149486897 149489564 149487991 N NA NA TAB2,UST,SASH1,ZC3H12D IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 149872 3233 chr6 150799660 150801471 150800437 N NA NA PLEKHG1 IMR90 Hi-C 24141950 PCMT1 728829 3234 chr6 151529380 151532300 151530566 N NA AKAP12 MTHFD1L,AKAP12 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP12 28834 3235 chr6 153471373 153473083 153472065 N NA RGS17 NA NA NA NA RGS17 18984 3236 chr6 1553300 1556581 1555480 N NA NA MYLK4,LOC100508120,EXOC2,GMDS IMR90 Hi-C 24141950 GMDS 689287 3237 chr6 156013996 156016704 156015407 N NA NA NA NA NA NA SCAF8 959484 3238 chr6 156877343 156880472 156878881 N NA NA ARID1B IMR90 Hi-C 24141950 ARID1B 218592 3239 chr6 157006520 157010888 157008141 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88176 3240 chr6 157039786 157043001 157041265 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 56063 3241 chr6 157612332 157615770 157614756 N NA NA NA NA NA NA TMEM242 129483 3242 chr6 157619623 157640821 157639439 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 104432 3243 chr6 158173128 158174783 158173783 N NA NA SNX9,ZDHHC14,SYNJ2,TMEM242 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2H5 414596 3244 chr6 158177042 158179242 158177942 N NA NA SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2H5 410137 3245 chr6 158653455 158660553 158653848,158658961 N,N NA;NA NA TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2H5 64076 3246 chr6 158662479 158729856 158663335 N NA TULP4 TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3,GTF2H5 IMR90 Hi-C 24141950 TULP4 3836 3247 chr6 159289013 159292740 159290813 N NA EZR OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZR 48557 3248 chr6 160600863 160604440 160602122 N NA NA NA NA NA NA SLC22A1 58000 3249 chr6 166586152 166587647 166586961 N NA NA NA NA NA NA PRR18 134224 3250 chr6 167638575 167640613 167639797 N NA NA NA NA NA NA RNASET2 268498 3251 chr6 167865893 167869421 167867745 N NA NA NA NA NA NA MLLT4-AS1 358055 3252 chr6 167902202 167905926 167904072 N NA NA NA NA NA NA MLLT4-AS1 321550 3253 chr6 167906960 167910711 167908026 N NA NA NA NA NA NA MLLT4-AS1 316765 3254 chr6 168150765 168154246 168151869 N NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4-AS1 73230 3255 chr6 168555802 168560542 168558988 N NA NA NA NA NA NA MLLT4 328131 3256 chr6 168561880 168565213 168563252 N NA NA NA NA NA NA MLLT4 334209 3257 chr6 168595864 168605807 168597253 N NA NA CCR6,SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 368193 3258 chr6 168616290 168618511 168617225 N NA NA CCR6 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 388619 3259 chr6 168645879 168649979 168648492 N NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 418208 3260 chr6 168661325 168664610 168662966 N NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 433654 3261 chr6 168673415 168676748 168675258 N NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 445744 3262 chr6 168722795 168724896 168723836 N NA NA NA NA NA NA MLLT4 495124 3263 chr6 168768970 168779021 168771435 N NA NA FGFR1OP IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 541299 3264 chr6 168788289 168791047 168789671 Y NA NA CCR6,SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 560618 3265 chr6 169176957 169191320 169178658,169183106,169186357 N,N,N NA;NA;NA NA CCR6,SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 910839 3266 chr6 169226612 169228672 169227623 N NA NA NA NA NA NA WDR27 873487 3267 chr6 169233263 169236606 169234327 N NA NA NA NA NA NA WDR27 865553 3268 chr6 169276434 169279525 169278204 Y NA NA WDR27,LINC00574 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 822634 3269 chr6 169294086 169296818 169295689 N NA NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 805341 3270 chr6 169573957 169577800 169575144 N NA NA THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 524359 3271 chr6 170231829 170237106 170232405 N NA NA FAM120B,LOC154449,PSMB1,LINC00574,DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf70 80108 3272 chr6 170345162 170347827 170346509 N NA NA SMOC2,LOC154449,DLL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf70 193441 3273 chr6 17042302 17044195 17043025 N NA NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 280581 3274 chr6 170429665 170432841 170430870 N NA NA NA NA NA NA DLL1 166856 3275 chr6 170491344 170500746 170492230,170494457 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DLL1 98951 3276 chr6 170532000 170533673 170532809 N NA NA LOC154449,DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 66024 3277 chr6 171041141 171046415 171043365 N NA NA NA NA NA NA TBP 177720 3278 chr6 19891463 19894339 19892686 N NA NA NA NA NA NA ID4 53862 3279 chr6 20067506 20070423 20069578 N NA NA NA NA NA NA MBOAT1 142247 3280 chr6 20290174 20296573 20292078 N NA NA E2F3,MBOAT1,CDKAL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBOAT1 77504 3281 chr6 21450608 21455554 21451820 N NA NA CDKAL1 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 138418 3282 chr6 21461169 21468344 21462456 N NA NA NA NA NA NA SOX4 125628 3283 chr6 21478490 21481891 21479658 N NA NA NA NA NA NA SOX4 112081 3284 chr6 22361512 22365823 22363391 N NA NA SOX4 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 767540 3285 chr6 22469902 22473802 22471466 N NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 875930 3286 chr6 22519690 22523591 22521380 N NA NA NA NA NA NA SOX4 925718 3287 chr6 23695613 23699562 23697407 N NA NA NA NA NA NA NRSN1 426852 3288 chr6 2477616 2479336 2478520 N NA NA C6orf195,LOC100508120,GMDS IMR90 Hi-C 24141950 GMDS 231748 3289 chr6 25140261 25142463 25141861 N NA NA NA NA NA NA LRRC16A 137193 3290 chr6 25153057 25155685 25154640 N NA NA NA NA NA NA LRRC16A 123971 3291 chr6 25641147 25644398 25642643 N NA SCGN NA NA NA NA SCGN 8031 3292 chr6 26312468 26313508 26313433 N NA NA HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 51890 3293 chr6 26568111 26569312 26569075 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,HIST1H2AE,HIST1H2BG,ABT1,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E K562 ChIA-PET 22265404 ABT1 27859 3294 chr6 26571313 26574392 26572195 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 22779 3295 chr6 27019385 27022803 27020737,27019958 N,N NA;NA NA ZNF322 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 91834 3296 chr6 27026151 27030174 27027725 N NA NA ZNF322 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 84463 3297 chr6 27042033 27048299 27043791,27046617 N,N NA;NA NA ZNF322,LINC00240,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H4I,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 66338 3298 chr6 27154605 27157292 27155835 N NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 39968 3299 chr6 27161991 27163311 27162789 N NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 47354 3300 chr6 27200233 27201154 27200570 N NA NA LOC100507173,OR2B2,ZNF184,LOC100131289,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 85596 3301 chr6 27203268 27203899 27203407 Y NA NA OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 88631 3302 chr6 27446472 27448530 27446934 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 5575 3303 chr6 27485881 27487766 27487241 N NA ZNF184 LOC100131289,HIST1H2BJ,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2AH,MIR3143,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF184 44984 3304 chr6 27584487 27586922 27586013 Y NA NA NA NA NA NA LOC100507173 74892 3305 chr6 28424946 28427766 28426304 N NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 13667 3306 chr6 28601119 28604749 28602912 N NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 46007 3307 chr6 28615454 28618462 28616049 N NA NA SCAND3,ZSCAN12 IMR90 Hi-C 24141950 SCAND3 60342 3308 chr6 28649037 28662441 28651155,28655671,28658145,28660281 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA C16orf42,GNPTG MCF7 ChIA-PET 19890323 SCAND3 93925 3309 chr6 28691371 28694834 28693419 N NA NA ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 SCAND3 136259 3310 chr6 28702909 28704542 28703524 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 147797 3311 chr6 28710083 28711133 28710566 N NA NA NA NA NA NA SCAND3 154971 3312 chr6 28716915 28721596 28717560,28719205 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SCAND3 161803 3313 chr6 28731818 28732565 28732172 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 159203 3314 chr6 28743510 28745288 28744183 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 146480 3315 chr6 28833877 28836781 28834633 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 54987 3316 chr6 28848127 28850080 28848987 N NA TRIM27 TRIM27 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 41688 3317 chr6 28908286 28909871 28909104 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 16518 3318 chr6 28920569 28922247 28921255 N NA TRIM27 ZNF311,TRIM27 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRIM27 28801 3319 chr6 28983270 28986191 28984225 N NA ZNF311 TRIM27,LOC401242 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF311 10233 3320 chr6 29616351 29618598 29617740 N NA GABBR1 HLA-G,GABBR1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GABBR1 15389 3321 chr6 30482844 30485554 30484213 N NA PRR3,GNL1 HLA-E,PPP1R10,MRPS18B,ABCF1,PRR3,GNL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PRR3 38932 3322 chr6 3065786 3071601 3069207 N NA RIPK1 NQO2,LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 5457 3323 chr6 30749290 30750880 30749869 N NA FLOT1 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM,MRPS18B,PPP1R10,DDR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLOT1 38837 3324 chr6 30760943 30762977 30761705 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLOT1 50490 3325 chr6 30785457 30787645 30786533 N NA NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 64216 3326 chr6 30845020 30846635 30845632 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 5226 3327 chr6 31159779 31162512 31162362 N NA CCHCR1,TCF19,POU5F1,PSORS1C3,HCG27 NA NA NA NA HCG27 3025 3328 chr6 32582818 32585991 32584914 N NA NA NA NA NA NA TAP2 220556 3329 chr6 33475907 33477496 33476990 N NA NA SYNGAP1,CUTA,GGNBP1,BAK1 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB9 53551 3330 chr6 33514053 33516967 33515500 N NA BAK1 ZBTB9,SYNGAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BAK1 31103 3331 chr6 33794804 33797088 33796159 N NA LEMD2 IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275,MLN IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 37898 3332 chr6 34163254 34165847 34164441 N NA HMGA1 PACSIN1,C6orf106,SPDEF,NUDT3,RPS10-NUDT3,UHRF1BP1,ANKS1A,TAF11,SNRPC,HMGA1,C6orf1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGA1 38730 3333 chr6 34189995 34193129 34192174 N NA HMGA1,C6orf1 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1 11448 3334 chr6 35490177 35492538 35490947 N NA NA TULP1,TEAD3,CLPSL1,CLPS MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL10A 53999 3335 chr6 35507829 35517492 35515596,35510015 N,N NA;NA NA CLPSL1,CLPS,FKBP5,ARMC12,CLPSL2,LHFPL5,SRPK1,SLC26A8,MAPK14,TULP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL10A 71651 3336 chr6 3664101 3666821 3665441 N NA NA SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 354748 3337 chr6 3668683 3672482 3670295 N NA NA SLC22A23,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 349087 3338 chr6 36964538 36966659 36965940 N NA NA MTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 C6orf89 110898 3339 chr6 37068306 37074171 37071402,37073892 N,N NA;NA NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D22B 151377 3340 chr6 37076740 37079852 37078192 N NA NA PIM1,PPIL1,TMEM217,CPNE5,FGD2,C6orf89,TBC1D22B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D22B 145696 3341 chr6 37482857 37486495 37484402 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 15157 3342 chr6 37672095 37675810 37673169 Y NA NA MDGA1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAND3 111497 3343 chr6 37747285 37753355 37752046 N NA ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1,CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 33952 3344 chr6 3825450 3828151 3826432 Y C6orf145 NA SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 193418 3345 chr6 3899094 3901524 3900455 N NA NA SLC22A23,FAM50B,BPHL,RIPK1,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 120045 3346 chr6 39109797 39112402 39111375 N NA SAYSD1 GLP1R IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 26932 3347 chr6 3911987 3914934 3913968 N NA NA SLC22A23,FAM50B,SLIT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 PRPF4B 106635 3348 chr6 40243020 40245282 40244087,40244117 N,N NA;NA NA KIF6 IMR90 Hi-C 24141950 LRFN2 309844 3349 chr6 40874177 40876583 40875296 N NA NA UNC5CL,TSPO2,APOBEC2,C6orf130,LRFN2 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 163605 3350 chr6 40963498 40967801 40964721 Y NA NA UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf130 72387 3351 chr6 41285240 41289813 41286777,41288557 Y,N NFYA,TFEB,TREML4,TREM1;NA NA C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 LOC221442 216467 3352 chr6 41389275 41400068 41396067 N NA NA FOXP4 IMR90,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 MDFI 206127 3353 chr6 41422523 41426146 41424362 N NA NA FOXP4,MDFI,TFEB,PRICKLE4,TOMM6 IMR90,K562,H1ESC,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MDFI 180049 3354 chr6 42514318 42517291 42515560 N NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14469 3355 chr6 43665742 43670115 43666999 N NA MRPS18A RSPH9,MRPS18A,VEGFA,C6orf223,XPO5,LOC100132354,MRPL14,TMEM63B,CAPN11,MAD2L1BP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 10193 3356 chr6 43814820 43815740 43815618 N NA NA LOC100132354,RSPH9,VEGFA,MRPS18A,C6orf223,POLH,GTPBP2 IMR90 Hi-C 24141950 VEGFA 76874 3357 chr6 43957977 43959546 43958704 N NA NA POLH,MRPS18A,LOC100132354,VEGFA,C6orf223 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL14 135645 3358 chr6 44457060 44459301 44458130 Y NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 101809 3359 chr6 44697101 44701319 44698669 N NA NA SUPT3H,CLIC5,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 341850 3360 chr6 45644292 45646946 45645447 Y NA NA RUNX2,CDC5L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENPP4 450755 3361 chr6 4646996 4648433 4647840 N NA NA CDYL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECI2 511165 3362 chr6 47381084 47383999 47382653 Y NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 61526 3363 chr6 47385196 47388749 47387613 N NA NA CD2AP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 56776 3364 chr6 47402379 47410543 47408583 N NA CD2AP NA NA NA NA CD2AP 34982 3365 chr6 47412062 47429796 47428165 N NA CD2AP GPR111,CD2AP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 15729 3366 chr6 49628827 49638419 49631047,49635854,49632678,49636042 N,N,N,N NA;NA;NA;NA CRISP2 RHAG,C6orf141 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CRISP2 42880 3367 chr6 49764315 49766541 49764951 N NA NA NA NA NA NA CRISP3 52147 3368 chr6 49871552 49876186 49873947 N NA NA NA NA NA NA CRISP3 159384 3369 chr6 52474194 52476435 52475061 N NA NA EFHC1,TRAM2,LOC730101,TMEM14A,PAQR8 IMR90 Hi-C 24141950 MCM3 324612 3370 chr6 52782072 52785173 52783409 N NA NA NA NA NA NA GSTA4 75005 3371 chr6 53056867 53057048 53056879 N NA NA KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO9 127071 3372 chr6 53222036 53226337 53224206,53225830 Y,N NA;NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 8059 3373 chr6 53328609 53332754 53330697 N NA NA GCM1 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 77173 3374 chr6 53452846 53456024 53454015 N NA GCLC KLHL31 IMR90 Hi-C 24141950 GCLC 42919 3375 chr6 53554803 53557963 53556149 N NA NA KLHL31,GCLC IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 101815 3376 chr6 53558933 53562349 53560361 N NA NA KLHL31,GCLC IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 97429 3377 chr6 54582114 54584755 54583447 N NA NA FAM83B,HCRTR2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC1 922336 3378 chr6 56690036 56708331 56707508 N NA NA DST,BAG2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 182342 3379 chr6 56758214 56759838 56758540 N NA NA PRIM2,DST,RAB23,BEND6,ZNF451,BAG2,KIAA1586 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 151546 3380 chr6 57109551 57113760 57109710,57111225 N,N NA;NA RAB23 PRIM2,RAB23,BAG2,BEND6 IMR90 Hi-C 24141950 RAB23 22473 3381 chr6 57151986 57155471 57153153 N NA NA NA NA NA NA RAB23 64908 3382 chr6 57836533 57840553 57838575 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 447171 3383 chr6 58441342 58445201 58443171 N NA NA NA NA NA NA GUSBP4 153618 3384 chr6 5866280 5867545 5867000 N NA NA FARS2,F13A1,LY86-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 LYRM4 605108 3385 chr6 63921420 63923272 63922147 N NA NA NA NA NA NA PHF3 433159 3386 chr6 64167579 64170286 64168673 Y PTP4A1 NA NA NA NA NA PHF3 186145 3387 chr6 66545255 66547099 66545749 N NA NA NA NA NA NA PHF3 2188824 3388 chr6 6682837 6691263 6687379,6688638,6684310 Y,N,N NA;NA;NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 416567 3389 chr6 6747218 6751040 6749080 N NA NA RREB1,SSR1,RIOK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 356790 3390 chr6 68000986 68003637 68002523 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 2503412 3391 chr6 6811109 6813832 6812025 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293998 3392 chr6 68571968 68575230 68573473 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1931819 3393 chr6 6914740 6917545 6916159 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 190285 3394 chr6 7041681 7044736 7042780 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 63094 3395 chr6 7047366 7053920 7051414 N NA NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 53910 3396 chr6 71105563 71110576 71108890 N NA FAM135A FAM135A K562 ChIA-PET 22265404 FAM135A 12531 3397 chr6 77127502 77130049 77128488 N NA NA NA NA NA NA MYO6 668593 3398 chr6 77578262 77587103 77585699 N NA NA NA NA NA NA MYO6 1119353 3399 chr6 80446507 80448391 80447120 N NA NA NA NA NA NA TTK 265931 3400 chr6 82539557 82542396 82541242 N NA NA NA NA NA NA IBTK 415052 3401 chr6 82738961 82741231 82740416 N NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 IBTK 216217 3402 chr6 82810628 82814936 82811101 N NA NA NA NA NA NA IBTK 142512 3403 chr6 84735373 84738401 84736940 N NA NA SNAP91 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5R4 166003 3404 chr6 89726720 89729343 89728122 N NA NA NA NA NA NA RNGTT 53372 3405 chr6 91085038 91087654 91085792 N NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K7 209253 3406 chr6 9131228 9133058 9132113 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 1279493 3407 chr6 9139448 9141924 9140637 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 1270627 3408 chr6 92453018 92455675 92454490 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1156111 3409 chr6 93096276 93113422 93111849 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1799369 3410 chr6 93353606 93355855 93354500 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2056699 3411 chr6 93365164 93434791 93433628 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2068257 3412 chr6 93573162 93576173 93575061 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2276255 3413 chr6 93685811 93688294 93687007 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2388904 3414 chr6 9462496 9465114 9463755 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 947437 3415 chr6 9466592 9469605 9468282 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 942946 3416 chr6 96007867 96009581 96009128 N NA NA NA NA NA NA UFL1 960121 3417 chr7 100433219 100437053 100435112 N NA SLC12A9,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A9 13305 3418 chr7 100894298 100896963 100895679 N NA ZNHIT1,PLOD3,CLDN15,FIS1 NA NA NA NA FIS1 5927 3419 chr7 100928482 100935392 100930312 N NA CLDN15,FIS1,RABL5 FIS1,ZNHIT1,CLDN15,PLOD3,EMID2,NAT16,ACHE,SRRT,UFSP1,MUC17,MUC12,SERPINE1,VGF,AP1S1,MOGAT3,MYL10 IMR90 Hi-C 24141950 RABL5 29701 3420 chr7 100988530 100994212 100992723 N NA RABL5 EMID2,CUX1 IMR90 Hi-C 24141950 RABL5 23437 3421 chr7 100995992 101002050 101001342 N NA RABL5 NA NA NA NA RABL5 30899 3422 chr7 105033483 105034516 105033945 N NA SRPK2 SRPK2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SRPK2 4142 3423 chr7 105697534 105700993 105699118,105697620 N,N NA;NA NA ATXN7L1,CDHR3,SYPL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 52064 3424 chr7 105704751 105707529 105706221 N NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45528 3425 chr7 105818804 105821813 105820402,105819398 N,N NA;NA NA CCDC71L,NAMPT,PRKAR2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 65747 3426 chr7 105845055 105853283 105847350 N NA NA PRKAR2B,NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 72355 3427 chr7 105855861 105858882 105857455 N NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 66756 3428 chr7 105952685 105955996 105954142,105954085 N,N NA;NA NAMPT NAMPT,CCDC71L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 27047 3429 chr7 106056974 106059695 106058091 N NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 131336 3430 chr7 106238460 106240533 106239383 N NA NA CCDC71L K562 ChIA-PET 22265404 CCDC71L 61101 3431 chr7 107450342 107454441 107451947 N NA NA SLC26A4 IMR90 Hi-C 24141950 CBLL1 66063 3432 chr7 107455562 107458422 107456715 N NA NA SLC26A4 IMR90 Hi-C 24141950 CBLL1 71283 3433 chr7 107490201 107503683 107491646,107497895,107501655 N,N,N NA;NA;NA DLD COG5,SLC26A3,GPR22,CBLL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLD 27903 3434 chr7 107509251 107511009 107510190 N NA DLD GPR22,COG5,CBLL1,SLC26A4,NRCAM IMR90 Hi-C 24141950 DLD 20577 3435 chr7 107519313 107522812 107521210 N NA DLD CBLL1,COG5,DLD IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLD 8774 3436 chr7 108250791 108256474 108251845,108254599 N,N NA;NA THAP5,DNAJB9 THAP5,DNAJB9 MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJB9 40602 3437 chr7 109282084 109284262 109282733 N NA NA IMMP2L IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB9 1071895 3438 chr7 112030032 112033702 112032122 N NA IFRD1 DOCK4,ZNF277,IFRD1 IMR90 Hi-C 24141950 IFRD1 29497 3439 chr7 112211604 112214887 112213443 N NA NA C7orf60 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf53 90696 3440 chr7 11231253 11235180 11233296 N NA NA NA NA NA NA PHF14 217754 3441 chr7 11275505 11278795 11276971 N NA NA NA NA NA NA PHF14 262006 3442 chr7 112815386 112818919 112817083 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 56749 3443 chr7 112859903 112863876 112861608 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 101266 3444 chr7 113047094 113056329 113054505 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 288457 3445 chr7 113063163 113066807 113064640 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 304526 3446 chr7 113130718 113132731 113131656 N NA NA NA NA NA NA LOC401397 372081 3447 chr7 11329600 11336830 11330956,11334850 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PHF14 316101 3448 chr7 117590310 117594175 117592052 N NA NA MET,ST7-AS2,ST7 HELA 5C 22955621 NAA38 229911 3449 chr7 117620847 117624752 117622620 N NA NA NA NA NA NA NAA38 199334 3450 chr7 118491286 118501305 118498701 N NA NA NA NA NA NA NAA38 667200 3451 chr7 118739459 118742684 118740741 N NA NA NA NA NA NA NAA38 915373 3452 chr7 121876634 121886253 121878803 N NA NA NA NA NA NA RNF133 452955 3453 chr7 122559014 122561174 122559983 N NA NA NA NA NA NA RNF133 219806 3454 chr7 123037047 123039927 123038317 N NA NA NA NA NA NA NDUFA5 158031 3455 chr7 123049165 123052015 123050861 N NA NA NA NA NA NA NDUFA5 145943 3456 chr7 124672181 124675872 124673543 N NA NA NA NA NA NA POT1 102144 3457 chr7 12536041 12541691 12536938 N NA NA THSD7A IMR90 Hi-C 24141950 TMEM106B 285193 3458 chr7 125579664 125581182 125580298 N NA NA NA NA NA NA POT1 1009627 3459 chr7 127115083 127119948 127117489 N NA NA NA NA NA NA ZNF800 82316 3460 chr7 12754043 12756259 12755551 Y VWDE,ARL4A NA NA NA NA NA TMEM106B 503195 3461 chr7 127774690 127778129 127775960 N NA NA SND1,MIR129-1,PAX4,LEP IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 169687 3462 chr7 127805864 127808042 127807199 N NA NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 139774 3463 chr7 128168122 128217195 128170705,128210504,128172678 N,N,N NA;NA;NA NA METTL2B,IMPDH1,HILPDA,FAM71F1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL2B 51339 3464 chr7 128241308 128278878 128242137 N NA FLJ45340,FAM71F2 FAM71F1,CCDC136,KCP,LOC100130705,ATP6V1F,FLJ45340,CALU,IRF5,FAM71F2,OPN1SW,FLNC IMR90 Hi-C 24141950 FLJ45340 2417 3465 chr7 129702664 129703178 129702672 N NA ZC3HC1,KLHDC10 NA NA NA NA KLHDC10 7171 3466 chr7 131305239 131307513 131306521 N NA NA PODXL MCF7 ChIA-PET 22265404 MKLN1 510384 3467 chr7 131632008 131635787 131633752 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 837153 3468 chr7 1328541 1331052 1330091 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 128686 3469 chr7 1335713 1338377 1336919 N NA NA UNCX,COX19 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 135858 3470 chr7 134052305 134055368 134053885 N NA NA LRGUK,EXOC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35B4 50478 3471 chr7 135457548 135466336 135458743 N NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 110327 3472 chr7 135717032 135719324 135718281 Y NA NA C7orf73 IMR90 Hi-C 24141950 MTPN 54828 3473 chr7 137690668 137695836 137693589 N NA CREB3L2 CREB3L2,DGKI MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CREB3L2 3821 3474 chr7 137877861 137883368 137879822 N NA NA NA NA NA NA CREB3L2 191014 3475 chr7 137896144 137898745 137897165 N NA NA NA NA NA NA CREB3L2 209297 3476 chr7 138801676 138804771 138802679 N NA ZC3HAV1 KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3HAV1 7211 3477 chr7 139928823 139961536 139931570,139960546,139942581 N,N,N NA;NA;NA NA JHDM1D,LOC100134229,SLC37A3,TBXAS1,PARP12,KLRG2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100134229 51762 3478 chr7 140183303 140187396 140185331 N NA MKRN1 MKRN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MKRN1 3934 3479 chr7 140355235 140358043 140356574 N NA ADCK2,NDUFB2,LOC100134713 DENND2A,MKRN1,LOC100134713,NDUFB2,ADCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCK2 14910 3480 chr7 140681355 140684049 140682442 N NA MRPS33 NA NA NA NA MRPS33 30732 3481 chr7 140731494 140738190 140732674 N NA MRPS33,LOC100507421 MRPS33 K562 ChIA-PET 22265404 MRPS33 16713 3482 chr7 140749239 140759360 140752800,140757181 N,N NA;NA MRPS33,LOC100507421 MRPS33,LOC100507421 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507421 14672 3483 chr7 141685495 141687082 141686211 N NA NA NA NA NA NA TAS2R5 195478 3484 chr7 142330738 142334441 142332890 N NA MTRNR2L6 NA NA NA NA MTRNR2L6 39690 3485 chr7 142697950 142701948 142700470 N NA NA TRPV6 K562 ChIA-PET 22265404 TRPV6 114460 3486 chr7 148601328 148608688 148608479 N NA NA CUL1,EZH2,C7orf33 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF786 179181 3487 chr7 148634885 148639694 148638450 Y NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF786 148175 3488 chr7 149071159 149075616 149072573,149074700 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF777 82437 3489 chr7 149401760 149405406 149404669 N NA KRBA1 NA NA NA NA KRBA1 6742 3490 chr7 149665228 149700291 149697719 N NA NA NA NA NA NA LOC401431 94277 3491 chr7 149755684 149759119 149757908 N NA NA NA NA NA NA LOC401431 184733 3492 chr7 150598458 150602691 150601036 N NA NA ATG9B,NOS3,KCNH2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNH2 72711 3493 chr7 150606528 150607851 150606850 N NA NA NA NA NA NA KCNH2 67551 3494 chr7 150998125 151003159 151002007 N NA NUB1 GBX1,CHPF2,SMARCD3,ABCF2,NUB1,SLC4A2,CDK5,ACCN3,ABCB8,FASTK,AGAP3,TMUB1,ASB10,WDR86,LOC100131176,CRYGN,RHEB,PRKAG2 IMR90 Hi-C 24141950 NUB1 35688 3495 chr7 151614091 151616814 151615500 N NA LOC100505483,PRKAG2 NA NA NA NA PRKAG2 39775 3496 chr7 151620089 151625487 151620738,151623299 N,Y NA;RHEB,PRKAG2,PRKAG2 LOC100505483,PRKAG2 LOC100505483,PRKAG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 45773 3497 chr7 151628427 151631065 151629833 N NA NA PRKAG2,LOC100505483 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 54111 3498 chr7 152200722 152203375 152201692 N NA NA NA NA NA NA MLL3 67632 3499 chr7 152310718 152315472 152313148 N NA NA MLL3 IMR90 Hi-C 24141950 XRCC2 57778 3500 chr7 152395133 152398528 152396673 N NA XRCC2 XRCC2,LOC100128822 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 XRCC2 21883 3501 chr7 155005759 155007965 155006703 N NA NA NA NA NA NA INSIG1 81521 3502 chr7 155014038 155017501 155015771 N NA NA INSIG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INSIG1 71985 3503 chr7 155170277 155197373 155170328,155174210 N,N NA;NA NA HTR5A,PAXIP1,LOC100132707,INSIG1,DPP6,LOC202781 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 80791 3504 chr7 155410589 155412281 155411564 N NA RBM33 RBM33 MCF7 ChIA-PET 22265404 RBM33 24922 3505 chr7 155635536 155638737 155637074 N NA SHH LMBR1,RNF32 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 30569 3506 chr7 156190512 156195235 156192468,156194231 N,N NA;NA NA LOC285889,SHH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C7orf13 238113 3507 chr7 156269816 156274391 156273595 N NA NA SHH,LMBR1,LINC00244 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C7orf13 158957 3508 chr7 156400172 156408979 156407882,156401937 N,Y NA;NA C7orf13 RNF32,C7orf13,RBM33,LMBR1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C7orf13 24369 3509 chr7 156695134 156703010 156696387 N NA LMBR1 NOM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMBR1 9232 3510 chr7 156718977 156722552 156720523 N NA LMBR1 CNPY1,NOM1,UBE3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMBR1 33075 3511 chr7 156723397 156726103 156724892 Y NA LMBR1 CNPY1,NOM1,UBE3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMBR1 37495 3512 chr7 156840725 156843781 156841960 N NA MNX1,LOC645249 NA NA NA NA LOC645249 37174 3513 chr7 156848394 156851357 156850657 N NA MNX1,LOC645249 LOC645249,MNX1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645249 44843 3514 chr7 157254076 157256518 157254994 N NA NA NA NA NA NA DNAJB6 124365 3515 chr7 159109704 159113159 159111699 N NA NA NA NA NA NA NCAPG2 612184 3516 chr7 160090 167011 165635 N NA NA FAM20C,SUN1 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1B 600302 3517 chr7 20145738 20149730 20147452 N NA NA NA NA NA NA ITGB8 220995 3518 chr7 20632700 20635147 20633711 N NA NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 261975 3519 chr7 20637667 20640667 20638813 N NA NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 266942 3520 chr7 20835036 20839488 20837304 N NA NA SP8 K562 ChIA-PET 22265404 ITGB8 464311 3521 chr7 20997369 21000116 20999044,20998761 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SP4 467573 3522 chr7 22121500 22124391 22123054 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 135958 3523 chr7 23075113 23076495 23075535 N NA NA FAM126A,IL6,SNORD93 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL7-AS1 68827 3524 chr7 23115378 23117789 23116937 N NA KLHL7-AS1,KLHL7 TOMM7,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 KLHL7-AS1 27533 3525 chr7 24161996 24168520 24165893 N NA NA NA NA NA NA NPY 155287 3526 chr7 24190892 24197381 24192601 N NA NA NA NA NA NA NPY 126426 3527 chr7 25395116 25398002 25396506 N NA NA NA NA NA NA CYCS 230136 3528 chr7 25422119 25431129 25424358,25428513,25430349 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CYCS 257139 3529 chr7 25432724 25435648 25434015 N NA NA NA NA NA NA CYCS 267744 3530 chr7 25443354 25447278 25445594 N NA NA NA NA NA NA CYCS 278374 3531 chr7 25494464 25500102 25496558 N NA NA NA NA NA NA CYCS 329484 3532 chr7 25581800 25585846 25583937 N NA NA NA NA NA NA CYCS 416820 3533 chr7 25595292 25599879 25597332 N NA NA NA NA NA NA CYCS 430312 3534 chr7 25606945 25609626 25608447 N NA NA NA NA NA NA CYCS 441965 3535 chr7 25627757 25644748 25642656 N NA NA NA NA NA NA CYCS 462777 3536 chr7 25649872 25661420 25660008,25658778 Y,N NA;NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 CYCS 484892 3537 chr7 25714789 25716590 25715938 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA2B1 523823 3538 chr7 25790104 25792204 25790780 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA2B1 448209 3539 chr7 25869685 25872985 25871489 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA2B1 367428 3540 chr7 25884683 25887940 25886516 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA3,HOXA4,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA2B1 352473 3541 chr7 25888967 25892100 25890926 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA2B1 348313 3542 chr7 25893642 25898938 25894941,25897073 Y,Y NA;NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 341475 3543 chr7 25931983 25934507 25932808 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10,HOXA5,HOXA-AS3,HOXA7,HOXA6,LOC441204,MIR196B,HOXA3,HOXA4,HOTTIP,HOXA13,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA2,HOXA1,HOTAIRM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 305906 3544 chr7 26002746 26007464 26004766 N NA NA MIR148A MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA2B1 232949 3545 chr7 26027224 26030090 26028707 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA2B1 210323 3546 chr7 26118099 26119792 26118752 Y NA NA SNX10,HOXA10-HOXA9,MIR196B,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA9,NFE2L3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 120621 3547 chr7 26588257 26591744 26589326 Y SNX10 NA LOC441204,KIAA0087 IMR90 Hi-C 24141950 CBX3 347426 3548 chr7 26623763 26625852 26624478 N NA NA NA NA NA NA CBX3 382932 3549 chr7 27327401 27334454 27330887 N NA NA NA NA NA NA HOTTIP 87361 3550 chr7 27350246 27369499 27353922,27368132 N,N NA;NA NA HIBADH,HOTTIP,HOXA13,EVX1 IMR90,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 HOTTIP 110206 3551 chr7 27400603 27402930 27401498 N NA NA EVX1 IMR90 Hi-C 24141950 HOTTIP 160563 3552 chr7 2895748 2901404 2897311,2900632 N,N NA;NA GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 11789 3553 chr7 30292539 30295170 30293935 N NA ZNRF2 NOD1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF2 28753 3554 chr7 30552613 30556897 30554120 N NA GGCT LOC401320,GGCT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGCT 8156 3555 chr7 3095436 3098344 3096679 N NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA12 211477 3556 chr7 3147941 3150516 3149169 N NA NA NA NA NA NA GNA12 263982 3557 chr7 3156126 3159017 3157330 N NA NA CARD11,SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA12 272167 3558 chr7 3333273 3335243 3334965 N NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA12 449314 3559 chr7 34237099 34242343 34238728 N NA NA NA NA NA NA NT5C3 1134690 3560 chr7 358131 359251 359075 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1B 408062 3561 chr7 36071169 36073777 36072205 N NA NA KIAA0895,EEPD1 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7 230573 3562 chr7 36075049 36079071 36077082 N NA NA EEPD1 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7 234453 3563 chr7 365113 368185 367046 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1B 399128 3564 chr7 369689 374772 373402 N NA NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAR1B 392541 3565 chr7 380382 383560 382307 N NA NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAR1B 383753 3566 chr7 38343144 38366867 38346183,38354422 N,N NA;NA TARP,LOC100506776 LOC100506776,STARD3NL IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506776 14311 3567 chr7 400954 403521 402562 N NA NA NA NA NA NA PRKAR1B 363792 3568 chr7 41015692 41018766 41017097 N NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 841441 3569 chr7 41023772 41027680 41025365 N NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 849521 3570 chr7 41042091 41045034 41043280 N NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 867840 3571 chr7 41153039 41155824 41154075,41154511 N,N NA;NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 978788 3572 chr7 411733 414410 413161 N NA NA LOC442497 K562 ChIA-PET 22265404 PRKAR1B 352903 3573 chr7 41184604 41186361 41185599 N NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 1010353 3574 chr7 41186959 41189330 41188352 N NA NA LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 C7orf11 1012708 3575 chr7 41347344 41349975 41348774 N NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 926643 3576 chr7 42301522 42304037 42302714 N NA GLI3 GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 24904 3577 chr7 42331190 42334285 42332763 N NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 54572 3578 chr7 42532003 42534104 42533344 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 255385 3579 chr7 42894908 42897354 42896634 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 54335 3580 chr7 46595358 46598917 46597271 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 634487 3581 chr7 46642362 46644889 46643828 N NA NA NA NA NA NA IGFBP3 681491 3582 chr7 46925167 46927179 46926309 N NA NA NA NA NA NA IGFBP3 964296 3583 chr7 46938408 46941932 46940136 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 977537 3584 chr7 4700136 4702384 4701618 N NA NA SDK1,FOXK1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0415 112878 3585 chr7 47091807 47092875 47092149 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 926347 3586 chr7 47220717 47222772 47221674 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 796450 3587 chr7 474733 476843 475430 N NA NA HEATR2,PRKAR1B MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAR1B 290470 3588 chr7 47674695 47676360 47674997 N NA NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HUS1 342862 3589 chr7 47785973 47789263 47786980 N NA NA TNS3,C7orf65,PKD1L1,C7orf69,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 229959 3590 chr7 50924016 50934005 50925962 N NA NA COBL IMR90 Hi-C 24141950 FIGNL1 405928 3591 chr7 50964777 50972417 50966753 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 446689 3592 chr7 51405301 51410517 51408162 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 887213 3593 chr7 51416600 51419684 51418032 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 898512 3594 chr7 51714634 51716613 51715865 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 1196546 3595 chr7 53022721 53025368 53024411 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 1801571 3596 chr7 53931957 53935235 53934026 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 891704 3597 chr7 54742885 54744277 54743417 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 82662 3598 chr7 54999668 55007150 55000966 N NA NA EGFR IMR90 Hi-C 24141950 SEC61G 172729 3599 chr7 55799332 55800854 55800154 N NA NA NA NA NA NA MRPS17 218757 3600 chr7 5600784 5605398 5602118 N NA ACTB FBXL18,RNF216 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACTB 30552 3601 chr7 5608804 5612653 5609844 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 38572 3602 chr7 6119006 6122767 6121227 N NA EIF2AK1 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 20146 3603 chr7 63374558 63375352 63374971 N NA NA NA NA NA NA ZNF736 397834 3604 chr7 63877422 63880395 63878695 N NA LOC649395 NA NA NA NA LOC649395 13676 3605 chr7 64035058 64036187 64035387 N NA ZNF680 NA NA NA NA ZNF680 11553 3606 chr7 64724985 64726731 64725766 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 112037 3607 chr7 64733767 64735905 64734171 Y NA NA NA NA NA NA ZNF92 102863 3608 chr7 65019203 65021286 65020163 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 180435 3609 chr7 65877362 65881039 65878572 Y RABGEF1,KCTD7 LINC00174 ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00174 11967 3610 chr7 65956848 65961326 65958633 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 82172 3611 chr7 66083597 66089048 66084321 N NA LOC493754,KCTD7 ASL,LOC493754,KCTD7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 4820 3612 chr7 66934030 66937421 66935562 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 166405 3613 chr7 67118954 67120399 67119587 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 351329 3614 chr7 67144768 67163507 67159200,67162084 N,N NA;NA NA NA NA NA NA STAG3L4 377143 3615 chr7 67341948 67344628 67343439 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 574323 3616 chr7 67650447 67652345 67650782 N NA NA NA NA NA NA STAG3L4 882822 3617 chr7 68886561 68888985 68887652 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 174921 3618 chr7 68893944 68896820 68895319 N NA NA NA NA NA NA AUTS2 167086 3619 chr7 69012166 69018335 69014798 N NA AUTS2 AUTS2 IMR90 Hi-C 24141950 AUTS2 45571 3620 chr7 69025135 69028106 69025863 N NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 35800 3621 chr7 6989736 6995472 6993647 N NA NA NA NA NA NA CCZ1B 123810 3622 chr7 73330233 73389234 73330986,73352902 N,N NA;NA NA EIF4H,WBSCR28,ELN,MLXIPL,LIMK1,ABHD11-AS1,ABHD11,CLDN4,WBSCR22,MIR4284,DNAJC30,STX1A,WBSCR27,LAT2,CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBSCR27 73378 3623 chr7 73842003 73845186 73843666 N NA NA NA NA NA NA RFC2 173265 3624 chr7 74057244 74059054 74057829 Y LAT2 GTF2I GTF2I K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GTF2I 12976 3625 chr7 75720311 75739542 75728729,75738242 N,N NA;NA STYXL1,MDH2 SRRM3,MDH2,STYXL1,PMS2P3,HIP1,CCL24,CCL26,POR,HSPB1,YWHAG IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 42918 3626 chr7 75794380 75797254 75795979 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33962 3627 chr7 76355874 76359624 76358039 N NA NA NA NA NA NA POMZP3 99254 3628 chr7 76579548 76581859 76580312 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 28280 3629 chr7 76589658 76596404 76590151 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 13735 3630 chr7 77096329 77129160 77109364,77128300 N,N NA;NA PTPN12 PION,PTPN12,PHTF2,CCDC146,LOC100505854,RSBN1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN12 37613 3631 chr7 77160215 77163086 77162333 N NA PTPN12 PTPN12,PION MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPN12 3687 3632 chr7 79879098 79885227 79882809 N NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 114958 3633 chr7 79905260 79912232 79907025,79909439 N,N NA;NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 141120 3634 chr7 79938983 79944000 79941672 N NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 174843 3635 chr7 79961992 79967809 79963983,79964933 N,N NA;NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 197852 3636 chr7 80013081 80017090 80015027 N NA NA GNAI1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 248941 3637 chr7 80783566 80787060 80785300 N NA NA SEMA3C MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA3C 234899 3638 chr7 8342527 8393380 8343838,8346057 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GLCCI1 334153 3639 chr7 8431316 8462931 8431684 N NA NA NXPH1 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 422942 3640 chr7 88019505 88024573 88022137,88021395 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC25A40 513813 3641 chr7 89815077 89832887 89831461,89823617 N,N NA;NA STEAP1,STEAP2,C7orf63 NA NA NA NA STEAP2 8113 3642 chr7 90115475 90119655 90117748 N NA NA NA NA NA NA CLDN12 82827 3643 chr7 90212997 90294571 90224876,90226734,90234594,90248337,90252270,90269584 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA NA CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63,STEAP1 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CLDN12 180349 3644 chr7 90969810 90973620 90971891 N NA NA NA NA NA NA FZD1 76027 3645 chr7 91189270 91197476 91195226 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 295487 3646 chr7 91526261 91528923 91527887 N NA MTERF,AKAP9 NA NA NA NA MTERF 16245 3647 chr7 92643012 92646915 92643926,92645718 N,N NA;NA NA CDK6,FAM133B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC132 214738 3648 chr7 95977775 95982473 95979085 N NA NA NA NA NA NA LOC100506136 311177 3649 chr7 97399380 97402730 97401253 N NA NA NA NA NA NA ASNS 99124 3650 chr7 97718968 97720250 97719283 N NA LMTK2 LMTK2 IMR90 Hi-C 24141950 LMTK2 15947 3651 chr7 98038146 98045920 98039056 N NA BAIAP2L1 NA NA NA NA BAIAP2L1 7719 3652 chr7 99604584 99608623 99606273 N NA ZKSCAN1,ZSCAN21 ZKSCAN1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZKSCAN1 4596 3653 chr8 101346614 101351002 101349297 N NA RNF19A NA NA NA NA RNF19A 24287 3654 chr8 101428348 101430918 101429448 N NA NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471,CMTM7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 RNF19A 106021 3655 chr8 101468475 101471997 101469981 N NA NA SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 100015 3656 chr8 101474653 101478091 101476349 Y YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 93921 3657 chr8 101482980 101485479 101484400 Y NA NA SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 86533 3658 chr8 101497095 101501286 101498863 N NA NA RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 70726 3659 chr8 101503723 101508798 101507162 N NA NA RNF19A,GRHL2,SPAG1,ANKRD46 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANKRD46 63214 3660 chr8 101674553 101676304 101675618 N NA NA FLJ42969,SNX31 IMR90 Hi-C 24141950 PABPC1 58011 3661 chr8 101858331 101860714 101859690 N NA NA ANKRD46,SNX31,PABPC1,ZNF706,SPAG1,FLJ42969,YWHAZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 104909 3662 chr8 102037543 102038073 102037702 N NA NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 71920 3663 chr8 102119538 102140615 102139260 N NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 77345 3664 chr8 102244728 102247314 102246085 N NA ZNF706 ZNF706,ANKRD46,YWHAZ,FLJ42969 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 26768 3665 chr8 102287737 102294338 102290083,102292812 N,N NA;NA NA YWHAZ,FLJ42969,PABPC1,ZNF706 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 69777 3666 chr8 102343748 102347594 102345340 Y NA NA GRHL2,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 125788 3667 chr8 102370639 102375030 102373302 Y NA NA GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRHL2 129638 3668 chr8 102404196 102407198 102405882 N NA NA GRHL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 97470 3669 chr8 102416728 102437176 102419745,102422341,102436635 N,N,N NA;NA;NA NA GRHL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 67492 3670 chr8 102445126 102448498 102446240 N NA NA KALRN,NACAP1 MCF7 ChIA-PET 19890323,22265404 GRHL2 56170 3671 chr8 103173550 103176867 103174945 N NA NCALD NA NA NA NA NCALD 36415 3672 chr8 10344954 10347606 10346015 N NA NA NA NA NA NA XKR6 711269 3673 chr8 103539771 103543269 103540897 N NA NA UBR5,ODF1 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 114854 3674 chr8 103941021 103981548 103942058 N NA NA AZIN1,ATP6V1C1,BAALC,CTHRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1C1 51700 3675 chr8 105742700 105746280 105744288 N NA NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 141448 3676 chr8 108606333 108611677 108609985 N NA NA NA NA NA NA EIF3E 649282 3677 chr8 108617559 108620589 108618980 N NA NA NA NA NA NA EIF3E 640370 3678 chr8 117484461 117487008 117485661 N NA NA LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3H 281054 3679 chr8 11774649 11779790 11776867 N NA NA NEIL2,GATA4,FDFT1,BLK,CTSB IMR90 Hi-C 24141950 FDFT1 114459 3680 chr8 117770201 117773244 117771606 N NA EIF3H,UTP23 NA NA NA NA EIF3H 2139 3681 chr8 117813489 117817131 117815369 N NA EIF3H,UTP23 NA NA NA NA UTP23 34747 3682 chr8 121084036 121088443 121085584 Y NA NA DEPTOR,DSCC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEPTOR 198136 3683 chr8 124630814 124633050 124631706 N NA NA FBXO32,ANXA13,KLHL38 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO32 77321 3684 chr8 125203083 125205394 125204298 N NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 179546 3685 chr8 125209150 125211419 125210193 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM65 173521 3686 chr8 125212718 125215605 125214448 N NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM65 169335 3687 chr8 125220900 125223589 125222267 N NA NA TMEM65,FER1L6,FAM91A1,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 161351 3688 chr8 125859948 125862304 125860790 N NA NA MTSS1,TATDN1,ZNF572,LOC157381,NDUFB9,SQLE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTSS1 119218 3689 chr8 125917942 125920892 125919318 N NA NA LOC157381,MTSS1,SQLE,ZNF572,TATDN1,NDUFB9 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF572 64647 3690 chr8 126655644 126668534 126660760,126656907 N,N NA;NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 213081 3691 chr8 126711345 126716067 126712855 N NA NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 268782 3692 chr8 127390871 127393333 127391828 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 177378 3693 chr8 127575743 127580115 127576485 N NA FAM84B NA NA NA NA FAM84B 5032 3694 chr8 127620909 127628660 127623845 N NA NA FAM84B MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM84B 50198 3695 chr8 127834767 127841770 127837041 N NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 183629 3696 chr8 127883931 127911364 127886834,127889379 N,N NA;NA NA PVT1,MYC,PCAT1,LOC727677,POU5F1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 114035 3697 chr8 128072588 128117185 128075982,128089350,128099752,128095763,128114031,128105558,128114096 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA PCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 PCAT1 47189 3698 chr8 128169256 128260712 128171131,128227520,128255959,128181791 Y,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC,PVT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCAT1 143857 3699 chr8 128507845 128510933 128509454 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 237382 3700 chr8 128517628 128522979 128520742 N NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 MYC 225336 3701 chr8 128774824 128777352 128775974 N NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 26509 3702 chr8 128793677 128796875 128795031 N NA MYC,PVT1 MYC,PVT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 9904 3703 chr8 129354688 129359494 129356386 N NA NA MYC,PVT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PVT1 547909 3704 chr8 1337881 1341070 1339027 N NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 981073 3705 chr8 134318233 134324904 134320177,134323499 N,N NA;NA NDRG1 TG,NDRG1,ST3GAL1,WISP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 8686 3706 chr8 134332285 134342053 134333712,134334634,134339202,134339261 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NDRG1 NDRG1,WISP1,ST3GAL1,TG,SLA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 22738 3707 chr8 134355153 134380261 134368624,134372745 Y,N NDRG1;NA NDRG1 WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 45606 3708 chr8 134381727 134391695 134390132 N NA NA NDRG1,TG,ST3GAL1,WISP1,PHF20L1,SLA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 72180 3709 chr8 134419771 134422435 134420188 N NA NA TG,NDRG1,WISP1,PHF20L1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 110224 3710 chr8 134436044 134438503 134437094 N NA NA NDRG1,TG,WISP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 126497 3711 chr8 134439790 134442629 134441290 N NA NA NDRG1,TG,WISP1,PHF20L1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 130243 3712 chr8 134655829 134657573 134656584 N NA NA ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 71646 3713 chr8 134862249 134865641 134863710 N NA NA ST3GAL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST3GAL1 278066 3714 chr8 134930121 134933208 134931775 N NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 345938 3715 chr8 135742933 135747821 135747134 N NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 17641 3716 chr8 135752872 135757431 135756225 N NA ZFAT ZFAT,MIR30D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 27580 3717 chr8 135763762 135768195 135766316 N NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 38470 3718 chr8 135878350 135880644 135879362 N NA NA MIR30D,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ZFAT 153058 3719 chr8 135897813 135899847 135898881 N NA NA ZFAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 172521 3720 chr8 136007373 136012117 136008568 N NA NA NA NA NA NA ZFAT 282081 3721 chr8 140061024 140063417 140062214 N NA NA NA NA NA NA CHRAC1 1457980 3722 chr8 140559080 140561163 140559775 N NA NA NA NA NA NA CHRAC1 960234 3723 chr8 140592765 140595506 140594463 N NA NA COL22A1 IMR90 Hi-C 24141950 CHRAC1 925891 3724 chr8 141473265 141476485 141474929 Y NA CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CHRAC1 44912 3725 chr8 142082768 142084840 142083459 N NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A4 153833 3726 chr8 142126069 142128196 142127339 N NA NA PTK2,DENND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A4 110477 3727 chr8 142284213 142321910 142289921,142318616,142316177 N,N,N NA;NA;NA SLC45A4 SLC45A4,PTK2,DENND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A4 45540 3728 chr8 142729304 142734002 142732676 N NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 297297 3729 chr8 142932723 142936369 142934277 N NA NA NA NA NA NA PTP4A3 500716 3730 chr8 142964846 142967158 142966274 N NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 532839 3731 chr8 143124293 143126700 143125668 N NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 PSCA 625026 3732 chr8 143137060 143140312 143138469 N NA NA TSNARE1 IMR90 Hi-C 24141950 PSCA 611414 3733 chr8 144287747 144291043 144289987 N NA NA NA NA NA NA ZNF696 82516 3734 chr8 145875401 145909155 145907535 N NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5,ZNF7,C8orf77 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 36513 3735 chr8 15350845 15352976 15351718 N NA NA NA NA NA NA CNOT7 1751411 3736 chr8 1692808 1695204 1693862 Y CLN8 NA ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO25 1336000 3737 chr8 17345467 17348027 17346884 N NA NA MTMR7,SLC7A2 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37A 241066 3738 chr8 17692795 17696436 17694277 N NA MTUS1 MTUS1,FGL1 IMR90 Hi-C 24141950 MTUS1 34369 3739 chr8 18952304 18954991 18953411 N NA NA LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 81108 3740 chr8 19621075 19628980 19626196,19623113 N,N NA;NA INTS10 CSGALNACT1,PSD3,SH2D4A,INTS10 IMR90 Hi-C 24141950 INTS10 45938 3741 chr8 20043713 20046029 20044790 Y NA ATP6V1B2 ATP6V1B2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP6V1B2 8675 3742 chr8 20537597 20538642 20538008 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 482893 3743 chr8 20795247 20798180 20796675 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1B2 740543 3744 chr8 23470728 23477869 23477851,23472168 N,N NA;NA NA SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 62581 3745 chr8 23478631 23485241 23482589,23484257,23483882,23482454 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA SLC25A37,NKX3-1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 55209 3746 chr8 23498675 23503665 23501397 N NA NKX3-1 NA NA NA NA NKX3-1 36785 3747 chr8 23509602 23514556 23511483 N NA NKX3-1 NKX3-1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 25894 3748 chr8 24074458 24079084 24076342 N NA NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 534008 3749 chr8 24538961 24542103 24540449 N NA NA NA NA NA NA DOCK5 500184 3750 chr8 247208 250100 248643 N NA NA NA NA NA NA ZNF596 65008 3751 chr8 25440697 25444887 25442296 N NA NA EBF2 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD9 124713 3752 chr8 2589708 2592940 2591312 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 2232900 3753 chr8 264840 279000 277356 N NA NA NA NA NA NA FBXO25 77808 3754 chr8 28257190 28261781 28259090 N NA ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 13213 3755 chr8 28455951 28457869 28456698 N NA NA NA NA NA NA EXTL3 101284 3756 chr8 29132523 29135830 29133566 N NA KIF13B NA NA NA NA KIF13B 11913 3757 chr8 29139964 29146442 29140704,29144501 N,N NA;NA KIF13B KIF13B,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 19354 3758 chr8 29316240 29318134 29317045 N NA NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 195630 3759 chr8 29399078 29400877 29400153 N NA NA MIR3148,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 278468 3760 chr8 30209181 30211266 30210179 N NA NA MIR548O2 IMR90 Hi-C 24141950 DCTN6 195368 3761 chr8 30588367 30591689 30589495 N NA NA UBXN8,GSR IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 78663 3762 chr8 30768029 30770794 30769850 Y NA NA WRN,TEX15,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 97677 3763 chr8 329302 330845 330048 N NA FBXO25 FBXO25 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 25963 3764 chr8 332848 336714 335098 N NA FBXO25 FBXO25 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 20094 3765 chr8 349114 352802 350952 N NA FBXO25 NA NA NA NA FBXO25 4006 3766 chr8 37019991 37021468 37020883 N NA NA KCNU1,ERLIN2,LOC728024,PROSC,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 531833 3767 chr8 37159198 37161469 37160006 N NA NA ZNF703,KCNU1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF703 391832 3768 chr8 37214860 37219897 37217799 N NA NA ERLIN2,LOC728024,ZNF703 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 333404 3769 chr8 37329477 37331411 37330129 N NA NA ZNF703,ERLIN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF703 221890 3770 chr8 37440114 37458775 37457521 N NA NA ZNF703,KCNU1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF703 94526 3771 chr8 37759575 37763823 37761687 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 2560 3772 chr8 38329017 38331098 38329725 N NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 2665 3773 chr8 38339524 38342197 38340548 N NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 13172 3774 chr8 38578396 38580321 38579078 N NA NA NA NA NA NA RNF5P1 119621 3775 chr8 39707179 39712761 39710400 N NA NA NA NA NA NA ADAM9 852674 3776 chr8 39911098 39914670 39912531 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1056593 3777 chr8 39944478 39947849 39946083 N NA NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1089973 3778 chr8 40036886 40040876 40039281 N NA NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1182381 3779 chr8 40067043 40069715 40068444 N NA NA ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1212538 3780 chr8 41941477 41944793 41942841 N NA KAT6A AP3M2,ANK1,KAT6A IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 31972 3781 chr8 41960592 41964952 41962278 N NA NA KAT6A,POLB IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 51087 3782 chr8 41996120 41999895 41997375 Y NA NA KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT6A 86615 3783 chr8 42071542 42074031 42072726 N NA NA AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 IKBKB 54789 3784 chr8 42101421 42104788 42103130 N NA IKBKB VDAC3,AP3M2,IKBKB,PLAT IMR90 Hi-C 24141950 IKBKB 24032 3785 chr8 43594616 43595712 43595145 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 599024 3786 chr8 47175684 47177176 47176249 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 996313 3787 chr8 47669427 47670893 47670133 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 502596 3788 chr8 48039084 48042000 48041357 N NA NA NA NA NA NA KIAA0146 131489 3789 chr8 49281907 49285671 49283935 N NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 360912 3790 chr8 49291678 49311212 49292851 N NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 370683 3791 chr8 49425214 49429048 49427033 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 504219 3792 chr8 49489945 49495440 49491254,49494026 N,N NA;NA NA SNAI2,UBE2V2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 568950 3793 chr8 49560195 49564092 49561885 N NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 639200 3794 chr8 49700425 49705446 49701357,49703276,49703337 N,N,N NA;NA;NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 779430 3795 chr8 49738680 49741594 49740117 N NA NA EFCAB1,SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 817685 3796 chr8 49745121 49747093 49746118,49746130 N,N NA;NA NA EFCAB1,SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 824126 3797 chr8 49837214 49839703 49838683 N NA NA NA NA NA NA UBE2V2 916219 3798 chr8 521173 534498 523453 N NA NA NA NA NA NA FBXO25 164365 3799 chr8 52884917 52888683 52886072 N NA NA NA NA NA NA PCMTD1 73182 3800 chr8 53338033 53343069 53339919 N NA NA NA NA NA NA RB1CC1 283957 3801 chr8 53378630 53381864 53379847 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 245162 3802 chr8 53898427 53901247 53899788 N NA NA NA NA NA NA OPRK1 262947 3803 chr8 54555011 54572094 54570101 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 183756 3804 chr8 54603879 54607566 54605842 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 148284 3805 chr8 55278377 55281400 55280105 N NA NA NA NA NA NA MRPL15 230596 3806 chr8 55294091 55295983 55294680 N NA NA NA NA NA NA MRPL15 246310 3807 chr8 58441070 58443916 58441887 N NA NA NA NA NA NA FAM110B 463197 3808 chr8 58455797 58471599 58457441,58461600,58471086 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM110B 435514 3809 chr8 58475349 58478993 58476894 N NA NA NA NA NA NA FAM110B 428120 3810 chr8 58497742 58501409 58499245 N NA NA NA NA NA NA FAM110B 405704 3811 chr8 58614271 58616535 58615401 N NA NA NA NA NA NA FAM110B 290578 3812 chr8 58657208 58662978 58658560,58660861 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM110B 244135 3813 chr8 58713704 58718752 58714950,58717111 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM110B 188361 3814 chr8 58766107 58770228 58767945 N NA NA NA NA NA NA FAM110B 136885 3815 chr8 58868835 58871798 58870083 N NA FAM110B NA NA NA NA FAM110B 35315 3816 chr8 59584190 59585476 59584505,59584754 N,N NA;NA NSMAF NSMAF,SDCBP K562 ChIA-PET 22265404 NSMAF 11786 3817 chr8 59670595 59673239 59672067 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 NSMAF 98191 3818 chr8 60627799 60631688 60630586 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 CA8 562266 3819 chr8 60794427 60796436 60794901 N NA NA NA NA NA NA CA8 397518 3820 chr8 61557487 61573274 61564897,61565560 N,N NA;NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 18050 3821 chr8 61810222 61814972 61812521 N NA NA CHD7,LOC100130298 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 218898 3822 chr8 61849358 61852409 61849980 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 258034 3823 chr8 61915889 61918828 61917266 Y CLVS1 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 324565 3824 chr8 61924389 61928261 61925867 N NA NA CHD7,RAB2A IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 333065 3825 chr8 61933808 61937734 61936372 N NA NA CHD7,RAB2A IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 342484 3826 chr8 70268708 70312726 70269413 N NA NA SULF1,C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO5A1 434573 3827 chr8 70761176 70788893 70767167,70786174 N,N NA;NA SLCO5A1 NA NA NA NA SLCO5A1 13877 3828 chr8 70802321 70807604 70804874 N NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 55022 3829 chr8 70905633 70908714 70907029 N NA NA NA NA NA NA SLCO5A1 158334 3830 chr8 71356272 71359706 71358051 N NA NCOA2 NCOA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA2 40252 3831 chr8 71366900 71369710 71368731 N NA NA NCOA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NCOA2 50880 3832 chr8 72318350 72323121 72318798 N NA NA NA NA NA NA LACTB2 736903 3833 chr8 72518171 72520764 72519466 N NA NA NA NA NA NA LACTB2 936724 3834 chr8 74090851 74093411 74091863 N NA NA NA NA NA NA RPL7 112458 3835 chr8 741566 745410 743086 N NA NA NA NA NA NA FBXO25 384758 3836 chr8 746944 750681 748785 N NA NA NA NA NA NA FBXO25 390136 3837 chr8 75316841 75324170 75318530 N NA NA NA NA NA NA GDAP1 54223 3838 chr8 75324828 75398519 75395167,75326076 N,N NA;NA NA TRIM37 MCF7 ChIA-PET 19890323 GDAP1 62210 3839 chr8 75423925 75430415 75425116 N NA NA NA NA NA NA GDAP1 161307 3840 chr8 75485315 75491454 75488486 N NA NA NA NA NA NA GDAP1 222697 3841 chr8 75860177 75862809 75860678 N NA CRISPLD1 NA NA NA NA CRISPLD1 33899 3842 chr8 76318705 76353305 76320751 N NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 421997 3843 chr8 76370097 76399295 76370640 N NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 473389 3844 chr8 77812980 77815923 77813841 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 219465 3845 chr8 78424759 78427339 78426013 N NA NA NA NA NA NA ZFHX4 831244 3846 chr8 78879521 78882506 78881787 N NA NA NA NA NA NA PKIA 545830 3847 chr8 79350493 79352648 79351579 N NA NA NA NA NA NA PKIA 75688 3848 chr8 79828717 79838583 79830431 N NA NA STMN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZC2HC1A 250435 3849 chr8 80791179 80793720 80792610 N NA NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 148786 3850 chr8 80801631 80804500 80803119 N NA NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 138006 3851 chr8 81152162 81154902 81153032 N NA NA TPD52,MRPS28,PAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52 68326 3852 chr8 81157555 81161410 81159666 N NA NA TPD52,PAG1,ZBTB10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52 73719 3853 chr8 81278587 81280866 81279582 N NA NA NA NA NA NA ZBTB10 117582 3854 chr8 81288617 81291101 81289863 Y ZBTB10 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 107347 3855 chr8 81300289 81303441 81301709 N NA NA NA NA NA NA ZBTB10 95007 3856 chr8 813656 816563 815589 N NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 456848 3857 chr8 81487919 81495358 81490099,81491536 N,N NA;NA NA ZBTB10,TPD52,PAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZBTB10 89471 3858 chr8 81509471 81512626 81511235 N NA NA NA NA NA NA ZBTB10 111023 3859 chr8 81805576 81807941 81806292 N NA ZNF704 NA NA NA NA ZNF704 18560 3860 chr8 81830151 81834552 81830906 N NA ZNF704 ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF704 43135 3861 chr8 81837332 81840030 81838909 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF704 50316 3862 chr8 82249281 82251945 82250614 N NA NA NA NA NA NA PAG1 224978 3863 chr8 82480379 82483539 82481868 N NA NA FABP5 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA1 115050 3864 chr8 82901801 82904259 82902866 N NA NA NA NA NA NA SNX16 147280 3865 chr8 83038556 83040852 83039681 N NA NA NA NA NA NA SNX16 284035 3866 chr8 8318191 8320606 8318934 N NA NA SGK223 IMR90 Hi-C 24141950 TNKS 1092839 3867 chr8 83203091 83205254 83203784 N NA NA NA NA NA NA SNX16 448570 3868 chr8 84438076 84442313 84439723 N NA NA NA NA NA NA SNX16 1683555 3869 chr8 851033 852927 852159 N NA NA NA NA NA NA FBXO25 494225 3870 chr8 8512375 8515846 8514097 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 TNKS 897599 3871 chr8 855642 1072278 858502,932918,935444 N,N,N NA;NA;NA NA DLGAP2,MYOM2,ZNF596 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 498834 3872 chr8 8820356 8823948 8821425 N NA NA MFHAS1,CLDN23,FLJ10661,SGK223 IMR90 Hi-C 24141950 TNKS 589497 3873 chr8 8958743 8961965 8960238 N NA NA ERI1,TNKS,LOC157273 IMR90 Hi-C 24141950 TNKS 451480 3874 chr8 90318145 90321472 90320153 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 448503 3875 chr8 90483207 90486013 90484420 N NA NA NA NA NA NA RIPK2 283962 3876 chr8 9369341 9371821 9370693,9370676 N,N NA;NA TNKS NA NA NA NA TNKS 41624 3877 chr8 94236636 94241433 94238559 N NA NA NA NA NA NA C8orf83 258264 3878 chr8 94879948 94883623 94882088 N NA PDP1 TMEM67,MIR378D2,PDP1,FAM92A1,C8orf39,RBM12B IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 45460 3879 chr8 94968485 94971947 94970035 N NA PDP1 RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDP1 39402 3880 chr8 95002381 95005677 95003889 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 73298 3881 chr8 96001755 96017369 96003399,96009475 N,N NA;NA C8orf38 CCNE2,C8orf37,LOC100616530,PLEKHF2,C8orf69,TP53INP1,MIR3150B,MIR3150A,C8orf38 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C8orf38 19845 3882 chr8 96107693 96118208 96108714,96113009 N,N NA;NA PLEKHF2 MIR3150A,MIR3150B,C8orf38,C8orf69,PLEKHF2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHF2 27741 3883 chr8 96122991 96127725 96124912 N NA PLEKHF2 PLEKHF2,C8orf69,C8orf38,C8orf37,MIR3150A,MIR3150B,LOC100616530 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHF2 18224 3884 chr8 97421665 97423490 97422104,97422404 N,N NA;NA NA CPQ,TSPYL5 IMR90 Hi-C 24141950 PTDSS1 147498 3885 chr8 98243166 98245837 98244765 N NA NA PTDSS1,CPQ,SDC2,TSPYL5 IMR90 Hi-C 24141950 MTDH 410570 3886 chr8 9896 27543 20049,23391 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF596 154657 3887 chr8 99317294 99319082 99318469 N NA NIPAL2 NIPAL2,KCNS2,STK3,POP1 IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL2 10673 3888 chr8 99382920 99387986 99386773 N NA NA STK3,NIPAL2,POP1,VPS13B IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL2 76299 3889 chr9 100563681 100568810 100565814 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 103990 3890 chr9 102020589 102023217 102021891 Y NA ALG2,SEC61B ALG2,SEC61B,NR4A3,LOC441461,STX17,ERP44,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC61B 36019 3891 chr9 103172897 103175560 103174083 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 57638 3892 chr9 103187911 103189670 103189083 N NA NA C9orf30-TMEFF1,NR4A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 72652 3893 chr9 104211168 104212228 104211687 N NA NA RNF20,ALDOB IMR90 Hi-C 24141950 ZNF189 50005 3894 chr9 104718925 104721712 104720236 N NA NA NA NA NA NA RNF20 422792 3895 chr9 104741851 104744592 104742897 N NA NA NA NA NA NA RNF20 445718 3896 chr9 104966429 104970339 104968336 N NA NA NA NA NA NA RNF20 670296 3897 chr9 105011226 105014951 105012919,105011346 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RNF20 715093 3898 chr9 105274995 105278365 105276996 N NA NA NA NA NA NA RNF20 978862 3899 chr9 105282842 105284703 105283724 N NA NA NA NA NA NA RNF20 986709 3900 chr9 106026860 106030167 106028315 N NA NA NA NA NA NA SMC2 826374 3901 chr9 107729858 107732077 107730697 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 NIPSNAP3A 219889 3902 chr9 107752214 107754916 107753782 N NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NIPSNAP3A 242245 3903 chr9 107826050 107828625 107827375 N NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 NIPSNAP3A 316081 3904 chr9 108719978 108723052 108721975 N NA NA NA NA NA NA TMEM38B 263153 3905 chr9 109398699 109404622 109402467 N NA NA NA NA NA NA ZNF462 220756 3906 chr9 109421539 109434831 109432697 N NA NA MIR548Q IMR90 Hi-C 24141950 ZNF462 190547 3907 chr9 109495102 109497616 109496364 N NA NA NA NA NA NA ZNF462 127762 3908 chr9 110017721 110019130 110018367 N NA RAD23B ZNF462,RAD23B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAD23B 26387 3909 chr9 110145657 110152815 110147116 N NA NA NA NA NA NA KLF4 99232 3910 chr9 110194321 110205129 110195405,110202575 N,N NA;NA KLF4 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 46918 3911 chr9 110221465 110224491 110222600 N NA KLF4 NA NA NA NA KLF4 27556 3912 chr9 110265567 110273046 110267153 Y NA KLF4 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 13520 3913 chr9 110348766 110351571 110350006 N NA NA PRR11,SKA2 MCF7 ChIA-PET 19890323 KLF4 96719 3914 chr9 110359546 110361207 110360269 N NA NA NA NA NA NA KLF4 107499 3915 chr9 110398963 110401889 110400326 N NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF4 146916 3916 chr9 110460584 110461731 110461066 N NA NA NA NA NA NA KLF4 208537 3917 chr9 110815206 110817150 110816128 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 KLF4 563159 3918 chr9 110835980 110838167 110837104 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF4 583933 3919 chr9 111032914 111036033 111034447 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKBKAP 660575 3920 chr9 111055767 111058143 111057006 N NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 IKBKAP 638465 3921 chr9 112090731 112095279 112091960,112093802 Y,N PTPN3;NA NA EPB41L4B,C9orf4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C9orf5 208506 3922 chr9 112265803 112271901 112268669 N NA NA PTPN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PALM2-AKAP2 270676 3923 chr9 112352168 112354998 112353732 N NA NA PALM2-AKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 PALM2-AKAP2 187579 3924 chr9 113587714 113590409 113589129 N NA NA LPAR1,OR2K2,MUSK IMR90 Hi-C 24141950 TXN 568794 3925 chr9 114636965 114639636 114638122 N NA UGCG UGCG MCF7 ChIA-PET 22265404 UGCG 19570 3926 chr9 115826973 115828276 115827412 N NA ZFP37 NA NA NA NA ZFP37 7977 3927 chr9 116411077 116422868 116413161 N NA NA C9orf43,RGS3,ALAD,RNF183,WDR31,CDC26,SLC31A1,PRPF4,POLE3,HDHD3,BSPRY IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLE3 238048 3928 chr9 116879379 116883106 116880764 N NA KIF12 COL27A1,KIF12,AMBP,ORM1,AKNA,ORM2,ZNF618 IMR90 Hi-C 24141950 KIF12 18042 3929 chr9 117319734 117322311 117320759 N NA ATP6V1G1 DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1G1 27683 3930 chr9 118245524 118248649 118246965 N NA NA DEC1,TNC IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 677116 3931 chr9 118255724 118261580 118258140,118260719 N,N NA;NA NA TNC,DEC1,TNFSF15 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 687316 3932 chr9 11893914 11895901 11894847 N NA NA NA NA NA NA LURAP1L 879111 3933 chr9 120308143 120310659 120309469 N NA NA NA NA NA NA TRIM32 858562 3934 chr9 120717233 120721517 120719708 N NA NA NA NA NA NA TRIM32 1267652 3935 chr9 122156144 122158594 122157284 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1183843 3936 chr9 122317922 122319925 122318742 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1022512 3937 chr9 122518278 122521836 122520651 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 820601 3938 chr9 122563516 122565907 122565022 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 776530 3939 chr9 122913751 122916273 122914944 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 426164 3940 chr9 125210121 125211818 125210804 N NA NA PTGS1,RBM18,TTLL11 IMR90 Hi-C 24141950 RBM18 182978 3941 chr9 126089206 126091944 126089796 N NA NA STRBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR600HG 211450 3942 chr9 126109527 126110905 126110395 N NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR600HG 231771 3943 chr9 126707000 126709834 126708330 N NA NA DENND1A,LHX2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129034 405918 3944 chr9 126982130 126986958 126983511,126985861 Y,N DENND1A;NA NA DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129034 128794 3945 chr9 128907640 128909746 128908972 Y NA NA PBX3,MAPKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MAPKAP1 438127 3946 chr9 12907748 12910913 12909114 N NA NA LURAP1L IMR90 Hi-C 24141950 LURAP1L 132736 3947 chr9 13069421 13072760 13070771 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 177605 3948 chr9 13081672 13084917 13083255 N NA NA NA NA NA NA MPDZ 165448 3949 chr9 131176404 131180673 131178427 N NA URM1,CERCAM,ODF2 URM1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CERCAM 2086 3950 chr9 132123319 132126406 132124692 Y NA C9orf106 LOC100506190,PHYHD1,SH3GLB2,DOLPP1,CRAT,PPP2R4,IER5L,C9orf50 MCF7,HELA,K562,GM12878,H1ESC,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 C9orf106 40024 3951 chr9 132142815 132149049 132145400 N NA NA LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 C9orf106 59520 3952 chr9 132174017 132178816 132176107 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 72123 3953 chr9 132191502 132197235 132191551,132195004 N,N NA;NA NA C9orf106,C9orf50,PPP2R4,LOC100506190,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 53704 3954 chr9 132198377 132202146 132199444 N NA LOC100506190 C9orf50,PPP2R4,LOC100506190,IER5L,C9orf106,METTL11A,ASB6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 48793 3955 chr9 132204029 132208049 132205484 N NA LOC100506190 C9orf50,PPP2R4,LOC100506190,IER5L,C9orf106,METTL11A,ASB6,TOR1B,CRAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 42890 3956 chr9 132213054 132215442 132213965 N NA LOC100506190 METTL11A,PPP2R4,CRAT,ASB6,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506190 35497 3957 chr9 132219013 132229229 132223043 N NA LOC100506190 PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190,PRRX2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 21710 3958 chr9 132238929 132242788 132241575 Y NA LOC100506190 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506190 8151 3959 chr9 132523286 132525557 132524223 N NA PTGES,TOR1B PPP2R4,METTL11A,C9orf50,ASB6,PRRX2,PTGES,TOR1B,TOR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTGES 7942 3960 chr9 133030269 133033596 133031253 N NA NA NCS1,GPR107,FNBP1,USP20,FUBP3,TOR1A,C9orf78,ASS1,LOC100272217,PRDM12 IMR90 Hi-C 24141950 FNBP1 224796 3961 chr9 133049349 133050773 133049945 N NA NA FNBP1,GPR107,NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 FNBP1 243876 3962 chr9 133408348 133412099 133411389 N NA LOC100272217,FUBP3 ASS1,FUBP3,GPR107,LOC100272217,PRDM12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100272217 42782 3963 chr9 134224012 134231108 134225377 N NA NA PRRC2B,LAMC3,AIF1L,NUP214,FAM78A,POMT1,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 74369 3964 chr9 134239591 134250797 134243204,134248881 N,Y NA;AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 54680 3965 chr9 134257903 134263914 134258820 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 41563 3966 chr9 134267678 134269934 134268832 N NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 35543 3967 chr9 135016506 135018077 135017047 N NA NTNG2 MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 19257 3968 chr9 13606101 13609206 13607418 N NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 355736 3969 chr9 136158472 136160470 136159405 N NA SURF6 OBP2B,ABO,SURF6,SURF2,SURF4,SURF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SURF6 42577 3970 chr9 136474968 136476199 136475417 N NA FAM163B C9orf96,SURF4,VAV2,TMEM8C,ADAMTSL2,DBH,SARDH IMR90 Hi-C 24141950 FAM163B 29600 3971 chr9 137099766 137103971 137102930 N NA NA NA NA NA NA WDR5 98556 3972 chr9 137105889 137109114 137107848 N NA NA BRD3,RNU6ATAC,RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR5 104679 3973 chr9 137177824 137179454 137178663 N NA RXRA RXRA,COL5A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RXRA 38862 3974 chr9 137365937 137368946 137367415 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 147621 3975 chr9 137425335 137427861 137426748 N NA NA UBE2D2 MCF7 ChIA-PET 19890323 RXRA 207019 3976 chr9 138166792 138168367 138167629 N NA NA PAEP,OLFM1,LOC100506599,LOC100130954 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506599 195728 3977 chr9 138172944 138174967 138174120 N NA NA PAEP,OLFM1,LOC100506599,LOC100130954 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506599 189128 3978 chr9 138179650 138182641 138181269 N NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506599 181454 3979 chr9 138285070 138286750 138285661 Y NA NA OLFM1,LOC100506599,PPP1R26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506599 77345 3980 chr9 138331840 138332835 138332535 N NA LOC100506599 OLFM1,LOC100506599 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506599 31260 3981 chr9 139157892 139163078 139159213 N NA NA QSOX2,LHX3,C9orf69 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CARD9 105055 3982 chr9 139519106 139522252 139521382 N NA NA MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7,GPSM1,DNLZ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNHG7 100384 3983 chr9 139589079 139591193 139590078 N NA SNHG7 AGPAT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNHG7 31443 3984 chr9 14025144 14031806 14027347,14030384 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 661674 3985 chr9 14424497 14439480 14433810,14437681 N,Y NA;NA NA LURAP1L,NFIB,MPDZ,FLJ41200 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 254000 3986 chr9 14451478 14454446 14453017 N NA NA FLJ41200,NFIB IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 239034 3987 chr9 14465255 14467739 14466806 N NA NA FLJ41200 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC21 225741 3988 chr9 14476996 14479385 14478261 Y NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 214095 3989 chr9 15055121 15057358 15055907 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 361641 3990 chr9 16266675 16268906 16267694 N NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 PSIP1 755672 3991 chr9 16897948 16901714 16899760 N NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 233324 3992 chr9 18392498 18395487 18393880 N NA NA ADAMTSL1,FAM154A IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 78592 3993 chr9 19180179 19184884 19182795 N NA NA HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 52575 3994 chr9 19191441 19276104 19192757,19202157,19230066,19232928,19234590,19205173,19208673,19226625 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA DENND4C DENND4C,PLIN2,ACER2,HAUS6,RPS6 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 14645 3995 chr9 19796208 19799632 19797406 N NA SLC24A2 SLC24A2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC24A2 9191 3996 chr9 19924919 19927998 19926312 N NA NA KIAA1797,MLLT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC24A2 137902 3997 chr9 20136829 20138562 20137649 N NA NA NA NA NA NA SLC24A2 349812 3998 chr9 20143280 20145291 20144393 N NA NA MLLT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC24A2 356263 3999 chr9 20197431 20200400 20198491 N NA NA NA NA NA NA SLC24A2 410414 4000 chr9 2240926 2244390 2242032 Y NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020,SMARCA2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA2 225584 4001 chr9 22536607 22540539 22537802 N NA NA NA NA NA NA MTAP 733972 4002 chr9 2291166 2293936 2292462 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 275824 4003 chr9 22953116 22956392 22955250 N NA NA NA NA NA NA ELAVL2 869671 4004 chr9 2296871 2300992 2298814 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 281529 4005 chr9 23594631 23600848 23598438 N NA NA NA NA NA NA ELAVL2 225215 4006 chr9 2379509 2384156 2381999 N NA NA NA NA NA NA VLDLR 237637 4007 chr9 2415774 2428626 2427654 N NA NA VLDLR,FLJ35024 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 193167 4008 chr9 24373627 24376353 24374424 N NA NA NA NA NA NA ELAVL2 547564 4009 chr9 24379217 24384367 24382076 N NA NA NA NA NA NA ELAVL2 553154 4010 chr9 2447182 2492874 2485038,2466839,2478030,2491809 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA VLDLR,FLJ35024,KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 128919 4011 chr9 25463604 25484856 25465095 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 1407970 4012 chr9 25536689 25594184 25538167 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 1298642 4013 chr9 25600647 25615829 25602523 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 1276997 4014 chr9 26772197 26774533 26773273 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 118293 4015 chr9 26780177 26785126 26782453 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 107700 4016 chr9 26787769 26790643 26789666 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 102183 4017 chr9 26799257 26804186 26801149 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 88640 4018 chr9 28955500 28957311 28956270 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 1381636 4019 chr9 31345764 31348637 31347228 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 1177685 4020 chr9 3171620 3182487 3181416 N NA NA NA NA NA NA KIAA0020 327490 4021 chr9 32942091 32951803 32950907 N NA APTX ACO1,NDUFB6 IMR90 Hi-C 24141950 APTX 49836 4022 chr9 33413796 33417066 33415770 N NA AQP3 NFX1,AQP7,AQP3,NOL6,CHMP5,BAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AQP3 30565 4023 chr9 35961443 35963929 35962548 N NA NA C9orf128 IMR90 Hi-C 24141950 FP588 101172 4024 chr9 37054809 37057569 37056219 N NA PAX5,LOC100506710 ZCCHC7,PAX5,LOC100506710 IMR90 Hi-C 24141950 PAX5 20333 4025 chr9 37602039 37604324 37602946 N NA FBXO10,TOMM5 NA NA NA NA TOMM5 9403 4026 chr9 3793014 3795126 3794198 N NA NA GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 RFX3 267031 4027 chr9 38362033 38363999 38363044 N NA ALDH1B1 FRMPD1,POLR1E,ZBTB5,DCAF10,MCART1,SHB,ALDH1B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALDH1B1 28662 4028 chr9 38436251 38449109 38437564 N NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 43590 4029 chr9 38472875 38481623 38474607 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 80214 4030 chr9 38671367 38674210 38672480 N NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 51007 4031 chr9 38686103 38690963 38687740,38689805 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 65743 4032 chr9 39759606 39778149 39761776,39777075 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 1139246 4033 chr9 42238793 42269310 42251431,42253724 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MGC21881 283717 4034 chr9 42923823 42925694 42924817 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L2 206589 4035 chr9 44004372 44006505 44005644 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 983731 4036 chr9 44113402 44131228 44118850 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 859008 4037 chr9 44175568 44178272 44177078 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 811964 4038 chr9 4421240 4423113 4422377 N NA NA SLC1A1 IMR90 Hi-C 24141950 PPAPDC2 239185 4039 chr9 44244132 44247786 44245766 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 742450 4040 chr9 44878062 44880631 44879084 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 109605 4041 chr9 45350083 45359934 45352213,45358814,45356514 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27C 359847 4042 chr9 45435800 45509292 45437085,45439833,45442186 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM27A 217737 4043 chr9 46111190 46216549 46113169 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 384161 4044 chr9 46389597 46393073 46391163 N NA NA NA NA NA NA KGFLP1 294493 4045 chr9 5842287 5845358 5843737 N NA NA ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA2026 162645 4046 chr9 6078577 6081922 6080370 N NA NA NA NA NA NA RANBP6 62937 4047 chr9 66259408 66261700 66260433 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 2192675 4048 chr9 66351775 66354316 66353074 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 2100059 4049 chr9 66454539 66460230 66458560 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1994145 4050 chr9 66551825 66570093 66553854 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1884282 4051 chr9 6679384 6685815 6681377 Y UHRF2,KDM4C NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 71826 4052 chr9 66857520 66863440 66858359,66862437 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 1590935 4053 chr9 66957057 66970442 66957718 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 1483933 4054 chr9 6702724 6708738 6704280 N NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 48903 4055 chr9 6713632 6717866 6716125 N NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 39775 4056 chr9 68298349 68316469 68299656 Y NA NA NA NA NA NA LOC642236 137906 4057 chr9 68375986 68392238 68377354,68383803 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642236 62137 4058 chr9 68512157 68514259 68513022 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 57782 4059 chr9 69482114 69483919 69482279 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 279910 4060 chr9 69490617 69493290 69491612 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 288413 4061 chr9 69722108 69726874 69724595 N NA NA NA NA NA NA FOXD4L6 519904 4062 chr9 70607322 70664507 70621258,70646592 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CBWD3 192332 4063 chr9 73032691 73039890 73034636 Y SMC5,KLF9 NA TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMC5 158813 4064 chr9 73093421 73097446 73095610,73094098 N,N NA;NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMC5 219543 4065 chr9 73106509 73109303 73107760 N NA NA SMC5,TRPM3,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 SMC5 232631 4066 chr9 73794513 73808160 73806269 N NA NA TRPM3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM2 575640 4067 chr9 73816990 73866089 73818463,73847817,73864049,73840688,73849874 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA TRPM3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM2 517711 4068 chr9 74027242 74062662 74061810 N NA NA NA NA NA NA TMEM2 321138 4069 chr9 74397465 74399469 74398235 Y TMEM2 TMEM2 TMEM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM2 13665 4070 chr9 74910583 74914214 74912720 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND5 65949 4071 chr9 74929108 74932446 74930717 N NA ZFAND5 TMC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 47717 4072 chr9 75091645 75095317 75093327 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND5 111482 4073 chr9 75598629 75602212 75599966 N NA ALDH1A1 ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 30396 4074 chr9 75746171 75748340 75747441 Y ANXA1 NA ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 177938 4075 chr9 75814373 75816999 75815839 N NA NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 246140 4076 chr9 75940674 75943758 75942266 N NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 372441 4077 chr9 76128788 76132572 76130437 N NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 560555 4078 chr9 76161150 76165453 76163305 N NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 592917 4079 chr9 76453299 76455746 76454473 N NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 885066 4080 chr9 76813884 76816129 76815009 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 751673 4081 chr9 76971046 76974550 76972659 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 593252 4082 chr9 79200394 79205185 79201744 N NA NA PRUNE2 IMR90 Hi-C 24141950 RPSAP9 186879 4083 chr9 79551763 79559357 79558252 N NA PRUNE2 PRUNE2,FOXB2 IMR90 Hi-C 24141950 PRUNE2 30760 4084 chr9 79570786 79596898 79572711 N NA PRUNE2 PRUNE2,FOXB2,PCA3 IMR90 Hi-C 24141950 PRUNE2 49783 4085 chr9 80985617 80988266 80986542 N NA NA NA NA NA NA VPS13A 1193256 4086 chr9 81081690 81085021 81083301 N NA NA NA NA NA NA VPS13A 1289329 4087 chr9 82588710 82618825 82605579,82591091 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VPS13A 2796349 4088 chr9 84003973 84007033 84005981 N NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf103 2231000 4089 chr9 84946005 84948396 84947163 N NA NA NA NA NA NA C9orf103 1289637 4090 chr9 85833621 85835552 85834524 N NA NA NA NA NA NA C9orf103 402481 4091 chr9 86675785 86677862 86676767 N NA NA NA NA NA NA RMI1 80148 4092 chr9 86715257 86717182 86715887 N NA NA SLC28A3,C9orf64 IMR90 Hi-C 24141950 RMI1 119620 4093 chr9 86753529 86755440 86754496 N NA NA HNRNPK,RMI1,C9orf64,SLC28A3 IMR90 Hi-C 24141950 RMI1 157892 4094 chr9 88135509 88138605 88137210 Y NA NA NTRK2 IMR90 Hi-C 24141950 AGTPBP1 218339 4095 chr9 88740876 88744086 88742417 N NA GOLM1 C9orf153,GOLM1,ISCA1 IMR90 Hi-C 24141950 GOLM1 25760 4096 chr9 88976068 88979893 88977321 N NA ZCCHC6 ZCCHC6,DAPK1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC6 6666 4097 chr9 89017432 89024378 89020175 N NA ZCCHC6 GAS1,DAPK1,ZCCHC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC6 48030 4098 chr9 89190702 89192754 89191639 N NA NA NA NA NA NA ZCCHC6 221300 4099 chr9 89199937 89201691 89200870 N NA NA NA NA NA NA ZCCHC6 230535 4100 chr9 89951234 89953312 89952628 N NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTSL1 387662 4101 chr9 90009907 90013183 90011199 N NA NA LOC440173,DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSL1 327791 4102 chr9 90037155 90039273 90038090 N NA NA NA NA NA NA CTSL1 301701 4103 chr9 90431150 90434493 90431858 N NA NA DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSL1 90176 4104 chr9 90689162 90692675 90691311 N NA NA SPIN1,NXNL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPIN1 310622 4105 chr9 91547098 91549502 91547888 N NA NA LOC286238,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 376611 4106 chr9 92687571 92690480 92689110 N NA NA GADD45G,SYK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GADD45G 467644 4107 chr9 92756312 92758967 92757487 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 536385 4108 chr9 92928453 92929598 92928975 N NA NA SYK IMR90 Hi-C 24141950 DIRAS2 475510 4109 chr9 92988009 92992138 92990004 N NA NA NA NA NA NA DIRAS2 412970 4110 chr9 93700332 93702904 93701766 N NA NA AUH,ROR2,SPTLC1 IMR90 Hi-C 24141950 DIRAS2 295224 4111 chr9 93796702 93801393 93800156 N NA NA NFIL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 AUH 322813 4112 chr9 93858597 93863982 93862668 Y SYK,SYK,NFIL3 NA ROR2,AUH,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 260224 4113 chr9 93898010 93923289 93922037 N NA NA LOC100129316,AUH,NFIL3,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 200917 4114 chr9 96654509 96657676 96656441 N NA NA MIR4291,WNK2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF169 363902 4115 chr9 96746405 96748656 96747354 N NA NA PHF2,PTPDC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF169 272922 4116 chr9 97430566 97435379 97431637 N NA FBP1 FANCC,FBP1,C9orf3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBP1 28035 4117 chr9 98323381 98325008 98324404 N NA PTCH1 C9orf102,FBP1,FANCC,LOC158435,SLC35D2 IMR90 Hi-C 24141950 PTCH1 44134 4118 chr9 98458149 98462416 98459161 N NA NA LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf102 175484 4119 chr9 98533118 98537097 98534605 N NA NA LOC158435,LINC00476,C9orf102,FANCC,LINC00092,PTCH1,LOC158434,HSD17B3 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf102 100803 4120 chr9 98802294 98804442 98803316 N NA NA FANCC,PTCH1,C9orf102,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 164035 4121 chr9 98809422 98812629 98811371 Y NA NA FANCC,PTCH1,C9orf102,LOC158434,LINC00092,LOC158435 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 171163 4122 chr9 98898999 98900691 98899711 Y CDC14B NA FBP1,C9orf102,PTCH1,LOC158435,LOC158434,LINC00092,FANCC IMR90 Hi-C 24141950 SLC35D2 245301 4123 chr9 99446743 99479149 99449274,99469211 N,N NA;NA NA SLC35D2,LOC441455,BDAG1,HSD17B3,ZNF510 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF510 61179 4124 chrX 103023732 103028174 103024994 N NA NA LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1 IMR90 Hi-C 24141950 MORF4L2 80646 4125 chrX 105361332 105365056 105363323 N NA MUM1L1 NA NA NA NA MUM1L1 47242 4126 chrX 105636620 105639631 105638109 N NA NA NA NA NA NA MUM1L1 224322 4127 chrX 106915656 106921627 106920321 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSMD10 413247 4128 chrX 110860729 110863812 110861084 N NA NA NA NA NA NA ALG13 60534 4129 chrX 114264118 114265936 114265168 N NA NA NA NA NA NA ALG13 3339772 4130 chrX 114959561 115010778 115005757 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 3359433 4131 chrX 115039224 115086760 115066834,115085496 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PGRMC1 3283451 4132 chrX 115235483 115237034 115235655 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 3133177 4133 chrX 115370685 115373010 115371542 Y NA NA SLC6A14 MCF7 ChIA-PET 22265404 PGRMC1 2997201 4134 chrX 11952363 11955558 11953306 N NA NA NA NA NA NA MSL3 176085 4135 chrX 119618772 119623232 119619886 N NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 15568 4136 chrX 122646709 122649205 122648211 N NA NA NA NA NA NA THOC2 217699 4137 chrX 122877608 122880826 122879502 N NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 10704 4138 chrX 122897464 122900578 122898935 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 30560 4139 chrX 122903935 122909003 122905412 N NA THOC2 STAG2,THOC2,XIAP K562,HELA,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 THOC2 37031 4140 chrX 122909551 122916991 122911610,122913986 N,N NA;NA THOC2 XIAP,THOC2,STAG2 IMR90,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 THOC2 42647 4141 chrX 123350661 123353535 123351662 N NA NA NA NA NA NA STAG2 256186 4142 chrX 1245670 1247655 1246782 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 263384 4143 chrX 125605601 125608285 125606224 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2511126 4144 chrX 127569100 127572250 127570884 N NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1085210 4145 chrX 128302003 128328120 128326820,128322816 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SMARCA1 329340 4146 chrX 128535861 128539836 128538397 N NA NA NA NA NA NA SMARCA1 117624 4147 chrX 128542306 128544777 128544384 N NA NA NA NA NA NA SMARCA1 112683 4148 chrX 128793956 128797507 128795497 N NA NA ZDHHC9 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA1 136496 4149 chrX 128805902 128814372 128812111 N NA NA ZDHHC9,XPNPEP2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA1 148442 4150 chrX 129085562 129092633 129091380 N NA UTP14A,BCORL1 UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 UTP14A 45465 4151 chrX 129094316 129097372 129095379 N NA BCORL1 UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 BCORL1 41792 4152 chrX 129113870 129116337 129114958 N NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 22827 4153 chrX 129727187 129729960 129728609 N NA NA NA NA NA NA RBMX2 191244 4154 chrX 130085508 130094596 130093130 N NA NA NA NA NA NA RBMX2 549565 4155 chrX 13015483 13017633 13016545 N NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22257 4156 chrX 13018953 13022761 13020786 Y TLR7 TMSB4X TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 25727 4157 chrX 13128043 13129804 13129343 N NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 134817 4158 chrX 13136367 13139288 13138331 Y NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 143141 4159 chrX 13220167 13223205 13221635 N NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 226941 4160 chrX 132305832 132309412 132306666 N NA NA NA NA NA NA PHF6 1197930 4161 chrX 134539918 134541099 134540525 N NA NA NA NA NA NA ZNF449 61222 4162 chrX 13516398 13519252 13518030 N NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB9A 187988 4163 chrX 135990229 136003299 135991913 N NA RBMX RBMX K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBMX 27290 4164 chrX 138422708 138425670 138424122,138424523 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FGF13 135523 4165 chrX 139014210 139017033 139015760 N NA NA MIR505,ATP11C MCF7 ChIA-PET 22265404 FGF13 727025 4166 chrX 140901184 140902986 140902141 N NA NA NA NA NA NA LDOC1 629874 4167 chrX 149714982 149718072 149716299 N NA NA MAMLD1,MTM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100272228 608216 4168 chrX 152065198 152073004 152066685 N NA NA CETN2,NSDHL,ZNF185 MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 65687 4169 chrX 152639677 152643460 152641004 N NA NA NA NA NA NA SLC6A8 310292 4170 chrX 152646729 152648196 152647521 N NA NA NA NA NA NA SLC6A8 305556 4171 chrX 152875342 152876916 152875843 N NA NA FAM58A IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A8 76836 4172 chrX 15926036 15928958 15926932 N NA NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 ZRSR2 117462 4173 chrX 16132021 16136152 16133753 N NA GRPR AP1S2,GRPR,CTPS2,S100G IMR90 Hi-C 24141950 GRPR 5272 4174 chrX 16387453 16390508 16388899 N NA NA NA NA NA NA GRPR 246029 4175 chrX 16401906 16405828 16403747 N NA NA GRPR IMR90 Hi-C 24141950 GRPR 260482 4176 chrX 16491990 16494001 16492755 Y NA NA CTPS2,GRPR IMR90 Hi-C 24141950 CTPS2 237058 4177 chrX 16899923 16902609 16901202 N NA RBBP7 RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 11389 4178 chrX 17365540 17367668 17366413 N NA NA NA NA NA NA SCML1 387924 4179 chrX 17939102 17942058 17941013 N NA NA NA NA NA NA SCML1 183510 4180 chrX 17985243 17987659 17986218 N NA NA NA NA NA NA SCML1 229651 4181 chrX 18025973 18030074 18028555 N NA NA NA NA NA NA SCML1 270381 4182 chrX 18042653 18045447 18044093 N NA NA NA NA NA NA SCML1 287061 4183 chrX 18111403 18115453 18113966 N NA NA NA NA NA NA SCML1 355811 4184 chrX 18116256 18120254 18117532 N NA NA NA NA NA NA SCML1 360664 4185 chrX 19231548 19236927 19232777,19235626 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PDHA1 125084 4186 chrX 19352949 19356385 19354890 N NA PDHA1 PPEF1,PHKA2,GPR64 IMR90 Hi-C 24141950 PDHA1 5626 4187 chrX 20380227 20382235 20381292 N NA NA RPS6KA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPS6KA3 95477 4188 chrX 23677567 23679035 23678542 N NA PRDX4 PRDX4 IMR90 Hi-C 24141950 PRDX4 6610 4189 chrX 26542779 26545405 26544101 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 2060276 4190 chrX 26766242 26767914 26767077 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1837767 4191 chrX 27535263 27538005 27536099 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1067676 4192 chrX 30635000 30637432 30636123 N NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 2029319 4193 chrX 30648203 30649237 30648608 N NA NA GK IMR90 Hi-C 24141950 IL1RAPL1 2042522 4194 chrX 36551339 36555320 36553099 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 2105365 4195 chrX 36866538 36868897 36867698 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 1791788 4196 chrX 37721784 37724659 37723133 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 936026 4197 chrX 3837899 3855847 3853951 N NA NA NA NA NA NA LOC389906 75964 4198 chrX 39194289 39199498 39196255 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 533604 4199 chrX 39377831 39379000 39378277 N NA NA NA NA NA NA BCOR 657582 4200 chrX 39472494 39473481 39473112 N NA NA NA NA NA NA BCOR 563101 4201 chrX 39546425 39550171 39548316 N NA NA NA NA NA NA BCOR 486411 4202 chrX 39671897 39674798 39673223 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 361784 4203 chrX 39678249 39684869 39680522 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 351713 4204 chrX 39688043 39691610 39689907 N NA NA NA NA NA NA BCOR 344972 4205 chrX 39723880 39726829 39725175 N NA NA NA NA NA NA BCOR 309753 4206 chrX 39734473 39738137 39736023 N NA NA NA NA NA NA BCOR 298445 4207 chrX 39752245 39756746 39754695 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 279836 4208 chrX 39763877 39766536 39765049 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 270046 4209 chrX 39812293 39814365 39813338 N NA NA BCOR MCF7 ChIA-PET 22265404 BCOR 222217 4210 chrX 39861647 39877242 39872673 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 159340 4211 chrX 40125305 40129606 40126288 N NA NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 88723 4212 chrX 40326198 40329541 40327820,40328899 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CXorf38 177278 4213 chrX 40332670 40335050 40333562 N NA NA BCOR MCF7 ChIA-PET 22265404 CXorf38 171769 4214 chrX 40376123 40379677 40378009 N NA NA NA NA NA NA CXorf38 127142 4215 chrX 40749766 40750830 40750807 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 154962 4216 chrX 40860261 40862819 40861457 N NA NA MED14,USP9X IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 82069 4217 chrX 40868283 40871367 40869502,40871273 Y,N USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14;NA NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73521 4218 chrX 41132193 41137876 41135453 N NA NA DDX3X,USP9X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 54775 4219 chrX 41300495 41303012 41301624 Y NA NA DDX3X K562 ChIA-PET 22265404 DDX3X 107844 4220 chrX 42144065 42146049 42144383 N NA NA NA NA NA NA DDX3X 951414 4221 chrX 42691606 42694876 42693104 N NA NA NA NA NA NA MAOA 820533 4222 chrX 43473999 43476435 43474845 N NA MAOA NA NA NA NA MAOA 38974 4223 chrX 44507106 44510189 44508572 N NA NA NA NA NA NA FUNDC1 104885 4224 chrX 46636967 46638868 46637743 N NA SLC9A7 RP2,CHST7,SLC9A7,PHF16,CXorf31 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A7 18495 4225 chrX 46650323 46653242 46652152 N NA SLC9A7 RP2,CXorf31,PHF16,SLC9A7,CHST7,ZNF674,LOC401588 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A7 31851 4226 chrX 46762505 46765361 46763218 N NA PHF16 PHF16 IMR90 Hi-C 24141950 PHF16 6375 4227 chrX 47219885 47223451 47221403 N NA NA USP11,ZNF157,UBA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF41 118894 4228 chrX 47368649 47376671 47373115 N NA ZNF41,ARAF CDK16,USP11,UBA1,ARAF,SYN1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 26304 4229 chrX 47382194 47385643 47382951 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 34856 4230 chrX 47399010 47402190 47400754 N NA ARAF ELK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARAF 18309 4231 chrX 48594222 48597560 48595900 N NA NA SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PQBP1 157635 4232 chrX 49395997 49397475 49396265 N NA NA NA NA NA NA SYP 339336 4233 chrX 49968360 49971360 49969198 N NA NA NA NA NA NA SYP 911699 4234 chrX 52002808 52006326 52005018 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 456653 4235 chrX 53798318 53799604 53798577 N NA NA NA NA NA NA HUWE1 84645 4236 chrX 54664274 54667928 54666041 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 107630 4237 chrX 55533370 55535916 55534675 N NA USP51 NA NA NA NA USP51 17739 4238 chrX 57245530 57299613 57275262,57246393 N,N NA;NA FAAH2 NA NA NA NA FAAH2 13497 4239 chrX 58091593 58092792 58092297 N NA NA NA NA NA NA ZXDA 154526 4240 chrX 62613427 62614682 62613787 N NA SPIN4 NA NA NA NA SPIN4 42209 4241 chrX 63652556 63655978 63654013 N NA NA NA NA NA NA LOC92249 871683 4242 chrX 65292262 65294974 65293541 N NA NA NA NA NA NA LAS1L 537576 4243 chrX 65948518 65950693 65948918 N NA NA NA NA NA NA AR 813181 4244 chrX 66117760 66129298 66122258,66120965,66126708 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA AR 634576 4245 chrX 66261819 66266692 66264314 N NA NA NA NA NA NA AR 497182 4246 chrX 66742921 66745923 66744268 N NA AR NA NA NA NA AR 17951 4247 chrX 66999378 67002625 67000893 N NA NA NA NA NA NA AR 235504 4248 chrX 67007120 67011825 67007238,67009180 N,N NA;NA NA NA NA NA NA AR 243246 4249 chrX 67673524 67675788 67674830 N NA YIPF6 OPHN1,YIPF6 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF6 42836 4250 chrX 68113047 68116221 68114641 N NA NA PJA1 IMR90 Hi-C 24141950 PJA1 269144 4251 chrX 68235010 68236754 68236009 N NA NA NA NA NA NA PJA1 148611 4252 chrX 69307298 69309374 69308319 N NA NA AWAT2 IMR90 Hi-C 24141950 PDZD11 200424 4253 chrX 71952920 71954041 71953557 N NA NA NA NA NA NA HDAC8 159967 4254 chrX 72399400 72402221 72400771 N NA NAP1L2 NA NA NA NA NAP1L2 32489 4255 chrX 75363826 75371119 75365049,75369756 N,N NA;NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 21652 4256 chrX 77588254 77590624 77589217 Y ATP7A,CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 193075 4257 chrX 78666042 78669170 78667970 N NA ITM2A NA NA NA NA ITM2A 42993 4258 chrX 81342182 81344225 81343261 N NA NA NA NA NA NA RPS6KA6 2098718 4259 chrX 84977140 84979069 84978026 N NA NA NA NA NA NA CHM 323497 4260 chrX 86405191 86406821 86405983 N NA NA NA NA NA NA CHM 1102625 4261 chrX 87226936 87228151 87227575 N NA NA NA NA NA NA CHM 1924370 4262 chrX 88769113 88773241 88770250 N NA NA NA NA NA NA CHM 3466547 4263 chrX 89467916 89469345 89468782 N NA NA NA NA NA NA CHM 4165350 4264 chrX 92688710 92693934 92689811 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 3245728 4265 chrX 93311751 93314531 93313270 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 2625131 4266 chrX 93694535 93757703 93747901,93743365,93749286,93755065 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA DIAPH2 2181959 4267 chrX 93791749 93856895 93807178,93854923,93845404,93798029 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA DIAPH2 2082767 4268 chrX 93947978 93955281 93952994 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1984381 4269 chrX 95791207 95796930 95795392 N NA NA NA NA NA NA DIAPH2 142732 4270 chrX 9974404 9981261 9979043 Y NA NA SHROOM2,WWC3 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1X 543069 4271 chrX 99999137 100002444 100000691 N NA NA SYTL4,SRPX2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36A-HNRNPH2 643434 4272 chrY 10027491 10030668 10029490 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2885478 4273 chrY 13225284 13227646 13226549 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 1546652 4274 chrY 13257873 13260008 13258880 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 1514290 4275 chrY 13306758 13331991 13330780 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 1442307 4276 chrY 13357722 13371617 13370731 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 1402681 4277 chrY 15865415 15866460 15866122 N NA TMSB4Y NA NA NA NA TMSB4Y 49968 4278 chrY 17456101 17458627 17457720 N NA NA NA NA NA NA TMSB4Y 1640654 4279 chrY 17474966 17478384 17477104 N NA NA NA NA NA NA TMSB4Y 1659519 4280 chrY 17884055 17886801 17885756 N NA NA NA NA NA NA TMSB4Y 2068608 4281 chrY 1968119 1970289 1968892 N NA NA NA NA NA NA ASMTL-AS1 498695 4282 chrY 20247148 20249910 20248334 N NA NA NA NA NA NA NCRNA00185 790204 4283 chrY 20451957 20453380 20452351 N NA NA NA NA NA NA NCRNA00185 586734 4284 chrY 21539471 21544108 21540882 N NA NA NA NA NA NA TXLNG2P 185136 4285 chrY 23137914 23139002 23138401 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 400303 4286 chrY 24094183 24100602 24097111 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1356572 4287 chrY 24366165 24368976 24367750 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1628554 4288 chrY 24779061 24791990 24781606 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2041450 4289 chrY 24876813 24880198 24878349 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2139202 4290 chrY 25548534 25554208 25551186 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2810923 4291 chrY 25702251 25710150 25706896,25703017 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 2964640 4292 chrY 26026157 26028463 26027037 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 3288546 4293 chrY 27934955 27936097 27935511 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5197344 4294 chrY 28253639 28264228 28256350 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5516028 4295 chrY 28409201 28431902 28415248 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5671590 4296 chrY 7468835 7471865 7469899 N NA NA NA NA NA NA PRKY 326822 4297 chrY 7578556 7580855 7579847 N NA NA NA NA NA NA PRKY 436543 4298 chrY 7585135 7588020 7586802 N NA NA NA NA NA NA PRKY 443122 4299 chrY 831403 833618 832003 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 627421 4300 chrY 8734864 8739785 8735884 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1592851 4301 chrY 8978956 8979692 8979537 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1836943