Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 104058024 104061248 104060357 N NA RNPC3 NA NA NA NA RNPC3 7330 2 chr1 104599119 104600846 104600138 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 530541 3 chr1 105134703 105137100 105135935 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 1066125 4 chr1 105473746 105477295 105475293 N NA NA NA NA NA NA RNPC3 1405168 5 chr1 106604281 106605456 106604917 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 993811 6 chr1 107674237 107677411 107675456 N NA NA NA NA NA NA PRMT6 74970 7 chr1 110357918 110360242 110359469 N NA NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 167145 8 chr1 111176239 111181108 111178290,111179111,111180855 N,Y,N NA;RBM15,CD53;NA KCNA2,KCNA3 KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 KCNA2 2143 9 chr1 111269248 111270767 111269877 N NA NA KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNA3 51593 10 chr1 111327983 111331366 111330303 N NA NA KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 CD53 82455 11 chr1 111755432 111766674 111757934,111760373,111762589,111764455,111764654 N,N,Y,Y,Y NA;NA;CD53,CEPT1,DENND2D,CHI3L2;CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2;CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2 DENND2D WDR77,OVGP1,C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2,CHI3L2,CHIA IMR90 Hi-C 24141950 DENND2D 12151 12 chr1 112157488 112160066 112159155 N NA RAP1A ADORA3,RAP1A,FAM212B,LOC100129269 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1A 2339 13 chr1 11469832 11473004 11470900 N NA NA PTCHD2 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 136577 14 chr1 11493988 11501737 11494664 N NA NA UBIAD1,PTCHD2 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 160733 15 chr1 115884991 115888034 115886189 N NA NA NA NA NA NA SIKE1 561683 16 chr1 11622462 11626132 11623735 N NA NA NA NA NA NA MAD2L2 125546 17 chr1 116324251 116326311 116325518 N NA NA CASQ2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A15 192808 18 chr1 116341563 116349162 116344362,116343678 N,N NA;NA NA SLC22A15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC22A15 169957 19 chr1 116351322 116352941 116352171 N NA NA SLC22A15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC22A15 166178 20 chr1 116785204 116787053 116786320 N NA NA NA NA NA NA ATP1A1 128742 21 chr1 116797866 116801853 116799995 N NA NA ATP1A1,SLC22A15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP1A1 113942 22 chr1 116866546 116869662 116868593 N NA ATP1A1 ATP1A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1A1 46133 23 chr1 117420455 117422877 117421915 Y TTF2 NA PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TTF2 180072 24 chr1 118195722 118200159 118197034,118199231 N,Y NA;MAN1A2,GDAP2,FAM46C FAM46C FAM46C K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46C 47118 25 chr1 118208085 118208880 118208624 N NA NA FAM46C K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46C 59481 26 chr1 118224720 118227636 118226220 N NA NA FAM46C,GDAP2,WDR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM46C 76116 27 chr1 118877019 118879042 118878151 N NA NA NA NA NA NA WDR3 404647 28 chr1 121484610 121485563 121485009 N NA NA NA NA NA NA PHGDH 1230191 29 chr1 13991739 13994288 13993645 N NA PRDM2 PDPN,PRDM2,KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 32447 30 chr1 145139083 145140170 145139423 N NA SEC22B NA NA NA NA SEC22B 42676 31 chr1 145396089 145398911 145397539 N NA TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 39551 32 chr1 145401196 145404120 145402239 N NA TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,RNF115,ITGA10,NUDT17,POLR3C,PIAS3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 34342 33 chr1 146369280 146370426 146370037 N NA NA NA NA NA NA PRKAB2 273703 34 chr1 14646042 14649384 14647213 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 619307 35 chr1 146554819 146558172 146556435 N NA NA CHD1L,LOC728989,PRKAB2,FMO5 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAB2 85957 36 chr1 14661642 14663125 14662522 N NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 634907 37 chr1 14693768 14699266 14696990 N NA NA NA NA NA NA PRDM2 667033 38 chr1 147805591 147809618 147807013 Y NA NA NA NA NA NA ACP6 662957 39 chr1 148176127 148176917 148176411 N NA NA NA NA NA NA ACP6 1033493 40 chr1 148240713 148242683 148241251 N NA NA NA NA NA NA ACP6 1098079 41 chr1 148247477 148248906 148248007 N NA NA NA NA NA NA ACP6 1104843 42 chr1 149222284 149224353 149223554 N NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 HIST2H2BF 559575 43 chr1 149238850 149240201 149239001 N NA NA LOC388692 IMR90 Hi-C 24141950 HIST2H2BF 543727 44 chr1 151891413 151893794 151892819 Y NA THEM4 C2CD4D,LOC100132111,THEM4,S100A10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 9052 45 chr1 152019149 152022021 152020698 N NA S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 9638 46 chr1 154847743 154850626 154849339 N NA KCNN3 IL6R,SHE,TDRD10,CHRNB2,ADAR,UBE2Q1,KCNN3,PBXIP1,SHC1,PYGO2,DCST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNN3 4989 47 chr1 157328255 157330592 157329738 N NA NA NA NA NA NA ETV3 219872 48 chr1 157372627 157374481 157373523 N NA NA NA NA NA NA ETV3 264244 49 chr1 157417205 157419503 157418308 N NA NA FCRL5 IMR90 Hi-C 24141950 FCRL3 251144 50 chr1 157455248 157457346 157456582 N NA NA NA NA NA NA FCRL3 213301 51 chr1 157818091 157827977 157819327 N NA FCRL1 FCRL1 IMR90 Hi-C 24141950 FCRL1 28151 52 chr1 15929401 15931605 15930167 N NA DDI2 DDI2,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 12348 53 chr1 160758770 160760876 160760031 N NA LY9 NA NA NA NA LY9 5052 54 chr1 161358470 161365579 161359914 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 74304 55 chr1 161367767 161370677 161369483 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83601 56 chr1 161408857 161410691 161410408 N NA NA NDUFS2,DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 124691 57 chr1 16493604 16495007 16494347 N NA ARHGEF19 EPHA2,SPATA21,C1orf144,CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,SPEN,ZBTB17,RSG1,FBXO42 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF19 44097 58 chr1 165566829 165569410 165567594 N NA NA RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH9A1 98490 59 chr1 167569648 167584635 167583320 N NA CREG1,RCSD1 RCSD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCSD1 14839 60 chr1 16824858 16826603 16826025 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 57691 61 chr1 17215190 17216743 17216040 N NA CROCC NBPF1,MIR3675,CROCC,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 31702 62 chr1 17222221 17224437 17223108 N NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 24008 63 chr1 17229309 17233205 17231513 Y PADI4,PADI2 CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15240 64 chr1 17239556 17242576 17240577 Y NA CROCC CROCC K562 ChIA-PET 22265404 CROCC 5869 65 chr1 172786957 172789820 172788300 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf9 284697 66 chr1 173990113 173993013 173991177 N NA RC3H1 ZBTB37,RC3H1,GAS5 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 27903 67 chr1 175176976 175180037 175178412 N NA KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14747 68 chr1 175186396 175196697 175187191,175194725 N,N NA;NA KIAA0040 TNR,PAPPA2,KIAA0040 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0040 24167 69 chr1 178539478 178541961 178541121 N NA C1orf220 NA NA NA NA C1orf220 27547 70 chr1 178546576 178552698 178550612,178549635 Y,N RALGPS2;NA C1orf220 C1orf220,MIR4424,RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 34645 71 chr1 178566104 178570534 178569799,178569040 N,N NA;NA NA RALGPS2,C1orf220,MIR4424,ANGPTL1,FAM20B IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 54173 72 chr1 178571991 178579042 178576298 N NA NA C1orf220,RALGPS2,FAM20B,ANGPTL1 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 60060 73 chr1 178632278 178635083 178633661 N NA NA RALGPS2,C1orf220 IMR90 Hi-C 24141950 RALGPS2 59217 74 chr1 181103634 181105411 181104092 N NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 45996 75 chr1 181997612 182000151 181998964 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 361190 76 chr1 18250306 18253120 18251612 N NA NA ACTL8,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 484056 77 chr1 182579451 182582001 182580864 Y NA RNASEL,RGS16,LOC284648 NA NA NA NA LOC284648 2274 78 chr1 182685541 182687812 182686876 N NA NA RGS8,RNASEL IMR90 Hi-C 24141950 NPL 70772 79 chr1 182728559 182732162 182730594 N NA NPL RNASEL,LOC284648,RGS16,RGS8 IMR90 Hi-C 24141950 NPL 26422 80 chr1 18283367 18286648 18285336 N NA NA ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 517117 81 chr1 18295962 18299321 18297696 N NA NA ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 529712 82 chr1 18305080 18307807 18306107 N NA NA NA NA NA NA RCC2 538830 83 chr1 18362491 18364750 18364357 N NA NA ARHGEF10L,IGSF21,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 596241 84 chr1 18365977 18368484 18367785 N NA NA ARHGEF10L,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 599727 85 chr1 18370128 18373943 18371898 N NA NA ARHGEF10L,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 603878 86 chr1 18403594 18405304 18404479 N NA NA IGSF21,ACTL8,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 637344 87 chr1 192507688 192509847 192508575 N NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 35010 88 chr1 192576811 192579068 192578415 Y TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2 RGS1,RGS13 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 26200 89 chr1 192593936 192598222 192597057 N NA RGS1,RGS13 NA NA NA NA RGS13 7046 90 chr1 193417681 193418845 193418173 N NA NA NA NA NA NA CDC73 326593 91 chr1 193447218 193449438 193448464 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 356130 92 chr1 193508906 193510740 193509801 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 417818 93 chr1 194252275 194259890 194259019 Y NA NA CDC73,B3GALT2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC73 1161187 94 chr1 194797404 194801218 194800165 N NA NA NA NA NA NA CDC73 1706316 95 chr1 198525376 198527953 198526193 Y PTPRC ATP6V1G3 PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1G3 15301 96 chr1 198563317 198569830 198567486 N NA PTPRC NA NA NA NA PTPRC 38307 97 chr1 198587837 198594400 198591592,198588972 N,N NA;NA PTPRC NA NA NA NA PTPRC 13737 98 chr1 199008824 199013242 199010893 N NA NA NA NA NA NA LOC100131234 102266 99 chr1 199057150 199060044 199058834 N NA NA LOC100131234,PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131234 150592 100 chr1 199917248 199919108 199918194 N NA NA NA NA NA NA ZNF281 460058 101 chr1 200269962 200272348 200271550 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 106818 102 chr1 20151057 20152219 20152071 N NA TMCO4,RNF186 NA NA NA NA RNF186 9286 103 chr1 203237208 203245434 203240561,203242842 N,N NA;NA LOC730227,BTG2 PPFIA4,ADORA1,ATP2B4,TMEM183A,BTG2,FMOD,LOC401980,MYBPH,CHI3L1,MYOG,CHIT1,LOC730227,PRELP,OPTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC730227 29019 104 chr1 203330259 203332370 203331340 N NA NA ATP2B4,FMOD,CHIT1,LOC730227,BTG2,OPTC,PRELP,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 55595 105 chr1 203349179 203351926 203350152 N NA NA FMOD,ATP2B4,CHIT1,PRELP,LAX1,ZC3H11A IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 74515 106 chr1 203377532 203379529 203378083 N NA NA FMOD,BTG2,PRELP IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 102868 107 chr1 203420405 203427468 203424137 N NA NA PRELP,FMOD,PPFIA4,CYB5R1,ATP2B4,BTG2,LOC730227 IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 145741 108 chr1 203429547 203434074 203431019 N NA NA FMOD,PPFIA4,CYB5R1,PRELP,ATP2B4,BTG2,LOC730227,OPTC IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 154883 109 chr1 203902816 203909413 203904739,203907599 N,N NA;NA NA GOLT1A,LINC00303,SNRPE,ETNK2,SOX13,REN,PLEKHA6 IMR90 Hi-C 24141950 SNRPE 72076 110 chr1 203912666 203915000 203914129 N NA NA GOLT1A,LINC00303,SNRPE,ETNK2,SOX13,REN,PLEKHA6 IMR90 Hi-C 24141950 SNRPE 81926 111 chr1 203922600 203925814 203924341 N NA NA LINC00303,SNRPE,ETNK2,SOX13,REN IMR90 Hi-C 24141950 SNRPE 91860 112 chr1 204462489 204467021 204463596 N NA PIK3C2B,MDM4 PIK3C2B,PPP1R15B,LOC127841 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PIK3C2B 3015 113 chr1 204474406 204479569 204475959 N NA PIK3C2B,MDM4 PIK3C2B,PPP1R15B,MDM4 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MDM4 5938 114 chr1 204776700 204778049 204777374 N NA NA MDM4,LRRN2,NFASC IMR90 Hi-C 24141950 TMEM81 275539 115 chr1 206302174 206308026 206306151,206304577 N,Y NA;NA C1orf186 PM20D1,C1orf186,SLC41A1,SLC26A9,AVPR1B,MFSD4,NUCKS1,LOC284581,CTSE IMR90 Hi-C 24141950 C1orf186 13527 116 chr1 207482654 207484330 207483353 N NA CD55 PFKFB2,CD55,C4BPB,C4BPA IMR90 Hi-C 24141950 CD55 10487 117 chr1 207587158 207589001 207588132 N NA CR2 PFKFB2,C4BPA,C4BPB IMR90 Hi-C 24141950 CR2 38644 118 chr1 208135374 208138264 208137032 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC148696 143650 119 chr1 212428978 212430541 212429475 Y LPGAT1,PPP2R5A,ATF3,PPP2R5A PPP2R5A DTL IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 28338 120 chr1 212730202 212733954 212732381 Y NA NA ATF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM206 141935 121 chr1 213118503 213120647 213120073 N NA NA FLVCR1,VASH2,ANGEL2,C1orf227 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANGEL2 68521 122 chr1 213842549 213844929 213844040 N NA NA NA NA NA NA SMYD2 609636 123 chr1 213851397 213853021 213851870 N NA NA NA NA NA NA SMYD2 601544 124 chr1 21723065 21726646 21724237 Y NA NBPF3 ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 NBPF3 39975 125 chr1 221219308 221221731 221220307 N NA NA NA NA NA NA DUSP10 693785 126 chr1 221329720 221331634 221330732 N NA NA HLX IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 583882 127 chr1 221949304 221951594 221950914 N NA DUSP10 DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 33788 128 chr1 222110844 222114785 222113104 N NA NA NA NA NA NA DUSP10 195328 129 chr1 222638091 222639714 222638901 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 123561 130 chr1 224179152 224182113 224180415 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119678 131 chr1 224200046 224204136 224202130 N NA NA NA NA NA NA FBXO28 97655 132 chr1 224685147 224686688 224686133 Y NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 63146 133 chr1 22488215 22490453 22488902 N NA NA WNT4,EPHA8,CDC42,ZBTB40 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 109095 134 chr1 225622648 225625019 225623760 N NA LBR LBR,TMEM63A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 6091 135 chr1 225630415 225635220 225632803 N NA LBR TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 13858 136 chr1 225640924 225643098 225642066 N NA LBR EPHX1,LBR,ENAH,SRP9,TMEM63A,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A IMR90 Hi-C 24141950 LBR 24367 137 chr1 226083347 226087149 226085034 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM63A 12927 138 chr1 226216041 226217843 226217315 N NA C1orf55,H3F3A C1orf55,H3F3A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf55 28975 139 chr1 226296557 226299974 226298100 Y NA H3F3A ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 46149 140 chr1 226612254 226614094 226613270 N NA PARP1 NA NA NA NA PARP1 16453 141 chr1 226623139 226626538 226624818 N NA PARP1 NA NA NA NA PARP1 27338 142 chr1 226631599 226635022 226632820 N NA PARP1 PARP1,C1orf95 IMR90 Hi-C 24141950 PARP1 35798 143 chr1 226644506 226646234 226645238 N NA PARP1 C1orf95 IMR90 Hi-C 24141950 PARP1 48705 144 chr1 227729718 227731250 227730414 N NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19970 145 chr1 230642595 230646937 230643393,230645706 N,Y NA;NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 PGBD5 129204 146 chr1 230710391 230713431 230711389 N NA NA NA NA NA NA COG2 64771 147 chr1 232681665 232689469 232684992,232689054 N,N NA;NA SIPA1L2 TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 30422 148 chr1 232695878 232702742 232698091,232701428 N,N NA;NA SIPA1L2 TSNAX-DISC1,PCNXL2,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 44635 149 chr1 232724668 232727861 232726741 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 73425 150 chr1 232731341 232737473 232732873,232735238 N,Y NA;NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 80098 151 chr1 232764397 232767616 232766248 N NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 113154 152 chr1 232810804 232813675 232812176 N NA NA PCNXL2,TSNAX-DISC1,KIAA1383,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L2 159561 153 chr1 234491108 234497922 234492515 N NA C1orf31 TARBP1,SLC35F3 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf31 11292 154 chr1 234504180 234506119 234504746 N NA C1orf31 C1orf31 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf31 3095 155 chr1 235090515 235091510 235091154 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 200746 156 chr1 235097341 235100635 235098605 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 191621 157 chr1 235146099 235149294 235147858 N NA NA LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 142962 158 chr1 23899267 23906617 23900810,23904032 N,Y NA;ID3 E2F2,ID3,MDS2 E2F2,ID3,MDS2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 12982 159 chr1 23908556 23911234 23909528 N NA ID3,MDS2 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 22271 160 chr1 23915722 23949544 23921784,23928747,23933806,23938748,23940868,23937402,23946299,23947634 N,N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA ID3,MDS2 E2F2,ID3,ASAP3,MDS2,TCEB3,HNRNPR,TCEA3,LOC100506963,ZNF436,RPL11 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDS2 4280 161 chr1 24241860 24244231 24243115 N NA FUCA1,CNR2,PNRC2 NA NA NA NA CNR2 2043 162 chr1 244401906 244403844 244402946 N NA NA SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF238 187345 163 chr1 244462566 244463238 244462948 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 152198 164 chr1 244898040 244900540 244898929 Y ADSS,PPPDE1 NA PPPDE1,C1orf101,EFCAB2 IMR90 Hi-C 24141950 PPPDE1 81688 165 chr1 245081585 245085902 245082183,245084464 Y,N EFCAB2;NA EFCAB2 SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 47382 166 chr1 247373087 247375324 247373977 N NA NA MIR3916,ZNF496 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF669 105413 167 chr1 249166600 249168960 249168217 N NA SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 ZNF692,PGBD2,MIR3124,SH3BP5L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF692 13285 168 chr1 249178837 249181265 249179598 N NA ZNF672,ZNF692,PGBD2 PGBD2,ZNF692 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGBD2 19177 169 chr1 25345271 25350558 25346046,25349002 Y,Y RUNX3;SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 53770 170 chr1 25357804 25360222 25358857 N NA NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 66303 171 chr1 25405937 25408344 25407261 N NA NA RUNX3,FUCA1,CNR2,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 114436 172 chr1 25471494 25473481 25472407 N NA NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 85532 173 chr1 25593313 25595627 25594377 N NA SYF2,C1orf63 NA NA NA NA C1orf63 19328 174 chr1 26945585 26949208 26947837 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73314 175 chr1 27375571 27377605 27376240 N NA NA C1orf172,WDTC1,TRNP1,FAM46B,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2 IMR90 Hi-C 24141950 TRNP1 55376 176 chr1 30160540 30161761 30161291 N NA NA PTPRU,MECR,MATN1,LOC100129196 IMR90 Hi-C 24141950 MECR 603086 177 chr1 30181146 30183767 30182359 N NA NA PTPRU,MECR,LOC100129196,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 MECR 623692 178 chr1 30265508 30267864 30266252 N NA NA PTPRU,MATN1 IMR90 Hi-C 24141950 MECR 708054 179 chr1 30783854 30786532 30785238 N NA NA PTPRU IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129196 405087 180 chr1 31255018 31256939 31255627 N NA LAPTM5 LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAPTM5 24335 181 chr1 31296121 31298266 31297385 N NA NA LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1 IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM5 65438 182 chr1 31626382 31629402 31628257 Y NA NA SNRNP40,PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 87818 183 chr1 31866596 31868742 31867624 N NA SERINC2 ZCCHC17,FABP3,SERINC2,LOC284551 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERINC2 13670 184 chr1 31943510 31946099 31945298 N NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 61098 185 chr1 31948543 31951276 31950072 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 66131 186 chr1 32014100 32016599 32015051 N NA NA FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 PEF1 94239 187 chr1 32036507 32037840 32037174 N NA NA NA NA NA NA PEF1 72998 188 chr1 32233727 32235891 32234757 N NA NA NA NA NA NA PEF1 122889 189 chr1 32291703 32293790 32293029 N NA NA SPOCD1,PTP4A2,KHDRBS1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTP4A2 110198 190 chr1 32313624 32315445 32314436 Y LCK NA PTP4A2,KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A2 88543 191 chr1 32344795 32348345 32346886 N NA NA NA NA NA NA PTP4A2 55643 192 chr1 32408515 32411610 32410110 N NA PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A2 4527 193 chr1 32427126 32427934 32427646 N NA PTP4A2 SPOCD1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,KHDRBS1,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 23138 194 chr1 32445605 32447896 32447275 N NA PTP4A2,KHDRBS1 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,KPNA6,BAI2,COL16A1,TMEM39B IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS1 31595 195 chr1 32449307 32453726 32450769,32452680 N,N NA;NA PTP4A2,KHDRBS1 SPOCD1,KHDRBS1,BAI2,COL16A1,TMEM39B,PTP4A2,KPNA6,CCDC28B,IQCC,TXLNA IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS1 25765 196 chr1 33181631 33183167 33182416 Y KIAA1522 NA SYNC,S100PBP,YARS,KIAA1522,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP4 64882 197 chr1 33442437 33448356 33446947 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 12151 198 chr1 33523593 33524972 33524125 N NA AK2 AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90 Hi-C 24141950 AK2 21081 199 chr1 33895862 33897706 33896760 N NA ZSCAN20 TRIM62,ZNF362 IMR90 Hi-C 24141950 ZSCAN20 40526 200 chr1 35393308 35396133 35394931 N NA LOC653160 NA NA NA NA LOC653160 48174 201 chr1 36951321 36953652 36952286 N NA MRPS15 CSF3R,MRPS15 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS15 21281 202 chr1 37152353 37153918 37153174 N NA NA NA NA NA NA MRPS15 222313 203 chr1 37168235 37170354 37169470 Y OSCP1,GRIK3 NA GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS15 238195 204 chr1 37753150 37759332 37754638,37759219 N,N NA;NA NA GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12A 180787 205 chr1 38578453 38581711 38580258 N NA NA LOC339442 IMR90 Hi-C 24141950 UTP11L 100069 206 chr1 38616557 38621110 38618653 N NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 UTP11L 138173 207 chr1 38939087 38942999 38940864 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 382341 208 chr1 40263136 40266124 40265249 N NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1,NT5C1A,TRIT1,MYCL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPIE 58619 209 chr1 40410207 40412992 40412037 N NA MYCL1,MFSD2A BMP8B,TRIT1,MFSD2A,MYCL1 IMR90 Hi-C 24141950 MFSD2A 7792 210 chr1 40460331 40462755 40461769 N NA MFSD2A,CAP1 BMP8B,TRIT1,CAP1,MFSD2A IMR90 Hi-C 24141950 MFSD2A 39547 211 chr1 40467964 40470722 40469782 N NA MFSD2A,CAP1 TRIT1,MFSD2A,BMP8B,MYCL1,CAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CAP1 35533 212 chr1 40479278 40480983 40480511 N NA CAP1 MYCL1,MFSD2A,PPIE,NT5C1A IMR90 Hi-C 24141950 CAP1 25272 213 chr1 40488715 40490021 40489400 N NA CAP1 MFSD2A,TRIT1,CAP1,BMP8B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAP1 16234 214 chr1 40621774 40623000 40622451 N NA RLF RLF,PPT1,SMAP2,CAP1,ZMPSTE24,COL9A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RLF 4041 215 chr1 4077494 4089055 4087798 N NA NA AJAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100133612 260526 216 chr1 40809781 40811129 40810445 N NA COL9A2,SMAP2 RLF,ZMPSTE24,PPT1,SMAP2 IMR90 Hi-C 24141950 COL9A2 26842 217 chr1 40814864 40817437 40815979 N NA COL9A2,SMAP2 RLF,ZMPSTE24,PPT1,SMAP2 IMR90 Hi-C 24141950 SMAP2 21941 218 chr1 4104308 4109161 4107165,4105547 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC100133612 287340 219 chr1 41830612 41841185 41831984 N NA NA NA NA NA NA SCMH1 122797 220 chr1 41843275 41856828 41845571 N NA NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 SCMH1 135460 221 chr1 42499789 42502834 42501688 N NA NA HIVEP3,CCDC30 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ3 298714 222 chr1 4368290 4373053 4370458 N NA NA MIR4417 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100133612 551322 223 chr1 4402915 4406902 4404346 N NA NA NA NA NA NA LOC100133612 585947 224 chr1 44532971 44535115 44533878 N NA SLC6A9 SLC6A9,DMAP1,RNF220,CCDC24 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A9 35837 225 chr1 46010534 46011911 46011227 N NA CCDC163P,MMACHC,PRDX1,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AKR1A1 4544 226 chr1 46631628 46633672 46632580 N NA PIK3R3 MAST2,PIK3R3 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R3 32920 227 chr1 4689827 4692757 4690685 N NA NA NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100133612 872859 228 chr1 50715296 50718253 50717599 N NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 707683 229 chr1 50730113 50733250 50731893 N NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 692686 230 chr1 51464844 51467753 51466099 N NA FAF1,CDKN2C FAF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2C 30477 231 chr1 52014083 52022382 52014863 N NA EPS15 OSBPL9,EPS15,NRD1 IMR90 Hi-C 24141950 EPS15 29088 232 chr1 5279316 5282149 5281094 N NA NA NA NA NA NA KCNAB2 770209 233 chr1 53167852 53170307 53168924 Y NA SELRC1,ZYG11B SELRC1,CPT2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SELRC1 3814 234 chr1 53831952 53834632 53833590 N NA LRP8 GLIS1,LRP8,FLJ40434,YIPF1,LOC100507564,MAGOH,TMEM48 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP8 38131 235 chr1 53855234 53856368 53856089 Y NA NA LRP8,YIPF1,FLJ40434,GLIS1,MAGOH,LOC100507564,DMRTB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP8 61413 236 chr1 54952008 54957124 54954442 N NA NA TCEANC2,SSBP3,TMEM59,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,C1orf177,YIPF1,HEATR8-TTC4,DIO1,HSPB11 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR8-TTC4 150303 237 chr1 55430759 55432655 55431841 Y NA NA TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 77838 238 chr1 55723149 55726583 55724063,55726171 N,N NA;NA USP24,LOC100507634 USP24,LOC100507634,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 42068 239 chr1 56889166 56891566 56890717 N NA NA USP24,LOC100507634,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 153691 240 chr1 56897443 56899491 56898880 N NA NA USP24,LOC100507634,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 145766 241 chr1 569467 570313 569983 N NA NA NA NA NA NA LOC643837 192751 242 chr1 58856855 58859219 58858047 N NA NA NA NA NA NA OMA1 153227 243 chr1 59189228 59193551 59190358,59192441 N,N NA;NA MYSM1 HOOK1,MYSM1,FGGY,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 MYSM1 23481 244 chr1 59432967 59434994 59434201 N NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 183182 245 chr1 66168455 66173030 66170029 N NA NA DNAJC6,PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 PDE4B 85163 246 chr1 66866260 66869517 66867955 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 521061 247 chr1 66908781 66912382 66911306 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 478196 248 chr1 68139704 68143846 68141128 N NA GADD45A GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 7014 249 chr1 6830795 6832267 6831602 N NA NA CAMTA1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC11 68829 250 chr1 723199 725706 723267 N NA LOC643837 NA NA NA NA LOC643837 37358 251 chr1 74057895 74060910 74059192 N NA NA NA NA NA NA TYW3 1137926 252 chr1 8013531 8016510 8014321 N NA PARK7 NA NA NA NA PARK7 5204 253 chr1 80175573 80177776 80176940 N NA NA NA NA NA NA IFI44 1060096 254 chr1 84225722 84231141 84226971,84229647 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PRKACB 312604 255 chr1 84736382 84738780 84737535 N NA SAMD13 LPAR3,DNASE2B,UOX,SAMD13,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 SAMD13 25269 256 chr1 85165121 85166875 85166017 N NA SSX2IP SSX2IP,UOX IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 8881 257 chr1 86683627 86686277 86684960 N NA NA NA NA NA NA SH3GLB1 483976 258 chr1 87237842 87241453 87239919 N NA NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 67589 259 chr1 87296829 87300147 87298243 N NA NA NA NA NA NA SEP15 79960 260 chr1 87857306 87861307 87860166 N NA NA NA NA NA NA LMO4 63155 261 chr1 87875407 87877915 87876852 N NA NA LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 81256 262 chr1 87914024 87917531 87915495,87916192 Y,N NA;NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 119873 263 chr1 87962204 87965242 87963718 N NA NA NA NA NA NA LMO4 168053 264 chr1 88336554 88339771 88338034 N NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 542403 265 chr1 89126687 89128209 89126939 N NA PKN2 GTF2B IMR90 Hi-C 24141950 PKN2 21713 266 chr1 8996563 9001635 8999838 Y NA NA SLC2A5,SLC2A7,CA6,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 ENO1 57412 267 chr1 90222263 90224471 90223330 Y NA NA LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8D 62102 268 chr1 9132809 9143485 9135890,9140572 N,N NA;NA SLC2A5 NA NA NA NA SLC2A5 2922 269 chr1 91519711 91521325 91520499 N NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 31899 270 chr1 92041185 92043367 92042128 N NA NA TGFBR3,HSP90B3P,EPHX4,CDC7,RPAP2,GLMN IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 74781 271 chr1 9260615 9262273 9262179 N NA H6PD SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD IMR90 Hi-C 24141950 H6PD 32590 272 chr1 93439653 93442489 93440848 N NA FAM69A FAM69A,RPL5 IMR90 Hi-C 24141950 FAM69A 12574 273 chr1 93445589 93447128 93446452 N NA FAM69A RPL5,FAM69A,EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 FAM69A 18510 274 chr1 93493569 93496286 93494998 N NA MTF2 MTF2,CCDC18 IMR90 Hi-C 24141950 MTF2 48506 275 chr1 93498042 93500632 93499495 N NA MTF2 MTF2,CCDC18,TMED5,FAM69A,RPL5 IMR90 Hi-C 24141950 MTF2 44160 276 chr1 94153383 94156461 94155270 N NA BCAR3 BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 5998 277 chr1 94157373 94159971 94158284 N NA BCAR3 BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 9988 278 chr1 94173519 94175195 94174352 N NA BCAR3 BCAR3,MIR760 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 26134 279 chr1 94177617 94183654 94181967 N NA BCAR3 MIR760,BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 30232 280 chr1 94215216 94217883 94216205 N NA NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 67831 281 chr1 9459749 9461089 9460379 N NA NA SLC25A33,SPSB1,H6PD IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 138439 282 chr1 9465971 9467065 9466466 N NA NA SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 132463 283 chr1 9472151 9474264 9473801 Y NA NA SPSB1,H6PD,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 125264 284 chr1 9482511 9490456 9486553,9489057 Y,Y NA;NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 109072 285 chr1 95743208 95744526 95743771 N NA NA NA NA NA NA ABCD3 859275 286 chr1 95846997 95849126 95847858 N NA NA NA NA NA NA ABCD3 963064 287 chr1 95901257 95905563 95903704 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 1017324 288 chr10 100098807 100101409 100100507 N NA NA C10orf28,PYROXD2,HPS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PYROXD2 73569 289 chr10 100108395 100110872 100109342 N NA NA PYROXD2,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PYROXD2 64106 290 chr10 10049485 10051236 10050127 N NA NA NA NA NA NA USP6NL 1602443 291 chr10 10085818 10091920 10087120 N NA NA NA NA NA NA USP6NL 1561759 292 chr10 101772364 101776373 101773970 N NA DNMBP CUTC,COX15,ABCC2,DNMBP,DNMBP-AS1,CPN1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMBP 2688 293 chr10 102098266 102100445 102099203 N NA SCD,LINC00263 PKD2L1,LINC00263,WNT8B,SEC31B,SCD IMR90 Hi-C 24141950 SCD 6327 294 chr10 112113481 112120362 112115378,112118362 N,N NA;NA SMNDC1 SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 48774 295 chr10 112173208 112176614 112175333 N NA NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81011 296 chr10 112200156 112202578 112201596 N NA NA NA NA NA NA DUSP5 55047 297 chr10 112294496 112297161 112296192 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5,SMC3 SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 30288 298 chr10 115783282 115786510 115784956 N NA NA NHLRC2 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf118 147854 299 chr10 116558584 116562822 116561411 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 18681 300 chr10 116760284 116763335 116761412 N NA NA NA NA NA NA TRUB1 62332 301 chr10 11702555 11740166 11705430,11706250,11715147,11728047,11720313,11730016 N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA USP6NL USP6NL,ECHDC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP6NL 48876 302 chr10 118933800 118936204 118934843 N NA NA PNLIPRP2,PNLIPRP1,HSPA12A,C10orf82,ENO4,VAX1,KCNK18 IMR90 Hi-C 24141950 PDZD8 198733 303 chr10 12381642 12383996 12382844 N NA CAMK1D CAMK1D IMR90 Hi-C 24141950 CAMK1D 7587 304 chr10 125000212 125007041 125001350 N NA NA GRB10 MCF7 ChIA-PET 19890323 BUB3 86452 305 chr10 125862127 125866134 125864816 N NA CHST15 CHST15 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHST15 10197 306 chr10 126602606 126606800 126605373 N NA ZRANB1 ZRANB1,CTBP2,METTL10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZRANB1 23892 307 chr10 129651610 129654676 129652859 N NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 269792 308 chr10 132093966 132101412 132099270 N NA NA NA NA NA NA GLRX3 159327 309 chr10 22517391 22520378 22518881 N NA NA COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3-BMI1 84934 310 chr10 22742825 22745671 22744051 N NA NA DNAJC1,ARMC3,COMMD3-BMI1 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD3-BMI1 137513 311 chr10 22764281 22770660 22768543 N NA NA ARMC3 IMR90 Hi-C 24141950 COMMD3-BMI1 158969 312 chr10 26189996 26191975 26191246 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 535291 313 chr10 26623396 26626556 26624422 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 100710 314 chr10 26659940 26663818 26662103 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 63448 315 chr10 26703510 26705993 26704360 N NA APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 21273 316 chr10 28590494 28593517 28591822 N NA NA MPP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC220906 227766 317 chr10 29316445 29318846 29317820 N NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 WAC 495023 318 chr10 30711253 30713037 30712552 N NA MAP3K8 MAP3K8 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 9913 319 chr10 30715740 30717463 30716692 N NA MAP3K8 MAP3K8,KIAA1462,LYZL2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 5487 320 chr10 30776656 30778639 30777408 Y MAP3K8 NA MAP3K8 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 53706 321 chr10 30791051 30792360 30791575 N NA NA MAP3K8,LOC729668 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 68101 322 chr10 30817463 30820170 30818716 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 94513 323 chr10 30983351 30996684 30994431,30995160,30990926 Y,N,N NA;NA;NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1,SVIL,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 260401 324 chr10 32044990 32050816 32049168 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166954 325 chr10 32251028 32253371 32251980 N NA ARHGAP12 KIF5B,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 33258 326 chr10 32665560 32669545 32668181 N NA EPC1 EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 29447 327 chr10 32733627 32736689 32735023 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 97514 328 chr10 33258933 33262842 33260910 N NA ITGB1 ITGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 11640 329 chr10 33268770 33271244 33270189 N NA ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 21477 330 chr10 33272918 33276422 33275328 N NA ITGB1 ITGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 25625 331 chr10 33283002 33286752 33284543 N NA ITGB1 ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 35709 332 chr10 33384016 33387092 33385479 N NA NA NA NA NA NA ITGB1 136723 333 chr10 33401668 33404625 33403656 Y NA NA ITGB1,NRP1,PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 154375 334 chr10 3526195 3528450 3526907 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 299023 335 chr10 36120159 36122147 36121275 Y NA NA NA NA NA NA CREM 704390 336 chr10 3663185 3670215 3666904,3668668 N,N NA;NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 157258 337 chr10 37345885 37346171 37346027 N NA NA NA NA NA NA ZNF248 800315 338 chr10 38434548 38440451 38435844 N NA NA NA NA NA NA ZNF37A 51284 339 chr10 3846549 3849725 3847962 N NA KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19076 340 chr10 43781561 43783961 43783009 Y CSGALNACT2 NA NA NA NA NA HNRNPF 120735 341 chr10 43854576 43859096 43857822 N NA HNRNPF FXYD4,HNRNPF,ZNF487P MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HNRNPF 45600 342 chr10 43913033 43917792 43913601,43916401 N,N NA;NA HNRNPF,ZNF487P ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPF 8337 343 chr10 45745456 45747462 45746178 N NA NA NA NA NA NA OR13A1 63594 344 chr10 45847556 45856801 45851718,45848275,45854655 N,N,N NA;NA;NA OR13A1,ALOX5 OR13A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5 12823 345 chr10 46973677 46975477 46974924 N NA NA NA NA NA NA ZFAND4 805426 346 chr10 47631510 47642121 47640374 N NA NA LOC643650,GPRIN2,PPYR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND4 1463259 347 chr10 48477380 48479139 48478056 N NA NA NA NA NA NA MAPK8 1130548 348 chr10 49513812 49515719 49514668 N NA NA FRMPD2,ARHGAP22 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK8 93968 349 chr10 49874211 49882526 49876268,49880078 Y,N WDFY4;NA WDFY4 ARHGAP22,WDFY4,C10orf71,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 WDFY4 10992 350 chr10 51497434 51499585 51498766,51498631 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NCOA4 65523 351 chr10 51502392 51504539 51503855 N NA NA NA NA NA NA NCOA4 60569 352 chr10 58381679 58385278 58384071 N NA NA NA NA NA NA ZWINT 260645 353 chr10 60751517 60762680 60752898,60756668,60759828 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TFAM 606341 354 chr10 60771012 60774102 60772325 N NA NA NA NA NA NA TFAM 625836 355 chr10 60795275 60796388 60795889 N NA NA NA NA NA NA TFAM 650099 356 chr10 6108862 6112447 6110885 N NA IL2RA,RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 IL2RA 4529 357 chr10 61729062 61731291 61730689 N NA NA CCDC6,C10orf40 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC6 62648 358 chr10 62892867 62896701 62895089 N NA NA NA NA NA NA CDK1 354655 359 chr10 65462463 65464679 65463720 N NA NA JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 181340 360 chr10 69522132 69524989 69523650 N NA NA NA NA NA NA SIRT1 119438 361 chr10 69531506 69534097 69532869 N NA NA NA NA NA NA SIRT1 110330 362 chr10 69607996 69612859 69609249 Y NA SIRT1 SIRT1,HERC4,MYPN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SIRT1 31568 363 chr10 6969334 6971444 6969918 N NA NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC439949 346947 364 chr10 71933121 71935511 71934110 N NA AIFM2,TYSND1,SAR1A SAR1A K562 ChIA-PET 22265404 SAR1A 2836 365 chr10 73648168 73649901 73648823 N NA PSAP PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,CDH23,ASCC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 37086 366 chr10 74018628 74024381 74020717,74023579 Y,N C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4;NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9296 367 chr10 7509146 7527642 7514048,7516550,7517881,7520255,7523297,7526617 N,N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA;SFMBT2,SFMBT2,TAF3,KIN NA NA NA NA NA SFMBT2 55698 368 chr10 7532911 7535488 7534426 N NA NA NA NA NA NA SFMBT2 79463 369 chr10 7549910 7553676 7550372 N NA NA NA NA NA NA SFMBT2 96462 370 chr10 75700234 75702452 75700517 N NA NA NA NA NA NA CAMK2G 65885 371 chr10 75715934 75717494 75716859 N NA NA CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1,LOC100507331,KIAA0913,NDST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAMK2G 81585 372 chr10 80061548 80064054 80062915 N NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 268030 373 chr10 80292304 80293556 80292784 N NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 498786 374 chr10 80416881 80420799 80417999 N NA NA RPS24,LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 LOC283050 406406 375 chr10 81360821 81362506 81361925 N NA NA NA NA NA NA LOC642361 223152 376 chr10 86419754 86421937 86420882 N NA NA GRID1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM190B 331344 377 chr10 88145066 88154650 88149419,88151991 N,N NA;NA NA GRID1,FAM190B IMR90 Hi-C 24141950 WAPAL 126891 378 chr10 88158246 88164489 88160262 Y NA NA WAPAL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WAPAL 117052 379 chr10 89354943 89357183 89356218 N NA NA MINPP1,PAPSS2 IMR90 Hi-C 24141950 MINPP1 90720 380 chr10 89787230 89788626 89787832 N NA NA RNLS,PTEN IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 164035 381 chr10 89839064 89844329 89840117,89842740 N,N NA;NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 215869 382 chr10 89866609 89868842 89867802 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTEN 243414 383 chr10 89872160 89875604 89873787 N NA NA PTEN,KLLN,RNLS,CFL1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTEN 248965 384 chr10 91646476 91653120 91648060,91650280 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIF20B 185109 385 chr10 91662289 91663860 91662913 N NA NA NA NA NA NA KIF20B 200922 386 chr10 91669990 91672854 91671257 N NA NA NA NA NA NA KIF20B 208623 387 chr10 92742400 92745581 92743912 N NA NA PCGF5,ANKRD1 IMR90 Hi-C 24141950 RPP30 110691 388 chr10 92929450 92932663 92932512 N NA NUDT9P1,PCGF5 RPP30 IMR90 Hi-C 24141950 NUDT9P1 16613 389 chr10 9335631 9337541 9337114 N NA NA TAF3,FLJ45983,GATA3,KIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF3 1474958 390 chr10 94501144 94504658 94502294,94504625 N,N NA;NA NA IDE,KIF11,HHEX,EXOC6 IMR90 Hi-C 24141950 HHEX 51463 391 chr10 94514706 94518730 94516279,94516781 N,N NA;NA NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 65025 392 chr10 94874429 94877131 94875813 N NA CYP26A1 CEP55,CYP26C1,EXOC6,MYOF IMR90 Hi-C 24141950 CYP26A1 41197 393 chr10 94881295 94885892 94884383 N NA CYP26A1 CEP55,EXOC6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP26A1 48063 394 chr10 94924848 94927562 94925886 N NA NA NA NA NA NA CYP26A1 91616 395 chr10 95026103 95029296 95027940 N NA NA CYP26C1,EXOC6 IMR90 Hi-C 24141950 CYP26A1 192871 396 chr10 95035591 95038526 95037418 N NA NA NA NA NA NA CYP26A1 202359 397 chr10 96941530 96946049 96943597 Y SORBS1,SORBS1 NA SORBS1,C10orf129,PDLIM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDLIM1 104732 398 chr10 973950 985868 977832 N NA LARP4B,GTPBP4 DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 42248 399 chr10 97883627 97886339 97884541 N NA LOC728558,ZNF518A LOC728558,CCNJ K562 ChIA-PET 22265404 ZNF518A 3133 400 chr10 98044600 98054981 98048211,98045103,98051415,98052930 Y,N,N,N BLNK;NA;NA;NA BLNK LOC728558,CC2D2B,DNTT,BLNK,OPALIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BLNK 13267 401 chr10 98499814 98503178 98500873 N NA PIK3AP1 PIK3AP1,SLIT1,TLL2 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3AP1 19535 402 chr10 98517480 98518601 98518334 N NA PIK3AP1 PIK3AP1,SLIT1,ARHGAP19-SLIT1,TLL2 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3AP1 37201 403 chr10 98523356 98526267 98524827 N NA PIK3AP1 SLIT1,PIK3AP1,TLL2,LCOR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3AP1 43077 404 chr11 102164658 102166608 102165828 N NA BIRC3 YAP1,MMP7,BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC3 21573 405 chr11 102175592 102177539 102177035 Y NA BIRC3,BIRC2 MMP7,BIRC2,BIRC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIRC3 10642 406 chr11 102343573 102348821 102347746,102345505 N,N NA;NA TMEM123 TMEM123,MMP20,BIRC2,BIRC3,MMP7,MMP27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM123 19798 407 chr11 102415620 102418426 102416972 N NA NA TMEM123,MMP20 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 91845 408 chr11 110965067 110969288 110968110 N NA NA ARHGAP20,FDX1,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf92 201251 409 chr11 111046028 111050527 111048417,111050080 N,N NA;NA NA ARHGAP20,FDX1,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf92 120012 410 chr11 111296933 111301347 111298311,111299973 Y,N POU2AF1,FDXACB1;NA POU2AF1,LOC100132078 POU2AF1,FDX1,C11orf53,C11orf93,C11orf92,LOC100132078,C11orf88,LAYN IMR90 Hi-C 24141950 LOC100132078 8022 411 chr11 111305344 111311692 111307619,111309989 Y,N POU2AF1;NA LOC100132078 LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20,C11orf88,C11orf93,MIR4491,POU2AF1,PPP2R1B,SIK2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100132078 16433 412 chr11 11170699 11172528 11171621 N NA NA GALNTL4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729013 290935 413 chr11 112150661 112151933 112151178 N NA NA BCO2,PTS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTS 53573 414 chr11 115742509 115747375 115744593 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 367268 415 chr11 115781958 115785841 115783336 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 406717 416 chr11 115798952 115806491 115801620 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 423711 417 chr11 115808647 115813895 115810141 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 433406 418 chr11 116212640 116217021 116214189,116216125 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BUD13 426693 419 chr11 116233233 116238187 116235446 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 405527 420 chr11 117818983 117822993 117822079 Y UBE4A,MPZL3,MLL,IL10RA,CD3G,CD3E,CD3D,AMICA1 IL10RA FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,IL10RA,LOC100526771 IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 34113 421 chr11 118560306 118561762 118560880 N NA NA BCL9L,DDX6,CXCR5,MIR4492,FOXR1,UPK2,RPS25,TRAPPC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 100210 422 chr11 118689574 118693609 118691662 N NA DDX6 DDX6,PHLDB1,UPK2,TREH,CXCR5,BCL9L,MIR4492,FOXR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 27602 423 chr11 118722066 118724126 118723098 N NA CXCR5 DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR5 30349 424 chr11 118725741 118729214 118727923 N NA CXCR5 DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492,UPK2 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR5 25261 425 chr11 118739535 118742305 118741347 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 CXCR5,BCL9L BCL9L,CXCR5,DDX6,UPK2,FOXR1,MIR4492 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR5 12170 426 chr11 121107249 121109595 121108484 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 53793 427 chr11 121236210 121240688 121238349 N NA NA SORL1,SC5DL IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 72822 428 chr11 121242113 121246196 121243998 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 76716 429 chr11 121248303 121251264 121249872 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 71648 430 chr11 121255010 121257720 121256676 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 65192 431 chr11 121290160 121308004 121301044,121297894,121306494 N,N,N NA;NA;NA SORL1 SORL1,SC5DL IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 14908 432 chr11 121313601 121319172 121317076 N NA SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 3740 433 chr11 121526054 121527560 121526605 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 203142 434 chr11 123348950 123354065 123351180 N NA NA CLMP,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 258298 435 chr11 123389186 123391516 123390447 N NA NA GRAMD1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF202 220847 436 chr11 124593863 124596277 124595391 N NA SIAE,NRGN,ESAM NA NA NA NA NRGN 13552 437 chr11 124993438 124994867 124994318 N NA TMEM218 PKNOX2,ROBO4,HEPACAM,HEPN1,CCDC15,SLC37A2,TMEM218 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM218 20233 438 chr11 128107914 128109749 128109144 N NA NA FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 454062 439 chr11 128128218 128133749 128132556,128129689 Y,N NA;NA NA KCNJ1,ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 430062 440 chr11 128158154 128167801 128161177 N NA NA ETS1,FLI1,LOC100507392,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 396010 441 chr11 128171471 128175086 128172466 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA ETS1,FLI1,KCNJ1,KCNJ5 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 388725 442 chr11 128192226 128194443 128193465 N NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 369368 443 chr11 128472414 128475639 128474018,128473364 N,N NA;NA NA ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 88172 444 chr11 128477511 128483102 128481148 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 80709 445 chr11 128492056 128496570 128494441 N NA NA ETS1,FLI1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 67241 446 chr11 133877624 133879247 133878704 N NA NA JAM3,NCAPD3,IGSF9B IMR90 Hi-C 24141950 NCAPD3 215179 447 chr11 13807999 13813206 13808812 N NA NA NA NA NA NA FAR1 117793 448 chr11 13839274 13841634 13840738 N NA NA NA NA NA NA FAR1 149068 449 chr11 13861687 13864227 13862553 N NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 171481 450 chr11 13870550 13885112 13883005,13872358 N,N NA;NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 180344 451 chr11 13894251 13895938 13895082 N NA NA NA NA NA NA FAR1 204045 452 chr11 13896606 13899212 13897840 N NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 206400 453 chr11 13899914 13904039 13902156 N NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 209708 454 chr11 13917512 13920978 13919342 N NA NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 227306 455 chr11 13943869 13948776 13945608 N NA NA NA NA NA NA FAR1 253663 456 chr11 14915825 14917777 14916761 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 2074 457 chr11 14926167 14927860 14926907 N NA CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 12416 458 chr11 15384120 15388173 15385872 N NA NA C11orf58 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 470369 459 chr11 15431620 15436540 15433294 N NA NA PLEKHA7 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2R1 517869 460 chr11 17228018 17239285 17229577 N NA PIK3C2A NUCB2,B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C2A 36664 461 chr11 22678144 22678958 22678819 N NA FANCF NA NA NA NA FANCF 30757 462 chr11 23561099 23564839 23562937 N NA NA NA NA NA NA FANCF 913712 463 chr11 23588142 23593470 23591491 N NA NA NA NA NA NA FANCF 940755 464 chr11 23596656 23602479 23598534,23602141 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FANCF 949269 465 chr11 26048508 26050768 26049776 N NA NA NA NA NA NA CCDC34 1334027 466 chr11 26062663 26064736 26064313 N NA NA NA NA NA NA CCDC34 1320059 467 chr11 26104649 26111687 26108279,26106010,26109340 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CCDC34 1273108 468 chr11 26117768 26122891 26121529 N NA NA NA NA NA NA CCDC34 1261904 469 chr11 26126129 26135666 26127985,26129473,26134096 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CCDC34 1249129 470 chr11 33396387 33419157 33401714,33398012,33405250,33410139 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA C11orf41,C11orf91,CD59,FBXO3 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK3 117219 471 chr11 33547085 33552280 33547667 N NA C11orf41 C11orf41,HIPK3 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf41 11597 472 chr11 35080021 35081753 35080738 N NA NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 APIP 142082 473 chr11 35098923 35100466 35099788 N NA NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 APIP 160984 474 chr11 35128052 35129438 35128380 N NA NA PDHX,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 APIP 190113 475 chr11 355087 359797 355807 N NA IFITM1 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM1 41096 476 chr11 36703384 36708246 36706067 N NA NA NA NA NA NA RAG2 83555 477 chr11 39984659 39988826 39987418 N NA NA NA NA NA NA API5 3344679 478 chr11 40104528 40111104 40108523 N NA NA NA NA NA NA API5 3222401 479 chr11 43665141 43667435 43665959 N NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 34708 480 chr11 44976244 44977203 44976820 N NA NA NA NA NA NA PRDM11 138361 481 chr11 45100650 45103169 45101860 Y TSPAN18 PRDM11 NA NA NA NA PRDM11 12395 482 chr11 45321393 45324363 45323661 N NA NA TSPAN18,TP53I11,PRDM11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM11 205829 483 chr11 45356081 45358617 45357381 N NA NA PRDM11,SYT13,TP53I11,TSPAN18,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM11 240517 484 chr11 45375931 45380829 45377010 N NA NA CHST1,PRDM11,SYT13,EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM11 260367 485 chr11 45863997 45866065 45864883 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 CRY2,MAPK8IP1 IMR90 Hi-C 24141950 CRY2 2604 486 chr11 46263242 46266693 46265008 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF21A 120257 487 chr11 47414865 47418308 47416469,47415298 N,Y NA;MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 11738 488 chr11 47877827 47880183 47879187 N NA NUP160 NUP160,FNBP4,PTPRJ IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 7770 489 chr11 47921034 47922490 47921556 N NA NA PTPRJ IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 50977 490 chr11 47937778 47941273 47939664 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 NA PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 PTPRJ 60837 491 chr11 57351854 57354062 57352792 N NA UBE2L6 SERPING1,YPEL4,MIR130A IMR90 Hi-C 24141950 UBE2L6 16051 492 chr11 58413993 58423141 58414740,58417543 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 67406 493 chr11 58861232 58871455 58869981,58865689 N,N NA;NA LOC283194,FAM111B,FAM111A FAM111B IMR90 Hi-C 24141950 FAM111B 3203 494 chr11 59024043 59043005 59040228,59042909,59035261 N,N,N NA;NA;NA NA DTX4,MPEG1 IMR90 Hi-C 24141950 DTX4 84231 495 chr11 59050332 59053421 59051612 N NA NA NA NA NA NA DTX4 110520 496 chr11 59316655 59319739 59318014 N NA NA PATL1,OSBP K562 ChIA-PET 22265404 OSBP 63878 497 chr11 6083211 6085353 6084351 N NA NA NA NA NA NA FAM160A2 170588 498 chr11 61809506 61810230 61809904 N NA NA FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 74374 499 chr11 64214847 64217926 64216123 N NA NA SLC22A12,NRXN2,SLC22A11,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 88222 500 chr11 65253120 65262862 65255722,65260560 N,Y NA;BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2371 501 chr11 66224335 66227639 66226139 N NA MRPL11,PELI3,DPP3 PELI3,DPP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PELI3 6159 502 chr11 66773087 66775244 66774204 N NA NA PC,RHOD,SYT12,KDM2A IMR90 Hi-C 24141950 KDM2A 111496 503 chr11 66879908 66881273 66880899 N NA KDM2A SYT12,RHOD,KDM2A,SSH3,PC,ADRBK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM2A 5467 504 chr11 6764174 6768580 6767754 N NA GVINP1 TRIM3,NLRP14,SYT9 IMR90 Hi-C 24141950 GVINP1 21064 505 chr11 70958266 70966075 70962711,70964588 N,N NA;NA SHANK2 SHANK2,FLJ42102 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHANK2 22458 506 chr11 72856923 72870156 72859083,72864444,72869000 N,N,Y NA;NA;NA FCHSD2 FCHSD2,MIR4692,STARD10,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,ARHGEF17 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FCHSD2 3780 507 chr11 72874059 72877099 72876316 N NA FCHSD2 ATG16L2,FCHSD2,P2RY6,ARAP1,STARD10,P2RY2,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 20916 508 chr11 72879592 72883326 72880768 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARHGEF17,STARD10,MIR4692,P2RY2 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 26449 509 chr11 72887679 72889935 72889193 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARHGEF17,STARD10,MIR4692,P2RY2,ARAP1 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 34536 510 chr11 72899885 72901199 72900624 N NA FCHSD2 FCHSD2,ATG16L2,ARHGEF17,P2RY2,P2RY6,ARAP1,STARD10 IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 FCHSD2 46742 511 chr11 73489340 73492679 73490610 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6238 512 chr11 75263749 75266867 75265622 Y SERPINH1 NA RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3 153214 513 chr11 75945220 75946983 75945622 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 144897 514 chr11 76340136 76341565 76341415 N NA LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 40226 515 chr11 7998033 8000062 7999110 N NA EIF3F LOC283299,NLRP10 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3F 8805 516 chr11 82669630 82672471 82671436 N NA NA ANKRD42 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf82 56893 517 chr11 82818670 82830297 82828542 N NA RAB30,LOC100506233,PCF11 LOC100506233,RAB30,PRCP,C11orf82,PCF11 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100506233 35562 518 chr11 8352992 8354173 8353502 N NA NA STK33 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM66 326210 519 chr11 8363925 8365289 8364857 N NA NA NA NA NA NA TRIM66 315094 520 chr11 85910821 85915228 85913849 Y PICALM,PICALM EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 40578 521 chr11 87068457 87089625 87070493 N NA NA NA NA NA NA TMEM135 319571 522 chr11 87163457 87168650 87165139,87167530 N,N NA;NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 414571 523 chr11 87681959 87684563 87683367 N NA NA NA NA NA NA CTSC 386378 524 chr11 9383760 9387044 9386108 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 19125 525 chr11 94988254 94991333 94989540,94989557 N,N NA;NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 24008 526 chr11 95028700 95031252 95030010 N NA NA NA NA NA NA SESN3 64454 527 chr11 95447435 95450354 95449193 Y FAM76B NA SESN3,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 72600 528 chr11 9633915 9649031 9635176,9636752,9643577,9638581 N,N,N,N NA;NA;NA;NA WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028,LYVE1,MRVI1,MRVI1-AS1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SWAP70 36597 529 chr12 102243452 102245327 102244585 N NA GNPTAB GNPTAB,DRAM1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPTAB 18807 530 chr12 102248109 102249880 102248690 Y NA GNPTAB GNPTAB,DRAM1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPTAB 23464 531 chr12 102344384 102346259 102345204 N NA NA CCDC53 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC53 109640 532 chr12 10403338 10407030 10405371 N NA GABARAPL1 NA NA NA NA GABARAPL1 37849 533 chr12 105350846 105353583 105352126 N NA C12orf45 CHST11,SLC41A2,TXNRD1,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf45 26515 534 chr12 106126490 106129126 106127416,106128857 N,N NA;NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 402076 535 chr12 106177114 106179784 106178626 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 452700 536 chr12 106423522 106424498 106424182 N NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 CKAP4 217215 537 chr12 10705967 10711666 10707020,10710386,10711053 N,N,N NA;NA;NA KLRAP1 CLEC1A,KLRC4-KLRK1 IMR90 Hi-C 24141950 KLRAP1 40768 538 chr12 110325662 110327133 110326481 N NA GLTP,TCHP GLTP,TCHP MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 GLTP 7369 539 chr12 110510580 110512194 110511180 N NA C12orf76 NA NA NA NA C12orf76 5080 540 chr12 110516488 110519554 110517628 Y GIT2,RAD9B,C12orf76 C12orf76 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf76 10988 541 chr12 111027434 111030175 111028833 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 GPN3,FAM216A,RAD9B,VPS29,PPTC7,TCTN1,PPP1CC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 6370 542 chr12 111040648 111044917 111043668 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,TCTN1,RAD9B,C12orf76,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC IMR90 Hi-C 24141950 TCTN1 6915 543 chr12 111134421 111137162 111136229 N NA HVCN1,PPP1CC NA NA NA NA HVCN1 6804 544 chr12 111213391 111216113 111214454 N NA PPP1CC PPP1CC K562 ChIA-PET 22265404 PPP1CC 32608 545 chr12 111246848 111248904 111247928 N NA NA CUX2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CC 66065 546 chr12 112553734 112555211 112554584 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 NAA25 7099 547 chr12 113485442 113491689 113488616 N NA DTX1 NA NA NA NA DTX1 3973 548 chr12 11650298 11652675 11651137 N NA NA BCL2L14 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 150113 549 chr12 120729372 120731396 120730505 N NA PXN PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PXN 25798 550 chr12 121497370 121499266 121498344 N NA C12orf43 SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,HNF1A-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf43 43070 551 chr12 12162382 12164663 12163708 N NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 LOH12CR2 345338 552 chr12 12176195 12179905 12178164 N NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 LOH12CR2 330096 553 chr12 122027019 122035038 122028624 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B,ANAPC5,CAMKK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM2B 8099 554 chr12 122124151 122126372 122125028 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16591 555 chr12 123608904 123612267 123611546 N NA LOC100507091,PITPNM2 MPHOSPH9,PITPNM2,OGFOD2,ABCB9,ARL6IP4,LOC100507091,VPS37B,C12orf65,DENR,CCDC62,HIP1R,CDK2AP1,SBNO1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 13929 556 chr12 123613596 123615408 123614564 N NA LOC100507091,PITPNM2 MPHOSPH9,PITPNM2,VPS37B,C12orf65,ABCB9,DENR,CCDC62,HIP1R,OGFOD2,ARL6IP4,LOC100507091,CDK2AP1,SBNO1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 18621 557 chr12 125228401 125230636 125229426 Y NA NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 117883 558 chr12 125367174 125371408 125369575 Y NA SCARB1,UBC UBC K562 ChIA-PET 22265404 SCARB1 18655 559 chr12 125403163 125407151 125406111 N NA UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3576 560 chr12 125532784 125536330 125534248 Y NA AACS AACS,DHX37,BRI3BP K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AACS 13595 561 chr12 125669834 125671911 125670839 N NA NA NA NA NA NA AACS 119909 562 chr12 125732984 125735413 125734285 N NA NA NA NA NA NA AACS 183059 563 chr12 129217959 129219882 129219211 N NA NA TMEM132D IMR90 Hi-C 24141950 SLC15A4 88659 564 chr12 129227090 129234242 129228006,129231975 N,N NA;NA NA TMEM132D,GLT1D1,TMEM132C IMR90 Hi-C 24141950 SLC15A4 74299 565 chr12 131237757 131240346 131239159 N NA NA NA NA NA NA STX2 83473 566 chr12 131995223 131997060 131996017 N NA NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 198575 567 chr12 133017123 133022509 133022170 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2,LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 44648 568 chr12 14262062 14265778 14264871 N NA NA GRIN2B IMR90 Hi-C 24141950 ATF7IP 252833 569 chr12 14303001 14312299 14306815,14309956 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATF7IP 206312 570 chr12 14343986 14346119 14344898 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 172492 571 chr12 14391877 14394475 14392973 N NA NA ATF7IP,GUCY2C,PLBD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 124136 572 chr12 14425567 14427564 14426591 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA ATF7IP 91047 573 chr12 14429285 14432745 14431622 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 85866 574 chr12 14435073 14438182 14437326 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 80429 575 chr12 14729095 14730866 14730164 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 210484 576 chr12 15186247 15190373 15188275 N NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 71685 577 chr12 15218183 15220715 15219180 N NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 103621 578 chr12 1641885 1645262 1642992 Y NA LOC100292680 ERC1,LOC100292680,FBXL14,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100292680 32228 579 chr12 1710030 1713070 1710939 N NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 6699 580 chr12 1716456 1720279 1717696 N NA FBXL14 FBXL14,ERC1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 13125 581 chr12 18102140 18103800 18102782 N NA NA NA NA NA NA LMO3 1340992 582 chr12 25155687 25159980 25157618 N NA C12orf77,LRMP C12orf77,BCAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C12orf77 5314 583 chr12 25161441 25166731 25162260,25165964 N,N NA;NA C12orf77,LRMP BCAT1,C12orf77,LRMP,CASC1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf77 11068 584 chr12 25169488 25173851 25172480 N NA C12orf77,LRMP NA NA NA NA C12orf77 19115 585 chr12 25176565 25178964 25177968 N NA C12orf77,LRMP CASC1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf77 26192 586 chr12 25179476 25189085 25180634 N NA C12orf77,LRMP CASC1,LRMP IMR90 Hi-C 24141950 LRMP 16096 587 chr12 25536498 25540875 25539201 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 132644 588 chr12 26998572 27000241 26999537 N NA ITPR2 RASSF8,BHLHE41,ITPR2,ASUN,STK38L,SSPN,TM7SF3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITPR2 12441 589 chr12 28341451 28345292 28343340 N NA NA KLHDC5,CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 KLHDC5 408264 590 chr12 29541699 29544722 29542535 N NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 7556 591 chr12 31755739 31759012 31756730 N NA DENND5B,METTL20 DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 11787 592 chr12 32016440 32022251 32020985 N NA NA C12orf35 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 90102 593 chr12 32033685 32040556 32039767 N NA NA NA NA NA NA C12orf35 71797 594 chr12 32049504 32054446 32050767 N NA NA AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 57907 595 chr12 32551247 32554246 32552679 N NA NA BICD1,FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 FGD4 100795 596 chr12 32620668 32622137 32621309 N NA FGD4 FGD4,BICD1 IMR90 Hi-C 24141950 FGD4 32904 597 chr12 32634393 32636300 32635554 N NA FGD4 FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 FGD4 18741 598 chr12 34390036 34391236 34390952 N NA NA NA NA NA NA ALG10 214820 599 chr12 40953236 40956701 40955167 N NA NA NA NA NA NA GXYLT1 1581972 600 chr12 43024267 43026561 43025515 N NA NA NA NA NA NA PPHLN1 304320 601 chr12 45902430 45903832 45903119 N NA NA NA NA NA NA LOC400027 217872 602 chr12 46096732 46099345 46097878 N NA LOC400027,ARID2 LOC400027,ARID2 K562 ChIA-PET 22265404 LOC400027 22359 603 chr12 46502022 46505412 46504749 N NA NA NA NA NA NA SCAF11 117621 604 chr12 46776083 46784020 46777619,46781574 N,N NA;NA SLC38A2 SLC38A1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC38A2 9438 605 chr12 46823531 46826385 46824386 Y NA NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 56886 606 chr12 46848449 46850440 46849500 N NA NA SLC38A2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 81804 607 chr12 46852007 46855119 46854162 N NA NA SLC38A2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 85362 608 chr12 46863174 46866998 46864013 N NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A2 96529 609 chr12 46967027 46968038 46967177 N NA NA SLC38A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC38A2 200382 610 chr12 47670039 47672024 47670864 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100233209 59813 611 chr12 47753471 47755771 47755068 N NA NA AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100233209 143245 612 chr12 49626863 49629789 49628384 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2,LMBR1L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 29076 613 chr12 52510919 52514980 52513126,52512246 N,N NA;NA C12orf44 GRASP,NR4A1,KRT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf44 47161 614 chr12 52516852 52520078 52517979 N NA NA NR4A1,KRT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf44 53094 615 chr12 53266959 53269150 53268094 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4B 130912 616 chr12 53763820 53767149 53765143 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6830 617 chr12 54139503 54153914 54145309,54149057,54151121 Y,N,N NA;NA;NA CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 18196 618 chr12 55383735 55388698 55386107,55386083 N,N NA;NA KIAA0748 NA NA NA NA KIAA0748 5279 619 chr12 56767313 56772213 56770712 N NA PAN2,IL23A,STAT2 COQ10A,ANKRD52,CS,PAN2,STAT2,APOF,MIP,TIMELESS IMR90 Hi-C 24141950 STAT2 13276 620 chr12 57511822 57513391 57512928 N NA TMEM194A,NAB2,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 STAT6 6626 621 chr12 57810906 57826294 57824746 N NA INHBE,GLI1,ARHGAP9 R3HDM2,SHMT2,NDUFA4L2,STAC3,INHBE,GLI1,INHBC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INHBE 22802 622 chr12 58287137 58294367 58290607 N NA CTDSP2,LOC100506844,XRCC6BP1 CTDSP2,TSFM,AVIL,CDK4,METTL21B,CYP27B1,METTL1,MARCH9,TSPAN31,AGAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506844 35580 623 chr12 58595718 58599321 58597279 N NA NA NA NA NA NA XRCC6BP1 260273 624 chr12 59988420 60010916 59990335 N NA NA NA NA NA NA SLC16A7 72210 625 chr12 61916695 61919012 61918090 N NA NA NA NA NA NA USP15 735109 626 chr12 6249687 6250738 6250428 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL,IFFO1,CHD4 NA VWF,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 200545 627 chr12 65549087 65551355 65550565 N NA LEMD3 LEMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 LEMD3 11996 628 chr12 67084781 67092871 67087241,67091362 N,N NA;NA NA GRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 HELB 388425 629 chr12 67908806 67911604 67909821 N NA NA NA NA NA NA DYRK2 130908 630 chr12 68024104 68026160 68024728 Y DYRK2 DYRK2 NA NA NA NA DYRK2 16352 631 chr12 68090797 68094941 68093084 N NA DYRK2 DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 48285 632 chr12 68380608 68439963 68385091,68382588,68436205 Y,Y,N DYRK2,IFNG;IL22;NA NA IFNG IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 286198 633 chr12 68839482 68842712 68841798 N NA NA NA NA NA NA MDM1 113321 634 chr12 68843877 68846005 68845161 N NA NA SNORA70G,RAP1B,LOC100507250,NUP107 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 117716 635 chr12 68984400 68987403 68985664 N NA RAP1B NA NA NA NA RAP1B 17216 636 chr12 69549780 69551844 69551001 N NA NA CPM,CPSF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPSF6 81473 637 chr12 69723572 69726173 69724501 N NA YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 27359 638 chr12 70298796 70302557 70300425 N NA NA PTPRB,PTPRR,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3IP 166165 639 chr12 70325950 70328400 70327093 Y NA NA PTPRB,PTPRR,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3IP 193319 640 chr12 70861230 70865105 70861841 N NA NA NA NA NA NA KCNMB4 101168 641 chr12 70879908 70883030 70881411 N NA NA NA NA NA NA KCNMB4 119846 642 chr12 75865220 75866921 75866151 N NA KRR1 NA NA NA NA KRR1 38497 643 chr12 775513 777332 776182 Y NA NA NINJ2,CCDC77,B4GALNT3,WNK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNK1 84757 644 chr12 781334 785283 783136 N NA NA CCDC77,NINJ2,B4GALNT3,WNK1 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 76806 645 chr12 78811864 78814630 78812838 N NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 1270160 646 chr12 793585 796298 794785 Y CCDC77,KDM5A NA NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 65791 647 chr12 8122220 8124471 8123428 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 NA SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP1 110336 648 chr12 8177838 8180879 8179295 Y NA NA PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP1 53928 649 chr12 827866 830008 828801 N NA WNK1 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 32081 650 chr12 82997231 83000268 82998379 N NA NA NA NA NA NA CCDC59 244647 651 chr12 83002091 83004290 83003553 N NA NA NA NA NA NA CCDC59 249507 652 chr12 85214503 85219240 85215803 N NA NA NA NA NA NA CCDC59 2461919 653 chr12 85219861 85222071 85220844 N NA NA NA NA NA NA CCDC59 2467277 654 chr12 85817714 85819577 85818565 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 2609691 655 chr12 85920865 85922234 85921438 N NA NA NA NA NA NA C12orf29 2507034 656 chr12 8728584 8733431 8730645,8732187 N,N NA;NA AICDA KLRG1 IMR90 Hi-C 24141950 AICDA 32011 657 chr12 8839623 8841954 8840680 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8564 658 chr12 8844193 8846692 8845358 N NA RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 3826 659 chr12 89618004 89619843 89619033 N NA NA DUSP6,LOC728084,POC1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POC1B 300196 660 chr12 89637382 89640054 89638598 N NA NA POC1B,DUSP6 IMR90 Hi-C 24141950 POC1B 279985 661 chr12 90255874 90259085 90257110 N NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 153142 662 chr12 90273705 90276271 90274821 N NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 170973 663 chr12 90320272 90324286 90321881 N NA NA NA NA NA NA LOC338758 217540 664 chr12 92549890 92556995 92551881 N NA LOC256021 CLLU1OS,CLLU1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC256021 13443 665 chr12 92600818 92603226 92602252 N NA NA LOC256021 K562 ChIA-PET 22265404 LOC256021 64371 666 chr12 92754973 92759184 92757208 N NA NA NA NA NA NA LOC256021 218526 667 chr12 92853622 92888098 92856115,92860624 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC256021 317175 668 chr12 92895334 92909250 92899295,92897213 Y,N EEA1,BTG1;NA NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC256021 358887 669 chr12 92932333 92936124 92933824 N NA NA NA NA NA NA EEA1 386983 670 chr12 92946112 92953366 92950864,92949817 N,N NA;NA NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 369741 671 chr12 95161371 95164185 95162708 N NA NA TMCC3,PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA12 233326 672 chr12 95198661 95200730 95199675 N NA NA TMCC3,PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA12 196781 673 chr12 95264600 95268011 95267265 N NA NA NA NA NA NA NDUFA12 129500 674 chr12 95735614 95739285 95737634 N NA NA FGD6,VEZT,PLXNC1,NR2C1 IMR90 Hi-C 24141950 VEZT 124092 675 chr12 95755085 95757096 95755937 N NA NA METAP2,USP44 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 110726 676 chr12 95806869 95812712 95810802 N NA NA FGD6,VEZT,NDUFA12,PLXNC1,METAP2 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 55110 677 chr12 95821641 95823652 95822442 N NA METAP2 NR2C1 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 44170 678 chr12 95830647 95834810 95831645,95833486 N,N NA;NA METAP2 NR2C1,FGD6,VEZT IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 33012 679 chr12 96498842 96500654 96499807 N NA NA CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 ELK3 87553 680 chr12 96800338 96802781 96801797 N NA CDK17 CDK17,ELK3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDK17 5972 681 chr12 9916187 9918468 9917494 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69 CLECL1,CD69 NA NA NA NA CD69 2690 682 chr13 100071874 100073532 100072716 Y GPR18,GPR183 NA UBAC2,MIR548AN,GPR18,DOCK9,UBAC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 80196 683 chr13 103240057 103245980 103244688 N NA TPP2 BIVM-ERCC5,TEX30,METTL21C,TPP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPP2 3306 684 chr13 103586497 103590434 103588605 N NA NA NA NA NA NA METTL21CP1 54048 685 chr13 103750310 103755521 103754189 N NA SLC10A2 NA NA NA NA SLC10A2 31114 686 chr13 110358789 110361295 110359493 Y IRS2 NA MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CARKD 906512 687 chr13 113021962 113023994 113023470 N NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 218487 688 chr13 113259663 113261303 113260777 N NA TUBGCP3 ATP11A,TUBGCP3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBGCP3 17182 689 chr13 113279911 113281453 113280558 N NA TUBGCP3 ATP11A,C13orf35,TUBGCP3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP3 37430 690 chr13 114044235 114048974 114048437 N NA NA GRTP1,LAMP1,F7,F10,MCF2L,CUL4A,ADPRHL1,DCUN1D2,MCF2L-AS1,PCID2,TMCO3 IMR90 Hi-C 24141950 ADPRHL1 58865 691 chr13 114907000 114909998 114908620 Y RASA3 NA RASA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC16 90364 692 chr13 20159438 20161816 20161214 N NA MPHOSPH8 NA NA NA NA MPHOSPH8 45972 693 chr13 21117590 21119554 21118854 N NA NA IFT88,IL17D,XPO4 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT2 228503 694 chr13 21871382 21873921 21872614 N NA NA ZDHHC20 MCF7 ChIA-PET 22265404 SKA3 120641 695 chr13 24670353 24672185 24671383 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 62676 696 chr13 25192030 25193817 25192835 N NA NA NA NA NA NA PARP4 105082 697 chr13 25199156 25200915 25200449 N NA NA ATP12A,RNF17 IMR90 Hi-C 24141950 PARP4 112208 698 chr13 25754888 25756099 25755480 N NA NA NA NA NA NA MTMR6 105605 699 chr13 26759292 26766777 26760593 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 29731 700 chr13 27358234 27361315 27359892 N NA NA CDX2 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 384718 701 chr13 27538256 27539709 27539170 N NA NA NA NA NA NA USP12 206324 702 chr13 27570905 27573312 27571701 N NA NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 172721 703 chr13 28035248 28037474 28036121 N NA GTF3A,MTIF3 GSX1,MTIF3,POLR1D,PRHOXNB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTIF3 10509 704 chr13 28050856 28052574 28051843 Y POLR1D MTIF3 GSX1,PRHOXNB,MTIF3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTIF3 26117 705 chr13 28056658 28058770 28057288 N NA MTIF3 ATP5EP2 IMR90 Hi-C 24141950 MTIF3 31919 706 chr13 28270050 28273114 28271240 N NA NA GSX1 IMR90 Hi-C 24141950 POLR1D 75170 707 chr13 29394061 29396122 29394543 N NA NA FLT3,PAN3,PAN3-AS1,FLT1,SLC46A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC46A3 100911 708 chr13 29423868 29427154 29424751 N NA NA NA NA NA NA SLC46A3 130718 709 chr13 30967869 30971012 30969424 N NA LINC00426 LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 19833 710 chr13 30980652 30984144 30982742 Y NA LINC00426 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 32616 711 chr13 30987567 30998140 30990017,30996487 N,N NA;NA LINC00426,HMGB1 LINC00426,USPL1,KATNAL1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 39531 712 chr13 31950616 31954279 31952290 N NA NA NA NA NA NA B3GALTL 176504 713 chr13 34300225 34305613 34302691,34304462 N,Y NA;NA NA STARD13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC3 86593 714 chr13 34311482 34314735 34313888 N NA NA STARD13 IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 77471 715 chr13 34316799 34322046 34319004 N NA NA NA NA NA NA RFC3 70160 716 chr13 34359347 34363496 34361706 N NA RFC3 NBEA IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 28710 717 chr13 40685655 40703552 40701190,40699525 N,N NA;NA NA FOXO1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00548 91087 718 chr13 41265039 41269924 41268058 N NA FOXO1 COG6,MIR320D1,MRPS31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXO1 24305 719 chr13 43226074 43231858 43227888 N NA NA ENOX1,EPSTI1,CCDC122 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 334519 720 chr13 43705704 43707713 43707251 N NA NA NA NA NA NA DNAJC15 108342 721 chr13 44713619 44719306 44716275 N NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC122 259793 722 chr13 44823387 44824059 44823710 N NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1-AS1 325973 723 chr13 44828572 44834998 44833665 N NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 315034 724 chr13 44844498 44851396 44848849 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 298636 725 chr13 44914032 44915914 44914852 N NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1-AS1 234118 726 chr13 44924928 44927625 44926462 N NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1-AS1 222407 727 chr13 46784328 46787157 46786056 N NA LCP1 NA NA NA NA LCP1 27869 728 chr13 46868581 46872261 46870624 N NA NA NA NA NA NA KIAA0226L 89374 729 chr13 46967898 46980752 46975921,46979974 N,N NA;NA KIAA0226L KIAA0226L IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0226L 6263 730 chr13 47008823 47013641 47012362 N NA KIAA0226L NA NA NA NA KIAA0226L 47188 731 chr13 50180796 50183725 50182107 N NA RCBTB1,ARL11 RCBTB1,CDADC1,CAB39L,SETDB2,FNDC3A,MLNR,PHF11,ARL11 IMR90 Hi-C 24141950 ARL11 18710 732 chr13 50525671 50533473 50531029 N NA SPRYD7,TRIM13 EBPL,KPNA3 IMR90 Hi-C 24141950 SPRYD7 15046 733 chr13 50726442 50729560 50726903 N NA DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 26765 734 chr13 51085059 51088782 51086652 N NA NA DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 385382 735 chr13 51098886 51104196 51100870 N NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613,CTAGE10P,ST13P4,DLEU7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASEH2B 379618 736 chr13 51149116 51151071 51149844 N NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 332743 737 chr13 51162036 51164078 51163352 N NA NA DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 319736 738 chr13 51166465 51171871 51168942 N NA NA DLEU1,DLEU2,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 311943 739 chr13 51190288 51191815 51191271 N NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 291999 740 chr13 51463492 51469877 51466708 N NA RNASEH2B DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 13937 741 chr13 51897951 51899860 51898989 N NA NA FAM124A,DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 INTS6 127415 742 chr13 53683550 53685831 53684474 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 456719 743 chr13 54602765 54604577 54603547 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 1375934 744 chr13 58775934 58778731 58777622 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1959388 745 chr13 58891605 58894459 58892281 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1843660 746 chr13 62782354 62785386 62783885 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 1811763 747 chr13 66711654 66714941 66712890 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 5741063 748 chr13 74861129 74865830 74864699,74861336 Y,N KLF12;NA NA KLF12 IMR90 Hi-C 24141950 KLF12 153063 749 chr13 77912233 77916694 77913594 N NA MYCBP2 MYCBP2 K562 ChIA-PET 22265404 MYCBP2 11056 750 chr13 78711587 78712902 78712144 N NA NA POU4F1 IMR90 Hi-C 24141950 SLAIN1 439598 751 chr13 79419271 79422634 79420396 N NA NA NA NA NA NA RNF219 185957 752 chr13 85507589 85508586 85507989 N NA NA NA NA NA NA NDFIP2 5452330 753 chr13 87205776 87207107 87206511 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4792967 754 chr13 87408284 87419755 87409803,87412912,87417861 Y,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4580319 755 chr13 87574973 87577682 87575964 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4422392 756 chr13 88020651 88021245 88020700 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 3978829 757 chr13 88405514 88407529 88406600 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 3592545 758 chr13 90938979 90947552 90939908,90946151 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1052522 759 chr13 91273585 91277768 91275279 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 722306 760 chr13 91706819 91710400 91709217 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 289674 761 chr13 91962879 91966466 91964286 N NA MIR17HG NA NA NA NA MIR17HG 33608 762 chr13 95199597 95203048 95201419 N NA TGDS NA NA NA NA TGDS 45463 763 chr13 97664412 97668856 97666163,97668201 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MBNL2 205718 764 chr13 99780276 99782478 99781447 N NA DOCK9 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK9 41616 765 chr14 100658005 100661154 100659455 Y NA DEGS2,YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 31993 766 chr14 100677227 100682274 100680643 N NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 22828 767 chr14 101822655 101829204 101827190,101824672 N,N NA;NA NA MEG8,DIO3OS,DIO3,MIR1247,MEG3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00239 367570 768 chr14 101864968 101867596 101866367 N NA NA DIO3OS IMR90 Hi-C 24141950 LINC00239 329178 769 chr14 101916250 101918404 101917841 N NA NA NA NA NA NA LINC00239 278370 770 chr14 101930971 101932845 101932124 N NA NA NA NA NA NA LINC00239 263929 771 chr14 102989563 102992583 102991122 Y NA NA ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 66413 772 chr14 103039752 103040478 103040112 N NA RCOR1 TECPR2,RCOR1,TRAF3,AMN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 18518 773 chr14 103557159 103558557 103558031 N NA EXOC3L4 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EXOC3L4 7924 774 chr14 106026651 106028069 106027321 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 70459 775 chr14 106030640 106032229 106031833 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 74448 776 chr14 106035067 106041081 106039274 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 78875 777 chr14 106042272 106045004 106043458 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 86080 778 chr14 106046596 106048626 106047729 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 90404 779 chr14 106051687 106057196 106052354 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 95495 780 chr14 106150231 106152009 106151443 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 194039 781 chr14 106152697 106159055 106153713,106158018 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 196505 782 chr14 106165965 106170193 106166698 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 209773 783 chr14 106171378 106178245 106172694 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 205593 784 chr14 106210806 106215925 106214299 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 167913 785 chr14 106282017 106287521 106284587 Y TEX22,C14orf80 NA NA NA NA NA KIAA0125 96317 786 chr14 106313258 106330546 106327916,106322928 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIAA0125 53292 787 chr14 106370417 106378586 106372461 N NA KIAA0125 NA NA NA NA KIAA0125 5252 788 chr14 106828856 106832635 106830287 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 445018 789 chr14 106841749 106854572 106843958,106852907 N,N NA;NA NA LINC00221 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA0125 457911 790 chr14 106877478 106879444 106877967 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 493640 791 chr14 107149935 107152493 107150992 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 766097 792 chr14 107153480 107156827 107154825 N NA NA KIAA0125 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0125 769642 793 chr14 107165615 107171974 107170399 N NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0125 781777 794 chr14 107174810 107179054 107175558 N NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0125 790972 795 chr14 107179745 107185617 107183338,107179758 N,N NA;NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0125 795907 796 chr14 107198618 107202151 107199456,107201047 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIAA0125 814780 797 chr14 107215628 107222155 107219385 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 831790 798 chr14 107227477 107264120 107230735,107238039,107248681,107259827,107253073 N,N,N,N,Y NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA KIAA0125 843639 799 chr14 107277805 107287476 107283452 N NA NA NA NA NA NA KIAA0125 893967 800 chr14 21135351 21137994 21136832 N NA NA RNASE4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNASE6 111216 801 chr14 22361929 22364610 22362782 N NA NA NA NA NA NA METTL3 382472 802 chr14 22391209 22393840 22392496 N NA NA NA NA NA NA METTL3 411752 803 chr14 22850835 22853388 22852140 N NA NA OXA1L,SLC7A7,RBM23,DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 204755 804 chr14 22884205 22888900 22887756 N NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 169243 805 chr14 22897725 22903656 22898708,22902049 N,N NA;NA NA DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 154487 806 chr14 22915810 22919384 22917469 N NA NA OXA1L,SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 138759 807 chr14 22936865 22939716 22938216 N NA NA SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 118427 808 chr14 22951901 22955298 22953321 N NA NA SLC7A7,DAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 102845 809 chr14 22956514 22965817 22960079 N NA NA DAD1,MMP14 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 92326 810 chr14 23216460 23218746 23217809 N NA OXA1L SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 16985 811 chr14 24931972 24939969 24932941 N NA CBLN3,KHNYN,SDR39U1 CMA1 IMR90 Hi-C 24141950 SDR39U1 19965 812 chr14 25142264 25143427 25142274 N NA NA NA NA NA NA GZMH 63400 813 chr14 31730219 31732259 31731207 N NA NA AP4S1,HEATR5A,HECTD1,STRN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 53530 814 chr14 32669507 32674191 32670759,32672560 N,Y NA;ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 123012 815 chr14 34485714 34489201 34487870 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 442267 816 chr14 34649446 34650604 34649851 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 280864 817 chr14 34799722 34802801 34801284 N NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 128667 818 chr14 35808637 35810480 35809148 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA PSMA6 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMA6 47063 819 chr14 35907704 35909669 35908752 N NA NFKBIA RALGAPA1,KIAA0391,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 33744 820 chr14 38533499 38536390 38534568 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 1036047 821 chr14 38543108 38544258 38543543 N NA NA NA NA NA NA SEC23A 1028179 822 chr14 38590964 38599869 38594628,38597743 N,N NA;NA NA CLEC14A IMR90 Hi-C 24141950 SEC23A 972568 823 chr14 40762117 40763930 40763244 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 860413 824 chr14 40764446 40766906 40765298 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 862742 825 chr14 50323989 50336549 50330320,50324417,50328303,50334958 N,N,N,Y NA;NA;NA;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 NEMF,ARF6,C14orf182,C14orf183,METTL21D,SOS2,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 4450 826 chr14 50505904 50508219 50507350 N NA C14orf182 C14orf182,ARF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C14orf182 31666 827 chr14 50510781 50512893 50512105 Y RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182 C14orf182,C14orf183 C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C14orf182 36543 828 chr14 50513781 50514642 50514231 N NA C14orf182,C14orf183 C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C14orf182 39543 829 chr14 50527235 50530317 50529017 N NA C14orf183 NA NA NA NA C14orf183 29044 830 chr14 51325947 51327553 51326752 N NA NIN ATL1,NIN,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 NIN 28108 831 chr14 52313123 52315986 52314082 N NA NA GNG2,FRMD6,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 140242 832 chr14 52641277 52644294 52642840 N NA NA NA NA NA NA C14orf166 185049 833 chr14 54078978 54081657 54080652 N NA NA NA NA NA NA DDHD1 458932 834 chr14 55568003 55570528 55569133 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK1IP1L 49641 835 chr14 56811260 56813310 56811959 N NA NA PELI2,KTN1,LINC00520 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf101 233201 836 chr14 56878242 56888645 56880410,56885328,56878325 N,N,N NA;NA;NA NA RPL13AP3,LINC00520,PELI2,KTN1 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf101 157866 837 chr14 60430452 60433094 60432133 N NA NA DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 125535 838 chr14 60669464 60672697 60671695 N NA DHRS7,PPM1A NA NA NA NA DHRS7 37253 839 chr14 60791976 60799954 60794941,60798367 N,N NA;NA NA C14orf39,SIX6,TMEM30B IMR90 Hi-C 24141950 PPM1A 79506 840 chr14 61121782 61125996 61124032 N NA NA SLC38A6,SIX1,TRMT5,MNAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MNAT1 75463 841 chr14 64113408 64119158 64117455,64114143 N,N NA;NA WDR89 SGPP1,SYNE2,WDR89 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR89 4817 842 chr14 64205790 64208182 64206988 N NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 11034 843 chr14 64210415 64218127 64212946,64215665 N,N NA;NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 15659 844 chr14 65346074 65347636 65346864 N NA CHURC1-FNTB SPTB IMR90 Hi-C 24141950 CHURC1-FNTB 33443 845 chr14 65623056 65624193 65623590 N NA NA LOC645431,FUT8 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 53829 846 chr14 65634561 65637425 65636247 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 65334 847 chr14 65670565 65676596 65673010 N NA NA LOC645431,FUT8 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 101338 848 chr14 65709746 65711971 65710902 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 140519 849 chr14 65748389 65750772 65749310 N NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645431 128563 850 chr14 65752783 65756056 65754136 N NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC645431 123279 851 chr14 65768222 65773276 65768975,65771036 N,N NA;NA NA MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645431 106059 852 chr14 65819705 65821480 65820162 N NA NA MIR4708,FUT8,LOC645431 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC645431 57855 853 chr14 65823466 65825444 65824055 N NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC645431 53891 854 chr14 69141388 69153587 69149937,69152376,69142081 N,N,N NA;NA;NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 109373 855 chr14 69155458 69156885 69155823 N NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 106075 856 chr14 69271100 69291081 69282503,69273761,69289155 N,N,Y NA;NA;NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 8140 857 chr14 71278269 71283209 71281275 N NA MAP3K9 MAP3K9 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAP3K9 2381 858 chr14 71780593 71789178 71787463 N NA NA SIPA1L1,PCNX IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 165400 859 chr14 75084468 75086277 75084896 N NA NA LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KIAA0317 93530 860 chr14 75341901 75343882 75342837 N NA PROX2,DLST DLST K562 ChIA-PET 22265404 DLST 4712 861 chr14 75724724 75727035 75725845 N NA FOS,LOC731223 TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOS 18446 862 chr14 77421686 77424228 77422888 N NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 70806 863 chr14 77497976 77501480 77500153 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 2942 864 chr14 77505204 77508544 77506667 N NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 10170 865 chr14 82513241 82515949 82514451 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 513036 866 chr14 82520621 82523027 82522041 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 520416 867 chr14 85032952 85034158 85033580 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 3032747 868 chr14 90186240 90188012 90187338 Y FOXN3,FOXN3,TDP1 NA EFCAB11,LOC400236,FOXN3,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 100746 869 chr14 90847426 90851539 90849645 N NA C14orf102,CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11788 870 chr14 91293954 91296250 91294610 N NA NA TTC7B,RPS6KA5,CCDC88C,C14orf159 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA5 230743 871 chr14 93327170 93330832 93329485 N NA NA NA NA NA NA GOLGA5 66520 872 chr14 95793127 95796662 95793914 N NA NA CLMN,GSC IMR90 Hi-C 24141950 LINC00341 79765 873 chr14 96106203 96109735 96107471 N NA TCL6,TCL1B NA NA NA NA TCL6 7780 874 chr14 97068137 97069673 97068605 N NA NA NA NA NA NA PAPOLA 99424 875 chr14 97099717 97103745 97101243 N NA NA NA NA NA NA PAPOLA 131004 876 chr14 97427882 97434277 97428826 N NA NA NA NA NA NA VRK1 164198 877 chr14 97571687 97574034 97572849 N NA NA NA NA NA NA VRK1 308003 878 chr14 99826131 99828571 99827486 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 118655 879 chr15 100041501 100045862 100042789,100044858 N,N NA;NA NA LRRC28,MEF2A IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 60271 880 chr15 100046939 100054184 100047528,100052187,100049692 N,N,N NA;NA;NA NA MEF2A,LRRC28,TTC23 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 51949 881 chr15 101665114 101669306 101667378 Y NA NA CHSY1,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122831 882 chr15 22445950 22450619 22449549 Y NA NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 382776 883 chr15 22775702 22778140 22777119,22776166 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 55255 884 chr15 31114540 31121882 31116057 N NA NA NA NA NA NA FAN1 74194 885 chr15 31546249 31549400 31546687,31549052 N,N NA;NA LOC283710 LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283710 23199 886 chr15 31593029 31595449 31594030 N NA KLF13 OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 23634 887 chr15 31599481 31601039 31600623 Y NA KLF13 OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 18044 888 chr15 31726673 31729177 31727934 N NA NA KLF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 107590 889 chr15 38360730 38362506 38361446 N NA NA SPRED1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM98B 383822 890 chr15 38368414 38370417 38369230 N NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 375911 891 chr15 38942087 38945741 38943947,38945377 N,N NA;NA NA RASGRP1,FAM98B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RASGRP1 85080 892 chr15 38961921 38966768 38962694,38964627 N,N NA;NA NA RASGRP1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 104914 893 chr15 38974426 38977036 38975519 N NA NA RASGRP1,FAM98B,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASGRP1 117419 894 chr15 40406437 40409922 40408167 N NA BMF,BUB1B SRP14,LOC100131089,BMF,BUB1B,PAK6,PLCB2,ANKRD63 IMR90 Hi-C 24141950 BMF 5362 895 chr15 42782013 42785190 42783387 N NA ZFP106,SNAP23 NA NA NA NA SNAP23 2314 896 chr15 44971522 44976075 44975214 N NA SPG11,PATL2,B2M B2M MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PATL2 2436 897 chr15 46024299 46026491 46025515 N NA NA NA NA NA NA PLDN 144882 898 chr15 46067867 46071866 46070076 N NA NA NA NA NA NA PLDN 188450 899 chr15 46073851 46076809 46075445 N NA NA NA NA NA NA PLDN 194434 900 chr15 48104171 48107465 48105731 N NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 363093 901 chr15 51170575 51174973 51173580,51171418 Y,N USP8,SPPL2A;NA AP4E1 TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 AP4E1 25896 902 chr15 52999782 53003580 53002067 N NA FAM214A NA NA NA NA FAM214A 28962 903 chr15 53021429 53023464 53022519 N NA NA MYO5C,FAM214A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM214A 50609 904 chr15 56823159 56827415 56825946 N NA NA ZNF280D IMR90 Hi-C 24141950 TEX9 165515 905 chr15 56828891 56831988 56830850 N NA NA ZNF280D IMR90 Hi-C 24141950 TEX9 171247 906 chr15 58589477 58592367 58590706 N NA NA ADAM10,LIPC,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 449810 907 chr15 58593834 58595483 58594908 N NA NA ADAM10,LIPC,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 446694 908 chr15 59271124 59274337 59271937 N NA SLTM,RNF111 FAM81A,RNF111 IMR90 Hi-C 24141950 RNF111 5528 909 chr15 59681192 59707159 59686807,59698672,59705154,59692222,59687888 N,Y,N,N,N NA;FAM81A;NA;NA;NA MYO1E,FAM81A MYO1E,FAM81A,LDHAL6B,CCNB2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1E 16121 910 chr15 62410861 62412459 62411679 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 58197 911 chr15 62681250 62684818 62682690 N NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 328586 912 chr15 63765092 63768817 63767213 Y RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 27893 913 chr15 63772570 63773711 63773347 Y LACTB,RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 22999 914 chr15 63778640 63780822 63778853 N NA USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 15888 915 chr15 65127533 65130055 65128056 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1,RBPMS2,PLEKHO2,ANKDD1A,SPG21,MTFMT K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHO2 4027 916 chr15 65183484 65189897 65187166,65183531 Y,N ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16;NA PLEKHO2 SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHO2 49402 917 chr15 65587066 65589646 65588276 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 8048 918 chr15 65595659 65598401 65596898 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 16641 919 chr15 66124747 66127374 66125753 N NA DENND4A,RAB11A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11A 34423 920 chr15 66661139 66664309 66662968,66662734 N,N NA;NA TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNORD18C,SNORD18B,SNORD16,SNAPC5,ZWILCH IMR90 Hi-C 24141950 TIPIN 12085 921 chr15 66984488 66986044 66985372 N NA SMAD6 SMAD6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 8630 922 chr15 67157870 67159558 67158710 N NA NA SMAD6,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 163196 923 chr15 67171003 67171718 67171333 N NA NA SMAD6,IQCH,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 176329 924 chr15 67200104 67201191 67200816 N NA NA LOC100506686,IQCH,SMAD6,SMAD3,MAP2K5,SKOR1,AAGAB,C15orf61 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 157004 925 chr15 68154485 68157133 68155537 N NA SKOR1 PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 SKOR1 36544 926 chr15 68288710 68290477 68289681 N NA NA PIAS1,IQCH,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 56095 927 chr15 68850120 68855856 68853047 N NA CORO2B NA NA NA NA CORO2B 15452 928 chr15 69960295 69963818 69961211 N NA NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 215136 929 chr15 70050543 70053206 70051467 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 305384 930 chr15 70174716 70176193 70175199 N NA NA C15orf50,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 214063 931 chr15 70211291 70214472 70212372 N NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 175784 932 chr15 70271021 70273998 70272390 N NA NA LOC145837,C15orf50,TLE3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 116258 933 chr15 70289302 70290923 70290396 N NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 99333 934 chr15 70411870 70413631 70412613 N NA TLE3 TLE3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 21614 935 chr15 70610822 70614722 70612031 Y NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 220566 936 chr15 70727014 70729269 70727971 N NA NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 326581 937 chr15 70782753 70784829 70783635 N NA NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 271021 938 chr15 70794759 70798677 70797260 Y TLE3 NA LOC145837,TLE3,KIF23,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 257173 939 chr15 70799635 70801080 70800682 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 254770 940 chr15 70819498 70821686 70820777 N NA NA TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 234164 941 chr15 71098815 71100737 71099777 N NA UACA LRRC49,THAP10,UACA,LARP6 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 42965 942 chr15 75253101 75254394 75253963 N NA COX5A,SCAMP5 CLK3,EDC3,CYP1A2,CSK,C15orf17,COX5A,RPP25,SCAMP5,C15orf39,COMMD4,NEIL1 IMR90 Hi-C 24141950 COX5A 22606 943 chr15 76348255 76350204 76349379 N NA NRG4 NRG4,C15orf27,FBXO22,FBXO22-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NRG4 43470 944 chr15 77196332 77198708 77197752 N NA RCN2 ETFA IMR90 Hi-C 24141950 RCN2 25254 945 chr15 77374582 77377434 77376360 N NA TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 11012 946 chr15 77833761 77836330 77835817 N NA NA PEAK1,TSPAN3,HMG20A,PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 HMG20A 120518 947 chr15 77962057 77963965 77962912 N NA NA NA NA NA NA HMG20A 248814 948 chr15 77997365 77999706 77998916 N NA NA LINGO1,LOC253044 IMR90 Hi-C 24141950 HMG20A 284122 949 chr15 78094006 78095397 78094910 N NA NA LOC253044 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 274597 950 chr15 78128153 78130741 78128980 N NA NA LINGO1,LOC253044 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 239253 951 chr15 78942749 78946488 78944070 N NA NA NA NA NA NA PSMA4 110002 952 chr15 78955577 78957519 78956782 N NA NA CHRNA5,CHRNB4,LOC729911 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA4 122830 953 chr15 79020439 79021624 79021414 N NA NA NA NA NA NA MORF4L1 143548 954 chr15 79152239 79153341 79152781 Y IREB2 MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11831 955 chr15 79652617 79653875 79652770 N NA TMED3 MTHFS,ST20-MTHFS IMR90 Hi-C 24141950 TMED3 49126 956 chr15 79864388 79864675 79864532 N NA NA NA NA NA NA TMED3 260897 957 chr15 82150264 82154004 82152628,82151000 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MEX3B 184357 958 chr15 82157173 82160374 82158487 N NA NA NA NA NA NA MEX3B 177987 959 chr15 82170607 82174360 82172797 N NA NA EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 164001 960 chr15 82200280 82204118 82202084,82203828 N,N NA;NA NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 134243 961 chr15 85273474 85279861 85278556 N NA SEC11A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF592 11957 962 chr15 85870859 85876034 85873773 N NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47837 963 chr15 86413869 86416365 86415012 N NA NA NA NA NA NA AKAP13 489998 964 chr15 86492355 86494963 86493491 N NA NA NA NA NA NA AKAP13 568484 965 chr15 88943237 88947351 88945309 N NA NA NA NA NA NA MRPL46 63282 966 chr15 89544975 89546905 89545682 N NA NA MFGE8,HAPLN3,ACAN,ABHD2,RLBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABHD2 84476 967 chr15 89985474 89987398 89986039 N NA NA POLG,LOC254559,MIR9-3,RHCG,LOC283761,C15orf42 IMR90 Hi-C 24141950 POLG 107448 968 chr15 92026734 92029701 92028423 N NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 367237 969 chr15 93361906 93367420 93363753,93366126 Y,Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2;NA NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 58653 970 chr15 93373283 93377667 93375623 N NA LOC100507217 LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 48406 971 chr15 93382302 93384636 93383140 N NA LOC100507217 CHD2,LOC100507217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507217 41437 972 chr15 93391534 93393587 93392785 N NA LOC100507217,CHD2 LOC100507217 K562 ChIA-PET 22265404 LOC100507217 32486 973 chr15 94772608 94784970 94774755 N NA NA MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 56460 974 chr15 98685733 98696392 98690828,98694150,98686527 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA IGF1R 496369 975 chr15 98700716 98712667 98702705,98707414 N,N NA;NA NA NA NA NA NA IGF1R 480094 976 chr15 99143081 99144209 99143619 N NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 48552 977 chr16 10390734 10392907 10391413 N NA NA NA NA NA NA NUBP1 444791 978 chr16 10406321 10407930 10407157 N NA NA NA NA NA NA NUBP1 429768 979 chr16 10421933 10424496 10423719 N NA NA NA NA NA NA NUBP1 413202 980 chr16 10689399 10692508 10691384 N NA NA EMP2,TEKT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUBP1 145190 981 chr16 10961000 10965526 10962642 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 5529 982 chr16 11317967 11320414 11319409 Y LITAF,CLEC16A,SOCS1 SOCS1 CLEC16A,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS1 29625 983 chr16 11326500 11327468 11327083 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 SOCS1 CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 22571 984 chr16 11386817 11394800 11387270,11388752,11391546,11393922 N,N,Y,N NA;NA;ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1;NA SOCS1,RMI2 SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOCS1 36778 985 chr16 11401076 11411206 11403278,11406761 N,N NA;NA RMI2 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 28105 986 chr16 11418495 11425075 11422113,11424148,11418900 N,N,N NA;NA;NA RMI2 CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 14236 987 chr16 11479911 11491587 11481058 N NA RMI2 BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 40600 988 chr16 11590268 11593649 11592083 N NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 87673 989 chr16 11599253 11601485 11600539 N NA NA CLEC16A,LITAF,SNN,TXNDC11,ZC3H7A,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 79837 990 chr16 11693227 11697970 11696205 N NA LITAF LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 11905 991 chr16 11705626 11709147 11707532 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 24304 992 chr16 11713657 11720524 11716304,11718857 N,Y NA;SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4,PRM2,PRM1,SNN,ZC3H7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 32335 993 chr16 13482707 13486658 13484759 N NA NA NA NA NA NA ERCC4 527356 994 chr16 1350331 1354696 1351090,1354050 N,N NA;NA UBE2I,C16orf42,GNPTG UNKL K562 ChIA-PET 22265404 UBE2I 4458 995 chr16 14090920 14093278 14091979 N NA NA PARN,MKL2 IMR90 Hi-C 24141950 MKL2 71918 996 chr16 14448449 14450559 14449300 N NA NA PARN,ERCC4,MIR365A,MIR193B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 273569 997 chr16 17584598 17586359 17585375 N NA XYLT1 XYLT1 IMR90 Hi-C 24141950 XYLT1 19860 998 chr16 17591739 17594969 17592744 N NA XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 27001 999 chr16 17604154 17608168 17606807 N NA XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 39416 1000 chr16 17615750 17618711 17616950 N NA NA XYLT1 IMR90 Hi-C 24141950 XYLT1 51012 1001 chr16 19388779 19393601 19391166 N NA NA SYT17 IMR90 Hi-C 24141950 GDE1 139849 1002 chr16 20711082 20713549 20712336 N NA THUMPD1 NA NA NA NA THUMPD1 39650 1003 chr16 21565134 21567704 21566252 Y DNAH3 SLC7A5P2,METTL9 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A5P2 33369 1004 chr16 22200158 22201849 22200169 N NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 15743 1005 chr16 22206730 22207854 22207142 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9738 1006 chr16 23837377 23838801 23838146 Y GGA2 PRKCB PRKCB K562 ChIA-PET 22265404 PRKCB 8499 1007 chr16 25077055 25086460 25078184,25085438 N,N NA;NA LCMT1 LCMT1,LOC100506655,TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 36587 1008 chr16 25101073 25107912 25102612,25105305 N,N NA;NA LCMT1 SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 LCMT1 15135 1009 chr16 25115459 25120193 25119010 N NA LCMT1 ARHGAP17,LCMT1,ZKSCAN2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 2854 1010 chr16 26719102 26722071 26720677 N NA NA C16orf82 IMR90 Hi-C 24141950 JMJD5 492736 1011 chr16 27121616 27125701 27124920 N NA NA NA NA NA NA JMJD5 89106 1012 chr16 27184309 27186753 27185547 N NA JMJD5 HS3ST4,LOC283888,IL21R,NSMCE1 IMR90 Hi-C 24141950 JMJD5 28054 1013 chr16 27189827 27191920 27190965 N NA JMJD5 HS3ST4,IL21R,NSMCE1,LOC283888,JMJD5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JMJD5 22887 1014 chr16 27208179 27211830 27210726 N NA JMJD5 NA NA NA NA JMJD5 2977 1015 chr16 2913413 2919391 2918243 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 13805 1016 chr16 29656545 29658437 29657198 N NA SPN,QPRT SPN K562 ChIA-PET 22265404 SPN 15863 1017 chr16 30467627 30472166 30468744,30470317 N,N NA;NA ZNF771,DCTPP1,SEPHS2,ITGAL SEPHS2,ZNF771,DCTPP1,ZNF688,PRR14,ZNF764,ITGAL,ZNF689,ZNF747,ZNF785,ZNF768,SRCAP MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SEPHS2 10403 1018 chr16 30644080 30650644 30645719 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF785,ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 11597 1019 chr16 30824940 30827579 30825741 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 26417 1020 chr16 30855214 30857429 30856623 N NA NA CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CTF1 50499 1021 chr16 31880185 31881639 31881198 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 KIAA0664L3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF267 3440 1022 chr16 33368608 33372138 33370378 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1483529 1023 chr16 33402468 33404580 33403609 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1517389 1024 chr16 3397278 3400399 3399000 N NA ZNF75A,TIGD7,MTRNR2L4 NA NA NA NA MTRNR2L4 21884 1025 chr16 3670539 3677909 3674278,3677718 N,N NA;NA NLRC3,SLX4,DNASE1 NLRC3,CLUAP1,SLX4,TRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 SLX4 8954 1026 chr16 4189691 4191786 4190659 N NA NA CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507501 112004 1027 chr16 4329439 4339139 4338429 N NA LOC100507501,TFAP4 TFAP4,CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TFAP4 6438 1028 chr16 4350552 4359059 4357740,4357075 Y,N CORO7;NA LOC100507501,TFAP4,PAM16 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16,LOC100507501 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 27551 1029 chr16 46804959 46810357 46806056,46809379 N,N NA;NA MYLK3 MYLK3,C16orf87,VPS35,ORC6 IMR90 Hi-C 24141950 MYLK3 22738 1030 chr16 46882540 46885995 46884907 N NA C16orf87,GPT2 ORC6,GPT2,DNAJA2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf87 17466 1031 chr16 47071245 47072420 47071856,47071851 N,N NA;NA NA ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJA2 63620 1032 chr16 48464697 48470361 48467629 N NA SIAH1 MIR548AE2,SIAH1,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 SIAH1 45468 1033 chr16 48656968 48659069 48657552 N NA N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 12848 1034 chr16 48662810 48665084 48664296 N NA N4BP1 MIR548AE2,ABCC11,N4BP1,ITFG1,ABCC12,SIAH1,NETO2 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 18690 1035 chr16 48934385 48938139 48936347 N NA NA C16orf78 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 290265 1036 chr16 49059024 49061129 49060523 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 254613 1037 chr16 49089773 49092114 49090490 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 223628 1038 chr16 49170772 49173720 49172581 N NA NA C16orf78 IMR90 Hi-C 24141950 CBLN1 142022 1039 chr16 49183257 49185528 49184511 N NA NA C16orf78 IMR90 Hi-C 24141950 CBLN1 130214 1040 chr16 49194693 49197454 49195226 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 118288 1041 chr16 49345631 49348189 49346940 N NA CBLN1 NA NA NA NA CBLN1 29889 1042 chr16 49398730 49402021 49400746 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 82988 1043 chr16 49475616 49477679 49476337 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 159874 1044 chr16 49494042 49498866 49497258 N NA NA NA NA NA NA CBLN1 178300 1045 chr16 49917896 49919209 49918241 N NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 CNEP1R1 139980 1046 chr16 49951639 49958689 49958135 N NA NA NA NA NA NA CNEP1R1 100500 1047 chr16 50044879 50048424 50045915 N NA CNEP1R1 NA NA NA NA CNEP1R1 10765 1048 chr16 50299657 50302188 50300425 N NA ADCY7 PAPD5,BRD7,ADCY7 IMR90 Hi-C 24141950 ADCY7 19635 1049 chr16 50307701 50310488 50308814 N NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 11335 1050 chr16 50315246 50319461 50315930 Y SNX20,NOD2,CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7 ADCY7 PAPD5,BRD7,ADCY7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADCY7 2362 1051 chr16 50717386 50719173 50718087 Y ADCY7,NOD2,CYLD,CYLD,SNX20 SNX20 NA NA NA NA SNX20 2122 1052 chr16 51007567 51009602 51008852 N NA NA LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 CYLD 231606 1053 chr16 51020862 51033576 51022539,51028236 N,N NA;NA NA LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 CYLD 244901 1054 chr16 51063818 51065931 51064575 N NA NA NA NA NA NA CYLD 287857 1055 chr16 51067564 51069605 51068446 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 291603 1056 chr16 51216952 51222074 51219211 N NA NA NA NA NA NA CYLD 440991 1057 chr16 56742109 56744761 56742555 Y NLRC5 MT1X,NUP93 OGFOD1,BBS2,MT3,MT2A,MT1M,MT1B,MT1DP,MT1JP,MT1A,MT1G,MT1H,MT1X,NUP93,MT1L IMR90 Hi-C 24141950 NUP93 19256 1058 chr16 57332766 57334632 57334162 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 53728 1059 chr16 5808261 5810362 5809563 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 660472 1060 chr16 58276771 58279791 58277543 Y NA CSNK2A2 CCDC113,PRSS54 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSNK2A2 44989 1061 chr16 62375118 62378920 62376211 N NA NA NA NA NA NA GOT2 3606872 1062 chr16 63649610 63653188 63652085,63653053 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TK2 2931127 1063 chr16 63658856 63664655 63662922 N NA NA NA NA NA NA TK2 2919660 1064 chr16 63667489 63668902 63668130 N NA NA NA NA NA NA TK2 2915413 1065 chr16 63722682 63725755 63724271 N NA NA NA NA NA NA TK2 2858560 1066 chr16 64165300 64168817 64166248 N NA NA NA NA NA NA TK2 2415498 1067 chr16 64186559 64187916 64187245 N NA NA NA NA NA NA TK2 2396399 1068 chr16 64302904 64305336 64303849 N NA NA NA NA NA NA TK2 2278979 1069 chr16 64354386 64357845 64354912,64356090,64356196 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TK2 2226470 1070 chr16 67547889 67553401 67548487,67551179 N,N NA;NA ATP6V0D1,FAM65A,CTCF AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF IMR90 Hi-C 24141950 FAM65A 9316 1071 chr16 68525768 68529098 68526593 Y NA ZFP90 SMPD3,CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 44563 1072 chr16 68563103 68566031 68564090 N NA ZFP90 CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 7630 1073 chr16 72697263 72703121 72698941 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 PMFBP1 490914 1074 chr16 73846561 73848170 73847650 N NA NA LOC100506172,ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 482503 1075 chr16 75793981 75796622 75795700 N NA NA KARS,ADAT1,TERF2IP,SYCE1L IMR90 Hi-C 24141950 TERF2IP 112346 1076 chr16 77090142 77092721 77091347 N NA NA NA NA NA NA SYCE1L 140628 1077 chr16 80551621 80553871 80552479 N NA NA NA NA NA NA CENPN 486232 1078 chr16 81465186 81468370 81467097 N NA CMIP NA NA NA NA CMIP 10405 1079 chr16 81771484 81777566 81773279 N NA PLCG2 CMIP,PKD1L2,GAN,ATMIN,GCSH,MIR4720,BCMO1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 35333 1080 chr16 81778900 81788346 81779524,81785974 N,N NA;NA PLCG2 GAN,ATMIN,PKD1L2,BCMO1,MIR4720,CMIP IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 24553 1081 chr16 84547228 84549977 84548719 Y COTL1 KIAA1609 COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA1609 8940 1082 chr16 84674522 84679288 84677465,84675018 Y,Y NA;KLHL36 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2843 1083 chr16 85285731 85286985 85286599 N NA NA LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 224321 1084 chr16 85293958 85296788 85295397 N NA NA KIAA0182,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 232548 1085 chr16 85477922 85484217 85478894,85481767 N,N NA;NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 160812 1086 chr16 85494197 85496548 85495216 N NA NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 148481 1087 chr16 85513557 85515069 85514332 N NA NA KIAA0182,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 129960 1088 chr16 85557229 85560161 85558591 N NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0182 84868 1089 chr16 85585845 85605709 85590081,85591999,85586922 N,N,N NA;NA;NA KIAA0182 GINS2,KIAA0182,LINC00311,LOC400548,FAM92B,KIAA0513,LOC727710,C16orf74,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 39320 1090 chr16 85864256 85867235 85866473 N NA COX4NB,COX4I1 NA NA NA NA COX4I1 31083 1091 chr16 85921644 85923816 85922540 Y COX4I1,IRF8 IRF8 COX4NB,COX4I1,LOC400550,MTHFSD IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 8958 1092 chr16 86021640 86023205 86022566 N NA NA COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 88866 1093 chr16 86028650 86030598 86029479 Y IRF8 NA MTHFSD,FLJ30679,IRF8,COX4I1,COX4NB,C16orf74,LOC732275,LOC400550,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 95876 1094 chr16 86034552 86037245 86035877 N NA NA IRF8,COX4I1,COX4NB,LOC400550,LOC732275,FOXF1,MTHFSD,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 101778 1095 chr16 87805118 87815514 87808612,87805865,87812053,87814587 N,N,N,N NA;NA;NA;NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 5520 1096 chr16 89048465 89053183 89050643,89050263 Y,Y CBFA2T3;CBFA2T3,CBFA2T3 CBFA2T3 CBFA2T3,ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 CBFA2T3 4961 1097 chr16 89058214 89062253 89059500 N NA CBFA2T3 CBFA2T3,ACSF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBFA2T3 14710 1098 chr16 89098189 89099514 89098558 N NA NA ACSF3,CBFA2T3,LOC400558,LINC00304,CDH15 IMR90 Hi-C 24141950 CBFA2T3 54685 1099 chr16 89102982 89107909 89106312 N NA NA ACSF3,CBFA2T3,LOC400558,LINC00304,CDH15 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 52308 1100 chr16 89887054 89891157 89889070 N NA FANCA,SPIRE2,TCF25 FANCA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPIRE2 3750 1101 chr16 90148558 90149764 90149015 N NA NA GAS8,DBNDD1,PRDM7,LOC100130015 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GAS8 59550 1102 chr16 9085378 9087116 9085958 N NA USP7 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP7 28037 1103 chr16 9165713 9172568 9167060 N NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12969 1104 chr17 1099218 1105061 1101373 N NA ABR YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 8602 1105 chr17 1110431 1134999 1116459,1119803,1132443 N,N,N NA;NA;NA ABR ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK,RILP,SCARF1 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 19815 1106 chr17 14330514 14333422 14331722 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 357795 1107 chr17 14360721 14364913 14362225,14363537 N,N NA;NA NA NA NA NA NA COX10 388002 1108 chr17 14462053 14465003 14463161 N NA NA HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 489334 1109 chr17 14498688 14501463 14500615 N NA NA NA NA NA NA COX10 525969 1110 chr17 14524018 14527035 14525644 N NA NA CDRT7 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 551299 1111 chr17 14663512 14664702 14664129 N NA NA HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 690793 1112 chr17 14687373 14690342 14688601 N NA NA HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 714654 1113 chr17 14691489 14695969 14694351 N NA NA HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 718770 1114 chr17 14696940 14699361 14698221 N NA NA HS3ST3A1,HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 COX10 724221 1115 chr17 15789210 15791569 15789866 N NA NA NA NA NA NA TTC19 111125 1116 chr17 15799220 15800732 15800014 N NA NA ADORA2B IMR90 Hi-C 24141950 TTC19 101962 1117 chr17 16310828 16312202 16311729 N NA UBB,TRPV2,C17orf76-AS1 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 6654 1118 chr17 16756870 16758978 16757905 N NA NA NA NA NA NA MPRIP 187096 1119 chr17 16878500 16880653 16879273 N NA NA NA NA NA NA MPRIP 65421 1120 chr17 16890127 16894271 16891696 N NA NA MPRIP,FLCN IMR90 Hi-C 24141950 MPRIP 51803 1121 chr17 17305784 17308789 17306993 N NA NA NA NA NA NA MED9 71511 1122 chr17 17348090 17351727 17350224 N NA MED9 MED9,PEMT,NT5M,RAI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MED9 28573 1123 chr17 17512062 17514191 17512638 N NA NA PEMT,NT5M,SMCR9,MED9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI1 70596 1124 chr17 17565970 17567600 17566804 Y NA RAI1 RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 17187 1125 chr17 17569275 17572423 17570081 N NA RAI1 RAI1,NT5M,TOM1L2,PEMT,MED9,SMCR5,SREBF1,COPS3 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 12364 1126 chr17 19365718 19366985 19366742 N NA NA ULK2,AKAP10,B9D1,EPN2,SLC47A2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 84223 1127 chr17 19409272 19412301 19411274 Y NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 127777 1128 chr17 20811086 20813368 20811992 N NA NA USP22 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 132984 1129 chr17 20953842 20956846 20955873 N NA USP22 USP22 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 USP22 7490 1130 chr17 20963747 20966546 20965187 N NA USP22 USP22 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 USP22 17395 1131 chr17 20999580 21004261 21002568 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 25980 1132 chr17 21177386 21180567 21179211 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 7401 1133 chr17 21250306 21253554 21251831 N NA NA C17orf51,KCNJ12,DHRS7B,MAP2K3,FAM27L IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K3 62338 1134 chr17 2445500 2446601 2445842 N NA METTL16 PAFAH1B1,METTL16 IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 30300 1135 chr17 2475068 2475862 2475501 N NA PAFAH1B1 PAFAH1B1,METTL16 IMR90 Hi-C 24141950 PAFAH1B1 21061 1136 chr17 25362043 25364653 25363510 N NA NA NA NA NA NA WSB1 256453 1137 chr17 25542290 25546783 25545705 N NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 74323 1138 chr17 25678558 25682245 25680931 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 57452 1139 chr17 26132239 26133922 26132821 N NA NA NA NA NA NA NLK 235766 1140 chr17 26311688 26313441 26312597 N NA NA NOS2,NLK IMR90 Hi-C 24141950 NLK 56247 1141 chr17 27521265 27523475 27522635 N NA MYO18A MYO18A,TAOK1,CRYBA1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 13858 1142 chr17 28993629 28994865 28994384 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 41761 1143 chr17 29387135 29389985 29388451 N NA NF1 NF1,ADAP2,MIR4733,RNF135,OMG,EVI2B IMR90 Hi-C 24141950 NF1 31960 1144 chr17 30409736 30411526 30410655 N NA NA NA NA NA NA RHOT1 57947 1145 chr17 30453034 30456899 30454713 N NA RHOT1 RHOT1,LRRC37B IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 12574 1146 chr17 32717060 32719228 32718516 N NA NA ACCN1,NLE1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF830 569321 1147 chr17 34128318 34129358 34128731 N NA TAF15 AP2B1,RASL10B,C17orf50,MMP28 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF15 7130 1148 chr17 35077404 35080716 35078635 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 119379 1149 chr17 36178620 36181472 36180191 N NA NA NA NA NA NA DDX52 175127 1150 chr17 37772718 37775921 37774360 N NA STARD3,TCAP PPP1R1B K562 ChIA-PET 22265404 STARD3 17412 1151 chr17 38751626 38754755 38752811 N NA CCR7,SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17 IMR90 Hi-C 24141950 CCR7 29890 1152 chr17 39820929 39824753 39823033 N NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20374 1153 chr17 41399150 41402179 41400727 N NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 35256 1154 chr17 41796447 41798711 41798004 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 57657 1155 chr17 4276627 4282628 4278540,4280621 Y,N UBE2G1;NA UBE2G1 UBE2G1,ANKFY1,SPNS3,ZZEF1,CYB5D2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2G1 6658 1156 chr17 4291605 4294184 4292500 N NA UBE2G1,SPNS3 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 21636 1157 chr17 4296904 4301253 4299855,4296949 N,N NA;NA UBE2G1,SPNS3 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 26935 1158 chr17 44342967 44345653 44344344 Y NA KANSL1 KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KANSL1 40227 1159 chr17 45276708 45278896 45277704 Y NA CDC27 CDC27,MYL4,ITGB3,C17orf57,NPEPPS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC27 10043 1160 chr17 46517014 46518531 46517504 Y CDK5RAP3,SKAP1 NA SKAP1,HOXB3,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB3 133279 1161 chr17 46533709 46535058 46534445 N NA NA SKAP1,HOXB3,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB9 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB3 116752 1162 chr17 46548958 46550595 46549932 N NA NA SKAP1,HOXB4,HOXB3,HOXB8,MIR10A,HOXB-AS3,HOXB5,HOXB6,HOXB13,HOXB1,HOXB2 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB3 101215 1163 chr17 48083237 48086059 48084881 N NA NA NXPH3,SLC35B1,KAT7,TAC4,FLJ45513,DLX3,DLX4,ITGA3,LOC284080,PDK2,SPOP,FAM117A IMR90 Hi-C 24141950 PDK2 86042 1164 chr17 48993668 48998241 48994840 N NA LOC400604,TOB1 SPAG9,LOC400604,TOB1,SPATA20,EPN3,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 48329 1165 chr17 49445745 49449727 49449193 N NA NA NA NA NA NA UTP18 107848 1166 chr17 5167463 5169442 5168404 N NA SCIMP,RABEP1 LOC100130950,SCIMP,RABEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RABEP1 16116 1167 chr17 53501640 53502749 53502339 N NA MMD NA NA NA NA MMD 2299 1168 chr17 53737447 53743165 53738230,53741795 N,N NA;NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 PCTP 85175 1169 chr17 55274317 55276473 55275314 N NA NA MSI2,LPO IMR90 Hi-C 24141950 MSI2 57458 1170 chr17 56016136 56019494 56017690 N NA VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 VEZF1 46121 1171 chr17 56022759 56025159 56024369 N NA VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 VEZF1 40456 1172 chr17 57516607 57518035 57516644 N NA NA YPEL2,GDPD1,SMG8,CLTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YPEL2 107554 1173 chr17 61538263 61539844 61539146 N NA ACE CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACE 14578 1174 chr17 62979048 62984246 62982339,62981603 Y,N DDX5,CEP95,GNA13;NA AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 7345 1175 chr17 63059833 63061787 63060751 N NA GNA13 GNA13,RGS9 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 6913 1176 chr17 63094909 63098620 63096455 N NA GNA13 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 41989 1177 chr17 63117164 63120382 63119542 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 64244 1178 chr17 65806785 65808830 65807876 N NA BPTF NA NA NA NA BPTF 12950 1179 chr17 66015524 66017770 66016191 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 14078 1180 chr17 66081299 66084737 66082946 N NA KPNA2,LOC100499466 NA NA NA NA LOC100499466 12959 1181 chr17 66176271 66185121 66178213,66181300 N,N NA;NA LOC440461 LOC100499466,WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC440461 9680 1182 chr17 66232530 66239260 66234453 N NA LOC440461,AMZ2,ARSG,SLC16A6 NA NA NA NA AMZ2 4885 1183 chr17 66456123 66460143 66457797 N NA WIPI1,PRKAR1A BPTF,LOC100499466,LOC440461,AMZ2,ARSG,SLC16A6,WIPI1,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WIPI1 2470 1184 chr17 66484024 66485165 66484526,66484391 N,N NA;NA WIPI1,PRKAR1A ABCA10 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 22945 1185 chr17 67322448 67325016 67323664 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 814338 1186 chr17 67571884 67579838 67573270,67577372 N,N NA;NA NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2-AS1 585705 1187 chr17 70020149 70029571 70026537,70021172 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC39A11 1059282 1188 chr17 71129556 71131266 71130728 Y NA SLC39A11 SLC39A11,LINC00511,LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A11 40703 1189 chr17 72627808 72628961 72628406 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF RAB37 GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 RAB37 38295 1190 chr17 72977822 72979053 72978466 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L C17orf28,ICT1 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C17orf28 8922 1191 chr17 74241563 74243778 74242876 N NA FAM100B MRPL38,SRP68,GALR2,ZACN,EXOC7,RNF157,FAM100B,QRICH2,PRPSAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM100B 17508 1192 chr17 74584187 74588119 74586082 N NA LOC100507246 NA NA NA NA LOC100507246 30341 1193 chr17 74593191 74595740 74594328 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6 LOC100507246 ST6GALNAC2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 LOC100507246 39345 1194 chr17 74837079 74841997 74838338,74840673 N,N NA;NA NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9,METTL23 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF2 103586 1195 chr17 74987839 74996309 74990078,74994521 N,Y NA;SRSF2 NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC14L1 88416 1196 chr17 75661883 75665120 75663122 N NA NA TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT9 384391 1197 chr17 75842144 75844569 75843080 N NA NA NA NA NA NA LOC100131096 263311 1198 chr17 75953253 75956936 75954591 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131096 150944 1199 chr17 78125036 78127299 78126947 N NA GAA,EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SLC26A11,SGSH K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF4A3 4054 1200 chr17 78460394 78461789 78461253 N NA NA NA NA NA NA RPTOR 56836 1201 chr17 7892288 7894412 7893618 N NA NA CHD3,EFNB3,DNAH2,KDM6B,CNTROB,KCNAB3,TRAPPC1,GUCY2D,ALOX15B,LOC284023 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTROB 56846 1202 chr17 79315407 79321205 79319794 N NA SLC38A10 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 46311 1203 chr17 79923202 79926697 79925247 N NA SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 8729 1204 chr17 80245433 80252492 80250758 N NA CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC,CD7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSNK1D 13839 1205 chr17 80307345 80311658 80308773 N NA TEX19 FASN,HEXDC K562 ChIA-PET 22265404 TEX19 5465 1206 chr18 10260477 10267802 10261557,10264332 N,N NA;NA NA APCDD1,PIEZO2 IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 258071 1207 chr18 20368607 20372220 20370180 N NA NA RBBP8,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 141075 1208 chr18 20417128 20423707 20420297 N NA NA CABLES1,RBBP8,RIOK3,GATA6,TMEM241 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBBP8 89588 1209 chr18 20649263 20652918 20651481 Y C18orf8 NA RIOK3,CABLES1,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 CABLES1 61610 1210 chr18 23097352 23099648 23098545 N NA NA ZNF521 IMR90 Hi-C 24141950 SS18 570963 1211 chr18 25201992 25208438 25205674,25202004 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TAF4B 1395583 1212 chr18 25233789 25235983 25234902 N NA NA NA NA NA NA TAF4B 1427380 1213 chr18 25247528 25249709 25249285 N NA NA NA NA NA NA TAF4B 1441119 1214 chr18 30381570 30385951 30383522 N NA KLHL14 NA NA NA NA KLHL14 28596 1215 chr18 31381558 31386326 31383001,31384447 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KLHL14 1028584 1216 chr18 31389079 31390440 31389752 N NA NA NA NA NA NA KLHL14 1036105 1217 chr18 31406929 31410845 31407380,31409186 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KLHL14 1053955 1218 chr18 32989431 32992286 32990736 N NA NA GALNT1,ZNF397 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF24 65005 1219 chr18 33195645 33206101 33197033 N NA GALNT1 NA NA NA NA GALNT1 28432 1220 chr18 33365136 33367939 33366579 N NA NA NA NA NA NA GALNT1 130603 1221 chr18 33389193 33391582 33390002 N NA NA NA NA NA NA GALNT1 154660 1222 chr18 3400194 3402566 3402009 N NA TGIF1 TGIF1,DLGAP1,FLJ35776 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TGIF1 9506 1223 chr18 42684938 42687881 42686548 Y NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SETBP1 424075 1224 chr18 43747225 43748636 43748136 N NA C18orf25 C18orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C18orf25 5352 1225 chr18 43903592 43905876 43904422 N NA NA RNF165 IMR90 Hi-C 24141950 C18orf25 149604 1226 chr18 44809423 44812800 44811225 N NA NA NA NA NA NA IER3IP1 106678 1227 chr18 4638606 4640708 4639447 N NA NA NA NA NA NA LINC00526 597320 1228 chr18 47833004 47835489 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 18312 1229 chr18 48777674 48779096 48778155 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 53623 1230 chr18 51773120 51775054 51773642 Y NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 20795 1231 chr18 51787554 51789211 51788461 Y MBD2,POLI MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 6638 1232 chr18 51789882 51791595 51790445 N NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 4254 1233 chr18 52031907 52034411 52032911 N NA NA NA NA NA NA C18orf54 146736 1234 chr18 52054906 52059136 52057800 N NA NA NA NA NA NA C18orf54 169735 1235 chr18 53901758 53903608 53902740 N NA NA TCF4,LOC100505474 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL1 402312 1236 chr18 56324177 56331211 56325578 Y MALT1 MALT1 ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 7407 1237 chr18 57513715 57516543 57515683 N NA NA CCBE1,PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 50649 1238 chr18 57624157 57630135 57625467,57628221 N,N NA;NA NA PMAIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 56965 1239 chr18 57914197 57916106 57914559 N NA NA NA NA NA NA MC4R 123895 1240 chr18 58544565 58549698 58545802,58547994 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MC4R 504564 1241 chr18 60169865 60174259 60173311 N NA ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 16399 1242 chr18 60317162 60320830 60318759 N NA NA ZCCHC2,PHLPP1,BCL2 IMR90 Hi-C 24141950 PHLPP1 61842 1243 chr18 63967561 63969809 63968561 N NA NA NA NA NA NA TMX3 2412544 1244 chr18 69756991 69759358 69758767 N NA NA NA NA NA NA RTTN 1884029 1245 chr18 71706159 71710008 71708905 N NA NA NETO1 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM21 105738 1246 chr18 74211022 74212465 74212040 N NA ZNF516 ZNF516 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF516 3876 1247 chr18 75472421 75475328 75474619 N NA NA NA NA NA NA MBP 627647 1248 chr18 8703315 8709999 8705145,8707580 N,N NA;NA CCDC165 CCDC165,NDUFV2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC165 7370 1249 chr18 8977754 8979448 8978529 N NA NA CCDC165,RAB12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 123180 1250 chr18 9066114 9068604 9066750 N NA NDUFV2 CCDC165,NDUFV2,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1,RAB12,TWSG1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 34024 1251 chr19 10520032 10524757 10523237 Y C19orf66,ICAM3,S1PR5,S1PR5,ATG4D,TYK2 TYK2,CDC37,PDE4A CDC37 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PDE4A 2692 1252 chr19 10702792 10706513 10704870 N NA ATG4D,KRI1,CDKN2D,SLC44A2 TYK2,CDC37,S1PR5,KEAP1,CDKN2D,AP1M2,KRI1,LOC147727,SLC44A2,ILF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A2 6608 1253 chr19 12351542 12359177 12357936,12353587 N,N NA;NA ZNF44 ZNF564,ZNF442,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF136,ZNF563 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF44 46537 1254 chr19 12604659 12608053 12606217 N NA ZNF709 ZNF709,ZNF823,ZNF491,ZNF441,ZNF439,ZNF433,ZNF878,ZNF788,ZNF844,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF44,ZNF563,ZNF442,ZNF443,ZNF564 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF709 9027 1255 chr19 13842087 13843653 13842566 N NA CCDC130,MRI1,C19orf53 CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 15100 1256 chr19 14352272 14361193 14359636 N NA NA LOC100507373 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507373 104308 1257 chr19 14466001 14467491 14466947 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 24465 1258 chr19 14476192 14478205 14477691 N NA CD97 DDX39A,CD97 K562 ChIA-PET 22265404 CD97 13751 1259 chr19 14485070 14487914 14486396 Y NA CD97,DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 4042 1260 chr19 15399882 15412732 15408677,15403824,15411755 N,N,N NA;NA;NA BRD4 ILVBL,NOTCH3,BRD4,EPHX3,AKAP8L,AKAP8,WIZ,MIR1470,RASAL3,SYDE1 IMR90 Hi-C 24141950 BRD4 8620 1261 chr19 15608743 15611054 15609964 N NA WIZ,RASAL3 NA NA NA NA RASAL3 33361 1262 chr19 16111590 16113700 16112888 N NA NA NA NA NA NA RAB8A 108790 1263 chr19 1659449 1662981 1661695 N NA TCF3 TCF3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TCF3 7121 1264 chr19 1664417 1673920 1668553,1665811,1671415 N,N,N NA;NA;NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 12089 1265 chr19 17961023 17962715 17961463 Y FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3 RPL18A PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18A 8016 1266 chr19 1894755 1898735 1897767 N NA REXO1,KLF16,FAM108A1,SCAMP4,CSNK1G2 BTBD2,CSNK1G2,KLF16,SCAMP4,MKNK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCAMP4 6638 1267 chr19 20161566 20164134 20163013 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 NA ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF486 113889 1268 chr19 20347830 20350521 20349257 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 69807 1269 chr19 20354078 20356411 20355042 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 76055 1270 chr19 20379712 20386801 20383862 N NA NA NA NA NA NA ZNF486 101689 1271 chr19 20459036 20461778 20460539 N NA NA NA NA NA NA ZNF826P 145993 1272 chr19 20624963 20628088 20626692 N NA ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 17192 1273 chr19 23257615 23258930 23258205,23257827 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF724P 174242 1274 chr19 23455829 23457501 23457099 N NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 22657 1275 chr19 24215701 24217926 24216496 N NA NA NA NA NA NA ZNF254 52050 1276 chr19 28871078 28880723 28877096 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 586230 1277 chr19 28883872 28886693 28885559 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 599024 1278 chr19 28925236 28929448 28928040 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 640388 1279 chr19 29009170 29012449 29010390 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 691687 1280 chr19 29024853 29027293 29026437 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 676843 1281 chr19 29031849 29035344 29033179 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 668792 1282 chr19 29080007 29083237 29081316 N NA NA LOC284395 IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1 620899 1283 chr19 29121652 29125008 29123747 N NA NA LOC284395 IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1 579128 1284 chr19 30335379 30337415 30336417 N NA CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 32478 1285 chr19 3069888 3071282 3070636 N NA AES,GNA11 AES,TLE2,GNA11,S1PR4,GNA15,NCLN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AES 6924 1286 chr19 34040017 34049070 34046860 N NA NA PEPD,CHST8 IMR90 Hi-C 24141950 CEBPG 175442 1287 chr19 34624727 34627169 34625423 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 36183 1288 chr19 36086715 36088655 36087467 N NA LOC100506469,HAUS5,RBM42,ETV2 FFAR1,HAUS5,ATP4A IMR90 Hi-C 24141950 HAUS5 14991 1289 chr19 36191722 36194337 36193426 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A,ZBTB32,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,PSENEN,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB32 9493 1290 chr19 36421168 36423415 36422574 N NA NFKBID,HCST,LRFN3 NFKBID,HCST MCF7 ChIA-PET 22265404 LRFN3 4607 1291 chr19 37707340 37710368 37709095 N NA ZNF585A,ZNF383 ZNF585B,ZNF383 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF383 6998 1292 chr19 37807384 37809884 37808766 N NA HKR1 NA NA NA NA HKR1 15696 1293 chr19 39535754 39537966 39536975 N NA NA FBXO27,SAMD4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAK4 78454 1294 chr19 40458671 40460258 40459591 Y ZNF546,FCGBP PSMC4,ZNF546 FCGBP IMR90 Hi-C 24141950 PSMC4 16815 1295 chr19 42034860 42043486 42038007,42041861 Y,N CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1;NA CEACAM21 CEACAM21,LOC100505495,B3GNT8,C19orf69,ATP5SL IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 39045 1296 chr19 42050902 42068615 42052493,42055862,42059123,42062305 N,N,N,N NA;NA;NA;NA CEACAM21 C19orf69,ATP5SL,LOC100505495,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 13916 1297 chr19 42679467 42682732 42681140 N NA POU2F2,LOC100505622,DEDD2,ZNF526 POU2F2,MIR4323,LOC100505622 IMR90 Hi-C 24141950 DEDD2 39081 1298 chr19 42969451 42972074 42970793 N NA LIPE CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8 IMR90 Hi-C 24141950 LIPE 37873 1299 chr19 44710634 44713698 44711611 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 2993 1300 chr19 45075861 45078623 45078074 N NA NA PVR,IGSF23,MIR4531,CEACAM19,CEACAM16,TOMM40 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF180 71287 1301 chr19 45089469 45093265 45091189 N NA NA MIR4531,PVR,CEACAM16,TOMM40,CEACAM22P,IGSF23,BCL3,CBLC,BCAM,CEACAM19 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF180 84895 1302 chr19 45941496 45944898 45943746 N NA CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERCC1 14319 1303 chr19 45945502 45948681 45947466 N NA CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERCC1 18325 1304 chr19 45951339 45955541 45953583 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB,RTN2,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 15712 1305 chr19 46933871 46936329 46935150 N NA NA CCDC8,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 PPP5C 83620 1306 chr19 47358374 47365801 47363860 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 AP2S1,SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 4171 1307 chr19 47398583 47410560 47399789 N NA AP2S1,ARHGAP35 ARHGAP35,ZC3H4,STRN4,FKRP,SLC1A5,AP2S1,NPAS1,TMEM160,SAE1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP35 11373 1308 chr19 48102224 48105329 48103724 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 GLTSCR1 SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLTSCR1 6124 1309 chr19 482376 491031 489059 N NA TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 16466 1310 chr19 50871153 50874261 50872338 N NA KCNC3,NAPSB,NAPSA,NR1H2,POLD1,SPIB NA NA NA NA NAPSA 2222 1311 chr19 51704092 51705497 51705113 N NA NA NA NA NA NA CTU1 92445 1312 chr19 53399793 53402097 53401006 N NA ZNF468,ZNF320,ZNF321P ZNF468,ZNF160 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF320 5194 1313 chr19 53699179 53704473 53700250 N NA ZNF347 ZNF677,ZNF415 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF347 36857 1314 chr19 55470668 55471512 55471449 N NA NLRP7 NA NA NA NA NLRP7 11795 1315 chr19 5803354 5804856 5804172 Y NA PRR22,DUS3L NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUS3L 12105 1316 chr19 6515869 6518667 6516680 N NA DENND1C,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 12343 1317 chr19 6520923 6524997 6522243 N NA DENND1C,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 6013 1318 chr19 6598322 6605558 6604106,6601825 N,Y NA;NA CD70 EMR4P IMR90 Hi-C 24141950 CD70 7159 1319 chr19 7400707 7404174 7402376 N NA NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 55825 1320 chr19 7408809 7428412 7410195,7414490 N,N NA;NA ARHGEF18 ZNF557,INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 31587 1321 chr19 8224773 8227616 8226233 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 46601 1322 chr19 8256290 8260049 8259615,8257413 N,N NA;NA CERS4 FBN3,TIMM44,CERS4,ELAVL1,CCL25 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 14168 1323 chr19 9131341 9135538 9133551 N NA NA NA NA NA NA ZNF317 115518 1324 chr19 9141272 9146130 9142841 N NA NA NA NA NA NA ZNF317 104926 1325 chr19 9418752 9421662 9420455 N NA ZNF699,ZNF559-ZNF177 NA NA NA NA ZNF699 2957 1326 chr19 9894650 9898127 9896702 N NA ZNF846,FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA ZNF846 15240 1327 chr2 100793498 100795823 100794863 N NA AFF3 AFF3 IMR90 Hi-C 24141950 AFF3 34461 1328 chr2 100849837 100853843 100851881 N NA NA AFF3,CHST10 IMR90 Hi-C 24141950 AFF3 90800 1329 chr2 100864548 100868766 100865994 N NA NA NA NA NA NA AFF3 105511 1330 chr2 10229281 10234278 10232625 N NA RRM2,C2orf48 GRHL1,HPCAL1,NOL10,YWHAQ,RRM2,ODC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRM2 28417 1331 chr2 103592275 103594365 103593698 N NA NA NA NA NA NA MFSD9 238938 1332 chr2 103619243 103624174 103621607 N NA NA NA NA NA NA MFSD9 265906 1333 chr2 104701318 104704004 104702024 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 950479 1334 chr2 104725078 104728047 104726501 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 926436 1335 chr2 105504807 105506982 105505861 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 147501 1336 chr2 105591390 105593897 105593340 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 60586 1337 chr2 105791641 105793096 105792243 N NA NA NA NA NA NA MRPS9 137158 1338 chr2 106082986 106089107 106086482 N NA NA FHL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C2orf49 128973 1339 chr2 106091141 106093184 106091765 N NA NA FHL2 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf49 137128 1340 chr2 106307452 106311849 106308237,106311043 N,N NA;NA NCK2 UXS1 IMR90 Hi-C 24141950 NCK2 49671 1341 chr2 106339109 106344716 106343043 N NA NCK2 NCK2 IMR90 Hi-C 24141950 NCK2 16804 1342 chr2 106348466 106359231 106350374,106356194 N,N NA;NA NCK2 NCK2 IMR90 Hi-C 24141950 NCK2 2289 1343 chr2 106549116 106552698 106550972 N NA NA LOC285000,C2orf40 IMR90 Hi-C 24141950 NCK2 187596 1344 chr2 106583707 106591763 106589084,106584890 N,N NA;NA NA LOC285000,NCK2 IMR90 Hi-C 24141950 UXS1 219032 1345 chr2 107280069 107281952 107281296 N NA NA NA NA NA NA UXS1 469274 1346 chr2 112389533 112391259 112390409 Y NA NA ACOXL,BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 250482 1347 chr2 112416553 112418248 112417313 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 223493 1348 chr2 112424545 112429777 112425907,112428368 N,N NA;NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 211964 1349 chr2 112457988 112464831 112458856,112463276 N,N NA;NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 176910 1350 chr2 113550123 113552743 113551880 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 27869 1351 chr2 113636305 113640390 113637966 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B NA CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 CKAP2L 114051 1352 chr2 114162556 114167920 114163882 Y NA NA IL1RN IMR90 Hi-C 24141950 FOXD4L1 88741 1353 chr2 114611029 114613752 114612676 N NA ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3 33785 1354 chr2 118475643 118487154 118477320,118481146 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DDX18 85101 1355 chr2 118494179 118498704 118497038 N NA NA NA NA NA NA DDX18 73551 1356 chr2 118811607 118815207 118813947 N NA CCDC93,INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 30843 1357 chr2 118940619 118945473 118943979 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 94569 1358 chr2 12001950 12005773 12003847 N NA NA LOC100506474,TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 115210 1359 chr2 120171298 120174956 120172941 N NA C2orf76,DBI,TMEM37 SCTR,TMEM37 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM37 14490 1360 chr2 121313717 121315643 121315088 N NA NA RALB,LOC84931,GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 RALB 303303 1361 chr2 12138450 12139049 12138526 N NA NA LOC100506474,TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 251710 1362 chr2 12171019 12178161 12172101,12176769 N,N NA;NA NA LOC100506474,TRIB2,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 284279 1363 chr2 12183618 12187651 12185635 N NA NA LOC100506474,TRIB2,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 296878 1364 chr2 12254636 12258714 12256572 N NA NA LOC100506474,TRIB2,LPIN1,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 367896 1365 chr2 122560951 122562963 122561680 N NA TSN NA NA NA NA TSN 47830 1366 chr2 12266058 12269574 12268063 N NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 379318 1367 chr2 12401707 12403671 12402928 Y TRIB2 NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 453327 1368 chr2 126795649 126797859 126796640 N NA NA NA NA NA NA GYPC 615652 1369 chr2 127885862 127887038 127886262 N NA NA ERCC3,BIN1,CYP27C1,IWS1,MYO7B IMR90 Hi-C 24141950 ERCC3 164714 1370 chr2 128132292 128159328 128145279,128148001 N,N NA;NA MAP3K2 IWS1,CYP27C1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 31487 1371 chr2 130192073 130202059 130201040 Y NA NA NA NA NA NA MZT2B 737442 1372 chr2 130237520 130242140 130238617,130241215 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MZT2B 697361 1373 chr2 130633405 130635885 130635204 N NA NA NA NA NA NA MZT2B 303616 1374 chr2 131547420 131550708 131549392 N NA NA NA NA NA NA FAM168B 300296 1375 chr2 131553668 131557383 131555444 N NA NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293621 1376 chr2 132428364 132431933 132430885 N NA NA NA NA NA NA LOC150776 177978 1377 chr2 132439256 132441289 132440016 N NA NA NA NA NA NA LOC150776 188870 1378 chr2 133027687 133035340 133034441,133029649 N,N NA;NA NA GPR39,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,ANKRD30BL,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC150776 777301 1379 chr2 133141334 133143005 133142164 N NA NA NA NA NA NA LOC150776 890948 1380 chr2 134975664 134980527 134976670 N NA MGAT5 MGAT5,MIR3679 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 31303 1381 chr2 135493380 135499075 135494845,135497636 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCNT2 177317 1382 chr2 136757403 136761048 136758845 N NA DARS NA NA NA NA DARS 14181 1383 chr2 136807656 136811716 136809599 N NA NA CXCR4 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR4 64009 1384 chr2 136813267 136817890 136814675,136816979 N,Y NA;NA NA CXCR4 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR4 57835 1385 chr2 136886125 136896698 136890075,136893908,136886437,136894057 Y,Y,N,Y UBXN4,CXCR4,CXCR4;UBXN4,CXCR4,CXCR4;NA;UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 10400 1386 chr2 136983229 136985771 136984374 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 107504 1387 chr2 136993699 137000508 136997053,136994409 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CXCR4 117974 1388 chr2 137001339 137006461 137003874 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 125614 1389 chr2 137008203 137016469 137012425 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 132478 1390 chr2 137082094 137086624 137084971 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 206369 1391 chr2 137115484 137118295 137116619 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 239759 1392 chr2 137137633 137144798 137140432,137142730 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CXCR4 261908 1393 chr2 137146325 137156814 137151976,137147958,137154824 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CXCR4 270600 1394 chr2 137162862 137174374 137164597 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 287137 1395 chr2 137178756 137185480 137181668 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 303031 1396 chr2 140277860 140278147 140278002 N NA NA NA NA NA NA SPOPL 1018510 1397 chr2 145280337 145283218 145281711 N NA ZEB2 NA NA NA NA ZEB2 2379 1398 chr2 145337965 145340704 145338803 N NA NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 60007 1399 chr2 145353046 145354751 145353859 N NA NA ZEB2,DKFZp686O1327 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZEB2 75088 1400 chr2 145398914 145400959 145399890 N NA NA NA NA NA NA ZEB2 120956 1401 chr2 145976574 145981032 145977614 N NA NA NA NA NA NA ZEB2 698616 1402 chr2 146167302 146169741 146168816 N NA NA NA NA NA NA ZEB2 889344 1403 chr2 146444249 146447370 146445332 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 1166291 1404 chr2 147954176 147958905 147956646 N NA NA NA NA NA NA MBD5 819675 1405 chr2 149371443 149373409 149372301 N NA EPC2 KIF5C,ORC4 IMR90 Hi-C 24141950 EPC2 29151 1406 chr2 15281224 15283772 15282520 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 417682 1407 chr2 155999641 156002197 156001132 N NA NA NA NA NA NA GPD2 1289768 1408 chr2 157196398 157200229 157198621 N NA NA GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPD2 91736 1409 chr2 157256902 157257803 157257510 N NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 34162 1410 chr2 158324139 158328400 158325547,158327125 Y,N CYTIP;NA CYTIP NA NA NA NA CYTIP 23535 1411 chr2 160146275 160148289 160147193 N NA WDSUB1 WDSUB1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WDSUB1 3039 1412 chr2 161063126 161065904 161064578 N NA NA ITGB6,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LY75-CD302 301859 1413 chr2 161950653 161952345 161951079 N NA TANK TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 41121 1414 chr2 161958560 161962683 161960570 N NA TANK ITGB6,TANK,RBMS1,LY75-CD302,PLA2R1 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 30783 1415 chr2 161967182 161970593 161968543 N NA TANK PLA2R1,RBMS1,TANK,LY75-CD302 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 22873 1416 chr2 16898161 16900303 16899059 N NA NA FAM49A IMR90 Hi-C 24141950 FAM49A 51027 1417 chr2 17305092 17307288 17306556 N NA NA NA NA NA NA FAM49A 457958 1418 chr2 17340926 17343228 17341863 N NA NA NA NA NA NA FAM49A 493792 1419 chr2 174212895 174215896 174214823 N NA CDCA7 NA NA NA NA CDCA7 3665 1420 chr2 174738249 174740622 174738951 N NA NA OLA1,LOC285084,CIR1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 89808 1421 chr2 174855103 174857157 174856376 Y CIR1,SP3,SP3 SP3 SP3,OLA1 IMR90 Hi-C 24141950 SP3 24673 1422 chr2 175357417 175358979 175357989 Y WIPF1,CIR1 NA GPR155 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CIR1 96974 1423 chr2 176439973 176442075 176440859 N NA NA EVX2,HOXD13 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5G3 393483 1424 chr2 177310947 177313837 177311872 N NA NA HOXD-AS1,HOXD3,HOXD1,MTX2,MIR10B,HOXD4,HOXD-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 176824 1425 chr2 177355191 177359013 177356195 N NA NA HOXD8,HOXD-AS2,HOXD-AS1,HOXD4,MIR10B,HOXD3 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 221068 1426 chr2 177417484 177419756 177418926 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 283361 1427 chr2 178028732 178031507 178030439 Y NFE2L2 HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 45915 1428 chr2 179922412 179925358 179923501 Y NA CCDC141 NA NA NA NA CCDC141 7626 1429 chr2 180139323 180140345 180139691 N NA SESTD1 SESTD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SESTD1 9973 1430 chr2 180734827 180749174 180736980,180744050 N,N NA;NA ZNF385B NA NA NA NA ZNF385B 8595 1431 chr2 180762568 180764523 180763785 N NA ZNF385B NA NA NA NA ZNF385B 36336 1432 chr2 182258969 182260307 182259751 N NA NA NA NA NA NA ITGA4 61312 1433 chr2 182274450 182277792 182275995 N NA ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 43827 1434 chr2 185234826 185237292 185235828 N NA NA NA NA NA NA ZNF804A 225801 1435 chr2 18779260 18781354 18779961 N NA NA NT5C1B-RDH14,OSR1,FLJ12334 IMR90 Hi-C 24141950 GEN1 844083 1436 chr2 190816016 190818426 190817730 N NA NA PMS1,HIBCH,C2orf88 IMR90 Hi-C 24141950 ORMDL1 166919 1437 chr2 191499843 191503804 191502859 N NA NAB1 NAB1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAB1 10044 1438 chr2 19337401 19339321 19338311 N NA NA OSR1,MIR4757 IMR90 Hi-C 24141950 TTC32 762423 1439 chr2 196425776 196427419 196426655 Y NA NA SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 94113 1440 chr2 199636350 199640768 199640205 N NA NA NA NA NA NA MARS2 1066322 1441 chr2 199836457 199840054 199838362 N NA NA NA NA NA NA C2orf69 935925 1442 chr2 199949859 199953694 199952360 N NA NA NA NA NA NA C2orf69 822285 1443 chr2 199959569 199967196 199966392 N NA NA NA NA NA NA C2orf69 808783 1444 chr2 199975756 199996934 199995027,199986440 N,N NA;NA NA SATB2 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf69 779045 1445 chr2 200050763 200056187 200054082,200051098 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C2orf69 719792 1446 chr2 20532346 20552383 20550720 N NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5202 1447 chr2 207109558 207111254 207110217 N NA ZDBF2 NA NA NA NA ZDBF2 28269 1448 chr2 208363993 208366681 208365177 N NA CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 27935 1449 chr2 214090594 214093733 214092330 N NA NA NA NA NA NA IKZF2 74261 1450 chr2 214096307 214100153 214098044,214099754 Y,N IKZF2,IKZF2;NA NA ABCA12 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 79974 1451 chr2 21454406 21456036 21455256 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 431579 1452 chr2 217470699 217472657 217471636 N NA NA DIRC3,MARCH4,RPL37A,IGFBP2,TNS1,PKI55 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 107179 1453 chr2 222064543 222069826 222068021 N NA NA NA NA NA NA FARSB 1451001 1454 chr2 223846126 223848028 223847073 N NA NA MOGAT1,AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 120394 1455 chr2 225502203 225504781 225503239 N NA NA FAM124B,SERPINE2,CUL3 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 52093 1456 chr2 225530044 225533667 225531782 N NA NA FAM124B IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 79934 1457 chr2 230998669 231000684 230999819 N NA NA SLC16A14 IMR90 Hi-C 24141950 SP110 84143 1458 chr2 231452725 231456181 231454458 N NA NA SP140,SP100,CAB39,FBXO36,SLC16A14,SP110,SP140L IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 121376 1459 chr2 231462946 231468880 231465806,231467526 N,Y NA;GPR55,SP110,SP110,SP140,SP140L,SP100,SP100 NA SP140,SP110,CAB39,SP100,SP140L IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 108677 1460 chr2 231479097 231480776 231480068 N NA NA CAB39,SP140,FBXO36,SLC16A14,SP110,SP140L,SP100,ITM2C,SPATA3,LOC348761,LOC151475 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 96781 1461 chr2 232256249 232257337 232256905 Y PTMA,NMUR1,B3GNT7 B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 2998 1462 chr2 232507111 232508802 232507832 N NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 64433 1463 chr2 232525277 232528957 232527160 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 44278 1464 chr2 232532438 232541212 232536600 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32023 1465 chr2 232544311 232555544 232550887,232545955 Y,Y NA;COPS7B PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17691 1466 chr2 233308920 233310239 233309350 N NA NA MIR1471,NPPC,ALPPL2,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 TIGD1 104987 1467 chr2 233313668 233317940 233314878 N NA NA MIR1471,NPPC,ALPPL2,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 TIGD1 97286 1468 chr2 233379381 233382633 233381992 N NA TIGD1,EIF4E2 NA NA NA NA TIGD1 32593 1469 chr2 235334032 235336181 235335473 N NA NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 556977 1470 chr2 235479349 235481874 235480590 N NA NA SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3P1 702294 1471 chr2 237454425 237456059 237455495 N NA NA NA NA NA NA COPS8 538025 1472 chr2 237960155 237969604 237967342 N NA COPS8 IQCA1,AGAP1,ASB18,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 24480 1473 chr2 238375837 238379887 238378321 N NA NA LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRFIP1 156337 1474 chr2 240831449 240833344 240832727 N NA NA LOC150935,HDAC4,NDUFA10 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 131475 1475 chr2 242856689 242857963 242856840 N NA NA CXXC11 IMR90 Hi-C 24141950 D2HGDH 182659 1476 chr2 242903420 242905998 242904730 N NA NA NA NA NA NA D2HGDH 229390 1477 chr2 24712408 24715313 24713870 N NA NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 129011 1478 chr2 27974352 27978009 27975602 N NA MRPL33 RBKS,PLB1,BRE,FOSL2,MRPL33 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 16575 1479 chr2 2904564 2906330 2905355 N NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 475323 1480 chr2 30445791 30452271 30448325 Y YPEL5,LBH LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 2126 1481 chr2 30504097 30506866 30505165 N NA LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 49700 1482 chr2 30558494 30561528 30560252 N NA NA LCLAT1,LBH IMR90 Hi-C 24141950 LBH 104097 1483 chr2 30888208 30890990 30889544 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 218085 1484 chr2 31088109 31091907 31090458 N NA NA CAPN13,YPEL5,XDH IMR90 Hi-C 24141950 GALNT14 269685 1485 chr2 3129264 3132745 3131486 N NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 248908 1486 chr2 3144683 3156500 3155491 N NA NA MYT1L,TSSC1 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 225153 1487 chr2 37548340 37553494 37552006 N NA PRKD3,QPCT QPCT,FAM82A1,PRKD3,EIF2AK2,C2orf56 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD3 4118 1488 chr2 37557258 37567225 37562824,37560543,37564437,37566298 N,N,N,N NA;NA;NA;NA PRKD3,QPCT QPCT,FAM82A1,PRKD3,EIF2AK2,C2orf56,SULT6B1,CEBPZ IMR90 Hi-C 24141950 QPCT 4528 1489 chr2 37933242 37935132 37934278 N NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 33916 1490 chr2 38119058 38120789 38120132 Y FAM82A1 NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3,FAM82A1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 219732 1491 chr2 38148944 38154711 38152587 N NA NA CDC42EP3,PRKG2,CYP1B1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CDC42EP3 249618 1492 chr2 38160943 38163720 38162461 N NA NA CYP1B1-AS1,FAM82A1,ATL2,CYP1B1 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 261617 1493 chr2 38635412 38638244 38636468 N NA ATL2 ATL2,DHX57,FAM82A1,GALM IMR90 Hi-C 24141950 ATL2 30980 1494 chr2 38750268 38752886 38751992 N NA NA GALM,ATL2,SRSF7 IMR90 Hi-C 24141950 ATL2 145836 1495 chr2 38759394 38761746 38760548 N NA NA ATL2,HNRPLL,GALM,SRSF7,DHX57 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATL2 154962 1496 chr2 38869768 38872373 38870859 N NA NA GALM,HNRPLL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF7 106263 1497 chr2 38874425 38877135 38875406 N NA NA GALM,HNRPLL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF7 101501 1498 chr2 39354298 39357779 39355344 N NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 6694 1499 chr2 39365807 39369836 39368411 N NA SOS1 SOS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOS1 18203 1500 chr2 40065259 40067120 40066000 N NA NA NA NA NA NA THUMPD2 58843 1501 chr2 42331625 42334667 42333048 Y EML4 NA EML4,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 61823 1502 chr2 42772797 42775021 42773925 N NA MTA3 MTA3 IMR90 Hi-C 24141950 MTA3 20650 1503 chr2 43022081 43023968 43023012 N NA NA NA NA NA NA MTA3 226410 1504 chr2 43034835 43039487 43038051 N NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 239164 1505 chr2 43357449 43364857 43360067,43364308 Y,Y NA;ZFP36L2,THADA,THADA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 88888 1506 chr2 43394704 43398438 43396513 Y OXER1,ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 55307 1507 chr2 43400409 43403508 43401502 N NA NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 50237 1508 chr2 46760389 46763246 46762362 N NA ATP6V1E2,RHOQ PIGF,CRIPT,RHOQ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOQ 6621 1509 chr2 47537366 47539234 47537901 N NA NA CALM2,TTC7A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSH2 91029 1510 chr2 47563455 47564630 47564145 N NA NA CALM2,TTC7A,EPCAM,MCFD2,C2orf61,MSH2,MSH6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSH2 65633 1511 chr2 47880198 47884542 47882490 N NA NA MSH2,EPCAM,KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK12 82728 1512 chr2 47887393 47892632 47889421 N NA NA KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK12 89923 1513 chr2 47922499 47932615 47925053 N NA NA KCNK12,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 77606 1514 chr2 47941392 47983732 47952722,47947380,47962880,47943972,47979607,47966032 N,N,N,N,Y,N NA;NA;NA;NA;NA;NA MSH6 MSH2,KCNK12,EPCAM,MSH6 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 26489 1515 chr2 48307462 48309035 48308554 N NA NA NA NA NA NA FBXO11 174530 1516 chr2 54280317 54282303 54280816 N NA NA SPTBN1,EML6,PSME4 IMR90 Hi-C 24141950 ACYP2 60107 1517 chr2 54318306 54321999 54320083 N NA ACYP2 EML6,SPTBN1,PSME4,RTN4,ACYP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACYP2 20411 1518 chr2 55344877 55348123 55346046 Y NA NA RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 67143 1519 chr2 55360404 55362332 55361521 N NA NA RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 82670 1520 chr2 56731308 56733531 56732697 N NA NA NA NA NA NA CCDC85A 320050 1521 chr2 57824539 57831266 57825746,57829835 N,N NA;NA NA NA NA NA NA VRK2 442511 1522 chr2 57841897 57847409 57843840 N NA NA NA NA NA NA VRK2 426368 1523 chr2 57911544 57914147 57913192 N NA NA NA NA NA NA VRK2 359630 1524 chr2 57922867 57927936 57926454 N NA NA NA NA NA NA VRK2 345841 1525 chr2 58741068 58744034 58743226 N NA NA NA NA NA NA FANCL 272553 1526 chr2 59410207 59413587 59411834 N NA NA NA NA NA NA FANCL 941692 1527 chr2 60532739 60534770 60533877 N NA NA FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 BCL11A 245863 1528 chr2 60535990 60538482 60537128 N NA NA FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 BCL11A 242151 1529 chr2 60542614 60544603 60543619 N NA NA FLJ30838 IMR90 Hi-C 24141950 BCL11A 236030 1530 chr2 60573954 60584725 60581172 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 195908 1531 chr2 60591715 60594358 60593475 N NA NA NA NA NA NA BCL11A 186275 1532 chr2 60887621 60890315 60888868 N NA NA NA NA NA NA PAPOLG 93050 1533 chr2 61920199 61923107 61921942 Y NA NA NA NA NA NA XPO1 154781 1534 chr2 61985091 61992845 61991517 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 122961 1535 chr2 62001057 62004217 62003219 N NA NA XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 CCT4 111589 1536 chr2 6362391 6366109 6364537 N NA NA NA NA NA NA LINC00487 544333 1537 chr2 6393611 6396434 6394846,6394767 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LINC00487 514008 1538 chr2 63960111 63965642 63963855 N NA NA UGP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGP2 102456 1539 chr2 63969097 63972306 63971575 N NA NA UGP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGP2 95792 1540 chr2 64036843 64051721 64044790,64046744,64050379 N,N,N NA;NA;NA UGP2 UGP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGP2 16377 1541 chr2 64288143 64292940 64290704 N NA VPS54 PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 41929 1542 chr2 64449253 64456838 64450592,64455515 N,N NA;NA NA LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 77648 1543 chr2 6447654 6452221 6449681 N NA NA LINC00487 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00487 458221 1544 chr2 64487247 64497142 64488097,64488026 Y,Y PELI1,SERTAD2,AFTPH;PELI1,SERTAD2,AFTPH NA LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 115642 1545 chr2 64552612 64554114 64553383 Y NA NA PELI1,AFTPH,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 181007 1546 chr2 6478963 6485971 6481932,6485309 N,N NA;NA NA LINC00487 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00487 424471 1547 chr2 64885626 64890304 64888949,64888794 N,N NA;NA SERTAD2 SERTAD2,LOC339807 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 4580 1548 chr2 6492625 6494921 6493966 N NA NA LINC00487,CMPK2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00487 415521 1549 chr2 64952281 64956245 64954993 N NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 71235 1550 chr2 64993043 64997334 64995303 N NA NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 111997 1551 chr2 65058112 65059923 65058899 N NA NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 99658 1552 chr2 65062728 65069138 65067189 Y SLC1A4,RAB1A NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 90443 1553 chr2 65076505 65081299 65080089 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400958 78282 1554 chr2 65083335 65094657 65086948,65092151,65090023 N,N,Y NA;NA;AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400958 64924 1555 chr2 65163673 65167567 65164525,65166904 N,N NA;NA LOC400958,SLC1A4 LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 4092 1556 chr2 65171964 65175216 65173492 Y AFTPH,SERTAD2 LOC400958,SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400958 12383 1557 chr2 65389916 65390928 65390470 N NA RAB1A ACTR2,RAB1A,CEP68,LOC400958 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB1A 32481 1558 chr2 65831921 65835708 65832906 N NA NA NA NA NA NA SPRED2 172265 1559 chr2 68916597 68918816 68917241 N NA ARHGAP25 PROKR1,APLF,ARHGAP25,BMP10,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 43097 1560 chr2 68941764 68943518 68942385 N NA ARHGAP25 GKN2,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 18395 1561 chr2 69133954 69136881 69135204 N NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 172041 1562 chr2 6915601 6920224 6919153 N NA LINC00487 NA NA NA NA LINC00487 5159 1563 chr2 69957152 69960154 69958901 N NA ANXA4 AAK1,ANXA4 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA4 8973 1564 chr2 71462540 71463966 71463431 N NA PAIP2B DYSF,PAIP2B,ZNF638,MPHOSPH10 IMR90 Hi-C 24141950 PAIP2B 8307 1565 chr2 71501821 71506075 71503628 N NA PAIP2B NA NA NA NA PAIP2B 47588 1566 chr2 74411064 74413554 74412794 N NA BOLA3,MOB1A,MTHFD2 SLC4A5,MOB1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOB1A 5069 1567 chr2 75641455 75645438 75643967 N NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 228471 1568 chr2 75656333 75660997 75660129 N NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 212912 1569 chr2 76532761 76536513 76535372 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 594650 1570 chr2 7764266 7766809 7765753 N NA NA LOC100506274 IMR90 Hi-C 24141950 RSAD2 746470 1571 chr2 7772720 7774265 7773743 N NA NA NA NA NA NA RSAD2 754924 1572 chr2 79177567 79179684 79179303 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 3239456 1573 chr2 79324763 79329425 79326844 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 3386652 1574 chr2 8006325 8010606 8008229 N NA NA LINC00299,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 811507 1575 chr2 8034132 8041310 8035629,8039480 N,N NA;NA NA ID2,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 780803 1576 chr2 80960898 80967220 80964497 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3719366 1577 chr2 81073079 81098797 81086285,81079666,81090710,81097394 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3587789 1578 chr2 85115101 85117226 85116329 N NA TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 15537 1579 chr2 85121043 85123976 85121684 N NA TMSB10 DNAH6,TMSB10 IMR90 Hi-C 24141950 TMSB10 8787 1580 chr2 85124901 85127468 85125696 N NA TMSB10 DNAH6,TMSB10,C2orf89,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 TMSB10 5295 1581 chr2 85165230 85174895 85166730,85173486 Y,Y KCMF1,C2orf89;TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 23336 1582 chr2 85647176 85649276 85647854 N NA CAPG ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 CAPG 5979 1583 chr2 8609283 8619225 8615649,8618071 N,N NA;NA NA LINC00299,LOC100506274,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 202888 1584 chr2 8653905 8656560 8655608 N NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 165553 1585 chr2 86619644 86621847 86621049 N NA KDM3A REEP1,KDM3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM3A 46424 1586 chr2 8663800 8667969 8666774 N NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 154144 1587 chr2 8671465 8693524 8692430,8683869,8685457,8683752 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2,LOC339788 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 128589 1588 chr2 8702104 8725327 8714384,8711831,8722684 N,N,N NA;NA;NA NA LINC00299,LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 96786 1589 chr2 8770275 8772661 8771965 N NA ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 49452 1590 chr2 89135480 89145726 89137756,89141002,89144934 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 70061 1591 chr2 89152408 89160759 89156506,89152477 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 86989 1592 chr2 89162752 89166775 89166180 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 97333 1593 chr2 89183295 89187116 89185487 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 117876 1594 chr2 89194368 89198176 89196681 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 128949 1595 chr2 89211651 89215179 89213354 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 146232 1596 chr2 89247701 89250552 89248807 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 182282 1597 chr2 89277095 89279230 89278687 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 211676 1598 chr2 89290510 89292967 89292095 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 225091 1599 chr2 89325715 89326972 89326640 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 260296 1600 chr2 89451264 89453098 89452288 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 385845 1601 chr2 89888428 89890883 89890540 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 823009 1602 chr2 89985880 89987723 89986651 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 920461 1603 chr2 90007236 90008384 90007589 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 941817 1604 chr2 90211930 90213580 90212280 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1146511 1605 chr2 90247912 90251653 90248825 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1182493 1606 chr2 90259073 90262310 90259824 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1193654 1607 chr2 9305744 9308475 9306853 N NA NA ASAP2,ITGB1BP1,CPSF3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1BP1 255168 1608 chr2 9313980 9321044 9317408,9315712 N,N NA;NA NA ASAP2,ITGB1BP1,CPSF3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1BP1 242599 1609 chr2 95870963 95874819 95873230 N NA ZNF514,ZNF2 ZNF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF2 39780 1610 chr2 96656748 96659101 96657960 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 17198 1611 chr2 96821371 96824337 96822382 N NA ASTL,DUSP2,LOC285033 ASTL,DUSP2,STARD7,LOC285033,ADRA2B,SNRNP200,TMEM127,CIAO1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP2 10192 1612 chr2 96978505 96988274 96987480 N NA TMEM127,CIAO1,SNRNP200,NCAPH SNRNP200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNRNP200 7198 1613 chr2 98629735 98632182 98630444 N NA TMEM131 TMEM131,VWA3B,ZAP70 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM131 17381 1614 chr2 98641823 98646968 98643346 N NA TMEM131 TMEM131,VWA3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM131 29469 1615 chr2 9892640 9894027 9893516 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 89544 1616 chr2 9899354 9909969 9904478,9905758,9900313 Y,N,N ADAM17;NA;NA NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11,TAF1B,CYS1,NOL10,HPCAL1,ODC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 73602 1617 chr2 9939434 9940279 9939978 N NA TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,TAF1B,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 43292 1618 chr20 1013399 1015071 1014610 N NA NA NA NA NA NA FAM110A 199043 1619 chr20 1055622 1056903 1056407 N NA NA NA NA NA NA FAM110A 241266 1620 chr20 11972946 11976514 11974922 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 101469 1621 chr20 12574657 12575833 12575573 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 703180 1622 chr20 16081005 16084113 16082488 N NA NA NA NA NA NA KIF16B 469966 1623 chr20 17762825 17763552 17763539 N NA NA BANF2,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 99897 1624 chr20 17775793 17777411 17776648 N NA NA BANF2,RRBP1,BFSP1,C20orf72,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 112865 1625 chr20 17789279 17791112 17790155 N NA NA BANF2,C20orf72,SNX5,RRBP1,DSTN,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 126351 1626 chr20 17801067 17803884 17802795 N NA NA BANF2,RRBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RRBP1 138139 1627 chr20 17819129 17831838 17824707,17822062,17828065 N,N,N NA;NA;NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 117652 1628 chr20 17832668 17845081 17834910,17834967,17838444,17842682,17842673 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 104409 1629 chr20 17858500 17860630 17859751 N NA NA BANF2,RRBP1,SNX5,DSTN,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 88860 1630 chr20 17862182 17866686 17863584,17865778 N,N NA;NA NA BANF2,RRBP1,SNX5,DSTN,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 82804 1631 chr20 17876409 17878952 17877865 N NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX5 70538 1632 chr20 17883130 17885653 17884316 N NA NA BANF2,RRBP1,BFSP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90 Hi-C 24141950 SNX5 63837 1633 chr20 19050243 19053706 19052297 N NA NA SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130264 211534 1634 chr20 19078862 19080710 19080085 N NA NA DTD1,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130264 184530 1635 chr20 19094124 19096717 19095299 N NA NA NA NA NA NA LOC100130264 168523 1636 chr20 22351078 22353547 22352696 N NA NA NA NA NA NA LOC200261 759726 1637 chr20 22662456 22666039 22665316 N NA NA NXT1,THBD IMR90 Hi-C 24141950 LOC200261 447234 1638 chr20 22731960 22733767 22733160 N NA NA NA NA NA NA LOC200261 379506 1639 chr20 22981606 22984289 22983005 N NA NA NA NA NA NA LOC200261 128984 1640 chr20 23121855 23124015 23122764 N NA LOC200261 LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 LOC200261 8582 1641 chr20 23127838 23133456 23128898,23131249,23132848 N,N,N NA;NA;NA LOC200261 CD93,THBD K562 ChIA-PET 22265404 LOC200261 14565 1642 chr20 23139716 23141571 23140438 N NA LOC200261 NA NA NA NA LOC200261 26443 1643 chr20 23464259 23465928 23465259 N NA NA NA NA NA NA NAPB 62103 1644 chr20 23620608 23623174 23621793 N NA CST9,CST4 NA NA NA NA CST9 33998 1645 chr20 23900793 23901881 23900828 N NA NA NA NA NA NA CST2 93481 1646 chr20 23981568 23983683 23982775 N NA NA CST4 IMR90 Hi-C 24141950 CST2 174256 1647 chr20 24001775 24003567 24002761 N NA NA NA NA NA NA CST2 194463 1648 chr20 24007093 24009073 24008105 Y NA NA NA NA NA NA CST2 199781 1649 chr20 24128092 24130612 24129262 Y NA NA FLJ33581 IMR90 Hi-C 24141950 CST2 320780 1650 chr20 24851932 24853247 24852135 N NA NA FLJ33581,SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf3 120178 1651 chr20 2505005 2506478 2505572 N NA ZNF343 TMC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF343 15227 1652 chr20 30217343 30218578 30218268 N NA ID1 HM13,ID1,MIR3193,BCL2L1,COX4I2,TPX2 IMR90 Hi-C 24141950 ID1 24257 1653 chr20 31250671 31254366 31252949 N NA C20orf203 C20orf203,DNMT3B IMR90 Hi-C 24141950 C20orf203 10888 1654 chr20 31256057 31262783 31260980,31258795 N,N NA;NA C20orf203 C20orf203,DNMT3B,C20orf112,COMMD7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C20orf203 16274 1655 chr20 32468352 32472978 32469589,32471681 N,N NA;NA NA ZNF341,CHMP4B,RALY,EIF2S2,PXMP4,E2F1 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP4B 69242 1656 chr20 32825650 32830014 32829105 Y NA NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 ITCH 121048 1657 chr20 32925161 32927069 32926318 N NA ITCH NCOA6,ITCH,DYNLRB1,AHCY,TP53INP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITCH 23993 1658 chr20 34651492 34653267 34652703 Y NA LOC647979 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC647979 12610 1659 chr20 39370654 39376138 39373333 N NA NA NA NA NA NA TOP1 281324 1660 chr20 39406614 39408602 39407738 N NA NA NA NA NA NA TOP1 248860 1661 chr20 39554075 39562183 39554863,39560278 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TOP1 95279 1662 chr20 39567089 39572215 39570597 N NA NA NA NA NA NA TOP1 85247 1663 chr20 39618459 39623967 39620283,39622860 Y,N MAFB,TOP1;NA TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 33495 1664 chr20 39635833 39644167 39637047,39640966,39643222 N,N,N NA;NA;NA TOP1 TOP1,ZHX3,CHD6,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 13295 1665 chr20 39944479 39948149 39946129 N NA ZHX3 ZHX3,IQGAP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 ZHX3 15740 1666 chr20 4017766 4020240 4018860 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 21550 1667 chr20 40320148 40323875 40321714 N NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 73015 1668 chr20 40459000 40460743 40459533 N NA NA PTPRT IMR90 Hi-C 24141950 CHD6 211867 1669 chr20 40465131 40468413 40466515 N NA NA PTPRT IMR90 Hi-C 24141950 CHD6 217998 1670 chr20 4062009 4065427 4063568 Y NA NA RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF24 65793 1671 chr20 42378643 42381825 42380631 N NA NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 82934 1672 chr20 42946747 42949894 42948715 Y NA FITM2 GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FITM2 6858 1673 chr20 43309931 43313331 43312444 N NA ADA PKIG,ADA,LOC79015,WISP2,LOC100505783,HNF4A,TTPAL,RIMS4,KCNK15,YWHAB IMR90 Hi-C 24141950 ADA 29555 1674 chr20 43781261 43783397 43782573 Y SYS1 NA WFDC5,MATN4,STK4 IMR90 Hi-C 24141950 SLPI 99809 1675 chr20 46019253 46021904 46020989 N NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMYND8 33779 1676 chr20 46041655 46047632 46044256,46045541 N,N NA;NA NA ZMYND8,NCOA3,SULF2,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 56181 1677 chr20 46066199 46069837 46067986 N NA NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60764 1678 chr20 46078947 46084776 46082324,46079471 Y,N NA;NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,LOC100131496,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 45825 1679 chr20 46094550 46108736 46097294,46101984,46095969,46101963 Y,N,N,N NA;NA;NA;NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2,LOC100131496 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 21865 1680 chr20 46114464 46117988 46116199 N NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 12613 1681 chr20 46443988 46447318 46445785 N NA NA NA NA NA NA NCOA3 313387 1682 chr20 46523368 46525165 46523683 Y NA NA NA NA NA NA NCOA3 392767 1683 chr20 46907810 46908960 46908374 N NA NA SULF2,LINC00494 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00494 79694 1684 chr20 46911084 46912561 46911751 N NA NA SULF2,LINC00494 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00494 76093 1685 chr20 47049795 47052317 47051266 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 61141 1686 chr20 47095423 47097538 47096189 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 106769 1687 chr20 47109462 47112548 47111403 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 120808 1688 chr20 47115949 47118832 47117195 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 127295 1689 chr20 47130280 47134405 47132305 N NA NA NA NA NA NA LINC00494 141626 1690 chr20 47145508 47148972 47148323 N NA NA SULF2,PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 156854 1691 chr20 47154364 47157299 47156099 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 165710 1692 chr20 47183953 47186581 47184776 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 195299 1693 chr20 47488688 47490158 47489456 N NA PREX1,ARFGEF2 PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 PREX1 44268 1694 chr20 48366281 48368474 48367674 N NA B4GALT5 B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT5 35860 1695 chr20 49066376 49068410 49067751 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 58481 1696 chr20 49097905 49101347 49100454 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 25544 1697 chr20 49406519 49408509 49407362 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 2958 1698 chr20 49649036 49653498 49651548 N NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOCS3 73673 1699 chr20 49715885 49718985 49717246 N NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 140522 1700 chr20 49744170 49746166 49745248 N NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 168807 1701 chr20 49805706 49807270 49806472 N NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 MOCS3 230343 1702 chr20 49899762 49902113 49900938 N NA NA KCNG1,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 NFATC2 277055 1703 chr20 49903070 49905749 49903733 N NA NA KCNG1,ATP9A,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 NFATC2 273419 1704 chr20 50596907 50598772 50598266 N NA NA SALL4,ATP9A,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 209752 1705 chr20 50603044 50604747 50604506 N NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP64 203777 1706 chr20 50619031 50622918 50621137 N NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 185606 1707 chr20 50639753 50641381 50640729 N NA NA ATP9A,SALL4 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 167143 1708 chr20 50648771 50650168 50650044 N NA NA SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 158356 1709 chr20 52205046 52218019 52205564,52208999,52217868 N,N,N NA;NA;NA ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,ZNF217,CSRNP3,BMP7,SULF2,ZMYND8,CYP24A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 ZNF217 5410 1710 chr20 52224216 52227491 52226398 N NA ZNF217 SUMO1P1,ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 24580 1711 chr20 52237808 52240901 52239450 N NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 38172 1712 chr20 52258979 52260792 52259874 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 59343 1713 chr20 52267472 52270870 52269507 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 67836 1714 chr20 52276371 52277876 52277157 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,SULF2,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 76735 1715 chr20 52297530 52300106 52298711 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 97894 1716 chr20 52301381 52303455 52302652 N NA NA SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 101745 1717 chr20 52322541 52325473 52324272 N NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 122905 1718 chr20 52356441 52357453 52356894 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 156805 1719 chr20 52367112 52369701 52367964 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 167476 1720 chr20 52445143 52447725 52446036 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 245507 1721 chr20 52450133 52452806 52450851 N NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 250497 1722 chr20 52455551 52457666 52456238 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 255915 1723 chr20 52462705 52464915 52464108 N NA NA SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 263069 1724 chr20 52507467 52513096 52510696 N NA NA BCAS1,SUMO1P1,ZNF217,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 307831 1725 chr20 52514496 52518419 52516095 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 306083 1726 chr20 52522153 52526719 52524655 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 297783 1727 chr20 52530119 52534844 52531688 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289658 1728 chr20 55263976 55267005 55265426 N NA NA BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C20orf43 220329 1729 chr20 55295770 55298542 55297440 N NA NA TFAP2C IMR90 Hi-C 24141950 C20orf43 252123 1730 chr20 55374498 55376797 55375734 N NA NA TFAP2C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C20orf43 330851 1731 chr20 55394040 55395916 55395337 N NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 C20orf43 350393 1732 chr20 55407560 55409817 55408701 N NA NA NA NA NA NA C20orf43 363913 1733 chr20 55417877 55423589 55420439,55422277 N,N NA;NA NA TFAP2C,BMP7 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf43 374230 1734 chr20 55431862 55444616 55433183,55443216 N,N NA;NA NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C20orf43 388215 1735 chr20 55448159 55453774 55450233,55453454 N,N NA;NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 BMP7 387933 1736 chr20 55467214 55470131 55468518 N NA NA NA NA NA NA BMP7 371576 1737 chr20 55483178 55486857 55485007 N NA NA NA NA NA NA BMP7 354850 1738 chr20 55547643 55559359 55549558 N NA NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP7 282348 1739 chr20 55576952 55579558 55578408 N NA NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP7 262149 1740 chr20 55679926 55682284 55681552 N NA NA BMP7,MIR5095,EYA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP7 159423 1741 chr20 55898998 55904417 55901821,55903810 N,N NA;NA MIR5095 BMP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR5095 8796 1742 chr20 56024738 56027658 56026377 N NA NA MIR5095 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR5095 111525 1743 chr20 56042339 56046678 56044608 N NA NA CTCFL,MIR5095 IMR90 Hi-C 24141950 MIR5095 129126 1744 chr20 5622750 5632171 5626858,5631233 N,Y NA;TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 GPCPD1,C20orf196,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 31078 1745 chr20 5632731 5637059 5634160 N NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 41059 1746 chr20 5639199 5640702 5640084 N NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 47527 1747 chr20 5644744 5647229 5646219 N NA NA GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 53072 1748 chr20 5653174 5657586 5654734 N NA NA C20orf196,GPCPD1 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 61502 1749 chr20 5670336 5674380 5672723 N NA NA GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 56663 1750 chr20 5699137 5701770 5700114 N NA C20orf196 GPCPD1,C20orf196 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf196 29273 1751 chr20 5716922 5720477 5718548 N NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10566 1752 chr20 57666172 57671354 57670250 N NA SLMO2-ATP5E GNAS,GNAS-AS1,SLMO2-ATP5E,CTSZ,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2-ATP5E 48271 1753 chr20 57694835 57707416 57694946,57698913 Y,N NA;NA NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF831 58659 1754 chr20 57716824 57732691 57718110 N NA ZNF831 MIR298,GNAS-AS1,MIR296,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF831 33384 1755 chr20 57737700 57755620 57738762,57741069 Y,Y ZNF831;ZNF831 ZNF831 ZNF831,SLMO2-ATP5E,GNAS-AS1,GNAS IMR90 Hi-C 24141950 ZNF831 10455 1756 chr20 58676541 58679257 58677663 N NA NA C20orf197 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPP1R3D 161189 1757 chr20 58977260 58978931 58978027 N NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 461908 1758 chr20 61068243 61071436 61069881 N NA NA NA NA NA NA CABLES2 85904 1759 chr20 6809457 6810367 6809695 N NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 CRLS1 822718 1760 chr20 6816892 6821858 6818227 N NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 CRLS1 830153 1761 chr20 6866399 6872520 6866828 N NA NA NA NA NA NA CRLS1 879660 1762 chr20 6894290 6896551 6895023 N NA NA NA NA NA NA CRLS1 907551 1763 chr20 6899247 6904098 6901625 N NA NA NA NA NA NA CRLS1 912508 1764 chr20 7392348 7394318 7392994 N NA NA NA NA NA NA TMX4 606075 1765 chr20 802425 805279 803830 N NA FAM110A FAM110A K562 ChIA-PET 22265404 FAM110A 9077 1766 chr21 15399080 15400707 15399731 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 354802 1767 chr21 16047031 16050807 16048695 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 291522 1768 chr21 16062251 16066237 16064452 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA HSPA13 306742 1769 chr21 19814289 19817417 19816180 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 622586 1770 chr21 19833835 19836495 19835066 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 642132 1771 chr21 19839401 19843366 19841151 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 647698 1772 chr21 23946602 23948695 23948106 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2985762 1773 chr21 24088072 24089231 24088991 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2845226 1774 chr21 24299910 24301578 24299946 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2632879 1775 chr21 24303183 24312222 24310912 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2622235 1776 chr21 24321275 24323424 24322077 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2611033 1777 chr21 24330741 24340283 24332588,24338091,24334122 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2594174 1778 chr21 24353065 24357827 24354975,24356447 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2576630 1779 chr21 24378254 24389730 24381444,24387470 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MIR155HG 2544727 1780 chr21 25183760 25185777 25184679 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 1748680 1781 chr21 25329556 25330378 25330033 N NA NA NA NA NA NA MIR155HG 1604079 1782 chr21 29844959 29847466 29846436 N NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 410227 1783 chr21 33018680 33020792 33020175 N NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 11143 1784 chr21 33143044 33147090 33145616 N NA SCAF4 MIS18A,SCAF4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCAF4 38613 1785 chr21 34574127 34577224 34576393 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2 IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 25007 1786 chr21 34586379 34589882 34588024 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR1,TMEM50B,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,IL10RB,CRYZL1 IMR90,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 12349 1787 chr21 35388883 35396398 35390071,35392517,35395322 N,N,Y NA;NA;GART,GART,SON MRPS6 MRPS6,ATP5O,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 49425 1788 chr21 35401598 35404728 35402554 Y GART,GART MRPS6 MRPS6,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 41095 1789 chr21 36560780 36563595 36562027 N NA NA RUNX1,SETD4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 139185 1790 chr21 36592051 36596197 36595048 N NA NA RUNX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 170456 1791 chr21 36597761 36600782 36598374,36599786 N,Y NA;NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 176166 1792 chr21 36602757 36605435 36603497 N NA NA RUNX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 181162 1793 chr21 38933121 38937394 38936247 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 193262 1794 chr21 40232950 40236075 40234176 N NA NA LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 55719 1795 chr21 42681066 42683267 42682175 N NA FAM3B MX2,MX1,LINC00323 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3B 5394 1796 chr21 43607245 43609877 43608516 N NA ABCG1 ABCG1,TFF3,TFF2,RSPH1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 9922 1797 chr21 44554031 44555587 44554898 N NA U2AF1,CRYAA HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 26343 1798 chr21 44579775 44586958 44582159,44584784 N,N NA;NA CRYAA HSF2BP,LINC00313,CRYAA,SIK1,RRP1B,U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 CRYAA 2183 1799 chr21 44713546 44717516 44715584 N NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 CRYAA 124405 1800 chr21 44730820 44734721 44733124,44731273 N,N NA;NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319,CRYAA,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 112281 1801 chr21 44770772 44783882 44773784,44781493 N,N NA;NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 63120 1802 chr21 45277733 45282898 45281781 N NA AGPAT3 AGPAT3,PDXK,LOC284837,TRAPPC10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT3 2218 1803 chr21 45593711 45607286 45595198 N NA C21orf33 PWP2,ICOSLG,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 40217 1804 chr21 45614855 45617952 45616264 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG ICOSLG AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ICOSLG 42882 1805 chr22 17392838 17396620 17395968 N NA NA CECR2 IMR90 Hi-C 24141950 CECR7 120840 1806 chr22 17694775 17701996 17700384,17698241 N,N NA;NA CECR5,CECR1,CECR3 NA NA NA NA CECR1 3996 1807 chr22 18547474 18552016 18549304,18547712 N,N NA;NA MICAL3,PEX26 BID,MICAL3,FLJ41941,PEX26 IMR90 Hi-C 24141950 PEX26 8670 1808 chr22 19584231 19586506 19585523 N NA NA CLDN5,UFD1L,CLTCL1,HIRA,MRPL40,C22orf39,CDC45 IMR90 Hi-C 24141950 CDC45 116817 1809 chr22 22353393 22382217 22380729 N NA PPM1F,TOP3B PPM1F,TOP3B,LOC96610,VPREB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP3B 16246 1810 chr22 22382820 22402791 22391709,22385356,22397557,22401032 N,N,N,N NA;NA;NA;NA TOP3B VPREB1,PPM1F,TOP3B IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 45673 1811 chr22 22412008 22417159 22412992,22415729 N,N NA;NA NA TOP3B,LOC96610 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TOP3B 74861 1812 chr22 22450214 22455977 22453619,22454230 N,N NA;NA NA LOC96610,VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 113067 1813 chr22 22463686 22466777 22465808 N NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 126539 1814 chr22 22471590 22474207 22472563 N NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 134443 1815 chr22 22476264 22479162 22477928 N NA NA NA NA NA NA TOP3B 139117 1816 chr22 22507700 22513094 22511538 N NA NA NA NA NA NA LOC96610 139369 1817 chr22 22515211 22524212 22517845,22519086,22523167 N,N,N NA;NA;NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 128251 1818 chr22 22530393 22534568 22533029 N NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 117895 1819 chr22 22548652 22557267 22550380,22555961 N,N NA;NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 95196 1820 chr22 22563631 22566383 22565068 N NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 86080 1821 chr22 22568226 22575281 22570294,22574308 N,N NA;NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 77182 1822 chr22 22589373 22591434 22590129 N NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 61029 1823 chr22 22701866 22704009 22702662 N NA LOC96610 LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 49403 1824 chr22 22710890 22713929 22711935 N NA NA NA NA NA NA LOC96610 58427 1825 chr22 22716346 22718644 22718156 N NA NA NA NA NA NA LOC96610 63883 1826 chr22 22722005 22738737 22724430,22730185,22735001 N,N,N NA;NA;NA NA IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 69542 1827 chr22 22748202 22751384 22749581 N NA NA IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 95739 1828 chr22 22755496 22760619 22758844 N NA NA NA NA NA NA ZNF280B 102886 1829 chr22 22776194 22781067 22777297,22779900 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF280B 82438 1830 chr22 22784947 22787093 22786083 N NA NA NA NA NA NA ZNF280B 76412 1831 chr22 22804031 22805581 22804693 N NA NA PRAME,IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280B 57924 1832 chr22 22945909 22948077 22947070 N NA NA PRAME,LOC648691 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF280B 82404 1833 chr22 23027366 23031497 23029108,23027723 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF280B 163861 1834 chr22 23032740 23044284 23039963,23035057 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF280B 169235 1835 chr22 23056637 23058447 23057529,23057619 N,N NA;NA NA ZNF280B IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 171513 1836 chr22 23062081 23065540 23063372 N NA NA ZNF280B,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 164420 1837 chr22 23088390 23089401 23088396 N NA NA NA NA NA NA IGLL5 140559 1838 chr22 23093680 23097431 23096002 N NA NA ZNF280B,MIR650,IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 132529 1839 chr22 23211609 23216495 23213600,23215661 N,N NA;NA IGLL5 IGLL5,MIR650 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 13465 1840 chr22 23264806 23277385 23271245,23271379,23274478 Y,N,Y NA;NA;IGLL5 IGLL5 MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 34846 1841 chr22 23278019 23288103 23279941,23285888 N,Y NA;IGLL5 IGLL5 MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1,BCR IMR90 Hi-C 24141950 IGLL5 48059 1842 chr22 23295292 23303663 23297025,23303651 N,N NA;NA NA RTDR1,GNAZ,IGLL5,BCR,MIR650,RAB36 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGLL5 65332 1843 chr22 23373641 23380545 23375379,23377649 N,N NA;NA GNAZ NA NA NA NA GNAZ 32124 1844 chr22 25798811 25803161 25800725 N NA LRP5L,CRYBB2P1 SEZ6L,CRYBB2P1,LRP5L,ADRBK2,MYO18B IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 21267 1845 chr22 27678848 27681296 27679905 N NA NA MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MIAT 625402 1846 chr22 27764272 27770255 27766427,27769461 N,N NA;NA NA MN1 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNB 545000 1847 chr22 29212954 29222241 29219201,29222127 Y,N NA;NA CCDC117,XBP1 TTC28,TTC28-AS1,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,C22orf31,KREMEN1,CHEK2,HSCB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XBP1 16394 1848 chr22 31458061 31462544 31459948 N NA SMTN OSBP2,TUG1,MORC2,LIMK2,SMTN,INPP5J IMR90 Hi-C 24141950 SMTN 14738 1849 chr22 33583903 33590257 33587993 N NA NA NA NA NA NA FBXO7 713196 1850 chr22 33612059 33618875 33617834 N NA NA NA NA NA NA LARGE 697541 1851 chr22 36022105 36024340 36023649 N NA APOL6 MB MCF7 ChIA-PET 22265404 APOL6 20084 1852 chr22 36029397 36031135 36030315 N NA APOL6 APOL5,RBFOX2 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 13289 1853 chr22 36460641 36463056 36462157 N NA RBFOX2 RBFOX2,APOL3,APOL6,MCM5,MB,APOL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBFOX2 36056 1854 chr22 36800513 36803049 36801715 N NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 16450 1855 chr22 36803706 36807842 36804671,36806248 N,Y NA;NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 19643 1856 chr22 37997050 37998648 37997811 Y GGA1,GGA1 GGA1,SH3BP1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGA1 5833 1857 chr22 39291977 39293839 39292873 N NA CBX6 APOBEC3A,CBX7,APOBEC3D,APOBEC3C,SUN2,CBX6,DNAL4,APOBEC3F,APOBEC3G,APOBEC3H IMR90 Hi-C 24141950 CBX6 23719 1858 chr22 39296405 39298977 39297284 N NA CBX6 APOBEC3A,APOBEC3D,APOBEC3C,SUN2,CBX6,CBX7,DNAL4,NPTXR,APOBEC3G,APOBEC3H,APOBEC3F,SYNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 CBX6 28147 1859 chr22 39316788 39319329 39317998 N NA CBX6 APOBEC3A,CBX7,DNAL4,CBX6,APOBEC3C,PDGFB,GTPBP1,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G,RPL3,SNORD83A,RNU86,NPTXR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX6 48530 1860 chr22 39566377 39568421 39567134 N NA CBX7 RPL3,PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 17839 1861 chr22 41046541 41050558 41047819 Y NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 13851 1862 chr22 41416892 41419116 41418054 Y MKL1,EP300 NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EP300 69498 1863 chr22 41464170 41466302 41465227 N NA EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 EP300 22312 1864 chr22 41474513 41476557 41475135 N NA EP300 RBX1,XPNPEP3 IMR90 Hi-C 24141950 EP300 12057 1865 chr22 42832280 42837472 42833922,42836355 N,N NA;NA NA WBP2NL,TCF20,LOC388906,SERHL,MEI1,LOC100132273,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 RRP7A 78357 1866 chr22 42838463 42845542 42839968 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 NA MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP7A 70287 1867 chr22 42853606 42858902 42854373 N NA NA MEI1,TCF20,WBP2NL,NDUFA6,LOC100132273,NAGA,C22orf32,CYP2D6,SERHL,SERHL2,POLDIP3,RRP7B,FAM109B,NFAM1,SEPT3,CYP2D7P1,LOC388906 IMR90 Hi-C 24141950 RRP7A 56927 1868 chr22 42933550 42936184 42935262 N NA RRP7A,RRP7B NA NA NA NA RRP7A 17721 1869 chr22 43051403 43052765 43051875 N NA POLDIP3,CYB5R3 RNU12,POLDIP3,CYB5R3,A4GALT,ARFGAP3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYB5R3 5998 1870 chr22 43059936 43062415 43061113 N NA POLDIP3,CYB5R3 A4GALT,CYB5R3,ARFGAP3,POLDIP3,RNU12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYB5R3 14531 1871 chr22 44724600 44727077 44725504 N NA NA NA NA NA NA SAMM50 373339 1872 chr22 44843871 44853086 44851581,44849611 N,N NA;NA NA PARVB,SAMM50,KIAA1644,LINC00207,PARVG,LINC00229,LDOC1L IMR90 Hi-C 24141950 SAMM50 492610 1873 chr22 45059334 45060829 45060200 N NA NA PNPLA3,PARVB,SAMM50,KIAA1644,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506714 498833 1874 chr22 45641826 45643668 45642753 N NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 5176 1875 chr22 45656833 45660339 45658714 N NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,NUP50,SMC1B,KIAA0930,PHF21B,FBLN1,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0930 20183 1876 chr22 45663663 45665721 45665079 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0930 27013 1877 chr22 46956111 46958871 46957632 Y NA NA TRMU,CELSR1,GRAMD4,TBC1D22A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD4 63787 1878 chr22 46971866 46978930 46972951 N NA GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 43728 1879 chr22 46981958 46995748 46983708,46989428 Y,Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4;TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 26910 1880 chr22 47007859 47010964 47010104 N NA GRAMD4 NA NA NA NA GRAMD4 11694 1881 chr22 48235949 48239386 48236554 N NA NA MIR3201 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D22A 1077431 1882 chr22 48242717 48244042 48243266 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1084199 1883 chr22 48313650 48316406 48314717 N NA NA TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D22A 1155132 1884 chr22 48323331 48326186 48324563 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1164813 1885 chr22 48390204 48394006 48392424 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1231686 1886 chr22 48464837 48469571 48467503 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1306319 1887 chr22 48478919 48481490 48479664 N NA NA TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D22A 1320401 1888 chr22 48491152 48503287 48494025 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1332634 1889 chr22 48746965 48748390 48747638 N NA NA TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 C22orf34 1302800 1890 chr22 49229097 49231959 49230417 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 819231 1891 chr22 49235192 49237951 49236485 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 813239 1892 chr22 49743544 49752562 49747145,49750663 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C22orf34 298628 1893 chr22 49753927 49756963 49755982 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 294227 1894 chr22 49776536 49778745 49777460 N NA NA NA NA NA NA C22orf34 272445 1895 chr22 50053693 50055805 50055279 N NA C22orf34 C22orf34 K562 ChIA-PET 22265404 C22orf34 2503 1896 chr22 50455089 50456341 50455577 N NA NA IL17REL MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 100946 1897 chr22 50770482 50773599 50772799 N NA PLXNB2,FAM116B,PPP6R2 PLXNB2,FAM116B MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM116B 4993 1898 chr3 101946939 101951132 101948518 N NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIZ 378581 1899 chr3 101951660 101954591 101952981 N NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 383302 1900 chr3 104241397 104242707 104242557 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 842850 1901 chr3 104435295 104437654 104436582 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 647903 1902 chr3 104625725 104629598 104628271 N NA NA ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 ALCAM 455959 1903 chr3 105688369 105689961 105689348 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 100482 1904 chr3 105973114 105977314 105975286 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 385227 1905 chr3 10599113 10601380 10600109 N NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 236255 1906 chr3 10602376 10610293 10604585,10605468 N,N NA;NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 239518 1907 chr3 107148101 107152716 107150375 N NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 89067 1908 chr3 107841985 107856776 107844067,107846296 N,Y NA;CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 32050 1909 chr3 109104301 109107078 109104742,109106276 N,N NA;NA NA NA NA NA NA KIAA1524 795810 1910 chr3 109278430 109279434 109278557 N NA NA CD96 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1524 969939 1911 chr3 111392549 111395015 111393487 N NA NA CD96,PHLDB2 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD10 302813 1912 chr3 112020565 112024422 112022111 N NA NA CD200,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52 IMR90 Hi-C 24141950 GCET2 168413 1913 chr3 125975657 125981802 125977768,125980025 N,N NA;NA NA CCDC37,ZXDC,ALDH1L1,KLF15 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 94434 1914 chr3 126004829 126007752 126006733 N NA NA KLF15 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 68484 1915 chr3 126700395 126702276 126701684 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZXDC 505633 1916 chr3 12750250 12752553 12751418 N NA RAF1 RAF1,MKRN2,CAND2,SYN2,TMEM40,RPL32 IMR90 Hi-C 24141950 RAF1 44550 1917 chr3 128391384 128394754 128393745 N NA RPN1 RAB7A,RPN1 IMR90 Hi-C 24141950 RPN1 21665 1918 chr3 129668639 129670643 129669628 N NA NA TRH,TMCC1,LOC100507032 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507032 55925 1919 chr3 13151404 13153975 13152599 N NA IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 36787 1920 chr3 13190384 13192166 13191305 N NA NA NUP210,FBLN2 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 75767 1921 chr3 133223859 133226157 133225421 Y CDV3,CDV3 NA BFSP2,TOPBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 66277 1922 chr3 133265378 133269964 133269264 N NA CDV3 BFSP2,CDV3 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 22470 1923 chr3 133394925 133396540 133395235 N NA TOPBP1 TMEM108 IMR90 Hi-C 24141950 TOPBP1 14188 1924 chr3 133451082 133452542 133451670 N NA NA NPHP3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TOPBP1 70345 1925 chr3 134148928 134152744 134150772 N NA NA ANAPC13 IMR90 Hi-C 24141950 CEP63 51831 1926 chr3 13469224 13471334 13469877 N NA NUP210 NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUP210 7415 1927 chr3 13492443 13495206 13493429 Y NA NUP210 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUP210 30634 1928 chr3 138552138 138555277 138553816 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 73937 1929 chr3 138633421 138635510 138634668 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 155220 1930 chr3 139554347 139559490 139556432 N NA NA TRIM42 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 445825 1931 chr3 140561202 140566063 140562288,140565000 N,N NA;NA NA SPSB4,CLSTN2 IMR90,Erythroid progenitor Hi-C,3C 24141950,19696202 SLC25A36 94599 1932 chr3 142924530 142929844 142926218 N NA NA SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 CHST2 85912 1933 chr3 142936254 142938507 142937231 N NA NA SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 CHST2 97636 1934 chr3 14359786 14363505 14361300 N NA NA SLC6A6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 80601 1935 chr3 14376155 14379275 14378262 N NA NA SLC6A6,LSM3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 64831 1936 chr3 14392243 14395368 14393744 N NA SLC6A6 SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 48738 1937 chr3 14429471 14431635 14430586 N NA SLC6A6 SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 SLC6A6 12471 1938 chr3 150100756 150103977 150103156 N NA TSC22D2 PFN2,RNF13,TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 22811 1939 chr3 151912918 151925487 151917223,151922320 Y,Y NA;AADACL2 NA MBNL1,LOC401093 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBNL1 60342 1940 chr3 152303 154935 153140 N NA NA NA NA NA NA TRNT1 3013665 1941 chr3 153339052 153341136 153340014 N NA NA NA NA NA NA RAP2B 459023 1942 chr3 153473969 153481919 153480461 N NA NA NA NA NA NA DHX36 560367 1943 chr3 15385998 15389052 15387099 N NA SH3BP5 SH3BP5,COL6A4P1,CAPN7,LOC100505696,COLQ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3BP5 3097 1944 chr3 15401940 15403870 15403318 N NA SH3BP5 CAPN7,COL6A4P1,LOC100505696,SH3BP5 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP5 19039 1945 chr3 154578204 154582624 154580816 N NA NA NA NA NA NA MME 214812 1946 chr3 154960653 154964906 154963158 N NA NA MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 163217 1947 chr3 156883827 156906969 156886022,156892924 N,N NA;NA CCNL1 VEPH1,CCNL1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCNL1 5345 1948 chr3 158670678 158674413 158672452 N NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MFSD1 150963 1949 chr3 158678537 158682770 158680253 N NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MFSD1 158822 1950 chr3 158708627 158709689 158709083 N NA NA NA NA NA NA MFSD1 188912 1951 chr3 158753607 158764685 158755730,158759972 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MFSD1 233892 1952 chr3 158775757 158779249 158777129 N NA NA NA NA NA NA MFSD1 256042 1953 chr3 159852624 159855422 159854071 N NA NA IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 IFT80 261898 1954 chr3 163641303 163644148 163642608 N NA NA NA NA NA NA NMD3 2702204 1955 chr3 16882303 16885761 16883986 Y RFTN1,PLCL2,PLCL2 PLCL2 TBC1D5 IMR90 Hi-C 24141950 PLCL2 40691 1956 chr3 170066153 170069796 170068698,170066647 N,N NA;NA SKIL SKIL,PHC3,PRKCI,CLDN11 IMR90 Hi-C 24141950 SKIL 5677 1957 chr3 171684308 171685985 171684885 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 71433 1958 chr3 171694747 171699243 171695926,171698413 N,N NA;NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 58175 1959 chr3 176557247 176559578 176559097 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 355470 1960 chr3 176565130 176566724 176566407 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 348324 1961 chr3 176998113 177000892 176999700 N NA NA TBL1XR1 K562 ChIA-PET 22265404 TBL1XR1 83065 1962 chr3 177037661 177042415 177038730 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 122613 1963 chr3 177067564 177071743 177069325 N NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 152516 1964 chr3 177074435 177080558 177076674,177079451 Y,Y TBL1XR1;NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 159387 1965 chr3 177314479 177316673 177315770 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 399431 1966 chr3 17790249 17791682 17791181 N NA TBC1D5 TBC1D5 MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D5 6009 1967 chr3 178182002 178184635 178183302 N NA NA NA NA NA NA ZMAT3 605021 1968 chr3 179180413 179187373 179182296,179182338,179184014 Y,Y,N NA;NA;NA GNB4 ACTL6A,GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 11042 1969 chr3 179192680 179196728 179194352 N NA GNB4 GNB4,ACTL6A IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 23309 1970 chr3 17951972 17955240 17954104 N NA NA NA NA NA NA TBC1D5 167732 1971 chr3 181203001 181206647 181205618,181204855 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DNAJC19 495439 1972 chr3 181555849 181558906 181556918 N NA NA SOX2-OT MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJC19 848287 1973 chr3 182107934 182131359 182130372 N NA NA NA NA NA NA ATP11B 379932 1974 chr3 182429753 182433602 182432080 N NA NA SOX2-OT IMR90 Hi-C 24141950 ATP11B 77689 1975 chr3 183277958 183279597 183278470 N NA KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 4459 1976 chr3 183294918 183301935 183297587 N NA KLHL6 MCF2L2,YEATS2,KLHL6,KLHL24,LAMP3,LOC100505687 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL6 21419 1977 chr3 183308194 183311211 183310232 N NA KLHL6,KLHL24 LOC100505687,KLHL6,LAMP3,MCF2L2,YEATS2 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL6 34695 1978 chr3 184472992 184475328 184474155 N NA MAGEF1 EPHB3,CHRD,CLCN2,POLR2H,VPS8 IMR90 Hi-C 24141950 MAGEF1 43156 1979 chr3 18484198 18488214 18486302 N NA SATB1 NA NA NA NA SATB1 3933 1980 chr3 18539221 18542632 18541002 N NA NA NA NA NA NA SATB1 58956 1981 chr3 186900201 186902279 186901196 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 42938 1982 chr3 186906519 186908357 186907144 N NA RPL39L LOC100131635,RTP1,MASP1,RPL39L,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 49256 1983 chr3 187615586 187622986 187618078,187621924 N,N NA;NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 152073 1984 chr3 187630122 187639138 187631413,187636521 N,N NA;NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 166609 1985 chr3 187643702 187655812 187653723,187644603,187650593 N,N,N NA;NA;NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 180189 1986 chr3 187657371 187666517 187663832,187660787 N,N NA;NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 193858 1987 chr3 187677047 187702374 187687231,187681329,187690897,187697041,187700145 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 169289 1988 chr3 187714913 187720351 187717911 N NA NA BCL6,LPP,LOC100131635,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 151312 1989 chr3 187748216 187750301 187749419 N NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 121362 1990 chr3 187753723 187755647 187754483 Y NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 116016 1991 chr3 187800894 187805551 187803948 N NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 66112 1992 chr3 187825195 187829232 187826844 N NA LPP,LPP-AS2 LPP,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 42431 1993 chr3 187839660 187842824 187841130 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 28839 1994 chr3 188740357 188746625 188741043 N NA NA LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP-AS2 868481 1995 chr3 191676149 191678348 191676946 N NA NA NA NA NA NA CCDC50 629275 1996 chr3 193786686 193790478 193788653 N NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 63453 1997 chr3 193800151 193803240 193801846 N NA NA HES1,LOC647323,LOC100131551 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 50691 1998 chr3 193819480 193823979 193822318 Y NA HES1 HES1,LOC647323 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 29952 1999 chr3 195640472 195642811 195642044 N NA TNK2 TNK2,MUC20,MIR570,SDHAP2,MUC4 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNK2 4592 2000 chr3 195822555 195824004 195823631,195823850 N,N NA;NA TFRC LOC401109,TFRC,PCYT1A,LRRC33 IMR90 Hi-C 24141950 TFRC 13523 2001 chr3 196254383 196256998 196255825 Y NA RNF168,WDR53,FBXO45 UBXN7,MUC20,TFRC,LOC401109,OSTalpha,ZDHHC19,PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19-TCTEX1D2,RNF168,C3orf43,WDR53,CEP19,PAK2,FBXO45 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 23744 2002 chr3 196357974 196361952 196359369 N NA NA FBXO45,SENP5,C3orf43,PAK2,LRRC33,CEP19 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO45 62249 2003 chr3 23112651 23114140 23113193 N NA NA NA NA NA NA UBE2E2 130644 2004 chr3 23202666 23205939 23204170 N NA UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 38845 2005 chr3 23656455 23659203 23657727 N NA NA UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 188181 2006 chr3 23662055 23665213 23663184 N NA NA UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 182171 2007 chr3 23689754 23692989 23692403 N NA NA UBE2E2,NKIRAS1,UBE2E1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 154395 2008 chr3 23698999 23707171 23700929 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1,RPL15,NKIRAS1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 140213 2009 chr3 23764262 23767069 23766088 N NA NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 80315 2010 chr3 23800872 23805093 23802157,23802265,23803876 N,N,N NA;NA;NA UBE2E1 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 42291 2011 chr3 27122565 27124707 27123556 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 373538 2012 chr3 27137469 27140494 27138905 N NA NA NA NA NA NA SLC4A7 357751 2013 chr3 27517806 27527545 27525312 N NA SLC4A7 NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 19561 2014 chr3 31266261 31270821 31268365 N NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 303670 2015 chr3 31503169 31505006 31503660 N NA NA NA NA NA NA STT3B 69485 2016 chr3 31562518 31564340 31563750 N NA STT3B GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 10151 2017 chr3 32067241 32070216 32068223 N NA ZNF860,OSBPL10 OSBPL10,STT3B,GPD1L IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL10 43899 2018 chr3 39247611 39250254 39249331 N NA NA NA NA NA NA CSRNP1 52509 2019 chr3 39273038 39276249 39274597 N NA NA NA NA NA NA CSRNP1 77936 2020 chr3 40754465 40757772 40756112 N NA NA NA NA NA NA ZNF621 188089 2021 chr3 40970259 40972848 40971720 N NA NA NA NA NA NA CTNNB1 268094 2022 chr3 41010277 41015197 41013486,41011049 N,N NA;NA NA ULK4,CTNNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNB1 225745 2023 chr3 41158371 41160184 41159059 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 80758 2024 chr3 41176599 41178816 41177607 N NA NA ULK4,CTNNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNB1 62126 2025 chr3 42037657 42057411 42055245 N NA NA TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 75335 2026 chr3 42097687 42100273 42099092 N NA TRAK1 ZNF621,ZNF620,TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 32473 2027 chr3 42343192 42345595 42344970 N NA NA NA NA NA NA TRAK1 210446 2028 chr3 43832831 43835299 43834501 N NA NA MIR138-1 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD5 100456 2029 chr3 43933122 43937235 43935919,43935110 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ABHD5 200747 2030 chr3 44037258 44047197 44040731 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD5 304883 2031 chr3 44550861 44554423 44552190 N NA ZNF445 ZNF445 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF445 31699 2032 chr3 44725899 44727858 44727014 N NA ZNF35 ZNF197,ZNF35,ZNF502,ZNF167 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF35 35666 2033 chr3 46136042 46141430 46137071,46139864 Y,Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1;CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 98726 2034 chr3 49480803 49482582 49481648 N NA RHOA,TCTA,NICN1 NICN1,RHOA,TCTA IMR90 Hi-C 24141950 NICN1 14046 2035 chr3 51555267 51557028 51555773 N NA VPRBP,RAD54L2 RAD54L2,TEX264 IMR90 Hi-C 24141950 RAD54L2 18568 2036 chr3 5301331 5304179 5303140 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 71972 2037 chr3 55305489 55307149 55306260 N NA NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 214521 2038 chr3 55369436 55372392 55371135 N NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 149278 2039 chr3 5540284 5542893 5541138 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 310925 2040 chr3 58459850 58461790 58460727 N NA PDHB,KCTD6 NA NA NA NA KCTD6 16033 2041 chr3 58655381 58657716 58656709 N NA NA NA NA NA NA KCTD6 177558 2042 chr3 58689525 58692546 58691059 N NA NA NA NA NA NA KCTD6 211702 2043 chr3 59247233 59249186 59248116 N NA NA NA NA NA NA KCTD6 769410 2044 chr3 6290622 6294041 6291608 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1061263 2045 chr3 62939446 62941471 62940395 N NA NA NA NA NA NA CADPS 78382 2046 chr3 63165311 63166997 63166064 N NA NA NA NA NA NA CADPS 304247 2047 chr3 6323684 6326709 6325647 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1094325 2048 chr3 64024762 64026115 64025508 N NA LOC100507062,PSMD6 LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 15642 2049 chr3 67021696 67023455 67022751 N NA KBTBD8 FAM19A4 IMR90 Hi-C 24141950 KBTBD8 25272 2050 chr3 67039143 67041758 67040706 N NA KBTBD8 KBTBD8 MCF7 ChIA-PET 22265404 KBTBD8 6969 2051 chr3 67096851 67098905 67098612 N NA KBTBD8 NA NA NA NA KBTBD8 48124 2052 chr3 67124638 67126958 67125831 N NA NA FAM19A4 IMR90 Hi-C 24141950 KBTBD8 75911 2053 chr3 6720844 6722479 6721710 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1491485 2054 chr3 70549732 70551901 70550964 N NA NA NA NA NA NA FOXP1 802010 2055 chr3 70560679 70563875 70562867 N NA NA NA NA NA NA FOXP1 790036 2056 chr3 70564770 70568178 70566105 N NA NA NA NA NA NA FOXP1 785733 2057 chr3 72032390 72037714 72034694,72037344 N,N NA;NA NA SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 399250 2058 chr3 72123947 72129903 72126837,72128307 N,N NA;NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 365871 2059 chr3 72135977 72152458 72144935,72149711 N,N NA;NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 343316 2060 chr3 72359162 72360631 72359889 Y RYBP NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 135143 2061 chr3 73159592 73161158 73159883 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 113473 2062 chr3 73876302 73877479 73876807 N NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R2 830183 2063 chr3 8700897 8708938 8707518,8702543 N,N NA;NA NA C3orf32,RAD18,CAV3,SRGAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RAD18 296221 2064 chr3 88481865 88484835 88482983 N NA NA NA NA NA NA CGGBP1 282849 2065 chr3 90159538 90161854 90160034 N NA NA NA NA NA NA CGGBP1 1960522 2066 chr3 97540461 97541988 97540825 N NA NA GABRR3,CPOX IMR90 Hi-C 24141950 ARL6 56866 2067 chr3 98730732 98733045 98731208 N NA NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL6 279160 2068 chr4 101466244 101468953 101467382 N NA NA NA NA NA NA LOC256880 594608 2069 chr4 10372805 10374187 10373607 N NA NA NA NA NA NA WDR1 254232 2070 chr4 10689003 10692150 10691141 N NA NA NA NA NA NA WDR1 570430 2071 chr4 10733371 10737187 10735611 N NA NA NA NA NA NA WDR1 614798 2072 chr4 10773419 10776657 10774716 N NA NA NA NA NA NA WDR1 654846 2073 chr4 10984035 10986334 10985031 N NA NA NA NA NA NA WDR1 865462 2074 chr4 110303985 110306780 110305203 N NA SEC24B,1/2-SBSRNA4 AGXT2L1,COL25A1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 48191 2075 chr4 110309109 110313372 110310932,110312692 N,N NA;NA SEC24B,1/2-SBSRNA4 COL25A1,OSTC,AGXT2L1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 41599 2076 chr4 11099481 11103911 11101028 N NA NA NA NA NA NA WDR1 980908 2077 chr4 111625497 111626931 111626468 N NA NA NA NA NA NA ELOVL6 505677 2078 chr4 1129096 1130420 1130013 Y NA SPON2 RNF212,TMED11P,KIAA1530,SPON2,CTBP1,C4orf42,MAEA,FAM53A,SLBP IMR90 Hi-C 24141950 SPON2 36579 2079 chr4 113047900 113050544 113049334 N NA C4orf32 C4orf32 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C4orf32 16009 2080 chr4 11339573 11342719 11341002 N NA NA NA NA NA NA WDR1 1221000 2081 chr4 119511396 119514040 119512793 N NA NA NA NA NA NA METTL14 92534 2082 chr4 121051223 121054879 121052301,121053152 N,N NA;NA NA NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 63210 2083 chr4 123071205 123074826 123073823 N NA KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 16932 2084 chr4 124363807 124366477 124365374 N NA NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA5 519582 2085 chr4 126906626 126909067 126907319 N NA NA NA NA NA NA PLK4 1892949 2086 chr4 12734633 12738245 12736435 N NA NA LOC285547 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 747744 2087 chr4 133186740 133189154 133188306 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 3171911 2088 chr4 134545358 134547685 134546084 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 4530529 2089 chr4 135297419 135300912 135300004 N NA NA NA NA NA NA SLC7A11 3862591 2090 chr4 135306042 135316907 135309031,135311748 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC7A11 3846596 2091 chr4 140096838 140100615 140098475 N NA ELF2 ELF2,NAA15,C4orf49 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 36232 2092 chr4 140134669 140136608 140135462 N NA NA NAA15,ELF2,C4orf49,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 C4orf49 64884 2093 chr4 141154575 141156800 141155589 N NA NA MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELMOD2 288512 2094 chr4 141158432 141160865 141159258 N NA NA MAML3,MGST2,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELMOD2 284447 2095 chr4 141163780 141165811 141164741 N NA NA MAML3,SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELMOD2 279501 2096 chr4 141727925 141731170 141729053 N NA NA TBC1D9,RNF150 IMR90 Hi-C 24141950 ELMOD2 282613 2097 chr4 146107189 146109234 146108096 N NA OTUD4 OTUD4,MMAA MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OTUD4 6357 2098 chr4 146967628 146984537 146976060,146980517,146983505 N,N,N NA;NA;NA NA TTC29,MMAA,LSM6 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF827 108021 2099 chr4 149754113 149757861 149756225 N NA NA NA NA NA NA NR3C2 390441 2100 chr4 149887950 149889569 149889069 N NA NA NA NA NA NA NR3C2 524278 2101 chr4 149900452 149907331 149904316 N NA NA NA NA NA NA NR3C2 536780 2102 chr4 150960363 150962371 150961120 N NA NA DCLK2 IMR90 Hi-C 24141950 LRBA 974278 2103 chr4 152999763 153002085 153001263 N NA NA FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 301579 2104 chr4 153021371 153024388 153021971 N NA NA FBXW7,SH3D19,RPS3A,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 279276 2105 chr4 15754218 15759268 15758187 Y FBXL5,TAPT1,CD38 CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 20663 2106 chr4 15765963 15769468 15768022 N NA CD38 CD38,FGFBP2,BST1 IMR90 Hi-C 24141950 CD38 10463 2107 chr4 1580813 1582416 1581794 N NA NA RNF212,TMED11P,KIAA1530,FAM53A,SLBP,CTBP1,C4orf42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLBP 131614 2108 chr4 15906642 15909340 15907902 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 NA CC2D2A,FGFBP1,BST1 IMR90 Hi-C 24141950 CD38 126711 2109 chr4 160021326 160023719 160022754 N NA NA FNIP2,C4orf45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAPGEF2 165279 2110 chr4 160070093 160103889 160090361,160071990,160080870,160099719 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA FNIP2,C4orf45,ETFDH,PPID,RAPGEF2,C4orf46 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 85109 2111 chr4 160107145 160115153 160109932 N NA NA FNIP2,C4orf45,PPID,ETFDH IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 73845 2112 chr4 16120330 16123668 16122609 N NA NA PROM1,FLJ39653 IMR90 Hi-C 24141950 TAPT1 104493 2113 chr4 171615690 171629588 171620581,171628141,171617779 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA CLCN3 1074018 2114 chr4 171649868 171668164 171650885 N NA NA NA NA NA NA CLCN3 1108196 2115 chr4 171696314 171703517 171697795 N NA NA NA NA NA NA CLCN3 1154642 2116 chr4 17309538 17312297 17311273 N NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 QDPR 201560 2117 chr4 175790106 175797510 175795974 N NA NA NA NA NA NA FBXO8 584704 2118 chr4 176307203 176309149 176308636 N NA NA NA NA NA NA GPM6A 614499 2119 chr4 176934007 176936636 176935527 N NA GPM6A NA NA NA NA GPM6A 10359 2120 chr4 181593045 181598674 181594988 N NA NA NA NA NA NA DCTD 2239956 2121 chr4 181652464 181658148 181656340,181654238 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DCTD 2180482 2122 chr4 181687252 181689041 181688321 N NA NA NA NA NA NA DCTD 2149589 2123 chr4 183889582 183891479 183890708 N NA NA WWC2,FAM92A3 IMR90 Hi-C 24141950 DCTD 50952 2124 chr4 184327800 184328772 184328464 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 37017 2125 chr4 185185928 185190718 185187186,185189284 Y,Y IRF2,CASP3;IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728175 84412 2126 chr4 185202131 185206227 185204415,185205810 Y,N CASP3;NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728175 68903 2127 chr4 185207939 185211071 185209220 N NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728175 64059 2128 chr4 185231179 185236498 185235538 Y NA LOC728175 IRF2,LOC728175 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728175 38632 2129 chr4 185455656 185459931 185458726 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 59930 2130 chr4 187833887 187837128 187834672 N NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 721213 2131 chr4 187863216 187865228 187864330 N NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 750542 2132 chr4 23992023 23994438 23993112 N NA NA NA NA NA NA DHX15 591746 2133 chr4 25534393 25540059 25538258 N NA NA NA NA NA NA ANAPC4 155545 2134 chr4 25551896 25557251 25554509 N NA NA SLC34A2 IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC4 173048 2135 chr4 25873407 25888881 25876567,25881178,25886182 N,N,N NA;NA;NA SEL1L3,C4orf52 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 8797 2136 chr4 26142395 26144997 26143806 N NA NA RBPJ,TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 176335 2137 chr4 26788320 26798390 26789720 N NA NA NA NA NA NA STIM2 63923 2138 chr4 26826936 26835076 26832283,26828691 N,N NA;NA STIM2 STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 STIM2 27237 2139 chr4 26837554 26846165 26839741,26842419 N,N NA;NA STIM2 NA NA NA NA STIM2 16148 2140 chr4 27144 30650 29148,27258 N,N NA;NA ZNF718 ZNF718 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF718 22627 2141 chr4 2787398 2790369 2788497 N NA TNIP2,SH3BP2 SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SH3BP2 4381 2142 chr4 29085136 29087420 29086475 N NA NA NA NA NA NA STIM2 2222823 2143 chr4 299372 302074 300478 N NA ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 29522 2144 chr4 304781 306297 305469 N NA ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 25299 2145 chr4 3303532 3308575 3304612 N NA NA RGS12,HTT,HGFAC IMR90 Hi-C 24141950 LRPAP1 225649 2146 chr4 33744818 33750441 33749593 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 2495538 2147 chr4 35475 45691 37233,40288,42843 N,N,N NA;NA;NA ZNF718 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF718 7586 2148 chr4 36427974 36430817 36429302 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 181995 2149 chr4 37749558 37752367 37751030 N NA NA FLJ13197,KLF3,RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 RELL1 61559 2150 chr4 37758642 37760729 37759867 Y RELL1,TBC1D1 NA RELL1 IMR90 Hi-C 24141950 PGM2 67553 2151 chr4 38319518 38322209 38320840 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D1 426813 2152 chr4 3834481 3838203 3836246 N NA NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 FAM86EP 118945 2153 chr4 39166175 39170219 39168444 N NA WDR19 RFC1,KLHL5,WDR19,KLB IMR90 Hi-C 24141950 WDR19 13805 2154 chr4 40182245 40194697 40182929,40185679,40187801,40193573 N,Y,N,N NA;RBM47;NA;NA RHOH RHOH IMR90 Hi-C 24141950 RHOH 3830 2155 chr4 40304585 40312575 40307479,40309981,40311653 N,N,N NA;NA;NA NA N4BP2,LOC344967,RHOH,RBM47,NSUN7,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOH 106058 2156 chr4 40318344 40320182 40319355 N NA NA N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOH 119817 2157 chr4 42672474 42675438 42673716 N NA ATP8A1 NA NA NA NA ATP8A1 13352 2158 chr4 43560992 43563009 43562249 N NA NA NA NA NA NA ATP8A1 901870 2159 chr4 43608273 43611244 43609940 N NA NA NA NA NA NA ATP8A1 949151 2160 chr4 43911277 43913999 43912527 N NA NA NA NA NA NA GUF1 766434 2161 chr4 4944164 4947167 4945908 N NA NA STX18,STK32B,LOC100507266 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507266 400306 2162 chr4 53130259 53137433 53131099,53132544,53134099,53136634 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA USP46 388069 2163 chr4 53234499 53238704 53235075,53236946 N,N NA;NA NA SCFD2,USP46,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 USP46 286798 2164 chr4 54568053 54569643 54568783 N NA NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21P44 283806 2165 chr4 55382287 55384958 55383784 N NA NA SRD5A3 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 451472 2166 chr4 55391271 55393597 55392330 N NA NA NA NA NA NA CHIC2 460456 2167 chr4 55412013 55415293 55413954 N NA NA NA NA NA NA CHIC2 481198 2168 chr4 56540824 56542427 56541921 N NA NMU LOC644145,KDR,PDCL2 IMR90 Hi-C 24141950 NMU 38359 2169 chr4 57552257 57554162 57553112 N NA HOPX SRP72,SPINK2,THEGL,HOPX IMR90 Hi-C 24141950 HOPX 4385 2170 chr4 57622001 57626320 57624235,57625526 N,N NA;NA NA PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 SPINK2 61573 2171 chr4 60418293 60421112 60419334 N NA NA NA NA NA NA POLR2B 2573184 2172 chr4 63267288 63268865 63268090 Y NA NA NA NA NA NA CENPC1 5142391 2173 chr4 63413276 63415573 63413999 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 4995683 2174 chr4 70206947 70209847 70208813 N NA NA NA NA NA NA YTHDC1 991123 2175 chr4 71539999 71551599 71544882,71549023 N,N NA;NA IGJ,UTP3,RUFY3 NA NA NA NA UTP3 2597 2176 chr4 71578546 71582021 71579593 N NA IGJ,UTP3,RUFY3 RUFY3 K562 ChIA-PET 22265404 RUFY3 5675 2177 chr4 73711358 73712957 73712345 N NA NA NA NA NA NA COX18 222515 2178 chr4 74520010 74521524 74520773 N NA RASSF6 CXCL5,RASSF6,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 33670 2179 chr4 76024331 76025610 76024748 N NA NA NA NA NA NA RCHY1 414030 2180 chr4 76105410 76107437 76106734 Y NA NA NA NA NA NA RCHY1 332203 2181 chr4 78047012 78049277 78048517 N NA CCNI,CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 29080 2182 chr4 78066812 78069166 78067559 N NA CCNG2 CCNI MCF7 ChIA-PET 22265404 CCNG2 9191 2183 chr4 78114140 78116477 78114774 N NA CCNG2 CCNI,CCNG2,SHROOM3 IMR90 Hi-C 24141950 CCNG2 35783 2184 chr4 79625795 79629884 79628560,79626217 Y,N NA;NA NA LOC100505702,BMP2K IMR90 Hi-C 24141950 BMP2K 67648 2185 chr4 79670220 79672857 79670925 N NA BMP2K LOC100505702,FRAS1,ANXA3,BMP2K IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP2K 24675 2186 chr4 79686410 79689378 79687333 N NA BMP2K LOC100505702,BMP2K IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP2K 8154 2187 chr4 81908266 81915225 81913022 N NA BMP3 C4orf22 IMR90 Hi-C 24141950 BMP3 36894 2188 chr4 82482016 82484895 82483539 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B 88955 2189 chr4 82525669 82529288 82528292 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B 132608 2190 chr4 82556031 82557917 82557055 N NA NA NA NA NA NA RASGEF1B 162970 2191 chr4 82568695 82573167 82570259,82572400 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RASGEF1B 175634 2192 chr4 82832772 82835688 82834669 N NA NA NA NA NA NA RASGEF1B 439711 2193 chr4 82842337 82843959 82843109 N NA NA NA NA NA NA RASGEF1B 449276 2194 chr4 82885644 82888395 82887250 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 406754 2195 chr4 82896804 82898472 82897538 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 396677 2196 chr4 82902929 82905561 82904456 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 389588 2197 chr4 83144107 83145966 83145086 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 149183 2198 chr4 83192150 83194582 83193389 N NA NA NA NA NA NA HNRNPD 100567 2199 chr4 84090997 84097411 84092115,84096358 N,N NA;NA NA PLAC8,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 55086 2200 chr4 84117944 84120242 84119315 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,PLAC8 NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 82033 2201 chr4 84131750 84144716 84133951,84139155,84140146,84142970 N,Y,N,N NA;THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8;NA;NA NA COPS4,COQ2,PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 61351 2202 chr4 84160285 84163228 84161860 N NA COQ2 NA NA NA NA COQ2 42839 2203 chr4 84287152 84291319 84287450 N NA HPSE NA NA NA NA HPSE 30846 2204 chr4 86370019 86370997 86370335 N NA ARHGAP24 NA NA NA NA ARHGAP24 25287 2205 chr4 89239410 89242663 89242024 N NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 33522 2206 chr4 9015614 9018348 9016906 N NA NA NA NA NA NA METTL19 573082 2207 chr4 90237048 90239273 90238200 N NA GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 7887 2208 chr4 90245387 90246490 90245967 N NA GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 16226 2209 chr4 9153574 9157349 9154895 Y NA NA NA NA NA NA METTL19 711042 2210 chr4 94903466 94905965 94904420 N NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 222794 2211 chr5 100115106 100117652 100115947 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 121335 2212 chr5 102090456 102092948 102091425 N NA NA NA NA NA NA GIN1 362894 2213 chr5 103787301 103790259 103788520 N NA NA NA NA NA NA C5orf30 1192859 2214 chr5 10545668 10548241 10546650 N NA ANKRD33B MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33B 16194 2215 chr5 10556404 10558076 10557045 N NA ANKRD33B ANKRD33B,ROPN1L,MARCH6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD33B 6359 2216 chr5 109255917 109259204 109257655 Y MAN2A1 NA TMEM232 IMR90 Hi-C 24141950 MAN2A1 230761 2217 chr5 109280655 109282729 109281401 N NA NA NA NA NA NA MAN2A1 255499 2218 chr5 111857200 111877177 111859660 N NA NA NA NA NA NA APC 166025 2219 chr5 116246009 116248225 116246999 N NA NA NA NA NA NA COMMD10 825282 2220 chr5 118365443 118369777 118368180 N NA DMXL1 TNFAIP8,DMXL1 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL1 37307 2221 chr5 120443924 120445452 120444650 N NA NA NA NA NA NA SRFBP1 852204 2222 chr5 121621663 121624372 121622765 N NA NA SNCAIP IMR90 Hi-C 24141950 SRFBP1 324007 2223 chr5 121631876 121639466 121634141,121636245 N,N NA;NA NA SNCAIP IMR90 Hi-C 24141950 SRFBP1 334220 2224 chr5 122036180 122039185 122037686 N NA NA NA NA NA NA SNX2 71565 2225 chr5 123390913 123393261 123392733 N NA NA NA NA NA NA CEP120 631627 2226 chr5 123754383 123757347 123756446 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 323458 2227 chr5 123773766 123776943 123775213 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 303862 2228 chr5 123787752 123791199 123789595,123791079 N,N NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 289606 2229 chr5 123918561 123920390 123919806 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 160415 2230 chr5 124160202 124162704 124161273 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 79397 2231 chr5 124182723 124185197 124184721 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 101918 2232 chr5 124237309 124239287 124238059 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 156504 2233 chr5 124254707 124259802 124256405,124258977 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF608 173902 2234 chr5 124286302 124291211 124288361 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 205497 2235 chr5 124295243 124297136 124296192 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 214438 2236 chr5 124314579 124323681 124316516 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 233774 2237 chr5 124335902 124343996 124337170,124342216,124341555 N,N,N NA;NA;NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 255097 2238 chr5 124535958 124537326 124536387 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 455153 2239 chr5 124628085 124629823 124628871 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 547280 2240 chr5 126015249 126017082 126016090 Y LMNB1,LMNB1 NA LMNB1,MEGF10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHAX 78642 2241 chr5 126093681 126094891 126094298 Y LMNB1,LMNB1 LMNB1 LMNB1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNB1 17424 2242 chr5 128680215 128682080 128681221 N NA NA NA NA NA NA ISOC1 249773 2243 chr5 130587203 130594734 130588690 N NA CDC42SE2 CDC42SE2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42SE2 4968 2244 chr5 132367949 132370051 132368962 Y AFF4,ZCCHC10 ZCCHC10,HSPA4 ZCCHC10,HSPA4,AFF4 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC10 5709 2245 chr5 133129887 133131840 133130776 N NA NA FSTL4 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf15 172566 2246 chr5 133434179 133438120 133435993,133437775 Y,N PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7;NA TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 12282 2247 chr5 133781070 133783749 133782203 N NA CDKN2AIPNL PHF15,SKP1,UBE2B,CDKN2AIPNL,PPP2CA,MIR3661,SEC24A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 33472 2248 chr5 133800456 133805103 133801611 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 52858 2249 chr5 134383106 134391200 134384792,134389226,134390493 N,N,N NA;NA;NA PITX1 TXNDC15,PCBD2,CATSPER3,LOC340073,H2AFY,PITX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 13142 2250 chr5 134475683 134478068 134476854 N NA NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 105719 2251 chr5 1366576 1367861 1367149 N NA CLPTM1L NA NA NA NA CLPTM1L 21574 2252 chr5 138896529 138899554 138897687 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 41197 2253 chr5 138922051 138923953 138923177 N NA UBE2D2 SPATA24,DNAJC18,ECSCR,TMEM173,UBE2D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2D2 16798 2254 chr5 139084174 139086680 139085718 N NA NA UBE2D2 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 55873 2255 chr5 139090519 139091638 139091136 N NA NA CXXC5,UBE2D2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CXXC5 62218 2256 chr5 139124338 139128688 139124575,139126515 N,N NA;NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 96037 2257 chr5 139485490 139489305 139487344 N NA PURA,IGIP NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 4403 2258 chr5 141070874 141073869 141072226 N NA FCHSD1 ARAP3,PCDH1,LOC729080,KIAA0141,PCDH12,RNF14,GNPDA1,NDFIP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FCHSD1 39888 2259 chr5 141116113 141118254 141117191 N NA NA PCDH12,KIAA0141,ARAP3,PCDH1,LOC729080,RNF14,GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD1 85127 2260 chr5 141295150 141297510 141296065 N NA KIAA0141,RNF14 NA NA NA NA KIAA0141 5875 2261 chr5 141403735 141405212 141404681 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 11115 2262 chr5 142962468 142963538 142962940 Y NR3C1,NR3C1 NA HMHB1,NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 147391 2263 chr5 142970730 142973451 142972421 N NA NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 155653 2264 chr5 148186848 148190117 148188828 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 16039 2265 chr5 149840139 149842657 149840825 N NA CD74,RPS14,NDST1 NDST1,SYNPO,RBM22,DCTN4,CAMK2A,ARSI,TCOF1,RPS14,CD74,MYOZ3,C5orf62 IMR90 Hi-C 24141950 RPS14 10820 2266 chr5 149859529 149872815 149866805,149869520 N,N NA;NA RPS14,NDST1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,NDST1,RBM22,TCOF1,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDST1 14859 2267 chr5 150611890 150615571 150613912 N NA CCDC69,GM2A ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC69 8236 2268 chr5 150619013 150619970 150619044 N NA CCDC69,GM2A ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 GM2A 12643 2269 chr5 153480654 153483754 153482429 N NA NA MFAP3,GALNT10 IMR90 Hi-C 24141950 MFAP3 62135 2270 chr5 153496570 153499096 153498056 N NA NA GALNT10,FLJ38109,MFAP3 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT10 71199 2271 chr5 1535432 1540780 1536579 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 LPCAT1,SLC6A3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LPCAT1 11356 2272 chr5 154058432 154066160 154062730 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 26302 2273 chr5 155447763 155449435 155448687 N NA NA SGCD IMR90 Hi-C 24141950 TIMD4 940831 2274 chr5 156251323 156254546 156253691 N NA NA NA NA NA NA TIMD4 135720 2275 chr5 156257662 156263153 156261897 N NA NA NA NA NA NA TIMD4 127113 2276 chr5 156305184 156312602 156306749,156310012 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TIMD4 77664 2277 chr5 156314631 156320557 156317186,156319909 N,N NA;NA NA KIF4B IMR90 Hi-C 24141950 TIMD4 69709 2278 chr5 156399405 156414716 156406005,156408862,156401248 N,N,N NA;NA;NA TIMD4 NA NA NA NA TIMD4 9139 2279 chr5 157021562 157025289 157023617 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 18779 2280 chr5 157029612 157030913 157030095 N NA ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 26829 2281 chr5 157601329 157608370 157603609,157607030 N,N NA;NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 315146 2282 chr5 157619698 157625746 157621666,157625604 Y,N NA;NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 333515 2283 chr5 157660356 157665730 157661163 N NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 374173 2284 chr5 157691354 157693801 157692751 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 405171 2285 chr5 157708464 157713414 157710232 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 422281 2286 chr5 157806875 157810149 157808426 N NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 520692 2287 chr5 157835434 157837302 157836375 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 549251 2288 chr5 157846775 157851379 157848560 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 560592 2289 chr5 157852726 157865860 157857112,157863030 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CLINT1 566543 2290 chr5 157892221 157894515 157893371 N NA NA NA NA NA NA CLINT1 606038 2291 chr5 157937631 157940435 157939417 N NA NA NA NA NA NA EBF1 586353 2292 chr5 157985606 157989413 157987434 N NA NA NA NA NA NA EBF1 537375 2293 chr5 158841401 158843284 158841822 N NA NA IL12B,LOC285627,ADRA1B IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 151312 2294 chr5 16002751 16006671 16005229 N NA NA FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF622 459223 2295 chr5 160562764 160567810 160564638,160566389 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GABRB2 407320 2296 chr5 16191451 16194329 16192579 N NA NA NA NA NA NA ZNF622 271565 2297 chr5 16253792 16256127 16255403 N NA NA NA NA NA NA ZNF622 209767 2298 chr5 163341597 163344582 163342807 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 411366 2299 chr5 163545946 163547772 163547004 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 615715 2300 chr5 1651984 1658363 1653439 N NA LOC728613 SLC12A7 IMR90 Hi-C 24141950 LOC728613 17864 2301 chr5 165551162 165559733 165555261 N NA NA NA NA NA NA RARS 2353730 2302 chr5 165560929 165563812 165563039 N NA NA NA NA NA NA RARS 2349651 2303 chr5 165842231 165846041 165844363 N NA NA NA NA NA NA RARS 2067422 2304 chr5 165851871 165860329 165853943,165855601,165858692 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA RARS 2053134 2305 chr5 169754082 169755309 169754707 N NA LOC257358 KCNIP1,LCP2,LOC257358 IMR90 Hi-C 24141950 LOC257358 3126 2306 chr5 172232499 172235480 172234343 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 25743 2307 chr5 173050824 173054025 173053013 N NA BOD1 CPEB4,C5orf47,HMP19 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 7158 2308 chr5 173109466 173142026 173117144,173125449,173141570,173134497 N,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA CPEB4,C5orf47,HMP19,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 65800 2309 chr5 173153266 173174229 173168290,173172879,173161160,173164321 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 109600 2310 chr5 17316064 17319307 17317827 N NA NA BASP1,LOC285696,LOC401177 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BASP1 98314 2311 chr5 173246388 173260247 173257161,173248303,173249838,173251264 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA BOD1,CPEB4,C5orf47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 55084 2312 chr5 173310876 173312881 173311846 N NA CPEB4 BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 2450 2313 chr5 173699065 173701525 173700556 N NA NA NA NA NA NA CPEB4 383734 2314 chr5 174587538 174590894 174589207 N NA NA DRD1,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 314620 2315 chr5 174632950 174634642 174633914 N NA NA FLJ16171,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 270872 2316 chr5 174707171 174710517 174709593 N NA NA FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 194997 2317 chr5 174742427 174744402 174743531 N NA NA FLJ16171,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 161112 2318 chr5 174748585 174751050 174749615 N NA NA FLJ16171,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 154464 2319 chr5 174762583 174769504 174764383,174768147,174763640 N,N,N NA;NA;NA NA FLJ16171,DRD1,SFXN1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 136010 2320 chr5 174786363 174794227 174788829,174791346,174793024 N,N,N NA;NA;NA NA FLJ16171,SFXN1,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 111287 2321 chr5 174878605 174885342 174879746,174883002 N,N NA;NA SFXN1 FLJ16171,DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 20172 2322 chr5 174888993 174894352 174891794,174894149 N,N NA;NA SFXN1 FLJ16171,DRD1,SFXN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SFXN1 11162 2323 chr5 1762113 1767075 1765461 N NA MRPL36,NDUFS6 NDUFS6,IRX4 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL36 32881 2324 chr5 176549393 176552654 176551387 N NA NSD1 ZNF346,NSD1,PRELID1,RAB24 IMR90 Hi-C 24141950 NSD1 7426 2325 chr5 179119181 179121300 179120192 N NA CBY3,CANX,MAML1 C5orf60,CBY3,CANX IMR90 Hi-C 24141950 CANX 4630 2326 chr5 18740557 18747155 18745608 N NA NA NA NA NA NA BASP1 1522807 2327 chr5 19263151 19270089 19267056 N NA NA NA NA NA NA BASP1 2045401 2328 chr5 27432375 27434575 27434014 N NA LOC643401 NA NA NA NA LOC643401 37824 2329 chr5 31661 43198 33164 N NA NA LRRC14B,SDHA,PLEKHG4B,CCDC127 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC14B 148428 2330 chr5 32530407 32537929 32532156 N NA SUB1 SUB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUB1 47676 2331 chr5 3364021 3368573 3366452 N NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1562525 2332 chr5 3374941 3378754 3376043 N NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1573445 2333 chr5 34243532 34245575 34244690 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 118899 2334 chr5 36441388 36443466 36442473 N NA NA NA NA NA NA NADKD1 199130 2335 chr5 36717120 36726200 36724700 N NA NA SLC1A3,NIPBL,LOC646719 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC646719 150596 2336 chr5 36744122 36745799 36745088 N NA NA LOC646719,NIPBL MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC646719 130997 2337 chr5 37775734 37779862 37777008,37777896 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA WDR70 396322 2338 chr5 37846487 37850142 37848116 N NA NA NA NA NA NA WDR70 467075 2339 chr5 37858967 37861274 37860083 N NA NA NA NA NA NA WDR70 479555 2340 chr5 41557301 41560421 41559534 N NA NA OXCT1,C7 IMR90 Hi-C 24141950 OXCT1 310370 2341 chr5 41578208 41578500 41578352 N NA NA PLCXD3,HEATR7B2 IMR90 Hi-C 24141950 OXCT1 292291 2342 chr5 43105306 43108379 43105914 Y NA LOC100132356,ZNF131 LOC153684,LOC100132356,ZNF131,LOC648987,NIM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF131 13263 2343 chr5 4625815 4628519 4627196 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 794288 2344 chr5 49740643 49743227 49741348 N NA EMB NA NA NA NA EMB 3409 2345 chr5 52495382 52497176 52496431 N NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 LOC257396 89695 2346 chr5 53735926 53736848 53736608 N NA NA CDC20B,ARL15,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 ARL15 129523 2347 chr5 53941180 53943553 53942470 N NA NA SNX18,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 ARL15 334777 2348 chr5 542198 545119 544322 Y NA NA SLC9A3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEP72 67286 2349 chr5 55708064 55712540 55711360 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K1 398360 2350 chr5 55774880 55778245 55777146 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K1 332655 2351 chr5 55883515 55886232 55884708 N NA NA MAP3K1,SETD9 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MAP3K1 224668 2352 chr5 55964146 55967516 55965990 N NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K1 143384 2353 chr5 55981007 55985127 55982723,55983627 N,N NA;NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K1 125773 2354 chr5 5755064 5757330 5756499 N NA NA NA NA NA NA KIAA0947 332257 2355 chr5 64355538 64359325 64356675 N NA NA CWC27,ADAMTS6 IMR90 Hi-C 24141950 CWC27 290783 2356 chr5 66497961 66504144 66501522 N NA CD180 MAST4,CD180,PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD180 5344 2357 chr5 66510451 66514670 66511851 Y NA CD180 MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD180 17834 2358 chr5 66517132 66519247 66517970 N NA CD180 NA NA NA NA CD180 24515 2359 chr5 69696820 69697588 69697328 N NA NA NA NA NA NA MARVELD2 985881 2360 chr5 75260213 75261137 75261091 N NA NA NA NA NA NA POC5 246900 2361 chr5 77147765 77149919 77148618 N NA NA TBCA IMR90 Hi-C 24141950 TBCA 75580 2362 chr5 78020131 78025881 78024089 Y NA NA ARSB,SCAMP1,LHFPL2 IMR90 Hi-C 24141950 LHFPL2 75483 2363 chr5 78030775 78032646 78031743 N NA NA LHFPL2,ARSB IMR90 Hi-C 24141950 LHFPL2 86127 2364 chr5 79135062 79140262 79135840 N NA NA NA NA NA NA MTX3 146826 2365 chr5 79153223 79156720 79155928 N NA NA SERINC5,CMYA5,PAPD4,THBS4,HOMER1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTX3 130368 2366 chr5 79172285 79176036 79174923 N NA NA CMYA5,THBS4 IMR90 Hi-C 24141950 MTX3 111052 2367 chr5 79178384 79188405 79179120,79182991,79186380 N,N,N NA;NA;NA NA THBS4 IMR90 Hi-C 24141950 MTX3 98683 2368 chr5 79694688 79696608 79695445 Y ZFYVE16,FAM151B ZFYVE16 THBS4,ZFYVE16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 7230 2369 chr5 81073476 81075793 81074969 Y NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 26404 2370 chr5 81145032 81149972 81147797,81146318 Y,N NA;NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 97960 2371 chr5 86315287 86316711 86315867 N NA NA NA NA NA NA RASA1 247359 2372 chr5 86415632 86417860 86416641 N NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 146210 2373 chr5 91205714 91211619 91206717 N NA NA NA NA NA NA ARRDC3 526565 2374 chr5 95168031 95172971 95170683 N NA GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 9454 2375 chr5 96150749 96154193 96152352 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 6857 2376 chr6 100159472 100161705 100160993 N NA NA NA NA NA NA CCNC 142782 2377 chr6 101458135 101460065 101459318 N NA NA NA NA NA NA ASCC3 128911 2378 chr6 105085279 105089816 105087881 N NA NA NA NA NA NA PREP 761183 2379 chr6 105092155 105095492 105093096 N NA NA NA NA NA NA PREP 755507 2380 chr6 106047961 106050545 106049615 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 196962 2381 chr6 106203970 106208129 106205896 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 326066 2382 chr6 106232615 106234030 106233521 Y PRDM1 NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 300165 2383 chr6 106240216 106241137 106240241 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 293058 2384 chr6 106439071 106441120 106440484 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 93075 2385 chr6 106592096 106594298 106593251 N NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 57901 2386 chr6 109505215 109507172 109506393 N NA NA CD164 K562 ChIA-PET 22265404 CEP57L1 88859 2387 chr6 110360538 110361758 110361154 N NA NA FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24 IMR90 Hi-C 24141950 WASF1 139449 2388 chr6 112363848 112364963 112364463 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 43788 2389 chr6 113950824 113954031 113952894 N NA NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC2 338328 2390 chr6 113968411 113969235 113968580 N NA NA MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC2 323124 2391 chr6 114130025 114132177 114131109 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 160182 2392 chr6 119040003 119041368 119040856 N NA CEP85L CEP85L IMR90 Hi-C 24141950 CEP85L 8765 2393 chr6 119842904 119846265 119844846 N NA NA NA NA NA NA MAN1A1 171978 2394 chr6 119853000 119857640 119854736 N NA NA LOC285762 IMR90 Hi-C 24141950 MAN1A1 182074 2395 chr6 123072186 123074482 123072570 N NA NA NA NA NA NA SERINC1 279234 2396 chr6 125666803 125668940 125667823 N NA HDDC2 HEY2 IMR90 Hi-C 24141950 HDDC2 43521 2397 chr6 125917324 125920827 125919606 N NA NA NA NA NA NA HEY2 149905 2398 chr6 130067903 130071584 130070571 N NA NA ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 1312878 2399 chr6 132588912 132593899 132591125 N NA NA STX7,CTGF,ENPP1 IMR90,GM12878,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 STX7 240438 2400 chr6 134399370 134402832 134401218 N NA SLC2A12 TBPL1,HBS1L,EYA4,SLC2A12 IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A12 25581 2401 chr6 135194367 135196020 135195081 N NA NA SGK1,SLC2A12,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 180016 2402 chr6 13523572 13529047 13524645,13527143 N,Y NA;TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1,SIRT5 GFOD1,SIRT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GFOD1 35703 2403 chr6 135422830 135426112 135424395 N NA HBS1L HBS1L,AHI1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 46794 2404 chr6 137422864 137425303 137424200 Y NA NA IL20RA IMR90 Hi-C 24141950 IFNGR1 115264 2405 chr6 137725342 137727845 137726898 N NA NA NA NA NA NA IFNGR1 184775 2406 chr6 138056177 138058923 138057716 Y PBOV1,TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 129658 2407 chr6 138065393 138066959 138066231 N NA NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 121622 2408 chr6 138131755 138133386 138132729 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 55195 2409 chr6 138224744 138226908 138225830 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 36163 2410 chr6 138269073 138275566 138271987 N NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 80492 2411 chr6 138282602 138286873 138285421 N NA NA NA NA NA NA TNFAIP3 94021 2412 chr6 139627133 139628665 139627249 N NA TXLNB HECA,TXLNB IMR90 Hi-C 24141950 TXLNB 13925 2413 chr6 139640986 139649675 139646432 N NA TXLNB,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA IMR90 Hi-C 24141950 TXLNB 27778 2414 chr6 14088461 14090724 14089154 N NA CD83 JARID2,RNF182,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 26763 2415 chr6 14092804 14097841 14095282 N NA CD83 JARID2,DTNBP1,CCDC90A,RNF182,CD83 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 19646 2416 chr6 14106782 14111776 14109191 Y CD83 CD83 RNF182,CD83 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 5711 2417 chr6 141803866 141807053 141805441 N NA NA NA NA NA NA VTA1 661357 2418 chr6 14208533 14213523 14211431 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 91046 2419 chr6 14239742 14243788 14241657 N NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 122255 2420 chr6 14253136 14257192 14254931 N NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 135649 2421 chr6 14275312 14278910 14277289 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 157825 2422 chr6 144535901 144538066 144537438 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 UTRN 74807 2423 chr6 145365219 145367116 145366019 N NA NA SHPRH,UTRN IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507557 688889 2424 chr6 14624994 14642587 14636011,14640192 N,N NA;NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 507507 2425 chr6 14654103 14668848 14655789,14661709,14665703 N,Y,N NA;NA;NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 536616 2426 chr6 14669390 14676900 14675208,14674855 N,N NA;NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 551903 2427 chr6 149429518 149433242 149431998 N NA NA ZC3H12D,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 206194 2428 chr6 149531292 149533231 149532266 N NA NA TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 106205 2429 chr6 149592025 149593667 149592854 N NA TAB2 TAB2,PPIL4,UST IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 45769 2430 chr6 152999835 153002036 153001786 N NA SYNE1,MYCT1 SYNE1,MYCT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYCT1 16994 2431 chr6 155004519 155005815 155005347 N NA SCAF8 OPRM1,IPCEF1,SCAF8,TIAM2,CNKSR3 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 48697 2432 chr6 155654090 155655924 155655033 N NA TFB1M ARID1B,TFB1M,NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 18473 2433 chr6 155661377 155663717 155662093 N NA TFB1M TFB1M,NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 25760 2434 chr6 155669912 155675184 155672514,155674141 N,N NA;NA TFB1M NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 34295 2435 chr6 156576493 156602381 156601086 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 496683 2436 chr6 156688381 156719985 156713220,156717204,156719827 N,N,N NA;NA;NA NA NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 ARID1B 379079 2437 chr6 156884683 156886172 156885005 N NA NA ARID1B IMR90 Hi-C 24141950 ARID1B 212892 2438 chr6 156954056 156960166 156957360 N NA NA NA NA NA NA ARID1B 138898 2439 chr6 157006402 157010678 157008281 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88386 2440 chr6 157017630 157021149 157019117,157020807 N,N NA;NA NA ARID1B,MIR4466 IMR90 Hi-C 24141950 ARID1B 77915 2441 chr6 157072829 157075911 157074006 N NA ARID1B ARID1B,MIR4466 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1B 23153 2442 chr6 158184202 158186517 158185579 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZDHHC14 381645 2443 chr6 158642402 158656112 158653158 N NA NA TULP4,SYTL3,DYNLT1,TMEM181 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2H5 53023 2444 chr6 15879343 15882516 15881173 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 DTNBP1 216054 2445 chr6 15886014 15889513 15887865 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 DTNBP1 222725 2446 chr6 15900173 15903627 15901755 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 225690 2447 chr6 15904284 15907157 15905432,15906186 N,N NA;NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 222160 2448 chr6 159285525 159292707 159286845,159290893 N,N NA;NA EZR OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZR 45069 2449 chr6 159473088 159475671 159474175 N NA TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 6904 2450 chr6 159481373 159485637 159483652 Y DYNLT1,SYTL3,TAGAP TAGAP NA NA NA NA TAGAP 15189 2451 chr6 159500688 159502234 159501378 N NA TAGAP TAGAP,RSPH3 IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 34504 2452 chr6 159515649 159522253 159516465,159519687 N,Y NA;DYNLT1,SYTL3,TAGAP TAGAP TAGAP,RSPH3 IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 49465 2453 chr6 159523654 159530310 159526067,159528430 Y,N EZR,EZR,TAGAP;NA NA TAGAP,RSPH3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAGAP 57470 2454 chr6 159546718 159548256 159547124 N NA NA NA NA NA NA TAGAP 80534 2455 chr6 16203721 16207627 16205808 Y NA NA DTNBP1,MYLIP,GMPR IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 74404 2456 chr6 164088025 164090452 164089036 Y QKI NA NA NA NA NA QKI 252350 2457 chr6 164125082 164139931 164127139,164137878 N,N NA;NA NA NA NA NA NA QKI 289407 2458 chr6 164143778 164151142 164145074,164149317 N,N NA;NA NA QKI IMR90 Hi-C 24141950 QKI 308103 2459 chr6 166606839 166610039 166608833 N NA NA RPS6KA2 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D1 145952 2460 chr6 167486761 167488113 167487380 N NA CCR6 GPR31 IMR90 Hi-C 24141950 CCR6 37182 2461 chr6 167505375 167509304 167508143 N NA CCR6 NA NA NA NA CCR6 15991 2462 chr6 167516009 167519190 167516844 N NA CCR6 TCP10L2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR6 6105 2463 chr6 169342397 169352618 169343564,169347616,169352190 Y,N,N NA;NA;NA NA LOC154449,WDR27,PHF10,C6orf70,TCTE3,FAM120B IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 749541 2464 chr6 169417973 169420316 169418861 N NA NA WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 681843 2465 chr6 169514742 169519831 169516786 N NA NA WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 582328 2466 chr6 169559509 169562812 169561488 N NA NA C6orf70,THBS2,WDR27,PHF10 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 539347 2467 chr6 182646 192566 184456,187185,190788,189135 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA IRF4,EXOC2,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 99535 2468 chr6 18326145 18333653 18329616 N NA NA NA NA NA NA RNF144B 53928 2469 chr6 18340640 18347063 18343863,18342004 Y,N RNF144B;NA RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 40518 2470 chr6 18349973 18352482 18351248 Y KDM1B,RNF144B RNF144B RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 RNF144B 35099 2471 chr6 18358225 18362281 18359903 N NA RNF144B RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 RNF144B 25300 2472 chr6 18379516 18382254 18380475 N NA RNF144B NA NA NA NA RNF144B 5327 2473 chr6 19278833 19283111 19279974 N NA NA NA NA NA NA RNF144B 891252 2474 chr6 193450 194741 194023 N NA NA IRF4,EXOC2,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 97360 2475 chr6 19416682 19423652 19420264 N NA NA NA NA NA NA E2F3 978485 2476 chr6 19432119 19434830 19433744 N NA NA NA NA NA NA E2F3 967307 2477 chr6 19437421 19444023 19443487 N NA NA NA NA NA NA E2F3 958114 2478 chr6 19447774 19454828 19449881,19452837 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA E2F3 947309 2479 chr6 19586637 19588644 19587518 N NA NA NA NA NA NA E2F3 813493 2480 chr6 19801332 19806673 19804397 N NA NA ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 E2F3 595464 2481 chr6 20320018 20320954 20320333 N NA NA E2F3 IMR90 Hi-C 24141950 E2F3 81183 2482 chr6 21587381 21590185 21588783 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 3787 2483 chr6 217042 220135 218673 N NA NA DUSP22,EXOC2,IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 71966 2484 chr6 24917863 24935801 24919957,24933034 N,N NA;NA FAM65B FAM65B,CMAHP IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 6668 2485 chr6 24940558 24942507 24941249 N NA FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 29363 2486 chr6 24995853 24998809 24996684 N NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 84658 2487 chr6 25003997 25016042 25013834,25006979 N,Y NA;TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 92802 2488 chr6 25040933 25043603 25042531,25041384 N,N NA;NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 94448 2489 chr6 25052971 25055241 25054005 N NA NA FAM65B,GMNN IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 82810 2490 chr6 25154622 25156437 25155783 N NA CMAHP NA NA NA NA CMAHP 16571 2491 chr6 25250239 25252184 25251146 N NA LRRC16A LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 27472 2492 chr6 256287 260808 258495 N NA DUSP22 IRF4,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 31293 2493 chr6 26304457 26306383 26305510 N NA NA HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 59015 2494 chr6 26320650 26323779 26322865 Y NA BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 41619 2495 chr6 26330802 26332472 26331395 N NA BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,BTN2A3P,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,BTN2A2,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,HIST1H3F,HIST1H4D,HIST1H4E,HIST1H2BH,HIST1H3E,HIST1H3D,HIST1H4G,HIST1H2BF,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H,BTN3A3,BTN1A1,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H2BM,HIST1H4K,HIST1H2BO,HIST1H3J,HIST1H4L,HIST1H2AM,HIST1H3I IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 32926 2496 chr6 27144583 27147139 27145649 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BK HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 29946 2497 chr6 27155715 27157177 27156389 Y NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 41078 2498 chr6 27445702 27448560 27446938 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 4805 2499 chr6 27520399 27522113 27520959 N NA NA HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL,ZNF184,HIST1H2BJ,HIST1H2AG K562 ChIA-PET 22265404 ZNF184 79502 2500 chr6 27654802 27656436 27655427 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 213905 2501 chr6 28743890 28746213 28744824 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 145555 2502 chr6 28784610 28785795 28785180 N NA NA NA NA NA NA TRIM27 105973 2503 chr6 28841754 28846780 28844687,28843457 N,N NA;NA TRIM27 LOC401242,TRIM27 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRIM27 44988 2504 chr6 28907304 28909774 28909140 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 15536 2505 chr6 28910611 28912734 28911916 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 18843 2506 chr6 29727566 29728751 29728306 N NA HLA-F,HLA-F-AS1 NA NA NA NA HLA-F-AS1 10740 2507 chr6 30482468 30485088 30484232 N NA HLA-E,PRR3,GNL1 HLA-E,PPP1R10,MRPS18B,ABCF1,PRR3,GNL1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 25285 2508 chr6 3052387 3055447 3054097 N NA RIPK1 MYLK4,WRNIP1,DKFZP686I15217,NQO2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIPK1 21611 2509 chr6 3065458 3070896 3069212 N NA RIPK1,BPHL NQO2,LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 6162 2510 chr6 30731103 30732924 30731900 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 FLOT1 20650 2511 chr6 30772653 30776322 30774907 N NA NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLOT1 62200 2512 chr6 30802121 30803636 30802550 N NA DDR1 DDR1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDR1 48225 2513 chr6 31152642 31154669 31154019 N NA CCHCR1,TCF19,POU5F1,PSORS1C3,HCG27 NA NA NA NA PSORS1C3 6966 2514 chr6 32211629 32213810 32212852 N NA NOTCH4 HLA-DOB,NOTCH4 IMR90 Hi-C 24141950 NOTCH4 19785 2515 chr6 32222751 32224278 32223292 N NA NOTCH4 C6orf10,HCG23,NOTCH4,BTNL2,ATF6B,AGER,PBX2,TNXB IMR90 Hi-C 24141950 NOTCH4 30907 2516 chr6 32571563 32573671 32572077 N NA HLA-DRB6,HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DRB1 13950 2517 chr6 32576627 32579343 32578108 N NA HLA-DRB6,HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DRB1 19014 2518 chr6 32984533 32988815 32986831 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA BRD2,HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 7144 2519 chr6 32995167 32999070 32995733,32997326 N,Y NA;HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA,HLA-DPB1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1,BRD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLA-DOA 17778 2520 chr6 33310984 33313520 33312799 N NA RGL2,TAPBP,ZBTB22,DAXX,KIFC1 TAPBP,ZBTB22,DAXX,KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 DAXX 20191 2521 chr6 34190777 34193238 34191914 Y C6orf1,HMGA1 HMGA1,C6orf1 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1 11339 2522 chr6 36547097 36548394 36547779 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 PXT1,ETV7,SRSF3,STK38,KCTD20,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 13696 2523 chr6 36631542 36634400 36632758 N NA CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN1A 9837 2524 chr6 37021934 37028758 37023606 N NA FGD2 CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 FGD2 48511 2525 chr6 37038099 37040216 37039644 N NA NA FGD2,PIM1,TMEM217,PPIL1,C6orf89,CPNE5,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FGD2 64676 2526 chr6 37068324 37072844 37070921 N NA NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65078 2527 chr6 37109133 37110598 37109861 N NA PIM1 PIM1,C6orf89,FGD2,PPIL1,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 27324 2528 chr6 37121643 37125597 37123346 Y FGD2 PIM1 CPNE5,PPIL1,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 12325 2529 chr6 37127924 37129722 37129017 N NA PIM1 CPNE5,PPIL1,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 8200 2530 chr6 37483395 37485400 37484351 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 15695 2531 chr6 37671065 37674750 37673426 N NA MDGA1 MDGA1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MDGA1 5299 2532 chr6 37698929 37700462 37699844 N NA MDGA1 ZFAND3,BTBD9,CCDC167,FTSJD2,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 MDGA1 33163 2533 chr6 40723464 40724718 40723977 N NA NA LRFN2 IMR90 Hi-C 24141950 UNC5CL 282220 2534 chr6 41281549 41284481 41283127 N NA NA TFEB,TREML2,TREM1 IMR90 Hi-C 24141950 TREML2 112624 2535 chr6 41285797 41287966 41286708 Y NFYA,TFEB,TREML4,TREM1 NA C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 TREML2 116872 2536 chr6 42737492 42746704 42738936,42743149 Y,N CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226;NA TBCC,KIAA0240 KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D,KLHDC3,MEA1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 23608 2537 chr6 42747447 42771902 42750193 N NA TBCC,KIAA0240 KIAA0240,UBR2,RPL7L1,PTCRA,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D,PRPH2,TBCC,ATP6V0CP3,C6orf226,TRERF1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0240 16892 2538 chr6 43350818 43353712 43351757 Y NA ZNF318,ABCC10 TJAP1,TTBK1,DLK2,POLH,SLC22A7,ABCC10,C6orf108,CUL9,YIPF3,LRRC73,POLR1C,CRIP3,ZNF318,XPO5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF318 13637 2539 chr6 43669461 43672303 43670706 N NA MRPS18A MRPS18A,RSPH9,XPO5,LOC100132354,C6orf223,MRPL14,TMEM63B,CAPN11,VEGFA,MAD2L1BP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 13912 2540 chr6 43681718 43685014 43682885 N NA MRPS18A MRPS18A,TMEM63B,CAPN11,LOC100132354,RSPH9,VEGFA,POLH,C6orf223,MRPL14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 26169 2541 chr6 43691266 43694392 43691812,43693006 N,Y NA;TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 35717 2542 chr6 43795670 43797209 43796632 N NA NA VEGFA,MRPS18A,RSPH9,LOC100132354 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFA 57724 2543 chr6 45553028 45555849 45555064 N NA NA RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX2 256974 2544 chr6 45626149 45628554 45626882 N NA NA RUNX2,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX2 330095 2545 chr6 47170692 47172576 47171286 N NA NA TNFRSF21 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF21 105104 2546 chr6 47381605 47383318 47382795 N NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 62207 2547 chr6 52166908 52171635 52169902 N NA MCM3 PAQR8,MCM3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MCM3 17326 2548 chr6 52458216 52462076 52460355 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 16354 2549 chr6 53103869 53106580 53105752 N NA NA FBXO9,ELOVL5 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 107397 2550 chr6 53222424 53226776 53224285 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 8447 2551 chr6 53555671 53557706 53556474 N NA NA KLHL31,GCLC IMR90 Hi-C 24141950 LRRC1 102072 2552 chr6 5850665 5852594 5851621 N NA NA NA NA NA NA FARS2 589081 2553 chr6 68795618 68797723 68796723 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1709326 2554 chr6 7035815 7037187 7036553 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 70643 2555 chr6 70522592 70524661 70523523 N NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 15543 2556 chr6 710212 712092 711144 N NA EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 17103 2557 chr6 71106582 71109286 71107213 N NA FAM135A FAM135A K562 ChIA-PET 22265404 FAM135A 13821 2558 chr6 71957299 71959904 71958316 N NA OGFRL1 OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 38573 2559 chr6 72167273 72169138 72168026 N NA NA MIR30C2,OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 168796 2560 chr6 79517190 79518818 79518163 N NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 58371 2561 chr6 81799192 81799478 81799333 N NA NA NA NA NA NA BCKDHB 982848 2562 chr6 88450417 88453512 88451589 N NA AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 ORC3,RARS2,RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 38432 2563 chr6 88508247 88510062 88509129 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 96262 2564 chr6 88536073 88538562 88537942 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 124088 2565 chr6 88539459 88543444 88541397 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 127474 2566 chr6 88589237 88593567 88590886 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 177252 2567 chr6 88611988 88619340 88614016,88615219,88616884 N,N,N NA;NA;NA NA ANKRD6 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 200003 2568 chr6 88624758 88643525 88628614,88632481,88635225,88625389,88639609,88642387 N,Y,N,N,N,N NA;CNR1;NA;NA;NA;NA NA RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 212773 2569 chr6 88823858 88826255 88825253 N NA CNR1 NA NA NA NA CNR1 49512 2570 chr6 91057551 91084408 91060330,91074173 N,N NA;NA NA BACH2,CASP8AP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BACH2 50924 2571 chr6 91089885 91104310 91092684,91098742,91102871 N,N,N NA;NA;NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 83258 2572 chr6 91121716 91127475 91125138 N NA NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 115089 2573 chr6 91179889 91189837 91189173,91183441,91186330,91182257 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA BACH2,GJA10,CASP8AP2,MDN1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K7 107070 2574 chr6 93379091 93383519 93381298 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2082184 2575 chr6 93393372 93399956 93396840 N NA NA NA NA NA NA MAP3K7 2096465 2576 chr7 100433192 100436306 100435131 N NA SLC12A9,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A9 14052 2577 chr7 101330479 101332789 101331813 N NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 126395 2578 chr7 101377475 101394291 101384400,101382556,101379598,101386970,101389818 Y,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 64893 2579 chr7 101438289 101443990 101441697,101440183 N,N NA;NA CUX1 CUX1,MYL10,SH2B2,EMID2 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 15194 2580 chr7 101446869 101450747 101448894 N NA CUX1 CUX1,EMID2,MYL10,SH2B2 IMR90 Hi-C 24141950 CUX1 8437 2581 chr7 104583291 104587240 104585646,104585653 Y,Y MLL5;MLL5 LOC100216546 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100216546 44372 2582 chr7 105756175 105758866 105756782 N NA SYPL1 EFCAB10,ATXN7L1,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 SYPL1 3118 2583 chr7 106210189 106212571 106212014 N NA NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89063 2584 chr7 106407134 106410159 106408701 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1 NA CCDC71L,PIK3CG,HBP1,NAMPT,PRKAR2B,CBLL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CG 95765 2585 chr7 107490645 107492503 107491323 N NA DLD COG5,SLC26A3,GPR22 IMR90 Hi-C 24141950 DLD 39083 2586 chr7 107495459 107499460 107497879 N NA DLD COG5,SLC26A3,GPR22,CBLL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLD 32126 2587 chr7 107510584 107512520 107511219 N NA DLD GPR22,COG5,CBLL1,SLC26A4,NRCAM IMR90 Hi-C 24141950 DLD 19066 2588 chr7 112781136 112785398 112782862,112784212 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C7orf60 201204 2589 chr7 11340487 11364823 11342930,11362701,11355652 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA PHF14 326988 2590 chr7 115783683 115786693 115785522 N NA NA MET IMR90 Hi-C 24141950 CAPZA2 715870 2591 chr7 115789672 115791486 115790776 N NA NA MET IMR90 Hi-C 24141950 CAPZA2 711077 2592 chr7 1213972 1216922 1215898 N NA C7orf50,ZFAND2A CYP2W1,C7orf50,ZFAND2A,UNCX,COX19,GPR146,GPER,MICALL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND2A 14117 2593 chr7 1228914 1232434 1232033 N NA ZFAND2A C7orf50,ZFAND2A,MICALL2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 29059 2594 chr7 127053378 127056226 127054757 N NA ZNF800 GRM8,FSCN3,GCC1,ARF5 H1ESC,HELA 5C 22955621 ZNF800 20611 2595 chr7 127756567 127758832 127757846 N NA NA PAX4,SND1,MIR129-1 IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 188984 2596 chr7 127768202 127773835 127769413 N NA NA SND1,MIR129-1 IMR90 Hi-C 24141950 MGC27345 173981 2597 chr7 128082990 128085887 128084389 N NA IMPDH1,HILPDA,METTL2B CALU,HILPDA,PRRT4,IMPDH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HILPDA 9997 2598 chr7 129418650 129424174 129419889 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 167095 2599 chr7 130526027 130526822 130526277 N NA NA MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329 IMR90 Hi-C 24141950 LOC646329 71247 2600 chr7 139908747 139911221 139910332 N NA JHDM1D,LOC100134229 JHDM1D,SLC37A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100134229 31686 2601 chr7 139928793 139935385 139929931 Y TBXAS1,RAB19,JHDM1D NA JHDM1D,LOC100134229,SLC37A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100134229 51732 2602 chr7 139952052 139954269 139953227 N NA NA JHDM1D IMR90 Hi-C 24141950 LOC100134229 74991 2603 chr7 142001083 142002251 142001912 N NA NA MOXD2P IMR90 Hi-C 24141950 TAS2R5 511066 2604 chr7 142023607 142025178 142023995 N NA NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 TAS2R5 533590 2605 chr7 144779399 144780844 144779964 N NA NA NA NA NA NA CASP2 1794091 2606 chr7 145504745 145510593 145507868 N NA NA NA NA NA NA CASP2 2519437 2607 chr7 145541405 145543759 145542605 N NA NA NA NA NA NA CASP2 2556097 2608 chr7 145653066 145655254 145653987 N NA NA NA NA NA NA CASP2 2667758 2609 chr7 148636659 148639234 148638142 N NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EZH2 55218 2610 chr7 150588096 150590137 150588960 N NA NA ATG9B,NOS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNH2 85265 2611 chr7 150592770 150596712 150594788,150593044 Y,N NA;NA NA ATG9B,NOS3,KCNH2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNH2 78690 2612 chr7 152952742 152954807 152953981 N NA NA DPP6 IMR90 Hi-C 24141950 ACTR3B 495891 2613 chr7 1549682 1552340 1550796 N NA INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 5664 2614 chr7 154994673 154999695 154997919 N NA NA INSIG1,LOC202781,PAXIP1 K562 ChIA-PET 22265404 INSIG1 89791 2615 chr7 156719274 156723127 156720750 N NA LMBR1,NOM1 CNPY1,NOM1,UBE3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOM1 19290 2616 chr7 158768747 158770758 158769625 N NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 ESYT2 146428 2617 chr7 20949530 20952952 20951062,20951741 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SP4 514737 2618 chr7 20968396 20972104 20970543 N NA NA NA NA NA NA SP4 495585 2619 chr7 22402337 22405424 22403831 Y RAPGEF5 RAPGEF5 NA NA NA NA RAPGEF5 5804 2620 chr7 22414520 22418687 22417696 N NA RAPGEF5 RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF5 17987 2621 chr7 23056036 23058093 23056866 N NA FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 2266 2622 chr7 24364204 24366604 24365506 N NA NA NA NA NA NA MPP6 246481 2623 chr7 25894416 25903410 25894909,25896575,25902098 Y,Y,Y NA;NA;NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 288437 2624 chr7 25932484 25935827 25934016 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10,HOXA5,HOXA-AS3,HOXA7,HOXA6,LOC441204,MIR196B,HOXA3,HOXA4,HOTTIP,HOXA13,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA2,HOXA1,HOTAIRM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 256020 2625 chr7 26002848 26009165 26004415,26004021,26007763 Y,N,N NA;NA;NA NA MIR148A MCF7 ChIA-PET 22265404 NFE2L3 182682 2626 chr7 26436620 26439961 26438241 N NA NA LOC441204 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNX10 105105 2627 chr7 27737047 27738322 27737773 N NA HIBADH,TAX1BP1 HOXA-AS5,HOXA10-HOXA9,HOXA11,JAZF1,EVX1,HIBADH,TAX1BP1,HOTTIP IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 34427 2628 chr7 28304457 28306685 28306214 N NA NA JAZF1-AS1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 JAZF1 84020 2629 chr7 28929934 28931480 28930685 N NA NA CPVL IMR90 Hi-C 24141950 JAZF1 709497 2630 chr7 2914020 2915796 2915015 N NA GNA12 AMZ1,GNA12,FOXK1,KIAA0415 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA12 30061 2631 chr7 30265315 30266524 30265724 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 57399 2632 chr7 30277336 30281159 30279395 N NA ZNRF2 NA NA NA NA ZNRF2 42764 2633 chr7 30763462 30768127 30767054 N NA NA GARS,CRHR2 IMR90 Hi-C 24141950 GARS 129281 2634 chr7 38358655 38360172 38359058 N NA NA STARD3NL IMR90 Hi-C 24141950 STARD3NL 140847 2635 chr7 38373084 38376263 38375352 N NA NA LOC100506776 K562 ChIA-PET 22265404 STARD3NL 155276 2636 chr7 41310810 41313794 41311592 N NA NA C7orf10,COL6A4P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 C7orf11 1136559 2637 chr7 47124104 47145044 47143678 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 476698 2638 chr7 47179128 47197815 47179861,47194397,47182103,47189229,47186161 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA IGFBP3,IGFBP1,TNS3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 423927 2639 chr7 47206095 47210088 47208745 N NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 411654 2640 chr7 47639330 47642593 47640955 N NA TNS3 TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 17588 2641 chr7 47685690 47687610 47687063 N NA NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 63948 2642 chr7 47753077 47754552 47754447 N NA NA C7orf69,PKD1L1,TNS3,C7orf65,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 131335 2643 chr7 47758750 47761910 47760633 N NA NA TNS3,C7orf65,PKD1L1,C7orf69,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 137008 2644 chr7 49267127 49270277 49268698 N NA NA NA NA NA NA IKZF1 1074101 2645 chr7 49371878 49374610 49373110 N NA NA NA NA NA NA IKZF1 969768 2646 chr7 50304461 50310033 50307604 N NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 34345 2647 chr7 50320344 50324259 50321749 Y NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 20119 2648 chr7 51392702 51398868 51393896,51395310 N,Y NA;NA NA COBL MCF7 ChIA-PET 22265404 FIGNL1 874614 2649 chr7 51433671 51435141 51434528 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 915583 2650 chr7 51834896 51839173 51836508 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 1316808 2651 chr7 52566935 52571595 52569109 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 2048847 2652 chr7 52572254 52576865 52574714 N NA NA NA NA NA NA FIGNL1 2054166 2653 chr7 52778399 52782265 52779791 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 2044674 2654 chr7 54319040 54322632 54320378 N NA NA NA NA NA NA SEC61G 504307 2655 chr7 5594406 5599465 5596114,5597882 Y,N CCZ1,ACTB;NA FBXL18,ACTB RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 24174 2656 chr7 55953900 55956811 55955214 N NA ZNF713 NA NA NA NA ZNF713 23520 2657 chr7 5608566 5610578 5609878 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 38334 2658 chr7 6119783 6121900 6121200 N NA EIF2AK1,USP42 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 20923 2659 chr7 63763998 63769744 63767816 N NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 3442 2660 chr7 64460244 64467786 64467117 N NA CCT6P3 ZNF117,CCT6P3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CCT6P3 30946 2661 chr7 64733701 64735635 64734516 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 103133 2662 chr7 64939348 64943483 64940952 N NA NA ZNF92 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF92 100580 2663 chr7 64973513 64976983 64974683 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 134745 2664 chr7 65272772 65276687 65274568,65276273 N,N NA;NA LOC441242 LOC441242,VKORC1L1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LOC441242 36975 2665 chr7 65956916 65959887 65958624 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 83611 2666 chr7 66045774 66059264 66057376 N NA LOC493754,KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC493754 2276 2667 chr7 66142902 66148290 66147039 N NA KCTD7 ASL,CRCP,KCTD7,RABGEF1,LOC493754 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD7 49034 2668 chr7 73685489 73687726 73686727 N NA RFC2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC2 16751 2669 chr7 74063024 74065681 74064632 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 6349 2670 chr7 7983039 7985512 7984415 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 22862 2671 chr7 81514550 81516352 81515874 N NA NA HGF IMR90 Hi-C 24141950 PHTF2 4086441 2672 chr7 86919761 86922237 86920821 N NA NA NA NA NA NA TP53TG1 52571 2673 chr7 90224988 90227209 90225748 N NA NA FZD1,CDK14 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 111503 2674 chr7 91465319 91468203 91467134 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 41813 2675 chr7 93677952 93683281 93679556,93681976 N,N NA;NA BET1 TFPI2,GNG11,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 44262 2676 chr7 98188808 98190211 98189513 Y NA NA NA NA NA NA BRI3 277829 2677 chr7 99880376 99885710 99885052 N NA GATS,PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA GATS 10521 2678 chr8 101449724 101451391 101450405 Y RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD46 120621 2679 chr8 101505495 101508399 101506585 N NA NA RNF19A,GRHL2,SPAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANKRD46 63613 2680 chr8 102108503 102110136 102108921 N NA FLJ42969 FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 FLJ42969 44221 2681 chr8 102120419 102122814 102121477 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLJ42969 56137 2682 chr8 102137011 102139941 102138832 N NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ42969 72729 2683 chr8 102148124 102151284 102149672 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66676 2684 chr8 102342742 102346851 102344934 Y NA NA GRHL2,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 124782 2685 chr8 103443467 103450803 103444568 N NA UBR5 UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR5 18550 2686 chr8 103534629 103537280 103536249 N NA NA UBR5,ODF1,KLF10 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 109712 2687 chr8 103538556 103550774 103538886,103548120,103541820,103549981 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR5 113639 2688 chr8 103595258 103600214 103598156,103595715 N,N NA;NA NA UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 67769 2689 chr8 103629346 103630948 103630049 N NA KLF10 KLF10,UBR5,ODF1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 37035 2690 chr8 103897506 103903752 103899341 N NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 21109 2691 chr8 103989452 104001066 103991466 N NA ATP6V1C1 ATP6V1C1,AZIN1,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1C1 32182 2692 chr8 109972287 109974262 109973525 N NA NA NA NA NA NA NUDCD1 372088 2693 chr8 110063790 110067492 110065977 N NA NA NA NA NA NA NUDCD1 278858 2694 chr8 11107212 11109760 11108723 N NA XKR6,MTMR9 XKR6,MTMR9 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR9 32240 2695 chr8 11333544 11342862 11338374,11341552 N,N NA;NA FAM167A,BLK C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 BLK 8659 2696 chr8 11734898 11736437 11735694 Y CTSB NA CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A,GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 FDFT1 74708 2697 chr8 117770633 117772552 117771678 N NA EIF3H,UTP23 NA NA NA NA EIF3H 2571 2698 chr8 118451079 118453715 118451752 N NA NA NA NA NA NA MED30 79250 2699 chr8 121869195 121871038 121869811 N NA SNTB1 MRPL13,SNTB1,MTBP IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 44886 2700 chr8 121872361 121875699 121874506 N NA SNTB1 SNTB1,MRPL13,MTBP IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 48052 2701 chr8 123118619 123120195 123119418 N NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX2 673706 2702 chr8 123477668 123480041 123478611 N NA NA NA NA NA NA ZHX2 313860 2703 chr8 124076760 124079101 124077947 N NA DERL1,WDR67 WDR67,ZHX2,DERL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR67 5819 2704 chr8 125208959 125210901 125210182 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM65 174039 2705 chr8 125801245 125804253 125802534 N NA NA MTSS1,ZNF572 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF572 181286 2706 chr8 126557320 126560375 126558417 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 114757 2707 chr8 126580288 126581706 126581017 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB1 137725 2708 chr8 126601234 126604015 126602408 N NA NA TRIB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIB1 158671 2709 chr8 126613296 126622424 126614370,126620559 N,N NA;NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 170733 2710 chr8 126648103 126649312 126648353 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 205540 2711 chr8 127204018 127206152 127205087 N NA NA NA NA NA NA FAM84B 364559 2712 chr8 128207705 128210408 128209317 Y NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 MYC 537907 2713 chr8 128218525 128223657 128219391,128222848 Y,Y NA;NA NA LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYC 524658 2714 chr8 128575399 128577137 128576296 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 171178 2715 chr8 128584744 128592451 128590832 N NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 155864 2716 chr8 128610822 128616928 128615576 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 131387 2717 chr8 128649478 128708787 128707379 N NA MYC LOC727677,MYC,PVT1,PCAT1,POU5F1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYC 39528 2718 chr8 128800436 128802900 128801059 N NA PVT1 PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 PVT1 3879 2719 chr8 134628234 134631013 134629036 N NA ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT,ZFAT-AS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ST3GAL1 44051 2720 chr8 135055402 135057570 135056301 N NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 471219 2721 chr8 135730410 135734359 135732252 N NA ZFAT ST3GAL1,ZFAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 5118 2722 chr8 135830941 135846728 135844742 N NA NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 105649 2723 chr8 141472820 141476895 141474917 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1,PTK2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRAPPC9 4142 2724 chr8 142095808 142102130 142096425,142099721 Y,Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3;EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 36590 2725 chr8 142104350 142107992 142106230 N NA DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 30728 2726 chr8 142128573 142132557 142129477,142131242 N,Y NA;EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 6163 2727 chr8 142401577 142403232 142402070 N NA NA FLJ43860,PTP4A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 262857 2728 chr8 145910622 145912162 145911355 N NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF251 68808 2729 chr8 16403542 16416501 16405775 N NA NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 597335 2730 chr8 18951436 18956134 18954322 N NA NA LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 INTS10 718784 2731 chr8 19551938 19558005 19554031,19556986 Y,N NA;NA NA CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 INTS10 116913 2732 chr8 19563995 19568486 19567440,19565696 Y,N NA;NA NA CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 INTS10 106432 2733 chr8 20146407 20163414 20161536 N NA LZTS1 ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33604 2734 chr8 22804951 22811584 22809594 N NA RHOBTB2 RHOBTB2,TNFRSF10B,PEBP4,KIAA1967,C8orf58,BIN3,EGR3,LOC254896 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 33346 2735 chr8 22828507 22840862 22832467,22839039 N,N NA;NA RHOBTB2 BIN3,PEBP4,LOC254896,TNFRSF10B,RHOBTB2,C8orf58,KIAA1967,LOC286059 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB2 4068 2736 chr8 2496480 2499152 2498210 N NA NA NA NA NA NA CLN8 784610 2737 chr8 26305880 26307914 26306634 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3L 65357 2738 chr8 26321304 26326856 26322141,26325575 N,N NA;NA NA NA NA NA NA BNIP3L 80781 2739 chr8 28257412 28264891 28259551,28264074 N,Y NA;HMBOX1,HMBOX1,ZNF395 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 13435 2740 chr8 29385518 29389348 29387501 N NA NA C8orf75,DUSP4,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF13B 264908 2741 chr8 29412772 29415174 29413674 Y DUSP4 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF13B 292162 2742 chr8 29629775 29633462 29631442 Y DUSP4 NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 307187 2743 chr8 34485025 34487763 34486134 N NA NA NA NA NA NA RNF122 1060382 2744 chr8 35951046 35954812 35952730 N NA NA NA NA NA NA ERLIN2 1639285 2745 chr8 37258474 37260899 37259588 N NA NA KCNU1,ZNF703,LOC728024,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN2 333198 2746 chr8 37272939 37275933 37274341 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERLIN2 318164 2747 chr8 37396258 37399089 37397443 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERLIN2 195008 2748 chr8 38501042 38503474 38501870 N NA NA FGFR1,C8orf86,WHSC1L1,LETM2,RNF5P1,BAG4,TACC1,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA2 255279 2749 chr8 41323071 41324965 41324422 N NA GOLGA7 NA NA NA NA GOLGA7 23116 2750 chr8 41997133 41999307 41998627 N NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 11157 2751 chr8 42508529 42512831 42509145,42511633 N,N NA;NA NA SLC20A2,VDAC3,C8orf40,KAT6A,DKK4,CHRNB3,PLAT,AP3M2,POLB,CHRNA6,RNF170 IMR90 Hi-C 24141950 CHRNA6 111098 2752 chr8 42644541 42646381 42645472 N NA CHRNA6 SLC20A2,CHRNA6,C8orf40,CHRNB3 IMR90 Hi-C 24141950 CHRNA6 20612 2753 chr8 43132917 43137262 43136556 N NA NA SGK196 K562 ChIA-PET 22265404 HGSNAT 137325 2754 chr8 43262953 43267209 43265528 N NA NA NA NA NA NA HGSNAT 267361 2755 chr8 49182007 49186240 49184262 N NA NA SNAI2,MCM4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 261012 2756 chr8 49190678 49193434 49191940 N NA NA SNAI2,MCM4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 269683 2757 chr8 49425433 49433717 49427195,49430067 Y,N SNAI2;NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 504438 2758 chr8 49514036 49515918 49514600 N NA NA MCM4,SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 593041 2759 chr8 49517512 49519654 49518682 N NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 596517 2760 chr8 49558199 49565005 49559119,49562144 N,N NA;NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 637204 2761 chr8 49575539 49579197 49577602,49577554 N,N NA;NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 654544 2762 chr8 49581722 49588179 49585060 N NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 660727 2763 chr8 49861696 49863347 49862253 N NA NA MCM4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 940701 2764 chr8 55933446 55940188 55937877 N NA NA NA NA NA NA TGS1 745603 2765 chr8 56769236 56781106 56774608 N NA LYN LYN,RPS20 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYN 11280 2766 chr8 60968298 60971275 60969587 N NA NA TOX IMR90 Hi-C 24141950 RAB2A 458194 2767 chr8 61557082 61567556 61564720,61566127 N,N NA;NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 23768 2768 chr8 61806876 61808623 61807396 N NA NA NA NA NA NA CHD7 215552 2769 chr8 61821019 61826597 61822392,61824540 N,Y NA;CHD7 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 229695 2770 chr8 61827243 61831252 61829256 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 235919 2771 chr8 61837960 61841046 61839745 N NA NA NA NA NA NA CHD7 246636 2772 chr8 61887886 61889264 61888236 N NA NA NA NA NA NA CHD7 296562 2773 chr8 61891050 61893858 61892326 N NA NA NA NA NA NA CHD7 299726 2774 chr8 61910519 61912600 61911842 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 319195 2775 chr8 62025444 62026863 62026041 N NA NA NA NA NA NA CHD7 434120 2776 chr8 62190550 62193362 62191877 N NA NA NA NA NA NA ASPH 433837 2777 chr8 62658498 62661520 62661138,62659218 N,N NA;NA ASPH ASPH IMR90 Hi-C 24141950 ASPH 31299 2778 chr8 63072750 63078634 63074405,63077681 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ASPH 445551 2779 chr8 64056551 64060191 64059441 N NA YTHDF3 NA NA NA NA YTHDF3 20930 2780 chr8 64304227 64304796 64304613 N NA NA NA NA NA NA YTHDF3 223106 2781 chr8 6538634 6549524 6548176 N NA AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 AGPAT5 16354 2782 chr8 66789746 66791972 66791101 N NA PDE7A PDE7A IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 35777 2783 chr8 66853376 66867312 66863983,66866843,66860856 Y,N,N RRS1,PDE7A;NA;NA NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 99407 2784 chr8 66892798 66896561 66893954 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 138829 2785 chr8 66910776 66913040 66911762 N NA NA PDE7A IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 156807 2786 chr8 66921335 66923185 66922615 N NA NA DNAJC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 167366 2787 chr8 68304784 68306967 68305974 N NA ARFGEF1 NA NA NA NA ARFGEF1 48872 2788 chr8 6937177 6939867 6938446,6938449 N,N NA;NA NA NA NA NA NA XKR5 244011 2789 chr8 74804450 74808579 74805354 Y NA UBE2W UBE2W IMR90 Hi-C 24141950 UBE2W 13340 2790 chr8 76263696 76265790 76264611 N NA NA NA NA NA NA GDAP1 1001078 2791 chr8 79768237 79770846 79769396 N NA NA NA NA NA NA PKIA 339901 2792 chr8 80636498 80638520 80637966 N NA HEY1 TPD52 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 41578 2793 chr8 80694333 80697704 80696113 N NA HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 14235 2794 chr8 80779361 80780923 80779911 N NA NA HEY1,MRPS28,TPD52 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 99263 2795 chr8 81104562 81111426 81105852,81109272 N,N NA;NA TPD52 TPD52 IMR90 Hi-C 24141950 TPD52 20726 2796 chr8 81142428 81144003 81142884 N NA NA ZNF704,TPD52 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52 58592 2797 chr8 81288630 81290465 81290059 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 107983 2798 chr8 8140162 8142701 8141249 N NA NA SGK223,CLDN23,MFHAS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ10661 54070 2799 chr8 8145837 8148240 8146923 N NA NA SGK223,MFHAS1,CLDN23 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ10661 59745 2800 chr8 81826752 81829873 81828077 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 194430 2801 chr8 81835107 81840025 81836794 N NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 184278 2802 chr8 82044107 82045566 82045064 Y PAG1 PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 19804 2803 chr8 82058651 82060882 82059581 N NA PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 34348 2804 chr8 82065193 82069815 82066333 N NA PAG1 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 40890 2805 chr8 8405300 8407192 8406268 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN23 152474 2806 chr8 8535657 8541348 8540399 N NA CLDN23 FLJ10661,SGK223,CLDN23,MFHAS1,ERI1 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN23 18318 2807 chr8 8594916 8613499 8600926,8604672,8609673 N,N,N NA;NA;NA CLDN23 FLJ10661,SGK223,MFHAS1,ERI1,CLDN23 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN23 35250 2808 chr8 86079546 86086184 86084444 N NA E2F5,C8orf59 E2F5 MCF7 ChIA-PET 22265404 E2F5 3435 2809 chr8 90738639 90742975 90741494 Y OSGIN2,RIPK2 RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIPK2 27000 2810 chr8 93183452 93185305 93184276 N NA NA NA NA NA NA OTUD6B 1101028 2811 chr8 95990426 95994684 95991321 N NA TP53INP1,C8orf38 C8orf69,CCNE2,C8orf37,LOC100616530,PLEKHF2 IMR90 Hi-C 24141950 TP53INP1 28811 2812 chr8 95998346 96021649 95999564 N NA TP53INP1,C8orf38 CCNE2,C8orf37,LOC100616530,PLEKHF2,C8orf69,TP53INP1,MIR3150B,MIR3150A,C8orf38 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C8orf38 15565 2813 chr8 98651496 98653286 98652673 N NA MTDH NA NA NA NA MTDH 3121 2814 chr9 100564886 100569997 100565841 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 105195 2815 chr9 100800576 100802842 100802033 N NA NANS NA NA NA NA NANS 16117 2816 chr9 102390183 102391235 102390743 N NA NA SEC61B IMR90 Hi-C 24141950 STX17 277680 2817 chr9 103172620 103174764 103174053 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 57361 2818 chr9 103188705 103192371 103189463 N NA NA C9orf30-TMEFF1,NR4A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 73446 2819 chr9 105258724 105261065 105259504 N NA NA NA NA NA NA RNF20 962591 2820 chr9 105281587 105282501 105281851 N NA NA NA NA NA NA RNF20 985454 2821 chr9 107730278 107731736 107730721 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 39751 2822 chr9 107752284 107754947 107753810 N NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 61757 2823 chr9 115487737 115489112 115488421 N NA C9orf80,SNX30 NA NA NA NA C9orf80 7350 2824 chr9 117750654 117753348 117752208 N NA NA DFNB31,LOC100505478,TNFSF15,TNFSF8,C9orf91 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF8 57779 2825 chr9 118268603 118270733 118269562 N NA NA TNC,DEC1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF8 575728 2826 chr9 120545359 120546954 120545912 N NA NA NA NA NA NA TLR4 78906 2827 chr9 122498215 122501114 122499321 N NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 841323 2828 chr9 123496196 123499155 123497713 N NA MEGF9 FBXW2,MEGF9 IMR90 Hi-C 24141950 MEGF9 19431 2829 chr9 123832842 123836439 123834384 Y TRAF1,TRAF1,CNTRL CNTRL CNTRL,TRAF1,MEGF9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTRL 14135 2830 chr9 123968946 123979576 123969755,123975579 N,N NA;NA RAB14 RAB14,GSN,STOM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB14 4581 2831 chr9 126082814 126090411 126085161,126089174 N,N NA;NA CRB2 STRBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CRB2 28037 2832 chr9 126093007 126106992 126097916,126102276,126106572 N,N,N NA;NA;NA CRB2 STRBP,RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CRB2 11456 2833 chr9 126958622 126960412 126959929 Y DENND1A NA NEK6,DENND1A IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 59473 2834 chr9 126977770 126981867 126980166 N NA NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 38018 2835 chr9 127181200 127184785 127182686 N NA PSMB7 PSMB7,NR5A1,GPR144,NR6A1,MIR181A2HG IMR90 Hi-C 24141950 PSMB7 3479 2836 chr9 128170867 128179016 128172680 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 146756 2837 chr9 129292984 129298122 129295983 N NA NA LMX1B IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB43 269163 2838 chr9 129483586 129487446 129485346 N NA NA NA NA NA NA ZBTB43 79839 2839 chr9 130005964 130009477 130007546 N NA NA NA NA NA NA SLC2A8 149988 2840 chr9 130369326 130372023 130370836 N NA STXBP1 AK1,STXBP1,FAM129B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STXBP1 2463 2841 chr9 130769512 130770883 130770288 Y SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A FAM102A FAM102A,SLC25A25,NAIF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM102A 26700 2842 chr9 130787108 130790286 130788735 Y CDK9,SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A FAM102A,NAIF1,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1,FAM102A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAIF1 39313 2843 chr9 132032268 132034432 132033193 N NA NA LOC100506190,C9orf50,PTGES,C9orf106,IER5L,METTL11A,TOR1A,TOR1B,SH3GLB2,DOLPP1,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,GM12878,HELA,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 IER5L 91728 2844 chr9 132142902 132149118 132146056 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA LOC100506190,C9orf50,METTL11A,C9orf106,SH3GLB2,PPP2R4,CRAT,IER5L,PTGES IMR90,K562,GM12878,HELA,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 IER5L 202362 2845 chr9 132174332 132178089 132176078 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL11A 210346 2846 chr9 134247515 134250259 134248942 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 55218 2847 chr9 134266259 134276106 134269863 N NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 29371 2848 chr9 134618443 134622341 134619571 Y FAM78A,RAPGEF1 RAPGEF1 RAPGEF1 K562 ChIA-PET 22265404 RAPGEF1 5518 2849 chr9 135845542 135847018 135846704 N NA TSC1,GFI1B C9orf9,AK8,C9orf171,DDX31,TSC1,GFI1B IMR90 Hi-C 24141950 GFI1B 7080 2850 chr9 137094330 137109140 137096275,137107646,137104563 N,N,N NA;NA;NA NA BRD3,RNU6ATAC,RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR5 93120 2851 chr9 137158726 137161772 137160084 N NA NA WDR5,RXRA,COL5A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR5 157516 2852 chr9 137162847 137165251 137164201 N NA NA RXRA,COL5A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR5 161637 2853 chr9 137820328 137832380 137822931,137828804 N,N NA;NA FCN1 LOC100130954,FCN2,LOC100506599 IMR90 Hi-C 24141950 FCN1 10522 2854 chr9 139667330 139669321 139668343 N NA SNHG7,TMEM141,KIAA1984,C9orf86,LOC100131193 LCN15,LCN8 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM141 16456 2855 chr9 19229779 19232807 19230750 N NA NA DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 57942 2856 chr9 21094105 21097913 21096425 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 237516 2857 chr9 22164602 22167330 22165610 N NA NA MTAP,CDKN2B-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2B-AS1 169812 2858 chr9 2240964 2243509 2242391 N NA NA FLJ35024,VLDLR,KIAA0020,SMARCA2 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCA2 225622 2859 chr9 2256962 2259790 2257721 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 241620 2860 chr9 26665378 26666915 26666208 N NA NA NA NA NA NA C9orf82 225911 2861 chr9 27644548 27646522 27645274 N NA NA NA NA NA NA C9orf72 70684 2862 chr9 31345773 31350031 31347443 N NA NA NA NA NA NA DDX58 1176291 2863 chr9 31388685 31391890 31390498 N NA NA NA NA NA NA DDX58 1134432 2864 chr9 33220469 33222570 33221139,33221565 N,N NA;NA BAG1,CHMP5 B4GALT1 IMR90 Hi-C 24141950 BAG1 42189 2865 chr9 34168663 34173250 34171986 N NA DCAF12,UBAP1 UBAP2,UBAP1,KIF24,DCAF12 IMR90 Hi-C 24141950 UBAP1 5753 2866 chr9 35976504 35977518 35976987 N NA NA C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 RECK 59392 2867 chr9 36485634 36491262 36487324 N NA NA RNF38 IMR90 Hi-C 24141950 MELK 81597 2868 chr9 36764628 36768463 36766070 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 191769 2869 chr9 37063797 37068761 37066275 N NA PAX5,LOC100506710 ZCCHC7,PAX5 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506710 11132 2870 chr9 38278113 38280139 38278702 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 112522 2871 chr9 41017687 41018861 41018463 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 2625026 2872 chr9 42250737 42252196 42251581 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 3858076 2873 chr9 4462056 4466041 4465000 N NA NA SLC1A1 IMR90 Hi-C 24141950 PPAPDC2 196257 2874 chr9 45355827 45357451 45356621 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 6963166 2875 chr9 45440822 45442529 45441998 N NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 7048161 2876 chr9 6079193 6081415 6080381 N NA NA NA NA NA NA RANBP6 63553 2877 chr9 6382484 6386197 6385377 N NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 26954 2878 chr9 66454536 66461094 66457947,66460386,66455322 N,N,N NA;NA;NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 4859522 2879 chr9 66469840 66472726 66471814 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 4847890 2880 chr9 66485964 66487469 66486751 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 4833147 2881 chr9 66553345 66555832 66553744 N NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 4764784 2882 chr9 6679998 6684734 6681663,6682898 Y,N UHRF2,KDM4C;NA NA KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 72907 2883 chr9 6702589 6707273 6704266 N NA NA KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 50368 2884 chr9 71209351 71212669 71210932 N NA NA NA NA NA NA PIP5K1B 107947 2885 chr9 71250257 71261150 71251891,71255024,71259202 N,N,N NA;NA;NA NA PIP5K1B IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 59466 2886 chr9 71263083 71265562 71264037 N NA NA PIP5K1B IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 55054 2887 chr9 73032950 73035651 73034492 Y SMC5,KLF9 NA TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMC5 159072 2888 chr9 74408791 74414858 74410499 Y FAM108B1,TMEM2 NA NA NA NA NA FAM108B1 111290 2889 chr9 76895688 76898307 76897794 N NA NA NA NA NA NA C9orf40 669495 2890 chr9 81640633 81642562 81641381 N NA NA NA NA NA NA TLE4 544316 2891 chr9 84715809 84718178 84717113 N NA NA NA NA NA NA C9orf103 1519855 2892 chr9 84742179 84745035 84743300 N NA NA NA NA NA NA C9orf103 1492998 2893 chr9 84797563 84801281 84797633,84799725 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C9orf103 1436752 2894 chr9 92119492 92121699 92120330 N NA SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 24881 2895 chr9 92133170 92135120 92134133 N NA SEMA4D SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 38559 2896 chr9 92136401 92138930 92137468 Y SECISBP2 SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 41790 2897 chr9 92155573 92159065 92157646 N NA NA SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 60962 2898 chr9 92169692 92172328 92171319 N NA NA SECISBP2,SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 75081 2899 chr9 93531380 93534201 93532244 N NA SYK UNQ6494,SYK IMR90 Hi-C 24141950 SYK 29811 2900 chr9 93534758 93538763 93536634 N NA SYK UNQ6494,SYK IMR90 Hi-C 24141950 SYK 25249 2901 chr9 93556231 93559845 93556707,93558604 N,Y NA;SYK,SYK SYK SYK MCF7 ChIA-PET 22265404 SYK 4167 2902 chr9 93796460 93798176 93797962 N NA NA NFIL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYK 232448 2903 chr9 95531937 95533942 95532979 N NA BICD2 BICD2 K562 ChIA-PET 22265404 BICD2 4854 2904 chr9 95553293 95554766 95553780 N NA BICD2 BICD2,NOL8,IPPK,ANKRD19P IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BICD2 26210 2905 chr9 95905893 95907638 95906413 N NA C9orf89,NINJ1,WNK2 NINJ1,C9orf89 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NINJ1 9323 2906 chr9 96900226 96902225 96901085 N NA NA NA NA NA NA PTPDC1 107150 2907 chr9 96911182 96913625 96912182 N NA NA NA NA NA NA ZNF169 107953 2908 chr9 96915478 96917139 96916390 N NA NA NA NA NA NA ZNF169 104439 2909 chr9 97250138 97254437 97251436 N NA NA FBP2 IMR90 Hi-C 24141950 HIATL1 113305 2910 chr9 97257429 97266788 97259029,97261128,97265909 N,N,N NA;NA;NA NA FBP2 IMR90 Hi-C 24141950 HIATL1 120596 2911 chr9 97271952 97281071 97274314 N NA NA NA NA NA NA HIATL1 135119 2912 chr9 97286126 97292105 97288470,97291298 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HIATL1 149293 2913 chr9 97417430 97419514 97418690 N NA NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 69437 2914 chrX 102658826 102661729 102659658 N NA NA NGFRAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TCEAL8 148705 2915 chrX 106663413 106665085 106663943 N NA NA NA NA NA NA PRPS1 206569 2916 chrX 106682466 106684908 106683598 N NA NA NA NA NA NA PRPS1 186746 2917 chrX 106687058 106694891 106693327 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176763 2918 chrX 106915845 106921741 106916435,106919831 N,N NA;NA PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 44191 2919 chrX 112129449 112131769 112130549 N NA NA NA NA NA NA ALG13 1205103 2920 chrX 112226548 112228495 112227327 N NA NA NA NA NA NA ALG13 1302202 2921 chrX 115005585 115029512 115028814 N NA NA NA NA NA NA DOCK11 2600360 2922 chrX 115054462 115057793 115057064 N NA NA NA NA NA NA DOCK11 2572079 2923 chrX 115082512 115087384 115085188 N NA NA NA NA NA NA DOCK11 2542488 2924 chrX 115125385 115127827 115126393 N NA NA NA NA NA NA DOCK11 2502045 2925 chrX 118634247 118636758 118635181 N NA SLC25A5,SLC25A5-AS1 SOWAHD IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A5-AS1 31164 2926 chrX 119619372 119620571 119620004 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 16168 2927 chrX 119881582 119894167 119883164,119886801,119889066,119893989,119890092 Y,Y,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 117577 2928 chrX 120476607 120478896 120477532 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 712602 2929 chrX 120589070 120591781 120590848 N NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 825065 2930 chrX 123350650 123352236 123351562 Y SH2D1A NA NA NA NA NA SH2D1A 127896 2931 chrX 129085408 129093421 129086902,129091385 N,N NA;NA UTP14A UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 UTP14A 45311 2932 chrX 129094693 129096774 129095408 N NA NA UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 UTP14A 54596 2933 chrX 129115063 129119875 129116483 N NA NA BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UTP14A 74966 2934 chrX 12967311 12970780 12968818 N NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22446 2935 chrX 12972314 12977497 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 15729 2936 chrX 13016653 13019219 13018307 N NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 23427 2937 chrX 13091143 13094288 13092928 N NA NA LOC100133123,TMSB4X,FAM9C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMSB4X 97917 2938 chrX 133502070 133504608 133503744 N NA PHF6 NA NA NA NA PHF6 2734 2939 chrX 13491016 13493206 13492059 N NA NA NA NA NA NA TCEANC 178101 2940 chrX 13504111 13506619 13505916 N NA NA TMSB4X,RAB9A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCEANC 164688 2941 chrX 135990615 135993559 135991899 N NA RBMX RBMX K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RBMX 27676 2942 chrX 139013027 139016320 139014348 N NA NA MIR505,ATP11C MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP11C 98580 2943 chrX 139900165 139907416 139903696,139905655 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP11C 985718 2944 chrX 147461272 147464130 147462899 N NA NA NA NA NA NA AFF2 118009 2945 chrX 147539643 147542821 147541104 N NA AFF2 NA NA NA NA AFF2 39318 2946 chrX 14963164 14968195 14964957 N NA NA MOSPD2 IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD2 71637 2947 chrX 15921102 15922639 15921655 N NA AP1S2 CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 48002 2948 chrX 16118825 16124990 16122456 N NA NA NA NA NA NA AP1S2 245725 2949 chrX 16899514 16902161 16900982 N NA RBBP7 RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 10980 2950 chrX 18692442 18695262 18693178 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA PHKA2 307218 2951 chrX 22691683 22695117 22693244 N NA NA NA NA NA NA SMS 732968 2952 chrX 22702204 22705605 22703928 N NA NA NA NA NA NA SMS 743489 2953 chrX 23782990 23787222 23785724 N NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 14053 2954 chrX 34576364 34579247 34577573 N NA NA NA NA NA NA CYBB 3060023 2955 chrX 38736924 38740989 38738728 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 76239 2956 chrX 39194530 39197309 39195776 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 533845 2957 chrX 40869167 40869967 40869761 N NA NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 74921 2958 chrX 41134926 41137142 41135737 N NA NA USP9X,DDX3X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 55509 2959 chrX 42792516 42794656 42793183 N NA NA NA NA NA NA DDX3X 1599865 2960 chrX 42800593 42804803 42803008 Y NA NA NA NA NA NA FUNDC1 1597418 2961 chrX 42847256 42849047 42848418 N NA NA NA NA NA NA FUNDC1 1553174 2962 chrX 45709545 45712533 45711216 N NA NA NA NA NA NA ZNF673 594091 2963 chrX 47219608 47222374 47221396 N NA NA USP11,ZNF157,UBA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF41 119971 2964 chrX 47225163 47226619 47225642 N NA NA NA NA NA NA ZNF41 115726 2965 chrX 48494518 48496051 48495348 N NA WDR13,WAS NA NA NA NA WDR13 38638 2966 chrX 48525866 48530063 48527996 N NA WAS,SUV39H1 NA NA NA NA WAS 12123 2967 chrX 48532667 48537732 48534896 N NA WAS,SUV39H1 NA NA NA NA WAS 4454 2968 chrX 48594226 48597157 48595803 N NA SUV39H1 SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUV39H1 39095 2969 chrX 49968109 49972084 49969256 N NA NA NA NA NA NA USP27X 323639 2970 chrX 52003702 52005878 52004995 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 457547 2971 chrX 53028327 53030692 53030023 N NA GPR173 NA NA NA NA GPR173 47814 2972 chrX 53739631 53744931 53741891,53744335,53740465 Y,Y,N KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8;NA;NA HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 25958 2973 chrX 54664213 54667984 54666040 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 107569 2974 chrX 55932215 55937201 55934913 N NA NA NA NA NA NA USP51 416584 2975 chrX 56091669 56096304 56094218 N NA NA NA NA NA NA UBQLN2 493722 2976 chrX 57976636 57979945 57977705 N NA ZXDA NA NA NA NA ZXDA 39569 2977 chrX 63799382 63801505 63800224 N NA NA NA NA NA NA MTMR8 184049 2978 chrX 64067386 64079886 64070805 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 452053 2979 chrX 64820778 64822780 64821749 Y MSN NA MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 64731 2980 chrX 7122880 7127305 7123552 N NA STS NA NA NA NA STS 10167 2981 chrX 7516106 7518548 7517477 N NA NA NA NA NA NA PNPLA4 377232 2982 chrX 7522993 7524789 7523629 N NA NA NA NA NA NA PNPLA4 370991 2983 chrX 75366905 75369031 75368115 N NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 23740 2984 chrX 76642044 76644627 76643481 N NA NA NA NA NA NA ATRX 397092 2985 chrX 78392179 78395761 78394493 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA P2RY10 191350 2986 chrX 83971219 83974399 83973204 N NA NA NA NA NA NA SH3BGRL 3513916 2987 chrX 83978418 83980409 83979238 N NA NA NA NA NA NA SH3BGRL 3521115 2988 chrX 9308250 9310091 9308958 N NA NA TBL1X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 121244 2989 chrY 13459480 13469640 13460826,13464476,13466981 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 1304658 2990 chrY 13471057 13487361 13475977,13482494 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 1286937 2991 chrY 14416578 14420348 14417157 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 353950 2992 chrY 14636378 14643346 14638025,14641366,14641564 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA TTTY15 130952 2993 chrY 22887945 22889551 22888436 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 150334 2994 chrY 22896238 22898828 22897289 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 158627 2995 chrY 23895833 23898817 23898106 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 1158222 2996 chrY 7597581 7599606 7598546 N NA NA NA NA NA NA PRKY 455568 2997 chrY 9096105 9097771 9096931 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1954092